View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4915-Insertion-10 (Length: 390)

Name: NF4915-Insertion-10
Description: NF4915
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4915-Insertion-10
NF4915-Insertion-10
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (8-390)||(26207045-26207427)
chr7 (11-390)||(26226583-26226962)
chr7 (35-389)||(26259536-26259890)
chr7 (41-307)||(19103785-19104051)
chr7 (41-305)||(26203537-26203801)
chr7 (68-155)||(26297115-26297202)
chr7 (41-387)||(26154846-26155192)
chr7 (63-307)||(26301476-26301720)
chr7 (66-277)||(26128235-26128446)
chr7 (65-277)||(26190932-26191144)
chr7 (31-155)||(26223165-26223289)
chr7 (68-155)||(26250515-26250602)
chr7 (73-137)||(26242072-26242136)
chr7 (63-277)||(26178748-26178962)
chr7 (63-155)||(26082395-26082487)
chr7 (63-155)||(26106182-26106274)
chr7 (63-134)||(26184937-26185008)
chr7 (221-277)||(26240110-26240166)
chr7 (239-307)||(26297286-26297354)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (48-146)||(44902891-44902989)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 390
Target Start/End: Original strand, 26207045 - 26207427
Alignment:
Q  8 tcttaaacatggaaacccaaacccaacaactcaatgttacttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26207045 tcttaaacatggaaactcaaacccaacaactcaatgttacttttctaccatatccaactcctggccatatgaaccctatgattgacacagcaagactatt 26207144  T
Q  108 tgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgccttgttattcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatc 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26207145 tgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatcactacacaagcaaatgccttgttattcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatc 26207244  T
Q  208 aaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaatca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26207245 aaaacttgtgtgattcaattccctggagcccaagtaggtctcccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccgtgaaatgcttggtaaaatca 26207344  T
Q  308 tgcttggaattgcgaagatccaagatcaaattgagattttgttccgtgatctccaaccagattgtatagtctcagatatgtta 390  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26207345 tgcttggaattgcgaacatccatgatcaaattgagattttgttccgtgatctccaaccagattgtatagtctcagatatgtta 26207427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 26226583 - 26226962
Alignment:
Q  11 taaacatggaaacccaaacccaacaactcaatgttacttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgc 110  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26226583 taaacatagaaactcaaccccaacaactcaatgttacttttctaccacatgtaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaaggctatttgc 26226682  T
Q  111 aaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgccttgttattcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaa 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26226683 aaagcatggtgttgatgttaccatcatcactacacaagcaaatgccttgttattcaagaaacccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaa 26226782  T
Q  211 acttgtgtgattcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaatcatgc 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26226783 gcttgtgtgattcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccgtgaaatgcttggtaaaatcatgc 26226882  T
Q  311 ttggaattgcgaagatccaagatcaaattgagattttgttccgtgatctccaaccagattgtatagtctcagatatgtta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26226883 ttggaattgcgaagatccaagatcaaattgagattttgttccatgatctccaacaagattgtatagtctcagatatgtta 26226962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 389
Target Start/End: Original strand, 26259536 - 26259890
Alignment:
Q  35 aactcaatgttacttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccat 134  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26259536 aactcaatgttatttttctaccttatctaactcctggccatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtattaatgttaccat 26259635  T
Q  135 catcactacacaagcaaatgccttgttattcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgca 234  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||  || |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  26259636 tatcactacacatgccaatgccttgttattcaagaaagctatcgacaacgacacctgttgcggttattccatcagaacttgtgtcattcaattcccttca 26259735  T
Q  235 gcccaagttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaatcatgcttggaattgcgaagatccaagatc 334  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||   | ||||||| |   | | |||||||    
T  26259736 gcacaagttggtcttccagaaggtgtcgaaaacatcaaagatggaacttccttagaaatgcttggtaaaatcggtcatggaatttcattgcttcaagatc 26259835  T
Q  335 aaattgagattttgttccgtgatctccaaccagattgtatagtctcagatatgtt 389  Q
    ||||||| ||| |||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  26259836 aaattgaaattctgtttcaagatcttcaacctgattgcatagtctctgatatgtt 26259890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19104051 - 19103785
Alignment:
Q  41 atgttacttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcac 140  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  |    
T  19104051 atgtaacttttcttccatatccaactccaggccatatgattcctatgatagacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgttacaatcattgc 19103952  T
Q  141 tacacaagcaaatgccttgttattcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaa 240  Q
    ||| || || ||||| |    |||| | ||| |||| ||||  |||||   ||| ||||| ||||||||||||    | ||||  |||||| |||| |||    
T  19103951 tactcatgccaatgcttccacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaaactcaacttattcccttcccttcagctcaa 19103852  T
Q  241 gttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaatca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19103851 gttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatggaacttcacttgaaatgcttggtaaaatca 19103785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 305
Target Start/End: Original strand, 26203537 - 26203801
Alignment:
Q  41 atgttacttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcac 140  Q
    |||| |||||||| |||  || ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26203537 atgtaacttttcttccatttccaactcctggccatatgattcctatgatagacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgttaccatcatcac 26203636  T
Q  141 tacacaagcaaatgccttgttattcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaa 240  Q
    |||||| || ||||| |     ||| | ||||| || ||||  |||||   ||| ||||| |||||||| |||  | | ||||| |||||| |||| |||    
T  26203637 tacacatgctaatgcttcaaccttccaaaaagcgatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaagactcatcttattcagttcccttcagctcaa 26203736  T
Q  241 gttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaat 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||   ||||| |||||||||||    
T  26203737 gtttgtcttccagatggtgttgaaaatctcaaagatggaacttcctcagaaattcttggtaaaat 26203801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Original strand, 26297115 - 26297202
Alignment:
Q  68 ctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26297115 ctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttgatgtaaccatcatcactacacatgccaatgc 26297202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 387
Target Start/End: Original strand, 26154846 - 26155192
Alignment:
Q  41 atgttacttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcac 140  Q
    |||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26154846 atgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagctagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcac 26154945  T
Q  141 tacacaagcaaatgccttgttattcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaa 240  Q
    ||| || || ||||| |    |||| | ||| |||| ||||  |||||   ||| |||||  | ||||||||   | | ||  | |||||| |||| |||    
T  26154946 tacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttcagctcaa 26155045  T
Q  241 gttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaatcatgcttggaattgcgaagatccaagatcaaattg 340  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||||   |||||| || |||||||||   ||||||||  | | | |||||||||  ||||    
T  26155046 gttggtctccctgatggtgttgaaaacatgaaagatggaacttcatttgaaatactaggtaaaatcggccttggaatatccatgctccaagatccgattg 26155145  T
Q  341 agattttgttccgtgatctccaaccagattgtatagtctcagatatg 387  Q
    ||  |||||| |  || || ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26155146 aggctttgtttcaagaccttcaacctgattgtatagtgacagatatg 26155192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 307
Target Start/End: Original strand, 26301476 - 26301720
Alignment:
Q  63 aactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgccttgtta 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    |    
T  26301476 aactcctggtcatatgaatcctatgatagacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaaca 26301575  T
Q  163 ttcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttg 262  Q
    ||| | ||| | || ||| | |||||   ||| |||||  | || ||||||    | ||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  26301576 ttccaaaaatctatagacgatgacttcaattcaggataccctattaaaactcaacttattcagttcccttcagctcaagttggtctccctgatggtgttg 26301675  T
Q  263 aaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaatca 307  Q
    ||||| |||| ||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26301676 aaaacttcaatgatggaacttcacttgaaatacttggtaaaatca 26301720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 277
Target Start/End: Original strand, 26128235 - 26128446
Alignment:
Q  66 tcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgccttgttattc 165  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    ||||    
T  26128235 tcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgctaatgcctcaacattc 26128334  T
Q  166 aagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttgaaa 265  Q
     | |||||||| ||||  |||     ||  ||||| ||||| ||||||    | ||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  26128335 caaaaagccatagacagtgacaccagtttaggatactccattaaaactcaacttattcagttcccttcagctcaagttggtctccctgatggtgttgaaa 26128434  T
Q  266 acatcaaagatg 277  Q
    |||| |||||||    
T  26128435 acatgaaagatg 26128446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 277
Target Start/End: Original strand, 26190932 - 26191144
Alignment:
Q  65 ctcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgccttgttatt 164  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |    |||    
T  26190932 ctcctggccatatgattcctatgattgacactgcaagactattagccaaacatggtgttaatgtaaccatcattactacacatgccaatgcttcaacatt 26191031  T
Q  165 caagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttgaa 264  Q
    | | ||| |||| ||||  |||||   ||  ||||| ||||||||||||  | | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26191032 ccaaaaaaccatagacagtgacttcagtttaggatactccatcaaaactcatcttattgaattcccttcagctcaagttggtcttccagatggtgttgaa 26191131  T
Q  265 aacatcaaagatg 277  Q
    ||  |||||||||    
T  26191132 aatctcaaagatg 26191144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 26223165 - 26223289
Alignment:
Q  31 caacaactcaatgttacttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtca 130  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  26223165 caacaactgaatgtcacttttcttccatttccaactcctggtcatatgatttcaatgattgacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgtta 26223264  T
Q  131 ccatcatcactacacaagcaaatgc 155  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  26223265 ccatcatcactacacatgccaatgc 26223289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Original strand, 26250515 - 26250602
Alignment:
Q  68 ctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26250515 ctggtcatatgaaccctatgattgacactgcaagactatttgctaaacatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgctaatgc 26250602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Original strand, 26242072 - 26242136
Alignment:
Q  73 catatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26242072 catatgaaccctatgattgacactgcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcat 26242136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 26178748 - 26178962
Alignment:
Q  63 aactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgccttgtta 162  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |    |    
T  26178748 aactcctggtcatatgattcctatgatagacacagcaagactattcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcgctacacatgccaatgcttcaaca 26178847  T
Q  163 ttcaagaaagccatcgacaacgacttgttttctggatattccatcaaaacttgtgtgattcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttg 262  Q
    ||| | ||| | || ||||  |||||   ||| ||||| ||||||||||||  | | || || |||||| |||| || || ||||| || ||||||||||    
T  26178848 ttccaaaaatctatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaaaactcatcttatacagttcccttcagctcaggtaggtctccctgatggtgttg 26178947  T
Q  263 aaaacatcaaagatg 277  Q
    ||||||| |||||||    
T  26178948 aaaacatgaaagatg 26178962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Original strand, 26082395 - 26082487
Alignment:
Q  63 aactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgc 155  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26082395 aactcctggccatatgaatccaatgatagccacagcaagactatttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgc 26082487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Original strand, 26106182 - 26106274
Alignment:
Q  63 aactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacacaagcaaatgc 155  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26106182 aactcctggccatatgaatccaatgatagccacagcaagactatttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgc 26106274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Original strand, 26184937 - 26185008
Alignment:
Q  63 aactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccat 134  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26184937 aactcctggccatatgaatcccatgatagccacatcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccat 26185008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 277
Target Start/End: Original strand, 26240110 - 26240166
Alignment:
Q  221 ttcaattccctgcagcccaagttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatg 277  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  26240110 ttcaattcccttcaacttaagttggtctccctgatggtgttgaaaacatgaaagatg 26240166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 307
Target Start/End: Original strand, 26297286 - 26297354
Alignment:
Q  239 aagttggtcttccagatggtgttgaaaacatcaaagatgccacttcccatgaaatgcttggtaaaatca 307  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  26297286 aagttggtctcccagagggtattgaaaacacgatcgatgccacttcacttgaaatgcttgttaaaatca 26297354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Original strand, 44902891 - 44902989
Alignment:
Q  48 ttttctaccacatctaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccatcatcactacaca 146  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44902891 ttttcttccatatccaactcctggccatatgattcccatggtagacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatcactacaca 44902989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University