View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4843-Insertion-3 (Length: 818)

Name: NF4843-Insertion-3
Description: NF4843
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4843-Insertion-3
NF4843-Insertion-3
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (7-818)||(4313930-4314739)
chr2 (7-808)||(4253746-4254546)
chr2 (7-478)||(4305405-4305877)
chr2 (7-642)||(4246628-4247263)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (7-814)||(41933190-41933995)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (12-781)||(34802043-34802810)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (276-555)||(6059613-6059901)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 720; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 720; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 4314739 - 4313930
Alignment:
Q  7 aaaactggctggaaagaagttcttaattgttttggatgatgtttggaccgaggattatgacgcttggaattcacttttaagacctcttcatgatggcacc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314739 aaaactggctggaaagaagttcttaattgttttggatgatgtttggaccgaggattatgacgcttggaattcacttttaagacctcttcatgatggcacc 4314640  T
Q  107 aggggaagtaaaattcttgtaacaacccgaagtaaaaa-gttgcttctatggtacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgatgaagatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314639 aggggaagtaaaattcttgtaacaacccgaagtaaaaaagttgcttgtatggtacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgatgaagatt 4314540  T
Q  206 gttggtcagtgtttggaagtcatgcatgcctttctccaaaagaatacactgagaatatggatctccaaataattggcaaagagattgctagaaaatgtaa 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314539 gttggtcagtgtttggaaatcatgcatgcctttctccaaaagaatacactgagaatatggatcttcaaataattggcaaagagattgctagaaaatgtaa 4314440  T
Q  306 gggattacctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaataatatactaaatagtaacatttgggaaaat 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314439 gggattgcctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaataatatactaaatagtaacatttgggaaaat 4314340  T
Q  406 gagagtaagatcattccagcactccgaattagttatcattatctccctccctatttgaaacgctgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattata 505  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4314339 gagagtaatatcattccagcactccgaattagttatcattatctctctccctatttgaaacgctgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattaca 4314240  T
Q  506 catttcgtaaagacaatttgatcttgttatggatggccgaaggtcttttaaaagtctcctaaaaatgggaagactttagaagaagttggtaatgaatatt 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314239 catttcgtaaagacaatttgatcttgttatggatggccgaagatctttt-aaagtctcctaaaaatgggaagactttagaagaagttggtaatgaatatt 4314141  T
Q  606 ttaatgacttagtttcaaggtcattttttcaatgttcagggaagtgagaacaagagnnnnnnnatgcatgacctagtgcatgatttggccacattgcttg 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4314140 ttaatgacttagtttcaaggtcattttttcaatgttca-ggaagtgagaacaagagttttgttatgcatgacctggtgcatgatttggccacattgctt- 4314043  T
Q  706 ggtggagaattctattacagagtagaagaactcagaaatgaaacaaatattggtaccaagactcgacatttatcatttaccacgttcattgatccaatct 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314042 ggtggagaattctattacagagtagaagaactcggaaatgaaacaaatattggtaccaagactcgacatttatcatttaccacgttcattgatccaatct 4313943  T
Q  806 tgggaaactatga 818  Q
    |||||||||||||    
T  4313942 tgggaaactatga 4313930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 808
Target Start/End: Original strand, 4253746 - 4254546
Alignment:
Q  7 aaaactggctggaaagaagttcttaattgttttggatgatgtttggaccgaggattatgacgcttggaattcacttttaagacctcttcatgatggcacc 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||  | ||  |     
T  4253746 aaaactgactggaaaaaagttcttaattgttttggatgatgtatggaccgaggattatgacagctggaattctcttttaaggcctcttcaatacggggct 4253845  T
Q  107 aggggaagtaaaattcttgtaacaacccgaagt-aaaaagttgcttctatggtacaaacttttcaaggttact-ctcttgagcaattgtctgatgaagat 204  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||    
T  4253846 aagggaaataaaattcttgtaacaactcgtattgaaaaagttgcttctatggtccaaacttttcaaggttaattctcttgatgaattatctgatgaagat 4253945  T
Q  205 tgttggtcagtgtttggaagtcatgcatgcctttctccaaaagaatacactgagaatatggatctccaaataattggcaaagagattgctagaaaatgta 304  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4253946 tgttggtcggtgtttgcaaaccatgcatgcctttctccagaagaaaccactgagaacatggatctccaaaaaattggcaaagagattgttagaaaatgta 4254045  T
Q  305 agggattacctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaataatatactaaatagtaacatttgggaaaa 404  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4254046 agggattgcctttagcagcacagtcatttgggggcttgttgcgacgtaaatgtgacataagggactggaataatatactcaatagtaacatctgggaaaa 4254145  T
Q  405 tgagagtaagatcattccagcactccgaattagttatcattatctccctccctatttgaaacgctgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4254146 tgagagtaagatcattccagcactaaaaattagataccattatctccctccctgtttgaaacgttgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattac 4254245  T
Q  505 acatttcgtaaagacaatttgatcttgttatggatggccgaaggtcttttaaaagtctcctaaaaatgggaagactttagaagaagttggtaatgaatat 604  Q
      ||||  || |||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |  || | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||    
T  4254246 gaatttgatagagatgatttgatcttgttgtggatagctgaagatcttttaaga-ccttcaaaaaatgggaatactttagaagaagttggttatgggtat 4254344  T
Q  605 tttaatgacttagtttcaaggtcattttttcaatgttcagggaagtgagaacaagagnnnnnnnatgcatgacctagtgcatgatttggccacattgctt 704  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||       |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4254345 tttaatgacttagcttctagatcattttttcaacgttccgggaa-tgagaaccagagttttgtgatgcatgatctggtgcatgatttagcaacatttctt 4254443  T
Q  705 gggtggagaattctattacagagtagaagaactcagaaatgaaacaaatattggtaccaagactcgacatttatcatttaccacgttcattgatccaatc 804  Q
     | |||||||||||||| ||||  | |||| ||  | || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||    ||||| ||||||||||    
T  4254444 -gatggagaattctatttcagaacataagagcttgggaaagaaactaagattggtactaacactcgtcatttatcatttagtgagttcagtgatccaatc 4254542  T
Q  805 ttgg 808  Q
    ||||    
T  4254543 ttgg 4254546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4305877 - 4305405
Alignment:
Q  7 aaaactggctggaaagaagttcttaattgttttggatgatgtttggaccgaggattatgacgcttggaattcacttttaagacctcttcatgatggcacc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  |  |   |    
T  4305877 aaaactggccggaaagaagttcttaattgttttggatgacgtttggactgaggattatgatgcttggaaatcccttttaaggcctcttcagtacagtgac 4305778  T
Q  107 aggggaagtaaaattcttgtaacaacccgaagtaaaaa-gttgcttctatggtacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgatgaagatt 205  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4305777 aaaggaagtaaaattcttgtaacaacccgtattaaaaaagttgcttctatgctacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgatgaagatt 4305678  T
Q  206 gttggtcagtgtttggaagtcatgcatgcctttctccaaaagaatacactgagaatatggatctccaaataattggcaaagagattgctagaaaatgtaa 305  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| |||| | | || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  4305677 gttggtctgtgtttgaaaaccatgcatgcctttctctaaaacactccattgagaaaatggaactccaaaaaattggcaaagagattattagaaaatgtca 4305578  T
Q  306 gggattacctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaataatatactaaatagtaacatttgggaaaat 405  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4305577 aggattgcctttagcagcacaatcacttgggggcttattgcgaagtaaacgtgacatcaaggattgcaataatatactaactagtaacatttgggaaact 4305478  T
Q  406 gagagtaagatcattccagcactccgaattagttatcattatctccctccctatttgaaacgctgctttgttt 478  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4305477 gagagtaagattattcctgcactccaaatcagttaccattatctccctccctatttgaaatgttgctttgttt 4305405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 642
Target Start/End: Original strand, 4246628 - 4247263
Alignment:
Q  7 aaaactggctggaaagaagttcttaattgttttggatgatgtttggaccgaggattatgacgcttggaattcacttttaagacctcttcatgatggcacc 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||  ||||||||| ||| | |  ||||||||  | ||  |     
T  4246628 aaaactgactggaaaaaagttcttgattgttttggacgatgtttggatcaaggattataacagttggaattctcttatgatgcctcttcaatacggagct 4246727  T
Q  107 aggggaagtaaaattcttgtaacaacccgaagtaa-aaagttgcttctatggtacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgatgaagatt 205  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4246728 aagggaagcaaaattcttgtaacaacgcgtagtgataaagttgcttctatggtccaaacttttcaaggttattctcttgagaaattgtctgatgaagatt 4246827  T
Q  206 gttggtcagtgtttggaagtcatgcatgcctttctccaaaagaatacactgagaatatggatctccaaataattggcaaagagattgctagaaaatgtaa 305  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||  || ||| ||| ||||| | ||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  4246828 gttggtcagtgtttgcaatccatgcatgcctttcacccgaacaatccaccgagaagacggatctccaaaaaactggtagagagattgttagaaaatgtaa 4246927  T
Q  306 gggattacctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaataatatactaaatagtaacatttgggaaaat 405  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  4246928 gggattgccattagcagcaaaatcacttggaggccttttgcgaagtacacatgacatcagtgattggaataatctactacatagtaacatttgggaaact 4247027  T
Q  406 gagagtaagatcattccagcactccgaattagttatcattatctccctccctatttgaaacgctgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattata 505  Q
     |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||     
T  4247028 cagagtaagatcattccagcattgagaattagttatcaacatctacccccttatttgaaacgctgctttgtttactgttcattgtttcctaaggatcatg 4247127  T
Q  506 catttcgtaaagacaatttgatcttgttatggatggccgaaggtcttttaaaagtctcctaaaaatgggaagactttagaagaagttggtaatgaatatt 605  Q
     ||||   | |||  |  |||||||||| |||||||| |||| |||||| | || |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  4247128 aattttacagagaggaactgatcttgttgtggatggcagaagatctttt-acagcctccaaaaactggtaagactttagaagcagttggtaatgatcatt 4247226  T
Q  606 ttaatgacttagtttcaaggtcattttttcaatgttc 642  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  4247227 ttaatgatttagtttccatatcattttttcaacgttc 4247263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 814
Target Start/End: Original strand, 41933190 - 41933995
Alignment:
Q  7 aaaactggctggaaagaagttcttaattgttttggatgatgtttggaccgaggattatgacgcttggaattcacttttaagacctcttcatgatggcacc 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||    
T  41933190 aaaactgtccggaaagaagttcttaattgttttagatgatttctggaccgaggattatgatgcttggaattctcttttaaggcctcttcaatatggtacc 41933289  T
Q  107 aggggaagtaaaattcttgtaacaacccgaagtaaaa-agttgcttctatggtacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgatgaagatt 205  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41933290 aagggaagtaaaattcttgtaacaacccatattaaaaaagttgcttctatggtacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgaagaagatt 41933389  T
Q  206 gttggtcagtgtttggaagtcatgcatgcctttctccaaaagaatacactgagaatatggatctccaaataattggcaaagagattgctagaaaatgtaa 305  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||| || ||| ||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  41933390 gttggtccgtgtttgcaaaccatgcctgtcttcctccagaagaatcctttgagaaaatggatctccaaaaaattggcaaagagattgttagaaaatgtca 41933489  T
Q  306 gggattacctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaataatatactaaatagtaacatttgggaaaat 405  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41933490 gggattgcctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgtaacctcaaggactgggatgatatactaaatagtaacatttgggaaaat 41933589  T
Q  406 gagagtaagatcattccagcactccgaattagttatcattatctccctccctatttgaaacgctgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattata 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  41933590 gagagtaagatcattccagcactccgaatcagttatcattatctccttccttatttgaaacgttgctttgtttattgttccttatatcctaaggattatg 41933689  T
Q  506 catttcgtaaagacaatttgatcttgttatggatggccgaaggtcttttaaaagtctcctaaaaatgggaagactttagaagaagttggtaatgaatatt 605  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41933690 aatttcataaagacaatttgatcttgttatggatggccgaaggtctttt-acagcctaaaagaagtgggatgactttagaagaagttggtaatgaatatt 41933788  T
Q  606 ttaatgacttagtttcaaggtcattttttcaatgttcagggaagtgagaacaagagnnnnnnnatgcatgacctagtgcatgatttggccacattgcttg 705  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||       |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |     
T  41933789 ttaatgacttagcttcaaggtcattttttcaatgttc-tggaaatgagaacaaaagttttgtgatgcatgatctagtgcacgatttagccacgttgc-tc 41933886  T
Q  706 ggtggagaattctattacagagtagaagaactcagaaatgaaacaaatattggtaccaagactcgacatttatcatttaccacgttcattgatccaatct 805  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  41933887 ggtggggaattctattacagaacagaagaacttggaaatgaaacaaagattagtaccaagactcgtcatttatcatttagcacattcactgatccaatct 41933986  T
Q  806 tgggaaact 814  Q
     || |||||    
T  41933987 cggaaaact 41933995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 34802810 - 34802043
Alignment:
Q  12 tggctggaaagaagttcttaattgttttggatgatgtttggaccgaggattatgacgcttggaattcacttttaagacctcttcatgatggcaccagggg 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||   ||| |||| ||| ||||    || || |  ||    
T  34802810 tggcgggaaagaagttcttaattgtattggatgatgtctggactgaggattatgacagttggaatattcttataaggccttttcaatgcggaactaaagg 34802711  T
Q  112 aagtaaaattcttgtaacaacccgaagtaaaaa-gttgcttctatggtacaaacttttcaaggttactctcttgagcaattgtctgatgaagattgttgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  34802710 aagtaaaattcttgtaacaacctgtattgaaaatgttgctactatggtccaaacttttcaaccttaccatcttaagatattgtctgatgaagattgttgg 34802611  T
Q  211 tcagtgtttggaagtcatgcatgcctttctccaaaagaatacactgagaatatggatctccaaataattggcaaagagattgctagaaaatgtaagggat 310  Q
    ||||| || | ||  |||||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||| |||||| |   | ||| ||||||| ||||||||| ||||||     
T  34802610 tcagttttcgcaaaccatgcatgtctttctccagaaaaatcttctgagaatatggatatccaaaaatacgccaaggagattgttagaaaatgcaagggac 34802511  T
Q  311 tacctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaataatatactaaatagtaacatttgggaaaatgagag 410  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34802510 tgcctttagcagcacaatcactcgggggtttgttgcgaggtaaacgtgacatcagggattggaataatatactaaataataacatttgggaaaatgagtg 34802411  T
Q  411 taagatcattccagcactccgaattagttatcattatctccctccctatttgaaacgctgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattatacattt 510  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||  |||     
T  34802410 taagatcattccggcactatgaattagttatcattatctccctccctgcttgaagggatgctttgtttattattcactgtatcctaaggattatgaattc 34802311  T
Q  511 cgtaaagacaatttgatcttgttatggatggccgaaggtcttttaaaagtctcctaaaaatgggaagactttagaagaagttggtaatgaatattttaat 610  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  34802310 gataaagacgatttgatcttgttatggatggctgaagatctttt-acagcctccggaaattgggaagactttagaagaagttagttatgggtattttaat 34802212  T
Q  611 gacttagtttcaaggtcattttttcaatgttcagggaagtgagaacaagagnnnnnnnatgcatgacctagtgcatgatttggccacattgcttgggtgg 710  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||| |||| |||  ||||       |||||||| |||||||||||||| || || |||  | |||||    
T  34802211 gacttagcttcaagatcattttttcatcgttctggg-agtgggaatgagagttttgtgatgcatgatctagtgcatgatttagcaacgttg-ataggtgg 34802114  T
Q  711 agaattctattacagagtagaagaactcagaaatgaaacaaatattggtaccaagactcgacatttatcat 781  Q
    ||| |||||||  |||   ||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  34802113 agagttctattttagaacggaagaactagggaaagaaacaaagattggtaccaagactcgtcacttatcat 34802043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 6059901 - 6059613
Alignment:
Q  276 aattggcaaagagattgctagaaaatgtaagggattacctttagcagcacaatcacttgggggcttgttgcgaagtaaacgggacatcaatgactggaat 375  Q
    |||||||  |||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||  | |||    || |||| |    
T  6059901 aattggccgagagattgttaaaaagtgcaagggattgcctttagcagcacaatcacttggaggcattctgcgaagaaaacatggcatattggattggagt 6059802  T
Q  376 aatatactaaatagtaacatttgggaa---------aatgagagtaagatcattccagcactccgaattagttatcattatctccctccctatttgaaac 466  Q
    ||| |||| || ||| |||||||||||         | ||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  6059801 aatgtactgaagagtgacatttgggaattatctgaaagtgaaagtaaggtcattccggcattgagaattagttatcactatctccctccacatttgaaac 6059702  T
Q  467 gctgctttgtttattgttccttgtatcctaaagattatacatttcgtaaagacaatttgatcttgttatggatggccgaaggtctttta 555  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||  ||||   ||| |  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6059701 gctgttttgtttattgttcgctatatcccaaagattatgaatttgagaaaaatgatttaatcttgttgtggatggccgaagatctttta 6059613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University