View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4895-Insertion-4 (Length: 729)

Name: NF4895-Insertion-4
Description: NF4895
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4895-Insertion-4
NF4895-Insertion-4
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (8-477)||(9192734-9193207)
chr5 (524-726)||(40885163-40885366)
chr5 (524-729)||(9275441-9275646)
chr5 (524-729)||(41834842-41835047)
chr5 (524-729)||(32454487-32454692)
chr5 (524-729)||(22482139-22482344)
chr5 (528-720)||(2430258-2430449)
chr5 (524-726)||(33953859-33954060)
chr5 (548-688)||(39987948-39988088)
chr5 (540-726)||(13253056-13253241)
chr5 (548-726)||(40495339-40495516)
chr5 (548-721)||(3060205-3060376)
chr5 (524-725)||(7714894-7715095)
chr5 (524-729)||(10058024-10058229)
chr5 (524-723)||(42146264-42146462)
chr5 (548-694)||(8049032-8049178)
chr5 (524-726)||(24045784-24045985)
chr5 (524-723)||(40791027-40791225)
chr5 (548-694)||(7385913-7386059)
chr5 (548-729)||(32030666-32030845)
chr5 (548-700)||(3667833-3667985)
chr5 (524-700)||(35760168-35760344)
chr5 (548-700)||(41740574-41740726)
chr5 (548-726)||(16158446-16158624)
chr5 (548-708)||(4292120-4292280)
chr5 (524-693)||(5710343-5710511)
chr5 (551-722)||(27021085-27021256)
chr5 (594-729)||(28869530-28869664)
chr5 (546-669)||(34106926-34107049)
chr5 (548-697)||(7178760-7178908)
chr5 (548-654)||(23914235-23914341)
chr5 (548-628)||(19784864-19784944)
chr5 (548-602)||(35847871-35847925)
chr5 (540-629)||(2483687-2483776)
chr5 (548-712)||(2694741-2694905)
chr5 (577-630)||(22811075-22811128)
chr5 (548-703)||(16843514-16843660)
chr5 (560-633)||(20068960-20069033)
chr5 (578-668)||(41959472-41959561)
chr5 (526-630)||(33467951-33468055)
chr5 (577-628)||(2868363-2868414)
chr5 (546-631)||(9861131-9861214)
chr5 (548-630)||(19203986-19204067)
chr5 (578-631)||(29922990-29923043)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (524-729)||(42850180-42850385)
chr1 (505-726)||(25229970-25230190)
chr1 (524-724)||(31223339-31223539)
chr1 (524-729)||(7826315-7826520)
chr1 (524-729)||(20800238-20800443)
chr1 (526-725)||(40229433-40229632)
chr1 (524-729)||(1199787-1199992)
chr1 (524-729)||(35569163-35569368)
chr1 (526-726)||(45710012-45710211)
chr1 (524-722)||(48510875-48511073)
chr1 (548-729)||(43728863-43729043)
chr1 (524-694)||(47123381-47123551)
chr1 (524-729)||(5410600-5410804)
chr1 (563-729)||(4369803-4369968)
chr1 (524-729)||(11023291-11023495)
chr1 (524-729)||(12247380-12247584)
chr1 (524-724)||(13055963-13056162)
chr1 (524-729)||(6166070-6166274)
chr1 (524-725)||(10470554-10470754)
chr1 (524-673)||(27801613-27801762)
chr1 (524-724)||(50977301-50977500)
chr1 (555-726)||(12468176-12468346)
chr1 (524-695)||(26058235-26058406)
chr1 (548-726)||(6464571-6464748)
chr1 (524-729)||(36205151-36205356)
chr1 (524-729)||(35536032-35536236)
chr1 (646-729)||(31933687-31933770)
chr1 (524-700)||(50406119-50406295)
chr1 (548-699)||(15884216-15884368)
chr1 (591-726)||(11051339-11051473)
chr1 (549-703)||(13931609-13931762)
chr1 (524-673)||(34718467-34718616)
chr1 (546-694)||(25061221-25061369)
chr1 (548-631)||(49242967-49243050)
chr1 (591-726)||(40821788-40821922)
chr1 (577-664)||(291731-291818)
chr1 (563-658)||(11561853-11561948)
chr1 (546-630)||(4347033-4347116)
chr1 (548-602)||(29441271-29441325)
chr1 (524-673)||(9447549-9447696)
chr1 (548-629)||(40352451-40352531)
chr1 (548-603)||(43134536-43134591)
chr1 (544-624)||(15576519-15576599)
chr1 (563-670)||(23628706-23628812)
chr1 (540-625)||(41989-42074)
chr1 (548-626)||(13344836-13344913)
chr1 (578-630)||(29759710-29759762)
chr1 (578-630)||(43730059-43730111)
chr1 (577-624)||(47085898-47085945)
chr1 (561-628)||(47978359-47978426)
chr1 (524-618)||(6061214-6061307)
chr1 (548-630)||(7765269-7765350)
chr1 (578-625)||(32365143-32365190)
chr1 (638-696)||(13855712-13855770)
chr1 (577-631)||(40709234-40709287)
chr1 (577-626)||(5930823-5930872)
chr1 (524-625)||(7335840-7335941)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (524-729)||(46830029-46830234)
chr4 (517-726)||(39636709-39636918)
chr4 (524-729)||(16566226-16566431)
chr4 (524-722)||(51922868-51923066)
chr4 (524-729)||(43781479-43781683)
chr4 (524-721)||(26651808-26652005)
chr4 (548-726)||(43772107-43772285)
chr4 (524-729)||(19592191-19592396)
chr4 (548-728)||(49136444-49136624)
chr4 (524-726)||(14072427-14072628)
chr4 (524-726)||(32238019-32238220)
chr4 (524-725)||(6138580-6138780)
chr4 (527-726)||(42944861-42945060)
chr4 (524-725)||(9889295-9889495)
chr4 (524-725)||(9893636-9893837)
chr4 (524-729)||(30842053-30842257)
chr4 (524-728)||(15603282-15603486)
chr4 (524-729)||(28986942-28987144)
chr4 (548-726)||(49519654-49519832)
chr4 (524-726)||(54152969-54153170)
chr4 (548-729)||(48407682-48407862)
chr4 (548-722)||(14564130-14564304)
chr4 (563-729)||(4954050-4954216)
chr4 (524-694)||(54150482-54150652)
chr4 (524-729)||(13183010-13183215)
chr4 (524-723)||(26426075-26426273)
chr4 (548-726)||(54735635-54735812)
chr4 (548-727)||(6505124-6505303)
chr4 (524-695)||(48550172-48550343)
chr4 (577-724)||(48550440-48550587)
chr4 (548-726)||(14075939-14076116)
chr4 (548-700)||(29149291-29149443)
chr4 (548-694)||(25312671-25312817)
chr4 (577-729)||(56241848-56242000)
chr4 (561-729)||(15619538-15619703)
chr4 (524-669)||(39187715-39187860)
chr4 (524-697)||(48908228-48908399)
chr4 (578-726)||(2175161-2175309)
chr4 (524-699)||(13167476-13167651)
chr4 (524-688)||(46926010-46926174)
chr4 (524-722)||(31520331-31520528)
chr4 (524-628)||(41866176-41866280)
chr4 (524-700)||(14054801-14054977)
chr4 (577-724)||(30887167-30887313)
chr4 (548-726)||(38693974-38694150)
chr4 (542-643)||(55638733-55638834)
chr4 (555-695)||(19599487-19599625)
chr4 (545-669)||(38263881-38264004)
chr4 (554-625)||(33574203-33574274)
chr4 (548-699)||(38305962-38306113)
chr4 (548-699)||(54488556-54488707)
chr4 (646-729)||(55638869-55638952)
chr4 (584-694)||(26402960-26403070)
chr4 (548-626)||(28947733-28947811)
chr4 (548-631)||(53531996-53532079)
chr4 (548-602)||(4649913-4649967)
chr4 (563-629)||(33843803-33843869)
chr4 (548-650)||(45779994-45780095)
chr4 (561-631)||(53914918-53914987)
chr4 (545-634)||(523166-523255)
chr4 (578-631)||(16492946-16492999)
chr4 (577-630)||(22699762-22699815)
chr4 (577-630)||(22980715-22980768)
chr4 (577-630)||(22994302-22994355)
chr4 (548-623)||(22694581-22694656)
chr4 (563-631)||(54487219-54487287)
chr4 (524-616)||(54655266-54655358)
chr4 (578-629)||(36150625-36150676)
chr4 (578-631)||(38740316-38740369)
chr4 (540-629)||(39993574-39993663)
chr4 (660-694)||(48908095-48908129)
chr4 (590-631)||(8754177-8754217)
chr4 (577-626)||(46958047-46958096)
chr4 (638-699)||(48257054-48257115)
chr4 (655-700)||(54655200-54655245)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (540-729)||(3348179-3348368)
chr3 (524-721)||(10853227-10853424)
chr3 (524-729)||(10334074-10334279)
chr3 (524-725)||(50664699-50664899)
chr3 (524-724)||(38172267-38172467)
chr3 (540-729)||(52966785-52966974)
chr3 (524-729)||(20813082-20813286)
chr3 (524-729)||(42318266-42318470)
chr3 (560-728)||(44224699-44224867)
chr3 (524-728)||(15511336-15511539)
chr3 (545-729)||(53074839-53075022)
chr3 (555-726)||(53179788-53179958)
chr3 (548-722)||(35425277-35425450)
chr3 (524-722)||(38340749-38340946)
chr3 (524-729)||(38125402-38125606)
chr3 (548-720)||(8424714-8424885)
chr3 (524-729)||(16246056-16246259)
chr3 (527-729)||(35930674-35930876)
chr3 (524-726)||(44939376-44939576)
chr3 (524-725)||(48189402-48189602)
chr3 (548-729)||(23496260-23496434)
chr3 (524-726)||(30811492-30811693)
chr3 (524-700)||(26519629-26519805)
chr3 (577-729)||(31084144-31084295)
chr3 (542-716)||(21224939-21225113)
chr3 (540-729)||(23207044-23207231)
chr3 (524-677)||(4984569-4984722)
chr3 (527-694)||(42475680-42475847)
chr3 (524-633)||(55154534-55154642)
chr3 (561-729)||(25847969-25848136)
chr3 (538-699)||(34561074-34561235)
chr3 (548-669)||(40415280-40415401)
chr3 (607-722)||(31618930-31619045)
chr3 (544-634)||(19877448-19877538)
chr3 (578-729)||(32357447-32357597)
chr3 (578-688)||(30809959-30810069)
chr3 (636-729)||(22736917-22737010)
chr3 (546-602)||(52813278-52813334)
chr3 (548-703)||(49526653-49526808)
chr3 (577-630)||(7012675-7012728)
chr3 (552-661)||(29716674-29716783)
chr3 (548-630)||(21023201-21023281)
chr3 (548-629)||(42644298-42644379)
chr3 (578-626)||(10852727-10852775)
chr3 (540-630)||(44225600-44225689)
chr3 (548-715)||(14651086-14651252)
chr3 (650-729)||(14959655-14959734)
chr3 (558-624)||(22737055-22737121)
chr3 (578-632)||(52931586-52931640)
chr3 (577-626)||(23918881-23918930)
chr3 (577-617)||(30736172-30736212)
chr3 (524-572)||(31618372-31618420)
chr3 (589-627)||(38626750-38626788)
chr3 (684-726)||(55154491-55154533)
chr3 (577-630)||(25181245-25181298)
chr3 (578-631)||(48089632-48089685)
chr3 (578-631)||(52836019-52836072)
chr3 (545-630)||(53567967-53568051)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (524-729)||(3622407-3622612)
chr7 (524-725)||(37562531-37562732)
chr7 (527-726)||(44967349-44967548)
chr7 (524-726)||(48459670-48459872)
chr7 (524-729)||(39391084-39391289)
chr7 (548-729)||(3375447-3375628)
chr7 (524-724)||(3342752-3342952)
chr7 (524-729)||(37639387-37639592)
chr7 (548-729)||(38230025-38230206)
chr7 (524-729)||(47021876-47022081)
chr7 (552-729)||(3750644-3750820)
chr7 (548-729)||(9456062-9456242)
chr7 (548-729)||(12632054-12632235)
chr7 (548-729)||(43737910-43738091)
chr7 (545-726)||(47217509-47217690)
chr7 (524-727)||(48134539-48134741)
chr7 (524-721)||(10371905-10372102)
chr7 (524-724)||(34365929-34366128)
chr7 (524-695)||(41715648-41715819)
chr7 (524-723)||(43631643-43631841)
chr7 (526-695)||(32186931-32187100)
chr7 (540-726)||(34010300-34010485)
chr7 (524-729)||(34010908-34011114)
chr7 (557-726)||(42740352-42740521)
chr7 (524-723)||(386428-386627)
chr7 (524-688)||(42904551-42904715)
chr7 (524-673)||(37008300-37008446)
chr7 (524-722)||(46541564-46541762)
chr7 (524-694)||(39977544-39977714)
chr7 (577-726)||(32205886-32206034)
chr7 (548-699)||(42752162-42752313)
chr7 (527-692)||(24770861-24771026)
chr7 (548-717)||(36920149-36920318)
chr7 (544-625)||(12964659-12964740)
chr7 (548-699)||(39634136-39634287)
chr7 (524-700)||(40903115-40903290)
chr7 (646-726)||(47301626-47301706)
chr7 (617-729)||(19095894-19096005)
chr7 (561-712)||(1766399-1766550)
chr7 (548-626)||(20088929-20089007)
chr7 (548-598)||(12212440-12212490)
chr7 (576-626)||(38494276-38494326)
chr7 (524-609)||(19097474-19097559)
chr7 (548-630)||(4228603-4228684)
chr7 (577-628)||(16079460-16079511)
chr7 (576-631)||(29829309-29829364)
chr7 (578-673)||(33746402-33746497)
chr7 (578-697)||(41625514-41625633)
chr7 (524-578)||(47301572-47301626)
chr7 (578-631)||(15311217-15311270)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (524-729)||(7472632-7472836)
chr2 (524-722)||(9988459-9988657)
chr2 (524-729)||(5916200-5916404)
chr2 (524-729)||(36312222-36312426)
chr2 (524-726)||(14821111-14821312)
chr2 (524-726)||(36548148-36548349)
chr2 (524-693)||(1944997-1945166)
chr2 (524-729)||(26207887-26208092)
chr2 (524-729)||(32501931-32502135)
chr2 (541-700)||(44619036-44619195)
chr2 (540-726)||(39141444-39141629)
chr2 (524-700)||(2213480-2213656)
chr2 (546-729)||(28641587-28641770)
chr2 (548-700)||(2215228-2215378)
chr2 (524-725)||(8170262-8170462)
chr2 (524-700)||(28127245-28127421)
chr2 (526-726)||(42515936-42516135)
chr2 (524-663)||(2213658-2213797)
chr2 (548-727)||(7296102-7296281)
chr2 (548-722)||(28261246-28261420)
chr2 (548-727)||(7295330-7295507)
chr2 (525-703)||(31562646-31562821)
chr2 (545-673)||(42089507-42089639)
chr2 (544-664)||(31224690-31224810)
chr2 (524-700)||(23358232-23358407)
chr2 (524-631)||(30007511-30007618)
chr2 (548-697)||(25747864-25748012)
chr2 (548-700)||(41580692-41580844)
chr2 (548-664)||(45714650-45714766)
chr2 (548-631)||(34433288-34433371)
chr2 (548-694)||(16467066-16467212)
chr2 (589-727)||(25940264-25940402)
chr2 (543-703)||(3853871-3854031)
chr2 (548-699)||(18511077-18511228)
chr2 (577-694)||(27911386-27911503)
chr2 (548-634)||(38600425-38600511)
chr2 (577-695)||(43436292-43436410)
chr2 (546-697)||(8041257-8041406)
chr2 (577-729)||(39106680-39106831)
chr2 (548-602)||(23267346-23267400)
chr2 (524-625)||(34997194-34997295)
chr2 (544-630)||(12110918-12111003)
chr2 (524-700)||(18970248-18970421)
chr2 (577-630)||(23359941-23359994)
chr2 (548-628)||(43858194-43858274)
chr2 (577-630)||(30599915-30599968)
chr2 (576-628)||(10918649-10918701)
chr2 (578-630)||(23377548-23377600)
chr2 (681-726)||(2212769-2212814)
chr2 (548-697)||(11240648-11240796)
chr2 (563-631)||(3476356-3476424)
chr2 (685-729)||(45714767-45714811)
chr2 (638-700)||(2234901-2234962)
chr2 (577-630)||(26806266-26806319)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (524-729)||(28425432-28425637)
chr8 (524-717)||(3097166-3097359)
chr8 (524-726)||(3467480-3467682)
chr8 (548-728)||(6399092-6399272)
chr8 (548-728)||(40742279-40742457)
chr8 (524-729)||(22936753-22936958)
chr8 (548-729)||(25697944-25698124)
chr8 (561-729)||(40742068-40742236)
chr8 (548-729)||(44926785-44926965)
chr8 (515-722)||(4941732-4941939)
chr8 (578-729)||(43550835-43550986)
chr8 (511-726)||(27649693-27649907)
chr8 (548-722)||(440173-440347)
chr8 (548-729)||(38152159-38152339)
chr8 (524-729)||(36114001-36114205)
chr8 (542-699)||(41289036-41289193)
chr8 (548-729)||(8124915-8125095)
chr8 (524-729)||(38114389-38114593)
chr8 (524-673)||(42143324-42143473)
chr8 (548-700)||(33627018-33627170)
chr8 (548-687)||(24897572-24897710)
chr8 (578-700)||(42148978-42149100)
chr8 (544-729)||(30081631-30081815)
chr8 (548-668)||(26243129-26243249)
chr8 (524-634)||(36121505-36121614)
chr8 (548-644)||(25497721-25497816)
chr8 (548-699)||(15206670-15206821)
chr8 (583-729)||(34342873-34343016)
chr8 (548-622)||(30759289-30759363)
chr8 (548-699)||(31246299-31246450)
chr8 (611-729)||(26125516-26125634)
chr8 (608-700)||(29023212-29023304)
chr8 (638-729)||(41981101-41981192)
chr8 (548-602)||(3465424-3465478)
chr8 (546-700)||(3619051-3619204)
chr8 (620-724)||(16915010-16915114)
chr8 (548-700)||(22552724-22552876)
chr8 (548-599)||(30085623-30085674)
chr8 (548-699)||(35615683-35615834)
chr8 (546-673)||(8702390-8702516)
chr8 (578-630)||(19649229-19649281)
chr8 (540-588)||(29023308-29023356)
chr8 (561-631)||(32767479-32767547)
chr8 (578-624)||(10552923-10552969)
chr8 (577-630)||(26490976-26491029)
chr8 (546-630)||(29970845-29970928)
chr8 (585-697)||(45147271-45147383)
chr8 (548-629)||(36779435-36779515)
chr8 (563-626)||(42600968-42601031)
chr8 (578-631)||(1373081-1373134)
chr8 (560-632)||(23018137-23018209)
chr8 (548-588)||(26125842-26125882)
chr8 (661-729)||(26243035-26243103)
chr8 (577-629)||(39219765-39219817)
chr8 (544-597)||(6876603-6876656)
chr8 (577-630)||(33588763-33588816)
chr8 (544-625)||(40792184-40792264)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (524-729)||(13739142-13739346)
chr6 (524-720)||(13744651-13744846)
chr6 (528-715)||(29409215-29409402)
chr6 (524-729)||(33898965-33899170)
chr6 (524-726)||(6208023-6208224)
chr6 (577-729)||(16548075-16548227)
chr6 (561-725)||(16442347-16442511)
chr6 (524-708)||(17829958-17830142)
chr6 (548-726)||(10826030-10826208)
chr6 (548-728)||(31132401-31132580)
chr6 (548-698)||(699525-699673)
chr6 (548-729)||(21455818-21455997)
chr6 (540-699)||(1312415-1312574)
chr6 (548-697)||(21254863-21255011)
chr6 (548-726)||(7215514-7215690)
chr6 (524-603)||(32599422-32599501)
chr6 (548-602)||(15151489-15151543)
chr6 (548-629)||(5584033-5584113)
chr6 (548-697)||(16121985-16122134)
chr6 (526-618)||(29399755-29399846)
chr6 (565-631)||(882776-882842)
chr6 (577-630)||(29682202-29682255)
chr6 (546-627)||(3605734-3605814)
chr6 (578-631)||(1499990-1500043)
chr6 (660-701)||(2935695-2935736)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (524-726)||(8388-8590)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (524-725)||(9051-9251)
[»] scaffold0983 (1 HSPs)
scaffold0983 (526-726)||(2230-2430)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (548-720)||(29107-29278)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (548-722)||(253071-253245)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (548-727)||(2011-2190)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (548-721)||(5814-5988)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (548-655)||(118394-118501)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (524-700)||(46728-46903)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (544-630)||(15238-15323)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (548-712)||(138492-138656)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (577-626)||(199382-199431)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (560-628)||(301562-301630)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (548-629)||(65536-65616)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 477
Target Start/End: Original strand, 9192734 - 9193207
Alignment:
Q  8 acactcacacacaaccatttattctcatcacacaaccattaccaccctctctcttttttcttacttaaagctcaatatttcaaacaaactcaacaaggaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9192734 acactcacacacaaccatttattctcatcacacaaccattaccaccctctcttttttttcttacttaaagctcaatatttcaaacaaactcaacaaggaa 9192833  T
Q  108 tggttaatctctattttgtatgaattagctattgagatattggcttggttcactcagaagaaacaaaaaataacactacttgtgaatg------ttttga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  9192834 tggttaatctctattttgtatgaattagctattgagatattggcttggttcactcagaagaaacaaaaaataacactacttgtgaatgttttgattttga 9192933  T
Q  202 ttttgattttgattgagccgtgccaatatttcaaatgctatttcatgttttcattcataggttatagtgtgatgaattgaagagaatacaaaggtagtta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9192934 ttttgattttgattgagccgtgccaatatttcaaatgctatttcatgttttcattcataggttatagtgtgatgaattgaagagaatacaaaggcagttt 9193033  T
Q  302 tttttgcagttatttttatctattttcttctatatgaaactcaaatgcagttaccgacgtacattgaaagaggttatgnnnnnnngtttgtgatagacaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  9193034 tttttgcagttatttttatctattttcttctatatgaaactcaaatgcagttaccgacgtatattgaaagaggttatgtttttt--tttgtgatagacaa 9193131  T
Q  402 agttgtcatgtttaagaataataaccttttttaatgaagattagatgtttaagaatatccttttcttatataaatt 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9193132 agttgtcatgtttaagaataataaccttttttaatgaagattagatgtttaagaatatccttttcttatataaatt 9193207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 40885366 - 40885163
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885366 tgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgttagaattgagtttaagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 40885267  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagt-aattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||| ||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  40885266 tggacacacttgtttaaaagtgagtttttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgatcaaattatcctttt 40885167  T
Q  723 aatt 726  Q
    ||||    
T  40885166 aatt 40885163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 9275441 - 9275646
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9275441 tgtgtttggtttggcggtggggaaaattgattttgataaaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgagttagatgttaattgatttatgtt 9275540  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9275541 tggatacactttaataaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgtaatgaccaaattatcttttta 9275640  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  9275641 attgta 9275646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41835047 - 41834842
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41835047 tgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttgatagaattcagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgatttatgtt 41834948  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41834947 tggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatcctttta 41834848  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  41834847 attgta 41834842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32454692 - 32454487
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgat-agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgt 622  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32454692 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgattagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgt 32454594  T
Q  623 ttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| |    
T  32454593 ttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatccttgt 32454494  T
Q  723 aattgta 729  Q
    |||||||    
T  32454493 aattgta 32454487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 22482344 - 22482139
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22482344 tgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 22482245  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  22482244 tggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgactaaactatcctttta 22482145  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  22482144 attgta 22482139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 528 - 720
Target Start/End: Original strand, 2430258 - 2430449
Alignment:
Q  528 tttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgga 627  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  2430258 tttggtatggcggtggcgagaattcattttgatggaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacatgaattgatt-atgtttgga 2430356  T
Q  628 tacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctt 720  Q
    ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  2430357 tacacttcaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaatgactaaattatcctt 2430449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Original strand, 33953859 - 33954060
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  33953859 tgtgtttggtatggcagtggtgaaaattgattttggtagaattgagtttgagagaattgattttatttaaaagtgagttgaacgtaaattgatt-atgtt 33953957  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33953958 tggatacactttaatagaagtgattctgatgagttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtgtaatgactaaattatcctttta 33954057  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  33954058 att 33954060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 548 - 688
Target Start/End: Original strand, 39987948 - 39988088
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  39987948 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgat 39988047  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaatt 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  39988048 tcttatgagttgatgttgtttggatgatttaaatcaaaatt 39988088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 540 - 726
Target Start/End: Original strand, 13253056 - 13253241
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctta 639  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||    
T  13253056 gtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga-ttatgtttggatacactcattta 13253154  T
Q  640 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||||||||    
T  13253155 aaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattacccttttaatt 13253241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Original strand, 40495339 - 40495516
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  40495339 aattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgat 40495438  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  40495439 ttttatgagttgat-ttgtttgaatagtttaaatcaaaattgatttggaatgtacaatgatcaaattatccttttaatt 40495516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 548 - 721
Target Start/End: Original strand, 3060205 - 3060376
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  3060205 aattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttttatatgaattaatttatgtttggatatactcactt-aaagtgat 3060303  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 721  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060304 tcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 3060376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 7715095 - 7714894
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  7715095 tgtgttttgtatggcggtggtaaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattgatatatgtt 7714996  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    | || |||||  ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||    
T  7714995 ttgacacactcacttgaaattgattcttataagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaaagtataatgactaaattatcctttta 7714896  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  7714895 at 7714894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 10058229 - 10058024
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||| ||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10058229 tgtgtttagtatggcggtggggagaattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagtgagttggaaatgaattgatttatgtt 10058130  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||    
T  10058129 tggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaacgtgcaacgaccaaattatcatttta 10058030  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  10058029 attgta 10058024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 524 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 42146462 - 42146264
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  42146462 tgtgtttggtatgacggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-ttatgtt 42146364  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  42146363 tggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatgaccatattatcccttta 42146264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 548 - 694
Target Start/End: Original strand, 8049032 - 8049178
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  8049032 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggttaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgat 8049131  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  8049132 tcttatgagttgttgttgtttggatgatttaaatcaaaattgctttt 8049178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 24045985 - 24045784
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24045985 tgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgagtctgatgtgaattgatttatgtt 24045886  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||| | ||  ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||    
T  24045885 tggatgctctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttgaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattatcctttta 24045787  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  24045786 att 24045784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 524 - 723
Target Start/End: Original strand, 40791027 - 40791225
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  40791027 tgtgtttggtatcacggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-ttatgtt 40791125  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  40791126 tggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatgaccatattatcccttta 40791225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 548 - 694
Target Start/End: Original strand, 7385913 - 7386059
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||    
T  7385913 aattgattttgatagaattaagttttagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattgatttatgtttaaatacacttatttaaaagtgat 7386012  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7386013 tcttatgagttgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgctttt 7386059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32030845 - 32030666
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||  | |||||| ||    
T  32030845 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttagatgtgaattgatttttgttttgatatacttattcaaaagtgat 32030746  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  32030745 tcttat--gttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaaggtgtaatgactaaactatccttttagttgta 32030666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 548 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 3667985 - 3667833
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  3667985 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgttaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgat 3667886  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  3667885 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 3667833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 35760344 - 35760168
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35760344 tgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 35760245  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||||||   |||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  35760244 tggatacactcaattaaaactgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 35760168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 548 - 700
Target Start/End: Original strand, 41740574 - 41740726
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  41740574 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattataggtgagtttgagatgaattggtttatgtttgaatacacttgtttaaaagtgat 41740673  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41740674 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 41740726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Original strand, 16158446 - 16158624
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||    
T  16158446 aattgatttttatagatttgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattaatttatatttggatgcacttttttaaaagtgat 16158545  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||| || |||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  16158546 tcttaggaattgatgttctttggatgatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaaatattcttttaatt 16158624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 548 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 4292280 - 4292120
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  4292280 aattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaaataagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttaattagaagtgat 4292181  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgac 708  Q
    |||| |  |||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4292180 tcttgttggttgatattgtttggataatttgaatcaaaattaattttgaatgtgtaatgac 4292120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 524 - 693
Target Start/End: Original strand, 5710343 - 5710511
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  5710343 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgctttatgtt 5710442  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattt 693  Q
    ||||||| |||  ||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  5710443 tggatacgctt-attacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattt 5710511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 551 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 27021256 - 27021085
Alignment:
Q  551 tgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattct 650  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  27021256 tgattttgatataattgagtttgagaaaattgattttggttaaaaatgagttaaatgtgaattgatttatgtttgg-tatactcacttaaaagtgattct 27021158  T
Q  651 tatgagttgatgttgtttggat-attttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    ||  |||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  27021157 tagaagttgatgttgtttggataagattgaatcaaaattgattttgaatgtataatgacgaaattatcctttt 27021085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 594 - 729
Target Start/End: Original strand, 28869530 - 28869664
Alignment:
Q  594 aagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattt 693  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||| |||||    
T  28869530 aagttagttggatgtggattgatttatgtttgaatacacttacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt-gagtaaaatagattt 28869628  T
Q  694 tgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28869629 cgagtgtgtaatgaccaaattatccttttaattgta 28869664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 546 - 669
Target Start/End: Original strand, 34106926 - 34107049
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagta 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||| |   |||||||||    
T  34106926 aaaattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgattaatgtttaaatacattcatttaaaagta 34107025  T
Q  646 attcttatgagttgatgttgtttg 669  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  34107026 attcttatgaattaatgttgtttg 34107049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 548 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 7178908 - 7178760
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||| | ||    
T  7178908 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattaattttgactaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgat 7178810  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaa 697  Q
    |||||| | || ||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||    
T  7178809 tcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgcttttgaa 7178760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 548 - 654
Target Start/End: Original strand, 23914235 - 23914341
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||    
T  23914235 aattgattttgatagaattgattttgagagaattgattatacttaaaattgagttggatatgaattgatttacgtttggatacacccatttaaaagtgat 23914334  T
Q  648 tcttatg 654  Q
    |||||||    
T  23914335 tcttatg 23914341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 548 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 19784944 - 19784864
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggat 628  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  19784944 aattgattttgattgaattgattttatttgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtggtttatgtttggat 19784864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 602
Target Start/End: Original strand, 35847871 - 35847925
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35847871 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 35847925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 540 - 629
Target Start/End: Original strand, 2483687 - 2483776
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2483687 gtggagaaaattgatttggacataattgattttgttggaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggata 2483776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 712
Target Start/End: Original strand, 2694741 - 2694905
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactt-ccttaaaagtaa 646  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    | |||| |||||| ||| |||| ||||  | ||||||| |    
T  2694741 aattgattttgtcagaattgattttgattgaattgattttggttaaaagtgagttgatcataaattaatttatttttagata-acttaacataaaagtga 2694839  T
Q  647 ttcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaa 712  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  2694840 ttcttatcaattgatgatgtttgtataatttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaattaccaaa 2694905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 22811128 - 22811075
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  22811128 gaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 22811075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 16843660 - 16843514
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |   ||   |||||| ||| ||||      || | ||    
T  16843660 aattgattttgatataattgagtttgaacgaatagattttggttaaaagtgaattggatgtggaccaat---tgtttgtatatactt------aaatgat 16843570  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgta 703  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||    
T  16843569 ttttacgagttgatgttgtttggatagtttaaatgataattgattttgaatgtgta 16843514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 20069033 - 20068960
Alignment:
Q  560 tagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacact 633  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||    
T  20069033 tagaattgagtttgatcgaattgattttggtcaaaagtgagttgagtttaaatttatttatgtttggatacact 20068960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 41959561 - 41959472
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgttt 668  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||   | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41959561 aattaattttagttaaaagtgagttaaaagtgaattaatttatgtttggaaacac-cacataaaagtgattcttatgagttaatgttgttt 41959472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 526 - 630
Target Start/End: Original strand, 33467951 - 33468055
Alignment:
Q  526 tgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    |||||||| |||| ||||  | |||||||||| | | |||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||    
T  33467951 tgtttggtttgacggtggttagaattgattttaacaaaattgattttgatagaactgattttggttaaaagtgagttgagtgtatattgatttgtgtttg 33468050  T
Q  626 gatac 630  Q
    |||||    
T  33468051 gatac 33468055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 628
Target Start/End: Original strand, 2868363 - 2868414
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggat 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  2868363 gaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttaagtttggat 2868414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 546 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 9861214 - 9861131
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||  | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9861214 aaaattgatttttattgaattg--tttagctaaattgattttagttaaaatttagttggatgtgaagtggtttatgtctggataca 9861131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 548 - 630
Target Start/End: Original strand, 19203986 - 19204067
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| ||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  19203986 aattgattttggtagaattgattttacat-aattgattatgaataaaagtgagttggatgaaaagtgatttttgtttggatac 19204067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 29923043 - 29922990
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  29923043 aattgattttgactataagtgagttgaatgtgaagtaatttatgtttggataca 29922990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 42850180 - 42850385
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42850180 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 42850279  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42850280 tggatacacttccttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 42850379  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  42850380 attgta 42850385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 505 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 25230190 - 25229970
Alignment:
Q  505 aattatctatattactatttgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttgg 604  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||     
T  25230190 aattatatataatactatgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaactgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttga 25230091  T
Q  605 atgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtat 704  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||||||     
T  25230090 atgtgaattga-ttatgtttggatacactttaatagaagtgattcttattagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgagtgtgtaa 25229992  T
Q  705 tgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25229991 tgaccaaattatccttttaatt 25229970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 524 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 31223539 - 31223339
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31223539 tgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 31223440  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31223439 tggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatcctttta 31223340  T
Q  724 a 724  Q
    |    
T  31223339 a 31223339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 7826315 - 7826520
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7826315 tgtgtttggtttggcggtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagcttgatgtgaattgatttatgtt 7826414  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||| ||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7826415 tgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaagttatcctttta 7826514  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  7826515 attgta 7826520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 20800238 - 20800443
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20800238 tgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 20800337  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  20800338 tggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaatattgattttgaatgtataatgactaaattatcctttta 20800437  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  20800438 attgta 20800443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 526 - 725
Target Start/End: Original strand, 40229433 - 40229632
Alignment:
Q  526 tgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40229433 tgtttggtatgacggtgatgaaaattgattttgatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttg 40229532  T
Q  626 gatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaat 725  Q
    ||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40229533 gatacactttcttacaggtgattcttctgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccaaactatccttttaat 40229632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 1199992 - 1199787
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1199992 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 1199893  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||    
T  1199892 tggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgactaaactatcttttta 1199793  T
Q  724 attgta 729  Q
     |||||    
T  1199792 gttgta 1199787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 35569163 - 35569368
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35569163 tgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 35569262  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||    
T  35569263 tggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgactaaactatcatttta 35569362  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  35569363 attgta 35569368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 526 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 45710211 - 45710012
Alignment:
Q  526 tgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45710211 tgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgtatgtgaattga-ttatgtttg 45710113  T
Q  626 gatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaat 725  Q
     ||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  45710112 aatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatccttataat 45710013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 48511073 - 48510875
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48511073 tgtgtttggtatggcggcggcgagaattgattttgattgaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 48510974  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||    
T  48510973 tggatacacttgcttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgtaatgatcaaactatcctttt 48510875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Original strand, 43728863 - 43729043
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  43728863 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgatt-atgtttggataaacttatttaaaagtgat 43728961  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  43728962 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatattaaatgaccaaattacccttttatttgta 43729043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 524 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 47123551 - 47123381
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47123551 tgtgtttggtatggcggtggcaaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtt 47123452  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  47123451 tggatacacttcgttaaaagtgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgctttt 47123381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 5410804 - 5410600
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | | ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5410804 tgtgtttggtttggcggcggcgagaattgattttgatataattgaatttgaaagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtaaattgatttatgtt 5410705  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  5410704 tgaatacactac-ttaaaagtgattcttatgacttgatgttgtttggatagtttgaatcataattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcctttta 5410606  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  5410605 attgta 5410600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 563 - 729
Target Start/End: Original strand, 4369803 - 4369968
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatg 662  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4369803 aattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttg-atgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 4369901  T
Q  663 ttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4369902 ttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattatccttttaattgta 4369968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 11023291 - 11023495
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  11023291 tgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaattga-ttatgtt 11023389  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||| |   |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  11023390 tggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttaccctttta 11023489  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  11023490 attgta 11023495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 12247584 - 12247380
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  12247584 tgtgtttggtatagcggtgatgaaaattgattttaatagaattgagtttaagagaattgattctggttaaaagtgagttggatgtaaatt-aattatgtt 12247486  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||    
T  12247485 tggatacacttgtttaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggagaatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattaccctttta 12247386  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  12247385 attgta 12247380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 524 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 13056162 - 13055963
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13056162 tgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtgaattgatttatgtt 13056063  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    || |||| |||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  13056062 tgaatacgctt-attaaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgcgtaatgacgaaattaccctttta 13055964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 6166274 - 6166070
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  6166274 tgtgtttggtatcgcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatctgaattgatt-atgtt 6166176  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  6166175 tggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttaccctttta 6166076  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  6166075 attgta 6166070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 10470754 - 10470554
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  10470754 tgtgtttggtagggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-ttatgtt 10470656  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||| |    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  10470655 tggatacacgttaacagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtatagtgactaaattatccttcta 10470556  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  10470555 at 10470554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 673
Target Start/End: Original strand, 27801613 - 27801762
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27801613 tgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtt 27801712  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27801713 tggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggata 27801762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 524 - 724
Target Start/End: Original strand, 50977301 - 50977500
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  50977301 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgttttatgtt 50977400  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||| |||  ||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  50977401 tggatacgctt-attacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattaccctttta 50977499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 555 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 12468346 - 12468176
Alignment:
Q  555 tttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatg 654  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  12468346 tttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatatttggatacacttttttaaaagtgatttttatg 12468247  T
Q  655 agttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  12468246 agttgat-ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatccttttaatt 12468176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 524 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 26058406 - 26058235
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26058406 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattgatttatgtt 26058307  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttg 695  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  26058306 tggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttg 26058235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 6464748 - 6464571
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||   || |||| ||    
T  6464748 aattgattttgatataattgagtttgagtgagttcattttggttaaaagtgagtttaatgtgaattgatt-atgtttttatacactttactagaagtgat 6464650  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  6464649 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatccttataatt 6464571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 36205356 - 36205151
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||| || |    
T  36205356 tgtgtttggtatgacggtggtgagaattgattttaacggaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgggttagatatgaattggtttttgat 36205257  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  36205256 tggataaacttatttaaaagtgattcttacgagtgaatgttgcttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtttaatgaccaaattaacctttta 36205157  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  36205156 attgta 36205151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 35536236 - 35536032
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  35536236 tgtgtttggtatggcggtgatgaaaattaattttaatagaattgagtttgagagaattaattttgattaaaagtgactttgacgtgaattggtt-atgtt 35536138  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    | ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||    
T  35536137 tagatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattaccctttta 35536038  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  35536037 attgta 35536032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31933770 - 31933687
Alignment:
Q  646 attcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31933770 attcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 31933687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 50406295 - 50406119
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50406295 tgtgtttggtatagcggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgaaagatttgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtt 50406196  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| |||| |||||    
T  50406195 tggatgcacttcgttaaaaatgattcttataagttgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgtttttaaatgt 50406119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 15884368 - 15884216
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacact-tccttaaaagtaa 646  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | |||||| |    
T  15884368 aattgattttgatagagttgagtttgacagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacaataaagtaaaaagtga 15884269  T
Q  647 ttcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    || |||| | || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  15884268 tttttataaattcatgttgtttggatagtttggatcaaaattgattttgaatg 15884216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 591 - 726
Target Start/End: Original strand, 11051339 - 11051473
Alignment:
Q  591 taaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattga 690  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  11051339 taaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgaatacacacacttaaaaatggttcttaagagtt-atgttgtttggatagtttgaataaaaattga 11051437  T
Q  691 ttttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11051438 ttttgaatgtgtaatgaccaaattatccttttaatt 11051473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 549 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 13931762 - 13931609
Alignment:
Q  549 attgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaatt 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||  | |||    
T  13931762 attgattttgatagaattgagtttccaaaaattgattttgtttaaaaatgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatatactcacttaaacatgatt 13931664  T
Q  649 cttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgta 703  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13931663 cttacaagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgta 13931609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 524 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 34718616 - 34718467
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  34718616 tgtgtttggtttgacggtggaaaaaattgattttgatagaattgagtttgagataattaattttggttaaaagtgagtttgatataaattgatttatgtt 34718517  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
    || ||||||||    |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||    
T  34718516 tgaatacacttgtacaaaagtgattcttatgaattatagttgtttggata 34718467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 546 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25061369 - 25061221
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagta 645  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||  |  | |||||||     
T  25061369 aaaattgattttgttaaaattgattttggttgaattgattttggttaaaagtgagttgaacataaattgatttatgtttggataccttaacataaaagtg 25061270  T
Q  646 attcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  25061269 attcttatcaattgatgatgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 25061221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 548 - 631
Target Start/End: Original strand, 49242967 - 49243050
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49242967 aattaattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataca 49243050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 40821922 - 40821788
Alignment:
Q  591 taaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattga 690  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    | |||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  40821922 taaaaatgagttgaatgtgaattgatt-atgttaggatacactttaacataagtgattcttatttgttgatgttatttggataatttgaatcaaaattga 40821824  T
Q  691 ttttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
     |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  40821823 gtttgaatgtgcaatgactaaattatccttttaatt 40821788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 664
Target Start/End: Original strand, 291731 - 291818
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgtt 664  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  291731 gaattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaattggtttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattgttatgagttgttgtt 291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 563 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 11561948 - 11561853
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagtt 658  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||   |||||||| |||||||||||||    
T  11561948 aattgagtttgaaagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatatttgaatatactattttaaaagtgattcttatgagtt 11561853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 546 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 4347116 - 4347033
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  4347116 aaaattgattttggtagaattgatttt--gtagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 4347033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 29441325 - 29441271
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29441325 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 29441271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 9447696 - 9447549
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||  || |||||||||| ||| |||||| ||| || ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  9447696 tgtgtttggtatggcggtgaagagaattgattttaataaaattgaatttgagagaaatggttt-ggttaaaagtgagtttgatgtgaatggatt-atgtt 9447599  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
    | |||| |||   |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9447598 tagatatactcatttaaaagtgattctttcgagttgatgttgtttggata 9447549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 40352531 - 40352451
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  40352531 aattgattttgatagaattgattttgtg-gaattgattttggttaaaagtgagtttaatgtaaagtgatttatgtttggata 40352451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 43134591 - 43134536
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttg 603  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43134591 aatttatttggatagaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgagttg 43134536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 544 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 15576599 - 15576519
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgttt 624  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  15576599 cgaaaattgattttaattaaattgagtttaagagaattgattttaattaaaagtgagttagatattaattgttttatgttt 15576519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 670
Target Start/End: Original strand, 23628706 - 23628812
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatg 662  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||| | |||||||| | || |||    
T  23628706 aattgagtttgagataattgattttgactaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatg 23628804  T
Q  663 ttgtttgg 670  Q
    ||||||||    
T  23628805 ttgtttgg 23628812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 42074 - 41989
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||    ||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42074 gtggagaaaattgattttgataaaattgattttgttagaattgattttagtaaaaggtgagttgaacgtgaattgatttatgtttg 41989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 13344913 - 13344836
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  13344913 aattgattttgattgaattgatttt--gtagaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 13344836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 29759762 - 29759710
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  29759762 aattgattatggttaaaagtgagttgaatgtaaaatgatttatgtttggatac 29759710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Original strand, 43730059 - 43730111
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  43730059 aattgattttggttaaaagtgagttgagtgtcaattgatttgtgtttggatac 43730111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 577 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 47085945 - 47085898
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgttt 624  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47085945 gaattgattttaattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgttt 47085898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 561 - 628
Target Start/End: Original strand, 47978359 - 47978426
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggat 628  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  47978359 agaattcattttgagtgaattgattttgggtaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatggttggat 47978426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 6061307 - 6061214
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattt 618  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| | | | ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  6061307 tgtgtttggtttgacggtggtgaaaattgattttgatagaattgaatttgagataattgattataggt-aaagtgaattggatatgagttgattt 6061214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 630
Target Start/End: Original strand, 7765269 - 7765350
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  7765269 aattgattttgatagaattgattttacat-aattgattatgaataaaagtgagttggatgaaaagtgatttttgtttggatac 7765350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 32365190 - 32365143
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32365190 aattgattttagtcaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttg 32365143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 638 - 696
Target Start/End: Original strand, 13855712 - 13855770
Alignment:
Q  638 taaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttga 696  Q
    ||||||| ||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13855712 taaaagtgatttttatgatttcatgtcgtttggatattttagatcaaaattgcttttga 13855770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 577 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 40709287 - 40709234
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40709287 gaattgattttgattaatagtgagttgagtgt-aattgatttatgtttggataca 40709234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 5930872 - 5930823
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||    
T  5930872 gaattgattttggttaaaagtaaattgaatgtaaagtgatttatgtttgg 5930823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 625
Target Start/End: Original strand, 7335840 - 7335941
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgat--tttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatg 621  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||  || |||||||  ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  7335840 tgtgtttggttccacagtgacgaaaattgattttaataaaaatgatttt--gtaaattgatattttagttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatg 7335937  T
Q  622 tttg 625  Q
    ||||    
T  7335938 tttg 7335941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 46830029 - 46830234
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46830029 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 46830128  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46830129 tggatacactttcttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatattctacatcaaaattgattttaaatgtgtattgaccaaattatcctttta 46830228  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  46830229 attgta 46830234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 517 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 39636918 - 39636709
Alignment:
Q  517 tactatttgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgat 616  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39636918 tactatgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattgat 39636819  T
Q  617 ttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattat 716  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||    
T  39636818 ttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtatgaatcaaaattgattttaaatgtgtaacgaccaaaatat 39636719  T
Q  717 ccttttaatt 726  Q
    ||||||||||    
T  39636718 ccttttaatt 39636709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 16566431 - 16566226
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16566431 tgtgtttggtatggcagcagggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 16566332  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  16566331 tggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcctttta 16566232  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  16566231 attgta 16566226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 524 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 51923066 - 51922868
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51923066 tgtgtttggtatggcggcgacgagaattgattttgttagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatctgaattgatttatgtt 51922967  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  51922966 tggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaactatcctttt 51922868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 43781479 - 43781683
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  43781479 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatgtt 43781577  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||  |    
T  43781578 tggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatccttgca 43781677  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  43781678 attgta 43781683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 524 - 721
Target Start/End: Original strand, 26651808 - 26652005
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26651808 tgtgtttggtatggcggcggcgagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 26651907  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 721  Q
    | |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26651908 tagatacactttactaaaagtaattcttatgagtcgatgttatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaactatccttt 26652005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Original strand, 43772107 - 43772285
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  43772107 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatcgatttatgtttggatacacttttttagaagtgat 43772206  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43772207 tcttacgagttgatgttgtttggataatatgaatcaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaactatccttttaatt 43772285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 19592191 - 19592396
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19592191 tgtgtttgatatggcggtggggagaattgattttgatagaattgagttttagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgatttatgtt 19592290  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  19592291 tggatacactttactaaaagtgattcttacgaattgacgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattattctttta 19592390  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  19592391 attgta 19592396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 548 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 49136624 - 49136444
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||| || || |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  49136624 aattgattctggtataattgagtttgagagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgat 49136525  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgt 728  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  49136524 tcttatgagttgatgttgtttgaataattttaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatccttttaattgt 49136444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 14072628 - 14072427
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  14072628 tgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgtttaaaagtgagttgaaggtaaattgatt-atgtt 14072530  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14072529 tggatacactttaatagaagtgattctaatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcctttta 14072430  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  14072429 att 14072427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Original strand, 32238019 - 32238220
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  32238019 tgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattg-gttatgtt 32238117  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  32238118 tggatacactatattagaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaactgattttgaatgtctaatgactaaattatccttata 32238217  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  32238218 att 32238220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Original strand, 6138580 - 6138780
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6138580 tgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgaaataattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 6138679  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  6138680 tggatacacttatttaaaaatgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattga-tttgaatgtgtaatgaccaaactatcatttta 6138778  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  6138779 at 6138780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 527 - 726
Target Start/End: Original strand, 42944861 - 42945060
Alignment:
Q  527 gtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    |||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  42944861 gtttggtacggcggtggcaagaatttattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttag 42944960  T
Q  627 atacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  42944961 atatacttacttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaaactatccttttaatt 42945060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Original strand, 9889295 - 9889495
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  9889295 tgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaattg-tatatgtt 9889393  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  9889394 tggatacactcacttgaaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcctttta 9889493  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  9889494 at 9889495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 9893837 - 9893636
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  9893837 tgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgatttttgtcaaaagtgagttagatatgaattgatatatgtt 9893738  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  9893737 tggatacacccacttgaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttaaattaaaattgattttgaatgtataatgattaaattatcctttta 9893638  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  9893637 at 9893636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 30842257 - 30842053
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  30842257 tgtgtttggtatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatgtt 30842159  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  30842158 tggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgacaaaattatcctttta 30842059  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  30842058 attgta 30842053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 15603486 - 15603282
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15603486 tgtgtttggtttgacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattatggtaaaaagtgagtttgatgtgaattgatttgtgtt 15603387  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    | |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||     
T  15603386 tagatatacttgcttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaagtcaaaattgattttgaatgcacaatgatcaaattatccttttg 15603287  T
Q  724 attgt 728  Q
    |||||    
T  15603286 attgt 15603282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 28987144 - 28986942
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  28987144 tgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatgtt 28987046  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    || |||||||  |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||    
T  28987045 tgaatacactcactt--aagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttaccatttta 28986948  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  28986947 attgta 28986942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 49519832 - 49519654
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  49519832 aattggttttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatttatttatgtttggatacacttgcttaaaaatgat 49519733  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | |  || |||||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  49519732 tcttatgaattgatattgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaactatcattttaatt 49519654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 54153170 - 54152969
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54153170 tgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttaatataattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatgtt 54153072  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    || ||||||||   || |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  54153071 tgaatacactttactagaagtgattctcatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatccttata 54152972  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  54152971 att 54152969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Original strand, 48407682 - 48407862
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  48407682 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttgaaagtgat 48407780  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||    
T  48407781 tcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgacaaaattatccttttaattgta 48407862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 548 - 722
Target Start/End: Original strand, 14564130 - 14564304
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttc-cttaaaagtaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  14564130 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaattgatttatgtttggatac-cttcagttaaaagtga 14564228  T
Q  647 ttcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  14564229 ttcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgattttgaatatataatgaccaacttatcctttt 14564304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 563 - 729
Target Start/End: Original strand, 4954050 - 4954216
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatg 662  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4954050 aattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 4954149  T
Q  663 ttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4954150 ttgtttggataggttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgacctaattatccttttaattgta 4954216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 54150652 - 54150482
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  54150652 tgtgtttggtatggcggtggcaagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtt 54150553  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  54150552 tggatacacttcgttaaaaatgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgctttt 54150482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 13183010 - 13183215
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||||||    
T  13183010 tgtgtttggtatgacggtgacgataattgattttgataaaattgagtctgagataattgattttggttaaaagcaagtttaaggtgaattgatttatgtt 13183109  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||| | ||| |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |    
T  13183110 tggatacacttatttaaaaatgatttttataagttgatgttttttggataatttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaactatcctttaa 13183209  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  13183210 attgta 13183215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 524 - 723
Target Start/End: Original strand, 26426075 - 26426273
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  26426075 tgtgtttggtatgacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatataaattga-ttatgtt 26426173  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  26426174 tggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatgaccatattatcccttta 26426273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Original strand, 54735635 - 54735812
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||  | ||||||||| ||    
T  54735635 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaat-tgagtttgatgtaaattggtttatgtttggaaacatatacttaaaagtgat 54735733  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  54735734 tcttatgagttgatgttgtttgagtattttaaatcaaaattgatcttgaatgtgtaatgaccaaagtatccctttaatt 54735812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 548 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6505303 - 6505124
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| ||    
T  6505303 aattgactttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttagatacactcatataaaagtgat 6505204  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattg 727  Q
    | | |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||    
T  6505203 tatcatgacttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataatgactgaattatccttttaattg 6505124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 524 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 48550343 - 48550172
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48550343 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtt 48550244  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttg 695  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  48550243 tggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatattgtttggatagattggattaaaattgattttg 48550172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 577 - 724
Target Start/End: Original strand, 48550440 - 48550587
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48550440 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataaactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtt 48550539  T
Q  677 tacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaa 724  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  48550540 tgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgatcaaactatcattttaa 48550587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 14076116 - 14075939
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||    
T  14076116 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaa-gtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggaaacatatacttaaaagtgat 14076018  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14076017 tcttatgaattgatgttgtttgagtactttaaatcaaaattaatcttgaatgtgtaatgaccaaagtatccctttaatt 14075939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 548 - 700
Target Start/End: Original strand, 29149291 - 29149443
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  29149291 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgat 29149390  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  29149391 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 29149443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 548 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25312817 - 25312671
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||    
T  25312817 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtttggatacactttgttaaaagcgat 25312718  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  25312717 tcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgctttt 25312671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 577 - 729
Target Start/End: Original strand, 56241848 - 56242000
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||  ||    
T  56241848 gaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacattaatgtaaaagtgattcttatgagttgataatgtttagatgatt 56241947  T
Q  677 tacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  56241948 taaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaaatatccttttaattgta 56242000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 561 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 15619703 - 15619538
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttga 660  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  || |||| |||| | || |||||    
T  15619703 agaattgagtttgagagaattgattttggtaaaaagtgagttggatgtgaattgatgtatgtttggatacattac--tataagtgattcatgtgggttga 15619606  T
Q  661 tgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  15619605 tgttgtttggatagtttgaatcaaaa-tgatcttgaatgtgtaatgactaaattatcattttaattgta 15619538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 524 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 39187860 - 39187715
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  39187860 tgtgtttggtttggcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaatttgaatgtgaattgatttatgtt 39187761  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttg 669  Q
    |||||||||||   || |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  39187760 tggatacactttactagaagtgattcttgttagttgatgttgtttg 39187715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 524 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 48908399 - 48908228
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | | || ||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  48908399 tgtgtttggtttggcggcggtgaaaattgattttaatattattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattg-gttatgtt 48908301  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaa 697  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  48908300 tggatac-ctcgcttaaaagtaattcatataagttgatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgattttgaa 48908228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 578 - 726
Target Start/End: Original strand, 2175161 - 2175309
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatatttt 677  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||    
T  2175161 aattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagttt 2175260  T
Q  678 acatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
      || ||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||    
T  2175261 gaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattatccttttaatt 2175309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 524 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 13167651 - 13167476
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13167651 tgtgtttggtatggcggtaggaaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatatt 13167552  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    |||||||||    |||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||    
T  13167551 tggatacacccatttaaaagtgattcttatgtattaatgatgtttggatagattgaatcaaaattgcttttaaatg 13167476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 524 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 46926174 - 46926010
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46926174 tgtgtttcgtacgacggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtt 46926075  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaatt 688  Q
    ||||||||||   |||||||| ||| |||||| || || || |||  |||||||  |||||||||    
T  46926074 tggatacactcgtttaaaagtgatttttatgaattaattttatttatatattttgaatcaaaatt 46926010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 524 - 722
Target Start/End: Original strand, 31520331 - 31520528
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  |  |||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31520331 tgtgtttggtatagcgatggcgagaattgattttggtagaatgaagtttgaaagaattaattttggttaaaagtgagttgggtgtgaatggatttatgtt 31520430  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    | ||||  |||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  31520431 tagatatgctt-attaaaagtgatttttatgagttgatgttttttgggtagtttgaataaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaatcatcatttt 31520528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 524 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 41866280 - 41866176
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41866280 tgtgtttggtttggcggtggcgataattgattttgataaaattgagtttgagggaattgagtttagttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 41866181  T
Q  624 tggat 628  Q
    |||||    
T  41866180 tggat 41866176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 14054977 - 14054801
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14054977 tgtgtttggtacggcagtgacgggaattgattttgacataattgagtttgaaagaattgagtttagtcaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtt 14054878  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||   ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  14054877 tggataaacttatataaaagtgattatttcaagttgatgttgtttgaatactttaaattaaaattgattttggatgt 14054801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 577 - 724
Target Start/End: Original strand, 30887167 - 30887313
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  30887167 gaatttattttagttaaacgtgagtttgatga-aattgatttatgtttggatacaccaatataaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggatggtt 30887265  T
Q  677 tacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaa 724  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30887266 tgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaattaaccttttaa 30887313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 38694150 - 38693974
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  38694150 aattaattttgatatgattgagtttaaaagaattgattttgtctaaaagtaagttgagtgcaaattagtttatgtttggatacactcgcttaaaagtgat 38694051  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  38694050 tcttatgggttgatcttgcttgaataatttaaatcaaaattaattttgaa--tgtaatgaccaaattatacttttaatt 38693974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 542 - 643
Target Start/End: Original strand, 55638733 - 55638834
Alignment:
Q  542 ggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaa 641  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  55638733 ggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgagttaaatgtaaattgatttatgtttagatacacttatttaaa 55638832  T
Q  642 ag 643  Q
    ||    
T  55638833 ag 55638834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 555 - 695
Target Start/End: Original strand, 19599487 - 19599625
Alignment:
Q  555 tttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatg 654  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||     
T  19599487 tttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatgcaattacttaaaattgattcttatc 19599585  T
Q  655 agttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttg 695  Q
    | || ||||||||||| |||||   |||||||||| |||||    
T  19599586 aatttatgttgtttgg-tatttagaatcaaaattgcttttg 19599625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 545 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 38264004 - 38263881
Alignment:
Q  545 gaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagt 644  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  38264004 gaaaattgattttgatataattgagtttgagaaaattaattttgcttaaaattgagtttgatgtgaattaatttatgtttgaatatactcacttaaaagt 38263905  T
Q  645 aattcttatgagttgatgttgtttg 669  Q
     || |||||||||| ||||||||||    
T  38263904 gatacttatgagtt-atgttgtttg 38263881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 554 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 33574274 - 33574203
Alignment:
Q  554 ttttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33574274 ttttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttg 33574203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 38306113 - 38305962
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||| |||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |     |||||| ||    
T  38306113 aattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgcgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaagtgat 38306014  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    |||||| | || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  38306013 tcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttgaatg 38305962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 54488707 - 54488556
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||| |||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |     |||||| ||    
T  54488707 aattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaataccttaaagcaaaagtgat 54488608  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    |||||| | || || |||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||    
T  54488607 tcttataaattcattttgtttggataacttggatcaaaattgattttaaatg 54488556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Original strand, 55638869 - 55638952
Alignment:
Q  646 attcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  55638869 attcttatgagttgatattgtttggataatatgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcattttaattgta 55638952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 694
Target Start/End: Original strand, 26402960 - 26403070
Alignment:
Q  584 ttttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatca 683  Q
    ||||| ||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||  ||||    
T  26402960 ttttgattagaagtgatttagatatgaattgatttatgtttgaatccatttctttaaaagtaattcttatgaattaattttgtttgtatattttgaatca 26403059  T
Q  684 aaattgatttt 694  Q
     ||||| ||||    
T  26403060 taattgttttt 26403070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 626
Target Start/End: Original strand, 28947733 - 28947811
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtg-aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  28947733 aattgattttggtggaattga-tttaagtggaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 28947811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 53532079 - 53531996
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||    
T  53532079 aattgattttgataaaattgagtttgacataattgattttagttaaaagtgagttggatgtaacgtggtttatgtttggctaca 53531996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 602
Target Start/End: Original strand, 4649913 - 4649967
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagtt 602  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4649913 aattgattttgataaaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagcgagtt 4649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 33843869 - 33843803
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33843869 aattgattttgattgaattgattctggctaaaagtgagttggatgtaaagtgatttatgtttggata 33843803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 650
Target Start/End: Original strand, 45779994 - 45780095
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||| ||||| |||||| |  ||||||||| ||    
T  45779994 aattgatttcgatagaattgagtttgaga-aattgattttggtaaaaagtgagtttggtatgaattaatttttgtttagatacattcacttaaaagtgat 45780092  T
Q  648 tct 650  Q
    |||    
T  45780093 tct 45780095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 53914987 - 53914918
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53914987 agaattgagtttcagagaatcgattttgactaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggataca 53914918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 523255 - 523166
Alignment:
Q  545 gaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactt 634  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || |   ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  523255 gaaaattgattttgatttaattgagcttgacaaaattgattttgggaaaaagtgagttcaatatgaattgatttatgtttggattcactt 523166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 16492999 - 16492946
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16492999 aattgagtttgattaaaagtgagttgaatgtgaatttatttatgtttggataca 16492946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 22699815 - 22699762
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  22699815 gaattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 22699762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Original strand, 22980715 - 22980768
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  22980715 gaattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 22980768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Original strand, 22994302 - 22994355
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  22994302 gaattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 22994355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 623
Target Start/End: Original strand, 22694581 - 22694656
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||    
T  22694581 aattgattttggtagaattga-tttaagtagaattgattttggttaaaagtgagttgaacataaagtgatttatgtt 22694656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 631
Target Start/End: Original strand, 54487219 - 54487287
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  54487219 aattgagtttgatagaattgatttcgatcaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttggataca 54487287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 54655358 - 54655266
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgat 616  Q
    ||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  54655358 tgtgtttggtacggcggtgacgataattgattttgacataattgagtttaaaataattgattttagtcaaaagtgtgtttgatgtgaattgat 54655266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 36150676 - 36150625
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  36150676 aattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 36150625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Original strand, 38740316 - 38740369
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  38740316 aattgattttggataaaagtgagttgaagttgaagtgatttatgtttggataca 38740369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 39993663 - 39993574
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    |||| ||||||||||  | | |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  39993663 gtggagaaaattgatcataagagaattgattttcatagaattgattttgattaaaaatgagttaaatgtgaattgatttatgtttagata 39993574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 660 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 48908129 - 48908095
Alignment:
Q  660 atgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48908129 atgttgtttggataatttacatcaaaattgatttt 48908095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 590 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 8754217 - 8754177
Alignment:
Q  590 ttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8754217 ttaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggataca 8754177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 46958096 - 46958047
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||||||||||    
T  46958096 gaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtaatttatgtttgg 46958047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 638 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 48257115 - 48257054
Alignment:
Q  638 taaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  48257115 taaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataaattggatcaaaattgattttgaatg 48257054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 655 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 54655245 - 54655200
Alignment:
Q  655 agttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  54655245 agttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgattttggatgt 54655200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 540 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 3348368 - 3348179
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctta 639  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3348368 gtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttagaagtgagttggatgtaaattgatttatgtttggatacacttcctta 3348269  T
Q  640 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3348268 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttatatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 3348179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 524 - 721
Target Start/End: Original strand, 10853227 - 10853424
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  10853227 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtt 10853326  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 721  Q
    |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10853327 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 10853424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 10334279 - 10334074
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10334279 tgtgtttgatatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtcagttgaatatgaattgatttatgtt 10334180  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  10334179 tggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatttataatgaccaaactatcctttta 10334080  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  10334079 attgta 10334074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 50664899 - 50664699
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50664899 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 50664800  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||   |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50664799 tggatacacacacttagaagtgattcttaagagtt-atgttgtttagatagtttaaattaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaattatcctttta 50664701  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  50664700 at 50664699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 524 - 724
Target Start/End: Original strand, 38172267 - 38172467
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38172267 tgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtgggatgtgaattgatttatgtt 38172366  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38172367 tggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatcctttta 38172466  T
Q  724 a 724  Q
    |    
T  38172467 a 38172467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 540 - 729
Target Start/End: Original strand, 52966785 - 52966974
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctta 639  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  52966785 gtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgactttgatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcactta 52966884  T
Q  640 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52966885 aaagtgattcttatgagttgatgttgtttagataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattatccttttaattgta 52966974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 20813286 - 20813082
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20813286 tgtgtttggtatatcggtggagagaattgattttgatagaat-gagtttgagagaattgtgtttggttaaaagtgagttggatttgaattgatttttgtt 20813188  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  20813187 tggatatacttattcaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcctttta 20813088  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  20813087 attgta 20813082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42318470 - 42318266
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  42318470 tgtgtttggtatagcggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtt 42318372  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  42318371 tggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgacaaaattatcctttta 42318272  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  42318271 attgta 42318266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 560 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 44224867 - 44224699
Alignment:
Q  560 tagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttg 659  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  44224867 tagaattgagtttgagataattgattatggttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttg 44224768  T
Q  660 atgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgt 728  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44224767 atgttgtttggataattttagtcaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatccttttaattgt 44224699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 728
Target Start/End: Original strand, 15511336 - 15511539
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15511336 tgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaacggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgggtgtgaattgatttatgtt 15511435  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||    
T  15511436 tggatacgctt-attaaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgcgtaatgacgaaattactctttta 15511534  T
Q  724 attgt 728  Q
    |||||    
T  15511535 attgt 15511539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 53075022 - 53074839
Alignment:
Q  545 gaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagt 644  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  53075022 gaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacactcacttaaaagt 53074924  T
Q  645 aattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  53074923 gattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgcgtaaagaccaacttacccttttaattgta 53074839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 555 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 53179958 - 53179788
Alignment:
Q  555 tttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatg 654  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  53179958 tttgatagaattgagttttatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatg 53179859  T
Q  655 agttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  53179858 agttgat-ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatccttttaatt 53179788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 548 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 35425450 - 35425277
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||| ||    
T  35425450 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttaacagaagtgat 35425352  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35425351 tcttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcctttt 35425277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 524 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 38340946 - 38340749
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38340946 tgtgtttggtatggcgttggtgagaattgattttgatagaatgaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 38340847  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    ||||||  |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38340846 tggatatgctt-attaaaagtaatttttataagttgacgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttaaatgtgtagtgaccaaattatcctttt 38340749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 38125402 - 38125606
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||    
T  38125402 tgtgtttggtatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattgatt-atgtt 38125500  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  38125501 tggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgacaaaattatcctttta 38125600  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  38125601 attgta 38125606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 548 - 720
Target Start/End: Original strand, 8424714 - 8424885
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||    
T  8424714 aattgaatttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtgaattgatt-atgtttggatacacttcaatagaagtgat 8424812  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctt 720  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  8424813 tcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaatgactaaattatcctt 8424885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 16246056 - 16246259
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | || |||| ||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16246056 tgtgtttggtttggcggtagcgagaattgatattaatagaattgagtttgag--aattgattttagttaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtt 16246153  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||| ||||||   || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  16246154 tggaaacactttaatagaagtgattcttaggagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaactatcctttta 16246253  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  16246254 attgta 16246259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 527 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 35930876 - 35930674
Alignment:
Q  527 gtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  35930876 gtttggtatatcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgcttgg 35930777  T
Q  627 atacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |||||||    || |||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  35930776 atacactaatgtataagtcattcttatgagttgataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaaatatcattttaatt 35930677  T
Q  727 gta 729  Q
    |||    
T  35930676 gta 35930674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Original strand, 44939376 - 44939576
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  44939376 tgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgaatttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatatgaattga-ttatgtt 44939474  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  44939475 tggatacatttac-tataagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagttttaatcaaaattaattttgaatgtctaatgactaaattatccttata 44939573  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  44939574 att 44939576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Original strand, 48189402 - 48189602
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  48189402 tgtgtttggtagggcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-ttatgtt 48189500  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||| |    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  48189501 tggatacacgttaacagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatccttcta 48189600  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  48189601 at 48189602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 23496434 - 23496260
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||    
T  23496434 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatac-------taaaagtgat 23496342  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||    
T  23496341 tcttgcgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgactaaactatcattttaattgta 23496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Original strand, 30811492 - 30811693
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30811492 tgtgtttggtagggcggtgacgagaattgattttgatataattgaatttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatgtt 30811590  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||    | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  30811591 tggatacactttaacagaagtgattcttatgacttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgattaaattattctttta 30811690  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  30811691 att 30811693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 26519805 - 26519629
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26519805 tgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 26519706  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||    
T  26519705 tggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaaacaaaattgattttaaatgt 26519629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 577 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31084295 - 31084144
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  31084295 gaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactt-cttaaaagtgattcttatgacttgatattatttggatagtt 31084197  T
Q  677 tacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |  |||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  31084196 tgaatcataattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcattttaattgta 31084144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 542 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 21225113 - 21224939
Alignment:
Q  542 ggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaa 641  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21225113 ggcgagaattgatctctatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatatatgtttggatacactttcttaaa 21225014  T
Q  642 agtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattat 716  Q
    ||  ||||||| |||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||    
T  21225013 agcgattcttacgagttgatgtcgttttgatagtttgaatcaaaattgattatgagtgtataatgaccaaattat 21224939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 540 - 729
Target Start/End: Original strand, 23207044 - 23207231
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctta 639  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23207044 gtggcgaaaattgattttgatataattgattttgttataattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactttttta 23207143  T
Q  640 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  23207144 caagtgatt-ttatgagttgatgttgttt-gatagtttgaatcaaaattaattttgaacttgtaatgaccaaaccatccttttaattgta 23207231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 524 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4984722 - 4984569
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4984722 tgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttgatataattgaatttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtt 4984623  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatatttt 677  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||  || || ||||||| |||||||    
T  4984622 tggatacactcgtttaaaagtgattcttatgcattaattttgtttgtatatttt 4984569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 527 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 42475847 - 42475680
Alignment:
Q  527 gtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||||| || | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  42475847 gtttggtttggcggtgacgagaattgatttttatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtttga 42475748  T
Q  627 atacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  42475747 atacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgctttt 42475680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 524 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 55154642 - 55154534
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  55154642 tgtgtttggtatggcagtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatgtt 55154544  T
Q  624 tggatacact 633  Q
    | ||||||||    
T  55154543 tagatacact 55154534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 561 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 25848136 - 25847969
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttc-cttaaaagtaattcttatgagttg 659  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||     
T  25848136 agaattgagtttgagaaaattaattttggtaaaaagtgagtttaatatgaattgatttatgtttggatac-cttcacttaaaaatgattcttatgagttt 25848038  T
Q  660 atgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
     ||||||||||||| || | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  25848037 gtgttgtttggatagttga-ataaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattatactttaaattgta 25847969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 538 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 34561235 - 34561074
Alignment:
Q  538 cagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcct 637  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  34561235 cagtggagaaaattgattttgatagaattaagtttgataaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgcgaattgatttatgtttggatacattgact 34561136  T
Q  638 taaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    || || | |||||||  | || |||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||    
T  34561135 tagaattgattcttaaaaattaatgttggttggatagtttgacccaaaattgattttgaatg 34561074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 548 - 669
Target Start/End: Original strand, 40415280 - 40415401
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   ||||||  ||||    
T  40415280 aattgattttgatagaattgagtttaaaggaatcgattttagttaaaagtgagttggatgtaaattaatttatgtttggatatacccacttaaagataat 40415379  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttg 669  Q
    |||||| ||||||| |||||||    
T  40415380 tcttataagttgattttgtttg 40415401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 722
Target Start/End: Original strand, 31618930 - 31619045
Alignment:
Q  607 gtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattg 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| || ||    
T  31618930 gtgaattgatttatgtttggatactctcacttagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtataatg 31619029  T
Q  707 accaaattatcctttt 722  Q
    | ||| ||||||||||    
T  31619030 atcaacttatcctttt 31619045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 544 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 19877538 - 19877448
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactt 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  19877538 cgaaaatttattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtaaattgatttatgtttagatatactt 19877448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 578 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32357597 - 32357447
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatatttt 677  Q
    |||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  32357597 aattgattttggttgaa-gtgaatttgatgtaaattgatttatgtttgaaaacactcatttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttgggtacttt 32357499  T
Q  678 acatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
      || ||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  32357498 gaattaaaattgattttgaacgtgtgatgatcaaaatatccctttaattgta 32357447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 578 - 688
Target Start/End: Original strand, 30809959 - 30810069
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatatttt 677  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| |||    
T  30809959 aattgagtttggttaaaagtgagttaaatgtgaattgatttatgattgattacgcttacttaaaagtgattcttataaattgatgatgtttggatagttt 30810058  T
Q  678 acatcaaaatt 688  Q
      |||||||||    
T  30810059 gaatcaaaatt 30810069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 636 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 22737010 - 22736917
Alignment:
Q  636 cttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  22737010 cttaaaagtgattattatgagttaatgttgttgggatggtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaacaaattatacttttaattgta 22736917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 546 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 52813334 - 52813278
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52813334 aaaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 52813278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 548 - 703
Target Start/End: Original strand, 49526653 - 49526808
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcct-taaaagtaa 646  Q
    |||||| ||||||  |||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |    
T  49526653 aattgagtttgatgaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgaattgattgtaaattgatttatgtttggataca-ttcatgtaaaattga 49526751  T
Q  647 ttcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgta 703  Q
    ||||||| | || |||||||||  ||| | || |||||||||| |||||||||||||    
T  49526752 ttcttatcaatttatgttgtttaaatagtctaaatcaaaattgcttttgaatgtgta 49526808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 7012728 - 7012675
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  7012728 gaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 7012675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 661
Target Start/End: Original strand, 29716674 - 29716783
Alignment:
Q  552 gattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattctt 651  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | | || ||  ||  |||||||| ||||||    
T  29716674 gattttgataaaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgagttaaatatgaattgatttatttatagacacgtttaattaaaagtgattctt 29716773  T
Q  652 atgagttgat 661  Q
    |||| |||||    
T  29716774 atgaattgat 29716783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 548 - 630
Target Start/End: Original strand, 21023201 - 21023281
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtt-taagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  21023201 aattgattttgatagaattgatttgtaa---aattgattttggttaaatgtgagttgaatttgaagtgatttatgtttagatac 21023281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 548 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 42644379 - 42644298
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  42644379 aattgattttgagtgaattgattttataaaaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 42644298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 626
Target Start/End: Original strand, 10852727 - 10852775
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  10852727 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttgg 10852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 44225689 - 44225600
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  44225689 gtggagaaaattgattttaatataattgatttt--gtagaattgattttcgttaaaagtgagtttaatgtaaagtgatttatgtttggatac 44225600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 548 - 715
Target Start/End: Original strand, 14651086 - 14651252
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||| |||| | || |||| ||    
T  14651086 aattgattttaataaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgagttgaatat-aattgatttgtgttttgatatacttacatagaagtgat 14651184  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaatta 715  Q
    | |||  | || | |||||||||||| |||  |||||||| | ||||||| || || | |||||||||    
T  14651185 ttttaccaattcaagttgtttggataatttgaatcaaaatagcttttgaaagtataattaccaaatta 14651252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 650 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 14959734 - 14959655
Alignment:
Q  650 ttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||    
T  14959734 ttatgagttgatgttgtttagatgatttgaatcaaacttgattttgaatgtgtaacgattaaattatctttttaattgta 14959655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 558 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 22737121 - 22737055
Alignment:
Q  558 gatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgttt 624  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  22737121 gatagaattgagtttgaaaaaattgattttggttaaaagtaagtagaatgtaaattgatttatgttt 22737055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 632
Target Start/End: Original strand, 52931586 - 52931640
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacac 632  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  52931586 aattgattttagttaaaagtgagtttagtgtaaattgatttatgtttggatacac 52931640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 577 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 23918930 - 23918881
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23918930 gaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttgg 23918881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 30736212 - 30736172
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatt 617  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30736212 gaattgattttagttaaaagtgagttgtatgtgaattgatt 30736172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 572
Target Start/End: Original strand, 31618372 - 31618420
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagttt 572  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  31618372 tgtgtttggtatgacggtgggaagaattgattttgatagaattgagttt 31618420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 589 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 38626788 - 38626750
Alignment:
Q  589 gttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgga 627  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38626788 gttaaaagtgagttgaatgtgaaatgatttatgtttgga 38626750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 684 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 55154533 - 55154491
Alignment:
Q  684 aaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  55154533 aaattgattttgagtgtgtaatggccaaattatccttttaatt 55154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 25181298 - 25181245
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||    
T  25181298 gaattgattttgattaaaagtgagtttaatgtaaaattatttatgtttggatac 25181245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Original strand, 48089632 - 48089685
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||    
T  48089632 aattgattctagttaaaagtgagttgaatgtaaaatgatttatgattggataca 48089685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 52836072 - 52836019
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  52836072 aattgattttagttaaaagtatgttgaatgtgaattgatttatattgggataca 52836019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 545 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 53568051 - 53567967
Alignment:
Q  545 gaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||  || | ||||||||||||||||    
T  53568051 gaaaattgattttgagtgaattgattttacaa-aattgattttgattaaaagtgagttgaatgaaaagtaatttatgtttggatac 53567967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 3622407 - 3622612
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3622407 tgtgtttgttatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 3622506  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||    
T  3622507 tggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtataaatcaaaattgattttaaatgtgtaacgatcaaagtatcctttta 3622606  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  3622607 attgta 3622612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 37562732 - 37562531
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37562732 tgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 37562633  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37562632 tggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgtatgtgtaatgaccaaactatcctttta 37562533  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  37562532 at 37562531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 527 - 726
Target Start/End: Original strand, 44967349 - 44967548
Alignment:
Q  527 gtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  44967349 gtttggtatgacggtagcgagaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttga 44967448  T
Q  627 atacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44967449 atacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgagtttgtaatgaccaaattatccttttaatt 44967548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 48459872 - 48459670
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48459872 tgtgtttggtatgacgttggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 48459773  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |  || |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  48459772 tggatacacttacttaaaagtgattcttatgaatggatgttgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaactatcctttta 48459673  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  48459672 att 48459670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 39391084 - 39391289
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39391084 tgtgtttggtatggcggtggcgaaaattgattttgatagaattgatttttttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtt 39391183  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  39391184 tggatacactttcttacaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgacctaactatcctttta 39391283  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  39391284 attgta 39391289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 3375628 - 3375447
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  3375628 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgatttgtgtttggatacactcacttaaaagtgat 3375529  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3375528 tcttatgagtcgatgttgtttggatgatttggatcaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatccttttaattgta 3375447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 524 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 3342952 - 3342752
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3342952 tgtgtttggtttggcggtggggagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttggatatgaattgatttatgtt 3342853  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  3342852 tggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcctttta 3342753  T
Q  724 a 724  Q
    |    
T  3342752 a 3342752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 37639592 - 37639387
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37639592 tgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaattgaatgtgaattgatttatgtt 37639493  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||| | ||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  37639492 tggagaaactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgactaaactatcctttta 37639393  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  37639392 attgta 37639387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 38230206 - 38230025
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  38230206 aattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacattttattaaaagtgat 38230107  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    || | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  38230106 tcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgactaaactatccatttaattgta 38230025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 47022081 - 47021876
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  47022081 tgtgtttggtatgatggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttgaaagtgaattgatttatgtt 47021982  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || | || ||||||| || ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  47021981 tggatacactttactagatgtgattcttacgaattgatgttgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatcatttta 47021882  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  47021881 attgta 47021876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 552 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 3750820 - 3750644
Alignment:
Q  552 gattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattctt 651  Q
    |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || | | ||||    
T  3750820 gattttaataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatataattgaatctt 3750721  T
Q  652 atgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3750720 atgaattgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattaatttt-aatgtgtaatgaccaaactatccttttaattgta 3750644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 9456242 - 9456062
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  9456242 aattgattttgatagaattaagttcgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtaaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgat 9456144  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  9456143 tcttatgagttgatcttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaattatctttttaattgta 9456062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Original strand, 12632054 - 12632235
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||  ||||||||| ||    
T  12632054 aattgattttgatagaattttgtttgagagaatagattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtttgagtgtactcgcttaaaagtgat 12632153  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12632154 tcttatgagttgatgttgtttgaattgtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaaatatccttttaattgta 12632235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Original strand, 43737910 - 43738091
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  43737910 aattgattttaacataattgagtttaagagaattgattttgattaaaagttagttagatatgaattgatttttgtttggataaacttatttaaaagtgat 43738009  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  43738010 tcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgaaatgaccaaattaaccttttaattgta 43738091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 545 - 726
Target Start/End: Original strand, 47217509 - 47217690
Alignment:
Q  545 gaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagt 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  47217509 gaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagt 47217608  T
Q  645 aattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
     ||| | ||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||    
T  47217609 gattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattatccttttaatt 47217690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 524 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 48134741 - 48134539
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||| |||||    
T  48134741 tgtgtttggtatggcggttgcgaaaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgggtttgaggagaattgatt-atgtt 48134643  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||    
T  48134642 tggataaacttgtttaaaagtgatttttataagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacctagttatccttgta 48134543  T
Q  724 attg 727  Q
    ||||    
T  48134542 attg 48134539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 721
Target Start/End: Original strand, 10371905 - 10372102
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10371905 tgtgtttggtaaaacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 10372004  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 721  Q
    ||| |||| ||  ||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||    
T  10372005 tggttacagtttattagaagtgattcttgtgggttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgcgtaatgactaaaccatccttt 10372102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 524 - 724
Target Start/End: Original strand, 34365929 - 34366128
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34365929 tgtgtttggtatggcggtggctagaattgattttgatataatggagtttgaaagaattgattttagttaaaagttagttgggtgtgaattgatttatgtt 34366028  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  34366029 tggatacgctt-attaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaaggcgtaatgaccaaattaccctttta 34366127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 524 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 41715819 - 41715648
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41715819 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtt 41715720  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttg 695  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  41715719 tggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttg 41715648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 524 - 723
Target Start/End: Original strand, 43631643 - 43631841
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  43631643 tgtgtttggtatggcggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-ttatgtt 43631741  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||  |||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| || | | || ||||||||||||    
T  43631742 tggatatgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatatattgaatcaaaattgattgtgaatgtataattatcatattatcctttta 43631841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 526 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 32187100 - 32186931
Alignment:
Q  526 tgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32187100 tgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattaattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttg 32187001  T
Q  626 gatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttg 695  Q
    ||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  32187000 gatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttg 32186931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 540 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 34010485 - 34010300
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctta 639  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||   |||    
T  34010485 gtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaactga-ttatgtttgaatacactcattta 34010387  T
Q  640 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  |  | ||||||||||| ||||||||||    
T  34010386 aaagtggttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaacattaaatgaccaaattacccttttaatt 34010300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 34010908 - 34011114
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttgga-tgtgaattgatttatgt 622  Q
    |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  34010908 tgtgtttggtttggcagcggtgataattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggtt-aaagtgagtttgagtgtaaattaatttatgt 34011006  T
Q  623 ttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgttt-ggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 721  Q
    ||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||    
T  34011007 ttggaaacattcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggggtactttaaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccacaatatccctt 34011106  T
Q  722 taattgta 729  Q
    ||||||||    
T  34011107 taattgta 34011114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 557 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 42740521 - 42740352
Alignment:
Q  557 tgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgag 656  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| |    
T  42740521 tgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttgaatgttaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgattcttatgtg 42740422  T
Q  657 ttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  42740421 ttgatattgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaagtatcattttaatt 42740352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 524 - 723
Target Start/End: Original strand, 386428 - 386627
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  386428 tgtgtttggtttggcggtggttaaaattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagttagctgaatgtgaattgatttatgtt 386527  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattga-ttttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||||| |||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  386528 tggatatactaaccgaaaagtgattcttatga-ttgatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttttaaatgtataatgaccaaattatcctttt 386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 524 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 42904715 - 42904551
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42904715 tgtgtttggtatggcagtgggaaaaatgaattttgatagaattgagtttgagagaattgtttttggataaaaatgagttagatgtgaattgatttatgtt 42904616  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaatt 688  Q
    | ||||||||   |||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  42904615 ttgatacactcgtttaaaagtgattcttatgaattaattttgtttgtatattttaaatcaaaatt 42904551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 524 - 673
Target Start/End: Original strand, 37008300 - 37008446
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  37008300 tgtgtttggtat--cggtggcgaaaactgatttttatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtga-ttgatttatgtt 37008396  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37008397 tggagacactttcttataagtgattcttatgagttgatgttgtttggata 37008446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 524 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 46541762 - 46541564
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  46541762 tgtgtttggtttggcggtggttaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttagaagtgagttgaatgtgaattggtttatgtt 46541663  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattga-ttttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    ||  || | |  |  |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  46541662 tgagtatattcaccgaaaagtgattcttatga-ttgatattgttttgatagattgaatcaaaattgatttttaaatgtataatgaccaaattatcctttt 46541564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 524 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 39977714 - 39977544
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  39977714 tgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaatttagtttgaaagaattgattttagtcaaaagtgagtttgatatgaattgatttatttt 39977615  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    |||||| |||    ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  39977614 tggataaactcatataaaagttattatttcaagttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgatttt 39977544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 577 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 32206034 - 32205886
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  32206034 gaattgattttaattaaaagtgggtttgatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgagtt-atgttgttt-gatagta 32205937  T
Q  677 tacatcaaaattgattttgaatgtg-tattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  32205936 tgaatcaaaattgattttaaatgtgcaaatgaccaaattaacctttaaatt 32205886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Original strand, 42752162 - 42752313
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||| |||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |     |||| ||||    
T  42752162 aattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaaataat 42752261  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    |||||| | || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  42752262 tcttataaattcatgttgtttggataacttagatcaaaattgattttgaatg 42752313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 527 - 692
Target Start/End: Original strand, 24770861 - 24771026
Alignment:
Q  527 gtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  24770861 gtttggtatgacggtgacgagaattaattttgatagaattaagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttggatgtaaattgatttatatttag 24770960  T
Q  627 atacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatt 692  Q
    ||| ||     ||||||| ||| |||| | || |||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  24770961 atatacaaaactaaaagtgatttttatcaatttatgttgtttggataatttttgtcaaaattgatt 24771026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 548 - 717
Target Start/End: Original strand, 36920149 - 36920318
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || ||    
T  36920149 aattaattttgataaaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttagatataaattgatttatgtttgaatacgtttaattaaaggtgat 36920248  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatc 717  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||  |||| | || |||||| ||||||    
T  36920249 tcttttgagttgatgttgtttgggtacattgaatcaaaattgattgcgaatatataatgaccatattatc 36920318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 544 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 12964740 - 12964659
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  12964740 cgaaaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttcgttataagtgagttgaatgtagattgatttatgtttg 12964659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Original strand, 39634136 - 39634287
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactt-ccttaaaagtaa 646  Q
    ||||||||| || |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||     |||||| |    
T  39634136 aattgatttggacagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttatgtttggata-acttaaaacaaaagtga 39634234  T
Q  647 ttcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    ||||||| | ||  |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  39634235 ttcttataaattcttgttgtttggataacttggatcaaaattgattttgaatg 39634287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Original strand, 40903115 - 40903290
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  40903115 tgtgtttggttttccagtggcgaaaattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagtt-gaacttaattggtttatgtt 40903213  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    |||||| | |    ||||||| ||| |||| | || |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  40903214 tggatatattaaagtaaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttggatgt 40903290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 646 - 726
Target Start/End: Original strand, 47301626 - 47301706
Alignment:
Q  646 attcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  47301626 attcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgactaaattatccttttaatt 47301706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 617 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 19096005 - 19095894
Alignment:
Q  617 ttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattat 716  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |  | |||||||||||     
T  19096005 ttatgtttggatacactcgtttaaaaatgattcttatgagtt-atgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattac 19095907  T
Q  717 ccttttaattgta 729  Q
     ||||||||||||    
T  19095906 tcttttaattgta 19095894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1766550 - 1766399
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttga 660  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||  |  | ||||||| |||||||| | ||||    
T  1766550 agaattgattttgattaaattgattttgattaaaagtgagttgaacctaaattgatttatatttggataccttaacataaaagtgattcttatcaattga 1766451  T
Q  661 tgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaa 712  Q
    || |||||| ||| |||  || |||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  1766450 tgatgtttgaataatttgaattaaaattgattttgagtgtgtaattaccaaa 1766399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 20089007 - 20088929
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtg-aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  20089007 aattgattttgatagaattga-tttaagtataattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 20088929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 598
Target Start/End: Original strand, 12212440 - 12212490
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtg 598  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  12212440 aattgattttgatagaattgagcttgagtgaattgattttggttagaagtg 12212490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 38494326 - 38494276
Alignment:
Q  576 tgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  38494326 tgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaagtggtttatgtttgg 38494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 19097559 - 19097474
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtg 609  Q
    ||||||||||||| | | || || |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  19097559 tgtgtttggtatggcggcggtgagaattaattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagctagatgtg 19097474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 4228684 - 4228603
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  4228684 aattgattttggttgaattgattttacat-aattgattttgattaaaagtgagttgaatgaaaagtgatttatgtttggatac 4228603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 16079511 - 16079460
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggat 628  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  16079511 gaattgattttggtttaaagtgagttgaatgaaaagtgatttatgtttggat 16079460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 631
Target Start/End: Original strand, 29829309 - 29829364
Alignment:
Q  576 tgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  29829309 tgaattgattctggctaaaaatgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggataca 29829364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 33746497 - 33746402
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||| |  |||||  || |||||||| | || || |||||||||||    
T  33746497 aattgattttgattaaaagtgagttgaatataaattgatttttgtttggttacattaacttaaccgtgattcttataaattcattttgtttggata 33746402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 697
Target Start/End: Original strand, 41625514 - 41625633
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatatttt 677  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||| |||| |||||||||||  ||   || |||| |||||||| | || || ||||||||||| ||     
T  41625514 aattgattttgattaaaagtgacttgagtgtaaattaatttgtgtttggatacttttaagtagaagtgattcttattaatttattttgtttggatagttg 41625613  T
Q  678 acatcaaaattgattttgaa 697  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  41625614 agatcaaaattgcttttgaa 41625633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 578
Target Start/End: Original strand, 47301572 - 47301626
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtga 578  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  47301572 tgtgtttggtatggcagtggctagaattaattttgatataattgagtttcagtga 47301626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Original strand, 15311217 - 15311270
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  15311217 aattgaatatggttaaaagtgagttgaatgtatagtgatttatgtttggataca 15311270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 7472632 - 7472836
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7472632 tgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattga-ttatgtt 7472730  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||    
T  7472731 tggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaattatccttgta 7472830  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  7472831 attgta 7472836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 524 - 722
Target Start/End: Original strand, 9988459 - 9988657
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9988459 tgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 9988558  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  9988559 tggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatcatttt 9988657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 5916200 - 5916404
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5916200 tgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtt 5916298  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  5916299 tggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcctttta 5916398  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  5916399 attgta 5916404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 36312426 - 36312222
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36312426 tgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtt 36312328  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  36312327 tggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcctttta 36312228  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  36312227 attgta 36312222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 14821312 - 14821111
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  14821312 tgtgtttggtatagcggtgacgataattaattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttagttaaaagtgagtttaatgtgaattgatt-atgtt 14821214  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  14821213 tggatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatccttata 14821114  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  14821113 att 14821111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 36548349 - 36548148
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36548349 tgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtctgatgtgaattgatttatgtt 36548250  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||| ||  ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||    
T  36548249 tggatactctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttaaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattatcctttta 36548151  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  36548150 att 36548148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 524 - 693
Target Start/End: Original strand, 1944997 - 1945166
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1944997 tgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 1945096  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattt 693  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  1945097 tggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 1945166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 26207887 - 26208092
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26207887 tgtgtttggtatgacggtgacgaaaattgattttgatagaattaattttgagagaattggttttggttaaaagtcagttggatgtgaattgatttatgtt 26207986  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    | |||||||||  |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||     
T  26207987 ttgatacacttaattaaaattgattcttacaagttgatgttgtttggattatatgaatcaaaattgattttaaatgtacaatgaccaaactatccttttg 26208086  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  26208087 attgta 26208092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 32502135 - 32501931
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  32502135 tgtgtttggtatggcggtcgtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaattga-ttatgtt 32502037  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||| |   |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  32502036 tggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttaccctttta 32501937  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  32501936 attgta 32501931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 541 - 700
Target Start/End: Original strand, 44619036 - 44619195
Alignment:
Q  541 tggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaa 640  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44619036 tggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggggaattgatttatgtttggatacacttgtttaa 44619135  T
Q  641 aagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||    
T  44619136 aaatgattattatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaatcgattttgaatgt 44619195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 540 - 726
Target Start/End: Original strand, 39141444 - 39141629
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctta 639  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||    
T  39141444 gtggcgagaattgattttgatataattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaattga-ttatgtttggatacactcattta 39141542  T
Q  640 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |  | |||||||||||  |||||||||    
T  39141543 aaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattacgcttttaatt 39141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 2213656 - 2213480
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2213656 tgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 2213557  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  2213556 tggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 2213480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 546 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 28641770 - 28641587
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctt-aaaagt 644  Q
    |||||||||||| || ||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  28641770 aaaattgattttaattgaattgattctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgatttatatttgggta-acttcatttaaaagt 28641672  T
Q  645 aattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28641671 gattattataagttgatgttgtttggatatgttgaattaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattatccttttaattgta 28641587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 548 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 2215378 - 2215228
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  2215378 aattgattttgatagaattgagcttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacacttgtttaaaaataat 2215279  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
      || ||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  2215278 --ttttgagttgatgttgtttggataatttaaattagaattgattttgaatgt 2215228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 8170462 - 8170262
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  8170462 tgtgtttggtagggcggtggcgagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-ttatgtt 8170364  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||| |    | | || |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  8170363 tggatacacgttaacagatgtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatccttcta 8170264  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  8170263 at 8170262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Original strand, 28127245 - 28127421
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28127245 tgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaatttagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 28127344  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  28127345 tggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 28127421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 526 - 726
Target Start/End: Original strand, 42515936 - 42516135
Alignment:
Q  526 tgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42515936 tgtttggtatggcggtggagaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagtttgatgtgaattga-ttatgtttg 42516034  T
Q  626 gatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaat 725  Q
     ||| |||   | |||| | ||||||  |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  42516035 aatatactcattaaaaaatgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataataaccaaattatctttttaat 42516134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 524 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2213797 - 2213658
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  2213797 tgtgtttggtatggcagatgagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttgtctt 2213698  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgt 663  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2213697 tggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgt 2213658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 548 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7296281 - 7296102
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||    
T  7296281 aattgactttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcatataaaagtgat 7296182  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattg 727  Q
    | | |||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||    
T  7296181 tatcatgacttgatgttatttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataatgaccgaattatccttttgattg 7296102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 548 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 28261420 - 28261246
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | || |||| ||    
T  28261420 aattaattttaatacaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatatttggatactctcacatagaagtgat 28261321  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  28261320 tcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtataatgaccaacttatcctttt 28261246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 548 - 727
Target Start/End: Original strand, 7295330 - 7295507
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||    
T  7295330 aattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattctggttaaaaatgagtttgacgtaaattgatttatgtttggatacacat--ataaaagtgat 7295427  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattg 727  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  7295428 tatcatgagttgatgttgtttggatagtttaagtcaaacttgattttgaatatataatgaccgaattatccttttaattg 7295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 525 - 703
Target Start/End: Original strand, 31562646 - 31562821
Alignment:
Q  525 gtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgttt 624  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  31562646 gtgtttggtatggtggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaatttgaggtgaattga-ttatgttt 31562744  T
Q  625 ggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgta 703  Q
    ||  |||||   |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31562745 gg--acactcgtttaaaagtgattcttatgagtttatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaatgtgta 31562821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 545 - 673
Target Start/End: Original strand, 42089507 - 42089639
Alignment:
Q  545 gaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg----gatacacttccttaa 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||  ||||    
T  42089507 gaaaattgattttgatagaattaagttcaagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatagatacacttatttaa 42089606  T
Q  641 aagtaattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42089607 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggata 42089639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 544 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 31224810 - 31224690
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaag 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||    
T  31224810 cgaaaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttagttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatatattttactaaaag 31224711  T
Q  644 taattcttatgagttgatgtt 664  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  31224710 tgattcttatgagttgatgtt 31224690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 23358407 - 23358232
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||||||    |||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |  ||||||||    
T  23358407 tgtgtttggtatggtgttggcgagaattgattta-atagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaaatagtttatgtt 23358309  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23358308 tggatacacttgtttaaaagtgattgtgatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 23358232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 524 - 631
Target Start/End: Original strand, 30007511 - 30007618
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30007511 tgtgtatggtatggctgtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 30007610  T
Q  624 tggataca 631  Q
    ||| ||||    
T  30007611 tggttaca 30007618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 548 - 697
Target Start/End: Original strand, 25747864 - 25748012
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||| | ||    
T  25747864 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgat 25747962  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaa 697  Q
    |||||| | || ||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||    
T  25747963 tcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgcttttgaa 25748012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 548 - 700
Target Start/End: Original strand, 41580692 - 41580844
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    |||| | ||    
T  41580692 aattgattttgatcgaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattaatttatgtttggatacacatgtacaaaaatgat 41580791  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    |||||||| ||   ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||    
T  41580792 tcttatgaattatagttgtttggatattttagattgaaattgtttttggatgt 41580844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 548 - 664
Target Start/End: Original strand, 45714650 - 45714766
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||    
T  45714650 aattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaaatgagttcgatgtgaattgatttatgtttggatacactccgttaaaaatgat 45714749  T
Q  648 tcttatgagttgatgtt 664  Q
    | | |||| ||||||||    
T  45714750 tatcatgatttgatgtt 45714766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 548 - 631
Target Start/End: Original strand, 34433288 - 34433371
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34433288 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggataca 34433371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 548 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 16467212 - 16467066
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |    ||||||| ||    
T  16467212 aattgattttgatagaattgattttggcataattgattttggttaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatatgataatgtaaaagtgat 16467113  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgatttt 694  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16467112 tcttatgggttgatgtagtttggatagtttagatcaaaattaatttt 16467066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 589 - 727
Target Start/End: Original strand, 25940264 - 25940402
Alignment:
Q  589 gttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaatt 688  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    || |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  25940264 gttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatatttgaatacactcgtatagaagtgattattatgagatgatgttgtttggacagtttgaatcaaaatt 25940363  T
Q  689 gattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattg 727  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||    
T  25940364 gattttgaatatataatgaccaaattatccttctaattg 25940402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 543 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 3854031 - 3853871
Alignment:
Q  543 gcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcct-taaa 641  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  3854031 gcgagaattgagtttgatggaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttggataca-ttcatgtaaa 3853933  T
Q  642 agtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgta 703  Q
    | | |||||||| | |  |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  3853932 attgattcttatcaatctatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgcttttgaatgtgta 3853871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 18511228 - 18511077
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |   |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||      ||||| | ||    
T  18511228 aattgattttgataaaattgattttgatataattgattttggttaaaagtgatttaaatgttaattgatttatgtttggatacatcaatgtaaaaatgat 18511129  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18511128 tcttataaagtgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgattttgaatg 18511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 577 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 27911503 - 27911386
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| ||   |||||||||| |||||||| ||    
T  27911503 gaattgagtttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatatactcatttaaaagtgattatttcaagttgatgttatttggatactt 27911404  T
Q  677 tacatcaaaattgatttt 694  Q
    || || ||||||||||||    
T  27911403 taaattaaaattgatttt 27911386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 548 - 634
Target Start/End: Original strand, 38600425 - 38600511
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactt 634  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38600425 aattaattttgatcgaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttgaatacactt 38600511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 577 - 695
Target Start/End: Original strand, 43436292 - 43436410
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |    
T  43436292 gaattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattgatttatgttttgatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagat 43436391  T
Q  677 tacatcaaaattgattttg 695  Q
    |  || |||||||||||||    
T  43436392 tggattaaaattgattttg 43436410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 546 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8041406 - 8041257
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagta 645  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |     
T  8041406 aaaattgtgtttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtgaattgaatgt-aattgatttatgtttggatgcaattacttaaaattt 8041308  T
Q  646 attcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaa 697  Q
    ||| |||| | || ||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||    
T  8041307 atttttatcaatttatgttgtttgg-tagtttgaatcaaaattgtttttgaa 8041257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 729
Target Start/End: Original strand, 39106680 - 39106831
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |  ||||||||| |||| || || || | ||||||| |||| ||    
T  39106680 gaattgattttggtaaaaagtgagtttgatataaattgtttaatgtttggatacattcacttaaaagtgattc-tacgaatttaagttgtttagataatt 39106778  T
Q  677 tacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |  ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  39106779 tgaatcaaaattgattttaaatatacaatgaccaaattatcctttaaattgta 39106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 602
Target Start/End: Original strand, 23267346 - 23267400
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23267346 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 23267400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 625
Target Start/End: Original strand, 34997194 - 34997295
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | | || ||||||||||||||||| |||| ||||| |   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34997194 tgtgtttggtttggctgcggtgaaaattgattttgataaaatttagtttgacaaaattgatttttgttaaaaatgaattggatgtgaattgatttatgtt 34997293  T
Q  624 tg 625  Q
    ||    
T  34997294 tg 34997295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 544 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 12111003 - 12110918
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  12111003 cgaaaattgattttgatagaattgatttt--gtcaaattgattttggttaaaagtgagttgaatataaagtgatttatgtttggatac 12110918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Original strand, 18970248 - 18970421
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| |||| |||  | |||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||    
T  18970248 tgtgtttggtttgactgtgatggaaattgattttgatagaattgag--gaagataattgattttggttaaaagtgagtttg-cgtaaattgacttatgtt 18970344  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    | ||| ||||    ||||||| || ||||||| |||| || ||||||||| |||  || ||||||| ||||| ||||    
T  18970345 ttgatgcactcgtataaaagtgatccttatgacttgaagtagtttggatactttggattaaaattgtttttggatgt 18970421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Original strand, 23359941 - 23359994
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23359941 gaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 23359994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 628
Target Start/End: Original strand, 43858194 - 43858274
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatg-tgaattgatttatgtttggat 628  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  43858194 aattgattttgatagaattgattttaattgaattgattttgggcaaaagtgagtt-gatgaataattgatttatgtttggat 43858274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Original strand, 30599915 - 30599968
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  30599915 gaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtcaattgatttgtgtttggatac 30599968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10918701 - 10918649
Alignment:
Q  576 tgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggat 628  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  10918701 tgaattgattttggataaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggat 10918649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 23377600 - 23377548
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  23377600 aattaattttggttaaaagtgagttgaatgtaagttgatttatgtttggatac 23377548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 681 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 2212814 - 2212769
Alignment:
Q  681 tcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2212814 tcaaaattgattttaaatgtgcaatgaccaaattatccttttaatt 2212769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 11240796 - 11240648
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||   ||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| || | ||    
T  11240796 aattgattttgatttaattgggtttaacaaaattgattt-ggaaaaaagcgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaatacattcacttagaattgat 11240698  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaa 697  Q
    |||||  | ||  ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||    
T  11240697 tcttaaaaattcttgttgtttggatagtttggctcataattgattttgaa 11240648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 563 - 631
Target Start/End: Original strand, 3476356 - 3476424
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  3476356 aattgattttaagtgaattgattctggataaaagtgagctgaaagtgaagtgatatatgtttagataca 3476424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 685 - 729
Target Start/End: Original strand, 45714767 - 45714811
Alignment:
Q  685 aattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  45714767 aattgattttgaatatataatgaccaaattatccttttaattgta 45714811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 638 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 2234962 - 2234901
Alignment:
Q  638 taaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||    
T  2234962 taaaagtgattcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgt 2234901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Original strand, 26806266 - 26806319
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  26806266 gaattgattttgattaaaagtgagttgagtgaaaagtgatttatgtttggatac 26806319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 28425432 - 28425637
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28425432 tgtgtttggtatgacggtggcgaaaattgattttgatagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtt 28425531  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  28425532 tggatacactttcttacaagtgattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccaaactatcctttta 28425631  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  28425632 attgta 28425637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 524 - 717
Target Start/End: Original strand, 3097166 - 3097359
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3097166 tgtgtttggtatagcagtggtgagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtt 3097265  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatc 717  Q
    |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3097266 tggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtattgaccaaattatc 3097359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 3467682 - 3467480
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3467682 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttctgtt 3467583  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||| | ||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||    
T  3467582 tggatatatttatttaaaagtgattcttatgaattgatgttggttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatatggaatgaccaaactatcctttta 3467483  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  3467482 att 3467480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 548 - 728
Target Start/End: Original strand, 6399092 - 6399272
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  6399092 aattgattctggtagaattgagtttgatagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttcgatacactcacttaaaagtgat 6399191  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgt 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6399192 tcttatgagttgatgttgtttggataattttaatcaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatctttttaattgt 6399272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 548 - 728
Target Start/End: Original strand, 40742279 - 40742457
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    |  |||| ||    
T  40742279 aattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgattttcgttaaaagtgagtttgatctgaattgatttatgtttggatacact--aatgtaagtgat 40742376  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgt 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40742377 tcttatgagttgatgatgtttggatattttaaatcaaaattgattttaaatgtgtagtgaccaaattacccttttaattgt 40742457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 22936753 - 22936958
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22936753 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 22936852  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||| | || |||| ||| ||||||||||    
T  22936853 tggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaatttggttttgaatatataatgactaaactatcctttta 22936952  T
Q  724 attgta 729  Q
     |||||    
T  22936953 gttgta 22936958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Original strand, 25697944 - 25698124
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  25697944 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattga-ttatgtttggataaacttatttaaaagtgat 25698042  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |  | | ||||||||| ||||||| |||||    
T  25698043 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatattaaataaccaaattacccttttatttgta 25698124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 561 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 40742236 - 40742068
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttga 660  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||    
T  40742236 agaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttga 40742137  T
Q  661 tgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    | ||||||||||  |||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40742136 tattgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgtaatgatcaaattatccttttaattgta 40742068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 44926965 - 44926785
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  44926965 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgat 44926867  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||    
T  44926866 tcttatgagttgatgttatttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatctttgtaattgta 44926785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 515 - 722
Target Start/End: Original strand, 4941732 - 4941939
Alignment:
Q  515 attactatttgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattg 614  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  4941732 attactatgtgtgtttggtatggcggtggctagaattgattctgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaattg 4941831  T
Q  615 atttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaatt 714  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  4941832 atttatgtttggataaaattatttaaaagcgattcttatgagttgatgttgtttgaataatttgaattaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaatt 4941931  T
Q  715 atcctttt 722  Q
    || |||||    
T  4941932 attctttt 4941939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 578 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43550986 - 43550835
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatatttt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  43550986 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggataattt 43550887  T
Q  678 acatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
      ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  43550886 gaatcaaaattgattttgaatgtgtaaagactaaactatccttttaattgta 43550835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 511 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 27649907 - 27649693
Alignment:
Q  511 ctatattactatttgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtga 610  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27649907 ctatagtactatgtgtgtttggttgggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgatttggatatga 27649808  T
Q  611 attgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgacca 710  Q
    |||||  ||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |  | ||||||    
T  27649807 attga-atatgtttagatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacattgaatgacca 27649709  T
Q  711 aattatccttttaatt 726  Q
    ||||| ||||||||||    
T  27649708 aattacccttttaatt 27649693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 548 - 722
Target Start/End: Original strand, 440173 - 440347
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| | ||    
T  440173 aattgattttgatagaattgagtctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacattcagttaaaaatgat 440272  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  440273 tcttatgagttaacgttgtttggatagattgaatcaaaactgattttgaatgtataatgaccaacttatcctttt 440347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Original strand, 38152159 - 38152339
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | || ||||||| | ||    
T  38152159 aattgattttgatagaattaagtttgagaaaattgattttagttaaa-gtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggaaatatttacttaaaaatgat 38152257  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  38152258 tcttatgagttgatgtggtttggatactttaaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccaaagtatccctttaattgta 38152339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 36114001 - 36114205
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||  |||||||    
T  36114001 tgtgtttggtatgacggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtaagtttgatgtagattg-gttatgtt 36114099  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |  | |||||||||||  ||||||    
T  36114100 tggatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattactctttta 36114199  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  36114200 attgta 36114205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 542 - 699
Target Start/End: Original strand, 41289036 - 41289193
Alignment:
Q  542 ggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaa 641  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  41289036 ggcgagaattgattttgacagaattgagtttgagagaattgattttaattaaaagtgagttgattgtgaattgatttatgtttggatacactttactaaa 41289135  T
Q  642 agtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  41289136 agtgattcttataggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatg 41289193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8125095 - 8124915
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||| | |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||    
T  8125095 aattgattttggttgaatcgagtttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatacactcatttaaaagtgat 8124997  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  8124996 tcttaggagttgaagttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatggataatgaccaacttacccttttaattgta 8124915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 38114593 - 38114389
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| || | |||| || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38114593 tgtgtttggtttggcggtggtgagaatttattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttggatgtgaattga-ttatgtt 38114495  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||   ||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||   |  |||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||    
T  38114494 tggatacactcggtttcaagtgattcttatgagttgaggttgtttgaatatttcgaacaaaaattgattttgaacattcaatgaccaaattaccctttta 38114395  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  38114394 attgta 38114389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 524 - 673
Target Start/End: Original strand, 42143324 - 42143473
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42143324 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattatgatataattgagtttgagaaaattgattttagttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtt 42143423  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42143424 tggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgacgttgtttggata 42143473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 548 - 700
Target Start/End: Original strand, 33627018 - 33627170
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||    
T  33627018 aattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttatttaaaactgagttggataagaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgat 33627117  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  33627118 tcttatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaatcgattttgaatgt 33627170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 548 - 687
Target Start/End: Original strand, 24897572 - 24897710
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||| | ||    
T  24897572 aattgattttgataaaattgagtttatgagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaa-tgaattatgtttggatacatttatttaaaattgat 24897670  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaat 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  24897671 tcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaat 24897710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 42149100 - 42148978
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatatttt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  42149100 aattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatagacttatttaaaagtgattcgtatgagttgatgttgtttagataattt 42149001  T
Q  678 acatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  42149000 gaatcaaaattgattttgaatgt 42148978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 544 - 729
Target Start/End: Original strand, 30081631 - 30081815
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaag 643  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||  |  |||||    
T  30081631 cgaaaattgattttgataaaattgattttgtgaaaattgattttagttaaaagtgagttaaa-gtgaattgatttatgtttggataagctgacacaaaag 30081729  T
Q  644 taattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||| |||   ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30081730 caattcttatgggctgatgttgtttggatagtttgtttcaaaattgattttagatgtgtaatgaccaaattatccttttaattgta 30081815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 548 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26243249 - 26243129
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||    
T  26243249 aattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatataattgtttaaaagtgat 26243150  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgttt 668  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  26243149 tcttatgagttggtgatgttt 26243129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 524 - 634
Target Start/End: Original strand, 36121505 - 36121614
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||||   | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  36121505 tgtgtttggtacagcggtgtcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaataga-ttatgtt 36121603  T
Q  624 tggatacactt 634  Q
    |||||||||||    
T  36121604 tggatacactt 36121614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 548 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 25497816 - 25497721
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagt 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25497816 aattgattttgataaaattgagtttaggagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattga-ttatgtttggatacacttatttaaaagt 25497721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 15206821 - 15206670
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||    
T  15206821 aattaattttgatagaattgagtttgacaaaattgattttgggtaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacattgacttagaagtgat 15206722  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    |||||  | || |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||    
T  15206721 tcttaaaaattcatgttgtttggatagtttggcccaaaattgattttgaatg 15206670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 729
Target Start/End: Original strand, 34342873 - 34343016
Alignment:
Q  583 attttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatc 682  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  34342873 attttggttaaaagtgagtag-atatgaattgatttttgtttggataaatttatttaaaagtgattcttat-agtggatgttgtttggataatttgaatc 34342970  T
Q  683 aaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  34342971 aaaattgattttgaa-gtgtaatgaccaaattaatcttttaattgta 34343016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 548 - 622
Target Start/End: Original strand, 30759289 - 30759363
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgt 622  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759289 aattgattttaatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgt 30759363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Original strand, 31246299 - 31246450
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||| |||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |     |||||| ||    
T  31246299 aattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaagtgat 31246398  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    |||||| | || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||    
T  31246399 tcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttaaatg 31246450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 611 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 26125634 - 26125516
Alignment:
Q  611 attgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgacca 710  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26125634 attgatttatgtttggatacactaatgtaaaaatgattcttatgagttgataatgtttggacggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacga 26125535  T
Q  711 aattatccttttaattgta 729  Q
    || |||| |||||||||||    
T  26125534 aaatatctttttaattgta 26125516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 608 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 29023304 - 29023212
Alignment:
Q  608 tgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29023304 tgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaattgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 29023212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 638 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41981192 - 41981101
Alignment:
Q  638 taaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||| |||||||||||    
T  41981192 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatactttgaatcaaaattgattttaaatatggaatgaccaaactatctttttaattgta 41981101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 602
Target Start/End: Original strand, 3465424 - 3465478
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3465424 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 3465478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 546 - 700
Target Start/End: Original strand, 3619051 - 3619204
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagta 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || | ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| |    | |||||     
T  3619051 aaaattgattttgatagaattgattttgaatgaattgattctgatcaaaagtgagttgagtg-aaattgatttgtgtttggatacattaatatgaaagtg 3619149  T
Q  646 attcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    |||||||| | |  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  3619150 attcttatcaatgtatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 3619204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 620 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 16915114 - 16915010
Alignment:
Q  620 tgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcct 719  Q
    |||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  16915114 tgtttggatacaccaacataaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggttggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattaacct 16915015  T
Q  720 tttaa 724  Q
    |||||    
T  16915014 tttaa 16915010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 548 - 700
Target Start/End: Original strand, 22552724 - 22552876
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||||||||||| || |    ||||||| ||    
T  22552724 aattgattttgacataattgattttaattgaattgattttggataaaagtgagttgatggaaaattgatttatgtttggatgcattattgtaaaagtgat 22552823  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    | |||| | || |||||||||||||| |||  |  ||||||||||||| ||||    
T  22552824 tattatcaattcatgttgtttggatactttcaactaaaattgattttggatgt 22552876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 599
Target Start/End: Original strand, 30085623 - 30085674
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtga 599  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30085623 aattgattttgatataattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtga 30085674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 35615834 - 35615683
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| | ||    
T  35615834 aattgattttgatagaattgagtttgacaagattgattttggaaagaagtgagttgaatgggaattgatttatgtttagatacattcacttaaaattgat 35615735  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
    || ||    ||  ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  35615734 tcctaaatattcttgttgtttggatagtttggctcaaaattgattttgaatg 35615683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 546 - 673
Target Start/End: Original strand, 8702390 - 8702516
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacact-tccttaaaagt 644  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||| ||| || || |  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  8702390 aaaattgattttgatagaattgactttagcaaaattgattttagttaaaaatga-tttgaagataattgatttatgtttggatacattatcctt-aaagt 8702487  T
Q  645 aattcttatgagttgatgttgtttggata 673  Q
     |||||||| | || ||||||||||||||    
T  8702488 gattcttatcaattcatgttgtttggata 8702516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 19649281 - 19649229
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19649281 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatac 19649229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 540 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 29023356 - 29023308
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttg 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29023356 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttg 29023308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 561 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 32767547 - 32767479
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32767547 agaattaattttgagtgaattgattatg--taaaagtgagttggatgtaaattgatttatgtttggataca 32767479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 578 - 624
Target Start/End: Original strand, 10552923 - 10552969
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgttt 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10552923 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgttt 10552969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 26491029 - 26490976
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26491029 gaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtaaattgatttgtgtttggatac 26490976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 546 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 29970928 - 29970845
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||    
T  29970928 aaaattgattttgatagaattgaatttgtat-aattgattttagttaaaagtgagttgagtttaaagtgatttatgtttggatac 29970845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 697
Target Start/End: Original strand, 45147271 - 45147383
Alignment:
Q  585 tttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaa 684  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||   ||||||||||| || ||   |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||  |||||    
T  45147271 tttggttaaaagtgagttgaatgcaaatttggttatgtttggacactctcatttaaaagtgattcttataagttgatattgtttgaataacttgaatcaa 45147370  T
Q  685 aattgattttgaa 697  Q
    |||||||||||||    
T  45147371 aattgattttgaa 45147383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 548 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 36779515 - 36779435
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  36779515 aattgattttgatataattgatttt--gtagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaagtaatttatgtttggata 36779435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 563 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 42601031 - 42600968
Alignment:
Q  563 aattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42601031 aattgattttaacagaattgatttttgttcaaagtgagttgaatgtgaattgatttatttttgg 42600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 1373134 - 1373081
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  1373134 aattgattttggataaaagtgagttgaagttgaagtgatttatgtttggataca 1373081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 23018209 - 23018137
Alignment:
Q  560 tagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacac 632  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||    
T  23018209 tagaattgagtttgatcgaattgattttgatcaaaagtgagttgagtataaatttatttatgtttggatacac 23018137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 548 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26125882 - 26125842
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttg 588  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26125882 aattaattttgatagaattgagtttaagagaattgattttg 26125842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 661 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 26243103 - 26243035
Alignment:
Q  661 tgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||||||    
T  26243103 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgcgtaaaaaccaaactattcttttaattgta 26243035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 39219817 - 39219765
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  39219817 gaattgattttcgttaaaagtgagtttaatatgaagtgatttatgtttggata 39219765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 544 - 597
Target Start/End: Original strand, 6876603 - 6876656
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagt 597  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  6876603 cgaaaattaatctttatagaattgagtttaacagaattgattttgattaaaagt 6876656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 33588816 - 33588763
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||    
T  33588816 gaattgattttgattaaaagtgagtttaatgtaaaattatttatgtttggatac 33588763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 544 - 625
Target Start/End: Original strand, 40792184 - 40792264
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| |   ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  40792184 cgaaaattgattttaataaaattgattttgatataattgattttgattaaaagtgagttgaatg-caattgatttatatttg 40792264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13739346 - 13739142
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13739346 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtt 13739248  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| ||    
T  13739247 tggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatccttgta 13739148  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  13739147 attgta 13739142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 524 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 13744846 - 13744651
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  13744846 tgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatgtt 13744748  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctt 720  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  13744747 tggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatcctt 13744651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 528 - 715
Target Start/End: Original strand, 29409215 - 29409402
Alignment:
Q  528 tttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgga 627  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29409215 tttggtatgacggtggcgaaaattgattttaatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgga 29409314  T
Q  628 tacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaatta 715  Q
    |||| ||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  29409315 tacagttttttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtataatgaccaaatta 29409402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 524 - 729
Target Start/End: Original strand, 33898965 - 33899170
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33898965 tgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtt 33899064  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33899065 tggatacactaatgtaaaagtgattcttatgagttaataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaaatatcctttta 33899164  T
Q  724 attgta 729  Q
    ||||||    
T  33899165 attgta 33899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Original strand, 6208023 - 6208224
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6208023 tgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgattttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatgtt 6208121  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  6208122 tggatacactttactaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtctaatgactaaattatccttata 6208221  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  6208222 att 6208224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 577 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 16548227 - 16548075
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattt 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || |||||||||||||||||| ||    
T  16548227 gaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtt 16548128  T
Q  677 tacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  16548127 tgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatccttttaattgta 16548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 561 - 725
Target Start/End: Original strand, 16442347 - 16442511
Alignment:
Q  561 agaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttga 660  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  16442347 agaattgattttgagagaattgattttagttacaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttga 16442446  T
Q  661 tgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaat 725  Q
    | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16442447 tattgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatccttttaat 16442511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 524 - 708
Target Start/End: Original strand, 17829958 - 17830142
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17829958 tgtgtttggtatagctgtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtt 17830057  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgac 708  Q
    | | |||| ||  ||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17830058 tagttacagtttattagaagtcgttcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgac 17830142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 10826208 - 10826030
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  10826208 aattaattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatttgaattgatttttgtttggatatacttatttaaaagtgat 10826109  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||    
T  10826108 tcttatgagttgattttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatatggaatgaccaaactatccttttaatt 10826030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 548 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 31132580 - 31132401
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||  || || |||||||||||||  |||||||| ||    
T  31132580 aattgattttgatagaattgagtttgagataatttattttggctaaaaatgagttggatgttaattcgtt-atttttggatacacttatttaaaagtgat 31132482  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgt 728  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  31132481 tcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaactttaaatgaccaaattacccttttaattgt 31132401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 548 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 699673 - 699525
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  699673 aattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttagttaaa-gtgagttggataagaattgatttatgtttggatgcactttactaaaagtaat 699575  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaat 698  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  699574 tcttataagttaatgttg-ttggatagtttgaatcaaaatcgattttgaat 699525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 548 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 21455997 - 21455818
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  21455997 aattgattttgatataattgagtttgtaagaattgattttagttaaaagtaagttggatgtgaatcaattg-tgtttgtatacactta-ttaaaagtgat 21455900  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 729  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21455899 tctcatgagttaatgttgtttgcatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgattaaattatctttttaattgta 21455818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 540 - 699
Target Start/End: Original strand, 1312415 - 1312574
Alignment:
Q  540 gtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctta 639  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||    
T  1312415 gtggagaaaattgattttgatagaatcgagtttgataaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgcgaattgatttatgttcggatacattgactta 1312514  T
Q  640 aaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatg 699  Q
     || | |||||||  | || |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||    
T  1312515 gaattgattcttaaaaattaatgttgtttggatagtttgacccaaaattgattttgaatg 1312574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 548 - 697
Target Start/End: Original strand, 21254863 - 21255011
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||| | ||    
T  21254863 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgaatttgattaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgat 21254961  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaa 697  Q
    |||||| | || ||||||||| | || |||  |||||||||| |||||||    
T  21254962 tcttatcaatttatgttgtttcggtagtttgaatcaaaattgcttttgaa 21255011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 548 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 7215690 - 7215514
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  7215690 aattgattttgatataattgagtttttaagacttgattttagttaaaagtgaattggacgtgaatcaatt-atgtttgtatacactta-ttaaaagtgat 7215593  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaatt 726  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||  ||  ||||||||| ||||| ||| |||| |||  |||||||||||| ||||    
T  7215592 tctcatgagttaatgttgtttgcataaattgaatcaaaattaattttaaatatgtaatgattaaattatcctttaaatt 7215514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 603
Target Start/End: Original strand, 32599422 - 32599501
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttg 603  Q
    |||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32599422 tgtgtttgatttgacattggtgagaattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttgattaaaagtgagttg 32599501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 602
Target Start/End: Original strand, 15151489 - 15151543
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagtt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15151489 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 15151543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 629
Target Start/End: Original strand, 5584033 - 5584113
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  5584033 aattgattttgatagaattgattttgacagaattgattttgactaaaagtgagtttaatgt-aattgatttatgtttggata 5584113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 697
Target Start/End: Original strand, 16121985 - 16122134
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||| |||||| ||||  ||   || |||| ||    
T  16121985 aattgattttgataaaattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgatttgagtgtaagttgatttgtgtttgaatacctttatgtataagtgat 16122084  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaa 697  Q
    |||||| | || || ||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  16122085 tcttattaatttattttgtttggatagttgagatcaaaattgcttttgaa 16122134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 618
Target Start/End: Original strand, 29399755 - 29399846
Alignment:
Q  526 tgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattt 618  Q
    |||||||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  29399755 tgtttggtttggcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgatagaattgattttggtaaagagtaagttgaatg-gaattgattt 29399846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 882842 - 882776
Alignment:
Q  565 ttgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| | || || |||||||||||||||||||    
T  882842 ttgagtttgagtgaattgattctagttaaaattgagttgaaggtaaaatgatttatgtttggataca 882776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 577 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 29682255 - 29682202
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  29682255 gaattgattttggttaaaattgagttgcgtgtaaattgatttgtgtttggatac 29682202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 546 - 627
Target Start/End: Original strand, 3605734 - 3605814
Alignment:
Q  546 aaaattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgga 627  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||    
T  3605734 aaaattgattttgatataattgatttt--gtagaattgattttgattaaaagtgagttgagtgaaaagtgatttatgtttgga 3605814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 1500043 - 1499990
Alignment:
Q  578 aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataca 631  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  1500043 aattgattttggctaaaagcgagttgagtgtaaattgatttatgtttgaataca 1499990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 660 - 701
Target Start/End: Original strand, 2935695 - 2935736
Alignment:
Q  660 atgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtg 701  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  2935695 atgttgtttggataatttagatcaaaattgtttttgaatgtg 2935736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 524 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 8590 - 8388
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8590 tgtgtttggtatggcggtgggaataattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtt 8491  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    |||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  8490 tggatacacttttttaaaaatgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatcctttta 8391  T
Q  724 att 726  Q
    |||    
T  8390 att 8388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 524 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 9251 - 9051
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  9251 tgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaattg-tatatgtt 9153  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttta 723  Q
    ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  9152 tggatacactcacttgaaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcctttta 9053  T
Q  724 at 725  Q
    ||    
T  9052 at 9051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0983 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 526 - 726
Target Start/End: Original strand, 2230 - 2430
Alignment:
Q  526 tgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttg 625  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2230 tgtttggtatggcggtggcgaaaattgattttgacagaattgagtttgacataattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttg 2329  T
Q  626 gatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaat 725  Q
    || ||||||  ||||||||  || |||  |||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  2330 gacacacttgtttaaaagtggtttttacaagttgacgttgtttagatagtttgaatcaaaattgattttggatatgtaatgaccaaattatccttttaat 2429  T
Q  726 t 726  Q
    |    
T  2430 t 2430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 548 - 720
Target Start/End: Original strand, 29107 - 29278
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||| ||    
T  29107 aattgattttgatagaattaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttaatagaagttat 29205  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctt 720  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29206 tcttatgaattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcctt 29278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 548 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 253245 - 253071
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttc-cttaaaagtaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  253245 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaattgatttatgtttggatac-cttcagttaaaagtga 253147  T
Q  647 ttcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 722  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  253146 ttcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgattttgaatatataatgaccaacttatcctttt 253071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 548 - 727
Target Start/End: Original strand, 2011 - 2190
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    ||||||| ||    
T  2011 aattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttcaaaatgagtttgatatgaattgatttatgtttggatgcactcatataaaagtgat 2110  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattg 727  Q
    | | |||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||    
T  2111 tatcatggcttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataaagaccgaattatccttttaattg 2190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 548 - 721
Target Start/End: Original strand, 5814 - 5988
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||  |||  ||  ||| |||| ||    
T  5814 aattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattg----atgtttgattaccgtttattagaagtgat 5909  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatatttta-----catcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 721  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  5910 tcttgtgggttgatgttgtttggatagtttaatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatccttt 5988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 548 - 655
Target Start/End: Original strand, 118394 - 118501
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| ||    
T  118394 aattgattttgatcgaattgagtttgatagaatagatttttgttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttgtacaaaagtgat 118493  T
Q  648 tcttatga 655  Q
    ||||||||    
T  118494 tcttatga 118501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 46903 - 46728
Alignment:
Q  524 tgtgtttggtatgacagtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtt 623  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  46903 tgtgtttggttttccagtggcgaaaattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagtt-gaacttaattggtttatgtt 46805  T
Q  624 tggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 700  Q
    |||||| | |    ||||||| ||| |||| | || |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  46804 tggatatattaaagtaaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttggatgt 46728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 544 - 630
Target Start/End: Original strand, 15238 - 15323
Alignment:
Q  544 cgaaaattgattttgatagaattgagtttaagt-gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatac 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  15238 cgaaaattgattttgatagaattgatttt--gtcaaattgattttggttaaaagtgagttgaatataaagtgatttatgtttggatac 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 712
Target Start/End: Original strand, 138492 - 138656
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttccttaaaagtaat 647  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||  |  | ||||||| ||    
T  138492 aattgattttgtccgaattgattttagttgaattaattttagttaaaagtgagctgaacataaattgatttatgtttggataccttaacataaaagtgat 138591  T
Q  648 tcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaa 712  Q
    |||||| | |  ||   |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  138592 tcttatcaatccataaagtttagataatttaaatcaaaattgattttaaatgtgtaattaccaaa 138656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 577 - 626
Target Start/End: Original strand, 199382 - 199431
Alignment:
Q  577 gaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttgg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  199382 gaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 199431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 301630 - 301562
Alignment:
Q  560 tagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggat 628  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||    
T  301630 tagaattgagtttgatcgaattgattttggtcaaaagtgagttgagtataaatttatttatgtttggat 301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 65616 - 65536
Alignment:
Q  548 aattgattttgatagaattgagtttaagtg-aattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggata 629  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  65616 aattaattttgatagaattga--ttctgtgaaattgattttggttaaaaatgagtttaatgtaaagtgatttatgtttggata 65536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University