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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4891-Insertion-8 (Length: 676)

Name: NF4891-Insertion-8
Description: NF4891
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4891-Insertion-8
NF4891-Insertion-8
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (8-676)||(54013685-54014348)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 633; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 54014348 - 54013685
Alignment:
Q  8 gatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgt 107  Q
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T  54014348 gatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgt 54014249  T
Q  108 tttcttaaatttattgttaaaatatgtacataaatatctatctgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatatt 207  Q
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T  54014248 tttcttaaatttattgttaaaatatgttcataaatatctatatgattatatggttagatgtgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatatt 54014149  T
Q  208 agaataggacctatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagc 307  Q
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T  54014148 agaataggaccgatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagc 54014049  T
Q  308 tggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggta 407  Q
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T  54014048 tggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggta 54013949  T
Q  408 tacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagat 507  Q
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T  54013948 tacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagat 54013849  T
Q  508 atgtgatatacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagtaacaaaac 607  Q
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T  54013848 atgtgatacacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagattacagttaatgcacccttgaggttgagtaa-----c 54013754  T
Q  608 aaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagccccctca 676  Q
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T  54013753 aaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagccccctca 54013685  T

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