View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4868-Insertion-7 (Length: 1001)
Name: NF4868-Insertion-7
Description: NF4868
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4868-Insertion-7 |
 | |
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| [»] chr4 (1 HSPs) |
| |
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| [»] chr8 (4 HSPs) |
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| [»] chr5 (1 HSPs) |
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| [»] chr7 (1 HSPs) |
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Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 914; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 914; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 3945534 - 3944540
Alignment:
| Q |
6 |
cacaattgattcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
105 |
Q |
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| T |
3945534 |
cacaattggttcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
3945435 |
T |
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| Q |
106 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
205 |
Q |
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| T |
3945434 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
3945335 |
T |
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| Q |
206 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
305 |
Q |
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| T |
3945334 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttactatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
3945235 |
T |
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| Q |
306 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
405 |
Q |
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| T |
3945234 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
3945135 |
T |
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| Q |
406 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
505 |
Q |
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| T |
3945134 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
3945035 |
T |
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| Q |
506 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
605 |
Q |
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| T |
3945034 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
3944935 |
T |
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| Q |
606 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctccaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
705 |
Q |
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| T |
3944934 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctccaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
3944835 |
T |
|
| Q |
706 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacacaaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
805 |
Q |
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|
| T |
3944834 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattttttaacataaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
3944735 |
T |
|
| Q |
806 |
aatgtgagtcaattctactgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaagggttttatggagcctatacacactgtcttcataaccctgcaaca |
905 |
Q |
| |
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| T |
3944734 |
aatgtgagtcaattctactgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaa-ggctttatgaagcctatacacactgtcttcataa-cctgcaaca |
3944637 |
T |
|
| Q |
906 |
ataaaaccagcagg-tggtcaacataagtttcctcctccaggattccatttaagaatggcgatttgacttccaactgaaaagatc-tccatccacatt |
1001 |
Q |
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| T |
3944636 |
ataaaaccagcaggttgttcaacataaatttcctcctccaggattccatttaagaatgccgatttgacatccaaatg-aaagatcttccatccacatt |
3944540 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 898; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 898; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 30049280 - 30048286
Alignment:
| Q |
6 |
cacaattgattcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
105 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30049280 |
cacaattggttcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
30049181 |
T |
|
| Q |
106 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30049180 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
30049081 |
T |
|
| Q |
206 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30049080 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
30048981 |
T |
|
| Q |
306 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
405 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30048980 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
30048881 |
T |
|
| Q |
406 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
505 |
Q |
| |
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|
| T |
30048880 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
30048781 |
T |
|
| Q |
506 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30048780 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
30048681 |
T |
|
| Q |
606 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctccaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
705 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30048680 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctgcaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
30048581 |
T |
|
| Q |
706 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacacaaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
805 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30048580 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacataaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
30048481 |
T |
|
| Q |
806 |
aatgtgagtcaattctactgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaagggttttatggagcctatacacactgtcttcataaccctgcaaca |
905 |
Q |
| |
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|
| T |
30048480 |
aatgtgagtcaattctgctgtaccaggctctaggcgcctgttttagcccatacaa-ggctttgtgaagcctataaacactgtcttcatga-cctgcaaca |
30048383 |
T |
|
| Q |
906 |
ataaaaccagcagg-tggtcaacataagtttcctcctccaggattccatttaagaatggcgatttgacttccaactgaaaagatc-tccatccacatt |
1001 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30048382 |
ataaaaccagcaggttgttcaacataaatttcctcctccaggattccatttaagaatgccgatttgacatccaaatg-aaagatcttccatccacatt |
30048286 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 713; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 7161549 - 7160643
Alignment:
| Q |
78 |
agctgcagcagcaatatactcagcttcagctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaaca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7161549 |
agctgcagcagcaatatactcagcttcagctgaggattgagcaaccacgtcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaaca |
7161450 |
T |
|
| Q |
178 |
taaccacttgtgcttttagaatcatcaatagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaat |
277 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7161449 |
taaccacttgtgcttttagaatcatcaaccgatccagcccaat----------------ttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaat |
7161366 |
T |
|
| Q |
278 |
cagtagtacctcttatgtacctcaacactcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacat |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7161365 |
cagtagtacctcttatgtacctcaacactcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaaccttgaaagcaaactagtagagaacat |
7161266 |
T |
|
| Q |
378 |
caaatctggtctagttgcagtcaagtaaagaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttt |
477 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7161265 |
caaatctagtctagttgcagtcaagtaaagaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagatttcgagagtttt |
7161166 |
T |
|
| Q |
478 |
tcatttacagcaagaggtgttgaaacagatttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccat |
577 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7161165 |
tcatttacagcaagaggtgttgaaacagacttacaactctccaatttgaattttttcagaacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccat |
7161066 |
T |
|
| Q |
578 |
catcaagctgatgcaattccattcccaaaaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctccaacatgctcttcttaaacttgttaatctc |
677 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7161065 |
catcaagttgatgcaattccattcccaaaaaatacttcatcaatcccagcaccgtcatttcaaggacctgcaacatgctcttcttaaacttgttattctc |
7160966 |
T |
|
| Q |
678 |
atcaatgtcattaccggtaatcaacaagtcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacacaaagtgtaggctcattt |
777 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7160965 |
atcaatgtcattaccggtaatcaacaagtcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacaatctttaacataaagtgtaggctcattt |
7160866 |
T |
|
| Q |
778 |
tgactcctcctgaaatcattttgcagaaaatgtgagtcaattctactgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaagggttttatggagccta |
877 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |
|
|
| T |
7160865 |
tgactcctcctgaaatcattttgcagaaaatgtgagtcaattctgatgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaa-ggctttatgaagccta |
7160767 |
T |
|
| Q |
878 |
tacacactgtcttcataaccctgcaacaataaaaccagcagg-tggtcaacataagtttcctcctccaggattccatttaagaatggcgatttgacttcc |
976 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
7160766 |
taaacattgtcttcatga-cctgcaacaataaaaccggcaggttgttcaacataaatttcctcctccaggattccatttaagaatgccgatttgacatcc |
7160668 |
T |
|
| Q |
977 |
aactgaaaagatc-tccatccacatt |
1001 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7160667 |
aaatg-aaagatcttccatccacatt |
7160643 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7162233 - 7162157
Alignment:
| Q |
6 |
cacaattgattcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctg |
82 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7162233 |
cacaattggttcctcttgtatatgattcagatcactcaataccattttgatccaaatagcttgatttgatgcagctg |
7162157 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18014651 - 18014622
Alignment:
| Q |
199 |
tcatcaatagatccagcccaatcactatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18014651 |
tcatcaatagatccagcccaatcactatca |
18014622 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 898; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 898; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 1001
Target Start/End: Original strand, 196735 - 197729
Alignment:
| Q |
6 |
cacaattgattcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
196735 |
cacaattggttcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
196834 |
T |
|
| Q |
106 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
196835 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
196934 |
T |
|
| Q |
206 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
196935 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
197034 |
T |
|
| Q |
306 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197035 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
197134 |
T |
|
| Q |
406 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
505 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197135 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
197234 |
T |
|
| Q |
506 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197235 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
197334 |
T |
|
| Q |
606 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctccaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
705 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197335 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctgcaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
197434 |
T |
|
| Q |
706 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacacaaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
805 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197435 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacataaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
197534 |
T |
|
| Q |
806 |
aatgtgagtcaattctactgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaagggttttatggagcctatacacactgtcttcataaccctgcaaca |
905 |
Q |
| |
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| T |
197535 |
aatgtgagtcaattctgctgtaccaggctctaggcgcctgttttagcccatacaa-ggctttgtgaagcctataaacactgtcttcatga-cctgcaaca |
197632 |
T |
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| Q |
906 |
ataaaaccagcagg-tggtcaacataagtttcctcctccaggattccatttaagaatggcgatttgacttccaactgaaaagatc-tccatccacatt |
1001 |
Q |
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| T |
197633 |
ataaaaccagcaggttgttcaacataaatttcctcctccaggattccatttaagaatgccgatttgacatccaaatg-aaagatcttccatccacatt |
197729 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 878; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 878; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 1001
Target Start/End: Original strand, 39949896 - 39950890
Alignment:
| Q |
6 |
cacaattgattcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
105 |
Q |
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| T |
39949896 |
cacaattggttcctcttgtacatgattcagatcgctcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
39949995 |
T |
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| Q |
106 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
205 |
Q |
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| T |
39949996 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
39950095 |
T |
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| Q |
206 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
305 |
Q |
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| T |
39950096 |
cagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
39950195 |
T |
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| Q |
306 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
405 |
Q |
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| T |
39950196 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
39950295 |
T |
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| Q |
406 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
505 |
Q |
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| T |
39950296 |
agaagacaacctatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
39950395 |
T |
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| Q |
506 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
605 |
Q |
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| T |
39950396 |
atttacaactctccaatttgaattttttaagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
39950495 |
T |
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| Q |
606 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctccaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
705 |
Q |
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| T |
39950496 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctgcaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcgatgtcattaccggtaatcaacaag |
39950595 |
T |
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| Q |
706 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacacaaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
805 |
Q |
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| T |
39950596 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacataaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
39950695 |
T |
|
| Q |
806 |
aatgtgagtcaattctactgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaagggttttatggagcctatacacactgtcttcataaccctgcaaca |
905 |
Q |
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| T |
39950696 |
aatgtgagtcaattctgctgtaccaggctctaggcgcctgttttagcccatacaa-ggctttgtgaagcctataaacactgtcttcatga-cctgcaaca |
39950793 |
T |
|
| Q |
906 |
ataaaaccagcagg-tggtcaacataagtttcctcctccaggattccatttaagaatggcgatttgacttccaactgaaaagatc-tccatccacatt |
1001 |
Q |
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| T |
39950794 |
ataaaaccagcaggttgttcaacataaatttcctcctccaggattccatttaagaatgccgatttgacatccaaatg-aaagatcttccatccacatt |
39950890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 868; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 868; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 22365162 - 22364185
Alignment:
| Q |
6 |
cacaattgattcctcttgtacatgattcagatcactcaatacctttttgatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
105 |
Q |
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| T |
22365162 |
cacaattggttcctcttgtacatgattcagatcactcaataccttttttatccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttca |
22365063 |
T |
|
| Q |
106 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
205 |
Q |
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| T |
22365062 |
gctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaatacaccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaa |
22364963 |
T |
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| Q |
206 |
tagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
305 |
Q |
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| T |
22364962 |
cagatccagcccaatcactatcaacaaagccttcaatcttaccatcacctttgttgtaccaaataccaaaatcagtagtacctcttatgtacctcaacac |
22364863 |
T |
|
| Q |
306 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaacctagaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
405 |
Q |
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| T |
22364862 |
tcttttgcccacacctaagtgtgttacacttggtgaatgcatgaaccttgaaagcaaactagcagagaacatcaaatctggtctagttgcagtcaagtaa |
22364763 |
T |
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| Q |
406 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
505 |
Q |
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| T |
22364762 |
agaagacaaccaatcaaactcctatattgagtaacatctgccttagcatctccatcagattttgagagtttttcatttacagcaagaggtgttgaaacag |
22364663 |
T |
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| Q |
506 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagctgatgcaattccattcccaa |
605 |
Q |
| |
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| T |
22364662 |
atttacaactctccaatttgaattttttcagcacatcattagcatatttcttttgtgaaagaaatattccatcatcaagttgatgcaattccattcccaa |
22364563 |
T |
|
| Q |
606 |
aaaatacttcatcaatcccaggtccgtcatttcaaagacctccaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
705 |
Q |
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| T |
22364562 |
aaaatacttcatcaatcccagatccgtcatttcaaagacctgcaacatgctcttcttaaacttgttaatctcatcaatgtcattaccggtaatcaacaag |
22364463 |
T |
|
| Q |
706 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacattctttaacacaaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
805 |
Q |
| |
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| T |
22364462 |
tcatcaacataaagagaaactataatcctcttcccattgccacaatctttaacataaagtgtaggctcattttgactcctcctgaaatcattttgcagaa |
22364363 |
T |
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| Q |
806 |
aatgtgagtcaattctactgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaagggttttatggagcctatacacactgtcttcataaccctgcaaca |
905 |
Q |
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| T |
22364362 |
aatgtgagtcaattctgctgtaccaggctctaggcgcctgtttcagcccatacaa-ggctttgtgaagcctataaacactgtcttcatga-tctgcaaca |
22364265 |
T |
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| Q |
906 |
ataaaaccagcagg-tggtcaacataagtttcctcctccaggattccatttaagaatggcgatttgacttccaactgaaa |
984 |
Q |
| |
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| T |
22364264 |
ataaaatcagcaggttgttcaacataaatttcctcctccaggattccatttaagaatgccgatttgacatccaaatgaaa |
22364185 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22135112 - 22134942
Alignment:
| Q |
57 |
ccaaatagcttgatttgatgcagctgcagcagcaatatactcagcttcagctgaggattgagcaaccacatcttgttttttggaattccatgaaaataca |
156 |
Q |
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| T |
22135112 |
ccaaatagcttggtttgcagcagctgctgctgaaatatattcagcctctgccgtagattgagctacaatctcctgtttctttgacttccaagagaaaata |
22135013 |
T |
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| Q |
157 |
ccactaccaagtgaaaaaacataaccacttgtgcttttagaatcatcaatagatccagcccaatcactatc |
227 |
Q |
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| T |
22135012 |
ccattgccaaatgaaaaaacataaccagaagtgctcttggaatcatcaacacttccagcccaatcactatc |
22134942 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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