View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4859-Insertion-1 (Length: 1024)

Name: NF4859-Insertion-1
Description: NF4859
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4859-Insertion-1
NF4859-Insertion-1
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (7-952)||(37412888-37413828)
chr5 (288-736)||(37382184-37382632)
chr5 (288-784)||(37639735-37640232)
chr5 (11-290)||(37702184-37702463)
chr5 (288-791)||(37823758-37824262)
chr5 (11-290)||(37382706-37382985)
chr5 (7-290)||(37393257-37393540)
chr5 (288-791)||(37711493-37711991)
chr5 (288-790)||(37400672-37401169)
chr5 (8-290)||(37593702-37593984)
chr5 (8-290)||(37696093-37696375)
chr5 (7-290)||(37639243-37639526)
chr5 (7-290)||(37401378-37401661)
chr5 (8-290)||(37532598-37532880)
chr5 (7-290)||(37823401-37823684)
chr5 (7-290)||(37711001-37711284)
chr5 (288-790)||(37696584-37697087)
chr5 (288-734)||(37428594-37429041)
chr5 (387-791)||(37533062-37533467)
chr5 (14-288)||(37435214-37435488)
chr5 (314-791)||(37702563-37703035)
chr5 (288-781)||(37594193-37594681)
chr5 (377-791)||(37435665-37436074)
chr5 (288-791)||(37392685-37393183)
chr5 (723-791)||(37697085-37697154)
chr5 (288-350)||(37532954-37533016)
chr5 (288-345)||(37401247-37401304)
chr5 (288-345)||(37711358-37711415)
chr5 (723-784)||(37400612-37400674)
chr5 (288-345)||(37639600-37639657)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (288-736)||(24217589-24218037)
chr4 (14-290)||(16843376-16843652)
chr4 (14-287)||(24218114-24218387)
chr4 (17-267)||(16846067-16846317)
chr4 (292-791)||(16842669-16843163)
chr4 (293-412)||(16845842-16845961)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (7-290)||(14552869-14553152)
chr3 (521-791)||(14553206-14553477)
chr3 (826-894)||(14553507-14553575)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 772; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 772; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 37413828 - 37412888
Alignment:
Q  7 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37413828 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactaa 37413729  T
Q  107 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccataca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37413728 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcatctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggaaagcttccataca 37413629  T
Q  207 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgagtgaaaagtattgaatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37413628 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgcgtgaaaagtattgaatg 37413529  T
Q  307 ccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaagagcttctcatgaaaccatt 406  Q
          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37413528 ------agtggaattggaagatctccttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccctccatgtgtgtaagagcttctcatgaaaccatt 37413435  T
Q  407 taggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaactattaatattactagaaga 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37413434 taggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaactattaatattactagaaga 37413335  T
Q  507 taaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaagatcaaggaaagttagtttt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37413334 taaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctaccaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaagatcaaggaaagttagtttt 37413235  T
Q  607 tcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaatttaaatattgaatttggaa 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37413234 tcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaatttaaatattgaatttggaa 37413135  T
Q  707 aatgaccatgtaacttgttattagagagaagcaa-ttttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggtggttggcacactgaaggta 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||    
T  37413134 aatgaccatgtaacttgttattagagagaagcaatttttgcaacgaataagttgagaactctccaatggaccctctgaggtggttg--tcactg-aggta 37413038  T
Q  806 cactctctaaaaagagaaaacaaataataacaccaatggaggatttgttccatctaacatgttattatttaaatccac-atactcaa-tttggata-tag 902  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |    
T  37413037 ca-actctaataa-agaaaacaaataataacaccaat-gaggatttgttccatttaacattttattatttaaatccacaatactcaattttggatattgg 37412941  T
Q  903 gccaactaattta-taaatgataaatctaaataagaa--gtgagctagatgga 952  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  37412940 gccaactaatttattaaatgataaatctaaataagaaagttgagctagatgga 37412888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 288 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 37382632 - 37382184
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||| ||||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  37382632 gagtaaaaagtagtaaatgccataacgtgggattggaagatctccttgcaacttgttgaaactgagatcaacatgttgaatgtccctccatgtgtgtaag 37382533  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  37382532 agcttctcatgaaaccatttaggaactttcccttgaattttgtttttagagagatctaattctaccagattttgattttgtgctaagaatttaggaaaac 37382433  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||| |||||||    
T  37382432 tactaatattactagaagataaatataatatcccaaggttgggtaagatggagtcaactctgctttcaatattgatagaaagcaaactattgtgggaaag 37382333  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    ||||||||||  ||| || | | ||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||    
T  37382332 atcaaggaaaaatagcttcttacaatttgaaaattggtgaaagtccacaacaccactcaagttggttgatgacaatcctaagtcaaaaagattttgtaat 37382233  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaa 736  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||    
T  37382232 ttatatattgaatttggaaaatcaccttttatgttgttattagagagaa 37382184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 288 - 784
Target Start/End: Original strand, 37639735 - 37640232
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||| ||||||||  ||||||||   ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  37639735 gagtaaaaagtatacaatgccatcaggtggaattggaagatgtccttgcaacatgttgaaactaagatcaatgtaccgaatgtccttccatgtgtttaag 37639834  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||||| || |||||||||  ||||| ||| || | | |||| | ||| || |||||||    
T  37639835 agcttcttatgaaaccatttgggaattttcccatgaatgttgttattggagagatctaaccattgcaaattatgtactcgtgctaggaatttgggaaaac 37639934  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||    
T  37639935 ttttaatattagcagaagataaatataatgattcaaggttgggtaagatggagtcagcactgctatcaatgttgatagaaagaaaactattatgggaaag 37640034  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    ||||||| || ||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37640035 atcaagggaacttagtttgtttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccactcaagtttgttgatgacaaatctaagtaagtaagattttggagt 37640134  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagaga-agcaattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgag 784  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |  ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37640135 tgaaatattgaatttggaaaatgaccttgtaggttgttattaaagagatacaaagattgcaaagaatatgttgagaactcaccaatgaaccctgtgag 37640232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 290
Target Start/End: Original strand, 37702184 - 37702463
Alignment:
Q  11 agcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgagcca 110  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||   || |||||||    
T  37702184 agcacctgtaactctggtaaagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatgttgttgtcaccaaggtccaatacttcaagatttgaacattgagcca 37702283  T
Q  111 aagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaagtt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||    
T  37702284 aagactgcggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtctcaaatgcatttcctttggagaaggttctaggaatgcttccatagaggtt 37702383  T
Q  211 gttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37702384 gttcatttgcatatccaaaatagagagatgaggaaatgttcccagacattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 37702463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 288 - 791
Target Start/End: Original strand, 37823758 - 37824262
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |     | ||| |||||||||| || ||||    
T  37823758 gagtgaaaagtattgaatgccagaaggtggaattggaagatctccttgtaacttgttgaaactgaggtcaacggaccaaatgtccttccatgagtttaag 37823857  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  |||| || || ||||||||   |||||||||| | ||||| || | ||| ||||||||||    
T  37823858 agcttcttatgaaaccatttgggaattttcccatgaatgttgttgttggagagatctaatgattgcagatttggtagttgcgctaggaatttaggaaaac 37823957  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| | ||| | |||||    
T  37823958 tattaatattagcagaggataaatctaatgaaaaaaggttgggtaagatggagtcagcactgctatcagtgttgatagcaagaaaagtattgtgtgaaag 37824057  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    | | ||| || ||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| |    
T  37824058 aacgagggaatttagtttgtttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccactcaagtttgttgatgacaaaattaactcggtaagattttggagt 37824157  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggt 786  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  37824158 tgaaatattgaatttggaaaatgacctcgtaggttgttattagagagatccaaatattgcaaagaatatgttgaaaactcaccaatgaaccctgtgaggt 37824257  T
Q  787 ggttg 791  Q
    |||||    
T  37824258 ggttg 37824262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37382985 - 37382706
Alignment:
Q  11 agcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgagcca 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| || ||| | || |||||||    
T  37382985 agcacctgtaattcttgtagagtttcaagccaattgggaaaagtatcctctacgttgttgtctccaaggtccaaaacttcgagttttgtacagtgagcca 37382886  T
Q  111 aagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaagtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||| | |||    
T  37382885 aagactgtggtaatggtccttccaatcggtttccattcaactttattgtctcaaatgcatttcctttggagaaggttctaggaatgtgtccatagaggtt 37382786  T
Q  211 gttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37382785 gttcatttgcatatccaataccgaaagagaaggaaatgttcccaagcattgtggaatcatgccagttaaattgttgtgag 37382706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37393540 - 37393257
Alignment:
Q  7 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |   || | |    
T  37393540 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaaagtatcctctatgttgttgtcaccaaggtccaatacttcaagatatgaacagtaa 37393441  T
Q  107 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccataca 206  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  37393440 gccaaacattgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaattttatagtctcaaatatatttcctttggaaaaggttccaggaatgcttccacaga 37393341  T
Q  207 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37393340 ggttgttcatttgcatatccaaaatagagagataagaaaatgttcctagacattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 37393257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 288 - 791
Target Start/End: Original strand, 37711493 - 37711991
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |  ||||| |||||||||| || ||||    
T  37711493 gagtgaaaagtattgaatgccagatggtggaattggaagatctccttgcaacatgttgaaactaagatcaatgtaccgaatgtccttccatgagtttaag 37711592  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||  |||||||||||| |||| ||| || |||||  |||| || || ||||||||   |||||||||| |   |||      ||| ||||||||||    
T  37711593 agcttcgtatgaaaccatttgggaattttcccatgaatgttgttgttggagagatctaatgtttgcagatttcgtgcttg------gaatttaggaaaac 37711686  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||    
T  37711687 tattaatattagcagaggataaatctaatgaaaaaaggttgggtatgatggagtcaatactgctatcaatgttgatagaaagaaaagtattgtgtgaaag 37711786  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    | | ||  |   |||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  37711787 aacgagataccatagtttgtttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccactcaagtttgttgatgacaaatataagtaagtaagattttggagt 37711886  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggt 786  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  | ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37711887 tgaaatattgaatttggaaaatgaccttgtaggttgttattagagagatccaaagattgcaaagaatatgttgagaactcaccaatgaaccctgtgaggt 37711986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 288 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 37401169 - 37400672
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |  |   |||| |||||||||| || ||||    
T  37401169 gagtgaaaagtattcaatgccagaaggtggaattggaagatctccttgtaacttgttgaaactgaggtctaagtactgaatgtccttccatgagtttaag 37401070  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||  ||||  ||||||| || |||| |||   || ||||||| |      |||   ||| ||||||||||    
T  37401069 agcttcttatgaaaccatttgggaattttcccacgaatgttgttattggagagatataatcttttcagatttcg------tgctgggaatttaggaaaac 37400976  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||    
T  37400975 tattaatattagcagaggataaatctaataaaaaaaggttgggtaagatggagtcagcactgctatcaatgttgatagaaagaaaactattatgggaaag 37400876  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    ||  || ||   |||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37400875 atggagaaaccatagtttgtttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccactcaagtttgttgatgacaaatctaagtaagtaagattttggagt 37400776  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggt 786  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  37400775 tcaaatattgaatttggaaaatgaccttgtaggttgttattagagagaagcaaatattgcaaagaatatgttgaaaactcaccaatgaaccctgtgaggt 37400676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 37593702 - 37593984
Alignment:
Q  8 cttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgag 107  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |   || ||||    
T  37593702 cttagaacttgtaactcttgtagagtttctagccaatttggaaatgtgtcctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaatgaacagtgag 37593801  T
Q  108 ccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaa 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |     
T  37593802 acaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagag 37593901  T
Q  208 gttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37593902 gttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtggaatcatacctgttaaattgttgtgag 37593984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 37696093 - 37696375
Alignment:
Q  8 cttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgag 107  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |   || ||||    
T  37696093 cttagaacttgtaactcttgtagagtttctagccaatttggaaatgtgtcctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaatgaacagtgag 37696192  T
Q  108 ccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaa 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |     
T  37696193 acaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagag 37696292  T
Q  208 gttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37696293 gttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtggaatcatacctgttaaattgttgtgag 37696375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 37639243 - 37639526
Alignment:
Q  7 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactga 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   || | |    
T  37639243 acttatcacctgtaactctggtagagtttctagccaatcaggaaatgtatcctcaacgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagtta 37639342  T
Q  107 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccataca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  37639343 gccaaagattgtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtctcaaatgcatttcctttggagaaggttctaggaatgcttccataga 37639442  T
Q  207 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37639443 ggttgttcatttgcatatccaatacagtaagagaagttaatgttcccaggcattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 37639526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37401661 - 37401378
Alignment:
Q  7 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactga 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   || | |    
T  37401661 acttatcacctgtaactctggtagagtttctagccaatcaggaaatgtatcctcaacgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagtta 37401562  T
Q  107 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccataca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |    
T  37401561 gccaaagattgtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtctcaaatgcatttcctttggtaaaggttctaggaatgcttccataga 37401462  T
Q  207 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37401461 ggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 37401378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 290
Target Start/End: Original strand, 37532598 - 37532880
Alignment:
Q  8 cttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgag 107  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |   || ||||    
T  37532598 cttagaacttgtaactcttgtagagtttctagccaatttggaaatgtgtcctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaatgaacagtgag 37532697  T
Q  108 ccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaa 207  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |     
T  37532698 acaaagactggggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagag 37532797  T
Q  208 gttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37532798 gttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 37532880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 37823401 - 37823684
Alignment:
Q  7 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactga 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   || | |    
T  37823401 acttatcacctgtaactctggtagagtttctagccaatcaggaaatgtatcctcaacgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagtta 37823500  T
Q  107 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccataca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |    
T  37823501 gccaaagattgtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtctcaaatgcatttcctttggtaaaggttctaggaatgcttccataga 37823600  T
Q  207 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37823601 ggttgttcatttgcatatccaatacatgaagagaatttaatgttcccaggcattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 37823684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 37711001 - 37711284
Alignment:
Q  7 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactga 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   || | |    
T  37711001 acttatcacctgtaactctggtagagtttctagccaatcaggaaatgtatcctcaacgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagtta 37711100  T
Q  107 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccataca 206  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |    
T  37711101 gccaaagattgtggtaatgatccttccaattggttgccattcaactttatagtctcaaatgcatttcctttggtaaaggttctaggaatgcttccataga 37711200  T
Q  207 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
     ||||||||||||||||||||| | | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  37711201 ggttgttcatttgcatatccaaaacatagagattaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatacctttcaaattgttgtgag 37711284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 288 - 790
Target Start/End: Original strand, 37696584 - 37697087
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |  |   |||| |||||||||| || ||||    
T  37696584 gagtgaaaagtatccaatgctagaaggtggaattggaagatctccttgtaacttgttgaaactgaggtctaagtcctgaatgtccttccatgagtttaag 37696683  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  |||| || || |||||||||  |||||||||| | ||||| || | ||| ||||||||||    
T  37696684 agcttcttatgaaaccatttgggaattttcccatgaatgttgttgttggagagatctaacgattgcagatttggtagttgcgctaggaatttaggaaaac 37696783  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    |||||||||||  |  |||||| | |||     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| | ||| | |||||    
T  37696784 tattaatattagcattagataattctaagtcaacaaggttgggtaagatggagtcagcactgctatcagtgttgatagcaagaaaagtattgtgtgaaag 37696883  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    | | ||      ||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  ||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| ||||||| |    
T  37696884 aacgagatgccatagtttttttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccactcaagttggttgatgacaaatataactcggtaaggttttggagt 37696983  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggt 786  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37696984 tgaaatattgaatttggaaaatgaccttgtaggttgttattagagagatgcaaagattgcaaagaatatgttgagaactcaccaatgaaccctgtgaggt 37697083  T
Q  787 ggtt 790  Q
    ||||    
T  37697084 ggtt 37697087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 288 - 734
Target Start/End: Original strand, 37428594 - 37429041
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || | ||| | |||||||| || ||||    
T  37428594 gagtaaaaagtattcaatgccataaggtggaattggaagatctccttgcaacttgttgaaactgagatcaacgtgccaaatatacttccatgagtttaag 37428693  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaactttt-ccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaa 486  Q
    ||| | | |||||||||| | | || |||| || |||||  |||| || || |||||||| ||||||||| || | | | | || ||||| || ||||||    
T  37428694 agcattttatgaaaccatatggaaatttttcccatgaatgttgtttttggagagatctaattcttgcagacttggtattcgagctaagaattttggaaaa 37428793  T
Q  487 ctattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaa 586  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||| | | || |||| ||||| |||||||||  | ||| | ||||    
T  37428794 ctattaatatttgtagaagataaatataatgcattaaggctaggtgagatggagtcaatattactgtcaaagttgatagaaagaaagctattgtgcgaaa 37428893  T
Q  587 gatcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaa 686  Q
    |||| |||||||| |||  || ||| || ||||| |  | |||||| ||  | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  37428894 gatcgaggaaagtaagtaatttaaacttagaaaaattgtaaaagtctactacacctctcaagttggttgatgacaaagctaagtaagtaagattttggat 37428993  T
Q  687 tttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagag 734  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37428994 ttcaaatattgaatttggaaaaggaccatgtaacttgttattcgagag 37429041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 387 - 791
Target Start/End: Original strand, 37533062 - 37533467
Alignment:
Q  387 gagcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaa 486  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  |||| || || |||||||||  |||||||||| | ||||| || | ||| |||||||||    
T  37533062 gagcttcttatgaaaccatttgggaattttcccatgaatgttgttgttggagagatctaacgattgcagatttggtagttgcgctaggaatttaggaaaa 37533161  T
Q  487 ctattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaa 586  Q
    ||||||||||||  |  |||||| | |||     ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||  ||||||    
T  37533162 ctattaatattagcattagataattctaagtcaacaaggttgggtaagatggagtcaacattgctattaatgttgatagaaagaaaactattatgggaaa 37533261  T
Q  587 gatcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaa 686  Q
    |||||||| ||  |||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  | |||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||     
T  37533262 gatcaagggaacctagtttgtttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccacttaagtttgtggatgacaaatataagtcggtaagattttggag 37533361  T
Q  687 tttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgagg 785  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  37533362 ttgaaatattgaatttggaaaatgaccttgtaggttgttattagagagatccaaatattgcaaagaatatgttgaaaactcaccaatgaaccctgtgagg 37533461  T
Q  786 tggttg 791  Q
    ||||||    
T  37533462 tggttg 37533467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 37435214 - 37435488
Alignment:
Q  14 acctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgagccaaag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||  || | | | || ||||||||||    
T  37435214 acctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatgttgttgtatccaaggtccaaaattttgagttctgtacagtgagccaaag 37435313  T
Q  114 actgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaagttgtt 213  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||  | ||||||    
T  37435314 attgaggtaatggtccttctaattggttgccattcaactttatagtctcgaaggcatttcctctggaaaaagttttaggcatgcttccattaaggttgtt 37435413  T
Q  214 catttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtg 288  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  37435414 catttgcatatccaaaacggaaagaaaaggaaatgttcccaggcattttggaattatgcctgtcaatttgttgtg 37435488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 314 - 791
Target Start/End: Original strand, 37702563 - 37703035
Alignment:
Q  314 gtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaagagcttctcatgaaaccatttaggaac 413  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| || |  || |||  ||| |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  37702563 gtggaattggaagatgtccttgcaacattttgaaactcaggttaatgtgtataatgtccttccatgagtttaagagtttcttatgaaaccatttgggaat 37702662  T
Q  414 ttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaactattaatattactagaagataaatat 513  Q
    ||| || |||||   |||||| || ||||||||   ||||||||||||   |||      ||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||| |    
T  37702663 tttcccatgaatgtagttattggagagatctaatgtttgcagattttgtgcttg------gaatttaggaaaactattaatattagcagacgagaaatct 37702756  T
Q  514 aatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaagatcaaggaaagttagtttttcaaaat 613  Q
    ||     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| | ||||||   ||| || |||||||||  || |    
T  37702757 aagtcaacaaggttgggtaagatggagtcagcactgctatcaatgttgatagaaataaaactattgtgtgaaagaatgagggaatttagtttttttaatt 37702856  T
Q  614 ttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaatttaaatattgaatttggaaaatgacc 713  Q
    |||||||||| ||||| |||||  | ||  ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  37702857 ttgaaaattggtgaaaatccacgacaccactcaagtttgttgacgacaaatctaagttggtaagattttggagttcatatattgaatttggaaaatgacc 37702956  T
Q  714 atgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggtggttg 791  Q
    |||||  |||||| ||||||||  | ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37702957 atgtaggttgttactagagagatccaaagattgcaaagaatatgttgagaactcaccaatgaaccctgtgaggtggttg 37703035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 781
Target Start/End: Original strand, 37594193 - 37594681
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  || || |    ||| || ||||||| || ||||    
T  37594193 gagtgaaaagtattgaatgccagaaggtggaattggaagatctccttgtaacttgttgaaactcaagtcaatgtacgaaatctcattccatgagtttaag 37594292  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||||| || ||||||||   ||| |||||| |   |||      ||| ||||||||||    
T  37594293 agcttcttatgaaaccatttgggaattttcccatgaatgttgttattggagagatctaatctttgaagatttcgtgtttg------gaatttaggaaaac 37594386  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    |||||||||||  | ||||||||  |||     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| | |||||    
T  37594387 tattaatattagaataagataaaactaagtcaacaaggttgggtaagatggagtcagcactgctatcaaagttgatagaaagaaaactattgtgtgaaag 37594486  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    ||  ||  |   |||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||| | ||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |    
T  37594487 atggagatattctagtttgtttaattttgaaaattggtgaaaatcgacaacaccactcaagttggttgatgacaaagttaagtaagatagattttggagt 37594586  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgt 781  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  37594587 tgaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaggctgttattagagagaaacaaatattgcaaagaatatgttgaaaactcaccaatgaaccctgt 37594681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 377 - 791
Target Start/End: Original strand, 37435665 - 37436074
Alignment:
Q  377 atgtgtgtaagagcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaa 476  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||||| || ||||||||   ||| || |||||      ||||  |||    
T  37435665 atgtgtttaagagcttcttatgaaaccatttgggaattttcccatgaatgttgttattggagagatctaatgtttgaagtttttg------tgcgtggaa 37435758  T
Q  477 attaggaaaactattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattg 576  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |     
T  37435759 tttaggaaaactattaatattagcagaagataaatctaacatctcaaggttgggtaagatggagtcagcactgctattagtgttgatagaaagaaaacta 37435858  T
Q  577 ttgcgggaaagatcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaa 676  Q
    ||| | |||||||  |||| | |||| |||| ||  ||||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  37435859 ttgtgcgaaagattgaggagaattagatttttaagttttgaaaattggtgaaaatccacaacaccactcaagtttgttgatgacaaatctaattcagtaa 37435958  T
Q  677 gattttggaatttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatgga 775  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||| ||||||  | ||  ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  37435959 gattttggagttgaaatattgaatttgaaaaatgaccttctaggttgttatttgagagagtcaaagattgaaaagaatatgttgaaaactcaccaatgaa 37436058  T
Q  776 ccctgtgaggtggttg 791  Q
    ||||||||| ||||||    
T  37436059 ccctgtgagatggttg 37436074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 37393183 - 37392685
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||| |||||| || ||||||||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || || |||  ||| |||||||||| || ||||    
T  37393183 gagtaaaaagtcttcaatgccatcaggtggaattggaagatcaccttgtaacttgttgaaactcaggtcaatgtgtataatgtccttccatgagtttaag 37393084  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |  | |||||  || |||| || ||||||||   || ||||||| |   |||      ||| ||||||||||    
T  37393083 agcttcttatgaaaccatttgggaattctcgcatgaatgttgctattggagagatctaagctttccagatttcgtgcttg------gaatttaggaaaac 37392990  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
    ||||||||||   | | ||||||| ||||||   |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| | |||||    
T  37392989 tattaatattggcatatgataaatctaatgaaaaaaggttaggtaagatggtgtcaacactgctatcaatgttgatagaaagaaaaccattgtgtgaaag 37392890  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    ||  ||  |   |||| | |  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  | ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |    
T  37392889 atagagataccatagtctgtttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccacttaagtttgttgaagacaaatctaagttggtaagattttggagt 37392790  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagaga-agcaattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggt 786  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  ||  |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| |    
T  37392789 tcaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaggttgttatttgagagatacaaagattgcaaagaataagttgaaaactcatcaatgaaccctgtgagat 37392690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 723 - 791
Target Start/End: Original strand, 37697085 - 37697154
Alignment:
Q  723 gttattagagagaagcaatt-ttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggtggttg 791  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37697085 gttattagagagatccaaatattgcaaagaatatgttgagaactcaccaatgaaccctgtgaggtggttg 37697154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 37532954 - 37533016
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaact 350  Q
    |||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37532954 gagtgaaaagtatccaatgccatcaggtggaattggaagatctccttgtaacttgttgaaact 37533016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37401304 - 37401247
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttg 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  37401304 gagtgaaaagtattgaatgccagaaggtggaattggaagatctccttgaaagttgttg 37401247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Original strand, 37711358 - 37711415
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttg 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  37711358 gagtgaaaagtattgaatgccagaaggtggaattggaagatctccttgaaagttgttg 37711415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 723 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 37400674 - 37400612
Alignment:
Q  723 gttattagagagaagcaatt-ttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgag 784  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37400674 gttattagagagatccaaatattgcaaagaatatgttgagaactcaccaatgaaccctgtgag 37400612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Original strand, 37639600 - 37639657
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttg 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  37639600 gagtgaaaagtatttaatgccagaaggtggaattggaagatctccttgaaagttgttg 37639657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 288 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 24218037 - 24217589
Alignment:
Q  288 gagtgaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaag 387  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24218037 gagtgaaaagtattgaattccatagggtggaatcggaaggtctccttgcaacttgttgaaactgagattaataattcgaatttccttccatgtgtgtaag 24217938  T
Q  388 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaac 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||   ||| ||||| ||||||||||    
T  24217937 agcttctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattttgttattagagagatctaatccttgcagattttcaagacttgctaagaatttaggaaaac 24217838  T
Q  488 tattaatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaag 587  Q
     ||||| ||||| |||||||||| ||||    |||||||||||| ||||| ||||| | | |||| ||| ||| | ||||| || ||| |||  ||||||    
T  24217837 cattaacattacaagaagataaagataaatcatcaaggttgggtaagatgtagtcagcgccgctaccaacgttaatagaaataagattattgtaggaaag 24217738  T
Q  588 atcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaat 687  Q
    ||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||  |||||||||| | ||||  || ||||||||| |      
T  24217737 atcaagggaaaatagttttctaaaatttgaaaattggtgaaagtccacaacaccactcaagttgtttgatgacaagcttaaggcagcaagattttgaagc 24217638  T
Q  688 ttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagagaa 736  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||| || |  ||||||||||| ||||    
T  24217637 ttatatattgaatttgaaaaatcaccttgcagattgttattagacagaa 24217589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16843652 - 16843376
Alignment:
Q  14 acctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgagccaaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||    
T  16843652 acctgtaactcttgtagagtttcaagccaactgggaaatgtatcctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagtgagacaaag 16843553  T
Q  114 actgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaagttgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||    
T  16843552 actgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctgaaatgcatttcctttggaaaaggttttaggaatgcttccatagaggttgtt 16843453  T
Q  214 catttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16843452 catttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcctaggcattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 16843376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24218387 - 24218114
Alignment:
Q  14 acctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgagccaaag 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||    
T  24218387 acctgtaactcttgcagaacttctaaccaattgggaaatgtatcgtttatgatgttgtctccaaggtccaaaacttcaagttgtgtgcagtgagccaaag 24218288  T
Q  114 actgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaagttgtt 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  24218287 actgtggtaatggtccctccaattggttgccattcaactttatagtctcgaatgcatttccttccgaaaatgttttaggcatgcttccatagaggttgtt 24218188  T
Q  214 catttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24218187 catttgcatatccaatacagaaagataaggaaatgttcccaggcattgtggaatcgttcctgttaaattgttgt 24218114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16846317 - 16846067
Alignment:
Q  17 tgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactgagccaaagact 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   || | ||| ||||||     
T  16846317 tgtaactcttgtagagtttcaagccaactgggaaatgtatcctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagttagctaaagacc 16846218  T
Q  117 gtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccatacaagttgttcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  ||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||||||    
T  16846217 gtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtgacaaacacatttcctttggaaaaggttctaggaatgcttccaaagaggttgttcat 16846118  T
Q  217 ttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaat 267  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  16846117 ttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaagcattgtggaat 16846067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 292 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 16843163 - 16842669
Alignment:
Q  292 gaaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaagagct 391  Q
    ||||||||||||| ||||||   |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |  | ||| || |||||||||| ||||||||    
T  16843163 gaaaagtattgaaggccataagatggaattggaatgtctccttgcaatttgttgaaactaagatcaatgtaccaaatgtcattccatgtgtttaagagct 16843064  T
Q  392 tctcatgaaaccatttaggaacttttccttgaattatgttattagatagatctaactcttgcagattttgaagttgtgcgaagaaattaggaaaactatt 491  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||||| || ||||||||   ||| |||||| |   |||      ||| ||||||||||||||    
T  16843063 tcttatgaaaccatttgggaattttaccatgaatgttgttattggagagatctaatctttgaagatttcgtgtttg------gaatttaggaaaactatt 16842970  T
Q  492 aatattactagaagataaatataatgattcaaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaagatca 591  Q
    |||||||  | ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| | ||| | ||||||||     
T  16842969 aatattagcataagataaatctaatgaaaaaaggttgggtaagatggagtcagcaatgctatcagtgttgatagaaagaaaagtattgtgtgaaagatcg 16842870  T
Q  592 aggaaagttagtttttcaaaatttgaaaattgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaatttaa 691  Q
    ||  |   |||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||| |   ||||||||||||| || ||    
T  16842869 agataccctagtttgtttaattttgaaaattggtgaaaatccacaacaccactcaagtttgttgatgataaatctagggcggtaagattttggagttcaa 16842770  T
Q  692 atattgaatttggaaaatgaccatgtaacttgttattagagaga-agcaattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggtggtt 790  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| |  ||   | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16842769 atattgaatttggaaaatggccttgtaggttgttattagagagatacaaagacttcaaagaatatgttgagaactcaccaatgaaccctgtgagatggtt 16842670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16845961 - 16845842
Alignment:
Q  293 aaaagtattgaatgccatagagtggaattggaagatctcgttgcaacttgttgaaactgagatcgatatgtcgaatttccttccatgtgtgtaagagctt 392  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| | || |||||||||    
T  16845961 aaaagtatttaatgccataatatggaattggaatgtctccttgcaatttgttgaaactgaggtcaatgtgtcgaatgtccttccacgagtttaagagctt 16845862  T
Q  393 ctcatgaaaccatttaggaa 412  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  16845861 cttatgaaaccattttggaa 16845842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Original strand, 14552869 - 14553152
Alignment:
Q  7 acttagcacctgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactga 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||   || |||    
T  14552869 acttagcacttgtaactcttgtagagtttctagccaattgggaaatgtatcctctatgctgttgtcaccaaggtctaatacttcaagatttgaacagtga 14552968  T
Q  107 gccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatcgtctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggcaagcttccataca 206  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |    
T  14552969 gccaatgactgtggtagtggtcctttcaattggtttccattcaactttatagtctcaaatgcatttccttttgaaaaggttctaggaatgattccataga 14553068  T
Q  207 agttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggcattgtggaatcatgcctgttaaattgttgtgag 290  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14553069 ggttgttcatttgcatatccaaaatagagagaagaggaaatgtccccaggcattgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgag 14553152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 521 - 791
Target Start/End: Original strand, 14553206 - 14553477
Alignment:
Q  521 caaggttgggtgagatggagtcaacactgctatcaatgttgacagaaagaaaattgttgcgggaaagatcaaggaaagttagtttttcaaaatttgaaaa 620  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| | |||||||| ||| || |||||||||  || ||||||||    
T  14553206 caaggttgggtaagatggagttagcactgctatcaatgttgatagaaataaaactattgtgtgaaagatcgagggaatttagtttttttaattttgaaaa 14553305  T
Q  621 ttgatgaaagtccacatcgccgttcaagtttgttgatgacaaacctaagtaagtaagattttggaatttaaatattgaatttggaaaatgaccatgtaac 720  Q
    ||| ||||| |||||| | ||  |||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||      
T  14553306 ttggtgaaaatccacaacaccactcaagtttgtggatgacaaatataagtcggtaagattttggagttcaaatattgaatttggaaaatgaccttgtagg 14553405  T
Q  721 ttgttattagagagaagc-aattttgcaaagaataagttgagaactctccaatggaccctgtgaggtggttg 791  Q
    |||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14553406 ttgttatttgagagatccaaagattgcaaagaataagttgaaaactcaccaatgaaccctgtgaggtggttg 14553477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 826 - 894
Target Start/End: Original strand, 14553507 - 14553575
Alignment:
Q  826 caaataataacaccaatggaggatttgttccatctaacatgttattatttaaatccacata-ctcaattt 894  Q
    |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  14553507 caaagaataacaccaatgt-ggaattgttccatttaacatgttataacttaaatccacatagctcaattt 14553575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University