View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4851_low_1 (Length: 1094)
Name: NF4851_low_1
Description: NF4851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4851_low_1 |
 |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 835; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 835; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 1045
Target Start/End: Original strand, 14176219 - 14177231
Alignment:
| Q |
39 |
agatctccatctgttcctttgggctttgacattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgacggtatttggatgcaaagcct |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14176219 |
agatctccatctgttcctttgggctttgacattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgaaggtatttggatgcaaagcct |
14176318 |
T |
 |
| Q |
139 |
ttgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctataggttatg |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14176319 |
ttgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctacaggttatg |
14176418 |
T |
 |
| Q |
239 |
ggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctgctattctagaaacacctaaacgttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14176419 |
ggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctgctattctagaaacacctaaacgttat |
14176518 |
T |
 |
| Q |
339 |
ggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgtcacagaagggggatatcttgatgaagaccctagggttgatggtgagccagtagttg |
438 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14176519 |
ggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgccacagaagggggagatcttgatgaagaccctggggttgatggtgagccagtagttg |
14176618 |
T |
 |
| Q |
439 |
aagatggtgatgatgaagatgttcaggatggagagcaatccccaacatctcagctcaggagatcaagcagagatcatca------taccaggtaccctag |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14176619 |
aagatggtgatgatgaagatgttcaagatggagagcaatccacaacatctcatctcaggagatcaagcagagatcatcatccatctaccaggtaccctag |
14176718 |
T |
 |
| Q |
533 |
ttcggagtacatcctcatcactgatgagggggagccggaaagtttcgatgaagttcaaactcataaggataaaatccaatggatgaaagcaatgcaagaa |
632 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14176719 |
ttcggagtacatcctcatcactgatgagggggagccggaaagtttcgatgaagttcaaactcataaggataaaatccaatggatgaaagcaatgcaagaa |
14176818 |
T |
 |
| Q |
633 |
gagatggattcattgcagaaaaatgatacttatgaacttgtgaaacttcctgaaggcagaaaagccttgaaaaataaatgggtgttcaagctcaagaaag |
732 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14176819 |
gagatggattcattgcagaaaaatgatacttatgaacttgtgaaacttcctgaaggcagaaaagccttgaagaataaatgggtgttcaagctcaagaaag |
14176918 |
T |
 |
| Q |
733 |
atggtgacaagctagtgaagtacaaagctcgcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatcttctcttcagttgttaa |
832 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14176919 |
atggtgacaagctagtgaagtacaaagctcgcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatcttctctccagttgttaa |
14177018 |
T |
 |
| Q |
833 |
gatgagttcaattcgagttatacttggattggttgctagcttggatttggagcttgaacaaatggacgtaaagactgcatttcttcatggagatttggaa |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14177019 |
gatgagttcaattcgagttatactcggattagttgctagcttggatttggagcttgaacaaatggatgtaaagactgcatttcttcatggagatttagat |
14177118 |
T |
 |
| Q |
933 |
gaggagatttatatggagcaaccagaaggatttgaagtag-ctggaaagaaacacatggtgtgcaaattgaataagagtctttatggattgaagcaggca |
1031 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||| |||||||||||||||| || || || ||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||| |
|
|
| T |
14177119 |
gaagagatctacatggttcaaccagaaggatttg-agaagactcgaaaggagcacttggtttgcaaattgaagaagagcttgtatggattaaaacaagca |
14177217 |
T |
 |
| Q |
1032 |
ccaaggcagtggta |
1045 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| |
|
|
| T |
14177218 |
ccaagacaatggta |
14177231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 812; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 1068
Target Start/End: Complemental strand, 28609658 - 28608621
Alignment:
| Q |
39 |
agatctccatctgttcctttgggctttgacattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgacggtatttggatgcaaagcct |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28609658 |
agatctccatctgttcctttgggctttgatattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgaaggtatttggatgcaaagcct |
28609559 |
T |
 |
| Q |
139 |
ttgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaa-cttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctataggttat |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28609558 |
ttgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctacaggttat |
28609459 |
T |
 |
| Q |
238 |
gggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctgctattctagaaacacctaaacgtta |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28609458 |
gggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcataagcaagaaactatgtcagattctgctattctagaaacacctaaacgtta |
28609359 |
T |
 |
| Q |
338 |
tggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgtcacagaagggggatatcttgatgaagaccctagggttgatggtgagccagtagtt |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28609358 |
tggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgccacagaagggggagatcttgatgaagaccctggggttgatggtgagccagtagtt |
28609259 |
T |
 |
| Q |
438 |
gaagatggtgatgatgaagatgttcaggatggagagcaatccccaacatctcagctcaggagatcaagcagagatcatca------taccaggtacccta |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28609258 |
gaagatggtgatgatgaagatgttcaagatggagagcaatccacaacatctcatctcaggagattaagcagagatcatcatccatctaccaggtacccta |
28609159 |
T |
 |
| Q |
532 |
gttcggagtacatcctcatcactgatgagggggagccggaaagtttcgatgaagttcaaactcataaggataaaatccaatggatgaaagcaatgcaaga |
631 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28609158 |
gttcggagtacatcctcatcactgatgagggggagccggaaagtttcgatgaagttcaaactcataaggataaaatccaatggatgaaagcaatgcaaga |
28609059 |
T |
 |
| Q |
632 |
agagatggattcattgcag-aaaaatgatacttatgaacttgtgaaacttcctgaaggcagaaaagccttgaaaaataaatgggtgttcaagctcaagaa |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28609058 |
agagatggattcattgcagaaaaaatgatacttatgaacttgtgaaacttcctgaaggcagaaaagccttgaagaataaatgggtgttcaagctcaagaa |
28608959 |
T |
 |
| Q |
731 |
agatggtgacaagctagtgaagtacaaagctcgcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatcttctcttcagttgtt |
830 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28608958 |
agatggtgacaagctagtgaagtacaaagctcgcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatcttctctccagttgtt |
28608859 |
T |
 |
| Q |
831 |
aagatgagttcaattcgagttatacttggattggttgctagcttggatttggagcttgaacaaatggacgtaaagactgcatttcttcatggagatttgg |
930 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28608858 |
aagatgagttcaattcgagttatactcggattagttgctagcttggatttggagcttgaacaaatggatgtaaagactgcatttcttcatggagatttag |
28608759 |
T |
 |
| Q |
931 |
aagaggagatttatatggagcaaccagaaggatttgaagtag-ctggaaagaaacacatggtgtgcaaattgaataagagtctttatggattgaagcagg |
1029 |
Q |
| |
|
| || ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || || | |
|
|
| T |
28608758 |
atgaagagatctacatggttcaaccagaaggattt-aagaagactcgaaaggagcacttggtttgcaaattgaagaagagcttgtatggattaaaacaag |
28608660 |
T |
 |
| Q |
1030 |
caccaaggcagtggtacatgaagtttgattcattcatga |
1068 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| | ||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
28608659 |
caccaagacaatggtataagaaatttgactcgttcatga |
28608621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 834; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 834; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 1068
Target Start/End: Original strand, 12932949 - 12933984
Alignment:
| Q |
39 |
agatctccatctgttcctttgggctttgacattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgacggtatttggatgcaaagcct |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12932949 |
agatctccatctgttcctttgggctttgacattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgaaggtatttggatgcaaagcct |
12933048 |
T |
 |
| Q |
139 |
ttgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctataggttatg |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12933049 |
ttgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctataggttatg |
12933148 |
T |
 |
| Q |
239 |
ggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctgctattctagaaacacctaaacgttat |
338 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12933149 |
ggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctactattctagaaacacctaaacgttat |
12933248 |
T |
 |
| Q |
339 |
ggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgtcacagaagggggatatcttgatgaagaccctagggttgatggtgagccagtagttg |
438 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12933249 |
ggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgccacagaagggggagatcttgatgaagaccctggggttgatggtgagccagtagttg |
12933348 |
T |
 |
| Q |
439 |
aagatggtgatgatgaagatgttcaggatggagagcaatccccaacatctcagctcaggagatcaagcagagatcatca------taccaggtaccctag |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12933349 |
aagatggtgatgatgaagatgttcaagatggagagcaatccacaacatctcatctcaggagatcaagcagagatcatcatccatctaccaggtaccctag |
12933448 |
T |
 |
| Q |
533 |
ttcggagtacatcctcatcactgatgagggggagccggaaagtttcgatgaagttcaaactcataaggataaaatccaatggatgaaagcaatgcaagaa |
632 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12933449 |
ttcggagtacatcctcatcactgatgagggggagccggacagtttcgatgaagttcaaactcataaagataaaatccaatggatgaaagcaatgcaagaa |
12933548 |
T |
 |
| Q |
633 |
gagatggattcattgcagaaaaatgatacttatgaacttgtgaaacttcctgaaggcagaaaagccttgaaaaataaatgggtgttcaagctcaagaaag |
732 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12933549 |
gagatggattcattgcagaaaaatgatacttatgaacttgtgaaacttcctgaaggcagaaaagccttgaagaataaatgggtgttcaagctcaagaaag |
12933648 |
T |
 |
| Q |
733 |
atggtgacaagctagtgaagtacaaagctcgcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatcttctcttcagttgttaa |
832 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12933649 |
atggtgacaagctagtgaagtacaaagctcgcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatcttctctccagttgttaa |
12933748 |
T |
 |
| Q |
833 |
gatgagttcaattcgagttatacttggattggttgctagcttggatttggagcttgaacaaatggacgtaaagactgcatttcttcatggagatttggaa |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12933749 |
gatgagttcaattcgagttatactcggattggttgctagcttggatttggagcttgaacaaatggatgtaaagactgcatttcttcatggagatttagat |
12933848 |
T |
 |
| Q |
933 |
gaggagatttatatggagcaaccagaaggatttgaagtag-ctggaaagaaacacatggtgtgcaaattgaataagagtctttatggattgaagcaggca |
1031 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||| |||||||||||||||| || || || ||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||| |
|
|
| T |
12933849 |
gaagagatctacatggttcaaccagaaggatttg-agaagactcgaaaggagcacttggtttgcaaattgaagaagagcttgtatggattaaaacaagca |
12933947 |
T |
 |
| Q |
1032 |
ccaaggcagtggtacatgaagtttgattcattcatga |
1068 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| | ||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
12933948 |
ccaagacaatggtataagaaatttgactcgttcatga |
12933984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 888 - 934
Target Start/End: Original strand, 28893839 - 28893885
Alignment:
| Q |
888 |
gaacaaatggacgtaaagactgcatttcttcatggagatttggaaga |
934 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28893839 |
gaacaaatggatgtgaagactgcatttctacatggagagttggaaga |
28893885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 918 - 955
Target Start/End: Original strand, 36999937 - 36999974
Alignment:
| Q |
918 |
catggagatttggaagaggagatttatatggagcaacc |
955 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36999937 |
catggtgacttggaagaggagatttatatggagcaacc |
36999974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 684; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 684; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 967
Target Start/End: Original strand, 15298739 - 15299669
Alignment:
| Q |
39 |
agatctccatctgttcctttgggctttgacattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgacggtatttggatgcaaagcct |
138 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15298739 |
agatcttcatctattcctttgggctttgacattcctgagagagtacggtccggacatgatataagttactttcacttgaaggtgtttggatgtaaagcct |
15298838 |
T |
 |
| Q |
139 |
ttgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctataggttatg |
238 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15298839 |
ttgttcatgtaaataaggagcatagacaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatgtgcgggctatggagatgaggaatttggctacaggttatg |
15298938 |
T |
 |
| Q |
239 |
ggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctgctattctagaaacacctaaacgttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15298939 |
ggatccagagaagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctgctattccagaaacacctaaacgttat |
15299038 |
T |
 |
| Q |
339 |
ggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgtcacagaagggggatatcttgatgaagaccctagggttgatggtgagccagtagttg |
438 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15299039 |
ggtaaggttgatcttacagttaccactcctcctgtaagagttgccacagaagggggagatcttgatgaagaccctggggttaatggtgagttagtagttg |
15299138 |
T |
 |
| Q |
439 |
aagatggtgatgatgaagatgttcaggatggagagcaatccccaacatctcagctcaggagatcaagcagagatcatca------taccaggtaccctag |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15299139 |
aagatggtgatgaggaagatgttcaggatggagagcaatgcccaacatctcagctcaagagatcaagcagagatcatcatccatctaccaggtaccctag |
15299238 |
T |
 |
| Q |
533 |
ttcggagtacatcctcatcactgatgagggggagccggaaagtttcgatgaagttcaaactcataaggataaaatccaatggatgaaagcaatgcaagaa |
632 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15299239 |
tttggagtacattctcatcactgttgagggggagccgaaaagttttgatgaagttcaaactcataaggataaaatccaatggatgaaagcaatgtaagaa |
15299338 |
T |
 |
| Q |
633 |
gagatggattcattgcagaaaaatgatacttatgaacttgtgaaacttcctgaaggcagaaaagccttgaaaaataaatgggtgttcaagctcaagaaag |
732 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15299339 |
gagatggattccttgcagaaaaatgatacttatgaacttgtgaagcttcctgaaatcagaaaagccttaaagaataaatgggtgttcaagctcaagaaag |
15299438 |
T |
 |
| Q |
733 |
atggtgacaagctagtgaagtacaaagctcgcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatct--tctcttcagttgtt |
830 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
15299439 |
atagtgacaagctagtgaaatacaaagctctcttagtcgtaaaaggttttggacaaaagcgaggaatagattttgatgaaatcttctctctccagttgtt |
15299538 |
T |
 |
| Q |
831 |
aagatgagttcaattcgagttatacttggattggttgctagcttggatttggagcttgaacaaatggacgtaaagactgcatttcttcatggagatttgg |
930 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |
|
|
| T |
15299539 |
aagatgagttcaattcgagttatactcggattggttgctagcttgggtttggagcttgaacaaatggacgtaaagac------tcttcatggatatttag |
15299632 |
T |
 |
| Q |
931 |
aagaggagatttatatggagcaaccagaaggatttga |
967 |
Q |
| |
|
| || ||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15299633 |
atgaagagatctacatggttcaaccagaaggatttga |
15299669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 40 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 38995314 - 38994875
Alignment:
| Q |
40 |
gatctccatctgttcctttgggctttgacattcctgagagagtatggtccggacatgatataagttactctcacctgacggtatttggatgcaaagcctt |
139 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38995314 |
gatctacatatgttcctttggactttgacattcctgaaaaagtatgtgttggacatgatataagttattttcatttgaaggtgttttgatgcaaagcctt |
38995215 |
T |
 |
| Q |
140 |
tgctcatgtaaataaggagcatagacaaaaacttgatgataaagccattccttgcatatttgtgggctatggagatgaggaatttggctataggttatgg |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
38995214 |
ggctcatgtaagtaaggagcgtaga-aaaaacttgatgataaagccattccttgtatatttgtggggtatggagatgaggaatttggctgcacgttatgg |
38995116 |
T |
 |
| Q |
240 |
gatccagag-aagagaagaattattagaagcagagatgtagtgtttcatgagcaagaaactatgtcagattctgctattctagaaacacctaaacgttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||| | | |
|
|
| T |
38995115 |
gatccaaaataagagaagaatcattagaagtaaagacgtattgtttcatgagcaagaaactatgacaaatt-tactattcctgaaacacctaagcacggt |
38995017 |
T |
 |
| Q |
339 |
ggtaaggttgatcttacacttaccactcctcctgtaagagttgtcacagaagggggatatcttgatgaagaccctagggttgatggtgagccagtagttg |
438 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
38995016 |
ggtaaggttgaccttacactaaccactcctcctataagagttgccaaagaagggggagatcttgattaaaaccctagggttgatggtgagccaacaattg |
38994917 |
T |
 |
| Q |
439 |
aagatggtgatgatgaagatgttcaggatggagagcaatccc |
480 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38994916 |
aagatggtgatgacgaaaaaggataggatggagagcaatccc |
38994875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University