View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4813_high_5 (Length: 452)

Name: NF4813_high_5
Description: NF4813
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4813_high_5
NF4813_high_5
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (83-404)||(25726454-25726777)
chr3 (183-448)||(758136-758401)
chr3 (183-448)||(7570986-7571251)
chr3 (183-448)||(18472067-18472332)
chr3 (183-448)||(23661232-23661497)
chr3 (183-448)||(23665891-23666156)
chr3 (183-448)||(24038139-24038404)
chr3 (183-448)||(39775496-39775761)
chr3 (183-448)||(18467285-18467550)
chr3 (183-452)||(27708992-27709257)
chr3 (178-448)||(55431375-55431645)
chr3 (52-448)||(3656876-3657273)
chr3 (186-448)||(20520114-20520376)
chr3 (47-448)||(3419055-3419456)
chr3 (191-448)||(3033704-3033955)
chr3 (143-448)||(19276648-19276953)
chr3 (183-448)||(14438467-14438728)
chr3 (241-448)||(46964075-46964283)
chr3 (183-433)||(29350315-29350565)
chr3 (191-448)||(8069739-8069990)
chr3 (191-446)||(6596138-6596388)
chr3 (254-448)||(32474517-32474713)
chr3 (183-423)||(2207517-2207757)
chr3 (242-448)||(8883230-8883432)
chr3 (242-444)||(8887994-8888192)
chr3 (261-444)||(12971478-12971662)
chr3 (242-448)||(3672646-3672848)
chr3 (242-448)||(3692678-3692880)
chr3 (183-433)||(55325851-55326101)
chr3 (131-329)||(10708394-10708592)
chr3 (214-334)||(17025905-17026025)
chr3 (242-448)||(12965699-12965906)
chr3 (312-448)||(49971320-49971457)
chr3 (345-448)||(12112571-12112674)
chr3 (242-385)||(16013826-16013969)
chr3 (380-448)||(29715704-29715772)
chr3 (52-134)||(14438345-14438427)
chr3 (52-134)||(55326141-55326223)
chr3 (242-348)||(10586015-10586116)
chr3 (226-308)||(28125338-28125420)
chr3 (183-249)||(32473687-32473752)
chr3 (270-322)||(48435702-48435754)
chr3 (19-134)||(55431680-55431795)
chr3 (52-134)||(18467590-18467672)
chr3 (242-309)||(45904370-45904437)
chr3 (242-309)||(45904826-45904893)
chr3 (191-249)||(12112457-12112515)
chr3 (242-348)||(31002858-31002959)
chr3 (52-134)||(7570865-7570947)
chr3 (267-322)||(12156352-12156407)
chr3 (270-317)||(48432175-48432222)
chr3 (414-448)||(20507713-20507747)
chr3 (156-217)||(3672805-3672866)
chr3 (156-217)||(3692837-3692898)
chr3 (54-115)||(9121795-9121856)
chr3 (415-452)||(27605135-27605172)
chr3 (47-134)||(2207390-2207477)
chr3 (270-322)||(16983163-16983215)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (52-446)||(16115881-16116280)
chr5 (183-448)||(29167741-29168006)
chr5 (183-448)||(36428771-36429036)
chr5 (52-400)||(15414516-15414866)
chr5 (183-448)||(26667334-26667599)
chr5 (183-448)||(26938931-26939196)
chr5 (183-448)||(36423699-36423964)
chr5 (183-448)||(35679644-35679908)
chr5 (191-448)||(6155194-6155452)
chr5 (131-448)||(20180780-20181096)
chr5 (183-448)||(37248572-37248828)
chr5 (183-448)||(12103087-12103352)
chr5 (183-448)||(7451820-7452081)
chr5 (242-448)||(39523111-39523317)
chr5 (254-448)||(12501737-12501932)
chr5 (191-448)||(32461329-32461582)
chr5 (242-448)||(39518472-39518678)
chr5 (191-448)||(556757-557008)
chr5 (191-448)||(561529-561780)
chr5 (183-448)||(40147957-40148222)
chr5 (183-448)||(10759589-10759853)
chr5 (191-448)||(12044920-12045172)
chr5 (191-448)||(36937293-36937544)
chr5 (191-448)||(36942047-36942298)
chr5 (260-448)||(6514444-6514634)
chr5 (251-446)||(12041767-12041963)
chr5 (242-444)||(4871988-4872191)
chr5 (191-448)||(42001496-42001742)
chr5 (243-443)||(11981107-11981308)
chr5 (183-391)||(34707306-34707513)
chr5 (191-448)||(41996727-41996973)
chr5 (260-404)||(9726532-9726676)
chr5 (302-448)||(41587048-41587193)
chr5 (314-448)||(3665994-3666129)
chr5 (225-309)||(9911347-9911430)
chr5 (225-343)||(12102639-12102757)
chr5 (183-275)||(37549921-37550012)
chr5 (183-275)||(37652719-37652810)
chr5 (191-285)||(3666131-3666224)
chr5 (192-274)||(7086595-7086676)
chr5 (242-348)||(13301314-13301415)
chr5 (222-324)||(23688267-23688369)
chr5 (52-134)||(7452121-7452203)
chr5 (254-348)||(21323810-21323899)
chr5 (28-124)||(9726378-9726474)
chr5 (26-134)||(37549773-37549881)
chr5 (267-322)||(1286137-1286192)
chr5 (52-134)||(26667639-26667721)
chr5 (52-134)||(26939236-26939318)
chr5 (242-309)||(31731739-31731806)
chr5 (52-134)||(37248451-37248533)
chr5 (47-258)||(6513559-6513768)
chr5 (26-134)||(37652571-37652679)
chr5 (221-329)||(7833165-7833272)
chr5 (242-305)||(1429827-1429889)
chr5 (385-448)||(12102801-12102864)
chr5 (56-134)||(12103392-12103470)
chr5 (52-134)||(29167620-29167702)
chr5 (52-124)||(36424014-36424086)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (47-448)||(19798645-19799046)
chr1 (183-448)||(26927490-26927755)
chr1 (52-444)||(16035674-16036068)
chr1 (183-447)||(25843819-25844083)
chr1 (47-448)||(38620754-38621157)
chr1 (191-448)||(39588143-39588400)
chr1 (182-448)||(47450993-47451258)
chr1 (58-448)||(40166042-40166429)
chr1 (230-448)||(28434388-28434607)
chr1 (254-448)||(33301018-33301213)
chr1 (241-448)||(51041288-51041496)
chr1 (260-448)||(8138001-8138190)
chr1 (242-448)||(23192644-23192850)
chr1 (183-448)||(10140151-10140419)
chr1 (226-448)||(12260058-12260274)
chr1 (242-446)||(16833548-16833753)
chr1 (191-398)||(18784338-18784540)
chr1 (191-410)||(3094188-3094401)
chr1 (191-334)||(33055214-33055352)
chr1 (354-448)||(10135518-10135612)
chr1 (313-449)||(16649510-16649647)
chr1 (242-348)||(8267662-8267763)
chr1 (279-448)||(11806421-11806591)
chr1 (239-329)||(25779137-25779227)
chr1 (183-286)||(16649405-16649507)
chr1 (52-134)||(10135693-10135775)
chr1 (52-134)||(10140461-10140543)
chr1 (242-348)||(41097784-41097885)
chr1 (28-124)||(47450851-47450947)
chr1 (131-240)||(11806607-11806715)
chr1 (50-134)||(25844119-25844203)
chr1 (270-322)||(12906322-12906374)
chr1 (270-322)||(36724877-36724929)
chr1 (52-134)||(51041158-51041240)
chr1 (183-249)||(39200534-39200599)
chr1 (382-444)||(47455353-47455415)
chr1 (270-322)||(23193097-23193149)
chr1 (226-274)||(25779065-25779113)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (183-448)||(17964327-17964592)
chr6 (182-448)||(6407628-6407893)
chr6 (28-448)||(2699720-2700139)
chr6 (52-448)||(12405988-12406386)
chr6 (47-442)||(4156999-4157396)
chr6 (183-448)||(11570517-11570782)
chr6 (192-448)||(12689033-12689289)
chr6 (193-446)||(29892039-29892292)
chr6 (183-439)||(11559989-11560245)
chr6 (178-448)||(16835923-16836189)
chr6 (159-424)||(19995147-19995412)
chr6 (243-448)||(33687430-33687636)
chr6 (183-395)||(11428124-11428336)
chr6 (83-348)||(11613431-11613699)
chr6 (214-439)||(11534510-11534735)
chr6 (191-445)||(8747847-8748096)
chr6 (183-336)||(5856183-5856334)
chr6 (183-348)||(25314225-25314389)
chr6 (183-348)||(26201719-26201883)
chr6 (254-444)||(14509050-14509241)
chr6 (269-449)||(24589022-24589198)
chr6 (47-249)||(22694953-22695156)
chr6 (191-375)||(2863242-2863429)
chr6 (301-447)||(20748169-20748316)
chr6 (381-448)||(21309093-21309160)
chr6 (192-400)||(9751585-9751793)
chr6 (241-446)||(22609632-22609839)
chr6 (225-452)||(15991547-15991777)
chr6 (225-452)||(15999209-15999439)
chr6 (226-340)||(17913768-17913881)
chr6 (214-302)||(6112760-6112846)
chr6 (352-448)||(13736615-13736711)
chr6 (267-322)||(14775752-14775807)
chr6 (191-370)||(2882546-2882728)
chr6 (28-113)||(33687273-33687357)
chr6 (358-448)||(11614035-11614125)
chr6 (26-126)||(11559841-11559941)
chr6 (26-126)||(11570369-11570468)
chr6 (270-322)||(32814937-32814989)
chr6 (52-134)||(6407508-6407590)
chr6 (56-134)||(16835811-16835889)
chr6 (288-343)||(21309182-21309237)
chr6 (52-125)||(25314103-25314178)
chr6 (52-125)||(26201597-26201672)
chr6 (272-322)||(35129797-35129847)
chr6 (382-443)||(22695238-22695299)
chr6 (239-315)||(32551318-32551394)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (183-448)||(37259645-37259910)
chr4 (183-446)||(8693775-8694038)
chr4 (183-448)||(37264332-37264597)
chr4 (52-448)||(16421091-16421486)
chr4 (183-448)||(5927987-5928252)
chr4 (183-448)||(47244310-47244575)
chr4 (183-448)||(13059472-13059736)
chr4 (183-448)||(31273583-31273840)
chr4 (26-446)||(12823513-12823926)
chr4 (183-448)||(19102039-19102304)
chr4 (183-448)||(31269096-31269353)
chr4 (183-448)||(51697979-51698243)
chr4 (132-331)||(15134332-15134531)
chr4 (131-319)||(23093293-23093480)
chr4 (254-448)||(55251781-55251976)
chr4 (204-448)||(19540950-19541194)
chr4 (183-448)||(31729159-31729420)
chr4 (242-446)||(48276475-48276680)
chr4 (242-449)||(8030302-8030510)
chr4 (183-398)||(19106720-19106935)
chr4 (183-448)||(5271191-5271452)
chr4 (191-448)||(13521769-13522025)
chr4 (183-319)||(31766002-31766137)
chr4 (242-448)||(19906313-19906519)
chr4 (47-308)||(32081770-32082024)
chr4 (28-292)||(6942987-6943252)
chr4 (131-368)||(13065533-13065769)
chr4 (242-448)||(33468799-33469006)
chr4 (242-442)||(33463182-33463383)
chr4 (226-448)||(12874601-12874822)
chr4 (191-309)||(47574854-47574971)
chr4 (254-448)||(12878301-12878495)
chr4 (192-425)||(8649412-8649640)
chr4 (192-425)||(8661219-8661447)
chr4 (191-309)||(31298170-31298287)
chr4 (213-437)||(40408272-40408499)
chr4 (353-446)||(32082029-32082122)
chr4 (242-348)||(7902938-7903039)
chr4 (192-404)||(40840434-40840646)
chr4 (159-252)||(4551230-4551323)
chr4 (301-448)||(4551059-4551203)
chr4 (194-297)||(52690907-52691010)
chr4 (242-348)||(34560588-34560689)
chr4 (254-348)||(39319736-39319825)
chr4 (183-308)||(42758519-42758643)
chr4 (52-134)||(5271069-5271151)
chr4 (354-452)||(2819902-2820000)
chr4 (191-275)||(39217186-39217270)
chr4 (191-295)||(41816994-41817096)
chr4 (26-125)||(55252037-55252136)
chr4 (28-134)||(19102344-19102450)
chr4 (267-322)||(55081574-55081629)
chr4 (267-317)||(20513280-20513330)
chr4 (47-134)||(19106975-19107062)
chr4 (242-309)||(3997889-3997956)
chr4 (52-134)||(5927865-5927947)
chr4 (52-134)||(8694079-8694161)
chr4 (52-134)||(31269392-31269474)
chr4 (52-134)||(31273881-31273963)
chr4 (52-134)||(31729037-31729119)
chr4 (52-134)||(31766237-31766319)
chr4 (336-423)||(32545182-32545269)
chr4 (246-309)||(42316543-42316606)
chr4 (353-444)||(47574691-47574782)
chr4 (191-266)||(2820030-2820107)
chr4 (52-125)||(13059783-13059856)
chr4 (267-309)||(16595811-16595853)
chr4 (354-404)||(42758694-42758744)
chr4 (408-448)||(16953147-16953187)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (183-448)||(19892236-19892499)
chr2 (183-448)||(1934761-1935026)
chr2 (183-448)||(25497094-25497358)
chr2 (183-448)||(9189575-9189836)
chr2 (191-448)||(25478074-25478330)
chr2 (183-448)||(9180496-9180757)
chr2 (83-448)||(17544963-17545331)
chr2 (185-448)||(12796987-12797250)
chr2 (242-448)||(30650991-30651197)
chr2 (191-448)||(10160506-10160757)
chr2 (183-448)||(31326801-31327076)
chr2 (183-420)||(28603393-28603630)
chr2 (242-446)||(29677831-29678036)
chr2 (183-448)||(18344493-18344749)
chr2 (191-444)||(35601988-35602236)
chr2 (167-448)||(19578167-19578447)
chr2 (166-446)||(40847350-40847626)
chr2 (185-400)||(17453355-17453564)
chr2 (260-448)||(21523573-21523753)
chr2 (254-448)||(7737689-7737884)
chr2 (336-448)||(30658325-30658437)
chr2 (191-340)||(19538555-19538698)
chr2 (354-448)||(29677443-29677537)
chr2 (191-348)||(28855167-28855317)
chr2 (354-444)||(19094433-19094524)
chr2 (381-452)||(42926725-42926796)
chr2 (242-348)||(6297718-6297819)
chr2 (263-345)||(38591429-38591515)
chr2 (235-329)||(27414896-27414993)
chr2 (327-448)||(30631641-30631766)
chr2 (380-444)||(35638962-35639026)
chr2 (52-134)||(12797291-12797373)
chr2 (50-134)||(9185063-9185147)
chr2 (23-124)||(31327126-31327227)
chr2 (50-134)||(9180372-9180456)
chr2 (52-134)||(18344789-18344871)
chr2 (191-274)||(30629087-30629169)
chr2 (241-288)||(30643406-30643453)
chr2 (52-125)||(28603676-28603749)
chr2 (261-295)||(42926361-42926395)
chr2 (191-275)||(19094269-19094352)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (26-341)||(22714615-22714933)
chr8 (23-404)||(24672944-24673320)
chr8 (52-446)||(2965694-2966095)
chr8 (52-448)||(1910605-1911002)
chr8 (23-448)||(19166696-19167121)
chr8 (183-444)||(15951323-15951584)
chr8 (52-447)||(23548265-23548664)
chr8 (183-448)||(33416609-33416873)
chr8 (183-448)||(36683641-36683906)
chr8 (242-448)||(40125712-40125918)
chr8 (183-448)||(44925692-44925956)
chr8 (242-448)||(31449697-31449899)
chr8 (82-403)||(28564484-28564807)
chr8 (183-403)||(28572212-28572430)
chr8 (192-438)||(43302470-43302714)
chr8 (242-448)||(17025997-17026204)
chr8 (242-448)||(17556489-17556696)
chr8 (85-319)||(28559333-28559568)
chr8 (279-448)||(1807534-1807701)
chr8 (289-448)||(18876240-18876400)
chr8 (290-448)||(34118528-34118687)
chr8 (47-444)||(38181888-38182266)
chr8 (191-410)||(4238123-4238336)
chr8 (191-410)||(4242862-4243075)
chr8 (191-310)||(17793664-17793783)
chr8 (260-432)||(24090705-24090873)
chr8 (52-376)||(17020472-17020796)
chr8 (52-376)||(17550909-17551233)
chr8 (355-448)||(15875608-15875701)
chr8 (52-343)||(26779268-26779563)
chr8 (209-307)||(29220550-29220647)
chr8 (178-285)||(18876152-18876258)
chr8 (242-348)||(8331189-8331290)
chr8 (229-329)||(12820504-12820604)
chr8 (354-444)||(17953811-17953902)
chr8 (242-309)||(25367812-25367879)
chr8 (229-324)||(27236170-27236265)
chr8 (242-309)||(37771907-37771974)
chr8 (226-348)||(34818516-34818632)
chr8 (191-308)||(15875460-15875576)
chr8 (257-329)||(7001871-7001943)
chr8 (258-322)||(19949987-19950051)
chr8 (191-274)||(14035669-14035751)
chr8 (52-122)||(17793852-17793923)
chr8 (52-134)||(36683946-36684028)
chr8 (235-329)||(7902743-7902837)
chr8 (380-446)||(12820403-12820469)
chr8 (23-167)||(18260167-18260314)
chr8 (47-125)||(18876033-18876110)
chr8 (338-445)||(10933497-10933603)
chr8 (52-134)||(15951201-15951283)
chr8 (414-452)||(43302717-43302755)
chr8 (267-315)||(19954448-19954496)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (191-448)||(44510453-44510710)
chr7 (131-443)||(10388085-10388395)
chr7 (183-446)||(4930297-4930560)
chr7 (192-446)||(30258164-30258418)
chr7 (191-452)||(13314013-13314273)
chr7 (183-448)||(26341261-26341532)
chr7 (83-386)||(3045679-3045986)
chr7 (183-448)||(8268355-8268621)
chr7 (131-448)||(27238304-27238620)
chr7 (47-422)||(21671283-21671649)
chr7 (183-410)||(42626359-42626586)
chr7 (191-448)||(23866130-23866382)
chr7 (226-448)||(26286956-26287178)
chr7 (183-448)||(44422905-44423170)
chr7 (215-448)||(12799472-12799705)
chr7 (242-448)||(3880060-3880264)
chr7 (191-448)||(9650744-9651000)
chr7 (214-448)||(13142700-13142934)
chr7 (193-319)||(15642369-15642495)
chr7 (241-367)||(23318128-23318254)
chr7 (291-446)||(25543237-25543393)
chr7 (261-448)||(3357476-3357665)
chr7 (191-348)||(19640460-19640611)
chr7 (192-448)||(8076112-8076358)
chr7 (267-448)||(12254141-12254322)
chr7 (192-448)||(4579570-4579830)
chr7 (261-448)||(3284789-3284978)
chr7 (242-348)||(40865185-40865286)
chr7 (128-249)||(15642497-15642617)
chr7 (327-431)||(9008242-9008346)
chr7 (50-134)||(4930588-4930672)
chr7 (183-275)||(3356864-3356955)
chr7 (83-448)||(6590651-6591016)
chr7 (384-448)||(23246902-23246966)
chr7 (242-348)||(27256404-27256505)
chr7 (26-125)||(8268667-8268766)
chr7 (52-134)||(42626237-42626319)
chr7 (52-134)||(44422781-44422863)
chr7 (194-274)||(2628875-2628954)
chr7 (242-329)||(16372579-16372666)
chr7 (255-322)||(23616241-23616308)
chr7 (52-134)||(26341573-26341655)
chr7 (273-322)||(29478032-29478081)
chr7 (191-295)||(9008366-9008469)
[»] scaffold0352 (2 HSPs)
scaffold0352 (183-448)||(7166-7431)
scaffold0352 (52-134)||(7471-7553)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (242-448)||(9713-9920)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (242-448)||(4136-4342)
scaffold0002 (183-448)||(443714-443977)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (214-448)||(83128-83354)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (52-326)||(148040-148316)
scaffold0009 (321-446)||(164928-165060)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (47-317)||(25637-25906)
scaffold0054 (65-403)||(29262-29608)
scaffold0054 (299-448)||(25461-25611)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (358-448)||(35696-35786)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (225-348)||(4136-4259)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (327-446)||(165998-166117)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (353-447)||(1203-1297)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (290-452)||(13330-13491)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (230-319)||(9087-9174)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (191-329)||(146206-146343)
scaffold0011 (383-441)||(155486-155544)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (215-319)||(42142-42246)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (321-446)||(435-567)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (283-444)||(2374-2540)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (242-348)||(45946-46047)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (242-348)||(152740-152841)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (52-319)||(5478-5744)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (215-275)||(3004-3064)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (354-446)||(255881-255973)
scaffold0008 (225-307)||(256024-256106)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (279-348)||(1095-1159)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (267-315)||(171587-171635)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 83 - 404
Target Start/End: Original strand, 25726454 - 25726777
Alignment:
Q  83 ttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcag 177  Q
    ||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  25726454 ttttgaaataataacgttccgtcggaattaagaatgatcttaatattatataaatattctttcaatattttt-ctactcttggaaaagttaaaaagttag 25726552  T
Q  178 aattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctta 277  Q
    |||  ||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25726553 aatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacaccatatttgagtggtctta 25726652  T
Q  278 gcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttca 377  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  25726653 acaccataat--agtggtcacaataccatattagaatgatttcagtatttaagagtggtcttagtaccatattggaggtgtaaatctcgaacggttttct 25726750  T
Q  378 atagtgcagtagttaaccgcacagttg 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  25726751 acagtgcagtagttaaccgcacagttg 25726777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 758136 - 758401
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  758136 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 758234  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  758235 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 758334  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  758335 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 758401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 7570986 - 7571251
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7570986 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttataatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcacc 7571084  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  7571085 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagcgtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacag 7571184  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  7571185 tgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtgattgatagtct 7571251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18472332 - 18472067
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18472332 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctcagcacc 18472234  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |     
T  18472233 ataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacaa 18472134  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18472133 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 18472067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 23661232 - 23661497
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23661232 tggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcacc 23661330  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  23661331 ttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 23661430  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23661431 tgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 23661497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 23665891 - 23666156
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23665891 tggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcacc 23665989  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  23665990 ttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 23666089  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23666090 tgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 23666156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 24038139 - 24038404
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24038139 tggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcacc 24038237  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  24038238 ttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 24038337  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24038338 tgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 24038404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 39775496 - 39775761
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  39775496 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcatc 39775594  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||| | ||    
T  39775595 ataacagagtagtaacaataccatattaaagtggtttcagtagtaaagagttgtcttagtaccatatttggaggtgtaattttcgaacgattttctacag 39775694  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39775695 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 39775761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18467550 - 18467285
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18467550 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcacc 18467452  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  18467451 ataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaagtgtaattctcgaacgattttctacag 18467352  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||| ||| || ||   |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  18467351 tgcagtagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttatcctggaggcggcgtggttaatagtct 18467285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27709257 - 27708992
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||  | ||||    
T  27709257 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcgcaacacc 27709159  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||     ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  27709158 ataatagagtggttacaatactatag----gtggtttcagtattgaagagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 27709063  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27709062 tgcagtagttaaccgcacagttgaagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctacct 27708992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 55431645 - 55431375
Alignment:
Q  178 aattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctta 277  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |    
T  55431645 aattgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctca 55431547  T
Q  278 gcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttc 376  Q
     |||||||| |||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | || |||| || ||||||||  |||||    
T  55431546 acaccataacagagtgataacaatgccatattaaggtggtttaagtatcaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgcaattctcgaacagttttc 55431447  T
Q  377 aatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  55431446 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 55431375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 448
Target Start/End: Original strand, 3656876 - 3657273
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||   ||||||    || ||| ||||||    
T  3656876 ataaagagtactgttaagatcataatcccttttt-ggaataataatgtcccgtcggaattaagaacgatcttaaaggtatataaatattatttgaatatt 3656974  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||| ||| ||  |||||| |||||||||   |||  |||||||  |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3656975 ttt-ctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatc--catatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaag-ttaga 3657070  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaaca 346  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  3657071 atggtggtaacatcatatttgattggtctcagcaccgtaacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagcattaaagagtggtcttagtacca 3657170  T
Q  347 taatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatag 445  Q
    || |  | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||| |||||   |||||||||| | |||| ||  ||||||||||    
T  3657171 tatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatctaacagttgtagctggacttgttttatcttggaggtggcatggttgatag 3657270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20520376 - 20520114
Alignment:
Q  186 tatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccata 285  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  20520376 tatcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatattttagtggtttcagcaccata 20520278  T
Q  286 atagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgc 384  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||  || |||||||||||||||||  ||||| | ||| |    
T  20520277 acagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtactatatttgaaggtgtaaatctcgaacagttttctacagtac 20520178  T
Q  385 agtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  20520177 agtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcttggaggcggcgtggttgatagtct 20520114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3419456 - 3419055
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttca 141  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    ||||||||    
T  3419456 tcggaataaagagtattattaagatcatagtccctttttag-aataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatataaatattctttca 3419358  T
Q  142 atattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatat--catattgatattttggagaacttaaa 239  Q
    |||||||    | ||  |||||| ||||||||| | |||  ||||||| |||||||| |||||||| | | |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  3419357 atatttt----aattgaggagaaattaaaaagtgaaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgtgccatattgatattttggagaaattaaa 3419262  T
Q  240 ggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatctt 339  Q
    | |||||||| ||  |||| |||||| ||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  3419261 g-ttagaatggtggcaacaccatatt-gagtggtcacagcgccataacagagcggtaacaatacaatattaaagtggtttcagtattaa-gagtggtctt 3419165  T
Q  340 agtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtgg 438  Q
    |||| |||| | |||| |||||||||| |||| ||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || ||||    
T  3419164 agtaccatatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacgatgcaatagttaaccgcacagttgcagttgagcttgttttatcctgaaggtggcgtgg 3419065  T
Q  439 ttgatagtct 448  Q
    ||||||||||    
T  3419064 ttgatagtct 3419055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3033955 - 3033704
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  3033955 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattga 3033858  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||     ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  3033857 gtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaagattgatcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 3033763  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3033762 ttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgaggcggtgtggttgatagtct 3033704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 448
Target Start/End: Original strand, 19276648 - 19276953
Alignment:
Q  143 tattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgga-gaacttaaagg 241  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |   || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  19276648 tattttttttactattggagtagtcaaaaattcaaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccatattgatatttttgaaggatttaaagg 19276747  T
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||| ||||||| ||||||   |||| |    
T  19276748 ttagaacgatgataacaccaaatttgagtggt-ttagcaccataatagagtagtcatagtatcatattagactggtgttagtataaaagagatgtcttcg 19276846  T
Q  342 taacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttg 441  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |  |||| ||||||||| ||||||||   |||||||    
T  19276847 tatcatattagaggtgtaaatctcgaacaattttcaacattgcagtagctaaccgcatagttttaattgagcttgttttattctagaggcaacgtggttg 19276946  T
Q  442 atagtct 448  Q
    |||||||    
T  19276947 atagtct 19276953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 14438467 - 14438728
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |   || | |||||||||||||||| | ||||    
T  14438467 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggtagcaaaaccatatttgagtggtctcaacacc 14438565  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||     ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  14438566 ataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 14438661  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  14438662 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgattgtct 14438728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 241 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 46964283 - 46964075
Alignment:
Q  241 gttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatctta 340  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  46964283 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatatcaaagtggtttcagtattaaagagtggtctta 46964184  T
Q  341 gtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggt 439  Q
     || |||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||  |||     
T  46964183 ataccatatttgagggtgtaaatctcgaacggttttctatagtgcaatagttaaccacatagttgtatctgagtttgttttatcctagaggtggcatggg 46964084  T
Q  440 tgatagtct 448  Q
    |||||||||    
T  46964083 tgatagtct 46964075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29350565 - 29350315
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| | |||     
T  29350565 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaaa-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgctctcaacact 29350467  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  29350466 ataacagagtggtaacaatatcatattaaagtgattttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 29350367  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcgg 433  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  29350366 tgcagtaattaaccacacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcgg 29350315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8069990 - 8069739
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  8069990 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattga 8069893  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||     ||||| ||| ||||| || || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || || | ||||||||||    
T  8069892 gtggttacaataccatatt-----ggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttatctacagtgcagtag 8069798  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8069797 ttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 8069739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 446
Target Start/End: Original strand, 6596138 - 6596388
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6596138 ccatatttgagtggttgaaatactatattgacattt-ggagaagttagatgttagaatggtggtaacacaatatttgagtggtctcagcaccataataga 6596236  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    |||||||||  ||||||||     ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  6596237 gtggtcacagcaccatatt-----ggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtag 6596331  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||| || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6596332 ttaaccacataattgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagt 6596388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 448
Target Start/End: Original strand, 32474517 - 32474713
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatc-ttagtaacata-atg 351  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||  |     
T  32474517 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtctttagtaccatattta 32474616  T
Q  352 gaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  32474617 gaggtataattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtct 32474713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 423
Target Start/End: Original strand, 2207517 - 2207757
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| | ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  2207517 tggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttgaagaaattaaag-ttagaacggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 2207615  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||| | ||||| | ||    
T  2207616 ataatagagtggtaacaataccatataaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaagggttttctacag 2207715  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatc 423  Q
    | ||||||||||||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  2207716 tacagtagttaaccgcacaattgtagatgggcttgttttatc 2207757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8883432 - 8883230
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaag-agtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||     ||||| |||||||||  | || ||||     
T  8883432 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattgagtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaatattggtcttt 8883338  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  8883337 gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcagcgtggtt 8883238  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  8883237 gatagtct 8883230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8888192 - 8887994
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||     ||||| ||||||||| || || |||||    
T  8888192 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattgagtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaagattggtctta 8888098  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8888097 gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgcagctggatttgttttatcctggaggcggcgtggtt 8887998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Original strand, 12971478 - 12971662
Alignment:
Q  261 atatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgta 359  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||| ||| |||| ||||||||||    
T  12971478 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggttttagtattaaaagattagtcttggtaccatattggaggtgta 12971577  T
Q  360 aatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    | ||||||||| ||||| | | ||||||||||||  | ||||||| || || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12971578 attctcgaacggttttctacaatgcagtagttaattgaacagttgtagttgggcttgttttatcctagaggcggcgtgattgata 12971662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3672848 - 3672646
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||     ||||| ||||||||| || || |||||    
T  3672848 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattgagtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaagattggtctta 3672754  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3672753 gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggtt 3672654  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  3672653 gatagtct 3672646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3692880 - 3692678
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||     ||||| ||||||||| || || |||||    
T  3692880 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattgagtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaagattggtctta 3692786  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3692785 gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggtt 3692686  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  3692685 gatagtct 3692678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 55326101 - 55325851
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  55326101 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggaaaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacacc 55326003  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaac-gattttcaata 380  Q
    |||| ||| || | |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |  | ||||||| |||||| | | ||||| | |    
T  55326002 ataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccgtatttaagggtgtaattctcgatcgggttttctaca 55325903  T
Q  381 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcgg 433  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||    
T  55325902 gtgca-tagttaaccgcacagttgtaactgggcttgttttatcctggaggcgg 55325851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Original strand, 10708394 - 10708592
Alignment:
Q  131 atattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| |||||  |||  ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||| || |||    
T  10708394 atattctttcaatattttt-ctatttgaggagaaattaataagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgctcgtagtaccatattgatagttcgga 10708492  T
Q  231 gaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaata--ccatattagagtggttttagtattaa 328  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   ||||||| |||||||| ||||||||    
T  10708493 gaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgttaacaatatcacatattaaagtggtttcagtattaa 10708591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 17025905 - 17026025
Alignment:
Q  214 catattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagag 313  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17025905 catattgatactttagagaacttaaaggctggaatggtgataacaccatatttaagtggtcttagcaccatactagagtggtcacagcaccatattagag 17026004  T
Q  314 tggttttagtattaaagagtg 334  Q
    || ||| | ||||||||||||    
T  17026005 tgatttcaatattaaagagtg 17026025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 12965699 - 12965906
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  12965699 ttagaatggtggtaacaccatatttgagttgtctcagttccataatagagtggtaatattaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 12965798  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||| ||||  ||||| | |||||| ||||||| || ||| ||| || ||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12965799 gtaccatattggaggtgtaattcttgaacagttttctacagtgcattagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttatcctggaggcggcgtggtt 12965898  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  12965899 gatagtct 12965906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 448
Target Start/End: Original strand, 49971320 - 49971457
Alignment:
Q  312 agtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctg 410  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  49971320 agtggtttcagtattaaagagtggtctcagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgaagtagttaactgcacagttgcagctg 49971419  T
Q  411 agattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
       |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  49971420 gacttgttttatcctggaggcggcgtgattgatagtct 49971457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 448
Target Start/End: Original strand, 12112571 - 12112674
Alignment:
Q  345 cataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| || |||||||| | || ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12112571 catattggaggtgtaaatctcgaatggttttctacagtgtagcagttaaccacccatttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggtgtggttgata 12112670  T
Q  445 gtct 448  Q
    ||||    
T  12112671 gtct 12112674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16013969 - 16013826
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||| | |||||||   || | |||     
T  16013969 ttagaatggtggtaacatcatatttgaatggtcacaataccataatagagtggtcatagtaccataattgattggtttcaatattaaaatatggtgttac 16013870  T
Q  342 taacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgca 385  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16013869 taccatattggaggtgtaattctcgaatgattttcaatagtgca 16013826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29715772 - 29715704
Alignment:
Q  380 agtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29715772 agtgcaatagttaaccgcacagctgtagctggacttgttttatcctagaggcggcgtggttgatagtct 29715704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 14438345 - 14438427
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14438345 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 14438427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 55326223 - 55326141
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  55326223 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 55326141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 10586015 - 10586116
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||     |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  10586015 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagaatggtcttag 10586109  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  10586110 taccata 10586116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28125420 - 28125338
Alignment:
Q  226 ttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatat 308  Q
    |||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28125420 ttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtttcaacactataatagagtggtcacagtaccatat 28125338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 32473687 - 32473752
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatg 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32473687 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatg 32473752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Original strand, 48435702 - 48435754
Alignment:
Q  270 tggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  48435702 tggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattagagtggtcttag 48435754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 55431795 - 55431680
Alignment:
Q  19 taatgttcattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatg 117  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| |  || | |||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  55431795 taatgtaccttcgataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataat-ccatatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatg 55431697  T
Q  118 atcttaacattatatat 134  Q
    ||||||||| |||||||    
T  55431696 atcttaacagtatatat 55431680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18467672 - 18467590
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  18467672 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 18467590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 309
Target Start/End: Original strand, 45904370 - 45904437
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  45904370 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatagtaacaataccatatt 45904437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 309
Target Start/End: Original strand, 45904826 - 45904893
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  45904826 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataggatggtaacaataccatatt 45904893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 249
Target Start/End: Original strand, 12112457 - 12112515
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatg 249  Q
    ||||||||||| ||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12112457 ccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatatattggagaacttaaaggttagaatg 12112515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31002959 - 31002858
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| |||||     ||||||  || |||||||||| ||||||    
T  31002959 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaataccataatagaatggtaacaatatcatat-----tggtttcggtgttaaagagtggtcttag 31002865  T
Q  342 taacata 348  Q
    |||||||    
T  31002864 taacata 31002858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 7570865 - 7570947
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || | ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7570865 ataaagagtacttttaagatcatagt-ccatatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 7570947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Original strand, 12156352 - 12156407
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  12156352 gagtgggcttagtaccataatagagtgatgtcaataccatattagagtggtcttag 12156407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 317
Target Start/End: Original strand, 48432175 - 48432222
Alignment:
Q  270 tggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggt 317  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48432175 tggtcttggtaccataatagagtggtatcaataccatattagagtggt 48432222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20507747 - 20507713
Alignment:
Q  414 ttgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20507747 ttgttttatcctagaggtggtgtggttgatagtct 20507713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3672866 - 3672805
Alignment:
Q  156 tttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcata 217  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3672866 tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcata 3672805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3692898 - 3692837
Alignment:
Q  156 tttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcata 217  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3692898 tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcata 3692837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Original strand, 9121795 - 9121856
Alignment:
Q  54 aaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||    
T  9121795 aaagagtacttttaagatcatactctcgtttttagaatgaaaatgtccattcagaattaaaa 9121856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 27605135 - 27605172
Alignment:
Q  415 tgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27605135 tgttttatcctagaggcggtgtagttgttagtctacct 27605172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Original strand, 2207390 - 2207477
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2207390 tcggaataaagagtacttttaagatcatggtccc-tgtttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatatat 2207477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16983215 - 16983163
Alignment:
Q  270 tggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16983215 tggtcctagtaccataatagagtggtatcaatatcatattagagtggtcttag 16983163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 16115881 - 16116280
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattat----atattctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||||||  ||| |    
T  16115881 ataaagagtacttttaagatcatagtccattttttgaaataataatgtcctgtcagaattaagaatgatcttaacagtatattaatattcttttgata-t 16115979  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16115980 ttttctatttttttagaagttaaaaagttagaatggtggtatcatcatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttgaagaacttaaagg-taga 16116078  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtg--gtcacaataccatattag--agtggttttagtattaaagagtgatcttagt 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  16116079 atggtgataacatcatatttgagtggtcttaacaccataatagagtggtgtcacaataccatattagaaagcggtttcagtattaaagagtga--ttagt 16116176  T
Q  343 aacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttga 442  Q
    | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||| || |||  ||||||||||   |||| || ||||||||    
T  16116177 atcatattggatgtgtaattctcgaacggttttctatagtgcagtagttaacagtactgttgtagttgaacttgttttatctaggaggtggcgtggttga 16116276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 29167741 - 29168006
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  29167741 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagcggtctcagcacc 29167839  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  29167840 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacag 29167939  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||||||| || || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29167940 tgcagtagttaatcgaacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 29168006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36429036 - 36428771
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||     
T  36429036 tggtatcaccatatttgagttgtcgtattaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacatcatatttgagtggtctcaacact 36428938  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||    
T  36428937 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagaaccatatttggaggtgtaattctcgagcgattttctacag 36428838  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36428837 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 36428771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 400
Target Start/End: Original strand, 15414516 - 15414866
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||| ||||||    ||| ||  |||||    
T  15414516 ataaagagtacttgtaagatcatagttccttttt-ggaataataatgtctcgtcggaatcaagaatgatcttaacagtatataaatgttcatttgatatt 15414614  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||| |||| |||||||||| | ||| ||||||    |||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15414615 ttt-ctacctttggagaagattaaa-gtcagatgggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttgaagaacttaaatgttaga 15414712  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaaca 346  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| ||    
T  15414713 atggtgataacaccatattttagtggtcataacaccataacagagtggtcaaggtaccatattagagtgattctagtattaaagattggtcttagtagca 15414812  T
Q  347 taatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcaca 400  Q
    || ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15414813 tattggaggtgtaaatttcgaaaggttttctatagtgcagtagttaaccgcaca 15414866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26667599 - 26667334
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |   || ||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26667599 tggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 26667501  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  26667500 ataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctagag 26667401  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26667400 tgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 26667334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26939196 - 26938931
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |   || ||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26939196 tggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 26939098  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  26939097 ataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctagag 26938998  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26938997 tgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 26938931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36423964 - 36423699
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  36423964 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaataccatatttgagtggtctcagcacc 36423866  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  36423865 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagcaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacag 36423766  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| ||||||| |  ||||| | ||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  36423765 tgcattagttaatcaaacagtagtagctgggcttgttttattctggaggcggcgtggttgatagtct 36423699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 35679644 - 35679908
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  35679644 tggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctgaacacc 35679742  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||||| | |     
T  35679743 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacaa 35679842  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35679843 tgca-tagttaactgcacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 35679908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 6155194 - 6155452
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaactta-aaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatag 289  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  6155194 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttagaaaattaaaatgttggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacag 6155292  T
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagta 388  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  6155293 agtggtaacaataccaaattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagta 6155392  T
Q  389 gttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6155393 gttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggtgtggttgatagtct 6155452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Original strand, 20180780 - 20181096
Alignment:
Q  131 atattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgga 230  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||| | |||  ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  20180780 atattcattcaatattttt-ctaattgaggagaaattaaaaagtgaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttgga 20180878  T
Q  231 gaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaag 330  Q
    ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  20180879 gaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagaatggtagcaataccgtattaaagtggtttcaatattaaag 20180977  T
Q  331 agtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagag 429  Q
    |||| |||| ||| |||| | || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| | |||    
T  20180978 agtggtcttggtatcatatttgagggtgtaaatctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacaattgtagttgagcttgttttatcatggag 20181077  T
Q  430 gcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | || |||||| |||||||    
T  20181078 gtggcgtggttaatagtct 20181096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 37248572 - 37248828
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37248572 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 37248670  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |        ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  37248671 ataacagagtggtaa--------tattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatag 37248762  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37248763 tacagta-ttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 37248828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12103352 - 12103087
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |  |||    
T  12103352 tggtatcaccatatttaagtagtcgcagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaatacc 12103254  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  12103253 ataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttcagtattaaagagtgatcttagtaccatatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacag 12103154  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12103153 tgcagtagttaatcgcacatttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 12103087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7452081 - 7451820
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| || |||||||||||||| | |  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  7452081 tggtatcaccgtatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 7451983  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  7451982 ataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacag 7451887  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7451886 tgtagtagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcagcgtggttgatagtct 7451820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39523317 - 39523111
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39523317 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 39523219  T
Q  342 taacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || |||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39523218 taccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggtt 39523119  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  39523118 gatagtct 39523111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 448
Target Start/End: Original strand, 12501737 - 12501932
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-gg 352  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||| | ||    
T  12501737 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaatagtggtcttagtatcatatttgg 12501836  T
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12501837 aggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 12501932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 32461329 - 32461582
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg-ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatag 289  Q
    |||||||| || ||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32461329 ccatattttagcggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatag 32461427  T
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagta 388  Q
    |||||||| | ||||||||     |||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  32461428 agtggtcatagtaccatat-----tggtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagta 32461522  T
Q  389 gttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32461523 gttaaccgcacagttgcagctgaacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 32461582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39518678 - 39518472
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39518678 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 39518580  T
Q  342 taacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || |||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39518579 taccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacactgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggtt 39518480  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  39518479 gatagtct 39518472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 557008 - 556757
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  557008 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattga 556911  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||     ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  556910 gtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 556816  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  556815 ttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 561780 - 561529
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  561780 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattga 561683  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||     ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  561682 gtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 561588  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  561587 ttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 561529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40148222 - 40147957
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | |  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  |  |||| ||||||| |||||||| | ||||    
T  40148222 tggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatgggggcaacaccatatttaagtggtctcaacacc 40148124  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  40148123 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcgtagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacag 40148024  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || |||||||||  | ||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40148023 tgtagtagttaattgaacaattgaagctgagcttattttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 40147957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 10759589 - 10759853
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10759589 tggtatcaccgtatttgagtgctcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacacc 10759687  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| |  |    
T  10759688 ataacagagtggtaacaataccacattaaagtggtttcagtatgacagagtggtcttagtaccatatttgagggtataattctcgaacggttttctaccg 10759787  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10759788 tgca-tagttaaccgcacagttgtaaatgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 10759853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 12044920 - 12045172
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||| | || ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  12044920 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaaaggtggtaacaccatatttgattggtctcaacaccataataga 12045018  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    |||| || | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |  || | ||||||||||    
T  12045019 gtggccatagtaccatatt-----ggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggtagtctacagtgcagtag 12045113  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  12045114 ttaaccgcacagttgtagctatgcttgttttatcctggaggcggcgtggtcgatagtct 12045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 36937293 - 36937544
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  36937293 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattga 36937390  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||     ||||| ||||||||| || || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  36937391 gtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 36937485  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36937486 ttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 36937544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 36942047 - 36942298
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  36942047 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattga 36942144  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||     ||||| ||||||||| || || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  36942145 gtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 36942239  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36942240 ttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 36942298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 260 - 448
Target Start/End: Original strand, 6514444 - 6514634
Alignment:
Q  260 catatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatgga-ggtg 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||| | ||||||| ||||| | |||||| |||| | || ||||    
T  6514444 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatacaatatcaaagtggtttcaatattaaaagagtggttttagtaccatatttgaaggtg 6514543  T
Q  358 taaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6514544 taaatctcgaatgattttctacaatgcagtagttaaccacacagttgtagctaagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 6514634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 446
Target Start/End: Original strand, 12041767 - 12041963
Alignment:
Q  251 tgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataa 349  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||  ||| ||| ||||     
T  12041767 tgatgacaccatatttgagtagtcttagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaatgtggtttcagtattaaaagaatgtacttggtaccatat 12041866  T
Q  350 tggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12041867 tggaggtgtaattctcgaacagttttttatagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagt 12041963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4872191 - 4871988
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||| || ||||     
T  4872191 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcattattaaaagaatggtcttt 4872092  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||| |||| ||||| | ||| |||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  4872091 gtaccatattgaaggtataattctcaaacggttttctacagtacagtagttaatcgaacagttgtagttgagcttgttttatcatggaggcggcgtggtt 4871992  T
Q  441 gata 444  Q
    ||||    
T  4871991 gata 4871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42001742 - 42001496
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  42001742 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattga 42001645  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| ||||||||||||     |||||| ||| || ||||| || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||     | ||||||    
T  42001644 gtggttacaataccatat-----tggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc-----tacagtag 42001555  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42001554 ttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 42001496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 243 - 443
Target Start/End: Original strand, 11981107 - 11981308
Alignment:
Q  243 tagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| || |||| |    
T  11981107 tagaatgatggtaacaccatatttgagtggtctcatcaccacaatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcggtattaaaagaatggtcttgg 11981206  T
Q  342 taacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttg 441  Q
    || |||| | ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| || ||||||| || || | ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  11981207 taccatattagaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacagttgtagatgtgcttgttttattctggaggcggcgtggttg 11981306  T
Q  442 at 443  Q
    ||    
T  11981307 at 11981308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 391
Target Start/End: Original strand, 34707306 - 34707513
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  34707306 tggtatcaccatatttgagtggatttagtatcatattgatagttttgagaacttaaag-ttagaatagtgataacaccatatttgagtgattttagcacc 34707404  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagt 382  Q
    |||| ||| || | |||||| ||||||| | || ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  34707405 ataacagaatgataacaataacatattaaaatgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttaaggtgtaaatctcgaacggttttctatggt 34707504  T
Q  383 gcagtagtt 391  Q
    ||| |||||    
T  34707505 gcaatagtt 34707513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41996973 - 41996727
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  41996973 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattga 41996876  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| ||||||||||||     |||||| ||| || ||||| || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||     | ||||||    
T  41996875 gtggttacaataccatat-----tggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc-----tacagtag 41996786  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41996785 ttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 41996727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 404
Target Start/End: Original strand, 9726532 - 9726676
Alignment:
Q  260 catatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgta 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| || ||||| || |||| |  | |||||    
T  9726532 catatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatatgaaaatggtttcagtattaaagaatggtcttaataccatatttaaagtgta 9726631  T
Q  360 aatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttg 404  Q
    || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9726632 aaccttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttg 9726676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 302 - 448
Target Start/End: Original strand, 41587048 - 41587193
Alignment:
Q  302 accatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcaca 400  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41587048 accatattaaagtggtttcagtgttaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattc--gaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcaca 41587145  T
Q  401 gttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41587146 gttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 41587193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 314 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3666129 - 3665994
Alignment:
Q  314 tggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgag 412  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||| || |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  3666129 tggtttcagtattaaaagagtggtattagtaccatattgaaggtgtaattcccgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgga 3666030  T
Q  413 attgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3666029 cttgttttatcctagaggtggcgtggttgatagtct 3665994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9911430 - 9911347
Alignment:
Q  225 tttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  9911430 tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcttagcaccat-ataaagttgtcacaataccatatt 9911347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 343
Target Start/End: Original strand, 12102639 - 12102757
Alignment:
Q  225 tttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagca-ccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagt 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |  | |||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||    
T  12102639 tttggagaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcaaaaaccataacagagtggtaacaatgtcatattaaagtggtttcagt 12102737  T
Q  324 attaaagagtgatcttagta 343  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12102738 attaaagagtggtcttagta 12102757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 275
Target Start/End: Original strand, 37549921 - 37550012
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtct 275  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  37549921 tggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagtttagagaacttaaa-gttagaatgatattaacaccatatttgagtggtct 37550012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 275
Target Start/End: Original strand, 37652719 - 37652810
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtct 275  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  37652719 tggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagtttagagaacttaaa-gttagaatgatattaacaccatatttgagtggtct 37652810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3666224 - 3666131
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccata 285  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3666224 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttagatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcatcata 3666131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7086676 - 7086595
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtc 274  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7086676 catatttgagtgattgtaataccatattgatattt-ggagatgttaaaggttagaatggtgataacaccatatttgagtggtc 7086595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 13301314 - 13301415
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||     |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13301314 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaccaataccatat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttag 13301408  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  13301409 taccata 13301415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23688369 - 23688267
Alignment:
Q  222 tattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggtttta 321  Q
    |||||| |||| |||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  23688369 tatttttgagatcttaaaagtaagaatggtagtaacatcatatttgagtggtcataataccataataaaggggtcacaagaccatattagaatggtttaa 23688270  T
Q  322 gta 324  Q
    |||    
T  23688269 gta 23688267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7452203 - 7452121
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7452203 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcaaaattaagaatgatcttaacagtatatat 7452121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Original strand, 21323810 - 21323899
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  21323810 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagactggtcttagtaccata 21323899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 9726378 - 9726474
Alignment:
Q  28 ttcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  9726378 ttcgataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaa 9726474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Original strand, 37549773 - 37549881
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  37549773 cattcgataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaa 37549871  T
Q  125 cattatatat 134  Q
    |  |||||||    
T  37549872 cggtatatat 37549881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Original strand, 1286137 - 1286192
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  1286137 gagtggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattggagtggtcttag 1286192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26667721 - 26667639
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26667721 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 26667639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26939318 - 26939236
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26939318 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 26939236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31731806 - 31731739
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31731806 ttagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatatt 31731739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 37248451 - 37248533
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37248451 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 37248533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 258
Target Start/End: Original strand, 6513559 - 6513768
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttca 141  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||    ||||||||    
T  6513559 tcggaataaagagtgctattaagatcatagtccctttt--ggaata-taatgtcccgtcataattaagaatgatcttaaaggtatataaatattctttca 6513655  T
Q  142 atattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg 241  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| |||||||||   |||  |||||||  |||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  6513656 atattttt-ctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatc--catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatgaaa-g 6513751  T
Q  242 ttagaatgatgataaca 258  Q
    |||||||| || |||||    
T  6513752 ttagaatggtggtaaca 6513768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Original strand, 37652571 - 37652679
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||||| ||||| |  || | |||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  37652571 cattcgataatatatgtcccttcagaataaagagcacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaataatgatcttaa 37652669  T
Q  125 cattatatat 134  Q
    |  |||||||    
T  37652670 cggtatatat 37652679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 329
Target Start/End: Original strand, 7833165 - 7833272
Alignment:
Q  221 atattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggtttt 320  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||| || ||||| ||||  |||||| ||   | || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  7833165 atattttggaaaagttagaggttagaatggtg-taacaccataaatgagtgatcgccgtactataatagagtggtcacattaccataatatagtggtttt 7833263  T
Q  321 agtattaaa 329  Q
    | |||||||    
T  7833264 actattaaa 7833272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 305
Target Start/End: Original strand, 1429827 - 1429889
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaatacca 305  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1429827 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa-ataatggtcacaatacca 1429889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 448
Target Start/End: Original strand, 12102801 - 12102864
Alignment:
Q  385 agtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  12102801 agtagttaaccgcacagttgtagttggtcttgttttatcctggtgacggtgtggttgatagtct 12102864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12103470 - 12103392
Alignment:
Q  56 agagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  12103470 agagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatatcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 12103392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 29167620 - 29167702
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  29167620 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 29167702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 36424086 - 36424014
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||    
T  36424086 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgttccgtcggaattaataatgatcttaa 36424014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 448
Target Start/End: Original strand, 19798645 - 19799046
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttca 141  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||    ||||||||    
T  19798645 tcggaataaagagtactatgaagatcatagtcccttttt-ggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatataaatattctttca 19798743  T
Q  142 atattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg 241  Q
    ||| |||    | ||  |||||| |||||||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| ||||||     
T  19798744 atacttt----aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag- 19798838  T
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19798839 ttagaatgggggtaacaccatatttgagttgtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggttttagtattaaagagtggtcttag 19798938  T
Q  342 taacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    |  |||| | || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19798939 tgccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggtt 19799038  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  19799039 gatagtct 19799046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 26927490 - 26927755
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  26927490 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgcc 26927588  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  26927589 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacag 26927688  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  26927689 tgcagtagttaagtgtacagttgtagctgggcttgttttattttagaggcggcgtggttgatagtct 26927755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16036068 - 16035674
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||||| | ||||||    |||||||||||||    
T  16036068 ataaagagtacttttaagatcatagtctcttttc-ggaacaataatgtcccttccgaattaagaatgatcttaatagtatataaatattctttcaatatt 16035970  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||| ||| ||  |||||| | ||||| |   |||  ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16035969 ttt-ctatttgaggagaaataaaaaatttgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaga 16035872  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaa-agagtgatcttagtaac 345  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||| | | || |||| ||| |    
T  16035871 atggtgataacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtcattttaatattaacataatggtcttggtacc 16035772  T
Q  346 ataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16035771 atattggaggtgt-aatctcgaatggttttctaaagtgcagtagttaaccacacatttgtagatgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgata 16035674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25844083 - 25843819
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | ||||    
T  25844083 tggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtgacagcatcatatttgagtggtctcaacacc 25843985  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  25843984 ataagagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatatgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 25843885  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtc 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  25843884 tgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatactggaggcggcgtggttgatagtc 25843819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38621157 - 38620754
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata---ttctttcaa 142  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||    
T  38621157 tcggaataaagattactattaagatcatagtccctttt--gaaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatataaatttctttcaa 38621060  T
Q  143 tattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggt 242  Q
    ||||||||||| ||  ||| || ||||||||||  |||  || |||  ||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  38621059 tattttttctatttgaggataaattaaaaagtcgaaatgttgttattaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaag-t 38620961  T
Q  243 tagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagt 342  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |    
T  38620960 tagaatggtgaaaacaccatatttgagtggtcttaacatcataacagagtggtgacgataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttaat 38620861  T
Q  343 aacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttg 441  Q
    | |||| |  | |||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||| || ||||    
T  38620860 accatattttagggtgtaaatctcaaacagttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcttggaggcggcgtagttg 38620761  T
Q  442 atagtct 448  Q
    |||||||    
T  38620760 atagtct 38620754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 39588143 - 39588400
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39588143 ccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaga 39588241  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  39588242 gtggtaacaataccatattaaagtggttttagtattaaagattggtctcagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacactgcagtag 39588341  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| || ||| ||| || |||| ||| |||||||| |||  || ||||| ||||||||    
T  39588342 ttaatcgaacaattgtagatgagcttgctttatcctggagtaggcgtggtagatagtct 39588400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 448
Target Start/End: Original strand, 47450993 - 47451258
Alignment:
Q  182 atggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||      
T  47450993 atggtatcgccatatttgagtggttgtaatatcatattgatagtttggagaacttaaa-gttagaatggagttaatatcatatttgagtggtctcagcgt 47451091  T
Q  282 cataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaata 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||  |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||   |    
T  47451092 cataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaaaaaga-attagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctgca 47451190  T
Q  381 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || |||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  47451191 gtacagtagttaatcgaacagttgtagttgagcttgttttatcttggaggcggcgtggttgatagtct 47451258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40166429 - 40166042
Alignment:
Q  58 agtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttct 152  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||  | ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||        
T  40166429 agtactattaagatcatagtccctttt--gaaataataatgttccgtctgaattaagaatgatcttaacagtatataaatattctttcaatatttt---- 40166336  T
Q  153 acttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatg 252  Q
    | ||  |||||| |||||||||   || |  |||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  40166335 aattgaggagaaattaaaaagtggaaagt--ggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtg 40166239  T
Q  253 ataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-g 351  Q
     ||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |    
T  40166238 gtaacaccatatttgagtggtctcaataccataagagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattcg 40166139  T
Q  352 gaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     | |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||||| || || | |||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  40166138 aatgtgtaaatttcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgtatagttgtagttgtgcttgttttatcctagaggcggcgttgttgttagtct 40166042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 28434388 - 28434607
Alignment:
Q  230 agaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aa 328  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  28434388 agaagttaaaggttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaa 28434487  T
Q  329 agagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctaga 428  Q
    ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||| || |||  |||||||||||| ||    
T  28434488 agaatgatctttgtaccatattggaggtgtaaatctcgaacggttttctatagtaaagtagttaactgcacaattgtagttgaacttgttttatcctgga 28434587  T
Q  429 ggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | |||   ||||||||||||    
T  28434588 gacggcaaggttgatagtct 28434607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 448
Target Start/End: Original strand, 33301018 - 33301213
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga 353  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||    
T  33301018 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttaagtattaacgagtggtcttagtaccatatttga 33301117  T
Q  354 -ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33301118 aggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatgaaattgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 33301213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 241 - 448
Target Start/End: Original strand, 51041288 - 51041496
Alignment:
Q  241 gttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatctta 340  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51041288 gttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaattccatattaaagtggtttcaatattaaagagtgatctta 51041387  T
Q  341 gtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggt 439  Q
    ||| ||||  ||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||    
T  51041388 gtaccatatttggaggtatagttctcgaacgattttctacagtgcagtaattaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggt 51041487  T
Q  440 tgatagtct 448  Q
    |||||||||    
T  51041488 tgatagtct 51041496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 260 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8138190 - 8138001
Alignment:
Q  260 catatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgt 358  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| | |||| |||    
T  8138190 catatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaagagtatcatattaaagtggtttcagtattaaagggtggtcttagtaccatatttgagggtgt 8138091  T
Q  359 aaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  8138090 aattctcgaacggttttctacattgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcgatatggttgatagtct 8138001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 23192644 - 23192850
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  23192644 ttagaatggtggtaacattatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 23192743  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||| |||| || ||||||    
T  23192744 gtaccatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctg-gcttgttttatcctggaggaggcgtggtt 23192842  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  23192843 gatagtct 23192850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10140419 - 10140151
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| | |  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  10140419 tggtatcacaatatttgaatggtcgtagtggcatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 10140321  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaat-- 379  Q
    |||| | |||||| |||||||||||     ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| |||||  |      
T  10140320 ataacaaagtggttacaataccatag----gtggtttcaatattaaagaatggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttcggttt 10140225  T
Q  380 -----agtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  10140224 tctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctagaggtggcgtggttgattgtct 10140151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12260274 - 12260058
Alignment:
Q  226 ttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtat 325  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  12260274 ttggagaagttaaaacttagaatgatggtaacaccatatttgagtggtctcagcacaataatagagtggtcacaataccatattataatagtttcagtat 12260175  T
Q  326 taaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcct 425  Q
    | ||||||| ||||||     || ||||||||||| | || ||   ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |  || | ||||||||||||    
T  12260174 t-aagagtggtcttag-----tattggaggtgtaattttcaaattgttttctattatgcagtagttaaccgcatagttgtacatgtgtttgttttatcct 12260081  T
Q  426 agaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | || ||| ||||||||||||||    
T  12260080 aaagacggcgtggttgatagtct 12260058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16833753 - 16833548
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  16833753 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtttcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 16833654  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||| || | || | ||||    
T  16833653 gtaccatattggaggtgtaattttcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaggctgttttatcctggatgtggcgaggtt 16833554  T
Q  441 gatagt 446  Q
    ||||||    
T  16833553 gatagt 16833548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 398
Target Start/End: Original strand, 18784338 - 18784540
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||||||| || ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18784338 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-gaagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccagatttgagtggtctcaataccataataga 18784436  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||  ||| ||||||||     | |||| |||||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  18784437 gtggctacagtaccatat-----ttgtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 18784531  T
Q  390 ttaaccgca 398  Q
    |||||||||    
T  18784532 ttaaccgca 18784540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3094401 - 3094188
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  3094401 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattga 3094304  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| ||||||||||||     |||||| |||||| ||||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  3094303 gtggttacaataccatat-----tggtttcagtattaaaagattggtcttaataccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 3094209  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctg 410  Q
    |||| || ||||||| |||||    
T  3094208 ttaatcgaacagttgtagctg 3094188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33055352 - 33055214
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaa-tatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatag 289  Q
    ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  33055352 ccatatttgagtggttgaaagtacgatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtctcaacaccatagtag 33055254  T
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtg 334  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  33055253 agtggtcacaataccatatta-----gttttagtattaaagagtg 33055214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10135612 - 10135518
Alignment:
Q  354 ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10135612 ggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcaactgggcttgttttatcctagaggcggcgtggttgattgtct 10135518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 449
Target Start/End: Original strand, 16649510 - 16649647
Alignment:
Q  313 gtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctga 411  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  16649510 gtggtttcagtattaaagagtggtattagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctgg 16649609  T
Q  412 gattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtcta 449  Q
      |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16649610 acttgttttatcccggaggcggcgtggttgatagtcta 16649647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 8267662 - 8267763
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  8267662 ttagaatggtgataacaacatatttgagtggtctcaacaccataatagagtgatcacaataccatat-----tggtttcagtatttaagagtggtcttag 8267756  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  8267757 taccata 8267763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 279 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11806591 - 11806421
Alignment:
Q  279 caccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttca 377  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||  || | ||||||||||| ||||||||||     
T  11806591 caccataaaagagtggtaataataccatattaaagttgcttaagtattaaagagtgatcttagtgccatatttgaaagtgtaaatctcaaacgattttct 11806492  T
Q  378 atagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
      | ||||||| ||||||||||| ||| || |||  || |||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  11806491 gcactgcagtatttaaccgcacaattgtagttgaacttcttttattctgaaggcggcgtggttgatagtct 11806421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 329
Target Start/End: Original strand, 25779137 - 25779227
Alignment:
Q  239 aggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa 329  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  25779137 aggttagaatgacaatagcaccatatttgagtgatcttaataccataatagagtggtcataatactatattatagtggtttcagtattaaa 25779227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 286
Target Start/End: Original strand, 16649405 - 16649507
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||| | | ||||    
T  16649405 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtctcatattgatgttttggagaaattaaa-gttagaatcgtggtaacaccatatttgagtggtttcaacacc 16649503  T
Q  283 ataa 286  Q
    ||||    
T  16649504 ataa 16649507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10135775 - 10135693
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10135775 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 10135693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10140543 - 10140461
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10140543 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 10140461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 41097784 - 41097885
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41097784 ttagaatggtggtaataccatatttgcgtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttag 41097878  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  41097879 taccata 41097885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 47450851 - 47450947
Alignment:
Q  28 ttcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  47450851 ttcgataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaa 47450947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11806715 - 11806607
Alignment:
Q  131 atattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaatta-tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||| |||||  ||||||| |  |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  11806715 atattctttcaatattttt-ctacttgaagaaaaattaaaaagtc-gaattggtggtatcactgtatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttgg 11806618  T
Q  230 agaacttaaag 240  Q
    |||||||||||    
T  11806617 agaacttaaag 11806607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25844203 - 25844119
Alignment:
Q  50 ggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  25844203 ggataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 25844119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12906374 - 12906322
Alignment:
Q  270 tggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  12906374 tggtcttagtaccataataaagtggtatcaataccatattagagtggtcttag 12906322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36724929 - 36724877
Alignment:
Q  270 tggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  36724929 tggtcttagtgccataatagagtggtatcaataccatattagagtggtcttag 36724877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 51041158 - 51041240
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  51041158 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaacgatatatat 51041240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 39200534 - 39200599
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatg 249  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  39200534 tggtatcaccatatttgagtgatcgtaatgccatattgatactttggagaaattaaa-gttagaatg 39200599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Original strand, 47455353 - 47455415
Alignment:
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47455353 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctaggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgata 47455415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Original strand, 23193097 - 23193149
Alignment:
Q  270 tggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23193097 tggtcttagtaccataataaaatggtatcaataccatattagagtggtcttag 23193149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 25779065 - 25779113
Alignment:
Q  226 ttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtc 274  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  25779065 ttggagaagttagaggttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtc 25779113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 17964327 - 17964592
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17964327 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 17964425  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  17964426 ataacagagtggtaacaatttcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacag 17964525  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17964526 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 17964592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 448
Target Start/End: Original strand, 6407628 - 6407893
Alignment:
Q  182 atggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcac 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6407628 atggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccgtattgatagtttggaaaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcac 6407726  T
Q  282 cataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaata 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| | |    
T  6407727 cataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctaca 6407826  T
Q  381 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6407827 gtg-agtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 6407893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 2699720 - 2700139
Alignment:
Q  28 ttcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaaca 126  Q
    ||||||||| || ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  2699720 ttcgataatataagttccttcggaataaagagtactattaagatcatagtcccttttc-gaaataataatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacg 2699818  T
Q  127 ttatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgat 222  Q
     ||||||    |||||||||||||||    | ||  |||||  |||||||||   |||   | |||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||    
T  2699819 atatataaatattctttcaatatttt----aattgaggagatattaaaaagtggaaatggcgatatcaccatatttgaatggtcgtagtgtcatattgat 2699914  T
Q  223 attttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    ||||| || || |||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  2699915 attttagaaaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccgtatttgagtggtctcagcaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtggtttcag 2700013  T
Q  323 tattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgtttta 421  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| || || | ||||||||    
T  2700014 tattaaagagtgatcttagtaccatatttggaggtgtaattctcg-acgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagttgggcttgtttta 2700112  T
Q  422 tcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||    
T  2700113 tcctggaagcggcgtggttgatagtct 2700139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 448
Target Start/End: Original strand, 12405988 - 12406386
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||    
T  12405988 ataaagagtatttttaagatcatagtccctttt--ggaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgagcttaacagtatataaatattctttcaatatt 12406085  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||| ||| ||  |||||| |||||| |||| |||  | ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  12406086 ttt-ctaattgaggagaaattaaaatgtcaaaatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaag-ttaaa 12406183  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaaca 346  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||    
T  12406184 atagtggtaacatcatatttgagtggtatcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaaagtgattttagtatca 12406283  T
Q  347 taatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatag 445  Q
    || | || ||| ||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||    
T  12406284 tatttgagggtataaatctctcacggttttctacggtgcagtagttaaccacacagttgtagttgagcatgttttatcatgaaggcggcgtgattgatag 12406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 442
Target Start/End: Original strand, 4156999 - 4157396
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaac-----at-tatatattcttt 139  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||      || || |||||||||    
T  4156999 tcggaataaagagtattattaagatcataatccctttttag-aataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaatgggatatataaatattcttt 4157097  T
Q  140 caatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaa 239  Q
    |||||||||    | ||   ||||| |||||||||   |||  || |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4157098 caatatttt----aattgaagagaaattaaaaagtggaaatggtgatatcaccatatttgagtggtggtagtatcatattgatgttttggagaaattaaa 4157193  T
Q  240 ggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatctt 339  Q
    | || ||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  4157194 gttt-gaatggtggtgacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagcggtaacaataacatattaaagtgatttcagtattaaagagtgatatt 4157292  T
Q  340 agtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtgg 438  Q
    || | |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4157293 agcaccatatttaagggtgtaaatttcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgcaccgttgtagctgagtttgttttatcctagaggcagtgtgg 4157392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 11570517 - 11570782
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11570517 tggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgacatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtcttaacacc 11570615  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||| | ||    
T  11570616 ataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtataattctggaacggttttctacag 11570715  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  11570716 cggagtagttcaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgattgtct 11570782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12689289 - 12689033
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagag 291  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  12689289 catatttgagtggtcatagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagag 12689191  T
Q  292 tggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagt 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  12689190 tggtaacaatacgatattaaagtggtttcaatattaaagagtcgtcttaataccataattgagggtgtaattgtcgaacggttttctacagtgtagtagt 12689091  T
Q  391 taaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  12689090 taaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtct 12689033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 446
Target Start/End: Original strand, 29892039 - 29892292
Alignment:
Q  193 atatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagt 292  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  29892039 atatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaat-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtgctcttagtaccataacagagt 29892137  T
Q  293 ggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagtt 391  Q
    ||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||| | ||||| | | |||| |||||    
T  29892138 ggtaacaataccatattaaagcgatttcagtattaaagagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaaatatcgaaaggttttctacaatgcaatagtt 29892237  T
Q  392 aaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||| |||||||| |||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29892238 aaccacacagttgtagctggacttgttttatcctggaggaggtgtggttgatagt 29892292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 439
Target Start/End: Original strand, 11559989 - 11560245
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| | |  ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  11559989 tggtatcaccatatctaagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaactaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcaacacc 11560087  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||| ||||| ||||| | |     
T  11560088 ataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaa 11560187  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggt 439  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  11560188 tgcagtagttcaccgcacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcgtggt 11560245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 448
Target Start/End: Original strand, 16835923 - 16836189
Alignment:
Q  178 aattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctta 277  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |    
T  16835923 aattgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattaatgttttggagaagttaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctca 16836021  T
Q  278 gcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttc 376  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  16836022 acaccataacagtgtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccaaatatgagggtgtaattctcgaacggttttc 16836117  T
Q  377 aatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     | |||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16836118 tacagtgcagtaactaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 16836189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 424
Target Start/End: Original strand, 19995147 - 19995412
Alignment:
Q  159 ggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataaca 258  Q
    |||||| ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19995147 ggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaa-gttagaatgatggtaaca 19995245  T
Q  259 tcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtg 357  Q
     | || ||||| ||||| |  ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||  ||| | || ||||    
T  19995246 ccgtagttgaggggtctcataaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaatagtgtttttagtacgatatttgagggtg 19995345  T
Q  358 taaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcc 424  Q
    ||||||||||| | ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  19995346 taaatctcgaaaggttttctacggtgtagtagttaaccgcatagttgtagctgggcttgttttatcc 19995412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 448
Target Start/End: Original strand, 33687430 - 33687636
Alignment:
Q  243 tagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagt 342  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||    
T  33687430 tagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcggcaccataacagagtggtgacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggttttagt 33687529  T
Q  343 aacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttg 441  Q
    | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||  ||||||    
T  33687530 accatatttgagggtgtaaatctcgaaggattttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagtttgttttatcctggagacggcatggttg 33687629  T
Q  442 atagtct 448  Q
    |||||||    
T  33687630 atagtct 33687636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11428336 - 11428124
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  11428336 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaatgaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacacc 11428238  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  11428237 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtagtcttagtaccatatttgatggtgtaaatctcgaacggttttctacag 11428138  T
Q  382 tgcagtagttaacc 395  Q
    ||||||| ||||||    
T  11428137 tgcagtacttaacc 11428124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 348
Target Start/End: Original strand, 11613431 - 11613699
Alignment:
Q  83 ttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcag 177  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||      
T  11613431 ttttggaacaataatgttccgtcagaattaagaatgatcttaacaatatataaatattcttttaatatttt--ctacttgcggagaaattaaaaagtcga 11613528  T
Q  178 aattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctta 277  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  11613529 aatggtggtatcaccataattgagtggtcgtaggct-atattgatattttggagaactcaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagaggtctta 11613626  T
Q  278 gcaccataatagagtggtcacaatacc--atattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11613627 gcaccataatagagtggtaataataccatatattaaagtggtttcagtattaaatagtgatcttagtaccata 11613699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 439
Target Start/End: Original strand, 11534510 - 11534735
Alignment:
Q  214 catattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagag 313  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  11534510 catattgatgttttggagaaactaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaag 11534608  T
Q  314 tggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgag 412  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  11534609 tggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaatgcagtagttcaccgcacagttgtagttgag 11534708  T
Q  413 attgttttatcctagaggcggtgtggt 439  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||    
T  11534709 cttgttttatcctggaggcggcgtggt 11534735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 8748096 - 8747847
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| || ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||    
T  8748096 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagatgctaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctcaacaccataattga 8747998  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagt-attaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| ||||||||||||     |||||| ||| || |||||||| |||||||| |||| || |||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  8747997 gtggttacaataccatat-----tggtttcagtaataaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattttcgaacggttttctacagtgcagtag 8747903  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatag 445  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  8747902 ttaaccacatagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgttgttgatag 8747847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5856334 - 5856183
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| || |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5856334 tggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattgatactttggaaaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaacacc 5856236  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgat 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  5856235 ataatagagtggtaacaataccatatta-agtggtttcagtattatagagtgat 5856183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Original strand, 25314225 - 25314389
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  25314225 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacacc 25314323  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25314324 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 25314389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Original strand, 26201719 - 26201883
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  26201719 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacacc 26201817  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26201818 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 26201883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14509241 - 14509050
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatgg 352  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||| ||| |||| |||    
T  14509241 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtgataacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtaccatattgg 14509142  T
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  14509141 aggtgtaattctcgaacgattttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagatgagcttgttttatcttggaagcggcgtggttgata 14509050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 449
Target Start/End: Original strand, 24589022 - 24589198
Alignment:
Q  269 gtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcga 367  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||     ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  24589022 gtggtctcaacaccataatagagtggttacattaccatatt-----ggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcga 24589116  T
Q  368 acgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtcta 449  Q
    ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  24589117 acggttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtcta 24589198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 249
Target Start/End: Original strand, 22694953 - 22695156
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattata----tattctttca 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  | || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||    ||||||||||    
T  22694953 tcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctttt--gaaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacagtatagaaatattctttca 22695050  T
Q  142 atattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaatta-tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaag 240  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||| |||||||||||||||     
T  22695051 atattttt-ctaattaaggagaaattaaaaagtc-gaattggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtatcatgttgatagtttggagaacttaaa- 22695147  T
Q  241 gttagaatg 249  Q
    |||||||||    
T  22695148 gttagaatg 22695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 375
Target Start/End: Original strand, 2863242 - 2863429
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||    
T  2863242 ccatatttgagtggttgaaatttcatattgatattt-ggagatgttaaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcacaataccatagtaga 2863340  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa----gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgatttt 375  Q
    ||||||| | ||||||| | || |||||| |||| ||||    |||||  ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  2863341 gtggtcatagtaccataattgattggtttcagtactaaaatatgagtggccttagtatcatattggaggtgtaattttcgaacgttttt 2863429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 447
Target Start/End: Original strand, 20748169 - 20748316
Alignment:
Q  301 taccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcac 399  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |  |||||||| ||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20748169 taccatattggagtagttttagtattaaaagagtggttttagtaccatatttaaggtgtaattctcgaaccgttttctacggtgcagtagttaaccgcac 20748268  T
Q  400 agttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtc 447  Q
    ||||| || ||   ||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  20748269 agttgtagatggacttgttttattctggaggcggcgtggttgatagtc 20748316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21309160 - 21309093
Alignment:
Q  381 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21309160 gtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 21309093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 400
Target Start/End: Original strand, 9751585 - 9751793
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagag 291  Q
    ||||||| |||||| | |||  ||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  | |||| |||||    
T  9751585 catatttaagtggttgaaattacatattgatattt-ggagttgttaaatgttagaatgatggtaacatcatatttgagtggtcaaaatatcatagtagag 9751683  T
Q  292 tggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagt 390  Q
    |||||| | ||||||| | || ||||||   |||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | | ||| | |||||||||||    
T  9751684 tggtcatagtaccataattgattggtttcgctattaaaatagtggtcttagtgccatattggaggtgtaattctcgaatggtgttctacagtgcagtagt 9751783  T
Q  391 taaccgcaca 400  Q
    ||| ||||||    
T  9751784 taatcgcaca 9751793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22609839 - 22609632
Alignment:
Q  241 gttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatta--aagagtgatct 338  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||| ||||||| | |||||||| |  ||||  ||||||| ||     
T  22609839 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataataatgttggcacaacaccatatcaaagtggtttaaaaattaataagagtggtca 22609740  T
Q  339 tagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtgg 438  Q
    || || |||| ||||||||||| |||||||   ||||| |  ||||||| ||||| | | |||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||     
T  22609739 tattaccatattggaggtgtaattctcgaatagttttctaccgtgcagttgttaatcacgcagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcgtga 22609640  T
Q  439 ttgatagt 446  Q
     |||||||    
T  22609639 ctgatagt 22609632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 452
Target Start/End: Original strand, 15991547 - 15991777
Alignment:
Q  225 tttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagta 324  Q
    ||||||||  ||||| |||||| || || ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||| | ||||||| | || |||||| |||     
T  15991547 tttggagatgttaaaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtcataataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagtt 15991646  T
Q  325 ttaaa-gagtgatcttagtaac-ataatggag-gtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgtttta 421  Q
    ||||| |||||   ||| || | ||| | ||  |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15991647 ttaaaagagtggcattaatacccatatttgattgtgtaattctcaaacggttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgtttta 15991746  T
Q  422 tcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  15991747 tcctagaggcggcttggttgaaaatctacct 15991777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 452
Target Start/End: Original strand, 15999209 - 15999439
Alignment:
Q  225 tttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagta 324  Q
    ||||||||  ||||| |||||| || || ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||| | ||||||| | || |||||| |||     
T  15999209 tttggagatgttaaaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtcataataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagtt 15999308  T
Q  325 ttaaa-gagtgatcttagtaac-ataatggag-gtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgtttta 421  Q
    ||||| |||||   ||| || | ||| | ||  |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15999309 ttaaaagagtggcattaatacccatatttgattgtgtaattctcaaacggttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgtttta 15999408  T
Q  422 tcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  15999409 tcctagaggcggcttggttgaaaatctacct 15999439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17913881 - 17913768
Alignment:
Q  226 ttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtat 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| |||| |||||    
T  17913881 ttggagaacttaaag-ttagaatggtaataacactatatttaagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatactgtattaaagtagtttcagtat 17913783  T
Q  326 taaagagtgatctta 340  Q
    ||||||||| |||||    
T  17913782 taaagagtggtctta 17913768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 302
Target Start/End: Original strand, 6112760 - 6112846
Alignment:
Q  214 catattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaata 302  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6112760 catattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtcttaaca-cataatagagtggtaacaata 6112846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 13736615 - 13736711
Alignment:
Q  352 gaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||  |||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  13736615 gaggtgtaaatctcgaacagttttctacagtgcagtagttattcgcacatttgtagatgtgcttgttttatcctggaggcagtgtggttggtagtct 13736711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14775807 - 14775752
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  14775807 gagtggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattggagtggttttag 14775752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 370
Target Start/End: Original strand, 2882546 - 2882728
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||    
T  2882546 ccatatttgagtggttgaaatttcatattggtattt-ggatttgttaaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcacaataccatagtaga 2882644  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa----gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacg 370  Q
    ||||||| |  |||||| | || |||||| |||| ||||    |||||  ||||||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  2882645 gtggtcatagcaccataattgattggtttcagtactaaaatatgagtggccttagtatcatattggaggtgtaattttcgaacg 2882728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 33687273 - 33687357
Alignment:
Q  28 ttcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa 113  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  33687273 ttcgataatatatgttccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaa 33687357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 448
Target Start/End: Original strand, 11614035 - 11614125
Alignment:
Q  358 taaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |  || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11614035 taaatctcaaacagttttctaaagtgcattagttaaccgcacaattgtaattgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 11614125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 11559841 - 11559941
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    |||| |||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  11559841 catttgataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaa 11559939  T
Q  125 ca 126  Q
    ||    
T  11559940 ca 11559941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 11570369 - 11570468
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11570369 cattcgataatatatgtcccttcggattaaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcc-ctcagaattaagaatgatcttaa 11570466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Original strand, 32814937 - 32814989
Alignment:
Q  270 tggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  32814937 tggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattatagtggtcttag 32814989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 6407508 - 6407590
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  6407508 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 6407590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Original strand, 16835811 - 16835889
Alignment:
Q  56 agagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16835811 agagtacttttaaggtcatagtccctattt-ggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 16835889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21309237 - 21309182
Alignment:
Q  288 agagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagta 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21309237 agagtggtaacaataccatattaatgtgatttcagtattaaagagtggtcttagta 21309182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Original strand, 25314103 - 25314178
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacact-cccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  25314103 ataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaac 25314178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Original strand, 26201597 - 26201672
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacact-cccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  26201597 ataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaac 26201672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35129847 - 35129797
Alignment:
Q  272 gtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  35129847 gtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattagaatggtcttag 35129797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 22695238 - 22695299
Alignment:
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgat 443  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  22695238 tgcagtggttaaccgcacagttgtagctgtacttgttttatcgtggaggcggtgtgattgat 22695299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 315
Target Start/End: Original strand, 32551318 - 32551394
Alignment:
Q  239 aggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtg 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  || |||||| |||| ||  | || |||||||||||||||    
T  32551318 aggttagaatggtgaaaacatcatattagagtggtccgagtaccatattagaatgacctcagtaccatattagagtg 32551394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 37259645 - 37259910
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37259645 tggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 37259743  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  37259744 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 37259843  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37259844 tgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 37259910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 183 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8694038 - 8693775
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| || |||    
T  8694038 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagaacc 8693940  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  8693939 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacag 8693840  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8693839 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgaggcggcgtggttgatagt 8693775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 37264332 - 37264597
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37264332 tggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 37264430  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  37264431 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 37264530  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37264531 tgcagtagttaaccgcacaattgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 37264597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16421486 - 16421091
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||    ||||||| |||||    
T  16421486 ataaagagtactattaagatcatagtcccttttt-ggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatataaatattctttcgatatt 16421388  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||    | ||  |||||| |||||| ||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  16421387 tt----aattgaggagaaattaaaa-gtggaaatggtcgtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaga 16421294  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaaca 346  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||    
T  16421293 atggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatacaatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtacca 16421194  T
Q  347 taatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatag 445  Q
    || | || ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16421193 tattcgaaggtgtaaatctcggacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctgtaggcggcgtggttgatag 16421094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 5927987 - 5928252
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||| | ||||||||  |||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5927987 tggtatcaccatatttgagtggtcgtggtaccattttgatagtttgaaaaacttaaaa-ttagaacggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 5928085  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||    
T  5928086 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttaagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacgattttctacag 5928185  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5928186 tgcagtagttaatcgaacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggtgtggttgatagtct 5928252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47244575 - 47244310
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  47244575 tggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 47244477  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||| | ||    
T  47244476 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgggggtttaattctcgaacggttttctacag 47244377  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47244376 tgcagtagttaaccgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 47244310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13059736 - 13059472
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13059736 tggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcagcacc 13059638  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||  || |||||| ||||||||||| ||||| | |     
T  13059637 ataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagaaccatatttgaaggtgt-aatctcgaacggttttctacaa 13059539  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13059538 tgcagtagttaaccacacagttgtagctgagcttgttttattctagaggcggagtggttgatagtct 13059472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31273840 - 31273583
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||        || |||||||||||||||| ||||||    
T  31273840 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaat--------caccatatttgagtggtctcagcacc 31273750  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  31273749 ataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 31273650  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31273649 tgcagtagttaaccacacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 31273583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 446
Target Start/End: Original strand, 12823513 - 12823926
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||||| || || |  |||| |||||||||| | ||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||    
T  12823513 cattcgataatataagtcctttcggaataaagagtattattaagatcatagaccctttt--ggaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaa 12823610  T
Q  125 cattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattg 220  Q
    || ||||||    |||||||||||||||    | ||   ||||| || ||||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  12823611 cagtatataaatattctttcaatatttt----aattgatgagaaatttaaaagttgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattg 12823706  T
Q  221 atattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggtttt 320  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  12823707 atattttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttc 12823805  T
Q  321 agtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttt 419  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| || || |       ||||||    
T  12823806 agtattaaagagtggtcttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttagccgcatagatgga------cttgttt 12823899  T
Q  420 tatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12823900 tatcctggaggcggcgtggttgatagt 12823926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19102304 - 19102039
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19102304 tggtatcaccatatttgagtggtcgtatggccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacatcatatttgagtggtctcaacacc 19102206  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  19102205 ataacagagtggtaacaataccatattaaaatggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 19102106  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  19102105 tgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcctggaggcgacgtggttgatagtct 19102039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31269353 - 31269096
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||        || |||||||||||||||| ||||||    
T  31269353 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaat--------caccatatttgagtggtctcagcacc 31269263  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  31269262 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 31269163  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31269162 tgcagtagttaaccacacggttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 31269096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 51698243 - 51697979
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| || ||| | |||||||||||||||| | ||||    
T  51698243 tggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttaggatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcaacacc 51698145  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  51698144 ctaacagagtggtgacaataccatattaaagtagtttcaatattaaagagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 51698045  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51698044 tgca-tagttaaccgcacaattgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 51697979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 132 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15134531 - 15134332
Alignment:
Q  132 tattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggag 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||| ||||  | |||  ||||||| ||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||    
T  15134531 tattctttcaatattttttctacctgagaagaaattataaagataaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcctagtggcatattgatattttggag 15134432  T
Q  232 aacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaaga 331  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15134431 aacttaaatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaacaccataatagagtagtcacaatacgatattagagtggttttagtattaaaga 15134332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23093480 - 23093293
Alignment:
Q  131 atattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  23093480 atattctttcaatattttt-ctacttttaaagaagttataaagtcagaatggtggtatcaccattttttagcggtcgcagtgtcatattgatattttaga 23093382  T
Q  231 gaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  23093381 gaacttaaaggttagaatgatgataacactatattctggtggtcttagcaccataatagagtggttacaataccatattaaagtagttt 23093293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 55251976 - 55251781
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-gg 352  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |       
T  55251976 taacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattcaa 55251877  T
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || || | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  55251876 aggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgtacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggtggcgtggttgatagtct 55251781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 204 - 448
Target Start/End: Original strand, 19540950 - 19541194
Alignment:
Q  204 gtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaatac 303  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||     
T  19540950 gtcgtaataccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatagtgttaacaccatatttgagtggtctcaacaccatagcagagtggtaacaatat 19541048  T
Q  304 catattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagt 402  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||| || || ||    
T  19541049 catattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaactgt 19541148  T
Q  403 tgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || |||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19541149 tgtagctggacttgttttatcctataggcggcgtggttgatagtct 19541194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 31729159 - 31729420
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  31729159 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggttgcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 31729257  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  31729258 ataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 31729353  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  31729354 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtgattgattgtct 31729420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 446
Target Start/End: Original strand, 48276475 - 48276680
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||     
T  48276475 ttagaatggtggtaacaccatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 48276574  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  48276575 gtaccatattggaggtgtaattctcgaatggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgttttatcctggaggcggcgtggtt 48276674  T
Q  441 gatagt 446  Q
    ||||||    
T  48276675 gatagt 48276680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 449
Target Start/End: Original strand, 8030302 - 8030510
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||     
T  8030302 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaaatggttttagtattaaaagaatgatcttg 8030401  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||| | || |||    
T  8030402 gtatcatattggaggtgtaattttcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacatttgtagctgggcttgttttatcctggaggcagcgttgtt 8030501  T
Q  441 gatagtcta 449  Q
    |||||||||    
T  8030502 gatagtcta 8030510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19106935 - 19106720
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| | ||||    
T  19106935 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgttctcaacacc 19106837  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  19106836 ataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttctgtattaaagagtgatcttaataccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 19106737  T
Q  382 tgcagtagttaaccgca 398  Q
    |||||||||||||||||    
T  19106736 tgcagtagttaaccgca 19106720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 5271191 - 5271452
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  5271191 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctgaacacc 5271289  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  5271290 ataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagcaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacag 5271385  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||| || |  ||||||| || ||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5271386 tgcaatagtgaatcaaacagttgtagttggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 5271452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 13521769 - 13522025
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg-ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatag 289  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13521769 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaacatatttgagtggtctcaacaccataatag 13521867  T
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagta 388  Q
    |||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  13521868 agtggtcatagtaccatatt-----ggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattaaaagtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagta 13521962  T
Q  389 gttaaccgcacagttgcagc---tgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || ||||| |||||||||||   ||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13521963 gtcaaccgtacagttgcagcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 13522025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31766137 - 31766002
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31766137 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcacc 31766039  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttt 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31766038 ataatagagtggtaacaataccatattaaagtggttt 31766002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19906519 - 19906313
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  19906519 ttagaatggtgatagcaccatatttgagtgatctcggcaccataatagagtggtaacaataccatattagagtggtttaagtattaaaagaatggtcttg 19906420  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | || ||||||||| | |  ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |  |||    
T  19906419 gtaccatattggaggtgtaattttcgaacggttttctaaagcgcagtagtt-atcaaacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcggagtt 19906321  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  19906320 gatagtct 19906313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 308
Target Start/End: Original strand, 32081770 - 32082024
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaaaatgatcttaacattatata----ttctttcaa 142  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||| ||||||    ||||| |||    
T  32081770 tcggaataaagagtactattaagatcatagtccctttt--ggaataataatgtcccgtcggaattaaa----tcttaacagtatataaatattcttccaa 32081863  T
Q  143 tattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggt 242  Q
    ||||||    | ||  |||||| ||||||| |   |||  ||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  32081864 tatttt----aattgaggagaaattaaaaaatggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-t 32081958  T
Q  243 tagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatat 308  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32081959 tagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagcggtaacaataccatat 32082024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6943252 - 6942987
Alignment:
Q  28 ttcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaaca 126  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||      
T  6943252 ttcgataatatatgtccattcggaataaatagtatttttaagatcatagtccctttt--ggaataataatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaatg 6943155  T
Q  127 ttatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgat 222  Q
     ||||||    |||||||||||||||| ||| ||  | |||| ||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  6943154 gtatataaatattctttcaatattttt-ctaattaagaagaaattaaaaagtcaaaatggtgatatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgat 6943056  T
Q  223 attttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagt 292  Q
    | ||| ||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  6943055 agttttgagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtagtctcagcaccataacagagt 6942987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 368
Target Start/End: Original strand, 13065533 - 13065769
Alignment:
Q  131 atattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaa-gtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||| |||  |||| || |||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||     
T  13065533 atattctttcaatattttt-ctacttgagaagaaattaaaaaagtcgaaattgtgttatcaccatatttgagtggtcgtagtgttatattgatattttg- 13065630  T
Q  230 agaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa 329  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||| |||| ||| || | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  13065631 agaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtagtatcagcactataacagactgataacaataacatattaaagtggtttcggtattaaa 13065729  T
Q  330 gagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaa 368  Q
    ||||| | |||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  13065730 gagtggttttagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaa 13065769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 33468799 - 33469006
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||| || | | |||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  33468799 ttagaatgatggtaacaccaaatttgagtggtctcaacatcataatagagttgtaatagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 33468898  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||| | |||| || ||||||    
T  33468899 gtaccatattggaggtgtaattctcaaaccttattcaacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctgagcttgttttatcatggaggtggcgtggtt 33468998  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    || |||||    
T  33468999 gacagtct 33469006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 33463182 - 33463383
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || | | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| || | ||     
T  33463182 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagttgtaatagtacaatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggttttg 33463281  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||| || || | |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  33463282 gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcggggtt 33463381  T
Q  441 ga 442  Q
    ||    
T  33463382 ga 33463383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12874822 - 12874601
Alignment:
Q  226 ttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtat 325  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||  || ||||||||| || ||| |||||    
T  12874822 ttggagaagttaaaaattaaaatgatgataacaccatatttgagtggtttaagcaatataatagagtggtcac-gta-catattagaatgatttcagtat 12874725  T
Q  326 t-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcc 424  Q
    | |||| ||| ||||| || |||| |||| |||||| ||   |||| ||||| | |||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  12874724 taaaagggtggtcttactaccatattggaagtgtaattcattaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacaattttagctgagcttgttttatcc 12874625  T
Q  425 tagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||    
T  12874624 tggaggcggcgtgattgatggtct 12874601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 47574971 - 47574854
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47574971 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataga 47574873  T
Q  291 gtggtcacaataccatatt 309  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  47574872 gtggtcatagtaccatatt 47574854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12878495 - 12878301
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatgg 352  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  12878495 taacaccatatttgagtgttctcaacaccataactgagtggtcaccgtaccatactagagtcgtttcaacattaaaagagtggtcttagtatcatattgg 12878396  T
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||| || |||| || ||| ||||||||||    
T  12878395 aggtgtaattctcgaacggttttcta-cgtgcagtaattaacaacacagttgtagctgaacttgttttattctggaggtggcgtgattgatagtct 12878301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 425
Target Start/End: Original strand, 8649412 - 8649640
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagag 291  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |  || ||||| ||||| | | |||||| | || ||||||||||    
T  8649412 catagttgagtggttgaaatatcatattgatattt-ggagatgttaaaaattagactagtggtaacaccatatctaaatggtctcaacatcataatagag 8649510  T
Q  292 tggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagt 390  Q
    |||||||| |||||||||     ||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||| || |||||||| ||||||||  ||||| | |||| ||||||    
T  8649511 tggtcacagtaccatatt-----ggtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgtagtagt 8649605  T
Q  391 taaccgcacagttgcagctgagattgttttatcct 425  Q
    |||||||||||||| || |  | ||||||||||||    
T  8649606 taaccgcacagttgtagttaggcttgttttatcct 8649640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 425
Target Start/End: Original strand, 8661219 - 8661447
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagag 291  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |  || ||||| ||||| | | |||||| | || ||||||||||    
T  8661219 catagttgagtggttgaaatatcatattgatattt-ggagatgttaaaaattagactagtggtaacaccatatctaaatggtctcaacatcataatagag 8661317  T
Q  292 tggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagt 390  Q
    |||||||| |||||||||     ||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||| || |||||||| ||||||||  ||||| | |||| ||||||    
T  8661318 tggtcacagtaccatatt-----ggtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgtagtagt 8661412  T
Q  391 taaccgcacagttgcagctgagattgttttatcct 425  Q
    |||||||||||||| || |  | ||||||||||||    
T  8661413 taaccgcacagttgtagttaggcttgttttatcct 8661447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 309
Target Start/End: Original strand, 31298170 - 31298287
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  31298170 ccatatttgagtggttgaagtaccatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcaacaccatagtaga 31298268  T
Q  291 gtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31298269 gtggtcacaataccatatt 31298287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40408499 - 40408272
Alignment:
Q  213 tcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccat-aatagagtggtcacaataccatattag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  || |||||||||||||||  |||||||| || |||||| | ||||||||||||||     
T  40408499 tcatattgatattttggagaacttaaa-gttagaatggtggtggcaccatatttgagtggtcccagcaccataaacagagtgctaacaataccatattaa 40408401  T
Q  312 agtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggag-gtgtaaatct--cgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagc 408  Q
    |||| ||| | ||||||| |||| |||||||| |||| |  ||  |||||||||   ||||| ||||| | ||| ||||| |||||| |||| ||| ||     
T  40408400 agtgatttcaatattaaaaagtggtcttagtaccatatttaagaatgtaaatcttgagaacggttttctacagtacagtaattaaccacacaattgtagt 40408301  T
Q  409 tgagattgttttatcctagaggcggtgtg 437  Q
    |||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  40408300 tgaacttgttttatcctaaaagcggtgtg 40408272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 353 - 446
Target Start/End: Original strand, 32082029 - 32082122
Alignment:
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32082029 aggtgtaaatctcgaatggttttctacactgcagtagttaaccgcacaattgtaactgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagt 32082122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 7902938 - 7903039
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7902938 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttag 7903032  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  7903033 taccata 7903039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40840646 - 40840434
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagag 291  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||  ||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |  | |||| ||| |    
T  40840646 catatttgagtggttgaaatattacattgatattt-ggagatgttacaagttagaatgatcctaacaccatatttgagtggtcacaaaatcatagtaggg 40840548  T
Q  292 tggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaa-cataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    |||||| | ||||||| | || |||||| ||| ||||| ||||||  ||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |    
T  40840547 tggtcatagtaccataattgattggtttcagttttaaaagagtgacattaatagtcatattggaggtgtaattctcgaacgattttc-ttagtgcagtgg 40840449  T
Q  390 ttaaccgcacagttg 404  Q
    |||| ||||||||||    
T  40840448 ttaatcgcacagttg 40840434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4551323 - 4551230
Alignment:
Q  159 ggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatg 252  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||| | |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4551323 ggagaaattaaaaagtcaaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccacattgatattttggacaacttaaaggttagaatgatg 4551230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4551203 - 4551059
Alignment:
Q  301 taccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcac 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||| || |||||||| |||| | || |||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||| ||||     
T  4551203 taccatattagagtggtttcagta----agaatggtcttagtaccatatttgatggtgtaaatcttaaacggttttctacagtgcagtagttaatcgcag 4551108  T
Q  400 agttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||| |  |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  4551107 agttgtaattgagtttgttttatcctggaggcggcgtagttgatagtct 4551059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Original strand, 52690907 - 52691010
Alignment:
Q  194 tatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtg 293  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  52690907 tatttgagtggtcgtagtaccatatcgatattttggaaaagttaaatgttagaatgatgataacacaataattgagtggtctcattactataatagaatg 52691006  T
Q  294 gtca 297  Q
    ||||    
T  52691007 gtca 52691010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34560689 - 34560588
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  34560689 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcaatattaaagagtggtcttag 34560595  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  34560594 taccata 34560588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39319825 - 39319736
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||     |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39319825 taacaccatatttgagtgttctcagcaccataatagaatggtcacaatactatat-----tggtttcagtattgaagagtgatcttagtaccata 39319736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Original strand, 42758519 - 42758643
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| || ||||| ||||||| | |||||| || |||    
T  42758519 tggtagcgccatatttgagtgattgaaataccatattgacattt-ggagatgttaaaagttagaatggtggtaacaccatatttaaatggtctcagtacc 42758617  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatat 308  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  42758618 ataatagaatggtcacagtacgatat 42758643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 5271069 - 5271151
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5271069 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatat 5271151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2820000 - 2819902
Alignment:
Q  354 ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| ||||| |||| |  |||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||    
T  2820000 ggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcaacagttaattgcatagttgtagctaaacttgttttatcctggacgcggcatggtagatagtctacct 2819902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 275
Target Start/End: Original strand, 39217186 - 39217270
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtct 275  Q
    |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  39217186 ccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaagttaaaattcagaatgatcgaaacaccatatttgagtggtct 39217270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41817096 - 41816994
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||||| || |||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  41817096 ccatatttgagtggttgaagtaccatattgatactt-ggagaagttaaaaatt-gaatgatggtaacatcatattttaatggtctcaacaccataataga 41816999  T
Q  291 gtggt 295  Q
    |||||    
T  41816998 gtggt 41816994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 55252136 - 55252037
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||||| || || |  |||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  55252136 cattcgataatataagtcccttcggaataaagaatactattaagatcatagtcccttttt-ggaataataatgtcccgtcagaattaagaatgattttaa 55252038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19102450 - 19102344
Alignment:
Q  28 ttcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaaca 126  Q
    ||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||     
T  19102450 ttcgataatatatgtccattcgaaataaagagtacttttaagatcattgtccc-tatttggaataacaatgtcctgtcgaaattaagaatgatcttaacg 19102352  T
Q  127 ttatatat 134  Q
     |||||||    
T  19102351 gtatatat 19102344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Original strand, 55081574 - 55081629
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  55081574 gagtggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattggagtggtcttag 55081629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20513330 - 20513280
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggt 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  20513330 gagtggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattggagtggt 20513280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19107062 - 19106975
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaatt-aaaatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  19107062 tcggaataaagagtacttttaagatcata-gcccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtatatat 19106975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 309
Target Start/End: Original strand, 3997889 - 3997956
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  3997889 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataaaatggtagcaataccatatt 3997956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 5927865 - 5927947
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  5927865 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatatat 5927947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8694161 - 8694079
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  8694161 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 8694079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31269474 - 31269392
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  31269474 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatat 31269392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31273963 - 31273881
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  31273963 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatat 31273881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 31729037 - 31729119
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  31729037 ataaaaagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttatcagtatatat 31729119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31766319 - 31766237
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  31766319 ataaaaagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 31766237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 32545269 - 32545182
Alignment:
Q  336 tcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatc 423  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    | |||||||||||||  |||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  32545269 tcttagtaacatattggagttgtaattctcgaacgattaattacagtgcagtagttagtcgcacaattgtagttgagcttgttttatc 32545182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 309
Target Start/End: Original strand, 42316543 - 42316606
Alignment:
Q  246 aatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  42316543 aatggtgataataccatatttgagtggtatcagcaccataatagagttgccacaataacatatt 42316606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 47574782 - 47574691
Alignment:
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  47574782 aggtgtaattctcgaacagttttctacatggcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggatgcggcgtgattgata 47574691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2820107 - 2820030
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttg--gagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatattt 266  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  2820107 ccatatttgagtggttgtagtaccatatagatattttgcggagaacttaaatgttagaatggtggtaagatcatattt 2820030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13059856 - 13059783
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  13059856 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttagaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaac 13059783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 309
Target Start/End: Original strand, 16595811 - 16595853
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16595811 gagtggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatatt 16595853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 404
Target Start/End: Original strand, 42758694 - 42758744
Alignment:
Q  354 ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttg 404  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  42758694 ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgcacagttg 42758744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 408 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16953187 - 16953147
Alignment:
Q  408 ctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16953187 ctgagcttgttttatcctggaggcgttgtggttgatagtct 16953147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 19892236 - 19892499
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19892236 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccat--tgatagtttggagaatttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtcttagcacc 19892332  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  19892333 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacag 19892432  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19892433 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 19892499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 1934761 - 1935026
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||||| || |||    
T  1934761 tggtatcaccatatatgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagaacc 1934859  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  1934860 ttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 1934959  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1934960 tgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 1935026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 25497094 - 25497358
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  25497094 tggtatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacacc 25497192  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  25497193 ataacagagtggtaataataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 25497292  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25497293 tgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 25497358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 9189575 - 9189836
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  9189575 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 9189673  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  9189674 ataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacag 9189769  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9189770 tgcagtagttaatcaaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 9189836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 25478074 - 25478330
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  25478074 ccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacatcatatttgagtagtctcaacaccataacaga 25478172  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| |||    
T  25478173 gtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtactatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgca-tag 25478271  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||  |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  25478272 ttattcgcacagttgtagctgggcttgttttattctggaggcggcgtggttgatagtct 25478330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 9180496 - 9180757
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |   |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  9180496 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgctatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 9180594  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||     ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  9180595 ataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacag 9180690  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9180691 tgcagtagttaatcaaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 9180757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 448
Target Start/End: Original strand, 17544963 - 17545331
Alignment:
Q  83 ttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcag 177  Q
    ||||| || |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||      
T  17544963 ttttgaaacaataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacagtatataaatattctttcaatattttt-ctatttgaggagaaattaaaaagtcga 17545061  T
Q  178 aattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctta 277  Q
    ||   | |||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |    
T  17545062 aaaggtagtatcatcatatttgagtgttcgtaataccatattgatagtttagagaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatattttagtggtctca 17545160  T
Q  278 gcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttc 376  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||  | |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  17545161 gcaccataacaaagtggtaacaatat-agattaaagtggtttccgtattaaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaatctcgaatgattttc 17545259  T
Q  377 aatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     | | |||  ||||||||||||| |||| || || | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  17545260 tacaatgcgttagttaaccgcactgttgtagatgtgcttgttttatcctcgaggtggcgtggttgatagtct 17545331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 185 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12797250 - 12796987
Alignment:
Q  185 gtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccat 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| ||  || | |||||||||||||||| | ||||||    
T  12797250 gtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaata-ttagaatggtggcaataccatatttgagtggtctcaacaccat 12797152  T
Q  285 aatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtg 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| |  |||    
T  12797151 aacagagtggttacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacggtg 12797052  T
Q  384 cagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  12797051 cagtagttaaccgcacagttgtagccggacttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtct 12796987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30651197 - 30650991
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30651197 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 30651099  T
Q  342 taacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || |||| | |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  30651098 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggtt 30650999  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  30650998 gatagtct 30650991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 10160506 - 10160757
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  10160506 ccatatttgagtagttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaacaccaaaataga 10160604  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||||| | |||||||||     | ||| ||||||||| || || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  10160605 gtggtcatagtaccatatt-----gatttcagtattaaaagaatggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca-tag 10160698  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10160699 ttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 10160757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31327076 - 31326801
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttag---- 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||        
T  31327076 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggttgtagaacg 31326978  T
Q  279 -------caccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacg 370  Q
           ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| | || ||||||| |||||||||    
T  31326977 gtggcaacaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaatagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacg 31326878  T
Q  371 attttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     ||||| | |||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  31326877 gttttcta-agtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggtggcgtggttgatagtct 31326801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28603630 - 28603393
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||| | ||||    
T  28603630 tggtatcatcatatttgagtggtcgtagtaccatattaatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttaagtggtctcatcacc 28603532  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||    
T  28603531 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatattaaaaagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttttacag 28603432  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgtttt 420  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||    
T  28603431 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgtttt 28603393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 29678036 - 29677831
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  29678036 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtatcaatattaaagagtggtcttag 29677937  T
Q  342 taacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || ||||  ||  ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||  ||||||  |||||    
T  29677936 taccatatttgtgggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggctttttttatcctgtaggcggcttggtt 29677837  T
Q  441 gatagt 446  Q
    ||||||    
T  29677836 gatagt 29677831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18344749 - 18344493
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18344749 tggtatcaccatatctgagaggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgcc 18344651  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||||||          ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  18344650 ataacagagtggtaacaatat---------gtggtttcagtattaaatagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacag 18344560  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  18344559 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggagccggcgtggttaatagtct 18344493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 35602236 - 35601988
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||  || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35602236 ccatatttgagtggttgaaataccatattggtattt-ggagaagttaaaaattagaattttggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataga 35602138  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||||| | |||||||||     ||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  35602137 gtggtcatagtaccatatt-----ggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttggatgtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 35602043  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35602042 ttaatcgaacaattgtagctgggtttgttttatcctggaggcggcgtggttgata 35601988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 448
Target Start/End: Original strand, 19578167 - 19578447
Alignment:
Q  167 taaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatattt 266  Q
    |||||||||||| |  | ||||| |||||||||| |||||| |  | | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||    
T  19578167 taaaaagtcagagtggttgtatcaccatatttgaatggtcgtagcaccgtattgataatttagagaacttaaatgttagaatggtgataacaatttattt 19578266  T
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcg 366  Q
     | |||| | | || |||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||    
T  19578267 aaatggtataaacagcataatagagtggtta-agtaccatattagagtgattttagtattaaagagtgattttaataccatattgaaggtgtaaatctcg 19578365  T
Q  367 aacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||| || ||   |||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||    
T  19578366 aacgattttctacagtgcaatagttaaccgcccaattgtagttggacttgttttaccctggaggcagcatggttgatagtct 19578447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 446
Target Start/End: Original strand, 40847350 - 40847626
Alignment:
Q  166 ttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatt 265  Q
    ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||    
T  40847350 ttaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatcttgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggacgtaacatcatatt 40847448  T
Q  266 tgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaa-cataatggag-gtgtaaatc 363  Q
    |||||||||| | |||||| | | |||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||| | ||| |||||||||    
T  40847449 tgagtggtctcaacaccattacaaagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttggtaaccatatttgagagtgtaaatc 40847548  T
Q  364 tcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    ||||||| ||||| ||     ||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  40847549 tcgaacggttttctat-----agtagttaaccacacagttgtagttggacttgttttatccaggaggtggcgtggttgatagt 40847626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Original strand, 17453355 - 17453564
Alignment:
Q  185 gtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttg-gagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacca 283  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  17453355 gtatcaccatatttgagtggttgaaatattatattgatatttttagagatgttaaaaattagaatgatgataacaccatatttgagtggtctcaacacca 17453454  T
Q  284 taatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtg 383  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||     |||| |  |||| ||| || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  17453455 taatagagtggttacaataccatatta-----gtttca--attatagaatggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtg 17453547  T
Q  384 cagtagttaaccgcaca 400  Q
    |||||||||||||||||    
T  17453548 cagtagttaaccgcaca 17453564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 448
Target Start/End: Original strand, 21523573 - 21523753
Alignment:
Q  260 catatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgt 358  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||| | |||| |||    
T  21523573 catatttgagtggtcttaacacgataatagagtggtg----taccatattaaagtagtttaagttttaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgt 21523668  T
Q  359 aaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  21523669 aaatctcgaacgattttcta-----cagtagttaaccgcacagttgtagctgaacttgttttaacctagaagcggcgtggttgatagtct 21523753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 448
Target Start/End: Original strand, 7737689 - 7737884
Alignment:
Q  254 taacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatgg 352  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| || || | || ||| |||| |||    
T  7737689 taacaccatgtttgagtggtctcaacaccataatagagtggtgacaatatcatattaaagtgatttcagtattaaaagaatggttttggtatcatattgg 7737788  T
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| || ||| ||| || || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7737789 aggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacaattgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 7737884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 336 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30658437 - 30658325
Alignment:
Q  336 tcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtg 435  Q
    |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  30658437 tcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcg 30658338  T
Q  436 tggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||    
T  30658337 tggttgatagtct 30658325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19538698 - 19538555
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| | |||  |||||||| |  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19538698 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagtaaaaaattagaatggtagtaacaccataatagagtggtcttagcaccataataga 19538600  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatctta 340  Q
    ||||||||| ||||||||     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19538599 gtggtcacattaccatat-----tggtttcagtattaaagagtgatctta 19538555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29677537 - 29677443
Alignment:
Q  354 ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29677537 ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttattttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 29677443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28855317 - 28855167
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| |||| || ||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  28855317 ccatatttgagtggttgaagtaccatattgatattttg-agaagttcaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggttgcagcaccatagtaga 28855219  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
     |||||||||||||||||     |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28855218 atggtcacaataccatat-----tggtttcagtatt-aagagtgatcttagtaccata 28855167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 444
Target Start/End: Original strand, 19094433 - 19094524
Alignment:
Q  354 ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgtttt-atcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19094433 ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtaattaatcgcacagttgtagctgagcttgtttttatcctggaggcggtgtggttgata 19094524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 452
Target Start/End: Original strand, 42926725 - 42926796
Alignment:
Q  381 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42926725 gtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagcttgtattatcctggaggcggcgtggttgatagtctacct 42926796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 6297718 - 6297819
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  6297718 ttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaacataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagaatggtcttag 6297812  T
Q  342 taacata 348  Q
    |||||||    
T  6297813 taacata 6297819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38591515 - 38591429
Alignment:
Q  263 atttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaatacc--atattagagtggttttagtattaaa--gagtgatcttagtaac 345  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  38591515 atttgagtggtctcaataccataataaagtggtcacaataccatatattagagtggttttagtattaaattgagtgaccttagtaac 38591429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 329
Target Start/End: Original strand, 27414896 - 27414993
Alignment:
Q  235 ttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaatacc---atattagagtggttttagtattaaa 329  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27414896 ttaaaggttagaatggttataacatcatatttaagtggtctcaataccataatagaatggtcacgataccacaatattagagtgatttcagtattaaa 27414993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30631766 - 30631641
Alignment:
Q  327 aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaat-ctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcaca---gttgcagctgagattgttttat 422  Q
    |||||||  |||||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||   ||||||| || | |||||||||    
T  30631766 aaagagttgtcttagtaccatattgaaggtgtaaattctcgaacggttttctacagtgcagtagataaccgcacaacagttgcagttgggcttgttttat 30631667  T
Q  423 cctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||    
T  30631666 cctggaggtggcgtggttgatagtct 30631641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 444
Target Start/End: Original strand, 35638962 - 35639026
Alignment:
Q  380 agtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35638962 agtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgata 35639026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12797373 - 12797291
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaatt-aaaatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  12797373 ataaagagtacttttaagatcataatccctgttt-ggaataacaatgtcccgtcagaattaaaaatgatcttaacgatatatat 12797291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Original strand, 9185063 - 9185147
Alignment:
Q  50 ggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  9185063 ggataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 9185147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31327227 - 31327126
Alignment:
Q  23 gttcattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatct 121  Q
    |||| ||||||||| ||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31327227 gttccttcgataatatatgtcccttcgaaataaaaagtacttttaagatcatagtccctattt-ggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatct 31327129  T
Q  122 taa 124  Q
    |||    
T  31327128 taa 31327126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Original strand, 9180372 - 9180456
Alignment:
Q  50 ggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  9180372 ggataaagagtacttttaagatcatagttcc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 9180456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18344871 - 18344789
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  18344871 ataaatagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 18344789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30629169 - 30629087
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtc 274  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||  ||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  30629169 ccatatttgagtggttgaaataccatattggtatttt-gagatgttaaatgttacaatggtggtaacaccatatttgagtggtc 30629087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30643453 - 30643406
Alignment:
Q  241 gttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataata 288  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30643453 gttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataata 30643406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28603749 - 28603676
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  28603749 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaac 28603676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 295
Target Start/End: Original strand, 42926361 - 42926395
Alignment:
Q  261 atatttgagtggtcttagcaccataatagagtggt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42926361 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggt 42926395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 275
Target Start/End: Original strand, 19094269 - 19094352
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtct 275  Q
    ||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||    
T  19094269 ccatatttgagtgattgaaataccatattgacattt-ggagatattaaaagttagaatggtggtaacatcatatttaaatggtct 19094352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 341
Target Start/End: Original strand, 22714615 - 22714933
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatctta- 123  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||  |||||| ||||||||||     
T  22714615 cattcgataatgtatgttccttcgggataaagagtacttttaagatcatactcccttttt-ggaataataatatcccatcgaaattaagaatgatcttat 22714713  T
Q  124 --acat-tatatattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattg 220  Q
      |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  22714714 taacatataaatattctttcgatatttt-tctacttttggagaagttaaaaagtcataatgatagtatcatcatatttgagtgatcgtaataccatattg 22714812  T
Q  221 atattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggtttt 320  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| |||     
T  22714813 atatattgaagaagttaaatgttagaatggtcataacatcatatttgaatgatcttagcaccataaaagagtgatcaaagtatcatattagagtgatttc 22714912  T
Q  321 agtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  22714913 agtattaaagagtgatattag 22714933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 404
Target Start/End: Original strand, 24672944 - 24673320
Alignment:
Q  23 gttcattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatct 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |  || | |||||||||| |||||||| ||   |||  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  24672944 gttcattcgataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagaccag--tcc--tttttggaatagtaatgtccagtcggaattaagaatgatgt 24673039  T
Q  122 taacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcata 217  Q
    |||  |||||||    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||| | || ||||    
T  24673040 taaatttatataaatattctttcaatattt---ctacttttggagaagttaaaaagtcacaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccata 24673136  T
Q  218 ttgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggt 317  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  24673137 ttgttattttgaagaacttaaaggttggaatggtgataacatcatatttgagtggtcttagcaccactatagagt-gtcatagtaccatattagagtggt 24673235  T
Q  318 tttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttg 404  Q
    || |  |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  24673236 ttcaacattaaaaagtggtcttagtaccatattggaggtgtaaatcttgaactctttt--acagtgtagtggttaaccgcacagttg 24673320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2966095 - 2965694
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||| |||  |||||| |||||| |||||| ||||||    |||||||||||||    
T  2966095 ataaaaagtatttttaagatcatagtcc-ttttttgaaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacagtatataaatattctttcaatatt 2965997  T
Q  147 t---tttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggtt 243  Q
    |   |||||||||  |||||| ||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||| || | || ||||| ||||  || |||||||||| | ||    
T  2965996 tatttttctacttgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgggcgtagtaccatatcgatagattagagaacttaacg-tt 2965898  T
Q  244 agaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagta 343  Q
    | |||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2965897 aaaatggtggtaacatcatatttgagtagtctcaacaccataacagagtggtaacaatactatattaaagtagttttagtattaaagagtggtcttagta 2965798  T
Q  344 acataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttga 442  Q
     |||| | || |||||||||||| || | ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2965797 ccatatttgagggtgtaaatctcaaatggttttctacagtgcagtagttaactgcatagttgtagctggacttgttttatcctagaggcggtgtggttga 2965698  T
Q  443 tagt 446  Q
    ||||    
T  2965697 tagt 2965694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 448
Target Start/End: Original strand, 1910605 - 1911002
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    |||||||||||||    
T  1910605 ataaagagtactattaagatcatagtcccttttttg-aataataatgtcccgtcggaattaagaatgaccttaacggtatataaatattctttcaatatt 1910703  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggta-tcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttag 245  Q
    ||    | |   |||||| || ||||||   |||  ||||| |  ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  1910704 tt----aatcgaggagaaatttaaaagtggaaatggtggtaataaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttggagaaattaaag-tcag 1910798  T
Q  246 aatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaac 345  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  1910799 aatggtggtaacatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttaatacc 1910898  T
Q  346 ata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||  || | |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  1910899 atatttgaatgtgtaaatctcgaatggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagcttgttttatactggaggcagcgtggttgata 1910998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19167121 - 19166696
Alignment:
Q  23 gttcattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatct 121  Q
    |||||||||||||| || || |  |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||    
T  19167121 gttcattcgataatataagtcccttcggaataaagagtactattaagatcatagtcccttttt-gaaataataatgttctgccggaaataagaatgatct 19167023  T
Q  122 taacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcata 217  Q
    ||||  ||||||    ||||||||||| |||    | ||  |||||| ||||||||    |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||    
T  19167022 taacggtatataaatattctttcaatacttt----aattgaggagaaattaaaaagaagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccata 19166927  T
Q  218 ttgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggt 317  Q
    |||   |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |    
T  19166926 ttgtagttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatatgagtggtctcaacaccataatagagtggtaaccacaccatattaaagtgat 19166828  T
Q  318 tttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattg 416  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||    
T  19166827 ttaagttttaaagaatgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatagtgcagtagttaacagcacagttgtagttgagcttg 19166728  T
Q  417 ttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19166727 ttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 19166696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 444
Target Start/End: Original strand, 15951323 - 15951584
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15951323 tggtatcactatatttgagtggtcgtagtaccaaattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcacc 15951421  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttc--aata 380  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||  | | |||||||||||||||| |||||   | |    
T  15951422 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatcgaacgtgtaaatctcgaacggttttctacaga 15951521  T
Q  381 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  15951522 gtgcagtagttaactgcacagttgtagctgggcttgttttat-ctggaggcggcgtggttgata 15951584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 447
Target Start/End: Original strand, 23548265 - 23548664
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaaca--ttata--tattctttcaatatt 146  Q
    ||||||| |||||||||||| | | ||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |    
T  23548265 ataaagaatacttttaagattatagtccctttt--ggaacaataatgtcttgtcggaattaagaatgatcttaacagtttataaatattctttcaatagt 23548362  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||| ||| ||  |||||| ||||||||||  |||  |||||||  |||||||||||||||  | |   ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  23548363 ttt-ctatttgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcatagtgcgatattgatattatggagaacttaaag-ttcga 23548460  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatta--aagagtgatcttagtaa 344  Q
    ||| || ||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||  || |||| ||||||||     
T  23548461 atggtggtaacaccatatttgagtgatctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattataaatagtggtcttagtat 23548560  T
Q  345 cataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgat 443  Q
    |||| |  ||| || |||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23548561 catatttaagggtgaaaatcttgaacggttttctacaatgcagtagttaaccgcgcagttgtagctgaacttgttttatcctagaggcgacgtggttgat 23548660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33416873 - 33416609
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33416873 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacacc 33416775  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| ||| || | |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | || | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  33416774 ataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagcggtcttagtaccgtatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 33416675  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  33416674 tgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggttgatagtct 33416609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36683906 - 36683641
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||| | ||||    
T  36683906 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatcttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaagaccatatttgagtggtctcaacacc 36683808  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| |||| |||||||||| | ||    
T  36683807 ataacatagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcaaacgattttctacag 36683708  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  36683707 tgcagtagttaatcgcacagatgtagctgaccttgttttatcctggaggcagcgtggttgatagtct 36683641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 40125712 - 40125918
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40125712 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 40125810  T
Q  342 taacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || |||| | |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  40125811 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggtt 40125910  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  40125911 gatagtct 40125918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 44925692 - 44925956
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||    
T  44925692 tggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcgacacc 44925790  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  44925791 ataacagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggttttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 44925890  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44925891 tgca-tagttaaccgcatagttgtagatgaccttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 44925956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 31449697 - 31449899
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||     ||||| ||||||||| || || |||||    
T  31449697 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattgagtggttacaataccatatt-----ggtttcagtattaaaagattggtctta 31449791  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31449792 gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggtt 31449891  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  31449892 gatagtct 31449899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 403
Target Start/End: Original strand, 28564484 - 28564807
Alignment:
Q  82 tttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtca 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||   ||||||    ||||||||| |  ||| ||| ||  |||||| |||||||||      
T  28564484 tttttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaaatgtatataaacattctttcaaaaaattt-ctaattgaggagaaattaaaaagtgg 28564582  T
Q  177 gaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctt 276  Q
     |||  |||||||  |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||     
T  28564583 aaatagtggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaag-ttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 28564680  T
Q  277 agcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttc 376  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  28564681 agcaccataagagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaagagtggtcttactatcatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 28564780  T
Q  377 aatagtgcagtagttaaccgcacagtt 403  Q
     | | |||| ||||||| || ||||||    
T  28564781 tacactgcaatagttaatcgaacagtt 28564807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 403
Target Start/End: Original strand, 28572212 - 28572430
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28572212 tggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaag-ttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcacc 28572309  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagt 382  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | | |    
T  28572310 ataagagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaagagtggtcttactatcatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacact 28572409  T
Q  383 gcagtagttaaccgcacagtt 403  Q
    ||| ||||||| || ||||||    
T  28572410 gcaatagttaatcgaacagtt 28572430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 438
Target Start/End: Original strand, 43302470 - 43302714
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggt---cttagcaccataata 288  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||   || | ||||||||||    
T  43302470 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtggtctcaacaccataata 43302568  T
Q  289 gagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagt 387  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| | ||||||| ||||  |||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  43302569 gagtggtcatagtaccatatt-----ggtttcaatattaaaagagtagtcttagtaccacattgaaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagt 43302663  T
Q  388 agttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtgg 438  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  43302664 agttaaccgcacaggtgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtgg 43302714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17026204 - 17025997
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| | |||| ||||| || ||||     
T  17026204 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaatattaaaagaatggtcttg 17026105  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgaga-ttgttttatcctagaggcggtgtggt 439  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |    
T  17026104 gtaccatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagct-agacttgttttatcctggaggcgacgtgat 17026006  T
Q  440 tgatagtct 448  Q
    |||||||||    
T  17026005 tgatagtct 17025997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17556696 - 17556489
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatctta 340  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| | |||| ||||| || ||||     
T  17556696 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaatattaaaagaatggtcttg 17556597  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgaga-ttgttttatcctagaggcggtgtggt 439  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |    
T  17556596 gtaccatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagct-agacttgttttatcctggaggcgacgtgat 17556498  T
Q  440 tgatagtct 448  Q
    |||||||||    
T  17556497 tgatagtct 17556489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Original strand, 28559333 - 28559568
Alignment:
Q  85 ttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||   ||||||    |||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||| ||   ||    
T  28559333 ttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaaatgtatataaacattctttcaatattttt-ctaattgaggagaaattaaaa-gtggaaa 28559430  T
Q  180 ttatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagc 279  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||    
T  28559431 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaa-ttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagc 28559528  T
Q  280 accataatagagtggtcacaataccatattagagtggttt 319  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28559529 accataagagagtggtaacaataccatattaaagtggttt 28559568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 279 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1807701 - 1807534
Alignment:
Q  279 caccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttca 377  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||     
T  1807701 caccataatagagtggttacaatatcatag----gtggtttcagtattaaagagtgatcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttct 1807606  T
Q  378 atagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattg-ttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1807605 acagtgcactagttaaccgcacagttgtagctggacttgtttttatcctagaggcggcgtggttgatagtct 1807534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 289 - 448
Target Start/End: Original strand, 18876240 - 18876400
Alignment:
Q  289 gagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagt 387  Q
    |||||||| ||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||| | |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  18876240 gagtggtctcaacaccatattaaggtggtttcaatattaaagagtggtattagtatcatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 18876339  T
Q  388 agttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18876340 agttaaccgcacagttgtagatgagtttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 18876400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34118687 - 34118528
Alignment:
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagta 388  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||| | || ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||    
T  34118687 agtggtaacaataccatattaaagtggtttcattattaaagagtggccttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacagttttctacggtgcagta 34118588  T
Q  389 gttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  34118587 gttaacagcacagttgtagctgggcttgttttatcctaaaggcgacgtggttgatagtct 34118528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 444
Target Start/End: Original strand, 38181888 - 38182266
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaaaa-tgatcttaacattatata----ttctttca 141  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||    
T  38181888 tcggaataaagagtaccattaagatcatagtcc-ttttttggaataataatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtatataaatattctttca 38181986  T
Q  142 atattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg 241  Q
     |||||     | ||  |||||| |||||||||   |||  ||  ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| ||||||     
T  38181987 ttattta----aattgaggagaaattaaaaagttgaaatggtgagatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagt 38182082  T
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    || ||||  || ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||                   |    
T  38182083 tt-gaatagtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttta-------------------g 38182162  T
Q  342 taacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || |||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38182163 taccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttttatagtgcagtagttaacagcacagttgtagctgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggtt 38182262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 410
Target Start/End: Original strand, 4238123 - 4238336
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  4238123 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattga 4238220  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| ||||||||||||     |||||| |||||| ||||| || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4238221 gtggttacaataccatat-----tggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 4238315  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctg 410  Q
    |||| || ||||||| |||||    
T  4238316 ttaatcgaacagttgtagctg 4238336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 410
Target Start/End: Original strand, 4242862 - 4243075
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  4242862 ccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataattga 4242959  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| ||||||||||||     |||||| |||||| ||||| || |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4242960 gtggttacaataccatat-----tggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 4243054  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctg 410  Q
    |||| || ||||||| |||||    
T  4243055 ttaatcgaacagttgtagctg 4243075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17793783 - 17793664
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | | | |||||    
T  17793783 ccatatttgaatggttgcagtaccatatcgatatttaggagaagttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagaggtctcaataacttcataga 17793684  T
Q  291 gtggtcacaataccatatta 310  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17793683 gtggtcacaataccatatta 17793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24090873 - 24090705
Alignment:
Q  260 catatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgt 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||  ||| | |||| |||    
T  24090873 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtacaatatttgaggatgt 24090774  T
Q  359 aaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcg 432  Q
    |||||||||||| |||||     | || |||||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||||    
T  24090773 aaatctcgaacggttttc-----tacaatagttaaccgcacagttgtagataagcttgttttatcttggaggcg 24090705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17020796 - 17020472
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||  ||||||    ||||||| |||||    
T  17020796 ataaagagtactattaagatcattgtcccttttt-ggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtatataaatattctttcgatatt 17020698  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||    | ||  |||||| |||||||||   |||  ||||||| |||||||| |||||||  | |  |||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  17020697 tt----aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaaattaaag-ttaga 17020603  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaaca 346  Q
    ||| || ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | || |||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||    
T  17020602 atggtggtaacaccatgtttgagtggtctcagcgccataagagaattgtaacaatatcatatgaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtacca 17020503  T
Q  347 taat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttc 376  Q
    || | | | ||||||||||| |||| |||||    
T  17020502 tattcgaatgtgtaaatctcaaacggttttc 17020472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17551233 - 17550909
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||  ||||||    ||||||| |||||    
T  17551233 ataaagagtactattaagatcattgtcccttttt-ggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtatataaatattctttcgatatt 17551135  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||    | ||  |||||| |||||||||   |||  ||||||| |||||||| |||||||  | |  |||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  17551134 tt----aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaaattaaag-ttaga 17551040  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaaca 346  Q
    ||| || ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | || |||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||    
T  17551039 atggtggtaacaccatgtttgagtggtctcagcgccataagagaattgtaacaatatcatatgaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtacca 17550940  T
Q  347 taat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttc 376  Q
    || | | | ||||||||||| |||| |||||    
T  17550939 tattcgaatgtgtaaatctcaaacggttttc 17550909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 355 - 448
Target Start/End: Original strand, 15875608 - 15875701
Alignment:
Q  355 gtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15875608 gtgtaattcttgaacggttttctatagtgcagtagttaatcgtacaattgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 15875701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26779563 - 26779268
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaaca--ttata--tattctttcaatatt 146  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||    
T  26779563 ataaaaagtacttttaagatcatagtccctttt--ggaaaaataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaaaagtttataaatattctttcaatatt 26779466  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaat--tatggtatcgccatatttgagtggtcgc--aatatcatattgatattttgg-agaacttaaagg 241  Q
    ||| ||| ||  ||| || ||||||| ||| |||  | ||||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||| ||||||| | |||| ||||||     
T  26779465 ttt-ctatttgaggaaaaattaaaaaatcaaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcccgtagtgccatattaatatttttgcagaagttaaag- 26779368  T
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    ||| |||| || || || |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |  ||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26779367 ttaaaatggtg-tagcaccatatttgagtggtctcagcaacataacagagtgatatcaatatcatatta-aatggtttcagtattaaagggtgatcttag 26779270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29220647 - 29220550
Alignment:
Q  209 aatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccata 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  29220647 aatatcatattgatattttg-agatattaaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcacaatagcataatagagtggtcataataccata 29220550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 285
Target Start/End: Original strand, 18876152 - 18876258
Alignment:
Q  178 aattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctta 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |    
T  18876152 aattgtggtatcgccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaa-gttagaatggtggcaacaacatatttgagtggtctca 18876250  T
Q  278 gcaccata 285  Q
     |||||||    
T  18876251 acaccata 18876258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 8331189 - 8331290
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||     | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  8331189 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaccaccataatagaatggtaacaataacatat-----ttgtttcagtattaaagagtggtcttag 8331283  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  8331284 taccata 8331290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12820604 - 12820504
Alignment:
Q  229 gagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaa 328  Q
    ||||| |||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12820604 gagaaattaaaaattagaatggcgataacaccatatttgagtggtcacaatatcatagcagagtggtcacaataccatattagagtggtttcagtactaa 12820505  T
Q  329 a 329  Q
    |    
T  12820504 a 12820504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 444
Target Start/End: Original strand, 17953811 - 17953902
Alignment:
Q  354 ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacag-ttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| ||| || |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  17953811 ggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcacacagtttgtaggtgagcttgttttatcttggaggcggcgtggttgata 17953902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 309
Target Start/End: Original strand, 25367812 - 25367879
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25367812 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatatt 25367879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 324
Target Start/End: Original strand, 27236170 - 27236265
Alignment:
Q  229 gagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagta 324  Q
    ||||| |||||||||||| || ||  |||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27236170 gagaaattaaaggttagagtggtggaaacaccatattagagtgatcttagtgccataatagagtgatatcaataccatattagagtggtcttagta 27236265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37771974 - 37771907
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatatt 309  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37771974 ttagaatggtggtaatatcatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatatt 37771907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 348
Target Start/End: Original strand, 34818516 - 34818632
Alignment:
Q  226 ttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtat 325  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || || || |||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||| ||||||||     |||||| |||||    
T  34818516 ttggagaagttaaag-ttagaatggtggtagcaccatatttgagtggtcacaacaccataatagaatggtaacagtaccatat-----tggtttcagtat 34818609  T
Q  326 taaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  34818610 taaagagtggtcttagtaccata 34818632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 308
Target Start/End: Original strand, 15875460 - 15875576
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||| |||| | |||  ||||| |||||| || || ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  15875460 ccatatttgagtagttgaaataccatattgacattt-gaagatgttaaaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtctcagtaccataataga 15875558  T
Q  291 gtggtcacaataccatat 308  Q
     |||||||| ||||||||    
T  15875559 atggtcacagtaccatat 15875576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7001943 - 7001871
Alignment:
Q  257 catcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa 329  Q
    ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  7001943 catcatatttgagtggtctcaaaactataatagagtggtcacatcatcatattagagtgatttcagtattaaa 7001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19950051 - 19949987
Alignment:
Q  258 atcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  19950051 atcatataagagtggtcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattggagtggtcttag 19949987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14035751 - 14035669
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtc 274  Q
    ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  14035751 ccatatttgagcggttgaaataccatattgatattt-ggagatgttaaatgttagaatggtggtgacatcatatttgagtggtc 14035669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17793923 - 17793852
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatctt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17793923 ataaaaagtacttttaagatcatagtccatttttaggaataataatgtcctttcagaactaagaatgatctt 17793852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36684028 - 36683946
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  36684028 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcataattaagaatgatcttaacggtatatat 36683946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7902837 - 7902743
Alignment:
Q  235 ttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa 329  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||| | || ||| |||||||||||| | |||||||    
T  7902837 ttaaaagttagaacggtgataacatcatatttgagtggcctcaataccataatagaatgatcatagtatcatgttagagtggtttcaatattaaa 7902743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 12820469 - 12820403
Alignment:
Q  380 agtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12820469 agtgcagtagttagtcgcacagttgtacctgaacttgttttatcctggaggcggtgtgattgatagt 12820403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18260314 - 18260167
Alignment:
Q  23 gttcattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactccctttttt-ggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| ||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  18260314 gttcattcgataacttatgtcctttcggaataaaaaatacttttaagatcatagtccattttttatgaataataatgtcccttcggaattaagaatgatc 18260215  T
Q  121 ttaacattatatat--tctttcaatattttttctacttttggagaagtt 167  Q
    | || | |||||||   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18260214 tcaatagtatatataacctttcgata-tttttctacctttggagaagtt 18260167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 125
Target Start/End: Original strand, 18876033 - 18876110
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaac 125  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  18876033 tcggaataaagagtaatattaagatcatagtccctttt--ggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaac 18876110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 10933603 - 10933497
Alignment:
Q  338 ttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtg 437  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| | |||||||| || || | |||||||||| | ||||||  |||    
T  10933603 ttagtatcatattgaaggtgtaattctcgaacaattctctacagtgcagtagttaatcacacagttgtagttg-gtttgttttatcatggaggcgacgtg 10933505  T
Q  438 gttgatag 445  Q
    ||||||||    
T  10933504 gttgatag 10933497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 15951201 - 15951283
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  15951201 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 15951283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 452
Target Start/End: Original strand, 43302717 - 43302755
Alignment:
Q  414 ttgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43302717 ttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctacct 43302755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19954496 - 19954448
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtg 315  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  19954496 gagtggtcttagtacaataatagagtggtatcaataccatattggagtg 19954448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 44510453 - 44510710
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||    
T  44510453 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaacataacaga 44510551  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
     |||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||    
T  44510552 atggtaacaatgtcatattaaagtggtttcagtattaaaagtgtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagaag 44510651  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44510652 ttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 44510710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 131 - 443
Target Start/End: Original strand, 10388085 - 10388395
Alignment:
Q  131 atattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||    
T  10388085 atattctttcaatattttt-ctaattgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttgga 10388183  T
Q  231 gaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaag 330  Q
    ||| |||||| ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10388184 gaaattaaag-ttaaagttgtggtaacacca-atttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaag 10388281  T
Q  331 agtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagag 429  Q
    |||| | |||||| | || | || |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||    
T  10388282 agtggtattagtaccttatttgagggtgtaaatctcgaacaattttttagagtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgagtttgttttatcctggag 10388381  T
Q  430 gcggtgtggttgat 443  Q
    |||| || ||||||    
T  10388382 gcggcgttgttgat 10388395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4930560 - 4930297
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |  |||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||| | ||||    
T  4930560 tggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtgacagcaccatatttgagtggtctcaacacc 4930462  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  4930461 ataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatatgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 4930362  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4930361 tgcagtagttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagt 4930297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 192 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30258418 - 30258164
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagag 291  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||| |||  |||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  30258418 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttaaagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacatag 30258320  T
Q  292 tggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagt 390  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  30258319 tggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatttcgaacaattttctacagtgcagtagt 30258220  T
Q  391 taaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    ||||||||| |||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  30258219 taaccgcactgttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtgattgatagt 30258164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 452
Target Start/End: Original strand, 13314013 - 13314273
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  || |||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  13314013 ccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatagtggtaacacaatatttgagtggtctcaacaccataacaga 13314111  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13314112 gtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 13314210  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    ||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  13314211 ttaattgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcgacgtggctgatagtctacct 13314273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26341532 - 26341261
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatt------tgagtggtctt 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||      ||||||||||     
T  26341532 tggtatcaccatatttgagtggtcggagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatgatattaacaccatattgatatttgagtggtctc 26341434  T
Q  277 agcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaacgatttt 375  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  26341433 agcatcataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaatgatttt 26341334  T
Q  376 caatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | | |||| ||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26341333 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 26341261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3045986 - 3045679
Alignment:
Q  83 ttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcag 177  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||    || |||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |     
T  3045986 ttttggaacaataatatcctgacggaattaataatgatcttaatagtatataaatattttttcaatatttttt-tacttgatgagaaattaaaaagttaa 3045888  T
Q  178 aattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtctta 277  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |    
T  3045887 aatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttagaaaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3045789  T
Q  278 gcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttc 376  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||| | |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  3045788 gcaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcaatattaaagagcggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttc 3045689  T
Q  377 aatagtgcag 386  Q
     | |||||||    
T  3045688 tacagtgcag 3045679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8268621 - 8268355
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  8268621 tggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatatagatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaacatatttgagtggtctcaacacc 8268523  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata-atggaggtgtaaatctcgaac-gattttcaata 380  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| | ||||| |      
T  8268522 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtactaaagagtgatcttagtaccatatttggaggtgtaattatcgaacggtttttctacg 8268423  T
Q  381 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  8268422 gtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcatggaggtggcgtggttgatagtct 8268355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27238620 - 27238304
Alignment:
Q  131 atattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||| ||   |||  ||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  27238620 atattctttcaatattttt-ctaattgaggagaaattaaaaggtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttgga 27238522  T
Q  231 gaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaag 330  Q
    ||| ||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| || ||||||| |||||||| || |||||||    
T  27238521 gaaattacaa-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaaagtggtaacattatcatattaaagtggtttcagaattaaag 27238423  T
Q  331 agtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagag 429  Q
    |||| |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||||| |||||   |||||||||| |  ||    
T  27238422 agtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttctacagtgcagtagttaagcacgcagttgtagctggacttgttttatcttgcag 27238323  T
Q  430 gcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  27238322 gcggcgtgattgatagtct 27238304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21671649 - 21671283
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatattctttcaatat 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||       |||||    
T  21671649 tcggaataaagagtacttttaagatcatggtccctttt--gaaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaatactatata-------aatat 21671559  T
Q  146 tttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttag 245  Q
    |||| ||| ||  | |||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| || |||||| |||     
T  21671558 tttt-ctatttgagtagaaattaaaaagtcaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggaaaaattaaag-ttat 21671461  T
Q  246 aatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaa 344  Q
    |||| || ||||| |||||||||||  ||| | ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||| || || |||| ||      
T  21671460 aatggtggtaacaccatatttgagttatctcaacaccatattaaagtggtaataataccatattaaagtggtttcattattaaaagaatggtctttgtcc 21671361  T
Q  345 cataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttat 422  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  21671360 catattggaggtttaaatctcgaacgattttctacactgcagtagttaaccgcacagttgtaggtgagcttgttttat 21671283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 183 - 410
Target Start/End: Original strand, 42626359 - 42626586
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | |  |||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  42626359 tggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacacc 42626457  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  42626458 ataacagagtggtaacaataccatattaaggtggttttaatattaaagagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacag 42626557  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctg 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42626558 tgcagtaattaaccgcacagttgtagctg 42626586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23866382 - 23866130
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaactt-aaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatag 289  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| || |||  |||||||| || ||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  23866382 ccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatattt-agtggtctcaacacaataatag 23866285  T
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagta 388  Q
    |||||||| | ||||||||     |||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  23866284 agtggtcatagtaccatat-----tggtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagta 23866190  T
Q  389 gttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23866189 gttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 23866130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 448
Target Start/End: Original strand, 26286956 - 26287178
Alignment:
Q  226 ttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtat 325  Q
    |||||||| |||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  26286956 ttggagaagttaaaaatttgaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca-cacgataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtat 26287054  T
Q  326 taaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcc 424  Q
    |||| || || |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||    
T  26287055 taaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaaagctcgaacgattttctatagtgcagtagttaactgcacagttgtagctggatttgttttatcc 26287154  T
Q  425 tagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  26287155 tggaggcggcgtggttgatagtct 26287178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 44422905 - 44423170
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  || |||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||| |||| ||||||||| |||| | | ||||    
T  44422905 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccacattgatgttttggagaaattaaag-ttagaattgtgacaacaccatatttgattggtttcaacacc 44423003  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  44423004 ataacagagtggtaacaataccatattaaggtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacag 44423103  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  44423104 tgcagtagttaaccgcacagttgtagatggacttgttttatcctggaggcggcgtagttgatagtct 44423170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12799705 - 12799472
Alignment:
Q  215 atattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagt 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||    
T  12799705 atattgatattttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagt 12799607  T
Q  315 ggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgaga 413  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||       
T  12799606 gatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctgcaatgcagtagttaaccgcacagttgtagctggac 12799507  T
Q  414 ttgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || ||||||||| || | || ||||||||||||||    
T  12799506 ttattttatcctggatgtggcgtggttgatagtct 12799472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3880264 - 3880060
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3880264 ttagaatggtgataacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttag 3880165  T
Q  342 taacataatggag-gtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || |||| | ||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||  | |    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  3880164 tatcatatttgagagtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccacatagttgtagtgggg---cttttatcctggaggcggcgtggtt 3880068  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  3880067 gatagtct 3880060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 9650744 - 9651000
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg-ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatag 289  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9650744 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataatag 9650842  T
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagta 388  Q
    |||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  9650843 agtggtcatagtaccatatt-----ggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattaaaagtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagta 9650937  T
Q  389 gttaaccgcacagttgcagc---tgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    || ||||| |||||||||||   ||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9650938 gtcaaccgtacagttgcagcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 9651000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 448
Target Start/End: Original strand, 13142700 - 13142934
Alignment:
Q  214 catattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagag 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||   |||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||    
T  13142700 catattgatattttgtagaacttgaagaa-agaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcagcaccataacaaagtggtaacaataccatattaaag 13142798  T
Q  314 tggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgag 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||     
T  13142799 tggtttcaatattaaagagtgatcttagtaccatatttaacggtgtaaatctcgaacagttttctatagtgcaatagttagccttacagttgtagctgaa 13142898  T
Q  413 attgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
     |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||    
T  13142899 cttgttttatcctggtggcggcgttgttgaaagtct 13142934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15642495 - 15642369
Alignment:
Q  193 atatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagt 292  Q
    ||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15642495 atatttgagtggtcgtagtaccatcttgatattttggagaacttaaaggttagaatggtgataataccatatctgaatggtcttagcaccataagagagt 15642396  T
Q  293 ggtcacaataccatattagagtggttt 319  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15642395 ggtcacagtaccatatttgagtggttt 15642369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23318254 - 23318128
Alignment:
Q  241 gttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatctta 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23318254 gttagaatggtgataacatcatatttgaatggcctcatcactataatagagtgatcacaatgccatattagagtggtttcagtattaaagagtggtctta 23318155  T
Q  341 gtaacataatggaggtgtaaatctcga 367  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23318154 gtaccatattggaggtgtaaatctcga 23318128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 446
Target Start/End: Original strand, 25543237 - 25543393
Alignment:
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  25543237 gtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtag 25543336  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgaga-ttgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25543337 ttaaccgcacagttgtagct-agacttgttttatcctggaggcgatgtggttgatagt 25543393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 448
Target Start/End: Original strand, 3357476 - 3357665
Alignment:
Q  261 atatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgta 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||    
T  3357476 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaagagtgatcttagtaccatattttagggtgta 3357575  T
Q  360 aatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattg-ttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| |||| ||| || || | ||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  3357576 aatcttgaacgattttctacagtgcaatggttaaccacacaattgtagttgtgtttgtttttatcatggagacggcgtggttgatagtct 3357665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19640611 - 19640460
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19640611 ccatatttgagtggttgaagtatcatattgatattt-ggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatattttagtggtctcagcaccataataga 19640513  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19640512 gtgttcacaataccatat-----tggttttagtattaaagagtggtgttagtaccata 19640460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8076358 - 8076112
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg-ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||| | || ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  8076358 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaagttaaaaaattagaacggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccgtaataga 8076260  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa-gagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||||| | |||||||||     ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||  ||||| |     ||||||    
T  8076259 gtggtcatagtaccatatt-----ggtttcaacattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaa-tctcgaacagttttcta-----cagtag 8076171  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  8076170 ttaatcgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcagcgtggttgatagtct 8076112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12254322 - 12254141
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcg 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||  ||||||| |||| | ||||||||||||||     
T  12254322 gagtggtctcaacaccataacagagtggtagcaatatcatattaaagtggtttcagtaggaaagactggacttagtaccatatttgaggtgtaaatctca 12254223  T
Q  367 aacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  12254222 aacggttttctacacagcattagttaaccgcacagttgtagctgaacttgttttatcctgtaggcggcgtgattgatagtct 12254141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4579830 - 4579570
Alignment:
Q  192 catatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagag 291  Q
    ||||||| |||| | | |||| |||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||     
T  4579830 catatttaagtgctggaaataccatattgacattt-ggagatgttaaatgttagaatggtggtaacaccatatttgaacggtcttagtactataatagaa 4579732  T
Q  292 tggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa---gagtgatcttagtaac-ataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcag 386  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||    |||||  |||| || | ||| | |||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||    
T  4579731 tggtcacaataccatataatcgtggtttcattattaatttcgagtggccttaatagccatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcag 4579632  T
Q  387 tagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4579631 tagttaatcgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 4579570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3284978 - 3284789
Alignment:
Q  261 atatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgta 359  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||||||    ||||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||    
T  3284978 atatttgattggtctcagcaccataacagagtagtaaaaataccttattaaagtggtttcgacattaaagagtggtctcagtaccatatttgagggtgta 3284879  T
Q  360 aatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattg-ttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    | ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  3284878 attctcgaacggttttctattgtgcggtagttaaccgcacggttgtagctgagtttgtttttatcatgaagacggtgtggttgatagtct 3284789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 40865185 - 40865286
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40865185 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttag 40865279  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  40865280 taccata 40865286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15642617 - 15642497
Alignment:
Q  128 tatatattctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatatttt 227  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| | | ||  ||||| |||||||    
T  15642617 tatatattcttttgatattttc-ctagttttggaaaagttaaaaagtcagaatgacggtgtcaccatatttgagtggttgtagtactatattaatatttt 15642519  T
Q  228 ggagaacttaaaggttagaatg 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  15642518 ggagaacttaaaggttataatg 15642497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9008346 - 9008242
Alignment:
Q  327 aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatccta 426  Q
    |||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| || ||   ||||||||||||     
T  9008346 aaagagtgattttagtatcatattgaaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcacacagttgtagttggacttgttttatcctg 9008247  T
Q  427 gaggc 431  Q
    |||||    
T  9008246 gaggc 9008242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4930672 - 4930588
Alignment:
Q  50 ggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4930672 ggataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatatat 4930588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 275
Target Start/End: Original strand, 3356864 - 3356955
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtct 275  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | || | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  3356864 tggtatcaccatatttgattggtcgtagtaccgtattgatagtttggagaacttaca-gttagaattgtgataacaccatatttgagtggtct 3356955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 448
Target Start/End: Original strand, 6590651 - 6591016
Alignment:
Q  83 ttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata---ttctttcaatattttttctacttttggagaagttaaaaagtcaga 178  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  |||||    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |    
T  6590651 ttttagaataataatgtcatgtcataattaataatgatcttaacaacatataattatctttcgata-tttttctacttttggaggagttaaaaa-ttata 6590748  T
Q  179 attatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttag 278  Q
    ||   |||||| |||||||| |||||||| | ||        ||||||||||||| ||||| || |||||  |   |||| ||||||||| ||||||| |    
T  6590749 atggcggtatcaccatattttagtggtcgaagta-------catattttggagaaattaaaagtcagaatagtcgaaacaccatatttgaatggtcttgg 6590841  T
Q  279 caccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa---gagtgatcttagta-acataatgga-ggtgtaaatctcgaacgatt 373  Q
     ||||||||||| |||| | | |||||||| | | |||||| |||||||||   |||||  |||| ||  |||| | || ||||||| |||| |||||||    
T  6590842 taccataatagaatggttatagtaccatataataatggtttcagtattaaattcgagtggccttaatagccatatttgagggtgtaattctcaaacgatt 6590941  T
Q  374 ttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||| | | || ||||||||| | |||||||  | ||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  6590942 ttctacaatgtagtagttaatcacacagttataactgaacttgttttatcctgaaggcggcgtggttgatagtct 6591016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 448
Target Start/End: Original strand, 23246902 - 23246966
Alignment:
Q  384 cagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23246902 cagtagttaatcgcacagttgtaggtgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 23246966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27256505 - 27256404
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||     |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  27256505 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaataataccatat-----tggtttcagtattaaatagtggtcttag 27256411  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  27256410 taccata 27256404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 8268766 - 8268667
Alignment:
Q  26 cattcgataatttatgttcactcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaa 124  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  8268766 cattcgataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaa 8268668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 42626237 - 42626319
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  42626237 ataaagagtacttttaagatcatattccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 42626319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 44422781 - 44422863
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  44422781 ataaagagtacttttaagatcatagtccc-tatttggactaacaatgtcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 44422863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2628954 - 2628875
Alignment:
Q  194 tatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtc 274  Q
    |||||||||||| | | || ||||||||| ||||| |||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2628954 tatttgagtggttgtagtaccatattgat-ttttgaagatgttaaaagttagattgatggtaacatcatatttgagtggtc 2628875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16372666 - 16372579
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa 329  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||| || |||||| |||| ||  |||| |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  16372666 ttagaatggtggtaaaagcatatttgagtggtctcagtaccatagtagaatgaccacagtaccatataatagtggtttcagtattaaa 16372579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 322
Target Start/End: Original strand, 23616241 - 23616308
Alignment:
Q  255 aacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  23616241 aacatcatatttgagtggtcataataccatattatagtggtctcagtaccataatagagtggtcttag 23616308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26341655 - 26341573
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26341655 ataaagaatacttttaagatcatagtccc-tatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatat 26341573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 29478032 - 29478081
Alignment:
Q  273 tcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttag 322  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  29478032 tcttagtactataatagagtggtatcaataccatattagagtggtcttag 29478081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9008469 - 9008366
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||   |||||  |||||  |||||||| || || || |||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  9008469 ccatatttgagtggttgaaataccatattgatatcc-ggagatgttaaaaattagaatggtggtagcaccatatttgagtggtcccaacaccattataga 9008371  T
Q  291 gtggt 295  Q
    |||||    
T  9008370 gtggt 9008366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7431 - 7166
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||  |||||| |||||| | | ||||    
T  7431 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacacaatatttaagtggtatcaacacc 7333  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggt-gtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||| | ||||  |||| ||||||||| ||||| | ||    
T  7332 ataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttaatacaatatttgagggcgtaattctcgaacggttttctacag 7233  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7232 tgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 7166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7553 - 7471
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  7553 ataaagagtacttttaagatcatagtccctattt-ggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatatat 7471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 9713 - 9920
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  9713 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattatagagtggtcttag 9812  T
Q  342 taacata-atggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9813 taccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggtt 9912  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  9913 gatagtct 9920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4342 - 4136
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4342 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 4244  T
Q  342 taacataat-ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggtt 440  Q
    || |||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4243 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggtt 4144  T
Q  441 gatagtct 448  Q
    ||||||||    
T  4143 gatagtct 4136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 443714 - 443977
Alignment:
Q  183 tggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcacc 282  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||| |||||||| | ||||    
T  443714 tggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggaaacaccatattttagtggtctcaacacc 443812  T
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatgga-ggtgtaaatctcgaacgattttcaatag 381  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  443813 ataatagagtggttacaatatcatattaaggtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatag 443912  T
Q  382 tgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  443913 tgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcct-gagacggcgtggttgatagtct 443977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 83354 - 83128
Alignment:
Q  214 catattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagag 313  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||  |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||  |||||        
T  83354 catattgatattt-ggagatgttaaaaattagaatggtagtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggttatagtattatatt---- 83260  T
Q  314 tggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgaga 413  Q
     ||||| |||||  |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  83259 -ggtttcagtat--aagagtgatcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaaaggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagc 83163  T
Q  414 ttgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  83162 ttgttttatcctggaggcggcatggttgatagtct 83128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 326
Target Start/End: Original strand, 148040 - 148316
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattat----atattctttcaatatt 146  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||  | |||    ||||||||| |||| |    
T  148040 ataaagaatacttttaagatcatagtcccttttt--gaaaaataatgtcccatcaaaattaagaatgatcttagtagtatataaatattctttaaata-t 148136  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||||||||  ||   |||| || ||||||| ||||||| | | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  148137 ttttctatttgaggagaatttaaaaagtcgaaaaggtggtttcaccatattagagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaaagttaga 148236  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt 326  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  148237 atggtggtaacactatatttgagtggtctcaacatcataatagagtgataacaataccatattaatgtggttttagtatt 148316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 446
Target Start/End: Original strand, 164928 - 165060
Alignment:
Q  321 agtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgc------acagttgcagctgaga 413  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | || | |||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||      ||||||| |||||||     
T  164928 agtatgaaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagc 165027  T
Q  414 ttgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  165028 ttgttttatcctggaggcgacgtggttgatagt 165060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25906 - 25637
Alignment:
Q  47 tcgggataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttca 141  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||    ||||||||    
T  25906 tcggaataaagagtgctattaagatcatagtcccttttt-ggaataataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacggtatataaatattctttca 25808  T
Q  142 atattttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaagg 241  Q
    |||||||    | ||  |||||| |||||||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||      
T  25807 atatttt----aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttggagaaattaaaa- 25713  T
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggt 317  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  25712 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaataatatcatattaaagtggt 25637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29608 - 29262
Alignment:
Q  65 ttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatattttttctacttttg 159  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||    | ||       
T  29608 ttaagatcatagtcccttttt-ggaataataatgtctcgtcgaaattaagaatgatcttaacagtatataaatattctttcaatatttt----aattgaa 29514  T
Q  160 gagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttgg----agaacttaaaggttagaatgatgata 255  Q
    ||||| |||||||||   |||  |||| || ||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||    |||| |||||| |||||||| || ||    
T  29513 gagaaattaaaaagtggaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatattttggttagagaaattaaag-ttagaatggtggta 29415  T
Q  256 acatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtatt-aaagagtgatc----ttagtaacataat 350  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||||| |||||  ||||    |||||| |||| |    
T  29414 acaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaacaatactatactaaaatggtttcagtattaaaagaacgatcttaattagtatcatatt 29315  T
Q  351 ggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagtt 403  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  29314 gaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaaccgcacagtt 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25611 - 25461
Alignment:
Q  299 aataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgc 397  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  25611 aatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttgaagatgtaagtctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgc 25512  T
Q  398 acagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||| || || | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25511 acagttgtagttgggcttgttttatcctggacgcggcgtggttgatagtct 25461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 358 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35786 - 35696
Alignment:
Q  358 taaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtct 448  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35786 taaatctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 35696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4136
Alignment:
Q  225 tttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagta 324  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||| ||||    
T  4259 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagtaccataatagagtggtaacattaccataaaaaagtgatttaagta 4160  T
Q  325 ttaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  4159 ttaaagagtggtcttagtaccata 4136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 446
Target Start/End: Original strand, 165998 - 166117
Alignment:
Q  327 aaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatccta 426  Q
    ||||| || |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  165998 aaagattggtcttagtaccatagtaaaggtgtaattctcgaacggttttttacagtgcagtaattaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctg 166097  T
Q  427 gaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  166098 gaggcggcgtggttgatagt 166117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 1297 - 1203
Alignment:
Q  353 aggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtc 447  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||  ||| ||||| | |||||| ||||||    
T  1297 aggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcagtagttaaccgcacagtcgtagctgaacttgtttttgcctggaggcagcgtggtttatagtc 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 13491 - 13330
Alignment:
Q  290 agtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacataatggaggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtag 389  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||    
T  13491 agtggtcacatgaccataatagagtgcttcaagtattaaa-agtggtcttagtaccatattagaggtgtaaattgcgaaccattttctacagtgaagtag 13393  T
Q  390 ttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagtctacct 452  Q
    ||||||||||||||| || |||  ||||| |||| | |||||    |||||||||||||||||    
T  13392 ttaaccgcacagttgtagttgaacttgttgtatcttggaggcaccatggttgatagtctacct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9174 - 9087
Alignment:
Q  230 agaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  || | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174 agaacttaaaagttagaatgattataacaccatatgtgagtggtc--agtatcataatcgaatggtcacaataccatattagagtggttt 9087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Original strand, 146206 - 146343
Alignment:
Q  191 ccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataataga 290  Q
    ||||||||||||||| | | || | |||||| |||| |||||  |||||  |||||||| || ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  146206 ccatatttgagtggttgtactaccttattgacattt-ggagatgttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctcagtaccataataga 146304  T
Q  291 gtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa 329  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  146305 atggtcacaataccatataatagtggtttcattattaaa 146343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 155486 - 155544
Alignment:
Q  383 gcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttg 441  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  155486 gcagtagttaatcgcacagttgtagctgaacttgttttatcctagaggcggcgtggttg 155544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42246 - 42142
Alignment:
Q  215 atattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagt 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| || | | ||||||||| |  ||  || |||||||||||    
T  42246 atattgatattttggagaagttaaaggttagaatggtgagaacaccatacttgagtggtctcagtatcctaatagagttgctacggtatcatattagagt 42147  T
Q  315 ggttt 319  Q
    |||||    
T  42146 ggttt 42142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 435
Alignment:
Q  321 agtattaaagagtgatcttagtaacataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgc------acagttgcagctgaga 413  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | || | |||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||      ||||||| |||||||     
T  567 agtatgaaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagc 468  T
Q  414 ttgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  467 ttgttttatcctggaggcgacgtggttgatagt 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2540 - 2374
Alignment:
Q  283 ataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaa---gagtgatcttagta-acataatggagg-tgtaaatctcgaacgattttca 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||   |||||  |||| || ||||| |  ||| ||||| |||| ||| ||||||     
T  2540 ataatagaatggtcacaataccatattttagtggtttcaatattaaatttgagtggccttaatagacatatttaagggtgtaattctccaacaattttct 2441  T
Q  378 atagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgata 444  Q
    |  ||||||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2440 acggtgcagtagttaatctcacagttgtacctgagtttgttttatactagaggcggcgtggttgata 2374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46047 - 45946
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| |||     |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46047 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttag 45953  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  45952 taccata 45946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 152740 - 152841
Alignment:
Q  242 ttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttag 341  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| |||     |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  152740 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttag 152834  T
Q  342 taacata 348  Q
    || ||||    
T  152835 taccata 152841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5744 - 5478
Alignment:
Q  52 ataaagagtacttttaagatcacactcccttttttggaataataatgtcctgtcagaattaa-aatgatcttaacattatata----ttctttcaatatt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||| ||||||   |  ||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||    
T  5744 ataaagagtacttttaagatcatagtccatttt--ggaataaaaatgtctcattggaattaagaatgatcttaacagtatataaatattctttcaatatt 5647  T
Q  147 ttttctacttttggagaagttaaaaagtcagaattatggtatcgccatatttgagtggtcgcaatatcatattgatattttggagaacttaaaggttaga 246  Q
    ||  | | ||  |||||| ||||||| ||  | |  || |||| ||||||||||||||||  | || ||||  |||| ||||||||||||||| || |||    
T  5646 tt--cgatttgaggagaaattaaaaaatcgaagtggtgttatcaccatatttgagtggtcatagtaccataaagataatttggagaacttaaa-gtaaga 5550  T
Q  247 atgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttt 319  Q
    ||  || ||||| |||||||||||||| | |||||||||| | | | || |||||| ||||||| ||||||||    
T  5549 atagtggtaacaccatatttgagtggtatcagcaccataacataattgtaacaata-catattaaagtggttt 5478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3064 - 3004
Alignment:
Q  215 atattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtct 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||    
T  3064 atattgatattttggagaagttaaaggttagaatggtgagaacaccgtacttgagtggtct 3004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 255973 - 255881
Alignment:
Q  354 ggtgtaaatctcgaacgattttcaatagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagattgttttatcctagaggcggtgtggttgatagt 446  Q
    |||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  255973 ggtgtaatcctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcatagttgatagt 255881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 256106 - 256024
Alignment:
Q  225 tttggagaacttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccata 307  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| ||||||| | |||||||    
T  256106 tttggagattttaaaagttagaatggtgctaacatcatatttgaatggtcataataccatagtagtgtggtcatagtaccata 256024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1159
Alignment:
Q  279 caccataatagagtggtcacaataccatattagagtggttttagtattaaagagtgatcttagtaacata 348  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1095 caccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Original strand, 171587 - 171635
Alignment:
Q  267 gagtggtcttagcaccataatagagtggtcacaataccatattagagtg 315  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  171587 gagtgatcttagtaccataatagagtggtatcaataccatattggagtg 171635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University