View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4792_low_4 (Length: 242)

Name: NF4792_low_4
Description: NF4792
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4792_low_4
NF4792_low_4
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (6-234)||(44241350-44241579)
chr1 (6-228)||(29001730-29001953)
chr1 (6-234)||(31072311-31072540)
chr1 (6-227)||(9869105-9869327)
chr1 (4-228)||(4599527-4599753)
chr1 (6-228)||(1174604-1174828)
chr1 (6-234)||(42091889-42092118)
chr1 (6-228)||(6238654-6238877)
chr1 (6-228)||(39053338-39053561)
chr1 (6-228)||(39059710-39059933)
chr1 (6-228)||(45015780-45016003)
chr1 (6-228)||(26621468-26621692)
chr1 (6-234)||(44916323-44916560)
chr1 (6-228)||(41305514-41305738)
chr1 (37-228)||(27240161-27240354)
chr1 (6-228)||(41297515-41297739)
chr1 (6-223)||(11913262-11913479)
chr1 (6-228)||(43686626-43686851)
chr1 (6-234)||(32797729-32797945)
chr1 (6-234)||(1115982-1116213)
chr1 (6-234)||(41299188-41299418)
chr1 (95-228)||(23764521-23764655)
chr1 (70-234)||(5445028-5445192)
chr1 (11-234)||(28413678-28413903)
chr1 (6-85)||(23762336-23762415)
chr1 (11-234)||(39806050-39806274)
chr1 (32-234)||(38672792-38672997)
chr1 (76-228)||(2824891-2825042)
chr1 (15-141)||(47646755-47646883)
chr1 (12-234)||(23251336-23251568)
chr1 (11-118)||(5357752-5357861)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (6-234)||(37026041-37026270)
chr7 (6-228)||(26601911-26602134)
chr7 (6-228)||(15914637-15914860)
chr7 (6-228)||(39432907-39433129)
chr7 (6-228)||(15949158-15949381)
chr7 (6-228)||(3924093-3924316)
chr7 (6-228)||(36875544-36875767)
chr7 (6-228)||(5049912-5050135)
chr7 (6-228)||(14287714-14287937)
chr7 (6-227)||(14298900-14299122)
chr7 (6-228)||(6795437-6795660)
chr7 (6-228)||(23612388-23612611)
chr7 (9-234)||(45433578-45433805)
chr7 (6-228)||(9642916-9643141)
chr7 (6-228)||(1948633-1948857)
chr7 (6-228)||(6020864-6021088)
chr7 (6-228)||(8185392-8185616)
chr7 (6-228)||(8192952-8193176)
chr7 (6-228)||(48353480-48353704)
chr7 (6-228)||(2446645-2446868)
chr7 (6-210)||(21642535-21642740)
chr7 (6-234)||(33850643-33850872)
chr7 (6-228)||(19089806-19090030)
chr7 (6-228)||(48347096-48347320)
chr7 (6-228)||(5056307-5056531)
chr7 (6-228)||(1378946-1379169)
chr7 (6-228)||(8142446-8142669)
chr7 (11-234)||(10831130-10831355)
chr7 (11-234)||(11024922-11025147)
chr7 (6-80)||(13774130-13774204)
chr7 (11-228)||(21901193-21901413)
chr7 (177-230)||(1942042-1942095)
chr7 (11-72)||(27954243-27954303)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (6-232)||(2640-2867)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (6-234)||(4973556-4973785)
chr5 (6-228)||(22359963-22360186)
chr5 (6-228)||(22313829-22314052)
chr5 (6-227)||(5876218-5876440)
chr5 (6-228)||(34357288-34357511)
chr5 (6-228)||(34359079-34359302)
chr5 (6-228)||(2957857-2958081)
chr5 (6-228)||(2966326-2966550)
chr5 (6-228)||(29980458-29980681)
chr5 (6-228)||(30041244-30041467)
chr5 (6-228)||(40958617-40958840)
chr5 (6-228)||(25894649-25894873)
chr5 (6-234)||(2438794-2439022)
chr5 (6-234)||(12505765-12506002)
chr5 (8-228)||(42150817-42151039)
chr5 (6-228)||(29414669-29414892)
chr5 (11-234)||(33794085-33794309)
chr5 (11-228)||(9843348-9843566)
chr5 (11-228)||(2156125-2156341)
chr5 (15-117)||(19853484-19853588)
chr5 (11-118)||(12918955-12919064)
chr5 (11-118)||(30580195-30580304)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (6-228)||(13671817-13672040)
chr6 (6-225)||(27670096-27670316)
chr6 (6-228)||(31547894-31548117)
chr6 (6-228)||(32328493-32328716)
chr6 (6-228)||(1428423-1428646)
chr6 (6-228)||(34711557-34711780)
chr6 (6-228)||(9864760-9864984)
chr6 (6-228)||(4186684-4186907)
chr6 (6-228)||(11058150-11058373)
chr6 (6-225)||(21262574-21262795)
chr6 (6-228)||(4020235-4020459)
chr6 (6-228)||(4026661-4026885)
chr6 (6-228)||(34655249-34655473)
chr6 (6-228)||(34648798-34649022)
chr6 (6-228)||(4738323-4738547)
chr6 (6-218)||(7069702-7069916)
chr6 (73-234)||(29906883-29907045)
chr6 (73-234)||(30117335-30117497)
chr6 (101-228)||(7062578-7062707)
chr6 (57-149)||(1167538-1167630)
chr6 (11-204)||(10081567-10081762)
chr6 (6-68)||(7062516-7062578)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (6-234)||(16405335-16405568)
chr4 (6-228)||(55462772-55462995)
chr4 (6-228)||(16838359-16838581)
chr4 (6-228)||(27590304-27590527)
chr4 (6-230)||(41372983-41373209)
chr4 (7-228)||(37368315-37368538)
chr4 (6-228)||(13594105-13594330)
chr4 (6-228)||(7780406-7780629)
chr4 (6-228)||(8103880-8104104)
chr4 (6-228)||(30238259-30238482)
chr4 (6-228)||(17456853-17457077)
chr4 (6-234)||(30211536-30211757)
chr4 (6-223)||(36754791-36755017)
chr4 (6-153)||(5660549-5660696)
chr4 (32-234)||(13003812-13004016)
chr4 (11-228)||(2947844-2948062)
chr4 (132-228)||(48914898-48914996)
chr4 (196-234)||(5660743-5660781)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (6-228)||(21341882-21342105)
chr2 (6-225)||(2021448-2021668)
chr2 (6-228)||(21331994-21332217)
chr2 (6-228)||(42931372-42931595)
chr2 (6-234)||(12950789-12951018)
chr2 (6-228)||(16856487-16856709)
chr2 (6-228)||(16817330-16817552)
chr2 (6-228)||(36782184-36782408)
chr2 (6-228)||(34834812-34835035)
chr2 (6-228)||(34841256-34841479)
chr2 (6-228)||(29484925-29485149)
chr2 (6-228)||(45011981-45012205)
chr2 (6-230)||(2164025-2164250)
chr2 (6-228)||(15852548-15852772)
chr2 (6-228)||(43267857-43268081)
chr2 (6-228)||(2157611-2157834)
chr2 (6-228)||(13901957-13902180)
chr2 (6-228)||(21067958-21068181)
chr2 (6-155)||(45700644-45700793)
chr2 (11-234)||(41455599-41455823)
chr2 (37-170)||(11909981-11910116)
chr2 (11-170)||(17784443-17784604)
chr2 (15-153)||(13162892-13163032)
chr2 (11-170)||(17789096-17789257)
chr2 (198-234)||(45700843-45700879)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (6-234)||(12768737-12768966)
chr8 (6-234)||(8013320-8013549)
chr8 (6-228)||(11358193-11358417)
chr8 (6-228)||(7311348-7311571)
chr8 (6-228)||(36005482-36005705)
chr8 (6-230)||(36075964-36076189)
chr8 (6-228)||(36425730-36425954)
chr8 (6-228)||(6464576-6464799)
chr8 (6-222)||(15012393-15012610)
chr8 (6-228)||(36021799-36022023)
chr8 (6-228)||(41242116-41242339)
chr8 (6-234)||(1238206-1238436)
chr8 (6-228)||(16710668-16710892)
chr8 (6-234)||(31017392-31017608)
chr8 (6-149)||(26250591-26250734)
chr8 (6-198)||(45068416-45068609)
chr8 (11-228)||(7933931-7934150)
chr8 (175-234)||(14393727-14393786)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (6-234)||(49684-49912)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (6-234)||(10941304-10941533)
chr3 (6-228)||(4311486-4311709)
chr3 (6-228)||(32746369-32746592)
chr3 (6-228)||(6036265-6036488)
chr3 (6-228)||(24179072-24179296)
chr3 (6-230)||(9570548-9570775)
chr3 (6-228)||(27501967-27502191)
chr3 (6-230)||(9577050-9577277)
chr3 (6-228)||(13014985-13015208)
chr3 (6-234)||(43995062-43995300)
chr3 (6-228)||(25893229-25893458)
chr3 (6-234)||(43931575-43931799)
chr3 (6-230)||(23068461-23068686)
chr3 (102-228)||(41353860-41353987)
chr3 (34-153)||(20651153-20651272)
chr3 (78-228)||(41354142-41354293)
chr3 (162-229)||(3577095-3577162)
chr3 (11-230)||(4590791-4591012)
chr3 (11-234)||(20952759-20952992)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (6-234)||(15164-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (6-228)||(5005-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (6-234)||(3264-3492)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (6-228)||(8881-9105)
scaffold0510 (6-234)||(2560-2790)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (6-147)||(12014-12155)
scaffold0513 (164-228)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (122-228)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (32-234)||(24271-24475)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44241579 - 44241350
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44241579 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 44241480  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241479 aatgaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttcatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 44241380  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241379 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 44241350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29001953 - 29001730
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  29001953 tattatttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgacc 29001854  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001853 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 29001754  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29001753 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29001730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31072540 - 31072311
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31072540 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagagtccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 31072441  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31072440 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttagcttag 31072341  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31072340 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 31072311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9869327 - 9869105
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9869327 tattgtttggacacgaaagatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 9869228  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  9869227 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagtcattaaaacaaactaccaattatcttttaacttag 9869128  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9869127 aatgatatttggtgtcgaacggt 9869105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4599753 - 4599527
Alignment:
Q  4 agtattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4599753 agtattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaa 4599654  T
Q  104 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaact 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4599653 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaact 4599554  T
Q  202 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599553 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 4599527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1174828 - 1174604
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1174828 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgctc 1174729  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1174728 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaactta 1174629  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1174628 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 1174604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42092118 - 42091889
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42092118 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 42092019  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  42092018 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 42091919  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42091918 aatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 42091889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6238877 - 6238654
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6238877 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6238778  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6238777 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6238678  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238677 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6238654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 39053338 - 39053561
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39053338 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39053437  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39053438 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39053537  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39053538 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39053561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 39059710 - 39059933
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39059710 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39059809  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39059810 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39059909  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39059910 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45016003 - 45015780
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45016003 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 45015904  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  45015903 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 45015804  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015803 aatgatatttggtgtcgaacggtc 45015780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26621692 - 26621468
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26621692 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 26621593  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26621592 aaggaaccctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 26621493  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621492 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 26621468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44916560 - 44916323
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |     
T  44916560 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgtttggtt 44916461  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 196  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  44916460 aaggaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagttaacttagtttttaaaacaaacaacaaactatcttt 44916361  T
Q  197 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44916360 taatttagaatgatatttggtgtcgaatggtccgtgat 44916323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 41305514 - 41305738
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  41305514 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttaatc 41305613  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41305614 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttaaactta 41305713  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41305714 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 41305738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 228
Target Start/End: Original strand, 27240161 - 27240354
Alignment:
Q  37 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgcc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240161 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgcc 27240260  T
Q  137 ttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27240261 ttattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 27240354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41297739 - 41297515
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  41297739 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 41297640  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  41297639 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 41297540  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  41297539 gaatgatatttggagtcgaacggtc 41297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 11913262 - 11913479
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  11913262 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacatgtgatgcttggtc 11913361  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||   || |||||||| |||||  |||| ||| |||||    
T  11913362 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttag---tttaaacaaacaaacaatctatcttttaaactt 11913458  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913459 agaatgatatttggtgtcgaa 11913479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43686851 - 43686626
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  43686851 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttaaatgagacgctcgatc 43686752  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  43686751 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 43686652  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  43686651 ggaatggtatttggtgtcgaacggtc 43686626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32797945 - 32797729
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  32797945 tattgtttggacacgaattgtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 32797846  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||            |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32797845 aaggaactctaatcctaacaagtttttacgccctattactc------------ttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 32797759  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32797758 aatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 32797729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 1115982 - 1116213
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggt---gttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttg 102  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1115982 tattgtttggacacaaatggtagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaaggtagaatccatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttg 1116081  T
Q  103 atcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaact 201  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1116082 attaaggaactctaatcataagaagtttcacaccttattactctcaacttttactcttgcaacttagttact-aaacaaacaacaaattagcttttaact 1116180  T
Q  202 tagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1116181 tagaatgatatttggtgtcgaacggtatgtgat 1116213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 41299188 - 41299418
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  41299188 tattgtttggaaaagaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 41299287  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41299288 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 41299387  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41299388 gaatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 41299418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 23764521 - 23764655
Alignment:
Q  95 gacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23764521 gacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc 23764620  T
Q  194 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23764621 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 23764655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Original strand, 5445028 - 5445192
Alignment:
Q  70 catgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttag 168  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5445028 catgtatggtcattaggttatgtgtgaggcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaacttttactcttgcaacttag 5445127  T
Q  169 ttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5445128 ttactaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttagaatgatagttggtgtcgaacggtccgtgat 5445192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 28413678 - 28413903
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  28413678 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattggtaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 28413777  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 207  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28413778 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 28413876  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28413877 gatatttggtgtcgaacggtccgtgat 28413903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 23762336 - 23762415
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23762336 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 23762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39806274 - 39806050
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  39806274 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 39806175  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 207  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39806174 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaatttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatc-tttaacttaaaat 39806077  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39806076 gatatttggtgtcaaacggtttgtgat 39806050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Original strand, 38672792 - 38672997
Alignment:
Q  32 tgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || || || ||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||    ||    
T  38672792 tgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaaggaactctaattccaatgtttt 38672891  T
Q  130 tcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaatgatatttggtgtcgaacggt 227  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38672892 t-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatctttcaaacttagaatgatatttggtgtcgaacggt 38672990  T
Q  228 ctgtgat 234  Q
    | |||||    
T  38672991 cggtgat 38672997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Original strand, 2824891 - 2825042
Alignment:
Q  76 tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaa 175  Q
    |||| ||||| ||| || |||||| | |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||    
T  2824891 tgattattaggttatgtttgacgcataatcaaggaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaactttcacttttatacttggttactaa 2824989  T
Q  176 aacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2824990 aacaaacaacatattatcttttaacttagaatgatatttggtgtcgaatggtc 2825042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 47646883 - 47646755
Alignment:
Q  15 gacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 112  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||||  |||| |||| ||||    
T  47646883 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaatccgtatatgtgatcattaggttatatgtgattcttggtcaacgaac 47646784  T
Q  113 tctaatactaacaagtttcacgccttatt 141  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47646783 tctaatcataacaagttttacgccttatt 47646755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23251568 - 23251336
Alignment:
Q  12 ttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaagg 109  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  23251568 ttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaagg 23251469  T
Q  110 aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaac-aacaaattatcgtttaac 200  Q
    ||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | |||||||  |||     |||||||| ||||| |  || ||||||    
T  23251468 aactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaacttttattcttgcgaattagttaacttagttacaaacaaacaaacaactactcttttaac 23251370  T
Q  201 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23251369 ttcgaatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 23251336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 5357752 - 5357861
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  5357752 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattgggaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 5357851  T
Q  109 gaactctaat 118  Q
    ||||||||||    
T  5357852 gaactctaat 5357861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37026270 - 37026041
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37026270 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatcaatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 37026171  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026170 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttacaacttagttagtcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 37026071  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026070 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 37026041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26602134 - 26601911
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26602134 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgttcattaggttatgtgtgacgcttgatc 26602035  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602034 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 26601935  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26601934 aatgatatttggtgtcgaacggtc 26601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15914860 - 15914637
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15914860 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 15914761  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914760 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15914661  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15914660 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15914637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39433129 - 39432907
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433129 tattgtttggacacgaatggcgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 39433030  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttaga 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39433029 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaactttatcatttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttaga 39432930  T
Q  206 atgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  39432929 atgatatttgttgtcgaacggtc 39432907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15949381 - 15949158
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||    
T  15949381 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatatgcgacgcttgatc 15949282  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949281 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15949182  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15949181 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 3924093 - 3924316
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3924093 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 3924192  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  3924193 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 3924292  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3924293 aatgatatttggtatcgaacggtc 3924316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36875767 - 36875544
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36875767 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatatatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36875668  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36875667 aaggaactccaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 36875568  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875567 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36875544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 5049912 - 5050135
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5049912 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5050011  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  5050012 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttgg 5050111  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5050112 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5050135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14287937 - 14287714
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14287937 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14287838  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14287837 aaggaactctaatcctaacaagatttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14287738  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287737 aatgatatttggtgtcgaacggtc 14287714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14299122 - 14298900
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14299122 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14299023  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14299022 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14298923  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  14298922 aatgatatttggtgtcaaacggt 14298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6795660 - 6795437
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6795660 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6795561  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6795560 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6795461  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795460 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23612611 - 23612388
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23612611 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 23612512  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  23612511 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgtaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 23612412  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  23612411 aatgatatttcgtgtcgaacggtc 23612388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45433805 - 45433578
Alignment:
Q  9 tgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45433805 tgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgattaag 45433706  T
Q  109 gaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaa 206  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45433705 gaactctaatcctaacaagtttttacgccttattactctcaacttttactcttgaaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaa 45433606  T
Q  207 tgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45433605 tgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 45433578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 9642916 - 9643141
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9642916 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9643015  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  9643016 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 9643115  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9643116 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 9643141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 1948633 - 1948857
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  1948633 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatctcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatt 1948732  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1948733 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 1948832  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  1948833 gaatgatatttggtgttgaacggtc 1948857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 6020864 - 6021088
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6020864 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 6020963  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  6020964 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 6021063  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  6021064 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 6021088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 8185392 - 8185616
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8185392 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8185491  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8185492 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8185591  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8185592 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8185616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 8192952 - 8193176
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8192952 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8193051  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8193052 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8193151  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8193152 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8193176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 48353480 - 48353704
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48353480 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48353579  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48353580 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48353679  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48353680 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48353704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2446868 - 2446645
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2446868 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2446769  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2446768 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2446669  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  2446668 aatgatatttggtgtcgaatggtc 2446645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21642740 - 21642535
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21642740 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaatgaaaagctagaatccatgtttgttcattaggttatgtgtgatgcttgatc 21642641  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642640 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 21642541  T
Q  205 aatgat 210  Q
    ||||||    
T  21642540 aatgat 21642535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 33850643 - 33850872
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  33850643 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 33850742  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  33850743 aaggaactctaatcctaacaagtttaacgccttactactctcaacttttactattgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattgacttttaacttag 33850842  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33850843 aatgatatttggtgtcaaacggtatgtgat 33850872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19090030 - 19089806
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19090030 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 19089931  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19089930 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 19089831  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19089830 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 19089806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 48347096 - 48347320
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48347096 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48347195  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48347196 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48347295  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48347296 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48347320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 5056307 - 5056531
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5056307 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5056406  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  5056407 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 5056506  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  5056507 aaatgataattggtgtcgaacggtc 5056531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1379169 - 1378946
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1379169 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1379070  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1379069 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1378970  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1378969 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1378946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 8142446 - 8142669
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8142446 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8142545  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8142546 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgtaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8142645  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142646 aatgatatttggtgtcgaacggtc 8142669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 10831130 - 10831355
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||| ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10831130 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10831229  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 207  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10831230 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 10831328  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10831329 gatatttggtgtcgaacggtccgtgat 10831355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 11024922 - 11025147
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||| ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11024922 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 11025021  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 207  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11025022 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 11025120  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11025121 gatatttggtgtcgaacggtccgtgat 11025147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 13774130 - 13774204
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 80  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774130 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 13774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 21901193 - 21901413
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21901193 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaag 21901292  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaa 206  Q
    ||||||| || |||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  21901293 gaactctgattctaacgttttt-acgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaacttagaa 21901391  T
Q  207 tgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21901392 tgatatatggtgtcgaacggtc 21901413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1942095 - 1942042
Alignment:
Q  177 acaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1942095 acaaacaacaaattatcgtttaacttataatgatatttggtgtcgaacggtctg 1942042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27954303 - 27954243
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 72  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27954303 tttggacacgaatgatgttgttgaggaatatgtgataatatc-gagtaaagctagaatccat 27954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2640
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2867 tattgtttggatacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctataatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 2768  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcagcttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2668  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2667 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtg 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4973785 - 4973556
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4973785 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattatgttacgtgtgacgcttgatc 4973686  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973685 aaggaactctgatcctaacaagtttcaccccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 4973586  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4973585 aatgatatttggtgtcgaacggtttgtgat 4973556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22360186 - 22359963
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22360186 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22360087  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360086 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 22359987  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  22359986 aataatatttggtgtcgaacggtc 22359963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22314052 - 22313829
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22314052 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtacggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22313953  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22313952 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaataacaaattatcgtttaacttag 22313853  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22313852 aatgatatttggtgtcgaacggtc 22313829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5876440 - 5876218
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5876440 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 5876341  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876340 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 5876241  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggt 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  5876240 aatgatatttggtgttgaacggt 5876218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 34357288 - 34357511
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34357288 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34357387  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34357388 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34357487  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357488 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 34359079 - 34359302
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34359079 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34359178  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34359179 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34359278  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359279 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34359302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2958081 - 2957857
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2958081 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2957982  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2957981 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2957882  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2957881 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2957857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2966550 - 2966326
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2966550 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2966451  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2966450 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2966351  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2966350 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2966326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29980681 - 29980458
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29980681 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 29980582  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  29980581 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 29980482  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980481 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29980458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 30041244 - 30041467
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  30041244 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 30041343  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  30041344 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 30041443  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041444 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30041467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 40958617 - 40958840
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40958617 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgaggaatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 40958716  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  40958717 aaggaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaataaccaattatcttttaacttgg 40958816  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40958817 aatgatatttggtgtcgaacggtc 40958840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 25894649 - 25894873
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25894649 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcgatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 25894748  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  25894749 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 25894848  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  25894849 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 25894873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2439022 - 2438794
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2439022 tattgtttggacacaaatgatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgcatg-tcattaggttacgtgtgacgcttgatt 2438924  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  2438923 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcacttttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattttcttttaacttat 2438824  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  2438823 aatgatttttggtatcggacggtctgtgat 2438794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 12505765 - 12506002
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12505765 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagagaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgggactcttgatc 12505864  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta--tta------aaacaaacaacaaattatcgtt 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||      ||| |||||||||| |||| ||    
T  12505865 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttattattcgcaacatagttaacttagtttctaaataaacaacaaactatcttt 12505964  T
Q  197 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  12505965 taacttaaaatggtatttggtgtcgaaaggtccgtgat 12506002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42151039 - 42150817
Alignment:
Q  8 ttgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaa 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  42151039 ttgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgattaa 42150940  T
Q  108 ggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttaga 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  42150939 ggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttaga 42150840  T
Q  206 atgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  42150839 atgatatttggagtcgaacggtc 42150817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 29414669 - 29414892
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29414669 tattgtttgaacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 29414768  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||    ||   | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29414769 aagaaattctaatcctaataagttttacgccctattactctcgactttcaattttatatttgcttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaacttag 29414868  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  29414869 aatgatatttggtgttgaacggtc 29414892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33794309 - 33794085
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||| ||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  33794309 tttggatacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcagtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaa 33794210  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 207  Q
    |||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33794209 gaactctaattccaacattttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacatacaacaaattatc-tttaacttagaat 33794112  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33794111 gatatttggtgtcaaacggtccgtgat 33794085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9843566 - 9843348
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9843566 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 9843467  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 208  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9843466 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 9843368  T
Q  209 atatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9843367 atatttggtgtcgaacggtc 9843348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 2156125 - 2156341
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  2156125 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacactagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 2156224  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaat 207  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2156225 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaactttcacttttacacttggttactaaaaca---aacaaattatcttttaaacttagaat 2156320  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2156321 gatatttggtgtcgaacggtc 2156341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 117
Target Start/End: Original strand, 19853484 - 19853588
Alignment:
Q  15 gacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 112  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19853484 gacatgaatgatgttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaacgaac 19853583  T
Q  113 tctaa 117  Q
    |||||    
T  19853584 tctaa 19853588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 12918955 - 12919064
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  || | ||||| ||| || |||||||| | ||||    
T  12918955 tttggacacgaatagtcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtggttattaggttatgtttgacgcttaaccaag 12919054  T
Q  109 gaactctaat 118  Q
    ||||||||||    
T  12919055 gaactctaat 12919064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 30580195 - 30580304
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  30580195 tttggacacgaatgatgtcgtcgaccgatacgtgataatatcgataaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaac 30580294  T
Q  109 gaactctaat 118  Q
    ||||||||||    
T  30580295 gaactctaat 30580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 13671817 - 13672040
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671817 tattgtttggacactaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 13671916  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13671917 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgcattattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaataaacaacaaattatcgtttaacttat 13672016  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13672017 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13672040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27670316 - 27670096
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27670316 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgattattaggttacgtgtgacacttgatc 27670217  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670216 aaggaactctaatcctaacaagtttcacactttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 27670117  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacg 225  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27670116 aatgatatttggtgtcgaacg 27670096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31548117 - 31547894
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31548117 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 31548018  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  31548017 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaactaag 31547918  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31547917 aatgatatttggtgtcgaacggtc 31547894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 32328493 - 32328716
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  32328493 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttatatgtgacgctcgatc 32328592  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32328593 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 32328692  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  32328693 aatgatatctggtgtcgaacggtc 32328716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 1428423 - 1428646
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1428423 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1428522  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1428523 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1428622  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428623 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1428646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 34711557 - 34711780
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34711557 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34711656  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34711657 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34711756  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711757 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34711780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 9864760 - 9864984
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9864760 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 9864859  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9864860 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaactta 9864959  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  9864960 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 9864984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4186907 - 4186684
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4186907 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 4186808  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4186807 aaggaactctaatcctaacaagttctacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 4186708  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  4186707 aattatatttggtgtcgaacggtc 4186684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 11058150 - 11058373
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11058150 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 11058249  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  11058250 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 11058349  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058350 aatgatatttggtgtcgaacggtc 11058373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 21262574 - 21262795
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21262574 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 21262673  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21262674 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 21262773  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262774 gaatgatatttggtgtcgaacg 21262795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 4020235 - 4020459
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4020235 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4020334  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4020335 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4020434  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4020435 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4020459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 4026661 - 4026885
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4026661 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4026760  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4026761 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4026860  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4026861 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4026885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34655473 - 34655249
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34655473 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34655374  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34655373 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34655274  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34655273 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34655249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34649022 - 34648798
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34649022 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34648923  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | || || ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34648922 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagatactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34648823  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34648822 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34648798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 4738323 - 4738547
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4738323 tattgtttggactcgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4738422  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4738423 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4738522  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4738523 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4738547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 7069702 - 7069916
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7069702 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 7069801  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  7069802 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 7069901  T
Q  204 gaatgatatttggtg 218  Q
    ||||| |||||||||    
T  7069902 gaatggtatttggtg 7069916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29907045 - 29906883
Alignment:
Q  73 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 171  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  29907045 gtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 29906946  T
Q  172 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29906945 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtctgtgat 29906883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Original strand, 30117335 - 30117497
Alignment:
Q  73 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 171  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  30117335 gtatggtccttaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 30117434  T
Q  172 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30117435 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtctgtgat 30117497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Original strand, 7062578 - 7062707
Alignment:
Q  101 tgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  7062578 tgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttta 7062677  T
Q  199 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7062678 acttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 7062707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 1167538 - 1167630
Alignment:
Q  57 aaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 149  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167538 aaaaactagaatccgtatatgatcatcaggttatgtgtgacgcttgatcaaagaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaa 1167630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Original strand, 10081567 - 10081762
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| |||| |||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10081567 tttggacacgaataatcttgttgagcgatatgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10081666  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10081667 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaaattttactcttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Original strand, 7062516 - 7062578
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7062516 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16405568 - 16405335
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatat----caaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16405568 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacattataatatatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctt 16405469  T
Q  102 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405468 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 16405369  T
Q  201 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16405368 ttagaacgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 16405335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 55462772 - 55462995
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55462772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 55462871  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  55462872 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 55462971  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  55462972 aatgatatttggtgtcgaacggtc 55462995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 16838359 - 16838581
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16838359 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 16838458  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16838459 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 16838557  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16838558 aatgatatttggtgtctaacggtc 16838581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27590527 - 27590304
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27590527 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27590428  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  27590427 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 27590328  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  27590327 aatggtatttggtgtcgaacggtc 27590304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41373209 - 41372983
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41373209 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41373110  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41373109 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaactta 41373010  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41373009 gaatgataattggtgtcgaacggtctg 41372983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 37368315 - 37368538
Alignment:
Q  7 attgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatca 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37368315 attgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatca 37368414  T
Q  107 aggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttag 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |    
T  37368415 aggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttgg 37368514  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  37368515 aatggtatttggtgtcgaacggtc 37368538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13594330 - 13594105
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13594330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 13594231  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  13594230 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 13594131  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594130 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 13594105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7780629 - 7780406
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7780629 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 7780530  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7780529 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttatcatttgcaatttcgttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaactta 7780431  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  7780430 gaatgatatttagtgtcgaacggtc 7780406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8104104 - 8103880
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8104104 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 8104005  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  8104004 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 8103905  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8103904 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8103880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30238482 - 30238259
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30238482 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggataaatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 30238383  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  30238382 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 30238283  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30238282 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30238259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17457077 - 17456853
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17457077 tattgtttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 17456978  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  17456977 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttgtcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 17456878  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  17456877 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 17456853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 30211536 - 30211757
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||     
T  30211536 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaagttatgtgtgacgcttgatt 30211635  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        
T  30211636 aaggaactctaatcataacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaac---- 30211731  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
        ||||||||||||||||||||||||||    
T  30211732 ----atatttggtgtcgaacggtctgtgat 30211757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 36754791 - 36755017
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||     
T  36754791 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggtaatgtgtgacgcttgatt 36754890  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 196  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  36754891 aaggaacttcaatcctaataagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaatatagttaacttagttactaaaacaaacaacaaactatcttt 36754990  T
Q  197 taacttagaatgatatttggtgtcgaa 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36754991 taatttagaatgatatttggtgtcgaa 36755017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 5660549 - 5660696
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5660549 tattatttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgattatatcaaagaaaagttagaatccgtatatgatcattaggttacatgtgatgcttgatc 5660648  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5660649 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 5660696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Original strand, 13003812 - 13004016
Alignment:
Q  32 tgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||   ||    
T  13003812 tgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgtttt 13003911  T
Q  130 tcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13003912 t-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaacagtc 13004010  T
Q  229 tgtgat 234  Q
    ||||||    
T  13004011 tgtgat 13004016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2948062 - 2947844
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  2948062 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 2947963  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 208  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  2947962 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 2947864  T
Q  209 atatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2947863 atatttggtgtcgaacggtc 2947844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48914996 - 48914898
Alignment:
Q  132 acgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48914996 acgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 48914898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 234
Target Start/End: Original strand, 5660743 - 5660781
Alignment:
Q  196 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5660743 ttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 5660781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 21341882 - 21342105
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21341882 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21341981  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21341982 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagtcattaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 21342081  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21342082 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 2021448 - 2021668
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2021448 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 2021547  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021548 aaggaactctaatcctaacaagttttacaccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2021647  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacg 225  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2021648 aatgatatttggtgtcgaacg 2021668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 21331994 - 21332217
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21331994 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21332093  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  21332094 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgaaatttagtcattaaaacaaacaaccaactatcttttaacttag 21332193  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21332194 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21332217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 42931372 - 42931595
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42931372 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacatttgatc 42931471  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  42931472 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatctgttaacttgg 42931571  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42931572 aatgatatttggtgtcgaacggtc 42931595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12951018 - 12950789
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12951018 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 12950919  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  12950918 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 12950819  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12950818 aatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 12950789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 16856487 - 16856709
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16856487 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16856586  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16856587 aagaaactctaatcctaacaagtnttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16856685  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16856686 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16856709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 16817330 - 16817552
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16817330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16817429  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16817430 aagaaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16817528  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16817529 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16817552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 36782184 - 36782408
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36782184 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36782283  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36782284 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36782383  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36782384 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36782408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 34834812 - 34835035
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34834812 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34834911  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34834912 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34835011  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34835012 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34835035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 34841256 - 34841479
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34841256 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34841355  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34841356 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34841455  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841456 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34841479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29485149 - 29484925
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29485149 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 29485050  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  29485049 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 29484950  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  29484949 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 29484925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45012205 - 45011981
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45012205 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 45012106  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  45012105 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 45012006  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  45012005 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 45011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2164250 - 2164025
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2164250 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2164151  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2164150 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2164051  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2164050 aatgatatttggtgtcgaacggtctg 2164025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15852772 - 15852548
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15852772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttaagtgtgacgcttgatc 15852673  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  15852672 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 15852573  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15852572 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 15852548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43268081 - 43267857
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  43268081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 43267982  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  43267981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttg 43267882  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  43267881 aaatgataattggtgtcgaacggtc 43267857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2157834 - 2157611
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2157834 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2157735  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2157734 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2157635  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157634 aatgatatttggtgtcgaacggtc 2157611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 13901957 - 13902180
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13901957 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 13902056  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  13902057 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 13902156  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13902157 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 21067958 - 21068181
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||    
T  21067958 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgatgcctgctc 21068057  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21068058 aaggaactctaatcctaa-aagtttcacaccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaatacaaacaaacaaattatcttttaactta 21068156  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21068157 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 21068181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 45700644 - 45700793
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  45700644 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccaggtatgatcattaggttatgtgtgacgtttgatc 45700743  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45700744 aaggaactctaattctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 45700793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41455823 - 41455599
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| | | |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41455823 tttggacacgaataatcttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacggtggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 41455724  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 208  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41455723 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaatg 41455625  T
Q  209 atatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41455624 atatttggtgtcgaacggtctgtgat 41455599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Original strand, 11909981 - 11910116
Alignment:
Q  37 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga--tcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacg 134  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||   ||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11909981 gatacgtgataatatagattaaaagctagaatccgtatatgtggtcattggattatatgggatgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagttttacg 11910080  T
Q  135 ccttattaatctcaactttatcattgcaacttagtt 170  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||    
T  11910081 ccttattaatctcacttttattcttgcaaattagtt 11910116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 17784443 - 17784604
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  17784443 tttggacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 17784542  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 170  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17784543 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13163032 - 13162892
Alignment:
Q  15 gacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 112  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||  |||||||  |||  || ||  |||| |||| ||||    
T  13163032 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatattgattaaaagctagaatctgtatatgtgatcattatgttatatgcgattcttggtcaatgaac 13162933  T
Q  113 tctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 153  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13162932 tctaatcctaacaagttttacgccttattactctcaacttt 13162892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 17789096 - 17789257
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  17789096 tttggacaggaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaatcaag 17789195  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 170  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17789196 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17789257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 234
Target Start/End: Original strand, 45700843 - 45700879
Alignment:
Q  198 aacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45700843 aacttataatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 45700879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12768966 - 12768737
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12768966 tattgtttggacacgaatggtcttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtataatcattaggttacgtgtgaagcttgatc 12768867  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12768866 aaagaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcaatttagttattaaaacaaacaacgaattatcatttaacttag 12768767  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12768766 aatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 12768737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 8013320 - 8013549
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8013320 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8013419  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8013420 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8013519  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8013520 aatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 8013549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 11358193 - 11358417
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11358193 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 11358292  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  11358293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 11358392  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  11358393 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 11358417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7311571 - 7311348
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7311571 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 7311472  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  7311471 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 7311372  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311371 aatgatatttggtgtcgaacggtc 7311348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 36005482 - 36005705
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36005482 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36005581  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  36005582 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 36005681  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005682 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36005705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36076189 - 36075964
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36076189 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36076090  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||      
T  36076089 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactattgtttaacttga 36075990  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36075989 aatgatatttggtgtcgaacggtctg 36075964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 36425730 - 36425954
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36425730 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 36425829  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36425830 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36425929  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36425930 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36425954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 6464576 - 6464799
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6464576 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6464675  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6464676 aaggaactctaatcctaacgagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6464775  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464776 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6464799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15012610 - 15012393
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||     
T  15012610 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatagtcattaggttccgtgtgacgcttgatt 15012511  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15012510 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccctattactctcaacttttactcttgcaacttagtaactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 15012411  T
Q  205 aatgatatttggtgtcga 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012410 aatgatatttggtgtcga 15012393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 36021799 - 36022023
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36021799 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36021898  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  36021899 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 36021998  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  36021999 aaatgataattggtgtcgaacggtc 36022023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 41242116 - 41242339
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41242116 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41242215  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||      
T  41242216 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcatttaacttga 41242315  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  41242316 aaagatatttggtgtcaaacggtc 41242339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1238436 - 1238206
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||    
T  1238436 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatcaggttatttgtgacgcttgatc 1238337  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattg-caacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1238336 aaggaactctaatcctaacaagttttacgctctattactctcaacttttactttttcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattattttttaactta 1238237  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1238236 gaatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 1238206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 16710668 - 16710892
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16710668 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 16710767  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| || ||||||    
T  16710768 aaggaactctaatcctaacaagttttatgccctattgctctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacatactatctttcaactta 16710867  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  16710868 gaatgatatttggagtcgaacggtc 16710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31017608 - 31017392
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatg--tatgatcattagattacgtgtgacgcttga 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31017608 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaattagaatccatgtatatggtcattaggttacatgtgacgcttga 31017509  T
Q  104 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 203  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||              ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31017508 ttaaagaactctaatcctaactagtttcacgccttattattc--------------gcaactttgttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactta 31017423  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31017422 aaatgatatttggtgtcgaacggtctatgat 31017392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 149
Target Start/End: Original strand, 26250591 - 26250734
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  26250591 tattgtttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctataaaccatgtatggttattagattacgtgtgacgcttgatt 26250690  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 149  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26250691 aaggaactctaatcctaacaaatttcacgccttattaatctcaa 26250734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Original strand, 45068416 - 45068609
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  45068416 tattgttcggacacgaatggtgttatcgagggttacatgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttacgtgcgacgcttgatt 45068515  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttta 198  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45068516 aaagaactctaatcctaacaaattttacgttttattactctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatctttta 45068609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 7933931 - 7934150
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  7933931 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 7934030  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaat 207  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| |||||||||| |  || |||||||||| ||||||||    
T  7934031 gaactctaattccaa-tgtttttacgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaaccatcaactatcgtttaaccttagaat 7934129  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7934130 gatatttggtgtcgaacggtc 7934150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14393786 - 14393727
Alignment:
Q  175 aaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14393786 aaacaaacaaccaatcaacctttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 14393727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49912 - 49684
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  49912 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccgtgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatg 49813  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49812 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 49714  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49713 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 49684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 10941304 - 10941533
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10941304 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatatatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 10941403  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10941404 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10941503  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10941504 aattatattaggtgtcaaacggtctgtgat 10941533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 4311486 - 4311709
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  4311486 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgattgatc 4311585  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4311586 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttag 4311685  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  4311686 aatgatatttggtgttgaacggtc 4311709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32746592 - 32746369
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32746592 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 32746493  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  32746492 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 32746393  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32746392 aatgatatttggtgtcgaacggtc 32746369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6036488 - 6036265
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6036488 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgagtgacgcttgatc 6036389  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  6036388 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcattttcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 6036289  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  6036288 aattatatttggtgtcaaacggtc 6036265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24179296 - 24179072
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24179296 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 24179197  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  24179196 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 24179097  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24179096 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 24179072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Original strand, 9570548 - 9570775
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9570548 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9570647  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 202  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9570648 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9570747  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9570748 agaatgataattggtgtcgaacggtctg 9570775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 27501967 - 27502191
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27501967 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27502066  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  27502067 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 27502166  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  27502167 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 27502191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Original strand, 9577050 - 9577277
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9577050 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9577149  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 202  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9577150 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9577249  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9577250 agaataataattggtgtcgaacggtctg 9577277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13015208 - 13014985
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13015208 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 13015109  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  13015108 aagaaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 13015009  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13015008 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13014985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43995300 - 43995062
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaa-gaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43995300 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtaataatatcaaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttggt 43995201  T
Q  105 caaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt---------gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgt 195  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  43995200 taaggaactctaatcctgacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagtcaacttagtttctaaaacaaacaacaaactatctt 43995101  T
Q  196 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  43995100 ttaacttagaatgatatttgatgtcgaatggtccgtgat 43995062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25893458 - 25893229
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25893458 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 25893359  T
Q  106 aagg-----aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 198  Q
    ||||     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  25893358 aaggaatttaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattaacttttta 25893259  T
Q  199 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25893258 acttagaatggtatttggtgtcgaacggtc 25893229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43931799 - 43931575
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgt--gtgacgcttga 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43931799 tattgtttgaacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataa-------gaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtatgtgacgcttga 43931707  T
Q  104 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 202  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43931706 ttaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattatccgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactt 43931607  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  43931606 agaatggtatttggtgtcggacggtccgtgat 43931575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23068686 - 23068461
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  23068686 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaag-tagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgatgctcgatc 23068588  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 202  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23068587 aaagaactctaatcctaacaagtttc-cgccctattaatttcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 23068489  T
Q  203 agaatgatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23068488 agaatgatatttggtgacgaacggtctg 23068461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41353987 - 41353860
Alignment:
Q  102 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41353987 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgtcctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 41353888  T
Q  201 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41353887 ttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 41353860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Original strand, 20651153 - 20651272
Alignment:
Q  34 agggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcac 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20651153 agggatacgtgataatatcaaagaaaaggtagaatccgtatatgatcattaaattacgtgtgatgcttgatcaaggaactctaatcctaacgagtttcac 20651252  T
Q  134 gccttattaatctcaacttt 153  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20651253 gccttattaatctcaacttt 20651272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 41354142 - 41354293
Alignment:
Q  78 atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaa 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||    
T  41354142 atcattaggttacgtgtgacgcttgctcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaa 41354241  T
Q  177 acaaac-aacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354242 acaaacaaacaaattat-tttcaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 41354293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 3577095 - 3577162
Alignment:
Q  162 aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3577095 aacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttagaataatatttggtgtcgaacggtct 3577162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4591012 - 4590791
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  4591012 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 4590913  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaat 207  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||   | || |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  4590912 gaactctaattccaacgttttt-acgccctattactctcaactttaacttttatatttggttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttggaat 4590814  T
Q  208 gatatttggtgtcgaacggtctg 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  4590813 gataattggtgtcgaacggtctg 4590791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 20952759 - 20952992
Alignment:
Q  11 tttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 108  Q
    |||||||| ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    ||  |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  20952759 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaagcgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 20952858  T
Q  109 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt-atcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaacaacaaatta-tcgtttaa 199  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||  |||     ||| ||||||  ||||| || |||||    
T  20952859 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttattcttgcaaattagttaacttagttgcaaagaaacaaacaattactcttttaa 20952957  T
Q  200 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20952958 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 20952992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15393 - 15164
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  15393 tattgtttggacacgaacggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctggaat 15294  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttactattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaagttag 15194  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15193 aatgatattttgtgtcgaaaggtctgtgat 15164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 5005 - 5228
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5005 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5104  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  5105 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 5204  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3492
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  3264 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtaattaggttaagtgtgaagcttgatc 3363  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3364 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 3462  T
Q  205 aatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  3463 aatgatatttagtgtcgaatggtccgtgat 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 8881 - 9105
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  8881 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 8980  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  8981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 9080  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  9081 gaatgatatttggagtcgaacggtc 9105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2790
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  2560 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 2659  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2660 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 2759  T
Q  204 gaatgatatttggtgtcgaacggtctgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2760 gaatgatatttggtgtcgaacggtccgtgat 2790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12155 - 12014
Alignment:
Q  6 tattgtttggacacgaatggtgttggtgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12155 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatttatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 12056  T
Q  106 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12055 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctc 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12014 - 11949
Alignment:
Q  164 cttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12014 cttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttagaatgatatttggagtcgaacggtc 11949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 100020 - 99913
Alignment:
Q  122 aacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100020 aacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 99921  T
Q  221 gaacggtc 228  Q
    ||||||||    
T  99920 gaacggtc 99913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Original strand, 24271 - 24475
Alignment:
Q  32 tgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||   ||    
T  24271 tgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgtttt 24370  T
Q  130 tcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24371 t-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaacagtc 24469  T
Q  229 tgtgat 234  Q
    ||||||    
T  24470 tgtgat 24475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University