View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4808_high_7 (Length: 355)

Name: NF4808_high_7
Description: NF4808
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4808_high_7
NF4808_high_7
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (130-351)||(15231111-15231332)
chr4 (130-343)||(15281746-15281959)
chr4 (130-344)||(1903500-1903714)
chr4 (130-351)||(14668255-14668476)
chr4 (130-351)||(5009114-5009335)
chr4 (130-351)||(6573097-6573318)
chr4 (130-351)||(14760115-14760336)
chr4 (130-351)||(17016285-17016506)
chr4 (130-351)||(18313987-18314208)
chr4 (130-346)||(34185769-34185985)
chr4 (130-351)||(24589170-24589391)
chr4 (130-351)||(36341326-36341547)
chr4 (130-351)||(54836630-54836851)
chr4 (130-351)||(20335230-20335451)
chr4 (130-351)||(24115901-24116122)
chr4 (130-351)||(27160126-27160347)
chr4 (132-351)||(40102448-40102667)
chr4 (130-351)||(30756999-30757220)
chr4 (130-351)||(33670609-33670830)
chr4 (132-351)||(14101782-14102001)
chr4 (132-351)||(18797425-18797644)
chr4 (130-351)||(31123321-31123542)
chr4 (130-346)||(21972945-21973161)
chr4 (130-351)||(39853876-39854097)
chr4 (132-349)||(15388189-15388406)
chr4 (4-132)||(15281376-15281504)
chr4 (1-128)||(1903960-1904087)
chr4 (1-132)||(30757462-30757593)
chr4 (1-128)||(54837097-54837224)
chr4 (1-128)||(15231578-15231705)
chr4 (1-128)||(24116368-24116495)
chr4 (1-128)||(34185396-34185523)
chr4 (1-128)||(5009581-5009708)
chr4 (1-128)||(5698241-5698368)
chr4 (1-128)||(6573564-6573691)
chr4 (1-128)||(17016752-17016879)
chr4 (1-132)||(33670236-33670367)
chr4 (1-128)||(40102073-40102200)
chr4 (1-128)||(14102249-14102376)
chr4 (1-128)||(14668722-14668849)
chr4 (1-128)||(18797050-18797177)
chr4 (1-128)||(20334857-20334984)
chr4 (1-128)||(24588797-24588924)
chr4 (1-128)||(27159753-27159880)
chr4 (1-116)||(36340953-36341068)
chr4 (21-128)||(14759762-14759869)
chr4 (1-128)||(18313614-18313741)
chr4 (1-128)||(21973407-21973534)
chr4 (1-128)||(31122948-31123075)
chr4 (1-132)||(39854339-39854470)
chr4 (25-128)||(15384808-15384911)
chr4 (202-257)||(24459636-24459691)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (130-343)||(10844851-10845064)
chr7 (130-351)||(2157797-2158018)
chr7 (130-343)||(10842688-10842901)
chr7 (130-351)||(10913563-10913784)
chr7 (130-351)||(22145418-22145639)
chr7 (130-343)||(16446700-16446913)
chr7 (130-351)||(26534567-26534788)
chr7 (135-343)||(16044550-16044758)
chr7 (130-351)||(2106857-2107078)
chr7 (130-351)||(5131219-5131440)
chr7 (130-351)||(5144034-5144255)
chr7 (130-343)||(16515124-16515337)
chr7 (130-351)||(26516015-26516236)
chr7 (130-351)||(11421473-11421694)
chr7 (130-351)||(26271780-26272001)
chr7 (130-351)||(26316542-26316763)
chr7 (132-351)||(26438480-26438699)
chr7 (132-351)||(11444110-11444329)
chr7 (130-351)||(4141940-4142161)
chr7 (130-351)||(4202612-4202833)
chr7 (130-351)||(45390443-45390664)
chr7 (132-351)||(3448529-3448748)
chr7 (130-337)||(16748211-16748418)
chr7 (130-351)||(26666608-26666829)
chr7 (130-351)||(31561084-31561305)
chr7 (130-351)||(24589228-24589449)
chr7 (1-132)||(10842315-10842446)
chr7 (1-132)||(10845306-10845437)
chr7 (196-351)||(9621873-9622028)
chr7 (1-128)||(2776944-2777071)
chr7 (1-132)||(11444573-11444704)
chr7 (1-128)||(16045005-16045132)
chr7 (1-128)||(16747838-16747965)
chr7 (1-128)||(2106484-2106611)
chr7 (1-128)||(10913190-10913317)
chr7 (1-128)||(16514751-16514878)
chr7 (1-128)||(31127597-31127724)
chr7 (1-128)||(2158264-2158391)
chr7 (1-132)||(3448992-3449123)
chr7 (1-128)||(5131686-5131813)
chr7 (1-128)||(26316169-26316296)
chr7 (1-128)||(26534194-26534321)
chr7 (1-128)||(26681427-26681554)
chr7 (1-128)||(31086943-31087070)
chr7 (1-128)||(45734997-45735124)
chr7 (130-238)||(2776590-2776698)
chr7 (130-238)||(26512390-26512498)
chr7 (130-238)||(26681800-26681908)
chr7 (130-238)||(31127243-31127351)
chr7 (130-238)||(39209833-39209941)
chr7 (1-128)||(4203079-4203206)
chr7 (1-116)||(5143661-5143776)
chr7 (1-128)||(5162073-5162200)
chr7 (1-128)||(11421100-11421227)
chr7 (1-128)||(26512017-26512144)
chr7 (1-128)||(39209460-39209587)
chr7 (130-238)||(31087316-31087424)
chr7 (1-128)||(22145885-22146012)
chr7 (1-128)||(26271407-26271534)
chr7 (1-128)||(45390910-45391037)
chr7 (130-238)||(45734649-45734757)
chr7 (1-128)||(4141567-4141694)
chr7 (1-128)||(24588855-24588982)
chr7 (1-116)||(26438959-26439074)
chr7 (1-128)||(26666235-26666362)
chr7 (1-128)||(16446327-16446454)
chr7 (1-116)||(26516494-26516609)
chr7 (1-116)||(31560711-31560826)
chr7 (250-351)||(16287193-16287294)
chr7 (242-342)||(1893381-1893481)
chr7 (242-304)||(9469590-9469652)
chr7 (242-304)||(16393240-16393302)
chr7 (242-304)||(30369752-30369814)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (130-343)||(16621342-16621555)
chr3 (130-351)||(18333817-18334038)
chr3 (130-344)||(4793487-4793701)
chr3 (130-343)||(8286322-8286535)
chr3 (130-351)||(8299158-8299379)
chr3 (130-351)||(21677890-21678111)
chr3 (130-351)||(35883953-35884174)
chr3 (130-341)||(19697687-19697898)
chr3 (130-351)||(15737946-15738167)
chr3 (130-351)||(15889557-15889778)
chr3 (130-351)||(18054449-18054670)
chr3 (130-351)||(18273904-18274125)
chr3 (130-351)||(18289205-18289426)
chr3 (130-351)||(18304506-18304727)
chr3 (130-351)||(22384430-22384651)
chr3 (130-351)||(29145608-29145829)
chr3 (130-351)||(29661822-29662043)
chr3 (132-351)||(6205090-6205309)
chr3 (132-351)||(4686842-4687061)
chr3 (132-351)||(4724818-4725037)
chr3 (130-351)||(10399331-10399552)
chr3 (130-351)||(20069227-20069448)
chr3 (132-351)||(5593211-5593430)
chr3 (130-351)||(7076393-7076614)
chr3 (130-351)||(28112806-28113027)
chr3 (130-351)||(32442338-32442559)
chr3 (130-351)||(28024469-28024690)
chr3 (130-351)||(47026640-47026861)
chr3 (132-351)||(48469114-48469333)
chr3 (130-351)||(5470175-5470396)
chr3 (130-351)||(5606166-5606387)
chr3 (130-351)||(8214922-8215143)
chr3 (130-351)||(28342364-28342585)
chr3 (130-351)||(4343528-4343749)
chr3 (130-351)||(6539594-6539815)
chr3 (130-351)||(20573695-20573916)
chr3 (130-351)||(4420102-4420323)
chr3 (130-351)||(7999747-7999968)
chr3 (130-351)||(10646260-10646481)
chr3 (130-351)||(22867700-22867921)
chr3 (130-351)||(22882759-22882980)
chr3 (130-351)||(24331350-24331571)
chr3 (152-346)||(11107226-11107420)
chr3 (130-351)||(17981801-17982022)
chr3 (130-351)||(18228383-18228604)
chr3 (130-351)||(18245928-18246149)
chr3 (130-351)||(31961307-31961528)
chr3 (130-351)||(51785210-51785431)
chr3 (130-346)||(5016906-5017122)
chr3 (1-132)||(16620969-16621100)
chr3 (1-128)||(11106838-11106965)
chr3 (130-238)||(5714373-5714481)
chr3 (130-238)||(5725283-5725391)
chr3 (130-238)||(5766977-5767085)
chr3 (1-128)||(4793114-4793241)
chr3 (1-128)||(19698144-19698271)
chr3 (1-128)||(31032715-31032842)
chr3 (1-132)||(51785673-51785804)
chr3 (130-238)||(4627085-4627193)
chr3 (130-238)||(17992783-17992891)
chr3 (1-128)||(4627439-4627566)
chr3 (1-128)||(4725285-4725412)
chr3 (1-128)||(8215389-8215516)
chr3 (1-128)||(8285949-8286076)
chr3 (1-128)||(8299625-8299752)
chr3 (1-128)||(15737573-15737700)
chr3 (1-128)||(15889184-15889311)
chr3 (1-128)||(18054916-18055043)
chr3 (1-128)||(18304133-18304260)
chr3 (1-128)||(18334284-18334411)
chr3 (1-128)||(21678357-21678484)
chr3 (1-128)||(22384057-22384184)
chr3 (1-128)||(28112433-28112560)
chr3 (1-121)||(17973340-17973460)
chr3 (130-238)||(32293928-32294036)
chr3 (1-128)||(4687309-4687436)
chr3 (1-128)||(5653739-5653866)
chr3 (1-128)||(6205557-6205684)
chr3 (1-128)||(7076860-7076987)
chr3 (1-128)||(17981428-17981555)
chr3 (1-128)||(18273531-18273658)
chr3 (1-128)||(18288832-18288959)
chr3 (1-128)||(32294282-32294409)
chr3 (1-128)||(32442805-32442932)
chr3 (1-128)||(35884420-35884547)
chr3 (130-238)||(31033088-31033196)
chr3 (1-116)||(4420581-4420696)
chr3 (1-128)||(5017368-5017495)
chr3 (1-128)||(10399798-10399925)
chr3 (1-128)||(20069694-20069821)
chr3 (1-116)||(24331829-24331944)
chr3 (1-128)||(29145235-29145362)
chr3 (1-128)||(5592836-5592963)
chr3 (1-128)||(5714727-5714854)
chr3 (1-128)||(5725637-5725764)
chr3 (1-128)||(5766604-5766731)
chr3 (1-128)||(18228850-18228977)
chr3 (1-128)||(47027107-47027234)
chr3 (1-128)||(4343155-4343282)
chr3 (1-116)||(5470654-5470769)
chr3 (1-128)||(5605793-5605920)
chr3 (1-116)||(28024948-28025063)
chr3 (1-116)||(48469593-48469708)
chr3 (1-116)||(6539221-6539336)
chr3 (1-116)||(18246407-18246522)
chr3 (1-116)||(20573322-20573437)
chr3 (1-116)||(22867327-22867442)
chr3 (1-116)||(22882386-22882501)
chr3 (1-116)||(28342843-28342958)
chr3 (1-116)||(29661449-29661564)
chr3 (1-116)||(8000226-8000341)
chr3 (1-116)||(10646739-10646854)
chr3 (1-116)||(31960934-31961049)
chr3 (242-334)||(15918721-15918813)
chr3 (249-334)||(15592882-15592967)
chr3 (249-334)||(20443321-20443406)
chr3 (249-334)||(41440447-41440532)
chr3 (242-304)||(5950766-5950828)
chr3 (273-342)||(6571550-6571619)
chr3 (242-342)||(4446631-4446731)
[»] scaffold0143 (6 HSPs)
scaffold0143 (130-343)||(19304-19517)
scaffold0143 (130-351)||(30519-30740)
scaffold0143 (1-132)||(19759-19890)
scaffold0143 (1-128)||(30986-31113)
scaffold0143 (1-128)||(7653-7780)
scaffold0143 (130-238)||(7299-7407)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (130-343)||(19453221-19453434)
chr2 (130-343)||(21699969-21700181)
chr2 (130-351)||(34294379-34294600)
chr2 (130-351)||(11631982-11632203)
chr2 (130-351)||(13933345-13933566)
chr2 (130-351)||(37380902-37381123)
chr2 (130-346)||(12658766-12658982)
chr2 (130-351)||(20841138-20841359)
chr2 (130-351)||(23125366-23125587)
chr2 (130-343)||(27431239-27431452)
chr2 (130-351)||(39048617-39048838)
chr2 (132-351)||(28885432-28885651)
chr2 (130-351)||(12590033-12590254)
chr2 (130-351)||(37948660-37948881)
chr2 (130-351)||(39893294-39893515)
chr2 (130-351)||(27806928-27807149)
chr2 (130-351)||(9346784-9347005)
chr2 (130-351)||(40236733-40236954)
chr2 (132-351)||(257453-257672)
chr2 (130-351)||(19413299-19413520)
chr2 (130-351)||(37682693-37682914)
chr2 (130-351)||(37697958-37698179)
chr2 (130-351)||(37928594-37928815)
chr2 (130-346)||(16826136-16826352)
chr2 (130-346)||(16895128-16895344)
chr2 (130-346)||(32053033-32053249)
chr2 (130-351)||(21673973-21674194)
chr2 (130-351)||(34864909-34865130)
chr2 (130-351)||(12713399-12713620)
chr2 (130-346)||(31879516-31879732)
chr2 (132-349)||(27394789-27395006)
chr2 (1-132)||(19452848-19452979)
chr2 (1-128)||(21699596-21699723)
chr2 (1-128)||(3786185-3786312)
chr2 (1-128)||(13932972-13933099)
chr2 (1-128)||(20841605-20841732)
chr2 (1-128)||(34271345-34271472)
chr2 (1-128)||(34294846-34294973)
chr2 (1-128)||(40237200-40237327)
chr2 (1-128)||(11631609-11631736)
chr2 (1-128)||(12659228-12659355)
chr2 (1-128)||(22924573-22924700)
chr2 (1-128)||(27120216-27120343)
chr2 (130-238)||(16164818-16164926)
chr2 (130-238)||(22924946-22925054)
chr2 (130-238)||(27779572-27779680)
chr2 (130-238)||(27819329-27819437)
chr2 (1-128)||(21673600-21673727)
chr2 (1-128)||(27430866-27430993)
chr2 (1-128)||(27779926-27780053)
chr2 (1-116)||(27807407-27807522)
chr2 (1-128)||(27819683-27819810)
chr2 (1-128)||(28885971-28886098)
chr2 (131-238)||(34158182-34158289)
chr2 (1-128)||(34158536-34158663)
chr2 (130-238)||(3785831-3785939)
chr2 (130-238)||(27119862-27119970)
chr2 (130-238)||(31890289-31890397)
chr2 (1-116)||(257078-257193)
chr2 (1-116)||(12590512-12590627)
chr2 (1-128)||(23124994-23125120)
chr2 (1-128)||(31879978-31880105)
chr2 (1-128)||(31889916-31890043)
chr2 (1-128)||(37682320-37682447)
chr2 (1-128)||(37697585-37697712)
chr2 (1-128)||(39048244-39048371)
chr2 (1-116)||(9346411-9346526)
chr2 (1-128)||(16825763-16825890)
chr2 (1-128)||(16895590-16895717)
chr2 (1-116)||(37381381-37381496)
chr2 (1-128)||(37929061-37929188)
chr2 (1-116)||(39893773-39893888)
chr2 (1-132)||(12713026-12713157)
chr2 (1-128)||(19412926-19413053)
chr2 (1-128)||(27395254-27395381)
chr2 (1-128)||(32053495-32053622)
chr2 (1-116)||(34865388-34865503)
chr2 (13-116)||(37948299-37948402)
chr2 (1-116)||(16165184-16165299)
chr2 (130-195)||(27827841-27827906)
chr2 (242-330)||(12383906-12383994)
chr2 (242-304)||(22949665-22949727)
chr2 (249-334)||(21760532-21760617)
chr2 (242-342)||(34534353-34534453)
[»] chr5 (108 HSPs)
chr5 (130-340)||(22891707-22891917)
chr5 (130-343)||(25203519-25203732)
chr5 (130-343)||(25267674-25267887)
chr5 (130-343)||(23895447-23895660)
chr5 (130-351)||(11552588-11552809)
chr5 (130-351)||(33295761-33295982)
chr5 (130-351)||(33780722-33780943)
chr5 (130-351)||(15655464-15655685)
chr5 (130-351)||(22995823-22996044)
chr5 (130-351)||(23629203-23629424)
chr5 (130-351)||(24684851-24685072)
chr5 (130-351)||(30937868-30938089)
chr5 (130-351)||(41677938-41678159)
chr5 (130-351)||(18497431-18497652)
chr5 (130-351)||(24973139-24973360)
chr5 (130-351)||(9320709-9320930)
chr5 (130-351)||(12135408-12135629)
chr5 (130-351)||(26483627-26483848)
chr5 (130-351)||(43081488-43081709)
chr5 (130-351)||(28652475-28652696)
chr5 (130-351)||(3792774-3792995)
chr5 (130-351)||(34619751-34619972)
chr5 (130-351)||(31434697-31434918)
chr5 (130-351)||(32592980-32593201)
chr5 (130-351)||(37355349-37355570)
chr5 (132-351)||(18372242-18372461)
chr5 (132-351)||(30171702-30171921)
chr5 (130-351)||(8662181-8662402)
chr5 (130-351)||(30032661-30032882)
chr5 (130-351)||(30155264-30155485)
chr5 (130-351)||(33519613-33519834)
chr5 (130-351)||(37668192-37668413)
chr5 (130-351)||(37758216-37758437)
chr5 (130-351)||(2514295-2514516)
chr5 (130-351)||(15755558-15755779)
chr5 (130-351)||(24586607-24586828)
chr5 (130-351)||(28956491-28956712)
chr5 (130-351)||(31823113-31823334)
chr5 (130-351)||(37767697-37767918)
chr5 (130-351)||(40470256-40470477)
chr5 (130-351)||(5641021-5641242)
chr5 (130-351)||(13321536-13321757)
chr5 (130-351)||(24727202-24727423)
chr5 (132-351)||(6877538-6877757)
chr5 (1-128)||(25203978-25204105)
chr5 (1-128)||(25268133-25268260)
chr5 (130-257)||(13183499-13183626)
chr5 (1-132)||(24727665-24727796)
chr5 (1-128)||(11553055-11553182)
chr5 (1-128)||(23629670-23629797)
chr5 (1-128)||(24587074-24587201)
chr5 (1-132)||(6878001-6878132)
chr5 (1-128)||(9321176-9321303)
chr5 (1-128)||(9547042-9547169)
chr5 (1-128)||(22995450-22995577)
chr5 (1-128)||(24973606-24973733)
chr5 (1-128)||(26484094-26484221)
chr5 (1-128)||(30172169-30172296)
chr5 (1-128)||(30938335-30938462)
chr5 (1-128)||(33296228-33296355)
chr5 (1-128)||(33878830-33878957)
chr5 (1-116)||(40469883-40469998)
chr5 (130-235)||(13439389-13439494)
chr5 (130-238)||(18125122-18125230)
chr5 (1-132)||(2514758-2514889)
chr5 (1-128)||(3793241-3793368)
chr5 (1-128)||(12135875-12136002)
chr5 (1-128)||(13183126-13183253)
chr5 (1-128)||(13439016-13439143)
chr5 (1-128)||(18124749-18124876)
chr5 (1-128)||(18497058-18497185)
chr5 (1-128)||(37758683-37758810)
chr5 (1-128)||(41678405-41678532)
chr5 (130-238)||(9547415-9547523)
chr5 (130-238)||(11326983-11327091)
chr5 (130-238)||(29887903-29888011)
chr5 (1-128)||(8661808-8661935)
chr5 (1-116)||(11327349-11327464)
chr5 (1-128)||(15655091-15655218)
chr5 (1-128)||(18371867-18371994)
chr5 (1-128)||(28956118-28956245)
chr5 (1-128)||(30155731-30155858)
chr5 (1-128)||(33781189-33781312)
chr5 (4-128)||(22892163-22892287)
chr5 (130-238)||(33878477-33878584)
chr5 (1-128)||(5641488-5641615)
chr5 (1-128)||(29887530-29887657)
chr5 (1-128)||(31435164-31435291)
chr5 (1-116)||(32592607-32592722)
chr5 (1-128)||(33520080-33520207)
chr5 (1-116)||(34620230-34620345)
chr5 (1-128)||(37667819-37667946)
chr5 (1-128)||(37767324-37767451)
chr5 (1-116)||(28652954-28653069)
chr5 (1-132)||(31822740-31822871)
chr5 (1-116)||(43081967-43082082)
chr5 (1-121)||(30033135-30033255)
chr5 (1-116)||(15755185-15755300)
chr5 (1-116)||(37354976-37355091)
chr5 (1-116)||(13321163-13321278)
chr5 (162-304)||(15784463-15784605)
chr5 (250-351)||(34468855-34468956)
chr5 (242-330)||(36375780-36375868)
chr5 (242-330)||(37000434-37000522)
chr5 (242-304)||(5440043-5440105)
chr5 (242-304)||(11944240-11944302)
chr5 (242-304)||(17957376-17957438)
chr5 (242-322)||(31520569-31520649)
[»] scaffold0089 (4 HSPs)
scaffold0089 (130-343)||(3301-3514)
scaffold0089 (202-351)||(43872-44021)
scaffold0089 (1-128)||(3760-3887)
scaffold0089 (272-343)||(32096-32167)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (130-343)||(20464212-20464425)
chr1 (130-340)||(20339110-20339320)
chr1 (130-342)||(16204843-16205055)
chr1 (130-346)||(21894558-21894774)
chr1 (130-351)||(10965893-10966114)
chr1 (132-351)||(51641446-51641665)
chr1 (130-351)||(10948305-10948526)
chr1 (130-337)||(41790119-41790326)
chr1 (130-346)||(28588218-28588434)
chr1 (130-351)||(3644360-3644584)
chr1 (1-132)||(20464667-20464798)
chr1 (4-128)||(20336855-20336979)
chr1 (1-128)||(10966360-10966487)
chr1 (1-128)||(16204470-16204597)
chr1 (130-238)||(28153077-28153185)
chr1 (1-128)||(21894184-21894311)
chr1 (1-128)||(51641913-51642040)
chr1 (1-128)||(10948772-10948899)
chr1 (1-128)||(28153431-28153558)
chr1 (1-116)||(28588692-28588807)
chr1 (1-116)||(41789746-41789861)
chr1 (1-116)||(3644843-3644958)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (130-340)||(1433-1643)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (130-351)||(14560849-14561070)
chr8 (130-351)||(18793929-18794150)
chr8 (130-351)||(27605675-27605896)
chr8 (130-346)||(19691328-19691544)
chr8 (130-351)||(2134030-2134251)
chr8 (130-351)||(18712709-18712930)
chr8 (130-351)||(19205132-19205353)
chr8 (130-351)||(29832551-29832772)
chr8 (130-346)||(9357855-9358071)
chr8 (130-351)||(12089493-12089714)
chr8 (130-351)||(19677672-19677893)
chr8 (130-351)||(28358722-28358943)
chr8 (130-351)||(31357753-31357974)
chr8 (130-351)||(31486641-31486862)
chr8 (130-346)||(33261964-33262180)
chr8 (132-349)||(22077683-22077900)
chr8 (1-120)||(19657738-19657857)
chr8 (1-132)||(19678135-19678266)
chr8 (1-128)||(15771266-15771393)
chr8 (1-128)||(18794396-18794523)
chr8 (1-128)||(19691790-19691917)
chr8 (1-128)||(33246061-33246188)
chr8 (1-128)||(2133657-2133784)
chr8 (1-128)||(14561316-14561443)
chr8 (1-128)||(18713176-18713303)
chr8 (1-128)||(19204759-19204886)
chr8 (130-238)||(15770912-15771020)
chr8 (1-128)||(28358349-28358476)
chr8 (1-128)||(44564676-44564803)
chr8 (130-238)||(44564322-44564430)
chr8 (1-128)||(21344568-21344695)
chr8 (1-128)||(27605302-27605429)
chr8 (1-128)||(31358220-31358347)
chr8 (1-128)||(31486268-31486395)
chr8 (1-116)||(9358329-9358444)
chr8 (127-238)||(21344938-21345049)
chr8 (1-128)||(22077322-22077449)
chr8 (1-116)||(12089120-12089235)
chr8 (1-116)||(29833030-29833145)
chr8 (1-116)||(33262438-33262553)
chr8 (284-351)||(16286626-16286694)
chr8 (242-342)||(16768557-16768657)
chr8 (273-342)||(19844401-19844470)
[»] chr6 (94 HSPs)
chr6 (130-351)||(16677363-16677584)
chr6 (130-351)||(27022359-27022580)
chr6 (130-351)||(29552780-29553001)
chr6 (130-351)||(13295703-13295924)
chr6 (130-351)||(15421072-15421293)
chr6 (130-351)||(22931636-22931857)
chr6 (130-351)||(23854081-23854302)
chr6 (131-351)||(16753044-16753264)
chr6 (130-346)||(17089195-17089411)
chr6 (130-351)||(3699306-3699527)
chr6 (130-351)||(27179679-27179900)
chr6 (130-351)||(27269339-27269560)
chr6 (130-351)||(24866939-24867160)
chr6 (130-351)||(27287116-27287337)
chr6 (130-351)||(27060729-27060950)
chr6 (130-351)||(27626463-27626684)
chr6 (130-351)||(34461258-34461479)
chr6 (131-351)||(26921600-26921820)
chr6 (132-351)||(29504639-29504858)
chr6 (130-351)||(4760986-4761207)
chr6 (130-351)||(26113164-26113385)
chr6 (130-351)||(27010954-27011175)
chr6 (130-351)||(28210677-28210898)
chr6 (130-351)||(4542526-4542747)
chr6 (130-351)||(4720887-4721108)
chr6 (130-351)||(27488356-27488577)
chr6 (130-351)||(30554768-30554989)
chr6 (130-351)||(16940779-16941000)
chr6 (130-351)||(29576237-29576458)
chr6 (130-351)||(4528508-4528729)
chr6 (130-351)||(4776103-4776324)
chr6 (130-343)||(20171778-20171991)
chr6 (130-343)||(22164000-22164213)
chr6 (130-273)||(26992096-26992239)
chr6 (1-128)||(24302136-24302263)
chr6 (4-132)||(20172233-20172361)
chr6 (4-132)||(22163630-22163758)
chr6 (1-132)||(22931263-22931394)
chr6 (1-132)||(23853708-23853839)
chr6 (1-128)||(13295330-13295457)
chr6 (1-128)||(26789506-26789633)
chr6 (1-128)||(27022826-27022953)
chr6 (1-128)||(27197875-27198002)
chr6 (1-128)||(27251233-27251360)
chr6 (1-128)||(27626090-27626217)
chr6 (1-128)||(29553247-29553374)
chr6 (130-257)||(33373183-33373310)
chr6 (130-238)||(26775379-26775487)
chr6 (130-238)||(27358862-27358970)
chr6 (130-238)||(27449205-27449313)
chr6 (1-128)||(3699773-3699900)
chr6 (1-128)||(13520571-13520698)
chr6 (1-128)||(24867406-24867533)
chr6 (1-132)||(26775006-26775137)
chr6 (5-128)||(27180146-27180269)
chr6 (5-128)||(27268970-27269093)
chr6 (1-128)||(29505106-29505233)
chr6 (1-128)||(29576704-29576831)
chr6 (1-128)||(33372810-33372937)
chr6 (1-128)||(34460885-34461012)
chr6 (130-238)||(14142146-14142254)
chr6 (130-238)||(26789152-26789260)
chr6 (130-238)||(27197521-27197629)
chr6 (130-238)||(27251606-27251714)
chr6 (1-128)||(8902082-8902209)
chr6 (1-128)||(14141773-14141900)
chr6 (1-128)||(16753511-16753638)
chr6 (1-128)||(26922067-26922194)
chr6 (1-128)||(27061196-27061323)
chr6 (1-128)||(27286743-27286870)
chr6 (1-128)||(28164181-28164308)
chr6 (130-238)||(28163827-28163935)
chr6 (1-128)||(16677830-16677957)
chr6 (130-238)||(13520944-13521051)
chr6 (130-238)||(22455866-22455974)
chr6 (1-128)||(15408912-15409039)
chr6 (1-128)||(15420699-15420826)
chr6 (1-128)||(16940406-16940533)
chr6 (1-128)||(27011421-27011548)
chr6 (1-128)||(27488823-27488950)
chr6 (1-128)||(30554395-30554522)
chr6 (130-238)||(8902455-8902563)
chr6 (1-116)||(4776582-4776697)
chr6 (1-116)||(27358489-27358604)
chr6 (1-116)||(27448832-27448947)
chr6 (1-116)||(4528987-4529102)
chr6 (1-116)||(4720514-4720629)
chr6 (1-116)||(4761465-4761580)
chr6 (1-116)||(26112791-26112906)
chr6 (1-116)||(28211156-28211271)
chr6 (1-116)||(4542153-4542268)
chr6 (1-118)||(17088822-17088939)
chr6 (242-337)||(27545139-27545234)
chr6 (242-304)||(9136217-9136279)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (130-351)||(9262-9483)
scaffold0418 (1-128)||(9729-9856)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (130-343)||(9279-9492)
scaffold0322 (3-128)||(9738-9863)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (130-351)||(15807-16028)
scaffold0254 (1-128)||(16274-16401)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (130-351)||(12797-13018)
scaffold0336 (1-116)||(13276-13391)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (130-351)||(23000-23221)
scaffold0144 (1-128)||(22627-22754)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (130-351)||(11175-11396)
scaffold0038 (1-116)||(11654-11769)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (130-351)||(9248-9469)
scaffold0415 (1-128)||(9715-9842)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (130-351)||(11737-11958)
scaffold0237 (1-128)||(11364-11491)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (132-351)||(5990-6209)
scaffold0159 (1-132)||(5615-5746)
scaffold0159 (273-351)||(23105-23183)
[»] scaffold0748 (2 HSPs)
scaffold0748 (134-343)||(5484-5693)
scaffold0748 (19-132)||(5125-5238)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-132)||(118769-118900)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (130-342)||(43539-43762)
scaffold0099 (1-121)||(43146-43273)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (1-121)||(1979-2102)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (234-351)||(1149-1266)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-128)||(22809-22936)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (270-338)||(33699-33770)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (249-334)||(35168-35253)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (242-304)||(29443-29505)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15231332 - 15231111
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231332 aaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 15231233  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231232 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 15231133  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  15231132 tgtttctcggtctgtggagctg 15231111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 15281746 - 15281959
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281746 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 15281845  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281846 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 15281945  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  15281946 tgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1903714 - 1903500
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1903714 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttccatacaatagg 1903615  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1903614 ctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 1903515  T
Q  330 tgtttctcggtctgt 344  Q
    |||||||||||||||    
T  1903514 tgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14668476 - 14668255
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14668476 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 14668377  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14668376 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaatctctgact 14668277  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  14668276 tgcttctcggtctgtggagctg 14668255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5009335 - 5009114
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5009335 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 5009236  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5009235 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 5009136  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  5009135 tgcttctctgtctgtggagctg 5009114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6573318 - 6573097
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6573318 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 6573219  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6573218 ctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 6573119  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  6573118 tgcttctctgtctgtggagctg 6573097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 14760115 - 14760336
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14760115 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 14760214  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14760215 ctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 14760314  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  14760315 tgcttctcggtctgtggagctg 14760336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17016506 - 17016285
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17016506 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 17016407  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17016406 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 17016307  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  17016306 tgcttctcggtctgtggagctg 17016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 18313987 - 18314208
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18313987 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 18314086  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18314087 ctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 18314186  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  18314187 tgcttctctgtctgtggagctg 18314208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 34185769 - 34185985
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34185769 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 34185868  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34185869 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 34185968  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||||||||||||    
T  34185969 tgcttctcggtctgtgg 34185985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 24589170 - 24589391
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24589170 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 24589269  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24589270 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 24589369  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  24589370 tgcttctcagtctgtggagctg 24589391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 36341326 - 36341547
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||    
T  36341326 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattccatacgatagg 36341425  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36341426 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 36341525  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  36341526 tgtttctctgtctgtggagctg 36341547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 54836851 - 54836630
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54836851 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 54836752  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  54836751 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctgact 54836652  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  54836651 tgcttctcggtctgtggagctg 54836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 20335230 - 20335451
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20335230 aaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 20335329  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20335330 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 20335429  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||||||| |||| ||||    
T  20335430 tgcttctcggtccgtggagctg 20335451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24116122 - 24115901
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||    
T  24116122 aaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgacagg 24116023  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24116022 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 24115923  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  24115922 tgcttctcggtctgtggagctg 24115901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 27160126 - 27160347
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27160126 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 27160225  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27160226 ctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 27160325  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  27160326 tgcttctctgtctgtggagctg 27160347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Original strand, 40102448 - 40102667
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  40102448 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggct 40102547  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  40102548 ggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttg 40102647  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  40102648 cttctctgtctgtggagctg 40102667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30757220 - 30756999
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30757220 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 30757121  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  30757120 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgact 30757021  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  30757020 tgcttctctgtctgtggagctg 30756999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 33670609 - 33670830
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33670609 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 33670708  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  33670709 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 33670808  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  33670809 tgcttctctgtctgtggagctg 33670830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14102001 - 14101782
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  14102001 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggct 14101902  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  14101901 gattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttg 14101802  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  14101801 cttctctgtctgtggagctg 14101782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Original strand, 18797425 - 18797644
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  18797425 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggct 18797524  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18797525 ggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 18797624  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| ||| |||| ||||    
T  18797625 cttctctgtccgtggagctg 18797644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 31123321 - 31123542
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31123321 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 31123420  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31123421 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 31123520  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  31123521 tgcttctctgtctgtggagctg 31123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21973161 - 21972945
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21973161 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 21973062  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  21973061 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 21972962  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  21972961 tgcttctctgtctgtgg 21972945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 39854097 - 39853876
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39854097 aaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 39853998  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39853997 ctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 39853898  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| || ||||| ||||    
T  39853897 tgcttctctgtttgtggagctg 39853876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 132 - 349
Target Start/End: Original strand, 15388189 - 15388406
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  15388189 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggtt 15388288  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15388289 gattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 15388388  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgc 349  Q
     || ||||||||||||||    
T  15388389 cttttcggtctgtggtgc 15388406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 15281376 - 15281504
Alignment:
Q  4 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15281376 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacataatgtcatatttggacaagagcatttgccagcgtgcaa 15281475  T
Q  104 tcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281476 tcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 15281504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1904087 - 1903960
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1904087 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 1903988  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1903987 caatcttcccagtaacagcagctttctc 1903960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30757593 - 30757462
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30757593 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30757494  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30757493 caatcttcccagtgacagcagctttctcgaag 30757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 54837224 - 54837097
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54837224 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 54837125  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54837124 caatcttcccagtaacagcagctttctc 54837097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15231705 - 15231578
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15231705 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 15231606  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  15231605 caacctttccagtaacagcagctttctc 15231578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24116495 - 24116368
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24116495 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24116396  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24116395 caatcttcccagtaacaacagctttctc 24116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 34185396 - 34185523
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34185396 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34185495  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34185496 caatcttcccagtaacagcagctttctc 34185523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5009708 - 5009581
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5009708 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5009609  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5009608 caatctttccagtaacagcagctttctc 5009581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5698368 - 5698241
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5698368 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5698269  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5698268 caatctttccagtaacagcagctttctc 5698241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6573691 - 6573564
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6573691 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 6573592  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6573591 caatctttccagtaacagcagctttctc 6573564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17016879 - 17016752
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17016879 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 17016780  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17016779 caatcttcccagtaacagcagctttctc 17016752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 33670236 - 33670367
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33670236 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33670335  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33670336 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaag 33670367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 40102073 - 40102200
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  40102073 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 40102172  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40102173 caatctttccagtaacagcagctttctc 40102200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14102376 - 14102249
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14102376 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 14102277  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14102276 caatctttccagtaacggcagctttctc 14102249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14668849 - 14668722
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  14668849 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatatttagacaaaagcatctgccagcgtg 14668750  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14668749 caatcttcccggtaacagcagctttctc 14668722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18797050 - 18797177
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18797050 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18797149  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18797150 caatctttccagtaacagcagctttctc 18797177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 20334857 - 20334984
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20334857 agaggttggtaagcagggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 20334956  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20334957 caatcttcccagtaacagcagctttctc 20334984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24588797 - 24588924
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24588797 agaggttggtaagcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24588896  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24588897 caatcttcccagtaacagcagctttctc 24588924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27159753 - 27159880
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27159753 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27159852  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27159853 caatcttcccagtaacagcagctttctc 27159880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 36340953 - 36341068
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36340953 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 36341052  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  36341053 caatcttcccagtaac 36341068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 14759762 - 14759869
Alignment:
Q  21 atcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759762 atcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagca 14759861  T
Q  121 ggtttctc 128  Q
    | ||||||    
T  14759862 gctttctc 14759869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18313614 - 18313741
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18313614 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18313713  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18313714 caatcttcccagtaacaacagctttctc 18313741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21973534 - 21973407
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21973534 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 21973435  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21973434 caatctttccagtaacagcagctttctc 21973407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31122948 - 31123075
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31122948 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31123047  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31123048 caatctttccagtaacagcagctttctc 31123075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39854470 - 39854339
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39854470 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39854371  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  39854370 caatctttccagtaacggccgctttctcgaag 39854339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 15384808 - 15384911
Alignment:
Q  25 gcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||    
T  15384808 gcaagaatgctacctttgattgacttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctt 15384907  T
Q  125 tctc 128  Q
    ||||    
T  15384908 tctc 15384911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 257
Target Start/End: Original strand, 24459636 - 24459691
Alignment:
Q  202 cttggcattcatcgttccatacaataggttgattcttcctgagtagcttgaagatc 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24459636 cttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 24459691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10845064 - 10844851
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845064 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 10844965  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844964 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 10844865  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  10844864 tgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2158018 - 2157797
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2158018 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 2157919  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2157918 ctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 2157819  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  2157818 tgcttctcggtctgtggagctg 2157797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 10842688 - 10842901
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842688 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 10842787  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10842788 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaacctctaact 10842887  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  10842888 tgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 10913563 - 10913784
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10913563 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 10913662  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10913663 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 10913762  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  10913763 tgcttctcggtctgtggagctg 10913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22145639 - 22145418
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22145639 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 22145540  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  22145539 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctaact 22145440  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  22145439 tgtttctcggtctgtggagctg 22145418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 16446700 - 16446913
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16446700 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttccatacaatagt 16446799  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16446800 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaacctcttact 16446899  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||| ||||||||||    
T  16446900 tgtgtctcggtctg 16446913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 26534567 - 26534788
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26534567 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 26534666  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26534667 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 26534766  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||| ||||| ||||    
T  26534767 tgcttctcggtttgtggagctg 26534788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 135 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  135 cttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggttgat 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  235 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  335 ctcggtctg 343  Q
    |||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 2106857 - 2107078
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2106857 aaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 2106956  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2106957 ttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 2107056  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||| ||||| ||||    
T  2107057 tgcttctcggtatgtggagctg 2107078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5131440 - 5131219
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5131440 aaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 5131341  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5131340 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 5131241  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  5131240 tgcttctctgtctgtggagctg 5131219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 5144034 - 5144255
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5144034 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 5144133  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  5144134 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaacctctgact 5144233  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  5144234 tgcttctcggtctgtggagctg 5144255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 16515124 - 16515337
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16515124 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattccatacaatagg 16515223  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16515224 ctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 16515323  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    || |||||||||||    
T  16515324 tgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26516236 - 26516015
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26516236 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 26516137  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26516136 ctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 26516037  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| || ||||| ||||    
T  26516036 tgcttctctgtttgtggagctg 26516015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 11421473 - 11421694
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  11421473 aaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacagg 11421572  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11421573 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaccctctgact 11421672  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  11421673 tgcttctcggtctgtggagctg 11421694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 26271780 - 26272001
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26271780 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaacagg 26271879  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26271880 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 26271979  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  26271980 tgcttctctgtctgtggagctg 26272001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 26316542 - 26316763
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26316542 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 26316641  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  26316642 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 26316741  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  26316742 tgcttctctgtctgtggagctg 26316763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26438699 - 26438480
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26438699 ggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggct 26438600  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26438599 ggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26438500  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26438499 tttctcggtctgtggagctg 26438480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11444329 - 11444110
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  11444329 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggct 11444230  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  11444229 ggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgacttg 11444130  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  11444129 cttctctgtctgtggagctg 11444110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 4141940 - 4142161
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4141940 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 4142039  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4142040 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4142139  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4142140 tgcttctctgtctgtggagctg 4142161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4202833 - 4202612
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4202833 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 4202734  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  4202733 ctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctaact 4202634  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4202633 tgcttctctgtctgtggagctg 4202612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45390664 - 45390443
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  45390664 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 45390565  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  45390564 ctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 45390465  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  45390464 tgcttctctgtctgtggagctg 45390443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3448748 - 3448529
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  3448748 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggct 3448649  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  3448648 ggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttg 3448549  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  3448548 cttctctgtctgtggagctg 3448529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 130 - 337
Target Start/End: Original strand, 16748211 - 16748418
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16748211 aaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 16748310  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16748311 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 16748410  T
Q  330 tgtttctc 337  Q
    || |||||    
T  16748411 tgcttctc 16748418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 26666608 - 26666829
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||    
T  26666608 aaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgacagg 26666707  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  26666708 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 26666807  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  26666808 tgcttctctgtctgtggagctg 26666829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 31561084 - 31561305
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31561084 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 31561183  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31561184 ctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 31561283  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| || ||||| ||||    
T  31561284 tgcttctctgtttgtggagctg 31561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 24589228 - 24589449
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24589228 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 24589327  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  24589328 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 24589427  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  24589428 tgcttctctgtctgtggagctg 24589449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 10842315 - 10842446
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10842315 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtg 10842414  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842415 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 10842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10845437 - 10845306
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10845437 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtg 10845338  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845337 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 10845306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 196 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621873
Alignment:
Q  196 aagctccttggcattcatcgttccatacaataggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcggga 295  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  296 gatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9621873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2777071 - 2776944
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2777071 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2776972  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2776971 caatcttcccagtaacaacagctttctc 2776944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11444704 - 11444573
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11444704 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11444605  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11444604 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaag 11444573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16045132 - 16045005
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16045132 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctaccagcgtg 16045033  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16045032 caatcttcccagtaacagcagctttctc 16045005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16747838 - 16747965
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16747838 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16747937  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16747938 caatcttcccagtaacagcagctttctc 16747965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 2106484 - 2106611
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2106484 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2106583  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2106584 caatcttcccagtaacaacagctttctc 2106611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 10913190 - 10913317
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10913190 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10913289  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10913290 caatcttcccagtaacagcagctttctc 10913317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16514751 - 16514878
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16514751 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16514850  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16514851 caatcttcccagtaacagcagctttctc 16514878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31127724 - 31127597
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31127724 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31127625  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31127624 caatcttcccagtaacaacagctttctc 31127597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2158391 - 2158264
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2158391 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2158292  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2158291 caatctttccagtaacagcagctttctc 2158264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3449123 - 3448992
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3449123 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3449024  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  3449023 caatctttccagtgacggcagctttctcgaag 3448992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5131813 - 5131686
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5131813 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5131714  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5131713 caatcttcctagtaacagcagctttctc 5131686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26316169 - 26316296
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26316169 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26316268  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26316269 caatctttccagtaacagcagctttctc 26316296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26534194 - 26534321
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26534194 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26534293  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26534294 caatcttcccagtaacagcagctttctc 26534321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26681427 - 26681554
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  26681427 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgcccgcgtg 26681526  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26681527 caatcttcccagtaacaacagctttctc 26681554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31086943 - 31087070
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  31086943 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtg 31087042  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31087043 caatcttcccagtaacagcagctttctc 31087070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45735124 - 45734997
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45735124 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 45735025  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45735024 caatcttcccagtaacagcagctttctc 45734997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2776698 - 2776590
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2776698 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 2776599  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  2776598 ctgattctt 2776590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 26512390 - 26512498
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26512390 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 26512489  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  26512490 ctgattctt 26512498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 26681800 - 26681908
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26681800 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 26681899  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  26681900 ctgattctt 26681908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31127351 - 31127243
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31127351 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 31127252  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  31127251 ctgattctt 31127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 39209833 - 39209941
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39209833 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 39209932  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
    |||||||||    
T  39209933 ttgattctt 39209941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4203206 - 4203079
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4203206 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4203107  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4203106 caatcttcccagtaacagcagctttctc 4203079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 5143661 - 5143776
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5143661 agaggttggtaggcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5143760  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  5143761 caatcttcccagtaac 5143776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5162200 - 5162073
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5162200 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgccagcgtg 5162101  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5162100 caatcttcccagtaacaacagctttctc 5162073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11421100 - 11421227
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11421100 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11421199  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11421200 caatcttcccagtaacagcagctttctc 11421227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26512017 - 26512144
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26512017 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26512116  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26512117 caatcttcccagtaacaacagctttctc 26512144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 39209460 - 39209587
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39209460 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39209559  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39209560 caatcttcccagtaacaacagctttctc 39209587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 31087316 - 31087424
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087316 aaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 31087415  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  31087416 ctgattctt 31087424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22146012 - 22145885
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22146012 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgcctttcgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22145913  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22145912 caatctttccagtaacagcagctttctc 22145885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26271407 - 26271534
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26271407 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26271506  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  26271507 caatctttcccgtaacaacagctttctc 26271534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45391037 - 45390910
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  45391037 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 45390938  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45390937 caatctttccagtaacagcagctttctc 45390910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45734757 - 45734649
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45734757 aaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 45734658  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
      |||||||    
T  45734657 ccgattctt 45734649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 4141567 - 4141694
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  4141567 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 4141666  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  4141667 caatctttccagtaacagccgctttctc 4141694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24588855 - 24588982
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24588855 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24588954  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24588955 caatctttccagtaacagcagctttctc 24588982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26439074 - 26438959
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26439074 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26438975  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  26438974 cgatcttcccagtaac 26438959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26666235 - 26666362
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  26666235 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 26666334  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  26666335 caatctttccagtgacagcagctttctc 26666362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16446327 - 16446454
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16446327 agaggttgataagcaaggtgatcagcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaagagcatctgccagcgtg 16446426  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16446427 caatcttcccagtaacaacagctttctc 16446454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26516609 - 26516494
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  26516609 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtg 26516510  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  26516509 caatctttccagtaac 26516494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 31560711 - 31560826
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31560711 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31560810  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  31560811 cgatcttcccagtaac 31560826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Original strand, 16287193 - 16287294
Alignment:
Q  250 tgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgc 349  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || |||||||| || || ||||| ||    
T  16287193 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgtggagc 16287292  T
Q  350 tg 351  Q
    ||    
T  16287293 tg 16287294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Original strand, 1893381 - 1893481
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 341  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  || || |||||||| ||||||||||| |||    
T  1893381 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctctgtc 1893480  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  1893481 t 1893481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9469652 - 9469590
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469652 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Original strand, 16393240 - 16393302
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Original strand, 30369752 - 30369814
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369752 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 16621342 - 16621555
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621342 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 16621441  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621442 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 16621541  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  16621542 tgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18334038 - 18333817
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18334038 aaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 18333939  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18333938 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 18333839  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18333838 tgcttctcggtctgtggtgctg 18333817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 130 - 344
Target Start/End: Original strand, 4793487 - 4793701
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4793487 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 4793586  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4793587 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 4793686  T
Q  330 tgtttctcggtctgt 344  Q
    || ||||||||||||    
T  4793687 tgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 8286322 - 8286535
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8286322 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 8286421  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8286422 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 8286521  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    || |||||||||||    
T  8286522 tgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8299379 - 8299158
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8299379 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 8299280  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8299279 ttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 8299180  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  8299179 tgcttctcggtctgtggagctg 8299158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21678111 - 21677890
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21678111 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 21678012  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21678011 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 21677912  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  21677911 tgcttctcggtctgtggagctg 21677890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35884174 - 35883953
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35884174 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 35884075  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35884074 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 35883975  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  35883974 tgcttctcggtctgtggtgctg 35883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19697898 - 19697687
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19697898 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 19697799  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19697798 ctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 19697699  T
Q  330 tgtttctcggtc 341  Q
    ||||||||||||    
T  19697698 tgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 15737946 - 15738167
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  15737946 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacagtagg 15738045  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15738046 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 15738145  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  15738146 tgcttctcggtctgtggagctg 15738167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 15889557 - 15889778
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15889557 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 15889656  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15889657 ctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 15889756  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  15889757 tgcttctcggtctgtggagctg 15889778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18054670 - 18054449
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18054670 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 18054571  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18054570 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 18054471  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  18054470 tgcttctcggtctgtggagctg 18054449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 18273904 - 18274125
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18273904 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 18274003  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18274004 ctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 18274103  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  18274104 tgcttctcggtctgtggagctg 18274125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 18289205 - 18289426
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18289205 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 18289304  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18289305 ctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 18289404  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  18289405 tgcttctcggtctgtggagctg 18289426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 18304506 - 18304727
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18304506 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 18304605  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18304606 ctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 18304705  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  18304706 tgcttctcggtctgtggagctg 18304727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 22384430 - 22384651
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22384430 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 22384529  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22384530 ttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaacctctgact 22384629  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  22384630 tgcttctcggtctgtggagctg 22384651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 29145608 - 29145829
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29145608 aaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 29145707  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  29145708 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctaact 29145807  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  29145808 tgcttctcggtctgtggagctg 29145829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 29661822 - 29662043
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29661822 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 29661921  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29661922 ctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 29662021  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  29662022 tgcttctcggtctgtggggctg 29662043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6205309 - 6205090
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6205309 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggct 6205210  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6205209 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 6205110  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  6205109 cttctcagtctgtggagctg 6205090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4687061 - 4686842
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4687061 ggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggct 4686962  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4686961 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 4686862  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  4686861 cttctcagtctgtggagctg 4686842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4725037 - 4724818
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4725037 ggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggct 4724938  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4724937 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 4724838  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  4724837 cttctcagtctgtggagctg 4724818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10399552 - 10399331
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10399552 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 10399453  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10399452 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 10399353  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  10399352 tgtttctctgtctgtggagctg 10399331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20069448 - 20069227
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20069448 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgatagg 20069349  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20069348 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 20069249  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  20069248 tgcttctcagtctgtggagctg 20069227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Original strand, 5593211 - 5593430
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  5593211 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggct 5593310  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5593311 gattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 5593410  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  5593411 cttctctgtctgtggagctg 5593430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7076614 - 7076393
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7076614 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 7076515  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7076514 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 7076415  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  7076414 tgcttctcggtctgtggagctg 7076393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 28112806 - 28113027
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28112806 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaacagg 28112905  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  28112906 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 28113005  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  28113006 tgcttctctgtctgtggagctg 28113027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32442559 - 32442338
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  32442559 aaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaga 32442460  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32442459 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 32442360  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||| || |||| ||||    
T  32442359 tgcttctcgatccgtggagctg 32442338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28024690 - 28024469
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28024690 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacagg 28024591  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28024590 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 28024491  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  28024490 tgcttctctgtctgtggagctg 28024469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47026861 - 47026640
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47026861 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 47026762  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  47026761 ctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 47026662  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  47026661 tgcttctctgtctgtggagctg 47026640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 48469333 - 48469114
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  48469333 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaacaggct 48469234  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48469233 ggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctatgacttg 48469134  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  48469133 tttctctgtctgtggagctg 48469114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5470396 - 5470175
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5470396 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 5470297  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  5470296 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 5470197  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  5470196 tgcttctctgtctgtggagctg 5470175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 5606166 - 5606387
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5606166 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 5606265  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  5606266 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 5606365  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  5606366 tgcttctctgtctgtggagctg 5606387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8215143 - 8214922
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  8215143 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaacagg 8215044  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8215043 ctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgact 8214944  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  8214943 tgcttctctgtctgtggagctg 8214922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28342585 - 28342364
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28342585 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 28342486  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  28342485 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 28342386  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  28342385 tgcttctctgtctgtggagctg 28342364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 4343528 - 4343749
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4343528 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 4343627  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4343628 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4343727  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4343728 tgcttctctgtctgtggagctg 4343749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 6539594 - 6539815
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6539594 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 6539693  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  6539694 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 6539793  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  6539794 tgcttctctgtctgtggagctg 6539815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 20573695 - 20573916
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  20573695 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattccatacaatagg 20573794  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20573795 ctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 20573894  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  20573895 tgcttctctgtccgtggagctg 20573916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4420323 - 4420102
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4420323 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 4420224  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4420223 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4420124  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4420123 tgcttctctgtctgtggagctg 4420102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7999968 - 7999747
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7999968 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 7999869  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  7999868 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 7999769  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  7999768 tgcttctctgtctgtggagctg 7999747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10646481 - 10646260
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10646481 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 10646382  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  10646381 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 10646282  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  10646281 tgcttctctgtctgtggagctg 10646260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 22867700 - 22867921
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22867700 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 22867799  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  22867800 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 22867899  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  22867900 tgcttctctgtctgtggagctg 22867921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 22882759 - 22882980
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22882759 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 22882858  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  22882859 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 22882958  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  22882959 tgcttctctgtctgtggagctg 22882980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24331571 - 24331350
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||    
T  24331571 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattccatacaacagg 24331472  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  24331471 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 24331372  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  24331371 tgcttctctgtctgtggagctg 24331350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 346
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107420
Alignment:
Q  152 gacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggttgattcttcctgagtagcttg 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  252 aagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 346  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 11107420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 17981801 - 17982022
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17981801 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 17981900  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  17981901 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 17982000  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  17982001 tgcttctctgtctgtggagctg 17982022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18228604 - 18228383
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18228604 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 18228505  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  18228504 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 18228405  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  18228404 tgcttctctgtctgtggagctg 18228383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18246149 - 18245928
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18246149 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 18246050  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  18246049 ctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 18245950  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||  ||||||| ||||    
T  18245949 tgcttctctatctgtggagctg 18245928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 31961307 - 31961528
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31961307 aaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 31961406  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31961407 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 31961506  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  31961507 tgcttctctgtctgtggagctg 31961528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 51785431 - 51785210
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51785431 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 51785332  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  51785331 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 51785232  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  51785231 tgcttctctgtctgtggagctg 51785210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5017122 - 5016906
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5017122 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 5017023  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  5017022 ctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 5016923  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  5016922 tgcttctctgtctgtgg 5016906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 16620969 - 16621100
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16620969 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 16621068  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16621069 caatcttcctagtaacagcaggtttctcgaag 16621100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11106838 - 11106965
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11106838 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11106937  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11106938 caatcttcccagtaacagcagctttctc 11106965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5714481 - 5714373
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714481 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 5714382  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  5714381 ctgattctt 5714373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5725391 - 5725283
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725391 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 5725292  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  5725291 ctgattctt 5725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 5766977 - 5767085
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766977 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 5767076  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  5767077 ctgattctt 5767085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 4793114 - 4793241
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4793114 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4793213  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4793214 caatcttcccagtaacagcagctttctc 4793241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19698271 - 19698144
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19698271 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcggg 19698172  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19698171 caatcttcccagtaacagcagctttctc 19698144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31032715 - 31032842
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31032715 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31032814  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31032815 caatcttcccagtaacagcagctttctc 31032842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 51785804 - 51785673
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51785804 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 51785705  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51785704 caatcttcccagtgacagcagctttctcgaag 51785673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4627193 - 4627085
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4627193 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 4627094  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  4627093 ctgattctt 4627085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 17992783 - 17992891
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17992783 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 17992882  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
    |||||||||    
T  17992883 ttgattctt 17992891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4627566 - 4627439
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4627566 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgccagcgtg 4627467  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4627466 caatcttcccagtaacagcagctttctc 4627439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4725412 - 4725285
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4725412 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatttccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4725313  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4725312 caatcttcccagtaacagcagctttctc 4725285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8215516 - 8215389
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8215516 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8215417  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8215416 caatcttcccagtaacagcagctttctc 8215389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8285949 - 8286076
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8285949 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8286048  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8286049 caatcttcccggtaacagcagctttctc 8286076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8299752 - 8299625
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8299752 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaattctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8299653  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8299652 caatcttcccagtaacagcagctttctc 8299625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 15737573 - 15737700
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15737573 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacatttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15737672  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15737673 caatcttcccagtaacagcagctttctc 15737700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 15889184 - 15889311
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15889184 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15889283  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15889284 caatcttcccagtaacaacagctttctc 15889311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18055043 - 18054916
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18055043 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18054944  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18054943 caatcttcccagtaacagcagctttctc 18054916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18304133 - 18304260
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18304133 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18304232  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18304233 caatcttcccagtaacagcagctttctc 18304260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18334411 - 18334284
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18334411 agaggttggtaagcaagatgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18334312  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18334311 caatcttcccagtaacagcagctttctc 18334284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21678484 - 21678357
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21678484 agaggttggcaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 21678385  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21678384 caatcttcccagtaacaacagctttctc 21678357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22384057 - 22384184
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22384057 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22384156  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22384157 caatctttccagtaacagcagctttctc 22384184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 28112433 - 28112560
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28112433 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28112532  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28112533 caatctttccagtaacagcagctttctc 28112560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 17973340 - 17973460
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17973340 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 17973439  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcag 121  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  17973440 caatctttccagtaacagcag 17973460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32294036 - 32293928
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32294036 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 32293937  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  32293936 ctgattctt 32293928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4687436 - 4687309
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4687436 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgactgtcttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4687337  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4687336 caatcttcccagtaacagcagctttctc 4687309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5653866 - 5653739
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  5653866 agaggttggtaggcaggatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgtcagcgtg 5653767  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5653766 caatcttcccagtaacaacagctttctc 5653739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6205684 - 6205557
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6205684 agaggttggtaagcaagatgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtg 6205585  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6205584 caatcttcccagtaacagcagctttctc 6205557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7076987 - 7076860
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7076987 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 7076888  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7076887 caatctttccagtaacagcagctttctc 7076860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 17981428 - 17981555
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17981428 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 17981527  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17981528 caatctttccagtaacagcagctttctc 17981555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18273531 - 18273658
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18273531 agagattggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18273630  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18273631 caatcttcccagtaacagcagctttctc 18273658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18288832 - 18288959
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18288832 agagattggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18288931  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18288932 caatcttcccagtaacagcagctttctc 18288959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32294409 - 32294282
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32294409 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 32294310  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32294309 caatcttcccagtaacagcagctttctc 32294282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32442932 - 32442805
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  32442932 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 32442833  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32442832 caatcttcccagtaacagcagctttctc 32442805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35884547 - 35884420
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35884547 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttaattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 35884448  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35884447 caatcttcccagtaacagcagctttctc 35884420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 31033088 - 31033196
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31033088 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataatagg 31033187  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  31033188 ctgattctt 31033196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4420696 - 4420581
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4420696 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4420597  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  4420596 caatcttcccagtaac 4420581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5017495 - 5017368
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5017495 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 5017396  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5017395 caatctttccagtaacagcagctttctc 5017368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10399925 - 10399798
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10399925 agaggttggtaagcaaggtgatcgacaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10399826  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10399825 caatcttcccagtaacagccgctttctc 10399798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20069821 - 20069694
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20069821 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgctagcgtg 20069722  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20069721 caatctttccagtaacagcagctttctc 20069694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 24331944 - 24331829
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24331944 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24331845  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  24331844 caatcttcccagtaac 24331829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 29145235 - 29145362
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  29145235 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtg 29145334  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  29145335 caatcttcccggtaacagccgctttctc 29145362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5592836 - 5592963
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||    
T  5592836 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgcgttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagtgtg 5592935  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5592936 caatcttcccagtaacagcagctttctc 5592963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5714854 - 5714727
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5714854 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtg 5714755  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5714754 caatctttccagtaacagcagctttctc 5714727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5725764 - 5725637
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5725764 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtg 5725665  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5725664 caatctttccagtaacagcagctttctc 5725637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5766604 - 5766731
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5766604 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtg 5766703  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5766704 caatctttccagtaacagcagctttctc 5766731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18228977 - 18228850
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18228977 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18228878  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18228877 caatctttccagtaacagcagctttctc 18228850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47027234 - 47027107
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  47027234 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 47027135  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  47027134 caatctttccagtgacagcagctttctc 47027107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 4343155 - 4343282
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  4343155 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 4343254  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4343255 caatcttcccagtaacaacagctttctc 4343282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 5470769 - 5470654
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5470769 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5470670  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  5470669 caatcttcccagtaac 5470654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5605793 - 5605920
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5605793 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcggacaaaagcatctgccagcgtg 5605892  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5605893 cgatctttccagtaacagcagctttctc 5605920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28025063 - 28024948
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  28025063 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 28024964  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  28024963 caatctttccagtaac 28024948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 48469708 - 48469593
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  48469708 agaggttggtaagcaagatgattggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcg 48469609  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  48469608 caatctttccagtaac 48469593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 6539221 - 6539336
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6539221 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 6539320  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    |||||||||| |||||    
T  6539321 caatcttccccgtaac 6539336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18246522 - 18246407
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18246522 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18246423  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  18246422 cgatcttcccagtaac 18246407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 20573322 - 20573437
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20573322 agaggttgataagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 20573421  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20573422 caatctttccagtaac 20573437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22867327 - 22867442
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22867327 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22867426  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  22867427 cgatcttcccagtaac 22867442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22882386 - 22882501
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22882386 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22882485  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  22882486 cgatcttcccagtaac 22882501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28342958 - 28342843
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28342958 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28342859  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  28342858 cgatcttcccagtaac 28342843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 29661449 - 29661564
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  29661449 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtg 29661548  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  29661549 caatctttccagtaac 29661564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 8000341 - 8000226
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8000341 agaggctggtaagccaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8000242  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  8000241 cgatcttcccagtaac 8000226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10646854 - 10646739
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10646854 agaggctggtaagccaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10646755  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  10646754 cgatcttcccagtaac 10646739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 31960934 - 31961049
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31960934 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgtctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31961033  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  31961034 cgatcttcccagtaac 31961049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15918813 - 15918721
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 334  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||    
T  15918813 gagtagtttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 15918721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 334
Target Start/End: Original strand, 15592882 - 15592967
Alignment:
Q  249 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||    
T  15592882 ttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 15592967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20443406 - 20443321
Alignment:
Q  249 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 334  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||    
T  20443406 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 20443321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41440532 - 41440447
Alignment:
Q  249 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 334  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||    
T  41440532 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 41440447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Original strand, 5950766 - 5950828
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950766 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6571619 - 6571550
Alignment:
Q  273 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtct 342  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||  || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  6571619 gtcatgtgagagataaatctggagatataattcagtctaccaagaaaacctctgacttgtttctctgtct 6571550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4446731 - 4446631
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 341  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || || || || || ||||||||||| |||    
T  4446731 gagtaacttgaatatcggcccacacgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcaatcttcctagaaagcccctaacttgtttctctgtc 4446632  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  4446631 t 4446631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 6)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19517 - 19304
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19517 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 19418  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19417 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctaact 19318  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  19317 tgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30740 - 30519
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30740 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 30641  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30640 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 30541  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  30540 tgcttctcggtctgtggagctg 30519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19890 - 19759
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19890 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtg 19791  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 19759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31113 - 30986
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31113 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatctgccagcgtg 31014  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 30986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7780 - 7653
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7780 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 7681  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7680 caatctttccagtaacagcagctttctc 7653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7407 - 7299
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7407 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 7308  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  7307 ctgattctt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 19453221 - 19453434
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453221 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 19453320  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453321 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 19453420  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  19453421 tgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 21699969 - 21700181
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699969 aaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 21700068  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21700069 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctga-t 21700167  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  21700168 tgtttctcggtctg 21700181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34294600 - 34294379
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294600 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 34294501  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34294500 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 34294401  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  34294400 tgcttctcggtctgtggagctg 34294379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 11631982 - 11632203
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11631982 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 11632081  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  11632082 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 11632181  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  11632182 tgcttctctgtctgtggagctg 11632203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 13933345 - 13933566
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13933345 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 13933444  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13933445 ctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 13933544  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| || ||||| ||||    
T  13933545 tgcttctctgtttgtggagctg 13933566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37381123 - 37380902
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37381123 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37381024  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  37381023 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaacctctgact 37380924  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  37380923 tgtttctcggtctgtggagctg 37380902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12658982 - 12658766
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12658982 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 12658883  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12658882 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 12658783  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || |||||||| |||||    
T  12658782 tgcttctcggtttgtgg 12658766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20841359 - 20841138
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20841359 aaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 20841260  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20841259 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 20841160  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  20841159 tgcttctcggtctgtggagctg 20841138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 23125366 - 23125587
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23125366 aaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 23125465  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23125466 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 23125565  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  23125566 tgcttctcggtctgtggagctg 23125587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 27431239 - 27431452
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27431239 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 27431338  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27431339 ctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 27431438  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    || |||||||||||    
T  27431439 tgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 39048617 - 39048838
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39048617 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 39048716  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39048717 ctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcttact 39048816  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  39048817 tgcttctcagtctgtggagctg 39048838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28885651 - 28885432
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28885651 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggtt 28885552  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28885551 gattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 28885452  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  28885451 cttctcggtctgtggagctg 28885432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12590254 - 12590033
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12590254 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaacagg 12590155  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12590154 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 12590055  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  12590054 tgcttctctgtccgtggagctg 12590033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 37948660 - 37948881
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37948660 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 37948759  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37948760 ctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 37948859  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  37948860 tgcttctcggtctgtggagctg 37948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 39893515 - 39893294
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39893515 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 39893416  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39893415 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 39893316  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  39893315 tgcttctctgtctgtggagctg 39893294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27807149 - 27806928
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27807149 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 27807050  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27807049 ctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 27806950  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  27806949 tgcttctctgtccgtggagctg 27806928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 9346784 - 9347005
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9346784 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 9346883  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  9346884 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 9346983  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| || ||||| ||||    
T  9346984 tgcttctctgtttgtggagctg 9347005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40236954 - 40236733
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40236954 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattccatacaatagg 40236855  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40236854 ctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 40236755  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  40236754 tgcttctctgtctgtggagctg 40236733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Original strand, 257453 - 257672
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  257453 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggct 257552  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  257553 ggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 257652  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| || ||||| ||||    
T  257653 cttctctgtttgtggagctg 257672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 19413299 - 19413520
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19413299 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 19413398  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  19413399 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 19413498  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  19413499 tgcttctctgtctgtggagctg 19413520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 37682693 - 37682914
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37682693 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37682792  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  37682793 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 37682892  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  37682893 tgcttctctgtctgtggagctg 37682914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 37697958 - 37698179
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37697958 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37698057  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  37698058 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 37698157  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  37698158 tgcttctctgtctgtggagctg 37698179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37928815 - 37928594
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37928815 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37928716  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  37928715 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 37928616  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  37928615 tgcttctctgtctgtggagctg 37928594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 16826136 - 16826352
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16826136 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 16826235  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  16826236 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 16826335  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  16826336 tgcttctctgtctgtgg 16826352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16895344 - 16895128
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16895344 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 16895245  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  16895244 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 16895145  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  16895144 tgcttctctgtctgtgg 16895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32053249 - 32053033
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32053249 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 32053150  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  32053149 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 32053050  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  32053049 tgcttctctgtctgtgg 32053033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 21673973 - 21674194
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21673973 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 21674072  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  21674073 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 21674172  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  21674173 tgcttctctgtccgtggagctg 21674194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34865130 - 34864909
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34865130 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 34865031  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  34865030 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 34864931  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  34864930 tgcttctctgtctgtggagctg 34864909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 12713399 - 12713620
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12713399 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 12713498  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  12713499 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 12713598  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  12713599 tgcttctctgtctgtggagctg 12713620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31879732 - 31879516
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31879732 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 31879633  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31879632 ctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 31879533  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  31879532 tgcttctctgtctgtgg 31879516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 132 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27395006 - 27394789
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27395006 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggtt 27394907  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27394906 gattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 27394807  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgc 349  Q
     || ||||||||||||||    
T  27394806 cttttcggtctgtggtgc 27394789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 19452848 - 19452979
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19452848 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 19452947  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452948 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 19452979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 21699596 - 21699723
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21699596 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcatg 21699695  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21699696 caatcttcccagtaacagcagctttctc 21699723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3786312 - 3786185
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3786312 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3786213  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3786212 caatcttcccagtaacagcagctttctc 3786185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13932972 - 13933099
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13932972 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13933071  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13933072 caatcttcccagtaacagcagctttctc 13933099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20841732 - 20841605
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20841732 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 20841633  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20841632 caatcttcccagtaacagcagctttctc 20841605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 34271345 - 34271472
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34271345 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34271444  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34271445 caatcttcccagtaacagcagctttctc 34271472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34294973 - 34294846
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34294973 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34294874  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34294873 caatcttcccagtaacagcagctttctc 34294846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40237327 - 40237200
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40237327 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 40237228  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  40237227 caatcttcccagtaacaacagctttctc 40237200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11631609 - 11631736
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11631609 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11631708  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11631709 caatctttccagtaacagcagctttctc 11631736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12659355 - 12659228
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12659355 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12659256  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12659255 caatcttcccagtaacagcagctttctc 12659228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22924573 - 22924700
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22924573 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22924672  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22924673 caatcttcccagtaacaacagctttctc 22924700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27120343 - 27120216
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  27120343 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcg 27120244  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27120243 caatcttcccagtaacagcagctttctc 27120216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16164926 - 16164818
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16164926 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 16164827  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  16164826 ctgattctt 16164818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 22924946 - 22925054
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22924946 aaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 22925045  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
    |||||||||    
T  22925046 ttgattctt 22925054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27779680 - 27779572
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27779680 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 27779581  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  27779580 ctgattctt 27779572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27819437 - 27819329
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27819437 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 27819338  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  27819337 ctgattctt 27819329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 21673600 - 21673727
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21673600 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 21673699  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21673700 caatctttccagtaacagcagctttctc 21673727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27430866 - 27430993
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  27430866 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattccgacaaaagcatctgccaacgtg 27430965  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27430966 caatcttcccagtaacagcagctttctc 27430993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27780053 - 27779926
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27780053 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27779954  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27779953 caatcttcccagtaacaacagctttctc 27779926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 27807522 - 27807407
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27807522 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27807423  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  27807422 caatctttccagtaac 27807407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27819810 - 27819683
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27819810 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27819711  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27819710 caatcttcccagtaacaacagctttctc 27819683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28886098 - 28885971
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28886098 agaggttggtacgcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28885999  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28885998 caattttcccagtaacagcagctttctc 28885971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34158289 - 34158182
Alignment:
Q  131 aggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggt 230  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  34158289 aggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggc 34158190  T
Q  231 tgattctt 238  Q
    ||||||||    
T  34158189 tgattctt 34158182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34158663 - 34158536
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34158663 agaggttggtaagcaagatgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34158564  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34158563 caatcttcccagtaacaacagctttctc 34158536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3785939 - 3785831
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3785939 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 3785840  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  3785839 ctgattctt 3785831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27119970 - 27119862
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27119970 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 27119871  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  27119870 ctgattctt 27119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 31890289 - 31890397
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  31890289 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaatagg 31890388  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  31890389 ctgattctt 31890397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 257078 - 257193
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  257078 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 257177  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  257178 caatctttccagtaac 257193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12590627 - 12590512
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12590627 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12590528  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12590527 caatctttccagtaac 12590512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 23124994 - 23125120
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23124994 agaggttggtacgcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgag-tttgaacacaatatcgtattcagataaaagcatctgccagcgtg 23125092  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23125093 caatcttcccagtaacagcagctttctc 23125120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31880105 - 31879978
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  31880105 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 31880006  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31880005 caatctttccagtaacagcagctttctc 31879978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31889916 - 31890043
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31889916 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31890015  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31890016 caatcttcccagtaacagccgctttctc 31890043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 37682320 - 37682447
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  37682320 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 37682419  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37682420 caatctttccagtaacagcagctttctc 37682447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 37697585 - 37697712
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  37697585 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 37697684  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37697685 caatctttccagtaacagcagctttctc 37697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 39048244 - 39048371
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39048244 agaggttggtaagcaaggtgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39048343  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39048344 caatcttcccagtgacagcagctttctc 39048371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 9346411 - 9346526
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9346411 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9346510  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9346511 caatctttccagtaac 9346526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16825763 - 16825890
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16825763 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16825862  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16825863 caatctttccagtaacagcagctttctc 16825890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16895717 - 16895590
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16895717 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16895618  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16895617 caatctttccagtaacagcagctttctc 16895590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37381496 - 37381381
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37381496 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaccgtg 37381397  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  37381396 caatcttcccagtaac 37381381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37929188 - 37929061
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  37929188 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 37929089  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  37929088 caatctttccagtgacagcagctttctc 37929061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39893888 - 39893773
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39893888 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39893789  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  39893788 cgatcttcccagtaac 39893773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 12713026 - 12713157
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  12713026 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtg 12713125  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  12713126 caatctttccagtaacggccgctttctcgaag 12713157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 19412926 - 19413053
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  19412926 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 19413025  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  19413026 cgatctttccagtaacggcagctttctc 19413053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27395381 - 27395254
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27395381 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacaaaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 27395282  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  27395281 caatttttccagtaacagcagctttctc 27395254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32053622 - 32053495
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  32053622 agaggttgataagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttctgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 32053523  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32053522 cgatctttccagtaacagcagctttctc 32053495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34865503 - 34865388
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34865503 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34865404  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  34865403 cgatcttcccagtaac 34865388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 37948299 - 37948402
Alignment:
Q  13 gcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37948299 gcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccag 37948398  T
Q  113 taac 116  Q
    ||||    
T  37948399 taac 37948402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16165299 - 16165184
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16165299 agaggttggtaagcaaggtgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 16165200  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16165199 caatctttccagtaac 16165184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27827906 - 27827841
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaa 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27827906 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12383994 - 12383906
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgactt 330  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||    
T  12383994 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacctcttactt 12383906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22949727 - 22949665
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949727 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 334
Target Start/End: Original strand, 21760532 - 21760617
Alignment:
Q  249 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 334  Q
    ||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||    
T  21760532 ttgaatatcggcccacatgttgtagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 21760617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Original strand, 34534353 - 34534453
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 341  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  || || || ||||| ||||||||||| |||    
T  34534353 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggccgtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaccctctaacttgtttctctgtc 34534452  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  34534453 t 34534453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 108)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22891917 - 22891707
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22891917 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 22891818  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22891817 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 22891718  T
Q  330 tgtttctcggt 340  Q
    |||||||||||    
T  22891717 tgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25203732 - 25203519
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25203732 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaatagg 25203633  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25203632 ctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 25203533  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  25203532 tgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25267887 - 25267674
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25267887 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaatagg 25267788  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25267787 ctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 25267688  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  25267687 tgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23895660 - 23895447
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895660 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 23895561  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23895560 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 23895461  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  23895460 tgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11552809 - 11552588
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11552809 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 11552710  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11552709 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 11552610  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  11552609 tgcttctcagtctgtggagctg 11552588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33295982 - 33295761
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33295982 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 33295883  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33295882 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 33295783  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  33295782 tgcttctcggtctgtggagctg 33295761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33780943 - 33780722
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33780943 aaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 33780844  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33780843 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 33780744  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  33780743 tgcttctcggtctgtggagctg 33780722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 15655464 - 15655685
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15655464 aaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatggg 15655563  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15655564 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 15655663  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  15655664 tgcttctcggtctgtggagctg 15655685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 22995823 - 22996044
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  22995823 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacagg 22995922  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22995923 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 22996022  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  22996023 tgcttctcagtctgtggagctg 22996044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23629424 - 23629203
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23629424 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 23629325  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23629324 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 23629225  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  23629224 tgcttctcggtctgtggagctg 23629203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 24684851 - 24685072
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24684851 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 24684950  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24684951 ctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 24685050  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  24685051 tgcttctcggtctgtggagctg 24685072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30938089 - 30937868
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938089 aaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 30937990  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30937989 ctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 30937890  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  30937889 tgcttctcggtctgtggagctg 30937868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41678159 - 41677938
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41678159 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 41678060  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  41678059 ctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctaact 41677960  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  41677959 tgcttctcggtctgtggagctg 41677938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 18497431 - 18497652
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18497431 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 18497530  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18497531 ctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 18497630  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  18497631 tgtttctctgtctgtggagctg 18497652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24973360 - 24973139
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24973360 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaatagg 24973261  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  24973260 ctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaacctctgact 24973161  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  24973160 tgcttctcggtctgtggagctg 24973139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9320930 - 9320709
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9320930 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 9320831  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  9320830 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 9320731  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  9320730 tgcttctctgtctgtggagctg 9320709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12135629 - 12135408
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12135629 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 12135530  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  12135529 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 12135430  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  12135429 tgcttctctgtctgtggagctg 12135408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26483848 - 26483627
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26483848 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 26483749  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  26483748 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 26483649  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  26483648 tgcttctctgtctgtggagctg 26483627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 43081709 - 43081488
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43081709 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 43081610  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  43081609 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 43081510  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  43081509 tgcttctcggtctgtggagctg 43081488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28652696 - 28652475
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28652696 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 28652597  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  28652596 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 28652497  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  28652496 tgcttctcggtctgtggagctg 28652475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3792995 - 3792774
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||    
T  3792995 aaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacagg 3792896  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3792895 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 3792796  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  3792795 tgcttctctgtctgtggagctg 3792774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34619972 - 34619751
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34619972 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacagg 34619873  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34619872 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 34619773  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  34619772 tgcttctctgtctgtggagctg 34619751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31434918 - 31434697
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31434918 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 31434819  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31434818 ctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 31434719  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  31434718 tgcttctctgtctgtggagctg 31434697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 32592980 - 32593201
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32592980 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacagg 32593079  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32593080 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 32593179  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  32593180 tgcttctctgtctgtggagctg 32593201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 37355349 - 37355570
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37355349 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37355448  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  37355449 ctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 37355548  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  37355549 tgcttctctgtctgtggagctg 37355570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Original strand, 18372242 - 18372461
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  18372242 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggct 18372341  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  18372342 gattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttg 18372441  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  18372442 cttctctgtctgtggagctg 18372461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30171921 - 30171702
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  30171921 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattccatacaataggct 30171822  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30171821 ggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 30171722  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  30171721 cttctctgtctgtggagctg 30171702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 8662181 - 8662402
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8662181 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 8662280  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  8662281 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 8662380  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  8662381 tgcttctctgtctgtggagctg 8662402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30032882 - 30032661
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30032882 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 30032783  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  30032782 ctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 30032683  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  30032682 tgcttctctgtctgtggagctg 30032661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30155485 - 30155264
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30155485 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 30155386  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  30155385 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 30155286  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  30155285 tgcttctctgtctgtggagctg 30155264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33519834 - 33519613
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33519834 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 33519735  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  33519734 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 33519635  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  33519634 tgcttctctgtctgtggagctg 33519613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 37668192 - 37668413
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37668192 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37668291  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  37668292 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 37668391  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  37668392 tgcttctctgtctgtggagctg 37668413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37758437 - 37758216
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37758437 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37758338  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  37758337 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 37758238  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  37758237 tgcttctctgtctgtggagctg 37758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2514516 - 2514295
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2514516 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacagg 2514417  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  2514416 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 2514317  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  2514316 tgcttctctgtctgtggagctg 2514295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 15755558 - 15755779
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15755558 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 15755657  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  15755658 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 15755757  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  15755758 tgcttctctgtccgtggagctg 15755779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24586828 - 24586607
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24586828 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 24586729  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  24586728 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 24586629  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  24586628 tgcttctctgtctgtggagctg 24586607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 28956491 - 28956712
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28956491 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaatagg 28956590  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28956591 ctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 28956690  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  28956691 tgcttctctgtctgtggagctg 28956712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 31823113 - 31823334
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31823113 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 31823212  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31823213 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 31823312  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  31823313 tgcttctctgtctgtggagctg 31823334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 37767697 - 37767918
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37767697 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 37767796  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  37767797 ctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 37767896  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  37767897 tgcttctctgtctgtggagctg 37767918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 40470256 - 40470477
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40470256 aaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaatagg 40470355  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40470356 ctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 40470455  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  40470456 tgcttctctgtccgtggagctg 40470477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5641242 - 5641021
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5641242 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 5641143  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  5641142 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 5641043  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  5641042 tgcttctctgtctgtggagctg 5641021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 13321536 - 13321757
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13321536 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 13321635  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  13321636 ctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 13321735  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  13321736 tgcttctctgtctgtggagctg 13321757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24727423 - 24727202
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24727423 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 24727324  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  24727323 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 24727224  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  24727223 tgcttctctgtctgtggagctg 24727202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6877757 - 6877538
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| |    
T  6877757 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaacaggct 6877658  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  6877657 ggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttg 6877558  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  6877557 cttctctgtctgtggagctg 6877538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25204105 - 25203978
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25204105 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 25204006  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25204005 caatcttcccagtaacagcagctttctc 25203978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25268260 - 25268133
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25268260 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 25268161  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25268160 caatcttcccagtaacagcagctttctc 25268133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 257
Target Start/End: Original strand, 13183499 - 13183626
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13183499 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttccatacaatagg 13183598  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatc 257  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13183599 ctgattctttctgagtagcttgaagatc 13183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24727796 - 24727665
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24727796 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24727697  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24727696 caatcttcccagtgacagcagctttctcgaag 24727665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11553182 - 11553055
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11553182 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11553083  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11553082 caatcttcccagtaacagcagctttctc 11553055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23629797 - 23629670
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23629797 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 23629698  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23629697 caatcttcccagtaacagcagctttctc 23629670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24587201 - 24587074
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24587201 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24587102  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24587101 caatcttcccagtaacagcagctttctc 24587074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6878132 - 6878001
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6878132 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 6878033  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  6878032 caatctttccagtgacggcagctttctcgaag 6878001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9321303 - 9321176
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9321303 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9321204  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9321203 caatctttccagtaacagcagctttctc 9321176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 9547042 - 9547169
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9547042 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9547141  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9547142 caatcttcccagtaacagcagctttctc 9547169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22995450 - 22995577
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22995450 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22995549  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22995550 caatcttcccagtaacagcagctttctc 22995577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24973733 - 24973606
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24973733 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtg 24973634  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24973633 caatcttcccagtaacagcagctttctc 24973606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26484221 - 26484094
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26484221 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26484122  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26484121 caatctttccagtaacagcagctttctc 26484094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30172296 - 30172169
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30172296 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30172197  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  30172196 caatctttccagtaacggcagctttctc 30172169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30938462 - 30938335
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30938462 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30938363  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30938362 caatcttcccagtaacagcagctttctc 30938335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33296355 - 33296228
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33296355 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33296256  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33296255 caatcttcccagtaacagcagctttctc 33296228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33878957 - 33878830
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33878957 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33878858  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33878857 caatcttcccagtaacagcagctttctc 33878830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 40469883 - 40469998
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40469883 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 40469982  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  40469983 caatcttcccagtaac 40469998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 235
Target Start/End: Original strand, 13439389 - 13439494
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13439389 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 13439488  T
Q  230 ttgatt 235  Q
     |||||    
T  13439489 ctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 18125122 - 18125230
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18125122 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 18125221  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  18125222 ctgattctt 18125230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2514889 - 2514758
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2514889 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2514790  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  2514789 caatctttccagtgacggcagctttctcgaag 2514758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3793368 - 3793241
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3793368 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3793269  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3793268 caatctttccagtaacagcagctttctc 3793241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12136002 - 12135875
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12136002 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacataatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12135903  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12135902 caatctttccagtaacagcagctttctc 12135875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13183126 - 13183253
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13183126 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattaagacaaaagcatctgccagcgtg 13183225  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13183226 caatcttcccagtaacagcagctttctc 13183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13439016 - 13439143
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13439016 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13439115  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13439116 caatcttcccagtgacagcagctttctc 13439143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18124749 - 18124876
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18124749 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaacagcatctgccagcgtg 18124848  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18124849 caatctttccagtaacagcagctttctc 18124876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18497058 - 18497185
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18497058 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18497157  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18497158 caatctttccagtaacagcagctttctc 18497185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37758810 - 37758683
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37758810 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37758711  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  37758710 caatctttccagtaacggcagctttctc 37758683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41678532 - 41678405
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41678532 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 41678433  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41678432 caatctttccagtaacagcagctttctc 41678405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 9547415 - 9547523
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9547415 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 9547514  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  9547515 ctgattctt 9547523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11327091 - 11326983
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11327091 aaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 11326992  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
    |||||||||    
T  11326991 ttgattctt 11326983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 29887903 - 29888011
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29887903 aaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 29888002  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  29888003 ctgattctt 29888011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8661808 - 8661935
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  8661808 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 8661907  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8661908 caatctttccagtaacagcagctttctc 8661935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11327464 - 11327349
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11327464 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11327365  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  11327364 cgatcttcccagtaac 11327349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 15655091 - 15655218
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  15655091 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcg 15655190  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15655191 caatcttcccagtaacagccgctttctc 15655218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18371867 - 18371994
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18371867 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18371966  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18371967 caatctttccagtaacggcagctttctc 18371994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 28956118 - 28956245
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28956118 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28956217  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28956218 caatctttccagtaacggcagctttctc 28956245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30155858 - 30155731
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  30155858 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 30155759  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30155758 caatctttccagtaacagcagctttctc 30155731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33781312 - 33781189
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33781312 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttg----ttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33781217  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33781216 caatcttcccagtaacagcagctttctc 33781189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22892287 - 22892163
Alignment:
Q  4 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaa 103  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22892287 ggttgataggcaaggtgatcaacaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaa 22892188  T
Q  104 tcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||    
T  22892187 tctttccagtaacagcagctttctc 22892163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33878584 - 33878477
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  33878584 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcatcgttccatacaatagg 33878486  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  33878485 ctgattctt 33878477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5641615 - 5641488
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5641615 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5641516  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5641515 caatctttccagtaacagcagctttctc 5641488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 29887530 - 29887657
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  29887530 agaggttggtaggcgagattatcggcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagagtg 29887629  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29887630 caatcttcccagtaacaacagctttctc 29887657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31435291 - 31435164
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31435291 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31435192  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31435191 caatctttccagtaacagcagctttctc 31435164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 32592607 - 32592722
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  32592607 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 32592706  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  32592707 caatctttccagtaac 32592722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33520207 - 33520080
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33520207 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33520108  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33520107 caatctttccagtaacagcagctttctc 33520080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34620345 - 34620230
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  34620345 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 34620246  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  34620245 caatcttcccagtaac 34620230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 37667819 - 37667946
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37667819 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37667918  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37667919 caatcttcccagtaacagccgctttctc 37667946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 37767324 - 37767451
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37767324 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37767423  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37767424 caatcttcccagtaacaacagctttctc 37767451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28653069 - 28652954
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28653069 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28652970  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  28652969 caatctttccagtaac 28652954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 31822740 - 31822871
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31822740 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31822839  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    | |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31822840 cgatcttcccagtaacggccgctttctcgaag 31822871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 43082082 - 43081967
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43082082 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 43081983  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  43081982 caatctttccagtaac 43081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30033255 - 30033135
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  30033255 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 30033156  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcag 121  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  30033155 caatctttccagtaacagcag 30033135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 15755185 - 15755300
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15755185 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15755284  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  15755285 cgatcttcccagtaac 15755300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 37354976 - 37355091
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37354976 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37355075  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  37355076 cgatcttcccagtaac 37355091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 13321163 - 13321278
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13321163 agaggttgataagcaaggtgatcggcgaggatgctacctttgatcgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtg 13321262  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  13321263 caatcttcccagtaac 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 304
Target Start/End: Original strand, 15784463 - 15784605
Alignment:
Q  162 ggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcc 261  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||| ||| |||||||||||  ||| |  || | |||||| ||||| |||||||    
T  15784463 ggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcattcttcggtccatacaataccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcc 15784562  T
Q  262 cgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784563 cacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34468956 - 34468855
Alignment:
Q  250 tgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgc 349  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || |||||||| || || ||||| ||    
T  34468956 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgtggagc 34468857  T
Q  350 tg 351  Q
    ||    
T  34468856 tg 34468855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 330
Target Start/End: Original strand, 36375780 - 36375868
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgactt 330  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||    
T  36375780 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacctcttactt 36375868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 330
Target Start/End: Original strand, 37000434 - 37000522
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgactt 330  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||    
T  37000434 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacctcttactt 37000522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Original strand, 5440043 - 5440105
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440043 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Original strand, 11944240 - 11944302
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17957438 - 17957376
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957438 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31520649 - 31520569
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacc 322  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  31520649 gagtagtttgaatatcggcccacaagctgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatttagtcgtccaaggaaacc 31520569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3514 - 3301
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3514 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaatagg 3415  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3414 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 3315  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    || |||||||||||    
T  3314 tgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Original strand, 43872 - 44021
Alignment:
Q  202 cttggcattcatcgttccatacaataggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgta 301  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43872 cttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgta 43971  T
Q  302 attcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  43972 attcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtggagctg 44021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3887 - 3760
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3887 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3788  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3787 caatcttcccagtaacagcagctttctc 3760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  272 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20464425 - 20464212
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464425 aaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 20464326  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20464325 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagact 20464226  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  20464225 tgtttctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 130 - 340
Target Start/End: Original strand, 20339110 - 20339320
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20339110 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaatagg 20339209  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20339210 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 20339309  T
Q  330 tgtttctcggt 340  Q
    || || |||||    
T  20339310 tgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 16204843 - 16205055
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16204843 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttccatacaatagg 16204942  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16204943 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaacctctgact 16205042  T
Q  330 tgtttctcggtct 342  Q
    || ||||||||||    
T  16205043 tgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 21894558 - 21894774
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21894558 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 21894657  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21894658 ctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 21894757  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| || |||||    
T  21894758 tgcttctctgtttgtgg 21894774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10966114 - 10965893
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10966114 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 10966015  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10966014 ctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 10965915  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| || ||||| ||||    
T  10965914 tgcttctctgtttgtggagctg 10965893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 51641665 - 51641446
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  51641665 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaacaggct 51641566  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  51641565 gattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttg 51641466  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  51641465 cttctctgtctgtggagctg 51641446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10948526 - 10948305
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10948526 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 10948427  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  10948426 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 10948327  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  10948326 tgcttctctgtctgtggagctg 10948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 130 - 337
Target Start/End: Original strand, 41790119 - 41790326
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41790119 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 41790218  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41790219 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 41790318  T
Q  330 tgtttctc 337  Q
    || |||||    
T  41790319 tgcttctc 41790326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28588434 - 28588218
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28588434 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 28588335  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28588334 ctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctgact 28588235  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  28588234 tgcttctctgtctgtgg 28588218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3644584 - 3644360
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattctt-gatgctatcaaaagctcctt-ggcattcatcgttccatacaata 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3644584 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattccatacaata 3644485  T
Q  228 ggttgattcttc-ctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctg 326  Q
    || ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644484 ggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 3644385  T
Q  327 acttgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  3644384 acttgcttctctgtctgtggagctg 3644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20464798 - 20464667
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20464798 agaggttggcaggcaagatgattggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 20464699  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464698 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 20464667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 20336855 - 20336979
Alignment:
Q  4 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20336855 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataagagcatctgccagcgtgcaa 20336954  T
Q  104 tcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  20336955 tcttcccagtaacagcagctttctc 20336979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10966487 - 10966360
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10966487 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10966388  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10966387 caatctttccagtaacagcagctttctc 10966360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16204470 - 16204597
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  16204470 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatcttccagcggg 16204569  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16204570 caatctttccagtaacagcagctttctc 16204597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28153185 - 28153077
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28153185 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 28153086  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  28153085 ctgattctt 28153077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 21894184 - 21894311
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21894184 agaggttggtaggcaagatgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaatagcatctgccagcgtg 21894283  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  21894284 caaccttcccagtaacagccgctttctc 21894311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51642040 - 51641913
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51642040 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacagtatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 51641941  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51641940 caatctttccagtaacagcagctttctc 51641913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10948899 - 10948772
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10948899 agaggttgataagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10948800  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10948799 caatctttccagtaacagcagctttctc 10948772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28153558 - 28153431
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28153558 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28153459  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28153458 caatcttcccagtaacaacagctttctc 28153431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28588807 - 28588692
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28588807 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtg 28588708  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  28588707 caatctttccagtaac 28588692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 41789746 - 41789861
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41789746 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 41789845  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  41789846 caatcttcccagtaac 41789861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3644958 - 3644843
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3644958 agaggttgataagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3644859  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  3644858 caatctttccagtaac 3644843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 130 - 340
Target Start/End: Original strand, 1433 - 1643
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1433 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaatagg 1532  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 1632  T
Q  330 tgtttctcggt 340  Q
    || || |||||    
T  1633 tgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14561070 - 14560849
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14561070 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 14560971  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14560970 ttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 14560871  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  14560870 tgcttctcggtctgtggagctg 14560849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18794150 - 18793929
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794150 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 18794051  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18794050 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaacctctgact 18793951  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  18793950 tgcttctcggtctgtggagctg 18793929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 27605675 - 27605896
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27605675 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 27605774  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27605775 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 27605874  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  27605875 tgcttctcggtctgtggagctg 27605896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19691544 - 19691328
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19691544 aaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 19691445  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19691444 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgact 19691345  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || |||||||| |||||    
T  19691344 tgcttctcggtttgtgg 19691328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 2134030 - 2134251
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2134030 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaatagg 2134129  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2134130 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 2134229  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  2134230 tgcttctcggtctgtggagctg 2134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18712930 - 18712709
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  18712930 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacagg 18712831  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18712830 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgact 18712731  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  18712730 tgtttctcggtctgtggagctg 18712709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 19205132 - 19205353
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19205132 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 19205231  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19205232 ctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 19205331  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  19205332 tgcttctctgtccgtggagctg 19205353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29832772 - 29832551
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29832772 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 29832673  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  29832672 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgact 29832573  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  29832572 tgcttctctgtctgtggagctg 29832551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9358071 - 9357855
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9358071 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 9357972  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  9357971 ctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgact 9357872  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  9357871 tgcttctctgtctgtgg 9357855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 12089493 - 12089714
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12089493 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 12089592  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  12089593 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 12089692  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  12089693 tgcttctctgtctgtggagctg 12089714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19677893 - 19677672
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19677893 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 19677794  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19677793 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 19677694  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  19677693 tgcttctctgtctgtggagctg 19677672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 28358722 - 28358943
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28358722 aaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 28358821  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  28358822 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgact 28358921  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| ||| |||| ||||    
T  28358922 tgcttctctgtccgtggagctg 28358943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31357974 - 31357753
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31357974 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 31357875  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  31357874 gtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 31357775  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  31357774 tgcttctctgtctgtggagctg 31357753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 31486641 - 31486862
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31486641 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 31486740  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31486741 ctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctgact 31486840  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  31486841 tgcttctctgtctgtggagctg 31486862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33262180 - 33261964
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33262180 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 33262081  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  33262080 ctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 33261981  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||| ||||||||    
T  33261980 tgcttctctgtctgtgg 33261964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 349
Target Start/End: Original strand, 22077683 - 22077900
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  22077683 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaataggtt 22077782  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    ||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22077783 gattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 22077882  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgc 349  Q
     || ||||||||||||||    
T  22077883 cttttcggtctgtggtgc 22077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 19657738 - 19657857
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19657738 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 19657837  T
Q  101 caatcttcccagtaacagca 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19657838 caatcttcccagtaacagca 19657857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19678266 - 19678135
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19678266 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 19678167  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19678166 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaag 19678135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15771393 - 15771266
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15771393 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15771294  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15771293 caatcttcccagtaacagcagctttctc 15771266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18794523 - 18794396
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18794523 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18794424  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18794423 caatcttcccagtaacagcagctttctc 18794396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19691917 - 19691790
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19691917 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 19691818  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19691817 caatcttcccagtaacagcagctttctc 19691790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33246188 - 33246061
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33246188 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttaagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtg 33246089  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33246088 caatcttcccagtaacaacagctttctc 33246061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 2133657 - 2133784
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2133657 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2133756  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2133757 caattttcccagtaacagcagctttctc 2133784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14561443 - 14561316
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14561443 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 14561344  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14561343 caatcttcccagtaacagcagctttctc 14561316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18713303 - 18713176
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18713303 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18713204  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18713203 caatcttcccagtaacagcagctttctc 18713176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 19204759 - 19204886
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19204759 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 19204858  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19204859 caatctttccagtaacagcagctttctc 19204886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15771020 - 15770912
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15771020 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 15770921  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  15770920 ctgattctt 15770912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 28358349 - 28358476
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28358349 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28358448  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28358449 caatcttcccagtaacaacagctttctc 28358476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44564803 - 44564676
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44564803 agaggttggtaagccagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 44564704  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44564703 caatcttcccagtaacaacagctttctc 44564676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44564430 - 44564322
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44564430 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttctatacaatagg 44564331  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  44564330 ctgattctt 44564322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 21344568 - 21344695
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  21344568 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgtcagcgtg 21344667  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21344668 caatcttcccagtaacaacagctttctc 21344695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27605302 - 27605429
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27605302 agaggttggtaagcaaggtgatcgacaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27605401  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27605402 caatcttcccagtaacaacagctttctc 27605429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31358347 - 31358220
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  31358347 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 31358248  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31358247 caatctttccagtaacagcagctttctc 31358220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31486268 - 31486395
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31486268 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31486367  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31486368 caatcttcccggtaacagcagctttctc 31486395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9358444 - 9358329
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9358444 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagtcttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9358345  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9358344 caatctttccagtaac 9358329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 238
Target Start/End: Original strand, 21344938 - 21345049
Alignment:
Q  127 tcgaaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||     
T  21344938 tcgaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccctacaag 21345037  T
Q  227 aggttgattctt 238  Q
    ||| | ||||||    
T  21345038 aggctaattctt 21345049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22077322 - 22077449
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22077322 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 22077421  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  22077422 caatttttccagtaacatcagctttctc 22077449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 12089120 - 12089235
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12089120 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12089219  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  12089220 cgatcttcccagtaac 12089235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 29833145 - 29833030
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29833145 agaggttgataagcaaggtgatcggcgaggatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29833046  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  29833045 caatcttcccagtaac 29833030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33262553 - 33262438
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33262553 agaggttgataagcaaggtgatcggcgaggatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33262454  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  33262453 cgatcttcccagtaac 33262438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286626
Alignment:
Q  284 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgcc-cgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 16286626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16768657 - 16768557
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 341  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  || || |||||||| ||||||||||| |||    
T  16768657 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctctgtc 16768558  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  16768557 t 16768557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19844470 - 19844401
Alignment:
Q  273 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtct 342  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19844470 gtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtct 19844401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 94)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16677584 - 16677363
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16677584 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 16677485  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16677484 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 16677385  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  16677384 tgtttctctgtctgtggagctg 16677363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27022580 - 27022359
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27022580 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 27022481  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27022480 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 27022381  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  27022380 tgcttctcggtctgtggagctg 27022359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29553001 - 29552780
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29553001 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 29552902  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29552901 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 29552802  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  29552801 tgcttctcagtctgtggagctg 29552780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 13295703 - 13295924
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13295703 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattccatacaatagg 13295802  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13295803 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 13295902  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  13295903 tgcttctcggtctgtggagctg 13295924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 15421072 - 15421293
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15421072 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 15421171  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15421172 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 15421271  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  15421272 tgcttctcggtctgtggagctg 15421293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 22931636 - 22931857
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22931636 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 22931735  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22931736 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 22931835  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  22931836 tgcttctcggtctgtggagctg 22931857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 23854081 - 23854302
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23854081 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaatagg 23854180  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23854181 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 23854280  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  23854281 tgcttctcggtctgtggagctg 23854302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 131 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16753264 - 16753044
Alignment:
Q  131 aggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||     
T  16753264 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggc 16753165  T
Q  231 tgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgactt 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16753164 tgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgactt 16753065  T
Q  331 gtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16753064 gtttctcggtctgtggagctg 16753044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 17089195 - 17089411
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17089195 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccacacaatagg 17089294  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17089295 ctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 17089394  T
Q  330 tgtttctcggtctgtgg 346  Q
    || ||||||||| ||||    
T  17089395 tgcttctcggtccgtgg 17089411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3699527 - 3699306
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3699527 aaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaatagg 3699428  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3699427 ctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 3699328  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  3699327 tgtttctctgtctgtggagctg 3699306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27179900 - 27179679
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27179900 aaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaatagg 27179801  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27179800 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 27179701  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  27179700 tgcttctcggtctgtggagctg 27179679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 27269339 - 27269560
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27269339 aaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaatagg 27269438  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27269439 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 27269538  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  27269539 tgcttctcggtctgtggagctg 27269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24867160 - 24866939
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24867160 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 24867061  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24867060 ctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 24866961  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  24866960 tgcttctcggtctgtggagctg 24866939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 27287116 - 27287337
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27287116 aaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 27287215  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27287216 ctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 27287315  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  27287316 tgcttctcggtctgtggagctg 27287337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27060950 - 27060729
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27060950 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaacagg 27060851  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  27060850 ctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctgact 27060751  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  27060750 tgcttctctgtctgtggagctg 27060729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 27626463 - 27626684
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27626463 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaatagg 27626562  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27626563 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 27626662  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||||||| |||| ||||    
T  27626663 tgcttctcggtccgtggagctg 27626684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 34461258 - 34461479
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34461258 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 34461357  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34461358 ctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 34461457  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  34461458 tgcttctcagtctgtggagctg 34461479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 131 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26921820 - 26921600
Alignment:
Q  131 aggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||| |||     
T  26921820 aggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggc 26921721  T
Q  231 tgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgactt 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26921720 tgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgactt 26921621  T
Q  331 gtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  26921620 gcttctcggtctgtggagctg 26921600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29504858 - 29504639
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  29504858 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggct 29504759  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  29504758 ggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgacttg 29504659  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  29504658 cttctctgtctgtggagctg 29504639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4761207 - 4760986
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4761207 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 4761108  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4761107 ctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4761008  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4761007 tgcttctctgtctgtggagctg 4760986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 26113164 - 26113385
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26113164 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 26113263  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  26113264 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 26113363  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  26113364 tgcttctctgtctgtggagctg 26113385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27011175 - 27010954
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27011175 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 27011076  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  27011075 ctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 27010976  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  27010975 tgcttctctgtctgtggagctg 27010954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28210898 - 28210677
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28210898 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 28210799  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  28210798 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 28210699  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  28210698 tgcttctctgtctgtggagctg 28210677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 4542526 - 4542747
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4542526 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 4542625  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4542626 ctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4542725  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4542726 tgcttctctgtctgtggagctg 4542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 4720887 - 4721108
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4720887 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 4720986  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4720987 ctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4721086  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4721087 tgcttctctgtctgtggagctg 4721108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27488577 - 27488356
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27488577 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 27488478  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  27488477 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 27488378  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  27488377 tgcttctctgtctgtggagctg 27488356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 30554768 - 30554989
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30554768 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 30554867  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  30554868 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 30554967  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  30554968 tgcttctctgtctgtggagctg 30554989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 16940779 - 16941000
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16940779 aaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 16940878  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  16940879 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 16940978  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  16940979 tgcttctctgtctgtggagctg 16941000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29576458 - 29576237
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29576458 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 29576359  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  29576358 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctgact 29576259  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  29576258 tgcttctctgtctgtggagctg 29576237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4528729 - 4528508
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  4528729 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaacagg 4528630  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4528629 ctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4528530  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4528529 tgcttctctgtctgtggagctg 4528508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4776324 - 4776103
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4776324 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 4776225  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  4776224 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 4776125  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  4776124 tgcttctctgtctgtggagctg 4776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20171991 - 20171778
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20171991 aaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaatggg 20171892  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  20171891 ttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctaact 20171792  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    |||||||| |||||    
T  20171791 tgtttctcagtctg 20171778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Original strand, 22164000 - 22164213
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22164000 aaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaatggg 22164099  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  22164100 ttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctaact 22164199  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    |||||||| |||||    
T  22164200 tgtttctcagtctg 22164213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 130 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26992239 - 26992096
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26992239 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatagaatagg 26992140  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 273  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992139 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24302136 - 24302263
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24302136 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtg 24302235  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24302236 caatcttcccagtaacagcagctttctc 24302263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20172361 - 20172233
Alignment:
Q  4 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20172361 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaa 20172262  T
Q  104 tcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20172261 tcttcccggtaacagcaggtttctcgaag 20172233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 22163630 - 22163758
Alignment:
Q  4 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  22163630 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaa 22163729  T
Q  104 tcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22163730 tcttcccggtaacagcaggtttctcgaag 22163758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22931263 - 22931394
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22931263 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22931362  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22931363 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaag 22931394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 23853708 - 23853839
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23853708 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 23853807  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23853808 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaag 23853839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13295330 - 13295457
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13295330 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13295429  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13295430 caatcttcccagtaacagcagctttctc 13295457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26789633 - 26789506
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26789633 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26789534  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26789533 caatcttcccagtaacaacagctttctc 26789506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27022953 - 27022826
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27022953 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27022854  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27022853 caatcttcccagtaacagcagctttctc 27022826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27198002 - 27197875
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27198002 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27197903  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27197902 caatcttcccagtaacaacagctttctc 27197875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27251233 - 27251360
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27251233 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27251332  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27251333 caatcttcccagtaacaacagctttctc 27251360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27626090 - 27626217
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27626090 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 27626189  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27626190 caatcttcccagtaacagcagctttctc 27626217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29553374 - 29553247
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29553374 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29553275  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29553274 caatcttcccagtaacagcagctttctc 29553247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 257
Target Start/End: Original strand, 33373183 - 33373310
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33373183 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 33373282  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatc 257  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||    
T  33373283 ctggttctttctgagtagcttgaagatc 33373310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 26775379 - 26775487
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26775379 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 26775478  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  26775479 ctgattctt 26775487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 27358862 - 27358970
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27358862 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 27358961  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  27358962 ctgattctt 27358970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 27449205 - 27449313
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27449205 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 27449304  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  27449305 ctgattctt 27449313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3699900 - 3699773
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3699900 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3699801  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3699800 caatcttcccagtaacagcagctttctc 3699773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13520571 - 13520698
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13520571 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13520670  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13520671 caatcttcccagtaacagcagctttctc 13520698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24867533 - 24867406
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24867533 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24867434  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24867433 caatcttcccggtaacagcagctttctc 24867406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 26775006 - 26775137
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26775006 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26775105  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26775106 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaag 26775137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27180269 - 27180146
Alignment:
Q  5 gttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaat 104  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27180269 gttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaat 27180170  T
Q  105 cttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  27180169 cttcccagtaacagcagctttctc 27180146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Original strand, 27268970 - 27269093
Alignment:
Q  5 gttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaat 104  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27268970 gttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaat 27269069  T
Q  105 cttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  27269070 cttcccagtaacagcagctttctc 27269093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29505233 - 29505106
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29505233 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29505134  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29505133 caatcttcccagtaacagcagctttctc 29505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29576831 - 29576704
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29576831 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29576732  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29576731 caatctttccagtaacagcagctttctc 29576704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 33372810 - 33372937
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33372810 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33372909  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33372910 caatcttcccagtaacagcagctttctc 33372937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 34460885 - 34461012
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34460885 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34460984  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34460985 caatcttcccagtaacagcagctttctc 34461012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 14142146 - 14142254
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14142146 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 14142245  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  14142246 ctgattctt 14142254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26789260 - 26789152
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26789260 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 26789161  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  26789160 ctgattctt 26789152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27197629 - 27197521
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27197629 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 27197530  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  27197529 ctgattctt 27197521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 27251606 - 27251714
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27251606 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaatagg 27251705  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  27251706 ctgattctt 27251714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8902082 - 8902209
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8902082 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8902181  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8902182 caatattcccagtaacagcagctttctc 8902209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 14141773 - 14141900
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14141773 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 14141872  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14141873 caatcttcccagtaacaacagctttctc 14141900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16753638 - 16753511
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16753638 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16753539  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16753538 caatcttcccagtaacagccgctttctc 16753511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26922194 - 26922067
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26922194 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26922095  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26922094 caatcttcccagtaacagccgctttctc 26922067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27061323 - 27061196
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27061323 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatataatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27061224  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27061223 caatctttccagtaacagcagctttctc 27061196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27286743 - 27286870
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27286743 agaggttgataggcaagatgatcggcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccaacgtg 27286842  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27286843 caatcttcccagtaatagcagctttctc 27286870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28164308 - 28164181
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28164308 agaggttggtaagcaagatgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28164209  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28164208 caatctttccagtaacagcagctttctc 28164181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28163935 - 28163827
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28163935 aaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 28163836  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
      |||||||    
T  28163835 ccgattctt 28163827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16677957 - 16677830
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16677957 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccctttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16677858  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16677857 caatctttccagtaacagcagctttctc 16677830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 13520944 - 13521051
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  13520944 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcatcgttccatacaatagg 13521042  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
     ||||||||    
T  13521043 ctgattctt 13521051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 22455866 - 22455974
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22455866 aaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaatagg 22455965  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
    |||||||||    
T  22455966 ttgattctt 22455974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 15408912 - 15409039
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15408912 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15409011  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15409012 caatcttcctagtaacagcagctttctc 15409039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 15420699 - 15420826
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15420699 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15420798  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15420799 caatcttcctagtaacagcagctttctc 15420826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16940406 - 16940533
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16940406 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16940505  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16940506 caatcttcccagtaacaacagctttctc 16940533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27011548 - 27011421
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27011548 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27011449  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27011448 caatctttccagtaacagcagctttctc 27011421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27488950 - 27488823
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27488950 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27488851  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27488850 caatcttcccagtaacaacagctttctc 27488823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 30554395 - 30554522
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30554395 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30554494  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30554495 caatctttccagtaacagcagctttctc 30554522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 8902455 - 8902563
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8902455 aaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaatagg 8902554  T
Q  230 ttgattctt 238  Q
      |||||||    
T  8902555 ccgattctt 8902563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4776697 - 4776582
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4776697 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4776598  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  4776597 caatcttcccagtaac 4776582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 27358489 - 27358604
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27358489 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27358588  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  27358589 caatcttcccagtaac 27358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 27448832 - 27448947
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27448832 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27448931  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  27448932 caatcttcccagtaac 27448947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4529102 - 4528987
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4529102 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4529003  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  4529002 cgatcttcccagtaac 4528987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 4720514 - 4720629
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4720514 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4720613  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  4720614 cgatcttcccagtaac 4720629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4761580 - 4761465
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4761580 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4761481  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  4761480 cgatcttcccagtaac 4761465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 26112791 - 26112906
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26112791 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26112890  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  26112891 cgatcttcccagtaac 26112906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28211271 - 28211156
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28211271 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28211172  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  28211171 cgatcttcccagtaac 28211156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 4542153 - 4542268
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4542153 agaggttgataagcaaggtgattggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4542252  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  4542253 cgatcttcccagtaac 4542268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 17088822 - 17088939
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17088822 agaggttgataagcaaggtgatcagcaaggatgctacctttgattgccatttgagttttgaacacaatatcatattcggacaagagcatctgccatcgtg 17088921  T
Q  101 caatcttcccagtaacag 118  Q
    |||||||||| |||||||    
T  17088922 caatcttccctgtaacag 17088939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27545234 - 27545139
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctc 337  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  || || |||||||| |||||||||||    
T  27545234 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctc 27545139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Original strand, 9136217 - 9136279
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136217 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9483 - 9262
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  9483 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacagg 9384  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9383 ctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgact 9284  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  9283 tgcttctcggtctgtggagctg 9262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9856 - 9729
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9856 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9757  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9756 caatcttcccagtaacagcagctttctc 9729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 130 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9492 - 9279
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9492 aaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttccatacaatagg 9393  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9392 ctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaagcctctgact 9293  T
Q  330 tgtttctcggtctg 343  Q
    ||||||||||||||    
T  9292 tgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9863 - 9738
Alignment:
Q  3 aggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9863 aggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaacatcatattcagacaagagcatctgccagcttgca 9764  T
Q  103 atcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9763 atcttcccagtaacagcagctttctc 9738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16028 - 15807
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16028 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 15929  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15928 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgact 15829  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  15828 tgcttctcggtctgtggagctg 15807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16401 - 16274
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16401 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16302  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16301 caatcttcccagtaacagcagctttctc 16274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13018 - 12797
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13018 aaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 12919  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  12918 ctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctgact 12819  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  12818 tgcttctctgtctgtggagctg 12797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13276
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13391 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13292  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  13291 caatcttcccagtaac 13276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 23000 - 23221
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23000 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 23099  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  23100 ctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 23199  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  23200 tgcttctctgtctgtggagctg 23221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22627 - 22754
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  22627 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtg 22726  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22727 caatctttccagtaacagcagctttctc 22754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11396 - 11175
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11396 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 11297  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  11296 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 11197  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  11196 tgcttctctgtctgtggagctg 11175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11769 - 11654
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11769 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11670  T
Q  101 caatcttcccagtaac 116  Q
    | ||||||||||||||    
T  11669 cgatcttcccagtaac 11654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9469 - 9248
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9469 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 9370  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  9369 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 9270  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  9269 tgcttctctgtctgtggagctg 9248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9842 - 9715
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9842 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9743  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9742 caatcttcccagtaacagcagctttctc 9715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Original strand, 11737 - 11958
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaatagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11737 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacagg 11836  T
Q  230 ttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgact 329  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  11837 ctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgact 11936  T
Q  330 tgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  11937 tgcttctctgtctgtggagctg 11958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11364 - 11491
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11364 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11463  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11464 caatctttccagtaacagcagctttctc 11491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6209
Alignment:
Q  132 ggccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggtt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  5990 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaacaggct 6089  T
Q  232 gattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttg 331  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  6090 ggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttg 6189  T
Q  332 tttctcggtctgtggtgctg 351  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  6190 cttctctgtctgtggagctg 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 5615 - 5746
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5615 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5714  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  5715 caatctttccagtgacggcagctttctcgaag 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23105
Alignment:
Q  273 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 23105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 343
Target Start/End: Original strand, 5484 - 5693
Alignment:
Q  134 ccttccttccacgggtaggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggttga 233  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  5484 ccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttcataccacaggttga 5583  T
Q  234 ttcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtt 333  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5584 tttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaacctctgacttgct 5683  T
Q  334 tctcggtctg 343  Q
    |||| |||||    
T  5684 tctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 5125 - 5238
Alignment:
Q  19 tgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5125 tgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacag 5224  T
Q  119 caggtttctcgaag 132  Q
    |||| |||||||||    
T  5225 caggcttctcgaag 5238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 118769 - 118900
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  118769 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 118868  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaag 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  118869 caatcttcccagtaacaacaggtttctcgaag 118900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 342
Target Start/End: Original strand, 43539 - 43762
Alignment:
Q  130 aaggccttccttccacgggtaggacaaggata-ggtggttccagcaggtaatt-cttgatgctatc--aaaagctccttggcattca--tcgttccatac 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||  |  ||||||||    
T  43539 aaggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatac 43638  T
Q  224 aataggt-tgattcttcctga-gtagcttgaagatcggcccgcaggtt-gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaatcgcccgaggaa 319  Q
    ||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  43639 aataggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaa 43738  T
Q  320 acctctgacttg-tttctcggtct 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  43739 acctctgacttgctttctcggtct 43762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 43146 - 43273
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaaga-tgatcggcaagaat--gctacctttgattgc-tttttgagcctt-gaacacaatgtc-atattcagacaaga-gcatttgc 93  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| || |||||||||||| | |||| |||    
T  43146 agaggttggtaagcaagaatgatcggcaagaaatagctacctttgattgcctttttgagtttttgaacacaatatctatattcagacaaaaagcatctgc 43245  T
Q  94 cagcgtgcaatcttcccagtaacagcag 121  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  43246 caacgtgcaatcttcccagtaacagcag 43273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2102 - 1979
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaat---gctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2102 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaataatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgccatattcagacaagagcatctgccagc 2003  T
Q  98 gtgcaatcttcccagtaacagcag 121  Q
    || ||||||||| |||||||||||    
T  2002 gtccaatcttcctagtaacagcag 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 234 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1266 - 1149
Alignment:
Q  234 ttcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgtt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  1266 ttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgct 1167  T
Q  334 tctcggtctgtggtgctg 351  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  1166 tctcggtctgtggagctg 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22936 - 22809
Alignment:
Q  1 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatttgccagcgtg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22936 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 22837  T
Q  101 caatcttcccagtaacagcaggtttctc 128  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  22836 caatttttccagtaacagcagctttctc 22809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33699
Alignment:
Q  270 gcggtcatgtgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaatcgccc-gaggaaacctctgacttgtttctcg 338  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttgtttctcg 33699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 334
Target Start/End: Original strand, 35168 - 35253
Alignment:
Q  249 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 334  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  35168 ttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaaccctcttacttgttt 35253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29505 - 29443
Alignment:
Q  242 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29505 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University