View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4890_low_24 (Length: 302)

Name: NF4890_low_24
Description: NF4890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4890_low_24
NF4890_low_24
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (1-299)||(22831503-22831801)
chr6 (1-299)||(16920455-16920751)
chr6 (1-287)||(11185517-11185801)
chr6 (1-299)||(20360782-20361081)
chr6 (1-299)||(20638105-20638404)
chr6 (125-299)||(35245586-35245758)
chr6 (1-299)||(29060540-29060840)
chr6 (1-298)||(18409648-18409947)
chr6 (1-299)||(25629176-25629476)
chr6 (8-299)||(22780056-22780348)
chr6 (44-299)||(19303406-19303661)
chr6 (1-299)||(17287618-17287917)
chr6 (1-74)||(18821641-18821714)
chr6 (47-299)||(20593773-20594026)
chr6 (180-299)||(16496244-16496365)
chr6 (231-299)||(27333271-27333339)
chr6 (231-299)||(27394011-27394079)
chr6 (231-299)||(20076700-20076767)
chr6 (231-299)||(28496524-28496592)
chr6 (231-299)||(29808935-29809003)
chr6 (231-278)||(9098567-9098614)
chr6 (231-278)||(25644341-25644388)
chr6 (234-278)||(19668392-19668436)
chr6 (231-278)||(19652216-19652263)
chr6 (231-278)||(20109159-20109206)
chr6 (245-299)||(1561303-1561357)
chr6 (234-278)||(25656647-25656690)
chr6 (231-278)||(23076751-23076798)
chr6 (231-278)||(35008169-35008216)
chr6 (237-299)||(25714417-25714478)
chr6 (237-278)||(2291284-2291324)
chr6 (231-276)||(4185874-4185919)
chr6 (237-278)||(8055047-8055087)
chr6 (237-278)||(12742335-12742375)
chr6 (237-278)||(18334696-18334736)
chr6 (237-278)||(18456737-18456777)
chr6 (237-278)||(18461897-18461937)
chr6 (237-278)||(18821904-18821944)
chr6 (237-278)||(19005064-19005104)
chr6 (237-278)||(19859023-19859063)
chr6 (237-278)||(22782245-22782285)
chr6 (237-278)||(24422565-24422605)
chr6 (237-278)||(25754827-25754867)
chr6 (237-278)||(26924744-26924784)
chr6 (237-278)||(30676814-30676854)
chr6 (237-278)||(33861812-33861852)
chr6 (237-278)||(33864296-33864336)
chr6 (44-163)||(25603250-25603370)
chr6 (235-278)||(1595567-1595609)
chr6 (252-299)||(22080799-22080846)
chr6 (235-278)||(23019427-23019470)
chr6 (235-278)||(25688520-25688562)
chr6 (231-278)||(33443068-33443114)
chr6 (237-278)||(1541015-1541055)
chr6 (237-278)||(3852121-3852161)
chr6 (246-275)||(16448639-16448668)
chr6 (237-278)||(20556996-20557036)
chr6 (237-278)||(34963391-34963431)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (1-299)||(20309108-20309404)
chr2 (1-299)||(37938-38235)
chr2 (1-299)||(23285865-23286160)
chr2 (1-299)||(23654208-23654507)
chr2 (1-278)||(298636-298915)
chr2 (1-299)||(22738002-22738300)
chr2 (1-299)||(22731055-22731355)
chr2 (1-299)||(23076442-23076741)
chr2 (1-299)||(23060513-23060810)
chr2 (15-299)||(22337115-22337400)
chr2 (182-299)||(23103399-23103516)
chr2 (15-299)||(23660023-23660307)
chr2 (1-145)||(27753730-27753874)
chr2 (1-163)||(32451751-32451913)
chr2 (84-201)||(40622114-40622233)
chr2 (231-299)||(23072002-23072070)
chr2 (231-278)||(7679606-7679653)
chr2 (231-278)||(28405997-28406044)
chr2 (235-299)||(23040247-23040310)
chr2 (231-278)||(22105430-22105476)
chr2 (231-298)||(22134260-22134326)
chr2 (231-278)||(23207298-23207345)
chr2 (231-278)||(25175871-25175918)
chr2 (233-278)||(18786958-18787003)
chr2 (231-299)||(8946657-8946724)
chr2 (231-299)||(19671830-19671898)
chr2 (182-278)||(7735-7833)
chr2 (235-278)||(20520250-20520293)
chr2 (231-278)||(23708672-23708719)
chr2 (231-278)||(32451982-32452029)
chr2 (233-275)||(23004772-23004814)
chr2 (237-278)||(571415-571455)
chr2 (237-278)||(6726013-6726053)
chr2 (237-278)||(18808961-18809001)
chr2 (237-278)||(21155164-21155204)
chr2 (237-278)||(23130880-23130920)
chr2 (237-278)||(23133347-23133387)
chr2 (237-278)||(23135608-23135648)
chr2 (237-278)||(23709636-23709676)
chr2 (237-278)||(23712117-23712157)
chr2 (237-278)||(24367792-24367832)
chr2 (237-278)||(24643054-24643094)
chr2 (237-278)||(26505397-26505437)
chr2 (237-278)||(26507875-26507915)
chr2 (237-278)||(34402626-34402666)
chr2 (237-278)||(39682331-39682371)
chr2 (237-278)||(43137317-43137357)
chr2 (246-278)||(28577117-28577149)
chr2 (246-278)||(32215033-32215065)
chr2 (246-278)||(38967392-38967424)
chr2 (246-278)||(45029966-45029998)
chr2 (231-278)||(22413191-22413238)
chr2 (231-278)||(23287384-23287430)
chr2 (231-278)||(25108908-25108955)
chr2 (231-278)||(26392403-26392449)
chr2 (246-278)||(24529641-24529673)
chr2 (246-278)||(32039610-32039642)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-299)||(1289-1585)
scaffold0106 (1-299)||(7266-7562)
scaffold0106 (231-296)||(15292-15356)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (1-299)||(27847655-27847951)
chr7 (1-297)||(40443393-40443688)
chr7 (1-299)||(10589039-10589337)
chr7 (1-299)||(16386069-16386369)
chr7 (1-299)||(12698831-12699131)
chr7 (1-299)||(9509189-9509488)
chr7 (1-299)||(26211995-26212294)
chr7 (1-296)||(3564185-3564482)
chr7 (15-299)||(38227481-38227765)
chr7 (85-278)||(18456319-18456512)
chr7 (231-299)||(16495402-16495470)
chr7 (231-299)||(28505351-28505419)
chr7 (231-299)||(34200786-34200854)
chr7 (84-201)||(12187113-12187227)
chr7 (84-201)||(17137969-17138083)
chr7 (231-299)||(67745-67813)
chr7 (231-299)||(13647325-13647392)
chr7 (231-299)||(11996080-11996148)
chr7 (231-278)||(811184-811231)
chr7 (235-278)||(18005667-18005710)
chr7 (231-278)||(44014199-44014246)
chr7 (231-299)||(16219770-16219835)
chr7 (234-299)||(47831807-47831872)
chr7 (245-299)||(15754954-15755008)
chr7 (229-299)||(22072913-22072983)
chr7 (182-278)||(16056349-16056446)
chr7 (238-278)||(17062019-17062059)
chr7 (231-278)||(2280172-2280219)
chr7 (234-277)||(12255849-12255892)
chr7 (231-278)||(14044767-14044814)
chr7 (231-278)||(14354797-14354844)
chr7 (236-278)||(15144096-15144137)
chr7 (237-299)||(18430709-18430770)
chr7 (237-278)||(456339-456379)
chr7 (237-278)||(3386351-3386391)
chr7 (237-278)||(11393391-11393431)
chr7 (237-278)||(11972514-11972554)
chr7 (237-278)||(14949226-14949266)
chr7 (237-278)||(15376817-15376857)
chr7 (237-278)||(16213702-16213742)
chr7 (237-278)||(16232538-16232578)
chr7 (237-278)||(16410077-16410117)
chr7 (237-278)||(18640290-18640330)
chr7 (237-278)||(20385227-20385267)
chr7 (237-278)||(21189699-21189739)
chr7 (237-278)||(24275189-24275229)
chr7 (237-278)||(24702256-24702296)
chr7 (237-278)||(24704706-24704746)
chr7 (237-278)||(32125509-32125549)
chr7 (237-278)||(41522935-41522975)
chr7 (237-278)||(41525397-41525437)
chr7 (182-278)||(48273410-48273508)
chr7 (231-275)||(12901347-12901391)
chr7 (246-278)||(13831391-13831423)
chr7 (246-278)||(13869364-13869396)
chr7 (231-271)||(14036282-14036322)
chr7 (231-271)||(14346312-14346352)
chr7 (246-278)||(20110574-20110606)
chr7 (231-278)||(1868048-1868095)
chr7 (233-276)||(15008554-15008597)
chr7 (231-278)||(18154895-18154941)
chr7 (231-278)||(20220241-20220288)
chr7 (232-278)||(10063872-10063918)
chr7 (1-106)||(15143858-15143964)
chr7 (231-273)||(48991206-48991248)
chr7 (237-278)||(27216878-27216918)
chr7 (246-275)||(38898489-38898518)
chr7 (237-278)||(44116527-44116567)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-299)||(16282-16578)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-299)||(51582-51878)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (1-299)||(16199468-16199765)
chr8 (1-299)||(31971257-31971554)
chr8 (1-299)||(45130820-45131117)
chr8 (92-299)||(21389366-21389571)
chr8 (92-299)||(21395896-21396101)
chr8 (92-299)||(21790389-21790594)
chr8 (97-299)||(21778697-21778897)
chr8 (1-299)||(21918822-21919121)
chr8 (1-299)||(18879059-18879352)
chr8 (1-299)||(20536208-20536507)
chr8 (1-298)||(28648865-28649164)
chr8 (15-299)||(22626736-22627020)
chr8 (1-299)||(21923750-21924049)
chr8 (1-299)||(18818231-18818530)
chr8 (1-161)||(25362962-25363123)
chr8 (1-278)||(23648574-23648853)
chr8 (1-299)||(7372778-7373069)
chr8 (44-299)||(22875065-22875321)
chr8 (44-302)||(6759255-6759512)
chr8 (231-299)||(5866327-5866395)
chr8 (231-299)||(17140916-17140984)
chr8 (231-299)||(21490995-21491063)
chr8 (1-299)||(23406379-23406680)
chr8 (44-299)||(16092206-16092463)
chr8 (231-299)||(23760897-23760962)
chr8 (231-299)||(6520368-6520436)
chr8 (231-299)||(38855304-38855372)
chr8 (231-278)||(983459-983506)
chr8 (231-278)||(21285618-21285665)
chr8 (231-278)||(24353041-24353088)
chr8 (231-278)||(26355751-26355798)
chr8 (231-278)||(37116368-37116415)
chr8 (249-299)||(21249384-21249434)
chr8 (249-299)||(21255222-21255272)
chr8 (231-275)||(19154940-19154984)
chr8 (231-278)||(13508138-13508185)
chr8 (231-278)||(17267047-17267094)
chr8 (231-278)||(20498583-20498630)
chr8 (231-278)||(21673725-21673772)
chr8 (237-278)||(1484420-1484460)
chr8 (237-278)||(4542477-4542517)
chr8 (237-278)||(5853396-5853436)
chr8 (237-278)||(14409548-14409588)
chr8 (237-278)||(16413420-16413460)
chr8 (237-278)||(19896283-19896323)
chr8 (237-278)||(20046299-20046339)
chr8 (237-278)||(20403245-20403285)
chr8 (237-278)||(22001771-22001811)
chr8 (246-278)||(15070576-15070608)
chr8 (231-299)||(17612163-17612231)
chr8 (246-278)||(26219735-26219767)
chr8 (246-278)||(26225359-26225391)
chr8 (246-278)||(45290807-45290839)
chr8 (235-278)||(13597674-13597717)
chr8 (231-274)||(17439560-17439603)
chr8 (246-276)||(19937118-19937148)
chr8 (237-278)||(15203335-15203375)
chr8 (237-278)||(41598206-41598246)
chr8 (246-278)||(19801493-19801525)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-299)||(874-1170)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-299)||(38801213-38801508)
chr1 (6-299)||(27250556-27250850)
chr1 (1-298)||(50210034-50210333)
chr1 (1-299)||(21026680-21026979)
chr1 (1-219)||(22354394-22354611)
chr1 (15-296)||(34509783-34510065)
chr1 (7-171)||(22356002-22356168)
chr1 (7-171)||(22357688-22357854)
chr1 (1-299)||(22532269-22532569)
chr1 (1-219)||(20135269-20135487)
chr1 (233-299)||(14295606-14295672)
chr1 (1-106)||(20847041-20847146)
chr1 (84-161)||(48603652-48603730)
chr1 (231-299)||(20847208-20847275)
chr1 (231-299)||(45574941-45575008)
chr1 (231-299)||(33681010-33681075)
chr1 (231-295)||(22921922-22921986)
chr1 (231-278)||(16758670-16758717)
chr1 (231-278)||(20918625-20918672)
chr1 (231-278)||(21754066-21754113)
chr1 (231-299)||(22237630-22237695)
chr1 (234-278)||(52928026-52928070)
chr1 (231-278)||(16368339-16368386)
chr1 (231-278)||(20454607-20454653)
chr1 (231-278)||(35261131-35261178)
chr1 (231-278)||(50614170-50614217)
chr1 (231-278)||(50621998-50622045)
chr1 (237-278)||(22123171-22123212)
chr1 (231-278)||(20248300-20248347)
chr1 (231-278)||(21861623-21861670)
chr1 (231-278)||(21896309-21896356)
chr1 (246-299)||(13212974-13213027)
chr1 (237-278)||(13988884-13988924)
chr1 (237-278)||(21840785-21840825)
chr1 (237-278)||(21923395-21923435)
chr1 (237-278)||(23593839-23593879)
chr1 (237-278)||(29298155-29298195)
chr1 (237-278)||(29776706-29776746)
chr1 (237-278)||(31612331-31612371)
chr1 (246-278)||(21342114-21342146)
chr1 (246-278)||(21346979-21347011)
chr1 (246-278)||(21707185-21707217)
chr1 (246-278)||(21711727-21711759)
chr1 (231-278)||(26064959-26065006)
chr1 (231-278)||(41050089-41050136)
chr1 (231-278)||(50686632-50686679)
chr1 (248-278)||(433030-433060)
chr1 (246-276)||(15860121-15860151)
chr1 (248-278)||(16361935-16361965)
chr1 (237-278)||(21475191-21475231)
chr1 (237-273)||(21161742-21161778)
chr1 (246-278)||(21714563-21714595)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-299)||(13497-13794)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-296)||(4953-5246)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-299)||(10248-10544)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-299)||(14053124-14053422)
chr4 (60-299)||(17046487-17046724)
chr4 (1-299)||(12902757-12903056)
chr4 (1-299)||(7088877-7089176)
chr4 (1-299)||(44052829-44053128)
chr4 (1-297)||(22636437-22636733)
chr4 (1-171)||(3096772-3096942)
chr4 (1-292)||(23374181-23374473)
chr4 (1-278)||(16377343-16377621)
chr4 (1-299)||(16239791-16240090)
chr4 (1-161)||(17047894-17048055)
chr4 (90-299)||(16270147-16270356)
chr4 (15-299)||(7893703-7893985)
chr4 (44-278)||(14038669-14038904)
chr4 (231-299)||(15551817-15551885)
chr4 (116-299)||(7798774-7798958)
chr4 (1-163)||(6190599-6190761)
chr4 (123-201)||(15121747-15121823)
chr4 (231-299)||(3096293-3096360)
chr4 (231-278)||(12288263-12288310)
chr4 (231-278)||(12774028-12774075)
chr4 (231-278)||(52243249-52243296)
chr4 (231-299)||(39706341-39706409)
chr4 (234-278)||(43198611-43198655)
chr4 (231-299)||(52873421-52873488)
chr4 (182-278)||(13853-13951)
chr4 (128-299)||(6899891-6900062)
chr4 (231-278)||(6190483-6190530)
chr4 (231-278)||(8846377-8846424)
chr4 (231-297)||(22353835-22353900)
chr4 (234-278)||(46640512-46640556)
chr4 (235-278)||(53082209-53082252)
chr4 (237-278)||(12411-12451)
chr4 (237-278)||(1837613-1837653)
chr4 (237-278)||(7641286-7641326)
chr4 (237-278)||(12610968-12611008)
chr4 (237-278)||(14280334-14280374)
chr4 (237-278)||(15118456-15118496)
chr4 (237-278)||(18215378-18215418)
chr4 (237-278)||(19618276-19618316)
chr4 (237-278)||(23803369-23803409)
chr4 (237-278)||(44615306-44615346)
chr4 (237-278)||(44773191-44773231)
chr4 (237-278)||(44928984-44929024)
chr4 (237-278)||(50222443-50222483)
chr4 (237-278)||(51463972-51464012)
chr4 (237-278)||(52312528-52312568)
chr4 (246-278)||(8574935-8574967)
chr4 (246-278)||(15355437-15355469)
chr4 (246-278)||(18239531-18239563)
chr4 (246-278)||(19242717-19242749)
chr4 (246-278)||(44102232-44102264)
chr4 (237-278)||(3515025-3515065)
chr4 (246-299)||(15367690-15367743)
chr4 (246-299)||(15370018-15370071)
chr4 (246-299)||(15371202-15371255)
chr4 (246-299)||(15373483-15373536)
chr4 (246-299)||(15402703-15402756)
chr4 (246-299)||(16223532-16223585)
chr4 (237-278)||(54798814-54798854)
chr4 (246-278)||(14970819-14970851)
chr4 (233-261)||(16596686-16596714)
chr4 (181-225)||(43256161-43256205)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (13-299)||(32067-32351)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-299)||(15287-15584)
scaffold0114 (123-203)||(7387-7465)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-299)||(46995-47285)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (1-299)||(21292792-21293090)
chr5 (1-299)||(23390318-23390617)
chr5 (1-299)||(8286664-8286964)
chr5 (1-299)||(22075018-22075317)
chr5 (1-299)||(25421532-25421832)
chr5 (15-299)||(24493569-24493853)
chr5 (15-296)||(24529223-24529505)
chr5 (1-299)||(25431395-25431694)
chr5 (1-299)||(13095495-13095794)
chr5 (1-299)||(13025311-13025610)
chr5 (16-162)||(22107210-22107357)
chr5 (47-299)||(9077952-9078205)
chr5 (182-292)||(37723910-37724020)
chr5 (15-161)||(21985983-21986130)
chr5 (233-299)||(36314577-36314643)
chr5 (46-299)||(1096467-1096721)
chr5 (231-299)||(19660888-19660956)
chr5 (84-201)||(18769910-18770024)
chr5 (84-201)||(22032415-22032529)
chr5 (133-299)||(21808343-21808510)
chr5 (180-299)||(21729064-21729185)
chr5 (123-201)||(23572178-23572254)
chr5 (231-299)||(21329550-21329618)
chr5 (231-278)||(20026994-20027041)
chr5 (231-278)||(22959585-22959632)
chr5 (199-299)||(21997553-21997655)
chr5 (231-278)||(21565563-21565610)
chr5 (231-299)||(21502209-21502277)
chr5 (231-278)||(26012088-26012135)
chr5 (233-278)||(22144070-22144115)
chr5 (237-278)||(264872-264912)
chr5 (237-278)||(10733044-10733084)
chr5 (237-278)||(11581303-11581343)
chr5 (234-299)||(19668898-19668963)
chr5 (237-278)||(20902113-20902153)
chr5 (245-278)||(20909030-20909063)
chr5 (237-278)||(20918052-20918092)
chr5 (237-278)||(29329952-29329992)
chr5 (237-278)||(39245154-39245194)
chr5 (237-278)||(39363402-39363442)
chr5 (246-278)||(2154726-2154758)
chr5 (246-278)||(23064529-23064561)
chr5 (246-278)||(36154892-36154924)
chr5 (246-278)||(38619452-38619484)
chr5 (231-278)||(22178274-22178321)
chr5 (85-136)||(22412337-22412388)
chr5 (231-278)||(26732886-26732932)
chr5 (248-278)||(10775790-10775820)
chr5 (246-275)||(18319146-18319175)
chr5 (237-278)||(42245469-42245509)
chr5 (246-278)||(20806854-20806886)
chr5 (246-278)||(26704092-26704124)
chr5 (234-278)||(26740702-26740745)
chr5 (246-278)||(26973825-26973857)
chr5 (246-278)||(29345998-29346030)
chr5 (246-278)||(31061086-31061118)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-299)||(4712-5011)
scaffold0358 (1-219)||(18-235)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-299)||(871-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-299)||(167801-168099)
scaffold0011 (1-299)||(51913-52211)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-299)||(1952-2251)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (1-299)||(20698258-20698556)
chr3 (1-299)||(13442274-13442573)
chr3 (1-299)||(17487856-17488155)
chr3 (1-299)||(17499338-17499637)
chr3 (1-299)||(12399209-12399507)
chr3 (1-278)||(14576654-14576932)
chr3 (15-299)||(18438534-18438819)
chr3 (44-299)||(14972854-14973110)
chr3 (1-299)||(23083183-23083482)
chr3 (1-299)||(26686887-26687186)
chr3 (15-278)||(14572610-14572873)
chr3 (1-278)||(40213542-40213820)
chr3 (1-299)||(25476206-25476506)
chr3 (6-163)||(30029975-30030133)
chr3 (1-161)||(16796685-16796846)
chr3 (15-299)||(11424599-11424880)
chr3 (1-275)||(43840956-43841231)
chr3 (85-278)||(24153115-24153308)
chr3 (231-299)||(13210380-13210448)
chr3 (84-161)||(14179570-14179648)
chr3 (13-278)||(42386431-42386698)
chr3 (231-295)||(49668129-49668193)
chr3 (231-278)||(12174312-12174359)
chr3 (231-278)||(32307698-32307745)
chr3 (231-299)||(15470927-15470992)
chr3 (231-295)||(9512924-9512988)
chr3 (231-295)||(9520899-9520963)
chr3 (234-278)||(28194711-28194755)
chr3 (231-278)||(16097349-16097396)
chr3 (231-278)||(52523782-52523829)
chr3 (234-278)||(27165268-27165312)
chr3 (231-278)||(16103801-16103848)
chr3 (231-278)||(22110405-22110452)
chr3 (231-278)||(43925979-43926026)
chr3 (84-201)||(856234-856348)
chr3 (249-299)||(43550594-43550644)
chr3 (231-275)||(606379-606423)
chr3 (231-299)||(14234487-14234555)
chr3 (234-278)||(53301607-53301651)
chr3 (231-278)||(37251221-37251268)
chr3 (235-278)||(53070755-53070797)
chr3 (237-278)||(6469238-6469278)
chr3 (237-278)||(7781451-7781491)
chr3 (237-278)||(8899112-8899152)
chr3 (237-278)||(9707711-9707751)
chr3 (237-278)||(12567578-12567618)
chr3 (237-278)||(13544043-13544083)
chr3 (237-278)||(15977533-15977573)
chr3 (237-278)||(16282915-16282955)
chr3 (237-278)||(17463196-17463236)
chr3 (237-278)||(17737254-17737294)
chr3 (237-278)||(28848715-28848755)
chr3 (237-278)||(29172687-29172727)
chr3 (237-278)||(34159344-34159384)
chr3 (237-278)||(38961995-38962035)
chr3 (237-278)||(45607011-45607051)
chr3 (237-278)||(50242840-50242880)
chr3 (237-278)||(55476509-55476549)
chr3 (237-278)||(55500960-55501000)
chr3 (246-278)||(8499536-8499568)
chr3 (246-278)||(10557003-10557035)
chr3 (246-278)||(15412447-15412479)
chr3 (246-278)||(17672644-17672676)
chr3 (246-278)||(21618467-21618499)
chr3 (235-299)||(24340780-24340844)
chr3 (246-278)||(36166616-36166648)
chr3 (246-278)||(41123908-41123940)
chr3 (246-278)||(45577950-45577982)
chr3 (231-278)||(12377942-12377989)
chr3 (231-278)||(23274708-23274755)
chr3 (233-278)||(13919350-13919394)
chr3 (237-278)||(16454385-16454425)
chr3 (246-278)||(10247835-10247867)
chr3 (246-278)||(12119837-12119869)
chr3 (237-273)||(17446759-17446794)
chr3 (246-278)||(44494827-44494859)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-299)||(13211-13510)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-299)||(1851-2150)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-220)||(6691-6909)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-299)||(3470-3769)
scaffold0292 (15-278)||(364-627)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-299)||(5943-6245)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-278)||(24123-24403)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (15-299)||(2987-3271)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-299)||(4849-5147)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-299)||(38761-39060)
scaffold0145 (90-299)||(32942-33151)
scaffold0145 (237-278)||(9767-9807)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-299)||(20910-21210)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-207)||(124679-124884)
scaffold0021 (182-298)||(174767-174883)
scaffold0021 (231-299)||(121766-121833)
scaffold0021 (231-278)||(136422-136469)
scaffold0021 (231-278)||(145130-145177)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-278)||(339772-340047)
scaffold0003 (237-278)||(158554-158594)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (13-298)||(17049-17337)
scaffold0056 (237-278)||(79388-79428)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (15-278)||(22904-23167)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-161)||(1052-1213)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-278)||(25886-26165)
scaffold0122 (44-147)||(33360-33463)
scaffold0122 (182-278)||(44709-44807)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (16-299)||(39913-40196)
scaffold0080 (231-278)||(19938-19985)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-299)||(25896-26195)
scaffold0026 (1-299)||(39858-40156)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-107)||(11335-11441)
scaffold0235 (184-299)||(11447-11564)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-299)||(8479-8774)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (1-137)||(3644-3780)
scaffold0165 (1-137)||(7708-7844)
scaffold0165 (233-278)||(27804-27849)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (47-278)||(39498-39729)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (47-278)||(75083-75314)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-299)||(8354-8650)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (13-219)||(4589-4794)
scaffold0228 (13-219)||(12171-12376)
scaffold0228 (13-219)||(22123-22328)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-163)||(51706-51868)
scaffold0034 (231-278)||(32557-32604)
scaffold0034 (231-278)||(51937-51983)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (84-201)||(26922-27036)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-106)||(20597-20702)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (45-299)||(16466-16721)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-219)||(13174-13391)
scaffold0175 (231-299)||(34123-34191)
scaffold0175 (246-299)||(273-326)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-120)||(17809-17928)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (96-298)||(3103-3306)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (44-219)||(27912-28086)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (231-299)||(1122-1190)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (231-299)||(11292-11360)
scaffold0046 (231-299)||(1997-2065)
scaffold0046 (180-299)||(28414-28535)
scaffold0046 (243-299)||(4552-4608)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (231-299)||(119875-119943)
scaffold0023 (231-278)||(100395-100442)
scaffold0023 (231-278)||(40227-40274)
scaffold0023 (231-278)||(101520-101567)
scaffold0023 (237-278)||(44472-44512)
scaffold0023 (237-278)||(94429-94469)
scaffold0023 (246-278)||(17552-17584)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (84-201)||(12857-12971)
scaffold0029 (237-278)||(11306-11346)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (84-201)||(1975-2089)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (84-201)||(21712-21826)
scaffold0210 (84-201)||(29604-29718)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (231-299)||(6535-6603)
scaffold0621 (231-278)||(8487-8534)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (231-278)||(1053-1100)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (231-278)||(19285-19332)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (122-299)||(32901-33077)
scaffold0120 (122-299)||(45928-46104)
scaffold0120 (231-299)||(16113-16180)
scaffold0120 (237-299)||(17389-17450)
scaffold0120 (15-56)||(16331-16372)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (231-299)||(23936-24001)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (231-295)||(2859-2923)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (231-299)||(6611-6679)
scaffold0333 (231-299)||(13991-14059)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (231-299)||(6176-6244)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (231-299)||(15830-15898)
scaffold0020 (246-278)||(178915-178947)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (231-301)||(160685-160752)
scaffold0001 (246-296)||(85692-85742)
scaffold0001 (237-278)||(501102-501142)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (231-278)||(1103-1150)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (231-278)||(6833-6880)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (231-278)||(10594-10641)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (231-278)||(5664-5711)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (231-278)||(15682-15729)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (231-278)||(2698-2745)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (231-278)||(14750-14797)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (233-299)||(1089-1155)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (13-162)||(797-947)
scaffold0395 (232-299)||(4888-4954)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (13-278)||(4545-4810)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (234-278)||(22726-22770)
scaffold0037 (237-278)||(82090-82130)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (231-275)||(62222-62266)
scaffold0028 (235-295)||(132662-132722)
scaffold0028 (237-278)||(134229-134269)
scaffold0028 (237-278)||(136698-136738)
scaffold0028 (237-278)||(139167-139207)
scaffold0028 (237-278)||(144105-144145)
scaffold0028 (237-278)||(141636-141676)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (231-278)||(571-618)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (231-278)||(12787-12834)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (231-278)||(8127-8174)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (231-278)||(45845-45892)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (231-278)||(25127-25174)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (231-278)||(129024-129070)
scaffold0022 (231-276)||(78345-78390)
scaffold0022 (246-278)||(116448-116480)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (231-278)||(129926-129973)
scaffold0010 (231-275)||(60769-60813)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (231-299)||(12942-13007)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (84-219)||(3434-3569)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (231-276)||(38339-38384)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (44-137)||(10326-10419)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (235-295)||(32102-32162)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (234-278)||(38758-38802)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (231-278)||(150-197)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (231-278)||(6337-6384)
scaffold0420 (233-278)||(13793-13838)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (231-278)||(12589-12636)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (231-278)||(13149-13196)
scaffold0357 (233-278)||(16155-16200)
scaffold0357 (231-278)||(2682-2729)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (231-278)||(10548-10595)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (182-278)||(53551-53649)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (237-278)||(4315-4355)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (237-278)||(4712-4752)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (237-278)||(11984-12024)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (231-272)||(11491-11532)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (237-278)||(10791-10831)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (237-278)||(13410-13450)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (237-278)||(9260-9300)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (237-278)||(20765-20805)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (237-278)||(29950-29990)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (237-278)||(16802-16842)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (237-278)||(37839-37879)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (231-272)||(38309-38350)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (237-278)||(20482-20522)
scaffold0031 (245-299)||(128751-128805)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (235-299)||(18084-18148)
scaffold0247 (246-278)||(2241-2273)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (231-278)||(28822-28870)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (231-278)||(8114-8161)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (231-278)||(2696-2743)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (231-278)||(97026-97073)
scaffold0006 (231-278)||(106304-106351)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (237-278)||(124-164)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (237-278)||(12353-12393)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (237-278)||(13965-14005)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (237-278)||(40418-40458)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (233-278)||(103686-103731)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (246-278)||(23860-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (246-278)||(36471-36503)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (246-278)||(1393-1425)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (250-278)||(161206-161234)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22831801 - 22831503
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  22831801 agtgacttgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtg 22831702  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831701 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 22831602  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831601 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 16920455 - 16920751
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||| ||    
T  16920455 agtgacttgttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatg 16920554  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  16920555 aagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaatggaat 16920652  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||  ||||||||||  |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16920653 ttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11185801 - 11185517
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||  | | ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||    
T  11185801 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtg 11185702  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  11185701 aagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--aaagatgctgatgaattgaat 11185604  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttga 287  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11185603 ttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 20360782 - 20361081
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||    
T  20360782 agtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtg 20360881  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  20360882 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 20360979  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||| |||||||    
T  20360980 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatga 20361078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 20638105 - 20638404
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  20638105 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 20638204  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||| |    
T  20638205 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaat--attaaagatgttgataaattgca 20638302  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||    
T  20638303 attgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 20638401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  125 tgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt 224  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacat--aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 35245661  T
Q  225 gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    | | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35245660 gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29060840 - 29060540
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||| ||| |||||| | | |||  |||| ||||||||||    
T  29060840 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgt 29060741  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||||   | |||||||| ||| |||     
T  29060740 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatac--ttgagatgttgttgacttgc 29060643  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  29060642 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatg 29060544  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  29060543 atgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 18409648 - 18409947
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| |||    
T  18409648 agtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgt 18409747  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||  || ||  || | |||||||| ||| |||     
T  18409748 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggat-gat-tgagatgttgttgacttgc 18409845  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   | | | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  18409846 atttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 25629176 - 25629476
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||  ||||| ||||||||||    
T  25629176 agtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgt 25629275  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||| || | |||||||| ||| |||     
T  25629276 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttgc 25629373  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||   | | | ||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  25629374 atttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 25629472  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  25629473 atgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 299
Target Start/End: Original strand, 22780056 - 22780348
Alignment:
Q  8 tgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctga 107  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||||| | | ||| |||||  ||||||||||||||||     
T  22780056 tgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgt 22780155  T
Q  108 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgata 206  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||| | ||||||    
T  22780156 ttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgcaattgata 22780253  T
Q  207 tgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    | |||||||||   |||  ||| | | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||    
T  22780254 ttattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Original strand, 19303406 - 19303661
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataa 143  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||| || | | ||| ||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19303406 agagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 19303505  T
Q  144 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt--gaacagtgcctatgtt 240  Q
    |||| | | |||||||||||  |||  |||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||  | | | | ||| ||||    
T  19303506 tgttatgtacattacttgaaatatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgtt 19303603  T
Q  241 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  19303604 gttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 17287618 - 17287917
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||  ||||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||| |||||    
T  17287618 agtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtg 17287717  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||  |||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||| |    
T  17287718 aagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgca 17287815  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||    
T  17287816 attgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17287914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 18821641 - 18821714
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactt 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18821641 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20594026 - 20593773
Alignment:
Q  47 gttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt 146  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| | | | | | ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  20594026 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgt 20593927  T
Q  147 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgc 242  Q
    | || |||||||||||   ||| ||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||   | | | ||| | ||||||    
T  20593926 tatacgcattacttgatttatgattgtata-at-tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgc 20593829  T
Q  243 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||    
T  20593828 tgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16496365 - 16496244
Alignment:
Q  180 taagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||  |   ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496365 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16496267  T
Q  277 tactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||   ||||||||||||||||||    
T  16496266 taagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 27333271 - 27333339
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  27333271 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 27394011 - 27394079
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  27394011 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20076767 - 20076700
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 28496524 - 28496592
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  28496524 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 29808935 - 29809003
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29808935 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 9098567 - 9098614
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098567 tgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9098614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25644388 - 25644341
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644388 tgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668392
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 19668392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19652263 - 19652216
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19652263 tgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 19652216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20109206 - 20109159
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20109206 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 20109159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1561357 - 1561303
Alignment:
Q  245 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  1561357 tttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25656690 - 25656647
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656690 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25656647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23076798 - 23076751
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23076798 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23076751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35008216 - 35008169
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35008216 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 35008169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 2291284 - 2291324
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291284 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 2291324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 276
Target Start/End: Original strand, 4185874 - 4185919
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185874 tgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8055087 - 8055047
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055087 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8055047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12742375 - 12742335
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742375 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12742335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 18334696 - 18334736
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334696 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18334736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18456777 - 18456737
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456777 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18456737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18461937 - 18461897
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461937 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18461897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821944
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18821944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19005104 - 19005064
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005104 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 19005064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 19859023 - 19859063
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859023 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 19859063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22782285 - 22782245
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782285 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22782245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24422605 - 24422565
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422605 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24422565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25754867 - 25754827
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754867 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25754827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 26924744 - 26924784
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924744 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26924784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 30676814 - 30676854
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676814 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 30676854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33861852 - 33861812
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861852 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 33861812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33864336 - 33864296
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864336 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 33864296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Original strand, 25603250 - 25603370
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataa 143  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |  || ||| | || ||||||||||||||  |||||| | | ||  |||||||||||||| ||| |    
T  25603250 agagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatga 25603349  T
Q  144 tgtt-tatgcattacttgaag 163  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  25603350 tgttgtatacattacttgaag 25603370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1595609 - 1595567
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1595609 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 1595567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  252 tttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23019470 - 23019427
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019470 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25688562 - 25688520
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25688562 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 25688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33443114 - 33443068
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443114 tgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 1541015 - 1541055
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1541015 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 1541055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852161
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtcta 3852161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 275
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448668
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 16448668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 20556996 - 20557036
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20556996 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20557036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34963431 - 34963391
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34963431 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 34963391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20309404 - 20309108
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  20309404 agtgacttgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtg 20309305  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20309304 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaat 20309207  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20309206 ttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 37938 - 38235
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||| ||    
T  37938 agtgacttgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctg 38037  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||     
T  38038 aagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--taagatgatgatgaatcgaaa 38135  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||  |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23286160 - 23285865
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  23286160 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtg 23286061  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  23286060 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 23285963  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
     ||||||| |||||||| |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  23285962 attgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 23654208 - 23654507
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||||||    
T  23654208 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtg 23654307  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  23654308 aagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 23654405  T
Q  200 tttgatatgattatgtc---atgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||| |   |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23654406 attgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 23654504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 298636 - 298915
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||    
T  298636 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtg 298735  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  298736 aagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 298833  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
     |||||||  ||||||||||  |   ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298834 attgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 298915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 22738002 - 22738300
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  22738002 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 22738101  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  22738102 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 22738199  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||    
T  22738200 attgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatga 22738297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 22731055 - 22731355
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttggg-taggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||  || || | ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |  || ||||| ||||||||||    
T  22731055 agtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgt 22731154  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||||||||||||     
T  22731155 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaatatgttgatgaattgc 22731252  T
Q  199 atttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    | ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  22731253 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  22731352 atgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23076741 - 23076442
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||  || |||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  23076741 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtg 23076642  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || |||||| ||| ||| ||| |    
T  23076641 aagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatattgttgacttgca 23076544  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  23076543 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatga 23076445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23060810 - 23060513
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||| || |||||| |||  ||||| | | ||| ||||| |||||| ||||    
T  23060810 agtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtg 23060713  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  ||  || |||||||||| ||| ||| |    
T  23060712 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaat--atttaagatgttgttgacttgca 23060615  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  23060614 attgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22337400 - 22337115
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||    
T  22337400 ttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagat 22337301  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||  ||| ||||||||| |||||    
T  22337300 atgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattat 22337203  T
Q  214 gtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||   |||  ||  | |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22337202 gtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 299
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt-gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctact 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  281 atgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23660307 - 23660023
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    ||||| |||| || ||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||   | ||| ||||| |||||| ||| ||||||  ||||||    
T  23660307 ttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagat 23660208  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||| ||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  23660207 gtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaat--atttaagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23660110  T
Q  214 gtcatgtcgtt--gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||   |||  | | | |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  23660109 gtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27753874 - 27753730
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||    
T  27753874 agtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtg 27753775  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg 145  Q
    || |||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27753774 aaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 32451751 - 32451913
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||  |||  |||| || ||| ||||    
T  32451751 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtg 32451850  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaag 163  Q
    ||||||  || |  |||||  |||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  32451851 aagctg-ttatgggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgtatacgcattacttgaag 32451913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 40622114 - 40622233
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgta---tacatct 180  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |  |    
T  40622114 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacat 40622212  T
Q  181 aagatgttgatgaattgaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40622213 aagatgttgatgaattgaatt 40622233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 23072002 - 23072070
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7679653 - 7679606
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7679653 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 7679606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28406044 - 28405997
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28406044 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 28405997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22105476 - 22105430
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105476 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22105430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Original strand, 22134260 - 22134326
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  22134260 tgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23207345 - 23207298
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23207345 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23207298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25175918 - 25175871
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25175918 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtcta 25175871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Original strand, 18786958 - 18787003
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786958 cctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18787003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8946724 - 8946657
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  8946724 tgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19671898 - 19671830
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  19671898 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7833
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt--gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||| |||  | | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtcta 7833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Original strand, 20520250 - 20520293
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20520250 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 20520293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 23708672 - 23708719
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23708672 tgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtcta 23708719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 32451982 - 32452029
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32451982 tgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtcta 32452029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23004814 - 23004772
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23004814 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 23004772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 571455 - 571415
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571455 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 571415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6726053 - 6726013
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726053 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 6726013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18809001 - 18808961
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809001 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18808961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 21155164 - 21155204
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21155204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23130920 - 23130880
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130920 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23133387 - 23133347
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133387 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23133347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23135648 - 23135608
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135648 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23135608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 23709636 - 23709676
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709636 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23709676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 23712117 - 23712157
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712117 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23712157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24367832 - 24367792
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367832 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24367792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643094
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24643094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26505437 - 26505397
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505437 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26505397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26507915 - 26507875
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507915 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26507875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 34402626 - 34402666
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402626 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34402666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39682371 - 39682331
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682371 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 39682331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137317
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 43137317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577117
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28577117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 32215033 - 32215065
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215033 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32215065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967392
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 38967392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45029998
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45029998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 22413191 - 22413238
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22413191 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 22413238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23287430 - 23287384
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287430 tgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25108955 - 25108908
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25108955 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtcta 25108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26392449 - 26392403
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392449 tgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529673
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtcta 24529673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039642
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtcta 32039642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1585 - 1289
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||    
T  1585 agtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatg 1486  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1485 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--taagatgttgatgaattgaat 1388  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1387 ttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7562 - 7266
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||    
T  7562 agtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatg 7463  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7462 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--taagatgttgatgaattgaat 7365  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7364 ttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 296
Target Start/End: Original strand, 15292 - 15356
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  15292 tgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 27847655 - 27847951
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||    
T  27847655 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtg 27847754  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27847755 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--taagatgttgatgaattgaat 27847852  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27847853 ttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40443688 - 40443393
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  40443688 agtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtg 40443589  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  40443588 aagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac--ctaagatgttgatgaattgaaa 40443491  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatg-tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10589337 - 10589039
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  10589337 agtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttggacctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtg 10589238  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||   |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||  ||||||||| ||||||| |     
T  10589237 aagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttg--aacattgaagatgttgttgaattgcaa 10589140  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||    
T  10589139 ttgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgat 10589041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 16386069 - 16386369
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  16386069 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtg 16386168  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||  || ||||||||||||||| |  |    
T  16386169 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaat--atttaagatgttgatgaaataca 16386266  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     |||||||  ||||||||||  |   ||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16386267 attgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 16386366  T
Q  297 tgt 299  Q
    |||    
T  16386367 tgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12699131 - 12698831
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || | |  || ||||| |||||||||||    
T  12699131 agtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtg 12699032  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  12699031 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 12698934  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg----ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
     ||||||| |||||||||||  |    ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  12698933 attgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  12698834 atgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9509488 - 9509189
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  9509488 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 9509389  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  9509388 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 9509291  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  9509290 attgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 9509192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26212294 - 26211995
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||||||    
T  26212294 agtgatttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtg 26212196  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  26212195 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 26212098  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaag-atgatg 295  Q
     ||||||| |||||||||||  |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  26212097 attgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatg 26211999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 3564185 - 3564482
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| || |    
T  3564185 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctat 3564284  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||  |||  |||||| || | |||||||| ||| ||      
T  3564285 gaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttac 3564382  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  3564383 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38227765 - 38227481
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| |   ||||||    
T  38227765 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagat 38227666  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  38227665 atgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgcatttgatattattat 38227568  T
Q  214 gtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||  |  ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||    
T  38227567 gtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 278
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456512
Alignment:
Q  85 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaag 18456416  T
Q  184 atgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456417 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18456512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16495470 - 16495402
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 28505351 - 28505419
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  28505351 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34200854 - 34200786
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34200854 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12187227 - 12187113
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  12187227 gttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taag 12187131  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12187130 atgttgatgaattgaatt 12187113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 17137969 - 17138083
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  17137969 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taag 17138065  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17138066 atgttgatgaattgaatt 17138083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 67813 - 67745
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  67813 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13647392 - 13647325
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  13647392 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 11996080 - 11996148
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  11996080 tgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 811184 - 811231
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811184 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 811231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18005710 - 18005667
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005710 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18005667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44014246 - 44014199
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014246 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44014199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 16219770 - 16219835
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  16219770 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 47831872 - 47831807
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  47831872 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 15754954 - 15755008
Alignment:
Q  245 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  15754954 tttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22072983 - 22072913
Alignment:
Q  229 agtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   || | |||||||||||||    
T  22072983 agtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056349
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt-gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||| ||| | | | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 17062019 - 17062059
Alignment:
Q  238 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062019 gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17062059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 2280172 - 2280219
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2280172 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 2280219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 277
Target Start/End: Original strand, 12255849 - 12255892
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255849 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14044814 - 14044767
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14044814 tgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 14044767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14354844 - 14354797
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14354844 tgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 14354797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 278
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144137
Alignment:
Q  236 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15144137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18430770 - 18430709
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  18430770 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 456379 - 456339
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456379 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 456339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386351
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 3386351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 11393391 - 11393431
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 11393431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11972554 - 11972514
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972554 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 11972514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 14949226 - 14949266
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949226 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14949266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 15376817 - 15376857
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376817 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15376857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16213742 - 16213702
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213742 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16213702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16232578 - 16232538
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232578 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16232538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16410117 - 16410077
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410117 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16410077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18640330 - 18640290
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640330 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18640290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 20385227 - 20385267
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385227 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20385267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 21189699 - 21189739
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189699 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21189739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24275229 - 24275189
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275229 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24275189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24702296 - 24702256
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702296 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24702256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24704746 - 24704706
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24704706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32125549 - 32125509
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125549 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32125509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41522975 - 41522935
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522975 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 41522935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41525437 - 41525397
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525437 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 41525397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273410
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||   | | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12901391 - 12901347
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12901391 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 12901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831391
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13831391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869364
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13869364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14036322 - 14036282
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 271  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036322 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14346352 - 14346312
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 271  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346352 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110574
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20110574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 1868048 - 1868095
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1868048 tgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 1868095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 276
Target Start/End: Original strand, 15008554 - 15008597
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008554 cctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 18154895 - 18154941
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18154895 tgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 18154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 20220241 - 20220288
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20220241 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtcta 20220288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 278
Target Start/End: Original strand, 10063872 - 10063918
Alignment:
Q  232 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  10063872 gcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtcta 10063918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 15143858 - 15143964
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||  |||||| | |||||||| | | ||| ||| | ||||||||||    
T  15143858 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgt 15143957  T
Q  100 gaagctg 106  Q
     ||||||    
T  15143958 caagctg 15143964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48991248 - 48991206
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 273  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991248 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27216918 - 27216878
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27216918 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtcta 27216878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 275
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898518
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38898518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44116567 - 44116527
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44116567 tgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 44116527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16578 - 16282
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  16578 agtgacttgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtg 16479  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  16478 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--taatatgttgatgaattgaat 16381  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16380 ttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51878 - 51582
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  51878 agtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtg 51779  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51778 aagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaat 51681  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||| ||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  51680 ttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 16199468 - 16199765
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  16199468 agtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtg 16199567  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  16199568 aagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac--ctaagatgtagatgaattgaaa 16199665  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcg-ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31971554 - 31971257
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  31971554 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtg 31971455  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |     
T  31971454 aagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattggaa 31971357  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 45130820 - 45131117
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  45130820 agtgacttattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtg 45130919  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaa-ttgaa 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  45130920 aagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatac--ctaagatgttgatgaatttgaa 45131017  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatg-tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
     ||||||| ||||||||||| |  |||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45131018 attgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Original strand, 21389366 - 21389571
Alignment:
Q  92 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21389366 taatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat--aagatgttgat 21389463  T
Q  192 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21389464 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 21389563  T
Q  292 gatgatgt 299  Q
    ||||||||    
T  21389564 gatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Original strand, 21395896 - 21396101
Alignment:
Q  92 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21395896 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat--aagatgttgat 21395993  T
Q  192 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 291  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21395994 gaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 21396093  T
Q  292 gatgatgt 299  Q
    ||||||||    
T  21396094 gatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Original strand, 21790389 - 21790594
Alignment:
Q  92 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21790389 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat--aagatgttgat 21790486  T
Q  192 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 291  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21790487 gaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 21790586  T
Q  292 gatgatgt 299  Q
    ||||||||    
T  21790587 gatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 299
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  97 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaatt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--taagatgttgatgaatt 21778794  T
Q  197 gaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21778795 gaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 21778894  T
Q  297 tgt 299  Q
    |||    
T  21778895 tgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 21918822 - 21919121
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||  |||||||    
T  21918822 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtg 21918921  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaa-tgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  21918922 aagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 21919019  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  21919020 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21919118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 18879059 - 18879352
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  18879059 agtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtg 18879158  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  18879159 aagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 18879255  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
     ||||||| |||||||  |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  18879256 attgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20536507 - 20536208
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  20536507 agtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 20536408  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  20536407 aagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 20536310  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  20536309 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 20536211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 28648865 - 28649164
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| |||    
T  28648865 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgt 28648964  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  |||||| || |||||||||| ||| |||     
T  28648965 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtata-at-taagatgttgttgacttgc 28649062  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||   | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  28649063 atttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22627020 - 22626736
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  22627020 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagat 22626921  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  22626920 gtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgatttgtatttgatattattat 22626823  T
Q  214 gtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22626822 gtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 21923750 - 21924049
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  21923750 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 21923849  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| ||| |    
T  21923850 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgca 21923947  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| || ||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  21923948 attgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 21924046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 18818231 - 18818530
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  || |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  18818231 agtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 18818330  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||  |    
T  18818331 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttaca 18818428  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  18818429 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18818527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 25362962 - 25363123
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||    
T  25362962 agtgccttgtgagactttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtg 25363061  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 161  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363062 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23648853 - 23648574
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattt-tgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| | | | ||| ||||| ||||||||||    
T  23648853 agtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgt 23648754  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
     ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||  || |||||||||| || ||||     
T  23648753 taagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaat--atttaagatgttgttgtattgc 23648656  T
Q  199 atttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |  |||||| |||||||||   ||| |||| |   |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  23648655 aaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtcta 23648574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7373069 - 7372778
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | | | |||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  7373069 agtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 7372970  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||| |     
T  7372969 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgcaa 7372879  T
Q  201 ttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  7372878 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 7372780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22875321 - 22875065
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgatgtgttata 142  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||  | | ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22875321 agagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22875222  T
Q  143 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgt 239  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |  ||| | | ||||| |||    
T  22875221 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgt 22875124  T
Q  240 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22875123 tgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6759512 - 6759255
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg-aataagatatgttgttgttgattatgatgtgttata 142  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6759512 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 6759413  T
Q  143 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatg 238  Q
    ||||| || |||||| |||||  |||  |||||| || | ||||||   ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |   ||| | | ||||| ||    
T  6759412 atgttatacgcattaattgaattatgagtgtata-at-tgagatgt---tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtg 6759318  T
Q  239 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgtcca 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  6759317 ttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 5866327 - 5866395
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5866327 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17140984 - 17140916
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17140984 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21491063 - 21490995
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21491063 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23406680 - 23406379
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||  | ||||||||||| || || ||  |||  ||||| | |  || ||||| |||||| ||||    
T  23406680 agtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtg 23406581  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgtt--gatgaattg 197  Q
    ||| ||  |||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | ||||||| |  | ||| |||    
T  23406580 aagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata--tttaagatgatatgttgacttg 23406483  T
Q  198 aatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgat 294  Q
     | ||||||| |||||||||||| |||   | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  23406482 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23406384  T
Q  295 gatgt 299  Q
    |||||    
T  23406383 gatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Original strand, 16092206 - 16092463
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgatgtgttata 142  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||||| | | ||| ||||| |||||| || |||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16092206 agagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 16092305  T
Q  143 atgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatg 238  Q
    ||||| || ||||||||| ||  |||  ||||||  | | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||   | | | ||||| ||    
T  16092306 atgttatacgcattacttaaattatgaatgtata--tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtg 16092403  T
Q  239 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  16092404 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 23760897 - 23760962
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  23760897 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6520436 - 6520368
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  6520436 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 38855304 - 38855372
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  38855304 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 983459 - 983506
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983459 tgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21285665 - 21285618
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285665 tgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24353088 - 24353041
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24353088 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 24353041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 26355751 - 26355798
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26355751 tgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 26355798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37116415 - 37116368
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37116415 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 37116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  249 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  249 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 275
Target Start/End: Original strand, 19154940 - 19154984
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19154940 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 19154984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 13508138 - 13508185
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13508138 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtcta 13508185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 17267047 - 17267094
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17267047 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 17267094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20498630 - 20498583
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20498630 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 20498583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673725
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtcta 21673725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1484460 - 1484420
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484460 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1484420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542517
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 4542517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 5853396 - 5853436
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853396 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 5853436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 14409548 - 14409588
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409548 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14409588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 16413420 - 16413460
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413420 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16413460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896283
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 19896283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 20046299 - 20046339
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046299 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20046339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20403285 - 20403245
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403285 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20403245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22001811 - 22001771
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001811 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22001771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070576
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15070576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 17612163 - 17612231
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  17612163 tgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219735
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26219735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225391
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26225391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290839
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45290839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Original strand, 13597674 - 13597717
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13597674 tatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtcta 13597717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 274
Target Start/End: Original strand, 17439560 - 17439603
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 274  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17439560 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 17439603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 276
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937148
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19937148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 15203335 - 15203375
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15203335 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctcta 15203375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41598246 - 41598206
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41598246 tgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 41598206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 19801493 - 19801525
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19801493 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtcta 19801525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 874 - 1170
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||    
T  874 agtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtg 973  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  974 aagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaaa 1071  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1072 ttgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 38801213 - 38801508
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||    
T  38801213 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtg 38801312  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||    
T  38801313 aagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtat--atataatatgttgatgaattgaat 38801410  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  38801411 ttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 27250556 - 27250850
Alignment:
Q  6 cttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagct 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  27250556 cttgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagct 27250655  T
Q  106 gaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttga 204  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||| | ||||    
T  27250656 gtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaattga 27250753  T
Q  205 tatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27250754 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 50210034 - 50210333
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||    
T  50210034 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 50210133  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||  |||  |||||||   | |||||||| ||| |||     
T  50210134 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatac--ttgagatgttgttgacttgc 50210231  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  50210232 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21026979 - 21026680
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||||||    
T  21026979 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtg 21026880  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  21026879 aagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 21026782  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     |||||||  ||| ||||||  |   ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  21026781 attgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatga 21026683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22354394 - 22354611
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  22354394 agtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 22354493  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  22354494 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 22354591  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatg 219  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  22354592 attgatatttttatgtcatg 22354611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34510065 - 34509783
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  34510065 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagat 34509966  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  34509965 gtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtata-at-taagatgttgttgacttgcatttgatatcattat 34509868  T
Q  214 gtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  34509867 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Original strand, 22356002 - 22356168
Alignment:
Q  7 ttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  22356002 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22356101  T
Q  107 aataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 171  Q
      |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22356102 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22356168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Original strand, 22357688 - 22357854
Alignment:
Q  7 ttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctg 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  22357688 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22357787  T
Q  107 aataagatatgttgttg-ttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 171  Q
      |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22357788 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22357854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22532569 - 22532269
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | | ||| ||||  ||| | ||||    
T  22532569 agtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgt 22532470  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  || ||  || |||||||||| |||||||     
T  22532469 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaat--atttaagatgttgttgaattgc 22532372  T
Q  199 atttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    | | ||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||   || |||||||||||    
T  22532371 aatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  22532272 atgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20135487 - 20135269
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattt-tgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||| | | | ||  ||||| ||||||||||    
T  20135487 agtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgt 20135388  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||   |||||||||| |||||||     
T  20135387 gaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatac--ttaagatgttgttgaattgc 20135290  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatg 219  Q
    |  |||||| |||||||||||    
T  20135289 acatgatattattatgtcatg 20135269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 14295606 - 14295672
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14295606 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 20847041 - 20847146
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||| ||||||| ||    
T  20847041 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatg 20847140  T
Q  101 aagctg 106  Q
    ||||||    
T  20847141 aagctg 20847146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 20847208 - 20847275
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20847208 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 45574941 - 45575008
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  45574941 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33681075 - 33681010
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  33681075 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 22921922 - 22921986
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  22921922 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16758717 - 16758670
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16758717 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 16758670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20918672 - 20918625
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918672 tgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20918625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21754113 - 21754066
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754113 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21754066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22237695 - 22237630
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  22237695 tgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 52928026 - 52928070
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928026 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 52928070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 16368339 - 16368386
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16368339 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 16368386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 20454607 - 20454653
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454607 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20454653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 35261131 - 35261178
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35261131 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 35261178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 50614170 - 50614217
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50614170 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 50614217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 50621998 - 50622045
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50621998 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 50622045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123212
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22123212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20248347 - 20248300
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20248347 tgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtcta 20248300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 21861623 - 21861670
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21861623 tgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtcta 21861670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 21896309 - 21896356
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21896309 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 21896356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13988924 - 13988884
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988924 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13988884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21840825 - 21840785
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840825 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21840785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 21923395 - 21923435
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923395 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21923435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 23593839 - 23593879
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593839 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23593879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298155
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 29298155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776706
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 29776706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31612371 - 31612331
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612371 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342114
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21342114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346979
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707185
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21707185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711727
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21711727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26065006 - 26064959
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065006 tgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 41050089 - 41050136
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  41050089 tgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtcta 41050136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50686679 - 50686632
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  50686679 tgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtcta 50686632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 433060 - 433030
Alignment:
Q  248 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433060 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 276
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860151
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15860151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361935
Alignment:
Q  248 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16361935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 21475191 - 21475231
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21475191 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtcta 21475231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161742
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcg 21161742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714563
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 21714563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13794 - 13497
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  13794 agtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtg 13695  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||     
T  13694 aagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca--taagatgttgatgaatcgaaa 13597  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| || ||||||||| |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 4953 - 5246
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |   | ||||||| |||||| ||||    
T  4953 agtgacttattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtg 5052  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5053 aaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacat--aagatgttgatgaattgaat 5150  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5151 ttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 10248 - 10544
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   | ||||||| |||||||||||    
T  10248 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtg 10347  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||     
T  10348 aagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatactt--aagatgttgttgaattgaaa 10445  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10446 ttgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 14053124 - 14053422
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  14053124 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtg 14053223  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag-atgttgatgaattgaa 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  14053224 aagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgca--taagaatgttgatgaattgaa 14053321  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatg-tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
     ||||||| ||||||||||| |  ||| | | || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  14053322 attgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatg 14053421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  60 gtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattactt 159  Q
    ||||||||||||||| |   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  160 gaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaacta 259  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtataca--taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaacta 17046527  T
Q  260 agctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17046526 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12903056 - 12902757
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||    
T  12903056 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtg 12902957  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||  |    
T  12902956 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaat--atttaagatgttgatgaattaca 12902859  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12902858 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 12902760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7089176 - 7088877
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||||||    
T  7089176 agtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtg 7089077  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||| ||  |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  7089076 aagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaat--atgtaagatgttgatgaattgca 7088979  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  7088978 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 7088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44053128 - 44052829
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  44053128 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 44053029  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  44053028 aagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 44052931  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||   || ||||||||||||    
T  44052930 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatga 44052832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22636733 - 22636437
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  22636733 agtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtg 22636634  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  22636633 aagctg-ttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 22636537  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  22636536 attgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 22636438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3096942 - 3096772
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||| |||||| ||||    
T  3096942 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtg 3096843  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 171  Q
    ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096842 aagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 23374181 - 23374473
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||    
T  23374181 agtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctg 23374280  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  23374281 aagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 23374378  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatg 292  Q
     |||||||  ||||||||||  |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  23374379 attgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 16377343 - 16377621
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtc-gagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctg 98  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||    
T  16377343 agtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctg 16377442  T
Q  99 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattg 197  Q
    || |||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||| || | |||||||| ||| |||    
T  16377443 tggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttg 16377540  T
Q  198 aatttgatatgattatgtcatg-tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
     ||||||||| ||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377541 catttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16377621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 16239791 - 16240090
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||     
T  16239791 agtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgc 16239890  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| |||     
T  16239891 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgc 16239988  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||| |||||||||||  |  ||| | | ||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||   || ||||||||||||    
T  16239989 atttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 16240087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 17047894 - 17048055
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||  ||| || || |||||    
T  17047894 agtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtg 17047993  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 161  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047994 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 299
Target Start/End: Original strand, 16270147 - 16270356
Alignment:
Q  90 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgtt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || |||||||||    
T  16270147 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgtt 16270244  T
Q  189 gatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttg 286  Q
    | | | ||| ||||||||| |||||||||||  |  ||| | | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  287 aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7893985 - 7893703
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  7893985 ttttgcgacctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagat 7893886  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataat-gtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
        ||||| |||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||| | ||||||| |||||    
T  7893885 ---gtgttgctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgcaattgatattattat 7893791  T
Q  214 gtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||   |||  ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||    
T  7893790 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14038904 - 14038669
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataa 143  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | |||  |||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14038904 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14038805  T
Q  144 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgt 239  Q
    |||| | |||||||||||||  |||  |||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |   ||| | | ||| | |||    
T  14038804 tgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgt 14038707  T
Q  240 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14038706 tgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 14038669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15551885 - 15551817
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  15551885 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  116 tgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatg 214  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata--tttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatg 7798861  T
Q  215 tcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||  |||   | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  7798860 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6190761 - 6190599
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||  |||  |||| || |||  |||    
T  6190761 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaatatgatattaattacaattcgtg 6190662  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgat-tatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaag 163  Q
    ||||||  || || |||||  ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  6190661 aagctg-ttatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgtatacgcattacttgaag 6190599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121823
Alignment:
Q  123 gttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taagatgttgatgaattgaatt 15121823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3096360 - 3096293
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3096360 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 12288263 - 12288310
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288263 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12774075 - 12774028
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774075 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12774028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 52243249 - 52243296
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243249 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 52243296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 39706341 - 39706409
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  39706341 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198655
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 43198655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 52873421 - 52873488
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  52873421 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13951
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt--gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||| |||  | | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  128 ttatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt-- 224  Q
    |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  | |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  |||| |||      
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaata--tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt 6899965  T
Q  225 gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    | | | ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  6899964 gtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6190530 - 6190483
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6190530 tgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 6190483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8846424 - 8846377
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8846424 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtcta 8846377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22353900 - 22353835
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  22353900 tgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 46640512 - 46640556
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46640512 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 46640556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Original strand, 53082209 - 53082252
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  53082209 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 53082252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 12411 - 12451
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 1837613 - 1837653
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837613 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1837653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641326
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7641326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610968
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12610968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14280374 - 14280334
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280374 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 15118456 - 15118496
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118456 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15118496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 18215378 - 18215418
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215378 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18215418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 19618276 - 19618316
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618276 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 19618316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 23803369 - 23803409
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803369 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23803409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44615346 - 44615306
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615346 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44615306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 44773191 - 44773231
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773191 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44773231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 44928984 - 44929024
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928984 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 50222443 - 50222483
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222443 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 50222483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 51463972 - 51464012
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463972 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 51464012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52312568 - 52312528
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312568 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 52312528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 8574935 - 8574967
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574935 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8574967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355469
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15355469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239563
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18239563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242717
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 19242717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102232
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44102232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3515065 - 3515025
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3515065 tgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtcta 3515025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 54798814 - 54798854
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798814 tgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970851
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtcta 14970851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16596714 - 16596686
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596714 cctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256205
Alignment:
Q  181 aagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttg 225  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg 43256205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32351 - 32067
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataag 112  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32351 gattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataag 32252  T
Q  113 atatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgatta 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32251 atatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac--ctaagatgttgatgaattgaaattgatattatta 32154  T
Q  213 tgtcatgtcg-ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||| | |||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32153 tgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 15287 - 15584
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||    
T  15287 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtg 15386  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  15387 aagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttataca--taagatgttgatgaattgaaa 15484  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7387
Alignment:
Q  123 gttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttg 203  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taagatgttgatgaattgaatttg 7387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 47285 - 46995
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||      |||||||||||    
T  47285 agtgacttgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtg 47192  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  47191 aagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaaa 47094  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |||||||||||  | || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 21292792 - 21293090
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  21292792 agtgactttttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtg 21292891  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaa-ttgaa 199  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  21292892 aagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatac--ctaagatgttgatgaatttgaa 21292989  T
Q  200 t-ttgatatgattatgtcat-gtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    | ||||||| ||||||||||  |  |||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21292990 tattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgat 21293088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 23390318 - 23390617
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  23390318 agtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 23390417  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  23390418 aagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 23390515  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  23390516 attgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23390614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 8286664 - 8286964
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| |||| | ||||    
T  8286664 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtg 8286763  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||| |    
T  8286764 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgatt--atttaagatgttgatgaattgca 8286861  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatg----tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
     ||||||| |||||||||||    |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  8286862 attgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  8286961 atgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22075317 - 22075018
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||| ||||    
T  22075317 agtgacttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtg 22075219  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  22075218 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 22075121  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaag-atgatg 295  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  22075120 attgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatg 22075022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25421832 - 25421532
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||    
T  25421832 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 25421733  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| |||     
T  25421732 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgctgttgacttgc 25421635  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    | ||||||| |||||||||||| |   ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  25421634 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  25421535 atgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24493853 - 24493569
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  24493853 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagat 24493754  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  24493753 atgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgcatttgatattattat 24493656  T
Q  214 gtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||  |  ||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  24493655 gtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24529505 - 24529223
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||| | |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24529505 ttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagat 24529406  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  24529405 gtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtata-at-taagatgttgttgacttgcatttgatatcattat 24529308  T
Q  214 gtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||| |   ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  24529307 gtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25431694 - 25431395
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||    
T  25431694 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 25431595  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |||   |||| |||||||||| ||| |||     
T  25431594 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg--aacatttaagatgttgttgacttgc 25431497  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    | ||||||| |||||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  25431496 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaat-ttatgaagatgatg 25431399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13095794 - 13095495
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||    
T  13095794 agtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgt 13095695  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| |||     
T  13095694 gaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgc 13095597  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||| | |||||||||  |  ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  13095596 atttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 13095498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13025610 - 13025311
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||    
T  13025610 agtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgt 13025511  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| |||     
T  13025510 gaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgc 13025413  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||| | |||||||||  |  ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  13025412 atttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 13025314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 22107210 - 22107357
Alignment:
Q  16 tttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagata 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||  |||| |     
T  22107210 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtg 22107309  T
Q  116 tgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107310 tgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9078205 - 9077952
Alignment:
Q  47 gttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt 146  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9078205 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 9078106  T
Q  147 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgc 242  Q
    | || |||||||||||   |||  |||||| || | |||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||  |||   | | | ||||||||||||    
T  9078105 tatacgcattacttgagttatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgc 9078008  T
Q  243 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||   || |||||||||||||||    
T  9078007 tg-ttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 182 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacta 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  282 tgttgaagatg 292  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 21985983 - 21986130
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  21985983 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagat 21986082  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttga 161  Q
     ||||| |||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  21986083 gtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36314643 - 36314577
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36314643 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1096721 - 1096467
Alignment:
Q  46 agttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg 145  Q
    ||||| ||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1096721 agttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 1096622  T
Q  146 tt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttg 241  Q
    || |||||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |   ||| | | | ||| |||||    
T  1096621 ttatatgcattacttgaattatgaatgtat--atgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttg 1096524  T
Q  242 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  1096523 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 19660888 - 19660956
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19660888 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 18769910 - 18770024
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  18769910 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taag 18770006  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18770007 atgttgatgaattgaatt 18770024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22032529 - 22032415
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  22032529 gttaactgcaatctgtgaagctga-tacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taag 22032433  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22032432 atgttgatgaattgaatt 22032415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  133 atgtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaac 228  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||  | |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||  |   ||| |     
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaata--tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtat 21808440  T
Q  229 agtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21808441 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Original strand, 21729064 - 21729185
Alignment:
Q  180 taagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||  |   ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729064 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21729162  T
Q  277 tactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||   ||||||||||||||||||    
T  21729163 taagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572178
Alignment:
Q  123 gttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 21329550 - 21329618
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  21329550 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 20026994 - 20027041
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026994 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 22959585 - 22959632
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959585 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22959632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21565610 - 21565563
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565610 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21565563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 21502209 - 21502277
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  21502209 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 26012088 - 26012135
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26012088 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26012135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22144115 - 22144070
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144115 cctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22144070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 264872 - 264912
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264872 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 264912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 10733044 - 10733084
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733044 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10733084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 11581303 - 11581343
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581303 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 11581343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19668963 - 19668898
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   || ||| |||||||||||    
T  19668963 ctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 20902113 - 20902153
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902113 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20902153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20909063 - 20909030
Alignment:
Q  245 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909063 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20909030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918092
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20918092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29329992 - 29329952
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329992 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 29329952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39245194 - 39245154
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245194 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 39245154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39363442 - 39363402
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363442 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 39363402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154758
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 2154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064529
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23064529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154924
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 36154924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619452
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 38619452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 22178274 - 22178321
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22178274 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 22178321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412337
Alignment:
Q  85 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgt 136  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 22412337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 26732886 - 26732932
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732886 tgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 278
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775820
Alignment:
Q  248 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10775820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 275
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319175
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18319175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 42245469 - 42245509
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42245469 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 42245509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806886
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtcta 20806886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704092
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 26704092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 26740702 - 26740745
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26740702 ctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26740745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973825
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 26973825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29346030 - 29345998
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29346030 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtcta 29345998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061086
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 31061086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5011 - 4712
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||    
T  5011 agtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgt 4912  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  4911 gaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtataca--taagattttgatgaattgca 4814  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||| |  ||||||||   |||  ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4813 attgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 235 - 18
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||    
T  235 agtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgt 136  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  135 gaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtataca--taagattttgatgaattgca 38  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatg 219  Q
     ||||| |  ||||||||||    
T  37 attgatgtatttatgtcatg 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 871 - 1169
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||    
T  871 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttg 970  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |     
T  971 aagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaa 1068  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatg---tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    ||||||| |||||||||||   |  ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1069 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 167801 - 168099
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||    
T  167801 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttg 167900  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |     
T  167901 aagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaa 167998  T
Q  201 ttgatatgattatgtcatg---tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    ||||||| |||||||||||   |  ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  167999 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 168097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52211 - 51913
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  52211 agtgtcttgttaggttttgcgacc-ttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 52113  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||| |    
T  52112 aagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgca 52015  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  52014 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 51916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2251 - 1952
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||   ||||| |||     
T  2251 agtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgta 2152  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  2151 aagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 2054  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2053 attgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 1955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 20698258 - 20698556
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  20698258 agtgacttgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 20698357  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaat 200  Q
    ||||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |     
T  20698358 aagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaat--atataagatgttgatgaattgcaa 20698455  T
Q  201 ttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgat 297  Q
    ||||||| |||| ||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  20698456 ttgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 20698554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13442573 - 13442274
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |   |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  13442573 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 13442474  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  13442473 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 13442376  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  13442375 attgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 13442277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17488155 - 17487856
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  17488155 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtg 17488056  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    || |||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  17488055 aatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 17487958  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  17487957 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17487859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17499637 - 17499338
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||    
T  17499637 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtg 17499538  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    || |||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  17499537 aatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 17499440  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  17499439 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17499341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12399507 - 12399209
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || | |  || | ||||||||||| |||||||| | | |  ||||||||||||||||||||    
T  12399507 agtgacttgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtg 12399409  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  12399408 aagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaat--atttaagatgttgttgaattgca 12399311  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    |||||||| |||||||||||  |   ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12399310 tttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 12399212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 14576654 - 14576932
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || | | ||| ||||| ||||||||||    
T  14576654 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgt 14576753  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| |||     
T  14576754 gaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgc 14576851  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcgttg--aacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    | ||||||| |||||||||||  ||||   | | || ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14576852 aattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtcta 14576932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18438819 - 18438534
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18438819 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagat 18438720  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||| |   ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  18438719 gtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaa--aaagatgttgttgacttgcatttgatattattat 18438622  T
Q  214 gtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  18438621 atcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14973110 - 14972854
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataa 143  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14973110 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14973011  T
Q  144 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgt 239  Q
    |||| |||||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||   |||  ||| | | ||||| |||    
T  14973010 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtat--atatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgt 14972913  T
Q  240 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  14972912 tgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 23083183 - 23083482
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||   | ||| ||||| || ||||||||    
T  23083183 agtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtg 23083282  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |   ||| ||  || |||||||||| ||| ||| |    
T  23083283 aagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaat--atttaagatgttgttgacttgca 23083380  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  23083381 attgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23083479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26687186 - 26686887
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  26687186 agtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtg 26687087  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||  || ||||||| || ||| ||| |    
T  26687086 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaat--atttaagatgatgttgacttgca 26686989  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||    
T  26686988 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatga 26686890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14572873 - 14572610
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||||| ||  ||||||    
T  14572873 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagat 14572774  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| |   | ||||||| |||||    
T  14572773 ttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgactctcaattgatattattat 14572676  T
Q  214 gtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||  |  ||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572675 gtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14572610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 40213542 - 40213820
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||    
T  40213542 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgt 40213641  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
     ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  |||  |||||| || | |||||||| ||| |||     
T  40213642 aaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttgc 40213739  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcgttga---acagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |   | | ||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40213740 atttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 40213820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 25476206 - 25476506
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | |  || ||||| || |||||||    
T  25476206 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgt 25476305  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  |||||||   | |||||||| ||| |||     
T  25476306 gaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatac--ttgagatgttgttgacttgc 25476403  T
Q  199 atttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| |||||||||   |||  ||| | | | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||    
T  25476404 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 25476502  T
Q  296 atgt 299  Q
    ||||    
T  25476503 atgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30030133 - 30029975
Alignment:
Q  6 cttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagct 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||| ||| | |||||| |||||||||    
T  30030133 cttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagct 30030034  T
Q  106 gaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaag 163  Q
    |  |||||| | |||   |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  30030033 gtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaag 30029975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16796846 - 16796685
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||||| ||||    
T  16796846 agtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtg 16796747  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 161  Q
    ||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16796746 aagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 11424599 - 11424880
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  11424599 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagat 11424698  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     |||||  |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  || ||| || | ||||||||||   |||   |||||||  ||||    
T  11424699 gtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcata-at-tgagatgttgat---ttgctattgatattgttat 11424793  T
Q  214 gtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||  |  ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||    
T  11424794 gtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43841231 - 43840956
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  || || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  43841231 agtgtcttgttaggttttgcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtg 43841132  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||| |    
T  43841131 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgca 43841034  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841033 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 43840956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 278
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153308
Alignment:
Q  85 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| ||  || ||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaat--atttaag 24153212  T
Q  184 atgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |  ||| | | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153213 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24153308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 13210380 - 13210448
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13210380 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42386698 - 42386431
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aa 111  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| || | |||||||||||| |||||| |||  |||||     ||| |||||  ||||||||||||||||  | ||    
T  42386698 gattttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaa 42386599  T
Q  112 gatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgat 210  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  || |||  | | |||||||| ||| ||| |||||||||  |    
T  42386598 gatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaata--tttgagatgttgttgacttgcatttgatattgt 42386501  T
Q  211 tatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||  |||   | | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42386500 tatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtcta 42386431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 49668129 - 49668193
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  49668129 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 12174312 - 12174359
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174312 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12174359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32307745 - 32307698
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307745 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32307698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15470992 - 15470927
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  15470992 tgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9512988 - 9512924
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  9512988 tgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9520963 - 9520899
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  9520963 tgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194711
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28194711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097349
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16097349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 52523782 - 52523829
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523782 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 52523829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27165312 - 27165268
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165312 ctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 27165268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16103848 - 16103801
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16103848 tgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 16103801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 22110405 - 22110452
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22110405 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22110452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43926026 - 43925979
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43926026 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 43925979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 856348 - 856234
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || || |||||  ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  856348 gttaactgcaatctgtgaagctta-tatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtataca--taag 856252  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    |||||| |||||||||||    
T  856251 atgttgttgaattgaatt 856234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 43550594 - 43550644
Alignment:
Q  249 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  43550594 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 275
Target Start/End: Original strand, 606379 - 606423
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  606379 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 606423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14234555 - 14234487
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||   || | |||||||||||||    
T  14234555 tgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 53301607 - 53301651
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53301607 ctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtcta 53301651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 37251221 - 37251268
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37251221 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtcta 37251268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 278
Target Start/End: Original strand, 53070755 - 53070797
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070755 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 53070797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 6469238 - 6469278
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469238 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 6469278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 7781451 - 7781491
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781451 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7781491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8899152 - 8899112
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899152 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8899112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 9707711 - 9707751
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707711 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9707751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12567618 - 12567578
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567618 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12567578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13544083 - 13544043
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544083 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13544043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977533
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15977533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 16282915 - 16282955
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282915 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16282955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17463236 - 17463196
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463236 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17463196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737254
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17737254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 28848715 - 28848755
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848715 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28848755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 29172687 - 29172727
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172687 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 29172727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34159384 - 34159344
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159384 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34159344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 38961995 - 38962035
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961995 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 38962035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 45607011 - 45607051
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607011 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45607051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50242880 - 50242840
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242880 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 50242840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 55476549 - 55476509
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476549 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 55476509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 55501000 - 55500960
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501000 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 55500960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499536
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8499536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10557003
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10557003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412447
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15412447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17672676 - 17672644
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672676 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17672644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21618499 - 21618467
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618499 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21618467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 24340780 - 24340844
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  24340780 tatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36166648 - 36166616
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166648 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 36166616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123908
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 41123908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577982
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45577982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12377989 - 12377942
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  12377989 tgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtcta 12377942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23274755 - 23274708
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  23274755 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtcta 23274708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13919394 - 13919350
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13919394 cctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 16454385 - 16454425
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16454385 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 16454425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 10247835 - 10247867
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10247835 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtcta 10247867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119869
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 12119869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 273
Target Start/End: Original strand, 17446759 - 17446794
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17446759 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 17446794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494827
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 44494827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13510 - 13211
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||| ||||    
T  13510 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtg 13411  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  13410 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 13313  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  13312 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 13214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2150 - 1851
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  2150 agtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 2051  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  2050 aagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 1953  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  1952 attgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 1854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6909 - 6691
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||||||  ||||||||||     
T  6909 agtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgta 6810  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||| |||||||      
T  6809 aagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaat--atttaagatgttgttgaattgct 6712  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgt 220  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  6711 attgatatcattatgtcatgt 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3769 - 3470
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| || |||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||| ||    
T  3769 agtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatg 3670  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  3669 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 3572  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  3571 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 627 - 364
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||| | ||||||||  ||||||    
T  627 ttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagat 528  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||  || |||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||     
T  527 gtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaat--atttaagatgttgttgacttccaattgatattattac 430  T
Q  214 gtcatg--tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||     ||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  429 gtcatgctattttgtatactgcctatgttattg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 5943 - 6245
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||||  ||||    
T  5943 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtg 6042  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  6043 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgca 6140  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgt--ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgat 294  Q
     ||||||| || ||||||   |||  ||| | | | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  6141 attgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 6240  T
Q  295 gatgt 299  Q
    |||||    
T  6241 gatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 24123 - 24403
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||   |  || ||||| |||||||||||    
T  24123 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtg 24222  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttg-attatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||     
T  24223 aagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgc 24320  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg----ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    | |||||||  ||||||||||  |    ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24321 aattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
      |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 3184  T
Q  214 gtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||| |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  3185 gtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5147 - 4849
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||| ||| | |||||||| | |  | ||||| ||||||||||||    
T  5147 agtgacttgttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtg 5049  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||||   |||||||||| ||||||| |    
T  5048 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatac--ttaagatgttgttgaattgca 4951  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    |||||||| |||||||||||  |   ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4950 tttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39060 - 38761
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagatttt-gcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||    
T  39060 agtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgt 38961  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || |||||||||| | | |||     
T  38960 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgttgtttatttgc 38863  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||| |||||||||||  |  ||| | | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||    
T  38862 atttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatga 38764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33151 - 32942
Alignment:
Q  90 tataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgtt 188  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || |||||||||    
T  33151 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgtt 33054  T
Q  189 gatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttg 286  Q
    | | | ||| ||||||||| |||||||||||  |  ||| | | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  287 aagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9807 - 9767
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21210 - 20910
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| ||||| |||||    
T  21210 agtgacttgttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtg 21111  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||  || |||||||||| ||||||| |    
T  21110 aagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaat--atataagatgttgttgaattgca 21013  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg---ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||||| |   ||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    |||||||||| |||    
T  21012 attgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttga 20913  T
Q  297 tgt 299  Q
    |||    
T  20912 tgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 124884 - 124679
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  124884 agtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 124785  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||| | |||||||||||| |    
T  124784 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaat--atttaaaacgttgatgaattgca 124687  T
Q  200 tttgatat 207  Q
     |||||||    
T  124686 attgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacta 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  282 tgttgaagatgatgatg 298  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 121833 - 121766
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  121833 tgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 136422 - 136469
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  136422 tgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 136469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 145130 - 145177
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  145130 tgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 145177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 339772 - 340047
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  339772 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtg 339871  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  |||||||   | |||||||| ||| ||| |    
T  339872 aagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatac--ttgagatgttgttgacttg-a 339968  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||| | | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339969 tttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 340047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 158554 - 158594
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158554 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 158594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Original strand, 17049 - 17337
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  17049 gattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaag 17148  T
Q  113 atatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgatt 211  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||  |||  |||||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  17149 acgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatac--ttgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 17246  T
Q  212 atgtcatg-----tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatg 298  Q
    ||||||||     |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  17247 atgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79428
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 79428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23167 - 22904
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  23167 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagat 23068  T
Q  115 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattat 213  Q
     ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  23067 gtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgttgttgacttgcatttgatattattat 22970  T
Q  214 gtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||   |||  ||| | | ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22969 gtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 1052
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||    
T  1213 agtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtg 1114  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 161  Q
    ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1113 aagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 25886 - 26165
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||| |    
T  25886 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctat 25985  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||  |||  |||||||   | ||| |||| ||||||      
T  25986 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatac--ttgagacgttgttgaattac 26083  T
Q  199 atttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26084 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Original strand, 33360 - 33463
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataa 143  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  33360 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataa 33459  T
Q  144 tgtt 147  Q
    ||||    
T  33460 tgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44807
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||   | | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40196 - 39913
Alignment:
Q  16 tttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagata 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||   || |||     
T  40196 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatg 40097  T
Q  116 tgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |   | | || |||||||||  |||  || ||||||||| ||||||    
T  40096 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataat--caaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatg 39999  T
Q  215 tcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||| |  ||| | | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||    
T  39998 tcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 19938 - 19985
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  19938 tgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtcta 19985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26195 - 25896
Alignment:
Q  1 agtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| ||||||||||    
T  26195 agtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgt 26096  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  ||| ||  || | |||||||| | | |||     
T  26095 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaat--atttgagatgttgtttacttgc 25998  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatg--tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||| |||||||||||     ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||| ||||    
T  25997 atttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 25899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40156 - 39858
Alignment:
Q  1 agtgacttgtta-gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  || ||||| |||||| |||    
T  40156 agtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaacctt-gggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgt 40058  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  ||| ||  || | |||||||| | | |||     
T  40057 gaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaat--atttgagatgttgtttacttgc 39960  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatg--tcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    ||||||||| |||||||||||     ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||   || ||||||||||||    
T  39959 atttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 39861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 11335 - 11441
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  11335 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtg 11434  T
Q  101 aagctga 107  Q
    |||||||    
T  11435 aagctga 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 299
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  184 atgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctact 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||   | | | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  281 atgttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8774 - 8479
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||| | | ||| ||||| || ||||||||    
T  8774 agtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtg 8675  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    ||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||    ||||||| | |||||||||||||| |   ||| ||   | |||||||||| ||| ||| |    
T  8674 aagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaat--gtttaagatgttgttgacttgca 8581  T
Q  200 tttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
     ||||||| |||||||||   |||  ||| | | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  8580 attgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgct-attgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3780 - 3644
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||    
T  3780 agtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtg 3681  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtg 137  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3680 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtg 3644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7844 - 7708
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||    
T  7844 agtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtg 7745  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtg 137  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7744 aagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtg 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Original strand, 27804 - 27849
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27804 cctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 27849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39729 - 39498
Alignment:
Q  47 gttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt 146  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39729 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 39630  T
Q  147 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgct 243  Q
    | | |||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |  ||| | | ||||||||||| |    
T  39629 tatgtgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgtt 39532  T
Q  244 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39531 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 39498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 278
Target Start/End: Original strand, 75083 - 75314
Alignment:
Q  47 gttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt 146  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  75083 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 75182  T
Q  147 t-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgct 243  Q
    | | |||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |  ||| | | ||||||||||| |    
T  75183 tatgtgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgtt 75280  T
Q  244 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75281 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 75314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 8354 - 8650
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttggg-taggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgt 99  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||| |||  ||||| | |  || ||||| ||||||||||    
T  8354 agtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgt 8453  T
Q  100 gaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattga 198  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| |||     
T  8454 gaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgc 8551  T
Q  199 atttgatatgattatgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    | ||||||| |||||||||||  |  ||  | | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  8552 aattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgc----tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 8647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4794 - 4589
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataag 112  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  4794 gattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaag 4695  T
Q  113 atatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgatt 211  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  4694 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 4597  T
Q  212 atgtcatg 219  Q
    ||||||||    
T  4596 atgtcatg 4589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12376 - 12171
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataag 112  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  12376 gattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaag 12277  T
Q  113 atatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgatt 211  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  12276 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 12179  T
Q  212 atgtcatg 219  Q
    ||||||||    
T  12178 atgtcatg 12171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22328 - 22123
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataag 112  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  22328 gattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaag 22229  T
Q  113 atatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgatt 211  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  22228 atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 22131  T
Q  212 atgtcatg 219  Q
    ||||||||    
T  22130 atgtcatg 22123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 51706 - 51868
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||  |||| || ||| ||||    
T  51706 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtg 51805  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaag 163  Q
    ||||||  || || || ||  |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  51806 aagctg-ttatgagatattaatgttgatttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaag 51868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32604 - 32557
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32604 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 32557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 51937 - 51983
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 51983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27036 - 26922
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  27036 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataca--taag 26940  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26939 atgttgatgaattgaatt 26922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20702 - 20597
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  20702 agtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtg 20603  T
Q  101 aagctg 106  Q
    ||||||    
T  20602 aagctg 20597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16721
Alignment:
Q  45 gagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataat 144  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  16466 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataat 16565  T
Q  145 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgtt 240  Q
    ||| || ||||||||||||  |||  |||||||   | ||||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||||  |||   | | | ||| | ||||    
T  16566 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatac--ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgtt 16663  T
Q  241 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  16664 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13174
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||  ||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  13391 agtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtg 13292  T
Q  101 aagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaa 199  Q
    || |||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  || ||||||| || ||| ||| |    
T  13291 aaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--atttaagatgatgttgacttgca 13194  T
Q  200 tttgatatgattatgtcatg 219  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  13193 attgatattattatgtcatg 13174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34191 - 34123
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34191 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 17809 - 17928
Alignment:
Q  1 agtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||||| |||||||||||    
T  17809 agtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtg 17908  T
Q  101 aagctgaataagatatgttg 120  Q
    ||||||  |||||| |||||    
T  17909 aagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  96 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaa 194  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| |   |||||||| ||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttg--agatgttgttgaa 3200  T
Q  195 ttgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 291  Q
    ||  ||||||||| ||||| |||||  |||   | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  3201 ttacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 3299  T
Q  292 gatgatg 298  Q
    |||||||    
T  3300 gatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28086 - 27912
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataa 143  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28086 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataa 27987  T
Q  144 tgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatg 219  Q
    |||| |||||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  27986 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 1122 - 1190
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11360 - 11292
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  11360 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2065 - 1997
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  2065 tgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28535 - 28414
Alignment:
Q  180 taagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||   | | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28535 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28437  T
Q  277 tactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||   || |||||||||||||||    
T  28436 taagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  243 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 119943 - 119875
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  119943 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 100442 - 100395
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100442 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 100395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 40227 - 40274
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40227 tgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtcta 40274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 101567 - 101520
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  101567 tgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtcta 101520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44512 - 44472
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44512 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 94469 - 94429
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94469 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 94429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17584
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12971 - 12857
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||| ||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  12971 gttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taag 12875  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12874 atgttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11346 - 11306
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11346 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 11306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2089 - 1975
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || || |||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  2089 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtataca--taag 1993  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1992 atgttgatgaattgaatt 1975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 21712 - 21826
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  21712 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taag 21808  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21809 atgttgatgaattgaatt 21826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 29604 - 29718
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaag 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  29604 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtataca--taag 29700  T
Q  184 atgttgatgaattgaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29701 atgttgatgaattgaatt 29718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6603 - 6535
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||    
T  6603 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8534 - 8487
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8534 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1100 - 1053
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19332 - 19285
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19332 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 19285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 299
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  122 tgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgt 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  | |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||     
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaata--tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgc 32997  T
Q  221 cgtt--gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||  | | | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  32998 tgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  122 tgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgt 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  | |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||     
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaata--tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgc 46008  T
Q  221 cgtt--gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
     |||  | | | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  46007 tgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 16113
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  16180 tgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 16372 - 16331
Alignment:
Q  15 ttttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctt 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16372 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 23936 - 24001
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  23936 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2923
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  2859 tgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6611
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  6679 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14059 - 13991
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  14059 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 6176 - 6244
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  6176 tgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Original strand, 15830 - 15898
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  15830 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178915
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 178915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 160752 - 160685
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgtcc 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||    
T  160752 tgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggt---ctaagttgatgatgatgatgtcc 160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatga 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 501142 - 501102
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501142 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 501102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 1103
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1150 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6833
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6880 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtcta 6833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 10594 - 10641
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10594 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 10641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5711 - 5664
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5711 tgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtcta 5664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15729 - 15682
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15729 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtcta 15682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 2698 - 2745
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2698 tgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 2745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 14750 - 14797
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14750 tgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtcta 14797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1155
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  1089 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 797 - 947
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataag 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||| | ||||| | ||  ||| || ||||||||||  ||||    
T  797 gatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaag 896  T
Q  113 atatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaa 162  Q
    || ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  897 atgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 299
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  232 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||   || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4810 - 4545
Alignment:
Q  13 gattttgcgaccattgttgcacgagtggtcgagagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataag 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||||   |  || ||||| |||||| ||||| ||||  | |     
T  4810 gattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgtttta- 4712  T
Q  113 atatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgatt 211  Q
    | |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||  || |||||||||| ||||||  ||||||||| ||     
T  4711 agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaat--atttaagatgttgttgaattatatttgatattatg 4614  T
Q  212 atgtc---atgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    || ||    ||  |||| | | |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4613 atatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 22726 - 22770
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22726 ctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 82130 - 82090
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  82130 tgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtcta 82090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 62266 - 62222
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  62266 tgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 62222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 134269 - 134229
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134269 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 134229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 136738 - 136698
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136738 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 136698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 139207 - 139167
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139207 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 139167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 144145 - 144105
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144145 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 144105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 141676 - 141636
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  141676 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 141636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 618 - 571
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  618 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12787
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtcta 12787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 8127 - 8174
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8127 tgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtcta 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 45845 - 45892
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45845 tgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25174 - 25127
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25174 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 25127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 129024 - 129070
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129024 tgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 129070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 78390 - 78345
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78390 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116448
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 116448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 129973 - 129926
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129973 tgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtcta 129926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 275
Target Start/End: Original strand, 60769 - 60813
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  60769 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13007 - 12942
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  13007 tgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt---ctaagttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3569
Alignment:
Q  84 gttaactataatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatcta 181  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||| || |     
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtata-at-tg 3531  T
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatg 219  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  3532 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38384 - 38339
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38384 tgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10419 - 10326
Alignment:
Q  44 agagttgaacctttgggtaggattaagactttaaggtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtg 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||| |||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10419 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 295  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Original strand, 38758 - 38802
Alignment:
Q  234 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38758 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtcta 38802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 197 - 150
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  197 tgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtcta 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 6337 - 6384
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6337 tgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtcta 6384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13838
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtcta 13838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12636 - 12589
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12636 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtcta 12589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13196 - 13149
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13196 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Original strand, 16155 - 16200
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16155 cctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 16200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2729 - 2682
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2729 tgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 2682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10595 - 10548
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10595 tgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53649
Alignment:
Q  182 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt--gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||| |||  | | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtcta 53649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4315
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4355 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 4315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4752 - 4712
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4752 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11984
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 11984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11532 - 11491
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 272  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11532 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 11491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10831 - 10791
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10831 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13450 - 13410
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13450 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9260
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20805 - 20765
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20805 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29990 - 29950
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29990 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 29950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16842 - 16802
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16842 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37879 - 37839
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 37839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Original strand, 38309 - 38350
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 272  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38309 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 38350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 20482 - 20522
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20482 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  245 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | || | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 18084 - 18148
Alignment:
Q  235 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 299  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||    
T  18084 tatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2273
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtcta 2273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 28822 - 28870
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28822 tgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 28870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Original strand, 8114 - 8161
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8114 tgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2743 - 2696
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  2743 tgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtcta 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 97073 - 97026
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  97073 tgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtcta 97026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 106351 - 106304
Alignment:
Q  231 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  106351 tgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtcta 106304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 124
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 12353 - 12393
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12353 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14005 - 13965
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14005 tgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtcta 13965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40458 - 40418
Alignment:
Q  237 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40458 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtcta 40418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Original strand, 103686 - 103731
Alignment:
Q  233 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  103686 cctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtcta 103731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23860
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 23860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36471
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 36471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1425
Alignment:
Q  246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 278
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161234
Alignment:
Q  250 tatttaactaagctgcatgagtcggtcta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtcta 161234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University