View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4810-Insertion-3 (Length: 551)

Name: NF4810-Insertion-3
Description: NF4810
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4810-Insertion-3
NF4810-Insertion-3
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (8-551)||(34717285-34717828)
chr7 (12-550)||(34730559-34731099)
chr7 (12-550)||(34727401-34727941)
chr7 (70-512)||(34735196-34735640)
chr7 (43-550)||(18928816-18929325)
chr7 (8-412)||(18923875-18924283)
chr7 (311-513)||(34721121-34721320)
chr7 (257-445)||(34715630-34715818)
chr7 (8-229)||(34715849-34716074)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (9-520)||(7888440-7888953)
chr4 (350-414)||(6834289-6834353)
chr4 (288-360)||(7875924-7875996)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 520; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 34717828 - 34717285
Alignment:
Q  8 tgtacaagatgttatttaacttctgaacagccaacaatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717828 tgtacaagatgttatttaacttctgaacagccaacaatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgct 34717729  T
Q  108 aaatccggttataataaaattcatcgcgattttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagtttggagcaaattaatggcgacgtttctcaaca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34717728 aaatccggttataataaaattcatcgcgattttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagtttggagcaagttaatggcgacgtttctcaaca 34717629  T
Q  208 atagcaacttctttctgatatccacaaaacaacaaaaacgaagattgaaacagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacgagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717628 atagcaacttctttctgatatccacaaaacaataaaaacgaagatagaaacagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacgagg 34717529  T
Q  308 atatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717528 atatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtcagcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaa 34717429  T
Q  408 caagagacgatgatctactttgtaggcttaaggtggacatgcatatagaatcaaagaaatggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggattgca 507  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717428 caagagatgatgatctactttgtaggcttaaggtggacatgtatatagaatcaaagaaatggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggattgca 34717329  T
Q  508 ttcaaggaatcaagtcctatcaatggtttcgctgacctttctag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717328 ttcaaggaatcaagtcctatcaatggtttcgctgacctttctag 34717285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 34731099 - 34730559
Alignment:
Q  12 caagatgttatttaacttctgaacagccaacaatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgctaaat 111  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| | || ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  34731099 caagatgttattcaactattgaacggtcaagaatcaaaagaccctcgactgctcggaatatggggcatgggagggatcggcaaaacaacaattgctaaag 34731000  T
Q  112 ccggttataataaaattcatcgcgattttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagtttgg-agcaaattaatggcgacgtttctcaacaata 210  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||   ||||||| |||| |    
T  34730999 ctgcttataataaaattcatcgggattttgaggcgaaaagtttcctcctaaatgtcagggaagtttgggaacaagataatggcatagtttctctacaaca 34730900  T
Q  211 gcaacttctttctgatatccacaaaacaacaaaaacgaagattgaaacagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacgaggata 310  Q
     | ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  34730899 acgactcctttctgatatctacaaaacaacaaaaataaagatagaaacagttgaatcaggaaaaatgatattgcaggaaagactttgtcataagaggata 34730800  T
Q  311 tttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaacaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  34730799 tttcttgtgctggacgatgtgaataaactggaccaattgaatgctttgtgcggaagtcacggatggtttggtgaaggaagtagaataatcatcacaacaa 34730700  T
Q  411 gagacgatgatctactttgtaggcttaaggtggac-atgcatatagaatcaaagaaatggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggattgcatt 509  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||  || |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  || |||    
T  34730699 gagatgatgatttacttggtaggcttaaagttcactatgtgtatagaatgaaagaaatggacagcaatgaatctcttgagcttttcagttggcatgtatt 34730600  T
Q  510 caaggaatcaagtcctatcaatggtttcgctgacctttcta 550  Q
    |||| || ||| ||||||  | ||||| | |||||||||||    
T  34730599 caagcaaccaattcctatagaaggttttggtgacctttcta 34730559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 34727941 - 34727401
Alignment:
Q  12 caagatgttatttaacttctgaacagccaacaatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgctaaat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  34727941 caagatgttattcaactactgaacaatcaagaatcaaaagaccctttactgcttggaatatggggcatgggagggatcggcaaaacaacaattgctaaag 34727842  T
Q  112 ccggttataataaaattcatcgcgattttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagtttgg-agcaaattaatggcgacgtttctcaacaata 210  Q
    | | |||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |  ||||||| |||| |    
T  34727841 ctgcttataataaaattcgtcacgattttgaggcgaagagtttcctcctaaatgtcagggaagtttgggaacaagataatggtgtagtttctctacaaca 34727742  T
Q  211 gcaacttctttctgatatccacaaaacaacaaaaacgaagattgaaacagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacgaggata 310  Q
     | ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34727741 acgactcctttctgatatctacaaaacaacaaaaataaagatagaaacagttgaatcaggaaaaatgatattgcaggaaagacttcgtcataagaggata 34727642  T
Q  311 tttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaacaa 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  34727641 tttcttgtgcttgacgatgtgaataaagtggaccaattgaatgctttgtgtggaagtcatgaatggtttggtgaaggaagtagaataatgatcactacaa 34727542  T
Q  411 gagacgatgatctactttgtaggcttaaggtggac-atgcatatagaatcaaagaaatggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggattgcatt 509  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| || ||| |||  |||||||| |||||||||||    ||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||    
T  34727541 gagatgatgatttacttagtaggcttaaagttgactatgtgtatagaatgaaagaaatggatggcaatgaatctcttgagctttttagttggcatgcatt 34727442  T
Q  510 caaggaatcaagtcctatcaatggtttcgctgacctttcta 550  Q
    |||| || ||| ||||||  | ||||| | |||||||||||    
T  34727441 caagcaaccaattcctatagaaggttttggtgacctttcta 34727401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 70 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34735640 - 34735196
Alignment:
Q  70 tatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgctaaatccggttataataaaattcatcgcgattttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcag 169  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||    
T  34735640 tatggggcatgggagggatcggcaaaacaacaattgctaaagctgcttataataaaattcatcacgattttgaggcgaagagtttcctcccaaatgtcag 34735541  T
Q  170 ggaagtttgg-agcaaattaatggcgacgtttctcaacaatagcaacttctttctgatatccacaaaacaacaaaaacgaagattgaaacagttgaatcg 268  Q
    |||||| ||| | |||  ||||||||  ||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||     
T  34735540 ggaagtctgggaacaagataatggcgtagtttctctacaacaacaactcctttctgatatctacaaaacaacaaaaataaagatagatacagttgaatca 34735441  T
Q  269 ggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacgaggatatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtc 368  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  34735440 ggaaaaatgatattgcaggaaagacttcgtcataagaggatatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggaccaattgaatgctttgtgcggaagtc 34735341  T
Q  369 ggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaacaagagacgatgatctactttgtaggcttaaggtggac-atgcatatagaatcaaagaaat 467  Q
        |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||  || |||  |||||||| ||||||||    
T  34735340 acggatggtttggtgaaggaagtagaataatcatcacaacaagagatgatgatttacttggtaggcttaaagttcactatgtgtatagaatgaaagaaat 34735241  T
Q  468 ggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggattgcattcaa 512  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||    
T  34735240 ggacagcaatgaatctcttgagctttttagttggcatgcattcaa 34735196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 550
Target Start/End: Original strand, 18928816 - 18929325
Alignment:
Q  43 aatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgctaaatccggttataataaaattcatcgcgattttga 142  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||||    
T  18928816 aatcaaaagaccctttactgcttggaatatggggtatgggagggatcggcaaaacaacaattgctaaagctgcttataataaaattcgtcacgattttga 18928915  T
Q  143 ggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagtttgg-agcaaattaatggcgacgtttctcaacaatagcaacttctttctgatatccacaaaacaaca 241  Q
     |||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||||||  | ||||||| |||| | | ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  18928916 tgcaaagagtttcctcctaaatgtcagggaagattgggaacacgataatgggcaggtttctctacaacaacgactcctatctgatatctacaaaacaaca 18929015  T
Q  242 aaaacgaagattgaaacagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacgaggatatttcttgtgctggacgatgtgaataaactgg 341  Q
     |||  ||||||   ||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||   | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  18929016 gaaataaagattcgtactcttgaatcgggaaaaatgatattgaaggaaagacttcagaagaaaaagatatttcttgtgttggacgatgtgaataaagagg 18929115  T
Q  342 agccattgaatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaacaagagacgatgatctactttgtaggcttaaggt 441  Q
    | | |||||||||||||||  ||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||    
T  18929116 accaattgaatgctttgtgcggaagtcacgaatggtttggtgaaggaagtagaataatcatcacaacaagagatgatgatttacttagtaggcttaaagt 18929215  T
Q  442 ggac-atgcatatagaatcaaagaaatggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggattgcattcaaggaatcaagtcctatcaatggtttcgct 540  Q
      || |||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||| || ||||||| |    
T  18929216 tcactatgtgtatagaatgaaagaaatggacgacaatgaatctcttgagctttttagttggcatgcattcaagcaaccaaatcctataaaaggtttcggt 18929315  T
Q  541 gacctttcta 550  Q
     |||||||||    
T  18929316 aacctttcta 18929325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 412
Target Start/End: Original strand, 18923875 - 18924283
Alignment:
Q  8 tgtacaagatgttatttaacttctgaacagccaacaatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||| |||| ||||  ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| |||||     
T  18923875 tgtacaagaggttattcaactgctgaacaccgaaccatcagaagaaactcgagtgattgggatatgtggtactggagggattggcaaaacaacaattgcc 18923974  T
Q  108 aaatccggttataataaaattcatcgcgattttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagttt-ggagcaaattaatggcgacgtttctcaac 206  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||  |||||||| || |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||  ||    
T  18923975 aaagcagtttataataaaatccatcaccattttgaggcaaagagcttcctattaaatgtccggcaagtttgggaacaagataatggcgaagtttctttac 18924074  T
Q  207 aatagcaacttctttctgatatccacaaaacaaca---aaaacgaagattgaaacagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatac 303  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||  || |     
T  18924075 aacaacaacttctttctgatatctacaaaacaacagatataaaaaagatagaaacagttgaatcaggaaaaatgatattgcaggaaatgcttccacagaa 18924174  T
Q  304 gaggatatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatc 403  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||||||| ||| | | | |||| |||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  18924175 gaggatgttacttgtggtggacaatgtgaatgaacagcatcaattggatgctttgtgcataagttgcaaatggtttggtcaaggaagtataataatcatc 18924274  T
Q  404 acaacaaga 412  Q
    |||||||||    
T  18924275 acaacaaga 18924283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 34721320 - 34721121
Alignment:
Q  311 tttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaacaa 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||| | ||||||    | | || || |||||||   |||||||||||||||||    
T  34721320 tttcttgtgttggacgatgtgaataaactgaaccagttggatgctttgtgcataagtcg----tagatttgtcaaggaagtgtaataatcatcacaacaa 34721225  T
Q  411 gagacgatgatctactttgtaggcttaaggtgga-catgcatatagaatcaaagaaatggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggattgcatt 509  Q
    |||| | |||| ||||| | |||||| ||||||| ||||  |||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  34721224 gagatgttgatttacttcgcaggcttcaggtggatcatgtgtatacaatgaattcaatggatgagagtgaatctcttgaactttttagttggtatgcatt 34721125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 34715818 - 34715630
Alignment:
Q  257 acagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacgaggatatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctt 356  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| |||||| || |||| || |  || |||||| |||||| | |||||||||||||||   || | ||||  |||||    
T  34715818 acagttgaatccggaaaaaggatattgcaggagaggcttccccgttggaagatattacttgtggttgacgatgtgaataaaaaagaccaattgggtgctt 34715719  T
Q  357 tgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaacaagagacgatgatctactttgtaggcttaaggtggac 445  Q
    |||| | ||| ||  ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |  ||||| ||||||||    
T  34715718 tgtgcataagacgcaaatggtttggtcaaggaagtataataatcatcacaacgagagatcatgatttacttcggtggcttcaggtggac 34715630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34716074 - 34715849
Alignment:
Q  8 tgtacaagatgttatttaacttctgaacagccaacaatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||   || ||||||| ||||  || ||||| |||||||||| |||   |||||||| |  |||||||| |||||     
T  34716074 tgtacaagaggttattcaactactaaaatcccgacaatcagaagatcctgtactgcttgggatatggggcggaggagggatcggtaaaacaacaattgcc 34715975  T
Q  108 aaatccggttataataaaattcatcgcga---ttttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagtttgg-agcaaattaatggcgacgtttctc 203  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||  ||||||||| ||||||     
T  34715974 aaagcagtttataatgaaatccatcgccaccattttgaggcaaggagcttcctcttaaatgtcggtgaagtttggaaacaagataatggcgaagtttctt 34715875  T
Q  204 aacaatagcaacttctttctgatatc 229  Q
     |||| | |||||| |||||| ||||    
T  34715874 tacaaaaacaacttatttctgttatc 34715849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7888953 - 7888440
Alignment:
Q  9 gtacaagatgttatttaacttctgaacagccaacaatcaaaagactctctactgattgggatatgaggcatgggagggattgacaaaacaaccattgcta 108  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| ||| ||| |||| |||||  ||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  7888953 gtacgagatgttattcaactactgagcagacaaaaatccaaagatcctcaactactagggatatggggcatgggagggattgggaaaacaacccttgcta 7888854  T
Q  109 aatccggttataataaaattcatcgcgattttgaggcatggagcttcctcctaaatgtcagggaagtttggagcaaatta----atggcgacgtttctca 204  Q
    || ||| ||| |||||||||| ||  |||||||| |||  |||||||||  | |||||||| || ||||||   ||| ||    ||| | | ||||||      
T  7888853 aagccgtttacaataaaattcgtcatgattttgatgcaaagagcttcctgttcaatgtcagagatgtttgg---aaagtagacgatgacaaagtttcttt 7888757  T
Q  205 acaatagcaacttctttctgatatccacaaaacaacaaaaacgaagattgaaacagttgaatcgggaaaattgatatagcaggaaagacttcgccatacg 304  Q
    |||  | | |||||||| ||| |||  |||||| ||||| |  ||||| ||  |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||| |    |      
T  7888756 acagcaacgacttctttttgacatctgcaaaactacaaagataaagatagactcagttgaatcaggaaaaaagatattacaggaaagactttgttcgaaa 7888657  T
Q  305 aggatatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatca 404  Q
    | ||||||||||||  | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||  |||  ||||||||||| | |||||  ||||| ||||||    
T  7888656 aagatatttcttgtaatcgatgatgtgaataaattggatcaattgaatgctttgtgtggagatcgaaaatggtttggtaagggaagtagaatactcatca 7888557  T
Q  405 caacaagagacgatgatctactttgtaggcttaaggtgga-catgcatatagaatcaaagaaatggacaagaatgaatctcttgaagttttcagttggat 503  Q
    ||||||| || |||||| ||||  |||||||| | || || |||| ||| ||||| || |||||||| |  | ||||||||| ||  |||| | ||||      
T  7888556 caacaagggatgatgatttactcagtaggcttgaagtcgaccatgtatacagaatgaaggaaatggatagcagtgaatctctagagctttttaattggca 7888457  T
Q  504 tgcattcaaggaatcaa 520  Q
    |||||||||| ||||||    
T  7888456 tgcattcaagcaatcaa 7888440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 414
Target Start/End: Original strand, 6834289 - 6834353
Alignment:
Q  350 aatgctttgtgaagaagtcggcaatggtttggttaaggaaggtgaataatcatcacaacaagaga 414  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6834289 aatgctttgtgtggaagtcgcgaatggtttggttccggaagtagaataatcatcacgacaagaga 6834353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7875996 - 7875924
Alignment:
Q  288 aaagacttcgccatacgaggatatttcttgtgctggacgatgtgaataaactggagccattgaatgctttgtg 360  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  7875996 aaagacttcgccataggaagatatttcttgtacatgacaatttgaataaattggaccagttgaatgctttgtg 7875924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University