View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4901-Insertion-2 (Length: 759)

Name: NF4901-Insertion-2
Description: NF4901
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4901-Insertion-2
NF4901-Insertion-2
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (325-759)||(32659748-32660182)
chr7 (8-324)||(26168885-26169202)
chr7 (8-324)||(7893798-7894115)
chr7 (8-325)||(32660264-32660581)
chr7 (8-324)||(32038484-32038802)
chr7 (8-324)||(22007021-22007339)
chr7 (8-324)||(45115871-45116188)
chr7 (14-288)||(20955505-20955780)
chr7 (8-324)||(17696956-17697273)
chr7 (8-324)||(27715985-27716300)
chr7 (8-324)||(16719941-16720259)
chr7 (522-759)||(17695559-17695796)
chr7 (522-759)||(27714589-27714826)
chr7 (8-324)||(29956518-29956836)
chr7 (522-759)||(7887511-7887748)
chr7 (325-524)||(45115586-45115785)
chr7 (325-524)||(26168600-26168799)
chr7 (8-325)||(46909388-46909706)
chr7 (8-318)||(13398153-13398465)
chr7 (8-324)||(31100180-31100497)
chr7 (13-318)||(5093617-5093924)
chr7 (204-323)||(7888909-7889028)
chr7 (8-166)||(7889034-7889194)
chr7 (326-419)||(3595542-3595635)
chr7 (326-400)||(7893262-7893336)
chr7 (326-400)||(7893637-7893711)
chr7 (326-400)||(22006486-22006560)
chr7 (326-400)||(22006861-22006934)
chr7 (333-441)||(45823660-45823768)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (325-759)||(207269-207703)
chr2 (8-325)||(207788-208105)
chr2 (8-324)||(1512815-1513132)
chr2 (8-325)||(5013308-5013625)
chr2 (8-324)||(40605411-40605728)
chr2 (8-325)||(26455948-26456266)
chr2 (8-324)||(13908303-13908621)
chr2 (8-324)||(13905371-13905687)
chr2 (8-324)||(6123754-6124072)
chr2 (8-324)||(25647558-25647873)
chr2 (522-759)||(2299467-2299704)
chr2 (8-324)||(2300863-2301178)
chr2 (522-759)||(977301-977538)
chr2 (8-325)||(1916548-1916867)
chr2 (325-524)||(5013711-5013910)
chr2 (325-523)||(35432318-35432516)
chr2 (522-759)||(182778-183015)
chr2 (522-759)||(2448012-2448249)
chr2 (522-759)||(1272763-1272999)
chr2 (8-324)||(27997230-27997548)
chr2 (8-324)||(28098600-28098918)
chr2 (18-318)||(36437392-36437694)
chr2 (8-324)||(35431914-35432232)
chr2 (325-520)||(1512534-1512729)
chr2 (522-724)||(13904009-13904211)
chr2 (8-324)||(19821946-19822263)
chr2 (8-324)||(19842167-19842484)
chr2 (58-324)||(20890722-20890989)
chr2 (8-324)||(42109210-42109527)
chr2 (46-275)||(1273025-1273256)
chr2 (8-192)||(21588884-21589069)
chr2 (8-166)||(975858-976017)
chr2 (204-324)||(184175-184295)
chr2 (204-324)||(2449409-2449529)
chr2 (8-166)||(184301-184461)
chr2 (8-166)||(2449535-2449695)
chr2 (204-324)||(976023-976141)
chr2 (326-400)||(13907768-13907842)
chr2 (326-400)||(26455413-26455487)
chr2 (326-400)||(26455788-26455862)
chr2 (326-400)||(40605250-40605324)
chr2 (326-400)||(13908143-13908216)
chr2 (261-307)||(23455689-23455735)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (325-759)||(22730030-22730464)
chr8 (8-324)||(14994222-14994537)
chr8 (8-325)||(22729628-22729945)
chr8 (8-315)||(23827810-23828118)
chr8 (8-324)||(19961670-19961987)
chr8 (8-324)||(41376162-41376478)
chr8 (8-324)||(405904-406221)
chr8 (8-254)||(21639991-21640237)
chr8 (522-759)||(407377-407614)
chr8 (13-324)||(18265746-18266056)
chr8 (13-324)||(18274759-18275069)
chr8 (522-759)||(18267216-18267453)
chr8 (325-524)||(19961385-19961584)
chr8 (325-524)||(23827525-23827724)
chr8 (8-324)||(37983187-37983504)
chr8 (8-306)||(18492360-18492658)
chr8 (8-325)||(24011598-24011914)
chr8 (326-512)||(37589352-37589538)
chr8 (326-400)||(14994624-14994698)
chr8 (522-608)||(18287300-18287386)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (325-759)||(30388173-30388607)
chr4 (8-324)||(52682775-52683092)
chr4 (8-325)||(30387771-30388088)
chr4 (8-325)||(28389444-28389762)
chr4 (8-324)||(41859613-41859930)
chr4 (8-309)||(16909113-16909415)
chr4 (8-323)||(21382693-21383007)
chr4 (8-324)||(29358954-29359271)
chr4 (8-324)||(21581358-21581675)
chr4 (8-300)||(25839384-25839678)
chr4 (8-324)||(19514968-19515285)
chr4 (522-759)||(21582835-21583072)
chr4 (325-524)||(29359346-29359545)
chr4 (325-524)||(21382407-21382606)
chr4 (325-524)||(28389160-28389359)
chr4 (325-524)||(16908822-16909021)
chr4 (8-325)||(42347780-42348099)
chr4 (13-324)||(53288351-53288664)
chr4 (8-324)||(31448195-31448516)
chr4 (326-512)||(36895797-36895982)
chr4 (326-400)||(41860017-41860091)
chr4 (326-400)||(52682239-52682313)
chr4 (326-400)||(52682614-52682688)
chr4 (261-307)||(8121116-8121162)
chr4 (261-307)||(36895648-36895694)
chr4 (369-437)||(47507650-47507718)
chr4 (261-307)||(26602405-26602451)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (325-759)||(49562552-49562986)
chr3 (325-759)||(35715843-35716278)
chr3 (325-759)||(36087733-36088167)
chr3 (8-324)||(36087331-36087647)
chr3 (8-324)||(26951562-26951879)
chr3 (8-325)||(35716363-35716680)
chr3 (8-325)||(49562150-49562467)
chr3 (8-324)||(38655662-38655980)
chr3 (8-324)||(854630-854948)
chr3 (8-324)||(18198758-18199075)
chr3 (8-324)||(36091168-36091485)
chr3 (8-324)||(31487279-31487594)
chr3 (8-325)||(4594166-4594484)
chr3 (8-324)||(13454623-13454940)
chr3 (8-323)||(16651476-16651792)
chr3 (8-325)||(36946896-36947215)
chr3 (8-324)||(12260882-12261200)
chr3 (8-324)||(12825255-12825572)
chr3 (522-759)||(4592770-4593007)
chr3 (522-759)||(26946506-26946743)
chr3 (325-524)||(18198473-18198672)
chr3 (325-524)||(31486994-31487193)
chr3 (325-524)||(38656066-38656265)
chr3 (58-324)||(52418585-52418852)
chr3 (325-524)||(52418937-52419136)
chr3 (326-519)||(36947300-36947493)
chr3 (8-324)||(11826531-11826848)
chr3 (522-724)||(16650113-16650315)
chr3 (522-724)||(13456100-13456303)
chr3 (8-324)||(33003628-33003942)
chr3 (8-324)||(859881-860208)
chr3 (8-211)||(29864566-29864770)
chr3 (204-324)||(26947903-26948023)
chr3 (326-512)||(18256015-18256201)
chr3 (8-166)||(26948029-26948189)
chr3 (8-226)||(47726776-47726994)
chr3 (326-412)||(18201241-18201327)
chr3 (326-400)||(26951026-26951100)
chr3 (326-400)||(36091572-36091646)
chr3 (522-608)||(18207143-18207229)
chr3 (8-153)||(43508621-43508767)
chr3 (326-400)||(26951401-26951475)
chr3 (342-400)||(36091963-36092021)
chr3 (248-307)||(18256305-18256364)
chr3 (261-307)||(36006257-36006303)
chr3 (545-622)||(16472675-16472752)
chr3 (368-457)||(24759078-24759167)
chr3 (368-457)||(24826847-24826936)
chr3 (8-75)||(15081768-15081835)
chr3 (261-307)||(53521059-53521105)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (325-759)||(45503676-45504110)
chr1 (8-324)||(2044989-2045306)
chr1 (8-323)||(48651061-48651375)
chr1 (15-323)||(13926049-13926358)
chr1 (8-324)||(50708917-50709234)
chr1 (45-324)||(45503311-45503590)
chr1 (8-324)||(2047240-2047557)
chr1 (8-324)||(36866651-36866968)
chr1 (8-322)||(49787099-49787412)
chr1 (522-750)||(2048717-2048945)
chr1 (522-750)||(36868129-36868357)
chr1 (522-759)||(49788572-49788809)
chr1 (8-324)||(38210733-38211051)
chr1 (20-324)||(29245496-29245802)
chr1 (522-759)||(7479157-7479394)
chr1 (13-324)||(45501032-45501345)
chr1 (325-524)||(50708632-50708831)
chr1 (325-524)||(29245211-29245410)
chr1 (325-524)||(48650775-48650974)
chr1 (325-524)||(13926444-13926640)
chr1 (8-325)||(48960767-48961084)
chr1 (58-324)||(39513046-39513313)
chr1 (8-313)||(15691525-15691831)
chr1 (127-314)||(26211706-26211892)
chr1 (325-446)||(38211137-38211258)
chr1 (325-446)||(39513399-39513520)
chr1 (204-324)||(42496638-42496758)
chr1 (204-324)||(7480554-7480674)
chr1 (204-324)||(9533930-9534050)
chr1 (8-166)||(42496764-42496924)
chr1 (8-166)||(7480680-7480840)
chr1 (8-166)||(9534056-9534216)
chr1 (329-512)||(37891682-37891865)
chr1 (326-466)||(23086339-23086479)
chr1 (8-153)||(36461625-36461772)
chr1 (326-420)||(35594010-35594104)
chr1 (326-400)||(2045393-2045467)
chr1 (522-608)||(37901539-37901625)
chr1 (268-306)||(21056874-21056912)
chr1 (462-512)||(23089555-23089605)
chr1 (267-307)||(37891535-37891575)
chr1 (261-307)||(8256825-8256871)
chr1 (333-402)||(5429244-5429313)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (8-325)||(2280983-2281301)
chr6 (522-759)||(33046998-33047235)
chr6 (325-524)||(2280702-2280901)
chr6 (8-324)||(29369253-29369570)
chr6 (8-262)||(29924870-29925125)
chr6 (522-748)||(348993-349226)
chr6 (47-315)||(33004550-33004820)
chr6 (58-325)||(29371859-29372126)
chr6 (8-313)||(24458711-24459017)
chr6 (15-275)||(349252-349511)
chr6 (204-324)||(33045718-33045838)
chr6 (8-166)||(33045552-33045712)
chr6 (326-512)||(25971184-25971370)
chr6 (333-512)||(25975631-25975810)
chr6 (527-622)||(25001580-25001675)
chr6 (326-405)||(3591100-3591179)
chr6 (248-307)||(25971021-25971080)
chr6 (248-307)||(25975461-25975520)
chr6 (545-622)||(25002541-25002618)
chr6 (333-402)||(17905868-17905937)
[»] scaffold0097 (5 HSPs)
scaffold0097 (8-324)||(48835-49152)
scaffold0097 (8-324)||(51659-51974)
scaffold0097 (325-524)||(52060-52259)
scaffold0097 (204-324)||(40382-40502)
scaffold0097 (8-166)||(40216-40376)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (21-324)||(45618-45922)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (13-324)||(32674939-32675251)
chr5 (8-324)||(20104835-20105151)
chr5 (8-323)||(30090094-30090410)
chr5 (8-324)||(3607679-3607996)
chr5 (522-759)||(12653864-12654101)
chr5 (522-759)||(23182649-23182886)
chr5 (522-759)||(23186916-23187153)
chr5 (522-759)||(34759910-34760147)
chr5 (522-759)||(39876744-39876981)
chr5 (522-724)||(20106311-20106513)
chr5 (522-724)||(30091571-30091773)
chr5 (522-724)||(3609156-3609359)
chr5 (8-166)||(12655387-12655546)
chr5 (204-324)||(12655261-12655381)
chr5 (204-324)||(23184046-23184166)
chr5 (204-324)||(23188313-23188433)
chr5 (204-324)||(34761307-34761427)
chr5 (204-324)||(39878141-39878261)
chr5 (326-512)||(16678908-16679094)
chr5 (8-166)||(23184172-23184332)
chr5 (8-166)||(23188439-23188599)
chr5 (8-166)||(34761433-34761593)
chr5 (8-166)||(39878267-39878427)
chr5 (328-512)||(38095657-38095841)
chr5 (326-400)||(32674778-32674852)
chr5 (261-307)||(38095505-38095551)
chr5 (258-307)||(37609741-37609790)
chr5 (261-307)||(16678759-16678805)
chr5 (268-307)||(38936314-38936353)
[»] scaffold0642 (2 HSPs)
scaffold0642 (8-324)||(3440-3757)
scaffold0642 (522-759)||(2045-2281)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (8-324)||(13352-13669)
scaffold0345 (522-759)||(11956-12193)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (8-324)||(25312-25629)
scaffold0105 (522-759)||(26788-27024)
[»] scaffold0119 (4 HSPs)
scaffold0119 (522-759)||(28092-28328)
scaffold0119 (522-759)||(34493-34730)
scaffold0119 (13-275)||(34203-34467)
scaffold0119 (46-275)||(27835-28066)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (8-324)||(2012-2329)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (522-608)||(49-135)
[»] scaffold1910 (1 HSPs)
scaffold1910 (466-512)||(930-976)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (333-402)||(104606-104675)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 32660182 - 32659748
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32660182 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatattggaaactgccttcgttt 32660083  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660082 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgatgaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 32659983  T
Q  525 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32659982 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 32659883  T
Q  625 attaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacca 724  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32659882 attaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgtagaaaccttttcatcgacca 32659783  T
Q  725 gtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32659782 gtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 32659748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26169202 - 26168885
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26169202 cattgacccgtgctaacacacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 26169103  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26169102 aagcaaaatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 26169003  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26169002 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 26168903  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26168902 gcaacatcgatatcatcg 26168885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7894115 - 7893798
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7894115 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 7894016  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7894015 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 7893916  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893915 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 7893816  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7893815 gcaacatcgatatcatcg 7893798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32660581 - 32660264
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32660581 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 32660482  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32660481 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagcacgtagttcctgttactataaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 32660382  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660381 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 32660282  T
Q  308 caacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  32660281 caacatcgatatcgtcgt 32660264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32038802 - 32038484
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32038802 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 32038703  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccata--attctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32038702 agcaaaatgttaataccaaagactttgttattgttccatataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaaggggaaattg 32038603  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32038602 aagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 32038503  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32038502 tgcaacatcgatatcatcg 32038484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22007339 - 22007021
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa--taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22007339 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaaataagaaactgtagttcgcatgaatctaaaaattgttgtgaatc 22007240  T
Q  106 aaagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22007239 aaagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctggtacgtagttcctgttactttaaaataatatataattttgaaagggaaattg 22007140  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22007139 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 22007040  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22007039 tgcaacatcgatatcatcg 22007021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45116188 - 45115871
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45116188 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 45116089  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45116088 aagcaaaatgtcaatacgaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 45115989  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45115988 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgat 45115889  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  45115888 gcaacatcggtatcatcg 45115871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 20955505 - 20955780
Alignment:
Q  14 cccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20955505 cccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaaagcaa 20955604  T
Q  113 aatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcg 212  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20955605 aatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcg 20955704  T
Q  213 ttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttct 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20955705 ttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttct 20955780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17697273 - 17696956
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17697273 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatcgtgaatca 17697175  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  17697174 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 17697075  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17697074 aagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatcacacttga 17696975  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  17696974 tgcaacatcggtatcatcg 17696956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27716300 - 27715985
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  27716300 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatct-cactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 27716203  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  27716202 aagcaaaatgtcaattaccatagacgttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 27716103  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27716102 aagttcgttgacatgcaaatcgtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttga 27716004  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  27716003 tgcaacatcggtatcatcg 27715985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16720259 - 16719941
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16720259 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataatacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatcgtgaatca 16720161  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  16720160 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 16720061  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcc-tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttg 304  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16720060 aagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttg 16719961  T
Q  305 atgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  16719960 atgcaacatcggtatcatcg 16719941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 17695796 - 17695559
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17695796 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 17695697  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17695696 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 17695597  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17695596 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 17695559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 27714826 - 27714589
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27714826 agctgatatgtacccccttcttgaaccatgcacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 27714727  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27714726 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagttcaaacatgcagaaaccttttcatcga 27714627  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27714626 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 27714589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29956836 - 29956518
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  29956836 cattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagttaatattcaatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtaaatca 29956737  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||| ||    
T  29956736 aagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagatcgtacttcctgttactttaacataacttataattttaaaagggaaactg 29956637  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956636 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 29956537  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  29956536 tgcaacatcggtatcatcg 29956518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 7887748 - 7887511
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7887748 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 7887649  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7887648 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 7887549  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7887548 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 7887511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 45115785 - 45115586
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45115785 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 45115686  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45115685 aaatttgaaaggaattctattatcagatgttgttagcgataaccttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagc 45115586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26168799 - 26168600
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26168799 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcagaaactgccttcgttt 26168700  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26168699 aaatttgataggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacatcttctcaacgatattagaaccagatattacccgttcttcgagc 26168600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46909706 - 46909388
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  46909706 cattgacccgtgctaatgcacgcgtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 46909607  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  46909606 aagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 46909507  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46909506 aagttcgttgacatgtaaatagtttcaataagtaagaaaatgaataggacacaaaaaa-tcctacacattatggaaaacttctatgtagaccacatttga 46909408  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  46909407 tgcaacatcggtatcatcgt 46909388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 318
Target Start/End: Original strand, 13398153 - 13398465
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13398153 cattgacccatgctaacgcacgagtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 13398252  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |     
T  13398253 aagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaacta 13398352  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13398353 aagttcgttgacatacaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttga 13398452  T
Q  306 tgcaacatcgata 318  Q
    |||||||||||||    
T  13398453 tgcaacatcgata 13398465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31100497 - 31100180
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| | |||||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  31100497 cattgacccgtgctaacgcacaggtcattttaagaagttaatattcaccgtaaaaataaaataatatagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtaaatca 31100398  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  || |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  31100397 aagcataacgccaattatcataggctttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 31100298  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31100297 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtatacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttatctgtagaccacatttg- 31100199  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  31100198 tccaacatcggtatcatcg 31100180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5093924 - 5093617
Alignment:
Q  13 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcg 111  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  5093924 acccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagca 5093825  T
Q  112 aaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagtt 210  Q
     ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  |||   || ||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  5093824 taatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcgatttctgttattttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagta 5093725  T
Q  211 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5093724 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaataatacaaaaaaaagtcatacacattacagaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaa 5093625  T
Q  311 catcgata 318  Q
    ||||||||    
T  5093624 catcgata 5093617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7889028 - 7888909
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7889028 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 7888929  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatc 323  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  7888928 gatgcaacatcggtatcatc 7888909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7889194 - 7889034
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  7889194 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcattttaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 7889095  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7889094 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 7889034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 419
Target Start/End: Original strand, 3595542 - 3595635
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgcctt 419  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  3595542 aggagacagtagatagataccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgcctt 3595635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7893336 - 7893262
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7893336 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 7893262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7893711 - 7893637
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7893711 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 7893637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22006560 - 22006486
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22006560 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 22006486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22006934 - 22006861
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22006934 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacga-tgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 22006861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 45823768 - 45823660
Alignment:
Q  333 ggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgtttaaatttga 432  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || || || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || | ||| | ||||| || ||||||||    
T  45823768 ggtaggtatacaccaacatgtccgagtgattgcccttgacttttgttgatagtcattgcaaatgacacagaaataaaaaattaccttctttaaaatttga 45823669  T
Q  433 aaggaattc 441  Q
    |||||||||    
T  45823668 aaggaattc 45823660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 207703 - 207269
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  207703 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagacagatatcggaaactgtcttcgttt 207604  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207603 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcatcgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 207504  T
Q  525 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207503 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 207404  T
Q  625 attaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacca 724  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  207403 attaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatatagaaaccttttcatcgacca 207304  T
Q  725 gtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  207303 gtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 207269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 208105 - 207788
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  208105 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 208006  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  208005 agcaaaatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 207906  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207905 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 207806  T
Q  308 caacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  207805 caacatcgatatcatcgt 207788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1513132 - 1512815
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1513132 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactaaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 1513033  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513032 aagcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 1512933  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1512932 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 1512833  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1512832 gcaacatcgatatcatcg 1512815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 5013308 - 5013625
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5013308 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataattttcactgaaaaataagacaatgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 5013407  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5013408 agcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 5013507  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013508 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacatttgatg 5013607  T
Q  308 caacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5013608 caacatcgatatcatcgt 5013625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40605728 - 40605411
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40605728 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 40605629  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40605628 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 40605529  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605528 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 40605429  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40605428 gcaacatcgatatcatcg 40605411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26456266 - 26455948
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26456266 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 26456167  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26456166 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagtttctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 26456067  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26456066 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtactacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 26455967  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26455966 gcaacatcgatatcatcgt 26455948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13908621 - 13908303
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa--taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatc 105  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13908621 cattgacctgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaaataagaaactgtagttcgcatgaatctaaaaattgtcgtgaatc 13908522  T
Q  106 aaagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13908521 aaagcataatgtcaatatcaaagactttgtttttgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataatatataattttgaaagggaaattg 13908422  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13908421 aagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctatagaccacatttga 13908322  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13908321 tgcaacatcgatatcatcg 13908303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13905687 - 13905371
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13905687 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcacagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 13905589  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  13905588 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 13905489  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13905488 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacatattacggaaaacttctctgtagaccacacttga 13905390  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13905389 tgcaacatcggtatcatcg 13905371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6124072 - 6123754
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6124072 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 6123974  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  6123973 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 6123874  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcc-tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6123873 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttg 6123774  T
Q  305 atgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  6123773 atgcaacatcggtatcatcg 6123754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25647873 - 25647558
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  25647873 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactatagttcgcttgaatgaaaaaattgtcgtgaatca 25647774  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  25647773 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 25647674  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |       
T  25647673 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagaccacact--- 25647577  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  25647576 tgcaacatcggtatcatcg 25647558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 2299704 - 2299467
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2299704 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagatgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 2299605  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2299604 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 2299505  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2299504 ccactaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 2299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2301178 - 2300863
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2301178 cattgacccgtgttaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgaaaaaattatcgtgaatca 2301079  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| ||    
T  2301078 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacaaaacatataattttaaaagggaaactg 2300979  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |       
T  2300978 aagttcgttgatatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagaccacact--- 2300882  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  2300881 tgcaacatcggtatcatcg 2300863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 977301 - 977538
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  977301 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 977400  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  977401 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 977500  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  977501 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 977538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 1916548 - 1916867
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1916548 cattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagttaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattatcgtgaatca 1916647  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||   ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  1916648 aagaataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 1916747  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1916748 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacatattatggaaaacttctatgtagaccacatttga 1916847  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  1916848 tgcaacattggtatcatcgt 1916867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Original strand, 5013711 - 5013910
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5013711 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgaaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 5013810  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013811 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 5013910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 325 - 523
Target Start/End: Original strand, 35432318 - 35432516
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35432318 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 35432417  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgag 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35432418 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacatcttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgag 35432516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 183015 - 182778
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  183015 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 182916  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  182915 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 182816  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  182815 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 182778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 2448249 - 2448012
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2448249 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 2448150  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2448149 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 2448050  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2448049 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 2448012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 1272999 - 1272763
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1272999 agctgatatgtacccccttctttacccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacatccaccctattgacgaaa-caac 1272901  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1272900 agcagtaaacaactggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagttaagagtgcaaacatgtagaaaccttttcatcga 1272801  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1272800 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 1272763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 27997230 - 27997548
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  27997230 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 27997329  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  || || |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  27997330 aagcataaggtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 27997429  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27997430 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagttctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 27997529  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  27997530 tgctacatcggtatcatcg 27997548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 28098600 - 28098918
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  28098600 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 28098699  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  || || |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  28098700 aagcataaggtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 28098799  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28098800 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagttctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 28098899  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  28098900 tgctacatcggtatcatcg 28098918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 318
Target Start/End: Original strand, 36437392 - 36437694
Alignment:
Q  18 tgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  36437392 tgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatg 36437491  T
Q  117 ttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttg 215  Q
    | |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36437492 tcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttg 36437591  T
Q  216 acatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcg 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36437592 acatacaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcg 36437691  T
Q  316 ata 318  Q
    |||    
T  36437692 ata 36437694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 35431914 - 35432232
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaa-aaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatc 105  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  35431914 cattgaccggtgctaacgcacgggtcattttaagaaata-aatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatc 35432012  T
Q  106 aaagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaatt 204  Q
    |||||  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  35432013 aaagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaaaacgaagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaact 35432112  T
Q  205 gaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacac-aaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35432113 aaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaaagtcctacacattatggaaaacttctctgtag-ccacattt 35432211  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  35432212 gatgcaacatcgctatcatcg 35432232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1512729 - 1512534
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1512729 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcggaaactgccttcgttt 1512630  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1512629 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaatgatattagaaccagatattacccgtccttc 1512534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 522 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 13904211 - 13904009
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13904211 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatatgtccaccctattgacgacaacaac 13904112  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13904111 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcaa 13904012  T
Q  722 cca 724  Q
    |||    
T  13904011 cca 13904009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19822263 - 19821946
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19822263 cattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 19822164  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  19822163 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 19822064  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19822063 agttcgttgacatgcaaatagtttcaatcagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattccggaaaacttctttgtagaccacatttgat 19821964  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  19821963 gcaacatcggtataatcg 19821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19842484 - 19842167
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19842484 cattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 19842385  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  19842384 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 19842285  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19842284 agttcgttgacatgcaaatagtttcaatcagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattccggaaaacttctttgtagaccacatttgat 19842185  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  19842184 gcaacatcggtataatcg 19842167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20890989 - 20890722
Alignment:
Q  58 aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagta 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  20890989 aaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaaccataatgtcaattacgatagattttgttattgttccataattctaaga 20890890  T
Q  157 cgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtaca 256  Q
    || |||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20890889 cgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtaca 20890790  T
Q  257 caaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20890789 caaaaatgtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcg 20890722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 42109210 - 42109527
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| ||||||| |||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  42109210 cattgacccctgctaacacacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 42109309  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  42109310 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 42109409  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42109410 agttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaggtcctacacattacggaaaacttttttgtagaccacatttgat 42109509  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  42109510 gcaacatcggtataatcg 42109527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1273256 - 1273025
Alignment:
Q  46 taatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttc 143  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||| ||| | || |||| ||||||||||||    
T  1273256 taatattcactggaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgttgtgaatcaaagcataatgtcaattaccatagacattgttattgttc 1273157  T
Q  144 cataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1273156 cataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcatatagtttcaataagtaagaa 1273057  T
Q  244 aatgaacagtacacaaaaaagtcctacacatt 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1273056 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 1273025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 21588884 - 21589069
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  21588884 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaaattttgtgaatca 21588983  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataatttt 192  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21588984 aagcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataatttt 21589069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 975858 - 976017
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  975858 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 975957  T
Q  108 agcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    ||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  975958 agcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 976017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 184295 - 184175
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  184295 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 184196  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  184195 gatgcaacatcggtatcatcg 184175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2449529 - 2449409
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2449529 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 2449430  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  2449429 gatgcaacatcggtatcatcg 2449409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 184461 - 184301
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  184461 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 184362  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  184361 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 184301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2449695 - 2449535
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2449695 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcacttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 2449596  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449595 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 2449535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Original strand, 976023 - 976141
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  976023 tgaagttcgtt--catgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 976120  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  976121 gatgcaacatcggtatcatcg 976141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13907842 - 13907768
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13907842 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 13907768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26455487 - 26455413
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26455487 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 26455413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26455862 - 26455788
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26455862 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 26455788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40605324 - 40605250
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40605324 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 40605250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13908216 - 13908143
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13908216 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacga-tgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 13908143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Original strand, 23455689 - 23455735
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23455689 aaagtcctacacattacggaaaaattctctgtagactacatttgatg 23455735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Original strand, 22730030 - 22730464
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22730030 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttagtagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 22730129  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22730130 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacctgtccctcgagc 22730229  T
Q  525 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22730230 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctaattgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 22730329  T
Q  625 attaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacca 724  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22730330 attaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagttaagagtgcaaacatggaaaaaccttttcatcgacca 22730429  T
Q  725 gtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22730430 gtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 22730464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 14994222 - 14994537
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14994222 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacact--agttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 14994319  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14994320 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccgtaattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 14994419  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14994420 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccatatttgat 14994519  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14994520 gcaacatcgatatcatcg 14994537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 22729628 - 22729945
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22729628 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagtttgcgtgaatctaaaaattgtcatgaatcaa 22729727  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22729728 agcaaaatgtcaataccaaagactgtgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 22729827  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22729828 tttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacgtaaaacttttctgtagaccacatttgatg 22729927  T
Q  308 caacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22729928 caacatcgatatcatcgt 22729945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23828118 - 23827810
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23828118 cattgacccatgctaaggcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 23828019  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23828018 aagcaatatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacatagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 23827919  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827918 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 23827819  T
Q  307 gcaacatcg 315  Q
    ||| |||||    
T  23827818 gcatcatcg 23827810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19961987 - 19961670
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||    
T  19961987 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcattgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatttaaaaaaatttgtgaatca 19961888  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19961887 aagcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 19961788  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19961787 agttcgttgacatgcaaatagtttcagcaagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacagaaaacttctctgtagaccacatttgat 19961688  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  19961687 gcaacatcggtatcatcg 19961670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 41376162 - 41376478
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41376162 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttagaaaagataatattcactgaaaaataaaacactgtagtttgcgtgaatctaaaaattgttgtgaatcaa 41376261  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41376262 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcttgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 41376361  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41376362 gttcgttgacatgcaaatattttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagatcacacttgatg 41376461  T
Q  308 caacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||  |||||||    
T  41376462 caacatcggcatcatcg 41376478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 405904 - 406221
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  405904 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaact-taatactcaccgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgttgtgaatca 406002  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  406003 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 406102  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  406103 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacgcaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttga 406202  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  406203 tgcaacatcggtatcatcg 406221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21640237 - 21639991
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21640237 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 21640138  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21640137 agcaaaatgtcaataccaaagactatgttattgttacataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 21640038  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagta 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21640037 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagta 21639991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 407377 - 407614
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  407377 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaaa 407476  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  407477 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 407576  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  407577 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 407614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Original strand, 18265746 - 18266056
Alignment:
Q  13 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||     
T  18265746 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcgctgaaaaaataagatattgtagttcgcttgaatgaaaaaattgtcgtgaatcatagca 18265845  T
Q  112 aaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagtt 210  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18265846 aaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtt 18265945  T
Q  211 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  18265946 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacact---tgcaa 18266042  T
Q  311 catcgatatcatcg 324  Q
    ||||| ||||||||    
T  18266043 catcggtatcatcg 18266056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Original strand, 18274759 - 18275069
Alignment:
Q  13 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||     
T  18274759 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcgctgaaaaaataagatattgtagttcgcttgaatgaaaaaattgtcgtgaatcatagca 18274858  T
Q  112 aaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagtt 210  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18274859 aaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttccttttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtt 18274958  T
Q  211 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  18274959 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacact---tgcaa 18275055  T
Q  311 catcgatatcatcg 324  Q
    ||||| ||||||||    
T  18275056 catcggtatcatcg 18275069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 18267216 - 18267453
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18267216 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 18267315  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18267316 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 18267415  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18267416 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 18267453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 19961584 - 19961385
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19961584 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactaccttcgttt 19961485  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19961484 aaatttgaaatgaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 19961385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 23827724 - 23827525
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23827724 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaaccgccttcgttt 23827625  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23827624 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagc 23827525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 37983187 - 37983504
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37983187 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatataaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattatcgtgaatcaa 37983286  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  37983287 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 37983386  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37983387 agttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 37983486  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  37983487 gcaacatcggtataatcg 37983504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18492658 - 18492360
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  18492658 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaaaaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcatgaatcaa 18492559  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  18492558 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgtttcataattctaagacgc-gtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 18492460  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18492459 agttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 18492360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 24011598 - 24011914
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  24011598 cattgacccatgctaacgcacaggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattttcttgaatcaa 24011697  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| || |||||  ||||| ||||||||| |||    
T  24011698 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaaaacgcagtttctgttactttaacataacata--attttaaaagggaaactga 24011795  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24011796 agttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcttacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 24011895  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  24011896 gcaacatcggtataatcgt 24011914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 326 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 37589538 - 37589352
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttta 425  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||    
T  37589538 aggagacggtagatagataccaacatttttcatagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgtcttcgttta 37589439  T
Q  426 aatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    || ||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||    
T  37589438 aacttgaaaggaattctagtatcaaacggttgtagcgataactttagaataaacacctttttacctatattagattcagatattacc 37589352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Original strand, 14994624 - 14994698
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14994624 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagac 14994698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 522 - 608
Target Start/End: Original strand, 18287300 - 18287386
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctat 608  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  18287300 agctcatatgtagccccttcctcaaccattgacctgaatcttgccaccaaatcctttctaactgtggcgtggatacgtccaccctat 18287386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Original strand, 30388173 - 30388607
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30388173 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgatt 30388272  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30388273 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatattagaactagatattacccgtccttcgagc 30388372  T
Q  525 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388373 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccatcaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 30388472  T
Q  625 attaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacca 724  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30388473 attaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgtagaaaccttttcatcgacca 30388572  T
Q  725 gtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30388573 gtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 30388607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52683092 - 52682775
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52683092 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 52682993  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52682992 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 52682893  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682892 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 52682793  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52682792 gcaacatcgatatcatcg 52682775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 30387771 - 30388088
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30387771 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 30387870  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30387871 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagcacgtagttcctgttactataaaataacatataattttgaaaggaaaattgaa 30387970  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30387971 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 30388070  T
Q  308 caacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  30388071 caacatcgatatcgtcgt 30388088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28389762 - 28389444
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28389762 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgttgtgaatca 28389663  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28389662 aagcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 28389563  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28389562 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccaacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 28389463  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  28389462 gcaacatcggtatcatcgt 28389444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 41859613 - 41859930
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41859613 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtcgttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 41859712  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41859713 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacatagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 41859812  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41859813 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcttacacattacgaaaaacttcactgtagaccacatttgat 41859912  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41859913 gcaacatcgatatcatcg 41859930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16909415 - 16909113
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16909415 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 16909316  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16909315 aagcaaaatatcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 16909216  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16909215 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 16909116  T
Q  307 gca 309  Q
    |||    
T  16909115 gca 16909113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21383007 - 21382693
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21383007 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactataaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatgaa 21382908  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21382907 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 21382808  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21382807 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatg 21382709  T
Q  308 caacatcgatatcatc 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  21382708 caacatcggtatcatc 21382693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 29358954 - 29359271
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg--aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29358954 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaag-ataatattcactggaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatc 29359052  T
Q  106 aaagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  29359053 aaagcataatgtcaatatcaaagactttgttattatttcataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttggaaggcaaattg 29359152  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29359153 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacaatacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttga 29359252  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29359253 tgcaacatcgatatcatcg 29359271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 21581358 - 21581675
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21581358 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatcgtgaatca 21581456  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  21581457 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 21581556  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21581557 aagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatcacacttga 21581656  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  21581657 tgcaacatcggtatcatcg 21581675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25839678 - 25839384
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  25839678 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgaaaaaattgtcgtgaatca 25839579  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  25839578 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 25839479  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25839478 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagaccaca 25839384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 19514968 - 19515285
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19514968 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaat-taatactcaatgaaaaaataagacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattatcgtgaatca 19515066  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  19515067 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 19515166  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  19515167 aagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatcacacttga 19515266  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  19515267 tgcaacatcggtatcatcg 19515285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 21582835 - 21583072
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21582835 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 21582934  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21582935 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 21583034  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21583035 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 21583072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Original strand, 29359346 - 29359545
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29359346 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctcactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 29359445  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29359446 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacactttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 29359545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 21382606 - 21382407
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21382606 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagaaatcggaaactgccttcgttt 21382507  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  21382506 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagc 21382407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 28389359 - 28389160
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  28389359 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcgaaaaccgccttcgttt 28389260  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28389259 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagc 28389160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 16909021 - 16908822
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16909021 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgaccgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaaccgccttcgttt 16908922  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16908921 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttgaaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagc 16908822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42348099 - 42347780
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  42348099 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 42348000  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  ||||| |||  | | ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  42347999 aagcataatgtcaattacgatagactttattattgttccataattctaagacgcagtttttgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 42347900  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42347899 aagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttga 42347800  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  42347799 tgcaacatcggtataatcgt 42347780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 53288664 - 53288351
Alignment:
Q  13 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcg 111  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  53288664 acccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagca 53288565  T
Q  112 aaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagtt 210  Q
     ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  |||   || ||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  53288564 taatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcgatttctgttattttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagta 53288465  T
Q  211 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53288464 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaataatacaaaaaaaagtcatacacattacagaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaa 53288365  T
Q  311 catcgatatcatcg 324  Q
    ||||| ||| ||||    
T  53288364 catcggtataatcg 53288351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 31448195 - 31448516
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||    
T  31448195 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaagcaa 31448294  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttg--aaagggaaatt 204  Q
    | |  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || |||| |||| || ||||||||||||   ||||||||| |    
T  31448295 aacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctattactttaacataacatataattttttaaaagggaaact 31448394  T
Q  205 gaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaa--gtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatt 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31448395 gaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaaagctcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatt 31448494  T
Q  303 tgatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  31448495 tgatgcaacatcggtataatcg 31448516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 326 - 512
Target Start/End: Original strand, 36895797 - 36895982
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttta 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  36895797 aggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagattgaccctgaatcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttcgttta 36895896  T
Q  426 aatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    || ||||| || |||||| ||||| | |||    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  36895897 aacttgaacgggattctagtatcagacggttgaggcgataacctt-gaataaacaccttttcacctatattagatctagatattacc 36895982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Original strand, 41860017 - 41860091
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41860017 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 41860091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 52682313 - 52682239
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52682313 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 52682239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 52682688 - 52682614
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52682688 aggagacggtagataaacacgaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattacaaatgagac 52682614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8121162 - 8121116
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8121162 aaagtgctacacattacggaaaacttctctgtagaccatatttgatg 8121116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Original strand, 36895648 - 36895694
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36895648 aaagtgctaaacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 36895694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 47507718 - 47507650
Alignment:
Q  369 tgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgtttaaatttgaaagga 437  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  47507718 tgactcttgttaatagtcattgcgaatgaaacaactatcagaaactgtctccgttgaaatttgaaagga 47507650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Original strand, 26602405 - 26602451
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602405 aaagtgctacacattatagaaaacttctctgtagaccacatttgatg 26602451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Original strand, 49562552 - 49562986
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  49562552 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcgaaaattgcctttgttt 49562651  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49562652 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 49562751  T
Q  525 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49562752 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 49562851  T
Q  625 attaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacca 724  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49562852 attaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtacaaacatgcagaaaccttttcatcgacca 49562951  T
Q  725 gtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  49562952 gtaacatgttcatgaaaattatgctagtggggacc 49562986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 35716278 - 35715843
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  35716278 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaattgcctttgttt 35716179  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtcctt-cgag 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35716178 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtcctttcgag 35716079  T
Q  524 ctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaa 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35716078 ctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaattttgacaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaa 35715979  T
Q  624 cattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacc 723  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35715978 cattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtacaaacatgcaaaaaccttttcatcgacc 35715879  T
Q  724 agtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35715878 agtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 35715843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Original strand, 36087733 - 36088167
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36087733 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgacccggactcttgttaatagtgattgcaaatgagacagatatcggaaactgtcttcgttt 36087832  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36087833 aaatttgaatggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcactgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 36087932  T
Q  525 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 624  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36087933 tgatatgtagcccgttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggtgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaccaac 36088032  T
Q  625 attaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacca 724  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36088033 attaaacagctggttaaattacatagctaaaaaacaactatgacattagtttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcgacca 36088132  T
Q  725 gtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36088133 gtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 36088167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 36087331 - 36087647
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36087331 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 36087430  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36087431 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 36087530  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36087531 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtatacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 36087630  T
Q  308 caacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||    
T  36087631 caacatcgatatcatcg 36087647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26951879 - 26951562
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26951879 cattgacctgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 26951780  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26951779 aaacataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 26951680  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951679 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 26951580  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26951579 gcaatatcgatatcatcg 26951562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35716680 - 35716363
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35716680 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcatgaatcaa 35716581  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35716580 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 35716481  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35716480 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacagattacggaaaacttctctgtaaaccacatttgatg 35716381  T
Q  308 caacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||||||| |||||    
T  35716380 caacatcgatattatcgt 35716363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 49562150 - 49562467
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49562150 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcacttaaaaataagacaccgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcatgaatcaa 49562249  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49562250 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcttgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 49562349  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49562350 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 49562449  T
Q  308 caacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49562450 caacatcgatatcatcgt 49562467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 38655662 - 38655980
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaa-tataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38655662 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaatataataatcactaaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatc 38655761  T
Q  106 aaagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38655762 aaagaaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattg 38655861  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38655862 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 38655961  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38655962 tgcaacatcgatatcatcg 38655980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 854948 - 854630
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  854948 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgtgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaa 854849  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccata--attctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  854848 agcaaaatgttaataccaaagactttgttattgttccatataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaaggggaaattg 854749  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  854748 aagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 854649  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  854648 tgcaacattgatatcatcg 854630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18199075 - 18198758
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18199075 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 18198976  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18198975 aagcaaaatgtcaataccaaagacgttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttacattaaaataacatataattttgaaagggaaattga 18198876  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18198875 agtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 18198776  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  18198775 gcaacatcggtatcatcg 18198758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 36091168 - 36091485
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36091168 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaatgataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgtgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 36091267  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36091268 aagtataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 36091367  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36091368 atttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 36091467  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36091468 gcaacatcgatatcatcg 36091485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31487594 - 31487279
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31487594 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactataaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatgaa 31487495  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31487494 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 31487395  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31487394 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattaccgaaaacttctcaatagaccacatttgatg 31487296  T
Q  308 caacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||| ||||||||    
T  31487295 caacatcggtatcatcg 31487279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4594484 - 4594166
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4594484 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcattgaaaaaataagacaccgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 4594386  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| || ||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||| ||    
T  4594385 aagcaaactgtcaattaccatagattttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagagaaactg 4594286  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4594285 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttga 4594186  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  4594185 tgcaacatcggtatcatcgt 4594166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 13454623 - 13454940
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  13454623 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatga 13454721  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  13454722 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 13454821  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13454822 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacacttga 13454921  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13454922 tgcaacatcggtatcatcg 13454940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16651792 - 16651476
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  16651792 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 16651694  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  16651693 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccacaattctagtacgtagtacctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 16651594  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16651593 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttga 16651494  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatc 323  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16651493 tgcaacatcggtatcatc 16651476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 36946896 - 36947215
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  36946896 cattgacccgtgctaacgcacaagtcattttcaaaagttaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 36946995  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  36946996 aagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 36947095  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36947096 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaaattctctgtagaccacatttga 36947195  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  36947196 tgcaacatcggtatcatcgt 36947215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12261200 - 12260882
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  12261200 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 12261102  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  12261101 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 12261002  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcc-tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12261001 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttg 12260902  T
Q  305 atgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12260901 atgcaacatcggtatcatcg 12260882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12825572 - 12825255
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  12825572 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatacttaccgaaaaaataagacactgtagttcacttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 12825474  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  12825473 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgtttttgttccataattttagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 12825374  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||    
T  12825373 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattatggaaaatttatctgtagatcacacttga 12825274  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  12825273 tgcaacatcggtatcatcg 12825255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 4593007 - 4592770
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  4593007 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaaaacatccaccctattgacgacaacaac 4592908  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4592907 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgctgaaaccttttcatcga 4592808  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4592807 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 4592770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 26946743 - 26946506
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26946743 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 26946644  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26946643 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 26946544  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26946543 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 26946506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18198672 - 18198473
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  18198672 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaaagatatcggaaactaccttcgttt 18198573  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18198572 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttttcaccgatattagaatcagatattacccgtccttcgagc 18198473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 31487193 - 31486994
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31487193 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 31487094  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  31487093 aaatttgaaaggaattatattatcagatggtgttagcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagc 31486994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Original strand, 38656066 - 38656265
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38656066 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactaaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcggaaactgccttcgttt 38656165  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38656166 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaatgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 38656265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Original strand, 52418585 - 52418852
Alignment:
Q  58 aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagta 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  ||| | ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52418585 aaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtaaatcaaagcataatatcaattaacataaactttgttattgttccataattctagta 52418684  T
Q  157 cgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtaca 256  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52418685 cgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtaca 52418784  T
Q  257 caaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52418785 caaaaaagtcctatacattacagaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcg 52418852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Original strand, 52418937 - 52419136
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52418937 taggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 52419036  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52419037 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaacgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 52419136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 326 - 519
Target Start/End: Original strand, 36947300 - 36947493
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttta 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36947300 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacacatatcggaaactgccttcgttta 36947399  T
Q  426 aatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtcctt 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36947400 aatttgaaaggaattctattatcagatggtgttaaagataacctcggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacacgtcctt 36947493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11826848 - 11826531
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||    
T  11826848 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgattgaatgtaaaaattatcgtgaaacaa 11826749  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    | |  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||| |||    
T  11826748 aacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaaggaaaactga 11826649  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11826648 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 11826549  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  11826548 gcaacatcggtataatcg 11826531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 522 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 16650315 - 16650113
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16650315 agctgaaatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctacctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 16650216  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16650215 aacattaaacagctggttaaattagataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgtagaaaccttttcatcaa 16650116  T
Q  722 cca 724  Q
    |||    
T  16650115 cca 16650113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 522 - 724
Target Start/End: Original strand, 13456100 - 13456303
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13456100 agctgaaatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctacctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 13456199  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaa-aacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcg 720  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13456200 aacattaaacagctggttaaattagataactaaaacaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatca 13456299  T
Q  721 acca 724  Q
    ||||    
T  13456300 acca 13456303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 33003628 - 33003942
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33003628 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 33003727  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||   ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  33003728 agtataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattcta---cgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 33003824  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33003825 agttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagaccatatttgat 33003924  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  33003925 gcaacatcggtataatcg 33003942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 860208 - 859881
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||   ||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  860208 cattgacccgtgctaacgtacgggtcattttaagaagtaaatattcatcgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 860109  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    || |  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  860108 aaacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaattg 860009  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaactt---------ctctgtagac 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||         || |||||||    
T  860008 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctatgtagactatgtagac 859909  T
Q  297 cacatttgatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  859908 cacatttgatgcaacatcggtatcatcg 859881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 211
Target Start/End: Original strand, 29864566 - 29864770
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  29864566 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 29864664  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  29864665 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 29864764  T
Q  206 aagttc 211  Q
    ||||||    
T  29864765 aagttc 29864770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26948023 - 26947903
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26948023 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 26947924  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  26947923 gatgcaacatcggtatcatcg 26947903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 326 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18256201 - 18256015
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttta 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  18256201 aggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttcgttta 18256102  T
Q  426 aatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    || ||||| ||||||||| ||||| | ||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18256101 aacttgaacggaattctagtatcagacggctgtagcgataatcttggaataaacaccttttcacctatattagatccagatattacc 18256015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26948189 - 26948029
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  26948189 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 26948090  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26948089 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 26948029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47726994 - 47726776
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47726994 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaataagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 47726895  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  47726894 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgc-gtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 47726796  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaata 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47726795 agttcgttgacatgcaaata 47726776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18201327 - 18201241
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaa 412  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18201327 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagataacagaaa 18201241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26951100 - 26951026
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26951100 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 26951026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Original strand, 36091572 - 36091646
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36091572 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 36091646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 522 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18207229 - 18207143
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctat 608  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  18207229 agctcatatgtagccccttcctcaaccattgacctgaatcttgccaccaaatcctttctaactgtggcgtggatacgtccaccctat 18207143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 43508621 - 43508767
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  43508621 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 43508720  T
Q  108 agcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattcta 153  Q
    | |  ||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43508721 aacataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattcta 43508767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26951475 - 26951401
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26951475 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctaactcttgttaatagtcactgcaaatgagac 26951401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Original strand, 36091963 - 36092021
Alignment:
Q  342 acaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36091963 acaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 36092021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18256364 - 18256305
Alignment:
Q  248 aacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18256364 aacactacaaaacaaagtgctacacattatggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 18256305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36006303 - 36006257
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36006303 aaagtgctatacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 36006257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 545 - 622
Target Start/End: Original strand, 16472675 - 16472752
Alignment:
Q  545 aaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaaca 622  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  16472675 aaccattgacctgaactttgccaccaattcttttctaaccgtggtgtggatacgtccaccctatagatgacaacaaca 16472752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 457
Target Start/End: Original strand, 24759078 - 24759167
Alignment:
Q  368 ctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcatatggtgt 457  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  24759078 ctgacttttgtttatagtcattgcaaaacacaaagatataagaaactgcctacgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 24759167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24826936 - 24826847
Alignment:
Q  368 ctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcatatggtgt 457  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  24826936 ctgacttttgtttatagtcattgcaaaacacaaagatataagaaactgcctacgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 24826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15081835 - 15081768
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtag 75  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  15081835 cattgacccgtgctaacgtacgtgtcatttaaaaaat-taatactcacagaaaaaataagacactgtag 15081768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Original strand, 53521059 - 53521105
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53521059 aaagtgctacacattaccaaaaacttctctgtagaccacatttgatg 53521105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 759
Target Start/End: Original strand, 45503676 - 45504110
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  45503676 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagattacggaaactgccttcgttt 45503775  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45503776 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 45503875  T
Q  525 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaacaac 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45503876 tgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaattttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtcccccctattgacgaaaacaacaac 45503975  T
Q  625 attaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcgacca 724  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  45503976 attaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatacataaatcttttcatcgacca 45504075  T
Q  725 gtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45504076 gtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 45504110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 2044989 - 2045306
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2044989 cattgacccgtgctaacgcacatgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 2045088  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2045089 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 2045188  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045189 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 2045288  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2045289 gcaacatcgatatcatcg 2045306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48651375 - 48651061
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  48651375 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactataaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatgaa 48651276  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48651275 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 48651176  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48651175 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacaca-aaaagtcctacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatg 48651077  T
Q  308 caacatcgatatcatc 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  48651076 caacatcggtatcatc 48651061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 323
Target Start/End: Original strand, 13926049 - 13926358
Alignment:
Q  15 ccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaa 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13926049 ccgtgctaacacacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaattaaagcaaa 13926148  T
Q  114 atgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgt 213  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13926149 atgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctattacgtagttcctgttacttttaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgt 13926248  T
Q  214 tgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13926249 tgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacat 13926348  T
Q  314 cgatatcatc 323  Q
    || |||||||    
T  13926349 cggtatcatc 13926358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50709234 - 50708917
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  50709234 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcattgaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaaaatttgtgaatca 50709135  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50709134 aagcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 50709035  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50709034 agttcgttgacatgcaaatagtttcaaaaagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacagaaaacttctctgtagaccacatttgat 50708935  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  50708934 gcaacatcggtatcatcg 50708917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Original strand, 45503311 - 45503590
Alignment:
Q  45 ataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttcc 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  45503311 ataatattcactggaaaataagacactgtatttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaaagcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttct 45503410  T
Q  145 ataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45503411 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 45503510  T
Q  245 atgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45503511 atgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctccgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcg 45503590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 2047240 - 2047557
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2047240 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataaaacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 2047338  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  2047339 aagcaaaatgttaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 2047438  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2047439 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttga 2047538  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  2047539 tgcaacattggtatcatcg 2047557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 36866651 - 36866968
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  36866651 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataaaacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 36866749  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  36866750 aagcaaaatgttaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 36866849  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36866850 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttga 36866949  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  36866950 tgcaacattggtatcatcg 36866968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 322
Target Start/End: Original strand, 49787099 - 49787412
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  49787099 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataagacactgtagtttgcttgaatataaaaattgtcgtgaatca 49787197  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| ||||||||| ||    
T  49787198 aagcaaaatgccaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacata--attttaaaagggaaactg 49787295  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49787296 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaatatgtaagaaaatgaagagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttga 49787395  T
Q  306 tgcaacatcgatatcat 322  Q
    |||||||||| ||||||    
T  49787396 tgcaacatcggtatcat 49787412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 522 - 750
Target Start/End: Original strand, 2048717 - 2048945
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2048717 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 2048816  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2048817 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 2048916  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgcta 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2048917 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgcta 2048945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 522 - 750
Target Start/End: Original strand, 36868129 - 36868357
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36868129 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 36868228  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36868229 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 36868328  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgcta 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36868329 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgcta 36868357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 49788572 - 49788809
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49788572 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 49788671  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49788672 atcattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 49788771  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  49788772 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 49788809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 38210733 - 38211051
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  38210733 cattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 38210832  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    || |  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  38210833 aaacataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 38210932  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38210933 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttga 38211032  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  38211033 tgcaacatcggtatcatcg 38211051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29245802 - 29245496
Alignment:
Q  20 ctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgtt 118  Q
    |||||||| | ||||||| || ||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  29245802 ctaacgcatgggtcattttaagaagttaatattcactggaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatataaaaattatcgtgaatcaaaacataatgtt 29245703  T
Q  119 aat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgac 217  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29245702 aattaccatagactttgttattgttccataattctagtatttagttcctgttattttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgac 29245603  T
Q  218 atgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgat 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29245602 atgcaaatagttttaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacatttgatgcaacatcggt 29245503  T
Q  318 atcatcg 324  Q
    |||||||    
T  29245502 atcatcg 29245496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 7479394 - 7479157
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7479394 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 7479295  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7479294 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 7479195  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7479194 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 7479157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Original strand, 45501032 - 45501345
Alignment:
Q  13 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||     
T  45501032 acccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgtttgaatgtaaaaattgtcatgaatcaaagca 45501131  T
Q  112 aaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagtt 210  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  45501132 taatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgcagttcctgttacattaacataacatataattttaaaaggaaaactgaagtt 45501231  T
Q  211 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45501232 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 45501331  T
Q  311 catcgatatcatcg 324  Q
    ||||| ||||||||    
T  45501332 catcggtatcatcg 45501345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 50708831 - 50708632
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50708831 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactaccttcgttt 50708732  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50708731 aaatttgaaatgaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 50708632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 29245410 - 29245211
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  29245410 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgaggcagatatcggaaactgtcttcgttt 29245311  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29245310 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgttcttcgagc 29245211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 48650974 - 48650775
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48650974 taggagacagtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 48650875  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  48650874 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttgtaataaacactttctcaccgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagc 48650775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Original strand, 13926444 - 13926640
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13926444 taggagacggtagatagacacca---tgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatgtcggaaactgccttcgttt 13926540  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13926541 aaatttgaaaggaattctattatcacatgatgttagtgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 13926640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48961084 - 48960767
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  48961084 cattgacccctgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 48960985  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | | |||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  48960984 agcataatgtcaattacgataaactttgttattgttccataattctaagacgc-gtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 48960886  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48960885 agttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 48960786  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  48960785 gcaacatcggtataatcgt 48960767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Original strand, 39513046 - 39513313
Alignment:
Q  58 aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagta 156  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |  | ||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39513046 aaaaataaaacaatatagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtaaatcaaaacatactgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaaga 39513145  T
Q  157 cgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtaca 256  Q
    |  |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39513146 cccagttcctgttactttaacataacatataattttaaaaggaaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaacagtaca 39513245  T
Q  257 caaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39513246 caaaaaagtcctacacattacggaaaacttatctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcg 39513313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15691831 - 15691525
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  15691831 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgttaaaattttcgtgaatcaa 15691732  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  15691731 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 15691632  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15691631 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgat 15691532  T
Q  307 gcaacat 313  Q
    |||||||    
T  15691531 gcaacat 15691525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26211892 - 26211706
Alignment:
Q  127 agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26211892 agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatatcatttt-aaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaata 26211794  T
Q  227 gtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26211793 gtttcaataagtaagaaaatgaatggtacacaaaaaagtcctatacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatc 26211706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 325 - 446
Target Start/End: Original strand, 38211137 - 38211258
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38211137 taggagacagtaggtagacaccaacatgttctagcgattgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 38211236  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctatta 446  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38211237 aaatttgaaaggaattctatta 38211258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 325 - 446
Target Start/End: Original strand, 39513399 - 39513520
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39513399 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgttt 39513498  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctatta 446  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  39513499 aactttgaaaggaattatatta 39513520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42496758 - 42496638
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42496758 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 42496659  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42496658 gatgcaacatcgatatcatcg 42496638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7480674 - 7480554
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7480674 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 7480575  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  7480574 gatgcaacatcggtatcatcg 7480554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9534050 - 9533930
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9534050 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 9533951  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  9533950 gatgcaacatcggtatcatcg 9533930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42496924 - 42496764
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  42496924 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 42496825  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42496824 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 42496764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7480840 - 7480680
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  7480840 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagtttgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 7480741  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480740 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 7480680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9534216 - 9534056
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  9534216 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagtttgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 9534117  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9534116 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 9534056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 37891682 - 37891865
Alignment:
Q  329 agacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgtttaaat 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||     
T  37891682 agacggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgtcttcgtttaaac 37891781  T
Q  429 ttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37891782 ttgaacggaattctagtatcagacggctgtagcgataatcttggaataaacaccttttcacctatattagatccagatattacc 37891865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 326 - 466
Target Start/End: Original strand, 23086339 - 23086479
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttta 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |  || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23086339 aggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagattgaccccaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttcgttta 23086438  T
Q  426 aatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataa 466  Q
    || ||||| || |||||| ||||| | |||  |||||||||    
T  23086439 aacttgaacgggattctagtatcagacggttgtagcgataa 23086479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36461772 - 36461625
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  36461772 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 36461673  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattcta 153  Q
    ||||  ||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36461672 aagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattcta 36461625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 420
Target Start/End: Original strand, 35594010 - 35594104
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttc 420  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  35594010 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgactctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgccttc 35594104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Original strand, 2045393 - 2045467
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2045393 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 2045467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 522 - 608
Target Start/End: Original strand, 37901539 - 37901625
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctat 608  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  37901539 agctcatatgtagccccttcctcaaccattgacctgaatcttgccaccaaatcctttctaactgtggcgtggatacgtccaccctat 37901625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21056912 - 21056874
Alignment:
Q  268 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21056912 tacacattacggaaaacttctctgtagagcacatttgat 21056874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 512
Target Start/End: Original strand, 23089555 - 23089605
Alignment:
Q  462 gataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23089555 gataaccttggaataaacacattttcacctatattagatccagatattacc 23089605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 307
Target Start/End: Original strand, 37891535 - 37891575
Alignment:
Q  267 ctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37891535 ctacacattgcggaaaacttctttgtagaccacatttgatg 37891575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8256871 - 8256825
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8256871 aaagtgctacatattacggaaaacttctctttagaccatatttgatg 8256825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 5429313 - 5429244
Alignment:
Q  333 ggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacag 402  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  5429313 ggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgatacag 5429244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2281301 - 2280983
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2281301 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacattgtagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 2281202  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2281201 aagcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattga 2281102  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281101 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 2281002  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  2281001 gcaacatcggtatcatcgt 2280983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 33046998 - 33047235
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33046998 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 33047097  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33047098 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 33047197  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33047198 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 33047235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 2280901 - 2280702
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2280901 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaaccgccttcgttt 2280802  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2280801 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataatcttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagc 2280702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 29369253 - 29369570
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   |||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29369253 cattaacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcacgtcaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 29369352  T
Q  108 agcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    | |  ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  29369353 aacataatgtcaattatgatagactttgttattgttccataattctaagacgcaatttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 29369452  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29369453 agttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 29369552  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  29369553 gcaacatcggtataatcg 29369570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29925125 - 29924870
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  29925125 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 29925027  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  29925026 aagcaaaatgtcaattaccataggctttgttattgttccataattctagtacgtagttcttgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 29924927  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaa 262  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29924926 aaattcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaa 29924870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 522 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 349226 - 348993
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgt-------gaatacgtccaccctattgacga 614  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  349226 agctgatatgtacccccttcttcacccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtcaggcgtgaatacgtccaccctattgacga 349127  T
Q  615 aaacaacaacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttc 714  Q
     ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  349126 caacaacatcagtaaacaactggttaaattacataactaaaaatcaacgatgacattagtttaattttaaagccaagagtgcaaacatgtagaaaccttt 349027  T
Q  715 tcatcgaccagtaacatgttcatgaaaatgatgc 748  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  349026 tcatcgaccaataacatgttcatgaaaatgatgc 348993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Original strand, 33004550 - 33004820
Alignment:
Q  47 aatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttcc 144  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  | | ||||||||||||||||||    
T  33004550 aatattcactgtaaaaataaaacaatgtagtgcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttcc 33004649  T
Q  145 ataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 244  Q
    |||||||||  ||| ||||  |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33004650 ataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 33004749  T
Q  245 atgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcg 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33004750 atgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcg 33004820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 325
Target Start/End: Original strand, 29371859 - 29372126
Alignment:
Q  58 aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagta 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29371859 aaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaaga 29371958  T
Q  157 cgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtaca 256  Q
    ||  ||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29371959 cgc-gtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaatgaatagtaca 29372057  T
Q  257 caaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29372058 caaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgt 29372126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24459017 - 24458711
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  24459017 cattgacccatgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcatgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgttaaaattttcgtgaatcaa 24458918  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaa-agactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    |||  ||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  24458917 agcataatgtcaattacgatagactttgttattgttccataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactga 24458818  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24458817 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgat 24458718  T
Q  307 gcaacat 313  Q
    |||||||    
T  24458717 gcaacat 24458711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 349511 - 349252
Alignment:
Q  15 ccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaa 113  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||| | |||||||| | | |||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||| |  |    
T  349511 ccgtgctaacgcacatatcattttaaaaagttaatattcaccgtaaaaataaaataatgtagttcgattgaatgtaaaaatt---gtgaatcaaaacata 349415  T
Q  114 atgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcg 212  Q
    |||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  349414 atgtcaattaccatatactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaatataacatataattttaaaagggaaactgaagttcg 349315  T
Q  213 ttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  349314 ttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 349252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Original strand, 33045718 - 33045838
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33045718 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 33045817  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  33045818 gatgcaacatcggtatcatcg 33045838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 33045552 - 33045712
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  33045552 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 33045651  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33045652 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 33045712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 326 - 512
Target Start/End: Original strand, 25971184 - 25971370
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttta 425  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25971184 aggagatggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacagaaactgccttcgttta 25971283  T
Q  426 aatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    || ||||| ||||||||| ||||| |  |   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25971284 aacttgaacggaattctagtatcagacagctgtagcgataatcttggaataaacaccttttcacctatattagatccagatattacc 25971370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 333 - 512
Target Start/End: Original strand, 25975631 - 25975810
Alignment:
Q  333 ggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgtttaaatttga 432  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25975631 ggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaactgaaactgtcttcgtttaaacttga 25975730  T
Q  433 aaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    | ||||||||| ||||| |  |   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25975731 acggaattctagtatcagacagctgtagcgataatcttggaataaacaccttttcacctatattagatccagatattacc 25975810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 527 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 25001675 - 25001580
Alignment:
Q  527 atatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaaca 622  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  25001675 atatgtaccccctttctcaaccattgacctgaactttgccaccaattcttttctaaccgtggcgtggatacgtccaccctatagatgacaacaaca 25001580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 3591179 - 3591100
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagata 405  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3591179 aggagatggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagata 3591100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 307
Target Start/End: Original strand, 25971021 - 25971080
Alignment:
Q  248 aacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25971021 aacactacaaaacaaagtgctacacattacggaaaacttctctctagaccacatttgatg 25971080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 307
Target Start/End: Original strand, 25975461 - 25975520
Alignment:
Q  248 aacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25975461 aacactacaaaacaaagtgctacacattacggaaaacttctctctagaccacatttgatg 25975520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 545 - 622
Target Start/End: Original strand, 25002541 - 25002618
Alignment:
Q  545 aaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaaca 622  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  25002541 aaccattgacctgaactttgccaccaattcttttctaaccgtggtgtggatacgtccaccctatagatgacaacaaca 25002618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 17905868 - 17905937
Alignment:
Q  333 ggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacag 402  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  17905868 ggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgatacag 17905937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 5)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 48835 - 49152
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48835 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagacactgtagtttgcgtgaatctaaaaattgtcgtgaatca 48934  T
Q  107 aagcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattga 206  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48935 aagcataatgtcaatatcaaagactttgttattgtttcataattctagtaggtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaatgggaaattga 49034  T
Q  207 agttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49035 agttcgttgacatggaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaattcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 49134  T
Q  307 gcaacatcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49135 gcaacatcgatatcatcg 49152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 51659 - 51974
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  51659 cattgacccgtgctaatgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactaaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaagttgtcgtgaatcaa 51758  T
Q  108 agcgaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaa 207  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51759 agcaaaatgtcaataccaaagactttgttattgttccataattctagtaagtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaa 51858  T
Q  208 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51859 gttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaacgaatagtacac-aaaaagtcctacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatg 51957  T
Q  308 caacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||    
T  51958 caacatcgatatcatcg 51974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 325 - 524
Target Start/End: Original strand, 52060 - 52259
Alignment:
Q  325 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52060 taggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagaaatcggaaactgccttcgttt 52159  T
Q  425 aaatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 524  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  52160 aaatttgaaaggaattttattatcagatggtgttagtgataaccttggaataaacaccttctcactgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagc 52259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Original strand, 40382 - 40502
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40382 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 40481  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40482 gatgcaacatcgatatcatcg 40502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 40216 - 40376
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaa-ataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  40216 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 40315  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40316 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 40376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45922 - 45618
Alignment:
Q  21 taacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  45922 taacgcacatgtcatttaaaaatgataatattcactgaaaaaataagacactttagttcacgtgaatctaaaaattgtcgtgaatcaaagcataatgtca 45823  T
Q  120 atatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45822 atatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacat 45723  T
Q  220 gcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45722 gcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatat 45623  T
Q  320 catcg 324  Q
    |||||    
T  45622 catcg 45618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32675251 - 32674939
Alignment:
Q  13 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcg-tgaatcaaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  32675251 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaagataatattcactgaaaaaataagactctatagttcgcgtgaatctaaaaattgtcgatgaatcaaaac 32675152  T
Q  111 gaaatgttaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagtt 210  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32675151 ataatgtcaatatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagtt 32675052  T
Q  211 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32675051 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacaca-aaaagtcctacacattatggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaa 32674953  T
Q  311 catcgatatcatcg 324  Q
    ||||||||||||||    
T  32674952 catcgatatcatcg 32674939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 20104835 - 20105151
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20104835 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcacagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 20104933  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  20104934 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 20105033  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20105034 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacac-aaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttga 20105132  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20105133 tgcaacatcggtatcatcg 20105151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Original strand, 30090094 - 30090410
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  30090094 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 30090192  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  30090193 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagtacctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 30090292  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30090293 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttga 30090392  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatc 323  Q
    |||||||||| |||||||    
T  30090393 tgcaacatcggtatcatc 30090410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 3607679 - 3607996
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  3607679 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcatagaaaaaataagacactgtaggtcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatga 3607777  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  3607778 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 3607877  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3607878 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacacttga 3607977  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  3607978 tgcaacatcggtatcatcg 3607996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 12654101 - 12653864
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12654101 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 12654002  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12654001 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 12653902  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12653901 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 12653864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 23182886 - 23182649
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23182886 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 23182787  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23182786 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 23182687  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23182686 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 23182649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 23187153 - 23186916
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23187153 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 23187054  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23187053 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 23186954  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23186953 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 23186916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 34760147 - 34759910
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34760147 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 34760048  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34760047 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 34759948  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34759947 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 34759910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 39876981 - 39876744
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39876981 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctgttgacgacaacaac 39876882  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39876881 aacattaaacagctggttaaattacataactacaaaacaaaaatgacattactttaattttaaagttaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 39876782  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39876781 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 39876744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 522 - 724
Target Start/End: Original strand, 20106311 - 20106513
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20106311 agctgatatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatatgtccaccctattgacgacaacaac 20106410  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20106411 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcaa 20106510  T
Q  722 cca 724  Q
    |||    
T  20106511 cca 20106513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 522 - 724
Target Start/End: Original strand, 30091571 - 30091773
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30091571 agctgaaatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctacctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 30091670  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  30091671 aacattaaacagctggttaaattagataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgtagaaaccttttcatcaa 30091770  T
Q  722 cca 724  Q
    |||    
T  30091771 cca 30091773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 522 - 724
Target Start/End: Original strand, 3609156 - 3609359
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3609156 agctgaaatgtacccccttcttgaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctacctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 3609255  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaa-aacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcg 720  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3609256 aacattaaacagctggttaaattagataactaaaacaacaacaatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatca 3609355  T
Q  721 acca 724  Q
    ||||    
T  3609356 acca 3609359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12655546 - 12655387
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12655546 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatcaa 12655447  T
Q  108 agcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    ||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655446 agcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 12655387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12655381 - 12655261
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12655381 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 12655282  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  12655281 gatgcaacatcggtatcatcg 12655261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23184166 - 23184046
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23184166 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 23184067  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  23184066 gatgcaacatcggtatcatcg 23184046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23188433 - 23188313
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23188433 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 23188334  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  23188333 gatgcaacatcggtatcatcg 23188313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34761427 - 34761307
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34761427 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 34761328  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  34761327 gatgcaacatcggtatcatcg 34761307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39878261 - 39878141
Alignment:
Q  204 tgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacattt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39878261 tgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaatgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacactt 39878162  T
Q  304 gatgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  39878161 gatgcaacatcggtatcatcg 39878141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 326 - 512
Target Start/End: Original strand, 16678908 - 16679094
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgttta 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16678908 aggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacgaaaactgccttcgttta 16679007  T
Q  426 aatttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    || ||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||    
T  16679008 aacttgaaaggaattctagtatcagacggttgtagcgataaccttagaataaacaccttttcacttattttagatccagatattacc 16679094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23184332 - 23184172
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  23184332 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 23184233  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184232 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 23184172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23188599 - 23188439
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  23188599 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 23188500  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188499 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 23188439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34761593 - 34761433
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  34761593 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 34761494  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34761493 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 34761433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39878427 - 39878267
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  39878427 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaaattaatactcactgaaaaaataagacactgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 39878328  T
Q  107 aagcgaaatgttaa-tatcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 166  Q
    |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39878327 aagcaaaatgacaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcct 39878267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 328 - 512
Target Start/End: Original strand, 38095657 - 38095841
Alignment:
Q  328 gagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacagatatcagaaactgccttcgtttaaa 427  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  38095657 gagacggtagatagacaccaatatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactaccttcgtttaaa 38095756  T
Q  428 tttgaaaggaattctattatcatatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
     ||||| ||||||||| ||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38095757 cttgaacggaattctagtatcagacggttgtagcaataatcttggaataaacaccttttcacctatattagatccagatattacc 38095841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32674852 - 32674778
Alignment:
Q  326 aggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagac 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32674852 aggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 32674778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Original strand, 38095505 - 38095551
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38095505 aaagtgctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 38095551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37609790 - 37609741
Alignment:
Q  258 aaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609790 aaaaaagtgttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 37609741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Original strand, 16678759 - 16678805
Alignment:
Q  261 aaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16678759 aaagtgctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacatttgatg 16678805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Original strand, 38936314 - 38936353
Alignment:
Q  268 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38936314 tacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatg 38936353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0642
Description:

Target: scaffold0642; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3757 - 3440
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  3757 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 3659  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  3658 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttctataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 3559  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3558 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttga 3459  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  3458 tgcaacatcggtatcatcg 3440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2045
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2281 agctgatatgtacctccttcttgaaccatg-agctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 2183  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2182 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtctaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 2083  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2082 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13669 - 13352
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13669 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 13571  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  13570 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttctataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 13471  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13470 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttga 13371  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13370 tgcaacatcggtatcatcg 13352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 12193 - 11956
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12193 agctgatatgtacctccttcttgaaccatg-agctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 12095  T
Q  622 aacattaaacaa-ctggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcg 720  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12094 aacattaaacaagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtctaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcg 11995  T
Q  721 accagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11994 accagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 11956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 25312 - 25629
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactgaaaaa-taagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  25312 cattgacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaat-taatactcactgaaaaaataaaacattgtagttcgcttgaatgtaaaaattgtcgtgaatca 25410  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  25411 aagcaaaatgtcaattaccatagactttgttattgttctataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactg 25510  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25511 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttga 25610  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  25611 tgcaacatcggtatcatcg 25629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 26788 - 27024
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26788 agctgatatgtacctccttcttgaaccatg-agctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaac 26886  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26887 aacattaaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtctaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttttcatcga 26986  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26987 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 27024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 28092 - 28328
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28092 agctgatatgtacccccttctttacccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacatccaccctattgacgaaa-caac 28190  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28191 agcagtaaacaactggttaaattacataactaaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagataagagtgcaaacatgtagaaaccttttcatcga 28290  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28291 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 28328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 522 - 759
Target Start/End: Original strand, 34493 - 34730
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgaaaacaac 621  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34493 agctgatatgtacccccctcttcacccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagctgtggcgtgaatacgtccaccctattgacgacaacaaa 34592  T
Q  622 aacattaaacaactggttaagttacataactgaaaaacaacgatgacattagtttaattttaaagctaagagtgcaaacatgcagaaaccttctcatcga 721  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34593 aacaataaacagctggttaaattacataactaaaaaacaacaatgacattagtttaattttaaagttaagagtgcaaacatgtagaaaccttttcatcga 34692  T
Q  722 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctactggagacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34693 ccagtaacatgttcatgaaaatgatgctagtggggacc 34730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 34203 - 34467
Alignment:
Q  13 acccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactga-aaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||     
T  34203 acccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagttaatattcactggcaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgttgtgaatcaaagca 34302  T
Q  112 aaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagtt 210  Q
     ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  34303 taatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatttaattttaaaagggaaactgaagtt 34402  T
Q  211 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34403 cgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaatagtacacaaaaaactcctacacatt 34467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Original strand, 27835 - 28066
Alignment:
Q  46 taatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatcaaagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttc 143  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||| ||| | || |||| ||||||||||||    
T  27835 taatattcactggaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaaattgttgtgaatcaaagcataatgtcaattaccatagacattgttattgttc 27934  T
Q  144 cataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27935 cataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcatatagtttcaataagtaagaa 28034  T
Q  244 aatgaacagtacacaaaaaagtcctacacatt 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28035 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 28066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2329 - 2012
Alignment:
Q  8 cattcacccgtgctaacgcacgtgtcatttaaaaaatataatattcactg-aaaaataagacactgtagttcgcgtgaatctaaaaattatcgtgaatca 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  2329 cattgacccgtgctaacgcacgggtcattttaagaagtaaatattcactgtaaaaataaaacaatgtagttcgcttgaatgtaaaa-ttgtcgtgaatca 2231  T
Q  107 aagcgaaatgttaat-atcaaagactttgttattgttccataattctagtacgtagttcctgttaccttaaaatgacatataattttgaaagggaaattg 205  Q
    ||||  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||| ||    
T  2230 aagcataatgtcaattaccatagactttgttattgttccataattctaagacgccgttcctgttactttaacataacatataattctaaaagggaaactg 2131  T
Q  206 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaatgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2130 aagttcgttgacatgcaaatagtttcaacaagtaagaaaatgaatagtatacaaaaaagtgctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttga 2031  T
Q  306 tgcaacatcgatatcatcg 324  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  2030 tgcaacatcggtatcatcg 2012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 522 - 608
Target Start/End: Original strand, 49 - 135
Alignment:
Q  522 agctgatatgtacccccttcttcaaccatggacctgaactttgccaccaaatcttttctagttgtggcgtgaatacgtccaccctat 608  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  49 agctcatatgtagccccttcctcaaccattgacctgaatcttgccaccaaatcctttctaactgtggagtggatacgtccaccctat 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1910 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1910
Description:

Target: scaffold1910; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 466 - 512
Target Start/End: Original strand, 930 - 976
Alignment:
Q  466 accttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacc 512  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  930 accttggaataaacaccttttcacctatattagatccaaatattacc 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 104675 - 104606
Alignment:
Q  333 ggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgactcttgctaatagtcattgcaaatgagacag 402  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  104675 ggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgatacag 104606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University