View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4868-Insertion-5 (Length: 1049)

Name: NF4868-Insertion-5
Description: NF4868
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4868-Insertion-5
NF4868-Insertion-5
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (419-773)||(6110064-6110418)
chr3 (419-773)||(10572445-10572799)
chr3 (419-773)||(15600737-15601091)
chr3 (419-773)||(15607282-15607636)
chr3 (425-773)||(10579208-10579556)
chr3 (421-773)||(16482336-16482688)
chr3 (422-773)||(13211305-13211656)
chr3 (421-773)||(18522665-18523017)
chr3 (425-773)||(17780971-17781319)
chr3 (419-773)||(13248607-13248961)
chr3 (419-773)||(8490488-8490849)
chr3 (419-773)||(15357439-15357793)
chr3 (421-773)||(18519980-18520329)
chr3 (421-773)||(13516813-13517165)
chr3 (421-773)||(17200037-17200389)
chr3 (438-773)||(15342072-15342407)
chr3 (425-773)||(32056752-32057101)
chr3 (425-773)||(1647374-1647726)
chr3 (419-773)||(29924971-29925325)
chr3 (419-773)||(29974124-29974478)
chr3 (421-773)||(16200434-16200784)
chr3 (525-773)||(17136465-17136707)
chr3 (425-637)||(19089734-19089946)
chr3 (777-979)||(6110690-6110890)
chr3 (777-979)||(10571973-10572173)
chr3 (777-979)||(10578737-10578937)
chr3 (777-979)||(15600265-15600465)
chr3 (777-979)||(15606810-15607010)
chr3 (777-979)||(16481864-16482064)
chr3 (777-979)||(8491121-8491321)
chr3 (777-979)||(13211928-13212128)
chr3 (777-979)||(15356967-15357167)
chr3 (777-979)||(15341600-15341800)
chr3 (777-979)||(17780499-17780699)
chr3 (777-976)||(13517433-13517630)
chr3 (777-979)||(1646902-1647102)
chr3 (777-979)||(17136979-17137179)
chr3 (419-580)||(18640792-18640953)
chr3 (777-979)||(23014741-23014941)
chr3 (426-723)||(24253291-24253589)
chr3 (421-658)||(16200128-16200363)
chr3 (777-955)||(17197160-17197336)
chr3 (777-887)||(18520601-18520711)
chr3 (777-951)||(15846121-15846292)
chr3 (801-951)||(21034807-21034955)
chr3 (801-951)||(21399361-21399509)
chr3 (781-951)||(28088655-28088823)
chr3 (590-775)||(15846666-15846847)
chr3 (590-775)||(21034229-21034410)
chr3 (599-775)||(14890391-14890563)
chr3 (590-775)||(20147684-20147865)
chr3 (801-946)||(12300478-12300621)
chr3 (802-951)||(15316760-15316907)
chr3 (801-951)||(55427589-55427737)
chr3 (801-946)||(20147145-20147288)
chr3 (590-775)||(55427012-55427193)
chr3 (599-763)||(21398792-21398952)
chr3 (807-951)||(25978312-25978454)
chr3 (590-775)||(12299902-12300082)
chr3 (781-913)||(15538084-15538216)
chr3 (781-916)||(26816840-26816975)
chr3 (802-916)||(14147590-14147703)
chr3 (777-941)||(9504933-9505095)
chr3 (808-916)||(25800936-25801043)
chr3 (421-483)||(18534758-18534820)
chr3 (326-383)||(6109971-6110028)
chr3 (802-891)||(11788158-11788247)
chr3 (326-383)||(13248514-13248571)
chr3 (590-774)||(14147012-14147192)
chr3 (327-383)||(8490396-8490452)
chr3 (911-979)||(19081800-19081867)
chr3 (640-779)||(32280313-32280450)
chr3 (324-383)||(13211208-13211267)
chr3 (777-833)||(13249233-13249289)
chr3 (327-383)||(18640989-18641045)
chr3 (590-775)||(11787578-11787759)
chr3 (590-775)||(25978858-25979039)
chr3 (327-383)||(17136137-17136193)
chr3 (638-767)||(28953965-28954093)
chr3 (582-684)||(9504446-9504548)
chr3 (327-377)||(10579603-10579653)
chr3 (602-775)||(15317303-15317472)
chr3 (326-383)||(15607672-15607730)
chr3 (326-383)||(15351237-15351294)
chr3 (326-383)||(15357829-15357886)
chr3 (326-383)||(17200427-17200484)
chr3 (421-466)||(18510924-18510969)
chr3 (327-383)||(16482727-16482782)
chr3 (327-383)||(18519885-18519941)
chr3 (326-377)||(10572840-10572891)
chr3 (324-383)||(13516716-13516775)
chr3 (326-383)||(15601127-15601185)
chr3 (777-919)||(35199085-35199226)
chr3 (326-383)||(17781358-17781415)
chr3 (326-383)||(19089985-19090042)
chr3 (327-383)||(1647768-1647824)
chr3 (327-383)||(32057144-32057200)
chr3 (595-710)||(8251933-8252048)
chr3 (802-864)||(29925621-29925683)
chr3 (802-864)||(29974775-29974837)
chr3 (326-383)||(18510828-18510885)
chr3 (326-383)||(18522569-18522626)
chr3 (326-383)||(18534662-18534719)
chr3 (674-763)||(15526827-15526913)
chr3 (938-979)||(32056418-32056459)
chr3 (327-383)||(29924879-29924935)
chr3 (327-383)||(29974032-29974088)
chr3 (506-645)||(19345656-19345795)
[»] scaffold0234 (6 HSPs)
scaffold0234 (419-773)||(2174-2528)
scaffold0234 (419-773)||(11065-11419)
scaffold0234 (777-979)||(1702-1902)
scaffold0234 (777-979)||(10593-10793)
scaffold0234 (326-383)||(2564-2621)
scaffold0234 (326-383)||(11455-11512)
[»] chr1 (80 HSPs)
chr1 (419-773)||(18252030-18252384)
chr1 (419-773)||(18532367-18532721)
chr1 (419-773)||(27131262-27131616)
chr1 (421-773)||(21171086-21171438)
chr1 (421-773)||(27310430-27310782)
chr1 (421-773)||(16358888-16359240)
chr1 (425-772)||(36816488-36816834)
chr1 (419-773)||(3855772-3856126)
chr1 (419-739)||(22657108-22657429)
chr1 (777-979)||(18252656-18252856)
chr1 (777-979)||(18531895-18532095)
chr1 (777-971)||(27309966-27310158)
chr1 (777-979)||(27130791-27130991)
chr1 (425-773)||(27277411-27277756)
chr1 (777-979)||(16358416-16358616)
chr1 (789-976)||(27276944-27277129)
chr1 (802-979)||(36816016-36816191)
chr1 (453-731)||(12014179-12014457)
chr1 (431-708)||(9917837-9918106)
chr1 (777-978)||(22641264-22641457)
chr1 (777-951)||(28134308-28134479)
chr1 (801-951)||(19706024-19706172)
chr1 (453-704)||(12006461-12006712)
chr1 (801-951)||(9456684-9456832)
chr1 (801-951)||(9460780-9460928)
chr1 (801-951)||(20779231-20779379)
chr1 (625-773)||(22641727-22641871)
chr1 (590-775)||(19706569-19706750)
chr1 (801-951)||(22613061-22613208)
chr1 (590-775)||(28134853-28135034)
chr1 (590-775)||(43802495-43802676)
chr1 (801-951)||(47667070-47667218)
chr1 (575-728)||(23507056-23507209)
chr1 (590-775)||(9456107-9456288)
chr1 (590-775)||(20779775-20779956)
chr1 (590-775)||(22670387-22670568)
chr1 (590-775)||(42817119-42817300)
chr1 (801-946)||(22669848-22669991)
chr1 (801-946)||(33283447-33283590)
chr1 (801-951)||(14482458-14482606)
chr1 (801-946)||(42816580-42816723)
chr1 (806-941)||(634513-634645)
chr1 (806-945)||(8728237-8728374)
chr1 (590-775)||(20391369-20391550)
chr1 (590-775)||(22612483-22612664)
chr1 (801-946)||(20390830-20390973)
chr1 (797-970)||(31234313-31234485)
chr1 (801-951)||(43801950-43802098)
chr1 (793-893)||(12006013-12006112)
chr1 (599-775)||(633934-634106)
chr1 (832-946)||(35935924-35936036)
chr1 (590-774)||(8727658-8727838)
chr1 (590-731)||(35930573-35930713)
chr1 (327-383)||(18251936-18251992)
chr1 (327-383)||(18532757-18532813)
chr1 (590-714)||(47667662-47667785)
chr1 (667-776)||(29096789-29096895)
chr1 (777-891)||(35132483-35132597)
chr1 (674-778)||(51997353-51997454)
chr1 (327-383)||(27310821-27310877)
chr1 (816-918)||(10852045-10852146)
chr1 (607-733)||(26923553-26923678)
chr1 (778-891)||(9916247-9916360)
chr1 (674-774)||(21881507-21881604)
chr1 (327-383)||(16359280-16359336)
chr1 (793-891)||(12013762-12013853)
chr1 (933-979)||(9076258-9076304)
chr1 (326-383)||(21171479-21171536)
chr1 (789-889)||(23507536-23507636)
chr1 (326-380)||(36816881-36816935)
chr1 (326-383)||(3856164-3856221)
chr1 (326-379)||(22657469-22657522)
chr1 (425-494)||(30720625-30720694)
chr1 (327-383)||(27131652-27131704)
chr1 (449-526)||(3403248-3403325)
chr1 (449-526)||(3443494-3443571)
chr1 (327-383)||(27277800-27277856)
chr1 (688-767)||(31236402-31236478)
chr1 (145-206)||(5456400-5456461)
chr1 (714-774)||(9916631-9916688)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (419-773)||(18288-18642)
scaffold0220 (777-979)||(18913-19113)
scaffold0220 (327-383)||(18196-18252)
[»] chr7 (103 HSPs)
chr7 (419-773)||(29327784-29328138)
chr7 (419-778)||(11535910-11536269)
chr7 (419-778)||(11542828-11543187)
chr7 (421-773)||(15152445-15152797)
chr7 (421-773)||(12750828-12751180)
chr7 (421-755)||(18561009-18561343)
chr7 (425-773)||(12738542-12738890)
chr7 (8-299)||(23862964-23863255)
chr7 (421-776)||(18257694-18258047)
chr7 (421-640)||(15148144-15148363)
chr7 (777-971)||(11542369-11542561)
chr7 (777-979)||(29328410-29328610)
chr7 (779-979)||(24850940-24851138)
chr7 (777-971)||(11535451-11535643)
chr7 (777-979)||(15153069-15153269)
chr7 (777-979)||(18561624-18561824)
chr7 (425-773)||(13392157-13392504)
chr7 (777-969)||(12751452-12751642)
chr7 (777-969)||(12739160-12739350)
chr7 (777-979)||(13392774-13392975)
chr7 (777-951)||(8465545-8465716)
chr7 (801-951)||(18400672-18400820)
chr7 (801-951)||(18407656-18407804)
chr7 (801-951)||(48808082-48808230)
chr7 (599-775)||(8464999-8465171)
chr7 (781-945)||(41680559-41680721)
chr7 (802-946)||(47166449-47166591)
chr7 (792-951)||(19231448-19231605)
chr7 (806-945)||(24442968-24443105)
chr7 (590-775)||(2204543-2204724)
chr7 (806-944)||(15168886-15169022)
chr7 (590-775)||(18400095-18400276)
chr7 (590-775)||(18407079-18407260)
chr7 (590-775)||(30254129-30254310)
chr7 (590-775)||(48808626-48808807)
chr7 (801-946)||(18138929-18139072)
chr7 (801-946)||(30254706-30254849)
chr7 (801-951)||(18257150-18257299)
chr7 (801-951)||(15730319-15730467)
chr7 (590-775)||(19230879-19231060)
chr7 (801-946)||(2205120-2205263)
chr7 (802-951)||(18258708-18258855)
chr7 (441-637)||(2364917-2365112)
chr7 (802-945)||(34129144-34129285)
chr7 (590-775)||(15729742-15729923)
chr7 (590-775)||(18139468-18139649)
chr7 (452-677)||(7396221-7396450)
chr7 (777-880)||(11546418-11546521)
chr7 (425-699)||(39111819-39112092)
chr7 (590-764)||(10669043-10669213)
chr7 (618-731)||(10235361-10235474)
chr7 (777-945)||(19393018-19393184)
chr7 (777-944)||(12393174-12393339)
chr7 (600-776)||(24443456-24443628)
chr7 (667-775)||(41681098-41681203)
chr7 (802-946)||(28131132-28131274)
chr7 (806-944)||(25845114-25845251)
chr7 (590-775)||(19393554-19393735)
chr7 (590-775)||(47166989-47167170)
chr7 (666-774)||(2365169-2365274)
chr7 (326-383)||(11543223-11543280)
chr7 (327-383)||(2653275-2653331)
chr7 (327-383)||(12738443-12738499)
chr7 (600-708)||(47833875-47833983)
chr7 (591-775)||(19388544-19388728)
chr7 (674-775)||(14591924-14592022)
chr7 (674-775)||(16011515-16011613)
chr7 (597-778)||(25845603-25845780)
chr7 (597-778)||(25846022-25846199)
chr7 (326-383)||(11536305-11536362)
chr7 (326-383)||(12750732-12750789)
chr7 (326-383)||(15152349-15152406)
chr7 (848-944)||(12410113-12410207)
chr7 (599-699)||(19859122-19859221)
chr7 (590-765)||(28130552-28130723)
chr7 (326-382)||(29327689-29327745)
chr7 (681-776)||(31190568-31190660)
chr7 (493-732)||(3132748-3132986)
chr7 (604-722)||(7662569-7662686)
chr7 (802-908)||(19389131-19389236)
chr7 (674-774)||(22969024-22969121)
chr7 (327-383)||(15148049-15148105)
chr7 (895-957)||(11557444-11557503)
chr7 (209-298)||(23872073-23872160)
chr7 (777-840)||(5982399-5982463)
chr7 (326-382)||(13392029-13392085)
chr7 (674-765)||(34128647-34128735)
chr7 (802-913)||(14592463-14592573)
chr7 (801-891)||(7396858-7396948)
chr7 (843-945)||(31189962-31190062)
chr7 (777-891)||(39112422-39112536)
chr7 (469-534)||(10234179-10234244)
chr7 (667-775)||(18259254-18259359)
chr7 (327-383)||(18258087-18258143)
chr7 (777-906)||(23387713-23387841)
chr7 (419-451)||(2653207-2653239)
chr7 (590-730)||(3587900-3588039)
chr7 (327-383)||(18560913-18560969)
chr7 (633-688)||(29983179-29983234)
chr7 (811-889)||(47833437-47833516)
chr7 (664-706)||(7396469-7396511)
chr7 (802-916)||(16012012-16012125)
chr7 (708-776)||(15169419-15169484)
[»] chr6 (90 HSPs)
chr6 (419-773)||(27381105-27381459)
chr6 (419-773)||(27471488-27471842)
chr6 (421-773)||(17684322-17684674)
chr6 (419-773)||(29308890-29309244)
chr6 (419-773)||(29315850-29316204)
chr6 (419-773)||(17691293-17691647)
chr6 (421-773)||(188830-189182)
chr6 (421-773)||(11651725-11652077)
chr6 (421-689)||(16566257-16566525)
chr6 (421-637)||(25537148-25537364)
chr6 (777-979)||(17690821-17691021)
chr6 (777-979)||(27380633-27380833)
chr6 (777-979)||(27471016-27471216)
chr6 (777-979)||(29309516-29309716)
chr6 (777-979)||(29316475-29316675)
chr6 (777-979)||(27297255-27297455)
chr6 (777-979)||(16558853-16559053)
chr6 (777-971)||(11652349-11652541)
chr6 (777-979)||(17683850-17684050)
chr6 (421-774)||(13359126-13359474)
chr6 (777-971)||(25536580-25536772)
chr6 (633-773)||(16394298-16394438)
chr6 (777-979)||(18336281-18336480)
chr6 (458-723)||(20553492-20553755)
chr6 (667-773)||(27296877-27296983)
chr6 (665-771)||(25537046-25537152)
chr6 (457-729)||(17850392-17850663)
chr6 (442-772)||(27925772-27926103)
chr6 (801-951)||(18019414-18019562)
chr6 (781-946)||(14075029-14075192)
chr6 (684-773)||(16559325-16559414)
chr6 (590-775)||(18019971-18020152)
chr6 (801-951)||(27525147-27525295)
chr6 (590-775)||(16789062-16789243)
chr6 (590-775)||(22860018-22860199)
chr6 (801-951)||(27507933-27508081)
chr6 (801-946)||(16789639-16789782)
chr6 (801-946)||(22859479-22859622)
chr6 (801-951)||(1585694-1585842)
chr6 (590-775)||(27508477-27508658)
chr6 (590-775)||(27528063-27528244)
chr6 (590-775)||(1586238-1586419)
chr6 (781-945)||(22559786-22559948)
chr6 (602-731)||(2669476-2669605)
chr6 (781-937)||(10358653-10358808)
chr6 (806-951)||(33317440-33317583)
chr6 (806-946)||(8613494-8613632)
chr6 (781-945)||(19735110-19735272)
chr6 (590-774)||(14074471-14074651)
chr6 (792-945)||(19734835-19734986)
chr6 (457-775)||(20736459-20736773)
chr6 (777-869)||(16393944-16394036)
chr6 (438-772)||(8509941-8510273)
chr6 (802-916)||(21995529-21995642)
chr6 (617-722)||(28172754-28172859)
chr6 (803-891)||(28173188-28173276)
chr6 (590-733)||(8612906-8613048)
chr6 (598-776)||(22560313-22560487)
chr6 (329-383)||(17691683-17691737)
chr6 (326-383)||(27381495-27381552)
chr6 (326-383)||(27471878-27471935)
chr6 (326-383)||(29308797-29308854)
chr6 (326-383)||(29315757-29315814)
chr6 (840-968)||(28755639-28755765)
chr6 (597-778)||(19218427-19218599)
chr6 (326-383)||(17684712-17684769)
chr6 (590-776)||(10359180-10359360)
chr6 (802-866)||(20735997-20736061)
chr6 (327-381)||(11651630-11651684)
chr6 (667-776)||(21994655-21994761)
chr6 (326-383)||(25537405-25537462)
chr6 (850-971)||(13358665-13358786)
chr6 (590-694)||(13995151-13995254)
chr6 (597-774)||(4073574-4073746)
chr6 (674-733)||(5758650-5758709)
chr6 (777-860)||(13194518-13194601)
chr6 (613-734)||(19347092-19347212)
chr6 (819-927)||(8065243-8065350)
chr6 (904-979)||(16393870-16393944)
chr6 (426-481)||(31258065-31258120)
chr6 (326-383)||(13359512-13359569)
chr6 (667-775)||(17120635-17120740)
chr6 (808-888)||(8510436-8510516)
chr6 (335-383)||(16566563-16566611)
chr6 (775-838)||(28917960-28918023)
chr6 (327-383)||(189221-189280)
chr6 (825-886)||(24465191-24465252)
chr6 (780-855)||(17849960-17850035)
chr6 (341-383)||(16394484-16394526)
chr6 (435-500)||(22259925-22259990)
[»] chr4 (127 HSPs)
chr4 (419-773)||(5707320-5707674)
chr4 (419-773)||(55612683-55613037)
chr4 (419-773)||(5713948-5714302)
chr4 (419-773)||(19926613-19926967)
chr4 (419-773)||(26970463-26970817)
chr4 (419-776)||(868597-868954)
chr4 (421-773)||(18262214-18262566)
chr4 (419-773)||(26963640-26963994)
chr4 (419-776)||(10628262-10628619)
chr4 (419-773)||(10621186-10621540)
chr4 (421-773)||(18269070-18269427)
chr4 (421-773)||(28392987-28393339)
chr4 (431-773)||(8858179-8858521)
chr4 (431-773)||(8845215-8845557)
chr4 (421-748)||(4426482-4426808)
chr4 (777-979)||(8858793-8858993)
chr4 (777-979)||(18262838-18263038)
chr4 (777-979)||(19926141-19926341)
chr4 (777-979)||(26964266-26964466)
chr4 (777-979)||(55613309-55613509)
chr4 (427-731)||(20311299-20311604)
chr4 (425-773)||(5667980-5668327)
chr4 (777-979)||(10620714-10620914)
chr4 (777-979)||(26971089-26971289)
chr4 (777-978)||(869223-869422)
chr4 (425-773)||(35223576-35223914)
chr4 (777-979)||(5714574-5714773)
chr4 (777-979)||(18269699-18269899)
chr4 (777-979)||(28392515-28392715)
chr4 (777-979)||(10627796-10627993)
chr4 (777-979)||(5707946-5708145)
chr4 (777-979)||(8845829-8846029)
chr4 (777-979)||(4425996-4426196)
chr4 (779-971)||(35224186-35224376)
chr4 (791-979)||(5667511-5667698)
chr4 (777-971)||(10676968-10677158)
chr4 (777-979)||(10689905-10690103)
chr4 (777-971)||(10890608-10890798)
chr4 (777-979)||(10903545-10903743)
chr4 (419-534)||(12357136-12357251)
chr4 (781-946)||(34976101-34976264)
chr4 (801-951)||(26532181-26532330)
chr4 (425-643)||(10677538-10677753)
chr4 (425-643)||(10891178-10891393)
chr4 (457-731)||(56516094-56516368)
chr4 (801-951)||(2677581-2677729)
chr4 (590-775)||(15461488-15461669)
chr4 (801-946)||(15815589-15815732)
chr4 (445-773)||(21453993-21454319)
chr4 (421-776)||(5616215-5616568)
chr4 (590-775)||(2677004-2677185)
chr4 (801-951)||(15462070-15462218)
chr4 (590-775)||(15815012-15815193)
chr4 (590-775)||(17300089-17300270)
chr4 (590-775)||(18111173-18111354)
chr4 (590-775)||(34975542-34975723)
chr4 (801-946)||(5870985-5871128)
chr4 (801-946)||(17299550-17299693)
chr4 (801-946)||(18110634-18110777)
chr4 (674-773)||(10677435-10677534)
chr4 (674-773)||(10891075-10891174)
chr4 (812-951)||(28917360-28917497)
chr4 (590-775)||(3369153-3369334)
chr4 (801-951)||(4675569-4675717)
chr4 (801-951)||(18163730-18163878)
chr4 (801-951)||(20244505-20244653)
chr4 (802-951)||(1942260-1942407)
chr4 (802-939)||(9488118-9488253)
chr4 (600-775)||(5870419-5870590)
chr4 (590-775)||(4676113-4676294)
chr4 (590-775)||(18163153-18163334)
chr4 (590-775)||(20243928-20244109)
chr4 (780-913)||(24701630-24701763)
chr4 (590-775)||(26531604-26531785)
chr4 (801-946)||(3368614-3368757)
chr4 (802-951)||(4546633-4546780)
chr4 (781-909)||(19373894-19374022)
chr4 (781-916)||(19362958-19363093)
chr4 (806-941)||(30040084-30040217)
chr4 (803-945)||(11421558-11421698)
chr4 (582-730)||(32646697-32646845)
chr4 (781-914)||(9538507-9538640)
chr4 (777-944)||(5524582-5524748)
chr4 (599-765)||(19365519-19365681)
chr4 (590-776)||(32636475-32636657)
chr4 (590-775)||(1941715-1941896)
chr4 (811-944)||(5616975-5617105)
chr4 (326-383)||(5713855-5713912)
chr4 (326-383)||(26963547-26963604)
chr4 (326-383)||(26970370-26970427)
chr4 (895-976)||(47388328-47388408)
chr4 (327-383)||(19927003-19927059)
chr4 (590-775)||(4546071-4546252)
chr4 (603-681)||(24700213-24700291)
chr4 (781-914)||(32637032-32637165)
chr4 (326-383)||(10621576-10621633)
chr4 (327-383)||(5707228-5707284)
chr4 (327-383)||(12357044-12357100)
chr4 (329-383)||(868507-868561)
chr4 (777-927)||(36092869-36093022)
chr4 (327-383)||(10628655-10628711)
chr4 (327-383)||(17142372-17142428)
chr4 (327-383)||(55612594-55612650)
chr4 (674-776)||(9538033-9538132)
chr4 (674-775)||(9487625-9487723)
chr4 (667-776)||(19362477-19362583)
chr4 (327-381)||(28393380-28393434)
chr4 (326-383)||(18268975-18269032)
chr4 (327-383)||(4426847-4426903)
chr4 (646-773)||(34777850-34777975)
chr4 (468-636)||(39074190-39074346)
chr4 (590-776)||(5528608-5528790)
chr4 (686-775)||(30040619-30040705)
chr4 (816-927)||(9937430-9937540)
chr4 (689-775)||(11421096-11421179)
chr4 (806-965)||(23055635-23055790)
chr4 (575-657)||(9937933-9938015)
chr4 (334-383)||(55992680-55992729)
chr4 (342-383)||(5668371-5668412)
chr4 (655-730)||(33888594-33888666)
chr4 (335-383)||(8845118-8845166)
chr4 (335-383)||(8858082-8858130)
chr4 (343-383)||(18262136-18262176)
chr4 (469-528)||(11161913-11161972)
chr4 (329-383)||(20311207-20311261)
chr4 (590-635)||(11421007-11421052)
chr4 (590-635)||(30040740-30040785)
[»] scaffold0390 (6 HSPs)
scaffold0390 (419-773)||(6787-7141)
scaffold0390 (419-773)||(13803-14157)
scaffold0390 (777-979)||(6315-6515)
scaffold0390 (777-979)||(13331-13531)
scaffold0390 (326-383)||(7177-7234)
scaffold0390 (327-383)||(14193-14249)
[»] chr8 (79 HSPs)
chr8 (419-773)||(21940665-21941019)
chr8 (425-776)||(24642655-24643005)
chr8 (425-773)||(6094129-6094477)
chr8 (421-773)||(22171491-22171841)
chr8 (777-979)||(6094749-6094949)
chr8 (421-620)||(28554885-28555084)
chr8 (777-979)||(21941291-21941491)
chr8 (777-979)||(15326824-15327024)
chr8 (777-979)||(15507193-15507393)
chr8 (777-979)||(28548673-28548873)
chr8 (777-971)||(24643273-24643465)
chr8 (643-773)||(15326422-15326552)
chr8 (643-773)||(15506791-15506921)
chr8 (431-731)||(38232272-38232570)
chr8 (425-552)||(24636860-24636987)
chr8 (777-978)||(24796387-24796586)
chr8 (515-774)||(14983776-14984030)
chr8 (594-772)||(24797242-24797419)
chr8 (781-951)||(26241034-26241202)
chr8 (804-951)||(8370838-8370983)
chr8 (590-775)||(21969324-21969505)
chr8 (801-951)||(25611764-25611912)
chr8 (590-775)||(12562114-12562295)
chr8 (801-951)||(22130195-22130343)
chr8 (802-951)||(6431457-6431604)
chr8 (781-946)||(22659084-22659247)
chr8 (801-946)||(27007108-27007251)
chr8 (801-946)||(27014251-27014394)
chr8 (590-775)||(8371383-8371564)
chr8 (590-775)||(22130739-22130920)
chr8 (590-775)||(25611186-25611367)
chr8 (590-775)||(27007647-27007828)
chr8 (590-775)||(27014790-27014971)
chr8 (590-775)||(27880617-27880798)
chr8 (590-775)||(28020798-28020979)
chr8 (801-946)||(21917244-21917387)
chr8 (801-946)||(27880078-27880221)
chr8 (801-946)||(28020259-28020402)
chr8 (801-951)||(21969902-21970050)
chr8 (801-951)||(45533859-45534007)
chr8 (590-775)||(21916667-21916848)
chr8 (590-775)||(45534403-45534584)
chr8 (440-742)||(2375027-2375332)
chr8 (449-726)||(32872741-32873019)
chr8 (590-765)||(26240475-26240646)
chr8 (590-776)||(18835341-18835523)
chr8 (802-945)||(18835916-18836057)
chr8 (802-952)||(2962515-2962663)
chr8 (806-943)||(8781467-8781602)
chr8 (777-858)||(22172112-22172193)
chr8 (600-775)||(22659624-22659795)
chr8 (905-979)||(22172188-22172261)
chr8 (793-888)||(14978953-14979047)
chr8 (327-383)||(21940573-21940629)
chr8 (327-383)||(22070108-22070164)
chr8 (675-776)||(8782004-8782102)
chr8 (667-775)||(6430953-6431058)
chr8 (326-383)||(22171395-22171452)
chr8 (326-379)||(24642555-24642608)
chr8 (327-383)||(6094031-6094087)
chr8 (326-383)||(28554790-28554847)
chr8 (777-847)||(8967813-8967883)
chr8 (602-696)||(29645537-29645631)
chr8 (590-733)||(2963105-2963247)
chr8 (777-863)||(20534880-20534967)
chr8 (575-673)||(24535471-24535569)
chr8 (777-890)||(32872318-32872431)
chr8 (777-916)||(27098615-27098753)
chr8 (457-520)||(10920234-10920297)
chr8 (673-732)||(34659059-34659118)
chr8 (599-706)||(36970265-36970371)
chr8 (793-883)||(2375677-2375767)
chr8 (646-698)||(10920427-10920479)
chr8 (793-841)||(38231897-38231945)
chr8 (655-730)||(27677551-27677626)
chr8 (326-380)||(2374946-2375000)
chr8 (703-776)||(20535339-20535409)
chr8 (850-918)||(38231130-38231195)
chr8 (327-364)||(24636605-24636642)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (419-773)||(24695319-24695673)
chr5 (421-773)||(19714351-19714703)
chr5 (425-775)||(19707069-19707419)
chr5 (419-773)||(18569714-18570070)
chr5 (777-971)||(24694847-24695039)
chr5 (777-971)||(24701611-24701803)
chr5 (532-773)||(39538701-39538942)
chr5 (425-891)||(22546763-22547217)
chr5 (777-979)||(19713879-19714079)
chr5 (777-971)||(19706608-19706800)
chr5 (485-774)||(18806889-18807175)
chr5 (424-679)||(27347425-27347679)
chr5 (423-774)||(17285603-17285935)
chr5 (777-916)||(18567943-18568081)
chr5 (777-978)||(39539174-39539374)
chr5 (423-774)||(17298754-17299088)
chr5 (777-951)||(25804970-25805141)
chr5 (801-951)||(22941820-22941968)
chr5 (590-775)||(20941018-20941199)
chr5 (801-951)||(20941596-20941744)
chr5 (590-775)||(25805515-25805696)
chr5 (781-951)||(31097365-31097533)
chr5 (801-946)||(32467-32610)
chr5 (801-946)||(23546490-23546633)
chr5 (793-945)||(17282873-17283023)
chr5 (781-951)||(12764574-12764743)
chr5 (590-775)||(31890-32071)
chr5 (590-775)||(23545913-23546094)
chr5 (802-945)||(9811323-9811464)
chr5 (801-951)||(12789249-12789397)
chr5 (590-775)||(12789793-12789974)
chr5 (590-775)||(22941241-22941422)
chr5 (801-951)||(24932892-24933040)
chr5 (802-916)||(5098219-5098332)
chr5 (590-775)||(24933436-24933617)
chr5 (419-528)||(39537962-39538071)
chr5 (802-945)||(31651370-31651511)
chr5 (590-775)||(31096807-31096988)
chr5 (806-946)||(7865019-7865157)
chr5 (806-946)||(26245676-26245815)
chr5 (793-915)||(17298348-17298468)
chr5 (793-909)||(17314431-17314546)
chr5 (777-881)||(28719234-28719338)
chr5 (802-891)||(39535762-39535851)
chr5 (590-734)||(12765162-12765305)
chr5 (590-775)||(5097642-5097823)
chr5 (326-383)||(24695709-24695766)
chr5 (601-776)||(20100372-20100543)
chr5 (590-733)||(7865603-7865745)
chr5 (590-733)||(9811906-9812048)
chr5 (590-733)||(12704047-12704189)
chr5 (425-528)||(31886537-31886640)
chr5 (327-383)||(19714742-19714798)
chr5 (590-765)||(26245093-26245264)
chr5 (326-383)||(19707462-19707519)
chr5 (327-383)||(27347722-27347778)
chr5 (657-774)||(18829416-18829530)
chr5 (783-856)||(20099922-20099995)
chr5 (590-775)||(31651915-31652095)
chr5 (681-774)||(18806529-18806619)
chr5 (681-774)||(18806709-18806799)
chr5 (667-776)||(26129822-26129928)
chr5 (935-979)||(18565847-18565891)
chr5 (445-535)||(33477389-33477479)
chr5 (326-383)||(18570108-18570165)
chr5 (806-894)||(33476770-33476858)
chr5 (327-382)||(39537870-39537925)
chr5 (732-773)||(27347388-27347428)
chr5 (469-537)||(11479420-11479489)
chr5 (602-731)||(33477193-33477321)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (419-773)||(21330101-21330455)
chr2 (419-772)||(18796506-18796859)
chr2 (421-773)||(18619807-18620157)
chr2 (777-962)||(21329646-21329829)
chr2 (777-971)||(22791247-22791439)
chr2 (777-979)||(41661898-41662096)
chr2 (453-774)||(36270199-36270518)
chr2 (484-774)||(20977957-20978227)
chr2 (777-890)||(18797132-18797245)
chr2 (788-979)||(18620437-18620626)
chr2 (801-951)||(24249618-24249766)
chr2 (453-720)||(18822115-18822384)
chr2 (781-951)||(24228799-24228967)
chr2 (801-951)||(30174945-30175093)
chr2 (590-775)||(24250162-24250343)
chr2 (590-775)||(30174368-30174549)
chr2 (582-718)||(22183392-22183527)
chr2 (781-916)||(29801020-29801155)
chr2 (425-564)||(19692598-19692737)
chr2 (539-708)||(18851977-18852146)
chr2 (806-913)||(15341623-15341729)
chr2 (590-775)||(24229345-24229526)
chr2 (576-731)||(19279445-19279600)
chr2 (779-945)||(36270788-36270951)
chr2 (594-774)||(6991967-6992146)
chr2 (802-945)||(24763262-24763403)
chr2 (802-891)||(20687057-20687146)
chr2 (806-914)||(19617009-19617115)
chr2 (327-383)||(21330493-21330549)
chr2 (777-891)||(31848002-31848115)
chr2 (793-890)||(22182960-22183056)
chr2 (605-708)||(36801899-36802003)
chr2 (600-733)||(29800468-29800604)
chr2 (794-887)||(6991590-6991683)
chr2 (814-927)||(12298416-12298528)
chr2 (667-765)||(15342142-15342237)
chr2 (674-775)||(21626824-21626921)
chr2 (674-778)||(40301064-40301164)
chr2 (599-775)||(19616435-19616607)
chr2 (601-708)||(28741220-28741326)
chr2 (676-774)||(41316411-41316506)
chr2 (777-838)||(39338190-39338251)
chr2 (670-733)||(28718943-28719006)
chr2 (590-708)||(24763751-24763868)
chr2 (590-635)||(12098609-12098654)
chr2 (326-383)||(19692773-19692830)
chr2 (777-835)||(41315554-41315613)
chr2 (848-890)||(41332825-41332867)
chr2 (743-776)||(17241034-17241067)
[»] scaffold0433 (3 HSPs)
scaffold0433 (419-773)||(7107-7461)
scaffold0433 (777-979)||(7733-7933)
scaffold0433 (326-383)||(7014-7071)
[»] scaffold0186 (3 HSPs)
scaffold0186 (419-773)||(25843-26197)
scaffold0186 (777-867)||(25481-25571)
scaffold0186 (326-382)||(26231-26287)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (419-773)||(993-1347)
scaffold0657 (327-383)||(901-957)
[»] scaffold0063 (3 HSPs)
scaffold0063 (421-770)||(5531-5881)
scaffold0063 (777-979)||(6148-6348)
scaffold0063 (326-383)||(5435-5492)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (796-979)||(5602-5783)
scaffold0061 (796-979)||(91-272)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (777-979)||(229772-229972)
scaffold0008 (421-602)||(230365-230545)
scaffold0008 (650-773)||(230244-230367)
scaffold0008 (327-383)||(230584-230640)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (801-951)||(752-900)
scaffold0112 (590-775)||(174-355)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (801-951)||(120298-120446)
scaffold0028 (590-775)||(119721-119902)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (801-951)||(731-879)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (590-775)||(8296-8477)
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (590-775)||(3805-3986)
scaffold0264 (801-946)||(3266-3409)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (590-775)||(130354-130535)
[»] scaffold0466 (2 HSPs)
scaffold0466 (802-917)||(12567-12681)
scaffold0466 (590-775)||(13079-13260)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (599-776)||(40117-40290)
scaffold0031 (806-945)||(39578-39715)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (802-951)||(66993-67140)
scaffold0006 (590-775)||(67504-67685)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (802-946)||(54333-54475)
scaffold0086 (600-765)||(53766-53927)
[»] scaffold1303 (1 HSPs)
scaffold1303 (882-979)||(1343-1438)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (588-708)||(90033-90154)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (667-775)||(26609-26714)
scaffold0111 (822-945)||(27132-27253)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (419-483)||(8446-8510)
scaffold0176 (326-383)||(8546-8603)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (326-383)||(23769-23826)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (326-383)||(16522-16579)
scaffold0326 (419-452)||(16615-16648)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (590-776)||(8722-8904)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (802-916)||(108742-108855)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (860-951)||(8099-8188)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (777-864)||(81476-81563)
scaffold0034 (674-769)||(83151-83243)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (326-383)||(41-98)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (327-383)||(8944-9000)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (803-890)||(24424-24511)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (674-733)||(11699-11758)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (864-951)||(128128-128213)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (329-383)||(10202-10256)
scaffold0565 (438-469)||(10127-10158)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (638-729)||(45956-46051)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (327-363)||(1-37)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (686-776)||(11328-11415)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (793-917)||(9701-9830)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (448-684)||(92194-92432)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (326-379)||(5877-5930)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (777-840)||(15735-15799)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (710-775)||(96-158)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (590-635)||(15089-15134)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 6110064 - 6110418
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110064 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 6110163  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6110263  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6110264 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6110363  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110364 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 6110418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 10572799 - 10572445
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572799 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10572700  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10572600  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10572599 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10572500  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10572499 gaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgata 10572445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 15601091 - 15600737
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601091 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15600992  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600991 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15600892  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15600891 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15600792  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600791 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 15600737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 15607636 - 15607282
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607636 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15607537  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607536 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15607437  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15607436 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15607337  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607336 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 15607282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 10579556 - 10579208
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579556 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttaaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 10579457  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579456 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 10579357  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10579356 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 10579257  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579256 tacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 10579208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16482688 - 16482336
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482688 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16482589  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482588 cccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16482489  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16482488 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16482389  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482388 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 16482336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 422 - 773
Target Start/End: Original strand, 13211305 - 13211656
Alignment:
Q  422 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211305 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 13211404  T
Q  522 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211405 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 13211504  T
Q  622 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaa 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13211505 atgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 13211604  T
Q  722 tactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211605 tattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgata 13211656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 18522665 - 18523017
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522665 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18522764  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522765 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcatttaagcatagagactattatgtaggtagact 18522864  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18522865 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaa 18522964  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522965 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 18523017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17781319 - 17780971
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781319 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 17781220  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781219 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 17781120  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17781119 atcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 17781020  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781019 tacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 17780971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 13248607 - 13248961
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248607 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 13248706  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtattcgtagtcaagctttgttgagaagtgggataacattaaagcatagagactattatgtaggtaga 13248806  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13248807 ctgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatga 13248906  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13248907 gaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgata 13248961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 8490488 - 8490849
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490488 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 8490587  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagact-------attatgt 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  8490588 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactacagacgattatgt 8490687  T
Q  612 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490688 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 8490787  T
Q  712 accatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490788 gccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 8490849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 15357793 - 15357439
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357793 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15357694  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15357693 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtaga 15357594  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15357593 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatga 15357494  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357493 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 15357439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 18519980 - 18520329
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18519980 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18520079  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520080 cccgttaaacataaggaaactattcttaaa---tccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18520176  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18520177 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgaga 18520276  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520277 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 18520329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 13516813 - 13517165
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516813 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttcatggaacattaagtataacttaattgtgagac 13516912  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13516913 cccgttaaacataaggaaacgattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcacagagactattatgtgggtagact 13517012  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13517013 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgaga 13517112  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517113 atactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 13517165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17200389 - 17200037
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17200389 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgatac 17200290  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200289 ccctttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagttaagctttattgagatgtgtgatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 17200190  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  17200189 gatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgaga 17200090  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200089 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 17200037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 438 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 15342407 - 15342072
Alignment:
Q  438 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342407 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagtttgttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 15342308  T
Q  538 aactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 637  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342307 acctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 15342208  T
Q  638 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaag 737  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  15342207 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaa 15342108  T
Q  738 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342107 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 15342072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 32057101 - 32056752
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  32057101 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacatcaagtataactttattgtaagaccccg 32057002  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  32057001 ttaaacataaagaaactattcttaaagtgtccgtagtcaaactttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatg 32056902  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat-aaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaata 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32056901 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 32056802  T
Q  724 ctacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056801 ctacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 32056752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 1647726 - 1647374
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataa----cttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  1647726 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataattaacttaattgtgagac 1647627  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1647626 cccgttaaacataaggaaactatttttaaagtatccgtaatcaagctttattgagaaaagggatataattaaagcatagagactattatgtggatagact 1647527  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||    
T  1647526 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgaga 1647427  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1647426 atactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgata 1647374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 29924971 - 29925325
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29924971 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29925070  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29925071 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29925170  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  29925171 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29925270  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925271 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 29925325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 29974124 - 29974478
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29974124 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29974223  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29974224 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29974323  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  29974324 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29974423  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974424 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 29974478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 16200434 - 16200784
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200434 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200532  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
     ||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||    
T  16200533 tccaataaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatgtcattaaagcatgaagactatt-tgtggagagact 16200631  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16200632 gatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgaga 16200731  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200732 atactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgata 16200784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 525 - 773
Target Start/End: Original strand, 17136465 - 17136707
Alignment:
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17136465 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatg 17136564  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17136565 atcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatag------atattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 17136658  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136659 tacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgata 17136707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 425 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 19089946 - 19089734
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19089946 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccct 19089847  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089846 ttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatg 19089747  T
Q  625 atcacatctcaca 637  Q
    |||||||||||||    
T  19089746 atcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 6110690 - 6110890
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110690 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 6110789  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6110790 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 6110887  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  6110888 gac 6110890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10572173 - 10571973
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572173 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10572074  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10572073 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 10571976  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  10571975 gac 10571973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10578937 - 10578737
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10578937 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10578838  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10578837 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 10578740  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  10578739 gac 10578737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 15600465 - 15600265
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600465 attatacacatgatcactatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 15600366  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15600365 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 15600268  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  15600267 gac 15600265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 15607010 - 15606810
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607010 attatacacatgatcactatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 15606911  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15606910 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 15606813  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  15606812 gac 15606810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 16482064 - 16481864
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16482064 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgcttgataccgctcactgtt 16481965  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16481964 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 16481867  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  16481866 gac 16481864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 8491121 - 8491321
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8491121 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcatattacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 8491220  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8491221 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 8491318  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  8491319 gac 8491321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 13211928 - 13212128
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211928 attatacacatgatcattatcacagaaagatttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 13212027  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13212028 tataatattaaatatgt-gatgtaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 13212125  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  13212126 gac 13212128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 15357167 - 15356967
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357167 attatacacatgatcattatcacataaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 15357068  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15357067 tataatactaaatatgt-gatttattattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 15356970  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  15356969 gac 15356967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 15341800 - 15341600
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15341800 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagcgatgtggtgctagataccgctcactgtt 15341701  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15341700 tataatactaaatatgt-gatttattattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 15341603  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  15341602 gac 15341600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17780699 - 17780499
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780699 attatacatatgatcattatcacataaaggtttcgtcagatcacatgacattctcatcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 17780600  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17780599 tataatattaaatatgt-gatttaatattatttccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 17780502  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  17780501 gac 17780499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 777 - 976
Target Start/End: Original strand, 13517433 - 13517630
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13517433 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatggcattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccactcactgtt 13517532  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13517533 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacattacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgaaagaaataaataagtaa 13517630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 1647102 - 1646902
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1647102 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattttcgtcacttgggtagcagtgttgtgttgctagataatgctcactgtt 1647003  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1647002 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacactaaggacagataaatgagagaaataaataagtaa 1646905  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  1646904 gac 1646902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 17136979 - 17137179
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136979 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacaagaaattcacgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 17137078  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17137079 tataatattaaatgtgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaagaaaagatagatgagagaaataaataagtaa 17137176  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  17137177 gac 17137179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 18640953 - 18640792
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640953 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18640854  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtg 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640853 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtg 18640792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 23014941 - 23014741
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23014941 attatacacatgaacattatcacagaaaggtttcgtcagatcacataacattctcgtcacttggttagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtc 23014842  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23014841 tataatattaaatacgt-gatttaatattattgccaacgttacgagaacc-tatagggtcacatacaaatgacagatagatgagagaaataaataagtaa 23014744  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  23014743 gac 23014741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 426 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 24253589 - 24253291
Alignment:
Q  426 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-cccca 524  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  24253589 atttctttattgattttgttttacttcaaaataataaagtccttagaatagctcgttcgtttgatggaacattaagtatgacttaatcgtgagatcccca 24253490  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||  ||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24253489 tcaaacataaggacactattcttaaagtatatgtggtcaaaatttattgtaaagtgaggtaacattaaagcatagagactattatgtcggtagactaatg 24253390  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaata 723  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  24253389 atcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaata 24253291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 421 - 658
Target Start/End: Original strand, 16200128 - 16200363
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200128 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagttcgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200226  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||    
T  16200227 cccattaaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatatcattaaagcatggagactatt-tgtggagagact 16200325  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 658  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200326 gatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 777 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 17197336 - 17197160
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17197336 attatacacatgatcattatcacgtaaaggttttgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccactcactttt 17197237  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatag 955  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17197236 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgagaa-catatagggtcacacacaaaggacagatag 17197160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 777 - 887
Target Start/End: Original strand, 18520601 - 18520711
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18520601 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctccctgtt 18520700  T
Q  877 tataatattaa 887  Q
    |||||||||||    
T  18520701 tataatattaa 18520711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 777 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 15846292 - 15846121
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15846292 attatacacatgaatattatcat-gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtt 15846194  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15846193 tataatattaaatat-cagatttaatattattgccaacatgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 15846121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 21034807 - 21034955
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  21034807 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 21034905  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21034906 atattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 21034955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 21399361 - 21399509
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  21399361 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 21399459  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21399460 atattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 21399509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 781 - 951
Target Start/End: Original strand, 28088655 - 28088823
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28088655 tacacatgagtattatcatggaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgcttactatttata 28088754  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28088755 gcattaaatat-tagatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 28088823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 15846847 - 15846666
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15846847 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15846749  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15846748 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 15846666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 21034229 - 21034410
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21034229 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21034327  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21034328 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 21034410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 599 - 775
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890563
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  699 attggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 14890563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 20147865 - 20147684
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20147865 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20147767  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  20147766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 20147684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 12300478 - 12300621
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  12300478 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 12300576  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  12300577 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 12300621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 802 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 15316907 - 15316760
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||    
T  15316907 aaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttgtgtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattatttatagtattaaatat-tagatttaa 15316809  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15316808 tattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 15316760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 55427589 - 55427737
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  55427589 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 55427687  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  55427688 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 55427737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 20147288 - 20147145
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||    
T  20147288 gaaatgtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaat-gatggattta 20147190  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  20147189 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 20147145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 55427012 - 55427193
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  55427012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 55427110  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  55427111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 55427193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 599 - 763
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21398952
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  699 attggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattct 763  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattct 21398952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 807 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 25978454 - 25978312
Alignment:
Q  807 tttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatta 906  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25978454 tttcgtcaaatcacttgatattcttgtcacttgggtgacaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaatatta 25978356  T
Q  907 ttgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25978355 ttgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 25978312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 12299902 - 12300082
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  12299902 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagt 12299999  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  12300000 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 12300082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 781 - 913
Target Start/End: Original strand, 15538084 - 15538216
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15538084 tacacatgaacattatcatggaaaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgttacttgggtagtagtgatgtgttgctagataccgctcactttttat 15538183  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaa 913  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  15538184 aatattgaatat-aagatttaatattattgccaa 15538216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 781 - 916
Target Start/End: Original strand, 26816840 - 26816975
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26816840 tacacatgaacattatcatggaaaaggttttgtcatatcacttgacattcttgtcactttggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttat 26816939  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgt 916  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  26816940 aatattaaatat-aagatttaatattgttgtcaacgt 26816975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 802 - 916
Target Start/End: Original strand, 14147590 - 14147703
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  14147590 aaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgatgctagatattgctcattgtttataatattaaatat-taaatttaa 14147688  T
Q  902 tattattgccaacgt 916  Q
    |||||||| ||||||    
T  14147689 tattattgtcaacgt 14147703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 941
Target Start/End: Original strand, 9504933 - 9505095
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||  || |    
T  9504933 attatacataagatcattatcacataaaggtttt-tcagatcacgtgacattttcatcacttgggtagcactgatgtgttgctacatattgctccatgat 9505031  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacaca 941  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| | || | |||||||||    
T  9505032 tataattttaaatatgt-gatttaatattattgtcaacattacgagaaacctacaaggtcacaca 9505095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 808 - 916
Target Start/End: Original strand, 25800936 - 25801043
Alignment:
Q  808 ttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattat 907  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  25800936 ttcgtcaaatcacatgacattctcgtcatttgggtagcagtgatgtgttgctaaatatcgttcaccgtttattatatcacatatgt-gatttaatattat 25801034  T
Q  908 tgccaacgt 916  Q
    || ||||||    
T  25801035 tgtcaacgt 25801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 421 - 483
Target Start/End: Original strand, 18534758 - 18534820
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18534758 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccatagaatagttagtcc 18534820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 6109971 - 6110028
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109971 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 6110028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 802 - 891
Target Start/End: Original strand, 11788158 - 11788247
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  11788158 aaaggtttcgtcagatcacttgacattattgtcacttgggtagcaataatgtgttgctagatatcgctcattgtttatagtattaaatat 11788247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 13248514 - 13248571
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248514 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 13248571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 590 - 774
Target Start/End: Original strand, 14147012 - 14147192
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||     
T  14147012 taaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagg 14147110  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    |||||||||| |||||||| |  || ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  14147111 aatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataa 14147192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 8490396 - 8490452
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490396 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 8490452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 911 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 19081867 - 19081800
Alignment:
Q  911 caacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19081867 caacgttacgggaacct-atagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaagac 19081800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 640 - 779
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280450
Alignment:
Q  640 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagtt 739  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| |||| ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  740 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatt 779  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatt 32280450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 324 - 383
Target Start/End: Original strand, 13211208 - 13211267
Alignment:
Q  324 acttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13211208 acttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 13211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 777 - 833
Target Start/End: Original strand, 13249233 - 13249289
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13249233 attatacacatgatcattatcacagaaagatttcgtcagatcacatgacattctcgt 13249289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18641045 - 18640989
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18641045 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 18640989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 11787578 - 11787759
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11787578 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataaccgcatctcattggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 11787676  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |  | |||||||||||||||| | |||||||    
T  11787677 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcacaatgataat 11787759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 25979039 - 25978858
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  25979039 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataattattaggagt 25978941  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  25978940 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataat 25978858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 17136137 - 17136193
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17136137 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 17136193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 638 - 767
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  638 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaa 736  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  737 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 767  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 582 - 684
Target Start/End: Original strand, 9504446 - 9504548
Alignment:
Q  582 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 681  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  9504446 gatatctttaaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaata 9504545  T
Q  682 tta 684  Q
    |||    
T  9504546 tta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10579653 - 10579603
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10579653 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgt 10579603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317303
Alignment:
Q  602 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 701  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  702 ggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||||||  | |||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataat 15317303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15607730 - 15607672
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15607730 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggctttgtatcatg 15607672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15351294 - 15351237
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15351294 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15351237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15357886 - 15357829
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15357886 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15357829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17200484 - 17200427
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17200484 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgggtttggctttgtagcatg 17200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 466
Target Start/End: Original strand, 18510924 - 18510969
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510924 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 18510969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16482782 - 16482727
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482782 tgttagaataagccctaata-ccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 16482727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 18519885 - 18519941
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18519885 tgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 18519941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10572891 - 10572840
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10572891 ttgttggaataagccctaatagccaacctatattgattgggtttgactttgt 10572840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 383
Target Start/End: Original strand, 13516716 - 13516775
Alignment:
Q  324 acttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13516716 acttgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgagtttggctgtgtatcatg 13516775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15601185 - 15601127
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15601185 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggatttgtatcatg 15601127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 777 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 35199226 - 35199085
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| || | ||| ||| || |||||||||||||||||| || | ||| | |||||| |||||||| | | ||   |||     
T  35199226 attacacacatgatctttataacataatgatttggtctgaacacatgacattctcgtcatttagatagaattgatgtattgctagacatctcttgatgta 35199127  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttac 919  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  35199126 tataatattaaatatat-gatttaatattattgccaacgttac 35199085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17781415 - 17781358
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  17781415 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 17781358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19090042 - 19089985
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19090042 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 19089985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1647824 - 1647768
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647824 tgttggagtaagccctaatagctggtctatattgattgggtttggctttgtatcatg 1647768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 32057200 - 32057144
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32057200 tgttggagtaagctctaatagccaatctatgttgattgggtttgactttgtatcatg 32057144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 595 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  595 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 694  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  695 ttatattggattgatc 710  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 864
Target Start/End: Original strand, 29925621 - 29925683
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagata 864  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29925621 aaaggttttgtcataacacatgaaattctcgtcatttgagtagcagtgatgtgttgctagata 29925683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 864
Target Start/End: Original strand, 29974775 - 29974837
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagata 864  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29974775 aaaggttttgtcataacacatgaaattctcgtcatttgagtagcagtgatgtgttgctagata 29974837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 18510828 - 18510885
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18510828 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18510885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 18522569 - 18522626
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18522569 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18522626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 18534662 - 18534719
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18534662 ttgttgtagtaagccctaatagtcaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 18534719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 674 - 763
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15526913
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattct 763  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||  | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattct 15526913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 32056459 - 32056418
Alignment:
Q  938 cacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32056459 cacataaaggacagatagatgagagaaataaataagtaagac 32056418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 29924879 - 29924935
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29924879 tgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29924935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 29974032 - 29974088
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29974032 tgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29974088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 645
Target Start/End: Original strand, 19345656 - 19345795
Alignment:
Q  506 acttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagacta 605  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||  | | ||| ||  ||| ||||||  ||| ||||||||| || |||  |    
T  19345656 acttaatcgtgagactccattaattataagaacactattcttaaagaatcctcaattaaggttcattgtgaagtggtataacattaaagcgtaaagatca 19345755  T
Q  606 ttatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 645  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19345756 ttatgtgggtatactgatgatcacgtctcatagatcatgg 19345795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 2528 - 2174
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 2429  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 2329  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2328 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 2229  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2228 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 2174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 11419 - 11065
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 11320  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11220  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11219 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11120  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11119 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 1902 - 1702
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 1803  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1802 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 1705  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  1704 gac 1702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10793 - 10593
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10793 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10694  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10693 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 10596  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  10595 gac 10593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2621 - 2564
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2621 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11512 - 11455
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11512 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 80)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 18252030 - 18252384
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252030 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18252129  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18252229  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18252230 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18252329  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252330 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 18252384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18532721 - 18532367
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532721 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18532622  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18532621 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagataga 18532522  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18532521 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18532422  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532421 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 18532367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27131616 - 27131262
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131616 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27131517  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27131516 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 27131417  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27131416 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27131317  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131316 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 27131262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 21171438 - 21171086
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21171438 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttcatggaacattaaatataacttaattgtgagac 21171339  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21171338 cccgttgaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 21171239  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21171238 gatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 21171139  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171138 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 21171086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27310782 - 27310430
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310782 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 27310683  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    | | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27310682 cacgttgaacataaggaaactattcttaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 27310583  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27310582 gatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 27310483  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27310482 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgata 27310430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16359240 - 16358888
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16359240 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagaataacttaattgtgagac 16359141  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16359140 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtaaccctagtcaagctttattgagaaatggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 16359041  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16359040 gatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16358941  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358940 atactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgata 16358888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 425 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 36816834 - 36816488
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  36816834 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaatagttcgtctgtttaatggaacattaagtataaattaattgtgagactccg 36816735  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36816734 ttaaacataaggacattattcttaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggataccattaaagcatagagactattatgtggatagactgatg 36816635  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36816634 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 36816535  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  36816534 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgat 36816488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 3856126 - 3855772
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3856126 acaaggcatttctttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagcccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 3856027  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||  |||||||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3856026 accccattaaacataaggacattattcttaaaatatttgtagtcaaactttattgtgaagtgggatattattaaagcatggagactattacgtgggtaga 3855927  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  3855926 ctgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatga 3855827  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3855826 gaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgata 3855772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 22657429 - 22657108
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgatttt-gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtga 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22657429 acaagacatttctttattgatttttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtctgtttaatggaacattaaatataacttaattgtga 22657330  T
Q  518 gaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtag 617  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  22657329 gacccctttaaacataaggacacaattcttaaagtgtctctagtcaagctttattctgaaatgagatatcattaaagcatagagactatcatgtggatag 22657230  T
Q  618 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatg 717  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22657229 actgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatg 22657130  T
Q  718 agaatactacatagtaaaagtt 739  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22657129 tgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 18252656 - 18252856
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252656 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 18252755  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18252756 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 18252853  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  18252854 gac 18252856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 18532095 - 18531895
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532095 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttaggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 18531996  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18531995 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 18531898  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  18531897 gac 18531895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 27310158 - 27309966
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310158 attatacacatgatcattatcacaaaaaggtttcgtcatatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 27310059  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310058 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 27309966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27130991 - 27130791
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130991 attatacacatgaacattatcacggaaaggttttgtcatatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 27130892  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27130891 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttatgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 27130794  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  27130793 gac 27130791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27277756 - 27277411
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| || | ||||||| | ||||||       
T  27277756 catttctttgttgtttttgttttgtttcaaaataataacgtccctagaataattagtccatttaacggagcatta-gtgtgacttaatcgcgagacctt- 27277659  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||| |  || || | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27277658 ttaaccgaaatgacattattcttaaagtatccgtagtcaggctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattatgtgggtagaccgatg 27277559  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||     
T  27277558 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatat 27277459  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27277458 tgcatagtaaaagtcatg-aaagtgccataagatattcttatagtgata 27277411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 16358616 - 16358416
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358616 attatacacatgatcattatcacggaaaggtttcgtcatatcacatgatattctcgtcacttggatagcagtgatgtgttgctagatatcgctcactgtt 16358517  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16358516 tatagtattaaatatg-agatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacaaacaaaggacagatagatgagagaaataagtaagtaa 16358419  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  16358418 gac 16358416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 789 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 27277129 - 27276944
Alignment:
Q  789 atcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaa 888  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27277129 atcatcatcacaaaaaggtttcatcagatcacatgacattctcgtcacttgggtaggagtgatgtgttactagataccgctcactgtttataatattaaa 27277030  T
Q  889 tatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27277029 tatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgagaa-cttatagggtcacacacaaatgacagatagatgagtgaaataaataagtaa 27276944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 802 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 36816191 - 36816016
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36816191 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgagtaacattgatgtgttgctagatattgctcactgtttataatattaaatatgt-gatttaa 36816093  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36816092 tattattgtcaatgttacgggaatc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaagac 36816016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 453 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 12014457 - 12014179
Alignment:
Q  453 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 552  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||   |||||| |||      
T  12014457 aaaataataaagtcactagaatacatagtccgtttaatggaatattaagtgtaaattaatcgttagatcccattaaacataatgatgttattcttaaaac 12014358  T
Q  553 atccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 652  Q
    ||||||||| |||||||  || |||| | ||||  |||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  12014357 atccgtagttaagctttagtgtgaagagggatacgattaaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataagga 12014258  T
Q  653 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatag 731  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||    
T  12014257 gttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatag 12014179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 431 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 9918106 - 9917837
Alignment:
Q  431 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 530  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||  ||||||||     
T  9918106 tttattgattttgttttgttacaaaataataaagtcactt------ttagtttgtttaatcgaacattaagtataacttgatcacgaga-tccattaaat 9918014  T
Q  531 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 630  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||  |||| ||||||| |||  ||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  9918013 ataaggacattattcttaaaatatctatagttaagctttattgttaagtgggatagcattgaagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcaca 9917914  T
Q  631 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 708  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917913 tctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 777 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 22641457 - 22641264
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||      ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22641457 attatacacaagaacattatcactgaaaggtttcatcatatcacatgaaatt------acttgggtagcagcgatgttttgcgagatatcgctcactgtt 22641364  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22641363 tataatattaaacatgtg-atttcatattattgccaacgttacgagaacct-atagggtcacacacaaagtacagatagatgagagaaataaataagtaa 22641266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 777 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 28134479 - 28134308
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28134479 attatacacatgaatattatcat-gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtt 28134381  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28134380 tataatattaaatat-cagatttaatattattgccaacgtgaccagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 28134308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 19706172 - 19706024
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  19706172 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 19706074  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19706073 atattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 19706024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 453 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 12006712 - 12006461
Alignment:
Q  453 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||      
T  12006712 aaaataataaagtccctagaatagttagtctatttaatggaatattaagtgtgccttaatcgtgagaccccatgaaacataaggacattattattaaaac 12006613  T
Q  553 atccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 652  Q
    || ||||||||||| ||  || |||| | |||| ||||||| | |||||| | ||||||   |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||    
T  12006612 attcgtagtcaagccttagtgtgaagagggataacattaaaacttagagattgttatgtgcatagactgatgatcacaacttacgaatcattgataagga 12006513  T
Q  653 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 704  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006512 gttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 9456684 - 9456832
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9456684 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 9456782  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  9456783 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 9456832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 9460780 - 9460928
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9460780 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 9460878  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  9460879 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 9460928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 20779379 - 20779231
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20779379 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 20779281  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20779280 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 20779231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 625 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641727
Alignment:
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgata 22641727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 19706750 - 19706569
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19706750 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19706652  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  19706651 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 19706569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 22613061 - 22613208
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||    
T  22613061 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataata-taaatat-cagattta 22613158  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22613159 atattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 22613208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 28135034 - 28134853
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28135034 taaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28134936  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  28134935 aatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 28134853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 43802676 - 43802495
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43802676 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 43802578  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  43802577 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 43802495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 47667218 - 47667070
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||    
T  47667218 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagaatta 47667120  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  47667119 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 47667070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 728
Target Start/End: Original strand, 23507056 - 23507209
Alignment:
Q  575 gaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagat 674  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23507056 gaagtgggatagcattaaagtatatagaatataaggtggatagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagat 23507155  T
Q  675 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactaca 728  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  23507156 ataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctaca 23507209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 9456107 - 9456288
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9456107 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 9456205  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  9456206 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 9456288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 20779956 - 20779775
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20779956 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20779858  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  20779857 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 20779775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 22670568 - 22670387
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22670568 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22670470  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22670469 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 22670387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 42817300 - 42817119
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42817300 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 42817202  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  42817201 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 42817119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 22669991 - 22669848
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||    
T  22669991 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaat-gatggattta 22669893  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  22669892 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 22669848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 33283590 - 33283447
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  33283590 gaaaggtttcgtcagattacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagattta 33283492  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  33283491 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 33283447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 14482458 - 14482606
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  14482458 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 14482556  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  14482557 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 14482606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 42816723 - 42816580
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||    
T  42816723 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaat-gatggattta 42816625  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| |||||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||    
T  42816624 atatcattgccaacgtgcctagaacc-taaagggtcacacacaaag 42816580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 806 - 941
Target Start/End: Original strand, 634513 - 634645
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  634513 gtttcgtcagatcacatgacattcttgtcactttggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtatt-aatat-tagatttaatatt 634610  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacaca 941  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  634611 attgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacaca 634645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 806 - 945
Target Start/End: Original strand, 8728237 - 8728374
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8728237 gtttcgtcagatcacttgacattcttttcacttgggtagcaatgatgtgttcctagatactgctcactgtttataatattaaatat-tagatttaatatt 8728335  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    |||||||| || ||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  8728336 attgccaatgtgactagaa-cttatggggtcacacacaaa 8728374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 20391550 - 20391369
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  20391550 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagt 20391452  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  20391451 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcataagatattctcacaatgataat 20391369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 22612483 - 22612664
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22612483 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagt 22612581  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22612582 aatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 22612664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 20390973 - 20390830
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  20390973 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctacataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 20390875  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| |||||||| || ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  20390874 atatcattgccaatgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 20390830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 797 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 31234485 - 31234313
Alignment:
Q  797 cacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtgga 896  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    |    
T  31234485 cacataaaggtttcgtcagatcacatgacattcttgtgactttggtagcagtgatgtgttgttagataccactcaccgtttataatattaaatat-aata 31234387  T
Q  897 tttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacac-aaaggacagatagatgagagaaataaat 970  Q
    |||||| |||||| |||||| ||   |||| || |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31234386 tttaattttattgtcaacgtgaccataacc-tacagggtcacacacaaaatgacagttaaatgagagaaataaat 31234313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 43802098 - 43801950
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||    
T  43802098 gaaaggtttcgttagatcacttaacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttactagataccgctcattgtttataattttaaatat-catattta 43802000  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  43801999 atattattgccaacgtgactagaacc-tattgggtcacacacaaagaacag 43801950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 793 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 12006112 - 12006013
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatg 892  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12006112 ttatcacagaaaggttt-gtcatatcacgtggtattctcgtcacttgggtagtagtgatgtgttgctagataccgctcactgtatatactattaaatatg 12006014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 599 - 775
Target Start/End: Original strand, 633934 - 634106
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  633934 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 634032  T
Q  699 attggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    | |||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  634033 actggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataat 634106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 832 - 946
Target Start/End: Original strand, 35935924 - 35936036
Alignment:
Q  832 gtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttata 931  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  35935924 gtcacttgggtaacaatgatgtgttgctagataccgttcattgtttatattattaaatat-tagatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tata 35936021  T
Q  932 gggtcacacacaaag 946  Q
    || ||||||||||||    
T  35936022 ggatcacacacaaag 35936036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 590 - 774
Target Start/End: Original strand, 8727658 - 8727838
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| |||    
T  8727658 taaagcgtcgagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagt 8727756  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  8727757 aatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataa 8727838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 590 - 731
Target Start/End: Original strand, 35930573 - 35930713
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35930573 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 35930671  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatag 731  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  35930672 aatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 18251936 - 18251992
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251936 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18251992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18532813 - 18532757
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532813 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18532757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 590 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 47667785 - 47667662
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  47667785 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagt 47667687  T
Q  690 aatatttatattggattgatccacc 714  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  47667686 aatatttatattggattgacccacc 47667662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 667 - 776
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096895
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  767 agtgataatg 776  Q
    | ||||||||    
T  29096886 aatgataatg 29096895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 777 - 891
Target Start/End: Original strand, 35132483 - 35132597
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35132483 attatacacaaaatcattatcacataaatgttttggtagatcacatgatattcttgtcatttgagtagcattagtgtgttgctagataccgctcactatt 35132582  T
Q  877 tataatattaaatat 891  Q
    ||| |||||||||||    
T  35132583 tatgatattaaatat 35132597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997454
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  774 atgat 778  Q
    |||||    
T  51997450 atgat 51997454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27310877 - 27310821
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27310877 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 27310821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 816 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 10852146 - 10852045
Alignment:
Q  816 atcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacg 915  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| |    
T  10852146 atcacatgatattctcatcaattgagtagcaatgatgtgtttctagataccgctcacggtttataatattaaatgtgt-catttaacattattgtcaagg 10852048  T
Q  916 tta 918  Q
    |||    
T  10852047 tta 10852045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  607 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 706  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  707 gatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 778 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 9916360 - 9916247
Alignment:
Q  778 ttatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgttt 877  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||  |||||| ||||| |||||| | |||||| |||    
T  9916360 ttatacacaatatcgttatcacataaatgtttcatcagatcacttgacattcttgtcacttgattaatagtgatttgttgttagatatcactcactattt 9916261  T
Q  878 ataatattaaatat 891  Q
    ||||||||||||||    
T  9916260 ataatattaaatat 9916247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881507
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16359336 - 16359280
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16359336 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggttaggatttgtatcatg 16359280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 793 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 12013853 - 12013762
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||| |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12013853 ttatcacataaaggttt-gtcagatcacatgacattctcgtca------tagtagtgatatattgctagataatgctcactgtttataatattaaatat 12013762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 933 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 9076304 - 9076258
Alignment:
Q  933 ggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9076304 ggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaagac 9076258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21171536 - 21171479
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21171536 ttgttggagtaagctctaatagccaatctatatggattgagtttggctttgtatcatg 21171479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 23507536 - 23507636
Alignment:
Q  789 atcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaa 888  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  23507536 atcattatcaagaaaaggtttcttcatatcacatgacattcatgtcacttgtgtagcagtgataggttgctagatacctcttattgtttaaattattaaa 23507635  T
Q  889 t 889  Q
    |    
T  23507636 t 23507636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 36816935 - 36816881
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 380  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816935 ttgtcggattaagccctaatattcaatctatattgattgggtttggctttgtatc 36816881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3856221 - 3856164
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3856221 ttgttggagtaggccctaatagccaatccatcttgattgggtttgactttgtatcatg 3856164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22657522 - 22657469
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 379  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22657522 ttgttggagtaagccttaatagccaatatatattgattgagtttggctttgtat 22657469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 425 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 30720694 - 30720625
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaa 494  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  30720694 catttttttattggttttattttgttttaaaataataaagttcctggaataattagttcgtttaatggaa 30720625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27131704 - 27131652
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  27131704 tgttggaataagccctaatagccaatctat----gttgggtttggctttgtatcatg 27131652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 3403248 - 3403325
Alignment:
Q  449 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 526  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3403248 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3403325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3443571 - 3443494
Alignment:
Q  449 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 526  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3443571 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3443494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27277856 - 27277800
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||    
T  27277856 tgttggagtaagccctaatagccaatctatgttaattatgtttgactttgtatcatg 27277800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 688 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  688 gtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 767  Q
    |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5456461 - 5456400
Alignment:
Q  145 atacgcaaaaatcgaagatcgaacccctgtccacttacataaggggttcaagtctcttacca 206  Q
    |||| ||| |||| |||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5456461 atacacaagaatcaaagatcaaacccttggccacttatataaagggttcaagtctcttacca 5456400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 714 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916631
Alignment:
Q  714 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataa 9916631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 18288 - 18642
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18288 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18387  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18487  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18488 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18587  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18588 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 18642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 18913 - 19113
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18913 attatacacatgatcattatcacagaaaggtctcgtcaaatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 19012  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19013 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacaggaacc-tatagggtcacacagaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 19110  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  19111 gac 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 18196 - 18252
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18196 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 29327784 - 29328138
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327784 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29327883  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29327983  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29327984 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29328083  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328084 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 29328138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 11536269 - 11535910
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11536269 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtacaacttaattgtgag 11536170  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11536070  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11536069 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11535970  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgat 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11535969 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgat 11535910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 11543187 - 11542828
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11543187 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtcag 11543088  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543087 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11542988  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11542987 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11542888  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgat 778  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11542887 gaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgat 11542828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 15152445 - 15152797
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152445 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 15152544  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152545 cccgttaaacatacggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15152644  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15152645 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 15152744  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152745 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 15152797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 12750828 - 12751180
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750828 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgagac 12750927  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12750928 ctcgttaaacataaagaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagttggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagact 12751027  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12751028 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 12751127  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751128 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 12751180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 421 - 755
Target Start/End: Original strand, 18561009 - 18561343
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561009 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgagac 18561108  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561109 cccgttaaacattaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaggtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 18561208  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  18561209 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgaga 18561308  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561309 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa 18561343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Original strand, 12738542 - 12738890
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       
T  12738542 catttctttattgattttattttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtttgtttaatgaaacattaattataacttaattgtgagaccttg 12738641  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738642 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaag 12738741  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12738742 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatac 12738841  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738842 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 12738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 299
Target Start/End: Original strand, 23862964 - 23863255
Alignment:
Q  8 tcaacatgtctatattgtttttcgattgccatgttattggtacaaactttcgaccattgtttatcgatgactattcctcgtcaaagaatttgtgaggaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23862964 tcaacatgtctatattgtttttcgattgccatgttattggtacaaactttccaccattgtttatcgatgactattcctcgtcaaagaatttgtgaggaac 23863063  T
Q  108 gcaaggtgggttttctcttctccatctaattttctccatacgcaaaaatcgaagatcgaacccctgtccacttacataaggggttcaagtctcttaccac 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23863064 acaaggtgggttttctcttctccatctaattttttccatacgcaaaaatcgaagatcgaacccctgtccacttacataagggattcaagtctcttaccac 23863163  T
Q  208 taactaatttattgttgatatgattcaacatgtccttaacactcttggatgtgtacaagatgtgtctaaaaatgtctaaggtgtttcgaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23863164 taactaatttattgttgatatgattcaacatgtccttaacactcttggatgtgtacaagatgtctctaaaaatgtctaaggtgtttcgaaac 23863255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 421 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 18258047 - 18257694
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18258047 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgacttaattgtgagac 18257948  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||| |    
T  18257947 cccattaaacacaaggacattattcttaaagtatccgtagtcaagtttttttgttaagtaggataacaataatgcataaagactattatgtggatagatt 18257848  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||    
T  18257847 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcaga 18257748  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    ||| ||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18257747 atattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatg 18257694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 421 - 640
Target Start/End: Original strand, 15148144 - 15148363
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148144 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttgattgaacattaagtataacttaattgtgagac 15148243  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148244 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15148343  T
Q  621 gatgatcacatctcacagat 640  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15148344 gatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 11542561 - 11542369
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542561 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattcccgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 11542462  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542461 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 11542369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 29328410 - 29328610
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328410 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagcgatgtgttgctagataccgctcactgtt 29328509  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29328510 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaagaacagatagatgagagaaataaataagtaa 29328607  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  29328608 gac 29328610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 779 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 24851138 - 24850940
Alignment:
Q  779 tatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgttta 878  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851138 tatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcatatgacattctcgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcactgttta 24851039  T
Q  879 taatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaaga 978  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24851038 taatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaaga 24850941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 11535643 - 11535451
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535643 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattcccatcacttggatagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 11535544  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535543 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 11535451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 15153069 - 15153269
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15153069 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgactttctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 15153168  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15153169 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgtgaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagacgagagaaataactaagtaa 15153266  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  15153267 gac 15153269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 18561624 - 18561824
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561624 attatacatatgaacattatcacagaaaagtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 18561723  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18561724 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 18561821  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  18561822 gac 18561824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Original strand, 13392157 - 13392504
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  13392157 catttctttgttgactttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaacaattagtctgcttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc-a 13392255  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  | |||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||  ||||    
T  13392256 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatcaatagtcaaactttattgtgaaaagggataacattaaaacatagagactattgtattggtagatcgatg 13392355  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  13392356 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatat 13392455  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392456 tacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 13392504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 777 - 969
Target Start/End: Original strand, 12751452 - 12751642
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751452 attatacacatgattattatcatagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgct 12751551  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaa 969  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12751552 tataatattaaatatgt-gatttaatattaataccaacgttacgggaacc-tatagggtcacccacaaatgacagatagatgagagaaataaa 12751642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 777 - 969
Target Start/End: Original strand, 12739160 - 12739350
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739160 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatctcattactttttcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 12739259  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaa 969  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12739260 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-gataaggtcacacacaaaggacggatatatgagagaaataaa 12739350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 13392774 - 13392975
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgt 875  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13392774 attatacacacaaacattatcacagaaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagaagtgatgtgttgctagataccactcactgt 13392873  T
Q  876 ttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggta 975  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  13392874 ttataatattaaatatgt-gatttaatatttttgtcaacgttacgggaacc-tatatggtcacacacaaatgacatatagatgagagaaatatataagta 13392971  T
Q  976 agac 979  Q
    ||||    
T  13392972 agac 13392975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 777 - 951
Target Start/End: Original strand, 8465545 - 8465716
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8465545 attatacacatgaatattatcat-gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtt 8465643  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8465644 tataatattaaatat-cagatttaatattattgccaacgtgaccagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 8465716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 18400672 - 18400820
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18400672 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 18400770  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  18400771 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 18400820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 18407656 - 18407804
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18407656 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 18407754  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  18407755 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 18407804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 48808230 - 48808082
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  48808230 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaatat-tagattta 48808132  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  48808131 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 48808082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 599 - 775
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465171
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  699 attggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 8465171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 781 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 41680721 - 41680559
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41680721 tacacatgagtattatcatggaaagtcttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatatgttgctagataccgctcattgtttata 41680622  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  41680621 atattaaatat-tagatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaa 41680559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 802 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 47166591 - 47166449
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47166591 aaaggtttcgttagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagatactgctcattgtttataatattaaatat-tagatttaa 47166493  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  47166492 tattattgccaacatgactagaacc-tatagggtcacacacaaag 47166449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 792 - 951
Target Start/End: Original strand, 19231448 - 19231605
Alignment:
Q  792 attatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  19231448 attatcatggaaaggttttgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaaagatgtgttgctagataccactcattgtttatattattaaatat 19231547  T
Q  892 gtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19231548 -tagatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 19231605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 806 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 24443105 - 24442968
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  24443105 gtttcgtcagatcacttaacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtcttgttagataccgctcactgtttataatattaaatat-aagatttaatatt 24443007  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  24443006 attgccaacgtgacaagaacc-tatagggtcacaaacaaa 24442968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 2204543 - 2204724
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2204543 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2204641  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  2204642 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 2204724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 806 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 15169022 - 15168886
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  15169022 gtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcagtgatgtattgctagatactgatcactgtttataatattaaatat-aagatttaatatt 15168924  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaa 944  Q
    ||||||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  15168923 attgccaacgttacaagagcc-tatagggtcacacacaa 15168886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 18400095 - 18400276
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18400095 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18400193  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18400194 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 18400276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 18407079 - 18407260
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18407079 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18407177  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18407178 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 18407260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 30254129 - 30254310
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30254129 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30254227  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  30254228 aatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 30254310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 48808807 - 48808626
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48808807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 48808709  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  48808708 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 48808626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 18139072 - 18138929
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  18139072 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 18138974  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  18138973 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 18138929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 30254706 - 30254849
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  30254706 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacgtgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagattta 30254804  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  30254805 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 30254849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 18257299 - 18257150
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcactt-gggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattt 899  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  18257299 gaaaggttttgtcagatcacttgacattcttgtcactttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-aggattt 18257201  T
Q  900 aatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18257200 aatattattgtcaacgtgacttgaacc-tatggggtcacacacaaagaacag 18257150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 15730319 - 15730467
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  15730319 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 15730417  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  15730418 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 15730467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 19230879 - 19231060
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19230879 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19230977  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  19230978 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 19231060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 2205120 - 2205263
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||    
T  2205120 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgctgctagataccgctcattgtttatgatattaaat-gatggattta 2205218  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  2205219 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 2205263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 802 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 18258855 - 18258708
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18258855 aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtaacaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaa 18258757  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  18258756 tattattgtcaacgtgactaaaatc-tatagggtcacacacaaagaacag 18258708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 441 - 637
Target Start/End: Original strand, 2364917 - 2365112
Alignment:
Q  441 ttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaac 540  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||  || || |     
T  2364917 ttgttatgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctttctaatggaacattaagtgtggcttaatcgtgagaacccattaaactaaatgacat 2365016  T
Q  541 tattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 637  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| | || ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365017 tattcttaaaatattcgtagtcaa-ccttattgtgaaatgagataacattaaaacatagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 802 - 945
Target Start/End: Original strand, 34129144 - 34129285
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||||||    
T  34129144 aaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttggatagcaatgatgtgttgctagataccgctcattggttatattattaaatat-tagatttaa 34129242  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||    
T  34129243 tattattgccaacgtgactagaatc-tatagggtcacacacaaa 34129285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 15729742 - 15729923
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  15729742 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 15729840  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15729841 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 15729923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18139649 - 18139468
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18139649 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagt 18139551  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18139550 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 18139468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 452 - 677
Target Start/End: Original strand, 7396221 - 7396450
Alignment:
Q  452 caaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 550  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  7396221 caaaataaaaatgtcgctagaatagttagttcatttaaatggaacattaagtatgacttaatcttgagaccctattaaacataagaaaattattcttaaa 7396320  T
Q  551 gtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgt---aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 647  Q
      ||  |||||||||| ||  || ||| |  |||   ||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7396321 acatatgtagtcaagccttagtgtgaaatacgatgatattaaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaat 7396420  T
Q  648 aaagagttatcaagtcttcacatagatata 677  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396421 aaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 777 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 11546521 - 11546418
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11546521 attatacacatgatcattattacataaagttttcgtcagatcatatgacattctcgtcacttggataacagtgatgtgttgctaaataccactcactgtt 11546422  T
Q  877 tata 880  Q
    ||||    
T  11546421 tata 11546418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 425 - 699
Target Start/End: Original strand, 39111819 - 39112092
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    ||||  |     
T  39111819 catttctttattaattttgttttatttcaaaa-aataaagtccctagaatagcgagtccgtttaatgaaacattaagtacgacttaatcacaagacatct 39111917  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||| ||| |  |||| |||||| ||| |||  || ||| |||||||  ||||||||||||||   |||||||| |||    
T  39111918 ttaaacataaggacactatttcaaaaatattcacagtccagctttattgtgaaacgaaataacattaaaatatagagactattataagggtagactaatg 39112017  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 699  Q
     | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  39112018 gtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatttata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 590 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 10669213 - 10669043
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10669213 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 10669115  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 764  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10669114 aatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctc 10669043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 618 - 731
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235474
Alignment:
Q  618 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatg 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatg 10235460  T
Q  718 agaatactacatag 731  Q
    |||||  |||||||    
T  10235461 agaattatacatag 10235474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 777 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 19393184 - 19393018
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgt 875  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |    
T  19393184 attatacacatgaatattatcatggaaaaggtttcatcagatcacttgacattcttctcacttggatagcaatgatgtgttgctagatacccctca-ttt 19393086  T
Q  876 ttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19393085 ttatagtattaaatat-tagatttaatattatttccaacatgactagaacc-tatagggtcacacacaaa 19393018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 944
Target Start/End: Original strand, 12393174 - 12393339
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||| | | ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12393174 attatacacatgaacattatcacgaaaatgtttcgtcatatcacttaagattcttgtcacttaggtaacaatgatgtgttgctagatatctctcactgtt 12393273  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaa 944  Q
    | |||||||||||||   |||||||||||||| || || ||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  12393274 tgtaatattaaatat-aagatttaatattatttcccacattacaagaacc-tataggttcacacacaa 12393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 600 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443456
Alignment:
Q  600 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 699  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  700 ttggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
     | |||| | ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatg 24443456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 667 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41681098
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  767 agtgataat 775  Q
    | |||||||    
T  41681106 aatgataat 41681098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 802 - 946
Target Start/End: Original strand, 28131132 - 28131274
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||   |||||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||    
T  28131132 aaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttgggtaacaactatgtgtcgttagataccgctcattgtttattctattaaatat-tagatttaa 28131230  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    ||||||||||||||| ||   |||| ||||| |||||||||||||    
T  28131231 tattattgccaacgtgactataacc-tatagagtcacacacaaag 28131274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 806 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 25845251 - 25845114
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcact-gtttataatattaaatatgtggatttaatat 904  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  25845251 gtttcgtcatatcacttgactttcttgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagatgctgctcattagtttctaatattaaatat-aagatttaatat 25845153  T
Q  905 tattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaa 944  Q
    || |||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  25845152 taatgccaatgttacaagaacc-tatagtgtcacacacaa 25845114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 19393735 - 19393554
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19393735 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 19393637  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| | |||||| | ||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  19393636 aatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataat 19393554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 47167170 - 47166989
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  47167170 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagt 47167072  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  47167071 aatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataat 47166989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 666 - 774
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365274
Alignment:
Q  666 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  766 tagtgataa 774  Q
    | |||||||    
T  2365266 ttgtgataa 2365274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11543280 - 11543223
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11543280 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 11543223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2653331 - 2653275
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2653331 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggattggctttgtatcatg 2653275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 12738443 - 12738499
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738443 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12738499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 600 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  600 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 699  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  700 ttggattga 708  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 775
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388728
Alignment:
Q  591 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 690  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  691 atatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||   |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatg-aaagtgtcataagatattctcatagtggtaat 19388728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 775
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592022
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 775
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011613
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 597 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845603
Alignment:
Q  597 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 696  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  697 atattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgat 778  Q
    ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgat 25845603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 597 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25846022
Alignment:
Q  597 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 696  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  697 atattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgat 778  Q
    ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgat 25846022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11536362 - 11536305
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11536362 ttgttggaataagccctaatagccactctatattgattggttttggctttgtatcatg 11536305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 12750732 - 12750789
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750732 ttgttggagtaagccctaatagctaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12750789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 15152349 - 15152406
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15152349 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 15152406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 848 - 944
Target Start/End: Original strand, 12410113 - 12410207
Alignment:
Q  848 tgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaa 944  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  12410113 tgatgagttgctagataccgctcactgtttgtaatattaaatat-aagatttaatattatttcccacgttacaagaa-cttatagggtcacacacaa 12410207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 599 - 699
Target Start/End: Original strand, 19859122 - 19859221
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859122 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 590 - 765
Target Start/End: Original strand, 28130552 - 28130723
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  28130552 taaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagt 28130650  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28130651 aatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctca 28130723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 382
Target Start/End: Original strand, 29327689 - 29327745
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29327689 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcat 29327745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 681 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190568
Alignment:
Q  681 attaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgt--atgttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatg 31190568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 493 - 732
Target Start/End: Original strand, 3132748 - 3132986
Alignment:
Q  493 aacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaa 592  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||||  ||| || || |||  |  ||| ||  | |  | |||    
T  3132748 aacattaagtgtaacttaattgtgagaccccattaaacataaggtcattattatgaaagtatttgtaatctagttttacttggaattggaaaaatagtaa 3132847  T
Q  593 agcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaat 692  Q
     ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  3132848 tgcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatg-ttaat 3132946  T
Q  693 atttatattggattgatccaccatgagaatactacatagt 732  Q
    |||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||    
T  3132947 atttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 604 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  604 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 703  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  704 attgatccaccatgagaat 722  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 802 - 908
Target Start/End: Original strand, 19389131 - 19389236
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||   || |||||||||||||||||||||   |||||||    
T  19389131 aaaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttgggtagccttgatgtgtagctaaatataacttactgtttataatattaaatat-aagatttaa 19389229  T
Q  902 tattatt 908  Q
    |||||||    
T  19389230 tattatt 19389236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 774
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969121
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 15148049 - 15148105
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15148049 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattaattgggtttggttttgtatcatg 15148105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 895 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 11557503 - 11557444
Alignment:
Q  895 gatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagat 957  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11557503 gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggt--cacacaaaggacagatagat 11557444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 23872073 - 23872160
Alignment:
Q  209 aactaatttattgttgatatgattcaacatgtccttaacactcttggatgtgtacaagatgtgtctaaaaatgtctaaggtgtttcgaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23872073 aactaatttattgttgattc--tttaacatgtctttaacactcttagatgtgtacgagatgtgtttagaaatgtctaaggtgttttgaaa 23872160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 777 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 5982463 - 5982399
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacag-aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgg 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  5982463 attatacacatgatcattatcacagaaaaggtttcttcatatcacatgacattcttatcacttgg 5982399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 382
Target Start/End: Original strand, 13392029 - 13392085
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 382  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13392029 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgtgtttgactttgtatcat 13392085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 765
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128735
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctca 34128735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 802 - 913
Target Start/End: Original strand, 14592463 - 14592573
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||||| ||||  | |||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14592463 aaaggtttcctcatatcacttggcatacttgtcacttaggtaaaaatgatatgttactaaatactgctcattgtttataatattaaatat-tagatttaa 14592561  T
Q  902 tattattgccaa 913  Q
    ||||||||||||    
T  14592562 tattattgccaa 14592573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 801 - 891
Target Start/End: Original strand, 7396858 - 7396948
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||    
T  7396858 gaaagatttcgttatatcacatgacattcttgtcatttaggtagcagtaatgtgttgctacatcgggctcacagtttataataataaatat 7396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 843 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 31190062 - 31189962
Alignment:
Q  843 agcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacac 942  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||    
T  31190062 agcaatgatttgttgctggataccgctcattgtttataatattaaatat-tatattaaatattattgtcaacgtgactagaacc-tatggggtcacacac 31189965  T
Q  943 aaa 945  Q
    |||    
T  31189964 aaa 31189962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 777 - 891
Target Start/End: Original strand, 39112422 - 39112536
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | || |||||| || || | ||||||||||||||||| |  | | ||    
T  39112422 attatacacataatcgttatcacgaagaggtttcgtcaaatcaaatgacattattgttacttggatatcatttatgtgttgctagataccacctattctt 39112521  T
Q  877 tataatattaaatat 891  Q
    |||||||||||||||    
T  39112522 tataatattaaatat 39112536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 534
Target Start/End: Original strand, 10234179 - 10234244
Alignment:
Q  469 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  10234179 tagaatagttagtccgtttaatgaaccattaaatataacttaatcatgagattccattaaacataa 10234244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 667 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259254
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  767 agtgataat 775  Q
    | |||||||    
T  18259262 aatgataat 18259254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18258143 - 18258087
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18258143 tgttggagtaagccctgatagccaatctagattgattggttttggccttgtatcatg 18258087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 777 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 23387841 - 23387713
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||| |   || ||||  |||| ||||    
T  23387841 attatacacatgataattatcacataaatattttttcagaccacatgacattcttgtcacttggataacaatgatgtttctttatatacttctcattgtt 23387742  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatatta 906  Q
     |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23387741 aataatattaaatgtgt-aatttaatatta 23387713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 2653239 - 2653207
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653239 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 2653207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 730
Target Start/End: Original strand, 3587900 - 3588039
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||| | |  ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||||||| ||||| ||    
T  3587900 taaagcgtagagactattatgtatatagaccgatgaccagatctaataagtcatgaatat-gagatattaagtctatatataggtataaatgttaggggt 3587998  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacata 730  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3587999 aatattgatactggattgacccaacgtgagaatactacata 3588039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 18560913 - 18560969
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18560913 tgttggagtaagcccttaaaggcaatctatgttgattgggcttggctttgtatcatg 18560969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 688
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  633 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 688  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 811 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 47833516 - 47833437
Alignment:
Q  811 gtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgc-tcactgtttataatattaaat 889  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47833516 gtcaaatcacataacattctcgtcactttgatagtagtgatgtattgttgaataccccttcactgtttataatattaaat 47833437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 664 - 706
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  664 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 706  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 802 - 916
Target Start/End: Original strand, 16012012 - 16012125
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    |||||||||  || ||||| |||||| || ||||||| | ||| | |||| ||||  ||||||  ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||    
T  16012012 aaaggtttccacatatcacttgacatacttgtcacttagatagaaatgatatgttattagatagtgctcattgtttataatattagatac-tagatttaa 16012110  T
Q  902 tattattgccaacgt 916  Q
    |||||||||||||||    
T  16012111 tattattgccaacgt 16012125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 708 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 15169484 - 15169419
Alignment:
Q  708 atccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15169484 atccaccgttagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatg 15169419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27381459 - 27381105
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381459 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27381360  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27381260  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27381259 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27381160  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381159 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 27381105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27471842 - 27471488
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471842 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27471743  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27471643  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27471642 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27471543  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471542 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 27471488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17684674 - 17684322
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684674 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 17684575  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684574 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 17684475  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17684474 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 17684375  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684374 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 17684322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 29308890 - 29309244
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308890 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29308989  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29309089  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29309090 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29309189  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309190 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 29309244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 29315850 - 29316204
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315850 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29315949  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29316049  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29316050 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29316149  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316150 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 29316204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17691647 - 17691293
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691647 acaaggcatttctttattgattttgttttctttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 17691548  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17691547 accccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttagtgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 17691448  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17691447 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 17691348  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691347 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 17691293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 189182 - 188830
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189182 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 189083  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  189082 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 188983  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  188982 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 188883  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188882 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 188830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 11651725 - 11652077
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651725 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 11651824  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11651825 cccattaaaaataaggaaactattctaaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 11651924  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11651925 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 11652024  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11652025 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgata 11652077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 421 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 16566525 - 16566257
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566525 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16566426  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566425 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16566326  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566325 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 421 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 25537364 - 25537148
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537364 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtccgtttaatggaacattaagtataactttattgtgagac 25537265  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25537264 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagact 25537165  T
Q  621 gatgatcacatctcaca 637  Q
    |||||||||||||||||    
T  25537164 gatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17691021 - 17690821
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691021 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 17690922  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17690921 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 17690824  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  17690823 gac 17690821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27380833 - 27380633
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380833 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 27380734  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27380733 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 27380636  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  27380635 gac 27380633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27471216 - 27471016
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471216 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 27471117  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27471116 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 27471019  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  27471018 gac 27471016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 29309516 - 29309716
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309516 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 29309615  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29309616 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 29309713  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  29309714 gac 29309716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 29316475 - 29316675
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316475 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 29316574  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29316575 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 29316672  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  29316673 gac 29316675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 27297255 - 27297455
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297255 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 27297354  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27297355 tataatattaaatttgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgggagaaataaataagtaa 27297452  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  27297453 gac 27297455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 16559053 - 16558853
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559053 attatacacatgatcattatcacagaaagatttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtaacagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 16558954  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16558953 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tatatggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 16558856  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  16558855 gac 16558853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Original strand, 11652349 - 11652541
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652349 attatacacataatcattattacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 11652448  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11652449 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacattacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacaaatagatgagagacataaata 11652541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17684050 - 17683850
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684050 attatacaaatgaacattatcacagaaaagtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 17683951  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17683950 tatagtattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tataggatcacacacaaatgacagatagatgagagaaataaataagtaa 17683853  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  17683852 gac 17683850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 421 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13359474 - 13359126
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13359474 aaggcatttatttatttattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgcttaatggagcattaagtataacttaatcgtgaaac 13359375  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
     |||||||||||||  | | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||| ||| || || | ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||    
T  13359374 tccattaaacataaaaacattatttttaaagtatccgtagtcaacctttattgtgaaatgggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagact 13359275  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   ||||||  ||    
T  13359274 gatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccat--ga 13359177  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    |||||||||  | ||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  13359176 atactacat--tgaaaattatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataa 13359126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 25536772 - 25536580
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25536772 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcatatcacatgacattctcgtcagttgggttacagtgatgtgttactagataccgctcactgtt 25536673  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536672 tatagtattaaatatgt-gatttaatattattgccaatgttactggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 25536580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 633 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394298
Alignment:
Q  633 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagt 732  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  733 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgata 16394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 18336281 - 18336480
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18336281 attatacacataataattatcacagaaaggtttctt-agttcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagatacctctcactgtt 18336379  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18336380 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttccaagaacc-tatagggttgcacacaaaagacaaatagataagagaaataaataagtaa 18336477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 458 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20553755 - 20553492
Alignment:
Q  458 aataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccg 557  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||||    
T  20553755 aataaagtctctaggatagctagtccgtttaatgaaatattaagtacgacttaatcgtgagatcccattaaatataagaatattattcttaaagcatccg 20553656  T
Q  558 tagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 657  Q
    |||| ||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  20553655 tagtgaatttttattgtgaagtgagataaaattaaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatat 20553556  T
Q  658 caagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaata 723  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  20553555 caaacattcacatagatat-aatattaagaataatatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 667 - 773
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27296983
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  767 agtgata 773  Q
    |||||||    
T  27296977 agtgata 27296983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 665 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25537046
Alignment:
Q  665 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 764  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  765 atagtga 771  Q
    |||||||    
T  25537052 atagtga 25537046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 457 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 17850663 - 17850392
Alignment:
Q  457 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatcc 556  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| ||| |||||    
T  17850663 taataaagtccctataatagctagtttgtttgttggaacattatgtaagacttaattgtgatatccaattaaaaacaaggacactattcttaaattatcc 17850564  T
Q  557 gtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 656  Q
     |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||    
T  17850563 atagtcaagcttt-ttgtgaagtcaaataacattcaagtatatagactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagtta 17850465  T
Q  657 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacat 729  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||    
T  17850464 tcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacat 17850392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 442 - 772
Target Start/End: Original strand, 27925772 - 27926103
Alignment:
Q  442 tgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacat---taagtata--acttaattgtgagaccccattaaacataagg 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| |||||||   ||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||  |||     
T  27925772 tgttttgtttcaaaataataaagtccttagaataactagtatgtttaacggaacataattaagtgtgtgacttaatcgtgagactccattaaactaaaga 27925871  T
Q  537 aaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 636  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||  ||||||  ||| |||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  27925872 aaattattcttaaagtatctctagtcaaactttatttggaagtggtatagcattgaagcacaaagactattatgtggataaactgatgatctcatctcac 27925971  T
Q  637 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaa 736  Q
     ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||| ||  |||    
T  27925972 ggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactacacag--aaa 27926068  T
Q  737 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 772  Q
     ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  27926069 attatgtaaa-tgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 18019562 - 18019414
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  18019562 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 18019464  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18019463 atattattgccaacgtgactagaacc-tatggggtcacacacaaagaacag 18019414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 781 - 946
Target Start/End: Original strand, 14075029 - 14075192
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14075029 tacacatgagtattatcatggaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggaagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttata 14075128  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  14075129 gtattaaatat-taaatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaag 14075192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 684 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559325
Alignment:
Q  684 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 16559325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18020152 - 18019971
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18020152 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18020054  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18020053 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 18019971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 27525295 - 27525147
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27525295 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctaattgtttataatattaaatat-tagattta 27525197  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  27525196 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacaaaaagaacag 27525147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 16789062 - 16789243
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16789062 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 16789160  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  16789161 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 16789243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 22860199 - 22860018
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22860199 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22860101  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22860100 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 22860018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 27508081 - 27507933
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27508081 gaaaggtttcgtcggatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctaattgtttataatattaaatat-tagattta 27507983  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  27507982 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacaaaaagaacag 27507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 16789639 - 16789782
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  16789639 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 16789737  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  16789738 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 16789782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 22859622 - 22859479
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||    
T  22859622 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaat-gatggattta 22859524  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  22859523 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 22859479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 1585842 - 1585694
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  1585842 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 1585744  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  1585743 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 1585694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27508658 - 27508477
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27508658 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27508560  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  27508559 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataat 27508477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27528244 - 27528063
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27528244 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27528146  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  27528145 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataat 27528063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 1586419 - 1586238
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  1586419 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 1586321  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  1586320 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 1586238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 781 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 22559948 - 22559786
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22559948 tacacatgaatattatcatgaaaaggtttcgtcagatcatgtgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgtttttagataccgctcattgtttata 22559849  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||    
T  22559848 atattaaatat-tatatttaatattattaccaacgtgactagaacc-tatagggttacacacaaa 22559786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 602 - 731
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669605
Alignment:
Q  602 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 701  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  702 ggattgatccaccatgagaatactacatag 731  Q
     ||||||  || ||||| ||||||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag 2669605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 781 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 10358808 - 10358653
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10358808 tacacatgaacattatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttggcattcttgtcacttggatagcagtgatttgttgctagataccgttcactgtttat 10358709  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtca 937  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  10358708 aatattaaatat-aatatttaatattattgtcaacgatacaagaacc-tatagggtca 10358653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 806 - 951
Target Start/End: Original strand, 33317440 - 33317583
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  33317440 gtttcgtcagatcacttgacatttttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattatttatagtaataaatat-tagatttaatatt 33317538  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    ||| ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  33317539 attaccaacgtgactagaacc-tacagggtcacacacaaagaacag 33317583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 806 - 946
Target Start/End: Original strand, 8613494 - 8613632
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  8613494 gtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgttagatatcgctcattatttatagtaataaatat-tagatttaatatt 8613592  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8613593 attaccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaag 8613632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 781 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 19735272 - 19735110
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19735272 tacacatgagtattatcataaaaatgttttgtcaaatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatatgttgctagacaccgctcattgtttata 19735173  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||   || ||||| ||||||||||||||    
T  19735172 atattaaata-ctagatttaatattattgccaacgtgac-taaaacttatggggtcacacacaaa 19735110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 590 - 774
Target Start/End: Original strand, 14074471 - 14074651
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  14074471 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagt 14074569  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  14074570 aatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcacaatgataa 14074651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 792 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 19734986 - 19734835
Alignment:
Q  792 attatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    ||||||| | ||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  19734986 attatcataaaaatgttttgtcaaatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatatgttgctagacaccgctcattgtttataatattaaata- 19734888  T
Q  892 gtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||   || ||||| ||||||||||||||    
T  19734887 ctagatttaatattattgccaacgtgac-taaaacttatggggtcacacacaaa 19734835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 457 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 20736773 - 20736459
Alignment:
Q  457 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaa-gtat 554  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||||    
T  20736773 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacattattcttaaatgtat 20736675  T
Q  555 ccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagt 654  Q
    | |||||||||||||  | |||| || ||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    | || ||||  |||     
T  20736674 ctgtagtcaagctttaataagaactgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgtgttatagatat-gaga 20736576  T
Q  655 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 754  Q
    ||| |||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||    
T  20736575 tattaagtttata-ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcata 20736480  T
Q  755 agatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  20736479 agatattctcacagtgataat 20736459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 16394036 - 16393944
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgct 869  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16394036 attatacacatgaacattgtcacaataaggtttcgtcagattacatgacattctcgtcacttgggtagcagtattgtgttgctagataccgct 16393944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 438 - 772
Target Start/End: Original strand, 8509941 - 8510273
Alignment:
Q  438 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-ccccattaaacataagg 536  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  8509941 attttattttgttttaaaataataaagtctatagaataattagtctatttgatggaacattatgtacgacttaattatgagacccccattaaatatgagg 8510040  T
Q  537 aaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg-atcacatctca 635  Q
    |   |||| | |||||||  ||||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |  |||| || |||||  |    
T  8510041 atgatattattaaagtatatgtagttaagctttattatgaaatgagatagcattaaaacataaagactattatgtgcgtaaa--gatgtataacatcgta 8510138  T
Q  636 cagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagat-ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaa 734  Q
    || |||| || |||  ||||||||  |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||  |    
T  8510139 catatcacgggtaagtagttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--a 8510236  T
Q  735 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 772  Q
    | ||||||  ||||||||| || || ||||||||||||    
T  8510237 atgttatg-taagtgtcattagttactctcatagtgat 8510273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 802 - 916
Target Start/End: Original strand, 21995529 - 21995642
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21995529 aaaggttttgtcagatcacttaacattcttgtcacttggatagcaatgatgtattgctagataccgctcattgtttataattttaaatat-tagatttaa 21995627  T
Q  902 tattattgccaacgt 916  Q
    ||||||| |||||||    
T  21995628 tattatttccaacgt 21995642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 617 - 722
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  617 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccat 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  717 gagaat 722  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 803 - 891
Target Start/End: Original strand, 28173188 - 28173276
Alignment:
Q  803 aaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28173188 aaggtttcgtgagatcgattgacattcttgtcacttgggtagcagtgatgtgtggctagataccgctcactgttcataatattaaatat 28173276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 733
Target Start/End: Original strand, 8612906 - 8613048
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8612906 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 8613004  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  8613005 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagta 8613048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560313
Alignment:
Q  598 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 697  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  698 tattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    || || ||||| | || ||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatg 22560313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17691737 - 17691683
Alignment:
Q  329 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691737 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 17691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27381552 - 27381495
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381552 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27381495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27471935 - 27471878
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471935 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 29308797 - 29308854
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29308797 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29308854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 29315757 - 29315814
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29315757 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29315814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 840 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 28755765 - 28755639
Alignment:
Q  840 ggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcaca 939  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||| | || ||| |||||    
T  28755765 ggtagcagtattgtgttgctatacaccgctcactgtttataatattaaatatgt-aatttaatgttattgtcaacgttacgagaa-catagaggatcaca 28755668  T
Q  940 cacaaaggacagatagatgagagaaataa 968  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  28755667 cacaaataacagataaatgagaggaataa 28755639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 597 - 778
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218599
Alignment:
Q  597 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 696  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  697 atattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgat 778  Q
    ||||||     | ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19218526 atattg-----acccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctcagaatgataatgat 19218599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17684769 - 17684712
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17684769 ttgttggaataagccctaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 17684712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 590 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 10359360 - 10359180
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||    
T  10359360 taaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggt 10359263  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10359262 aatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttatg--aagtgtcataagatattctcacaatgataatg 10359180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 802 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 20736061 - 20735997
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagatacc 866  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20736061 aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttggatagcaatgatgtgttgctagatacc 20735997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 11651630 - 11651684
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651630 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatca 11651684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 667 - 776
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994761
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  767 agtgataatg 776  Q
    | ||||||||    
T  21994752 aatgataatg 21994761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25537462 - 25537405
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25537462 ttgttggattaagccctaatagccaatctatattgactgagtttggctttgtatcatg 25537405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 850 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 13358786 - 13358665
Alignment:
Q  850 atgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatat--tattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaagg 947  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||| |||||| |||||| | |  |||||||||||| |    
T  13358786 atgtgttgctagatatcgctcactgttaatagtatcaaatatgta-atttaatatattattgtcaaggttacgtgaacct-acattgtcacacacaaatg 13358689  T
Q  948 acagatagatgagagaaataaata 971  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  13358688 acagatagataagagaaataaata 13358665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 590 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 13995254 - 13995151
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13995254 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 13995156  T
Q  690 aatat 694  Q
    |||||    
T  13995155 aatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 774
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073746
Alignment:
Q  597 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 696  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  697 atattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||  | | ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataa 4073746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758650
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagta 5758650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 777 - 860
Target Start/End: Original strand, 13194518 - 13194601
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgcta 860  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13194518 attatacacaacatcattatcacagaaagatttagtcatatcacatgacattcctgtctcttggatagcagtgatgtattgcta 13194601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 613 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  613 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcca 712  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| |      
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  713 ccatgagaatactacatagtaa 734  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 819 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 8065350 - 8065243
Alignment:
Q  819 acatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgtta 918  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||  ||||| ||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| ||| ||||    
T  8065350 acatgacattctcgtcacttggttagcagtgatgtgttattgtatattgctcattgtttataaaattaaatgtgt-cattcaatattattgtcaatgtta 8065252  T
Q  919 cgggaacct 927  Q
    || ||||||    
T  8065251 cgagaacct 8065243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 904 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 16393944 - 16393870
Alignment:
Q  904 ttattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16393944 ttattgccaacgttatgagtacct-ataggctcacaaacaaatgacagatagatgagagaaataaataagtaagac 16393870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 31258120 - 31258065
Alignment:
Q  426 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagt 481  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  31258120 atttctttattgcttttgttttgtttcaaaataataaagtctctaaaataattagt 31258065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13359569 - 13359512
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13359569 ttgtgggagtaagtcctaatagccaatctatattcattgggtttgactttgtatcatg 13359512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 667 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120635
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  767 agtgataat 775  Q
    | |||||||    
T  17120643 aatgataat 17120635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 808 - 888
Target Start/End: Original strand, 8510436 - 8510516
Alignment:
Q  808 ttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaa 888  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||||||  |||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  8510436 ttcgtcagatcacatgacattattgccccttgggtgacagtgatgtgttcctagatattactcattgtttataatattaaa 8510516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16566611 - 16566563
Alignment:
Q  335 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16566611 taagccctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 16566563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 775 - 838
Target Start/End: Original strand, 28917960 - 28918023
Alignment:
Q  775 tgattatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcactt 838  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  28917960 tgattatacacatgatcattattacataaagatttcgtcatatcacataacatttttgtcactt 28918023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 189280 - 189221
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatcta---tattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189280 tgttggagtaagccctaataatcaatctagtatattgattgggtttggctttgtatcatg 189221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 825 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 24465252 - 24465191
Alignment:
Q  825 cattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatatta 886  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  24465252 cattcttgtcactagggtaacagtgatgagttgctagatactactcattgtttataatatta 24465191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 780 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 17850035 - 17849960
Alignment:
Q  780 atacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgt 855  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||| |||||||| |||||   |||||||||||||    
T  17850035 atacacataatcattatcacataaatgtttcatcaaattacatgaaattctcgttacttgtaaagcagtgatgtgt 17849960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16394526 - 16394484
Alignment:
Q  341 ctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16394526 ctaatagacaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 16394484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 435 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22259990 - 22259925
Alignment:
Q  435 ttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaa 500  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||    
T  22259990 ttgattttgttatgttgcaaaataataaactccctaaaataactagtccatttaatataacattaa 22259925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 5707320 - 5707674
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707320 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5707419  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5707519  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5707520 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5707619  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707620 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 5707674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 55612683 - 55613037
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612683 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 55612782  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 accccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 55612882  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55612883 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 55612982  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612983 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 55613037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 5713948 - 5714302
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713948 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagcccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5714047  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5714147  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714148 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5714247  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714248 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 5714302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 19926967 - 19926613
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926967 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 19926868  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 19926768  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19926767 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 19926668  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19926667 gaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 19926613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 26970463 - 26970817
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970463 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 26970562  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26970662  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26970663 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26970762  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970763 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 26970817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 776
Target Start/End: Original strand, 868597 - 868954
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868597 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 868696  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868697 accccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 868796  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  868797 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 868896  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 868954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 18262214 - 18262566
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262214 aaggcatttctttattgattttgtttcgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18262313  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262314 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18262413  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18262414 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 18262513  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262514 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 18262566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 26963640 - 26963994
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963640 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26963739  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26963839  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26963840 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26963939  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963940 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 26963994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 10628619 - 10628262
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628619 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10628520  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatattattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10628420  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10628419 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10628320  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628319 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 10628262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 10621540 - 10621186
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621540 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10621441  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10621341  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10621340 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10621241  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621240 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 10621186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 18269070 - 18269427
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgatttt-----gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269070 aaggcatttctttattgattttgttttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 18269169  T
Q  516 gagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 615  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269170 gagaccccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 18269269  T
Q  616 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccacca 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18269270 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 18269369  T
Q  716 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269370 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 18269427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 28393339 - 28392987
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393339 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28393240  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28393239 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 28393140  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28393139 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 28393040  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393039 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 28392987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 431 - 773
Target Start/End: Original strand, 8858179 - 8858521
Alignment:
Q  431 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8858179 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8858278  T
Q  531 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 630  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858279 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8858378  T
Q  631 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacata 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8858379 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8858478  T
Q  731 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858479 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 8858521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 431 - 773
Target Start/End: Original strand, 8845215 - 8845557
Alignment:
Q  431 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8845215 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8845314  T
Q  531 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 630  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845315 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8845414  T
Q  631 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacata 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8845415 tctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8845514  T
Q  731 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8845515 gtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgata 8845557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 421 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 4426808 - 4426482
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426808 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 4426709  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4426708 cccgttaaacataaggaa-ctattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 4426610  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4426609 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 4426510  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagt 748  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4426509 atactacatagtaaaatctatgaaaagt 4426482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 8858793 - 8858993
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858793 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 8858892  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8858893 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 8858990  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  8858991 gac 8858993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 18262838 - 18263038
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262838 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 18262937  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18262938 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 18263035  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  18263036 gac 18263038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 19926341 - 19926141
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926341 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 19926242  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19926241 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 19926144  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  19926143 gac 19926141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 26964266 - 26964466
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964266 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 26964365  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26964366 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaatgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 26964463  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  26964464 gac 26964466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 55613309 - 55613509
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55613309 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgcttgataccgctcactgtt 55613408  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55613409 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 55613506  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  55613507 gac 55613509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 427 - 731
Target Start/End: Original strand, 20311299 - 20311604
Alignment:
Q  427 tttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccat 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20311299 tttctttattgattttgttttgttttaaaataataaagtacttataatagttaatatgttcaatggagcattaaggtataacttaattgtgagaccccat 20311398  T
Q  526 taaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 625  Q
    |||||||||||| ||| || | |||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  20311399 taaacataaggacactgtttttaaagtatttgttgtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatga 20311498  T
Q  626 tcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatact 725  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  20311499 tcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatact 20311598  T
Q  726 acatag 731  Q
    ||||||    
T  20311599 acatag 20311604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 5668327 - 5667980
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| |    
T  5668327 catttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctatttaatggagcattaagtgtgatttaatcgtgagaccc-a 5668229  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatcc--gtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 622  Q
    |||||   ||||| | |||||| |||||||    ||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  5668228 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatatttgtagtcaagctttattgtgaaaagagataacattaaatcatagagactattatgtggatagaccga 5668129  T
Q  623 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaat 722  Q
    ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  5668128 tgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaat 5668031  T
Q  723 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5668030 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 5667980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10620914 - 10620714
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10620914 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagttaccgctcactgtt 10620815  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10620814 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 10620717  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  10620716 gac 10620714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 26971089 - 26971289
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26971089 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacataacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 26971188  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26971189 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaatgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 26971286  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  26971287 gac 26971289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 978
Target Start/End: Original strand, 869223 - 869422
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869223 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgttagatcgcatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 869322  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  869323 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 869420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Original strand, 35223576 - 35223914
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| || |           
T  35223576 catttctttgttgattttgttttgttttaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtaa------- 35223668  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
       |||  ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  35223669 ---aacgaaaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgtaaaaaaggataacattaaagcatatagactattatgtgggtagacggatg 35223765  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35223766 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatac 35223865  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223866 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 35223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 5714574 - 5714773
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714574 attatacacatgatcattatcaaagaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 5714672  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5714673 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 5714770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 18269699 - 18269899
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18269699 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacctgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgatgctagataccgctcactgtt 18269798  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18269799 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggatagatagatgagagaaataaataagtaa 18269896  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  18269897 gac 18269899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 28392715 - 28392515
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28392715 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcatcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgttcactgtt 28392616  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28392615 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacattacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 28392518  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  28392517 gac 28392515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10627993 - 10627796
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627993 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10627894  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10627893 tataatattaaatatgtg----taatattattgtcaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 10627799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 5707946 - 5708145
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5707946 attatacacatgatcattatcaaagaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatatgttgctagataccgctcactgtt 5708044  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5708045 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 5708142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 8845829 - 8846029
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8845829 attatatacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagtagtgatgtgttgctagataccactcactgtt 8845928  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8845929 tataatattaaatatgt-tatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaagtacatatagatgagagaaataaataagtaa 8846026  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  8846027 gac 8846029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 4426196 - 4425996
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  4426196 attatacacatgattattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttaggtagtagtgatgtgttgttagatactactcattgtt 4426097  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4426096 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgagaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 4425999  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  4425998 gac 4425996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 779 - 971
Target Start/End: Original strand, 35224186 - 35224376
Alignment:
Q  779 tatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgttta 878  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35224186 tatacacatgatcattatcacggaaaagtttcatcagatcacgtgtcattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgttta 35224285  T
Q  879 taatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35224286 taatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgtaacgagaacc-tatatggtcacacacaaaggacaaatagatgagagaaataaata 35224376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 791 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 5667698 - 5667511
Alignment:
Q  791 cattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaat 889  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5667698 cattatcacagaaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctaggtaccgctcactgtttataatattaaat 5667599  T
Q  890 atgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5667598 atgt-gattcaatattattgtcaacgttacgagaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgcgagaagtaaataagtaagac 5667511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 10677158 - 10676968
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10677158 attatacacatgatcattatcacgaaaaggttttgtcagatcacatgacattcttgtcacttggatagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10677059  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10677058 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttac-ggaaacttagagggt--cacacaaaggacaaataaatgagagaaataaata 10676968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 10689905 - 10690103
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689905 attatacacatgatcattatcacgaaaaggttttgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10690004  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  10690005 tataatattaaatatgt-gattaaatattattgtcagcgttacgggaa-cttacagggt--cacacaaaagacaaataaacgagagaaataaataagtaa 10690100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 10890798 - 10890608
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10890798 attatacacatgatcattatcacgaaaaggttttgtcagatcacatgacattcttgtcacttggatagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10890699  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10890698 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttac-ggaaacttagagggt--cacacaaaggacaaataaatgagagaaataaata 10890608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 10903545 - 10903743
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10903545 attatacacatgatcattatcacgaaaaggttttgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 10903644  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  10903645 tataatattaaatatgt-gattaaatattattgtcagcgttacgggaa-cttacagggt--cacacaaaagacaaataaacgagagaaataaataagtaa 10903740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 534
Target Start/End: Original strand, 12357136 - 12357251
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357136 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 12357235  T
Q  519 accccattaaacataa 534  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357236 accccattaaacataa 12357251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 781 - 946
Target Start/End: Original strand, 34976101 - 34976264
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34976101 tacacatgagtattatcatggaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgttagataccgctcattgtttata 34976200  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  34976201 atattaaatat-tagatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaag 34976264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 26532181 - 26532330
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  26532181 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatattaagattta 26532280  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  26532281 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 26532330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 425 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 10677753 - 10677538
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10677753 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10677655  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    ||||||  || || | |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10677654 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagctt--tagtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10677557  T
Q  625 atcacatctcacagatcat 643  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10677556 atcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 425 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 10891393 - 10891178
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10891393 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10891295  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    ||||||  || || | |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10891294 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagctt--tagtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10891197  T
Q  625 atcacatctcacagatcat 643  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10891196 atcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 457 - 731
Target Start/End: Original strand, 56516094 - 56516368
Alignment:
Q  457 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaagtatc 555  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||  ||| | ||||||  |||||||    
T  56516094 taataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaa-catatagaacattattcttgaagtatc 56516192  T
Q  556 cgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 655  Q
      |||||||||||| ||| |||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56516193 tatagtcaagctttattgtgaataacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagtt 56516292  T
Q  656 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatag 731  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||    
T  56516293 atcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 2677581 - 2677729
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2677581 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 2677679  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  2677680 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 2677729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 15461488 - 15461669
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15461488 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15461586  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15461587 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 15461669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 15815589 - 15815732
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15815589 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaatat-tagattta 15815687  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  15815688 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 15815732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 445 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 21454319 - 21453993
Alignment:
Q  445 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactat 543  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||  |||| || | |||    
T  21454319 tttgtttcaaagtaataaagttcttagaatagttagtttgattaatggaacattaaaatgtgacttaatattgagaccccattaattataatgacattat 21454220  T
Q  544 tctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 643  Q
    | | ||| ||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||  ||||   ||| ||    
T  21454219 ttttaaaatatctatagtcaaactttattgtgaaatgagataacaataatgcataaagattattatgtgagtagattgatgatcatctctcgg-gataat 21454121  T
Q  644 ggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatga 743  Q
    |||    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  21454120 ggactt-gagatatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgt 21454023  T
Q  744 aaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  21454022 aaaatatcataagatattttcattgtgata 21453993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 421 - 776
Target Start/End: Original strand, 5616215 - 5616568
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||| | ||| |||  |||||     
T  5616215 aaggcatttctttattcattttgttttgtttcaaaataataaagttcctaaaataattagtctatttcttggaacattaagtctgactaaatcatgagat 5616314  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaa--gctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||| ||||||   |||| | |||||| ||||||||||| |||||  | ||| ||  ||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5616315 cccgttaaactagaggacattattcttaaagtatccgttgtcaaaggttttattatgaattgggatattaataaagcattgagactattatgtatgtaga 5616414  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
     |||||| |||||||||  | ||||  || | ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  5616415 ttgatgaccacatctcatgggtcataaat-atgagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtga 5616513  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  5616514 gaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgataatg 5616568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 2677004 - 2677185
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2677004 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2677102  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  2677103 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 2677185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 15462070 - 15462218
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  15462070 gaaaggtttcatcagatcacttgacatttttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 15462168  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15462169 atattattgccaacgtgactaaaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 15462218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 15815012 - 15815193
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15815012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15815110  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15815111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 15815193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 17300270 - 17300089
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17300270 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 17300172  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  17300171 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 17300089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18111354 - 18111173
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18111354 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18111256  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18111255 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 18111173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 34975542 - 34975723
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34975542 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 34975640  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  34975641 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 34975723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 5870985 - 5871128
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  5870985 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 5871083  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  5871084 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 5871128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 17299693 - 17299550
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  17299693 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 17299595  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  17299594 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 17299550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 18110777 - 18110634
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  18110777 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 18110679  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  18110678 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 18110634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 674 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677435
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 674 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10891075
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 812 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 28917497 - 28917360
Alignment:
Q  812 tcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgcc 911  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  28917497 tcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-catatttaatattattgcc 28917399  T
Q  912 aacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28917398 aacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 28917360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 3369334 - 3369153
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3369334 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3369236  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  3369235 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 3369153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 4675717 - 4675569
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  4675717 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 4675619  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  4675618 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 4675569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 18163730 - 18163878
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  18163730 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 18163828  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  18163829 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 18163878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 20244505 - 20244653
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  20244505 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 20244603  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20244604 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 20244653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 802 - 951
Target Start/End: Original strand, 1942260 - 1942407
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  1942260 aaaggttttttcagatcacttgacattcttttcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaa 1942358  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1942359 tattattgtcaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 1942407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 802 - 939
Target Start/End: Original strand, 9488118 - 9488253
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9488118 aaagttttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttggatagcaatgatgtgttgctagatactgctcattgtttataatattaaatat-tagatttaa 9488216  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcaca 939  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  9488217 tattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcaca 9488253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 600 - 775
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870590
Alignment:
Q  600 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 699  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  700 ttggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcatatgatattctcacaatgataat 5870590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 4676294 - 4676113
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  4676294 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 4676196  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  4676195 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 4676113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 18163153 - 18163334
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  18163153 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 18163251  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18163252 aatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 18163334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 20243928 - 20244109
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20243928 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 20244026  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  20244027 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 20244109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 780 - 913
Target Start/End: Original strand, 24701630 - 24701763
Alignment:
Q  780 atacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgttta 878  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24701630 atacacaagatcattattacagaaaaggtttcttcagatcacatgacatttttgtcacttggatagcagtgatgtgttgttagataccactcactgttta 24701729  T
Q  879 taatattaaatatgtggatttaatattattgccaa 913  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  24701730 taatattaaatgt-ttgatttaatattatttccaa 24701763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 26531604 - 26531785
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  26531604 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagt 26531702  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  26531703 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 26531785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 3368757 - 3368614
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  3368757 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgcgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 3368659  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  3368658 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggttacacacaaag 3368614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 802 - 951
Target Start/End: Original strand, 4546633 - 4546780
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  4546633 aaaggtttcgttagatcacttgacattcttgtcacttggatagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaa 4546731  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  4546732 tattatttccaacgtgactagaacc-tataaggccacacacaaagaacag 4546780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 781 - 909
Target Start/End: Original strand, 19373894 - 19374022
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19373894 tacacatgaacattatcatggaaaaggtttcgttagagcacttgacattcttgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagatatcgctcactatttat 19373993  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattg 909  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19373994 aatattaaatat-aggatttaatattattg 19374022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 781 - 916
Target Start/End: Original strand, 19362958 - 19363093
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaagg-tttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| | |||||| ||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19362958 tacacatgaacattatcatggaaaagatttcgttagagcacttgacattcttgtaacttggatagcagtgatgtgttgctagataccgctcactatttat 19363057  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgt 916  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19363058 aatgttaaatat-tagatttaatattattgccaacgt 19363093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 806 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 30040217 - 30040084
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  30040217 gtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttggatagcaatgatgtgttgctagataccactcattgtttatagtattaaatat-tagacttaatatt 30040119  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacaca 941  Q
    |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||    
T  30040118 attgccaatgtgactagaacc-tatagggtcacaca 30040084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 803 - 945
Target Start/End: Original strand, 11421558 - 11421698
Alignment:
Q  803 aaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaat 902  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  11421558 aaggtttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctaaatacatatcactgtttataatattaaata-ctagatttaat 11421656  T
Q  903 attattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  11421657 attattggcaacgtgactagaacc-tatggggtcacacacaaa 11421698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 582 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 32646845 - 32646697
Alignment:
Q  582 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 681  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32646845 gataacattaaagaatgaagactattatgtggatatgttgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaata 32646746  T
Q  682 ttaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacata 730  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  32646745 ttaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata 32646697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 781 - 914
Target Start/End: Original strand, 9538507 - 9538640
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9538507 tacacatgaacattatcatggaaaaggtttcgtcagatcagttgacgttcttgtcacttggataacagtgatctgttgctagataccgctcattgtttat 9538606  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaac 914  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  9538607 aatattaaata-caagatttaatattattgccaac 9538640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 5524748 - 5524582
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgt 875  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5524748 attatacacatgaacattgtcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgaaattcctgtcacttggataagagtgatgtgttactagataccgctcactat 5524649  T
Q  876 ttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaa 944  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| || |||||||||    
T  5524648 ttataatattaaata-caagatttaatattattgccaacattacaagaacc-tataaggacacacacaa 5524582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 599 - 765
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365681
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  699 attggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctca 19365681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 590 - 776
Target Start/End: Original strand, 32636475 - 32636657
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| ||||    
T  32636475 taaagcgtggagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagt 32636573  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32636574 aatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatg 32636657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 1941715 - 1941896
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1941715 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 1941813  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  1941814 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataat 1941896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 811 - 944
Target Start/End: Original strand, 5616975 - 5617105
Alignment:
Q  811 gtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgc 910  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  5616975 gtcagatcactttacattcttgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagata-caatcactgtttataatattaaatat-aagatttaatattattgt 5617072  T
Q  911 caacgttacgggaaccttatagggtcacacacaa 944  Q
    ||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  5617073 cactgttacaagaacc-tataaggtcacacacaa 5617105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 5713855 - 5713912
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713855 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 5713912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 26963547 - 26963604
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963547 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26963604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 26970370 - 26970427
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970370 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26970427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 895 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 47388408 - 47388328
Alignment:
Q  895 gatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47388408 gatttaatattattgtcaacgttacggtaacct-atagggtcacacacaaatgacagatagatgagagaaataaataagtaa 47388328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19927059 - 19927003
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927059 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19927003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 4546071 - 4546252
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4546071 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 4546169  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  4546170 aatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataat 4546252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 603 - 681
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  603 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 681  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 781 - 914
Target Start/End: Original strand, 32637032 - 32637165
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaag-gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| || ||||| |||||  ||||||||| ||||  | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  32637032 tacacatgaacaatatcatagaaaaagtttcgtcaaatcatttaacattcttgtcacttaggtagtagtgatgtgttgctagatatcgcccattgtttat 32637131  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaac 914  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  32637132 aatattaaatat-aagatttaatattattgccaac 32637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10621633 - 10621576
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10621633 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 10621576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 5707228 - 5707284
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5707228 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 5707284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 12357044 - 12357100
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12357044 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggatttggctttgtatcatg 12357100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Original strand, 868507 - 868561
Alignment:
Q  329 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868507 ttggaataaaccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 868561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 777 - 927
Target Start/End: Original strand, 36092869 - 36093022
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactg-- 874  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  | ||| ||      
T  36092869 attatacacataatctttatcacataaatgtttcttcatatcacatgacattctagtcacttaggtagtagtgatgtgttgttagatattgttcattgct 36092968  T
Q  875 --tttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaacct 927  Q
       ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36092969 taattataatatttcatatgt-gatttaatattattgcaaacgttatgagaacct 36093022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10628711 - 10628655
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10628711 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttgactttgtatcatg 10628655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17142428 - 17142372
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17142428 tgttggaaaaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatcatg 17142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 55612594 - 55612650
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612594 tgttagaataagccctaataaccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 55612650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 674 - 776
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538132
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 775
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487723
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 667 - 776
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362583
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  767 agtgataatg 776  Q
    | ||||||||    
T  19362574 aatgataatg 19362583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28393434 - 28393380
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28393434 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatca 28393380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 18268975 - 18269032
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18268975 ttgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18269032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4426903 - 4426847
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426903 tgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggctctgtatcatg 4426847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 646 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  646 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 745  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  746 agtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 468 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 39074346 - 39074190
Alignment:
Q  468 ctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagc 566  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||            ||||||||  |    
T  39074346 ctagaataattagtccgtttaaattgaacattaagtatgacttaatcatgagaccccattaaacataag-ataccat------------cgtagtcatac 39074260  T
Q  567 tttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 636  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||    
T  39074259 tttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggagactattacgtgggttgattgttgatcacatctcac 39074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 5528790 - 5528608
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| || ||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||| | ||||| |||  ||| ||| | || |  |||||| ||||||||||||||||    
T  5528790 taaagcgtatagactattatgtttgtagaattatgaccacatctcacgggtcatgaatac-gagatattatgtatatacataggtataaatattaggagt 5528692  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
     |||||||||||| ||| | ||| | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5528691 gatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcataatgataatg 5528608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040619
Alignment:
Q  686 gagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataat 30040619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 816 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 9937540 - 9937430
Alignment:
Q  816 atcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacg 915  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||     
T  9937540 atcacatgacattctcgtcatttgggtaacaacggtgtgttacaagatatcactcattgtttataatattaaagatgt-tatttaatattattgtcaaca 9937442  T
Q  916 ttacgggaacct 927  Q
    | ||| ||||||    
T  9937441 taacgagaacct 9937430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 689 - 775
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421179
Alignment:
Q  689 taatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataat 11421179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 806 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 23055790 - 23055635
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |  || ||||||||| |   ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  23055790 gtttcgtcagatcatatgacattctcgtcacttgggtaacaacgtcgtattgctagatgcttatcattgtttataatatt-aatatat-gatttaatatt 23055693  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaa 965  Q
    ||| | ||| | ||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||| || |||||||    
T  23055692 attactaacatgacgggaacc-tataggg-gacacacatagaacagataaataagagaaa 23055635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 9938015 - 9937933
Alignment:
Q  575 gaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 657  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938015 gaagtgagatagcatcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 383
Target Start/End: Original strand, 55992680 - 55992729
Alignment:
Q  334 ataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55992680 ataagccctaatagccaatttgtattgattgggtttgactttgtatcatg 55992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5668412 - 5668371
Alignment:
Q  342 taatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5668412 taatagccaatctatattgattgtgtttggttttgtatcatg 5668371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 655 - 730
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888666
Alignment:
Q  655 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacata 730  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata 33888666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Original strand, 8845118 - 8845166
Alignment:
Q  335 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845118 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8845166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Original strand, 8858082 - 8858130
Alignment:
Q  335 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858082 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8858130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 383
Target Start/End: Original strand, 18262136 - 18262176
Alignment:
Q  343 aatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18262136 aatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18262176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 469 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 11161972 - 11161913
Alignment:
Q  469 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaa 528  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  11161972 tagaatagttaatcagtttaatggaacacaaagtgtgacttaattgtgagactccattaa 11161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Original strand, 20311207 - 20311261
Alignment:
Q  329 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20311207 ttggagtaagctgtaatagccaatctgtattcattggatttggctttgtatcatg 20311261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 635
Target Start/End: Original strand, 11421007 - 11421052
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 635  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421007 taaagcttcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 30040785 - 30040740
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 635  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040785 taaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 7141 - 6787
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7141 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 7042  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 accctattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6942  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6941 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6842  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6841 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 6787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 14157 - 13803
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14157 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctacaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 14058  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14057 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 13958  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13957 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 13858  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13857 gaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 13803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 6515 - 6315
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6515 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 6416  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6415 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 6318  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  6317 gac 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 13531 - 13331
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13531 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 13432  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13431 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 13334  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  13333 gac 13331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7177
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7234 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14249 - 14193
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14249 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 14193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 21940665 - 21941019
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940665 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21940764  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940765 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 21940864  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21940865 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 21940964  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940965 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 21941019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 425 - 776
Target Start/End: Original strand, 24642655 - 24643005
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24642655 catttctttattgattttgttttgtttcaaaatcataaagtccctagaattgttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24642754  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642755 ttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatg 24642854  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642855 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatac 24642954  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642955 tacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 24643005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 425 - 773
Target Start/End: Original strand, 6094129 - 6094477
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6094129 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 6094228  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  6094229 ttaaacataaggaaactatttttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatg 6094328  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6094329 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 6094428  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094429 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 6094477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 22171491 - 22171841
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171491 aaggcatttccttattgattttgttttatttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 22171590  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171591 cccattaaacata--gaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 22171688  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22171689 gatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 22171788  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171789 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 22171841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 6094749 - 6094949
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094749 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 6094848  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6094849 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacaggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagataagagaaataaataagtaa 6094946  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  6094947 gac 6094949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 421 - 620
Target Start/End: Original strand, 28554885 - 28555084
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554885 aaggcatttctttattgattttgtttagtttcaaaataataaaatacctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28554984  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554985 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 21941291 - 21941491
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941291 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgacagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 21941390  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21941391 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaatgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 21941488  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  21941489 gac 21941491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 15326824 - 15327024
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326824 attatacacatgaacattatcacggaaatgtttcgtcagatcacatgacattctcgtcactttggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 15326923  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15326924 tataatattaaatacgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaa-catatagggtcacacacaaaggacagatagatgaaagaaacaaataagtaa 15327021  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  15327022 gac 15327024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 15507193 - 15507393
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507193 attatacacatgaacattatcacggaaatgtttcgtcagatcacatgacattctcgtcactttggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 15507292  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15507293 tataatattaaatacgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaa-catatagggtcacacacaaaggacagatagatgaaagaaacaaataagtaa 15507390  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  15507391 gac 15507393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 28548673 - 28548873
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548673 attatacacatgaacattatcacggaaaggtttcgtcagatcaaatgacattctcgtcacttgggtaacagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 28548772  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28548773 tataatattaaatacg-aaatttaatattattgtcaacgctacgggaacc-tattgggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 28548870  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  28548871 gac 28548873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Original strand, 24643273 - 24643465
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24643273 attatacacatgatcattatcacggaaaggtttcctcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagaagtgatgtgttgctagataccgtttactgtt 24643372  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24643373 tatagtattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggagcc-tatagggtcacaaacaaatgacagatagatgagagaaataaata 24643465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 643 - 773
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326552
Alignment:
Q  643 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatg 742  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  743 aaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgata 15326552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 643 - 773
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15506921
Alignment:
Q  643 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatg 742  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  743 aaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgata 15506921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 431 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 38232570 - 38232272
Alignment:
Q  431 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 530  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  |   ||| ||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  38232570 tttattgattttgttttatttcaaaataataaa-tctctagaatagttagtctgtttaataaatttttaggtataacttaatcatgacactccattaaac 38232472  T
Q  531 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 630  Q
     |||  | | |||||| |||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  38232471 gtaaa-atagtattcttaaagtatttgtagtcaaactttattgtaaagtgagatagtcttaaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcaca 38232373  T
Q  631 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacata 730  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  38232372 tctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacata 38232273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 425 - 552
Target Start/End: Original strand, 24636860 - 24636987
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24636860 catttctttcttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccttttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24636959  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagt 552  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24636960 ttaaacataaggaaactattcttaaagt 24636987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 777 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 24796586 - 24796387
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24796586 attatacacatgatcattatctcaaaaaggtttcgtcagatcacatgaaattctcgtcacttgcatatcactgatgtgtggctagatatcgctcactatt 24796487  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||    
T  24796486 tataatattaaatatgt-gatttaataatattgtcaacgttaccggaacc-tatagagttacacacaaaggacagtatgatgagagaattaaataagtaa 24796389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 515 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14984030 - 14983776
Alignment:
Q  515 tgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtagg 614  Q
    |||||||| |||||||   |||| | |||||| ||||||||  || ||||  ||| ||| |||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  14984030 tgagacccaattaaactataggacattattcttaaagtatctataatcaaaatttattgtgaagtgggataacattaa-gaatagggactattatgtggg 14983932  T
Q  615 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccacc 714  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||    
T  14983931 tagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgcc 14983833  T
Q  715 atgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14983832 atgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataa 14983776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 594 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797242
Alignment:
Q  594 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 693  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  694 tttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 772  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 24797242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 781 - 951
Target Start/End: Original strand, 26241034 - 26241202
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26241034 tacacatgagtattatcatggaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttata 26241133  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26241134 atattaaatat-cagatttaatattattgccaatgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 26241202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 804 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 8370983 - 8370838
Alignment:
Q  804 aggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaata 903  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  8370983 aggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagatttaata 8370885  T
Q  904 ttattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8370884 ttattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 8370838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 21969324 - 21969505
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21969324 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21969422  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21969423 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 21969505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 25611764 - 25611912
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  25611764 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatgt-aagattta 25611862  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25611863 atattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 25611912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 12562114 - 12562295
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12562114 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 12562212  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  12562213 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 12562295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 22130343 - 22130195
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22130343 gaaaggtttcgtcagatcacttgacactcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 22130245  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  22130244 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 22130195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 802 - 951
Target Start/End: Original strand, 6431457 - 6431604
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6431457 aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttaggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaa 6431555  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6431556 tattattgccaacgtgactagaacc-tatagggccacacacaaagaacag 6431604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 781 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 22659247 - 22659084
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22659247 tacacatgagtattatcatggaaaagtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagaaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttata 22659148  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||    
T  22659147 gtattaaatat-tagatttaatattattgccaacgtgattagaacc-tatagggtcacacacaaag 22659084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 27007251 - 27007108
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  27007251 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaatat-tagattta 27007153  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  27007152 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 27007108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 27014394 - 27014251
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  27014394 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaatat-tagattta 27014296  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  27014295 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 27014251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 8371564 - 8371383
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  8371564 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagt 8371466  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  8371465 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 8371383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 22130920 - 22130739
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22130920 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22130822  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22130821 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 22130739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 25611186 - 25611367
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25611186 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25611284  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  25611285 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcataagatattctcacaatgataat 25611367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27007828 - 27007647
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27007828 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27007730  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  27007729 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 27007647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27014971 - 27014790
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27014971 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27014873  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  27014872 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 27014790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27880798 - 27880617
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27880798 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27880700  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  27880699 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 27880617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 28020979 - 28020798
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28020979 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28020881  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  28020880 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 28020798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 21917244 - 21917387
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  21917244 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagacaccgctcattgtttatgatattaaata-atggattta 21917342  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  21917343 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 21917387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 27880221 - 27880078
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||    
T  27880221 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaat-gatggattta 27880123  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  27880122 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 27880078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 28020402 - 28020259
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||    
T  28020402 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaat-gatggattta 28020304  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  28020303 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 28020259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 21969902 - 21970050
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  21969902 gaaaggtttcgtcagatcacttgatattcttgtcacttggatagcaatggtgtgttgctagataccgctcaatgtttataatattaaatat-cagattta 21970000  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21970001 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 21970050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 45534007 - 45533859
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  45534007 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 45533909  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  45533908 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 45533859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 21916667 - 21916848
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21916667 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagt 21916765  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21916766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 21916848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 45534584 - 45534403
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  45534584 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 45534486  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  45534485 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 45534403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 440 - 742
Target Start/End: Original strand, 2375027 - 2375332
Alignment:
Q  440 tttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaa 539  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||| |||||||||| | | |    
T  2375027 tttgttttgtttcaaaataataaactccctataataattagtcaatttaatggaacatttatgatgacttaatcatgaaaccc-attaaacatacgaata 2375125  T
Q  540 ctattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat-------gatcacatc 632  Q
     |||| | |||||||  ||||||| | ||| ||| || |||||||| |||||||| |||   ||||||| || |||||| ||||       |||||||||    
T  2375126 ttatttttaaagtatatgtagtcacgatttattgcga-gtgagataacattaaagtatatgaactattaagtgggtagattgatcactcatgatcacatc 2375224  T
Q  633 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagt 732  Q
     |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| |||||||      
T  2375225 acacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacata-- 2375322  T
Q  733 aaaagttatg 742  Q
    ||||||||||    
T  2375323 aaaagttatg 2375332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 449 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 32873019 - 32872741
Alignment:
Q  449 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttta-atggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctc 547  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || | |  || | || | |     
T  32873019 tttcaaaataataaagtccttataatagttcatccatttatatagaacattaagtatgacttaattgtgagatctcattgaaaagagtgacaatactatt 32872920  T
Q  548 aaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 647  Q
    ||| |||  ||||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| ||    
T  32872919 aaaatatttgtagttaagatttattgtgaagtgggataacatcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaat 32872820  T
Q  648 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatacta 726  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  32872819 aaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 590 - 765
Target Start/End: Original strand, 26240475 - 26240646
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26240475 taaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagt 26240573  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26240574 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctca 26240646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 590 - 776
Target Start/End: Original strand, 18835341 - 18835523
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  18835341 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagt 18835439  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18835440 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgataatg 18835523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 802 - 945
Target Start/End: Original strand, 18835916 - 18836057
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  18835916 aaaggtttcgtcaaatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagatactagtcattgtttataatattaaatat-taaatttaa 18836014  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    |||||||||||||||  |  |||||  |||||||||||||||||    
T  18836015 tattattgccaacgtggctagaacc-aatagggtcacacacaaa 18836057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 802 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 2962663 - 2962515
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||| || ||||||| | |||||||    
T  2962663 aaaggtttcgttagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgttagatactgctcattatttatagtaataaatat-tagatttaa 2962565  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacaga 952  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2962564 tattattaccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacaaaaagaacaga 2962515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 806 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 8781602 - 8781467
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  8781602 gtttcgttagatcacttgacattcttgtcacttgggaatcagtgatgtgttgctagataccgctcgttgtttataatattaaata-aaaaatttaatatt 8781504  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacaca 943  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8781503 attgtcaatgttacaggaa-cttatagggtcacacaca 8781467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 858
Target Start/End: Original strand, 22172112 - 22172193
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgc 858  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22172112 attatacacatgatcattatcacagaaaggttttgtcagatcatatgacattctcgtcacttgggtagcattgatgtattgc 22172193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 600 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659624
Alignment:
Q  600 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 699  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  700 ttggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 22659624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 905 - 979
Target Start/End: Original strand, 22172188 - 22172261
Alignment:
Q  905 tattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22172188 tattgccaacgttacgggaacct-atagggtcacacacaaaggacagaaagatgagagaaataaataagtaagac 22172261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 793 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 14979047 - 14978953
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaa 888  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14979047 ttatcacaaaaaggttt-gtcatatcacttgacattctcgtcatttaggtagcagtgacgtgtatctagataccgctcactgtttataatattaaa 14978953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 21940573 - 21940629
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21940573 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 21940629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 22070108 - 22070164
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22070108 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 22070164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 675 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8782004
Alignment:
Q  675 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagt--ctgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 667 - 775
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431058
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  767 agtgataat 775  Q
    | |||||||    
T  6431050 aatgataat 6431058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 22171395 - 22171452
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22171395 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgattttgtatcatg 22171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 379
Target Start/End: Original strand, 24642555 - 24642608
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642555 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 24642608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 6094031 - 6094087
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6094031 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 6094087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 28554790 - 28554847
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554790 ttgttggagtaagccctaatagccaatctttgttgattgggtttggctttgtatcatg 28554847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 777 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 8967883 - 8967813
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcag 847  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8967883 attatacgcatgattattatcacaaaaagatttaatcagatcacatgacattctcgccacttgggtagcag 8967813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 696
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  602 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 696  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 2963247 - 2963105
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | | ||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2963247 taaagcgtagagactattatgtatgtagactaatgaccgtatctcatgggttataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 2963149  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||| ||||| || | |||  |||||||||||||||||    
T  2963148 aatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagta 2963105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 777 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 20534967 - 20534880
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaag-gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagat 863  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20534967 attatgcacatgaacattatcatggaaaatgtttcgtcagatcatttgacattcttgtcacttgggtagcagtgaaatgttgctagat 20534880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 673
Target Start/End: Original strand, 24535471 - 24535569
Alignment:
Q  575 gaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 673  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||| |||| |||  ||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535471 gaagtgagataacattgaaacatcgagattattttgtgagtacactgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 777 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 32872431 - 32872318
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |  || ||    
T  32872431 attatgcacatgtttattatcacgaaaaggtgtcgtcagatcatgtgacatttttatcactttagtagcagtgatgtgttgttagatacctattgctctt 32872332  T
Q  877 tataatattaaata 890  Q
    ||||||||||||||    
T  32872331 tataatattaaata 32872318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 777 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 27098753 - 27098615
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacag-aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgt 875  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||  | |  || || |||||||||||   ||  |||    
T  27098753 attatacacatgatcattatcacggaaaaagtttcattagatcacatgacattcccgtaacttgggcgggaacgacgtattgctagatacttatcgttgt 27098654  T
Q  876 ttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgt 916  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  27098653 ttataatatt-aatatat-gatttaatattattaccaacgt 27098615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 520
Target Start/End: Original strand, 10920234 - 10920297
Alignment:
Q  457 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  10920234 taataaaattcctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgagttaatcgtgagac 10920297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 732
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659118
Alignment:
Q  673 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagt 732  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatactaaatagt 34659118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 706
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  699 attggatt 706  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 793 - 883
Target Start/End: Original strand, 2375677 - 2375767
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataata 883  Q
    |||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  2375677 ttatcacaaaaaagttttgtgaaatcacgtgacattcttctcgcgtgggtagcagtgatgtgttcttagataccactcattgtttataata 2375767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 646 - 698
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  646 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 793 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 38231945 - 38231897
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttggg 841  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38231945 ttatcacagaaagatttcgttagatcacttgacattcttgtcacttggg 38231897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 655 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 27677626 - 27677551
Alignment:
Q  655 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacata 730  Q
    ||||||||||  |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  27677626 tatcaagtctatacataagtataattattaggagtgatatttatatttgattgacacactacgagaatactacata 27677551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 380
Target Start/End: Original strand, 2374946 - 2375000
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 380  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2374946 ttgttggaataagccctaataataaatatgtattgattggatttggctttgtatc 2375000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 703 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535339
Alignment:
Q  703 gattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatg 20535339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 850 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 38231195 - 38231130
Alignment:
Q  850 atgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgtta 918  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||| ||||||||    
T  38231195 atgtgtagctagatactgctcattgtttataatactaaatat---ggtttaatattattgtcaacgtta 38231130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 364
Target Start/End: Original strand, 24636605 - 24636642
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattg 364  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24636605 tgttggagtaagccataatagccaatctatattgattg 24636642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 24695673 - 24695319
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695673 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 24695574  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcaataaagcatagagactattatgtaggtaga 24695474  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24695473 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 24695374  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695373 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 24695319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 19714703 - 19714351
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714703 aaggcatttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 19714604  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714603 cccgttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 19714504  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714503 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 19714404  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714403 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 19714351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 425 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 19707419 - 19707069
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19707419 catttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 19707320  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19707319 ttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatg 19707220  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19707219 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 19707120  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19707119 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataat 19707069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18570070 - 18569714
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18570070 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18569971  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18569970 accccgttaaacataaggaaactactcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcataaagactattatgttggtaga 18569871  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatgg--ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccat 716  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18569870 ctgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccat 18569771  T
Q  717 gagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569770 gagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgata 18569714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 24695039 - 24694847
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695039 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 24694940  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24694939 tataatattaaatatgt-gatttaatattattcccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 24694847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 24701803 - 24701611
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701803 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 24701704  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701703 tataatattaaatatgt-gatttaatattattcccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 24701611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 532 - 773
Target Start/End: Original strand, 39538701 - 39538942
Alignment:
Q  532 taaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacat 631  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  39538701 taaggacactattcttaaaatatccatagttaagctttattgtgaagtgggatatcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatat 39538800  T
Q  632 ctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatag 731  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39538801 ttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatag 39538900  T
Q  732 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39538901 taaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgata 39538942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 425 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 22547217 - 22546763
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22547217 catttatttattcattttgttttattttaaaataataaaaccgctataatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaatcgtgagatctca 22547118  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 624  Q
    ||||| ||| ||| | |||| | ||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22547117 ttaaatatatggacattatttttaaagtattcgcagtcaaactttattgtgaagtgagataacattaaaatatagagactattatgtggatagaccgatg 22547018  T
Q  625 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatac 724  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22547017 atcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatac 22546918  T
Q  725 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgattatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatga 824  Q
    ||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||||        |  || |   ||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  22546917 tacata--aaaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgataat-------taagtggt--gtatcacgaaaaggtttcgtcatattacatga 22546830  T
Q  825 cattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    |||||| ||||||||| ||   ||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  22546829 cattcttgtcacttggatatgcgtgatgtgttgttacataccactcattatttataatattaaatat 22546763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 19714079 - 19713879
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714079 attatacacatgatcattatcacataaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 19713980  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19713979 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagagtcacacgcaaatgacagatagatgagagaaataagtaagtaa 19713882  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  19713881 gac 19713879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 19706800 - 19706608
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19706800 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcatcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcagtgtt 19706701  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19706700 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgcaaacgttacggaaacc-tatagggtcacacacaaatgacagatagatgagagaaataaata 19706608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 485 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18807175 - 18806889
Alignment:
Q  485 tttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa-ggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgaga 583  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||    
T  18807175 tttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgagacaccattaaa-ataatggacattattcttaaagtatctatagtcaagcgttattgtgaagtaaga 18807077  T
Q  584 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 683  Q
    || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807076 taacaataaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 18806977  T
Q  684 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18806976 agaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataa 18806889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 27347679 - 27347425
Alignment:
Q  424 gcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccc 523  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||     
T  27347679 gcatttctttgttgattttgttttgattcaaaataataaagtccttagaataattaatctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc- 27347581  T
Q  524 attaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat 623  Q
    |||||||  ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||    
T  27347580 attaaacgaaaggacattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattttgtggataggccgat 27347481  T
Q  624 gatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 679  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347480 gatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 423 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17285935 - 17285603
Alignment:
Q  423 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 522  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  17285935 ggcatttatttattgattttgttatgtttcaaaataataatctccagagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgaaaccc 17285836  T
Q  523 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 622  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| | ||||| | |||| ||| ||| || ||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17285835 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgtgaattgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17285752  T
Q  623 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaat 722  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17285751 tgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaat 17285652  T
Q  723 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    |||||||||  ||||||||| | | | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17285651 actacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataa 17285603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 777 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 18568081 - 18567943
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568081 attatacacatgatcattattacataaaggtttggtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagccgtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 18567982  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgt 916  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18567981 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgt 18567943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 777 - 978
Target Start/End: Original strand, 39539174 - 39539374
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39539174 attatacacatgatcattttcacataaatgtttcgtcagatcacatgatattctcgtcacttgggtagcggtgttgtgttgctagataccgctaactatt 39539273  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||  ||    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  39539274 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaatgttattggattctacaggggtcacacacaaaggacatataagtgagagaaataaataagtaa 39539372  T
Q  977 ga 978  Q
    ||    
T  39539373 ga 39539374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 423 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17299088 - 17298754
Alignment:
Q  423 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 522  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||    
T  17299088 ggcatttatttattgattttgttatgtttataaataataatatccagagaatagttagtccgattaatggaacattaagtgcgacttaatcgtgaaaccc 17298989  T
Q  523 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 622  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| | ||||| | |||| |||  ||||| ||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17298988 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgttaagtgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17298905  T
Q  623 tgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    ||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17298904 tgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgaga 17298805  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17298804 atactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataa 17298754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 777 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 25805141 - 25804970
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25805141 attatacacatgaatattatcat-gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtt 25805043  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25805042 tataatattaaatat-cagatttaatattattgccaacgtgaccagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 25804970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 22941820 - 22941968
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  22941820 gaaaggtttcgtcagatcactttacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 22941918  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22941919 atattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 22941968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 20941018 - 20941199
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20941018 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20941116  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  20941117 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 20941199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 20941596 - 20941744
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||    
T  20941596 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-caaattta 20941694  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20941695 atattatttccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 20941744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 25805696 - 25805515
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25805696 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25805598  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  25805597 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 25805515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 781 - 951
Target Start/End: Original strand, 31097365 - 31097533
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31097365 tacacatgagtattatcatggaaaagtttcatcatatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgttcattgtttata 31097464  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31097465 atattaaatat-cggatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 31097533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 32467 - 32610
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  32467 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaata-atggattta 32565  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  32566 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 32610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Original strand, 23546490 - 23546633
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  23546490 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatgatattaaatat-tagattta 23546588  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  23546589 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 23546633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 793 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 17283023 - 17282873
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatg 892  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  17283023 ttatcacataaaagtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcagtgatgtgctgctagacactgctcactgtttataatattaaatat- 17282925  T
Q  893 tggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |  |||||||||||||||    
T  17282924 tggatttaatattattgtcaacgctacaagaacc-tgcagggtcacacacaaa 17282873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 781 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 12764743 - 12764574
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12764743 tacacataatcattatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattatttat 12764644  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12764643 agtaataaatat-tagatttaatattattaccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 12764574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 31890 - 32071
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31890 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 31988  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  31989 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 23545913 - 23546094
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23545913 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 23546011  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  23546012 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 23546094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 802 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 9811464 - 9811323
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| | |||||||    
T  9811464 aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattatttatagtaataaatat-tagatttaa 9811366  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  9811365 tattattaccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaa 9811323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 12789397 - 12789249
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  12789397 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 12789299  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  12789298 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 12789249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 12789974 - 12789793
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  12789974 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagt 12789876  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  12789875 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 12789793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 22941241 - 22941422
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22941241 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagt 22941339  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22941340 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 22941422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 24933040 - 24932892
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  24933040 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattagatat-tagattta 24932942  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  24932941 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 24932892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 802 - 916
Target Start/End: Original strand, 5098219 - 5098332
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5098219 aaaggttccgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaa 5098317  T
Q  902 tattattgccaacgt 916  Q
    |||||||| ||||||    
T  5098318 tattattgtcaacgt 5098332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 24933617 - 24933436
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  24933617 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 24933519  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  24933518 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 24933436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 419 - 528
Target Start/End: Original strand, 39537962 - 39538071
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39537962 acaagccatttctttaatgattttgttttgtttcaaaatggttaagtccttagaatagttggttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 39538061  T
Q  519 accccattaa 528  Q
    ||| ||||||    
T  39538062 acctcattaa 39538071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 802 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 31651511 - 31651370
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |    
T  31651511 aaaggtttcgtcggatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgttagataccgctcactctttataatattaaacat-aggatttca 31651413  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||    
T  31651412 tattattaccaacgttacaagaacc-tatggggtgacacacaaa 31651370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 31096807 - 31096988
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31096807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagt 31096905  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  31096906 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 31096988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 806 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 7865157 - 7865019
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  7865157 gtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgttagataacgctcattatttatagtaataaatat-tagatttaatatt 7865059  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  7865058 attaccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaag 7865019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 806 - 946
Target Start/End: Original strand, 26245676 - 26245815
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||  | ||||||||||    
T  26245676 gtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattgaacattagaatttaatatt 26245775  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26245776 attgccaacgtgactagaacc-tataggatcagacacaaag 26245815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 793 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 17298468 - 17298348
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatg 892  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17298468 ttatcacataaaagtttcgtcaaatcacttgacattctt-tcacttggatagcagtgatgtgttgctagacaccgctcactgtttataatattaaatat- 17298371  T
Q  893 tggatttaatattattgccaacg 915  Q
      ||||||||||||||| |||||    
T  17298370 aagatttaatattattgtcaacg 17298348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 793 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 17314546 - 17314431
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatg 892  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||     
T  17314546 ttattacataaaagtttcgtcagatcacttgacattcttttcacttgggtagcagtgatgtgttgctagacaccgcttattgtttataatattaaatat- 17314448  T
Q  893 tggatttaatattattg 909  Q
      |||||||||||||||    
T  17314447 aagatttaatattattg 17314431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 28719338 - 28719234
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  28719338 attatacacatgatcattatcacataaaggtttcgtcagattatttgatattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagatacatctcattgtt 28719239  T
Q  877 tataa 881  Q
    |||||    
T  28719238 tataa 28719234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 802 - 891
Target Start/End: Original strand, 39535762 - 39535851
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39535762 aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacactggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat 39535851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 590 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 12765305 - 12765162
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12765305 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12765207  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaa 734  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  12765206 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa 12765162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 5097642 - 5097823
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  5097642 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagt 5097740  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||    
T  5097741 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgataat 5097823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24695766 - 24695709
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695766 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 24695709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 601 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100372
Alignment:
Q  601 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 700  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  701 tggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    ||| |||| ||| | |||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatg 20100372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7865745 - 7865603
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7865745 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 7865647  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  7865646 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagta 7865603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9812048 - 9811906
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  9812048 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 9811950  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9811949 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagta 9811906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12704189 - 12704047
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12704189 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12704091  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  12704090 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagta 12704047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 528
Target Start/End: Original strand, 31886537 - 31886640
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31886537 catttctttagtgattttgttttgtttcaaattaataaagtccttagaataattagttcatttaattgaacatcaagtacgacttaatcgtgagactcca 31886636  T
Q  525 ttaa 528  Q
    ||||    
T  31886637 ttaa 31886640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19714798 - 19714742
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714798 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19714742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 590 - 765
Target Start/End: Original strand, 26245093 - 26245264
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26245093 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagt 26245191  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
    |||||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26245192 aatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctca 26245264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19707519 - 19707462
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19707519 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 19707462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27347778 - 27347722
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347778 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgcgtttggctttgtatcatg 27347722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 657 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829416
Alignment:
Q  657 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 756  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataag 18829434  T
Q  757 atattctcatagtgataa 774  Q
     |||||||||| ||||||    
T  18829433 ttattctcataatgataa 18829416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 783 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 20099995 - 20099922
Alignment:
Q  783 cacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgtt 856  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20099995 cacatgaacattatcatggaaagatttcgtcagatcatatgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgtt 20099922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 31652095 - 31651915
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |  |||||| | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||| | || |||||||||||||    
T  31652095 taaaacatagagactactatgtatgtagactgatgactaagtctcacgggtcatagatat-gagatattaagtttatacattggtaaaaatattaggagt 31651997  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    || ||| ||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31651996 aacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagt--atgttatg--aagtatcataagatattctcatagtgataat 31651915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806529
Alignment:
Q  681 attaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataa 18806529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806709
Alignment:
Q  681 attaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataa 18806709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 667 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129822
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  767 agtgataatg 776  Q
    | ||||||||    
T  26129831 attgataatg 26129822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 935 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 18565891 - 18565847
Alignment:
Q  935 tcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18565891 tcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaagac 18565847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 33477479 - 33477389
Alignment:
Q  445 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataag 535  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||| | |  |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  33477479 tttgtttcaaaataataaagtccttacaatagttaggctgattaatggatcattaagtgtgatctaatcgtgagacctcattaatcataag 33477389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18570165 - 18570108
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18570165 ttgttcgagtaagctctaatagctaatctatattaattgggtttggctttgtatcatg 18570108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 806 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 33476858 - 33476770
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtg 894  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33476858 gtttcatcaaatcaaatgatattctcgtcacttgaataacagtgatgtattgttagatatcactcactgtttataatactaaatgtgtg 33476770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 382
Target Start/End: Original strand, 39537870 - 39537925
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 382  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  39537870 tgttggattaagccctaatagccaatctatgttgactgagtttagctttgtatcat 39537925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 732 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347388
Alignment:
Q  732 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 27347388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 469 - 537
Target Start/End: Original strand, 11479420 - 11479489
Alignment:
Q  469 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc-cattaaacataagga 537  Q
    ||||||| |||||  |||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11479420 tagaataattagtgtgtttaatgaaatattaagtgtgacttgattgtgagaccctcattaaacataagga 11479489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 33477321 - 33477193
Alignment:
Q  602 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 701  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  33477321 actattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttataca 33477223  T
Q  702 ggattgatccaccatgagaatactacatag 731  Q
      |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  33477222 taattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 21330455 - 21330101
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330455 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21330356  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21330355 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtgga 21330256  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330255 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 21330156  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330155 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 21330101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 419 - 772
Target Start/End: Original strand, 18796506 - 18796859
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796506 acaaggaatttatttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18796605  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||| | || |||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18796606 acctcttttaacataaggatattattcttaaattatctgtagtcaagctttattgtgaagtggtatatcattaaagcattgagactattatgtgggtaga 18796705  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18796706 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatga 18796805  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796806 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 18796859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 421 - 773
Target Start/End: Original strand, 18619807 - 18620157
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18619807 aaggaatttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctataataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaattatgagac 18619906  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    || |||||||| ||||| | |||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||  | ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |     
T  18619907 cc-attaaacaaaaggatattattcttaaagtatctgtggtcaaactttattgtgaaaagggataatattaaagcatatagactattatgtgggtaggcc 18620005  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  18620006 gatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgaga 18620105  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18620106 atactacatagtaaaagttatg-aaagtgtcataagatattctcatggtgata 18620157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 777 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 21329829 - 21329646
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329829 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 21329730  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagag 962  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329729 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagag 21329646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 777 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 22791439 - 22791247
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22791439 attatacacatgatcattatcactgaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcatttgggtaacagtgatgtgttgctagatactgctcactgtt 22791340  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaata 971  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22791339 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaaagttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagataagagaaataaata 22791247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 41661898 - 41662096
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41661898 attatacatgtgatcattatcacggaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgtgtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 41661997  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41661998 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tataggat--cacacaaagggcagatagatgggagaaataaataagtaa 41662093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 453 - 774
Target Start/End: Original strand, 36270199 - 36270518
Alignment:
Q  453 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||  |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| || || |||||||| |||     
T  36270199 aaaataataaagtccctagaatagttagtttacttaaatgaaatgttaagtgtgacttaatcgtgagacatcattaaacacaatgacactattcttaaaa 36270298  T
Q  552 tatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaag 651  Q
     ||||||| |||||||||  || |||| | |||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||    
T  36270299 catccgtaatcaagctttagtgtgaagagggataacattaaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaag 36270398  T
Q  652 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtc 751  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||  ||| ||||| |||| |||    
T  36270399 agttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtc 36270495  T
Q  752 ataagatattctcatagtgataa 774  Q
    | |||  ||||||||||||||||    
T  36270496 acaagtcattctcatagtgataa 36270518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 484 - 774
Target Start/End: Original strand, 20977957 - 20978227
Alignment:
Q  484 gtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgaga 583  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  20977957 gtttaatggaacattaagaataatttaatcatgagatcccattaaaaataaggaaattattcttaaaacatccgtagtcaagctttaatgtgaagtgaga 20978056  T
Q  584 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 683  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  20978057 tatcactaaagcatagagactattatgtggatag-----------------acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattatt 20978139  T
Q  684 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || || |  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20978140 atgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--aaaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataa 20978227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 777 - 890
Target Start/End: Original strand, 18797132 - 18797245
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797132 attatacacatgagcattgtcacggaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcactgtt 18797231  T
Q  877 tataatattaaata 890  Q
    ||||||||||||||    
T  18797232 tataatattaaata 18797245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 788 - 979
Target Start/End: Original strand, 18620437 - 18620626
Alignment:
Q  788 gatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaa 887  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18620437 gatcattatcacgaaaatgtttcggcatatcacatgacgttctcgtcacttggataacagtgatgaatttctagataccgctcactatttataatattaa 18620536  T
Q  888 atatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18620537 atatgt-gatttaatattatttttaacgttataggaacc-tatagggtcacacacaaaggccatatagatgagagaaataaataagtaagac 18620626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 24249766 - 24249618
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24249766 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 24249668  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  24249667 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 24249618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 453 - 720
Target Start/End: Original strand, 18822115 - 18822384
Alignment:
Q  453 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaaca-ttaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 550  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  18822115 aaaataataaagtctatagaattgttagttcgtttaaatggaaaaattaagtgtggcttaatcgtgagacaccattaaacacaaggacactattcttaaa 18822214  T
Q  551 gtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 650  Q
      ||  ||| |||||||||  |  |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  18822215 acatatgtaatcaagctttagtttgaagtgggatatcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataag 18822314  T
Q  651 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18822315 gagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgaga 18822384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 781 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 24228967 - 24228799
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttata 880  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24228967 tacacatgagtattatcatggaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgcttactatttata 24228868  T
Q  881 atattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24228867 gcattaaatat-tagatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 24228799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 30174945 - 30175093
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30174945 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 30175043  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  30175044 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 30175093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 24250343 - 24250162
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24250343 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 24250245  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  24250244 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 24250162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 30174368 - 30174549
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30174368 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30174466  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  30174467 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 30174549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 582 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 22183527 - 22183392
Alignment:
Q  582 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 681  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183527 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaata 22183428  T
Q  682 ttaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22183427 ttaagagtaata-ttatattggattgacccgccatga 22183392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 781 - 916
Target Start/End: Original strand, 29801020 - 29801155
Alignment:
Q  781 tacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttat 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29801020 tacacatgaacattatcatggaaaaggtttcgtcagatcaattgacattcttgtcacttaggtagcagtgatgtgttgctagataccactcactgtttat 29801119  T
Q  880 aatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgt 916  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  29801120 aatattaaatat-aagatttaatattattgccaacgt 29801155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 425 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 19692737 - 19692598
Alignment:
Q  425 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| | ||    
T  19692737 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagcctgacttaatcatgagatctca 19692638  T
Q  525 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaa 564  Q
    ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  19692637 ttaaactaaaggaaattattcttaaagtatccttagtcaa 19692598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 539 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 18852146 - 18851977
Alignment:
Q  539 actattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacag 638  Q
    |||||||| |||||||  |||||| | |||| ||| |||||  |||| |||||||   || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |    
T  18852146 actattcttaaagtatatgtagtccaactttattgtgaagtaggataacattaaattgtatagactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacgg 18852047  T
Q  639 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 708  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18852046 atcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 806 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 15341729 - 15341623
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15341729 gtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcggtggtgtgttgctagataccgctcactatttataatattaaatatat-gatttaatatt 15341631  T
Q  906 attgccaa 913  Q
    ||||||||    
T  15341630 attgccaa 15341623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 24229526 - 24229345
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  24229526 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 24229428  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  24229427 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 24229345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 731
Target Start/End: Original strand, 19279445 - 19279600
Alignment:
Q  576 aagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagata 675  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19279445 aagtgggataactttaaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagata 19279544  T
Q  676 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatag 731  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||    
T  19279545 tagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 779 - 945
Target Start/End: Original strand, 36270788 - 36270951
Alignment:
Q  779 tatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgttta 878  Q
    |||||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36270788 tatacacaagatctttatcgtataaaggttt-gtcagatcacgtgacattctcgtcacttaagttacagtgatgtgttgctagatatcgctcactattta 36270886  T
Q  879 taatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  36270887 taatattaaatatgt-aatttaatattattgtcaacattacgagaacc-tacatggtcacacacaaa 36270951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 594 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991967
Alignment:
Q  594 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 691  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  692 tatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||| |||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattatg-taagtgacataaactattctcatagtgataa 6991967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 802 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 24763403 - 24763262
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24763403 aaaggtttcatcagatcatatgacattcgtgtcacttgaataacaatgatgtgttgctagatacggctcattgtttataatattaaatat-tagatttaa 24763305  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  24763304 tattattgccaacgtgactagaacc-taaggggtcacacacaaa 24763262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 802 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 20687146 - 20687057
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatat 891  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20687146 aaaggtttcgtaagatcacttgacattcttgtcatttgggtagcagtgaggtgttgctagatatcgctcactgtttatagtattaaatat 20687057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 806 - 914
Target Start/End: Original strand, 19617009 - 19617115
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |   | |||||||||    
T  19617009 gtttcgtcatatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaataatgtgttgctagataccgcttattgtttataatattaaattta--gttttaatatt 19617106  T
Q  906 attgccaac 914  Q
    |||||||||    
T  19617107 attgccaac 19617115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21330549 - 21330493
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330549 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 21330493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 777 - 891
Target Start/End: Original strand, 31848002 - 31848115
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31848002 attatacacatga-cattatcacataaaagttttgtcatgtcacttgacatcctcgtcacttggaaagtaatgatgtattgctagataccgctcactgtt 31848100  T
Q  877 tataatattaaatat 891  Q
    |||||| ||||||||    
T  31848101 tataatgttaaatat 31848115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 793 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 22183056 - 22182960
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaata 890  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22183056 ttatcacaaaaaggttt-gtaagatcacgtgacattcttgttacttgggtagcagtaatgtgttactagatacctctcattgtttataatattaaata 22182960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 605 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  605 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 703  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  704 attga 708  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 600 - 733
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800604
Alignment:
Q  600 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 696  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  697 atattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagta 29800604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 794 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 6991683 - 6991590
Alignment:
Q  794 tatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaa 887  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  6991683 tatcacggaaaagtttcgtcagatcatatgacattcttgtcacttaggtagtcgtgatgtgtttctagataccgctctctgtatgtaatattaa 6991590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 814 - 927
Target Start/End: Original strand, 12298416 - 12298528
Alignment:
Q  814 agatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaa 913  Q
    ||||||| | ||||||  ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  12298416 agatcacgtaacattcctgtcactaaggtagaagtgatgtgttgttagataccacttattgtttataatattaaatatgt-gatttaatatcattgtcaa 12298514  T
Q  914 cgttacgggaacct 927  Q
    ||||||| ||||||    
T  12298515 cgttacgagaacct 12298528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 667 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342142
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatagtctca 15342142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 775
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626921
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgct--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301064
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  774 atgat 778  Q
    |||||    
T  40301068 atgat 40301064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 599 - 775
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616607
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  699 attggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
      || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagt--attttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataat 19616607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 601 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  601 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 700  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  701 tggattga 708  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 676 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316411
Alignment:
Q  676 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 774  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataa 41316411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 777 - 838
Target Start/End: Original strand, 39338190 - 39338251
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcactt 838  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  39338190 attatacacatgatcattatcacatatatgtttcgtcggatcatatgacattatcgtcactt 39338251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 670 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  670 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 24763868 - 24763751
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  24763868 taaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagt 24763770  T
Q  690 aatatttatattggattga 708  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24763769 aatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12098654 - 12098609
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 635  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098654 taaaacatagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19692830 - 19692773
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  19692830 ttgttggagtaagccttaatagccaatctgtatttattaggtttggttttgtatcatg 19692773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 777 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 41315613 - 41315554
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcac-agaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtca 835  Q
    |||||||| |||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41315613 attatacatatgacctttatcacgaaaaaagtttcgtcagatcacatgacattctcgtca 41315554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 848 - 890
Target Start/End: Original strand, 41332825 - 41332867
Alignment:
Q  848 tgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaata 890  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  41332825 tgatgtgttgctagataccactcactatttataatatcaaata 41332867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 776
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241067
Alignment:
Q  743 aaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatg 17241067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7461
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7107 acaaggtatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatagaacattaagtataacttaattgtgag 7206  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7207 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 7306  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7307 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 7406  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7407 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 7733 - 7933
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7733 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 7832  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7833 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaa 7930  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  7931 gac 7933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 7014 - 7071
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7014 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgcatcatg 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 3)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 26197 - 25843
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26197 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccatttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26098  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgaaaagtgggatatcattaaagcatagcgactattatgtaggtaga 25998  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25997 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 25898  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 25843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 777 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 25571 - 25481
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccg 867  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25571 attatacatataatcattatcacataaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtcttgctagataccg 25481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26287 - 26231
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 382  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287 ttgttggaataagccctaatagtcaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 26231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 419 - 773
Target Start/End: Original strand, 993 - 1347
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  993 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgag 1092  T
Q  519 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 618  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 accccattaaacataaagaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 1192  T
Q  619 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatga 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1193 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatga 1292  T
Q  719 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1293 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgata 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 901 - 957
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  901 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 3)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 421 - 770
Target Start/End: Original strand, 5531 - 5881
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5531 aaggcatttctttattgatttatttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 5630  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 620  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5631 cccgttaaacataaggaaattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 5730  T
Q  621 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgaga 720  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5731 gatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtga 5830  T
Q  721 atactacatagtaaaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatagtg 770  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5831 atactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcatagtg 5881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Original strand, 6148 - 6348
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6148 attatacacatgatcattattacataaaggttttgccagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactatt 6247  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6248 tataatattaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaagacagatagatgagagaaataaataagtaa 6345  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  6346 gac 6348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 5435 - 5492
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5435 ttgttgaagtaagccctaatagccaatctatattgtttgggtttggctttgtatcatg 5492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 796 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 5783 - 5602
Alignment:
Q  796 tcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtgg 895  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5783 tcacataaaggtttcgtcatatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgt-g 5685  T
Q  896 atttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5684 atttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaagac 5602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 796 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 91
Alignment:
Q  796 tcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtgg 895  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  272 tcacataaaggtttcgtcatatcacatgacattctcgtcacttggttagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgt-g 174  T
Q  896 atttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  173 atttaatattattgccaacgttacgggaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataagtaagac 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 147; Significance: 6e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 777 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 229972 - 229772
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  229972 attatacacatgatcattatcacataaatgtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctggataccgctcactgtt 229873  T
Q  877 tataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaa 976  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  229872 tataatttgaaatatgt-gatttaatattattgtcaacgttacggcaacc-tatagggtcacacacaaaggacagatacatgagagaaataaataagtaa 229775  T
Q  977 gac 979  Q
    |||    
T  229774 gac 229772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 421 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 230545 - 230365
Alignment:
Q  421 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230545 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcttataatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 230446  T
Q  521 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagaga 602  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230445 ccc-ttaaacataaggaaaccattcttaaagtatttgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 230365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 650 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230244
Alignment:
Q  650 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  750 tcataagatattctcatagtgata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgata 230244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 230640 - 230584
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230640 tgttggagtaagcaataatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 230584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 752 - 900
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  752 gaaaggtttcgtaagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 850  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  851 atattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 174 - 355
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  174 taaagcgtcgagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 272  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  273 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 120298 - 120446
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  120298 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagccatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-tagattta 120396  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  120397 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 120446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 119721 - 119902
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  119721 taaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 119819  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  119820 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 119902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 87; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 951
Target Start/End: Original strand, 731 - 879
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  731 gaaaggattcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttataatattaaatat-cagattta 829  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  830 atattattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaagaacag 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 87; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Original strand, 8296 - 8477
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8296 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 8394  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  8395 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 8477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 83; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3805
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3986 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3888  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  3887 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 3805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 801 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 3409 - 3266
Alignment:
Q  801 gaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggattta 900  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  3409 gaaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatggtattaaatat-tagattta 3311  T
Q  901 atattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  3310 atatcattgccaacgtgactagaacc-taaagggtcacacacaaag 3266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 83; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 130535 - 130354
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  130535 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 130437  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  130436 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 130354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 802 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 12681 - 12567
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12681 aaaggtttcgtcagatcacttgacattcttgtcacttggttagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaa 12583  T
Q  902 tattattgccaacgtt 917  Q
    ||||||||||||||||    
T  12582 tattattgccaacgtt 12567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 13260 - 13079
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13260 taaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 13162  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13161 aatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcataatgataat 13079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 599 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 40117
Alignment:
Q  599 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 698  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  699 attggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |  ||||||| ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatg 40117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 806 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 39715 - 39578
Alignment:
Q  806 gtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatatt 905  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  39715 gtttcatcagatcacttgacattcttgtcacttgggtagcaatgttgtgttgttagatactgctcgttgtttataatattaaatat-tacatttaatatt 39617  T
Q  906 attgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  39616 attgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaa 39578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 802 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 67140 - 66993
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  67140 aaaggttttttcagatcacttgacattcttttcacttgggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaa 67042  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  67041 tattattgtcaacgtgactagaacc-tataggatcacacacaaagaacag 66993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 590 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 67685 - 67504
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  67685 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 67587  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  67586 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataat 67504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 73; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 802 - 946
Target Start/End: Original strand, 54333 - 54475
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||||||     
T  54333 aaaggtttcgtcagttcacttgacattcttgtcatttaggtagcaatgatgtgttgctagataccgctcattgtttatagtattgaatat-tagatttag 54431  T
Q  902 tattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaag 946  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  54432 tattattgccaacgtgactagaa-cttatagggtcacacacaaag 54475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 600 - 765
Target Start/End: Original strand, 53766 - 53927
Alignment:
Q  600 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 699  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  700 ttggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 765  Q
     ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctca 53927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1303 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1303
Description:

Target: scaffold1303; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 882 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 1438 - 1343
Alignment:
Q  882 tattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacagatagatgagagaaataaataggtaagac 979  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1438 tattaaatacgtg-atttaatattattgccaacgttacgagaacct-atagggtcacacacaaatgacagatagatgagagaaataaataagtaagac 1343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 90154 - 90033
Alignment:
Q  588 attaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat-aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagg 686  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  90154 attaaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacg 90055  T
Q  687 agtaatatttatattggattga 708  Q
      ||| ||||||||||||||||    
T  90054 tataacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 667 - 775
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26714
Alignment:
Q  667 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 766  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  767 agtgataat 775  Q
    |||||||||    
T  26706 agtgataat 26714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 822 - 945
Target Start/End: Original strand, 27132 - 27253
Alignment:
Q  822 tgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgg 921  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||      
T  27132 tgacactcttgtcacttggttagcaatgatgtgttgctagatacctctcattgtttataatattaaatat-tatatttaatattattgccaacgtgacta 27230  T
Q  922 gaaccttatagggtcacacacaaa 945  Q
     |||| ||| ||||||||||||||    
T  27231 aaacc-tatggggtcacacacaaa 27253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 419 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8446
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 483  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 8446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8603 - 8546
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8603 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggttcggctttgtatcatg 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23826 - 23769
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23826 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 16522 - 16579
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16522 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttatatcatg 16579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 452
Target Start/End: Original strand, 16615 - 16648
Alignment:
Q  419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttc 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16615 acaaggcatttctttattgattttgttttgnttc 16648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 590 - 776
Target Start/End: Original strand, 8722 - 8904
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 689  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||| |||  |   ||||  | ||||||||||||||    
T  8722 taaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatgatcacgtctcacatgtcatagatat-gagatattaaggatatgcatatgtgtaaatattaggagt 8820  T
Q  690 aatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8821 aatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagt--atgttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataatg 8904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 802 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 108855 - 108742
Alignment:
Q  802 aaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaa 901  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||| |  | |||||||    
T  108855 aaaggtttcctcggatcacttgacattcttgttacttgggtagcagtgatgtgtttctagatactgctcattcattataatattaaaga-atagatttaa 108757  T
Q  902 tattattgccaacgt 916  Q
    |||||||| ||||||    
T  108756 tattattgtcaacgt 108742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 860 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 8188 - 8099
Alignment:
Q  860 agataccgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8188 agataccgctcattgtttataatattaaatat-cagatttaatattattgccaacgtgactagaacc-tatagggtcacacacaaagaacag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 777 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 81563 - 81476
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagata 864  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||    
T  81563 attataaacatgatcgttatcacggaaaagtttcgttagatcacatgacattctcgtcacttgggtgacaatgacgtattgctagata 81476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83151
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagt 769  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| |||||||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagt 83151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 98 - 41
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  98 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 8944 - 9000
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8944 tgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 9000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 890
Target Start/End: Original strand, 24424 - 24511
Alignment:
Q  803 aaggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgggtagcagtgatgtgttgctagataccgctcactgtttataatattaaata 890  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24424 aaggtttcgtcaaatcacttgctatccttgtcacttgggtaacagtgacgtgttgctagatacccctcagtgtttataatattgaata 24511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 674 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11699
Alignment:
Q  674 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagta 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagta 11699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 864 - 951
Target Start/End: Original strand, 128128 - 128213
Alignment:
Q  864 accgctcactgtttataatattaaatatgtggatttaatattattgccaacgttacgggaaccttatagggtcacacacaaaggacag 951  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  128128 accgctcattgtttatagtattaaatat-tagatttaatattattgtcaacgtgactagaacct-atagggtcacacacaaagaacag 128213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10256 - 10202
Alignment:
Q  329 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 383  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10256 ttggagtaagctctaatagccaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 10202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10158 - 10127
Alignment:
Q  438 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10158 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 729
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  638 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacat 729  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37 - 1
Alignment:
Q  327 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 776
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11415
Alignment:
Q  686 gagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatg 776  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatg 11415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 793 - 917
Target Start/End: Original strand, 9701 - 9830
Alignment:
Q  793 ttatcacagaaaggttt-cgtcagatca-catgacattctcgtcactt-gggtagcagtgatgtgtt-gct-agataccgctcact-gtttataatatta 886  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||  |||||    
T  9701 ttatcatagaaaggttttcgtcagatcaacttgacattcttgtcactttgggtagcaatgatgtgtttgcttagataccgctcatttgtttatggtatta 9800  T
Q  887 aatatgtggatttaatattattgccaacgtt 917  Q
     |||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  9801 gatat-tagatttaatatcattgccaacgtt 9830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 684
Target Start/End: Original strand, 92194 - 92432
Alignment:
Q  448 gtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattct 546  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||  | |  | ||||||    
T  92194 gttttaaagtaataaagtctctagaatatctagttattttaaatggaacattaagtataacttaatcgtgagacagcaataaacagcaaggcattattct 92293  T
Q  547 caaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcatt-aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 645  Q
     |||  || ||||||||||||||  || | || | |||| | || ||| | |||| |||||||| | | |||||||||||| |||| ||||   ||||||    
T  92294 taaaacattcgtagtcaagctttagtgtggagagggataactttaaaatcttagaaactattatatggctagactgatgattacatgtcacgagtcatgg 92393  T
Q  646 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 684  Q
    |||| || |||||||||| || || | ||||||||||||    
T  92394 ataaggaattatcaagtcatcgcacatatataaatatta 92432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 379
Target Start/End: Original strand, 5877 - 5930
Alignment:
Q  326 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 379  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5877 ttgttggagtaagtcataatagccaatctatattgattgagtttgactttgtat 5930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 777 - 840
Target Start/End: Original strand, 15735 - 15799
Alignment:
Q  777 attatacacatgatcattatcacagaaa-ggtttcgtcagatcacatgacattctcgtcacttgg 840  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15735 attatacacatgattgttatcacggaaaaggtttcgttagatcacatcacattcttgtcacttgg 15799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 710 - 775
Target Start/End: Original strand, 96 - 158
Alignment:
Q  710 ccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataat 775  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  96 ccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataat 158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15134 - 15089
Alignment:
Q  590 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 635  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15134 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University