View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4824-Insertion-4 (Length: 936)

Name: NF4824-Insertion-4
Description: NF4824
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4824-Insertion-4
NF4824-Insertion-4
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (8-346)||(38386606-38386945)
chr3 (226-577)||(18542390-18542740)
chr3 (218-592)||(22993688-22994060)
chr3 (217-534)||(11784596-11784912)
chr3 (215-482)||(2775310-2775576)
chr3 (218-552)||(3292990-3293323)
chr3 (215-482)||(2778553-2778819)
chr3 (215-482)||(7486399-7486665)
chr3 (215-482)||(43809408-43809674)
chr3 (217-534)||(50461596-50461912)
chr3 (215-534)||(32287371-32287689)
chr3 (215-534)||(49742967-49743285)
chr3 (215-482)||(2873393-2873658)
chr3 (215-482)||(45896209-45896475)
chr3 (215-488)||(3840345-3840617)
chr3 (218-534)||(30220053-30220371)
chr3 (218-482)||(16184787-16185050)
chr3 (215-482)||(52199742-52200007)
chr3 (215-482)||(54723570-54723836)
chr3 (215-488)||(41976844-41977115)
chr3 (219-534)||(35412348-35412656)
chr3 (215-482)||(43926664-43926929)
chr3 (219-482)||(48064135-48064396)
chr3 (218-534)||(54719803-54720117)
chr3 (215-482)||(8461587-8461852)
chr3 (215-482)||(24125328-24125593)
chr3 (215-482)||(24128605-24128870)
chr3 (215-482)||(29343974-29344240)
chr3 (218-488)||(11190358-11190627)
chr3 (215-524)||(30690565-30690872)
chr3 (226-482)||(538666-538921)
chr3 (218-482)||(6434878-6435140)
chr3 (352-552)||(17545820-17546020)
chr3 (218-482)||(12561334-12561596)
chr3 (218-482)||(22416934-22417196)
chr3 (264-482)||(53815705-53815922)
chr3 (218-482)||(27091726-27091989)
chr3 (215-482)||(32367229-32367494)
chr3 (218-482)||(34983953-34984215)
chr3 (218-481)||(52988237-52988498)
chr3 (215-534)||(10884687-10885003)
chr3 (217-524)||(19301563-19301868)
chr3 (215-534)||(20728695-20729012)
chr3 (218-482)||(55034960-55035222)
chr3 (222-482)||(9392570-9392828)
chr3 (215-534)||(16243702-16244019)
chr3 (762-904)||(38386949-38387092)
chr3 (217-482)||(28008171-28008433)
chr3 (226-438)||(25443003-25443214)
chr3 (215-534)||(10106647-10106964)
chr3 (247-482)||(17040122-17040357)
chr3 (218-482)||(28265712-28265971)
chr3 (215-480)||(15195404-15195667)
chr3 (217-482)||(47054756-47055020)
chr3 (218-438)||(17141240-17141459)
chr3 (218-524)||(10881312-10881616)
chr3 (217-482)||(47051326-47051590)
chr3 (217-488)||(19304783-19305052)
chr3 (324-534)||(18644816-18645026)
chr3 (215-482)||(25584516-25584771)
chr3 (277-534)||(23298663-23298920)
chr3 (218-524)||(22783424-22783739)
chr3 (218-524)||(22787788-22788103)
chr3 (255-502)||(282271-282517)
chr3 (218-482)||(46884784-46885035)
chr3 (268-534)||(17531704-17531963)
chr3 (215-535)||(17528808-17529122)
chr3 (331-534)||(31549115-31549318)
chr3 (348-534)||(35751401-35751587)
chr3 (218-342)||(17544448-17544570)
chr3 (215-384)||(52309754-52309923)
chr3 (247-447)||(27308157-27308356)
chr3 (220-375)||(31857650-31857804)
chr3 (247-450)||(27298594-27298797)
chr3 (383-490)||(54461010-54461117)
chr3 (218-325)||(22360278-22360383)
chr3 (215-317)||(11636663-11636762)
chr3 (348-450)||(27308717-27308818)
chr3 (421-534)||(18641820-18641933)
chr3 (218-325)||(22370181-22370286)
chr3 (219-319)||(6922579-6922678)
chr3 (606-673)||(18542787-18542854)
chr3 (346-416)||(6030770-6030840)
chr3 (264-314)||(35751331-35751381)
chr3 (744-799)||(52309377-52309430)
chr3 (401-482)||(55032100-55032181)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (218-541)||(22172428-22172751)
chr4 (218-592)||(37739762-37740136)
chr4 (217-482)||(15812250-15812516)
chr4 (264-552)||(8877545-8877832)
chr4 (253-480)||(48014167-48014392)
chr4 (217-534)||(56195272-56195588)
chr4 (215-534)||(24150415-24150733)
chr4 (215-482)||(39501391-39501657)
chr4 (217-482)||(34320030-34320294)
chr4 (215-534)||(34017842-34018160)
chr4 (217-534)||(44809016-44809332)
chr4 (219-534)||(8874822-8875136)
chr4 (271-534)||(12238061-12238326)
chr4 (215-479)||(40903199-40903462)
chr4 (218-489)||(40493474-40493743)
chr4 (264-488)||(56198644-56198868)
chr4 (215-481)||(48415643-48415908)
chr4 (217-482)||(29324570-29324834)
chr4 (264-534)||(53094298-53094568)
chr4 (215-482)||(48637248-48637514)
chr4 (215-482)||(24044254-24044519)
chr4 (226-552)||(33408361-33408685)
chr4 (215-534)||(15163935-15164254)
chr4 (215-515)||(40794745-40795044)
chr4 (215-534)||(19820471-19820788)
chr4 (215-482)||(27014006-27014272)
chr4 (215-534)||(44164526-44164843)
chr4 (215-482)||(52531048-52531314)
chr4 (217-482)||(46955591-46955855)
chr4 (215-534)||(3718867-3719184)
chr4 (215-534)||(52006592-52006909)
chr4 (217-482)||(15431824-15432087)
chr4 (215-472)||(19827233-19827488)
chr4 (218-534)||(29544935-29545249)
chr4 (218-481)||(21419535-21419796)
chr4 (215-534)||(27677116-27677433)
chr4 (217-482)||(15405194-15405461)
chr4 (215-534)||(12782648-12782965)
chr4 (215-482)||(15429969-15430234)
chr4 (215-482)||(38283602-38283867)
chr4 (218-482)||(53009671-53009933)
chr4 (215-482)||(15436583-15436848)
chr4 (283-534)||(3797869-3798119)
chr4 (264-535)||(19859582-19859852)
chr4 (215-482)||(5672625-5672904)
chr4 (218-482)||(35509711-35509973)
chr4 (283-482)||(18673195-18673393)
chr4 (217-534)||(33926712-33927033)
chr4 (264-438)||(11195467-11195641)
chr4 (247-482)||(5681201-5681436)
chr4 (247-438)||(25961831-25962023)
chr4 (247-482)||(37103329-37103563)
chr4 (247-488)||(49270456-49270695)
chr4 (264-482)||(5670357-5670586)
chr4 (289-524)||(15446807-15447041)
chr4 (264-482)||(19864626-19864843)
chr4 (292-482)||(27679338-27679527)
chr4 (316-482)||(40616921-40617087)
chr4 (215-552)||(5677452-5677786)
chr4 (332-541)||(33493749-33493958)
chr4 (218-489)||(30392319-30392584)
chr4 (218-388)||(8448748-8448918)
chr4 (348-482)||(18911374-18911507)
chr4 (217-342)||(15438438-15438562)
chr4 (744-803)||(26060803-26060861)
chr4 (744-802)||(3797579-3797636)
chr4 (744-803)||(15404845-15404903)
chr4 (744-803)||(15811899-15811957)
chr4 (744-803)||(56195827-56195885)
chr4 (744-802)||(56199154-56199211)
chr4 (744-803)||(19821015-19821072)
chr4 (218-296)||(27691442-27691519)
chr4 (638-673)||(33927154-33927189)
chr4 (280-319)||(40617098-40617137)
chr4 (744-802)||(19827722-19827778)
chr4 (752-802)||(40795320-40795369)
chr4 (596-659)||(5681564-5681629)
chr4 (803-855)||(29442165-29442218)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (253-592)||(21914902-21915241)
chr5 (215-502)||(22937030-22937316)
chr5 (215-534)||(17664296-17664613)
chr5 (215-482)||(26752814-26753080)
chr5 (247-490)||(42062695-42062939)
chr5 (247-488)||(2837077-2837319)
chr5 (264-534)||(18239557-18239826)
chr5 (215-482)||(41876877-41877143)
chr5 (215-482)||(7270760-7271025)
chr5 (217-480)||(7624848-7625110)
chr5 (217-534)||(14016199-14016515)
chr5 (215-519)||(26292535-26292837)
chr5 (218-438)||(17748187-17748406)
chr5 (215-534)||(34831507-34831825)
chr5 (264-488)||(20055566-20055789)
chr5 (215-534)||(40582993-40583310)
chr5 (215-534)||(4099578-4099900)
chr5 (218-534)||(12087705-12088019)
chr5 (218-479)||(26907571-26907830)
chr5 (215-586)||(31575162-31575529)
chr5 (215-479)||(30066086-30066348)
chr5 (218-482)||(43491502-43491765)
chr5 (215-482)||(21335811-21336076)
chr5 (248-482)||(14375921-14376155)
chr5 (217-482)||(18952439-18952702)
chr5 (218-482)||(34133096-34133358)
chr5 (218-482)||(34143327-34143589)
chr5 (215-462)||(32837764-32838007)
chr5 (215-482)||(21332793-21333060)
chr5 (218-482)||(12058605-12058867)
chr5 (255-580)||(18765657-18765980)
chr5 (217-480)||(26895719-26895980)
chr5 (215-482)||(41306640-41306905)
chr5 (247-431)||(23043938-23044123)
chr5 (218-438)||(28787478-28787698)
chr5 (264-534)||(39192120-39192389)
chr5 (215-534)||(33551865-33552182)
chr5 (354-491)||(563363-563500)
chr5 (218-482)||(31863446-31863724)
chr5 (217-405)||(22130011-22130197)
chr5 (218-482)||(11959287-11959545)
chr5 (402-481)||(22131159-22131238)
chr5 (596-649)||(31575555-31575609)
chr5 (218-304)||(28441425-28441510)
chr5 (744-802)||(7271329-7271385)
chr5 (744-802)||(21332440-21332496)
chr5 (218-300)||(563517-563597)
chr5 (744-802)||(4099291-4099347)
chr5 (754-803)||(21335458-21335506)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (245-668)||(5796311-5796751)
chr7 (256-599)||(18562534-18562877)
chr7 (217-534)||(16165481-16165797)
chr7 (215-482)||(23225023-23225289)
chr7 (217-479)||(13449897-13450157)
chr7 (215-482)||(8276716-8276982)
chr7 (219-519)||(5242232-5242532)
chr7 (264-534)||(2441344-2441614)
chr7 (217-534)||(6603191-6603507)
chr7 (217-482)||(13842373-13842636)
chr7 (218-534)||(10468878-10469192)
chr7 (264-480)||(7227306-7227522)
chr7 (217-552)||(48645207-48645539)
chr7 (217-534)||(9864792-9865108)
chr7 (218-482)||(26136246-26136508)
chr7 (215-482)||(9132878-9133143)
chr7 (217-488)||(11398137-11398407)
chr7 (215-524)||(4546600-4546907)
chr7 (218-482)||(26144626-26144888)
chr7 (264-482)||(45287187-45287404)
chr7 (218-534)||(3068043-3068357)
chr7 (215-534)||(26557231-26557547)
chr7 (215-534)||(4596075-4596392)
chr7 (264-552)||(13809566-13809848)
chr7 (262-534)||(20594040-20594311)
chr7 (255-501)||(2090376-2090621)
chr7 (215-482)||(17730545-17730810)
chr7 (217-489)||(37166258-37166528)
chr7 (215-438)||(4695255-4695477)
chr7 (226-492)||(24917938-24918201)
chr7 (264-534)||(14683510-14683779)
chr7 (264-482)||(20080836-20081053)
chr7 (264-519)||(10344993-10345247)
chr7 (218-435)||(22611771-22611987)
chr7 (264-472)||(37415553-37415760)
chr7 (264-472)||(37423085-37423292)
chr7 (264-342)||(45290671-45290749)
chr7 (264-335)||(9273384-9273455)
chr7 (744-802)||(11397820-11397877)
chr7 (754-802)||(33844380-33844427)
chr7 (754-806)||(4595765-4595816)
chr7 (604-659)||(48645607-48645663)
chr7 (744-802)||(10345474-10345530)
chr7 (421-482)||(45290598-45290658)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (247-599)||(27331774-27332118)
chr1 (218-592)||(7635394-7635766)
chr1 (308-592)||(21434479-21434763)
chr1 (348-599)||(27355684-27355935)
chr1 (217-534)||(673133-673449)
chr1 (217-482)||(6071066-6071330)
chr1 (217-482)||(31204585-31204849)
chr1 (215-534)||(20398598-20398916)
chr1 (217-482)||(45960857-45961121)
chr1 (215-482)||(45941161-45941427)
chr1 (215-534)||(23021984-23022302)
chr1 (215-534)||(905746-906067)
chr1 (217-534)||(37183924-37184240)
chr1 (218-482)||(49853191-49853453)
chr1 (218-482)||(3796939-3797201)
chr1 (218-482)||(2793976-2794238)
chr1 (264-552)||(34732405-34732690)
chr1 (215-534)||(1950516-1950833)
chr1 (215-482)||(41058415-41058680)
chr1 (215-534)||(21107352-21107669)
chr1 (215-482)||(28110802-28111067)
chr1 (218-482)||(49498610-49498873)
chr1 (264-449)||(11668171-11668356)
chr1 (215-534)||(29643282-29643599)
chr1 (218-479)||(2405258-2405517)
chr1 (219-534)||(21018528-21018840)
chr1 (420-540)||(16055623-16055743)
chr1 (218-437)||(34066599-34066815)
chr1 (420-540)||(16056858-16056978)
chr1 (413-542)||(13431012-13431141)
chr1 (420-599)||(16060965-16061144)
chr1 (247-319)||(42022450-42022523)
chr1 (457-540)||(16062270-16062353)
chr1 (372-519)||(27355020-27355165)
chr1 (476-579)||(30938578-30938681)
chr1 (604-667)||(7635795-7635857)
chr1 (443-534)||(11667062-11667153)
chr1 (604-667)||(16056712-16056777)
chr1 (611-665)||(34065073-34065128)
chr1 (380-430)||(16062347-16062397)
chr1 (754-803)||(21110912-21110960)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (219-542)||(28848592-28848912)
chr6 (264-534)||(11247555-11247824)
chr6 (215-524)||(12988196-12988502)
chr6 (215-540)||(13021309-13021631)
chr6 (257-501)||(24371060-24371305)
chr6 (219-552)||(2846051-2846383)
chr6 (219-534)||(1125796-1126110)
chr6 (215-479)||(2378975-2379238)
chr6 (218-530)||(9839459-9839770)
chr6 (215-534)||(9953709-9954026)
chr6 (215-482)||(11402002-11402268)
chr6 (218-552)||(5259685-5260014)
chr6 (218-534)||(22561224-22561539)
chr6 (215-482)||(3596894-3597160)
chr6 (219-482)||(5738197-5738459)
chr6 (215-482)||(30655189-30655455)
chr6 (218-534)||(28230343-28230657)
chr6 (222-516)||(11192657-11192949)
chr6 (215-488)||(14281627-14281899)
chr6 (215-482)||(10289718-10289983)
chr6 (247-534)||(20185520-20185807)
chr6 (247-534)||(22150184-22150471)
chr6 (218-489)||(24399928-24400197)
chr6 (247-482)||(6513027-6513267)
chr6 (215-534)||(26942496-26942813)
chr6 (218-438)||(18856181-18856400)
chr6 (215-472)||(11125819-11126074)
chr6 (215-534)||(13004934-13005252)
chr6 (218-438)||(24410048-24410266)
chr6 (218-489)||(19475751-19476020)
chr6 (247-489)||(13946794-13947036)
chr6 (351-534)||(23007941-23008124)
chr6 (351-534)||(23780240-23780423)
chr6 (215-436)||(4512218-4512438)
chr6 (215-482)||(28111879-28112143)
chr6 (217-416)||(31072052-31072250)
chr6 (264-444)||(2372119-2372295)
chr6 (215-462)||(28107923-28108167)
chr6 (215-379)||(11188131-11188294)
chr6 (300-482)||(23384865-23385048)
chr6 (215-363)||(23388328-23388475)
chr6 (337-534)||(17106671-17106867)
chr6 (218-388)||(26898075-26898244)
chr6 (365-482)||(7128194-7128310)
chr6 (215-355)||(28665503-28665642)
chr6 (610-668)||(11192494-11192551)
chr6 (604-659)||(24371366-24371422)
chr6 (623-668)||(9839307-9839352)
chr6 (753-808)||(16731648-16731702)
chr6 (744-802)||(20186045-20186102)
chr6 (744-802)||(22149889-22149946)
chr6 (753-802)||(20527156-20527204)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (218-479)||(118561-118821)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (218-665)||(9685-10148)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (215-534)||(25959750-25960068)
chr2 (215-534)||(9185486-9185804)
chr2 (215-482)||(43208003-43208269)
chr2 (215-534)||(9188714-9189032)
chr2 (247-534)||(30274830-30275118)
chr2 (215-482)||(31586054-31586320)
chr2 (215-534)||(42368773-42369090)
chr2 (215-502)||(35521455-35521743)
chr2 (217-534)||(31427603-31427919)
chr2 (215-534)||(22020794-22021111)
chr2 (218-534)||(25138993-25139308)
chr2 (215-482)||(5105452-5105718)
chr2 (215-482)||(11348009-11348275)
chr2 (218-534)||(25820908-25821222)
chr2 (215-482)||(24234821-24235087)
chr2 (215-524)||(36808514-36808821)
chr2 (217-534)||(45453602-45453917)
chr2 (217-534)||(45456889-45457205)
chr2 (215-482)||(6826498-6826763)
chr2 (215-482)||(24238093-24238359)
chr2 (215-482)||(26365659-26365925)
chr2 (215-482)||(37279790-37280056)
chr2 (217-534)||(27266516-27266832)
chr2 (217-534)||(33310394-33310710)
chr2 (218-534)||(40259201-40259515)
chr2 (215-482)||(8888361-8888627)
chr2 (215-534)||(16178853-16179170)
chr2 (217-534)||(38015246-38015562)
chr2 (215-483)||(43723427-43723692)
chr2 (218-599)||(30926276-30926648)
chr2 (218-534)||(1386484-1386798)
chr2 (281-479)||(9966486-9966684)
chr2 (226-482)||(5666255-5666509)
chr2 (215-438)||(17876832-17877054)
chr2 (215-482)||(25870510-25870775)
chr2 (264-482)||(45493270-45493487)
chr2 (264-482)||(45501012-45501229)
chr2 (218-478)||(37937337-37937595)
chr2 (215-482)||(40781198-40781463)
chr2 (218-482)||(16790871-16791135)
chr2 (215-482)||(13972008-13972273)
chr2 (215-482)||(25873901-25874166)
chr2 (218-479)||(12219524-12219784)
chr2 (264-482)||(3875060-3875277)
chr2 (218-482)||(22630570-22630832)
chr2 (219-398)||(10600676-10600854)
chr2 (218-395)||(17876211-17876387)
chr2 (300-489)||(17874694-17874877)
chr2 (412-599)||(34682622-34682807)
chr2 (218-342)||(29440252-29440375)
chr2 (330-500)||(11187925-11188095)
chr2 (744-803)||(31427305-31427363)
chr2 (224-381)||(6298203-6298357)
chr2 (744-805)||(45457445-45457505)
chr2 (604-659)||(25820767-25820823)
chr2 (604-659)||(34682829-34682883)
chr2 (748-803)||(45454161-45454215)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (217-534)||(22173984-22174300)
chr8 (218-482)||(14421488-14421751)
chr8 (217-534)||(18824455-18824771)
chr8 (217-534)||(18825948-18826264)
chr8 (217-534)||(36710697-36711013)
chr8 (264-580)||(4868043-4868356)
chr8 (215-482)||(18721394-18721660)
chr8 (218-534)||(45155330-45155645)
chr8 (215-534)||(43681931-43682249)
chr8 (218-482)||(8911391-8911654)
chr8 (219-534)||(12582753-12583066)
chr8 (215-479)||(25594773-25595036)
chr8 (283-534)||(12516514-12516765)
chr8 (217-534)||(17930724-17931039)
chr8 (215-482)||(25591592-25591857)
chr8 (215-482)||(38248512-38248777)
chr8 (217-534)||(21279830-21280145)
chr8 (226-482)||(23619477-23619731)
chr8 (217-502)||(23643562-23643846)
chr8 (218-482)||(31284414-31284680)
chr8 (215-482)||(16953517-16953783)
chr8 (217-534)||(5980374-5980689)
chr8 (218-479)||(10663643-10663902)
chr8 (218-482)||(10498327-10498589)
chr8 (264-453)||(5538915-5539104)
chr8 (218-491)||(30784673-30784934)
chr8 (215-489)||(33419397-33419669)
chr8 (218-524)||(5613788-5614103)
chr8 (264-488)||(13196646-13196869)
chr8 (247-480)||(25230851-25231085)
chr8 (264-479)||(2560341-2560556)
chr8 (215-319)||(23613281-23613384)
chr8 (283-534)||(44027154-44027404)
chr8 (744-802)||(33883114-33883171)
chr8 (604-659)||(5538693-5538749)
chr8 (753-804)||(12820638-12820688)
chr8 (638-673)||(14589526-14589561)
chr8 (744-802)||(5538535-5538591)
chr8 (754-803)||(12583328-12583376)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (215-482)||(19139-19405)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (215-482)||(3901-4167)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (215-482)||(62261-62526)
scaffold0035 (218-438)||(63615-63825)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (226-580)||(48418-48769)
scaffold0034 (604-641)||(48343-48380)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (264-534)||(3343-3613)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (218-534)||(30841-31155)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (215-472)||(57712-57968)
[»] scaffold0520 (4 HSPs)
scaffold0520 (215-482)||(8332-8597)
scaffold0520 (215-387)||(4187-4358)
scaffold0520 (367-534)||(1609-1775)
scaffold0520 (745-802)||(1304-1359)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (215-534)||(67586-67903)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (215-482)||(5511-5778)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (264-534)||(124-394)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (217-482)||(89515-89779)
scaffold0045 (754-803)||(90080-90128)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (264-482)||(292815-293032)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (215-534)||(5096-5413)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (218-438)||(29112-29331)
scaffold0084 (218-388)||(19042-19211)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (218-489)||(3111-3387)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (264-480)||(197939-198154)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (218-438)||(58837-59058)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (264-438)||(10201-10375)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (215-472)||(2196-2451)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (218-482)||(19102-19358)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (324-482)||(14091-14248)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (348-482)||(6-140)
[»] scaffold1785 (1 HSPs)
scaffold1785 (218-438)||(1005-1215)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (390-534)||(102-246)
scaffold1208 (265-355)||(1-91)
[»] scaffold1063 (2 HSPs)
scaffold1063 (365-534)||(2385-2556)
scaffold1063 (744-802)||(2798-2854)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (367-534)||(248413-248579)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (215-314)||(24565-24663)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (357-483)||(6-131)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (368-534)||(27005-27170)
scaffold0080 (744-802)||(27422-27478)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (218-317)||(1493-1591)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (623-673)||(7616-7666)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 346
Target Start/End: Original strand, 38386606 - 38386945
Alignment:
Q  8 ttggagaccattcatgcatcacttttggtgagtaacagtgacggcacatgggaatgagaaacaagaacaactctaattgaaagagaattgaggagctaca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38386606 ttggagaccattcatgcatcacttttggtgagtaacagtgacggcacatgggaatgagaaacaagaacaactctaattgaaagagaattgaggagctaca 38386705  T
Q  108 cgggcaacacatcataactctatcggtttaatttctctactatgtttcttatttctaa--ctcatagagattaggtctaaaatgaatctaatgtactctg 205  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  38386706 caggcaacacatcagaactctattggtttaatttttctactatctttcttatttctaaatctcttagagattaggtctgagatgaatctaatgtattctg 38386805  T
Q  206 ttttgaaccaaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38386806 ttttgaaccaaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatatcaattcagttttattcaattcaattgtt-ttaatgctttttatatactgatc 38386904  T
Q  306 acatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcacc 346  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38386905 atgtataaacatgaattcgtgagaatgaatgactactcacc 38386945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 226 - 577
Target Start/End: Original strand, 18542390 - 18542740
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18542390 tgtgaaactctatttcatatatgaatatcaatatagttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatactgatcacatataa-catgaatttgt 18542488  T
Q  326 gagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgat 425  Q
    |||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  18542489 gagaatgaatgactaatgaccataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgat 18542588  T
Q  426 attaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaa 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||| ||  ||||||||||||||| ||||     
T  18542589 attaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagaaattagggactgtaatctgagaagaaggtcttaagtcaagggattgattag 18542688  T
Q  526 ggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaatagg 577  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  18542689 gactattttagttaaccatcgtgaagctagaggagtattcataggaaatagg 18542740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 218 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 22994060 - 22993688
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22994060 catgttgctgtaaaactctattt-at-tgtgaatatcaatctagttttattcaattcaatttttcttaatgttttttatatacttatcagatataaacat 22993963  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  22993962 gaattcgtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggtaagtttaggaatggataatcgttta 22993863  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggga 517  Q
    | ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||   ||||||||||||    
T  22993862 tttgtgatactaggttaacgttctaaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatttgagaagagggtcctaagtcaaggga 22993763  T
Q  518 tttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 592  Q
    || |||| || |||||||||||||| |||  ||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22993762 ttgattagggatattttagttaaccatcgtaaaactagagaagtattcatagtaaataggtgcagtgtaccaatt 22993688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 11784596 - 11784912
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11784596 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcacatataaat 11784693  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  11784694 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctt 11784793  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    |||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   ||| ||||||    
T  11784794 tattagtgatattagattaacgtgcttaaaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatccgataagagggtcctaactcaagg 11784893  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11784894 gatttattagggctatttt 11784912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 2775310 - 2775576
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2775310 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 2775407  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  2775408 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 2775507  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2775508 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2775576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 218 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3293323 - 3292990
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | |||||| ||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  3293323 catgttgatgtgaaactctatct-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaaatgttcttaatgctttttatatcctagtcaaatataaaca 3293226  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3293225 tgatttcgtgagaacgaatgactactaaccctagccttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgttt 3293126  T
Q  417 a-tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | | | | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||  |||||||||||    
T  3293125 atttttttatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggttgtaatcggagaagtgggtcttaagtcaagg 3293026  T
Q  516 gatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  3293025 gattgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 3292990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 2778553 - 2778819
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2778553 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 2778650  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  2778651 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 2778750  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2778751 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2778819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 7486399 - 7486665
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7486399 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 7486496  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  7486497 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 7486596  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  7486597 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 7486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 43809408 - 43809674
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43809408 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatcctgatcaaatataa 43809505  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  43809506 acatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcc 43809605  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43809606 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggg 43809674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 50461912 - 50461596
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50461912 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 50461815  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50461814 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtt 50461715  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||| ||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  50461714 tgttagtgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 50461615  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  50461614 gattgattagggctatttt 50461596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 32287689 - 32287371
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||    
T  32287689 aaccatgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatattgacaccatataa 32287592  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  32287591 acatgatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 32287492  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| || | | | |||||||   ||| ||||    
T  32287491 tttattagtgatattaggttaacatacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggattatagtttgagaagagggccctaactcaa 32287392  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  32287391 gggattgattatgactatttt 32287371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 49743285 - 49742967
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49743285 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 49743188  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  49743187 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtttaggaatggataatcg 49743088  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    | | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  49743087 tctgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 49742988  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  49742987 gggattgattaggactatttt 49742967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 2873393 - 2873658
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2873393 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 2873490  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  2873491 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaagaatggataatcg 2873590  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2873591 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2873658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 45896209 - 45896475
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45896209 aaccatattgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 45896306  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  45896307 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgagttgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 45896406  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45896407 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 215 - 488
Target Start/End: Original strand, 3840345 - 3840617
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3840345 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 3840442  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||     
T  3840443 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctaggaatggataatcc 3840542  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  3840543 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggggttgta 3840617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30220371 - 30220053
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |    
T  30220371 catgttgctgtgaaactatattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctctttatatccttatcaaatataaaga 30220274  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30220273 tgatttggtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 30220174  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtt---tttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    || |||||||||| ||||||  |    |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||   ||||||||    
T  30220173 atttgtgatattaagttaactatcaacttaaaagcttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggttacaatctatgaagagggtcctaagtcaa 30220074  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  30220073 gggattgattagggctatttt 30220053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16185050 - 16184787
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatct-agtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| | | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16185050 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttgttaatgttttttatatcctgatcaaatataaaca 16184953  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  16184952 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatctttt 16184853  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  16184852 attagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 16184787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 52199742 - 52200007
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52199742 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 52199839  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  52199840 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 52199939  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  52199940 tttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 52200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 54723570 - 54723836
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54723570 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 54723667  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  54723668 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 54723767  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |   |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  54723768 tttgttaatgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaaataggg 54723836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 488
Target Start/End: Original strand, 41976844 - 41977115
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41976844 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 41976941  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  41976942 acatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctatgaatggataatcg 41977041  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  41977042 tttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 41977115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 219 - 534
Target Start/End: Original strand, 35412348 - 35412656
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35412348 atgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 35412445  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||      || ||||||||||     
T  35412446 gatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc------tggataatcgtttg 35412539  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggga 517  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||   ||| ||||||||    
T  35412540 ttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctaacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagggtcctaactcaaggga 35412639  T
Q  518 tttattaaggctatttt 534  Q
    || |||| | |||||||    
T  35412640 ttgattaggactatttt 35412656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 43926664 - 43926929
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | ||  |||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926664 aaccatgttgctgtgaaactctatttattgta--aatgacaatctagtttttattcaattcagttgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 43926761  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43926762 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcg 43926861  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  43926862 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 43926929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 219 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 48064396 - 48064135
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||  || | |||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48064396 atgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 48064299  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48064298 gatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatccttta 48064199  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  48064198 ttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 48064135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Original strand, 54719803 - 54720117
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  54719803 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaaca 54719900  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  54719901 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 54720000  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||   ||| |||||||    
T  54720001 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 54720099  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  54720100 attgattaggactatttt 54720117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8461852 - 8461587
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8461852 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgtgcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 8461755  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  8461754 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcc 8461655  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8461654 tttattagtgatactaggttaacgttttt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8461587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 24125328 - 24125593
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24125328 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 24125425  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  24125426 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 24125525  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24125526 tttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24125593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 24128605 - 24128870
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24128605 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 24128702  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  24128703 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 24128802  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24128803 tttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24128870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 29344240 - 29343974
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29344240 aaccatgttgctgtcaaactctattt-at-tgtgaatgacaatccagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 29344143  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||     
T  29344142 acatgatttagttagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctaggaatgaataatct 29344043  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  29344042 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 29343974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 488
Target Start/End: Original strand, 11190358 - 11190627
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11190358 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 11190455  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||  ||    
T  11190456 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcgaggaatggataatcactt 11190555  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
     |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  11190556 gttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaagaattattagaccacctaaggaattaggggttgta 11190627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 215 - 524
Target Start/End: Original strand, 30690565 - 30690872
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | |  ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30690565 aaccatgttgctgtgaaactctatttactgt--gaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 30690662  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  30690663 atatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctaggaatggataatcg 30690762  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||   ||| ||||    
T  30690763 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatttgagaagagggtcctaactcaa 30690861  T
Q  514 gggatttatta 524  Q
    |||||| ||||    
T  30690862 gggattgatta 30690872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 226 - 482
Target Start/End: Original strand, 538666 - 538921
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcg 324  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  538666 tgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttag 538763  T
Q  325 tgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtga 424  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||| |||||| |  ||||    
T  538764 tgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgtttaaataaacaggtttagtctagcaatggatattcgtttgttagtga 538863  T
Q  425 tattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  538864 tattaggttaacgttcttaaaacattcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 538921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6435140 - 6434878
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  6435140 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaaca 6435043  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  6435042 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatccttt 6434943  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  6434942 attagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 6434878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 352 - 552
Target Start/End: Original strand, 17545820 - 17546020
Alignment:
Q  352 tttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc 451  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  17545820 tttcaacttagacctaattgaattattcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttatgatactaggttaacgtgcttaaaaccttc 17545919  T
Q  452 aaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaa 551  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17545920 aaagaatattagctcacctaaggaattagggattgtaatctgagaagagggtcataagtcaagggattgattagggctattttagttaaccatcgtgaaa 17546019  T
Q  552 c 552  Q
    |    
T  17546020 c 17546020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12561596 - 12561334
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  12561596 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 12561499  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  12561498 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 12561399  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  12561398 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 12561334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22417196 - 22416934
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22417196 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 22417099  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    | | || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  22417098 taatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 22416999  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  22416998 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 22416934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Original strand, 53815705 - 53815922
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  53815705 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttata 53815804  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  53815805 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattag 53815903  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  53815904 accacctaaggaattaggg 53815922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 27091726 - 27091989
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctta-ttcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27091726 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttgttaatgctttttatattctgatcaaatataaaca 27091823  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27091824 tgatttagtgagaacgaataactactgaccatagctttcgacttagacctaattaacttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 27091923  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| | |||||  ||||||||    
T  27091924 attagtgataaaaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccgcctaagaaattaggg 27091989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 32367494 - 32367229
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  32367494 aaccatgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttgtatcctgatcaaatataa 32367397  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  32367396 atatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 32367297  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  32367296 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 32367229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34984215 - 34983953
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34984215 catgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 34984118  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||  ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  34984117 tgatttagtgagaacgaatgactaccgactctaactttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatggataatcattt 34984018  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34984017 attagtgatattaggttaaagtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 34983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 481
Target Start/End: Original strand, 52988237 - 52988498
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  52988237 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 52988334  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  52988335 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 52988434  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagg 481  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  52988435 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaactttcaacggttattagaccacctaaggaattagg 52988498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 10884687 - 10885003
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  10884687 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgc-ttttatatcccgatcatatataa 10884783  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  10884784 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 10884883  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  10884884 tttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaa 10884982  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  10884983 gggattgattaggactatttt 10885003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 19301868 - 19301563
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19301868 ccatgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttaaatcctgatcaaatataaac 19301771  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  19301770 atgatttagtgagaatgaatgactacagaccctagctttcaacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcttt 19301671  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||| | |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  19301670 tgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattaaaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 19301572  T
Q  516 gatttatta 524  Q
    |||||||||    
T  19301571 gatttatta 19301563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20729012 - 20728695
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  20729012 aaccacgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatccttatcaaatataa 20728915  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  20728914 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatct 20728815  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  20728814 tttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagaggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaa 20728716  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  20728715 gggattgattagggctatttt 20728695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 55035222 - 55034960
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |  ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55035222 catgttgttgtgaaactctatttgttgt--gaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat-ctgatcaaatataaaca 55035126  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  55035125 tgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatggataatcgttt 55035026  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |  ||||||||||||||||||   |||||||||||| || || || | ||||||| |||||||||    
T  55035025 gttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattactaaaccacctaaggaattaggg 55034960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 222 - 482
Target Start/End: Original strand, 9392570 - 9392828
Alignment:
Q  222 ttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaa 320  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  9392570 ttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgat 9392667  T
Q  321 ttcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatct 420  Q
    || ||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |      
T  9392668 ttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagatctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgtta 9392767  T
Q  421 gtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  9392768 gtgatattagtttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggg 9392828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 16243702 - 16244019
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    |||    
T  16243702 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaccgtaa 16243799  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||  |||||||    
T  16243800 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatagataatcg 16243899  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||||||||    
T  16243900 tttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaacacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaa 16243998  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  16243999 gggattgattaggactatttt 16244019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 762 - 904
Target Start/End: Original strand, 38386949 - 38387092
Alignment:
Q  762 acttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaatatctacacctctaatgttttgtagcc-aaagagaggtaagttagtatgattattaaa 860  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38386949 acttcgatacatttgttagcacacttgctaaaagtctatcaatatctactcctctaatgtcttgtagccaaaagagagttaagttagtatgattattaaa 38387048  T
Q  861 gaggaggt-agttagtatgattattgattagaacttggatctgtt 904  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38387049 ga-gaggtaagttagtatgattattgattagaacttggatctgtt 38387092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 28008433 - 28008171
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28008433 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 28008336  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28008335 atgatttagtgagaacaaataactactaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaatatggttagtctaggaatggataatcgtt 28008236  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||  |||||| ||| |  ||||  ||| ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28008235 tattagtgataatagat--acgtacttacaacattcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28008171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 226 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25443214 - 25443003
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcg 324  Q
    ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  25443214 tgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttag 25443117  T
Q  325 tgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtga 424  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||    
T  25443116 tgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtga 25443017  T
Q  425 tattaggttaacgt 438  Q
    |||||| |||||||    
T  25443016 tattagcttaacgt 25443003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10106964 - 10106647
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10106964 aaccatgttgctatgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 10106867  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  10106866 gcatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatca 10106767  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || | ||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  10106766 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-acaccttcaaatattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaa 10106668  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  10106667 gggattgattaggactatttt 10106647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 247 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17040357 - 17040122
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||    
T  17040357 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactatttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgac 17040258  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||  || ||    
T  17040257 catagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataattgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aa 17040159  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||    
T  17040158 accttcaaagattattagatcatctaaggaattaggg 17040122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 28265712 - 28265971
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28265712 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 28265809  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| ||||   |||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||    
T  28265810 tgatttagtgagaacgaat---tactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatggataatctttt 28265906  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28265907 attagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28265971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 215 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15195667 - 15195404
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  15195667 aaccatgttgctatgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatcctgattaaatataa 15195570  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  15195569 atatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgtgctaataaacatggttagtctaggaatggataatct 15195470  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattag 480  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||    
T  15195469 tttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattag 15195404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 47054756 - 47055020
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  47054756 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatatcctggtcaaatataaac 47054853  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||    
T  47054854 atgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaaggataaccgtt 47054953  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |   |||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||  |||||||||    
T  47054954 tgttactgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggg 47055020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Original strand, 17141240 - 17141459
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17141240 catgttattgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 17141337  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||    
T  17141338 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggatgatccttt 17141437  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  17141438 attagtgatattaggttaacgt 17141459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 524
Target Start/End: Original strand, 10881312 - 10881616
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10881312 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattagtgttttttatatcctgatcaaatataaaca 10881409  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  10881410 tgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttatacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttaatctaggaatggataatcgttt 10881509  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
     |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||  |||| | | | |||||||  ||||||||| ||    
T  10881510 gttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaaagg 10881608  T
Q  517 atttatta 524  Q
    ||| ||||    
T  10881609 attgatta 10881616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 47051326 - 47051590
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  47051326 ccatggtgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatatcctggtcaaatataaac 47051423  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||    
T  47051424 atgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaaggataaccgtt 47051523  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |   |||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||  |||||||||    
T  47051524 tgttactgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggg 47051590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 217 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19305052 - 19304783
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19305052 ccatgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttaaatcctgatcaaatataaac 19304955  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||| |||||| ||    
T  19304954 atgatttagtgagaatgaatgactattgaccctagctttcaacttagacataaatgaattgttctaatgaacatggttagtataggaatggataatcatt 19304855  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    | |   |||| ||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  19304854 tgttaatgatgttaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 19304783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 324 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18645026 - 18644816
Alignment:
Q  324 gtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtg 423  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| |  |||    
T  18645026 gtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggacaatcgtttgttagtg 18644927  T
Q  424 atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttatt 523  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |   ||| |||||||||| |||    
T  18644926 atattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattgatt 18644827  T
Q  524 aaggctatttt 534  Q
    | | |||||||    
T  18644826 aggactatttt 18644816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 25584516 - 25584771
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  25584516 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 25584613  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||           |||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  25584614 acatgatttagtga-----------tactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccaggaatggataatcg 25584702  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||    
T  25584703 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 25584771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23298920 - 23298663
Alignment:
Q  277 ttattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattg 376  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23298920 ttattcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattg 23298821  T
Q  377 ttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaa 476  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||| || || | ||||| |||||||  ||    
T  23298820 ttctaataaacatcgttagtctaggaatggataatcgtttgttggtgatattaggttaatgttcttaaaaccttgaaagattcttagaccacctaagaaa 23298721  T
Q  477 ttagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||||  |||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  23298720 ttaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactatttt 23298663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 524
Target Start/End: Original strand, 22783424 - 22783739
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||    
T  22783424 catgttgatgtgaaactctattt-at-tgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaaatataaaca 22783521  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattg-------ttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaata 409  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||||||  |||||||||||       |||||||||||| ||||| |||| | ||| |||    
T  22783522 tgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttattctaggtatgcata 22783621  T
Q  410 atcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc-aaggaatattagatcacctaacgaattaggg--attgtaatctaataagagggagtt 506  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||||||    | |||||| | |||||||   |    
T  22783622 atcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatctgagaagagggtcct 22783721  T
Q  507 aagtcaagggatttatta 524  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22783722 aagtcaagggatttatta 22783739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 524
Target Start/End: Original strand, 22787788 - 22788103
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||    
T  22787788 catgttgatgtgaaactctattt-at-tgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaaatataaaca 22787885  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattg-------ttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaata 409  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||||||  |||||||||||       |||||||||||| ||||| |||| | ||| |||    
T  22787886 tgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttattctaggtatgcata 22787985  T
Q  410 atcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc-aaggaatattagatcacctaacgaattaggg--attgtaatctaataagagggagtt 506  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||||||    | |||||| | |||||||   |    
T  22787986 atcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatctgagaagagggtcct 22788085  T
Q  507 aagtcaagggatttatta 524  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22788086 aagtcaagggatttatta 22788103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 255 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 282517 - 282271
Alignment:
Q  255 aatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagcttt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||| |  ||||| | |||||| || |  | |||| |||||| ||| || ||||    
T  282517 aatctagttttattcaattcaatttcttttaatgctttttatatcatgataatttataatc-tgaatttgtaaacacgaatgactactgaccctaacttt 282419  T
Q  355 caacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaag 454  Q
      ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||| |     
T  282418 tgacttagacctaattgaattgttcgaataaacatggttagtctaggaatggataattgtttattggtgatattatgtcaacgttcttaaaaccttcgaa 282319  T
Q  455 gaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 502  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||    
T  282318 gaatattagatcacctaaggaattagtaattgtaatctgagaagaggg 282271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 46884784 - 46885035
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||    
T  46884784 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatata-----------taaaca 46884870  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||| |||||| |||    
T  46884871 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctagaaatggataatccttt 46884970  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  46884971 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaacacctaaggaattaggg 46885035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 268 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17531963 - 17531704
Alignment:
Q  268 tcaattcaattattcttaatgctttttatata-ctgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaact 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||    
T  17531963 tcaattcaattgttcttaatgcttttt-tatatctgatcaaatataaacataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacct 17531865  T
Q  367 aattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatc 466  Q
    |||||||||     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| |    
T  17531864 aattgaatt-----aataaacatggttagtctaggaatggataatc-tttattagtgatattaggttaacgtgttt-aaaccttcaacggttattagacc 17531772  T
Q  467 acctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  17531771 acctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 17531704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 215 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 17529122 - 17528808
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  17529122 aaccatgctgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgtcaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatattttgatcaaatataa 17529025  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||| || |||| |||| | ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    | ||||||||     
T  17529024 acatgatttagtgataacgaatgactattgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtct----aggaataatcc 17528929  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||| | |||||| |  | |||||||   ||| ||||    
T  17528928 tttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaacggttattaaaccacctaaggaattagtggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaa 17528830  T
Q  514 gggatttattaaggctatttta 535  Q
    |||||| |||| | ||||||||    
T  17528829 gggattgattaggactatttta 17528808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 331 - 534
Target Start/End: Original strand, 31549115 - 31549318
Alignment:
Q  331 tgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattag 430  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  31549115 tgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatggataatcgtttattagtgataatag 31549214  T
Q  431 gttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggcta 530  Q
    |||||| ||  |||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||  |||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||    
T  31549215 gttaacattcataaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattagggtctgtagttttagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgacta 31549314  T
Q  531 tttt 534  Q
    ||||    
T  31549315 tttt 31549318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 534
Target Start/End: Original strand, 35751401 - 35751587
Alignment:
Q  348 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||||     
T  35751401 tagctttcaacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttaatgatattaggttaacgtgcttaaaat 35751500  T
Q  448 cttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  35751501 cttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 35751587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 342
Target Start/End: Original strand, 17544448 - 17544570
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17544448 catgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagttttattcaattcaattgatcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacat 17544545  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactact 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  17544546 gaattcgtgagaatgaatgactact 17544570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52309923 - 52309754
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgcttttt-atatactgatcacatata 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  52309923 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatttcctgatcaaatata 52309826  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaata 384  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52309825 aacatgatttagtgagaatgaatgactactgacaatagttttctacttagacctaattgaattgttcaaata 52309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27308356 - 27308157
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatata-aacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||| || |||  |||| |||||| ||    
T  27308356 tgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattga-cac-tatataacttgaattggtaagatcgaatgactactgac 27308259  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
      ||| ||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  27308258 tctagtttatgactaagacctaattgaattgttcaaataaacaaggttaatcaaggaatagataatcgtttatttgtgttattaggttaacgttcttaaa 27308159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 31857650 - 31857804
Alignment:
Q  220 tgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatg 318  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  31857650 tgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaagatg 31857747  T
Q  319 aattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaatt 375  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31857748 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaatt 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27298797 - 27298594
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgcttttt-atatactgatcacatata-aacatgaattcgtgagaatgaataactactca 344  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||| | |||| || |||   ||| | |||| |    
T  27298797 tgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatatattga-cac-tatataacttaaattggtaagatcaaatgattactga 27298700  T
Q  345 ccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaa 444  Q
    || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27298699 ccctagcttacaacttagacataattgaattgttcaaataaatacggttagtttatgaatagataatcatatacctgtgatattatgttaacgttcttaa 27298600  T
Q  445 aacctt 450  Q
    ||||||    
T  27298599 aacctt 27298594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 490
Target Start/End: Original strand, 54461010 - 54461117
Alignment:
Q  383 taaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  54461010 taaacatggttagtctaggaatgtataatcctttactagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattaggg 54461109  T
Q  483 attgtaat 490  Q
    | ||||||    
T  54461110 actgtaat 54461117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 325
Target Start/End: Original strand, 22360278 - 22360383
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | |  |||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22360278 catgttgatgtgaaactcaatttcttgt--gaatatcaatctatttatattcaattcaattgttcttaatgttttttatatactgatcatatataaacat 22360375  T
Q  318 gaattcgt 325  Q
    ||||||||    
T  22360376 gaattcgt 22360383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 317
Target Start/End: Original strand, 11636663 - 11636762
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaa 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  11636663 aaccatgttgctgtgaaactctatt--at-tgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaaatataaa 11636759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27308818 - 27308717
Alignment:
Q  348 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 447  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27308818 tagcttacgacttagacctaattgagttgttcaaataaacatggt-agtctaggaatagataatcgcttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaac 27308720  T
Q  448 ctt 450  Q
    |||    
T  27308719 ctt 27308717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18641933 - 18641820
Alignment:
Q  421 gtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggattt 520  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |   ||| ||||||||||     
T  18641933 gtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattg 18641834  T
Q  521 attaaggctatttt 534  Q
    |||| | |||||||    
T  18641833 attaggactatttt 18641820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 325
Target Start/End: Original strand, 22370181 - 22370286
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |  |||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22370181 catgttgttgtgaaactcaatttctcgt--gaatatcaatctatttatattcaattcaattgttcttaatgttttttgtataatgatcacatataaacat 22370278  T
Q  318 gaattcgt 325  Q
    ||||||||    
T  22370279 gaattcgt 22370286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 319
Target Start/End: Original strand, 6922579 - 6922678
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6922579 atgttgatgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatttagtttttattcaattcgattgtgcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 6922676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 606 - 673
Target Start/End: Original strand, 18542787 - 18542854
Alignment:
Q  606 tctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacacgaacc 673  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18542787 tctcatctctctttatattttctaaagaaactttaacttctgttatttactttttatgcacacaaacc 18542854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 416
Target Start/End: Original strand, 6030770 - 6030840
Alignment:
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  6030770 cttagctttcaacttggatctaatttaactgttcaattaaacatggtcagtctaggaatgaataattgttt 6030840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 35751331 - 35751381
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaa 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  35751331 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaa 35751381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 52309430 - 52309377
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtcta 799  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  52309430 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtcta 52309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 55032181 - 55032100
Alignment:
Q  401 gaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||| |||||| || || |||| ||||||| |||| ||||    
T  55032181 gaatggataatcgtttgtcagtgatattaggttaacgtgcataaaagcttcaaagattactagaccacctaaggaatcaggg 55032100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 218 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 22172751 - 22172428
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22172751 catgttgttgtgaaactctgtttcatatatgaatatcaatatagttttgattcaattcaattgttattaatgatttttatatactgatcacatataa-ca 22172653  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22172652 tgaattcgtgagaatgaatgattactgaccatagctttcaacttagaccttattgaattgttcaaataaacagggttagtctatgaatggataatcgttt 22172553  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||    
T  22172552 atttgcgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaagaatattagttcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagggtcctaagtcaaggg 22172453  T
Q  517 atttattaaggctattttagttaac 541  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  22172452 attgattatggctattttagttaac 22172428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 218 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 37740136 - 37739762
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  37740136 catgttgttgtgaaactctatt--at-tgtgaatattaatctagttttattcaattcaattgttgttaatgctttttatattctaatcaaatataaacat 37740040  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37740039 gatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagctttcaacttagacctaatcgaatttttcaaataaactgggttaatctatgaatggataatcgttta 37739940  T
Q  418 tctgtga---tattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaag 514  Q
    | |||||   ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||   |||||||||    
T  37739939 tttgtgatattattaggttaatgtttgtaaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattagggacagtaatctgataagagggtcctaagtcaag 37739840  T
Q  515 ggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 592  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  37739839 ggattgattagggctattttagctaaccatcgtgaaactagagaaatattcataagacataggtgcagtgtaccaatt 37739762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15812516 - 15812250
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15812516 ccatgttgctgtgaaactctatttattatattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaac 15812417  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15812416 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 15812317  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15812316 ttttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 15812250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 264 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 8877832 - 8877545
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8877832 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgggaatgaatgactactgaccatagctttcaacttaga 8877733  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  8877732 tttaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaacattcttaaaaccttcaaagaatattag 8877633  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
    | |||||||  |||||||| |||| |||  | ||||| |   |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  8877632 accacctaagaaattaggggttgtgatcggagaagagagtcctaagtcaagggattgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 8877545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 253 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 48014392 - 48014167
Alignment:
Q  253 tcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagct 352  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  48014392 tcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatc--ctgatcaaatataaatatgaattcgtgagaatgaataactactgaccataact 48014295  T
Q  353 ttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttca 452  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48014294 ttcaactttgacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtttaggaatggataatcgtttatttgtgacattaggttaacgttcttaaaaccttca 48014195  T
Q  453 aggaatattagatcacctaacgaattag 480  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  48014194 aataatattagatcacctaaggaattag 48014167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 56195272 - 56195588
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  56195272 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 56195369  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  56195370 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 56195469  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  56195470 tgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 56195569  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  56195570 gattgattagggctatttt 56195588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 24150415 - 24150733
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24150415 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 24150512  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  24150513 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccaggaatggataatcg 24150612  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  24150613 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 24150712  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  24150713 gggattgattaggactatttt 24150733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 39501391 - 39501657
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39501391 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 39501488  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  39501489 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 39501588  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  39501589 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 39501657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34320294 - 34320030
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34320294 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 34320197  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  34320196 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 34320097  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34320096 tgttagtgatattaggttaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 34320030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34018160 - 34017842
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  34018160 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacagtctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 34018063  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  34018062 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 34017963  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  34017962 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaa 34017863  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  34017862 gggattgattaagactatttt 34017842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 44809332 - 44809016
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44809332 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaatttcattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 44809235  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  44809234 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggatgatcgtt 44809135  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  44809134 tgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 44809035  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  44809034 gattgattagggctatttt 44809016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 219 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8875136 - 8874822
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||    
T  8875136 atgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatcacttgatcaaatataaacat 8875039  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
     | || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  8875038 aatttagtgagaatgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggatagtcgttta 8874939  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggga 517  Q
    | ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||   ||||||||  ||    
T  8874938 tttgttatattaagttaatgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtaatcggagaagagggttctaagtcaatcga 8874839  T
Q  518 tttattaaggctatttt 534  Q
    || |||| |||||||||    
T  8874838 ttgattatggctatttt 8874822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 271 - 534
Target Start/End: Original strand, 12238061 - 12238326
Alignment:
Q  271 attcaattattcttaatgctttttatata--ctgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaa 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  12238061 attcaattgttcttaatgctttttatatctcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaa 12238160  T
Q  369 ttgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcac 468  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12238161 ttgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgtttaaaaccttcaaagaatattagctcac 12238260  T
Q  469 ctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| ||||||| || |||||||| | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  12238261 ctaaggaattagagactgtaatctgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactatttt 12238326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 215 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40903462 - 40903199
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40903462 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataa 40903365  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||  ||||||     
T  40903364 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaattgataatcc 40903265  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  40903264 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 40903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 218 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 40493743 - 40493474
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40493743 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 40493646  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  40493645 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatccttt 40493546  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  40493545 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 40493474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 264 - 488
Target Start/End: Original strand, 56198644 - 56198868
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  56198644 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttaga 56198743  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  56198744 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgcttaaaaccttcaaagattattag 56198843  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    | ||||||| |||| |||| |||||    
T  56198844 accacctaaggaatcaggggttgta 56198868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 48415908 - 48415643
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  48415908 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 48415811  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||  | |||||||||| ||||| ||||||     
T  48415810 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaatttttctaataataatggttagtctaggaatggataatca 48415711  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagg 481  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  48415710 tttattattgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagg 48415643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 29324570 - 29324834
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29324570 ccatgttgctgtgaaactcgattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 29324667  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  29324668 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 29324767  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  29324768 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 29324834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Original strand, 53094298 - 53094568
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  53094298 ttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatgatttcgtgagaacgaattactactgaccatagttttcaacttaga 53094397  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| ||||| || ||||||    
T  53094398 cctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttctgatattaagttaacgttcataaaacattcaaagagtattag 53094497  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | ||||||| || |||||| ||||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  53094498 accacctaaggagttaggggttgtactatgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggcctatttt 53094568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 48637248 - 48637514
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  48637248 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 48637345  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  48637346 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 48637445  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaagga-atattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  48637446 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagatttattagaccacctaaggaattaggg 48637514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24044519 - 24044254
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24044519 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 24044422  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  24044421 acatgatttagtgagaatgaattactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 24044322  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||| |||||||  ||||||||    
T  24044321 tttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaacctttaaagattattagaccacctaagaaattaggg 24044254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 226 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 33408685 - 33408361
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcg 324  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  33408685 tgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcagatataaacatgatttag 33408588  T
Q  325 tgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtga 424  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||  |||| |||||    
T  33408587 tgagaatgaatgattactgaccatagctgtctacttagacctaattgagttgttcaaataaacattgttagtctaggaatagataatcagttatttgtga 33408488  T
Q  425 tattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttatta 524  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| || || | | | |||||||   |||||||||||||| ||||    
T  33408487 tattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttatagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgatta 33408388  T
Q  525 aggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
     |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  33408387 gggctatttta-ttaaccatcgtgaaac 33408361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 15163935 - 15164254
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||  |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  15163935 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaattacaatctagtttttattcaattctattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 15164032  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg-aatgaataatc 412  Q
     ||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  15164033 tcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaatggataatc 15164132  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtca 512  Q
    |||| |  |||||||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||| |||    
T  15164133 gtttgttagtgatattaggttaatctgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagagggtcctaactca 15164232  T
Q  513 agggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  15164233 agggattgattatgactatttt 15164254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 215 - 515
Target Start/End: Original strand, 40794745 - 40795044
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40794745 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcgattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 40794842  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||| |   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40794843 atatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttaaacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 40794942  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||||||||    
T  40794943 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaa 40795042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 19820471 - 19820788
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19820471 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 19820568  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  19820569 acatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 19820668  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||| | |  | |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  19820669 tttgttagtgatattaggttaa-gatgcttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaa 19820767  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  19820768 gggattgattaggactatttt 19820788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 27014006 - 27014272
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  27014006 aaccatgttgttgtgaaaatctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaatataa 27014103  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||     
T  27014104 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcc 27014203  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  27014204 tttattagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggg 27014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 44164526 - 44164843
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  44164526 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttatttatttcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaatataa 44164623  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  44164624 acatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 44164723  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | | |||||||   ||||||||    
T  44164724 tttgttagtgatattaggttaacctgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggattgtagtttgagaagagggtcctaagtcaa 44164822  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  44164823 gggattgattatgactatttt 44164843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 52531314 - 52531048
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52531314 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttctgaatgctttttatatcctgatcaaatataa 52531217  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| | ||| |||||||  |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  52531216 acatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttttacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 52531117  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  52531116 tttgttagtgatattaggttaacactcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 52531048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 46955855 - 46955591
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  46955855 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaatgctttttatattatgatcaaatataaac 46955758  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  46955757 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgatttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcgtt 46955658  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||| |||||||||    
T  46955657 tgttagtgatattaggttaacgtttttaaaacattcaaagattattagtccacctaaggaattaggg 46955591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 3718867 - 3719184
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  3718867 aaccatattgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaatataa 3718964  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  3718965 acatgatttagtgagaatgaatgattactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 3719064  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   |||| |||    
T  3719065 tttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagccaa 3719163  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  3719164 gggattgattaggactatttt 3719184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 52006909 - 52006592
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || | |||||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  52006909 aaccatgttgctgtgaaactctatct-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcgattgttcttaatgttttttatatcttgatcaaatataa 52006812  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  52006811 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaggtttagtctaggaatggataatcg 52006712  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||||||||    
T  52006711 tttgttagtgatattaggttgacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaa 52006613  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  52006612 gggattgattatgactatttt 52006592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 15431824 - 15432087
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15431824 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaac 15431921  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||||||| |||||| | | |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15431922 atgatttagtgagaatgaatgactactgatcatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtt 15432021  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  |||||||||| |||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15432022 tgttagtgatattagattaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 15432087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 472
Target Start/End: Original strand, 19827233 - 19827488
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  19827233 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatacaa 19827330  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  19827331 acatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagactgaatggaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 19827430  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaa 472  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  19827431 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaa 19827488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 29545249 - 29544935
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29545249 catgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 29545152  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||  || || ||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  29545151 tgatttagtgagaacgaatgactactggccctaacttttgacttacacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 29545052  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||||||| | ||||| ||||||||| |||||| |  ||||||| |   ||| |||||||    
T  29545051 attagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaaggttattagacctcctaaggaattaggggttgtaaccctataagagagtcataactcaaggg 29544953  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  29544952 attgattagggctatttt 29544935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 218 - 481
Target Start/End: Original strand, 21419535 - 21419796
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21419535 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 21419632  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| ||   |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  21419633 tgatttagtgagaacgagcgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtctaggaatggataatctttt 21419732  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagg 481  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  21419733 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattagg 21419796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27677433 - 27677116
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctta-ttcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  27677433 aaccatgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttgttcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 27677336  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27677335 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattaaattattctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcg 27677236  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  | ||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  27677235 tttgttagcgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaa 27677137  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  27677136 gggattgattaggactatttt 27677116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15405461 - 15405194
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  15405461 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcgtgatcaaatataaac 15405364  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatg---aatgaataatc 412  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   |||| ||||||    
T  15405363 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaataatggataatc 15405264  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15405263 gtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 15405194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 12782648 - 12782965
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||| || || ||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  12782648 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgagtgacaatcttgtttttattcatttcagttgttcttaatactttttatattctgatcaaatataa 12782745  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || || | ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12782746 acatgatttagtaaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacggaattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatggataatcg 12782845  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  | ||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | || ||||   ||||||||    
T  12782846 tttgttagggatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaaaagggtcctaagtcaa 12782944  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  12782945 gggattgattaggactatttt 12782965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15430234 - 15429969
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15430234 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 15430137  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||  ||| ||||||  |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  15430136 acatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 15430037  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  15430036 ttttttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagataattagaccacctaaggaattaggg 15429969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38283867 - 38283602
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38283867 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 38283770  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    || ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| | |    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  38283769 acctgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctactgatagaatattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcc 38283670  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38283669 tttgttagtgatattaggttaacg-tgctaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 38283602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 53009933 - 53009671
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53009933 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctaggttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaatataaaca 53009836  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||| | |||    
T  53009835 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatttataaccattt 53009736  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||    
T  53009735 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaagaaattaggg 53009671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15436848 - 15436583
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15436848 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 15436751  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||  ||| ||||||  |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  15436750 acatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgtataatcg 15436651  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |   |||||||||||||||||  || |||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  15436650 ttttttattgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagataattagaccacctaaggaattaggg 15436583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 283 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3798119 - 3797869
Alignment:
Q  283 ttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaa 382  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||   ||||||||||||| ||    
T  3798119 ttaatactttttatatcctgatcacatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctatttagacagaattgaattgttctaa 3798020  T
Q  383 taaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3798019 taaacagggttaatctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 3797921  T
Q  483 attgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
     ||||| | | | |||||||  |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  3797920 gttgtagtgtgagaagagggtcttaactcaagggattgattaggactatttt 3797869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19859852 - 19859582
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  19859852 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaa 19859753  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
      ||||| | |||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||    
T  19859752 cttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattag 19859654  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttta 535  Q
    | ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  19859653 accacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactatttta 19859582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 5672625 - 5672904
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | |    ||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5672625 aaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 5672724  T
Q  314 aca-----------tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga 402  Q
    |||           ||| || |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  5672725 acaagatttagtgatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 5672824  T
Q  403 atgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5672825 atggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5672904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 35509711 - 35509973
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35509711 catgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaaatataaaca 35509808  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || || |||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||    
T  35509809 tgatttagtaagaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattgaattgttctaataaacatcgttagtctaggaatggataatccttt 35509908  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || ||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  35509909 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaacctttaatggttattagaccacctaaggaattaggg 35509973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 283 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18673393 - 18673195
Alignment:
Q  283 ttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaa 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  18673393 ttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaa 18673294  T
Q  383 taaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18673293 taaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 18673195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 33926712 - 33927033
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33926712 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatcctgatcaaatataaac 33926809  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaa-----taactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataa 410  Q
    |||| || ||||||| |||     | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  33926810 atgatttagtgagaacgaatgacttgactactgaccctagctttcgacttagatctaattgaactgttctaataaacatgattagtctaggaatggataa 33926909  T
Q  411 tcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagt 510  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||  || | ||||||| ||||| | |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| |    
T  33926910 tcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaacctttgagaattattagaccacctgaggaattaggggctgtagttttagaagagggtcctaact 33927009  T
Q  511 caagggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||||||| |||| |||||||||    
T  33927010 caagggattgattatggctatttt 33927033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 264 - 438
Target Start/End: Original strand, 11195467 - 11195641
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  11195467 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttaga 11195566  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 438  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  11195567 cctacttgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatgaataatcatttattagtgataataggttaacgt 11195641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 482
Target Start/End: Original strand, 5681201 - 5681436
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  | || |||| |||||| ||    
T  5681201 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagccataacgaatgactactgac 5681300  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||  || ||    
T  5681301 cctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtgtaggaatggataatcgtttgttagtgatactaggttaacgtgctt-aa 5681399  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5681400 accttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5681436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 438
Target Start/End: Original strand, 25961831 - 25962023
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||  |||||| |||| |||||| ||    
T  25961831 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaagctttttatatcctgatcaaatataaaaatgatttaatgagaacgaatgactactgac 25961930  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  25961931 cctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagcttaacgt 25962023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 37103563 - 37103329
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  37103563 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgctttatatatcctggtcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgac 37103464  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||    
T  37103463 catagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaac-aggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aa 37103366  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| | || ||||||| |||| || |||||||||    
T  37103365 accttcgaagattattagaccaccaaaggaattaggg 37103329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 488
Target Start/End: Original strand, 49270456 - 49270695
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattatt---cttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactact 342  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||   || |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  49270456 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattgttcttaatgctttttatattct---caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactact 49270552  T
Q  343 caccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgttttt 442  Q
     | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||    
T  49270553 gatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctcataaacatggttagtatatgaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacattctt 49270652  T
Q  443 aaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    ||||||||||   | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  49270653 aaaaccttca---attattagaccacctagggaattagggactgta 49270695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Original strand, 5670357 - 5670586
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtga-----------gaatgaataactactcaccttagct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||           |||||||| |||||| ||| ||| |    
T  5670357 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacaagatttagtgatgatttagaaagaatgaatgactactgaccatagtt 5670456  T
Q  353 ttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttca 452  Q
    ||| |||||||   |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5670457 ttctacttagacagaattaaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttca 5670556  T
Q  453 aggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5670557 aagattattagaccacctaaggaattaggg 5670586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 15447041 - 15446807
Alignment:
Q  289 ctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaaca 388  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  15447041 ctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccataactttctacttagactgaattgaattgttctaataaaca 15446942  T
Q  389 aggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| | || |||| || ||||||| |||||||||  ||||    
T  15446941 gggttagtctatgaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttctaagattattggaccacctaaggaattaggggctgta 15446843  T
Q  489 atctaataagagggagttaagtcaagggatttatta 524  Q
     | | | |||||||   |||||||||||||| ||||    
T  15446842 gtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgatta 15446807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19864843 - 19864626
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  19864843 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaa 19864744  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
      ||||| | |||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||    
T  19864743 cttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattag 19864645  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | || ||||  ||||||||    
T  19864644 accatctaagaaattaggg 19864626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 292 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27679527 - 27679338
Alignment:
Q  292 tttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaagg 391  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |   ||||||||||||| |||||||||||    
T  27679527 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaacatagctttctacttatacagaattgaattgttctaataaacaagg 27679428  T
Q  392 ttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27679427 ttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 27679338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 316 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40617087 - 40616921
Alignment:
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  40617087 atgaattagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagagagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtt 40616988  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  40616987 tgttagtgattttaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 40616921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 5677786 - 5677452
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5677786 aaccatgttgttgtgaaactctatttcctgt--gaatatcaatctagttttactcaattcatctgttcttaatgctttttatatattgatcacatataat 5677689  T
Q  315 catgaattcgtgaga----atga------ataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaat 404  Q
    | |||||  ||||||    ||||      || |||||| ||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||          |     
T  5677688 c-tgaatcagtgagattgtatgagattgcatgactactaaccataacttacaacttagacttaattgaattgttcaaataaacaaggt----------ag 5677600  T
Q  405 gaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggag 504  Q
    |||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| ||      
T  5677599 gaatgatcgtatatttgtgatacaaggttaacgtccttaaaaccttcaaagaatattagatcacttaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtc 5677500  T
Q  505 ttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
     |||||||||||||| |||| | |||||||||||| || ||| |||||    
T  5677499 ctaagtcaagggattgattaggactattttagttagccatcgtgaaac 5677452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 332 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 33493958 - 33493749
Alignment:
Q  332 gaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattagg 431  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| || |    
T  33493958 gaatgactactgaccatagcttacaatttagacctaattgaattgttcaaataaacagagttagtctaggaatagataatcgtttatttgtgataatatg 33493859  T
Q  432 ttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctat 531  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||   ||||| |||| ||| | || | ||||    
T  33493858 ttaacgttctttaaacattcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtcctaagttaaggaattaaataggactat 33493759  T
Q  532 tttagttaac 541  Q
    ||||||||||    
T  33493758 tttagttaac 33493749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 489
Target Start/End: Original strand, 30392319 - 30392584
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||  |||||| |    ||||||||||||||  | |||| ||||||| |    
T  30392319 catgttgctgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatctagtttttattcatctcaattgt----aatgctttttatatcttaatcaaatataaata 30392412  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||    
T  30392413 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgaattagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatacttt 30392512  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  30392513 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccaccttaggaattaggggttgtaa 30392584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8448918 - 8448748
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  8448918 catgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattgttaatgctttttatatcttgatcaaatataaaca 8448821  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaact-aattgaattgttcaaataaaca 388  Q
    | | ||||| ||||||||| ||||||   | |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  8448820 tcatttcgtaagaatgaatgactactggtcatagctttctacttagacctaaattgaattgctcaaataaaca 8448748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 482
Target Start/End: Original strand, 18911374 - 18911507
Alignment:
Q  348 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 447  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||  || ||||    
T  18911374 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgataataggttaacgtgctt-aaac 18911472  T
Q  448 cttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18911473 cttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 18911507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Original strand, 15438438 - 15438562
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15438438 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 15438535  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactact 342  Q
    |||| || ||||||| |||| ||||||    
T  15438536 atgatttagtgagaacgaatgactact 15438562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 744 - 803
Target Start/End: Original strand, 26060803 - 26060861
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  26060803 tacgaacttatttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 26060861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 3797636 - 3797579
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  3797636 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 3797579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 744 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 15404903 - 15404845
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  15404903 tacgaacttaattttattacttcgatgcatat-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 15404845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 744 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 15811957 - 15811899
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15811957 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaggtctatcaa 15811899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 744 - 803
Target Start/End: Original strand, 56195827 - 56195885
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  56195827 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaaatctatcaa 56195885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 56199154 - 56199211
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  56199154 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaaatctatca 56199211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 803
Target Start/End: Original strand, 19821015 - 19821072
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19821015 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtatatcaa 19821072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27691519 - 27691442
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27691519 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttat 27691442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 673
Target Start/End: Original strand, 33927154 - 33927189
Alignment:
Q  638 ttattttatgttatttactttttatgcacacgaacc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33927154 ttattttatgttatttactttttatgcacaccaacc 33927189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40617137 - 40617098
Alignment:
Q  280 ttcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatga 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40617137 ttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatga 40617098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 19827722 - 19827778
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19827722 tacgaactta-ttttattacttcgagacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 19827778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 752 - 802
Target Start/End: Original strand, 40795320 - 40795369
Alignment:
Q  752 taattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  40795320 taattttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtttatca 40795369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 659
Target Start/End: Original strand, 5681564 - 5681629
Alignment:
Q  596 gaaagacc-agtctcatctctccatatctttt-ctaaacaaactttattttatgttatttactttt 659  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  5681564 gaaagacctagtctcatctctccttatcttttccaaaactatctttattttatgttatttaatttt 5681629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 855
Target Start/End: Original strand, 29442165 - 29442218
Alignment:
Q  803 atatctacacctctaatgttttgtag-ccaaagagaggtaagttagtatgatta 855  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  29442165 atatctactcctctaatgttttgtagacaaaagagaggtgagttaatatgatta 29442218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 253 - 592
Target Start/End: Original strand, 21914902 - 21915241
Alignment:
Q  253 tcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagct 352  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  21914902 tcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatagcctgatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagct 21915001  T
Q  353 ttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttca 452  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21915002 ttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttcaaaccttca 21915101  T
Q  453 aggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||     
T  21915102 aagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagggtcataagtcaagggattgattagggctattttagttaaccatcgtgaaat 21915201  T
Q  553 atgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 592  Q
      ||| | ||||||||  |||||||||  ||||| |||||    
T  21915202 tagagaaatattcataagaaataggtgtagtgtaccaatt 21915241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 215 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22937316 - 22937030
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  22937316 aaccaagttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcattttatatcctgatcaaatataa 22937219  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  22937218 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 22937119  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 502  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22937118 tttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagaggg 22937030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 17664296 - 17664613
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17664296 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 17664393  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||     
T  17664394 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatcgataatcc 17664493  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||   ||| ||||    
T  17664494 tttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatcttagaagagggtcctaactcaa 17664592  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  17664593 gggattgattatgactatttt 17664613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26753080 - 26752814
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26753080 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 26752983  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  26752982 acatgatttagtgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 26752883  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26752882 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 26752814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 247 - 490
Target Start/End: Original strand, 42062695 - 42062939
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||    
T  42062695 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgac 42062794  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||    
T  42062795 cctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaa 42062894  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaat 490  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  42062895 accttcaaagaatattagttcacctaaggaattagggactgtaat 42062939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 247 - 488
Target Start/End: Original strand, 2837077 - 2837319
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||    
T  2837077 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgatttagtcagaatgaatgactactgac 2837176  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||    
T  2837177 catagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttatgaatggataatcgtttattagtgataataggttaacgttcataaa 2837276  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  2837277 accttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 2837319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18239826 - 18239557
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  18239826 ttattaaattcaattgttcttcatgctttttatatcct-atcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttgaacttaga 18239728  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18239727 cctaattgaattgttcaaataaacaaggctagtctaggaatggataatcgtttatatgtaatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattag 18239628  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | |||||||  |||||||| || || ||| | ||| |||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18239627 accacctaagaaattaggggttttactctgacaagggggtcctaagtcaagggattgattagggctatttt 18239557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41877143 - 41876877
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41877143 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 41877046  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  41877045 acatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 41876946  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  41876945 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 41876877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 7270760 - 7271025
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtct-tattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  7270760 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttctattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctggtcaaatataa 7270857  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7270858 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaacatggttagtctatgaatggataatcg 7270957  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||||| || |||||| ||| |||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  7270958 tttgttagtgatattgggctaacgtgttt-aaaccttcaaagattatcagaccacctaaggaattaggg 7271025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 217 - 480
Target Start/End: Original strand, 7624848 - 7625110
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7624848 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 7624945  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||  ||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7624946 atgatttagtgagaacaaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtt 7625045  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattag 480  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||    
T  7625046 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattag 7625110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14016515 - 14016199
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14016515 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 14016418  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14016417 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 14016318  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||| ||  || |||||||| || | ||||| | |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  14016317 tgttagtgatattaggttaaagtgctttaaaccttcgagaattattaaaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 14016218  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  14016217 gattgattagggctatttt 14016199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 519
Target Start/End: Original strand, 26292535 - 26292837
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  26292535 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactatttatatcctgatcaaatataa 26292632  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  26292633 acatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatcc 26292732  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||   ||| ||||    
T  26292733 tttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctataagagggtcgtaactcaa 26292831  T
Q  514 gggatt 519  Q
    ||||||    
T  26292832 gggatt 26292837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Original strand, 17748187 - 17748406
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17748187 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 17748284  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  17748285 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagaactaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 17748384  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  17748385 attagtgatattaggttaacgt 17748406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 34831507 - 34831825
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgcttttt-atatactgatcacatata 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  34831507 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatttcctgatcaaatata 34831604  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  34831605 aacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatc 34831704  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtca 512  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||    
T  34831705 gtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactca 34831803  T
Q  513 agggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  34831804 agggattgattaggactatttt 34831825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 264 - 488
Target Start/End: Original strand, 20055566 - 20055789
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  20055566 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttaga 20055665  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||    
T  20055666 cctaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-taaccttcaaagattattag 20055764  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||    
T  20055765 accacctaaggaattaggggttgta 20055789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 40582993 - 40583310
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40582993 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 40583090  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||  |||||||    
T  40583091 atatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaagatggttagtctaggaatagataatcg 40583190  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||| ||||    
T  40583191 tttcttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagagggtcataactcaa 40583289  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  40583290 gggattgattaggactatttt 40583310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4099900 - 4099578
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt------attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcaca 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4099900 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaa 4099803  T
Q  309 tataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaat 408  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  4099802 tataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttatacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggat 4099703  T
Q  409 aatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaa 508  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||| ||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  ||||    
T  4099702 aatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaatcttcaaatattattagaccacctaaagaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaa 4099604  T
Q  509 gtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||    
T  4099603 gtcaagggattgattatgactatttt 4099578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Original strand, 12087705 - 12088019
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  12087705 catgttgctgtgaaactttatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 12087802  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  12087803 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 12087902  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||   ||| |||||||    
T  12087903 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 12088001  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  12088002 attgattaggactatttt 12088019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26907830 - 26907571
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctta-ttcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  26907830 catgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaaca 26907733  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  26907732 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacttaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 26907633  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||    
T  26907632 attggtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaatta 26907571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 586
Target Start/End: Original strand, 31575162 - 31575529
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31575162 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatgt--gaatatcaatctagttttatttaattcaattgttcataatgctttttatatactgatcacatat-aa 31575258  T
Q  315 catgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttag--aactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||| | |   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| ||    
T  31575259 cataaattcgagagaatgaattactaatta---tagctttcaacttagacacctaattgaattgttcaaataaacagggttattctgagaatggatattc 31575355  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtc- 511  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||   | |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| | | ||||| |    |||||     
T  31575356 gtttatttgtgatattaggttaactttcttttta-cttcaaagaatattagattacctagggaattagagactgtaatttgagaagagagtcccaagtca 31575454  T
Q  512 aagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgta 586  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||  ||| | ||||||||  |||||| ||| |||||    
T  31575455 aagggattgattagagctattttagttaaccatcgtgaaactagagaaatattcatatgaaatagctgcagtgta 31575529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 479
Target Start/End: Original strand, 30066086 - 30066348
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30066086 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcttgatcaaatataa 30066183  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||||| || || |||||||    
T  30066184 acatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaaatgaattgttctaacaaacatggttagtctaggagtggataatcg 30066283  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    ||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  30066284 tttgttagagatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 43491502 - 43491765
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  43491502 catgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttattaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 43491599  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43491600 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 43491699  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |  ||||||||||||||||||   ||||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||||    
T  43491700 gttagtgatattaggttaacgtgcataaaatcttcaaagattattaaaccacctaaggaattaggg 43491765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21336076 - 21335811
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctta-ttcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||  |||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21336076 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaataacaatatagttttaattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 21335979  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||  || ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  21335978 acatgatttagtgagaatgaatgactactgactataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctataaatggataatcg 21335879  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  21335878 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattaggg 21335811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 248 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14376155 - 14375921
Alignment:
Q  248 gaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcacc 346  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||    
T  14376155 gaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgacc 14376056  T
Q  347 ttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaa 446  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||  || |||    
T  14376055 atagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgctagtgatattaggttaacgtgctt-aaa 14375957  T
Q  447 ccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  14375956 ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 14375921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 18952439 - 18952702
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18952439 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatattctgatcaaatataaac 18952536  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||    
T  18952537 atgatttagtgagaacgaatgactaatgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatggataattgtt 18952636  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18952637 tgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 18952702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34133358 - 34133096
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  34133358 catgttgctgtgaaactttatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 34133261  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  34133260 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 34133161  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34133160 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 34133096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34143589 - 34143327
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  34143589 catgttgctgtgaaactttatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 34143492  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  34143491 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 34143392  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  34143391 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 34143327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 462
Target Start/End: Original strand, 32837764 - 32838007
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32837764 aaccattttgctgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttc--aatgctttttatatcctgatcaaatataa 32837859  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  32837860 acatgattt-gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 32837958  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatatta 462  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  32837959 tttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattatta 32838007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21333060 - 21332793
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21333060 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcatgatcaaatataa 21332963  T
Q  314 aca--tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataat 411  Q
    | |  ||| || |||||||| ||| |||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21332962 aaagatgatttagtgagaataaatgactactgactatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatggataat 21332863  T
Q  412 cgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||    
T  21332862 cgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcatctaaggaattaggg 21332793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12058867 - 12058605
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  12058867 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctggtcaaatataaata 12058770  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  12058769 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 12058670  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  12058669 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 12058605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 18765980 - 18765657
Alignment:
Q  255 aatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatata-aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctt 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||  |||||| || ||| ||||| |||||| | | ||||||    
T  18765980 aatctagttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatattga-cac-tatataatttgaattggtaaga-tgaatgactactaatcctagctt 18765884  T
Q  354 tcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaa 453  Q
     | ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  18765883 acgacttagacctatttgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaataaataatcatttatttgtgatattaggttaacgctcttaaaaccttcga 18765784  T
Q  454 ggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaaca 553  Q
     |||| ||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||  ||||     
T  18765783 agaatgttagaccacttaaggaattaggagttgtaagctaacaagagggatctaactcaagggattgattataactattttagttaaccatcgtaaaact 18765684  T
Q  554 tgaggagtattcatagaaaataggtgc 580  Q
     ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  18765683 agagaagtatgcataggaaataggtgc 18765657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 217 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26895980 - 26895719
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtct-tattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| | |||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  26895980 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttctatttaattcagttgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaac 26895883  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| || | |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26895882 atgatttagtgagaacgattgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 26895783  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattag 480  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||    
T  26895782 tgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 26895719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41306905 - 41306640
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatct-agtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41306905 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 41306808  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||  | ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  41306807 acatgatttaataagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggtatggataatcg 41306708  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  41306707 tttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 41306640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 431
Target Start/End: Original strand, 23043938 - 23044123
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||  |    
T  23043938 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactggc 23044037  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattagg 431  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23044038 cctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattagg 23044123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28787698 - 28787478
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac- 315  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  28787698 catgttgctgtgaaagtctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaact 28787601  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28787600 atgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttggacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtt 28787501  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    | |  ||||||||||||||||||    
T  28787500 tgttagtgatattaggttaacgt 28787478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Original strand, 39192120 - 39192389
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||  ||||||  ||| |||| | ||| |||||||| || ||||    
T  39192120 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttaatgagaacaaatgactattgaccatagctttcgacctaga 39192219  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||| ||  || ||||||| || || |||||     
T  39192220 tctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttgaaagattattat 39192318  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||  |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  39192319 accacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagagggtcttaactcaagggattgattatgactatttt 39192389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 33551865 - 33552182
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatc-acatata 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  33551865 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaaatata 33551962  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||| ||||||    
T  33551963 aacatgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaatatggtcagtctaggaatggataatc 33552062  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtca 512  Q
    |||| |  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||    
T  33552063 gtttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagatta-tagaccacttaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactca 33552160  T
Q  513 agggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  33552161 agggattgattatgactatttt 33552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 354 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 563500 - 563363
Alignment:
Q  354 tcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaa 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||  |    
T  563500 tcaacttagacctaattgaattgttcaactaaacaaggttagtctaggaatgaataatcgtttaattgtgatattatgttaatgctttgaaaacctttga 563401  T
Q  454 ggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatc 491  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  563400 agaatattagatcacctaaagaattaggggttgtaatc 563363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 31863446 - 31863724
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaa-tgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31863446 catgttgctgtgaaactttattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 31863543  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaata------ 409  Q
    |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||          
T  31863544 atgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatt 31863643  T
Q  410 --------atcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
            ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31863644 tgttagtgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 31863724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 405
Target Start/End: Original strand, 22130011 - 22130197
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22130011 ccatattgctgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatctagtttttatcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 22130108  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatg 405  Q
    ||| || |||||| ||||| |||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  22130109 tgattttgtgagattgaatgactacggaccctagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatg 22130197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11959545 - 11959287
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11959545 catgttgctgttaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat-ctgatcaaatataaaca 11959449  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaac-taattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||   |||||| ||    
T  11959448 tgatttagtgagaacgaatgactactaaccatagcgttcgacttagaccttaattgaattgttctaataaacatggttagtcta--aa--gataatcctt 11959353  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11959352 tattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattacaccacctaaggaattaggg 11959287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 22131159 - 22131238
Alignment:
Q  402 aatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagg 481  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  22131159 aatggataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaggattattaaaccacctaaggaattagg 22131238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 31575555 - 31575609
Alignment:
Q  596 gaaagacc-agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgtt 649  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31575555 gaaagacctagtctcatctctccatatcttttccaaacaaactttattttttgtt 31575609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28441510 - 28441425
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  28441510 catgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatattctgat 28441425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 7271329 - 7271385
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7271329 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 7271385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 21332496 - 21332440
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21332496 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 563597 - 563517
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatac 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |  |||| | ||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  563597 catgtggttgtgaaactctattgcatgt--gaatattaatatagttttattcaatttaattgttcttaatactttttatatac 563517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 4099347 - 4099291
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  4099347 tacgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 4099291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 754 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 21335506 - 21335458
Alignment:
Q  754 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  21335506 attttattacttcgatacattt-ttagtacacttgttaaaagtctatcaa 21335458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 245 - 668
Target Start/End: Original strand, 5796311 - 5796751
Alignment:
Q  245 tatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactca 344  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || || |    
T  5796311 tatgaataacaatctagttttattcaattcaattattcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgattttgtgagaatgaatacctgctga 5796410  T
Q  345 ccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaa 444  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||    
T  5796411 ccatagctttcaacttagacctaattgagtttttcaaataaaaagggttagtctatgaatgaataatcgtttatttgtgatataatgttaacgttcttaa 5796510  T
Q  445 aaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgt 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||   |||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | |    
T  5796511 aaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagagattgtaatatgataagagggtcctaagtcaagggattgattagagctattttagttagtcat 5796610  T
Q  545 cgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgg----------------gaaagac-cagtctcatctctccatatcttttc 627  Q
    |  |||||  ||| | ||||| ||  |||||||||  ||||| ||||| ||                |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5796611 catgaaactagagaattattcttaagaaataggtgttgtgtaccaattaggggaacccaaaggactcgaaagacttagtctcatctctccatatcttttc 5796710  T
Q  628 taaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacac 668  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5796711 taaacaaactttattttctgttatttactttttatgcacac 5796751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 256 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 18562877 - 18562534
Alignment:
Q  256 atctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttc 355  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||  ||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  18562877 atctagttttattcaattcagttgttcttaatgctttttatatccttataaaatataaacatgttttattgagaatgaatgactactgaccatagctttc 18562778  T
Q  356 aacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaagg 455  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  18562777 aacttagacctaattgaattgttcaattaaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaat 18562678  T
Q  456 aatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatg 555  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| |   |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  |||  ||||  |    
T  18562677 aatattagctcacctaaggaattagggactgtaatatgagaagagagtcctaagtcaaaggattaatcagggctattttagttaactatcgtaaaactag 18562578  T
Q  556 aggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 599  Q
    || ||||||||||  || |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18562577 agaagtattcataagaagtaggtgcaatgtatcaattagggaaa 18562534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 16165481 - 16165797
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16165481 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaac 16165578  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||    
T  16165579 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattattctaataaacatggttaatctaggaatgggtaatcgtt 16165678  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||   ||| ||||||    
T  16165679 tgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtaatctgagaagagggtcctaactcaagg 16165778  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  16165779 gattgattagggctatttt 16165797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23225289 - 23225023
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23225289 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 23225192  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  23225191 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 23225092  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23225091 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 23225023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13450157 - 13449897
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13450157 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 13450060  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  13450059 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccc-agctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 13449961  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  13449960 tgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 13449897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 8276716 - 8276982
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | | |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8276716 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 8276813  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  8276814 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaattgataatcg 8276913  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8276914 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8276982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 219 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 5242532 - 5242232
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  5242532 atgttgttgtgaaactctatct-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatagaatataaacat 5242435  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || ||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| || ||||    
T  5242434 gatttcgtgataatgaatgactgctgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtccaagaatggatactcattta 5242335  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtt-tttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| ||| | || ||||   |||||||||||    
T  5242334 tttgtgatattaagttaacgttctttaaaatcttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtagtctgagaatagggtcctaagtcaaggg 5242235  T
Q  517 att 519  Q
    |||    
T  5242234 att 5242232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2441614 - 2441344
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  2441614 ttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaaagactactgaccctagctttcgacttaga 2441515  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
      |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||     
T  2441514 cataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattaa 2441415  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  2441414 accacctaaggaattagggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagggctatttt 2441344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 6603191 - 6603507
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6603191 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 6603288  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  6603289 atgatttagtgagaacgaatgactattgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 6603388  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||||  ||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  6603389 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 6603488  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  6603489 gattgattagggctatttt 6603507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 13842373 - 13842636
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13842373 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 13842470  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  13842471 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatagataatcgtt 13842570  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  13842571 tgttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 13842636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Original strand, 10468878 - 10469192
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10468878 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 10468975  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||| |||    
T  10468976 tgatttcgtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatagataatccttt 10469075  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||   ||| |||||||    
T  10469076 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 10469174  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  10469175 attgattaggactatttt 10469192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 264 - 480
Target Start/End: Original strand, 7227306 - 7227522
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7227306 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacattatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttaga 7227405  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||  |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7227406 cctaattgagttgttcaaataaacatggctagcctagcaatggataatcgtttatttgagatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattag 7227505  T
Q  464 atcacctaacgaattag 480  Q
    ||||  ||| |||||||    
T  7227506 atcatataaggaattag 7227522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 217 - 552
Target Start/End: Original strand, 48645207 - 48645539
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48645207 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaaatcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 48645304  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||| || |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  48645305 atgatttagtgataacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 48645404  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |   |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  48645405 tgttactgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 48645503  T
Q  516 gatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  48645504 gattgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 48645539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9865108 - 9864792
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9865108 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatgtagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatcctgatcaaatataaac 9865011  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  9865010 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 9864911  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||| ||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||| || ||||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  9864910 tgttagtgatattaagttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattatgggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 9864811  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  9864810 gattgattagggctatttt 9864792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26136508 - 26136246
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26136508 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 26136411  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26136410 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 26136311  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26136310 gttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 26136246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9133143 - 9132878
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9133143 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttctatatcctgatcaaatataa 9133046  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  9133045 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaatggaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatca 9132946  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  9132945 tttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 9132878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 217 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 11398407 - 11398137
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctta-ttcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||  |||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11398407 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttgttcagttcaattgttctgaatgttttttatattctgatcaaatataaac 11398310  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  11398309 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagagtggataatcgtt 11398210  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    | |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  11398209 tgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 11398137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 524
Target Start/End: Original strand, 4546600 - 4546907
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4546600 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaattacaatctagttttcattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataa 4546697  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |    
T  4546698 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataattg 4546797  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  4546798 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaa 4546896  T
Q  514 gggatttatta 524  Q
    |||||| ||||    
T  4546897 gggattgatta 4546907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26144888 - 26144626
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26144888 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 26144791  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26144790 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 26144691  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  || |||| ||||||| |||||||||    
T  26144690 gttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttactagaccacctaaggaattaggg 26144626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 45287404 - 45287187
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  45287404 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttata 45287305  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  45287304 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattag 45287206  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  45287205 accacctaaggaattaggg 45287187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3068357 - 3068043
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  3068357 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataatca 3068260  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  3068259 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaatatacatggttagtctaggaatggataatctttt 3068160  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||   ||| |||||||    
T  3068159 attagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 3068061  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  3068060 attgattaggactatttt 3068043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 26557231 - 26557547
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  26557231 aaccatgttgctgtgaaactctatttaatgt--gaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttt-atatcctaatcaaatataa 26557327  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  26557328 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtttaggaatggataatcg 26557427  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||   || |||||    
T  26557428 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagagggttctatgtcaa 26557526  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  26557527 gggattgattaggactatttt 26557547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4596392 - 4596075
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  4596392 aaccatgttgctctgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataa 4596295  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||| |||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  4596294 acatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagttttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaataattg 4596195  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||||||||    
T  4596194 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccaactaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaa 4596096  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  4596095 gggattgattatgactatttt 4596075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 264 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13809848 - 13809566
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  13809848 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattatgatcaaatataaacatgatttcatgagaatgaatgactattggccatagctttcaactcaga 13809749  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  13809748 cct-----aattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattag 13809654  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
      ||| ||| ||||||| | ||||||| | | |||||||   |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  13809653 gccacataaggaattagaggttgtaatatgagaagagggtcctaagtcaagggattgatcagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 13809566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 262 - 534
Target Start/End: Original strand, 20594040 - 20594311
Alignment:
Q  262 tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaactta 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||    
T  20594040 tcttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctactta 20594139  T
Q  362 gaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatatt 461  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||    
T  20594140 gacataattgaattgttctaataaacagggttagtgtaagaatggataatcgttttttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattatt 20594238  T
Q  462 agatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20594239 agaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactatttt 20594311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Original strand, 2090376 - 2090621
Alignment:
Q  255 aatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagcttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||  ||  || ||||    
T  2090376 aatctagtcttattcaattcaattgttcttaattttttttatatactgatcatatataa-catgaatttgtgagtatgaatgcctaccgacaataacttt 2090474  T
Q  355 caacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaag 454  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||  || ||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||    
T  2090475 caacttaaatctaattggattgttcaaataaacaggggtagtctaggaatagatgatcgtttaattgtgatactaggttaacggtttgaaaacctttgag 2090574  T
Q  455 gaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagg 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  2090575 gaatattagatcacctaatgaattagagattgtaatccaagaagagg 2090621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 17730545 - 17730810
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||| || || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  17730545 aaccatgttgctgtgaaactctactt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaatataa 17730642  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  17730643 acatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 17730742  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |   |||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17730743 tttgttaatgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 17730810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 217 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 37166528 - 37166258
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||     
T  37166528 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaacgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaat 37166431  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  37166430 atgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatt 37166331  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    |||  ||||||||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  37166330 tattagtgatattaggttaacgtgctt-aaacattcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 37166258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 438
Target Start/End: Original strand, 4695255 - 4695477
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4695255 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgctttttatatcctgatcaaatataa 4695352  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  4695353 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacacatttgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 4695452  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||    
T  4695453 tttgttagtgatattaggttaacgt 4695477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 492
Target Start/End: Original strand, 24917938 - 24918201
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgt 325  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||| | ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  24917938 tgtgaaactctattgcatgt--gaatattaatttagttttattcaatccaattgttcttaatgctttttatatactaatcatatgtaa-catgaattcgt 24918034  T
Q  326 gagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgat 425  Q
     || |||||| |||||| |||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  24918035 aagtatgaatgactactgaccaaagctttcaacttagacataattggattgttcaattaaacagggcttgtctatgaatggataatcgtttaattgtaat 24918134  T
Q  426 attaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatct 492  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  24918135 attaggttaacactttgaaaactttcagggaatattagaccacataaggaattagggagtgtaatct 24918201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14683779 - 14683510
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||| || ||||  |||||||    
T  14683779 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactagtgaccataacttttgacttaga 14683680  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||  | ||||||    
T  14683679 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgcataatcatttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaataactattag 14683581  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | ||||||  |||||||||  |||||||  | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  14683580 accacctatggaattaggggctgtaatcctagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactatttt 14683510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20081053 - 20080836
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  20081053 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatggctactgaccctagctttcgacttaga 20080954  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||  || ||||||    
T  20080953 cctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcagcgattattag 20080855  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |||||||  ||||||||    
T  20080854 accacctaagaaattaggg 20080836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 519
Target Start/End: Original strand, 10344993 - 10345247
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| || | |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  10344993 ttattccattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgactgactactgaccctagctttcgacttaga 10345092  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||||  || |||||||||| |  ||||||    
T  10345093 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatggataatcctttattagtgatattaagttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattag 10345191  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 519  Q
    | || |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||   ||| ||||||||||    
T  10345192 accatctaaggaattaggggttgtaaccctataagagggtcctaactcaagggatt 10345247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22611987 - 22611771
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22611987 catgttgttgcgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattttgatcaaatataaaca 22611890  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  22611889 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttacacctaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatgaataatccttt 22611790  T
Q  417 atctgtgatattaggttaa 435  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  22611789 attagtgatattaggttaa 22611771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 264 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37415760 - 37415553
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| |    
T  37415760 ttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttata 37415661  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  37415660 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattag 37415562  T
Q  464 atcacctaa 472  Q
    | |||||||    
T  37415561 accacctaa 37415553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 264 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37423292 - 37423085
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| |    
T  37423292 ttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttata 37423193  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  37423192 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattag 37423094  T
Q  464 atcacctaa 472  Q
    | |||||||    
T  37423093 accacctaa 37423085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45290749 - 45290671
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactact 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  45290749 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactact 45290671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9273455 - 9273384
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaat 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  9273455 ttattcaattcaattgttcttaatattttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaat 9273384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 11397877 - 11397820
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  11397877 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 11397820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 754 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 33844427 - 33844380
Alignment:
Q  754 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33844427 attttattacttcgatacattt-ttagcacacttgctaaaagtctatca 33844380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 754 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 4595816 - 4595765
Alignment:
Q  754 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaatat 806  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4595816 attttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaatat 4595765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 604 - 659
Target Start/End: Original strand, 48645607 - 48645663
Alignment:
Q  604 agtctcatctctccatatcttttctaaaca-aactttattttatgttatttactttt 659  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  48645607 agtctcatctctccatatattttccaaacatatctttattttctgttatttactttt 48645663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 10345474 - 10345530
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  10345474 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaattctatca 10345530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 45290658 - 45290598
Alignment:
Q  421 gtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45290658 gtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45290598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 247 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 27332118 - 27331774
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcacc 346  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  27332118 tgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttattaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcatgagaatgaatgactactgacc 27332019  T
Q  347 ttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaa-tgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27332018 ataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaattgaataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttgttaaa 27331919  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtc 545  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||         || | ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27331918 accttcaaaaaatattagatcacctaatgaattagg---------ctgagaagaggttcctaagtcaagggatttattagggctattttagttaaccatc 27331828  T
Q  546 gggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 599  Q
    | |||||  ||| | ||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  27331827 gtgaaactagagaaatattcataggaaataggtgcattgtaccaattagggaaa 27331774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 218 - 592
Target Start/End: Original strand, 7635394 - 7635766
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7635394 catgttgatgtgaaactctatttcttat--gaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttagtgctttttatatgctgatcacatatatacat 7635491  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  7635492 gaattcgtgagaatgaatgactattgatcataactttcaacttagacctgattgaattgttcaaataaacagggtcagtctaggaatagataatcgttta 7635591  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggga 517  Q
    | ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||   |||||||||| |    
T  7635592 tttgtaataagaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattatggactgtaatctgagaagagggtcctaagtcaaggta 7635691  T
Q  518 tttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 592  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||| |||||  ||| | ||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  7635692 ttgattagggttattttagttaatcatcgtgaaactagagaaatattcataggaagtaggtgcagtgtaccaatt 7635766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 308 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21434763 - 21434479
Alignment:
Q  308 atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaa 407  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21434763 atataaacatgttttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttatacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaa 21434664  T
Q  408 taatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagtta 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |  |||    
T  21434663 taatcgtttatttgttatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtctta 21434564  T
Q  508 agtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatt 592  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||   ||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  21434563 agtcaatggattgattatggctattttagttaactgtcgtgaaagtagagaagtattcataggaaataggtgtagtgtaccaatt 21434479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 348 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 27355935 - 27355684
Alignment:
Q  348 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27355935 tagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaac 27355836  T
Q  448 cttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgg 547  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||   |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||     
T  27355835 cttcaaaaaatattagatcacctaatgaattagggactgtaatatgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggcctattttagttaaccatcgt 27355736  T
Q  548 gaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 599  Q
    |||||  ||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27355735 gaaactagagaaatattcataggaaataggtgcagtgtaccaattagggaaa 27355684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 673449 - 673133
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  673449 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgataaaatataaac 673352  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || |||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  673351 atgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtt 673252  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    |||  ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| || ||||||| |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||  |||| ||||||    
T  673251 tattagtgatattatgttaacgtacttaaacccttcaaagattattagaccacctaaaaaattaggggttgtagtttgagaagagggtattaactcaagg 673152  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  673151 gattgattgagactatttt 673133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6071330 - 6071066
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6071330 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgccttttatatactgatcaaatataaac 6071233  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  6071232 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 6071133  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||    
T  6071132 tgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 6071066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 31204585 - 31204849
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31204585 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 31204682  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  31204683 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 31204782  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31204783 tgttagtgatattaggttaacgtgttttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 31204849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 20398598 - 20398916
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20398598 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 20398695  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20398696 acatgatttagtgagaatgaatcactactgaccatagctttctactttgacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 20398795  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||   ||| ||||    
T  20398796 tttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtctgagaagagggttctaactcaa 20398895  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  20398896 gggattgattaggactatttt 20398916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 45961121 - 45960857
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45961121 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 45961024  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  45961023 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 45960924  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45960923 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 45960857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 45941161 - 45941427
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  | ||  |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45941161 aaccatgttgctgtgaaaccctatttattgta--aatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 45941258  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  45941259 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 45941358  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45941359 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 45941427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23022302 - 23021984
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||    
T  23022302 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctaatcaaatataa 23022205  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  23022204 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 23022105  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||  |||  ||||| |||||||   ||| ||||    
T  23022104 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatttgatcacctaaggaattaggggctgtggtctaagaagagggtcctaactcaa 23022005  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  23022004 gggattgattaggactatttt 23021984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 906067 - 905746
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  906067 aaccatgttattgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 905970  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  905969 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcc 905870  T
Q  414 tttatctgtg----atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaag 509  Q
    |||||  |||    |||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  | |||||||   |||     
T  905869 tttattagtgatatatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccatagaagagggtcctaac 905771  T
Q  510 tcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||||||| |||||  |||||||    
T  905770 tcaagggattgattaaaactatttt 905746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 37184240 - 37183924
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37184240 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 37184143  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37184142 atgatttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctaggaatggataaccgtt 37184043  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  37184042 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 37183943  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  37183942 gattgattagggctatttt 37183924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 49853453 - 49853191
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49853453 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 49853356  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49853355 tgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgttt 49853256  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |   |||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  49853255 gttattgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 49853191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3797201 - 3796939
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  3797201 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 3797104  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||    
T  3797103 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatggataatccttt 3797004  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3797003 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 3796939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 2793976 - 2794238
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2793976 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 2794073  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  2794074 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 2794173  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  |||||| ||| |||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2794174 attagtgatactagcttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 2794238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 264 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 34732690 - 34732405
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcac-atataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttag 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||     
T  34732690 ttattcaattcaattgttcttaatt-tttttatttattga-cacgatataaacatgatttcctgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttaa 34732593  T
Q  363 aactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatatta 462  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  34732592 acctaattgaattgttcaaataaacatagttagtctaggaatgaataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtatta 34732493  T
Q  463 gatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
    || |||||||| ||||||||  |||| | | | |||||||   |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  34732492 gaccacctaacaaattaggggatgtactttgagaagagggtcctaagtcaagggattga-tagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 34732405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1950833 - 1950516
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1950833 aaccatgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcatatataa 1950736  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  1950735 atatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgtattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 1950636  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  1950635 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaa 1950537  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  1950536 gggattgattaggactatttt 1950516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41058680 - 41058415
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41058680 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 41058583  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||| |    
T  41058582 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataattg 41058483  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||  || |||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  41058482 tttgttagtgataataggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagactacctaaggaattaggg 41058415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21107669 - 21107352
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21107669 aaccatgttgctgtcaaactctattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataa 21107572  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  21107571 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 21107472  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  21107471 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaa 21107373  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  21107372 gggattgattaggactatttt 21107352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 28110802 - 28111067
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  28110802 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatg-tttttatatcctgatcaaatataa 28110898  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||| |||||||    
T  28110899 acatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtataggaatggataatcg 28110998  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28110999 tttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28111067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 49498873 - 49498610
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49498873 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 49498776  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaactt-agaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    ||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  49498775 tgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttaagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtt 49498676  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  49498675 tgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 49498610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 264 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11668356 - 11668171
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11668356 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgattttgtgagaattaatgactactgaccatagctttcaacttaga 11668257  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaacct 449  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11668256 ccgaattgaatttttcaaataaatatggttactctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaacct 11668171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 29643599 - 29643282
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  29643599 aaccatattgctgtgaaactctattt-at-tttgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 29643502  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||     
T  29643501 acatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcc 29643402  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  |||||||||||||||| |  || |||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  | |||||||   ||| ||||    
T  29643401 tttattagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattagaggttgtaatcctagaagagggtcctaactcaa 29643303  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  29643302 gggattgattagggctatttt 29643282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 479
Target Start/End: Original strand, 2405258 - 2405517
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  2405258 catgttgttgtgaaactcaattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttcatatcctgatcaaatataaaca 2405355  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  2405356 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccataacgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 2405455  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||| |   |||||||| ||||||| ||||||    
T  2405456 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacagatattagaccacctaaggaatta 2405517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21018840 - 21018528
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  21018840 atgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgttcttaacgcttttt-tatcttgatcaaatataaacat 21018744  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  21018743 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttg 21018644  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggga 517  Q
    |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||||||    
T  21018643 ttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcataagtcaaggga 21018545  T
Q  518 tttattaaggctatttt 534  Q
    || |||| | |||||||    
T  21018544 ttgattaggactatttt 21018528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 420 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16055743 - 16055623
Alignment:
Q  420 tgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 519  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  16055743 tgtgatattaggttaacattcttcaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggatttaggggttgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagggatt 16055644  T
Q  520 tattaaggctattttagttaa 540  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  16055643 gattagggctattttagttaa 16055623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 34066815 - 34066599
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |   ||||||| | |    
T  34066815 catgttgttgtgaaactctatttcttgt--gaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacaccatataatc-t 34066719  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    ||||  |  ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  | |||    
T  34066718 gaatcggcaagattgaatgactactaaccatagcttacaacttatacctaatttgattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataactgctta 34066619  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacg 437  Q
    | |||||||| | |||||||    
T  34066618 tttgtgatatcaagttaacg 34066599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 420 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16056978 - 16056858
Alignment:
Q  420 tgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 519  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  16056978 tgtgatattaggttaacgttattcaaacctttaaagtatattagatcacctaaggaattagggatcgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagggatt 16056879  T
Q  520 tattaaggctattttagttaa 540  Q
     ||||  ||||||||||||||    
T  16056878 gattagagctattttagttaa 16056858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 413 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13431141 - 13431012
Alignment:
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtca 512  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| | | ||||| |   |||||||    
T  13431141 gtttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagagactgtaatatgagaagagagtcctaagtca 13431042  T
Q  513 agggatttattaaggctattttagttaacc 542  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  13431041 agggattgattagggctatttaagttaacc 13431012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 420 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16061144 - 16060965
Alignment:
Q  420 tgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 519  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||     |||||||| |||||    
T  16061144 tgtgatattaggttaatgttcttcaaacctataaagtatattagatcacctaaggaattagggattgtaatatgagaagagaatcctaagtcaatggatt 16061045  T
Q  520 tattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 599  Q
     |||| ||||||||||||||| | |||  ||||  ||| | |||||||   |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16061044 gattagggctattttagttaatcatcgtaaaactagagaaatattcatgagaaataggtgcagtgtaccaattagggaaa 16060965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Original strand, 42022450 - 42022523
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatga 319  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42022450 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatga 42022523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 457 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16062353 - 16062270
Alignment:
Q  457 atattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaa 540  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||   ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16062353 atattagatcatttaaggaattagggattgtaatctgagaagagggttctaagttaagggattaattatggctattttagttaa 16062270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27355165 - 27355020
Alignment:
Q  372 aattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcaccta 471  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || ||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||| | || || |||| ||||||    
T  27355165 aattgttctaataaacatggttagtgtaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgttt-aaaccttcgaagattaatagaccaccta 27355067  T
Q  472 acgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatt 519  Q
    | ||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||| ||||||||||    
T  27355066 aggaattaggg-ttgtagtttaagaagagggtcctaactcaagggatt 27355020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 30938681 - 30938578
Alignment:
Q  476 attagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaata 575  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||  ||  | |||||||||||||||    
T  30938681 attaggggttgtaatcttataagaggatcctaagtcaagggattgattatgactattttagttaaccatcgtgaaactagataaatattcatagaaaata 30938582  T
Q  576 ggtg 579  Q
    ||||    
T  30938581 ggtg 30938578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 604 - 667
Target Start/End: Original strand, 7635795 - 7635857
Alignment:
Q  604 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcaca 667  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7635795 agtctaatctctctctatcttttctaaacaa-ctttattttctgatatttactttttatgcaca 7635857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 443 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 11667153 - 11667062
Alignment:
Q  443 aaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||    |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11667153 aaaaccttcaaataatattagaccacctaaggaattaggggctgtaatctgagaagaggatcctaagtcaagggattgattagggctatttt 11667062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16056777 - 16056712
Alignment:
Q  604 agtctcatctctc--catatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcaca 667  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16056777 agtctcatctctctccataacttttccaaacaatctttattttctgttatttaatttttatgcaca 16056712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 34065128 - 34065073
Alignment:
Q  611 tctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgt-tatttactttttatgca 665  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  34065128 tctctccatatcttttccaaacaatctttattttttgtctatttactgtttatgca 34065073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 380 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16062397 - 16062347
Alignment:
Q  380 aaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattag 430  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16062397 aaataagcagggttagtctacgaataaataatcgtttatttgtgatattag 16062347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 754 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 21110960 - 21110912
Alignment:
Q  754 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  21110960 attttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 21110912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 219 - 542
Target Start/End: Original strand, 28848592 - 28848912
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatg 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  28848592 atgttgttgtgaaactctgtttcatat--gaatatcaatataggtttattcaattcaactgttcttaatgttttttatatactgatcatatataacc-tg 28848688  T
Q  319 aattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttat 418  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  28848689 aattcgtgagaatgaatgactgctgaacatagctttcaactcagacctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctaggaatagataatcgtttat 28848788  T
Q  419 ctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggat 518  Q
     ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||   |||||||||||||    
T  28848789 ttgtgataataggttaacgttctcaaaaccttcaaagaatatcagatcacctaaggaattagggactgtaatttgagaagagggccctaagtcaagggat 28848888  T
Q  519 ttattaaggctattttagttaacc 542  Q
    |||| | | |||||||||||||||    
T  28848889 ttatcaggactattttagttaacc 28848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Original strand, 11247555 - 11247824
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11247555 ttattaaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgattacgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttaga 11247654  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11247655 cataattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattag 11247754  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |   |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11247755 accacctaaggaattaggg-ctgtaatctgataagagagttctaagtcaagggattgattaaggatatttt 11247824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 215 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 12988502 - 12988196
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaa 314  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12988502 aaccatgttgctgtgaagctctatt--at-tgtgaatatcaatctagttttattcaattcaatatttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 12988406  T
Q  315 catgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgt 414  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12988405 catgatttcgtgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacataattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 12988306  T
Q  415 ttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaag 514  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||||||   |||||||||    
T  12988305 ttatttgtgatattaggttagcgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatatgcgaagagggtcctaagtcaag 12988206  T
Q  515 ggatttatta 524  Q
    ||||| ||||    
T  12988205 ggattgatta 12988196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 215 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 13021631 - 13021309
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaa 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13021631 aaccatgttgttgtgaagctctatt--at-tgtgaatatcaatctagttttattcaattcaatatttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaa 13021535  T
Q  315 catgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgt 414  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  13021534 catgatttcgtaagaatgaatgactactgatcataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatcgttagtctaggaatggataatcgt 13021435  T
Q  415 ttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaag 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||| | |||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||| | |||||||   |||||||||    
T  13021434 ttatttgtgatattaggttaatgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacttaaggagttagggactataatctgagaagagggtcctaagtcaag 13021335  T
Q  515 ggatttattaaggctattttagttaa 540  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  13021334 ggattgattagggctattttagttaa 13021309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 257 - 501
Target Start/End: Original strand, 24371060 - 24371305
Alignment:
Q  257 tctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttca 356  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  24371060 tctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatataatgagaatgaatgactactgaccatagctttca 24371159  T
Q  357 acttagaactaattgaatt-gttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaagg 455  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||      
T  24371160 acttagacctaattgaatttgttcaaataaaccgggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgataataggttaatgttcttaaaaccttcaaat 24371259  T
Q  456 aatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagg 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24371260 aatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgataagagg 24371305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 219 - 552
Target Start/End: Original strand, 2846051 - 2846383
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||    
T  2846051 atgttgttgtgaaactctatat-at-tgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcatgataaaatataaacat 2846148  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  2846149 gatttcgtgataatgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatctttta 2846248  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtt-tttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   || ||||||||    
T  2846249 tttgtgatattaagttaacgttctttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctatgtcaaggg 2846348  T
Q  517 atttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  2846349 attgattatggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 2846383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 219 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1126110 - 1125796
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1126110 atgttgctgtgaaactctatt-cat-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacat 1126013  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  1126012 gatttagtgagaaggaataactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatccttta 1125913  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggga 517  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||| ||||||||    
T  1125912 ttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaaggga 1125813  T
Q  518 tttattaaggctatttt 534  Q
    || |||| | |||||||    
T  1125812 ttgattaggactatttt 1125796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 215 - 479
Target Start/End: Original strand, 2378975 - 2379238
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2378975 aaccatattgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 2379072  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  2379073 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 2379172  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  2379173 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 2379238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 218 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 9839770 - 9839459
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||    
T  9839770 catgttgctgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatccttatcaaatataaaca 9839673  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9839672 tgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaatatggttagtctaggaatggataatcgttt 9839573  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    || |||||||||| |||||||||  |||||| ||| | || ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||   |||||||||||    
T  9839572 atttgtgatattaagttaacgttcgtaaaactttcgaagattattagaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagagggtcctaagtcaaggg 9839473  T
Q  517 atttattaaggcta 530  Q
    ||| |||| |||||    
T  9839472 attgattagggcta 9839459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 9953709 - 9954026
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9953709 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttgttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 9953806  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  9953807 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcc 9953906  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  9953907 tttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 9954005  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  9954006 gggattgattaagactatttt 9954026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 11402002 - 11402268
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11402002 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 11402099  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  11402100 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacagggttaatctaggaatggataatcg 11402199  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  11402200 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaacacctaaggaattaggg 11402268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 218 - 552
Target Start/End: Original strand, 5259685 - 5260014
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||    
T  5259685 catgttgttgtgaaactctatct-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttagatattgacaccatataaaca 5259782  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| |  || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||    
T  5259783 tgattctgtaagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgggtaatcgttt 5259882  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||  || |||||   ||| | ||| |||||||   |||||||||||    
T  5259883 atttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagaaaataggg---gtattttaagaagagggtcctaagtcaaggg 5259979  T
Q  517 atttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaac 552  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5259980 attgattagggctatttt-gttaaccatcgtgaaac 5260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22561539 - 22561224
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22561539 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaaggacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 22561442  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22561441 tgatttagtgagaatgaatgactactaacaatagctttctacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 22561342  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    || | |||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| |||||||    
T  22561341 atttctgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattatgagatcacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggg 22561242  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  22561241 attgattaagactatttt 22561224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3597160 - 3596894
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3597160 aaccatgttgctgtgaaactctattt-attt-tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 3597063  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  3597062 acatgatttagtgagaataaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 3596963  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3596962 tttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 3596894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 219 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5738459 - 5738197
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5738459 atgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacat 5738362  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  5738361 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttg 5738262  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5738261 ttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5738197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 30655189 - 30655455
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  30655189 aaccatattgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataa 30655286  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  30655287 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 30655386  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  30655387 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 30655455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Original strand, 28230343 - 28230657
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  28230343 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 28230440  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  28230441 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatccttt 28230540  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |  | |||||||   ||| |||||||    
T  28230541 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 28230639  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  28230640 attgattaagactatttt 28230657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11192949 - 11192657
Alignment:
Q  222 ttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaat 321  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |    
T  11192949 ttgttgtgaaactctatt--at-tgtgaatatcaatctagttttattcaatttaattgttcttaatgctttctatatgctaatcaaatataaacatgatt 11192853  T
Q  322 tcgtgagaatgaataactactcaccttagctttca-acttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggtta----gtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||||||||||||    ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    ||||| || || ||||||||||    
T  11192852 tcgtgagaatga----ctactgaccataggtttcacacttagacctaattgaaatgttcaaataaacagggttaattagtctaggattggataatcgttt 11192757  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||| |  ||||||||||||    
T  11192756 atttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtagtctgagaagagagtcttaagtcaaggg 11192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14281899 - 14281627
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||   |||||||    
T  14281899 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tttgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatattgacaccatataa 14281802  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  14281801 acatgatttcgttagaatgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattcaattgttctaataaacatggttagtctaggaattgataatcg 14281702  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  14281701 tttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgta 14281627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 10289718 - 10289983
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10289718 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaatacatttgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 10289815  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10289816 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcg 10289915  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10289916 tttgttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 10289983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 247 - 534
Target Start/End: Original strand, 20185520 - 20185807
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  20185520 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgac 20185619  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || || ||    
T  20185620 catagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgatattaggttaacattctt-aa 20185718  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20185719 accttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactatttt 20185807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 247 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22150471 - 22150184
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  22150471 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgac 22150372  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || || ||    
T  22150371 catagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgatattaggttaacattctt-aa 22150273  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22150272 accttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactatttt 22150184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 218 - 489
Target Start/End: Original strand, 24399928 - 24400197
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24399928 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 24400025  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  24400026 tgatttagtgagaacgaatgactactaaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 24400125  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||| | |  ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  24400126 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacggttattagaccacctgaggaattaggggttgtaa 24400197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 247 - 482
Target Start/End: Original strand, 6513027 - 6513267
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcac-----atataaacatgaattcgtgagaatgaataacta 340  Q
    |||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||     |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  6513027 tgaatgacaatctagtttttactcaattcaattgttcttaatactttttatatattga-caccatatatataaacatgatttcatgagaatgaatgacta 6513125  T
Q  341 ctcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgttt 440  Q
    || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||      
T  6513126 ctgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaatgaataatcgtttattagtgatattaggttaacgtac 6513225  T
Q  441 ttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  6513226 ttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 6513267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26942813 - 26942496
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26942813 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctcgtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 26942716  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26942715 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttgataaacaaggttagtctaggaatggataatcg 26942616  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||  |||||| | | |||||||   ||| ||||    
T  26942615 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagtttattagaccacctaaggaattaggggctgtaatttgagaagagggtcctaactcaa 26942517  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  26942516 gggattgattaggactatttt 26942496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18856400 - 18856181
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18856400 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 18856303  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  18856302 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 18856203  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  18856202 attagtgatattaggttaacgt 18856181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11126074 - 11125819
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11126074 aaccatgttgttgtgaaactttattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 11125977  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||| || |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  11125976 acatgatttagtgaaaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 11125877  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaa 472  Q
    ||| |   ||||||| |||||||||  || |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  11125876 tttgttactgatatttggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaa 11125819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 13004934 - 13005252
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||| ||||||||| || ||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| |||   |||||||    
T  13004934 aaccatgttgttgtgaaactctatttattgta--aatgacaatctagtttttattgaatttaattgttcttgatcctttttatatattgacaccatataa 13005031  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||  |||||||    
T  13005032 acatgatttcgtgagaatgaatgactactggccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatagataatcg 13005131  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  13005132 tttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaaattcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcataactcaa 13005231  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  13005232 gggattgattaggactatttt 13005252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Original strand, 24410048 - 24410266
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24410048 catgttgctgtgaaactctattt-atgg-tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat-ctgatcaaatataaaca 24410144  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  24410145 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 24410244  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  24410245 attagtgatattaggttaacgt 24410266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 489
Target Start/End: Original strand, 19475751 - 19476020
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || | |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  19475751 catgttgctgtgaaactttatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcatttgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 19475848  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||  |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||    
T  19475849 tgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcctaggaatggataatccttt 19475948  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    ||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19475949 attagtgatagtaggttaacg-tgttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 19476020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 247 - 489
Target Start/End: Original strand, 13946794 - 13947036
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||  ||| |||||| ||    
T  13946794 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacaaatgactactgac 13946893  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||  || ||    
T  13946894 cataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagattaacgtgctt-aa 13946992  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    |||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  13946993 accttcaaaggttattaaaccacctaaggaattaggggttgtaa 13947036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 534
Target Start/End: Original strand, 23007941 - 23008124
Alignment:
Q  351 ctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaacctt 450  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23007941 ctttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacctt 23008040  T
Q  451 caaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
     || |||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23008041 taaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctatttt 23008124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23780423 - 23780240
Alignment:
Q  351 ctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaacctt 450  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23780423 ctttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacctt 23780324  T
Q  451 caaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
     || |||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23780323 taaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctatttt 23780240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 436
Target Start/End: Original strand, 4512218 - 4512438
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  4512218 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatctcgtgatcaaatataa 4512315  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  4512316 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagactgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatca 4512415  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaac 436  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  4512416 tttattagtgatattaggttaac 4512438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 28112143 - 28111879
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcac-atata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||| ||| ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||||    
T  28112143 aaccatgttgttgtgaaactctatttactgt--gaatgacaaactagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatatattaa-cactatata 28112047  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||||||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  28112046 aacatgatttagtgagattgaatgactactaaccatagctt-cgacttagaccaaattgaattgatctaataaacatggttagtctaggaatgaagaatc 28111948  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  28111947 gtttattagtgatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 28111879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 416
Target Start/End: Original strand, 31072052 - 31072250
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| || |||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31072052 ccatgttgctgcgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 31072149  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||| |||||||||    
T  31072150 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggctggtctaggaatggataatcgtt 31072249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 264 - 444
Target Start/End: Original strand, 2372119 - 2372295
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||  || |||||| ||    ||||||||||||||    
T  2372119 ttatttaattcaattgttcttaatgttttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgtgagaattgatgactactgac----gctttcaacttaga 2372214  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaa 444  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  2372215 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgaataatcgtttattagtgatattaggttaacgtatttaa 2372295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28108167 - 28107923
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcac-atata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  28108167 aaccatgttgttgtgaaactctatttactat--gaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattga-cactatata 28108071  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||| | | | ||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||| ||||||    
T  28108070 aacatgatttagagagaatgaatgactaatgatcatagctttga-cttagacctaattgaattgttctaataaacacggttagtcatggaatggataatc 28107972  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatatta 462  Q
    | ||||  || |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  28107971 gattattagtcatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaagaatatta 28107923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 215 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11188294 - 11188131
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11188294 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataa 11188197  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttc 379  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||    
T  11188196 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaaacagaattgaattgttc 11188131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 300 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23385048 - 23384865
Alignment:
Q  300 ctgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtcta 399  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23385048 ctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtcta 23384949  T
Q  400 tgaatg--aataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||    
T  23384948 ggaatggatataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaacaactaaggaattaggg 23384865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 215 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23388475 - 23388328
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23388475 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataa 23388378  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23388377 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaga 23388328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 337 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17106867 - 17106671
Alignment:
Q  337 actactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaac 436  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17106867 actactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgttttttagtgatattaggttaac 17106768  T
Q  437 gtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  17106767 gtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactatttt 17106671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26898244 - 26898075
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  26898244 catgttgctgtgaaactatattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatatcctgatcaaatttaaaca 26898147  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaaca 388  Q
    ||| || |||| || |||| |||||| ||| |||||||| | ||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  26898146 tgatttagtgacaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattaagttgttctaataaaca 26898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 7128194 - 7128310
Alignment:
Q  365 ctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattaga 464  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||    |||||||    
T  7128194 ctaactgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaatgttattaga 7128292  T
Q  465 tcacctaacgaattaggg 482  Q
     ||||||| |||||||||    
T  7128293 ccacctaaggaattaggg 7128310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28665642 - 28665503
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| ||| ||    
T  28665642 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatatcatgatcaaataaaa 28665545  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttc 355  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||    
T  28665544 acatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagttttc 28665503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 11192551 - 11192494
Alignment:
Q  610 atctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacac 668  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11192551 atctctctctatcttttctaaacaa-ctttattttatgttatttactttttatgcacac 11192494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 659
Target Start/End: Original strand, 24371366 - 24371422
Alignment:
Q  604 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaa-ctttattttatgttatttactttt 659  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24371366 agtctcatctctccatatattttccaaacaaatctttattttctgttatttactttt 24371422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 623 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9839352 - 9839307
Alignment:
Q  623 ttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacac 668  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  9839352 ttttctaaacaaactttattttcttttatttaatttttatgcacac 9839307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 753 - 808
Target Start/End: Original strand, 16731648 - 16731702
Alignment:
Q  753 aattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaatatct 808  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  16731648 aattttattacttcgatatattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcattatct 16731702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 20186045 - 20186102
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgct-aaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20186045 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtgcacttgctaaaaagtctatca 20186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 22149946 - 22149889
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgct-aaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22149946 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtgcacttgctaaaaagtctatca 22149889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 753 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 20527204 - 20527156
Alignment:
Q  753 aattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  20527204 aattttattacttcgatatatttg-tagtacacttgctaaaagtctatca 20527156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 147; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 218 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 118821 - 118561
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  118821 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaaca 118724  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  118723 tgaattcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 118624  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    || ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  118623 atttgtgatattaggttaacgcatgtaaaaccttcaaagaatattagatcatctaaggaatta 118561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 218 - 665
Target Start/End: Original strand, 9685 - 10148
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9685 catgttgctgtgaaactctatttcttat--gaatatcaatatagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgatcacataaaaacat 9782  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||   |||| |||||    
T  9783 gaattcgtgagaatgaatgattattgaccataactttcaacttagacctaattgaattgatcgaataaacagagttagtctaggaattggtaattgttta 9882  T
Q  418 tctgtgatatt-aggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||| | |||||| | |||||||   |||||||||||    
T  9883 tttgtgatattaaggttaactttcttaaaaccttcaaataatattataacacataaggaattagggactctaatctgagaagagggtcctaagtcaaggg 9982  T
Q  517 atttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttggg----------------aaag 600  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||   ||| | |||||  || |||||||||| ||||| ||||| |||                ||||    
T  9983 attgattagggctattttggttaaccatcgtgaaattagagaaatattcgaaggaaataggtgcagtgtaccaattaggggaactcagaggattcaaaag 10082  T
Q  601 ac-cagtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgca 665  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10083 acatagtctcatctctccttatcttttccaaacaatatttaatttatgttatttactttttatgca 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25960068 - 25959750
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25960068 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 25959971  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  25959970 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 25959871  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||   ||| ||||    
T  25959870 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtctgagaagagggtcctaactcaa 25959771  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  25959770 gggattgattaggactatttt 25959750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9185804 - 9185486
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9185804 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 9185707  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||     
T  9185706 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatgaataatcc 9185607  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| || |||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  9185606 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagagactgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 9185507  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  9185506 gggattgattaggactatttt 9185486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43208269 - 43208003
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43208269 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaatataa 43208172  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43208171 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaataatcg 43208072  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  43208071 tttgttagtgatattaggttaacgttcttacaaccttcaaagactattagaccacctaaggaattaggg 43208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9189032 - 9188714
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9189032 aaccatgatgttgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 9188935  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||     
T  9188934 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagatttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcc 9188835  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  9188834 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagtaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 9188735  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  9188734 gggattgattaggactatttt 9188714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 247 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30275118 - 30274830
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcac 345  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  30275118 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgac 30275019  T
Q  346 cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaa 445  Q
    | |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30275018 catagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttatcagtgatattaggttaacgttcttaaa 30274919  T
Q  446 accttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  30274918 accttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagggattgattatgactatttt 30274830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 31586320 - 31586054
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31586320 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagttttgattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 31586223  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||     
T  31586222 tcatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcc 31586123  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31586122 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 31586054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 42369090 - 42368773
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42369090 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 42368993  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  42368992 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 42368893  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  42368892 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 42368794  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  42368793 gggattgattaggactatttt 42368773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 215 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 35521743 - 35521455
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||     
T  35521743 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatgtgggtat--caatctagttttactcaattcaattgttcttaatgtattttatatactgataatatataa- 35521647  T
Q  315 catgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatga----atgaataa 410  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    ||| ||||    
T  35521646 catgaattcgtgagaatgaaagactactgatcctagctttcaacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctaggaatatatggataa 35521547  T
Q  411 tcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 502  Q
    | |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  35521546 ttgtttatttgtgatataaggttagcgctcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagaaattagggattgtaatctgagaagaggg 35521455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 31427919 - 31427603
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31427919 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 31427822  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  31427821 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcgtt 31427722  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  31427721 tgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 31427622  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  31427621 gattgattagggctatttt 31427603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 22020794 - 22021111
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  22020794 aaccatgttgctgtgaaactctatt--at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataa 22020890  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  22020891 acatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 22020990  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||    
T  22020991 tttattagtgatattaggttaacgtacttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggttctaactcaa 22021090  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  22021091 gggattgattaggactatttt 22021111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25139308 - 25138993
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  25139308 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcctaatgctttttatatcctgatcaaatgtaaaca 25139211  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  25139210 tgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctcataatcatggttagtctaggaatggataatccttt 25139111  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||||||    
T  25139110 attagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggg 25139011  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  25139010 attgattatgactatttt 25138993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 5105452 - 5105718
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5105452 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 5105549  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||| | || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||| ||||||     
T  5105550 acataatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtataggaatggataatcc 5105649  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5105650 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5105718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11348275 - 11348009
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11348275 aaccatgttgctgtgaaactttattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 11348178  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  11348177 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 11348078  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||    
T  11348077 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 11348009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25821222 - 25820908
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25821222 catgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 25821125  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25821124 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 25821025  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
     |  |||||| |||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| |||||||    
T  25821024 gttagtgatactaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggg 25820926  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  25820925 attgattaggactatttt 25820908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 24234821 - 24235087
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24234821 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 24234918  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  24234919 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctaggaatggataatcg 24235018  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24235019 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24235087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 36808821 - 36808514
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatct-agtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  36808821 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 36808724  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  36808723 acatgatttagtaagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgtataatcg 36808624  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  || |||||||||||||||  || |||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||  |||| ||||    
T  36808623 tttattagtaatattaggttaacgtgctt-aaactttcaaagattattagaccacctaaagaattagggtctgtagtttaagaagagggtcttaactcaa 36808525  T
Q  514 gggatttatta 524  Q
    |||||| ||||    
T  36808524 gggattgatta 36808514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 45453602 - 45453917
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  45453602 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa-c 45453698  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  45453699 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 45453798  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  45453799 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 45453898  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| ||||  ||||||||    
T  45453899 gattgattagtgctatttt 45453917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 45456889 - 45457205
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  45456889 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttatccaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaaatataaac 45456986  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || || |||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  45456987 atgatttagttagaacgaatgactactgaccctagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcttt 45457086  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||| || |||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  |||| ||||||    
T  45457087 ttttagtgatattaggttaacgttctttaaaccttctattattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagg 45457186  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  45457187 gattgattagggctatttt 45457205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 6826498 - 6826763
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6826498 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 6826595  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  6826596 acatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagaaagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 6826695  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  6826696 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaaattattagaccacctaaggaattaggg 6826763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 24238093 - 24238359
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24238093 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 24238190  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  24238191 acatgatttagtgagaatgaatggctactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 24238290  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24238291 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 24238359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 26365659 - 26365925
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26365659 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 26365756  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  26365757 acatgatttagtgagaacgaattactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaatttttctaataaacatggttagtttaggaatgaataatcg 26365856  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26365857 tttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 26365925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 37280056 - 37279790
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37280056 aaccatgttgccgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 37279959  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  37279958 atatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 37279859  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  37279858 tttgttagtgatattaggttaacattcttaaaaccttcaaagattattagaccacgtaaggaattaggg 37279790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 27266516 - 27266832
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27266516 ccatgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaac 27266613  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  27266614 atgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatggataatcgtt 27266713  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    |||  |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  27266714 tattagtgataataggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 27266813  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
     |||||||| | |||||||    
T  27266814 aatttattaggactatttt 27266832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 33310394 - 33310710
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33310394 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 33310491  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  33310492 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttggacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctaggaatggataatcgtt 33310591  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  |||||||||||||||| |  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  33310592 tgttagtgatattaggttaacttgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 33310691  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  33310692 gattgattagggctatttt 33310710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 40259515 - 40259201
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40259515 catgttgttgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 40259418  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||    
T  40259417 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatggataatcattt 40259318  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||   ||||| |  |||||| ||   ||| |||||||    
T  40259317 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacgattattataccacctaaggaattaggcgctgtaaccctataagaaggtcctaactcaaggg 40259219  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  40259218 attgattaagactatttt 40259201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 8888361 - 8888627
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaa-tgctttttatatactgatcacatata 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  8888361 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaatgctttttatatcctgatcaaatata 8888458  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8888459 aacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaataatc 8888558  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8888559 gtttgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8888627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 16178853 - 16179170
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16178853 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 16178950  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  16178951 atatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcc 16179050  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
     ||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||   ||| ||||    
T  16179051 attattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtaatcctagaagagggtcctaactcaa 16179149  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| ||||  ||||||||    
T  16179150 gggattgattagagctatttt 16179170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 38015246 - 38015562
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  38015246 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaac 38015343  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  38015344 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgactttgacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatt 38015443  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||| ||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  38015444 tgttagtgatattaggttaaggtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 38015543  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  38015544 gattgattagggctatttt 38015562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 483
Target Start/End: Original strand, 43723427 - 43723692
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43723427 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat-ctgatcaaatataa 43723523  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  43723524 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaactgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 43723623  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggga 483  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43723624 tttgttagtgatattaggttagcgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggga 43723692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 599
Target Start/End: Original strand, 30926276 - 30926648
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30926276 catgttgttgtgaaactctatct-at-tgtgaatgtcaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaaca 30926373  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||           || ||||||||||    
T  30926374 tgattttgtgagaatgaatgactgctaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggt-----------tggataatcgttt 30926462  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacc----taacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtca 512  Q
    || |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||    ||| ||||||||| |||| |||| | |||||||   |||||||    
T  30926463 atttgtgatattaagttaacgttcataaaaccttcaaagagtattagaccacctaattaaggaattaggggttgtcatctgagaagagggtcctaagtca 30926562  T
Q  513 agggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 599  Q
    | ||||| |||| | ||||||| | ||||| ||| |||||  ||  |  |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  30926563 atggattgattaggactatttt-gctaaccatcgtgaaactagaaaatcattcgtagaaaataggtgcagtatatcaattagggaaa 30926648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1386798 - 1386484
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |    
T  1386798 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaata 1386701  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||    
T  1386700 tgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatggataatccttt 1386601  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |  | |||||||   ||| |||||||    
T  1386600 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 1386502  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  1386501 attgattaagactatttt 1386484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9966684 - 9966486
Alignment:
Q  281 tcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttca 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  9966684 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagcttcctacttagacctaattgaattgttca 9966585  T
Q  381 aataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  9966584 aataaacatggttagtctaggaatggataatcatttatttgtgatgttaagttaacgttcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 9966486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 226 - 482
Target Start/End: Original strand, 5666255 - 5666509
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcg 324  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  5666255 tgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttag 5666352  T
Q  325 tgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtga 424  Q
    |||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||    
T  5666353 tgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaatagttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtga 5666452  T
Q  425 tattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5666453 tattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 5666509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 438
Target Start/End: Original strand, 17876832 - 17877054
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  17876832 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaattctttttatatcctggtcaaatataa 17876929  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  17876930 acatgatttagtgagaacgaattactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcc 17877029  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||    
T  17877030 tttattagtgatattaggataacgt 17877054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 25870510 - 25870775
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||  |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25870510 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaattacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataa 25870607  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |    
T  25870608 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataattg 25870707  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  25870708 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 25870775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 45493487 - 45493270
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| |    
T  45493487 ttattcagttcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttata 45493388  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  45493387 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattag 45493289  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  45493288 accacctaaggaattaggg 45493270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 45501229 - 45501012
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| |    
T  45501229 ttattcagttcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttata 45501130  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  45501129 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattag 45501031  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  45501030 accacctaaggaattaggg 45501012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37937595 - 37937337
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37937595 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 37937498  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||    
T  37937497 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattattctaataaacatggttagtttaggaatggataatccttt 37937398  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatt 478  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  37937397 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaatt 37937337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 40781198 - 40781463
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40781198 aaccatgttgctctgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 40781295  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40781296 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccacagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 40781395  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  || ||||||||| |||||  || |||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||    
T  40781396 tttgttagtaatattaggtcaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 40781463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16791135 - 16790871
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  16791135 catgttgttgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 16791038  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| ||  |||||| |||| |||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  16791037 tgatttaatgagaacgaatgactactgaccatagctttcggcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcattt 16790938  T
Q  417 atctgtgatattaggtta--acgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |  ||||||||||||||  ||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  16790937 gttagtgatattaggttaacacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 16790871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 13972273 - 13972008
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtc-ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || |||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  13972273 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgattgacaatatagttattattcaattcaactgttcttaatgttttttatatcatgatcaaatataa 13972176  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  13972175 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattggatttttctaaaaaacatggttagtctaggaatggataatcg 13972076  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  13972075 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 13972008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 25873901 - 25874166
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  25873901 aaccatgttggtgtgaaactctattt-at-tgtgaattacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaatataa 25873998  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |    
T  25873999 atatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataattg 25874098  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  25874099 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 25874166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 479
Target Start/End: Original strand, 12219524 - 12219784
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  12219524 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 12219621  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaat-aactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    | | || ||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  12219622 tcatttagtgagaacgaatgaactactgaccctagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctt 12219721  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    |||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||    
T  12219722 tattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacataaggaatta 12219784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Original strand, 3875060 - 3875277
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||| |||||||    
T  3875060 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaattactaccgaccctagctttcgacttaga 3875159  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||    
T  3875160 cctaattgaatttttctaataaacatggttagtataggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgatt-aaaccttcaatggttattag 3875258  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  3875259 accacctaaggaattaggg 3875277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 22630570 - 22630832
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22630570 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgataatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 22630667  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||  |||    
T  22630668 tgatttagtgagaacgaatgactactaaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacattgttagtctaagaatggataatatttt 22630767  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||   ||||||||||||||| |  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  22630768 attattgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 22630832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 398
Target Start/End: Original strand, 10600676 - 10600854
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10600676 atgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagattttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacat 10600773  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtct 398  Q
    || || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  10600774 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtct 10600854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 218 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17876387 - 17876211
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17876387 catgttgctgtgaaactctattt-atcg-tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 17876290  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttag 395  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17876289 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttag 17876211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 300 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 17874877 - 17874694
Alignment:
Q  300 ctgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtcta 399  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17874877 ctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttagtcta 17874778  T
Q  400 tgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
     ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||      |||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  17874777 ggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgt------aaccttcaacagatattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 17874694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 599
Target Start/End: Original strand, 34682622 - 34682807
Alignment:
Q  412 cgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtc 511  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | ||||| |   ||||||    
T  34682622 cgtttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacc--caaagaatattagatcaccttaggaattagggactgtaatctgagaagagagtcctaagtc 34682719  T
Q  512 aagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgcggtgtatcaatttgggaaa 599  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| | || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  34682720 aagggattgattagggctattttggttaaccatcgtgaaactagagaaatactcataggaaatacgtgcagtgtaccaattagggaaa 34682807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 342
Target Start/End: Original strand, 29440252 - 29440375
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29440252 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaatttaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 29440349  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactact 342  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||    
T  29440350 tgatttagtgagaacgaatgactact 29440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 500
Target Start/End: Original strand, 11187925 - 11188095
Alignment:
Q  330 atgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatatta 429  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| | ||    
T  11187925 atgaatgactactgacattaactttcaacttatacctaattgaattgtttaattaaacatggttagtctaggaatggataaccgtttaattgtgagaata 11188024  T
Q  430 ggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagag 500  Q
      ||||| || | ||||||||| |  ||||| ||| |||||||  |||| |||  |||||||||| |||||    
T  11188025 tattaacattctaaaaaccttcgaacaatatgagagcacctaagaaattgggggatgtaatctaagaagag 11188095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 744 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 31427363 - 31427305
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  31427363 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 31427305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 381
Target Start/End: Original strand, 6298203 - 6298357
Alignment:
Q  224 gttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaa-ttattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaatt 322  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||| |||||||| || | | |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||    
T  6298203 gttgtgaaactctattt--tatatgaatgtcaatataattttatccaattcaatttgtgcctaatgctttttatatcttgatcacatgtaaa-atgattt 6298299  T
Q  323 cgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaa 381  Q
    |  | | |||||| |||| | ||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  6298300 c-agggtatgaatgactattgaccataactttcaacttagatctaagtgaatagttcaa 6298357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 805
Target Start/End: Original strand, 45457445 - 45457505
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaata 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  45457445 tacgaacttaattttattacttcgatgcatat-ttagtacacttgctaaaaatctatcaata 45457505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 604 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25820823 - 25820767
Alignment:
Q  604 agtctcatctctccatatcttttctaaaca-aactttattttatgttatttactttt 659  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25820823 agtctcatctctccatatattttccaaacatatctttattttctgttatttactttt 25820767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 659
Target Start/End: Original strand, 34682829 - 34682883
Alignment:
Q  604 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttattttatgttatttactttt 659  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34682829 agtctcatttctctctatcttttctaaacaa-ctttaatttatgttatttactttt 34682883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 748 - 803
Target Start/End: Original strand, 45454161 - 45454215
Alignment:
Q  748 aacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  45454161 aacttaattttattacttcgatgcatat-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 45454215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22174300 - 22173984
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22174300 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgaccatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatgctgatcaaatataaac 22174203  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  22174202 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcgtt 22174103  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  22174102 tgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 22174003  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  22174002 gattgattagggctatttt 22173984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 14421488 - 14421751
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |  | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  14421488 catgttgctgtgaaactctatt--aattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaga 14421585  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  14421586 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatccttt 14421685  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  14421686 attagtgatactaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatcagaccacctaaggaattaggg 14421751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18824771 - 18824455
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18824771 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 18824674  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  18824673 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 18824574  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  18824573 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 18824474  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  18824473 gattgattagggctatttt 18824455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18826264 - 18825948
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18826264 ccatgttactgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 18826167  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18826166 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtt 18826067  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  18826066 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 18825967  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  18825966 gattgattagggctatttt 18825948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 36711013 - 36710697
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  36711013 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataagc 36710916  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  36710915 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttggacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 36710816  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  36710815 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 36710716  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  36710715 gattgattagggctatttt 36710697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 264 - 580
Target Start/End: Original strand, 4868043 - 4868356
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttat---atactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaactt 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||    
T  4868043 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttattatatcctgatcaaatataaagatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccataactttcaactt 4868142  T
Q  361 agaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatat 460  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4868143 aggcctaattgaattgttcaaataaa-----ttagtctaggaatggataattttttatttgtgatattaggtgaacgttcttaaaaccttcaaagaatat 4868237  T
Q  461 tagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggag 560  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||  | |||||||   |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||   |||||    
T  4868238 tagatcacctaaggaattatgaactgtaatccgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggcta-tttagttaaccatcgtgaaactataggag 4868336  T
Q  561 tattcatagaaaataggtgc 580  Q
    |||| |||| ||||||||||    
T  4868337 tattaataggaaataggtgc 4868356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18721660 - 18721394
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18721660 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatactgatcaaatataa 18721563  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  18721562 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatggataatcg 18721463  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||  ||||||||    
T  18721462 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccaactaagaaattaggg 18721394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 45155645 - 45155330
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  45155645 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaaca 45155548  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45155547 tgatttcgtggaaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctattaaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 45155448  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| || || | | | |||||||  |||| |||||||    
T  45155447 attagtgatattaggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttttagtttgagaagagggtcttaactcaaggg 45155348  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  45155347 attgattaggactatttt 45155330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43682249 - 43681931
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43682249 aaccatgttgttgtgaaattttattt-at-tgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 43682152  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  43682151 atatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaaatgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcc 43682052  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| | | |||||||   ||| ||||    
T  43682051 tttattagtgatattaggttaacatgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctacggaattagggactgtaatatgagaagagggtcctaactcaa 43681952  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  43681951 gggattgattaggactatttt 43681931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 8911391 - 8911654
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  8911391 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 8911488  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  8911489 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgcataatccttt 8911588  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8911589 attagtgatattatgttaacgtgcttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 8911654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 219 - 534
Target Start/End: Original strand, 12582753 - 12583066
Alignment:
Q  219 atgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12582753 atgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 12582850  T
Q  318 gaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttta 417  Q
    || || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||     
T  12582851 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatagataattgtttg 12582950  T
Q  418 tctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggga 517  Q
    |  ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||| | | | |||||||   ||||||||||||    
T  12582951 ttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattacaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagtcaaggga 12583049  T
Q  518 tttattaaggctatttt 534  Q
    || |||| | |||||||    
T  12583050 ttgattaggactatttt 12583066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25595036 - 25594773
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  25595036 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaagtataa 25594939  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||     
T  25594938 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgatttgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcc 25594839  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||    
T  25594838 tttattactgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaatta 25594773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 283 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12516765 - 12516514
Alignment:
Q  283 ttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaa 382  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | || ||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12516765 ttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacataatttagtgagaacgaatggctactgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaa 12516666  T
Q  383 taaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12516665 taaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattatgttaaagtgcataaaaccttcaaagaatattagatcaactaaggaattaggg 12516566  T
Q  483 attgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  12516565 attgtaatctaagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 12516514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Original strand, 17930724 - 17931039
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  17930724 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaac 17930821  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  17930822 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctagtaaacatggttagtataggaatggataatcgtt 17930921  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||| || | |||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  17930922 tgttagtgatataagatcaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcgtaactcaagg 17931020  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  17931021 gattgattaagactatttt 17931039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25591857 - 25591592
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  25591857 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcacttgttcttaatgttttttatattatgatcaaatataa 25591760  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||     
T  25591759 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttta-cttagacaaaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcc 25591661  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||    
T  25591660 tttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggg 25591592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38248777 - 38248512
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  38248777 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataa 38248680  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |  || |||||||    
T  38248679 acatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttacgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagatagtctaggtttggataatcg 38248580  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38248579 tttattagtgatattaggttaacg-tactaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 38248512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21280145 - 21279830
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | | |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  21280145 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaac 21280048  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| || || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21280047 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctaggaatggataatcgtt 21279948  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||| |  |||| ||||||    
T  21279947 tgttagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttaagaagagagtcttaactcaagg 21279849  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| | |||||||    
T  21279848 gattgattaggactatttt 21279830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 226 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23619731 - 23619477
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcg 324  Q
    ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || |    
T  23619731 tgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttag 23619634  T
Q  325 tgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtga 424  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||    
T  23619633 tgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatttattagtga 23619534  T
Q  425 tattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23619533 aattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 23619477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 502
Target Start/End: Original strand, 23643562 - 23643846
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||    
T  23643562 ccatgttgctgtgaaactgtattt-at-tctgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctgtttatatcctgataaaaaataaac 23643659  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  23643660 atgacttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatgtttagtctaggaatggataatcgtt 23643759  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagaggg 502  Q
    | |  ||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||| | |||||||    
T  23643760 tgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgagaagaggg 23643846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 31284414 - 31284680
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatata----ctgatcacatata 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| |||||    
T  31284414 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatatatcctgatcaaatata 31284511  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  31284512 aacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagccttcgacttagacctaattgaattgttgtaataaacatggttagtctaggaatggataatc 31284611  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31284612 ctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggg 31284680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 16953517 - 16953783
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16953517 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 16953614  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  16953615 atatgatttagtgagaatgaatgactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttcttataaacagggttagtctaggaatggataatcg 16953714  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |   |||||||||||||| ||  || |||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||    
T  16953715 tttgttaatgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccgcctaaggaattaggg 16953783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 217 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5980689 - 5980374
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5980689 ccatgttgctgtgaaaatctattt-at-tgtgaatgtcaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 5980592  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||    
T  5980591 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgacttgttctaataaacaagtttagtctagatatggataatcgtt 5980492  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagg 515  Q
    | |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| |||||||  ||||| ||| |||| | | | |||||||   ||| ||||||    
T  5980491 tgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattacggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 5980393  T
Q  516 gatttattaaggctatttt 534  Q
    |||| |||| | |||||||    
T  5980392 gattgattatgactatttt 5980374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 479
Target Start/End: Original strand, 10663643 - 10663902
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  10663643 catgttgctgtgaaactctattt-at-tctgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcatgatcaaatataaaca 10663740  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  10663741 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 10663840  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaatta 479  Q
    ||  |||||| |||||||| ||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  10663841 attagtgatactaggttaatgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 10663902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10498589 - 10498327
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  10498589 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 10498492  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    | | || ||||||| |||  |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||    
T  10498491 taatttagtgagaacgaacgactactgatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcttggaatggataatccttt 10498392  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10498391 attagtgatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggg 10498327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 264 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5539104 - 5538915
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  5539104 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatactgatcaaatataaaaatgattaagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaga 5539005  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaa 453  Q
       ||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  5539004 caaaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgcataaaaccttcaa 5538915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 491
Target Start/End: Original strand, 30784673 - 30784934
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  30784673 catgttgatgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaaca 30784770  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||            
T  30784771 tgaattcgtgagaatgaatgactattgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaacatgaataatctaggaatggat-------- 30784862  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatc 491  Q
       ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  30784863 ---tgtgatattaggttaacgttcgtaaaaccttcagagaactttaaatcacctaaggaattagagactgtaatc 30784934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 489
Target Start/End: Original strand, 33419397 - 33419669
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||    
T  33419397 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaaagctctttatatcatgatcaaatataa 33419494  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  33419495 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatcc 33419594  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    |||||  |||||||||| | ||| |  || |||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  33419595 tttattagtgatattagataaacatgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacataaggaattaggggttgtaa 33419669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 5614103 - 5613788
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||    
T  5614103 catgttgatgtgaaactctattt-at-tgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaaatataaaca 5614006  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattg-------ttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaata 409  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| || |||  | |||||||||||||  |||||||||||       |||||||||||| ||||| |||| | ||| |||    
T  5614005 tgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttattctaggtatgcata 5613906  T
Q  410 atcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttc-aaggaatattagatcacctaacgaattaggg--attgtaatctaataagagggagtt 506  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||||||    | |||||| | |||||||   |    
T  5613905 atcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatctgagaagagggtcct 5613806  T
Q  507 aagtcaagggatttatta 524  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5613805 aagtcaagggatttatta 5613788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 264 - 488
Target Start/End: Original strand, 13196646 - 13196869
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| |||||  ||| || ||||| ||||| |    
T  13196646 ttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaataaaaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccataactttcgacttaaa 13196745  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |  | |||||||||| || ||||||    
T  13196746 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacg-tgctcaaaccttcaaagattattag 13196844  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgta 488  Q
    |  ||||||  |||||||| |||||    
T  13196845 actacctaagaaattaggggttgta 13196869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Original strand, 25230851 - 25231085
Alignment:
Q  247 tgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcaca---tataa-acatgaattcgtgagaatgaataactac 341  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    |||||   ||||| | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  25230851 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatata----tcacaccgtataatatatgatttcgtgagaatgaatgactac 25230946  T
Q  342 tcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttt 441  Q
    | ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |  |    
T  25230947 tgaccgtaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcttaggaatggataatcgtttattagtgatattaggttaacatact 25231046  T
Q  442 taaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattag 480  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||    
T  25231047 taaaaccttcaaatattattagaacacccaaggaattag 25231085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 264 - 479
Target Start/End: Original strand, 2560341 - 2560556
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| || |||| |||||| ||| | | |||| |||||||    
T  2560341 ttattcaattcaattgtttataatcctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactactgaccatggttttcgacttaga 2560440  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     |||| |||||||||| |||| | | |||||||||| ||||| |||||| |||||   ||||||||| |||||||  ||||| ||||||| || ||||||    
T  2560441 cctaactgaattgttctaatacagatggttagtctaggaatggataatcctttattaatgatattagtttaacgtgcttaaagccttcaaagattattag 2560540  T
Q  464 atcacctaacgaatta 479  Q
    | ||||||| ||||||    
T  2560541 accacctaaggaatta 2560556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 319
Target Start/End: Original strand, 23613281 - 23613384
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23613281 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 23613378  T
Q  314 acatga 319  Q
    ||||||    
T  23613379 acatga 23613384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 283 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 44027404 - 44027154
Alignment:
Q  283 ttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaa 382  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||| ||  |||||| |||| | |||| | | ||| |||  |||||||  |||||||||| ||| ||    
T  44027404 ttaatgttttttatatcatgatcaaatataaatatgatttactgagaacgaatgattactgatcatagtttttgacttagacttaattgaatttttctaa 44027305  T
Q  383 taaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| | ||||  || |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  44027304 taaacatgattaggttaggaatgaataatcatttattagtgacattaggttaacgtgttt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggg 44027206  T
Q  483 attgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
     |||||| |  | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  44027205 gttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatttt 44027154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 33883171 - 33883114
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  33883171 tacgaacttaattttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 33883114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 604 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 5538749 - 5538693
Alignment:
Q  604 agtctcatctctccatatcttttctaaaca-aactttattttatgttatttactttt 659  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  5538749 agtctcatctctccatatattttccaaacatatctttattttctgttatttactttt 5538693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 753 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 12820688 - 12820638
Alignment:
Q  753 aattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaat 804  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12820688 aattttattacttcgatatattt-ttagcacacttgctaaaagtttatcaat 12820638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 14589561 - 14589526
Alignment:
Q  638 ttattttatgttatttactttttatgcacacgaacc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14589561 ttattttatgttatttactttttatgcacaccaacc 14589526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 5538591 - 5538535
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  5538591 tacgaactta-ttttattacttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaaatctatca 5538535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 754 - 803
Target Start/End: Original strand, 12583328 - 12583376
Alignment:
Q  754 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  12583328 attttattatttcgatacattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 12583376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 19139 - 19405
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19139 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 19236  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  19237 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 19336  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  19337 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagtttattagaccacctaaggaattaggg 19405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4167 - 3901
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4167 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 4070  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  4069 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 3970  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3969 tttgttagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 3901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Original strand, 62261 - 62526
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  62261 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 62358  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  62359 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 62458  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  62459 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 62526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Original strand, 63615 - 63825
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||         ||||||| |||||||||    
T  63615 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctc--------ctgatcaaatataaaca 63704  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  63705 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 63803  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  63804 attagtgatattaggttaacgt 63825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 120; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 226 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 48769 - 48418
Alignment:
Q  226 tgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgt 325  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||  | | |||  ||    
T  48769 tgtgcaactctatttcatgt--gaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatatagtc-taaatcggt 48673  T
Q  326 gagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgat 425  Q
     ||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  48672 aagattgaatgactactgaccctagcttacaactttgacctaattgaattgttcaagtaaacaaggttagcctaggaatggataatcgtttatttgtgat 48573  T
Q  426 attaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaa 525  Q
    |||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||   || ||||||||||| ||||     
T  48572 attatgttaacattcataaaaccttcaaagaatattggatcacctaaggaattagggaccgtaatctgagaagagggtcctacgtcaagggattgattat 48473  T
Q  526 ggctattttagttaaccgtcgggaaacatgaggagtattcatagaaaataggtgc 580  Q
    | ||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||| |||| ||||||||||    
T  48472 gactattttagttgaccatcgtgaaactagagaaatatttataggaaataggtgc 48418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 48380 - 48343
Alignment:
Q  604 agtctcatctctccatatcttttctaaacaaactttat 641  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48380 agtctcatctctccatatattttctaaacaacctttat 48343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 119; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3613 - 3343
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3613 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttaga 3514  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  3513 cctaattgaattgttctaataaacatggttaacctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggtaaacatgcttaaaaccttcaaagaatattag 3414  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  3413 ctcacctaaggaattagggactgtaatatgagaagagggttctaactcaagggattgattaggactatttt 3343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 119; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 534
Target Start/End: Original strand, 30841 - 31155
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  30841 catgttgttgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 30938  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  30939 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatccttt 31038  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaaggg 516  Q
    ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |  | |||||||   ||| |||||||    
T  31039 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 31137  T
Q  517 atttattaaggctatttt 534  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  31138 attgattaagactatttt 31155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 215 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 57968 - 57712
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  57968 aaccatgttactgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataa 57871  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||| |||||||    
T  57870 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaaaatggttagtctagaaatggataatcg 57771  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaa 472  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  57770 tttattagtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagagtattagaccacctaa 57712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8597 - 8332
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  8597 aaccatgttgatgtgaaacactattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataa 8500  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  8499 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacttggttagtctaggaatggataatcg 8400  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    ||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8399 tttgtttgtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 8332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 215 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4187
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  4358 aaccatgttgatgtgaaacactattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaaagctttttatatcctaatcaaatataa 4261  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaac 387  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  4260 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaac 4187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1609
Alignment:
Q  367 aattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatc 466  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||| || || || ||||||| |    
T  1775 aattgaattattctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaacttttaaagattattagacc 1677  T
Q  467 acctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | | | |||| ||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  1676 acctaaggaattaggggttgtagtttgagaagacggtcctaagtcaagggattgattatgactatttt 1609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 745 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1304
Alignment:
Q  745 acgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1359 acgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 67903 - 67586
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  67903 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 67806  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| || ||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  67805 atatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatatataatcg 67706  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||| |||||||   ||| ||||    
T  67705 tttgttagtgatattaagttaacatgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggagttgtagtttaagaagagggtcctaactcaa 67607  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  67606 gggattgattaggactatttt 67586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5778 - 5511
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt--attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatata 312  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  | ||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5778 aaccatgttgctgtgaaaccctatttattgta--aatgacaatctagttttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatata 5681  T
Q  313 aacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatc 412  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  5680 aacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatc 5581  T
Q  413 gtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
     |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5580 ctttattagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggg 5511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 264 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 394 - 124
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  394 ttattcaattcaattgttcttattgctctttatatcctgatcaaatataaacatgaattagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttaga 295  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
      ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||| || || ||||||    
T  294 tataattgaattgttctgataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctaaaaaccttgaaagattattag 195  T
Q  464 atcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | | |||||  ||||||||  |||| | | | |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  194 accgcctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggatttattagggctatttt 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 482
Target Start/End: Original strand, 89515 - 89779
Alignment:
Q  217 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  89515 ccatgttgctgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaac 89612  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  89613 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 89712  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||| ||||||||  || |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  89713 tgttagtgatattaagttaacgtgcttcaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggg 89779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 754 - 803
Target Start/End: Original strand, 90080 - 90128
Alignment:
Q  754 attttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatcaa 803  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  90080 attttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatcaa 90128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Original strand, 292815 - 293032
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||  |||||||| |||||||    
T  292815 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgacgatagctttcgacttaga 292914  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  292915 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtataggaatggataatcctttattagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattag 293013  T
Q  464 atcacctaacgaattaggg 482  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  293014 accacctaaggaattaggg 293032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 215 - 534
Target Start/End: Original strand, 5096 - 5413
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  5096 aaccatgttgttgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgtttttaatgctttttatatccttatcaaatataa 5193  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||| || ||||    
T  5194 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattaaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggatgatcg 5293  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaa 513  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||   ||||||||    
T  5294 tttgttagtgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaa 5392  T
Q  514 gggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| |||| | |||||||    
T  5393 gggattgattaggactatttt 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Original strand, 29112 - 29331
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  29112 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 29209  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||  |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  29210 tgatttagtgagaacgaaagactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 29309  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  29310 attagtgatattaggttaacgt 29331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 388
Target Start/End: Original strand, 19042 - 19211
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  19042 catgttgctgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 19139  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaaca 388  Q
    ||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  19140 tgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaaca 19211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 98; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3387 - 3111
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  3387 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaaca 3290  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcac-------cttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaata 409  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||       | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  3289 tgatttagtgagaacgaatgactactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaatggata 3190  T
Q  410 atcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  3189 atcctttattagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaa 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 480
Target Start/End: Original strand, 197939 - 198154
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  197939 ttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaga 198038  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattag 463  Q
       ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||    
T  198039 cagaattgaattgttctaataaacaggaatagtctaggaatggataatcatttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattag 198137  T
Q  464 atcacctaacgaattag 480  Q
    | ||||||| |||||||    
T  198138 accacctaaggaattag 198154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 59058 - 58837
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  59058 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 58961  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaa--ttgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgt 414  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||||| |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |    
T  58960 tgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttagacctaattgaatttttttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 58861  T
Q  415 ttatctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  58860 ttattagtgatattaggttaacgt 58837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 264 - 438
Target Start/End: Original strand, 10201 - 10375
Alignment:
Q  264 ttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttaga 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  10201 ttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacaggatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttaga 10300  T
Q  364 actaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgt 438  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  10301 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtcaaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgt 10375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2451 - 2196
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagt-cttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  2451 aaccatgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctaatgtttattcaattcaattgttcttaatgctttttgcatcctgatcaaatataa 2354  T
Q  314 acatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcg 413  Q
    | |||| ||  |||||| |||| ||||||  || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||     
T  2353 atatgatttattgagaacgaattactactggccctagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcc 2254  T
Q  414 tttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaa 472  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  || |||||||| | || ||||||| |||||||    
T  2253 tttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaa 2196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 482
Target Start/End: Original strand, 19102 - 19358
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt--attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaac 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||| |||||| |    
T  19102 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacaatctagttttttattcaattcaattgttcataatgcttgttatatcttgatcaaatataa-c 19198  T
Q  316 atgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtt 415  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||        | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  19199 atgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgactgagacctaattgaattgttc-------tatggttagtctaggaatggataatcgtt 19291  T
Q  416 tatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    | |  ||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  19292 tgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattaggg 19358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 324 - 482
Target Start/End: Original strand, 14091 - 14248
Alignment:
Q  324 gtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtg 423  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||    
T  14091 gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtg 14190  T
Q  424 atattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  14191 atattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacggttattagatcacctaaggaattaggg 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 348 - 482
Target Start/End: Original strand, 6 - 140
Alignment:
Q  348 tagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaac 447  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6 tagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaac 105  T
Q  448 cttcaaggaatattagatcacctaacgaattaggg 482  Q
    |||||| || ||||||| |||||||  ||||||||    
T  106 cttcaaagattattagaccacctaagaaattaggg 140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 438
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1215
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||         ||||||| |||||||||    
T  1005 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctc--------ctgatcaaatataaaca 1094  T
Q  317 tgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttcaacttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgttt 416  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  1095 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatccttt 1193  T
Q  417 atctgtgatattaggttaacgt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  1194 attagtgatattaggttaacgt 1215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 534
Target Start/End: Original strand, 102 - 246
Alignment:
Q  390 ggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatcacctaacgaattagggattgtaa 489  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  ||||     
T  102 ggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtag 201  T
Q  490 tctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | | | ||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  202 tttgagaagagagtcttaactcaagggattgattaagactatttt 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 355
Target Start/End: Original strand, 1 - 91
Alignment:
Q  265 tattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaacatgaattcgtgagaatgaataactactcaccttagctttc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  1 tattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttc 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 365 - 534
Target Start/End: Original strand, 2385 - 2556
Alignment:
Q  365 ctaattgaattgttcaaataaacaaggtta--gtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatatta 462  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  2385 ctaactgaattgttctaataaacatggttatagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaacgttcaaagaatatta 2484  T
Q  463 gatcacctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||   ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  2485 gctcacctaaggaattagggactgtagtatgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactatttt 2556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 2798 - 2854
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  2798 tacgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 2854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 367 - 534
Target Start/End: Original strand, 248413 - 248579
Alignment:
Q  367 aattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||| |    
T  248413 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgatt-aaaccttcaaagattattagacc 248511  T
Q  467 acctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |   |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  248512 acctaaggaattaggggttgtagtttgtgaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactatttt 248579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 314
Target Start/End: Original strand, 24565 - 24663
Alignment:
Q  215 aaccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctagtctt-attcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24565 aaccatgttgttgtgaaactctatt--atttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 24662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 357 - 483
Target Start/End: Original strand, 6 - 131
Alignment:
Q  357 acttagaactaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaagga 456  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||    
T  6 acttagacctaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcctttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaga 104  T
Q  457 atattagatcacctaacgaattaggga 483  Q
     ||||||| |||||||  |||||||||    
T  105 ttattagaccacctaagcaattaggga 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 534
Target Start/End: Original strand, 27005 - 27170
Alignment:
Q  368 attgaattgttcaaataaacaaggttagtctatgaatgaataatcgtttatctgtgatattaggttaacgtttttaaaaccttcaaggaatattagatca 467  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||| | ||    
T  27005 attgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcgtttgttcgtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattacacca 27103  T
Q  468 cctaacgaattagggattgtaatctaataagagggagttaagtcaagggatttattaaggctatttt 534  Q
    ||||| |||||||||  |||| | | | |||||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  27104 cctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaatggattgattaggactatttt 27170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 744 - 802
Target Start/End: Original strand, 27422 - 27478
Alignment:
Q  744 tacgaacttaattttattacttcgatacatttgttagcgcacttgctaaaagtctatca 802  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27422 tacgaactta-ttttattacttcgatgcattt-ttagtacacttgctaaaagtctatca 27478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 317
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1591
Alignment:
Q  218 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatgtcaatctag-tcttattcaattcaattattcttaatgctttttatatactgatcacatataaaca 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1493 catgttgctgtgaaactctattt-at-tgtgtatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 1590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 623 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 7666 - 7616
Alignment:
Q  623 ttttctaaacaaactttattttatgttatttactttttatgcacacgaacc 673  Q
    ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7666 ttttcaaaactatctttattttctgttatttactttttatgcacaccaacc 7616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University