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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4881_high_1 (Length: 518)
Name: NF4881_high_1
Description: NF4881
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4881_high_1 |
 | |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0277 (4 HSPs) |
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| [»] scaffold0419 (2 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0349 (4 HSPs) |
| | |
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Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27604687 - 27604199
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
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| T |
27604687 |
aaggtagttacggtcaagcattggctgagcataaaaaaaggtttcaaaatgatgaggataacataaagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
27604588 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
202 |
Q |
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| T |
27604587 |
ggctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctgggtactcaacactacataaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
27604488 |
T |
|
| Q |
203 |
gcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaa |
301 |
Q |
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| T |
27604487 |
acccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaacaagtattagttatttatatgtcaaaatagttagaaa |
27604388 |
T |
|
| Q |
302 |
tgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgga |
401 |
Q |
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|
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| T |
27604387 |
tgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattatgatgttgttacatactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattgga |
27604288 |
T |
|
| Q |
402 |
gagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
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| T |
27604287 |
aagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaaca |
27604199 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 488
Target Start/End: Original strand, 26802650 - 26803131
Alignment:
| Q |
6 |
gtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgc |
105 |
Q |
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| T |
26802650 |
gtagctatggtgaagcattggctgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaagtggctctgagccaggc |
26802749 |
T |
|
| Q |
106 |
tgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattgcc |
205 |
Q |
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| T |
26802750 |
tgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttatattttatttcttcaacttcaatttcc |
26802849 |
T |
|
| Q |
206 |
caataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgt |
304 |
Q |
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| T |
26802850 |
caataatctcatcttaaaggttaaatggg---aaatacctttcttatatacgtttttaaacaagtattagttatttatatgttgaaatagttagaaatgt |
26802946 |
T |
|
| Q |
305 |
ataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgt---tacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgga |
401 |
Q |
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|
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| T |
26802947 |
ataatatattatgag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagtacatactaacttatcttgttggacatgaatagatatgaatacaagttgattgga |
26803044 |
T |
|
| Q |
402 |
gagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaa |
488 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26803045 |
gagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaa |
26803131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27593002 - 27592516
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27593002 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatggaaagacgctctgagcca |
27592903 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
202 |
Q |
| |
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| T |
27592902 |
ggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaatt |
27592803 |
T |
|
| Q |
203 |
gcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttac-gtttttaaaaag---tattagttatttatatgtcacaatagttag |
298 |
Q |
| |
|
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| T |
27592802 |
ttacaataatctcatcttaaaggttaaaaggg---aaataccttttttatatacagttttaaacaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttag |
27592706 |
T |
|
| Q |
299 |
aaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttatt |
398 |
Q |
| |
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|
| T |
27592705 |
aaatgtataatacattcttag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagacactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttatt |
27592608 |
T |
|
| Q |
399 |
ggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
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||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27592607 |
ggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
27592516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Original strand, 27679151 - 27679637
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
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| T |
27679151 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcaaggatggaaaaaggctctgagcca |
27679250 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
202 |
Q |
| |
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|
| T |
27679251 |
ggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaatt |
27679350 |
T |
|
| Q |
203 |
gcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttac-gtttttaaaaag---tattagttatttatatgtcacaatagttag |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
27679351 |
ttacaataatctcatcttaaaggttaaaaggg---aaataccttttttatatacagttttaaacaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttag |
27679447 |
T |
|
| Q |
299 |
aaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttatt |
398 |
Q |
| |
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|
| T |
27679448 |
aaatgtataatacattcttag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagacactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttatt |
27679545 |
T |
|
| Q |
399 |
ggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
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||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
27679546 |
ggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
27679637 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27677596 - 27677115
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27677596 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaagcatggagaggttgcagggatggaaagaggctctgagcca |
27677497 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
202 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27677496 |
ggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaatt |
27677397 |
T |
|
| Q |
203 |
gcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaaa--agtattagttatttatatgtcacaatagttagaa |
300 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
27677396 |
tcacaataatctcatcttaaaggttaaaaggg---aaataccttttttatatacagttttaaaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttagaa |
27677300 |
T |
|
| Q |
301 |
atgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgg |
400 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27677299 |
atgtataatacatt---ag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagacactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattgg |
27677205 |
T |
|
| Q |
401 |
agagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
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| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
27677204 |
aaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
27677115 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27706384 - 27705899
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27706384 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatggaaagaggctctgagcca |
27706285 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
27706284 |
ggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttatttcttcaacttcaatt |
27706185 |
T |
|
| Q |
203 |
gcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttac-gtttttaaaaag---tattagttatttatatgtcacaatagttag |
298 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27706184 |
tcacaataatctcatcttaaagtttaaagg----gaaataccttttttatatacagttttaaacaagtactattagttatttatatgtcgaaatagttag |
27706089 |
T |
|
| Q |
299 |
aaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttatt |
398 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27706088 |
aaatgaataatacattcttag--tacatggatgtgattgggatgttgttagacactaacttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttatt |
27705991 |
T |
|
| Q |
399 |
ggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27705990 |
ggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
27705899 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27427587 - 27427107
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27427587 |
aggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacgaaaaacatggagaggttgcagcaatggaaagtggctctgagtctg |
27427488 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattg |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| | || | ||||| | |||||||| |||| |||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
27427487 |
gctgctaacttgcccagctaccatgatgatagtcatgggtacgcctatttacttaattcctgttttgct-ttttgcatttaatttatttaatttctattc |
27427389 |
T |
|
| Q |
204 |
cccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaat |
302 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| || ||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
27427388 |
ctcaatac---catcttaaagcctaaatgtgt---aacaccttttttatttatgtttttaaacaattgttagttatttatatgtcaaaatagttaaaaat |
27427295 |
T |
|
| Q |
303 |
gtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtg--acgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgg |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
27427294 |
gtataatatattatgagt--acatggatgtgattgtgtgatgttgttacatactaacttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattgg |
27427197 |
T |
|
| Q |
401 |
agagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27427196 |
aaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
27427107 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 242 - 490
Target Start/End: Original strand, 28786677 - 28786925
Alignment:
| Q |
242 |
accttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtg |
339 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28786677 |
accttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtg |
28786774 |
T |
|
| Q |
340 |
acgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtca |
439 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28786775 |
atgttgttacatactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtca |
28786874 |
T |
|
| Q |
440 |
gcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28786875 |
gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
28786925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 242 - 490
Target Start/End: Original strand, 28792798 - 28793046
Alignment:
| Q |
242 |
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339 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28792798 |
accttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtg |
28792895 |
T |
|
| Q |
340 |
acgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtca |
439 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28792896 |
atgttgttacatactaacttatcttatcggacattaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtca |
28792995 |
T |
|
| Q |
440 |
gcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28792996 |
gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
28793046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 245 - 490
Target Start/End: Original strand, 28781543 - 28781788
Alignment:
| Q |
245 |
ttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacg |
342 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28781543 |
ttttctatttacgtttttaaacaattatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatg |
28781640 |
T |
|
| Q |
343 |
ttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcc |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28781641 |
ttgttacatactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagca |
28781740 |
T |
|
| Q |
443 |
cttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28781741 |
cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaaca |
28781788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 268 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27698301 - 27698083
Alignment:
| Q |
268 |
gtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttatt |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
27698301 |
gtattagttatttatatgtcgaaatagttagaaatttataatatattctgagt--acatagatgtgattgtgatgttgtttcatactaacttttcttact |
27698204 |
T |
|
| Q |
368 |
ggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgtt |
467 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27698203 |
cgacacgagtagatatgaatacaagtttattgaagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgtt |
27698104 |
T |
|
| Q |
468 |
ggattgcagtctcgagtacaa |
488 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27698103 |
ggattacagtctcaagtacaa |
27698083 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27698476 - 27698297
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27698476 |
aaggtagttatggcaaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatggaaagaggctctgagcca |
27698377 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtatt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27698376 |
ggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcccaggtacccaactttacttaaatcctatatttcccttttgtatt |
27698297 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27718361 - 27718219
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27718361 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
27718262 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27718261 |
ggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtac |
27718219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27610984 - 27610842
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27610984 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcagggatggaaagtggctctgagcca |
27610885 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac |
145 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27610884 |
ggctgcaaacttttccggctaccatgatagtcctcctgggtac |
27610842 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 328 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27718156 - 27717994
Alignment:
| Q |
328 |
gatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaa |
427 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
27718156 |
gatgtgattgtgatgttgtcacatactaacttatcttactggacatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaa |
27718057 |
T |
|
| Q |
428 |
gattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27718056 |
gaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
27717994 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 323 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27610782 - 27610617
Alignment:
| Q |
323 |
acatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctcc |
422 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
27610782 |
acatggatgtgattgtgatgttgtcacatactaacttatcttattgggcatgaatagatatgaatacgagtttactggagagatagtcaaatacatctcc |
27610683 |
T |
|
| Q |
423 |
aacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaa |
488 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27610682 |
aacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaa |
27610617 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 350 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27530936 - 27530794
Alignment:
| Q |
350 |
atactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacat |
449 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
27530936 |
atactaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagtttattggaaagatagtcgaagacatttccaacaggattagtcgtgagcccttagat |
27530837 |
T |
|
| Q |
450 |
gttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacatg |
492 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27530836 |
gttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatg |
27530794 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 28786484 - 28786616
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
28786484 |
aggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaa |
28786583 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcct |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28786584 |
gctgctaacttgtccggctaccattctagtcct |
28786616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 28792605 - 28792737
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
28792605 |
aggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaa |
28792704 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcct |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28792705 |
gctgctaacttgtccggctaccattctagtcct |
28792737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 26884371 - 26884580
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
26884371 |
aggtagttatggtgaagcattggctgaccatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcagcgatggaaaatggctatgaggcaa |
26884470 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttc-aatt |
202 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||| || | |||| | || ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
26884471 |
gttgctaacttgtccggctaccattttag---tcttgggtatcccactttacttaaatcatattttccttttttatattttctttctttaatttcaaatt |
26884567 |
T |
|
| Q |
203 |
gcccaataatctc |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
26884568 |
ccccaataatctc |
26884580 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 28781351 - 28781477
Alignment:
| Q |
10 |
ttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgct |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
28781351 |
ttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgct |
28781450 |
T |
|
| Q |
110 |
aacttttccggctaccatgatagtcct |
136 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28781451 |
aacttgtccggctaccattctagtcct |
28781477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 26861819 - 26861951
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
26861819 |
aggtatttatggtgaagcattggctaagcatgaaaaaaggtttcaaaatgatatggataacatggagaggttgcagagatggaaagttgctctgaaccaa |
26861918 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcct |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26861919 |
gctgctaacttgtcaggctaccattttagtcct |
26861951 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 430
Target Start/End: Original strand, 26646728 - 26647106
Alignment:
| Q |
47 |
caaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtact |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| ||| | ||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
26646728 |
caaaataacaagaaaaacaaggaacgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatagtcctg---ggtacc |
26646824 |
T |
|
| Q |
147 |
caacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagat-caaatacct |
245 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| || ||| |||||| || || ||| |
|
|
| T |
26646825 |
ccactttacttaaaccttgtttttcctttttatattttctttatttaattttttttccacaa-aatctcatcttaaagcttaaataggaaacacata--- |
26646920 |
T |
|
| Q |
246 |
tttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgtt |
344 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
26646921 |
tttttattaatgtttttaaacaagtataaattatttatatgtcaaaagagttagaactgtataatatattctcggt--acatcaatgtatttgtgatgtt |
26647018 |
T |
|
| Q |
345 |
gttacat--actaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagat |
430 |
Q |
| |
|
| | ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26647019 |
ggtgcatgtactaacttatcttgtgggacatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagat |
26647106 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 430
Target Start/End: Original strand, 26752696 - 26753074
Alignment:
| Q |
47 |
caaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtact |
146 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| ||| | ||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
26752696 |
caaaataacaagaaaaacaaggaacgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatagtcctg---ggtacc |
26752792 |
T |
|
| Q |
147 |
caacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagat-caaatacct |
245 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| || ||| |||||| || || ||| |
|
|
| T |
26752793 |
ccactttacttaaaccttgtttttcctttttatattttctttatttaattttttttccacaa-aatctcatcttaaagcttaaataggaaacacata--- |
26752888 |
T |
|
| Q |
246 |
tttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgtt |
344 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
26752889 |
tttttattaatgtttttaaacaagtataaattatttatatgtcaaaagagttagaactgtataatatattctcggt--acatcaatgtatttgtgatgtt |
26752986 |
T |
|
| Q |
345 |
gttacat--actaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagat |
430 |
Q |
| |
|
| | ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26752987 |
ggtgcatgtactaacttatcttgtgggacatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagat |
26753074 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27531178 - 27530983
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27531178 |
aggtagatatggtgaagcattagctgtgcataaaaaaaagtttcaaaatgataaggataacactgagaggttgcagcaatggaaagaagctctgagccaa |
27531079 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaatt |
202 |
Q |
| |
|
|| |||||||| || ||| | ||| ||| | | |||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27531078 |
gcggctaacttgtctggccagcattata---aacatgggtagcccactttacttaaatcctatttttcccttttatattttctttctttaatttcaatt |
27530983 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 427
Target Start/End: Original strand, 25538773 - 25539167
Alignment:
| Q |
31 |
gcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgat |
130 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| | |||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
25538773 |
gcatgaagagaggtttcaaaataatgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattat |
25538872 |
T |
|
| Q |
131 |
agtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaa |
230 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| | || ||||||||||| | ||||||| || | |||||| ||| | ||||| || | |||||||| | || || ||||| |
|
|
| T |
25538873 |
agtcctcatgggtaccccactttacttaaatcttgtttttcctttctatattttatttcattaatttttatgcctaaataatctactcttaaaacttaaa |
25538972 |
T |
|
| Q |
231 |
tgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaaa--agtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatgg |
328 |
Q |
| |
|
| || || || ||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| | | |||||| |
|
|
| T |
25538973 |
taggaacacat----tttctattaatgtttttaaaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaaattagaattgcataatatattctcaat--acatgg |
25539066 |
T |
|
| Q |
329 |
atgtgattgtgacgttg--ttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaaca |
426 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
25539067 |
atgtgattttgattttagtttatgttctaacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaaca |
25539166 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 490
Target Start/End: Original strand, 31285126 - 31285246
Alignment:
| Q |
370 |
acatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttgg |
469 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31285126 |
acatgaacagatatgaatatgattttattggagacatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgccaattaccctgttgg |
31285225 |
T |
|
| Q |
470 |
attgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
31285226 |
atttaagtttcgaatacaaca |
31285246 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 427
Target Start/End: Original strand, 25579952 - 25580346
Alignment:
| Q |
31 |
gcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgat |
130 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| | |||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
25579952 |
gcatgaagagaggtttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttacccaagctgctaacttgtccggctatcattat |
25580051 |
T |
|
| Q |
131 |
agtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaa |
230 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| | || ||||||||| | | ||||||| || | |||||| ||| || |||| || | ||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
25580052 |
agtcctcatgggtaccccactttacttaaaacttctttttcctttctatattttatttctttaattgttatgcctcaataatctaatcttcaagcttaaa |
25580151 |
T |
|
| Q |
231 |
tgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaaa--agtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatgg |
328 |
Q |
| |
|
| || || || ||| |||| | |||||||||| ||| | ||||| |||||| ||| || || ||||| || ||||||| |||| | | |||||| |
|
|
| T |
25580152 |
taggaacagat----tttctattaatgtttttaaaacaagtgtaagttaattatatttcaaaaaaggtagaattgaataatattttctcaat--acatgg |
25580245 |
T |
|
| Q |
329 |
atgtgattgtgacgtt-gt-tacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaaca |
426 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
25580246 |
atgtgattttgattttagtgtatgttctaacttatcttattggacacgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaaca |
25580345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 427
Target Start/End: Original strand, 26143338 - 26143492
Alignment:
| Q |
273 |
agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgtt-gt-tacatactaacttattttattgga |
370 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| || || || | |||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
26143338 |
agttatttatatgtcaaaaaagttagaattgcataatatattctcaat--acatggatgtgattttgattttagtgtattttctaatttatcttattgga |
26143435 |
T |
|
| Q |
371 |
catgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaa |
427 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
26143436 |
catgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaa |
26143492 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27724827 - 27724775
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgat |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27724827 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgat |
27724775 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 490
Target Start/End: Original strand, 26623835 - 26623958
Alignment:
| Q |
367 |
tggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgt |
466 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || || ||||| |
|
|
| T |
26623835 |
tggacatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgt |
26623934 |
T |
|
| Q |
467 |
tggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
26623935 |
tggattacagtctcaactacaaca |
26623958 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 490
Target Start/End: Original strand, 26729812 - 26729935
Alignment:
| Q |
367 |
tggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgt |
466 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || || ||||| |
|
|
| T |
26729812 |
tggacatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgt |
26729911 |
T |
|
| Q |
467 |
tggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
26729912 |
tggattacagtctcaactacaaca |
26729935 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 427
Target Start/End: Original strand, 25483609 - 25483683
Alignment:
| Q |
353 |
ctaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaa |
427 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
25483609 |
ctaacttatcttattggacatgaatagatatgaacacaagtttattgagaagatagtccaatacatctccaacaa |
25483683 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 430
Target Start/End: Original strand, 25511488 - 25511565
Alignment:
| Q |
353 |
ctaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagat |
430 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25511488 |
ctaacttaccttattggacatgaatagatctgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaagat |
25511565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 27214630 - 27214758
Alignment:
| Q |
8 |
agttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctg |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| | ||| |||| |
|
|
| T |
27214630 |
agttatggtgaagcgcttgctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctg |
27214729 |
T |
|
| Q |
108 |
ctaacttttccggctaccatgatagtcct |
136 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
27214730 |
ctaacttatctggctatcattatagtcct |
27214758 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27234598 - 27234470
Alignment:
| Q |
8 |
agttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctg |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| | ||| |||| |
|
|
| T |
27234598 |
agttatggtgaagcgcttgctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctg |
27234499 |
T |
|
| Q |
108 |
ctaacttttccggctaccatgatagtcct |
136 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
27234498 |
ctaacttatctggctatcattatagtcct |
27234470 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 26143098 - 26143227
Alignment:
| Q |
31 |
gcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgat |
130 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| | |||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
26143098 |
gcatgaagagaggtttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattat |
26143197 |
T |
|
| Q |
131 |
agtcctcctaggtactcaacattacttaaa |
160 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
26143198 |
agtcctcatgggtaccccactttacttaaa |
26143227 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 429
Target Start/End: Original strand, 27215001 - 27215078
Alignment:
| Q |
352 |
actaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaaga |
429 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27215001 |
actaacttatcttattggacattaacagatatgaatacaagtttattgagaagatagttgaagacatctcaaacaaga |
27215078 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 490
Target Start/End: Original strand, 26656532 - 26656652
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| Q |
370 |
acatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttgg |
469 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
26656532 |
acatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttgg |
26656631 |
T |
|
| Q |
470 |
attgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26656632 |
attagagtctcgagtacaaca |
26656652 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 490
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| Q |
370 |
acatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttgg |
469 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
26762503 |
acatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttgg |
26762602 |
T |
|
| Q |
470 |
attgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26762603 |
attagagtctcgagtacaaca |
26762623 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
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| Q |
353 |
ctaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagat |
430 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26056472 |
ctaacttaccttattggacatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagat |
26056549 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
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| Q |
353 |
ctaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagat |
430 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26076442 |
ctaacttaccttattggacatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagat |
26076519 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| | | ||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
26656222 |
gcatgaaaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat |
26656318 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
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| Q |
31 |
gcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| | | ||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
26762193 |
gcatgaaaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat |
26762289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
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Target Start/End: Original strand, 26884621 - 26884757
Alignment:
| Q |
354 |
taacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttg |
453 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| |||| || | |||| |||||||| | |
|
|
| T |
26884621 |
taacttatcttattggacatgaatagatacgaatacgagtttatcgggaagatagtcgaagatatctccgacaaaatcaatcgtgttgttttacatgtag |
26884720 |
T |
|
| Q |
454 |
ccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26884721 |
ccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaaca |
26884757 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25506963 - 25506897
Alignment:
| Q |
6 |
gtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagag |
72 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25506963 |
gtagttatggtgaagatctgactaagcatgaagagaagtttcaaaataataagaaaaacatggagag |
25506897 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27338003 - 27337923
Alignment:
| Q |
47 |
caaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
27338003 |
caaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccat |
27337923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27398743 - 27398663
Alignment:
| Q |
47 |
caaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
27398743 |
caaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccat |
27398663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 490
Target Start/End: Original strand, 59776 - 60256
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
59776 |
aggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacgaaaaacatggagaggttgcagcaatggaaagtggctctgagtctg |
59875 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattg |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| | || | ||||| | |||||||| |||| |||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
59876 |
gctgctaacttgcccagctaccatgatgatagtcatgggtacgcctatttacttaattcctgttttgct-ttttgcatttaatttatttaatttctattc |
59974 |
T |
|
| Q |
204 |
cccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaat |
302 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| || ||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
59975 |
ctcaatac---catcttaaagcctaaatgtgt---aacaccttttttatttatgtttttaaacaattgttagttatttatatgtcaaaatagttaaaaat |
60068 |
T |
|
| Q |
303 |
gtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtg--acgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgg |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
60069 |
gtataatatattatgagt--acatggatgtgattgtgtgatgttgttacatactaacttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattgg |
60166 |
T |
|
| Q |
401 |
agagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60167 |
aaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
60256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 490
Target Start/End: Original strand, 18073968 - 18074448
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
18073968 |
aggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacgaaaaacatggagaggttgcagcaatggaaagtggctctgagtctg |
18074067 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattg |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| | || | ||||| | |||||||| |||| |||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
18074068 |
gctgctaacttgcccagctaccatgatgatagtcatgggtacgcctatttacttaattcctgttttgct-ttttgcatttaatttatttaatttctattc |
18074166 |
T |
|
| Q |
204 |
cccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaat |
302 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| || ||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
18074167 |
ctcaatac---catcttaaagcctaaatgtgt---aacaccttttttatttatgtttttaaacaattgttagttatttatatgtcaaaatagttaaaaat |
18074260 |
T |
|
| Q |
303 |
gtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtg--acgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgg |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
18074261 |
gtataatatattatgagt--acatggatgtgattgtgtgatgttgttacatactaacttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattgg |
18074358 |
T |
|
| Q |
401 |
agagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18074359 |
aaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
18074448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18731440 - 18730995
Alignment:
| Q |
36 |
aaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcc |
135 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18731440 |
aaaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttagtca |
18731341 |
T |
|
| Q |
136 |
tcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgaga |
235 |
Q |
| |
|
| ||||||| | |||||||| || | |||| || ||||| ||||| |||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || ||| ||||| || |
|
|
| T |
18731340 |
tg---ggtactcctctttacttaattcttgtttt-ccattttgcattttatttatttaatttttattcctcaataataccatcttaaagcctaaattgga |
18731245 |
T |
|
| Q |
236 |
tcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtga |
334 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18731244 |
---aacacctttttt-tttacatttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgagg--acatggatgtga |
18731151 |
T |
|
| Q |
335 |
ttgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagt |
434 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18731150 |
ctgtgatgttgttacatactgacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgaaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagt |
18731051 |
T |
|
| Q |
435 |
cgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18731050 |
cgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaaca |
18730995 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 246 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18699134 - 18698891
Alignment:
| Q |
246 |
tttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgtt |
344 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
18699134 |
tttttaattacgtttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatactatgagg--acatggatgtgactgtgatgtt |
18699037 |
T |
|
| Q |
345 |
gttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagccct |
444 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18699036 |
gttacacactgatttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagccct |
18698937 |
T |
|
| Q |
445 |
tacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18698936 |
tacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
18698891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 246 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18679301 - 18679051
Alignment:
| Q |
246 |
tttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagtt-------agaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattg |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || |
|
|
| T |
18679301 |
tttttatttacgtttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagtttgaatttagaaatgtatgatatattatgagt--acatgggtgtgactg |
18679204 |
T |
|
| Q |
338 |
tgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgt |
437 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
18679203 |
tgatgttgttacatactgacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacgtctctaacaagatcagtcgg |
18679104 |
T |
|
| Q |
438 |
cagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18679103 |
cagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
18679051 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 246 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18723819 - 18723576
Alignment:
| Q |
246 |
tttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgtt |
344 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
18723819 |
tttttatttacatttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgagt--aaatggatgtgactgtgatgtt |
18723722 |
T |
|
| Q |
345 |
gttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagccct |
444 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18723721 |
gttacatactgacttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggaaagatagtcaaatatgtcaacaacaagatcagtcgtcagccct |
18723622 |
T |
|
| Q |
445 |
tacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18723621 |
tacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaaca |
18723576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 246 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18655211 - 18654968
Alignment:
| Q |
246 |
tttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgtt |
344 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
18655211 |
tttttatttacatttttaaacaagtattagttatttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgagt--aaatggatgtgactgtgatgtt |
18655114 |
T |
|
| Q |
345 |
gttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagccct |
444 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18655113 |
gttacacactgatttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagccct |
18655014 |
T |
|
| Q |
445 |
tacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18655013 |
tacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaaca |
18654968 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18655402 - 18655322
Alignment:
| Q |
47 |
caaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18655402 |
caaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccat |
18655322 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18724010 - 18723930
Alignment:
| Q |
47 |
caaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18724010 |
caaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccat |
18723930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18699335 - 18699245
Alignment:
| Q |
37 |
aaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18699335 |
aaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccat |
18699245 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18679502 - 18679412
Alignment:
| Q |
37 |
aaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| | || |||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18679502 |
aaagagtttccaaaataacaataaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccat |
18679412 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0277 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:
Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 242 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4457 - 4205
Alignment:
| Q |
242 |
accttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtata--atatattctgagtctacatggatgtgattg |
337 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4457 |
accttttatatttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcacaatagttagaaatgtataccatatattatgagt--acatggatgtgattg |
4360 |
T |
|
| Q |
338 |
tgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgt |
437 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
4359 |
tgatgttgttacatactaacttatcttatcggacattaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaagaacatctccaacaagatcagtcat |
4260 |
T |
|
| Q |
438 |
cagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacatg |
492 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4259 |
cagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatg |
4205 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 245 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13415 - 13168
Alignment:
| Q |
245 |
ttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacg |
342 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
13415 |
ttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatg |
13318 |
T |
|
| Q |
343 |
ttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcc |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13317 |
ttgttacatactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcc |
13218 |
T |
|
| Q |
443 |
cttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacatg |
492 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13217 |
cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatg |
13168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4653 - 4529
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
4653 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgaccca |
4554 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4553 |
agctgctaacttgtccggctaccat |
4529 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13613 - 13490
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
13613 |
aggtcgttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagcgattgcatcaatggaagttggctctgacccaa |
13514 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13513 |
gctgctaacttgtccggctaccat |
13490 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0419 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:
Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 245 - 492
Target Start/End: Original strand, 7929 - 8176
Alignment:
| Q |
245 |
ttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacg |
342 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7929 |
ttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatg |
8026 |
T |
|
| Q |
343 |
ttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcc |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8027 |
ttgttacatactaacttatcttatatgacatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcc |
8126 |
T |
|
| Q |
443 |
cttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacatg |
492 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8127 |
cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatg |
8176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 7731 - 7854
Alignment:
| Q |
4 |
aggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccat |
103 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
7731 |
aggtcgttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagcgattgcatcaatggaagttggctctgacccaa |
7830 |
T |
|
| Q |
104 |
gctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7831 |
gctgctaacttgtccggctaccat |
7854 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0349
Description:
Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3403 - 3260
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaa-catggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcc |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3403 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcc |
3304 |
T |
|
| Q |
102 |
atgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac |
145 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3303 |
aggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtac |
3260 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14338 - 14196
Alignment:
| Q |
3 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagcca |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14338 |
aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatggaaagaggctctgagcca |
14239 |
T |
|
| Q |
103 |
tgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14238 |
ggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtac |
14196 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 328 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3196 - 3034
Alignment:
| Q |
328 |
gatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaa |
427 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
3196 |
gatgtgattgtgatgttgtcacatactaacttatcttactggacatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaa |
3097 |
T |
|
| Q |
428 |
gattagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3096 |
gaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaaca |
3034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14135 - 14082
Alignment:
| Q |
323 |
acatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttattggacatgaa |
376 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14135 |
acatggatgtgattgtgatgttgtcacatactaacttatcttattggacatgaa |
14082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 268094 - 267835
Alignment:
| Q |
242 |
accttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtcta--catggatgtgattgt |
338 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
268094 |
accttttttatttacgtttctaaataagtattagttgtttatatgacgaaatagttagaaacgtataatatattttgagtacatgcatggatgtgattgt |
267995 |
T |
|
| Q |
339 |
g--acgttgttacatacta------acttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagat |
430 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
267994 |
gtgatgttgttacatactattactaacttgcattatttgacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagat |
267895 |
T |
|
| Q |
431 |
tagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
267894 |
cagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaaca |
267835 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28127612 - 28127516
Alignment:
| Q |
39 |
agaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcc |
135 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||| | |||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28127612 |
agaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgcaccaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtcc |
28127516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28164296 - 28164200
Alignment:
| Q |
39 |
agaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcc |
135 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||| | |||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28164296 |
agaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgcaccaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtcc |
28164200 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28127308 - 28127262
Alignment:
| Q |
352 |
actaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttatt |
398 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28127308 |
actaacttatcttattggagattaatagatatgaatacaagtttatt |
28127262 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 268273 - 268202
Alignment:
| Q |
56 |
aagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
268273 |
aagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggctaccat |
268202 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28164100 - 28164048
Alignment:
| Q |
248 |
tttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttaga |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28164100 |
tttatttatgtttttaaacaagtataagatatttatatgtcaaaatagttaga |
28164048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29273472 - 29273333
Alignment:
| Q |
351 |
tactaacttattttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtagagtacatctccaacaagattagtcgtcagcccttacatg |
450 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
29273472 |
tactaacttgtattatttgacatgaatagatatgaatacaagtttatcggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatg |
29273373 |
T |
|
| Q |
451 |
ttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaaca |
490 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29273372 |
ttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaaca |
29273333 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 484
Target Start/End: Original strand, 16440694 - 16440734
Alignment:
| Q |
444 |
ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagt |
484 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16440694 |
ttacatgttgctaattaccctgttggattggagtctcgagt |
16440734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 484
Target Start/End: Original strand, 16449533 - 16449573
Alignment:
| Q |
444 |
ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagt |
484 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16449533 |
ttacatgttgcgaattatccagttggattggagtctcgagt |
16449573 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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