View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4809-Insertion-9 (Length: 713)

Name: NF4809-Insertion-9
Description: NF4809
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4809-Insertion-9
NF4809-Insertion-9
[»] chr6 (97 HSPs)
chr6 (7-701)||(26885198-26885888)
chr6 (109-701)||(26657093-26657678)
chr6 (109-701)||(26763064-26763649)
chr6 (147-683)||(26803590-26804124)
chr6 (144-629)||(28787438-28787922)
chr6 (144-629)||(28793559-28794043)
chr6 (306-682)||(31285704-31286081)
chr6 (306-629)||(26647679-26648001)
chr6 (306-629)||(26753647-26753969)
chr6 (144-683)||(27680094-27680631)
chr6 (147-683)||(27603211-27603742)
chr6 (299-683)||(27717152-27717537)
chr6 (306-674)||(26624424-26624793)
chr6 (306-674)||(26730401-26730770)
chr6 (306-629)||(26825019-26825341)
chr6 (306-683)||(27426272-27426650)
chr6 (306-683)||(27609780-27610158)
chr6 (306-617)||(26862792-26863102)
chr6 (333-675)||(27704941-27705284)
chr6 (301-683)||(27697241-27697624)
chr6 (306-506)||(27215774-27215974)
chr6 (306-683)||(27529964-27530339)
chr6 (144-628)||(25491820-25492300)
chr6 (306-646)||(25512075-25512413)
chr6 (109-260)||(25075432-25075583)
chr6 (306-474)||(26144222-26144390)
chr6 (306-683)||(25484203-25484581)
chr6 (306-527)||(25581023-25581244)
chr6 (306-474)||(26057276-26057444)
chr6 (306-474)||(26077246-26077414)
chr6 (467-629)||(27336916-27337077)
chr6 (467-629)||(27397656-27397817)
chr6 (296-475)||(26938382-26938561)
chr6 (109-260)||(26850277-26850428)
chr6 (134-260)||(26637193-26637319)
chr6 (134-260)||(26743159-26743285)
chr6 (144-264)||(26624811-26624931)
chr6 (144-264)||(26730788-26730908)
chr6 (296-551)||(29842642-29842897)
chr6 (144-254)||(27609633-27609743)
chr6 (144-254)||(27717012-27717122)
chr6 (339-683)||(27676313-27676658)
chr6 (156-261)||(27697114-27697219)
chr6 (109-261)||(26951295-26951447)
chr6 (113-261)||(26960677-26960825)
chr6 (296-551)||(29827263-29827518)
chr6 (144-273)||(26648010-26648139)
chr6 (144-273)||(26753978-26754107)
chr6 (352-683)||(27591727-27592059)
chr6 (144-260)||(27591528-27591644)
chr6 (109-257)||(27663681-27663829)
chr6 (142-261)||(2186369-2186488)
chr6 (109-261)||(26863123-26863279)
chr6 (144-255)||(31286114-31286225)
chr6 (148-262)||(27704780-27704894)
chr6 (109-257)||(26978936-26979084)
chr6 (144-260)||(27676127-27676243)
chr6 (352-486)||(28296446-28296580)
chr6 (352-486)||(28515493-28515627)
chr6 (144-260)||(26813102-26813218)
chr6 (130-262)||(27529806-27529938)
chr6 (352-571)||(28186651-28186870)
chr6 (352-571)||(28326735-28326954)
chr6 (352-571)||(28504371-28504590)
chr6 (156-262)||(25484607-25484713)
chr6 (144-262)||(26144416-26144534)
chr6 (144-262)||(25546531-25546649)
chr6 (144-262)||(26057470-26057588)
chr6 (144-262)||(26077440-26077558)
chr6 (533-618)||(26636857-26636941)
chr6 (533-618)||(26742823-26742907)
chr6 (170-262)||(28141089-28141181)
chr6 (156-259)||(25581273-25581376)
chr6 (531-618)||(26849923-26850009)
chr6 (170-261)||(29827541-29827632)
chr6 (156-262)||(25512439-25512545)
chr6 (109-255)||(26938581-26938727)
chr6 (296-482)||(27663865-27664050)
chr6 (352-486)||(28182451-28182585)
chr6 (352-486)||(28244137-28244271)
chr6 (144-262)||(29673528-29673646)
chr6 (533-618)||(26960336-26960420)
chr6 (109-262)||(26825376-26825533)
chr6 (296-482)||(2186172-2186358)
chr6 (539-618)||(26950954-26951032)
chr6 (170-261)||(29842528-29842619)
chr6 (408-482)||(26978726-26978800)
chr6 (175-261)||(28096993-28097079)
chr6 (403-506)||(28240679-28240778)
chr6 (170-260)||(29469759-29469849)
chr6 (355-456)||(28097152-28097253)
chr6 (542-618)||(25075078-25075153)
chr6 (538-578)||(26812778-26812818)
chr6 (190-262)||(28150726-28150798)
chr6 (339-482)||(25075213-25075356)
chr6 (408-482)||(26960471-26960545)
chr6 (205-262)||(29759026-29759083)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (109-572)||(28131974-28132427)
chr1 (286-675)||(28126315-28126705)
chr1 (306-621)||(267000-267314)
chr1 (109-262)||(28126162-28126315)
chr1 (294-482)||(26137234-26137422)
chr1 (130-262)||(266848-266980)
chr1 (144-261)||(26137434-26137551)
chr1 (144-257)||(5921988-5922101)
chr1 (568-629)||(28163298-28163358)
chr1 (397-519)||(5922220-5922342)
chr1 (540-618)||(26137099-26137176)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (144-629)||(8687-9168)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (144-597)||(1-450)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (296-629)||(12325-12657)
scaffold0277 (296-629)||(3362-3694)
scaffold0277 (144-259)||(3216-3331)
scaffold0277 (144-259)||(12179-12294)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (306-628)||(29272498-29272819)
chr8 (296-506)||(35984621-35984837)
chr8 (144-237)||(29272351-29272444)
chr8 (144-261)||(16371647-16371764)
chr8 (170-262)||(12590286-12590378)
chr8 (352-425)||(12590144-12590217)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (299-683)||(2192-2577)
scaffold0349 (144-254)||(2052-2162)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (306-683)||(60713-61091)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (306-683)||(18074905-18075283)
chr4 (364-675)||(18722799-18723111)
chr4 (340-675)||(18654167-18654503)
chr4 (109-260)||(18653960-18654111)
chr4 (109-260)||(18678040-18678191)
chr4 (109-264)||(18729978-18730133)
chr4 (364-675)||(18678274-18678586)
chr4 (109-260)||(18722553-18722704)
chr4 (340-629)||(18688316-18688604)
chr4 (364-675)||(18730218-18730530)
chr4 (109-260)||(18697883-18698034)
chr4 (392-675)||(18698142-18698426)
chr4 (109-260)||(18688097-18688248)
chr4 (297-629)||(5089601-5089932)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (119-431)||(17991688-17992000)
chr2 (403-508)||(3280979-3281084)
chr2 (540-618)||(17992109-17992186)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (298-571)||(56946-57219)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (352-486)||(44299-44433)
scaffold0038 (403-506)||(40841-40940)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (352-517)||(238571-238736)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (301-413)||(615211-615323)
chr3 (204-262)||(615341-615399)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 560; Significance: 0; HSPs: 97)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 26885888 - 26885198
Alignment:
Q  7 ataatatatagagaaatagatatgtaatgaagtggtnnnnnnnctagtatgagatgataagtccataaagagcaaaatcatgattnnnnnnnnnnnnnnn 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||                   
T  26885888 ataatatatagagaaatagatatgtaatgaagtggtaaaaaaactagtatgagatgataagtccataaagagaaaaatcatggttaaaactaaaacaaaa 26885789  T
Q  107 nnttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttga 206  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885788 aattgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttga 26885689  T
Q  207 ttcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaag 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885688 ttcttgccgaacgatttctttacccatgtcctctaccaagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttctcgctgaacggtattgagtattaatctttaag 26885589  T
Q  307 agagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagc 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26885588 agagatttttcgaccaacactccaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacaccctttgaagc 26885489  T
Q  407 aacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcata 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885488 aacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcata 26885389  T
Q  507 tccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgc 606  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26885388 tccatctagtgtactcttccatgtttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaa-ggaaggcccgaagcatatgaaactgc 26885290  T
Q  607 acggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtctctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttcttttccccatatagccctt 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  26885289 acggtttaaaatctcttcataacct-aaaggaactttgtctttaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttcttt--cccatatatccctt 26885198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 109 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 26657678 - 26657093
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26657678 ttgttcatagatatcaatcttacggtatctttctgtaaaacatgaactatgtcattgtgacaccataacctactacgttctccgggctctttacttgatt 26657579  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagag 308  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||| ||| || |   |    | ||  ||| |||||||||| || |||    
T  26657578 cttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatcaaatcgtgtaatgccacatcatcattatat---gaccgatggctttgtgtattaatctctatgag 26657482  T
Q  309 agatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaa 408  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||  || || |||| |||| |||  ||    
T  26657481 agatttttcaaccaacactccaacatgatgttttatgcaatgaccatagtgagcaagaagtgtctcttcgacctcactcaatctacatcctttgaaaaaa 26657382  T
Q  409 caagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatc 508  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26657381 caagctatatctaaaaagacactttgctcctcttcctccaaatcatcatagcttactttaagtatctcttgaatctttttattgggaatcttttcatatc 26657282  T
Q  509 catctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcac 608  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26657281 catctaatgtactcttccatttttcgatgctctttccaaacaagtttgaagccactacttctataact-aagggaagtcctgaagcatatgaaactgcac 26657183  T
Q  609 ggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtctctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttcttttccccatatagccctt 701  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||    
T  26657182 ggcttaaaatttcttcataacct-gaaggaacattgtctctaaaagccatccatctcaacaattcaagtgcttctgt--cccatatagccctt 26657093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 109 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 26763649 - 26763064
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26763649 ttgttcatagatatcaatcttacggtatctttctgtaaaacatgaactatgtcattgtgacaccataacctactacgttctccgggctctttacttgatt 26763550  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagag 308  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||| ||| || |   |    | ||  ||| |||||||||| || |||    
T  26763549 cttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatcaaatcgtgtaatgccacatcatcattatat---gaccgatggctttgtgtattaatctctatgag 26763453  T
Q  309 agatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaa 408  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||  || || |||| |||| |||  ||    
T  26763452 agatttttcaaccaacactccaacatgatgttttatgcaatgaccatagtgagcaagaagtgtctcttcgacctcactcaatctacatcctttgaaaaaa 26763353  T
Q  409 caagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatc 508  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26763352 caagctatatctaaaaagacactttgctcctcttcctccaaatcatcatagcttactttaagtatctcttgaatctttttattgggaatcttttcatatc 26763253  T
Q  509 catctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcac 608  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26763252 catctaatgtactcttccatttttcgatgctctttccaaacaagtttgaagccactacttctataact-aagggaagtcctgaagcatatgaaactgcac 26763154  T
Q  609 ggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtctctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttcttttccccatatagccctt 701  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||    
T  26763153 ggcttaaaatttcttcataacct-gaaggaacattgtctctaaaagccatccatctcaacaattcaagtgcttctgt--cccatatagccctt 26763064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 147 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26804124 - 26803590
Alignment:
Q  147 aacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaag 246  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  26804124 aacatgaactatatcttcatgacgccataacctacttcgtttttcaggatctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctttatcaag 26804025  T
Q  247 tcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgc 346  Q
    ||||||| | | ||| || ||  |  ||   | ||| ||||   |||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||||    
T  26804024 tcatgtactcttacaacatcaatagatc---ccgaatggtaacaagtactaatcttaatgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgttatgc 26803928  T
Q  347 aatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctc 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||  ||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  26803927 aatggccataatgaacatgaagtatatcttcaaactcctcccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctcttcctc 26803828  T
Q  447 taaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttcca 546  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  26803827 caaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttttatgctctttcca 26803728  T
Q  547 aacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttg-- 644  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||      
T  26803727 aacaagttggaacccactatctctaaaact-aagggaagacctgaagcatatgaaactgcacgatttaaaatgtcttcataa-cttgaaggtactttgtt 26803630  T
Q  645 -tctctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
     | | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26803629 atttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 26803590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28787922 - 28787438
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||| || | |    
T  28787922 taaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcttctatc 28787823  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtatta---atctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgtt 340  Q
    |||||||||||| ||||||||  |  |  ||   | ||| ||||   |||| ||   ||||| | ||||||||||||  |||||||| | | |||||||     
T  28787822 aagtcatgtaatctcacatcataaatagatc---ccgaatggtaagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtg 28787726  T
Q  341 ttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   ||| | ||| |||| ||||||||| || || || ||||| |||||||| | |||    
T  28787725 ttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaaactcctcccactcacatcctttgaagcaacatgcaatgtctagaaaaacactttgttgctc 28787626  T
Q  441 ttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctc 540  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||  ||    
T  28787625 ttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaaagtacccttccattcttctatcgtc 28787526  T
Q  541 tttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  28787525 tttccaaacaagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcccgaagcataagaaactgcacgatttaaaacgtcttcataac 28787438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28794043 - 28793559
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||| || | |    
T  28794043 taaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcttctatc 28793944  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtatta---atctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgtt 340  Q
    |||||||||||| ||||||||  |  |  ||   | ||| ||||   |||| ||   ||||| | ||||||||||||  |||||||| | | |||||||     
T  28793943 aagtcatgtaatctcacatcataaatagatc---ccgaatggtaagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtg 28793847  T
Q  341 ttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   ||| | ||| |||| ||||||||| || || || ||||| |||||||| | |||    
T  28793846 ttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaaactcctcccactcacatcctttgaagcaacatgcaatgtctagaaaaacactttgttgctc 28793747  T
Q  441 ttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctc 540  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||  ||    
T  28793746 ttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaaagtacccttccattcttctatcgtc 28793647  T
Q  541 tttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  28793646 tttccaaacaagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcccgaagcatacgaaactgcacgatttaaaacgtcttcataac 28793559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 306 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 31286081 - 31285704
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||   || |||| ||||    
T  31286081 gagagatttttcagccaacacttctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagcatggagtatatctttgacatccgcccatccgcatcctttgaag 31285982  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  31285981 caacaagcaatgtccagaaagacactctgctcctcttcttccaaagcatcatagcttactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcttgtcat 31285882  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||    
T  31285881 acccatctaatgtactcttccatttttctatgctctttccaaacaagtttgaacccactacttctataact-aatggaaggccagaagaatatgcaactg 31285783  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttc 682  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||   | |||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  31285782 cacggtttaaaatgtcttcgtaacct-gaaggaactttgtcacttttaaaagccatccaccttaacaattcaagagcttc 31285704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 306 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 26648001 - 26647679
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||   |||| |||| |||| ||||    
T  26648001 gagagatttttcagccaacactccaagatgatgtgttatgcaatggccataatgataacgaagtatatcttcaaactcctcccatctacatcctttgaag 26647902  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26647901 caacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctcttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcat 26647802  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26647801 atccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccatataagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcctgaagcatatgaaactg 26647703  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  26647702 cacggtttaaaacgtcttcataac 26647679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 306 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 26753969 - 26753647
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||   |||| |||| |||| ||||    
T  26753969 gagagatttttcagccaacactccaagatgatgtgttatgcaatggccataatgataacgaagtatatcttcaaactcctcccatctacatcctttgaag 26753870  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26753869 caacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctcttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcat 26753770  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26753769 atccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccatataagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcctgaagcatatgaaactg 26753671  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  26753670 cacggtttaaaacgtcttcataac 26753647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 144 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27680631 - 27680094
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||  | |    
T  27680631 taaaacatgaattatatcttcttgacgccataacctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctttatc 27680532  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgtttta 343  Q
    |||||||||||| ||||||||  |  |  ||   | ||| |||| | |||| ||||||| | |||||||||| |  |||||||| | | ||||||| |||    
T  27680531 aagtcatgtaatctcacatcattaatagatc---ccgaagggtaataagtactaatcttaacgagagattttccagccaacactcctagatgatgtgtta 27680435  T
Q  344 tgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttc 443  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||| | | |||| |||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  27680434 tgcaatggtcataatgagcacaaagtatatcttcgaactccttccattgatatcctttgaagcagcaagcgatgtcaagaaagacactctgctcctcttc 27680335  T
Q  444 ctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctcttt 543  Q
     || |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| ||||||| ||||  ||||||   |||||||||||||    
T  27680334 ttccaaagcatcatagctcaccttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcatacccatctaatgtatgcttccaatcttctatgctcttt 27680235  T
Q  544 ccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaacttt 643  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  27680234 ccaaacaagttagaacccactacttctaaaact-aacggaaggccaaaagcatatgcaactgcacggtttaaaatgtcttcgtaacct-gaaggaacttt 27680137  T
Q  644 gtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
     ||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27680136 atcacttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 27680094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 147 - 683
Target Start/End: Original strand, 27603211 - 27603742
Alignment:
Q  147 aacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaag 246  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  27603211 aacatgaactatatcgtcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaag 27603310  T
Q  247 tcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgc 346  Q
    | ||| | |||||| | |  |  |  ||   | ||| ||||   ||||  |||||  |  |||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||||    
T  27603311 ttatgcagtgtcactttataaatagatc---cagaatggta---agtacaaatctgaacaagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgttatgc 27603404  T
Q  347 aatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctc 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  | ||  ||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  27603405 aatggccataatgagcacgaagtatatcttcaaccacttccaatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctcttcctc 27603504  T
Q  447 taaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttcca 546  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||  |||||| |||||||||    
T  27603505 caaagcatcatagcttactttaagaatctcgtggatctttttattgggaatcttctcatatccttctaacgtacccttccattcttctatcctctttcca 27603604  T
Q  547 aacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgt- 645  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| |||||||     
T  27603605 aacaagttggaacccactacttccaaaact-aagggaagtcctgaagcatatgaaactgcacggtttaaaacgtcttcataaact-gaaggtactttgtt 27603702  T
Q  646 -ctc-taaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
      || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27603703 attcttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 27603742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 299 - 683
Target Start/End: Original strand, 27717152 - 27717537
Alignment:
Q  299 tctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacaccc 398  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || | | |||  ||||||||| |     
T  27717152 tctttatgagagatttttcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagaattaagtatatatttggcatcttcccatttacatct 27717251  T
Q  399 ttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatc 498  Q
    || |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  27717252 tttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactttgctgctcttcctccaaagcatcataacttactttaagtatcttttggatctctttattgggaatc 27717351  T
Q  499 ttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatat 598  Q
     | ||||| ||||||| |||| ||||||||   |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27717352 ctgtcatacccatctaatgtattcttccattcctctatgttctttccagataagttagaacccactatttctataact-aacggaaggccagaagcatat 27717450  T
Q  599 gaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27717451 gcaactgcacggtttaaaatctcttcgtaacct-gaaggaacattgtcacttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 27717537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 306 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 26624793 - 26624424
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    |||| |||| || ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||  ||| ||||   ||    
T  26624793 gagacatttgtcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagcatatcttcgaactccctccatccacatcctttcgag 26624694  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||    
T  26624693 caacaagcaatatctagaaagacactctgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 26624594  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  26624593 acccatctaatgtatacttccattcttctatgctctttccaaacaagttggaacccacaatttctaaaact-aacggaaggccagaagcatatgcaactg 26624495  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattca 674  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  26624494 cacggtttaaaatgtcttcataacct-gaaggaactttgtcacttttaaaagccatccacctcaacaattca 26624424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 306 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 26730770 - 26730401
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    |||| |||| || ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||  ||| ||||   ||    
T  26730770 gagacatttgtcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagcatatcttcgaactccctccatccacatcctttcgag 26730671  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||    
T  26730670 caacaagcaatatctagaaagacactctgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 26730571  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  26730570 acccatctaatgtatacttccattcttctatgctctttccaaacaagttggaacccacaatttctaaaact-aacggaaggccagaagcatatgcaactg 26730472  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattca 674  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  26730471 cacggtttaaaatgtcttcataacct-gaaggaactttgtcacttttaaaagccatccacctcaacaattca 26730401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 306 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 26825341 - 26825019
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||   |||  ||    ||| ||||    
T  26825341 gagagatttttctgccaacacttgaacatgatgttttatgcaatggccgtaatgagtacgaagtatatcttcgaactcctcccaactatgttctttgaag 26825242  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || || || |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  26825241 caacaagcaatgtcgaggaaaacactttgttgctcttcttccaaagcatcatagcttactctaagtatctcttggatctttttgtcaggaatcctttcat 26825142  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26825141 atccatctaatgcacccttccatatttgtatgctctttccaaacaaattggaacccactatttctaatact-aagggaaggcccgaagcatatgaaactg 26825043  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  26825042 cacggtttaaaatgtgttcataac 26825019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 306 - 683
Target Start/End: Original strand, 27426272 - 27426650
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  27426272 gagacatttttcaactagcacttcaacatgatgatttatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgaccttttcccatttacaacctttgaag 27426371  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27426372 caacaagcaatgtctagaaagacactttgctcctcttcctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatcttttcat 27426471  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | | ||||| |||| |||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||||     
T  27426472 accaatctaatgtattcttgcattcttctatgttctttccaaacaagttagaacccactatttctataact-accggaaggccagaagcataagcaacta 27426570  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    |||| || ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27426571 cacgattcaaaatcttttcataa-cttgaaggaactttgtcatttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 27426650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 306 - 683
Target Start/End: Original strand, 27609780 - 27610158
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatat-cttcgacctctgtccatttacacccttcgaa 404  Q
    ||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | | |||  ||| ||| | |||| |||    
T  27609780 gagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgttatggaatggccataatgagaatgaagtgtatactttg-catcttcccaattatatcctttgaa 27609878  T
Q  405 gcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttca 504  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | |||    
T  27609879 gcaacaagcaatgtccagaaagacactttgctcctcttcttccaaagaatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtca 27609978  T
Q  505 tatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaact 604  Q
    || ||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||     
T  27609979 tacccatctaatgtatacttccattcctctatgttctttccaaacaagttagaacccactatttctataact-aacggaaggccagaagcatatgcaaca 27610077  T
Q  605 gcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27610078 gcacggtttaaaatctcttcgtaacct-gaaggaacattgtcacttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 27610158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 306 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 26863102 - 26862792
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||   | ||||||||||||||  ||| ||||  ||| ||||| |||     
T  26863102 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttttatgcatcggccataatgatatttaagtatatcttcgaattctatccagctaccccctttgaaa 26863003  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  26863002 caacaagcaatatctagaaagacactttgctgctcttcttccaaagcatcatagcttactttaagtatcctttggatctctttattgggaatcttttcat 26862903  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | ||||||| ||| |  | ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  26862902 acccatctaatgtgcattgccattcttccatgctctttccaaacaagttagaacccactatttcgagaact-aacggaaggccggaagcatatgcaactg 26862804  T
Q  606 cacggtttaaaa 617  Q
    ||||||||||||    
T  26862803 cacggtttaaaa 26862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 333 - 675
Target Start/End: Original strand, 27704941 - 27705284
Alignment:
Q  333 atgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactt 432  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||  ||||||||||| || || |||||||||||     
T  27704941 atgatgtgttatacaatggtcataatgagaatgaagtatattttcaacctctgtcaatctatacccttttaagcaacaagcaatgtcaagaaagacactc 27705040  T
Q  433 tgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatattt 532  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||  ||    
T  27705041 tgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactctaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcatacccatctaatgtattcttccattctt 27705140  T
Q  533 ctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataaccta 632  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27705141 ctatgttcttgccaaacaagttagaacccattacttctaaaact-aacggaaggccagaagcatatgcaactgcacggtttaaaatgtcttcataacct- 27705238  T
Q  633 aaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaa 675  Q
     ||||||| |||||   | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  27705239 gaaggaacgttgtcatttttaaaagccatccacctcaacaattcaa 27705284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 301 - 683
Target Start/End: Original strand, 27697241 - 27697624
Alignment:
Q  301 tttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacaccctt 400  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||  ||||  |   ||||    
T  27697241 tttatgagagatttttcagccaacactgctagatgatgtgttatggaatggccataatgagcatgaagcatatatttggcatcttcccatccatgtcctt 27697340  T
Q  401 cgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatctt 500  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||| |||||| |    
T  27697341 tgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactttgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactctaagtatcttttggatctctttattgggaatcct 27697440  T
Q  501 ttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatga 600  Q
     ||||| ||||||| | ||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  27697441 gtcatacccatctaatatatacttccattcttctatgttctttccaaacaagttagaacccactatttctataact-aacggaaggccagaaacatatga 27697539  T
Q  601 aactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | ||||  | ||||| |||||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27697540 aactgcacgacttaaaatctctttgt-accttgatggaacattgtcacttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 27697624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 306 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27215974 - 27215774
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27215974 gagagatttttcggccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgggcatgaagtatatctttgacctttgtccatttacaccctttgaag 27215875  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27215874 caacaagcaatgtctagaaagacactcttctccttttcctccagagcatcatagctgactttaagtatcctttggatctctttattgggaatcttttcat 27215775  T
Q  506 a 506  Q
    |    
T  27215774 a 27215774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 306 - 683
Target Start/End: Original strand, 27529964 - 27530339
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27529964 gagagatttttcagccaaaactgcaacatgatgtactatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgacctctggccatttacaccctttgaag 27530063  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| | |||| ||||| | |||||    
T  27530064 caacaagcaatgtctagaaagacactttgctcttctttctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatttcttcat 27530163  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | ||||||| ||||||| |  |   || || |||| |||||| ||| ||||| || | |||| | ||| || || |||||||| |||||||| | || ||    
T  27530164 acccatctaatgtactcattgaatcttgtacgctccttccaaccaaattggaccctattattacaatagct-aatggaaggccagaagcataagtaagtg 27530262  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtctctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||| || ||| | || |||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  27530263 cacggtttaaaatgtcttcatga-cttgaaggaacattttctttgaaagccatccacctcaacaattcgagagcttct 27530339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 628
Target Start/End: Original strand, 25491820 - 25492300
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |    
T  25491820 taaaacttgaaccatatcatcgggacaccacaacctactacgttctccaggatcattacgtgattcttgtcgaacgacttctttacccatgtgctctatc 25491919  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgtttta 343  Q
    |||| |||||||||  |||||  |  || ||   |  || |||||  |||| | || |||| || ||||||||   |||||  | ||| |||||  ||||    
T  25491920 aagttatgtaatgtttcatcatgaatatatc---ccaaagggtatatagtagttatatttatgaaagattttttagccaactttccaagatgatagttta 25492016  T
Q  344 tgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttc 443  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || | |||||| || |||| |||| ||||||  || || ||||||| ||| ||||||| |||    
T  25492017 cgcaatggccataatgatcatgaagtatatttttgacatccgcccatttccaacctttgaagaaacaagtcatgtctagaaagatactctgctccttttc 25492116  T
Q  444 ctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctcttt 543  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||   ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||    
T  25492117 ctccaaagcatcatagctcactctaagtatcttttggatctctttattgaaaatcttttcatactcatctaatgtacacttccattcttctatgctattt 25492216  T
Q  544 ccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataa 628  Q
    |||||||| || || || | |||| ||| | || || |||||||| |||||||| | || |||| |  ||||||| |||||||||    
T  25492217 ccaaacaaatttgaccctattattactaaagct-aatggaaggccagaagcataggtaattgcaagtgttaaaatgtcttcataa 25492300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 306 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 25512413 - 25512075
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || | |||||||||| |||||| ||||    
T  25512413 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtattttttttacttttgtccatttataccctttgaag 25512314  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
     ||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | | |||  ||||| |||||||    
T  25512313 taacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcat 25512214  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    |  |||||| ||||| ||||||   |||||   || |||||||||| ||||  || | | || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||     
T  25512213 actcatctaatgtacgcttccaatcttctaccttccttccaaacaaattggcccctattgttactatagct-aacggaaggccagatgcataagtaacta 25512115  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  25512114 cacggtttaaaatctcttcataa-cttgaaggaactttgtc 25512075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25075583 - 25075432
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25075583 ttgttcataaatattattcttactttgttgttctgtaaaacatcaaatatatcatcgtgataccacaacctactacgttctccaggctctttaattgatt 25075484  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25075483 catgtcggacgatttctttacccatgtcctctaacaagtcatgtaatgtcac 25075432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 306 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26144390 - 26144222
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26144390 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccattcacaccctttgaag 26144291  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatc 474  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26144290 caacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatc 26144222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 306 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25484581 - 25484203
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || | |||||||||| |||||| ||||    
T  25484581 gagacatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtattttttttacttttgtccatttataccctttgaag 25484482  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
     ||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | | |||  ||||| |||||||    
T  25484481 taacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcat 25484382  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    |  |||||| ||||| ||||||   |||||   || |||||||||| |||   || | | || ||||  || ||||| ||||| || ||||| | ||||     
T  25484381 actcatctaatgtacgcttccaatcttctaccttccttccaaacaaattgccccctattgttactattgct-aagggcaggccagatgcataagtaacta 25484283  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||   | |||| ||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  25484282 cacggtttaaaatctcttcataa-cttgaaggaactttgtcatttttaaaagccattcgcctcaacaattcaagagcttct 25484203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 306 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25581244 - 25581023
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25581244 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccatttacaccctttgaag 25581145  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || ||||||||||| | ||||| |   || |||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | | |||| ||||| |||||||    
T  25581144 caacaagcaatgtctagaaagacactcttctcctttggttccaaagcatcatagctaacttgaagtatcctttggatatctttattgggaatattttcat 25581045  T
Q  506 atccatctagtgtactcttcca 527  Q
    |  |||||| | ||| ||||||    
T  25581044 actcatctaatatacgcttcca 25581023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 306 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26057444 - 26057276
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26057444 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgggatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccatttacaccctttgaag 26057345  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatc 474  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26057344 caacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatc 26057276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 306 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26077414 - 26077246
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26077414 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgggatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccatttacaccctttgaag 26077315  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatc 474  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26077314 caacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatc 26077246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 629
Target Start/End: Original strand, 27336916 - 27337077
Alignment:
Q  467 taagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactat 566  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||| |||||| | ||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27336916 taagtatcttttgtatctctttattgggaatcctgtcatacccatctaatgtgttcttccatacttctatgttctttccaaacaagttagaacccactat 27337015  T
Q  567 ttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27337016 ttctaaaact-aagggaatgcccgaaccatatgaaactgcacggtttaaaacatcttcataac 27337077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 629
Target Start/End: Original strand, 27397656 - 27397817
Alignment:
Q  467 taagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactat 566  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||| |||||| | ||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27397656 taagtatcttttgtatctctttattgggaatcctgtcatacccatctaatgtgttcttccatacttctatgttctttccaaacaagttagaacccactat 27397755  T
Q  567 ttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27397756 ttctaaaact-aagggaatgcccgaaccatatgaaactgcacggtttaaaacatcttcataac 27397817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26938561 - 26938382
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttaca 395  Q
    ||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | || ||||    
T  26938561 taatctttatgagagatttattaaccaacactccaacatgattttttatgcaatgaccataatgagcatgaagtttatcttcaacctcagccaatctaca 26938462  T
Q  396 cccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatct 475  Q
    ||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| || |||  |||| |||||||| |||||||||    
T  26938461 cccattgaagcaacacgtaatatccagaaagacactttgttcttcttcatccaaacaatcaaagcttactctaagtatct 26938382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26850428 - 26850277
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||| ||   ||||||||||||| ||||||    
T  26850428 ttgttcatagaaatcaatcttactgtgttttcttgtaaaacatgaacaatatcatcacaacaccacaacctactgcgccttccaggctctttaattgatt 26850329  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26850328 cttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcac 26850277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26637319 - 26637193
Alignment:
Q  134 tgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccat 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  26637319 tgtttttctgtaaaacatgaactatatcgtcatgacaccacaacctactgcgttctccaggcttattacgtgattcttgtcggacgatttctatacccat 26637220  T
Q  234 gtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||    
T  26637219 atcctctatcaagtcatgtaatgtcac 26637193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26743285 - 26743159
Alignment:
Q  134 tgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccat 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  26743285 tgtttttctgtaaaacatgaactatatcgtcatgacaccacaacctactgcgttctccaggcttattacgtgattcttgtcggacgatttctatacccat 26743186  T
Q  234 gtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||    
T  26743185 atcctctatcaagtcatgtaatgtcac 26743159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26624931 - 26624811
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |    
T  26624931 taaaacatgaaatatatcatcttgacaccataatctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgattgctttacccatgtcctctatc 26624832  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatca 264  Q
    ||||||||||| |||| ||||    
T  26624831 aagtcatgtaaggtcatatca 26624811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26730908 - 26730788
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |    
T  26730908 taaaacatgaaatatatcatcttgacaccataatctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgattgctttacccatgtcctctatc 26730809  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatca 264  Q
    ||||||||||| |||| ||||    
T  26730808 aagtcatgtaaggtcatatca 26730788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 296 - 551
Target Start/End: Original strand, 29842642 - 29842897
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttaca 395  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| || |||| || ||||  ||| |||||||| ||||||  | | | | |    
T  29842642 taatctttatgagagttttttcgaccaacactccaatatgatattctatgcattgaccatgataagcacaaagaatatcttcaacctctcccaaatcata 29842741  T
Q  396 cccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattagga 495  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| | ||||||||    
T  29842742 ccctttgaagcaacaagcaatgtcgagaaaaacaccttgttcgtcttcctccaaagcatcaaagcttattttaagtatattgtggatctctttattagga 29842841  T
Q  496 atcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaa 551  Q
    ||| ||||||| | ||||| ||||   ||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  29842842 atcctttcatacctatctaatgtagatttccattcttctatattctttccaaacaa 29842897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 27609633 - 27609743
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |    
T  27609633 taaaacacgaactatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 27609732  T
Q  244 aagtcatgtaa 254  Q
    |||||||||||    
T  27609733 aagtcatgtaa 27609743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 27717012 - 27717122
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |    
T  27717012 taaaacacgaactatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 27717111  T
Q  244 aagtcatgtaa 254  Q
    |||||||||||    
T  27717112 aagtcatgtaa 27717122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 339 - 683
Target Start/End: Original strand, 27676313 - 27676658
Alignment:
Q  339 ttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcc 438  Q
    |||||||| ||  |||||||||  ||||||||| | |||||| |||  | || |||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  27676313 ttttatgctataaccataatgatgatgaagtatctgttcgacttcttccaatctacatcctttgatgcaacaagcaatatccaaaaagacactctgctcc 27676412  T
Q  439 tcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgc 538  Q
    ||||| || |||||||||||||| | | ||||||||| |||||| | | |||  |||||  || ||||   ||||| ||||  ||  |||  | | || |    
T  27676413 tcttcgtccaaagcatcatagctcagtctaagtatcttttggatatctttatgtggaattcttccatacttatctaatgtagactcacattctgcaatac 27676512  T
Q  539 tctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaagga 638  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || || |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  27676513 tctttccaaacaagttagaacccactacttctatcgct-aatggaaggccagaagcatatacaactgcacgctttaaaatgtcttcataa-cttgaagga 27676610  T
Q  639 actttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    ||||| ||   | |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  27676611 actttctcatttttaaaagccttccacctcaacaattcaagagcttct 27676658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 261
Target Start/End: Original strand, 27697114 - 27697219
Alignment:
Q  156 tatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaat 255  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27697114 tatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttagttgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaat 27697213  T
Q  256 gtcaca 261  Q
    ||||||    
T  27697214 gtcaca 27697219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26951447 - 26951295
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  26951447 ttgttcacagatatcaatcttactgtgttttcttgtaaaacatgaacaatatcatcacgagaccacaacctactgcgttctccaggttctctaattgatt 26951348  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcaca 261  Q
    |||| || | ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26951347 cttgtcggatgatttctatacccatatcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 26951295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26960825 - 26960677
Alignment:
Q  113 tcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26960825 tcatatatatcaatcttacttttttttcttgtaaaacatgaactatatcatcacgacaccacaacctactgcgttttccaggctctttaattgattcctg 26960726  T
Q  213 ccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcaca 261  Q
     ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26960725 tcgaacaatttccatacccatatcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 26960677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29827518 - 29827263
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttaca 395  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  || |||| |||||||  ||| ||||||| |||||||  | | | | |    
T  29827518 taatctgtatgagagttttttcgaccaacactccaatatgatattctatgctttgaccatgatgagcacaaagaatatctttgacctctcccaaatcata 29827419  T
Q  396 cccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattagga 495  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  29827418 ccctttgaagcaacaagcaatgtcgagaaaaacaccttgttcatcttcctccaaagcatcaaaacttattttaagtatattttggatctctttattagga 29827319  T
Q  496 atcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaa 551  Q
    ||| ||||||||| ||||| | ||   ||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  29827318 atcctttcatatctatctaatatagatttccattcttctatattctttccaaacaa 29827263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26648139 - 26648010
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||||||||||  | |    
T  26648139 taaaacatgaactatttcatcttgacaccataacctactttgttctccaggctctttacgtgattcttgtcggactacttccttacccatgtcctttatc 26648040  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgattt 273  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  26648039 aagtcatgtaatctcagataaccatgattt 26648010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26754107 - 26753978
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||||||||||  | |    
T  26754107 taaaacatgaactatttcatcttgacaccataacctactttgttctccaggctctttacgtgattcttgtcggactacttccttacccatgtcctttatc 26754008  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgattt 273  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  26754007 aagtcatgtaatctcagataaccatgattt 26753978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 352 - 683
Target Start/End: Original strand, 27591727 - 27592059
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatt-tacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaa 450  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| | | |||| | |||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  27591727 ccataatgagcatgaagtatctgtttgactt-tctccaatctacatcctttgatgcaacaagcaatatccaaaaagacactctgctcctcttcttccaaa 27591825  T
Q  451 gcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaaca 550  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| |||||| | | |||  |||||  || ||||   ||||| ||||  ||  |||  | | || |||||||||||||    
T  27591826 gcatcatagctgagtctaagtatcttttggatatctttatgtggaattcttccatacttatctaatgtagactcacattctgcaatactctttccaaaca 27591925  T
Q  551 agttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---t 647  Q
    |||| |||||||||| ||||||  || || |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||   |    
T  27591926 agttagaacccactacttctatcgct-aatggaaggccagaagcatatacaactgcacgctttaaaatgtcttcataa-cttgaaggaactttctcattt 27592023  T
Q  648 ctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
     |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  27592024 ttaaaagccttccacctcaacaattcaagagcttct 27592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Original strand, 27591528 - 27591644
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| | |    
T  27591528 taaaacatgaactatatcatcttgagaccataacctgcttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgacctctatc 27591627  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcac 260  Q
    || ||||||||||||||    
T  27591628 aattcatgtaatgtcac 27591644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 257
Target Start/End: Original strand, 27663681 - 27663829
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  27663681 ttgttcatagatatcaatcttactgtgttttgttttaaaacatgagctatatcatcatgacgccacaacctagtgcgctctccaggctctttaattgatt 27663780  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgt 257  Q
    |||| || || |||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  27663781 cttgtcggactatttctatacccatatactctatcaagtcatgtaatgt 27663829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2186488 - 2186369
Alignment:
Q  142 tgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctcca 241  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  2186488 tgtaaaacaggaactatatcttcatgggaccacaacctactacgttttccaggctcttttggtgattcttgtcgtacgatttctttacccatttcctcta 2186389  T
Q  242 ccaagtcatgtaatgtcaca 261  Q
     |||||||||||||||||||    
T  2186388 tcaagtcatgtaatgtcaca 2186369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26863279 - 26863123
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttac----agtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttactt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||| |  | |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||       
T  26863279 ttgttcataaatatcaatcttactcacagtgttttcttctaaaacgtggattatatcatcatgacaccataacctacttcgttcacccggctctttagga 26863180  T
Q  205 gattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcaca 261  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26863179 gattcttgtcggacgatttctttgcccatgtcctctatcaagtcatgtaatctcaca 26863123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31286225 - 31286114
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |    
T  31286225 taaagcatgaactatatcatcttgacaccatagcctacttctttctcctggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 31286126  T
Q  244 aagtcatgtaat 255  Q
    ||||||||||||    
T  31286125 aagtcatgtaat 31286114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 27704780 - 27704894
Alignment:
Q  148 acatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagt 247  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  27704780 acattaactatatcatcatggcagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatatcctctatcaagt 27704879  T
Q  248 catgtaatgtcacat 262  Q
     ||||||||||||||    
T  27704880 tatgtaatgtcacat 27704894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26979084 - 26978936
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||  ||   ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26979084 ttgttcacagatatcaaacttactgtgttttcttgtaaaacatgaactatactattacgacaccacaacctactgcgttctccaggttctttaattgatt 26978985  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgt 257  Q
    |||| || ||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  26978984 cttgtcggacgatttctatacccatatcctctatcaagtaatgtaatgt 26978936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Original strand, 27676127 - 27676243
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||| || || | ||||||||||||| |||| | |    
T  27676127 taaaacatgaactatatcatcttgagaccataacctgcttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggaccacttctttacccatgacctctatc 27676226  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcac 260  Q
    || ||||||||||||||    
T  27676227 aattcatgtaatgtcac 27676243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Original strand, 28296446 - 28296580
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||| || ||| | | |||| |||||| ||||| || || ||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  28296446 ccataatgagcatgaagtatattttcaagttctttcaattcatatcctttgaagcagcaagcgatgtcaagaaaaacatttttctcatcttcctccaaag 28296545  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatcttt 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28296546 catcaaagcttactttaagtatctcttggatcttt 28296580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28515627 - 28515493
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||| || ||| | | |||| |||||| ||||| || || ||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  28515627 ccataatgagcatgaagtatattttcaagttctttcaattcatatcctttgaagcagcaagcgatgtcaagaaaaacatttttctcatcttcctccaaag 28515528  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatcttt 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28515527 catcaaagcttactttaagtatctcttggatcttt 28515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26813218 - 26813102
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||| |  |||||||||  | || |||||||||||| ||| ||| | |    
T  26813218 taaaacatgaactatatcatcttgacaccatagcctacttcgttctcctggttcttcaggtgattcttgttggacaatttctttacccgtgtgctctatc 26813119  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcac 260  Q
    |||||||||||||||||    
T  26813118 aagtcatgtaatgtcac 26813102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 262
Target Start/End: Original strand, 27529806 - 27529938
Alignment:
Q  130 acagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttac 229  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||   | | |||| |||||||| |||||||||||||| |    ||||||||| || |||| ||||||||    
T  27529806 acagtgtttttttttaaaacatgaactatatcacgctcaaaccacaacctactgcgttctccaggctcatcgggtgattcttgtcggacgacttctttac 27529905  T
Q  230 ccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27529906 ccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 27529938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28186870 - 28186651
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  ||| || ||| | | |||| |||||| ||||| || || ||||| ||| |||| ||  ||||| | ||||    
T  28186870 ccataatgagcatgaagtacatcttcaagttctttcaattcatatcctttgaagcagcaagcgatgtcgagaaaaacattttgttctgcttcccccaaag 28186771  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaa 551  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||   || || || |   ||||||  | ||||  |||||||||||||    
T  28186770 catcaaagcttactttgagtatctcttggatctttttatcgggaatcctttcatactgatttaatgcagatttccattctcctatattctttccaaacaa 28186671  T
Q  552 gttggaacccactatttcta 571  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  28186670 gttggaacccactacttcta 28186651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28326954 - 28326735
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||| | | || | |||||| ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||    
T  28326954 ccataatgagcatgaagtatatcttcaagttctttcaattcatatccattgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatcttcatccaaag 28326855  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaa 551  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||   || || || |   || |||  | ||||  |||||||||||||    
T  28326854 catcaaagcttactttaagtatcgcttggatctttttaatgggaatcctttcatactgatataatgcagatttacattctactatattctttccaaacaa 28326755  T
Q  552 gttggaacccactatttcta 571  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  28326754 gttggaacccactacttcta 28326735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28504590 - 28504371
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||| | | || | |||||| ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||    
T  28504590 ccataatgagcatgaagtatatcttcaagttctttcaattcatatccattgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatcttcatccaaag 28504491  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaa 551  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||   || || || |   || |||  | ||||  |||||||||||||    
T  28504490 catcaaagcttactttaagtatcgcttggatctttttaatgggaatcctttcatactgatataatgcagatttacattctactatattctttccaaacaa 28504391  T
Q  552 gttggaacccactatttcta 571  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  28504390 gttggaacccactacttcta 28504371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25484713 - 25484607
Alignment:
Q  156 tatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaat 255  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  25484713 tatatcatcgtgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttcttgggagattcttgtcgaacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaag 25484614  T
Q  256 gtcacat 262  Q
    |||||||    
T  25484613 gtcacat 25484607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26144534 - 26144416
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  ||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |    
T  26144534 taaaacgttaactatatcatcgggaaaccacaacctactgcgttctccaggcttgttgggagattcttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatc 26144435  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26144434 aagtcatgtaaggtcacat 26144416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25546649 - 25546531
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  ||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |    
T  25546649 taaaacgttaactatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttgttgggagattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 25546550  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  25546549 aagtcatgtaaggtcacat 25546531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26057588 - 26057470
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  ||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |    
T  26057588 taaaacgttaactatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttattgggagattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 26057489  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26057488 aagtcatgtaaggtcacat 26057470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26077558 - 26077440
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  ||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |    
T  26077558 taaaacgttaactatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttcttgggagattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 26077459  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26077458 aagtcatgtaaggtcacat 26077440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 533 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26636941 - 26636857
Alignment:
Q  533 ctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26636941 ctatactctttccaaacaagttggaacccactacttctaaagct-aatggaaggccagaagcatatttaactgcacggtttaaaat 26636857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 533 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26742907 - 26742823
Alignment:
Q  533 ctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26742907 ctatactctttccaaacaagttggaacccactacttctaaagct-aatggaaggccagaagcatatttaactgcacggtttaaaat 26742823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28141181 - 28141089
Alignment:
Q  170 accataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28141181 accataatctactccgtttcccaggctcttttggtgattcttgtcgaacaatttctttacccatctcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 28141089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25581376 - 25581273
Alignment:
Q  156 tatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaat 255  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |  ||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  25581376 tatatcatcgtgaaaccacaacctactgcgttctccagggttcttgggagattcttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaag 25581277  T
Q  256 gtca 259  Q
    ||||    
T  25581276 gtca 25581273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26850009 - 26849923
Alignment:
Q  531 ttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  26850009 ttctatactctttccaaacaagttggaacccactacttctaaagct-aatggaaggccagaagcatatttaactgcacgatttaaaat 26849923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29827632 - 29827541
Alignment:
Q  170 accataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcaca 261  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||| || || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  29827632 accacaacctactacgctttccaggctctttcggtgattcttgtcgtacaatttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtaatgtcaca 29827541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25512545 - 25512439
Alignment:
Q  156 tatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaat 255  Q
    |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  ||    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  25512545 tatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttgttgggagattcttgtcggacggtttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaag 25512446  T
Q  256 gtcacat 262  Q
    |||||||    
T  25512445 gtcacat 25512439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26938727 - 26938581
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    |||||||||  |||||||||||| || || |  | ||| |||||||||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||| ||||||   |||||    
T  26938727 ttgttcatacttatcaatcttaccgtattttcttttaatacatgaactatatctttgtcaaaccacaatctagtgcgttctccagcctctttgactgatt 26938628  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaat 255  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26938627 cttgtctaacaatttctttacccatgtcctcaatcaagtcatgtaat 26938581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 482
Target Start/End: Original strand, 27663865 - 27664050
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttaca 395  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||||||  |||||||||| | ||  ||||||||||||||   |||||| | |||   || |||| ||| | |||    
T  27663865 taatctttatgagagattcatcaaccaacactctaacatgatgtgtcattgaatggccataatgaaattgaagtgtctctgaaacttctg-ccaatcaca 27663963  T
Q  396 cccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 482  Q
     |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |  ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27663964 tcctttgaagcaacaagcaatatccaaaaagacactctgttgttcttcttccaaagtatcaaagcttactttaagtatcttttggat 27664050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28182585 - 28182451
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||| || | | | | ||||  ||| ||||||  || |||||||| ||| | ||||| || ||||| | ||    
T  28182585 ccataatgagcatgaaatatatcttcaacttctttcaaatcatatccttttaagaaacaagaaatgtccagaaaaacattctgctcatcatcctccagag 28182486  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatcttt 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28182485 catcatagctaactttaagtatctcttggatcttt 28182451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28244271 - 28244137
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  ||| || | ||| | |||| |||||| ||||| || || ||||| ||| | ||||| |||| ||| ||||    
T  28244271 ccataatgagcataaagtatatcttcaagttctttcaaattatatcctttgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatctttctccaaag 28244172  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatcttt 486  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28244171 catcaaagcttactttaagtatctcctgtatcttt 28244137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Original strand, 29673528 - 29673646
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| |||| |||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||| |||| |  || |||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  29673528 taaaacttgaattatatcttcggaaaaccataacctactacgttttccaggatcttcaggtgcttcttgtctaacaatttcttttcccatatcctctacc 29673627  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    || ||||||||||||||||    
T  29673628 aaatcatgtaatgtcacat 29673646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 533 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26960420 - 26960336
Alignment:
Q  533 ctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26960420 ctatactcttgccaaacaagttggaacccactacttctaaagct-aatggaaggccagaagcatatttaactgcacggtttaaaat 26960336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26825533 - 26825376
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttaca----gtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttactt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||   ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||| || ||||| || |||||||||  |    
T  26825533 ttgttcataaatatcaatcttactcactgtgtttccctgcaaaacatgaataatatcattgtgacaccacagcctgctgcgttcaccgggctctttagat 26825434  T
Q  205 gattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    |||| ||| || || | |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  26825433 gattgttgtcggactacttctttgcccatgtcctttatcaagtcatgtaatgtcacat 26825376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2186358 - 2186172
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtcca-tttac 394  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| | |||    
T  2186358 taatctttatgagtgatttttcaaccaacactccaatatgatttttgatgcaataagtataatgagcatcaagtatatcttggaactct-tccagtctac 2186260  T
Q  395 acccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 482  Q
    | |||| |||  ||||||| || || ||||||| ||| |  || || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  2186259 atcctttgaaaaaacaagcaatgtcgagaaagagactcttatcttcctcctgcaaagcatcaaagctgactttaagtatctgttggat 2186172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 539 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26951032 - 26950954
Alignment:
Q  539 tctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || || |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  26951032 tctttccaaacaagttagaacccactacttctaaagct-aatggaaggccagcagcatatttaactgcacggtttaaaat 26950954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 261
Target Start/End: Original strand, 29842528 - 29842619
Alignment:
Q  170 accataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcaca 261  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||||||  |||||||| | || || ||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  29842528 accacaacctactatgctttccaggctctttcgttgattctggtcgtacaatttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtagtgtcaca 29842619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26978800 - 26978726
Alignment:
Q  408 acaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| || |  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26978800 acaagcaatatccaaaaagacactctgttgttcttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggat 26978726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Original strand, 28096993 - 28097079
Alignment:
Q  175 aacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcaca 261  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||   ||||||||| |  || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  28096993 aacctgctacgttttccaggttcttttggtgattcttgtcttacaatttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtaatgtcaca 28097079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 28240778 - 28240679
Alignment:
Q  403 aagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatctttt 502  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |    ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||    
T  28240778 aagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactttgctcatctttctccaaagcatcaaa----actttaagtatcttttggatctctttatttggaatccttt 28240683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29469849 - 29469759
Alignment:
Q  170 accataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||| |  ||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  29469849 accataacctactgcgttttccaggatcttcaggtgattcttgtctaacaatttctttccccatatcctctatcaaatcatgtaatgtcac 29469759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 456
Target Start/End: Original strand, 28097152 - 28097253
Alignment:
Q  355 taatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcat 454  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||||| || || ||||| |||||   ||| |||||||| |||||||    
T  28097152 taatgagcacaaagcatatcttccacctctttcaatttataccctttgaagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactcctctcatcttcctccaaagcat 28097251  T
Q  455 ca 456  Q
    ||    
T  28097252 ca 28097253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 25075153 - 25075078
Alignment:
Q  542 ttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| || |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    
T  25075153 ttccaaacaagttggaacccacaacttctaaagctaatgg-aaggccagaagcatatttaattgcacggtttaaaat 25075078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 538 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26812818 - 26812778
Alignment:
Q  538 ctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaa 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26812818 ctctttccaaacaagttggaacccactacttctatagctaa 26812778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28150798 - 28150726
Alignment:
Q  190 ccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    |||||||||||   ||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  28150798 ccaggctcttttggtgattcttgtcgtacaatttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtaatgttacat 28150726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25075356 - 25075213
Alignment:
Q  339 ttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcc 438  Q
    |||||||||||| |||||||||   | |||||| |||||||| | || | ||| |||||  |  ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |      
T  25075356 ttttatgcaatgaccataatgatattcaagtatctcttcgacatatgccgattcacaccaattaaagaaacaagcaatatccaaaaagacactctgttgt 25075257  T
Q  439 tcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 482  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25075256 tcttcgtccaaagcgtcaaagcttactttaagtattttttggat 25075213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 408 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26960545 - 26960471
Alignment:
Q  408 acaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| || |  |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26960545 acaagcaatatccaaaaagacactctgttgttcttcagccaaagcgtcatagcttactttaagtatcttttggat 26960471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 262
Target Start/End: Original strand, 29759026 - 29759083
Alignment:
Q  205 gattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  29759026 gattcttgtctaacaatttctttacccatatcctctaccaaatcatgcaatgtcacat 29759083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 109 - 572
Target Start/End: Original strand, 28131974 - 28132427
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||    
T  28131974 ttgttcatagatatcaatcttaccgtgtttttctgtaga-catgaactatatcattgtgacaccataacctactgcgttctccaggttccttacacgatt 28132072  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagag 308  Q
    |||   | ||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||   ||        ||| | ||| |||| ||||||| || |||    
T  28132073 ctttatggacgatttctttacctgtgtcttctatcaagtcatgtaatgtcacatcaacgacat--------gaaag-tatcgagtcttaatctctatgag 28132163  T
Q  309 agatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaa 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| || || |||| | |||||||    
T  28132164 agatttttcgaccaacactccaacatgatgttttatgcaatggccattatgagcatgaagtatctcttcgaccattgtcaatctataccccttgaagcaa 28132263  T
Q  409 caagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatc 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28132264 caagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctccaaagcatcgtaacttactttaaatatctcatggatctttttattaggaatcttttcatatc 28132363  T
Q  509 catctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctat 572  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28132364 catctaatgtacacttccattcttctatgctctttccaaataagtttgaacccactatttctat 28132427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 286 - 675
Target Start/End: Original strand, 28126315 - 28126705
Alignment:
Q  286 tattgagtattaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctg 385  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  28126315 tattgagtattaatctcaatgagagatttttcaaccaacactccaacatgatgctttatgcaatggccataatgagcatgaagtatcttttcaacctctg 28126414  T
Q  386 tccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctt 485  Q
    || || || |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28126415 tcaatctataccctttgaagcagcaagctatatcgagaaagacactttgctcatcttcctccaaagcatcatagcttagtttaaatatctcttggatctt 28126514  T
Q  486 tgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaag 585  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28126515 tttatttggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccaaataagttggaacccactatttctataact-aagggaag 28126613  T
Q  586 gcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttg---tctctaaaggccagccacctcaacaattcaa 675  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||  |||||||||||   | | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  28126614 gcctgaagcatatgaaactgcccggtttaaaacatcatcataa-cttgaaggaactttgttatgtttaaaagccatccacctcaacaattcaa 28126705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 306 - 621
Target Start/End: Original strand, 267000 - 267314
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | | |||  ||||| | | |||| ||||    
T  267000 gagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgttatgcagtggccataatgagaatgaagtatatgtttggcatcttcccattcatatcctttgaag 267099  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  267100 caacaagcaatgtctaaaaagacactctgctcctcttcttccaaaccatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcttatcat 267199  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||| | |||||    
T  267200 acccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccaaacaagttagaacccacaatttctaaaact-aacggaaggccagaagcataagcaactg 267298  T
Q  606 cacggtttaaaatctc 621  Q
    ||||  ||||||||||    
T  267299 cacgaattaaaatctc 267314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Original strand, 28126162 - 28126315
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  28126162 ttgttcatagatatcaatcttaccgtgtttttctgtagaacatgaactatatcattgtgacaccataacctgttgcgttctccaggctctttacgtgatt 28126261  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28126262 ctttccggacgatttctttacccgtatcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 28126315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26137422 - 26137234
Alignment:
Q  294 attaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccattta 393  Q
    ||||||||| | ||||| ||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||| |||||| |||||    
T  26137422 attaatcttcatgagagctttatcaaccaacactccaacatgactttttatgcaatggtcataacgagcatgaagtatcttttggacttctgtcaattta 26137323  T
Q  394 cacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 482  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  26137322 caccctttgaagcaacaagcaatatccaaaaatacactttgttgttcttcgtccaaagcatcatagcttactctaagtatgttttggat 26137234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 262
Target Start/End: Original strand, 266848 - 266980
Alignment:
Q  130 acagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttac 229  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || || | ||||||||    
T  266848 acagtgtttttatttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttggcggaccacttctttac 266947  T
Q  230 ccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  266948 ccatgtcctctatcatgtcatgtaatgtcacat 266980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26137551 - 26137434
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||   ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| | |    
T  26137551 taaaacatgaactatatcttcatgaaaccacaacctactgcgttttccaggttctttgggtgattcttgtcggacaatttctttacccatatcctctatc 26137452  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcaca 261  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  26137451 aagtcatgtaatgccaca 26137434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 5921988 - 5922101
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || | ||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| | |    
T  5921988 taaaacttgaactatatcttcagggcaccataacctactgcgctttccaggctctttcggtgattcttgtctaacaatttcttttcccatgtcctctatc 5922087  T
Q  244 aagtcatgtaatgt 257  Q
    |  |||||||||||    
T  5922088 acatcatgtaatgt 5922101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 568 - 629
Target Start/End: Original strand, 28163298 - 28163358
Alignment:
Q  568 tctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  28163298 tctataactaa-gggaaggcctgaagcatatgaaactgcacgatttaaaacatcttcataac 28163358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 519
Target Start/End: Original strand, 5922220 - 5922342
Alignment:
Q  397 ccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaa 496  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || | |  ||| |||||| ||| |||||    
T  5922220 cctttgaagcaacaagcaatatcaagaaaaacacttttctcttcttcttccaaagcatcaaagctcacttttagcaacgtttgcatctttttatcaggaa 5922319  T
Q  497 tcttttcatatccatctagtgta 519  Q
    || ||||||| | ||||| ||||    
T  5922320 tcctttcataacgatctaatgta 5922342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 540 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26137176 - 26137099
Alignment:
Q  540 ctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||    
T  26137176 ctttccaaacaagctggaacccactacttctaaagct-aacggaaggccagaagcatatttaactgcactgtttaaaat 26137099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 144 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 9168 - 8687
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||   |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |      
T  9168 taaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctcctggctctttaggcgattcttgtcgtacgacttctttacccatgtcctctata 9069  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgtttta 343  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  |  ||   | |||    |   | || ||||||| | ||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||    
T  9068 aagtcatgtaatgtcacatgattaatagatc---ccgaataagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtttta 8972  T
Q  344 tgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttc 443  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||  |||||  ||| |||| ||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||    
T  8971 tgcaatggccataatgagcacgtagtatatcttcaaactccttccatccacatcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctcttc 8872  T
Q  444 ctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctcttt 543  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  |||||    
T  8871 ctccaaagcatcataacttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtcttt 8772  T
Q  544 ccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  8771 ccaaacaagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacgatttaaaacgtcttcataac 8687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 144 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 450 - 1
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||   |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |      
T  450 taaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctcctggctctttaggcgattcttgtcgtacgacttctttacccatgtcctctata 351  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgtttta 343  Q
    ||||||||||||||||||| |  |  |  ||   | |||    |   | || ||||||| | ||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||    
T  350 aagtcatgtaatgtcacatgattaatagatc---ccgaataagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtttta 254  T
Q  344 tgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttc 443  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||  |||||  ||| |||| ||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||    
T  253 tgcaatggccataatgagcacgtagtatatcttcaaactccttccatccacatcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctcttc 154  T
Q  444 ctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctcttt 543  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  |||||    
T  153 ctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtcttt 54  T
Q  544 ccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcata 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53 ccaaacaagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcccgaagcata 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 296 - 629
Target Start/End: Original strand, 12325 - 12657
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttaca 395  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  |||||  |||    
T  12325 taatcttaacgagagatttttcagccaacactactagatgatgtgttatgcgatggccataatgagcacgaagtatatattcaaactccttccatccaca 12424  T
Q  396 cccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattagga 495  Q
     |||| ||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  12425 tcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctcttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattggga 12524  T
Q  496 atcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagca 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12525 atcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtctttccaaacaagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcccgaagca 12623  T
Q  596 tatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12624 tatgaaactgcacgatttaaaacgtcttcataac 12657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 296 - 629
Target Start/End: Original strand, 3362 - 3694
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttaca 395  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||   ||||  |||    
T  3362 taatcttaacgagagatttttcagccaacactactagatgatgtgttatgcgatggccataatgagcacgaagtatatattcaaactcctcccatccaca 3461  T
Q  396 cccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattagga 495  Q
     |||| ||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    
T  3462 tcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctcttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctggtggatctttttattggga 3561  T
Q  496 atcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagca 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3562 atcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtctttccaaacaagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcccgaagca 3660  T
Q  596 tatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  3661 tatgaaactgcacgatttaaaacgtcttcataac 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 259
Target Start/End: Original strand, 3216 - 3331
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||  | |    
T  3216 taaaacattaactatatcatcttcacaccataatctacttctttctccaggctctttgggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctttatc 3315  T
Q  244 aagtcatgtaatgtca 259  Q
    |||||||||| |||||    
T  3316 aagtcatgtagtgtca 3331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 259
Target Start/End: Original strand, 12179 - 12294
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||  | |    
T  12179 taaaacattaactatatcatcttcacaccataatctacttctttctccaggctctttgggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctttatc 12278  T
Q  244 aagtcatgtaatgtca 259  Q
    |||||||||| |||||    
T  12279 aagtcatgtagtgtca 12294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 306 - 628
Target Start/End: Original strand, 29272498 - 29272819
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    ||||||||||||  |||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |||  ||||| ||| |||| ||||    
T  29272498 gagagatttttcagccaatactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagaatgaagtatatatttggcatcttcccattcacaacctttgaag 29272597  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||    
T  29272598 caacaagcaatgtccagaaagacactttgttgctcttcttccaaagcatcataacttactttaagtatctggtggatccttttattgggaatcttttcat 29272697  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29272698 atccatctaatgtacccttccattcttctatcctctttccaaacaagttggaacccactatttctaaaact-aagggaaggcccgaagcatatgaaactg 29272796  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataa 628  Q
    |||| |||||||  |||||||||    
T  29272797 cacgatttaaaacgtcttcataa 29272819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 35984837 - 35984621
Alignment:
Q  296 taatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccattta-c 394  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| |||| ||| || |||| | ||||| |    
T  35984837 taatctttatgagagatttttcaaccaatactccaatatgatatttcatgcaagcatcataatgagcatgaagcatattttctacatctgccaatttatc 35984738  T
Q  395 ac-----ccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgta 489  Q
    |      ||| || || ||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | ||    
T  35984737 atttgttcctccgtagaaacaagcaatgtcaagaaaaacactttgctcatcttcctctaaagcatcaaaacttactttaagtatcttttggatgtcttta 35984638  T
Q  490 ttaggaatcttttcata 506  Q
    ||||||||  |||||||    
T  35984637 ttaggaatggtttcata 35984621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Original strand, 29272351 - 29272444
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcc 237  Q
    ||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  29272351 taaaacacgaactagatcatcctggcagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcc 29272444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Original strand, 16371647 - 16371764
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    |||||| ||||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||| || ||||| ||   ||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||    
T  16371647 taaaacttgaactacatcattgacaaaccataacctactacgttcgcctggctcctttggtgattcttgtcggacaatttctttacccatgtcttctacc 16371746  T
Q  244 aagtcatgtaatgtcaca 261  Q
    | || |||||||||||||    
T  16371747 aggttatgtaatgtcaca 16371764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12590378 - 12590286
Alignment:
Q  170 accataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||    ||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12590378 accataacctactacgttttccaggattttccggtgattcttgtctaactatttctttccccatatcctctaccaaatcatgtaatgtcacat 12590286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12590217 - 12590144
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaa 425  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  12590217 ccatgatgagcatgaagtatttcttcgacccttgtcaatttccatcctttgaagcaacaagcaatatcaagaaa 12590144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 299 - 683
Target Start/End: Original strand, 2192 - 2577
Alignment:
Q  299 tctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacaccc 398  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || | | |||  ||||||||| |     
T  2192 tctttatgagagatttttcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagaattaagtatatatttggcatcttcccatttacatct 2291  T
Q  399 ttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatc 498  Q
    || |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  2292 tttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactttgctgctcttcctccaaagcatcataacttactttaagtatcttttggatctctttattgggaatc 2391  T
Q  499 ttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatat 598  Q
     | ||||| ||||||| |||| ||||||||   |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2392 ctgtcatacccatctaatgtattcttccattcctctatgttctttccagataagttagaacccactatttctataact-aacggaaggccagaagcatat 2490  T
Q  599 gaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2491 gcaactgcacggtttaaaatctcttcgtaacct-gaaggaacattgtcacttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 2577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 2052 - 2162
Alignment:
Q  144 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccacc 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |    
T  2052 taaaacacgaactatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 2151  T
Q  244 aagtcatgtaa 254  Q
    |||||||||||    
T  2152 aagtcatgtaa 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 306 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 61091 - 60713
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  61091 gagacatttttcaactagcacttcaacatgatgatttatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgaccttttcccatttacaacctttgaag 60992  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  60991 caacaagcaatgtctagaaagacactttgctcctcttcctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatcttttcat 60892  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | | ||||| |||| |||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||||     
T  60891 accaatctaatgtattcttgcattcttctatgttctttccaaacaagttagaacccactatttctataact-accggaaggccagaagcataagcaacta 60793  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    |||| || ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  60792 cacgattcaaaatcttttcataa-cttgaaggaactttgtcatttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 306 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18075283 - 18074905
Alignment:
Q  306 gagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaag 405  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  18075283 gagacatttttcaactagcacttcaacatgatgatttatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgaccttttcccatttacaacctttgaag 18075184  T
Q  406 caacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcat 505  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18075183 caacaagcaatgtctagaaagacactttgctcctcttcctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatcttttcat 18075084  T
Q  506 atccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactg 605  Q
    | | ||||| |||| |||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||||     
T  18075083 accaatctaatgtattcttgcattcttctatgttctttccaaacaagttagaacccactatttctataact-accggaaggccagaagcataagcaacta 18074985  T
Q  606 cacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaaaagcttct 683  Q
    |||| || ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||   | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18074984 cacgattcaaaatcttttcataa-cttgaaggaactttgtcatttttaaaagccatccacctcaacaattcaagagcttct 18074905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 675
Target Start/End: Original strand, 18722799 - 18723111
Alignment:
Q  364 tgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagctta 463  Q
    |||||||| |||||||| |||| | || |||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||  | ||||||||| ||||||    
T  18722799 tgaagtatctcttcgacttctgccaatctacatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcgcccaaagcatcaaagctta 18722898  T
Q  464 ctttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccac 563  Q
    |||||||||||| |||||| | |  ||  |||||  |||||||   ||||| ||||  ||  |||  | | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18722899 ctttaagtatcttttggatatcttcatctggaattctttcatacatatctaatgtagactcacattctgcaatactctttccaaacaagttggaacccac 18722998  T
Q  564 tatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgt---ctctaaaggccagcc 660  Q
    || ||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    | |||| |||| ||    
T  18722999 tacttctatagct-aatggaaggccagaagcatacgcaactgctcggtttaaaatctcttcataa-cttgaaggaactttgtaacttttaaaagccatcc 18723096  T
Q  661 acctcaacaattcaa 675  Q
    |||||||||||||||    
T  18723097 acctcaacaattcaa 18723111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 340 - 675
Target Start/End: Original strand, 18654167 - 18654503
Alignment:
Q  340 tttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcct 439  Q
    ||||||||||  |||||||||   |||||||| |||||||| |||| | || |||| |||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |    
T  18654167 tttatgcaataaccataatgactttgaagtatctcttcgacttctgccaatctacatcctttgaacaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgtt 18654266  T
Q  440 cttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgct 539  Q
    |||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | |  ||  |||||  |||||||   ||||| ||||   |  |||  | | || ||    
T  18654267 cttcatccaaagcatcaaaacttactttaagtatcttttggatatcttcatgtggaattctttcatacttatctaatgtagattcacattctgcaatact 18654366  T
Q  540 ctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaa 639  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  18654367 ctttccaaacaagttggaacccacgacttctatagctaatgg-aaggccagaagcatacgcaactgcacggtttaaaatctcttcataa-cttgaaggaa 18654464  T
Q  640 ctttgt---ctctaaaggccagccacctcaacaattcaa 675  Q
    ||||||    | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  18654465 ctttgtaaattttaaaagccatccacctcaacaattcaa 18654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 18653960 - 18654111
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||  |||||    
T  18653960 ttgttcatagatatcaatcttactttgttttcctgtaaaatatgaactatgtcattgcgacaccacaacctactacgcttttcaggctgtttaggtgatt 18654059  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18654060 ctttccggacgatttctttacccatgacctctagcaagtcatgtaatgtcac 18654111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 18678040 - 18678191
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||   |||||    
T  18678040 ttgttcatagatatcaatcttactttgttttcctgtaaaatatgaactatgtcattgcgacaccacaacctactacgcttttcaggctctttgggtgatt 18678139  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18678140 ctttccggacgatttctttacccatgacctctagcaagtcatgtaatgtcac 18678191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Original strand, 18729978 - 18730133
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||| | | ||||||||||   |||||    
T  18729978 ttgttcatagatatcaatcttactttgttttcctgtaaaatatgaattatgtcatcgcgacaccacaaccgactacgcttttcaggctctttgggtgatt 18730077  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacatca 264  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18730078 ctttccggacgatttctttacccatgacctctagcaagtcatgtaatgtcacatca 18730133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 364 - 675
Target Start/End: Original strand, 18678274 - 18678586
Alignment:
Q  364 tgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagctta 463  Q
    |||||||| |||||||| |||| | || |||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||| || ||||||||| ||||||    
T  18678274 tgaagtatctcttcgacttctgccaatctacatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacaatttgttgttcttcgtccaaagcatcaaagctta 18678373  T
Q  464 ctttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccac 563  Q
    |||||||||||| |||||| | |  ||  |||||  |||||||   ||||| ||||  ||  |||  |   ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18678374 ctttaagtatcttttggatatcttcatgtggaattctttcatacttatctaatgtagactcacattctgaaatattctttccaaacaagttggaacccac 18678473  T
Q  564 tatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgt---ctctaaaggccagcc 660  Q
    || ||||||| || || |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    | |||| |||| ||    
T  18678474 tacttctatagct-aatggaaggccagaagcatacacaactgcacgttttaaaatctcttcataa-cttgaaggaactttgtaacttttaaaagccatcc 18678571  T
Q  661 acctcaacaattcaa 675  Q
    |||||||||||||||    
T  18678572 acctcaacaattcaa 18678586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 18722553 - 18722704
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| | | |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||    
T  18722553 ttgttcatagatatcaatcttactttgttttccagtaaaatatgaactatgtcatcacgacaccacaaccgactacgtttttcaggctctttaggtgatt 18722652  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    |||  |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18722653 ctttacgaatgatttctttacccatgacctctagcaagtcatgtaatgtcac 18722704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 629
Target Start/End: Original strand, 18688316 - 18688604
Alignment:
Q  340 tttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcct 439  Q
    ||||||||||  |||||||||   | |||||| |||||||| | || | || |||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |    
T  18688316 tttatgcaataaccataatgaagtttaagtatctcttcgacttttgccaatatacatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgtt 18688415  T
Q  440 cttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgct 539  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |   || |||||  ||| |||   ||||| ||||  ||  |||  |   || ||    
T  18688416 cttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggatatcttcgtttggaattctttgatacttatctaatgtagactcacattctgaaatact 18688515  T
Q  540 ctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688516 ctttccaaacaagttggaacccactacttctatagct-aatggaaggccagaagcatacacgactgcacggtttaaaatctcttcataac 18688604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 364 - 675
Target Start/End: Original strand, 18730218 - 18730530
Alignment:
Q  364 tgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagctta 463  Q
    |||||||| |||||||| |||| | || |||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||| ||||||    
T  18730218 tgaagtatctcttcgacttctgccaatctacatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcgtccaaagcatcaaagctta 18730317  T
Q  464 ctttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccac 563  Q
    |||||||||||| |||||| | |  ||  |||||  |||||||   ||||| ||||   |  |||  | | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18730318 ctttaagtatcttttggatatcttcatgtggaattctttcatacttatctaatgtagaatcacattctgcaaaactctttccaaacaagttggaacccac 18730417  T
Q  564 tatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttg---tctctaaaggccagcc 660  Q
    || ||||| | || || |||||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||   | | |||| |||| ||    
T  18730418 tacttctagagct-aatggaaggccagaagcatacacaactgcatggttaaaaatctcttcataa-cttgaaggaactttgtaatttttaaaagccatcc 18730515  T
Q  661 acctcaacaattcaa 675  Q
    |||||||||||||||    
T  18730516 acctcaacaattcaa 18730530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 18697883 - 18698034
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || | |||||| | | ||||||||||   |||||    
T  18697883 ttgttcatagatatcaatcttactttgttttcctgtaaaatatgaattatgtcatcgcgacaccacaatcgactacgcttttcaggctctttgggtgatt 18697982  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18697983 ctttccggacgatttctttacccatggcctctagcaagtcatgtaatgtcac 18698034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 392 - 675
Target Start/End: Original strand, 18698142 - 18698426
Alignment:
Q  392 tacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtatt 491  Q
    |||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |  ||     
T  18698142 tacatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggatatcttcatg 18698241  T
Q  492 aggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccga 591  Q
     |||||  |||||||   ||||| ||||   |  |||  | | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| ||    
T  18698242 tggaattctttcatacttatctaatgtagagtcacattctgcaaaactctttccaaacaagttggaacccactacttctagagctaatgg-aaggccaga 18698340  T
Q  592 agcatatgaaactgcacggtttaaaatctcttcataacctaaaaggaactttgtc---tctaaaggccagccacctcaacaattcaa 675  Q
    ||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||    | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  18698341 agcatacacaactgcatggttaaaaatctcttcataacttgaa-ggaactttgtaatttttaaaagccatccacctcaacaattcaa 18698426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 18688097 - 18688248
Alignment:
Q  109 ttgttcataaatatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgatt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||  |||| ||| ||| |  ||||||| |||| |||||| | | |||||||||||  |||||    
T  18688097 ttgttcatagatatcaatcttactttgttttcctgtaaaatttgaattatgtcaccacgacaccacaaccgactacgcttttcaggctctttaggtgatt 18688196  T
Q  209 cttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcac 260  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  18688197 ctttccggacaatttctttacccatgacctctagcaagtcatgtaatgtcac 18688248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 629
Target Start/End: Original strand, 5089601 - 5089932
Alignment:
Q  297 aatctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacac 396  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||  | | | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||   | |  || |     
T  5089601 aatctttatgagagatttatcaaccaactttcctatatgatatttcatgcaataaccataatgagcacaaagtatatattcgacctcatccaagctatat 5089700  T
Q  397 ccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaa 496  Q
    |||| ||| |||||||| || || || || ||||| ||||| | |||  |||||  || | |||| ||| ||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  5089701 cctttgaaacaacaagcaatgtcgaggaaaacactctgctcatattcacctaaattattaaagctcactataagtatcttttggatttctttattaggaa 5089800  T
Q  497 tcttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcat 596  Q
    || |||||||  ||||||||  |   |||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||   || |||||||| |||||||    
T  5089801 tcctttcatactcatctagtaaagatttccatttttctatatcctttccaaacaaattggaacccacaacttcta-aagccaatggaaggccagaagcat 5089899  T
Q  597 atgaaactgcacggtttaaaatctcttcataac 629  Q
    | |  ||  |||||||||||||  |||||||||    
T  5089900 aagttaccacacggtttaaaattccttcataac 5089932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 431
Target Start/End: Original strand, 17991688 - 17992000
Alignment:
Q  119 atatcaatcttacagtgttcttctgtaaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaac 218  Q
    |||| |||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||  | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17991688 atatgaatcttactgtattttcctgtaaaacatgaactatgtcattataacaccacaatctactccgttctccaggctctttaggtgattcttgccgaac 17991787  T
Q  219 gatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttcttgctgaacggtattgagtattaatctttaagagagatttttcg 318  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||  |||| ||    | |  ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     
T  17991788 gatttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtactgtaacatagacatcatgagatccccaatagtatttagtattaatctttatgagagatttatca 17991887  T
Q  319 accaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatat 418  Q
    ||||||||||| |  ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| | || | ||  |  | ||| |||||||||||| ||||    
T  17991888 accaacacttcgaggtggctttttatgcaatgaccataatgaccatgaagcatttcttcgacatatgccaatacatgctctttgaagcaacaagcaatat 17991987  T
Q  419 ccagaaagacact 431  Q
    ||| |||||||||    
T  17991988 ccaaaaagacact 17992000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3281084 - 3280979
Alignment:
Q  403 aagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatctttt 502  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||  || |||| | ||||||||||| |||    
T  3281084 aagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactttgctcgtcttcctccaaagcatcaaaactcactttaagtatcttctgaatctctttattaggaatccttt 3280985  T
Q  503 catatc 508  Q
    ||||||    
T  3280984 catatc 3280979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 540 - 618
Target Start/End: Original strand, 17992109 - 17992186
Alignment:
Q  540 ctttccaaacaagttggaacccactatttctataactaaagggaaggcccgaagcatatgaaactgcacggtttaaaat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||| | |||||||  |||| |||||||||||||    
T  17992109 ctttccaaacaagttggaacccactacttctaaagctaatggg-aggccagcagcatatttaactacacggtttaaaat 17992186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 571
Target Start/End: Original strand, 56946 - 57219
Alignment:
Q  298 atctttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacc 397  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||  ||  |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |  | | ||| |    
T  56946 atctttatgagagatttttcatgcaacactctaatttgatgtttcatgcagctaccataatgagcatgaagtatatcttcaacttcttttaaatcacatc 57045  T
Q  398 cttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaat 497  Q
    |||| ||| ||||||  || || ||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  57046 cttctaagaaacaagaaatgtcgagaaaaacattcttctcatcttcctccaaagcatcaaagcttactttaagtatctcttggatctttttaatgggaat 57145  T
Q  498 cttttcatatccatctagtgtactcttccatatttctatgctctttccaaacaagttggaacccactatttcta 571  Q
    | |||||||   || || || |   ||||||  | ||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  57146 cctttcatactgatttaatgcagatttccattctcctatattctttccaaacaagttcgaacccactacttcta 57219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 44433 - 44299
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  ||| || | ||| | |||| |||||| ||||| || || ||||| ||| | ||||| |||| ||| ||||    
T  44433 ccataatgagcataaagtatatcttcaagttctttcaaattatatcctttgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatctttctccaaag 44334  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatcttt 486  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44333 catcaaagcttactttaagtatctcctgtatcttt 44299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 40940 - 40841
Alignment:
Q  403 aagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatctttt 502  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |    ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||    
T  40940 aagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactttgctcatctttctccaaagcatcaaa----actttaagtatcttttggatctctttatttggaatccttt 40845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 517
Target Start/End: Original strand, 238571 - 238736
Alignment:
Q  352 ccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacacccttcgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctctaaag 451  Q
    |||| |||||||| ||| || | |||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||| || || || ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  238571 ccatgatgagcataaagaatttgttcgacccttgtcaatttatatcctttgaagcaacatgcaatgtcaagaaaaacaattttctcttcttcctgtaaag 238670  T
Q  452 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtg 517  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||| ||| |||||  |||||| | | ||||||||    
T  238671 catcatagcttagttgtagtgtcatttggatctttttatgaggaactttttcaaaacgatctagtg 238736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 615323 - 615211
Alignment:
Q  301 tttaagagagatttttcgaccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacaccctt 400  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | ||  |||| ||| |||  ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||| || ||||    
T  615323 tttatgagagatttttccaccaacacattaatgtgatctttcatgatatcaccataatgagcatgaagtatttcttcaacccttgtcaatttccatcctt 615224  T
Q  401 cgaagcaacaagc 413  Q
     ||||||||||||    
T  615223 tgaagcaacaagc 615211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 615399 - 615341
Alignment:
Q  204 tgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctccaccaagtcatgtaatgtcacat 262  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  615399 tgattcttgtctaacaatttctttccccatatcctctaccaaatcatgtaatgtcacat 615341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University