View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4814-Insertion-8 (Length: 466)

Name: NF4814-Insertion-8
Description: NF4814
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4814-Insertion-8
NF4814-Insertion-8
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (6-463)||(3086634-3087091)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (13-463)||(3179-3630)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (13-466)||(4259612-4260065)
chr6 (13-450)||(4461344-4461781)
chr6 (74-466)||(4299279-4299671)
chr6 (6-466)||(4622356-4622814)
chr6 (13-466)||(4256082-4256523)
chr6 (9-422)||(4626168-4626581)
chr6 (40-466)||(4613176-4613602)
chr6 (14-450)||(4585858-4586294)
chr6 (13-450)||(4266640-4267077)
chr6 (9-466)||(4557342-4557799)
chr6 (14-466)||(4563933-4564388)
chr6 (13-448)||(4514597-4515032)
chr6 (11-450)||(4579651-4580090)
chr6 (48-450)||(4598427-4598829)
chr6 (14-466)||(4592453-4592908)
chr6 (30-450)||(4470041-4470461)
chr6 (13-419)||(4602010-4602416)
chr6 (26-447)||(4489832-4490253)
chr6 (13-450)||(4506078-4506515)
chr6 (9-450)||(4560723-4561162)
chr6 (26-446)||(3171975-3172395)
chr6 (6-466)||(4571186-4571646)
chr6 (9-448)||(4516538-4516977)
chr6 (40-450)||(4574556-4574966)
chr6 (45-450)||(4480946-4481351)
chr6 (40-466)||(4617270-4617699)
chr6 (40-450)||(4503871-4504281)
chr6 (32-450)||(4457834-4458253)
chr6 (40-448)||(4568304-4568700)
chr6 (13-183)||(4493176-4493346)
chr6 (75-253)||(4391794-4391976)
chr6 (368-427)||(4835512-4835571)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (40-466)||(4147-4570)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (13-466)||(1281335-1281791)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (13-450)||(24103220-24103657)
chr5 (13-278)||(27999745-28000010)
chr5 (425-466)||(24107008-24107049)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (13-466)||(1674447-1674903)
chr8 (9-459)||(16685732-16686182)
chr8 (12-450)||(20863317-20863755)
chr8 (78-128)||(1965197-1965247)
chr8 (81-127)||(1969140-1969186)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (40-168)||(3441-3568)
scaffold0475 (174-271)||(3162-3259)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (337-466)||(8-140)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 463
Target Start/End: Original strand, 3086634 - 3087091
Alignment:
Q  6 cagatatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3086634 cagatatatctacagtttattggttgatctccataaaatggccaacacaacattggcactccagcaagtacgctttcaaccgttgagttccatccacaat 3086733  T
Q  106 gactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086734 gagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaatacttgctcttgcggacaccagcttgcgattagacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 3086833  T
Q  206 tgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3086834 tgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagttgc 3086933  T
Q  306 tctggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaa 405  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3086934 tcttgagtcataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagactcaagtccctttgattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaa 3087033  T
Q  406 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3087034 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgaagtttgatttagtagtgaaggtaa 3087091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3630 - 3179
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3630 atctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggtactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaa 3531  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |    
T  3530 gaatccaccaattgaagggtggatcagtacttgctcttgtggacaccagcttgtgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctgatgacaaa 3431  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  3430 ataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaacggtttcttgctatcggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatttggag 3331  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3330 tcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattgga 3231  T
Q  413 acct-aaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaa 463  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  3230 acctaaaagattccaagtgattatgtggagtttgacttaataatgaaggtaa 3179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4260065 - 4259612
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||    
T  4260065 atctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaacttcggcacaaatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagttaa 4259966  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  4259965 gaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgcgattaggcctctatccgaaatttcactctcaaactcagatgacaaa 4259866  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  4259865 ataaaggagccaccaataatgaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaaaaattgatctggag 4259766  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4259765 tcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttaaattcaagccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattgga 4259666  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  4259665 acctaacgatgccaggtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaagg 4259612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 450
Target Start/End: Original strand, 4461344 - 4461781
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4461344 atctacagtttgctggctgatcaccaaagaatggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaa 4461443  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  4461444 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaa 4461543  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  4461544 ataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagttgatcaggag 4461643  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  4461644 tcataactgtgatgctgccaaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 4461743  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    |  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  4461744 atttaaagatgccaggtgattttgtggactttgattta 4461781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 74 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4299671 - 4299279
Alignment:
Q  74 tatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcga 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |     
T  4299671 tatgctttcaatggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacactagcttgcggttagg 4299572  T
Q  174 cctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctat 273  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4299571 cctctatttgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacaagccgccaatgacaaggtctggcctaatgatccacaaaaatggtttcctgcaat 4299472  T
Q  274 tggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaag 373  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||    
T  4299471 tggccaaaccccaagcaatctctaacagttgctctggagtcataactgtaacgctgccaaaattcacataaacaaccgatcccggctccttggattcaag 4299372  T
Q  374 ccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  4299371 ccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaagg 4299279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Original strand, 4622356 - 4622814
Alignment:
Q  6 cagatatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaat 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||| |||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  4622356 cagatatatctacagtttgttggctgatcagcgaaaaatggccaacacagcattgaaactccagcacatatgctttcggtggttgaattccatccacaat 4622455  T
Q  106 gactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 205  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4622456 gagtcaagaatccaccaattgcagggtggttaagtacttcctcttgtggacaccaacctgcgattaggcctctacctgaaatttcattctcaaactcaga 4622555  T
Q  206 tgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgc 305  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  4622556 tgacaaaataaacgagccgcccatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaatagttga 4622655  T
Q  306 tctggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaa 405  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4622656 tctcgagtcatcactgtaatgctgccaaaattcacgtaaaca--agagtcaggttccttggattcaagccactcaagacacttgatatcttctttccaaa 4622753  T
Q  406 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  4622754 gattggaacctagagatgccaagtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaagg 4622814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4256523 - 4256082
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggt-tgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactca 111  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  4256523 atctacagtttgttggtctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccggcacaaatgctttcaatggttgagttccatcctcaatgagtca 4256424  T
Q  112 agaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacat 211  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||||             |||||||||||     
T  4256423 agaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccaactctcgattagtcctctatccgaaa-------------ctcagatgacaa 4256337  T
Q  212 aataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctgga 311  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4256336 aataaaggagccaccaatgacgaggtcaggcctaatgatacacaaaaatggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaacagttgatctgga 4256237  T
Q  312 gttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgg 411  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4256236 gtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttggattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattgg 4256137  T
Q  412 aacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  4256136 aacctaacgatgccaagtgactatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaagg 4256082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 422
Target Start/End: Original strand, 4626168 - 4626581
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| || ||   |||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4626168 atatatctacaatttgttggctgatcagcaaaatttggccaacacagcattggaactccagcgcatatgctttcaatggttgagttccatccacaatgag 4626267  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4626268 ttaagaatccaccaattgaaggatggttcagtactttctcttgcggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcggatga 4626367  T
Q  209 cataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    |  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  4626368 cgaaataaatgagccaccaatcacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagtttctgt 4626467  T
Q  309 ggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  4626468 ggagtcataactataacgctgccaaagttcacataaacaacagactttggttccttgaattcaagccattcaagacaattggtgtcttctttccaaagat 4626567  T
Q  409 tggaacctaaagat 422  Q
    ||||||||||||||    
T  4626568 tggaacctaaagat 4626581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 40 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4613602 - 4613176
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  4613602 aaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggtttaa 4613503  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatca 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  4613502 tacttgctcttgaggacaccagctcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactctgatgacaaaacaactgagccgccaatgacaagatca 4613403  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  4613402 ggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctattcgccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataacggtcatgctcccaaaattca 4613303  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||    
T  4613302 cataaacaacggacttcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacttaaacttgccaagtgattttgtgg 4613203  T
Q  440 aatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    | ||||| |||  ||||||| ||||||    
T  4613202 actttgacttaaaagtgaagataaagg 4613176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 450
Target Start/End: Original strand, 4585858 - 4586294
Alignment:
Q  14 tctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaag 113  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4585858 tctacagtttgttggctgatcagcaatgaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacagtgagtcaag 4585957  T
Q  114 aatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  4585958 aatccaccaattgaagggtggttcaatacttgctcttgcgggcaccaacccgcgattaggcctctatctgaaatttcattcttaaactcagatgacaaaa 4586057  T
Q  214 taaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagt 313  Q
      ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  4586058 ccaaggaaccaccaatgacaagatcaggtctaatgatccataaaaaatgttgcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgtagt 4586157  T
Q  314 tataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaa 413  Q
     ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |    
T  4586158 cataactgttgtgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttggtatcctctttccaaagatttgta 4586257  T
Q  414 cctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    | ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  4586258 cttaaagatgctaagtggttttgtggactttgattta 4586294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4267077 - 4266640
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4267077 atctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaa 4266978  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |    
T  4266977 gaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttaaaaaaatcagatgacaaa 4266878  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||| | |    
T  4266877 acaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtg 4266778  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  4266777 acataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 4266678  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4266677 atttaaagatgccaagtgattttgtggactttgattta 4266640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 4557342 - 4557799
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  4557342 atatatctgcagtttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgag 4557441  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  4557442 tcaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagcccgcgattaggcctctatctgaaatttcattgacaaactccgatga 4557541  T
Q  209 cataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    || || ||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  4557542 caaaacaactgagccaccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttct 4557641  T
Q  309 ggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    |  || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4557642 gccgtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttccttggattcaagccaaccaagacacttgttatcttctttccaaagat 4557741  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    ||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||    
T  4557742 tggtacttaaacttgccaagtgattatgtggactttgacttaaaagtgaagataaagg 4557799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 466
Target Start/End: Original strand, 4563933 - 4564388
Alignment:
Q  14 tctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaag 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4563933 tctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaag 4564032  T
Q  114 aatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  4564033 aatccgccaattgaagggtggttcaatactttctcctgtggacaccaacttgcaattaagcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaa 4564132  T
Q  214 taaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagt 313  Q
      |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||    
T  4564133 cgactgagccaccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttattgcaattggccaacccccaagcaaattccaacagttgttttggtgt 4564232  T
Q  314 tataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaa 413  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  4564233 cataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacacttagtatcttctttccaaaggttggaa 4564332  T
Q  414 cctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    ||||||||  |||| ||||   | |||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  4564333 cctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagg 4564388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4515032 - 4514597
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||| | |||||||||||||||   |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4515032 atctacagtttgttggttgatcaccaaagaattgccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctctcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 4514933  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |    
T  4514932 gaatccgccaattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattcacaaactcagacgacaaa 4514833  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  4514832 accactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaaggttttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttctccggag 4514733  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      ||||  || ||||| |||||| | ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  4514732 acataatcgtgatgctaccaaaattaacataaacaacagatcctgattcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 4514633  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatt 448  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  4514632 acctaaagattccaagtgattttgtggactttgatt 4514597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 450
Target Start/End: Original strand, 4579651 - 4580090
Alignment:
Q  11 atatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactc 110  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||    
T  4579651 atatctgcagcttactgggtgatcagcgaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtgattgagttccatccgcaatgagtc 4579750  T
Q  111 aagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  4579751 aagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgttattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgaca 4579850  T
Q  211 taataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctgg 310  Q
     || |   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||  ||||     
T  4579851 aaacagctgagccgccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgc 4579950  T
Q  311 agttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattg 410  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4579951 agtcataactgtcaagctcccaaaattcacataaacaacagacctaggttccttggattcaagccaataaagacacttggtatcttctttccaaaaattg 4580050  T
Q  411 gaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    |  | |||||||| ||| || || | |||| |||||||||    
T  4580051 gtgcttaaagatgtcaaatggttttctggactttgattta 4580090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 48 - 450
Target Start/End: Original strand, 4598427 - 4598829
Alignment:
Q  48 caacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgct 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  4598427 caacacaacattggcactccggcacatatactttcagtggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgct 4598526  T
Q  148 cttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaat 247  Q
    ||||| ||||||||||||| | |   ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4598527 cttgcagacaccagcttgcaactaagcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaat 4598626  T
Q  248 gatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaaca 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |  |||| ||| || || || ||||| |||||| |||||||||||    
T  4598627 gatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaagtctaacaacttttctgcagtcatcaccgttatgctcccaaaattcacataaaca 4598726  T
Q  348 acagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgat 447  Q
    |||||    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| || ||||||    
T  4598727 acagaccttggttcattggattcaagccagtcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacctaaagatgccaaatgcttttgttgactttgat 4598826  T
Q  448 tta 450  Q
    |||    
T  4598827 tta 4598829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 466
Target Start/End: Original strand, 4592453 - 4592908
Alignment:
Q  14 tctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaag 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | | || ||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4592453 tctacagtttgttggctgatcactaaagaatggccaacacaacattggaattccagcacatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaag 4592552  T
Q  114 aatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  4592553 aatccaccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggacaccagctcgcgattacgcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaa 4592652  T
Q  214 taaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagt 313  Q
     ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |    
T  4592653 caattgtgccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaaaggtttattgcaattggccaaaccccaagcaaactctaacattttctcttcatt 4592752  T
Q  314 tataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaa 413  Q
     |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |  ||||||    
T  4592753 cataactgtaaggctgccgaaattcacataaacaacggaacccgattccttcgattcaagccatttaagacactcagtatcttctttccatatgttggaa 4592852  T
Q  414 cctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    || |||||  |||| ||||   | |||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  4592853 ccaaaagaatccaattgatggatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagg 4592908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 450
Target Start/End: Original strand, 4470041 - 4470461
Alignment:
Q  30 tgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaag 129  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4470041 tgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaag 4470140  T
Q  130 ggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||| | ||  ||| ||| ||||| | ||  |  |||||||||||    
T  4470141 ggtggttcagtacttgctcttgaggacaccagttcacgattaggcctctatctgaaattccatttacaatctctgatgagaaaactaccgagccgccaat 4470240  T
Q  230 gacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctg 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||    
T  4470241 gacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgccaaaccccaagcaaactctaacagtttctctggagacataactgtgacgctg 4470340  T
Q  330 ccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagt 429  Q
    || ||| | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |  |    
T  4470341 ccgaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgaaatttaaagatgctagat 4470440  T
Q  430 gattatgtggaatttgattta 450  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  4470441 gattttgtggactttgattta 4470461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 419
Target Start/End: Original strand, 4602010 - 4602416
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4602010 atctacagtttgttggctgatcggcaaaaaaaggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaa 4602109  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||| || || |||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |    
T  4602110 gaatccgccgatcgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcatttgtaaactcagatgacaaa 4602209  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |  || |    
T  4602210 atcactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttatggcaattggccaaaccccaagcgaattctaataattgatggggtg 4602309  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||    
T  4602310 tcataactgtaatgctgccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccagaggttgga 4602409  T
Q  413 acctaaa 419  Q
    |||||||    
T  4602410 acctaaa 4602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4490253 - 4489832
Alignment:
Q  26 tggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaatt 125  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || || | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4490253 tggttgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatactctccatgattgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaatt 4490154  T
Q  126 gaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgc 225  Q
    |||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |     ||||| |    
T  4490153 gaagggtgattcaataccttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgacaacacctgtgagccac 4490054  T
Q  226 caatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaat 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || | |||| |||  ||||| || ||    
T  4490053 caataacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaatagcttctctcgagacataacagtgat 4489954  T
Q  326 gctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgcc 425  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||  |    
T  4489953 gctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatttc 4489854  T
Q  426 aagtgattatgtggaatttgat 447  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  4489853 aagtgattttctggaatttgat 4489832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 450
Target Start/End: Original strand, 4506078 - 4506515
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4506078 atctacagtttgttggttgatcaccaaagaacggccaacacagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 4506177  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||| | |||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| ||  ||||||| || |||| |    
T  4506178 gaatccaccaattgaagggtgatttaacactttctcttgtgaacaccagcttgctataaggcttctatctgaaatttcatttgcaaactctgaagacaaa 4506277  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    |  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||    
T  4506278 accactgagccaccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaaaaatttctccggag 4506377  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||    
T  4506378 acataattgtgatgcttccaaaattcacataaacaacagaagccggttcttttgattccagccattcgagacatttagtatcctctttccaaagatttga 4506477  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    | |||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  4506478 atctaaagttgcaaactgattttgtggactttgattta 4506515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 450
Target Start/End: Original strand, 4560723 - 4561162
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
T  4560723 atatatcttcagtttgctggctgatctgcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgag 4560822  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  4560823 tcaagaatccaccgactgatgggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttc-aaaaatcagatga 4560921  T
Q  209 cataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
     | ||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||    
T  4560922 gaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaatggtttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaa-ggcttctct 4561020  T
Q  309 ggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
     |||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  4561021 tgagacttaacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagat 4561120  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    |  |  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  4561121 tacagtctaaagatgtcaagtgattttgtggactttgattta 4561162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 446
Target Start/End: Original strand, 3171975 - 3172395
Alignment:
Q  26 tggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaatt 125  Q
    |||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||  |||||   ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  3171975 tggttgatcagcaaaaaatggcctacacaacattggcattccagcacatacactttccgtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaatccgccaatt 3172074  T
Q  126 gaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgc 225  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||  ||||| |    
T  3172075 gaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccac 3172174  T
Q  226 caatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaat 325  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | || |||| |||  |||||| | ||    
T  3172175 caatgacaagatcaggcctaataatccacaaaaagggtttcttgctgttggctaaaccccaagcaaactctaataatttctcttgagacataactatgat 3172274  T
Q  326 gctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgcc 425  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  | ||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3172275 gctgccaaaatttacataaacaacagattttgattcttttgtttcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagaatctaaagatgcc 3172374  T
Q  426 aagtgattatgtggaatttga 446  Q
    |||||||| || ||| |||||    
T  3172375 aagtgattttgcggactttga 3172395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Original strand, 4571186 - 4571646
Alignment:
Q  6 cagatatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||    ||||||||||||||||| |    
T  4571186 cagatatatctacagtttgctggctgatcagcaaaaaatggctaacacaacattggaactccagtagatatgctttcggtcgttgagttccatccacagt 4571285  T
Q  106 gactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 205  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||| |  || ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  4571286 gagtcaagaaaccaccaattgaaggatggttcaatactttctcttgcgagcaccaaccagcaattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccga 4571385  T
Q  206 tgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgc 305  Q
    ||||| || ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||      
T  4571386 tgacaaaacaactgagccaccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagagttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttt 4571485  T
Q  306 tctggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaa 405  Q
    |||| ||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4571486 tctgaagtcataactgtcctgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttgttatcttctttccaaa 4571585  T
Q  406 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    |||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||||||    
T  4571586 gattggtacttaaacttgccaagtgattctgtggactttgacttaaaagtgaagataaagg 4571646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 448
Target Start/End: Original strand, 4516538 - 4516977
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| || ||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |  || ||||||||||||||||||     
T  4516538 atatatctgcaatttgttggctgctcagcaaaaaaaggccaacacaacattggtactccggcacagatgctttccattgtggagttccatccacaatgag 4516637  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| |||| ||| |||| || |||||    
T  4516638 tcaagaatcctccaactgaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccagcttgctattacgcctctatccgaagtttcattcacaaaatcggatga 4516737  T
Q  209 cataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  4516738 caaaataaccgagccaccaatgacaaggtcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctgttggccaaaccccaagcgaactctaacagttgatct 4516837  T
Q  309 ggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    ||||| || || || ||||| |||||| |||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  4516838 ggagtcatgaccgtgatgcttccaaaattcacataaactacagaaccttgttccttagattcaagccattcaagacatttcatatcttctttccaaagat 4516937  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatt 448  Q
    | ||||||| ||| ||||||| ||| || ||| |||||||    
T  4516938 tagaacctatagaagccaagttattttgcggactttgatt 4516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 40 - 450
Target Start/End: Original strand, 4574556 - 4574966
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  4574556 aaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaa 4574655  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatca 239  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||||||||||    
T  4574656 tactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatca 4574755  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||| |||  ||||| || |||||||||||| | |    
T  4574756 ggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattta 4574855  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  4574856 cataaacaacagatcttggttcttttgattcaatccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtgg 4574955  T
Q  440 aatttgattta 450  Q
    | |||||||||    
T  4574956 actttgattta 4574966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 450
Target Start/End: Original strand, 4480946 - 4481351
Alignment:
Q  45 ggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtactt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||    
T  4480946 ggccaacacaacattggcactccagcacatacactttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaaaactt 4481045  T
Q  145 gctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcct 244  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  |  |  ||||| ||||||||||||| || |||    
T  4481046 tctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatttgaaatttctttcaaatactcagatgacaacaccactgagccaccaatgacaagattagacct 4481145  T
Q  245 aatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataa 344  Q
    ||| |||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  4481146 aataatccacaaaaagttttttttgctattggcaaaaccccaagcaaactctaagagtttctcttgagacataattgtgatgctgccaaaatttacataa 4481245  T
Q  345 acaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaattt 444  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||  |||||| |||    
T  4481246 acaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaatgtttccaagtgatattgtggacttt 4481345  T
Q  445 gattta 450  Q
    ||||||    
T  4481346 gattta 4481351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 466
Target Start/End: Original strand, 4617270 - 4617699
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  4617270 aaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatactttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaa 4617369  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatca 239  Q
     ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||| ||   |||||||||||| | ||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  4617370 cactttgtcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgagaaaatcactgagccaccaatgacaagatca 4617469  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |  | |||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||    
T  4617470 ggccttatgatccacaaaaatgatttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattca 4617569  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgat---tatg 436  Q
    |||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||   | ||    
T  4617570 cataaacaactgatcccggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttg 4617669  T
Q  437 tggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    |||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  4617670 tggagtttgttttaataatgaaggtaaagg 4617699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4504281 - 4503871
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  4504281 aaaatggccaacacaacattggcactccagcacaaacactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaa 4504182  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatca 239  Q
     ||||  ||||| |||||||| ||||| |   | |||||||  ||| |||| ||| |||| ||||||||||  |     ||||| ||||| |||||||||    
T  4504181 cactttatcttgtggacaccaacttgctacaagtcctctattagaagtttcattcacaaaatcagatgacaacacctctgagccaccaataacaagatca 4504082  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||  ||  ||||||||||||||||||||| | |    
T  4504081 ggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttatcttaagacataactgtaatgctgccaaaattta 4503982  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  4503981 cataaacaacagatcctggttcttttaattcaagccaatcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtgg 4503882  T
Q  440 aatttgattta 450  Q
    | |||||||||    
T  4503881 actttgattta 4503871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 450
Target Start/End: Original strand, 4457834 - 4458253
Alignment:
Q  32 atcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaaggg 131  Q
    ||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4457834 atcaccaaagaatggccaacgcagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtttcatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaaggg 4457933  T
Q  132 tggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatga 231  Q
    |||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||| |||   |||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||| || ||  ||||| |||||||    
T  4457934 tggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattaagcctctatcagaagtttcattcacaaaatccgatgacaaaacaaccgagccaccaatga 4458033  T
Q  232 caagatcaggcctaatgatccacaaaaatgg-tttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgc 330  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || | |||| |||  |||||||| ||||| |    
T  4458034 caagatcaggcctagttatccacaaaaaaggttttcttgctgttggccaaaacccaagcaaattctaagagcttctcttgagacataactgtgatgcttc 4458133  T
Q  331 caaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtg 430  Q
    ||||| | ||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4458134 caaaatttacataaataacagactttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatattctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtg 4458233  T
Q  431 attatgtggaatttgattta 450  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  4458234 attttgtggactttgattta 4458253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 448
Target Start/End: Original strand, 4568304 - 4568700
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  |||   |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||     
T  4568304 aaaaaggccaacataacattggtactctggcacaaatgctttccaatgtggagttccatccacaatgagtcaagaatcgtccaactgaagggtggttcaa 4568403  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatca 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||| | |    
T  4568404 cacttgctcttgcggacaccagcttgctatttggcctctatccgaagttccattcacaaactcggatgacaaaataactgagccaccaatgacaagctaa 4568503  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||   ||||||||||| |||||  || |||| |||||| |||    
T  4568504 ggcctaatgatccacaaaaaaggtttcttgctgttggcaaaacctcaagagaactctaac---tgctctggagtcataaccatagtgcttccaaaattca 4568600  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||| |         |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  4568601 cataaactacagaaccttgttccttag---------attcaagacatttcatatcttctttccaaagattggaacctaaagaagccaagtgcttttgggg 4568691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 4493176 - 4493346
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4493176 atctacagtttgttggctgatcactaaagaaaggccaacacaacattggcactccggcacatatgtttttggtagttgagttccatccacaatgagtcaa 4493275  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctg 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||    
T  4493276 gaatccaccaatcgaatggtggttcagcagtttctcttgtggacaccaactagcaattaggcctctatctg 4493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4391976 - 4391794
Alignment:
Q  75 atgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcga----tt 170  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||     |    
T  4391976 atgctttcaatgggtgagtttcatccacaatgcgttaagaatccacaaattcaagggtggttcaatacttgctctttcggacaccatcttgcgactagat 4391877  T
Q  171 cgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 253  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| || | | || | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4391876 agacctctatctgaaatttcattctcatactcatataacaaaacacatgacctgccaatgacaaggtcaagcctaatgatcca 4391794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4835571 - 4835512
Alignment:
Q  368 ttcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaa 427  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4835571 ttcaagccattcaagacattttgtatcttccttccaaagatcggaacctaaagatgccaa 4835512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 40 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4570 - 4147
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570 aaaatggccaacacaacattggcactcctacacatatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 4471  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatca 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4470 tacttgctcttgtggacaccagctcgcaattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaaggtca 4371  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggagttataactgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  4370 ggcctaatgatccacaaaaaggatttcttacaattggtcaaaacccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgcttccaaaattca 4271  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  4270 cataaacaaccgactcaggttccttggatgcaagccactcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat---tagtgattatgtgg 4174  T
Q  440 aatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  4173 agtttgatttaataatgaagttaaagg 4147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 466
Target Start/End: Original strand, 1281335 - 1281791
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||| | |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1281335 atctacagtctgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 1281434  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  1281435 gaatccaccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcgcaaagtcagatgacaaa 1281534  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||    |||||||||||||    
T  1281535 atcactgagccgccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaatggtttcttgctattagccagaccccaagcaaattcctgaagttgctctggag 1281634  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  1281635 tcataactgtaatgcttccgaaattcacataaacaacagatctcggttccttcgattcaagccattgaagacactcgatatcttctttccaaaggttgga 1281734  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    | |||||||  |||| ||||   | |||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  1281735 atctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagg 1281791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 450
Target Start/End: Original strand, 24103220 - 24103657
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24103220 atctacagtttgttggttgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 24103319  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||| |    
T  24103320 gaatccaccaatcgaagggtggtttaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaacttctttaaaaaaatcagatgacaaa 24103419  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| | |    
T  24103420 acaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtg 24103519  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  24103520 acataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaactgatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 24103619  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24103620 atttaaagatgccaagtgattttgtggactttgattta 24103657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28000010 - 27999745
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||   ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  28000010 atctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatgaccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcggtggttgagttccatccgcagtgagtcaa 27999911  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||| || |  ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  27999910 gaacccgctgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcctaaactcagatgacaaa 27999811  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggcc 278  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27999810 accactgagccaccaatgacaagattaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaattggcc 27999745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 466
Target Start/End: Original strand, 24107008 - 24107049
Alignment:
Q  425 caagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  24107008 caagtgattatgttgaatttgatttaataatgaaggtaaagg 24107049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 466
Target Start/End: Original strand, 1674447 - 1674903
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| || ||  ||||    
T  1674447 atctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcagtgtgtcaa 1674546  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  1674547 gaatccgccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcataaactcagatgacaaa 1674646  T
Q  213 ataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  1674647 accactgagccaccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaatcggccaaaccccaagcaaactccaatagttgatctggag 1674746  T
Q  313 ttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | |||||  ||||||| || ||| ||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  1674747 tcataacaataatgctaccgaaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttgga 1674846  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
    |||||||||| | || ||||   | |||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  1674847 acctaaagattctaattgatgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagg 1674903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16686182 - 16685732
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| || |||  ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  16686182 atatatctgcattttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcatatatactttcagtggttgagttccatccacaatgag 16686083  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  16686082 ttaagaatccaccgattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagctcgcgattaggcttctatctgagatttcattcttaaactcagatga 16685983  T
Q  209 cataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    || ||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||    
T  16685982 caaaaccacggaaccgcaaatgacaagatcagacctaatgatccattgaaaatgttgcttgctattggtcaaaccccaagcaaactctaatagtttttct 16685883  T
Q  309 ggagttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16685882 gcagtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggaactcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttatttccaaagat 16685783  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaag 459  Q
    ||  || ||||  || ||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  16685782 tgatacttaaacttgacaactgattatgtggactttgacttaaaagtgaag 16685732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20863755 - 20863317
Alignment:
Q  12 tatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactca 111  Q
    ||||| |||||| | || |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  20863755 tatctgcagtttgtcggctgatcagcaaaaaatggccagcacaacattggcactccagcacatatgctctcaatggttgagttccatccacaatgagtta 20863656  T
Q  112 agaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacat 211  Q
      ||||||||||||||||| |||||||  || | |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |     
T  20863655 gaaatccaccaattgaaggatggttcaacaccttctcttgtggacaccaactcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaacgcagatgaaaa 20863556  T
Q  212 aataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaacctcaagcaaactctaacagttgctctgga 311  Q
    ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||  |    
T  20863555 aatcaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaacaatttttctaca 20863456  T
Q  312 gttataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgg 411  Q
    |  || |||||  | ||||||||| | ||||| |||| |||  | ||||| || |||||||||||| ||||||| |  |  ||||||||||||||| | |    
T  20863455 gacatgactgtggtactgccaaaatttacatatacaatagatcccggttctttcgattcaagccatgcaagacattcagtgtcttctttccaaagacttg 20863356  T
Q  412 aacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20863355 aatctaaagacgccaagtgattctgtggactttgattta 20863317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1965247 - 1965197
Alignment:
Q  78 ctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaa 128  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  1965247 ctttcaagggttgagttccaaccacagtgactcaagaaccctccaattgaa 1965197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1969186 - 1969140
Alignment:
Q  81 tcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattga 127  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1969186 tcaagggttgaattccagccacaatgagtcaagaatccaccaattga 1969140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3568 - 3441
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||     
T  3568 aaaatggccaacgcagcattggaactccagaacaaatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaact-aagggtggttcaa 3470  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcga 168  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3469 cacttgctcttacggacaccatcttgcga 3441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3259 - 3162
Alignment:
Q  174 cctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgct 271  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |  | | || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3259 cctctatctgaagtttcattctcaaactcatataacaaagcacatgatccgccaatgacaaggtcagacctaatgatccacacaaagggtttcttgct 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 466
Target Start/End: Original strand, 8 - 140
Alignment:
Q  337 tcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgat---t 433  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||   |    
T  8 tcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaattgatgaat 107  T
Q  434 atgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaagg 466  Q
     |||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  108 ttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagg 140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University