View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4847-Insertion-2 (Length: 832)

Name: NF4847-Insertion-2
Description: NF4847
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4847-Insertion-2
NF4847-Insertion-2
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (261-832)||(46007027-46007599)
chr3 (259-761)||(42340162-42340664)
chr3 (255-672)||(53496920-53497338)
chr3 (251-758)||(55199313-55199821)
chr3 (8-176)||(46007632-46007801)
chr3 (203-470)||(34497201-34497468)
chr3 (251-470)||(27608780-27608999)
chr3 (255-670)||(2615383-2615789)
chr3 (199-471)||(31341550-31341826)
chr3 (251-470)||(11020057-11020276)
chr3 (259-512)||(647055-647303)
chr3 (203-403)||(55213483-55213683)
chr3 (199-385)||(26046864-26047050)
chr3 (203-428)||(19117549-19117774)
chr3 (200-407)||(2121235-2121442)
chr3 (332-470)||(24176861-24176999)
chr3 (251-428)||(27747560-27747739)
chr3 (472-647)||(647311-647485)
chr3 (291-391)||(1702806-1702906)
chr3 (557-665)||(48227308-48227415)
chr3 (507-640)||(27941129-27941261)
chr3 (203-361)||(48227568-48227726)
chr3 (617-673)||(1070900-1070956)
chr3 (199-338)||(24181749-24181892)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (200-761)||(16731732-16732294)
chr7 (200-761)||(17709866-17710428)
chr7 (199-713)||(9328427-9328941)
chr7 (199-764)||(29200781-29201340)
chr7 (251-665)||(30493487-30493901)
chr7 (255-764)||(22289037-22289547)
chr7 (203-715)||(17877253-17877756)
chr7 (258-665)||(16098385-16098793)
chr7 (198-761)||(1581414-1581980)
chr7 (203-471)||(3601742-3602010)
chr7 (199-378)||(24251622-24251798)
chr7 (204-470)||(3275125-3275392)
chr7 (203-383)||(33224389-33224569)
chr7 (203-378)||(44481270-44481445)
chr7 (215-428)||(30824336-30824548)
chr7 (199-348)||(24139224-24139373)
chr7 (199-419)||(47580017-47580236)
chr7 (259-401)||(35013719-35013861)
chr7 (389-468)||(44480893-44480972)
chr7 (374-450)||(24139142-24139218)
chr7 (199-240)||(35030483-35030524)
chr7 (527-615)||(34578433-34578520)
chr7 (684-751)||(11745952-11746019)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (200-761)||(49951112-49951674)
chr4 (199-761)||(2064652-2065215)
chr4 (259-696)||(37245737-37246175)
chr4 (206-740)||(29655498-29656032)
chr4 (199-761)||(32576873-32577434)
chr4 (199-674)||(51734797-51735272)
chr4 (204-761)||(21321326-21321887)
chr4 (200-674)||(41835138-41835612)
chr4 (259-741)||(18442032-18442513)
chr4 (204-761)||(28537613-28538173)
chr4 (199-713)||(49119225-49119727)
chr4 (199-691)||(28426065-28426545)
chr4 (203-758)||(51259358-51259915)
chr4 (251-730)||(56065459-56065943)
chr4 (322-713)||(55734856-55735248)
chr4 (199-525)||(26422427-26422755)
chr4 (373-764)||(43840305-43840698)
chr4 (200-470)||(44935908-44936178)
chr4 (199-468)||(24989759-24990027)
chr4 (205-468)||(47226163-47226424)
chr4 (251-374)||(23095401-23095524)
chr4 (251-402)||(8754340-8754491)
chr4 (290-342)||(43840241-43840293)
chr4 (203-277)||(6753948-6754022)
chr4 (258-342)||(51364614-51364696)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (199-761)||(477881-478444)
chr8 (200-670)||(13414913-13415384)
chr8 (251-758)||(7127025-7127533)
chr8 (251-761)||(8451000-8451511)
chr8 (293-672)||(23853820-23854200)
chr8 (200-579)||(40588556-40588937)
chr8 (251-469)||(33642641-33642859)
chr8 (203-471)||(598066-598334)
chr8 (251-461)||(11870364-11870574)
chr8 (251-580)||(185470-185798)
chr8 (251-440)||(3606614-3606805)
chr8 (203-519)||(9496822-9497135)
chr8 (621-761)||(40588963-40589103)
chr8 (203-378)||(36194450-36194625)
chr8 (301-641)||(37711998-37712333)
chr8 (199-240)||(32555096-32555137)
chr8 (263-339)||(8670203-8670279)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (276-761)||(28106938-28107424)
chr6 (198-672)||(15605818-15606293)
chr6 (255-760)||(14679959-14680468)
chr6 (251-628)||(15053052-15053430)
chr6 (251-450)||(34104342-34104541)
chr6 (255-566)||(19690760-19691073)
chr6 (203-440)||(11731498-11731735)
chr6 (214-407)||(21944468-21944661)
chr6 (279-615)||(29367960-29368296)
chr6 (367-579)||(30801984-30802198)
chr6 (612-751)||(30802209-30802348)
chr6 (254-463)||(27443029-27443240)
chr6 (311-391)||(3100415-3100496)
chr6 (609-764)||(11731885-11732037)
chr6 (204-280)||(3101261-3101336)
chr6 (199-240)||(19690328-19690369)
chr6 (531-579)||(11731825-11731873)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (203-761)||(88358-88917)
chr2 (203-715)||(34695733-34696244)
chr2 (203-715)||(34718145-34718656)
chr2 (203-761)||(12130467-12131026)
chr2 (199-471)||(9710045-9710317)
chr2 (203-465)||(26198778-26199040)
chr2 (289-674)||(44017233-44017619)
chr2 (251-469)||(11291941-11292157)
chr2 (200-470)||(1417816-1418077)
chr2 (203-469)||(13109701-13109964)
chr2 (203-468)||(14827173-14827437)
chr2 (203-408)||(35158671-35158879)
chr2 (199-394)||(25552312-25552507)
chr2 (256-408)||(18344176-18344328)
chr2 (490-672)||(18345605-18345785)
chr2 (251-482)||(22845613-22845833)
chr2 (490-578)||(9709910-9709998)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (203-761)||(20204754-20205313)
chr5 (200-674)||(25730694-25731169)
chr5 (213-665)||(12660211-12660664)
chr5 (199-713)||(22767098-22767597)
chr5 (258-672)||(4267987-4268402)
chr5 (203-672)||(27292322-27292791)
chr5 (203-761)||(41940565-41941125)
chr5 (251-764)||(27532783-27533298)
chr5 (251-764)||(8387882-8388396)
chr5 (303-670)||(26597386-26597754)
chr5 (258-761)||(15988633-15989137)
chr5 (200-656)||(11375348-11375796)
chr5 (255-443)||(23074950-23075138)
chr5 (251-627)||(34652138-34652507)
chr5 (502-764)||(30222929-30223190)
chr5 (203-471)||(32632605-32632872)
chr5 (199-395)||(30573502-30573698)
chr5 (289-466)||(30222755-30222930)
chr5 (203-361)||(26076480-26076639)
chr5 (435-657)||(37448028-37448251)
chr5 (616-673)||(16074623-16074680)
chr5 (200-240)||(3308171-3308211)
chr5 (297-396)||(31908319-31908418)
chr5 (199-240)||(26597291-26597332)
chr5 (535-628)||(42989360-42989452)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (204-671)||(25682540-25683008)
chr1 (200-722)||(5609177-5609700)
chr1 (203-758)||(48949553-48950109)
chr1 (203-672)||(44527141-44527612)
chr1 (199-758)||(51113117-51113677)
chr1 (251-761)||(4394958-4395468)
chr1 (199-674)||(36733580-36734052)
chr1 (251-670)||(52109344-52109763)
chr1 (199-648)||(48166149-48166588)
chr1 (203-665)||(16816626-16817091)
chr1 (258-761)||(24538308-24538790)
chr1 (203-546)||(44602765-44603105)
chr1 (203-471)||(2885313-2885585)
chr1 (251-459)||(21031251-21031459)
chr1 (251-388)||(14485183-14485320)
chr1 (204-329)||(5594266-5594391)
chr1 (259-361)||(17371648-17371750)
chr1 (257-402)||(38678979-38679124)
chr1 (253-373)||(4898499-4898619)
chr1 (203-240)||(23163431-23163468)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (251-696)||(50-500)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (257-462)||(147-352)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (251-403)||(20316-20468)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (254-463)||(44121-44332)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 261 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 46007599 - 46007027
Alignment:
Q  261 aaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaa 360  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  46007599 aaatacggtgattagcttaagaagatgccgccctagttaaagtatgagcaatcatgttcatttgtcttctaacaaactttaccctaaaattagaatgtaa 46007500  T
Q  361 aaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcg 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46007499 aaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattccgaatcgccatggcccggagacgatatagtttgcactagagtagttgaatcggactcg 46007400  T
Q  461 aagacaacccgcccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttc 560  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46007399 aagaca-cccgcccatctgttcatatcgacaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgtctccccctaaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttc 46007301  T
Q  561 gtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttc 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46007300 gtttgagcccgaataaattttccacgagagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaataatggaacacggcatccacattgcacttc 46007201  T
Q  661 aaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctctt 760  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  46007200 aaccacgtctcgctttgtttttcccaaactgagttgttatcctgcactttattttacctgtgctgcacaaccggtggtgagggctgtttataaacctatt 46007101  T
Q  761 gtcagcctaaccattaacttatttgataggaaacaaatatttttatatttgttg-aaatc-ttaaatttcatac 832  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  46007100 gccagcctaaccattaacttatttgataggaaacaaatatttttgtatttgttgaaaatctttaaatttcatac 46007027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 259 - 761
Target Start/End: Original strand, 42340162 - 42340664
Alignment:
Q  259 aaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgt 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  42340162 aaaaatacggtgactagccaaagaacaggccgccctatctaaagtgtgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 42340261  T
Q  359 aaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagact 458  Q
    ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| | || |||||||| ||||||||| || ||||    
T  42340262 aaagatagctgataaataatattagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcactaaagtagctgagtctgact 42340361  T
Q  459 cgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgcca 556  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||   ||||||||||| |||| |||| | ||| || |||||  || || | |||| ||| ||||||||||||    
T  42340362 cgaagacaactcggtcccatctgttcacatctgcaaagtgaatgacatcgagtagggctattgcctccccctccaacactgtcatatctgcccgctgcca 42340461  T
Q  557 tttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgca 656  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||| |  |||||||||||||    
T  42340462 ttttgtttgagcccgaataaattgtccacgagagtctct-aacacaacacgcaaaagatgtaagatggttgccgacatagaac-caacatccacattgca 42340559  T
Q  657 cttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacc 756  Q
    ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| | || |  |||||||| | |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  42340560 cttcaaccacgtctcgcacggtttctctcaaactgagttgttgccttagactctattctgcacgtgttgcacaaccggtggtgagggctgtttatgaatc 42340659  T
Q  757 tcttg 761  Q
    |||||    
T  42340660 tcttg 42340664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 255 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 53497338 - 53496920
Alignment:
Q  255 aataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  53497338 aataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcagccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttgga 53497239  T
Q  355 atgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatca 454  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| ||     
T  53497238 atgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcacaagagtagatgagtcg 53497139  T
Q  455 gactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgct 552  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||   ||   ||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||    
T  53497138 gactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctcaaaaactgtcacatttgtccgct 53497039  T
Q  553 gccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacat 652  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  53497038 gtcattttgtttgagcccgaataaattgcccacaagagtctct-aacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacggtcatggaacgcggcgtccacat 53496940  T
Q  653 tgcacttcaaccatgtctcg 672  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  53496939 tgcactttaaccatgactcg 53496920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 251 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 55199821 - 55199313
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | | |||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  55199821 taagaataaaaaatatggtcactagcgcaagaacaggccgccgtagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt 55199722  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  55199721 tggaatgtaaagatgactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatgacccgtagacgatagcgcttgcaccagagtagctga 55199622  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     || |||| ||||||||||||  ||||||||||   |   ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||  || |||| |||| |||||  |    
T  55199621 gtcggacttgaagacaacccggtcccatctgtttccaacaacaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttatc 55199522  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcc 648  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||  | ||  ||||| |||| |||||||    
T  55199521 agctgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctct-aacacaacacgcgaaagatgtaatatattgacggtcatgaaacgtggcatcc 55199423  T
Q  649 acattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtt 748  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |   |||| || |||||||||||| || | |||||| |||| | | |||| ||||||| || || |||| ||||||    
T  55199422 acattgcacgtcaaccacatctcacgcggtttctcccaaactgagttgttagcttgcactttattctgcatgtgttgcacaatcgatgatgagggctgtt 55199323  T
Q  749 tataaacctc 758  Q
    ||| ||||||    
T  55199322 tatgaacctc 55199313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46007801 - 46007632
Alignment:
Q  8 ctatcattgattcgttgttgtaggatccgtagttatattggagaagaaaaacgtgtattagttccattaatatagtttaattggtagttgcaacaacgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46007801 ctatcattgattcgttgttgtaggatccgtagttatattggagaagaaaaacgtgtattagttccattaatatagttcaattggtagttgcaacaacgtt 46007702  T
Q  108 catctgcaa-ggtttgaagttaaactcaaattttaattgcttgcatttaagatgtatgaacctaaccatt 176  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46007701 gatctgcaagggtttgtagttaaactcaaattttaattgcttgcatttaagatgtatgaacctaaccatt 46007632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 203 - 470
Target Start/End: Original strand, 34497201 - 34497468
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||          ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||      
T  34497201 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacatgaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagc 34497300  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34497301 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaggaacaatagcataaaattc 34497400  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc 470  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34497401 cgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 34497468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 251 - 470
Target Start/End: Original strand, 27608780 - 27608999
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |    
T  27608780 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgctctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagt 27608879  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  27608880 tggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctga 27608979  T
Q  451 atcagactcgaagacaaccc 470  Q
     || ||||||||||||||||    
T  27608980 gtcggactcgaagacaaccc 27608999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 255 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 2615789 - 2615383
Alignment:
Q  255 aataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgga 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||    
T  2615789 aataaaaattacggtgactagcccaagaacaggtcgccctagttaaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcatctcgaggttgga 2615690  T
Q  355 atgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatca 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |  |||||||| || | |||||||||||| ||| ||     
T  2615689 atgtaaaaataactgataaataatactaaaaacaatatcatagaattctgaatcaccatggcacaaagacgatagagctcgcactagagtagttgagtcg 2615590  T
Q  455 gactcgaagacaacccgcccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgc 554  Q
    || |  ||||||||         | |||  ||   ||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||  || |||| | || ||||||||||||||    
T  2615589 gattgaaagacaac--------attttcccatcagcaaagtgaacgacatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgcccgctgc 2615498  T
Q  555 catttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattg 654  Q
    || ||||||||||||||||| ||||  ||||   || |||| |||| ||| | ||||| || ||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  2615497 caattcgtttgagcccgaatgaattgcccacaaaagcctct-aacacaacgcacaaaaaatgtaatatggttatgatcatgaaacgcggtatccacattg 2615399  T
Q  655 cacttcaaccatgtct 670  Q
    || |||||||| ||||    
T  2615398 catttcaaccacgtct 2615383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 31341550 - 31341826
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |  ||||||  |    
T  31341550 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaaccggctgccctaact 31341649  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    || |||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  31341650 aaggtatgagcaaccatgtcagtttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatagtataaa 31341749  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagac----gatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg 471  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    |||| || ||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||    
T  31341750 attctgaatcaccatgacccggagacgtaggatagagcttgcactagagtagtggagtcagattcgaagataacccg 31341826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 251 - 470
Target Start/End: Original strand, 11020057 - 11020276
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | | || | ||||| |||| |||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||   ||  |    
T  11020057 taagaataaaaaatacagtgactagcccaaggataggttgtcctagctaaaatatgattaaccatgttcgcttgtctccaaacaaacttcacatcgaggt 11020156  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |  || |||| |||||| | |    
T  11020157 tgaaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcacagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagaccttacactggagtagttaa 11020256  T
Q  451 atcagactcgaagacaaccc 470  Q
     |||||||||||||||||||    
T  11020257 gtcagactcgaagacaaccc 11020276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 512
Target Start/End: Original strand, 647055 - 647303
Alignment:
Q  259 aaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgt 358  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||    
T  647055 aaaaatacggtgattagtccaagaacaggccgccctaactaaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgt 647154  T
Q  359 aaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagact 458  Q
    ||| ||||||||||       ||| |||||| | |||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  647155 aaagataactgata-------ctataaacaacaacatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcagact 647247  T
Q  459 cgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaag 512  Q
    |||||| ||| ||  | |||||||||| ||   ||||||||||| |||| ||||||    
T  647248 cgaagataactcggtcacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaag 647303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 55213683 - 55213483
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  55213683 caaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaagaataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaaccggccgccctagttaaag 55213584  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||| | ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  55213583 tataagcaaccatgttcgcttttctcctaacaaatttcacctcgaagttggaacgtaaagataactgatatataataccaaaaacaatagcatagaattc 55213484  T
Q  403 t 403  Q
    |    
T  55213483 t 55213483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26047050 - 26046864
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  26047050 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatatttaatataagaaggataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataagccgccctagct 26046951  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaa 385  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||   || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26046950 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacgtcacctcaaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaa 26046864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 428
Target Start/End: Original strand, 19117549 - 19117774
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||          ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | || ||||| |||      
T  19117549 caaagttaactattatcatcaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgacctagctaagc 19117648  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19117649 tatgagcaactatgttcgactgtctcctaacaaacttcacctcaaatttggaatgcaaaaataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattc 19117748  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgata 428  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  19117749 cgaatcaccatggcccggagacgata 19117774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2121442 - 2121235
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||          ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |   |||||||  ||    
T  2121442 aaacaaaattaactattatcatcaatcaaccaatgtgcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtaactaacccaagaacagaccgccctaacta 2121343  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2121342 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaactttacctcgaagttgagatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcacaaaa 2121243  T
Q  400 ttctgaat 407  Q
    || |||||    
T  2121242 ttatgaat 2121235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24176999 - 24176861
Alignment:
Q  332 acaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatag 431  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  24176999 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacttataaataatactagatacaatagcttagaattccgaatcaccatgacccagagacgatagag 24176900  T
Q  432 tttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc 470  Q
     |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  24176899 cttgcactagagtagttgtgtcagactcgaagacaaccc 24176861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 428
Target Start/End: Original strand, 27747560 - 27747739
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagat---gtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctga 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    |||  ||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  27747560 taagaatcaaaaatacggtgacta-cccaagaatagaccgtcaacctagataaagtatgagcaactatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcga 27747658  T
Q  348 aattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgata 428  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  27747659 agttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcatagaattttgaatcaccatggcccggagacgata 27747739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 647
Target Start/End: Original strand, 647311 - 647485
Alignment:
Q  472 cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 571  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||  || | || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  647311 cccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctgctgcctccccctccataactgtcatattagcccgctgccatttcgtttgagcccg 647410  T
Q  572 aataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatc 647  Q
     | |||||  | |  | ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  647411 gaaaaattgcctagagaagtctct-aacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacgctcatggaacgcggcatc 647485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 391
Target Start/End: Original strand, 1702806 - 1702906
Alignment:
Q  291 ccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaat 390  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||| |||    
T  1702806 ccctagttaaagtatgagtaatcatattcgcttgtcttctaacaaacttcaccttgaagttcgaatgtaaagataactagtaaataatactaaaaataat 1702905  T
Q  391 a 391  Q
    |    
T  1702906 a 1702906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 557 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 48227415 - 48227308
Alignment:
Q  557 tttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgca 656  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||  | ||| || ||||||||||||||| |    
T  48227415 tttcgtttaagcccgaataaattgcccgcgagagtctctaa-cacaacacgcaaaagatgtaacatggttacggtaatgaaatgcggcatccacattgta 48227317  T
Q  657 cttcaacca 665  Q
    |||||||||    
T  48227316 cttcaacca 48227308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 640
Target Start/End: Original strand, 27941129 - 27941261
Alignment:
Q  507 agtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacac 606  Q
    |||||| |||||| |||||  || |||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||    
T  27941129 agtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgtccgctgccattttgtttgagtccgaataaattgtcctcgagaatctct-aatacaacac 27941227  T
Q  607 gcaaaagatataagatggttacaatcatggaacg 640  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  27941228 gcaaaaaatataatatggttacgatcatgaaacg 27941261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48227726 - 48227568
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||          ||| ||||||||||| || || || |||||||| | |||||||||| |||||    
T  48227726 caaaattaactattatcattaatcaaccattgttcaatacaagaaagataaaaataaaaaatatggcgaataacccaagaacaagtcgccctagctaaag 48227627  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaa 361  Q
    |||||  || ||| || | ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||    
T  48227626 tatgaggaaccatatttgcttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgtaaa 48227568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 1070956 - 1070900
Alignment:
Q  617 taagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgc 673  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1070956 taagatggttacgatcatggaaggcaacatccacattgcagttcaaccatgtctcgc 1070900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24181892 - 24181749
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||          ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |    
T  24181892 aaaacaaagttaactattatgattaatcaatcaatgttcaatacaacaaggataaaaattaaaaatatggtgactaacccaagaacaggccgccctagct 24181793  T
Q  299 aaagtatg----aacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaact 338  Q
    ||||| ||    | ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24181792 aaagtgtgagtaaccaaccgtgttcatttgtctcctaacaaact 24181749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 200 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 16732294 - 16731732
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||    
T  16732294 aaacaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagcta 16732195  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  16732194 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaa 16732095  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||   ||||||||||  ||   || |||||    
T  16732094 ttctgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtga 16731995  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||||  || || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |    
T  16731994 atggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgggaatctct-a 16731896  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgc 697  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||     
T  16731895 acacaacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgt 16731796  T
Q  698 taccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  16731795 taccttgcactctattatgcatgtgttgcacaactggtggtgagtgttgtttatgaacctcttg 16731732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 200 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 17710428 - 17709866
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||    
T  17710428 aaacaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagcta 17710329  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  17710328 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaa 17710229  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||   ||||||||||  ||   || |||||    
T  17710228 ttctgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtga 17710129  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||||  || || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |    
T  17710128 atggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgggaatctct-a 17710030  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgc 697  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||     
T  17710029 acacaacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgt 17709930  T
Q  698 taccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  17709929 taccttgcactctattatgcatgtgttgcacaactggtggtgagtgttgtttatgaacctcttg 17709866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 199 - 713
Target Start/End: Original strand, 9328427 - 9328941
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | | || | ||| |    
T  9328427 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggacgtcgtagct 9328526  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  9328527 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaaacgcataga 9328626  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    |||||||||  ||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||| | ||   |||||||    
T  9328627 attctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactccaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtg 9328726  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| |||||  || ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||     
T  9328727 aatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatattttcccgttgccatttcgtttgagctcgaataaattgtcc-cgggaatctct- 9328824  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  9328825 aacacaacacgcaaatgatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttg 9328924  T
Q  697 ctaccctgcactctatt 713  Q
     |||| |||||||||||    
T  9328925 ttaccttgcactctatt 9328941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 199 - 764
Target Start/End: Original strand, 29200781 - 29201340
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| |    
T  29200781 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaga-taagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagct 29200879  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29200880 aaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataga 29200979  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |||||||    
T  29200980 attctgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgaagacaacccgtttccatctgttcacatcagcaaagtg 29201079  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttc--cacgggagtctc 594  Q
    |||| ||||||||||   | ||  |||||  || |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  |||  |||||||    
T  29201080 aatgacatcaagtaaacatgctacctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgtcatttcgtttgagcccgaataaactggccacacatgagtctc 29201179  T
Q  595 taaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagt 694  Q
    | || | |||| ||||||||||||| ||||        |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||| || |||||||||     
T  29201180 t-aatacaacatgcaaaagatataatatgg--------atggaaagcggcatcaacattgcacttcaaccacgtctcgtgcggtttctcccaaactgagc 29201270  T
Q  695 tgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttgtca 764  Q
    |  |||| |||||| |||| |  | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29201271 tattaccttgcactgtattttgtccgtgttgcacaaccgatggtgagggctgtttatgaacctcttgtca 29201340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 251 - 665
Target Start/End: Original strand, 30493487 - 30493901
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |    
T  30493487 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgaacaaccatgtttggttgtctcctaacaaacttcactatgaagt 30493586  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||  |||    
T  30493587 tgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcccgaagacgatagagcttgcactagagtaattga 30493686  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     || ||||||||||||||| |  | |||||||||||||   | ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||  || |||| |||| || ||| |    
T  30493687 gtcggactcgaagacaacctggtctcatctgttcatatcagctaagtgaacgacatcaagtaaggctactgcctccc-ctccaaaactgtcatacttgtc 30493785  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcc 648  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| | || | ||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||| |||||    
T  30493786 tgctgccatttcgtttgagcctgagtaaattgcccatgagaatttct-aacacaacacgcaaaatatgtaagttggttacagtcatggaatgcgacatcc 30493884  T
Q  649 acattgcacttcaacca 665  Q
    | ||||||||| |||||    
T  30493885 atattgcactttaacca 30493901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 255 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 22289547 - 22289037
Alignment:
Q  255 aataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgga 354  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||| | | |||||||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||    
T  22289547 aataaaaaatacggtaactagttcaagaacaggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacatcacctcgaagttgga 22289448  T
Q  355 atgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatca 454  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||| ||     
T  22289447 atgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcg 22289348  T
Q  455 gactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgct 552  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||||  |  | |||||||||||||||| |||||| | ||   |||||  || |||| |||| ||||||| || |    
T  22289347 gactcgaagacagcccggtcccatttgttcccaacggcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaaccacctccccctccaaaactgtcatatttgctcgtt 22289248  T
Q  553 gccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacat 652  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||| | ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  22289247 gccatttcgtctgagtccgaatgaattgcccacgggaatctct-aacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacat 22289149  T
Q  653 tgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttata 752  Q
    ||||||| ||||| ||||| |   | || || |||||||||||| || | ||||||||||| | || ||| |||||||||| || |||| | |||||||     
T  22289148 tgcacttaaaccacgtctcacgcggcttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccgatgatgagggttgtttatg 22289049  T
Q  753 aacctcttgtca 764  Q
    |||||| |||||    
T  22289048 aacctcctgtca 22289037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 203 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 17877756 - 17877253
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||  |||||    
T  17877756 caaagttaactattatcattaattaatcaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaataacatgccgtcctacctaaag 17877657  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  17877656 tatgagcaaccatggtcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaaattgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaatta 17877557  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
     ||||| ||||||||| || |||||| || ||||||          || ||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||   |||||||| |    
T  17877556 cgaatcaccatgacccataaacgatagagcttgcac----------gagtcagactcgaagacaacccgattccatctgttcgcatttgtaaagtgaagg 17877467  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    || |  |||||| |||||  |||||  || || | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||| | |||     
T  17877466 gccttgagtaaggctacttcctccccctccaatactgtcatatttccccgctgcgatttcgtttgagcacgaatgaacttcccatgggagtctat-aacg 17877368  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctac 700  Q
      |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || |||| ||||||| |||    
T  17877367 ccacacgcaacaaatgtaatatggttacaatcatggaacgcgacatccacattgcatttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaattgagttgttac 17877268  T
Q  701 cctgcactctattat 715  Q
    | ||||||| |||||    
T  17877267 cttgcactcgattat 17877253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 258 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 16098793 - 16098385
Alignment:
Q  258 aaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatg 357  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | | |||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16098793 aaaaaatacggtgactagctcatgaacaggccgccctagctaaaatatgagcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatg 16098694  T
Q  358 taaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagac 457  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  || ||| |||||||||| ||| || |||    
T  16098693 taaagataactgataactaatactagaaacaatatcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatggagcttgtactagagtagatgagtcggac 16098594  T
Q  458 tcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgcc 555  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||   ||   |||| |||| ||| || |||||| |||||  ||| |  || ||||||||| ||||||  || | ||    
T  16098593 tcgaagacaacccggtcccatttgttagcatcagcaaattgaagggcctctagtaaggctactacctctccctccaaaattgtcatatttgttcgtttcc 16098494  T
Q  556 atttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgc 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||  || ||||||||||    
T  16098493 atttcgtttgagcccgaataaattgcctatgggagtctct-aacacaacacgcaaaagaagtaatatggttacggtcatggaacgatgcgtccacattgc 16098395  T
Q  656 acttcaacca 665  Q
    ||||||||||    
T  16098394 acttcaacca 16098385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 198 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 1581980 - 1581414
Alignment:
Q  198 aaaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagt 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | || |||     
T  1581980 aaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaaaaataagcctccttagc 1581881  T
Q  298 taaagtatgaacaatc-atgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcata 396  Q
    |||| ||||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  1581880 taaactatgagcaccccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatattataaacaatggcata 1581781  T
Q  397 aaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaag 494  Q
     ||||  ||||| |||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||| |  ||||| || | ||||||  | |||||||||  ||   |||||    
T  1581780 gaatttcgaatcaccatggtccggagacgatagagtttgcattagtgtagatgagttggactccaatagaacccgatctcatctgttcgcatcagcaaag 1581681  T
Q  495 tgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaa-tcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtct 593  Q
    |||| ||| || |||||| ||||||  ||||   ||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||    
T  1581680 tgaagggcctcgagtaaggctactgcatcccccctcaaaaactataatatttgccctctgccatttcgtttgagcccggataaactatccgctggagtct 1581581  T
Q  594 ctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgag 693  Q
    |||  || |||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||||||    
T  1581580 ctag-cacaacacgcaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacatctcgctcagtttctcccaaactgag 1581482  T
Q  694 ttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    ||| |||  |||||| || | |    ||| || ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  1581481 ttgttacgttgcactatactttgttcgtgttgtacaaccgatggtgagggatgtttatgaacctcttg 1581414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 203 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3602010 - 3601742
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||| || |   |||||||| ||||     
T  3602010 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatgcaagaaggataagaataaaaaatacggtgacaagcccaacaacagcccgccctagctaaac 3601911  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3601910 tatgagcaaccatgttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaatttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataaaattc 3601811  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg 471  Q
    |||||| |||||  ||  |||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  3601810 tgaatcaccatggtccagagacgataaagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaaacaacccg 3601742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24251798 - 24251622
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| |    
T  24251798 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagga---taagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacaggccgccctagct 24251702  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataat 378  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24251701 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataat 24251622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3275392 - 3275125
Alignment:
Q  204 aaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag- 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||          ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| | |||     
T  3275392 aaagttaattattatcattaatcaaacactgtttaatataagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgccctagcttaagc 3275293  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  3275292 tatgatcaaccatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaatta 3275193  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc 470  Q
    ||||||  | || ||   ||| ||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3275192 tgaatcatcgtggcctagagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 3275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 383
Target Start/End: Original strand, 33224389 - 33224569
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||      
T  33224389 caaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacaagaatgataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagataagt 33224488  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctag 383  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  33224489 tatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactag 33224569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44481445 - 44481270
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  44481445 caaagttaactattatcattaatcaacccatgttcaatacaagatggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaag 44481346  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataat 378  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  44481345 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgtaaagataactggtaaataat 44481270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 30824336 - 30824548
Alignment:
Q  215 ttatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatca 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |  |||| |||| |||||| ||| ||    
T  30824336 ttatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaagataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaaca-gaccacctaattaaggtatgagcaacca 30824434  T
Q  315 tgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatg 414  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  30824435 tgttcgcttatctcctaacaaacttcacttcaaagttggaatgtaaagataactgataaataagactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatg 30824534  T
Q  415 acccgtagacgata 428  Q
    ||||  ||||||||    
T  30824535 acccagagacgata 30824548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24139373 - 24139224
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  24139373 aaaacaaaattaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccgccctagct 24139274  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaa 348  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24139273 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaa 24139224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47580236 - 47580017
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          | |||||||||| |||||||||||||||||||| | | || | ||  |    
T  47580236 aaaacaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgagaataaaaa-tacggtgactagcccaagaacaggccgtcttaact 47580138  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
     ||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||      
T  47580137 gaagaatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaccaaacttcacctcgaagttggaatataaagataactgataaataatactagatccaatagcatagg 47580038  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccg 419  Q
    | |||||||| ||||| ||||    
T  47580037 actctgaatcaccatggcccg 47580017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35013861 - 35013719
Alignment:
Q  259 aaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgt 358  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || | | ||| || | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  35013861 aaaaacacggcgactagccgaagaataggtcgccctagctaaagtacgagcgaccatatttgcttgtctcctaataaacttcaacttgaaattggaatgt 35013762  T
Q  359 aaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaatt 401  Q
    |||| ||||| |  |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  35013761 aaaactaacttagcaataatacaagaaataatagcctaaaatt 35013719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44480972 - 44480893
Alignment:
Q  389 atagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaac 468  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  44480972 atagcataaaattccgaatcaccatgacccggagacgataacgtttgcagtagagtagcggagtcggactcgaagacaac 44480893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24139218 - 24139142
Alignment:
Q  374 ataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  24139218 ataatactagaaacaatagcataaaatttcaaatcaacatgacccggagacgacagagcttgcactagagtagctga 24139142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 35030483 - 35030524
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaat 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35030483 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaat 35030524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 527 - 615
Target Start/End: Original strand, 34578433 - 34578520
Alignment:
Q  527 atcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagat 615  Q
    |||||||| |||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||  |||| ||||||||||||||    
T  34578433 atcaaaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtctgagcccgaataaattgcccacgggaatttc-gaacacaacacgcaaaagat 34578520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 684 - 751
Target Start/End: Original strand, 11745952 - 11746019
Alignment:
Q  684 tcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttat 751  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  11745952 tcaaactgagttgttactttgcactctattctgtctgtgttgcacaaccggtggtgagggttgtttat 11746019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 200 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 49951674 - 49951112
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||||| ||    
T  49951674 aaacagagttaactattatcattaatcaactaatgttcaatacaataaggataagaataaaaaatacaatgactagcccaagaacaggccgccctagcta 49951575  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  49951574 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaa 49951475  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgc--ccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| |||| || ||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||   ||||||||||  ||   ||||||||    
T  49951474 ttctgaatcaccacggcccgaagatgataaagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcaaagtga 49951375  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | ||| || |||||| |||||| |||||  || || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || |||||||    
T  49951374 agggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattggccgcgagaatctctaa 49951275  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgc 697  Q
     || | || ||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||     
T  49951274 -cacagcatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctccaaaactgagttgt 49951176  T
Q  698 taccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  49951175 taccttgcactctattatgcctgtgttgcacaactggtggtgagcgttgtttatgaacctcttg 49951112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 199 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 2065215 - 2064652
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |    
T  2065215 aaaacaaagttaattattatcatcaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgctaccctagct 2065116  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2065115 aaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatata 2065016  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    |||  ||||| |||||||| | |||||||| || |||  ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||  ||   |||||||    
T  2065015 atttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttgggctagagtagatgagtccgactcaaagacaacccgactccatctgttctcatcagcaaagtg 2064916  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    || ||| || |||||| |||||| |||||  |  || | |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  2064915 aagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatactgtcatatttgcccgctgtcattttgtttgagcccgaataaattatccgcgggagtctct- 2064817  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    |||| |||||||| | ||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  2064816 aacacaacacgcagaggatgtaatatggttacggtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagttg 2064717  T
Q  697 ctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
     |||| ||||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||  | ||||||  |||||||||    
T  2064716 ttaccttgcactctattttgtccgtgttgcacaaccgatggtgaaggttgtttacgaacctcttg 2064652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 259 - 696
Target Start/End: Original strand, 37245737 - 37246175
Alignment:
Q  259 aaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgt 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  37245737 aaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaaccatgttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 37245836  T
Q  359 aaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagact 458  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||| | || |||||||| |||||| || |||||||    
T  37245837 aaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccagagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagact 37245936  T
Q  459 cgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgcca 556  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  || |||| |||| |||||||||| | |||    
T  37245937 cgaagacaacccggtcccatctgttcacataagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgtttcca 37246036  T
Q  557 tttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgca 656  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||| | ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37246037 tttcgtttgtgcccgaataaatttccctcgggagtctct-aacacaacatgcagaggatgtaagacgattacggtcatggaacgcggcatccacattgca 37246135  T
Q  657 cttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||    
T  37246136 cttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 37246175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 206 - 740
Target Start/End: Original strand, 29655498 - 29656032
Alignment:
Q  206 agttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtat 305  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  29655498 agttaactattattattaatcaatcaatgttcaataaaagaatgataagaataaaaaatgcggtgattagccaaagaacaggtcgccctagctaaagtat 29655597  T
Q  306 gaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctga 405  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| | | |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  29655598 gagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagtggaaatgtaaagatagctgataaataatactagaaacaataacatagaattctga 29655697  T
Q  406 atcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggca 503  Q
    ||| ||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||   ||||||||||| ||    
T  29655698 atcaccatggcccgaagatgatagagcttgcactagagtagcgtagtcagactcgaagacaacacggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgaca 29655797  T
Q  504 tcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaa 603  Q
    || |||||| |||||| ||| |  || ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||    
T  29655798 tcgagtaaggctactgcctctccctccaaaacagtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacgggagcctct-aacacaa 29655896  T
Q  604 cacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccct 703  Q
    ||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |  ||||||||| |  |||| |    
T  29655897 ca-acaaaagatgtaagagggttacgatcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcactcggtttcttccaaactgagatattacctt 29655995  T
Q  704 gcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtga 740  Q
    ||| |||||||| ||  || |||||| ||||||||||    
T  29655996 gcattctattatgcccatgttgcacacccggtggtga 29656032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 199 - 761
Target Start/End: Original strand, 32576873 - 32577434
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||| |    
T  32576873 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaaacaaaaatacagtgactagcccaagaacaggctgccctagct 32576972  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  32576973 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatcgcataga 32577072  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc--gcccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||||  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||   ||||||     
T  32577073 attctgaatcaccatgtcccgctgacgattgagcttgcactagagtagcagagtcagactcgaagacaacccagtcccatatgtttacatcagcaaagta 32577172  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    ||| ||| | |||||| ||| |  |||||  || ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||     
T  32577173 aatagcagcgagtaaggctagtacctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaa-ttgccccgggaatctct- 32577270  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  32577271 aacacaacacgcaaaagatgtaagatggttaaggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctc-ctcggtttctcccaaactgagttg 32577369  T
Q  697 ctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
     |||| |||||| |||| |  | ||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| |||||||||    
T  32577370 ttaccttgcactatattctggccgtgttgcacaaacggtagtgacggatgtttatgaacctcttg 32577434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 199 - 674
Target Start/End: Original strand, 51734797 - 51735272
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| | | |||||||| |    
T  51734797 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaatcaaagatacggtaattagcccaagaacaggccgccctagct 51734896  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  51734897 aaagtatgagcaaccatgttcacttgtcacctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacagataaataatactagaaacaatatcataga 51734996  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg-cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||| |||||| |||||  ||  |||||||| || ||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| || || |||| |||| ||   ||||||||    
T  51734997 attatgaatcaccatggtccagagacgatagagcttgcactagagtagaggagcctgactcgaagacaactcgtcctatctattcacatcagcaaagtga 51735096  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||  || |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| |    
T  51735097 atggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcacgctgtcatttcgtttaagcccgaataaattgtcaacggaagtctct-a 51735195  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgct 674  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  51735196 acacaacacacaaaagatgtaagatggttacaatcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcgct 51735272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 204 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21321887 - 21321326
Alignment:
Q  204 aaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagt 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  21321887 aaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagt 21321788  T
Q  304 atgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaa-acaatagcataaaattc 402  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||  | ||| |||||| |||| |||||    
T  21321787 atgagcaaccatgatcgcttgtctcttaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatattggaacacaataacatagaattc 21321688  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatag--tttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaa 498  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||| ||   |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||   ||    ||||||||    
T  21321687 tgaatcaccatgaccctgagacaatagagcaattgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagaaaagtgaa 21321588  T
Q  499 tggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaa 598  Q
     ||| || |||||| ||| ||||||||  || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  21321587 gggcctcgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaatttcccgcgagagtctct-aa 21321489  T
Q  599 caaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgct 698  Q
     | |||| ||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||   ||| || ||||||| |||| |    
T  21321488 tacaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcaacatccacattgcacttcaaccacgtttcgctcgatttctcccaaactgtgttgtt 21321389  T
Q  699 accctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
     || ||||||||||||| |  ||| || ||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||    
T  21321388 gccttgcactctattatgctcgtgttgtacaaccggtagtgagggatgtttatgaacatcttg 21321326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 200 - 674
Target Start/End: Original strand, 41835138 - 41835612
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||          |||||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||  ||    
T  41835138 aaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgt-caatacaagaaagataagaataaaaaatatagtgactagcccaagaacaggccgccctatcta 41835236  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    || |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  41835237 aactatgaggaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagga 41835336  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||| ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||   ||   |||| |||    
T  41835337 ttccgaatcaccatggcccggagacgatagcgtttgcactagagtagatgaatcgaactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatccgcaaaatga 41835436  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | ||  || |||||| ||||||  ||||  || |||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |    
T  41835437 agggtctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgccagctgtcattttgtttgagcccgaataaattgtctgcgagagtctct-a 41835535  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgct 674  Q
    ||| |||||||||||| | ||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41835536 acacaacacgcaaaagttgtaatatggttacgttcaaggaacgtggcatccacattgcacttcaaccacgtctcgct 41835612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 259 - 741
Target Start/End: Original strand, 18442032 - 18442513
Alignment:
Q  259 aaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  18442032 aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaaatatgagcaaccattttcgtttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatat 18442131  T
Q  359 aaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagact 458  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||  |||    
T  18442132 aaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgggccaaagacgatatagcttgcact--agtagatgagtcgcact 18442229  T
Q  459 cgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgcca 556  Q
    |||| | ||||||   ||||||||||  |    ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||  || || | |||| ||||| |||||| |||    
T  18442230 cgaaaataacccggttccatctgttcgcaacagcaaagtgtagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgcttcca 18442329  T
Q  557 tttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgca 656  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||    
T  18442330 tttcgtttgagcccgaataaattgcccatgggagtctct-aacacaacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccgcattgca 18442428  T
Q  657 cttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgag 741  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| ||||    
T  18442429 cttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaacagagttgttaccttgcactctattttgtctgtattgcacaaccggtgatgag 18442513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 204 - 761
Target Start/End: Original strand, 28537613 - 28538173
Alignment:
Q  204 aaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaa--tacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaa 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||          |||||||||||||  || ||||||||| ||||| | | | |||||||| || |    
T  28537613 aaagttaactattatcattaatcaaccaatattcaatataagaaggataagaataaaaaaaatatggtgactagtccaaggacaggccgccctagctata 28537712  T
Q  302 g--tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
       ||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28537713 tactatgagcaaccatgttcgcttgtcttctaccaaacttcacctcgaagttggaatgtaatgataactgattaataatactagaaacaatagcatagaa 28537812  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    || |||||| ||||| |||  |||||||| || |||||||| ||||| ||| || |||| ||| ||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||    
T  28537813 ttttgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactaaagtagatgagtcggacttgaacacaacccggtcccatctgttcgcatcaacaaagtga 28537912  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | ||| || |||||| |||||| |||||  |||||   | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  28537913 agggcctcgagtaaggctactgcctccccctcaaac--tatcatattttcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgtgggagtctctaa 28538010  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgc 697  Q
     || ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| || |||||||| |||     
T  28538011 -cacaacacgcaaaatatgtaatatggttacgatcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacgtctcgttcggtttctcccaaactgaattgt 28538109  T
Q  698 taccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    |||| ||||||||| | | || ||| || |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  28538110 taccttgcactctactgtgcccgtgttgtacaatcggtggtgagtggtgtttatgaacctcttg 28538173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 199 - 713
Target Start/End: Original strand, 49119225 - 49119727
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||          ||||||| |||||||| |||||||||||||||  | | | || ||| |    
T  49119225 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccaccttagct 49119324  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  49119325 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcatata 49119424  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    ||||| |||  ||||| ||||  ||||||| || | ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||   |||||||    
T  49119425 attctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtg 49119524  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| |||||  || ||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||             ||| |||||     
T  49119525 aatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccgaa-------------ggaatctct- 49119610  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||    
T  49119611 aacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcgcttggtttatcccaaactgggttg 49119710  T
Q  697 ctaccctgcactctatt 713  Q
     |||| | |||||||||    
T  49119711 ttaccttacactctatt 49119727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 199 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 28426545 - 28426065
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||          ||||||| |||||||| |||||||||||||||  | | | || ||| |    
T  28426545 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccaccttagct 28426446  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  28426445 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcatata 28426346  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    ||||| |||  ||||| ||||  ||||||| || | ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||   |||||||    
T  28426345 attctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtg 28426246  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| |||||  || ||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||             ||| |||||     
T  28426245 aatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccgaa-------------ggaatctct- 28426160  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactg 691  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||    
T  28426159 aacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcgcttggtttatcccaaactg 28426065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 203 - 758
Target Start/End: Original strand, 51259358 - 51259915
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||      
T  51259358 caaagttaactattatcattaatcaaccagttttcaatacaaaaaggataataataaaaaatacggtgactagcccaaaaataggccgccctagctaagc 51259457  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51259458 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaataacataaaattc 51259557  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  || | ||| ||  |    |||||||||||    
T  51259558 tgaatcaccatggcccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacctggtccgaactgatcccaacagcaaagtgaatg 51259657  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtct-cccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaac 599  Q
     |||| |||||| | |||| || |||  || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||    
T  51259658 acatcgagtaaggcaactgcctcccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgagagtctct-aac 51259756  T
Q  600 aaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgcta 699  Q
    | ||||  | |||||| ||| ||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |   |||| || |||||||||||| ||    
T  51259757 acaacatacgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcagttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaaactgagttgtta 51259856  T
Q  700 ccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctc 758  Q
     | ||||||||||| | || ||| ||| ||| || || |||| | ||||||| ||||||    
T  51259857 gcttgcactctattctgcccgtgttgcgcaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 51259915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 251 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 56065943 - 56065459
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |    
T  56065943 taagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagt 56065844  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc----tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtag 446  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    | |||| |||||  | | ||| ||||  | ||||||||||||||    
T  56065843 tggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatcaccatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtag 56065744  T
Q  447 ctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatt 544  Q
    |||| || |||||||||||||||||  ||||| | |||  |    |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||  || |||| |||| ||||    
T  56065743 ctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatt 56065644  T
Q  545 tgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggc 644  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||| | ||  ||||| ||| || |    
T  56065643 tgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaaa-acaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacgac 56065545  T
Q  645 atccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaa 730  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |   |||| || |||||||||||| || | ||||||||||| | || ||| |||||||    
T  56065544 atccacattgcacttcaaccacgtctcacacagtttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaa 56065459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 322 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 55735248 - 55734856
Alignment:
Q  322 ttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgta 421  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |    
T  55735248 ttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgttaagataactgatcaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggtccgaa 55735149  T
Q  422 gacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgc--ccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactg 519  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||   |||| |||||  |   |||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  55735148 gacgatagagcttgcactagagtagatgaatcggactcgaaaataacccggttccatgtgttcgcaacaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctactg 55735049  T
Q  520 tctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataa 619  Q
     |||||  || || | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  55735048 cctccccctccaatactgtcatatttgctcgcttccatttcgtttgagcccgaacaaattgctcatgggagtctctaa-cacaacacgcaaaagatgtaa 55734950  T
Q  620 gatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctatt 713  Q
     ||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  55734949 tatggttgagatcatggagcgcgacatccacattgcacttcaaccacatctcgctcggtttctcccaaaccgagttgttaccttgcactctatt 55734856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 525
Target Start/End: Original strand, 26422427 - 26422755
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  26422427 aaaataaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggccgccgtagtt 26422526  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  26422527 aaagtatgagcaaccatgtttgtctgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactaaaaacaatcgcataga 26422626  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    |||||||||| | ||| ||||  ||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||   ||||||     
T  26422627 attctgaatcactatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactcgaagacaacccgatcccatctgtttacatcagcaaagta 26422726  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctccc 525  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  26422727 aatagcatcgagtaaggctactgcctccc 26422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 373 - 764
Target Start/End: Original strand, 43840305 - 43840698
Alignment:
Q  373 aataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg- 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||| |||     
T  43840305 aataatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcattagagtagctgagtcgaactcgaagacaaaccgg 43840404  T
Q  472 -cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaa-gactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcc 569  Q
     | ||| |||||| ||   |||||||||||||||| ||||| |  |  ||||||||  || || | |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43840405 tctcatttgttcacatcagcaaagtgaatggcatcgagtaaaggttgttgtctccccctccaacactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgaccc 43840504  T
Q  570 cgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtc 669  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  43840505 cgaataaattgtccacgggagtctct-aacacaaaacgcaaaagatgtaagatggttatgctcatagaacgcggcatccacgttgaacttcaaccacgtc 43840603  T
Q  670 tcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttgtca 764  Q
    |||    || | || |||||| ||||| |  | ||||||||||||| |  ||| |||| || |||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  43840604 tcgtgcggtctctcccaaactaagttgttgtcttgcactctattatgctagtgttgcataatcggtggtgagggctttttatgaatctcttgtca 43840698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 470
Target Start/End: Original strand, 44935908 - 44936178
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||          ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| || | ||| ||    
T  44935908 aaacaaagttaactattatcattaatcaatcaatattcaatacaagaaggataaaaaaaaaaaatacggtgactaacccaagaacatgccgtcatagcta 44936007  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  44936008 aactatgagcaaccatgttcgcttgtctgctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataataatagaaacaataacatagaa 44936107  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc 470  Q
    |||| |||| || || |||| | |||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||    
T  44936108 ttctaaatcaccgtggcccgaaaacgatagagtttgcactagagtaaatgagtcggactcgaacacaaccc 44936178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Original strand, 24989759 - 24990027
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||||| |||| ||| || || || |||||| |    
T  24989759 aaaataaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaaaaagaataagaataaaaagtacggtgattagctcaaaaacatatcaccctagat 24989858  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |    
T  24989859 aaagtataagcaaccgtgttcgtttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaac-ataacataga 24989957  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaac 468  Q
    ||| |||||| || || |||  ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24989958 attttgaatcaccgtggcccagagacggtagagcttgcactagagtagctgagtcagactcaaagacaac 24990027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 468
Target Start/End: Original strand, 47226163 - 47226424
Alignment:
Q  205 aagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagta 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||    
T  47226163 aagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaagataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaaaatgtcgccctagttac--ta 47226260  T
Q  305 tgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctg 404  Q
    | | |||||||||| | ||||| |||||||  ||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  47226261 taagcaatcatgtttgcttgtcgcctaacattcttcactttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcatataaatctg 47226360  T
Q  405 aatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaac 468  Q
    |||| ||||| || | |||||||| || |||| ||| ||||| ||| || |||||||| |||||    
T  47226361 aatcaccatggcctgaagacgatagagcttgctctaaagtagatgagtcggactcgaacacaac 47226424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23095524 - 23095401
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | | |||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  23095524 taagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccaccctagctaaaatatgagtaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt 23095425  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaa 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  23095424 tggaatgtaaagataactgataaa 23095401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 402
Target Start/End: Original strand, 8754340 - 8754491
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |   ||| |||  ||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||| |    
T  8754340 taagaataaaaaatacggtgactatccaaagaacagaccgctctatctaaagtacgagcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcatctcgaagt 8754439  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  8754440 tggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagtatagaattc 8754491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 43840241 - 43840293
Alignment:
Q  290 gccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcac 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43840241 gccctagttaaagtatgaacaaccatgttcgtttgtttcctaaccaacttcac 43840293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Original strand, 6753948 - 6754022
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcc 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  6753948 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcc 6754022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 342
Target Start/End: Original strand, 51364614 - 51364696
Alignment:
Q  258 aaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcac 342  Q
    |||||||||||||||  |||||||   | || ||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51364614 aaaaaatacggtgac--gcccaagggcaggttgccctagctaaagtatgagcaacaatattcgtttgtcttctaacaaacttcac 51364696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 199 - 761
Target Start/End: Original strand, 477881 - 478444
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |    
T  477881 aaaacaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaacaggacgccctagct 477980  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  477981 aaggtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatatcataaa 478080  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    || | ||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||| |||  |||||||    
T  478081 ataccgaatcaccataacccggagacgatagagcttgcactagagtagtagagtcagattcgaagataacccggtcccatctattcacattagcaaagtg 478180  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||  || |||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||| || | |||||     
T  478181 aatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccattttgtttgagcccggataaattgaccatggaaatctct- 478279  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||||||    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| || |||| |||| ||    
T  478280 aacacaacacacaaaagatgttagatggttgtggtcatggaacgttgcatccacattacacttcaaccacatctcgcttggtttctcccaaattgagatg 478379  T
Q  697 ctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
     |||| || |||||||| | |||||| |||||||||  ||||||  | ||||||| |||||||||    
T  478380 ttaccttggactctattttgcctgtgttgcacaaccactggtgatggatgtttatgaacctcttg 478444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 200 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 13415384 - 13414913
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||    
T  13415384 aaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagcta 13415285  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13415284 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctagcaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagcataaaa 13415185  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||   ||   ||||  ||    
T  13415184 ttcagaatcaccatggcccggggacgatataccttgcactagagtagaagaatcggactcaaagacaactcgatcccatctgtttgcatccgcaaaagga 13415085  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | ||| || |||||| |||||| |||||  || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||    
T  13415084 agggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgaaagtctctaa 13414985  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtct 670  Q
    | ||||||| |||||| | ||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13414984 a-aaaacacacaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtct 13414913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 251 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 7127533 - 7127025
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    || |    
T  7127533 taagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcaaagt 7127434  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| || |||| ||||| |||| |||||| | || |||||||| ||||||  |    
T  7127433 tggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaataacatagaatactaaatcaccatggcccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcata 7127334  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||   |||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||  || |||| | || ||||||||    
T  7127333 gtcagactcgaaggcaacccggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactacctccccctccaaaactttcatatttgcc 7127234  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcc 648  Q
    || | ||||||| |||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| |||| ||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7127233 cgtttccatttcatttgtgcacgaataaatttcccccgagagtctct-aacacaacatgcagaggatgtaagacggttacgttcatggaacgcggcatcc 7127135  T
Q  649 acattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtt 748  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | || || |||||| ||||| |||| ||| | ||||| |  ||||| |||||||||||| ||||| | ||||    
T  7127134 acattccacttcaaccatgtctcgctcggcttctcccaaactaagttgttaccttgccccctattctggctgtgttgcacaaccggtagtgagggatgtt 7127035  T
Q  749 tataaacctc 758  Q
    ||| ||||||    
T  7127034 tatgaacctc 7127025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 251 - 761
Target Start/End: Original strand, 8451000 - 8451511
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||    | |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |    
T  8451000 taaggataaaaaatacggtgactagcctaagacagggccgccctaactagagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcntaacaaacttcacctcgaagt 8451099  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  8451100 ttgaatgtaaagataactgatanataatactagacacaataacataaaattccgaatcaccatgacctggagacgataaagcttgcactaaagtagatga 8451199  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||   | |||||||||| ||| |||||  |||||| |||||  || || | |||| ||||||||    
T  8451200 gtcagactcgaagacaacccggtcccatccgttcacatcagcgaagtgaatggaatcgagtaaagctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcc 8451299  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcc 648  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||  |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8451300 cgcttcctttttgtttgagcccgaataaattgtccacaagagtctct-aacacaacatccaaaagatgtaaaatggttacggtcatggaacgcggcatcc 8451398  T
Q  649 acattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtt 748  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||   |||| || |||| |||  |   ||| ||||||||||| | |  ||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  8451399 acattacacttcaaccacgtctcgcacggtttctcccaaattgaactatgaccttgcactctattttgctggtgttgcacaacctgtggtgatggctgtt 8451498  T
Q  749 tataaacctcttg 761  Q
    ||| |||||||||    
T  8451499 tatgaacctcttg 8451511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 293 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 23854200 - 23853820
Alignment:
Q  293 ctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatag 392  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  23854200 ctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaagttcaccttgaagttggaatgtaaagataacggataactaatactagaaacaatag 23854101  T
Q  393 cataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc--gcccatctgttcatattgac 490  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |   | ||||||||   ||  ||    
T  23854100 catagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagttgatgagtcggactcgaagacaactcagtctcatctgttagcatcaac 23854001  T
Q  491 aaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggag 590  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |  || |||| |||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  23854000 aaagtgaatggcctcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatttttccgctgtcatttcgtttgaacccgaataaattgcccacgggag 23853901  T
Q  591 tctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 672  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23853900 tctct-aacataacacgcaaaagatgtaatatagttacggtcatggaacgcggcgtccacatcgcacttcaaccacgtctcg 23853820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 579
Target Start/End: Original strand, 40588556 - 40588937
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||    
T  40588556 aaacaaagttaactattatcattaatcaactaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 40588655  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  40588656 aagtatgtgcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcatagaa 40588755  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||| |||||  |||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||   ||   ||||  ||    
T  40588756 ttcagaatcatcatggcccggggacgatagagtttacactagagtagatgaatcagactcaaagacaacccggtctcatctgtttgcatccgcaaaacga 40588855  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaatt 579  Q
    | ||| || |||| | |||||| |||||  || |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40588856 agggcctcgagtacggctactgcctccccctccaaaactgttatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaatt 40588937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 251 - 469
Target Start/End: Original strand, 33642641 - 33642859
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |    
T  33642641 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccaccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcgccttgaagt 33642740  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||| | || ||||| |||||||| |||    
T  33642741 tggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatatcattgaattctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcattagagtagatga 33642840  T
Q  451 atcagactcgaagacaacc 469  Q
     |  |||| ||||||||||    
T  33642841 gttggacttgaagacaacc 33642859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 203 - 471
Target Start/End: Original strand, 598066 - 598334
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||| ||| |||||    
T  598066 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcctaagaacagaccgccttagctaaag 598165  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |     
T  598166 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaatttcaccacgaagttgaaatgtaaagataactaataaataatactagaaacaatagcatagaactt 598265  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg 471  Q
     ||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||    
T  598266 cgaatcaccatgacctgaagacgatagagcttgcactagagtagctaagtccgacttgaagacaacccg 598334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 11870574 - 11870364
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  11870574 taagaataaaaaatatggtgattagcccaagaacaggttgccctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt 11870475  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | |  |||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  11870474 tagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaaatccgaatcaccatggctccgagacaatagagcttgcacaagagtagctga 11870375  T
Q  451 atcagactcga 461  Q
     ||||||||||    
T  11870374 gtcagactcga 11870364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 251 - 580
Target Start/End: Original strand, 185470 - 185798
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||  | |||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||      
T  185470 taagaattaaaaatgcggtgactatcc-aagatcaggtcgccctagctaaactatgaccaactatgttcgcttgtctcctaacaaactacacctcgaatg 185568  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| | || |||||||| |||||| ||    
T  185569 tg-aatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggtccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcaga 185667  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     ||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||  ||||||||||| | ||| |||||| |||||  |||||  || |||| |||| ||||||||    
T  185668 gtcagactcgtagacaacccggttccatctattcacatcaacaaagtgaatagtatcgagtaaggctacttcctccc-ctccaaaactgtcatatttgcc 185766  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattt 580  Q
    || | |||||||||||||||||  ||||||||    
T  185767 cgtttccatttcgtttgagcccagataaattt 185798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 440
Target Start/End: Original strand, 3606614 - 3606805
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatg--tcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaa 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |  || |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  3606614 taagaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggcgtcaccctagctaaagtatgaacaaccatattcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaa 3606713  T
Q  349 attggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcacta 440  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  3606714 gttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattccaagtcaccatgaccctgagacgatagagtttgtacta 3606805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 203 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 9497135 - 9496822
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||    
T  9497135 caaaattaattattatcattaatcaatcaatgttcaa-ccagaaaagataagaataaaaaatacggtgactagtccaagaacaggccgccctagctaaag 9497037  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||| | |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  9497036 tataagcaactatgttcgcttgtctcctaataaacttcactctgaagttgggatgtaaatatcacagataaataatgttagcaacaataacatagaattc 9496937  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
      | || ||||||| || |||||||| || ||||||||   | |||||||  ||||| |||||||| ||  |||||  ||||| ||  ||||||||||||    
T  9496936 caagtcaccatgactcgaagacgatagagattgcacta---tggctgaattggactcaaagacaacacggtcccat-agttcacatcaacaaagtgaatg 9496841  T
Q  501 gcatcaagtaagactactg 519  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  9496840 tcatcaagtaaggctactg 9496822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 621 - 761
Target Start/End: Original strand, 40588963 - 40589103
Alignment:
Q  621 atggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctg 720  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||| || |    
T  40588963 atggttacgttcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcactcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctgttatgcccg 40589062  T
Q  721 tgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40589063 tgttgcacaaccggtggtgagggctgtttatgaacctcttg 40589103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 378
Target Start/End: Original strand, 36194450 - 36194625
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||     
T  36194450 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacatgtcaccctagctaaac 36194549  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataat 378  Q
    ||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||    
T  36194550 tatgagcaaccatgttttcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattgaaatataaagataatcgataaataat 36194625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 37712333 - 37711998
Alignment:
Q  301 agtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaat 400  Q
    ||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||| |||||||   ||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  37712333 agtatgagcaaccatgtttgcatgtctcttaacagacttcacatcgaagttagaatgtaaagataactcataaataatactagaaacaatagcatagtat 37712234  T
Q  401 tctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaa 498  Q
    |||||||| |||||  ||| |||| ||| || || |||||||||||| |  ||| ||| ||||| |||| |  | |||||||||| ||  ||||||||||    
T  37712233 tctgaatcaccatg-tccgaagacaatagagcttacactagagtagcagggtcaaactagaagataacctgatctcatctgttcacatcaacaaagtgaa 37712135  T
Q  499 tggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaa 598  Q
    ||||||    |||  |||||  |||||  || |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||  ||||  |||| ||| ||    
T  37712134 tggcat----taaagctactacctccccttc-aaaactgtcatattttcccgctgtcatttcgttttagctcaaataaattgcccacacgagtttct-aa 37712041  T
Q  599 caaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgc 641  Q
    || ||||||||||| || ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  37712040 cacaacacgcaaaaaatgtaagataattacagtcatggtacgc 37711998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32555137 - 32555096
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaat 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32555137 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaat 32555096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 339
Target Start/End: Original strand, 8670203 - 8670279
Alignment:
Q  263 atacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaactt 339  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| | ||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8670203 atacggtgactagtccaagaacaggccgccctagtaagagtgtgagcaaccatgtttgtttgtcgcctaacaaactt 8670279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 28107424 - 28106938
Alignment:
Q  276 cccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaat 375  Q
    |||||||| | || ||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  28107424 cccaagaacaagttgccctagctaaagtatgagcaaccatgtttggttgtctcctaacaaactacagctcgaagttggaatgtaaagataactaataaat 28107325  T
Q  376 aatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cc 473  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||  |  ||    
T  28107324 aatactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaagacaacgtgatcc 28107225  T
Q  474 catctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaa 573  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  28107224 catctattcatatttgcaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatctgtccgctgccatttcgtttgagcctgaa 28107125  T
Q  574 taaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgc 673  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||     
T  28107124 taaattgtccacgggagtctct-aacacaacacacgaaagatgtaagatggttacgatcatggaacgtggcttcctcgttgcacttcaaccacgtctcgt 28107026  T
Q  674 tttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    || |||| || ||||||||| || |||| ||||||||||| | | |||| |||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||    
T  28107025 ttggtttctcccaaactgagatgttaccttgcactctattttgcatgtgttgcacaaccaatggtgaaagatgtttatgaacctcttg 28106938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 198 - 672
Target Start/End: Original strand, 15605818 - 15606293
Alignment:
Q  198 aaaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagt 297  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||          ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||     
T  15605818 aaaagcaaaattaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataataaatatggtgactagcccaagaataagccgccctagc 15605917  T
Q  298 taaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataa 397  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15605918 taaagcatgagcaaccatgttcgcttgtctgctaacaaaattcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatag 15606017  T
Q  398 aattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagt 495  Q
      ||||||||| ||||||||   |||||||| || |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| |||||  ||  |||||||    
T  15606018 tgttctgaatcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatttgttcccatcaacaaagt 15606117  T
Q  496 gaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctct 595  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||  || |||| |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  15606118 gaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatgttttcccgctgccattttgtttgagcccgaataagttgcccatgggagtctct 15606217  T
Q  596 aaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 672  Q
     |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15606218 -aacacaacacgaaaaagatgtaatatggttacgatcgtgaaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 15606293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 255 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 14680468 - 14679959
Alignment:
Q  255 aataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  14680468 aataaaaaatacggtgactagcctgagaacaggccgccctagttaaagtatgagcaaccatgttcgcatgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgga 14680369  T
Q  355 atgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatca 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||   |||| ||| |||| || ||||| ||||||||  || ||     
T  14680368 atgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattttgaatcaccactgcccggagatgatagagcttgcaatagagtagacgagtcg 14680269  T
Q  455 gactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgct 552  Q
    || || |||||||| ||   |||||||||   ||   || |||||| ||| || |||||| |||||| |||||  || || | |||| ||||| ||||||    
T  14680268 gaatcaaagacaactcggttccatctgtttgcatcagcagagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgct 14680169  T
Q  553 gccatttcgtttgagcccgaataaatt---ttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcca 649  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||     || ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  14680168 gccatttcatttgagccataataaattgcccgccgcgggagtctct-aacacaacatgcaaaagatgtaatgtggttgcggtcatggaacgcggtatcca 14680070  T
Q  650 cattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgttt 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  14680069 cattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgctcgtgttgcacaactagtggtgagagttgttt 14679970  T
Q  750 ataaacctctt 760  Q
    || ||||||||    
T  14679969 atgaacctctt 14679959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 628
Target Start/End: Original strand, 15053052 - 15053430
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || | ||| | |  ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||  |||||    
T  15053052 taagaattaaaaatacggtgattaacctaggaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgtttgcttgtcttctaacaaacttcacctcgaaat 15053151  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  || || ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15053152 tggaatgtaaatataattgataaataatattataagcaacagcatagaattccgaatcaccatggcccgaagacgatagcgtttgcactagagtagctga 15053251  T
Q  451 atcagactcgaagacaacc--cgcccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     || |||||||||||||||    | ||| | ||||  |   ||| | |||||||||| |||||| |||||| |||||  || || | | || ||||| ||    
T  15053252 gtcggactcgaagacaaccttgtctcattttttcacgtcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacc 15053351  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttac 628  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15053352 cgctgtcatcttgtttgagcccgaataaattgtccactgaagtctct-aacacaacacgcaaaagatgtaagatggttac 15053430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 251 - 450
Target Start/End: Original strand, 34104342 - 34104541
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  34104342 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccatagctaagctatgagcaaccatgtttgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt 34104441  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  34104442 tcgaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccggagacgatagcgcttgcactagagtagctga 34104541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 566
Target Start/End: Original strand, 19690760 - 19691073
Alignment:
Q  255 aataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgga 354  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |  |||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||   || ||  |    
T  19690760 aataaaaaatacagtgactagcccaagaacaggtcgcccttgcaaaaacatgagcaatcatgttcgcttgtttcctaacaaacttcacctcaaagtttaa 19690859  T
Q  355 atgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatca 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||  |||| ||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  19690860 atgtaaagataactgataaataatactagaaacaatgacatagaattccaaatcaccatgactcagagacgatagagcttgcactaaagtagctgagtca 19690959  T
Q  455 gactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgct 552  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| ||   ||||||||||| |||| | |||| ||| || |||||  || ||||  ||| |||||| ||| |    
T  19690960 gactcgaagacaactcggtcacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaggctattgcctccccttccaaaacggtcatatttgtccgtt 19691059  T
Q  553 gccatttcgtttga 566  Q
    | ||||||||||||    
T  19691060 gtcatttcgtttga 19691073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 203 - 440
Target Start/End: Original strand, 11731498 - 11731735
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||    
T  11731498 caaagctaactattatcattaatcaacgaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatatggtgactagcccaagagcaggctgccctagctaaag 11731597  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||    
T  11731598 tatgagcaaccatgttcgcttgcctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaatattactagaaacagtagcatagaactc 11731697  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcacta 440  Q
     ||| | ||||| |||| |||| ||| || ||||||||    
T  11731698 cgaaccaccatggcccggagacaatagagcttgcacta 11731735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 407
Target Start/End: Original strand, 21944468 - 21944661
Alignment:
Q  214 attatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  || |||  |||||||||| |||      
T  21944468 attatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcacaagaacctgctgctctaactaaagtatgagcaaca 21944567  T
Q  314 atgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaat 407  Q
    ||| ||| ||||||  |||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21944568 atgatcgcttgtcttttaacaaacttcacatcgaagttggaatataaaaataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 21944661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 279 - 615
Target Start/End: Original strand, 29367960 - 29368296
Alignment:
Q  279 aagaagatgtcgccctagttaaa-gtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataa 377  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  29367960 aagaacatgtcgccctaactaaaagtatgaataactatgttcgcttgtttcctaacaaactttaccttgaagttggaaggtaaagataactgataactaa 29368059  T
Q  378 tgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--ccca 475  Q
    | |||||| |||||||||| ||||  ||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| || |||||||| |||    |  ||||    
T  29368060 tactagaagcaatagcatagaattacgaatcactatgacccggagacgatagagcttgcactatagtagatgagtcggactcgaaaacagttaggtccca 29368159  T
Q  476 tctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaata 575  Q
    ||| ||   ||   ||||||||| ||| || ||||||  || || |||||  || |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  29368160 tctattagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggatattgcctccccctccaaaactgtcatatttatccgctgccatttcttttgag--cgaata 29368257  T
Q  576 aattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagat 615  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29368258 aattgtccacgagagtctc-aaacacaacacgcaaaagat 29368296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 367 - 579
Target Start/End: Original strand, 30801984 - 30802198
Alignment:
Q  367 ctgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagaca 466  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  | || ||||| | || | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30801984 ctgataaataatactagaaacaataacatagaattccaagtcaccatggctcggaaacgatagagcttgcactaaagtagctgaatcggactcgaagaca 30802083  T
Q  467 acc--cgcccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgttt 564  Q
    |||    ||||| | |||| ||   |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||   | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30802084 acctagtcccattttttcacatctgcaaagtaaatggcatctagtaaggctactgcctcccccaccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgttt 30802183  T
Q  565 gagcccgaataaatt 579  Q
     ||||||||||||||    
T  30802184 aagcccgaataaatt 30802198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 612 - 751
Target Start/End: Original strand, 30802209 - 30802348
Alignment:
Q  612 agatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactcta 711  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  30802209 agatgtaagatggttacattcattgaatgcggcatccacaatgcactttaactacctctcgcttagtttttcccaaactgagttggtaccttgcactcta 30802308  T
Q  712 ttatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttat 751  Q
    || | |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30802309 ttctgcctgtgttccacaaccgttggtgagggctgtttat 30802348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27443240 - 27443029
Alignment:
Q  254 gaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgg 353  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||   || ||||    
T  27443240 gaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcaaagttgg 27443141  T
Q  354 ---aatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
       |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  27443140 tggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcg-ctgcactagagtagctga 27443042  T
Q  451 atcagactcgaag 463  Q
     ||  ||||||||    
T  27443041 gtccaactcgaag 27443029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3100496 - 3100415
Alignment:
Q  311 atcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaa-ataactgataaataatgctagaaacaata 391  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3100496 atcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagttggaatgtaaaagataactgataaataatactataaacaata 3100415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 764
Target Start/End: Original strand, 11731885 - 11732037
Alignment:
Q  609 aaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcact 708  Q
    ||||||| ||| || |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||| |||||||| |||| ||||||    
T  11731885 aaaagatgtaatattgttacagtcatggaatgcgtcatctacattgcacttccaccacgtctcgctcagtttctcccaagctgagttgttaccttgcact 11731984  T
Q  709 ctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttgtca 764  Q
     |||| | ||||   ||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  11731985 atattcttcctgcaatgcacaac---tggtgagggttgtttatgaacctcttgtca 11732037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3101336 - 3101261
Alignment:
Q  204 aaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaa 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3101336 aaagttaactattatcattaatcaa-caatgttcaatacaacaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaa 3101261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 19690328 - 19690369
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaat 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19690328 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaat 19690369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 531 - 579
Target Start/End: Original strand, 11731825 - 11731873
Alignment:
Q  531 aaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaatt 579  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11731825 aaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccggataaatt 11731873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 203 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 88917 - 88358
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  88917 caaaattaactattatcattaatcaaccaatgctcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaag 88818  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  88817 tatgagcaaccatgttcgcttgtctccaaataaacttcacgttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatactggaaacaatagcatagaattc 88718  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    |||||| |||||| |   |||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||   ||  |||||||||| |    
T  88717 tgaatcaccatgatcttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcaacaaagtgaagg 88618  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    || || |||||| |||||| |||||  || |||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||    
T  88617 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccattgccatttcatttgagcccgaataaattgcccgcgagagtctct-aaca 88519  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctac 700  Q
     |||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||| | |    
T  88518 caacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgtgttgttgc 88419  T
Q  701 cctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    | ||||||||||||| |  ||| || ||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||    
T  88418 cttgcactctattatgctcgtgttgtacaaccggtagtgagggatgtttatgaacatcttg 88358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 203 - 715
Target Start/End: Original strand, 34695733 - 34696244
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||    
T  34695733 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgccctagctaaag 34695832  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34695833 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcataaaattc 34695932  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| || | ||   |||||||||||    
T  34695933 tgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaagtgaatg 34696032  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    || |  |||||| |||||| |||||  || |||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  34696033 gccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaataaattgcccacgggagtctct-aacg 34696129  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctac 700  Q
     |||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| | |||||   |||| || |||||||||||| |||    
T  34696130 caacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgcagtttctcccaaactgagttgttac 34696229  T
Q  701 cctgcactctattat 715  Q
    | |||| ||||||||    
T  34696230 cttgcattctattat 34696244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 203 - 715
Target Start/End: Original strand, 34718145 - 34718656
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||    
T  34718145 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgccctagctaaag 34718244  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34718245 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcataaaattc 34718344  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| || | ||   |||||||||||    
T  34718345 tgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaagtgaatg 34718444  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    || |  |||||| |||||| |||||  || |||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  34718445 gccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaataaattgcccacgggagtctct-aacg 34718541  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctac 700  Q
     |||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| | |||||   |||| || |||||||||||| |||    
T  34718542 caacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgcagtttctcccaaactgagttgttac 34718641  T
Q  701 cctgcactctattat 715  Q
    | |||| ||||||||    
T  34718642 cttgcattctattat 34718656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 203 - 761
Target Start/End: Original strand, 12130467 - 12131026
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | | |  ||||| |||||    
T  12130467 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtaactagctcaagaataggccctcctagctaaag 12130566  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  12130567 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaataatagcatagaattc 12130666  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||   |||||| ||   ||   |||||||||      
T  12130667 tgaatcaccatgtcccgaagatgatagagcttggactagagtagatgagtcagactcgaagataacccgattccatctatttgcatcagcaaagtgaaga 12130766  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    || ||||||||| |||||| |||||  || || | | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||    
T  12130767 gcctcaagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttgctcgctgtcatttcgtttgagcccgaataatttgcccgcgggagtctct-aaca 12130865  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctac 700  Q
     ||||| ||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| || |||| ||||||| |||    
T  12130866 caacacccaaaagatagaatatggttacggtcatggaacggggcatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcgatttctcccaaattgagttgttac 12130965  T
Q  701 cctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    | |||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  12130966 cttgcactctgtttgtcccgtgttgcacaaccggtggtgatggttgtttatgaacctcttg 12131026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 9710317 - 9710045
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |   || | ||| |    
T  9710317 aaaataaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaactaaaaatacggttactagcccaagaacagaccgtcttagct 9710218  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  9710217 aaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaattgcataga 9710118  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg 471  Q
    ||| |||||  ||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  9710117 attatgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcaaagtcagactcgaagacaacccg 9710045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 203 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26199040 - 26198778
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  26199040 caaagttaattattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaatgataagaataaaaaatgcggtgactagctcaagaagaagtcaccctagctaaag 26198941  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    |||||  || |||||||  ||||  ||||||||||||||||   || ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  26198940 tatgagaaaccatgttcacttgttacctaacaaacttcacctcaaagttgaaatgtaaagataactggtaaataatactagaaacaatagcatagaattt 26198841  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagac 465  Q
      | || ||||||||   |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26198840 caattcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagac 26198778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 289 - 674
Target Start/End: Original strand, 44017233 - 44017619
Alignment:
Q  289 cgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaaca 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||   ||||||||||||| ||||||    ||| || ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  44017233 cgccctagttaaagtatgagcaactatgtttacttgtctcctaacacacttcatatcgaagttagaatgaaaagataactgataaataatacaagaaaca 44017332  T
Q  389 atagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatat 486  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||   || |||||||| || |||||||| |||| | || |||||||||||||||||  |  | ||| |||||| ||    
T  44017333 atggcatataattcttaatgaccatgtttcggagacgatagagcttgcactaaagtaacggagtcagactcgaagacaacttggtctcatatgttcacat 44017432  T
Q  487 tgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacg 586  Q
    |  ||| |||||||||||| ||||||  |  ||||||||  || |||| |||| ||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  44017433 tagcaacgtgaatggcatcgagtaaggttgttgtctccccctccaaaactgtcatatttgcacggtgtcattttatttgagcccgaataaattgcccacg 44017532  T
Q  587 ggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgct 674  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |  ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  44017533 ggagtctct-aacacaacacgcgaaagatgtaagatggtcatgatcacagaacgcggaattcgcattgcacttcaaccatgtctcgct 44017619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 251 - 469
Target Start/End: Original strand, 11291941 - 11292157
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |    
T  11291941 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaagccgacctagctaaagtatgagcaaacatgttcgctcgtctcctaacaaacttcaccttgaagt 11292040  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||  ||| | |||||| || |||||||||||||| |||    
T  11292041 t-gaatgtatagataactgataaataatactataaacaataacataaaattttgaatcatcatg-gccgaaaacgatagagcttgcactagagtagatga 11292138  T
Q  451 atcagactcgaagacaacc 469  Q
     || ||||| |||||||||    
T  11292139 gtcggactcaaagacaacc 11292157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 470
Target Start/End: Original strand, 1417816 - 1418077
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaa-tacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||||||| |    
T  1417816 aaacaaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacagcctgccctagct 1417915  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||| |||||          ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1417916 aaactatga----------tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcataga 1418005  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc 470  Q
    |||||||||| ||||   ||  |||| ||| || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1418006 attctgaatcaccatagtccagagacaatagagcttgaactagagtagatgagtcagactcgaagacaaccc 1418077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 469
Target Start/End: Original strand, 13109701 - 13109964
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||          ||||| ||||||||||||||||||  ||   || |||||||||||| |||||    
T  13109701 caaagttaattattatcgtaaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagagtaaaaaatacggtgactaaacc---aacatgtcgccctagctaaag 13109797  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  13109798 tatgaacaactatgttcgtttgtctcctgacaaacttcacctcaacgttggaatgtaaagataactgataaataatactggaaacaatagcttataattc 13109897  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacc 469  Q
      |||| ||||| |||| |||||||| || || |||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  13109898 caaatcaccatggcccgaagacgatagagcttccactagagtagaagagtcggactcgaagacaacc 13109964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 203 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14827437 - 14827173
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||          |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14827437 caaagttaactaatatcattaatcaactaatgttcaatacaagaagaataagaatagaaaatgcggtgactagcccaagaatatgtcgccctagataaag 14827338  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  14827337 tatgagcaaccatgttcgtttgt-tcttaactaactttacctcgaagttggaatgtaaagataactaatacataatattataaataatagcatagaattt 14827239  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaac 468  Q
     ||||| |||||||||  | |||||| || |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  14827238 cgaatcaccatgacccaaacacgatagagcttgcactagagtagctaagtcagattcaaagacaac 14827173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 203 - 408
Target Start/End: Original strand, 35158671 - 35158879
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatc-aatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||  |||    
T  35158671 caaagttaaatattatcattaatcaaaccaatgttcaatataaaaagcataagaataaaaaatacggtgcctagcccaagaacaggccgccctagcgaaa 35158770  T
Q  302 gtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttca--ccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
     ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  35158771 ctatgagcaactatgttcgcttgtctcataacaaacttcatgccttgaagttggaatgtaaaaataattgataaataataatagaaacaatagcatagaa 35158870  T
Q  400 ttctgaatc 408  Q
    |||||||||    
T  35158871 ttctgaatc 35158879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25552507 - 25552312
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  ||||  |    
T  25552507 aaaataaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacctaagaacaggtcttcctaact 25552408  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagca 394  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  25552407 aaagtatgagcaaccatgttcacttgtctcttaacaaatttcatcttaaaattgaaatgtaaaaataactgataaataatattagaaataatagca 25552312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 408
Target Start/End: Original strand, 18344176 - 18344328
Alignment:
Q  256 ataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaa 355  Q
    |||||||||||| ||| ||| | || || | | |||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  18344176 ataaaaaatacgatgattagtctaacaacaggccgccctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaatttcaccttgaagttggaa 18344275  T
Q  356 tgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatc 408  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  18344276 tgtaaagataactgataattaatactagaaacaatatcatagaattctaaatc 18344328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 490 - 672
Target Start/End: Original strand, 18345605 - 18345785
Alignment:
Q  490 caaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacggga 589  Q
    ||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||  |||||| | ||| |||||| ||| | ||||||||||||||  | ||||||||  |||||| |    
T  18345605 caaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctcaaaact-gtcatatttgtccgttaccatttcgtttgagttcaaataaattacccacggaa 18345703  T
Q  590 gtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 672  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18345704 gtctctaa-cacaacacgcaaaagaagtaatatggttacgctcatggaacgttgcgtccacattgcacttcaaccatgtctcg 18345785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22845833 - 22845613
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  22845833 taagaataaaaaatatggtgactagcttaagaacaggtcgccctagctaaagtatgagcaa--atgttcgcttgt-tcctaacaaacttcacattgaagt 22845737  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||| | ||||           ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | | |||||||| || |||||||||||||| | |    
T  22845736 tggaaagcaaaag----------ataatactagaaacaatagcctagaattctgaatcaccatgatctggagacgatagagcttgcactagagtagatta 22845647  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttc 482  Q
     |  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22845646 gttggactcgaagacaacccggtcccatctgttc 22845613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9709998 - 9709910
Alignment:
Q  490 caaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaat 578  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||  || |||| |||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9709998 caaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaataaat 9709910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 203 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20205313 - 20204754
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |  ||||||| |||||    
T  20205313 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacgttgactggcccaagaataggctgccctagctaaag 20205214  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  20205213 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctagaagttggaatgtaaagataactgatatataatactagaaacaatagcatagaattt 20205114  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||   ||||||||||  |   ||||||||||||    
T  20205113 tgaatcaccatgacccggagaggatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcaacaacaaagtgaatg 20205014  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    || || |||||| |||||| |||||  || || | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| | ||    
T  20205013 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcctggataaatttcccgcgggagtctct-agca 20204915  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctac 700  Q
     || | | ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| || |||||||||||  |||    
T  20204914 caaaatgtaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcatttggtttctcccaaactgagttattac 20204815  T
Q  701 cctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    | | ||||||||| | | |||| |||||||||   |||||| | ||||||| |||||||||    
T  20204814 cttacactctattttgcttgtgttgcacaaccaagggtgagggttgtttatgaacctcttg 20204754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 200 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 25731169 - 25730694
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||    
T  25731169 aaacaaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 25731070  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  25731069 aagtatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaacttcacctggaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaacaataacatagaa 25730970  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc--gcccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |   |||||||||||  ||   ||||||||    
T  25730969 ttcttaatcaccatgaccctgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcagtcccatctgttcgcatcagcaaagtga 25730870  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | ||| || |||||| |||||| |||||  || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |    
T  25730869 agggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagctcgaataaatttcccgcgtgagactct-a 25730771  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgct 674  Q
    ||| ||||||  |||  | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25730770 acacaacacgtgaaaattgtaatatggttacggtcatggaacgcggaatccacattgcacttcaaccacgtctcgct 25730694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 213 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 12660664 - 12660211
Alignment:
Q  213 tattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||          ||| ||||||||||| | ||| |||| |||||| | | || ||||| |||||||||| || |    
T  12660664 tattatcattaatcaatcaatgtttaatacaaaaaagataaaaataaaaaatatgttgattagctcaagaacaggccgtcctagctaaagtatgagcagt 12660565  T
Q  313 catgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgcca 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  12660564 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagttagaatgtaaacataactgaaaaataatactagaaacaatatcatagaattctgaatcaccg 12660465  T
Q  413 tgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagta 510  Q
    || |||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||  | ||| |||||| |||  ||||||||||| |||| ||||    
T  12660464 tggcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgacgataacacggtctcatttgttcacattagcaaagtgaatgacatcgagta 12660365  T
Q  511 agactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaa 610  Q
    ||||||||| |||||  || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  12660364 agactactgcctcccgctctaacactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgtccatgaaagtctct-aacacaacacgcaa 12660266  T
Q  611 aagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaacca 665  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12660265 aagatgtaagatggttacgttcatggaacgcggcatccacattgcacttcaacca 12660211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 199 - 713
Target Start/End: Original strand, 22767098 - 22767597
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  22767098 aaaacaaagttaactattatcattcatcaaccaatgttcaacacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccttagct 22767197  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||                |||| ||||| |    
T  22767198 aaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga----------------caatcgcataga 22767281  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    |||||||||  ||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||   |||||||    
T  22767282 attctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcaaactcgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtg 22767381  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    ||| ||| | |||||| |||||| |||||  || ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  22767382 aatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccccgggaatctcta 22767481  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    | || |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  22767482 a-cacaacacgcaaaagatgtaagatgattactgtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttg 22767580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 258 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 4268402 - 4267987
Alignment:
Q  258 aaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  4268402 aaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccctagataaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatg 4268303  T
Q  358 taaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagac 457  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| || |||    
T  4268302 taaagataactgagaattaatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggac 4268203  T
Q  458 tcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgcc 555  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||   ||   ||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||  || |||| |||| |||||||||||||||    
T  4268202 tcgaagaaaacccggtcccacctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcc 4268103  T
Q  556 atttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgc 655  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  4268102 attttgtttgagcctgaataaattgcccacgagagtctct-aacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacaatcaagaaacgcggcgtccacgttgc 4268004  T
Q  656 acttcaaccatgtctcg 672  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  4268003 actttaaccatgactcg 4267987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 203 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 27292791 - 27292322
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  27292791 caaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgtc-ccctagctaaag 27292693  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27292692 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctgataaacttcactttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcataaaattc 27292593  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
      |||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||   ||   ||||||||| |    
T  27292592 caaatcaccatggcctggagacgatagagtttgcactagagcagatgagtcgaactcgaagacaacccggtcccatctgttatcatcagcaaagtgaagg 27292493  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    ||||| |||||| ||| || |||||  |  ||||   |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  27292492 gcatctagtaaggctattgcctcccccttcaaaacaataatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacgagagtctct-aaca 27292394  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 672  Q
     |||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27292393 caacatgcaaaatatgtaatatggttactatcatggaacgtgacatccacattgcacttcaaccatgactcg 27292322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 203 - 761
Target Start/End: Original strand, 41940565 - 41941125
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaa-tacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaa 301  Q
    |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  | ||||| ||||    
T  41940565 caaagttaacaactatcattaatcaaccaatgttcaataaaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaataacaagcagtcctagctaaa 41940664  T
Q  302 gtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaatt 401  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41940665 gtattagcaatcatgttctcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataaccggtaaataatactagaaacaatagcatagaatt 41940764  T
Q  402 ctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaaccc-gcccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    ||||||| | |||  ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||  |||||| ||   |||||||||||    
T  41940765 ctgaatcacaatggtccagagacgatagagtttgcactagagtagttgagtcggactcgaagacaacccggtccagttgttcacatgagcaaagtgaatg 41940864  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgta-tttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaac 599  Q
     |||  |||||| ||| ||||||||  || |||| |||| || ||| |    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  41940865 acattgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttttctatatgtcatttcgtttgagctcgaataaatttcccacgggagtct-ttaac 41940963  T
Q  600 aaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgcta 699  Q
    |  |||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||| || |||| ||    
T  41940964 actacacacaaaagatgtaagatagttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccacatctcgctcggtttctcccaaattgggttgata 41941063  T
Q  700 ccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttg 761  Q
    || ||||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  41941064 ccttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccggtggcgagggttgtttatgaacctcttg 41941125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 251 - 764
Target Start/End: Original strand, 27532783 - 27533298
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  27532783 taagaataaaaaatacagtgattagcccaagaacatgtcaccctagctaaagtataagtaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagt 27532882  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| || |||  |    
T  27532883 tggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaatagcaaagaattctgaatcaccatgacccggagacgataaagtctgcactaaagaagcaaa 27532982  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     || |||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||   ||||||||||| |||| | |||  ||| || |||||  || |||| |||  ||||| ||    
T  27532983 gtcggactcgaaaacaacccggtcccatctattcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaagctattgcctccccctccaaaactgttatattttcc 27533082  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgc-aaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatc 647  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27533083 tgctaccatttcgtttgagcccgaataaattgcccacgggagtctct-aacacaacacgcaaaaagatgtaaactggttacgatcatggaacgcgacatc 27533181  T
Q  648 cacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgt 747  Q
    |||||| |||||||  |  |||||||    ||| || |||||| |  |  |||| |||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  27533182 cacattacacttcagtcgcgtctcgcgcgatttctcccaaactaaactattaccttgcactatattctgtctgtgttgcacaaccggtggtgagggatgt 27533281  T
Q  748 ttataaacctcttgtca 764  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27533282 ttatgaacctcttgtca 27533298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 251 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 8388396 - 8387882
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  8388396 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaaaccaccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcccctcgaagt 8388297  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8388296 tggaatgtaaagaaaactgaaaaataatactggaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctggagacgatagcgcttgcactagagtagctga 8388197  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||||  |    |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||  || |||| |||| ||||||      
T  8388196 gtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaaccgcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtt 8388097  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcc 648  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||  | ||  ||||| ||||||||||||    
T  8388096 cgttgccatttcgtttgagcctgaatgaattgcccacgagagtctct-aacacaacacgcgaaagatgtaatattttaacggtcatgaaacgcggcatcc 8387998  T
Q  649 acattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtt 748  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |   |||| || || ||||||||| || | ||||||||||| | || ||| ||||||| || || |||| | ||||    
T  8387997 acattgtacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccagactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtt 8387898  T
Q  749 tataaacctcttgtca 764  Q
    ||| |||||| |||||    
T  8387897 tatgaacctcctgtca 8387882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 303 - 670
Target Start/End: Original strand, 26597386 - 26597754
Alignment:
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26597386 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgaaaaataatactagaaacaataacataaaattc 26597485  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||  |    |||||||||||    
T  26597486 cgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatctattcccaactgcaaagtgaatg 26597585  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    ||||| |||||| | |||| |||||  || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26597586 gcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaattgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgtccacgggagtctct-aaca 26597684  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtct 670  Q
     ||||||| |||||| ||| ||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26597685 caacacgcgaaagatgtaatatgttgatgatcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtct 26597754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 258 - 761
Target Start/End: Original strand, 15988633 - 15989137
Alignment:
Q  258 aaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatg 357  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  | | |||| ||| |||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||    
T  15988633 aaaaaatatggtgactagcccaatagcaggccgccttagctaaagtatgagcaaccatgtctgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgtaatg 15988732  T
Q  358 taaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagac 457  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||  | |||    
T  15988733 taaagataactgataaataatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggcctgaagacgatagagattgcactagagtagctgagacggac 15988832  T
Q  458 tcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgcc 555  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||  ||   |||||| || ||| || ||||||  ||||| |||||  || |||| |||| |||||| ||||||||    
T  15988833 ttgaagacaacccggtcccatatgttcgcatcagcaaagtaaagggcctcgagtaaggttactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgcc 15988932  T
Q  556 atttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgc 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||||  ||| |||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||||||| |||||| ||| |    
T  15988933 atttcgtttgagcccgaataaattgctcgcgaaagtctct-gacataacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccatatttc 15989031  T
Q  656 acttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaac 755  Q
    |||||||| | ||||||||  |||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||  | ||||||| |||    
T  15989032 acttcaacaacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgctcgtgttgcacaaccgctagtgaaggttgtttatgaac 15989131  T
Q  756 ctcttg 761  Q
    ||||||    
T  15989132 ctcttg 15989137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 656
Target Start/End: Original strand, 11375348 - 11375796
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| ||    
T  11375348 aaacaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgaatagcccaagaacaggccgccctagcta 11375447  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||          || ||    
T  11375448 aagtatgagcaactatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcggagttggaatgtaaagataactcataaataatacgaga---------gtagaa 11375538  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||| ||||| |||||  ||| |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||   ||   |||| |||    
T  11375539 ttccgaatcaccatggaccggagacgatagagcttgcactagaatagatgaatcagactcaaagacaacccggtcccatatatttgcatccgcaaaatga 11375638  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | ||| || |||||| ||||||||||||  || |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||   |  || |||||||| |    
T  11375639 agggcctcgagtaaggctactgtctccccctccaaaactgtcatatttactcgctgccatttcgtttgagtccgaataaatcacctgcgagagtctct-a 11375737  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgca 656  Q
    ||| |||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11375738 acacaacatgcaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacgcagcatccacattgca 11375796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 255 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23075138 - 23074950
Alignment:
Q  255 aataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  23075138 aataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgtcgtcctagctaaactatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttaaagttgga 23075039  T
Q  355 atgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagag 443  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||| || |||||||||||    
T  23075038 atgtaaacataactgataaataatactataaacaataacatagaattatgaatcaccatggaccgaagacgataaagcttgcactagag 23074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 627
Target Start/End: Original strand, 34652138 - 34652507
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtat--gaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |  ||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||    |||||| ||     |||    
T  34652138 taagaataaaaaatacggtgactaacccaagaataagccatcctagttaaagtatatgagcaaccatgttcgcttgtct----acaaacctc-----gaa 34652228  T
Q  349 attggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagct 448  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||  ||||| || || ||||||||||||||      
T  34652229 gttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaataacatataattctgaatcaccatggcccagagacggtagagcttgcactagagtagtc 34652328  T
Q  449 gaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttg 546  Q
    || || | |||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||  || | ||||||  |  || | |||| ||||||    
T  34652329 gagtcgggctcgaagacaacccgatcccatctgttcacatcggcaaagtgaatggcatcgagtaaggttattatctccccttacaacactgtcatatttg 34652428  T
Q  547 cccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggtta 627  Q
    | ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34652429 ctcgctgcc-ttttgtttgagaccggataaattgcccacgggagtctct-aacacaacacacaaaagatgtaagatggtta 34652507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 502 - 764
Target Start/End: Original strand, 30222929 - 30223190
Alignment:
Q  502 catcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaa 601  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||||  ||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||     
T  30222929 catcaagtaaagctactgtctccctctccaaaactgtcaaattcgcttgctgcaaattcgtttgagcccgaataaattgcccatggaagtctctaa-cac 30223027  T
Q  602 aacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctacc 701  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||   |||| || ||||| |||||| ||||    
T  30223028 aacacgcaaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcgacgtccatgttgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcccaaacagagttgttacc 30223127  T
Q  702 ctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctcttgtca 764  Q
     ||||||||||| | || ||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30223128 ttgcactctattctgcccgtgttgcacaactgttggtgagggctgtttatgaacctcttgtca 30223190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32632872 - 32632605
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||    
T  32632872 caaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatccaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgcc-tagctaaag 32632774  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||  |||  ||||||| ||||||| ||| |||| |||||  ||| || ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||  |||| |||||    
T  32632773 tatgggcaactatgttcgcttgtctcataataaacgtcacctcgaagttagaatgtaaagataacaaataaataatattagaaacaatgtcatagaattc 32632674  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg 471  Q
    |||||| | ||| | || |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  32632673 tgaatcactatggctcggagacgataaagcttacactaaagtagatgagtcagactcaaagacaacccg 32632605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 395
Target Start/End: Original strand, 30573502 - 30573698
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |||| ||| |    
T  30573502 aaaacaaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacccaaaaacagaccgccttagct 30573601  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcat 395  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||   |||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30573602 aaaatatgaacaaccatgttcgcttgtcttctaacaaatttcacctcaaaattaaaatataaagataactgataaataatactaaaaacaatagcat 30573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 466
Target Start/End: Original strand, 30222755 - 30222930
Alignment:
Q  289 cgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaaca 388  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||    || || ||||||||| |||| |||||||  || ||| |||||    
T  30222755 cgccctaattaaagtatgagcaatcatgtttgcatgtctcttaacaaacttcacatcaaagttagaatgtaaagataattgataaa--attctataaaca 30222852  T
Q  389 atagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagaca 466  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30222853 atagcatagaattccgaatcaccgtgacccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcagattcgaagaca 30222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26076639 - 26076480
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccct-agttaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||| |||| || |||||||| | |   |||| | | |||    
T  26076639 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatacagtgattatcccaagaacaggctaccctgactaaaa 26076540  T
Q  302 gtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaa 361  Q
     ||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26076539 atatgagcaaccatgtttgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaa 26076480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 37448251 - 37448028
Alignment:
Q  435 gcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgc--ccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaa 532  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||   ||||||||||| ||   ||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||  |  ||    
T  37448251 gcactagagtagttgaattgaactcgaagacaacccggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctaccgcctcccctttcaa 37448152  T
Q  533 aattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatc 632  Q
     | |||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||   ||| ||| |||||||||||   ||    
T  37448151 cactgtcatgtttgcacgctgccattttgtttgagtccgaatacattgtccacgagagtctct-aacacaacatataaacgatgtaagatggttatggtc 37448053  T
Q  633 atggaacgcggcatccacattgcac 657  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||    
T  37448052 atggaacacgacatccacatcgcac 37448028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 616 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 16074680 - 16074623
Alignment:
Q  616 ataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgc 673  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  16074680 ataagatggttacgttcatggaacgcggcatccacattgcactttgaccacgtctcgc 16074623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 3308171 - 3308211
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaat 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3308171 aaacaaagttaactattatcattaatcgatcaatgttcaat 3308211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 396
Target Start/End: Original strand, 31908319 - 31908418
Alignment:
Q  297 ttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcata 396  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |   || ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  31908319 ttaaagtatgagcaaccatgtttgtttatcgactaacaaacttcatctcaaagttgaaatgtgaagataactgataaataatattataaacaatagcata 31908418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 26597291 - 26597332
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaat 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  26597291 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaat 26597332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 628
Target Start/End: Original strand, 42989360 - 42989452
Alignment:
Q  535 ttgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttac 628  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||    
T  42989360 ttgtcatatttgtctgctgctatttcgcttgagccggaataaattagtcacggaagtctctaaac-caacacgcaaaagatgaaatatggttac 42989452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 204 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 25683008 - 25682540
Alignment:
Q  204 aaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagt 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||          || |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  25683008 aaagttaactattatcattaatcaacaaatgttcaatataagaaagataggaattaaaagtacggtgactaacccaagaacatgcctccctagctaaagt 25682909  T
Q  304 atgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattct 403  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  25682908 atgagcaaccatgctcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttagaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagtatagaattct 25682809  T
Q  404 gaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatgg 501  Q
     |||| |  || |||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||  |||||||||||     
T  25682808 aaatcactgtggcccggagacgatagagcttgtactagagtagctgagtcaaactcgaagacagcccggtcccatctgttcacattagcaaagtgaatga 25682709  T
Q  502 catcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaa 601  Q
    |||| |||||| |||||| |||||  || || | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||     
T  25682708 catcgagtaaggctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccagataaattgcccacgggagtctct-aacac 25682610  T
Q  602 aacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctc 671  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25682609 aacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatgaaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctc 25682540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 200 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 5609700 - 5609177
Alignment:
Q  200 aaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtta 299  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  5609700 aaacaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacatgccgccctagcta 5609601  T
Q  300 aagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaa 399  Q
    | |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5609600 atgtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaa 5609501  T
Q  400 ttctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||||  |    ||||||||    
T  5609500 ttctgaatcaccatgaccctgagacgatagagtttgcactagagtagatgagtcgaactcgaagacaacccgatctcatctgttcgcaacatcaaagtga 5609401  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | | | || |||||| |||||| |||||  |  |||| | || |||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||   |  | |||||||| |    
T  5609400 aggacctcgagtaaggctactgcctcccccttcaaaactatcatatttgtccgctgtcatagagtttgagcccgaataaattgctcgtgtgagtctct-a 5609302  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgc 697  Q
     || | ||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||     
T  5609301 gcacagcacgcgaaagttgtaatatggttacagtcatggaacgcgacatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgt 5609202  T
Q  698 taccctgcactctattatacctgtg 722  Q
    | || ||||||||||||| ||||||    
T  5609201 tgccttgcactctattatgcctgtg 5609177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 203 - 758
Target Start/End: Original strand, 48949553 - 48950109
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||      
T  48949553 caaagttaactattatctttaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagctaagc 48949652  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48949653 tatgagtaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattc 48949752  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||  |||||||||||  |   |||||||||||     
T  48949753 cgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagttgaactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatc 48949852  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaaca 600  Q
    ||||| |||||| | |||| |||||  || |||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||    
T  48949853 gcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactttcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgccaacgggagtctct-aaca 48949951  T
Q  601 aaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctac 700  Q
     ||||||| |||||| ||| ||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||| || ||| |||||||| ||     
T  48949952 caacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttag 48950051  T
Q  701 cctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctc 758  Q
    | ||||||||||| | || ||| ||||||| || || |||| | ||||||| ||||||    
T  48950052 cttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 48950109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 203 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 44527612 - 44527141
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaa-tacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaa 301  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| | | |||||||||||||    
T  44527612 caaatttaactattatcattaatcaagcaatgttcaatacaaaaaggataataataaaaaaatacggtgattaacccaagaacaggccgccctagttaaa 44527513  T
Q  302 gtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaatt 401  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44527512 gtatgagcagccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactaataattaatactagaaacaatagcatagaatt 44527413  T
Q  402 ctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaat 499  Q
    | ||||| ||||| |||| ||| |||| || |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||   ||   |||||||||     
T  44527412 ccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagtgaag 44527313  T
Q  500 ggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaac 599  Q
    ||| || |||||| |||||| |||||  || |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||    
T  44527312 ggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacaagagtctct-aac 44527214  T
Q  600 aaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 672  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44527213 acaacacgcaaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcg 44527141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 199 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 51113677 - 51113117
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||          |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  51113677 aaaacaaagttaactattatcattaatcaaccagtattcaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactaacccaagaacaggtcgccctagct 51113578  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  51113577 aagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgttaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaa 51113478  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    | || ||||| ||||| |||  ||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||  |   ||||||||    
T  51113477 actccgaatcaccatggcccagagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtg 51113378  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    |||| |||| |||||| | |||| |||||  || ||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||     
T  51113377 aatgacatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaacggttatatttgctcgttgccatttcgtttgagtccgaatgaattgcccacgggagtctct- 51113279  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| ||| | ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    ||| || ||||||||||||    
T  51113278 aacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacggcatccacattgcactttaaccacgtctcacacgatttctcccaaactgagttg 51113179  T
Q  697 ctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttataaacctc 758  Q
     || | ||||||||||| | || ||| ||||||| || || |||| ||||||||| ||||||    
T  51113178 ttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggctgtttatgaacctc 51113117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 251 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 4395468 - 4394958
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |    
T  4395468 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagt 4395369  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||   |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  4395368 tgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaataggatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatga 4395269  T
Q  451 atcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcc 548  Q
     |  |||||||||| |||| |  ||||||| |||  ||   ||||||||| ||| || |||||| ||| || |||||  || |||| | || ||||||||    
T  4395268 gttggactcgaagataacctggtcccatctattcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgcctccccttc-aaaactctcatatttgcc 4395170  T
Q  549 cgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcc 648  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||| | || ||||||| | | | ||||||||  |||||||||||||| |||    
T  4395169 cgctgccatttcgattgagcccggataaattgcccacgagagtctct-aacacagcatgcaaaagttgtgatatggttacggtcatggaacgcggcttcc 4395071  T
Q  649 acattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtt 748  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||  |||| || |||||||||||| |  | |||||||| |||| | |||| ||||  |||||| | ||| | ||||    
T  4395070 acattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttgtcttgcactctgttatgcatgtgttgcattaccggtagcgagggatgtt 4394971  T
Q  749 tataaacctcttg 761  Q
    |||||||||||||    
T  4394970 tataaacctcttg 4394958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 199 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 36734052 - 36733580
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||          ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  36734052 aaaataaagttaactattatcattaatcaaccaatattcaatacaagaaggataagaattaaaaatacgatgactagcccaagaacaggccgccctagct 36733953  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    ||||||||      |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  36733952 aaagtatg------catgttcgcttgtctcgtaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaataacataga 36733859  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    ||| ||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   |||||||    
T  36733858 attatgaatcatcatggcccggagacgatatagcttgcactagagttatagagtcagactcgaagacaacccggtcccatttgttcacatcagcaaagtg 36733759  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    |||  |||  ||||||||||||| |||||  || |||| || | ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  36733758 aataacattgagtaagactactgcctccccctccaaaactgccatatttacccgttgtcattttgtttgagcccgaataaattgtccacgagagtctct- 36733660  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccac--attgcacttcaaccatgtctcgct 674  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36733659 aacacaacacacaaaaggtgtaagatggttatagtcatgaaacgcggcatccacatattgcacttcaaccatgtctcgct 36733580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 251 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 52109763 - 52109344
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |    
T  52109763 taagaattaaaaatacggtgactagtccaagaacatgtcgccctatctaaagtatgaacaactatgtttgtttgtctcataacaaactttaccttgaagt 52109664  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||  ||| |||| ||| || ||| |||||||||| |||    
T  52109663 tagaatgtaaagataactgataactaatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggtccggagacaatagagcttgtactagagtagatga 52109564  T
Q  451 atcagactcgaagacaaccc-gcccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgccc 549  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||   ||   ||||||||| | | || |||||| ||||||  ||||  || |||||  || |||||||||    
T  52109563 atcacactcaaagacaacccatcccatctgttagcatcagcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaatgatcatatttgccc 52109464  T
Q  550 gctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcca 649  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |  | ||||    
T  52109463 gctgccatttcgtttgagcctgaataaattgtccacaggagtctct-aacacaacatgcaaaagatataagatgattacggtcatggaacacaacgtcca 52109365  T
Q  650 cattgcacttcaaccatgtct 670  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  52109364 cattacacttcaaccacgtct 52109344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 48166588 - 48166149
Alignment:
Q  199 aaaacaaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagtt 298  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||          ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||    
T  48166588 aaaacaaagttaattattat-attaatcaaccaatattcaatacaagaaggataaaaatcaaagatacggtgactagcccaagagtaggccgctctagtt 48166490  T
Q  299 aaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaa 398  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||           ||||||||| |    
T  48166489 aaagtacgagcaatcatgttcgtttgtttcctaacaaacttcatcttgaagttgaaatgtaaagataacagataaatat----------aatagcataga 48166400  T
Q  399 attctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtg 496  Q
    |||||| ||| ||||   ||  |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||   |||||||    
T  48166399 attctgtatcaccatcgtcccaagactatagagcttgcaatagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgatcccatatattcacataagcaaagtg 48166300  T
Q  497 aatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctcta 596  Q
    |||| |||| |||||| ||| ||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  48166299 aatgacatcgagtaaggctattgtctcccactccaaaactgtcatatttgctcgctgccatttcatttgagcccgaataaattgaccacgggagtctct- 48166201  T
Q  597 aacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatcc 648  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  48166200 aacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgtggcatcc 48166149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 203 - 665
Target Start/End: Original strand, 16816626 - 16817091
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||    
T  16816626 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacgagatggataaggataaaaaatacggtgactagcccaagaataagtcgccctaactaaag 16816725  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16816726 tatgagcaaccatgttctcttctctcctaacaaacttcaccttaaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcgtagaattc 16816825  T
Q  403 tgaatc---gccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtga 497  Q
     |||||    ||||| | || ||||| || |  ||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||  ||||||||||   ||   |||| |||    
T  16816826 cgaatcacgtccatggctcggagacggtagaacttgaactagagtagacgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatcagcaaaatga 16816925  T
Q  498 atggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaa 597  Q
    | ||| || |||||| |||||| |||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||   | || ||||||||||    
T  16816926 agggcctcgagtaaggctactgcctccc-ctccaaaattgtcatatttgcccactgccattttgattgagctcgaataaattgcacgcgagagtctctaa 16817024  T
Q  598 acaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgcacttcaacca 665  Q
    | | || || |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16817025 a-acaatacacaaaagatgtaatatggttacagacatggaacgcggcgtccgcattgcacttcaacca 16817091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 24538790 - 24538308
Alignment:
Q  258 aaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatg 357  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||  ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||   || || |||||    
T  24538790 aaaaaatatggtgactagccgaagaacatgttgtcctagcaaaagtatgagcaatcatgttcgcttgtttcctaacgaacttcacctcaaagttagaatg 24538691  T
Q  358 taaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagac 457  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||| ||  |||| |  ||||||||||||||  || ||||||    
T  24538690 taaagataacagataaataatactagaaataatagcgtagaattctgaatcactatgacccgaagcagatagatcttgcactagagtagaagagtcagac 24538591  T
Q  458 tcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttgcccgctgcc 555  Q
    ||||| | ||| ||  |||||| |          |||||||||||||||| |||||           |||  || |||| ||||||||||||| ||||||    
T  24538590 tcgaaaagaactcggtcccatcag----------caaagtgaatggcatcgagtaa-----------ccc--tccaaaactgtcgtatttgcctgctgcc 24538514  T
Q  556 atttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggcatccacattgc 655  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  |||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  24538513 aattcgtttgagcccgaataaattatccacgggagtctctaa-cacaacacacaaaagatctaacttggttacggttatagaacgcggcatccacattgc 24538415  T
Q  656 acttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttgctaccctgcactctattatacctgtgctgcacaaccggtggtgagagctgtttat-aaa 754  Q
    | ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||| |||    
T  24538414 atttcgaccaggtctcacttggtttctctcaaactgagatgttaccttgcactctattctgcctatgttgcacaactggtggtgagggatgtttatgaaa 24538315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 203 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 44603105 - 44602765
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaag 302  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||     |||    
T  44603105 caaagttagttattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgccct-----aag 44603011  T
Q  303 tatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    ||||| | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  44603010 tatgagccaccatgttcgcttgtcccctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattt 44602911  T
Q  403 tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatg 500  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||  | |||||||||| ||    ||||||||||    
T  44602910 tgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaaggcaacccggtctcatctgttcacatcagtaaagtgaatg 44602811  T
Q  501 gcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatttg 546  Q
     |||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  44602810 acatcgagtaagactaatgtctccccctccaaaattgtcatatttg 44602765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 203 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2885585 - 2885313
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaa-tacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaa 301  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  2885585 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacaggtcgccctagctaaa 2885486  T
Q  302 gtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgtaaaaataa----ctgataaataatgctagaaacaatagcataa 397  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||    |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2885485 gtatgagcaa-catgttcgcttgtatcctaacaaacttcaccacgaagttgaaatgtaaagataattaactgataaataatactagaaacaatagcatat 2885387  T
Q  398 aattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcagactcgaagacaacccg 471  Q
    || || ||||| ||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2885386 aactccgaatcaccatagcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtctgactcgaagacaacccg 2885313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21031459 - 21031251
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || | |  ||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  21031459 taagaataaaacatacggtaactaacccaaaaacaggctgccctggctaaactatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaaaaaacttcacctcgaagt 21031360  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
    | | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||   ||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21031359 taggatgtaaagataattgataaataatactagaaactataacataaaattccgaatcaccatagtccggagacgatagagcttgcactagaatagctga 21031260  T
Q  451 atcagactc 459  Q
     ||||||||    
T  21031259 gtcagactc 21031251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14485320 - 14485183
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||| | || |    
T  14485320 taagaataaaaaatatgattactagctcaagaacaagccgccctagctaaagtatgagcaactatgttcgtttgtctcctaatgaacttcaccttaaagt 14485221  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaaca 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14485220 tggaatgtaaaaataactgataaacaatactaaaaaca 14485183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5594391 - 5594266
Alignment:
Q  204 aaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaatnnnnnnnnnntaagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagt 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||          ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  5594391 aaagttaactattatcattaatcaatcaatatttaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagtccaagaacatgccgtcctagttaaagt 5594292  T
Q  304 atgaacaatcatgttcgtttgtctcc 329  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5594291 atgagcaaccatgttcgcttgtctcc 5594266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17371750 - 17371648
Alignment:
Q  259 aaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaatgt 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||| | | ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  17371750 aaaaatacggtgactagctcaagaacatgccgccctagctaaggtatgagcgaccatattcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgt 17371651  T
Q  359 aaa 361  Q
    |||    
T  17371650 aaa 17371648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 402
Target Start/End: Original strand, 38678979 - 38679124
Alignment:
Q  257 taaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | ||| ||| ||||||  |||||| ||| ||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  38678979 taaaaaatatggtgactagcataagaatatgtcgtcttagctaaggtatgagtaatcatattcatttttcgcctaataaacttcaccttgaagttggaat 38679078  T
Q  357 gtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc 402  Q
    |||||  || || |||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  38679079 gtaaagctaccttataaataatattagaaacaataacaaaaaattc 38679124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 4898499 - 4898619
Alignment:
Q  253 agaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattg 352  Q
    |||||||||||||| | | ||| | |||||| | |||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||    
T  4898499 agaataaaaaatacagcgtctaactcaagaacaggtcggcctaactaaagtatgagcaatcatattcgtttgtctcctaacaaactttacatcgaagttg 4898598  T
Q  353 gaatgtaaaaataactgataa 373  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  4898599 aaatgtaaagacaactgataa 4898619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23163468 - 23163431
Alignment:
Q  203 caaagttaaatattatcattaatcaatcaatgttcaat 240  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23163468 caaagttaactattattattaatcaatcaatgttcaat 23163431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 251 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 500 - 50
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |    
T  500 taagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagt 401  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattc----tgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtag 446  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    | |||| |||||  | | ||| ||||  | ||||||||||||||    
T  400 tggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatcaccatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtag 301  T
Q  447 ctgaatcagactcgaagacaacccg--cccatctgttcatattgacaaagtgaatggcatcaagtaagactactgtctcccaatcaaaaattgtcgtatt 544  Q
    |||| || |||||||||||||||||  ||||| | |||  |    |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||  ||  ||| |||| ||||    
T  300 ctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctcccaaactgtcatatt 201  T
Q  545 tgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattttccacgggagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaatcatggaacgcggc 644  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||   | ||| | ||  ||||| ||| || |    
T  200 tgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaaa-acaacacgcgaaagatngtatatgttgacggtcatgaaacacgac 102  T
Q  645 atccacattgcacttcaaccatgtctcgctttgtttttctcaaactgagttg 696  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |   |||| || ||||||||||||    
T  101 atccacattgcacttcaaccacgtctcacacagtttctcccaaactgagttg 50  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 257 - 462
Target Start/End: Original strand, 147 - 352
Alignment:
Q  257 taaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattggaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  147 taaaaaatacggtgactagcccaagaacaagtcgtcctagttaaagtatgagcaaccgtgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaat 246  T
Q  357 gtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctgaatcaga 456  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||| || ||    
T  247 gtaaggataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaattaccatgacctggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcgga 346  T
Q  457 ctcgaa 462  Q
    ||||||    
T  347 ctcgaa 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 73; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20468 - 20316
Alignment:
Q  251 taagaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaat 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||   || |    
T  20468 taagaataaaaaatacgatgactagcccaagaacaggttgccctagctaaagtatgagtaatcatattcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagt 20369  T
Q  351 tggaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattct 403  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  20368 tgacatgtaaagataactgataaataatactagaaacaaaaacaaaaaattct 20316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 463
Target Start/End: Original strand, 44121 - 44332
Alignment:
Q  254 gaataaaaaatacggtgactagcccaagaagatgtcgccctagttaaagtatgaacaatcatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccctgaaattgg 353  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |   |||||||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||   || ||||    
T  44121 gaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcaaagttgg 44220  T
Q  354 ---aatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattctgaatcgccatgacccgtagacgatatagtttgcactagagtagctga 450  Q
       |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  44221 tggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcg-ctgcactagagtagctga 44319  T
Q  451 atcagactcgaag 463  Q
     ||  ||||||||    
T  44320 gtccaactcgaag 44332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University