View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4889_low_4 (Length: 338)

Name: NF4889_low_4
Description: NF4889
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4889_low_4
NF4889_low_4
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (1-338)||(33574542-33574879)
chr5 (1-338)||(15542837-15543174)
chr5 (1-338)||(15532655-15532992)
chr5 (1-338)||(26712800-26713133)
chr5 (1-338)||(26982538-26982871)
chr5 (1-335)||(22159201-22159535)
chr5 (1-335)||(14616883-14617216)
chr5 (1-335)||(34405306-34405639)
chr5 (1-209)||(11989272-11989480)
chr5 (1-217)||(7650405-7650611)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (1-338)||(22626767-22627104)
chr3 (1-338)||(11139024-11139361)
chr3 (1-335)||(39563965-39564294)
chr3 (193-338)||(1096863-1097007)
chr3 (1-212)||(13979070-13979277)
chr3 (237-338)||(31878360-31878461)
chr3 (1-211)||(47411772-47411981)
chr3 (1-213)||(35365957-35366167)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (1-338)||(31527843-31528180)
chr2 (1-338)||(31626001-31626340)
chr2 (1-338)||(13709526-13709861)
chr2 (1-338)||(40017432-40017768)
chr2 (1-327)||(36326386-36326713)
chr2 (1-338)||(32576141-32576476)
chr2 (1-197)||(23673799-23673995)
chr2 (1-141)||(16294550-16294690)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-338)||(13017644-13017981)
chr6 (1-334)||(22221182-22221514)
chr6 (1-334)||(22247017-22247349)
chr6 (1-335)||(1837931-1838265)
chr6 (1-335)||(19665118-19665452)
chr6 (1-335)||(14790076-14790409)
chr6 (1-333)||(14795106-14795437)
chr6 (1-335)||(15534546-15534880)
chr6 (27-338)||(32426823-32427133)
chr6 (1-335)||(32704709-32705041)
chr6 (1-214)||(16883254-16883467)
chr6 (1-216)||(20527617-20527832)
chr6 (135-335)||(15537741-15537940)
chr6 (230-338)||(32426640-32426748)
chr6 (1-159)||(12983833-12983994)
chr6 (103-216)||(7769958-7770070)
chr6 (19-85)||(15537971-15538037)
chr6 (25-66)||(2330478-2330519)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (1-338)||(12171436-12171773)
chr4 (4-311)||(26063150-26063457)
chr4 (1-335)||(647658-647991)
chr4 (1-335)||(650930-651264)
chr4 (1-216)||(26060163-26060378)
chr4 (19-216)||(2541461-2541657)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-338)||(23760063-23760400)
chr7 (1-338)||(11278946-11279283)
chr7 (1-335)||(33312460-33312785)
chr7 (1-338)||(294319-294655)
chr7 (1-244)||(46846767-46847007)
chr7 (1-335)||(24782863-24783196)
chr7 (1-335)||(17863549-17863882)
chr7 (1-333)||(17866808-17867139)
chr7 (1-335)||(6966605-6966938)
chr7 (1-223)||(36222757-36222984)
chr7 (19-216)||(23313674-23313871)
chr7 (1-216)||(36843392-36843607)
chr7 (1-216)||(9765373-9765583)
chr7 (70-335)||(35773054-35773319)
chr7 (1-216)||(23107566-23107778)
chr7 (103-213)||(3862452-3862562)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-334)||(7447-7780)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (3-338)||(2145-2480)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-338)||(3058-3398)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-338)||(32506309-32506644)
chr1 (1-335)||(13495445-13495778)
chr1 (1-335)||(27282562-27282900)
chr1 (1-335)||(13492720-13493053)
chr1 (1-338)||(16190626-16190967)
chr1 (28-292)||(1936128-1936391)
chr1 (1-207)||(34065929-34066135)
chr1 (103-335)||(10759579-10759810)
chr1 (1-133)||(22104824-22104956)
chr1 (1-213)||(23990543-23990754)
chr1 (1-177)||(22456945-22457123)
chr1 (1-52)||(22453590-22453641)
chr1 (19-177)||(21152871-21153028)
chr1 (118-159)||(49147740-49147781)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (193-338)||(9463-9608)
scaffold0440 (1-48)||(9606-9653)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (1-335)||(99-432)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (1-296)||(12575754-12576048)
chr8 (1-216)||(13096606-13096812)
chr8 (1-206)||(44007889-44008092)
chr8 (103-188)||(41779233-41779318)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (1-216)||(6265-6479)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (1-106)||(24638-24743)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (25-66)||(7086-7127)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33574879 - 33574542
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574879 ttaaacctattacctaattcagagttaaaagttagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 33574780  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33574779 cataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggt 33574680  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574679 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 33574580  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574579 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 33574542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 15542837 - 15543174
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15542837 ttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctat 15542936  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15542937 cataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggt 15543036  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15543037 tacatcagattcatctcatgaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaacggattcatacatgtgaag 15543136  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15543137 gaagattgactcttagttttgatggttccccaccagat 15543174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 15532655 - 15532992
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15532655 ttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctat 15532754  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15532755 cataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggt 15532854  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15532855 tacatcagattcatctcatgaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaacggattcatccatgtgaag 15532954  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15532955 gaagattgactcttagttttgatggttccccaccagat 15532992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 26712800 - 26713133
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26712800 ttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaat 26712899  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26712900 gataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-ccgtaggat 26712998  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26712999 tacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtaaag 26713095  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26713096 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 26713133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 26982538 - 26982871
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26982538 ttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaat 26982637  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26982638 gataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-ccgtaggat 26982736  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26982737 tacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtaaag 26982833  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982834 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 26982871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22159535 - 22159201
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22159535 ttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccagggttaatggtcattcaatctctaacatcaatttgtatattcataaagctatggttagtagtcgat 22159436  T
Q  101 cgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagga 199  Q
      |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22159435 gataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtagga 22159336  T
Q  200 ttacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaa 299  Q
    ||||||| |||||||||||    | ||| |||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||       
T  22159335 ttacatcggattcatctca-ttctcaaccacaaagagattagttactcataactaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtatt 22159237  T
Q  300 ggatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||    
T  22159236 ggatgattgactatgagttgtgatgctctcccacca 22159201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 14616883 - 14617216
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  14616883 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccatggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtattcgat 14616982  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14616983 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatatttaaaggagttcaacaaactagggttctcataggat 14617082  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||   |    
T  14617083 tacatcatattcatctcaag-cttaaccagaaagagattagttactcataactaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtattg 14617181  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  14617182 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 14617216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34405639 - 34405306
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34405639 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 34405540  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405539 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 34405440  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||   |    
T  34405439 tacatcagattcatctcaag-ctgaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtattg 34405341  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  34405340 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 34405306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11989272 - 11989480
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11989272 ttaaacctaatacctagatcagagtcaaaagcgaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcataaagctagggttagtagtcgat 11989371  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11989372 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataaaat 11989471  T
Q  201 tacatcaga 209  Q
    |||||||||    
T  11989472 tacatcaga 11989480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 7650405 - 7650611
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  || |||| ||||||   ||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  7650405 ttaaacttattacctagttctgagtcaaaagc---ggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgat 7650501  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| ||  ||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  7650502 gataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatatt------agttcaacaaattagggtt-ccataaaat 7650594  T
Q  201 tacatcagattcatctc 217  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7650595 tacatcaaattcatctc 7650611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 22626767 - 22627104
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22626767 ttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctat 22626866  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626867 cataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 22626966  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626967 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 22627066  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627067 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 22627104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 11139024 - 11139361
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11139024 ttaaacctattac-tatttcagagttaaaagccagggttagtggccattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtttat 11139122  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139123 cataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 11139222  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataag-aaaaaggattcatacatgtgaa 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11139223 tacatcagattcatctcaagaattaaccacaaaagaattagttactcaaagctaaagtataagataactaacataagaaaaaaggattcatacatgtgaa 11139322  T
Q  300 ggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139323 ggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 11139361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 39563965 - 39564294
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39563965 ttaaacctattacctagttcaga-ttaaaagtcagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaat 39564063  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  39564064 gataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattaatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-tcgtaggat 39564162  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39564163 tacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtaaag 39564259  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564260 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 39564294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 338
Target Start/End: Original strand, 1096863 - 1097007
Alignment:
Q  193 cataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatac 292  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096863 catagaattatatcagattcatgtcaagc-ttaaccacaaaggaattagttactcatagctaaagtataagttaactaacataagaaaaaggattcatac 1096961  T
Q  293 atgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    |||| | |||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  1096962 atgtaatggatgattgactatgagttgtgatggttgcccaccagat 1097007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13979277 - 13979070
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||    
T  13979277 ttaaaactattacctagttcagagtcgaaagtcagggtcagtggtcattcaatctctacgatcaatttgcat-ttcataaagctagggtcagtagtcgat 13979179  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||   |||  ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13979178 gataa---tacgaaaaacattaaacaaaaagtaatatgaaaaaagactaaactttcatttaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataagat 13979082  T
Q  201 tacatcagattc 212  Q
    ||| ||||||||    
T  13979081 tacctcagattc 13979070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 338
Target Start/End: Original strand, 31878360 - 31878461
Alignment:
Q  237 attagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  31878360 attagttactcatagctaaagtacaaaataactaacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgagttttgatggttgcccaccag 31878459  T
Q  337 at 338  Q
    ||    
T  31878460 at 31878461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47411981 - 47411772
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||  ||| ||| | || ||||| ||    
T  47411981 ttaaacctattacctagatcagagtcaaaaggcaggactagtgatcattcaagttctaagatcaattttcatattcaagaagttagtgctagtagtcaat 47411882  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccatagga 199  Q
      |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||  |    
T  47411881 aataaacatacaaacaacattaaacacaaggtaatatgaat-taaactagactttcattgatattcaagggagttcatacatatta-ggtttccataaaa 47411784  T
Q  200 ttacatcagatt 211  Q
    ||||||||||||    
T  47411783 ttacatcagatt 47411772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35366167 - 35365957
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| ||||||||| || || ||||||| |||| |||||  | ||||| | || ||||| ||    
T  35366167 ttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccaaggctagtggtcattcaagttttaagatcaatttgcacattcacgatgctagtgctagtagtcaat 35366068  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccatagga 199  Q
      |||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| || |||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||      
T  35366067 aataaacataaaacaa-cattaaacacaaggtaatatgaat-taaactagtctttcattaatattcaagagagttcatacaaatta-ggtttccatagag 35365971  T
Q  200 ttacatcagattca 213  Q
    ||||||||||||||    
T  35365970 ttacatcagattca 35365957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31528180 - 31527843
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31528180 ttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctat 31528081  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528080 cataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 31527981  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31527980 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaacggattcatacatgtgaag 31527881  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31527880 gaagattgactcttagttttgatggttccccaccagat 31527843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31626340 - 31626001
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31626340 ttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctataatcaatatgtatattcataaagctagggttaatagtcgat 31626241  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaa--actaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagg 198  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |  | || |     ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31626240 gataaacatacataaaacattaaacacagggtaatatgaatagtaggattacatcaatatgtatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtagg 31626141  T
Q  199 attacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtga 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  31626140 attacatcagattcatctcaagaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactcacataagaaaaatgattcgtacatgtaa 31626041  T
Q  299 aggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31626040 aggatgattgactcatagttttgatggttgcccaccagat 31626001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13709861 - 13709526
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13709861 ttaaacttatcacctaggtcagagtcaaaatccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttacatattcataaagctagggttagtagtcgat 13709762  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13709761 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattagactttcattgatattctt-gaagttcaacaaattagggttcacataggat 13709663  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  13709662 tacatcagattcatctcag-aattaaccacaagagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaataaggattcatacatgtaatg 13709564  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13709563 gatgattgactattagttttgatggttgcccaccagat 13709526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40017768 - 40017432
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  40017768 ttaaacttattacctagttcaaagtcaaaagccagggtcagtggtcattcaatctctacgatcaatttgcatattcataaagatagggtcagtagtcgat 40017669  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40017668 gataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 40017569  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |    
T  40017568 tacatcatattcatctcaag-cttaaccacaaaagaattagttactcatagttaaagtataagctaactaacataggaagaaggattcatacatgtaatg 40017470  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  40017469 gatgactgactatgagttttgatggttgtccaccagat 40017432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36326713 - 36326386
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36326713 ttaaacttattacctagatcaaagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 36326614  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||  || || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36326613 gataaaca--caaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaatgagttcaacaaactagggttcccataggat 36326516  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggatt----catacatgt 296  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||    ||||| |||    
T  36326515 tacatcagattcatctcaagc-ttaaccacaaaagaattagttactcatagataaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggattgattcatacgtgt 36326417  T
Q  297 gaaggatgattgactcttagttttgatggtt 327  Q
       |||||||||||| | |||||||||||||    
T  36326416 attggatgattgactatgagttttgatggtt 36326386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 32576141 - 32576476
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||| ||    
T  32576141 ttaaacatattacctagttcatagtcaaaagacagggtcagtgatcattcaatctatacgatcaatttgcatattcataaagttaggatcagtagtcaat 32576240  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||| || || ||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32576241 gataaacatgcaaaaagcattaa-caaaaagtaatatggataaagactaaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggat 32576339  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||| |||||||| | |  | ||| |||||   |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||   |    
T  32576340 tacatcatattcatct-aagtctcaaccacaaagagattagttattgatagctaaagtagaagataactaacataaaaacaaggattcatacaagtattg 32576438  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  32576439 gatgactgactgtgagttttgatggtctcccactagat 32576476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 23673799 - 23673995
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23673799 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggatagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgat 23673898  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatag 197  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23673899 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccatag 23673995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16294690 - 16294550
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16294690 ttaaacctattacatagttcagagttaaaagccagagttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 16294591  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaat 141  Q
      |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16294590 gataaacatacacaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 16294550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 13017644 - 13017981
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13017644 ttaaacctattacctaattcagagttaagagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctat 13017743  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017744 cataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcatttatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 13017843  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13017844 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaacgtataagctaactaacacaagaaaaaggattcatacatgtgaag 13017943  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13017944 gatgattgactcttagttttgatggtttccaaccagat 13017981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22221514 - 22221182
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221514 ttaaacctattaccttttttagatttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 22221415  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22221414 cataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggat 22221316  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221315 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcgaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 22221216  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 334  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221215 aatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 22221182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22247349 - 22247017
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22247349 ttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctatggttaatagtctat 22247250  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22247249 cataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaaccaaactttcattgatgttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggat 22247151  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247150 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcgaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 22247051  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 334  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247050 aatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 22247017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1838265 - 1837931
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  1838265 ttaaacctattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgat 1838166  T
Q  101 cgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagga 199  Q
      |||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1838165 gataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaataaattagggttcccatagga 1838066  T
Q  200 ttacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||| |||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||       
T  1838065 ttacatcagattcatctca-gtctcaaccacaaagagattagttactcatatctaaagtacaagataactcacataaaaataaggtttcatacatgtatt 1837967  T
Q  300 ggatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  1837966 ggatgattgactatgagttgtgatggtctcccacca 1837931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 19665118 - 19665452
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19665118 ttaaacctattacctagatcagaattaaaagtcagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 19665217  T
Q  101 cgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagga 199  Q
      |||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19665218 gataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaatgagttcaacaaattagggttcccatagga 19665317  T
Q  200 ttacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||| |||||   ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||       
T  19665318 ttacatcagattcatctca-gtctcaaccacaaagagattagttactcatatataaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtatt 19665416  T
Q  300 ggatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  19665417 ggatgattgactatgagttgtgatggtctcccacca 19665452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14790409 - 14790076
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14790409 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 14790310  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790309 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 14790210  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||   |    
T  14790209 tacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattg 14790111  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  14790110 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 14790076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14795437 - 14795106
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14795437 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 14795338  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795337 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 14795238  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |  ||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||   |    
T  14795237 tacatcagattcatctcaag-cttaaccatgaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattg 14795139  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccac 333  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  14795138 gataattgactatgagttgtgatggtctcccac 14795106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15534880 - 15534546
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||| || | ||||| |||| ||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15534880 ttaaacctattaccaagatcagagttaaaagtcaagtttagtggtcactcaatctctaacatcaattttcatattcataaagctagggttagtagtcgat 15534781  T
Q  101 cgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagga 199  Q
      |||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534780 gataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagga 15534681  T
Q  200 ttacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaa 299  Q
    |||||||||||||||||||    | ||| |||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||       
T  15534680 ttacatcagattcatctca-atctcaaccacaaagagattagttactcatatctaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatatatgtatt 15534582  T
Q  300 ggatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  15534581 ggatgattgactatgagttgtgatggtctcccacca 15534546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32427133 - 32426823
Alignment:
Q  27 aaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaaca 126  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| |||| |||| || |||||| || |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||||||||||    
T  32427133 aaaatccagagttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatactcctaaagccagggttagtggtcgatgataaacatacaaaaagcattaaaca 32427034  T
Q  127 caaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaa 226  Q
     || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||    
T  32427033 taaagtaatataaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttctcataggattatatcatattcatctcaag-cttaa 32426935  T
Q  227 cgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggt 326  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||    
T  32426934 ccacaaaagaattagttactcctagctaaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgagttttgatggt 32426835  T
Q  327 ttcccaccagat 338  Q
    | ||||||||||    
T  32426834 tgcccaccagat 32426823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 32704709 - 32705041
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32704709 ttaaacttattacttagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 32704808  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| ||  ||||||||| || ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32704809 gataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaat-tgacttaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 32704907  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||   |    
T  32704908 tacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattg 32705006  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  32705007 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 32705041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16883467 - 16883254
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16883467 ttaaacttattacctagttcagagtcaaaagtgagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 16883368  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||| | || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  16883367 gataaacatacaaaaagcattaaagataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttctcataaaat 16883268  T
Q  201 tacatcagattcat 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16883267 tacatcagattcat 16883254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20527617 - 20527832
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  20527617 ttaaacttattacctagttcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaaaatcaatttgcatattcataaagctagggttaggagtcgat 20527716  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  20527717 gataaacatacaaaaagcattaaatataaagtaatatgaataaagattagactttcattgatattcaaaggagttcaacacattaaggttcccataaaat 20527816  T
Q  201 tacatcagattcatct 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  20527817 tacatcagattcatct 20527832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15537940 - 15537741
Alignment:
Q  135 tatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaa 234  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  | ||| |||||     
T  15537940 tatgaataaaaattagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatatgattacatcaaattcatctca-gtctcaaccacaaag 15537842  T
Q  235 gaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 334  Q
      |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  15537841 agattagttactcatatctaatgtacaagataactcacataaaaacaaggagtcatacatgtattagatgattgactatgagttgtgatggtctcccacc 15537742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32426748 - 32426640
Alignment:
Q  230 caaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttc 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||   |||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  32426748 caaaagaattagttactcctagctaaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggattcatacgtgtattggatgattgactatgagttttgatggttgc 32426649  T
Q  330 ccaccagat 338  Q
     ||||||||    
T  32426648 tcaccagat 32426640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 12983833 - 12983994
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaa-gctagggttaatagtc-- 97  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| | || || ||      
T  12983833 ttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatcagtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtactcaa 12983932  T
Q  98 tatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcatt 159  Q
    |||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  12983933 tataataaacatacagacagcattaaacacaaggtaatatgaattaaaactagacttccatt 12983994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Original strand, 7769958 - 7770070
Alignment:
Q  103 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccataggatt 201  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | | || | |||    
T  7769958 taaacatacatatgtcattaaacacaaggaaatatgaattaaa-ctagactttcattgatattcaagggagttcatacaaattaggtattc-atggaatt 7770055  T
Q  202 acatcagattcatct 216  Q
    |||||||||||||||    
T  7770056 acatcagattcatct 7770070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15538037 - 15537971
Alignment:
Q  19 tcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagcta 85  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  15538037 tcagagttaaaagcaagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaaacta 15537971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 2330519 - 2330478
Alignment:
Q  25 ttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaat 66  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2330519 ttaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaat 2330478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12171773 - 12171436
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171773 ttaaacctattacctaattaagaattaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 12171674  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  12171673 cataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaatttgggttccaatagggt 12171574  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12171573 tacatcagattcatctcagaaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtagaagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgacg 12171474  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171473 gatgatttactcttagttttgatggtttcccaccagat 12171436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 311
Target Start/End: Original strand, 26063150 - 26063457
Alignment:
Q  4 aacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgt 103  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  26063150 aacctattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttattagtcgatgat 26063249  T
Q  104 aaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 202  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26063250 aaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaatcagggttcccatatgatta 26063349  T
Q  203 catcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaagga 302  Q
    ||| |||||||||||||   | ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||   |||    
T  26063350 cattagattcatctcagtc-tcaaccacaaagaaattagttactcatatctaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtattgga 26063448  T
Q  303 tgattgact 311  Q
    |||||||||    
T  26063449 tgattgact 26063457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 647658 - 647991
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  647658 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 647757  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647758 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 647857  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||   |    
T  647858 tacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtattg 647956  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  647957 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 647991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 650930 - 651264
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |  | ||    
T  650930 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagttagggttaggaaacaat 651029  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaatta-gggttcccatagga 199  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  651030 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattaggggttcccatagga 651129  T
Q  200 ttacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||       
T  651130 ttacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtatg 651228  T
Q  300 ggatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  651229 ggataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 651264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26060378 - 26060163
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  26060378 ttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcatggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcatgaagctagggttagtagtcgat 26060279  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||  ||    
T  26060278 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaatctagacttttattgatattcaaaagagttcaacaaactaggattctcatacaat 26060179  T
Q  201 tacatcagattcatct 216  Q
    || |||| ||||||||    
T  26060178 tatatcatattcatct 26060163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2541657 - 2541461
Alignment:
Q  19 tcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggc 118  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||| |||||   |||| | | || ||||||||  |  ||||| ||  |||||||||  ||  |    
T  2541657 tcagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacatacgaaaatc 2541558  T
Q  119 attaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2541557 attaaacacaagataatatgaataaaaactagacttttattgatatg-aaaggaattcaacaaattagagttcccataagattacattagattcatct 2541461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 23760063 - 23760400
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  23760063 ttaaacctattacctaattcggagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcacgacgctaggattaatagtctat 23760162  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760163 cataaacgtacataaggtactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattaatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 23760262  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23760263 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacaagtgaag 23760362  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760363 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 23760400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11279283 - 11278946
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11279283 ttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatgttcataaagctagggttagtagtcgat 11279184  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11279183 gataaacatacaaaaagcattaagcacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggt 11279084  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11279083 tacatcagattcatctcacgaattaaccacaaaagaattagttactcataggtaaagtataagctaactaacataagaaaaatgattcatacatgtaaag 11278984  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11278983 gatgattgactcttagttttgatggttgcccaccagat 11278946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33312785 - 33312460
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33312785 ttaaacatattacctagttcagagttaaaagtcagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgat 33312686  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33312685 gataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaattttcattaatgttcaatggagttcaacaaattagggttcccgtaggat 33312586  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  33312585 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagc---------taagaaaaaggattcatacatgtgaag 33312495  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33312494 gatgattgactcttagtttcgatggtttcccacca 33312460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 294655 - 294319
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||    
T  294655 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaaactagagttaatagttcat 294556  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  294555 gataaacatacaataagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattatactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggat 294456  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  294455 tacatcagattcatctcagg-attaaccacaagagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaagaaagattcatacatgtaatg 294357  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  294356 gatgattgactattagttttgatggttgctcaccagat 294319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 46846767 - 46847007
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||    
T  46846767 ttaaacctattacttagttcagagttaaaagtcagggttagtgatcattcaatttccatgatcaatatgcatgttca---agctagggttaatagtcgat 46846863  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46846864 gataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggt 46846963  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46846964 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtta 46847007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24783196 - 24782863
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  24783196 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctatggttagtagtcgat 24783097  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24783096 gataaacatacaaaaagcatcaaacataaagtaatatggattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactacggttcccataggat 24782997  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||   |    
T  24782996 tacatcagattcatcttaag-cttaaccacaaaaagattagttactcataactaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtattg 24782898  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  24782897 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 24782863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 17863549 - 17863882
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17863549 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 17863648  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17863649 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 17863748  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||   |    
T  17863749 tacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattg 17863847  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  17863848 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 17863882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 17866808 - 17867139
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17866808 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 17866907  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866908 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 17867007  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||   |    
T  17867008 tacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattg 17867106  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccac 333  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  17867107 gataattgactatgagttgtgatggtctcccac 17867139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6966938 - 6966605
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6966938 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgaatattcataaagctagggttagtagtcaat 6966839  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6966838 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 6966739  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||   |    
T  6966738 tacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattg 6966640  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  6966639 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 6966605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36222757 - 36222984
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  36222757 ttaaatctattagctagttcagagttaaaagcgagggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcatgttcataaagctagggctagtagtcgat 36222856  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaa-taaaaactaaactttcat------tgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttccc 193  Q
      |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||      |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36222857 gataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaattaaagactaaactttcattgaatatgatattcaaa-gagttcaacaaattaggattccc 36222955  T
Q  194 ataggattacatcagattcatctcaggaat 223  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36222956 atagg-ttacatcagattcacctcaggaat 36222984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 23313674 - 23313871
Alignment:
Q  19 tcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggc 118  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| || ||    
T  23313674 tcagagtcaaaagccaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggtttgtagtcgatgataaacatacaaaaagc 23313773  T
Q  119 attaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23313774 attaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggagtttaacaaattagagttcccataagattacatcggattcatct 23313871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 36843392 - 36843607
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36843392 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccaggattagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 36843491  T
Q  101 cgtaaac-atacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagga 199  Q
      ||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  36843492 gataaacaatataaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaa-gagttcaacaaattagagttcccacaaga 36843590  T
Q  200 ttacatcagattcatct 216  Q
    |||||||| ||||||||    
T  36843591 ttacatcaaattcatct 36843607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9765583 - 9765373
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||   |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||      ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  9765583 ttaaacttattacctagaccagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatc-----gatcaatttgcatatccataaagctagggttaatagtcgat 9765489  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
     |||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9765488 ggtaaacatgcaaaacgcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagacttttattcatattcaaagaagttcaacaaattagggttctcataggat 9765389  T
Q  201 tacatcagattcatct 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9765388 tacatcatattcatct 9765373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 335
Target Start/End: Original strand, 35773054 - 35773319
Alignment:
Q  70 catattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaa 168  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  ||  |||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  35773054 catattcataaagttagggttagtagttgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgacattcaa 35773153  T
Q  169 aggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaac 268  Q
    | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| |  | ||| |||||   |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  35773154 atgagttcaacaaattagagttcttataggattacataagattcatctca-gtctcaaccacaaacagattagttactcatatctaacgtacaagataac 35773252  T
Q  269 taacataagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  35773253 tcacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgagttgtgatggtctcccacca 35773319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23107778 - 23107566
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  23107778 ttaaacctattacctagttcagagtcaaaagtctgggtcagtggtcattcaatctctactatcaatttgcatattcataacgttagggttaatagtcgat 23107679  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||| || || |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||| | ||| |||    
T  23107678 gataaacatgcaaaaagcattaaacaaaaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaa---agggtttctataagat 23107582  T
Q  201 tacatcagattcatct 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23107581 tacatcaaattcatct 23107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 3862452 - 3862562
Alignment:
Q  103 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 202  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3862452 taaacatacacaaagcattaaaaacaagatgatataaataaaaactagactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattagggttctcataagatta 3862551  T
Q  203 catcagattca 213  Q
    ||| |||||||    
T  3862552 cattagattca 3862562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 7447 - 7780
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7447 ttaaacctattacctagttctgagtaaaaagccagggttagtggtcaatcaaattctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgat 7546  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7547 gataaacatacataaagcattaaactcaaagtaatatgaataaaaactaaactttcatttatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggat 7646  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7647 tacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcataactaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagag 7746  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7747 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2480 - 2145
Alignment:
Q  3 aaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcg 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  2480 aaacctattacctagttcagagtaaaaagccagggttagtggtcatttattttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagttgatga 2381  T
Q  103 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2380 taaacatacataaagcattaaacacaaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaagttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggatta 2281  T
Q  203 catcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaagga 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2280 catcagattcatcttaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagttaactaacataagagaaaggattcatacatgtaaagga 2181  T
Q  303 tgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180 tgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 2145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 3058 - 3398
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaa-gctagggttaatagtcta 99  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3058 ttaaacgtattacctagttcagagttgaaagccatggttagtgttcattcaaattctgtgatcaatttgcatattcataaaagctagggttagtagtcga 3157  T
Q  100 tcgtaaacatacataaggcattaaacacaagg---taatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccata 196  Q
    |  |||||||||| ||  |||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  3158 tgataaacatacaaaaaacattaaacacaaagaagtaatatgagtaaagactaaactttcatttaaattcaaatgagttcaacaaattaggatttccata 3257  T
Q  197 ggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgt 296  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3258 agattacataagattcatctcaggaat-aaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaagaaggattcatacatgt 3356  T
Q  297 gaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3357 aaaggatgattgactcttagttttgatggttgcccaccagat 3398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 32506309 - 32506644
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32506309 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 32506408  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaa--ggagttcaacaaattagggttcccatagg 198  Q
      |||||||||| ||  ||||||||| || |||||||   | ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32506409 gataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaatat---ttaaaactagactttcattgatattcaaaaaggagttcaacaaactagggttcccatagg 32506505  T
Q  199 attacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtga 298  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||      
T  32506506 attacatcagattcatctcaagc-ttaatcacaaaagaattagttactcatagctaaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggattcatacgtgtat 32506604  T
Q  299 aggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  32506605 tggatgattgactatgagttttgatggttgcccaccagat 32506644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13495778 - 13495445
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13495778 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagctagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 13495679  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13495678 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggat 13495579  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||   |||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||||| || ||||||||||||||||   |    
T  13495578 tacatcatatttatctcaag-tttaaccacaaagagattagttactcataactaaagtacaagacaactcacataaaaacaaggattcatacatgtattg 13495480  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| || |||| ||||||||    
T  13495479 gataattgactatgagttgtgttggtctcccacca 13495445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 27282562 - 27282900
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27282562 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaattttcatattcataaagctagggttagtagtcgat 27282661  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||| ||||| || | |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27282662 gataaagatacaaaaaggattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggtgttcaacaaattagggttcccataggat 27282761  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacat-----aagaaaaaggattcatacatg 295  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||     || ||||| ||||||||||||    
T  27282762 tatatcagattcatctcagg-attaaccacaaagagattagttactcatagctaaagtacaagataactcacataaaaaaaaaaaaaagattcatacatg 27282860  T
Q  296 tgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    |   |||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  27282861 tattggataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 27282900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13493053 - 13492720
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13493053 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 13492954  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13492953 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataagat 13492854  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    ||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||   |||| |||||||||  ||||||| |||  |||| |||||| || ||||||||||||||||   |    
T  13492853 tacatcaaatttatctcaag-tttaaccacaaagagattaattactcataaataaagtacaagaaaactcacataaaaacaaggattcatacatgtattg 13492755  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| || |||| ||||||||    
T  13492754 gataattgactatgagttgtgttggtctcccacca 13492720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 16190626 - 16190967
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16190626 ttaaacttattacctagatcagagttaaaagccaaggttagtggtcatccaatctctaggatcaatttgcatattcataaagctaaggttagtagtcgat 16190725  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttc-----aaaggagttcaacaaattagggttcccat 195  Q
      |||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16190726 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcattgatattcaaattaaaggagttcaacaaattagggttcctat 16190825  T
Q  196 aggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatg 295  Q
    | ||||||||||||||||||| | || | ||| |||||   |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16190826 aagattacatcagattcatct-aagactcaaccacaaatagattagttacttatagctaaagtaaacgataactaacataaaaacaaggattcatacatg 16190924  T
Q  296 tgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    |   |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||    
T  16190925 tattggatgattgactatgaattttgatggttgcccaccagat 16190967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1936391 - 1936128
Alignment:
Q  28 aaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacac 127  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||     
T  1936391 aaagccatggttagtggtcatttaatctctaagatcaattttcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacat 1936292  T
Q  128 aaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaac 227  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |  | |||    
T  1936291 aaagtaatatgaattaaaactagacttccattgatattcaaaggagttcaacaaattatggttcccataagattacatgagattcatct-aagtctcaac 1936193  T
Q  228 gacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatac 292  Q
     |||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  || ||||||||||||    
T  1936192 cacaaagagattagttactcatagctaaagtacaagataactaccatagaaacaaggattcatac 1936128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34066135 - 34065929
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34066135 ttaaacttattacctaggtcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 34066036  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      ||||| |||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  34066035 gataaacgtacaaaaagcattaaacataacgtaatatgaattaaaactagattttcattgatattcaaaaaagttcaacaaattaggattcccataagat 34065936  T
Q  201 tacatca 207  Q
    |||||||    
T  34065935 tacatca 34065929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10759810 - 10759579
Alignment:
Q  103 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 202  Q
    |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10759810 taaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 10759711  T
Q  203 catcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaagga 302  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||   |||    
T  10759710 catcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtattgga 10759612  T
Q  303 tgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  10759611 taattgactatgagttgtgatggtctcccacca 10759579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22104824 - 22104956
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  22104824 ttaaacctattacatagttcagagttaaaaaccagaattagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagagttagtagtcgat 22104923  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggta 133  Q
      ||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  22104924 gataaacctacacaaaacattaaacacaaggta 22104956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 23990543 - 23990754
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttct--at--gatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagt 96  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||  ||||||| |||||||||||||||||     || ||||    
T  23990543 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctcttaattagatcaatttgcatattcataaagct-----tagtagt 23990637  T
Q  97 ctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccata 196  Q
    | ||  |||||||||| ||  |||| || | ||  |||| ||||| ||||||| |||||| |  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23990638 caatgataaacatacaaaaaacattgaagataatataatgtgaattaaaactagactttcttaaatattcagaggagttcaacaaattagtgttcccata 23990737  T
Q  197 ggattacatcagattca 213  Q
     ||||| ||||||||||    
T  23990738 agattaaatcagattca 23990754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 22456945 - 22457123
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaa-gctagggttaatagtc-- 97  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| | || |||||      
T  22456945 ttaaacctattacctaaaacagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatcagtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtagtcaa 22457044  T
Q  98 tatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca 177  Q
    |||  |||||||||| |   |||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |  ||||| ||||||||    
T  22457045 tataataaacatacaaacaacattgaaca-aaggtaatatgaattaaaactagacttccattaaaattcaagggagttca 22457123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 22453590 - 22453641
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaa 52  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22453590 ttaaacctattacctaaatcagagtcaaaagccagggctagtggtcattcaa 22453641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21153028 - 21152871
Alignment:
Q  19 tcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggc 118  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||| | || |||||  | ||||| | || ||||| ||| |||||||| | |   |    
T  21153028 tcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagttcaatttacacattcaagatgctagtgctagtagtcaatcataaacatataaacaac 21152929  T
Q  119 attaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca 177  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21152928 attaaacagaaggaaatatgaattaaa-ctagactttcattgatattcaagggagttca 21152871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49147781 - 49147740
Alignment:
Q  118 cattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcatt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  49147781 cattaaacacaaggtaatatgaattaaaactagacttccatt 49147740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9608 - 9463
Alignment:
Q  193 cataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatac 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608 cataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatac 9509  T
Q  293 atgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9508 atgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccactagat 9463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 9653 - 9606
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcat 48  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9653 ttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcat 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 99 - 432
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  99 ttaaacttattacctagatcagagtcaaaaaccagggttagtagtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaat 198  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  199 gataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 298  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaag 300  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |  ||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||   |    
T  299 tacatcagattcatctcaag-cttaaccatgaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattg 397  T
Q  301 gatgattgactcttagttttgatggtttcccacca 335  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  398 gataattgactatgagttgtgatggtctcccacca 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 12575754 - 12576048
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||  ||    
T  12575754 ttaaacctattaccttgatcaaagtcaaaagccaaggttagtagtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggctagttgttgat 12575853  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||| ||||| || || || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12575854 gataaagatacaaaaagcgttgaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggat 12575953  T
Q  201 tacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgt 296  Q
    |||||||||||||||| | |  | ||| |||||   ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  12575954 tacatcagattcatct-aagtctcaaccacaaagagattagttactcatcgctaaagtacaagataactaacataaaaacaatgattcatacatgt 12576048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13096812 - 13096606
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaag-ccagg-gttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtct 98  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||     
T  13096812 ttaaacttattacctaggtcagagttaaaaggccaggagttagtgatcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggatagtagtcg 13096713  T
Q  99 atcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagg 198  Q
    ||  |||||||||| ||| |||||||||          | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13096712 atgataaacatacaaaag-cattaaaca----------tcaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaataaatcagggttcccatagg 13096624  T
Q  199 attacatcagattcatct 216  Q
    |||||||||| |||||||    
T  13096623 attacatcaggttcatct 13096606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44008092 - 44007889
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| || |||  ||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44008092 ttaaacttattacctagttcagaatcaaaagccagagtcagtgttcattcaatctctacggtcaatttgcattttcataaagctagggtcaatagtcgat 44007993  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||| | || |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||    
T  44007992 gataaacata-aaaaagcattaaacaaagagtaataagaataaagactaaactttaattgaaattcaaaggagttcaacaaattaagg-aaccataggat 44007895  T
Q  201 tacatc 206  Q
    ||||||    
T  44007894 tacatc 44007889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 41779233 - 41779318
Alignment:
Q  103 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattaggg 188  Q
    |||||||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41779233 taaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatggataaagactaaactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattaggg 41779318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6265 - 6479
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6265 ttaaacttattacctagttcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgat 6364  T
Q  101 cgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggat 200  Q
      |||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6365 gataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaacact-gactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccataagat 6463  T
Q  201 tacatcagattcatct 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  6464 tacatcagattcatct 6479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 24638 - 24743
Alignment:
Q  1 ttaaacctattacctaagtcagagttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctat 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24638 ttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctatggttaatagtctat 24737  T
Q  101 cgtaaa 106  Q
    | ||||    
T  24738 cataaa 24743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 7086
Alignment:
Q  25 ttaaaagccagggttagttgtcattcaatttctatgatcaat 66  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7127 ttaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaat 7086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University