View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4833_high_1 (Length: 420)

Name: NF4833_high_1
Description: NF4833
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4833_high_1
NF4833_high_1
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (170-401)||(39242697-39242928)
chr7 (1-176)||(18440320-18440495)
chr7 (25-176)||(9169306-9169457)
chr7 (9-165)||(4221744-4221900)
chr7 (9-165)||(8003077-8003233)
chr7 (9-165)||(9094123-9094279)
chr7 (9-165)||(40043115-40043271)
chr7 (9-165)||(42875584-42875740)
chr7 (9-168)||(176623-176782)
chr7 (9-168)||(457997-458156)
chr7 (9-176)||(2706624-2706791)
chr7 (9-168)||(17951125-17951284)
chr7 (9-168)||(20988790-20988949)
chr7 (12-165)||(24743837-24743990)
chr7 (12-165)||(26391108-26391261)
chr7 (9-165)||(1997292-1997448)
chr7 (9-165)||(6868241-6868397)
chr7 (9-165)||(6878883-6879039)
chr7 (9-165)||(26654347-26654503)
chr7 (9-168)||(8627078-8627237)
chr7 (9-168)||(22098874-22099033)
chr7 (12-168)||(11014921-11015077)
chr7 (4-176)||(13175600-13175772)
chr7 (26-168)||(11004312-11004454)
chr7 (9-168)||(9442996-9443155)
chr7 (68-162)||(15705614-15705708)
chr7 (67-168)||(13879083-13879184)
chr7 (56-168)||(15466703-15466815)
chr7 (67-168)||(4413082-4413183)
chr7 (55-124)||(16311082-16311151)
chr7 (56-176)||(16408741-16408861)
chr7 (65-168)||(13028040-13028143)
chr7 (67-161)||(27870655-27870749)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-176)||(57745-57920)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-176)||(4417-4592)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (1-176)||(3842673-3842848)
chr8 (25-176)||(16746145-16746296)
chr8 (3-176)||(22148561-22148734)
chr8 (9-165)||(29075895-29076051)
chr8 (9-165)||(29086146-29086302)
chr8 (9-165)||(32078658-32078814)
chr8 (9-165)||(36087677-36087833)
chr8 (12-165)||(3349600-3349753)
chr8 (12-165)||(9367449-9367602)
chr8 (12-165)||(13689535-13689688)
chr8 (12-165)||(36302681-36302834)
chr8 (9-165)||(251563-251719)
chr8 (9-165)||(814664-814820)
chr8 (9-165)||(849937-850093)
chr8 (9-168)||(19138432-19138590)
chr8 (9-168)||(30315687-30315846)
chr8 (9-165)||(6160192-6160348)
chr8 (9-168)||(15781673-15781832)
chr8 (9-168)||(26120062-26120221)
chr8 (9-168)||(19428074-19428235)
chr8 (43-176)||(21297867-21298000)
chr8 (12-168)||(44490866-44491022)
chr8 (56-176)||(45569042-45569162)
chr8 (227-360)||(4617787-4617921)
chr8 (38-176)||(23792376-23792514)
chr8 (65-176)||(19942163-19942274)
chr8 (67-168)||(24834268-24834369)
chr8 (67-168)||(22672711-22672812)
chr8 (67-168)||(17287271-17287372)
chr8 (56-168)||(17015502-17015614)
chr8 (56-168)||(17541587-17541699)
chr8 (67-124)||(18676651-18676708)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (1-176)||(22307890-22308065)
chr6 (9-165)||(3671152-3671308)
chr6 (9-165)||(25985185-25985341)
chr6 (9-165)||(34808099-34808255)
chr6 (9-168)||(12864636-12864795)
chr6 (9-168)||(20030858-20031017)
chr6 (9-168)||(26874507-26874666)
chr6 (9-168)||(32962883-32963042)
chr6 (38-175)||(17609425-17609562)
chr6 (12-165)||(26035128-26035281)
chr6 (25-168)||(9113446-9113589)
chr6 (12-165)||(12717776-12717929)
chr6 (9-162)||(16958719-16958872)
chr6 (3-176)||(11205061-11205234)
chr6 (3-176)||(25725433-25725606)
chr6 (2-164)||(6157251-6157413)
chr6 (25-168)||(28252521-28252664)
chr6 (38-176)||(18554386-18554524)
chr6 (26-168)||(27412190-27412332)
chr6 (25-168)||(27505033-27505177)
chr6 (12-168)||(32301986-32302142)
chr6 (25-168)||(27503409-27503552)
chr6 (56-176)||(22385705-22385829)
chr6 (65-168)||(26043301-26043404)
chr6 (32-176)||(17063318-17063462)
chr6 (67-168)||(14054483-14054584)
chr6 (115-176)||(17609637-17609698)
chr6 (4-92)||(21127211-21127299)
chr6 (67-168)||(18434454-18434555)
chr6 (65-168)||(19469555-19469658)
chr6 (67-124)||(13434875-13434932)
chr6 (75-176)||(17446759-17446860)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (2-176)||(8741062-8741236)
chr3 (1-176)||(17282354-17282529)
chr3 (4-176)||(1063278-1063448)
chr3 (2-176)||(4432900-4433074)
chr3 (2-176)||(13262593-13262767)
chr3 (25-176)||(1785020-1785171)
chr3 (25-176)||(7795564-7795715)
chr3 (25-176)||(9381607-9381758)
chr3 (25-176)||(11207038-11207189)
chr3 (12-176)||(8996881-8997045)
chr3 (9-165)||(20674124-20674280)
chr3 (9-168)||(37884730-37884889)
chr3 (9-165)||(505097-505253)
chr3 (9-165)||(4753473-4753629)
chr3 (9-165)||(5537948-5538104)
chr3 (9-165)||(5580560-5580716)
chr3 (9-165)||(8784417-8784573)
chr3 (9-165)||(12287907-12288063)
chr3 (9-165)||(14475375-14475531)
chr3 (9-165)||(16391975-16392131)
chr3 (9-165)||(38204406-38204562)
chr3 (9-168)||(19788173-19788332)
chr3 (9-168)||(23767045-23767204)
chr3 (12-165)||(5866626-5866779)
chr3 (12-165)||(11273315-11273468)
chr3 (12-165)||(24384448-24384601)
chr3 (12-165)||(24669624-24669777)
chr3 (9-165)||(5520022-5520178)
chr3 (56-176)||(15848037-15848157)
chr3 (56-176)||(17016918-17017038)
chr3 (3-176)||(15652029-15652203)
chr3 (56-176)||(12753759-12753879)
chr3 (2-165)||(12238537-12238700)
chr3 (39-165)||(41693403-41693529)
chr3 (2-165)||(9982808-9982971)
chr3 (56-176)||(29934537-29934657)
chr3 (56-176)||(29983691-29983811)
chr3 (9-168)||(6491273-6491432)
chr3 (9-168)||(13373595-13373754)
chr3 (9-168)||(13384189-13384348)
chr3 (9-168)||(29462145-29462304)
chr3 (11-168)||(10627877-10628034)
chr3 (76-176)||(47541929-47542029)
chr3 (26-168)||(28315182-28315324)
chr3 (56-176)||(13147180-13147301)
chr3 (25-168)||(16396961-16397104)
chr3 (26-168)||(39381835-39381977)
chr3 (86-174)||(14312416-14312504)
chr3 (67-168)||(5211357-5211458)
chr3 (65-169)||(16031443-16031547)
chr3 (67-168)||(2560133-2560234)
chr3 (71-176)||(15960451-15960556)
chr3 (67-168)||(53057832-53057933)
chr3 (125-168)||(6183009-6183052)
chr3 (67-168)||(11188942-11189043)
chr3 (111-176)||(12410861-12410926)
chr3 (67-168)||(21639788-21639889)
chr3 (56-168)||(19886186-19886298)
chr3 (69-176)||(14078448-14078555)
chr3 (67-165)||(11221742-11221840)
chr3 (67-168)||(11222493-11222594)
chr3 (56-108)||(17240038-17240090)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (2-176)||(28722258-28722432)
chr2 (2-176)||(26878774-26878948)
chr2 (25-176)||(24415989-24416140)
chr2 (9-168)||(43092385-43092544)
chr2 (38-176)||(24802627-24802765)
chr2 (9-165)||(10276696-10276852)
chr2 (9-168)||(4219602-4219761)
chr2 (9-168)||(9898520-9898679)
chr2 (9-168)||(24328696-24328855)
chr2 (9-168)||(29253926-29254085)
chr2 (12-165)||(11396122-11396275)
chr2 (9-165)||(39171041-39171197)
chr2 (9-165)||(43354139-43354295)
chr2 (9-168)||(9763710-9763869)
chr2 (9-168)||(40250315-40250474)
chr2 (9-165)||(22915807-22915963)
chr2 (1-176)||(19303367-19303542)
chr2 (9-168)||(34791164-34791323)
chr2 (3-176)||(22773470-22773643)
chr2 (26-168)||(35262710-35262852)
chr2 (26-168)||(35273335-35273477)
chr2 (111-168)||(21162996-21163053)
chr2 (71-176)||(24843131-24843236)
chr2 (56-168)||(25828094-25828206)
chr2 (70-168)||(22782685-22782783)
chr2 (69-168)||(22257134-22257233)
chr2 (71-129)||(20567201-20567259)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (1-147)||(13080-13226)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (2-176)||(17456357-17456531)
chr5 (2-176)||(20552858-20553032)
chr5 (25-176)||(21705008-21705159)
chr5 (25-176)||(24982454-24982605)
chr5 (25-176)||(34053026-34053177)
chr5 (25-176)||(23393475-23393626)
chr5 (9-168)||(1120954-1121113)
chr5 (9-168)||(27621824-27621983)
chr5 (9-168)||(39353546-39353705)
chr5 (9-168)||(43620946-43621105)
chr5 (9-165)||(6976856-6977012)
chr5 (9-165)||(9337004-9337160)
chr5 (9-165)||(14031092-14031248)
chr5 (9-165)||(22677166-22677322)
chr5 (9-165)||(23297327-23297483)
chr5 (9-165)||(23363160-23363316)
chr5 (9-165)||(24568138-24568294)
chr5 (9-165)||(24826530-24826686)
chr5 (9-165)||(34772959-34773115)
chr5 (9-165)||(35216553-35216709)
chr5 (9-165)||(36592172-36592328)
chr5 (9-165)||(37739622-37739778)
chr5 (9-168)||(5300194-5300353)
chr5 (9-168)||(31834530-31834689)
chr5 (9-168)||(40391408-40391567)
chr5 (2-168)||(19465015-19465181)
chr5 (12-165)||(14456667-14456820)
chr5 (12-165)||(14567708-14567861)
chr5 (12-165)||(15741022-15741175)
chr5 (9-168)||(16002948-16003107)
chr5 (9-162)||(24808966-24809119)
chr5 (12-165)||(27461215-27461368)
chr5 (9-168)||(22147566-22147725)
chr5 (12-168)||(17608115-17608271)
chr5 (4-176)||(23487478-23487650)
chr5 (56-176)||(25112995-25113115)
chr5 (56-176)||(25172086-25172206)
chr5 (41-176)||(11209077-11209212)
chr5 (25-168)||(31419731-31419874)
chr5 (12-168)||(17719971-17720127)
chr5 (12-168)||(31349587-31349743)
chr5 (12-168)||(36688751-36688907)
chr5 (38-176)||(13532912-13533050)
chr5 (26-168)||(23697847-23697989)
chr5 (26-168)||(27051889-27052031)
chr5 (26-168)||(30237078-30237220)
chr5 (26-168)||(42043847-42043989)
chr5 (72-165)||(39500542-39500635)
chr5 (56-168)||(31144398-31144510)
chr5 (67-168)||(26764402-26764503)
chr5 (56-168)||(26783332-26783444)
chr5 (56-176)||(21200099-21200219)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (25-176)||(8751-8902)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (25-176)||(33889-34040)
scaffold0047 (9-168)||(41418-41577)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (25-176)||(14837055-14837206)
chr4 (25-176)||(16316484-16316635)
chr4 (14-176)||(3389605-3389767)
chr4 (9-168)||(19945269-19945428)
chr4 (9-168)||(27815877-27816036)
chr4 (9-165)||(18131180-18131336)
chr4 (9-165)||(36028059-36028215)
chr4 (9-165)||(55746183-55746339)
chr4 (9-168)||(460328-460487)
chr4 (9-168)||(22006182-22006341)
chr4 (9-168)||(27175839-27175998)
chr4 (9-168)||(30927424-30927583)
chr4 (12-165)||(10741532-10741685)
chr4 (12-165)||(10955301-10955454)
chr4 (12-165)||(27666341-27666494)
chr4 (4-176)||(14711749-14711921)
chr4 (9-165)||(16265633-16265789)
chr4 (9-168)||(14844583-14844742)
chr4 (9-168)||(17927864-17928023)
chr4 (9-168)||(40455291-40455450)
chr4 (2-165)||(5021904-5022067)
chr4 (38-176)||(16820318-16820456)
chr4 (12-168)||(18753424-18753580)
chr4 (26-168)||(49517302-49517444)
chr4 (25-168)||(18065739-18065882)
chr4 (97-174)||(11470428-11470505)
chr4 (67-168)||(17246516-17246617)
chr4 (111-165)||(4988828-4988882)
chr4 (56-132)||(10662242-10662318)
chr4 (56-132)||(10876387-10876463)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (25-168)||(7690454-7690597)
chr1 (9-168)||(5640679-5640838)
chr1 (9-165)||(3181297-3181453)
chr1 (9-165)||(5842900-5843056)
chr1 (9-165)||(7516980-7517136)
chr1 (9-165)||(38104781-38104937)
chr1 (9-168)||(4176995-4177154)
chr1 (9-168)||(12615292-12615451)
chr1 (11-168)||(21876841-21876998)
chr1 (12-165)||(47608908-47609061)
chr1 (9-168)||(12740221-12740380)
chr1 (9-165)||(19186901-19187058)
chr1 (9-165)||(38094155-38094312)
chr1 (4-176)||(22018249-22018421)
chr1 (26-168)||(35639024-35639166)
chr1 (26-168)||(36237416-36237558)
chr1 (26-168)||(51630178-51630320)
chr1 (266-401)||(45985681-45985817)
chr1 (95-176)||(20874280-20874361)
chr1 (67-176)||(23023802-23023911)
chr1 (244-401)||(43038358-43038516)
chr1 (71-176)||(18613845-18613950)
chr1 (67-168)||(22431148-22431249)
chr1 (67-168)||(21125404-21125505)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (9-165)||(37925-38081)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (9-168)||(44725-44884)
scaffold0022 (67-168)||(36377-36478)
scaffold0022 (67-168)||(134437-134538)
scaffold0022 (78-176)||(158070-158168)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (38-176)||(2289-2427)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-176)||(41357-41527)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (38-176)||(11329-11467)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (4-176)||(2024-2196)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (43-176)||(562-695)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (38-176)||(379-517)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (56-176)||(165719-165839)
scaffold0011 (67-124)||(66481-66538)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (38-176)||(545-683)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (25-168)||(52721-52864)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (66-176)||(11172-11282)
scaffold0161 (66-176)||(15845-15955)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (56-168)||(110653-110765)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (63-176)||(21997-22110)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (56-176)||(7600-7720)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (67-168)||(7766-7867)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (67-176)||(2128-2237)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (67-168)||(210346-210447)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (56-168)||(11557-11669)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (67-168)||(98631-98732)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (76-176)||(1264-1364)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (67-168)||(6787-6888)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (67-168)||(26713-26814)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (65-176)||(76191-76302)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (67-168)||(18006-18107)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (56-124)||(19706-19774)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (56-108)||(14110-14162)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 170 - 401
Target Start/End: Original strand, 39242697 - 39242928
Alignment:
Q  170 cttgaagctcttgaccggatgcacgagcctaaatggcagccatcaataaaggccaatagaaatactgtttgggaaaatggtatatcttcagagatccttt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39242697 cttgaagctcttgaccggatgcacgggcctaagtggcagccatcaataaaggccaatagaaatactgtttgggaaaatggtatatcttcagagatccttt 39242796  T
Q  270 tttggaatgttgaatatctggcagtgcttaatctgtaactaattttgttcattgactgtttcctctccttttgtagctcttgctgtcagagctaatattg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39242797 tttggaatgttgaatatctggcagtgcttaatctgtaactaattttgttcattgactgtttcctctccttttgtagctcttgctgtcagagctaatattg 39242896  T
Q  370 agtcacattgctgggagttacagcgtcgaaat 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39242897 agtcacattgctgggagttacagcgtcgaaat 39242928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18440495 - 18440320
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440495 cactacatccacaaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgataggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 18440396  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18440395 gagttttcatggtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattggatgaagaactatgggacattcttgaag 18440320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9169457 - 9169306
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9169457 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 9169358  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  9169357 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaag 9169306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4221900 - 4221744
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4221900 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 4221801  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4221800 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 4221744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 8003077 - 8003233
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8003077 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 8003176  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8003177 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 8003233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9094279 - 9094123
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9094279 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 9094180  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094179 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 9094123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 40043115 - 40043271
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40043115 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 40043214  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40043215 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 40043271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42875740 - 42875584
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42875740 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 42875641  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875640 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 42875584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 176782 - 176623
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  176782 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 176683  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  176682 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 176623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 457997 - 458156
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  457997 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 458096  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458097 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 458156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 2706624 - 2706791
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2706624 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 2706723  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    | ||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2706724 atggtggaagacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacattctggaag 2706791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 17951125 - 17951284
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17951125 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 17951224  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17951225 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 17951284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20988949 - 20988790
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| | |||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20988949 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgttgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 20988850  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20988849 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 20988790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24743990 - 24743837
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24743990 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 24743891  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24743890 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 24743837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 26391108 - 26391261
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26391108 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 26391207  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26391208 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 26391261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1997448 - 1997292
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1997448 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 1997349  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1997348 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatggaattggatgaagagctatggga 1997292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 6868241 - 6868397
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6868241 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 6868340  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6868341 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatggga 6868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 6878883 - 6879039
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6878883 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 6878982  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6878983 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatggga 6879039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 26654347 - 26654503
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26654347 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 26654446  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26654447 atggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatggga 26654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8627237 - 8627078
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8627237 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 8627138  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8627137 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgagattggatgaagagttatgggacat 8627078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22099033 - 22098874
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22099033 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaaactccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 22098934  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22098933 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 22098874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11015077 - 11014921
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  11015077 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 11014978  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11014977 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 11014921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 13175600 - 13175772
Alignment:
Q  4 tacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 103  Q
    ||||||||||| |||||  |||||   |||| | |||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13175600 tacatctacaagatacactaatgttggacatgattatggtactgctgacaagaaaacagattctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagag 13175699  T
Q  104 ttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  13175700 ttttcttggtggaaaaccaacatgtataactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaag 13175772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11004454 - 11004312
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  11004454 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 11004355  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11004354 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 11004312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9443155 - 9442996
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||| |||| ||||| |||||||  ||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9443155 ctacaaaatacacaagtatcaagcatgactacgatactgctgacaagaaaactgactttggaaaagctccaaagtttaatggagatccataagagttttc 9443056  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9443055 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctctgggacat 9442996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 162
Target Start/End: Original strand, 15705614 - 15705708
Alignment:
Q  68 ggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| || |||| |||||||||    
T  15705614 ggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatggagagctatg 15705708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13879184 - 13879083
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13879184 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctaaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatttcatgggtttagatgaagagctatgggac 13879085  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  13879084 at 13879083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15466815 - 15466703
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||    
T  15466815 aaatctgattatggaaaagttccaaagttcaatggagatcctaaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaag 15466716  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    | ||||| |||||    
T  15466715 aactatgagacat 15466703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 4413082 - 4413183
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||| | || |||||||| |||||||||    
T  4413082 tggaaatgttcctaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgagtttagatgaagaactatgggac 4413181  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  4413182 at 4413183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 16311082 - 16311151
Alignment:
Q  55 aaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  16311082 aaaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaac 16311151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16408861 - 16408741
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||  ||| |||||  ||  |||| |    
T  16408861 aaatccgactctggcaaagctccaaagtttaatggaaaccctgaagagttttcttggtggaaaacaaatatgtatagtcataacatggatttaaatgatg 16408762  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  16408761 agctttgggacatacttgaag 16408741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Original strand, 13028040 - 13028143
Alignment:
Q  65 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggg 164  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||||   |||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||    
T  13028040 tctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctaaagaattttcctagtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatggg 13028139  T
Q  165 acat 168  Q
    ||||    
T  13028140 acat 13028143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27870749 - 27870655
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctat 161  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||| | |||||  || ||||||| || |||||||| ||||    
T  27870749 tggaaaagttcctaagtttaatggagatccggaagaatttttctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagaactat 27870655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 57745 - 57920
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57745 cactacatctacaaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 57844  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57845 gagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 57920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4592 - 4417
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4592 cactacatctacaaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 4493  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4492 gagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 4417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3842848 - 3842673
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3842848 cactacatctacaaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 3842749  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3842748 gagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 3842673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16746296 - 16746145
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16746296 tgtcaaacatgactatggtactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 16746197  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16746196 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 16746145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 22148561 - 22148734
Alignment:
Q  3 ctacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 102  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |  ||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22148561 ctacatctacaaggtacaataatgttagtcatgactatggtacatctgacaagaaatcagattctggaaaaggtccaaagttcaatggagatccagaaga 22148660  T
Q  103 gttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22148661 attttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagagctgtgggatattcttgaag 22148734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29076051 - 29075895
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29076051 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 29075952  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29075951 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 29075895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29086302 - 29086146
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29086302 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 29086203  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086202 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 29086146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 32078658 - 32078814
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32078658 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 32078757  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078758 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 32078814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36087833 - 36087677
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36087833 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 36087734  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36087733 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 36087677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 3349600 - 3349753
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  3349600 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 3349699  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349700 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 3349753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9367602 - 9367449
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9367602 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 9367503  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367502 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 9367449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 13689535 - 13689688
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13689535 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 13689634  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689635 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 13689688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36302834 - 36302681
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  36302834 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 36302735  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36302734 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 36302681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 251719 - 251563
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  251719 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 251620  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  251619 atggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatggga 251563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 814820 - 814664
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  814820 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 814721  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  814720 atggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatggga 814664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 849937 - 850093
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  849937 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 850036  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  850037 atggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatggga 850093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19138590 - 19138432
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19138590 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 19138491  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19138490 atggtggaaaacaaatatgtacaact-tatcatgggattggatgaagagctatgggacat 19138432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 30315687 - 30315846
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30315687 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagattcagaagagttttc 30315786  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30315787 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaaaagctatgggacat 30315846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6160348 - 6160192
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  6160348 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccggaagagttttt 6160249  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160248 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 6160192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 15781673 - 15781832
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15781673 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaggctccaaggtttaatggagatccagaagagttttc 15781772  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15781773 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 15781832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26120221 - 26120062
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| | |||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26120221 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgttgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttc 26120122  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26120121 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 26120062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19428235 - 19428074
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactat--gatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttt 106  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19428235 ctacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatatgatactgctgacaagaaaacaaactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttt 19428136  T
Q  107 tcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19428135 tcatggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 19428074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21298000 - 21297867
Alignment:
Q  43 tacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatg 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21298000 tacagctgataagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagattctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatg 21297901  T
Q  143 ggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  21297900 ggattggatgatgagttgtgggatattcttgaag 21297867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44491022 - 44490866
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  44491022 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 44490923  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44490922 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 44490866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 45569042 - 45569162
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |    
T  45569042 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattaaatgatg 45569141  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  45569142 agctgtgggatattcttgaag 45569162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4617921 - 4617787
Alignment:
Q  227 agaaatactgtttgggaaaatggtatatcttcagagatccttttttggaatgttgaatatctggcagtgcttaatctgtaactaatttt-gttcattgac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||| |||    
T  4617921 agaaatactgtttgggaaaatggtatatctttgaagacactttcttggaatcttgaatatctggcagcgcttaatctgtgatgaatttttgttcatcgac 4617822  T
Q  326 tgtttcctctccttttgtagctcttgctgtcagag 360  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4617821 tgtttcctttctttttgtagctcttgctgtcagag 4617787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23792514 - 23792376
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23792514 tatggtacatctgacaagaaatcagatttttgaaaagctccaatgttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacatctaca 23792415  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  23792414 tcatgggtttagatgaagatctttgtgatattcttgaag 23792376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19942274 - 19942163
Alignment:
Q  65 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||| | |||| |||| ||||||  || |||||||| |||||||    
T  19942274 tctggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaataattttcttggtggaaaaccaacttctacaactatgtcatggatttagatgaagaactatggg 19942175  T
Q  165 acattcttgaag 176  Q
    |||| |||||||    
T  19942174 acatacttgaag 19942163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 24834268 - 24834369
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  24834268 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagagttatgggac 24834367  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  24834368 at 24834369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22672812 - 22672711
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| || || |||||||||||||||    
T  22672812 tggaaaagtttcaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagacgaagagctatgggac 22672713  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  22672712 at 22672711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 17287271 - 17287372
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  17287271 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagatctatgggac 17287370  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  17287371 at 17287372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17015614 - 17015502
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||   |||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||    
T  17015614 aaatccgactctggaaaagtttcaaagttcaatggagatcctgaaaaattttcctagtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaag 17015515  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    | |||||||||||    
T  17015514 aactatgggacat 17015502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 17541587 - 17541699
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||   |||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||    
T  17541587 aaatccgactctggaaaagtttcaaagttcaatggagatcctgaaaaattttcctagtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaag 17541686  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    | |||||||||||    
T  17541687 aactatgggacat 17541699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18676708 - 18676651
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  18676708 tggaaaagttccaaagttcaatgaagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaac 18676651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22308065 - 22307890
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22308065 cactacatctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatctagaa 22307966  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307965 gagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 22307890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3671308 - 3671152
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3671308 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 3671209  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671208 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 3671152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25985341 - 25985185
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25985341 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 25985242  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985241 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 25985185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 34808099 - 34808255
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34808099 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 34808198  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34808199 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 34808255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12864795 - 12864636
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12864795 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 12864696  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12864695 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 12864636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 20030858 - 20031017
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20030858 ctacaaaatacacaagcgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 20030957  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030958 atggtggaaaacaaatatgtacagttttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 20031017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26874666 - 26874507
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26874666 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 26874567  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26874566 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 26874507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 32962883 - 32963042
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32962883 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 32962982  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32962983 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 32963042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 175
Target Start/End: Original strand, 17609425 - 17609562
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17609425 tatggtacagctgataagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactaca 17609524  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaa 175  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  17609525 tcatgggattggatgaggagctgtgggatattcttgaa 17609562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26035281 - 26035128
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26035281 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 26035182  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035181 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 26035128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 9113446 - 9113589
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||     
T  9113446 tgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtagaaaacaaat 9113545  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113546 atgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 9113589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 12717776 - 12717929
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||  |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  12717776 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatattgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 12717875  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717876 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 12717929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16958872 - 16958719
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16958872 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 16958773  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatg 162  Q
    | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16958772 atggtggaaaactaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagctatg 16958719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11205234 - 11205061
Alignment:
Q  3 ctacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 102  Q
    |||||||||||| |||||  ||| | ||| || | |||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11205234 ctacatctacaagatacactaatataaaaaatgattatggtacaactgacaagaaatcaaattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 11205135  T
Q  103 gttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  11205134 gttttcttggtggaaaaccaacatgtatagctacatcatgggattagatgaggagctgtggaatattcttgaag 11205061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 25725433 - 25725606
Alignment:
Q  3 ctacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 102  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||  || | |||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25725433 ctacatctacaaggtacactaatgtcaactatgattatggtacgtctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 25725532  T
Q  103 gttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25725533 gttttcttggttgaaaaccaatatgtacagctacatcataggattagatgaagagctgtgggatattcttgaag 25725606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6157413 - 6157251
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    |||||||||  ||||||||  | |||||||||| |||||||||  |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6157413 actacatctttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgataatgctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagatccagaag 6157314  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggg 164  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6157313 agttttcatggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatggg 6157251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 28252521 - 28252664
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  28252521 tgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggaaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 28252620  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28252621 atgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 28252664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18554524 - 18554386
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18554524 tatggtacatctgacaagaaatcagatttttgaaaagctccaatgttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactaca 18554425  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  18554424 tcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaag 18554386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27412332 - 27412190
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  27412332 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 27412233  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27412232 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 27412190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27505177 - 27505033
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  27505177 tgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 27505078  T
Q  125 atgtacagctatatcat-gggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27505077 atgtatagctttatcatggggtttggatgaagagctatggtacat 27505033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 32301986 - 32302142
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| ||||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  32301986 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgacactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 32302085  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32302086 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 32302142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27503552 - 27503409
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  27503552 tgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 27503453  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27503452 atgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 27503409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22385829 - 22385705
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc----agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggat 151  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||     | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22385829 aaatcagattctggaaaagttcaaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtgcgtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggat 22385730  T
Q  152 gaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    || || || ||||| ||||||||||    
T  22385729 gatgaactgtgggatattcttgaag 22385705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26043404 - 26043301
Alignment:
Q  65 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggg 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26043404 tctggaaaagctccaaaattcaatggagatccagaagagttctcttggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatggg 26043305  T
Q  165 acat 168  Q
    ||||    
T  26043304 acat 26043301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17063462 - 17063318
Alignment:
Q  32 cataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtaca 131  Q
    ||||||||||| || ||||| |  ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||    
T  17063462 cataactatgacactgctgaaaagaaaacagagtttggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcttggtgaaaaacaaatatgtaca 17063363  T
Q  132 gctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
     ||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17063362 actacaacatgagattagatgaagagctgtgggacattcttgaag 17063318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 14054483 - 14054584
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14054483 tggaaaagttccaaaatttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 14054582  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  14054583 at 14054584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Original strand, 17609637 - 17609698
Alignment:
Q  115 gaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17609637 gaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattggatgaggagctgtgggatattcttgaag 17609698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21127299 - 21127211
Alignment:
Q  4 tacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggag 92  Q
    ||||||||||| |||||  |||||   |||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21127299 tacatctacaagatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctcaaaagttcaatggag 21127211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18434555 - 18434454
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18434555 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcttgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgggac 18434456  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  18434455 at 18434454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19469658 - 19469555
Alignment:
Q  65 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggg 164  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| | || |   || ||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  19469658 tctggtaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttttataatcatgtcatgggtttggatgaagaactatgag 19469559  T
Q  165 acat 168  Q
    ||||    
T  19469558 acat 19469555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13434932 - 13434875
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||    
T  13434932 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctaaagaattttcctggtggaagaccaac 13434875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 176
Target Start/End: Original strand, 17446759 - 17446860
Alignment:
Q  75 ctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttga 174  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  17446759 ctccaaggtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaagatgtatagtcacatcatgggtttagatgatgaactttgggatattcttga 17446858  T
Q  175 ag 176  Q
    ||    
T  17446859 ag 17446860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 8741062 - 8741236
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741062 actacatctacaaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatacagctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 8741161  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8741162 agttttcatggtggaaaaccaacatgtaaagctacatcatgggattggatgaagagctatgggatattcttgaag 8741236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 17282354 - 17282529
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17282354 cactacatttacaaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatccagaa 17282453  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17282454 gagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagttatgggacattcttgaag 17282529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1063448 - 1063278
Alignment:
Q  4 tacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 103  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063448 tacatcaacaaaatacaag--tgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 1063351  T
Q  104 ttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1063350 ttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaggagctatgggacattcttgaag 1063278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4433074 - 4432900
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4433074 actacttctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagacccagaag 4432975  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4432974 agttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 4432900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 13262593 - 13262767
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13262593 actacatctacaaaatacaatagtgtcaaacatgactacgatactgctgaaaggaaatcagattctgtaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 13262692  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13262693 agttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 13262767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 1785020 - 1785171
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  1785020 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcaaattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 1785119  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1785120 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 1785171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 7795564 - 7795715
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7795564 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 7795663  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  7795664 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaag 7795715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 9381607 - 9381758
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9381607 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 9381706  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  9381707 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaag 9381758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 11207038 - 11207189
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11207038 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 11207137  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11207138 atgtatagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 11207189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 8996881 - 8997045
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8996881 caaaatacaatagtgtcaaacatgagaatgatactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcagtggagatccagaagagttttcatg 8996980  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8996981 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaggagctatgggatattcttgaag 8997045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 20674124 - 20674280
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20674124 ctacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 20674223  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20674224 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 20674280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37884889 - 37884730
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37884889 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 37884790  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37884789 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 37884730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 505097 - 505253
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  505097 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 505196  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  505197 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 505253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4753629 - 4753473
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4753629 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 4753530  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4753529 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 4753473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 5537948 - 5538104
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5537948 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 5538047  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5538048 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 5538104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 5580560 - 5580716
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5580560 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 5580659  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580660 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 5580716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8784573 - 8784417
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8784573 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 8784474  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8784473 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 8784417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 12287907 - 12288063
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12287907 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 12288006  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288007 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 12288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14475531 - 14475375
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14475531 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 14475432  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475431 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 14475375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 16391975 - 16392131
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16391975 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 16392074  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16392075 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 16392131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38204562 - 38204406
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38204562 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 38204463  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204462 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 38204406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19788332 - 19788173
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19788332 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 19788233  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19788232 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 19788173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23767204 - 23767045
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23767204 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 23767105  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23767104 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 23767045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 5866626 - 5866779
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5866626 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 5866725  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866726 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 5866779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 11273315 - 11273468
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  11273315 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 11273414  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11273415 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 11273468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 24384448 - 24384601
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24384448 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 24384547  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384548 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 24384601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24669777 - 24669624
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24669777 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 24669678  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24669677 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 24669624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5520178 - 5520022
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5520178 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 5520079  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5520078 atggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatggga 5520022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15848157 - 15848037
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  15848157 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattggatgagg 15848058  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  15848057 agctgtgggatattcttgaag 15848037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17017038 - 17016918
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  17017038 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgagg 17016939  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  17016938 agctgtgggatattcttgaag 17016918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 15652029 - 15652203
Alignment:
Q  3 ctacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 102  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||| || ||| |||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652029 ctacatctactaggtacaataatgttaatcatgactatggtacatctgacaagaaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 15652128  T
Q  103 gttttc-agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15652129 gttttcttgtgtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagaactgtgggatattcttgaag 15652203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 12753759 - 12753879
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  12753759 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatgaagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgatg 12753858  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  12753859 agctgtgggatattcttgaag 12753879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 12238537 - 12238700
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    |||||||| | ||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12238537 actacatccataaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagacccagaag 12238636  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238637 agttttcatggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 12238700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41693529 - 41693403
Alignment:
Q  39 atgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatat 138  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||    
T  41693529 atgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaactaatatgtacagctttat 41693430  T
Q  139 catgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41693429 catgggattggatgaagagctatggga 41693403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 9982808 - 9982971
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgac-agaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    |||||||| | ||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9982808 actacatccataaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacggctgactagaaaa-cagactctggtaaagctccaaagtttaatggagacccagaa 9982906  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982907 gagttttcatggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 9982971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 29934537 - 29934657
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29934537 aaatctgattctggaaaagctccaaagttcaatggaaaaccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaag 29934636  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  29934637 agctgtgggatattcttgaag 29934657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 29983691 - 29983811
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29983691 aaatctgattctggaaaagctccaaagttcaatggaaaaccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaag 29983790  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  29983791 agctgtgggatattcttgaag 29983811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 6491273 - 6491432
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6491273 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttctc 6491372  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6491373 atggtggaaaactaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 6491432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 13373595 - 13373754
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  13373595 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatctggaagagttttc 13373694  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13373695 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 13373754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 13384189 - 13384348
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  13384189 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatctggaagagttttc 13384288  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13384289 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 13384348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 29462145 - 29462304
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29462145 ctacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagacccagaagagttttc 29462244  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29462245 atggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 29462304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 10627877 - 10628034
Alignment:
Q  11 acaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcag 110  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10627877 acaaaatacacaagtgtcaaacatgattatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttcat 10627976  T
Q  111 ggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10627977 ggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 10628034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47542029 - 47541929
Alignment:
Q  76 tccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaa 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47542029 tccaaagttcaatggagacccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaa 47541930  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  47541929 g 47541929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 28315182 - 28315324
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  28315182 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 28315281  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28315282 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 28315324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13147301 - 13147180
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcat-gggattggatgaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||     
T  13147301 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtgaaaaaccaacatgtacagctacatcatggggactagatgag 13147202  T
Q  155 gagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  13147201 gagctgtgggatattcttgaag 13147180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 16396961 - 16397104
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  16396961 tgtcaaacatgattatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctcttaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 16397060  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16397061 atgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 16397104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39381977 - 39381835
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  39381977 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 39381878  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39381877 tgtacaactttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 39381835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 174
Target Start/End: Original strand, 14312416 - 14312504
Alignment:
Q  86 aatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14312416 aatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctttatcatgggtttggatgaagaactatgggacattcttga 14312504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5211458 - 5211357
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||| | |||||  || ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  5211458 tggaaaagttccaaagttcaacggagatcctgaagaattttccttgtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatttgtttggatgaagagctatgggac 5211359  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  5211358 at 5211357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16031547 - 16031443
Alignment:
Q  65 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggg 164  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| | ||||||||  |||| || || |||||||| |||||||    
T  16031547 tctggtaaagttcctaagttcaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctacagctaggtcattggtttagatgaagaactatggg 16031448  T
Q  165 acatt 169  Q
    |||||    
T  16031447 acatt 16031443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2560234 - 2560133
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  2560234 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttttatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgagac 2560135  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  2560134 at 2560133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Original strand, 15960451 - 15960556
Alignment:
Q  71 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattc 170  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  15960451 aaagctccaaagtttaatggaaatcttgaagaattttcctggtggaaaaccaatatgtatagtcacatcatgggtttagatgatgaactatgggatattc 15960550  T
Q  171 ttgaag 176  Q
    ||||||    
T  15960551 ttgaag 15960556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 53057832 - 53057933
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||| |||||| | |||||  || ||||||| || |||||| | |||||||||    
T  53057832 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgtagaattttcctggtggaagaccaacttctacagtcatgtcatgggcttagatgaaaaactatgggac 53057931  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  53057932 at 53057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 168
Target Start/End: Original strand, 6183009 - 6183052
Alignment:
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6183009 atgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 6183052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11189043 - 11188942
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  11189043 tggaagagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactataggac 11188944  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  11188943 at 11188942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 12410861 - 12410926
Alignment:
Q  111 ggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||    
T  12410861 ggtggaaaaccaaaatgtatagttatatcatgggattagatgaagaattatgggatatccttgaag 12410926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21639889 - 21639788
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||| || | || ||  || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21639889 tggaaaagttcctaagtttaatggagatcttgaaaaattttccgggtggaaaacccacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagagctatgggac 21639790  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  21639789 at 21639788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 19886186 - 19886298
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||| | || |||||||    
T  19886186 aaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctggagaattttcctggtggaataccaacttctatagtcatgtcatgagtttagatgaag 19886285  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    | |||||||||||    
T  19886286 aactatgggacat 19886298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 14078448 - 14078555
Alignment:
Q  69 gaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||| ||  ||||||| ||    
T  14078448 gaaaagctccaaggtttaatggaaatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaatatgtatagtcacatcatcggattaaatgatgaattatgggatat 14078547  T
Q  169 tcttgaag 176  Q
    ||||||||    
T  14078548 tcttgaag 14078555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11221840 - 11221742
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || ||||||||  |||||||    
T  11221840 tggaaaagttccaaagttcaatggagatgctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaattatggga 11221742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11222594 - 11222493
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  11222594 tggaaaagtttcaaagttcaatggagatgctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaattatgggac 11222495  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  11222494 at 11222493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Original strand, 17240038 - 17240090
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17240038 aaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttc 17240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 28722258 - 28722432
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28722258 actacttctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatccagaag 28722357  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28722358 agttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 28722432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26878948 - 26878774
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878948 actacatctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactactgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 26878849  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26878848 agttttcatggtggaaaatcaatatgtacagctatatcatgagattggatgaagaactatgggatattcttgaag 26878774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 24415989 - 24416140
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24415989 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 24416088  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  24416089 atgtacagctatatcatgggattagatgatgaactatgggatattcttgaag 24416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43092544 - 43092385
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43092544 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 43092445  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092444 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 43092385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 24802627 - 24802765
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24802627 tatgttacagctgataagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctaca 24802726  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  24802727 tcatgggattggatgaggagctgtgggatattcttgaag 24802765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10276852 - 10276696
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10276852 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 10276753  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10276752 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 10276696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4219761 - 4219602
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4219761 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 4219662  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4219661 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 4219602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 9898520 - 9898679
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9898520 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 9898619  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9898620 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 9898679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 24328696 - 24328855
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24328696 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 24328795  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24328796 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 24328855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29254085 - 29253926
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29254085 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 29253986  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29253985 atggtggaaaacaaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 29253926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 11396122 - 11396275
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  11396122 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 11396221  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11396222 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 11396275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 39171041 - 39171197
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39171041 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggatatccagaagagttttc 39171140  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39171141 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 39171197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43354295 - 43354139
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43354295 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 43354196  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43354195 atggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatggga 43354139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 9763710 - 9763869
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9763710 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaacagttttc 9763809  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9763810 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 9763869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40250474 - 40250315
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40250474 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 40250375  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40250374 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgagattggatgaagagttatgggacat 40250315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 22915807 - 22915963
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22915807 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 22915906  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915907 atggtggaaaactaatatgtacaactttttcatgggattggatgaagagctatggga 22915963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 19303367 - 19303542
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |  ||| ||||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19303367 cactacatctacaagatacactaatgttagtcatgactatggcactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccgaagttcaatggagatccagaa 19303466  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  19303467 gagttttcttggtggaaaatcaacatgtacaactatatcatgggattagatgaggagttgtgggatattcttgaag 19303542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 34791164 - 34791323
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34791164 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttc 34791263  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34791264 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgagacat 34791323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22773643 - 22773470
Alignment:
Q  3 ctacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 102  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||   || | |||| |||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22773643 ctacatctacaagatacactaatgtcagctatgattatggtacgtctgacaagaaatcagattctagaaaagctccaaagttcaatggagatccagaaga 22773544  T
Q  103 gttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22773543 gttttcttggtgaaaaactaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagagctgtgggatattcttgaag 22773470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35262852 - 35262710
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  35262852 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 35262753  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35262752 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 35262710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35273477 - 35273335
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  35273477 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 35273378  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35273377 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 35273335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 168
Target Start/End: Original strand, 21162996 - 21163053
Alignment:
Q  111 ggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21162996 ggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 21163053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24843236 - 24843131
Alignment:
Q  71 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattc 170  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  24843236 aaagctccaaaattcaatggaaatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaatatgtagagttacatcatgggattagatgatgaactgtgggatattc 24843137  T
Q  171 ttgaag 176  Q
    | ||||    
T  24843136 tagaag 24843131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25828206 - 25828094
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||    
T  25828206 aaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatccagaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaag 25828107  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    | ||||| |||||    
T  25828106 aactatgagacat 25828094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Original strand, 22782685 - 22782783
Alignment:
Q  70 aaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| | || ||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22782685 aaaagttcctaagtttaatggagatcttgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctaaagtcatgtcatgggtttagatgaagagctatgggacat 22782783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22257233 - 22257134
Alignment:
Q  69 gaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  22257233 gaaaagttctaaagttcaatagagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacgtctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggacat 22257134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20567259 - 20567201
Alignment:
Q  71 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgta 129  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  20567259 aaagctccaaagtttaatggaaatcctgaagaattttcgtggtggaaaaccaatatgta 20567201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 13080 - 13226
Alignment:
Q  1 cactacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13080 cactacatctacaaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaa 13179  T
Q  101 gagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggatt 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13180 gagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggatt 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17456531 - 17456357
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17456531 actacttctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatgcagacccagaag 17456432  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17456431 agttttcatggtagaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 17456357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 20552858 - 20553032
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20552858 actacttctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatgagattctggaaaagctccgaagttcaatggagatccagaag 20552957  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  20552958 agttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggataaagaactatgggatattcttgaag 20553032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21705159 - 21705008
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  21705159 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 21705060  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21705059 atgtacaactatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 21705008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24982605 - 24982454
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24982605 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 24982506  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  24982505 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaag 24982454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 34053026 - 34053177
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  34053026 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaagtcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 34053125  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  34053126 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaag 34053177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 23393475 - 23393626
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23393475 tgtcaaacatgactatgatacaactgaaaggaaatcagactctggaaaagctctgaaattcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 23393574  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23393575 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 23393626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1121113 - 1120954
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1121113 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 1121014  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1121013 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 1120954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27621983 - 27621824
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27621983 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 27621884  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27621883 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 27621824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 39353546 - 39353705
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39353546 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 39353645  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353646 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 39353705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43621105 - 43620946
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43621105 ctacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgataatgctgacaagaaaacagattctggaaaagctctaaagtttaatggagatccagaagagttttc 43621006  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621005 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 43620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 6976856 - 6977012
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6976856 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 6976955  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976956 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 6977012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 9337004 - 9337160
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9337004 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 9337103  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9337104 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 9337160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 14031092 - 14031248
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14031092 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 14031191  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14031192 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 14031248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 22677166 - 22677322
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22677166 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 22677265  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22677266 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 22677322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 23297327 - 23297483
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23297327 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 23297426  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23297427 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 23297483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 23363160 - 23363316
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23363160 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 23363259  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23363260 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 23363316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 24568138 - 24568294
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24568138 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 24568237  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24568238 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 24568294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24826686 - 24826530
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24826686 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 24826587  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826586 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 24826530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 34772959 - 34773115
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34772959 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 34773058  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34773059 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 34773115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 35216553 - 35216709
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35216553 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 35216652  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216653 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 35216709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36592328 - 36592172
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36592328 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 36592229  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592228 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 36592172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37739778 - 37739622
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37739778 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 37739679  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37739678 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 37739622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5300353 - 5300194
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5300353 ctacaaaatacactagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 5300254  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300253 atggtggaaaataaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 5300194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 31834530 - 31834689
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31834530 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 31834629  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31834630 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 31834689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 40391408 - 40391567
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40391408 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 40391507  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40391508 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 40391567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 19465015 - 19465181
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||| || |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19465015 actacttctacaaaatacacaagtgtcaaatatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaag 19465114  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19465115 agttttcatggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggtttggatgaagagctatgtgacat 19465181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14456820 - 14456667
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14456820 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 14456721  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14456720 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 14456667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14567861 - 14567708
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14567861 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 14567762  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567761 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 14567708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 15741022 - 15741175
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15741022 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 15741121  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741122 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 15741175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16003107 - 16002948
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16003107 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 16003008  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16003007 atggtggaaaactaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 16002948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 24808966 - 24809119
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| || ||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24808966 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgacgatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 24809065  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatg 162  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24809066 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatg 24809119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 27461215 - 27461368
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27461215 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 27461314  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27461315 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatggga 27461368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 22147566 - 22147725
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22147566 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatattgctgacaagaaaacagactctggaaaacctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 22147665  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22147666 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 22147725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 17608115 - 17608271
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  17608115 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 17608214  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17608215 gtggaaaaccaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 17608271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23487650 - 23487478
Alignment:
Q  4 tacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 103  Q
    ||||||||||| |||||  |||||   |||| | |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23487650 tacatctacaagatacactaatgttgcacatgattatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatctagaagag 23487551  T
Q  104 ttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23487550 ttttcttgctggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaag 23487478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 25112995 - 25113115
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25112995 aaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttctcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgatg 25113094  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  25113095 agctgtgggatattcttgaag 25113115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 25172086 - 25172206
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25172086 aaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttctcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgatg 25172185  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  25172186 agctgtgggatattcttgaag 25172206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 11209077 - 11209212
Alignment:
Q  41 gatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatca 140  Q
    |||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11209077 gatacaactgacaagaaatcagactctagaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatca 11209176  T
Q  141 tgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  11209177 tgggattggatgatgaactgtgggatattcttgaag 11209212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 31419731 - 31419874
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  31419731 tgtcaaacatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctagtaaagctcaaaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 31419830  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31419831 atgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 31419874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 17719971 - 17720127
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  17719971 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 17720070  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17720071 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 17720127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 31349587 - 31349743
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  31349587 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 31349686  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31349687 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 31349743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 36688751 - 36688907
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  36688751 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 36688850  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36688851 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 36688907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13533050 - 13532912
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13533050 tatggtacatctgacaagaaatcagattctggaaaagcttcaaaattcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactaca 13532951  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  13532950 tcatgggattagatgaggagctgtgggatatccttgaag 13532912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 23697847 - 23697989
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  23697847 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 23697946  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23697947 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 23697989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27052031 - 27051889
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  27052031 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 27051932  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27051931 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 27051889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30237220 - 30237078
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  30237220 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 30237121  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30237120 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 30237078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 42043847 - 42043989
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  42043847 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 42043946  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42043947 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 42043989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39500635 - 39500542
Alignment:
Q  72 aagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39500635 aagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 39500542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 31144398 - 31144510
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| || |||||||    
T  31144398 aaatctgactctggaaaagttcctaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaag 31144497  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    | |||||||||||    
T  31144498 aactatgggacat 31144510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26764503 - 26764402
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||  | || ||||||||||||||||||    
T  26764503 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgatgaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatttgttttgatgaagagctatgggac 26764404  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  26764403 at 26764402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26783444 - 26783332
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||    
T  26783444 aaatctgactctagaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcatggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaag 26783345  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
      |||||||||||    
T  26783344 tactatgggacat 26783332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 21200099 - 21200219
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | || ||  || ||||||| || | |||||    
T  21200099 aaatctgactctggtaaagtcccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttaggtgaag 21200198  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    | || |||||||| |||||||    
T  21200199 aactctgggacatacttgaag 21200219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 8751 - 8902
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  8751 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 8850  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8851 atgtacaactatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaag 8902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 33889 - 34040
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  33889 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatctagaagagttttcatggtggaaaaccaat 33988  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33989 atgtacagctatatcatgggatttgatgaagaactatgggatattcttgaag 34040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 41418 - 41577
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41418 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccaaaagagttttc 41517  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41518 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 41577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 14837055 - 14837206
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  14837055 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatctagaagagttttcatggtggaaaaccaat 14837154  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14837155 atgtacagctatatcatgggatttgatgaagaactatgggatattcttgaag 14837206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16316635 - 16316484
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  16316635 tgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcgtggtggaaaaccaat 16316536  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16316535 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaag 16316484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3389767 - 3389605
Alignment:
Q  14 aaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggt 113  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3389767 aaatacaatagtgtcaaacatgactatgatattgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagtttttatggt 3389668  T
Q  114 ggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  3389667 ggaaaaccaatatgtacaactatatcatgggattggatgaagaactatgagataatcttgaag 3389605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 19945269 - 19945428
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19945269 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 19945368  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945369 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 19945428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 27815877 - 27816036
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27815877 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 27815976  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815977 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 27816036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 18131180 - 18131336
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18131180 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 18131279  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18131280 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 18131336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36028215 - 36028059
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36028215 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 36028116  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028115 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 36028059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 55746183 - 55746339
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55746183 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 55746282  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55746283 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 55746339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 460487 - 460328
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  460487 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 460388  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  460387 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 460328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22006341 - 22006182
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22006341 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 22006242  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22006241 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 22006182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27175998 - 27175839
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27175998 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 27175899  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27175898 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 27175839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 30927424 - 30927583
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30927424 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 30927523  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30927524 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 30927583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 10741532 - 10741685
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10741532 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 10741631  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741632 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 10741685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 10955301 - 10955454
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10955301 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 10955400  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955401 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 10955454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27666494 - 27666341
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27666494 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 27666395  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666394 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 27666341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 14711749 - 14711921
Alignment:
Q  4 tacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 103  Q
    ||||||||||| |||||  |||||   |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14711749 tacatctacaagatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 14711848  T
Q  104 ttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  14711849 ttttcttggtggaaaaccaatatgtacagctacatcatgggattagatgaggagttgtgggatattcttgaag 14711921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16265789 - 16265633
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16265789 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 16265690  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16265689 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgacgagctatggga 16265633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 14844583 - 14844742
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14844583 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccaaaagagttttc 14844682  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14844683 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 14844742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17928023 - 17927864
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17928023 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggacatccagaagagttttc 17927924  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17927923 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 17927864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 40455291 - 40455450
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40455291 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggacatccagaagagttttc 40455390  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40455391 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctataggacat 40455450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5022067 - 5021904
Alignment:
Q  2 actacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaag 101  Q
    |||||||| | ||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5022067 actacatccataaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagacccagaag 5021968  T
Q  102 agttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5021967 agttttcatggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 5021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 16820318 - 16820456
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16820318 tatggtacatctgacaagaaattagattctggaaaagctctaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctaca 16820417  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16820418 tcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaag 16820456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 18753424 - 18753580
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  18753424 caaaatacaagagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttg 18753523  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18753524 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 18753580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49517444 - 49517302
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  49517444 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 49517345  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49517344 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 49517302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18065882 - 18065739
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  18065882 tgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 18065783  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18065782 atgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 18065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11470505 - 11470428
Alignment:
Q  97 agaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttga 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11470505 agaagagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagaactatgggacattcttga 11470428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17246617 - 17246516
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||| ||    
T  17246617 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatggaac 17246518  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  17246517 at 17246516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 165
Target Start/End: Original strand, 4988828 - 4988882
Alignment:
Q  111 ggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4988828 ggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 4988882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Original strand, 10662242 - 10662318
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacag 132  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  10662242 aaatctgactctggaaaagctccaaagtttaacggagatcctaaagaattctcttggtggaaaaccaacatgtacag 10662318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Original strand, 10876387 - 10876463
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacag 132  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  10876387 aaatctgactctggaaaagctccaaagtttaacggagatcctaaagaattctcttggtggaaaaccaacatgtacag 10876463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 7690454 - 7690597
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7690454 tgtcaaacatgactatgatacagctgaaaggaaatcagactctggaaaagctccaaaattcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaat 7690553  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7690554 atgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggacat 7690597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 5640679 - 5640838
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5640679 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 5640778  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640779 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacat 5640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3181453 - 3181297
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3181453 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 3181354  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181353 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 3181297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5843056 - 5842900
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5843056 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 5842957  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5842956 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 5842900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7517136 - 7516980
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7517136 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 7517037  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517036 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 7516980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38104937 - 38104781
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38104937 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 38104838  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38104837 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 38104781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4177154 - 4176995
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4177154 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 4177055  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4177054 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 4176995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 12615292 - 12615451
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12615292 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 12615391  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12615392 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 12615451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21876998 - 21876841
Alignment:
Q  11 acaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcag 110  Q
    ||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21876998 acaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcat 21876899  T
Q  111 ggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21876898 ggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 21876841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 47608908 - 47609061
Alignment:
Q  12 caaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagg 111  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  47608908 caaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 47609007  T
Q  112 gtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47609008 gtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 47609061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12740380 - 12740221
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12740380 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatgcagaagagttttc 12740281  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12740280 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 12740221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19187058 - 19186901
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaa-tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagtttt 107  Q
    ||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19187058 ctacaaaataacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagtttt 19186959  T
Q  108 cagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19186958 catggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaatagctatggga 19186901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38094312 - 38094155
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgataca-gctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagtttt 107  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||  |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38094312 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatacttgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagtttt 38094213  T
Q  108 cagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094212 catggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 38094155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22018421 - 22018249
Alignment:
Q  4 tacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 103  Q
    ||||||||||| |||||  |||||   |||| | |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22018421 tacatctacaagatacactaatgttgcacatgattatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatctagaagag 22018322  T
Q  104 ttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  22018321 ttttcttgttggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggatttgatgatgagctgtgggatattcttgaag 22018249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 35639024 - 35639166
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  35639024 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 35639123  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35639124 tgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacat 35639166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 36237416 - 36237558
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  36237416 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 36237515  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36237516 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 36237558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 51630178 - 51630320
Alignment:
Q  26 gtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaaca 125  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  51630178 gtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaactaata 51630277  T
Q  126 tgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51630278 tgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacat 51630320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 45985681 - 45985817
Alignment:
Q  266 cttttttggaatgttgaatatctggcagtgcttaatctgtaactaa-ttttgttcattgactgtttcctctccttttgtagctcttgctgtcagagctaa 364  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  45985681 cttttttggaatattgaatatctggcagcgcttaatctgtatctaatttttgttcatcgactgtttcctttctttttgtagctcttgctggcagagataa 45985780  T
Q  365 tattgagtcacattgctgggagttacagcgtcgaaat 401  Q
      ||||||||   |||  |||||||||||||| ||||    
T  45985781 gcttgagtcattatgcatggagttacagcgtcaaaat 45985817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 20874280 - 20874361
Alignment:
Q  95 ccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  20874280 ccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagagctgtgagatattcttgaag 20874361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23023911 - 23023802
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | ||||   || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  23023911 tggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacaatcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 23023812  T
Q  167 attcttgaag 176  Q
    || |||||||    
T  23023811 atacttgaag 23023802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43038516 - 43038358
Alignment:
Q  244 aaatggtatatcttcagagatccttttttggaatgttgaatatctggcagtgcttaatctgtaactaa-ttttgttcattgactgtttcctctccttttg 342  Q
    ||||||||||| || ||| |  |||||||| ||| || ||||  | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | |||||    
T  43038516 aaatggtatatttttagataaacttttttgaaatcttaaatacattgcagcccttaatctgtaactaatttttgttcattgactgcttcattcctttttg 43038417  T
Q  343 tagctcttgctgtcagagctaatattgagtcacattgctgggagttacagcgtcgaaat 401  Q
    ||||| |||| ||||||| |||  |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  43038416 tagcttttgccgtcagagataagcttgagtcactatgcagggagttacagcgtcaaaat 43038358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18613950 - 18613845
Alignment:
Q  71 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattc 170  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  18613950 aaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctacaattatgtcatgggtttagatgaagaactatgggatattc 18613851  T
Q  171 ttgaag 176  Q
    ||||||    
T  18613850 ttgaag 18613845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 22431148 - 22431249
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | |||||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22431148 tggaaaagttccaaagttcaatgaagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctacagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgggac 22431247  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  22431248 at 22431249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 21125404 - 21125505
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | ||||   || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21125404 tggaaaagttcataagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacaatcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 21125503  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  21125504 at 21125505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 37925 - 38081
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37925 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 38024  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatggga 38081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 44725 - 44884
Alignment:
Q  9 ctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44725 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 44824  T
Q  109 agggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    | | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44825 atgttggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgagacat 44884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36478 - 36377
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  36478 tggaaaagttccaaagttcaatggatatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgggac 36379  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  36378 at 36377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 134538 - 134437
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  134538 tggaaaagttccaaagttcaatggatatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgggac 134439  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  134438 at 134437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 158168 - 158070
Alignment:
Q  78 caaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  158168 caaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggacatacttgaag 158070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 2289 - 2427
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2289 tatggtacagctgataagaaatcagattctagaaaatctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctaca 2388  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  2389 tcatgggattggatgatgagctgtgggatattcttgaag 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 41357 - 41527
Alignment:
Q  6 catctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagtt 105  Q
    ||||||||| |||||  |||||   |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41357 catctacaagatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacatgaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatacagaagagtt 41456  T
Q  106 ttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  41457 ttcttggtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaag 41527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 11329 - 11467
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11329 tatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacatctaca 11428  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  11429 tcatgggattagatgaggagctatgggatattcctgaag 11467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 2024 - 2196
Alignment:
Q  4 tacatctacaaaatacaacaatgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 103  Q
    ||||||||||| |||||  |||||   |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2024 tacatctacaagatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagag 2123  T
Q  104 ttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  2124 ttttcttggtggaaaaccaacatttacaactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcctgaag 2196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 695 - 562
Alignment:
Q  43 tacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatg 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  695 tacagctgataagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagattctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatg 596  T
Q  143 ggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  595 ggattggatgatgagttgtgggatattcttgaag 562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 379 - 517
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  379 tatggtacagctgataagaaatcagattctagcaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactaca 478  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  479 tcatgggaatagatgaagagctgtgggatattcttgaag 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 165719 - 165839
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  165719 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtggaaaaccgacatgtgcagctacatcatgggattagatgatg 165818  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  165819 agctgtgggatattcttgaag 165839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 66481 - 66538
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  66481 tggagaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaac 66538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 545 - 683
Alignment:
Q  38 tatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctata 137  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  545 tatggtacagctgataagaaatcagactctagaaaagctccaaagttcaatggagatcttgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctaca 644  T
Q  138 tcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaag 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  645 tcatgggactggatgatgagctgtgggatattattgaag 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 52721 - 52864
Alignment:
Q  25 tgtcaaacataactatgatacagctgacagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  52721 tgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactcttgtaaagctcttaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaacaaat 52820  T
Q  125 atgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacat 168  Q
    ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52821 atgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacat 52864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Original strand, 11172 - 11282
Alignment:
Q  66 ctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11172 ctggaaaagttcctaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacagctatgtcatggggttagatgaagaactatggga 11271  T
Q  166 cattcttgaag 176  Q
    ||| |||||||    
T  11272 catacttgaag 11282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15955
Alignment:
Q  66 ctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggga 165  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15845 ctggaaaagttcctaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacagctatgtcatggggttagatgaagaactatggga 15944  T
Q  166 cattcttgaag 176  Q
    ||| |||||||    
T  15945 catacttgaag 15955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 110653 - 110765
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||| | |||||  || ||||||| ||||||||||    
T  110653 aaatcagactatggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaatttttctggtggaaaaccaacttatacagtcatgtcatgggtttggatgaag 110752  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    |||||||||||||    
T  110753 agctatgggacat 110765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Original strand, 21997 - 22110
Alignment:
Q  63 attctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatg 162  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||| |||| ||||||| || |||||||| |||||    
T  21997 attctggaaaagttcttaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacatctatgtcatgggtttagatgaagaactatg 22096  T
Q  163 ggacattcttgaag 176  Q
     ||||| |||||||    
T  22097 agacatacttgaag 22110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7720 - 7600
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | || ||  || ||||||| || |||||||    
T  7720 aaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaag 7621  T
Q  156 agctatgggacattcttgaag 176  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  7620 aactatgggacatacttgaag 7600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 7766 - 7867
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | |||||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7766 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 7865  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  7866 at 7867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2237 - 2128
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2237 tggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 2138  T
Q  167 attcttgaag 176  Q
    || |||||||    
T  2137 atacttgaag 2128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 210447 - 210346
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  210447 tggaaaagttccaaagttcaacggagatcttgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaaaagctatgggac 210348  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  210347 at 210346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11669 - 11557
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaag 155  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||    
T  11669 aaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaag 11570  T
Q  156 agctatgggacat 168  Q
    | |||||||||||    
T  11569 aactatgggacat 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 98631 - 98732
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  98631 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgagac 98730  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  98731 at 98732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Original strand, 1264 - 1364
Alignment:
Q  76 tccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaa 175  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |||||||||||||| | ||||| ||| |||| || || |||||||| || |||||||||||||||    
T  1264 tccaaagtttaatggagatcttgaagatttctcttggtggaaaaccaacttctacagttatgtcattggtttagatgaagaactttgggacattcttgaa 1363  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  1364 g 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 6787 - 6888
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6787 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcttgaagaatttttctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 6886  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  6887 at 6888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 26713 - 26814
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||  || |||| || || |||||||| |||||||||    
T  26713 tggaaaagttcataagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcataggtttagatgaagaactatgggac 26812  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  26813 at 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 76302 - 76191
Alignment:
Q  65 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatggg 164  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||| || ||  |||||||||||||||||||||  || ||| |||| || |||||| | |  ||||    
T  76302 tctggcaaacctccaaagtttaatggagatcctaaagaattctcttggtggaaaaccaacatgtacaattacatcgtgggtttagatgaaaaaccgtggg 76203  T
Q  165 acattcttgaag 176  Q
    | ||||||||||    
T  76202 atattcttgaag 76191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18107 - 18006
Alignment:
Q  67 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaacatgtacagctatatcatgggattggatgaagagctatgggac 166  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||  || ||||||| || ||||| || |||||||||    
T  18107 tggaaaagttacaaagttgaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgatgaactatgggac 18008  T
Q  167 at 168  Q
    ||    
T  18007 at 18006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Original strand, 19706 - 19774
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcagggtggaaaaccaac 124  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||||    
T  19706 aaatctgactctggaaaagttccaaagttcaaaggagatcctgaagaatttttctggtggaagaccaac 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14162 - 14110
Alignment:
Q  56 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 108  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14162 aaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttc 14110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University