View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4899_low_1 (Length: 773)

Name: NF4899_low_1
Description: NF4899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4899_low_1
NF4899_low_1
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (17-763)||(40124250-40125009)
chr5 (303-763)||(17411754-17412214)
chr5 (239-449)||(15269504-15269721)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (210-762)||(29991832-29992384)
chr1 (210-763)||(16503883-16504436)
chr1 (232-763)||(24430215-24430746)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (215-763)||(53015774-53016322)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (220-763)||(12558748-12559290)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (210-335)||(5240951-5241076)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 636; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 636; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 40125009 - 40124250
Alignment:
Q  17 agtcatatattactaaaccaatcacttagtcttnnnnnnnnnnnnncctaaaccaatcacttagagctggaaataatttatatcgacgtattattgtttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40125009 agtcatatattactaaaccaatcacttagtcttaaaaaaaaaaa--cctaaaccaatcacttagagctggaaataatttatatcgacatattattgtttt 40124912  T
Q  117 taataaaaatattaaagaataaattattcttgttacgtattaaactcatagcctaaa---------------aaagctgaaaaatgattgtcaccatatt 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40124911 taataaaaatattaaagattaaattattcttgttacgtattaaactcatagcctaaatgaaatattaaaagaaaagctgaaaaatgattgtcaccatatt 40124812  T
Q  202 ttatctgtcactcgcaaatggagactcactcaaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgcgtcctcctctag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40124811 ttatctgtcactcgcaaatggagactcactcaaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgtgtcctcctctag 40124712  T
Q  302 gatatacatgtcagtaaaacaaagtgtatcgcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactat 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40124711 gatatacatgtcagtaaaacaaagtgtatcgcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctagagcatgatttgataaatttcacaagactat 40124612  T
Q  402 cactcagttgaatttctcttcttgtgctcatgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaatggtattgttgtcttccttctttatgtcaatgacatg 501  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40124611 cactcagttgaatttcccttcttgtgctcatgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaatggtattgttgtcttccttctttatgtcgatgacatg 40124512  T
Q  502 attatcagtggtgacgactccattggaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttgg 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40124511 attatcagtggtgacgactccattggaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttgg 40124412  T
Q  602 ggcttgaagcattatcttcgaatgatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcaa 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40124411 ggcttgaagcattatcttcgaatgatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcga 40124312  T
Q  702 atacactcgtcttgaacccaacattcaatttactcctcaagatggtactttacttgatgatg 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40124311 atacactcgtcttgaacccaacattcaatttactcctcaagatggtactttactcgatgatg 40124250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 303 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 17412214 - 17411754
Alignment:
Q  303 atatacatgtcagtaaaacaaagtgtatcgcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactatc 402  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||| |||||| ||||| | ||||    
T  17412214 atatacatgtcaggaaaacaaagtatgtcgacttggtaaagctctttatggtctcaaacaaacccctagagcttggtttgctaaattgcacaacattatc 17412115  T
Q  403 actcagttgaatttctcttcttgtgctcatgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaatggtattgttgtcttccttctttatgtcaatgacatga 502  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17412114 actcagttgaatctctcttccagtgctcatgactctgctttttttactcgaaaaattgaaaatggcattgttgtcttgcttctttatgtcgatgacatga 17412015  T
Q  503 ttatcagtggtgacgactccattggaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttggg 602  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17412014 ttatcactggtgatgactctattgcaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaacattttgaaatgaaggatcttggaccattaagttactttttggg 17411915  T
Q  603 gcttgaagcattatcttcgaatgatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcaaa 702  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  17411914 gcttgaagtattatcttcgagtgatggcttatttctctcataggctaagtatgcttctgatcttgtctctcgagcaggtctcactaattgtaaaatcgaa 17411815  T
Q  703 tacactcgtcttgaacccaacattcaatttactcctcaagatggtactttacttgatgatg 763  Q
     |||||| ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17411814 cacactcctcttgaacccaatgtttgatttactcttcaagatggtactttacttaatgatg 17411754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 449
Target Start/End: Original strand, 15269504 - 15269721
Alignment:
Q  239 atgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttag--aagaatagg-----tttacatgcgtcctcctctaggatatacatgtcagtaaaacaaagtgtatc 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| | |     |||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  15269504 atgttaaaaatgtatttctcaatggcaagttagtaaagaaaaagaaagttttacacgcatcttcctctaggatatacatgttaggaaaacaaagtgtatt 15269603  T
Q  332 gcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactatcactcagttgaatttctcttcttgtgctca 431  Q
    |||| ||| | | ||| ||||||||||||||| | |||  ||  || |||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||    
T  15269604 gccttcgtcaagttctatatggtctcaaacaaacacctaaagtttggtttgttaaatttcacaagactatcaaaaagttaaatttctcttctagtgctca 15269703  T
Q  432 tgactctgctctttttac 449  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  15269704 tgactcggctatttttac 15269721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 210 - 762
Target Start/End: Original strand, 29991832 - 29992384
Alignment:
Q  210 cactcgcaaatggagactcactcaaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgcgtcctcctctaggatataca 309  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29991832 cactcgcaaatggaaactcaatcaaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaagaggtttacatgcgtcctcctccaggatataca 29991931  T
Q  310 tgtcagtaaaacaaagtgtatcgcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactatcactcagt 409  Q
    ||| |  |||||||| | | ||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29991932 tgtaaagaaaacaaaatatgtcaacttcgtaagactctttatggtctcaaacaagcccctagagtttggtttgctaaatttcacaagactatcacttagt 29992031  T
Q  410 tgaatttctcttcttgtgctcatgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaa-tggtattgttgtcttccttctttatgtcaatgacatgattatca 508  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29992032 tgaatttctcttccagtgcacatgactttgctctttttactcgaaaaactgaaaaatggcactgttgtcttgcttctttatgtcgatgacatgattatca 29992131  T
Q  509 gtggtgacgactccattggaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttggggcttga 608  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29992132 ctggtgatgactccattggaattgaagagttcaagcaattcttatgtcaacattttgaaatgaaggatcttggaccattaagttactttttgggg-ttga 29992230  T
Q  609 agcattatcttcgaatgatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcaaatacact 708  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  29992231 agtattatcttcgagtgatggcttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcgagaaggtctcactgattgtaaaatcgaacacact 29992330  T
Q  709 cgtcttgaacccaacattcaatttactcctcaagatggtactttacttgatgat 762  Q
    | ||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  29992331 cttcttgaatcaaacgttcgatttactccttaagatggcactttacttaatgat 29992384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 210 - 763
Target Start/End: Original strand, 16503883 - 16504436
Alignment:
Q  210 cactcgcaaatggagactcactcaaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgcgtcctcctctaggatataca 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||     
T  16503883 cactcgcaaatggaaactcactcaaatggatgttaaaaatgcattcctcaatggcgagttagaagaagaggtttacatgcatcctcctccaagatatact 16503982  T
Q  310 tgtcagtaaaacaaagtgtatcgcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactatcactcagt 409  Q
    |||||| | |||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| || |||  |||||| ||||   ||||||| ||||    
T  16503983 tgtcaggataacaaagtttgtcgacttcgtaaggctctctatggtctcaaactagcacctagagcttgttttactaaattccacatagctatcacacagt 16504082  T
Q  410 tgaatttctcttcttgtgctcatgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaatggtattgttgtcttccttctttatgtcaatgacatgattatcag 509  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||  |||| |||||||||||| |||| || |||||||     
T  16504083 tgaatttctcttatagtggtcatgattctgctctttttactcgaaaaactgataacggtaccgtcatcttgcttctttatgtcgatgatatcattatcac 16504182  T
Q  510 tggtgacgactccattggaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttggggcttgaa 609  Q
    |||  | |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  16504183 tggatatgactcagttggaattaaagagctcacgaaattcttgagtcaacattttgagatgaaggatcttggaccattaagttattttctagggcttgaa 16504282  T
Q  610 gcattatcttcgaatgatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcaaatacactc 709  Q
    | ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| || ||||||    
T  16504283 gtattatcttcgagtgatggtttgttcctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcgagcaggtttcattgattgtaaaatcgaacacactc 16504382  T
Q  710 gtcttgaacccaacattcaatttactcctcaagatggtactttacttgatgatg 763  Q
     ||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16504383 ctcttgaatccgacgtttgatttactcctcaagatggtactttacttaatgatg 16504436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 232 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 24430746 - 24430215
Alignment:
Q  232 caaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgcgtcctcctctaggatatacatgtcagtaaaacaaagtgtatc 331  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  24430746 caaatggatgttaaaaatgcatttctgaatggtgaattagaagaagaggtttatatgcgtcctcctccaggttatacttgtcaggaaagcaaagtttgtc 24430647  T
Q  332 gcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactatcactcagttgaatttctcttcttgtgctca 431  Q
    | || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || || |||| |||||||||||  ||||| | |||||||  |||||||||  || ||||    
T  24430646 gtcttcgtaaggcactttatggtcttaagcaagcacctcgggcttggtttgctaaatttcacagtactataagtcagttgggtttctcttcaagtcctca 24430547  T
Q  432 tgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaatggtattgttgtcttccttctttatgtcaatgacatgattatcagtggtgacgactccattggaatt 531  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||  ||||||||||||| | |||| | |||||  ||||||||    
T  24430546 tgattctgctctttttactcgaaaaacagaaaatggtactattgtgttgctactttatgttgatgacatgattattactggtaatgactctgttggaatt 24430447  T
Q  532 gaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttggggcttgaagcattatcttcgaatgatgact 631  Q
    |  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||  |    
T  24430446 gtcgagcttaagcaattcttgtttcaacattttgagatgaaggatcttggaccattaagttattttttggggcttgaagttttatcttccattgatggtt 24430347  T
Q  632 tgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcaaatacactcgtcttgaacccaacattcaatt 731  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |  |||||| ||||||||| ||  ||| |||    
T  24430346 tatttctctcaaaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcgagcaggtctcactgattgtaaaattgagcacactcctcttgaaccaaatgttcgatt 24430247  T
Q  732 tactcctcaagatggtactttacttgatgatg 763  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24430246 ttctcctcaagatggtaccttacttgacgatg 24430215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 215 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 53016322 - 53015774
Alignment:
Q  215 gcaaatggagactcactcaaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgcgtcctcctctaggatatacatgtca 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  53016322 gcaaatggaaactcactcaaatggatgttaaaaatgcatttcttaatggtgagttagaagaagaggtttacatgtgtcctcctcctggatatacttgtca 53016223  T
Q  315 gtaaaacaaagtgtatcgcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactatcactcagttgaat 414  Q
    | |||| ||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53016222 ggaaaataaagtatgtcgcattcgcaaggctctttatggtctcaaacaagcacttcgagcttggtttgctaaatttcacaagactatcacccaattgaat 53016123  T
Q  415 ttctcttcttgtgctcatgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaatggtattgttgtcttccttctttatgtcaatgacatgattatcagtggtg 514  Q
    ||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  53016122 ttctcctccagtggtcatgattctgctctctttactcgaaaaattgataatggtactgttgtcttacttctttatgtcgatgacatgattatcactggag 53016023  T
Q  515 acgactccattggaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttggggcttgaagcatt 614  Q
    | |||||   ||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  53016022 atgactctgctggaattgaagagctcaataaattcctgtgtcaacattttgagatgaaggatctttgaccattaagttactttctagggcttgaagtatc 53015923  T
Q  615 atcttcgaatgatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcaaatacactcgtctt 714  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||  || |||||| ||||    
T  53015922 atcttcgagtgatggcttgtttctctcacaggctaagtatgcttcttatcttgtctctcgagcaggtctcagtgatagtaaaattgaacacactcctctt 53015823  T
Q  715 gaacccaacattcaatttactcctcaagatggtactttacttgatgatg 763  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53015822 gaaccaaacgttcgatttactcctcaagatggtactttacttaatgatg 53015774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 220 - 763
Target Start/End: Original strand, 12558748 - 12559290
Alignment:
Q  220 tggagactcactcaaatggatgttaaaaa-tgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgcgtcctcctctaggatatacatgtcagtaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||  | || |||||| || ||||||||||||||| |||||| |     
T  12558748 tggagactcactcaaatggatgttaaaaaatgccttcctcaatggtgagttagaagaagcg-ttcacatgcttcttcctctaggatatacttgtcagaat 12558846  T
Q  319 aacaaagtgtatcgcctccgtaaggctctttatggtctcaaacaagctcctggagcatgatttgataaatttcacaagactatcactcagttgaatttct 418  Q
    || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||   | | || |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  12558847 aataaagtatgtcgccttcgtaaggctctttatggtcttaaacaagcacccaaatcttggtttgctaaatttcacaagactatcacctaattgaatttct 12558946  T
Q  419 cttcttgtgctcatgactctgctctttttactcgaaaaactgaaaatggtattgttgtcttccttctttatgtcaatgacatgattatcagtggtgacga 518  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   | || ||    
T  12558947 cttctagtggtcatgattctgctctcttaactcgaaaaattgataatggtactgttgtcttgcttctttatgtcgatgacatgattatcaccagagatga 12559046  T
Q  519 ctccattggaattgaagagctcaagcaattcttatgtcaccattttgagatgaaggatcttgaaccattaagttactttttggggcttgaagcattatct 618  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  12559047 ctcctttggcattgaagagcttaaaaaattcttgtg-cagcattttgagatgaaggatcttggaccatttagttactttatagggcttgaagtattatct 12559145  T
Q  619 tcgaatgatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctcaagcaggtctcacagattgtaaaatcaaatacactcgtcttgaac 718  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||| || |||||| |||| |||    
T  12559146 tcgagtaatgacttgtttctctcacaggctaagtatgcttctgatcttgtctctctagcaggtctcaatgatactaaaatcgaacacactcctcttaaac 12559245  T
Q  719 ccaacattcaatttactcctcaagatggtactttacttgatgatg 763  Q
    | ||  ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12559246 caaatgttcgatttactcctcaaggtgatactttacttaatgatg 12559290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5241076 - 5240951
Alignment:
Q  210 cactcgcaaatggagactcactcaaatggatgttaaaaatgtctttctcaatggcgagttagaagaataggtttacatgcgtcctcctctaggatataca 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||     
T  5241076 cactcgaaaatggagactcactcaaatggatgttaaaaatgccttcctcaatggtgagttagaagaagaggtttacatgcatcctcctccaggatgtact 5240977  T
Q  310 tgtcagtaaaacaaagtgtatcgcct 335  Q
    |||||  |||| ||||| | ||||||    
T  5240976 tgtcacgaaaataaagtatgtcgcct 5240951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University