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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4933_low_2 (Length: 255)

Name: NF4933_low_2
Description: NF4933
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4933_low_2
NF4933_low_2
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (20-255)||(24420591-24420826)
chr4 (20-255)||(24470801-24471035)
chr4 (20-215)||(24470657-24470852)
chr4 (28-248)||(24421174-24421394)
chr4 (20-251)||(24420835-24421066)
chr4 (25-248)||(24470518-24470741)
chr4 (28-248)||(24470329-24470549)
chr4 (52-242)||(24477461-24477651)
chr4 (20-245)||(24421033-24421258)
chr4 (52-248)||(24421222-24421418)
chr4 (34-248)||(24420886-24421100)
chr4 (43-242)||(24420940-24421139)
chr4 (67-255)||(24421071-24421259)
chr4 (52-248)||(24470305-24470501)
chr4 (67-254)||(24420496-24420683)
chr4 (34-116)||(24476990-24477072)
chr4 (31-248)||(24470476-24470693)
chr4 (47-254)||(24470923-24471130)
chr4 (73-255)||(24470470-24470652)
chr4 (43-236)||(24420466-24420659)
chr4 (20-236)||(24470944-24471160)
chr4 (20-255)||(24420687-24420922)
chr4 (52-167)||(24477392-24477507)
chr4 (58-255)||(24421263-24421460)
chr4 (97-246)||(24421320-24421469)
chr4 (97-246)||(24470254-24470403)
chr4 (67-248)||(24470656-24470837)
chr4 (20-177)||(24477064-24477224)
chr4 (58-255)||(24470263-24470460)
chr4 (206-255)||(24476932-24476981)
chr4 (58-255)||(24477400-24477597)
chr4 (106-215)||(24477632-24477741)
chr4 (20-248)||(24420982-24421210)
chr4 (148-248)||(24421366-24421466)
chr4 (148-248)||(24470257-24470357)
chr4 (20-255)||(24470705-24470939)
chr4 (49-248)||(24477503-24477702)
chr4 (97-242)||(24406499-24406650)
chr4 (20-224)||(24420334-24420538)
chr4 (34-225)||(24477064-24477258)
chr4 (130-213)||(24481477-24481559)
chr4 (157-251)||(24477644-24477738)
chr4 (20-207)||(24471088-24471275)
chr4 (152-242)||(24406397-24406487)
chr4 (127-233)||(24420373-24420479)
chr4 (127-233)||(24471147-24471253)
chr4 (160-245)||(24476894-24476979)
chr4 (58-167)||(24477221-24477330)
chr4 (85-246)||(24477553-24477714)
chr4 (148-209)||(24482191-24482252)
chr4 (192-245)||(24482203-24482256)
[»] scaffold0879 (9 HSPs)
scaffold0879 (79-248)||(4431-4600)
scaffold0879 (20-245)||(4516-4741)
scaffold0879 (67-255)||(4515-4703)
scaffold0879 (20-176)||(4708-4864)
scaffold0879 (43-242)||(4635-4834)
scaffold0879 (25-251)||(4425-4651)
scaffold0879 (34-224)||(4674-4864)
scaffold0879 (20-248)||(4564-4792)
scaffold0879 (169-255)||(4425-4511)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (34-227)||(41900220-41900413)
chr2 (20-227)||(41900412-41900619)
chr2 (151-251)||(41899956-41900056)
chr2 (52-215)||(41900280-41900443)
chr2 (58-248)||(41899863-41900053)
chr2 (25-237)||(41899826-41900038)
chr2 (52-251)||(41900004-41900203)
chr2 (148-242)||(41900541-41900635)
chr2 (97-255)||(41900288-41900446)
chr2 (58-178)||(41900509-41900629)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (100-236)||(11882303-11882439)
chr1 (100-236)||(11891537-11891673)
chr1 (97-236)||(11879442-11879581)
chr1 (49-164)||(52818920-52819035)
chr1 (96-236)||(11882395-11882535)
chr1 (96-236)||(11891629-11891769)
chr1 (160-248)||(11879457-11879545)
chr1 (97-233)||(11902038-11902174)
chr1 (49-248)||(11904905-11905104)
chr1 (31-218)||(11904935-11905122)
chr1 (49-233)||(11882300-11882484)
chr1 (49-233)||(11891534-11891718)
chr1 (52-236)||(11879493-11879677)
chr1 (20-236)||(52818800-52819016)
chr1 (31-226)||(11905079-11905274)
chr1 (70-233)||(52818611-52818774)
chr1 (28-237)||(11905028-11905237)
chr1 (96-233)||(11882491-11882628)
chr1 (96-233)||(11891725-11891862)
chr1 (48-236)||(11905192-11905380)
chr1 (124-212)||(11879661-11879749)
chr1 (52-188)||(11902137-11902273)
chr1 (85-233)||(52821398-52821546)
chr1 (193-248)||(11879442-11879497)
chr1 (61-188)||(11882408-11882535)
chr1 (61-188)||(11891642-11891769)
chr1 (49-224)||(52821311-52821486)
chr1 (73-171)||(11902563-11902661)
chr1 (91-236)||(11902080-11902225)
chr1 (151-200)||(11902380-11902429)
chr1 (96-233)||(11905336-11905473)
chr1 (196-236)||(52819136-52819176)
chr1 (85-137)||(52821593-52821645)
chr1 (97-165)||(52821811-52821879)
[»] scaffold1918 (1 HSPs)
scaffold1918 (20-94)||(425-499)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24420826 - 24420591
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420826 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 24420727  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420726 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 24420627  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24420626 tcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcct 24420591  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 255
Target Start/End: Original strand, 24470801 - 24471035
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470801 catcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccc-accatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 24470899  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470900 tccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 24470999  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24471000 tcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcct 24471035  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 24470657 - 24470852
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24470657 catcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 24470756  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatc 215  Q
     ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||| | || ||||||||||| || |||||    
T  24470757 cccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatc 24470852  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24421394 - 24421174
Alignment:
Q  28 tctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccc 127  Q
    ||||||||||| || ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |    
T  24421394 tctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcac 24421295  T
Q  128 caccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccacc 227  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24421294 caccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcc 24421195  T
Q  228 ccctccatatgtctataagtc 248  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  24421194 tcctccatatgtctacaagtc 24421174  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24421066 - 24420835
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24421066 catcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 24420967  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||| || ||||||    
T  24420966 cccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttcccct 24420867  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataagtcccc 251  Q
    || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  24420866 tcccctcctcctccatatgtttacaagtcccc 24420835  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 24470518 - 24470741
Alignment:
Q  25 ccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccat 124  Q
    ||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||    
T  24470518 ccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccat 24470617  T
Q  125 ccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcacc 224  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  24470618 caccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacc 24470717  T
Q  225 accccctccatatgtctataagtc 248  Q
     || |||||||||||||| |||||    
T  24470718 tcctcctccatatgtctacaagtc 24470741  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 24470329 - 24470549
Alignment:
Q  28 tctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccc 127  Q
    ||||||||||| || ||| | || ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |    
T  24470329 tctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcac 24470428  T
Q  128 caccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccacc 227  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | || ||||| || || || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  24470429 caccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcc 24470528  T
Q  228 ccctccatatgtctataagtc 248  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  24470529 tcctccatatgtctacaagtc 24470549  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24477651 - 24477461
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||| || |||||      
T  24477651 aagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataaga 24477552  T
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 242  Q
     ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24477551 gtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtcta 24477461  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24421258 - 24421033
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  24421258 catcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatc 24421159  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||| || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||     
T  24421158 cccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccc 24421059  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataa 245  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  24421058 tcccctcccccaccatatgtatataa 24421033  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24421418 - 24421222
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||      
T  24421418 aagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataaga 24421319  T
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
     ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24421318 gtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtc 24421222  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24421100 - 24420886
Alignment:
Q  34 cctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccac 133  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || |    
T  24421100 cctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctc 24421001  T
Q  134 ctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || ||    
T  24421000 caccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccacc 24420901  T
Q  234 atatgtctataagtc 248  Q
    |||||| ||||||||    
T  24420900 atatgtatataagtc 24420886  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24421139 - 24420940
Alignment:
Q  43 tatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 142  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||| | |||||||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| |    
T  24421139 tatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatg 24421040  T
Q  143 tttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 242  Q
    | |||||||| || || || |||||||| || || || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24421039 tatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtcta 24420940  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24421259 - 24421071
Alignment:
Q  67 ccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccat 166  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| || || || || || || |||||||    
T  24421259 ccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccat 24421160  T
Q  167 ctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    | || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| ||||||    
T  24421159 ccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcct 24421071  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 24470305 - 24470501
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || ||||| || |||||      
T  24470305 aagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataaga 24470404  T
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
     ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||| | || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24470405 gtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtc 24470501  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24420683 - 24420496
Alignment:
Q  67 ccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccat 166  Q
    |||||||| || || || || |||||| | |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |    
T  24420683 ccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctcctt 24420584  T
Q  167 ctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcc 254  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||| || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  24420583 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctcc 24420496  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 24477072 - 24476990
Alignment:
Q  34 cctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccacc 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24477072 cctccaccatatctatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaagtcaccacctccacc 24476990  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Original strand, 24470476 - 24470693
Alignment:
Q  31 cctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccac 130  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  24470476 cctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctc 24470575  T
Q  131 cacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccc 230  Q
    | || ||||| || |||||   ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||    
T  24470576 ccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctccccc 24470675  T
Q  231 tccatatgtctataagtc 248  Q
     || ||| | ||||||||    
T  24470676 accctatatttataagtc 24470693  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Original strand, 24470923 - 24471130
Alignment:
Q  47 tttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgttta 146  Q
    |||||||||| || || ||  ||||||| || || || || |||||| | |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||    
T  24470923 tttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtcta 24471022  T
Q  147 taaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 246  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| || || || |||||||| |||||||| || || || |||||| |||||    
T  24471023 taagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataag 24471122  T
Q  247 tcccctcc 254  Q
    || |||||    
T  24471123 tcacctcc 24471130  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Original strand, 24470470 - 24470652
Alignment:
Q  73 ccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctcctt 172  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| || || || || || ||||| ||||||||||    
T  24470470 ccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctcctt 24470569  T
Q  173 caccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    |||| || || |||||| |||| |||   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24470570 cacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcct 24470652  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24420659 - 24420466
Alignment:
Q  43 tatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 142  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| |    
T  24420659 tatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatg 24420560  T
Q  143 tttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  24420559 tttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 24470944 - 24471160
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || ||    
T  24470944 catctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttc 24471043  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||| || | |||||||| ||||| || ||  ||    
T  24471044 tccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagct 24471143  T
Q  220 tcaccaccccctccata 236  Q
    |||||||| ||||||||    
T  24471144 tcaccacctcctccata 24471160  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24420922 - 24420687
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  24420922 catcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatc 24420823  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     || || || || || || ||  ||||||| || || || || |||||||| || || || || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||     
T  24420822 accttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctcca 24420723  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||    
T  24420722 tccccaccacctccatacgtttataaatctcctcct 24420687  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24477507 - 24477392
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||| |||||||| |||||||||||||| || || || |    
T  24477507 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 24477408  T
Q  152 ctcctcctccaccatc 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  24477407 ctcctcctccaccatc 24477392  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24421460 - 24421263
Alignment:
Q  58 ccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctc 157  Q
    ||||| || ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || || || || || |    
T  24421460 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24421361  T
Q  158 ctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||| |||| |||   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24421360 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcct 24421263  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421320
Alignment:
Q  97 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctaca 196  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || || || || || |||||||| || || || ||||||||| ||||||    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24421370  T
Q  197 agtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 246  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24421369 agtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24421320  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470403
Alignment:
Q  97 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctaca 196  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || || || || || |||||||| || || || ||||||||| ||||||    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24470353  T
Q  197 agtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 246  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24470354 agtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470403  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 24470656 - 24470837
Alignment:
Q  67 ccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccat 166  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || || || || || ||||||||||    
T  24470656 ccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccat 24470755  T
Q  167 ctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    | || || ||||| || |||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  24470756 ccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtc 24470837  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24477224 - 24477064
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccacc---atatgtttacaagtcaccacctccacc 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| || | || ||||| ||| |||| || ||| |||| ||   |||||| || ||| |||||||||| ||    
T  24477224 catcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccaccgccacctccatcccctacccctcctccatatgtctataaggcaccacctcctcc 24477125  T
Q  117 gtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcacca 177  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  24477124 atctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 255
Target Start/End: Original strand, 24470263 - 24470460
Alignment:
Q  58 ccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctc 157  Q
    ||||| || ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || || || || || |    
T  24470263 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24470362  T
Q  158 ctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    |||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |||   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24470363 ctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcct 24470460  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24476981 - 24476932
Alignment:
Q  206 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24476981 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcct 24476932  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24477597 - 24477400
Alignment:
Q  58 ccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctc 157  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || || || || |    
T  24477597 ccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccac 24477498  T
Q  158 ctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||   || || | ||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24477497 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcct 24477400  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477632
Alignment:
Q  106 ccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccac 205  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  206 caccaccatc 215  Q
    |||| |||||    
T  24477641 cacctccatc 24477632  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24421210 - 24420982
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  24421210 catccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatc 24421111  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     ||||| || || || |||||  | || || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| | || || ||||||||||| ||||| ||     
T  24421110 cccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctcca 24421011  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    || || || || ||||||||||| |||||    
T  24421010 tccccccctccaccatatgtctacaagtc 24420982  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24421466 - 24421366
Alignment:
Q  148 aaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 247  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||    
T  24421466 aaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagt 24421367  T
Q  248 c 248  Q
    |    
T  24421366 c 24421366  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Original strand, 24470257 - 24470357
Alignment:
Q  148 aaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 247  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||    
T  24470257 aaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagt 24470356  T
Q  248 c 248  Q
    |    
T  24470357 c 24470357  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 255
Target Start/End: Original strand, 24470705 - 24470939
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  24470705 catctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatc 24470804  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     || || || || || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || || |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||     
T  24470805 accttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcc-ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctcca 24470903  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  24470904 tccccaccacctccatacgtttataagtcacctcct 24470939  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24477702 - 24477503
Alignment:
Q  49 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 148  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||  || || || |||||| | || || |    
T  24477702 tataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctaca 24477603  T
Q  149 aatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    |||| || ||||| || |||||||  || || || |||||| |||| |||   |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24477602 aatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtc 24477503  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24406650 - 24406499
Alignment:
Q  97 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcca------tacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatata 190  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||      || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||     
T  24406650 tacaagaccccacctccaccatctccatcaccaccaccaccaccaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatg 24406551  T
Q  191 tctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 242  Q
    |||  |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  24406550 tctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatcta 24406499  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24420538 - 24420334
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||  | || || || || |||||    ||||| || ||||||||||| ||    
T  24420538 catctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttc 24420439  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
    |||||| || || || ||||| |  ||||| || || || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||     
T  24420438 tccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttacaagtctccacctccaccatctcca 24420339  T
Q  220 tcacc 224  Q
    |||||    
T  24420338 tcacc 24420334  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24477258 - 24477064
Alignment:
Q  34 cctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatcccca---c 130  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||| || || ||  ||||||||||    |    
T  24477258 cctccaccatatgtatataagtctcttcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccaccgccacctccatcccctaccc 24477159  T
Q  131 cacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcacca 225  Q
    | |||||||| || |||||  | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||| |||||    
T  24477158 ctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  130 ccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccacca 213  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24477738 - 24477644
Alignment:
Q  157 cctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccc 251  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || || ||| |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24477738 cctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtcccc 24477644  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 24471088 - 24471275
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| ||  | || || || || |||||    ||||| || ||||||||||| ||    
T  24471088 catctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttc 24471187  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccacca 207  Q
    |||||| || || || ||||| || ||||  || || || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  24471188 tccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttacaagtctccacca 24471275  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24406487 - 24406397
Alignment:
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || || ||| |||  |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  24406487 ctccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatcta 24406397  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24420479 - 24420373
Alignment:
Q  127 ccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccac 226  Q
    ||||| |||||||||   || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||  ||| |||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24420479 ccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccac 24420380  T
Q  227 cccctcc 233  Q
    | |||||    
T  24420379 cgcctcc 24420373  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 24471147 - 24471253
Alignment:
Q  127 ccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccac 226  Q
    ||||| |||||||||   || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||| | |||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24471147 ccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccac 24471246  T
Q  227 cccctcc 233  Q
    | |||||    
T  24471247 cgcctcc 24471253  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24476979 - 24476894
Alignment:
Q  160 ccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataa 245  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| || || || |  || |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24476979 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataa 24476894  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24477330 - 24477221
Alignment:
Q  58 ccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctc 157  Q
    |||||||||||||| || || |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  24477330 ccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtctacaagtccccaccaccaccgtcacactcaccccctccaccatatgtatataagtctcttc 24477231  T
Q  158 ctccaccatc 167  Q
    ||||||||||    
T  24477230 ctccaccatc 24477221  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24477714 - 24477553
Alignment:
Q  85 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctc 184  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || || || || |||||||  || || |||||||    
T  24477714 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 24477615  T
Q  185 catatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 246  Q
    || || ||||||| |||||||| || || || ||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  24477614 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataag 24477553  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24482252 - 24482191
Alignment:
Q  148 aaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccacc 209  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  24482252 aaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacc 24482191  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24482256 - 24482203
Alignment:
Q  192 ctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataa 245  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24482256 ctacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataa 24482203  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 9)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Original strand, 4431 - 4600
Alignment:
Q  79 cctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccac 178  Q
    ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  4431 cctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctc 4530  T
Q  179 cgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    | || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4531 ccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtc 4600  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Original strand, 4516 - 4741
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  4516 catcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatc 4615  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||| || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||     
T  4616 cccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccc 4715  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataa 245  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4716 tcccctcccccaccatatgtatataa 4741  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Original strand, 4515 - 4703
Alignment:
Q  67 ccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccat 166  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||| || || || || || || |||||||    
T  4515 ccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccat 4614  T
Q  167 ctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    | || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| ||||||    
T  4615 ccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcct 4703  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4864
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4708 catcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 4807  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcacc 176  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4808 cccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 242
Target Start/End: Original strand, 4635 - 4834
Alignment:
Q  43 tatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacg 142  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||| | |||||||| || |||||||| || || ||||| || || ||||| |    
T  4635 tatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatg 4734  T
Q  143 tttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 242  Q
    | |||||||| || || || |||||||| || || || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  4735 tatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtcta 4834  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 251
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4651
Alignment:
Q  25 ccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccat 124  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||   |||||||| || ||||| || || || || |||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  125 ccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcacc 224  Q
    | || || || ||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctcc 4624  T
Q  225 accccctccatatgtctataagtcccc 251  Q
    ||| ||||||||| | || ||||||||    
T  4625 accacctccatatatttacaagtcccc 4651  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Original strand, 4674 - 4864
Alignment:
Q  34 cctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccac 133  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || |    
T  4674 cctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctc 4773  T
Q  134 ctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcacc 224  Q
    | ||||| || || || || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  4774 caccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 4564 - 4792
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  4564 catccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatc 4663  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     ||||| || || || |||||  | || || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| | || || ||||||||||| ||||| ||     
T  4664 cccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctcca 4763  T
Q  220 tcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    || || || || ||||||||||| |||||    
T  4764 tccccccctccaccatatgtctacaagtc 4792  T

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Target: scaffold0879; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 255
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4511
Alignment:
Q  169 ccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    |||||||| || || |||||| |||| |||   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcct 4511  T

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Target: chr2 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41900413 - 41900220
Alignment:
Q  34 cctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccac 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||    
T  41900413 cctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccac 41900314  T
Q  134 ctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccacc 227  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||| | |||| ||| | | | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41900313 ctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacc 41900220  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41900619 - 41900412
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||    
T  41900619 catctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctccacctccctc 41900520  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
    |||||| |||| ||||   || || ||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| | | | || ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  41900519 tccatcaccacaacctaagtatgtctataagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatcccca 41900420  T
Q  220 tcaccacc 227  Q
    ||||||||    
T  41900419 tcaccacc 41900412  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41900056 - 41899956
Alignment:
Q  151 tctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtccc 250  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  41900056 tctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccc 41899957  T
Q  251 c 251  Q
    |    
T  41899956 c 41899956  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41900443 - 41900280
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||| || |  || || ||||| || || ||||    
T  41900443 aagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaat 41900344  T
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatc 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  41900343 ctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatc 41900280  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41900053 - 41899863
Alignment:
Q  58 ccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctc 157  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || || |    
T  41900053 ccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccac 41899954  T
Q  158 ctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    | || || || || ||||| || |||||||||   |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  41899953 caccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtc 41899863  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41900038 - 41899826
Alignment:
Q  25 ccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccat 124  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |    
T  41900038 ccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgt 41899939  T
Q  125 ccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcacc 224  Q
    | || || |||||||| |  || || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  41899938 caccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacc 41899839  T
Q  225 accccctccatat 237  Q
     || || ||||||    
T  41899838 tcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41900203 - 41900004
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  41900203 aagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaat 41900104  T
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccc 251  Q
    ||||||| ||||||| | | || | ||| | | | ||| ||||||| || ||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  41900103 ctcctccaccaccatatgcatcgctacccctttcttatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtcccc 41900004  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41900635 - 41900541
Alignment:
Q  148 aaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 242  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  41900635 aaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtcta 41900541  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900288
Alignment:
Q  97 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctaca 196  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  |||| || || || || || || ||||||||||  || || |||||| ||||||    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  197 agtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcct 255  Q
    | || || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcct 41900288  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41900629 - 41900509
Alignment:
Q  58 ccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctc 157  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||| || || || || ||||| || || ||||||||||    
T  41900629 ccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctc 41900530  T
Q  158 ctccaccatctccttcaccac 178  Q
    | || || ||||| |||||||    
T  41900529 cacctccctctccatcaccac 41900509  T

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Target: chr1 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Original strand, 11882303 - 11882439
Alignment:
Q  100 aagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatctacaag 198  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||     
T  11882303 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11882401  T
Q  199 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11882402 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11882439  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Original strand, 11891537 - 11891673
Alignment:
Q  100 aagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatctacaag 198  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||     
T  11891537 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11891635  T
Q  199 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11891636 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11891673  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  97 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctaca 196  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || || || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  197 agtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 52819035 - 52818920
Alignment:
Q  49 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 148  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||  |||||    
T  52819035 tataagtcaccaccaccaccatcaccatcccctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatcaccatcccctccccctccatactattata 52818936  T
Q  149 aatctcctcctccacc 164  Q
    |||||||||| |||||    
T  52818935 aatctcctccaccacc 52818920  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 236
Target Start/End: Original strand, 11882395 - 11882535
Alignment:
Q  96 ttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatcta 194  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||    
T  11882395 ttacaaatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-ta 11882493  T
Q  195 caagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11882494 caaatcacctccaccaccatccccatcaccaccacctccata 11882535  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 236
Target Start/End: Original strand, 11891629 - 11891769
Alignment:
Q  96 ttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatcta 194  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||    
T  11891629 ttacaaatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-ta 11891727  T
Q  195 caagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11891728 caaatcacctccaccaccatccccatcaccaccacctccata 11891769  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 248
Target Start/End: Original strand, 11879457 - 11879545
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Q  160 ccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11879457 ccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtc 11879545  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  97 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctaca 196  Q
    |||||||||||||| |||||  || | || ||||||||||| || || || || || || || |||||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  197 agtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 11904905 - 11905104
Alignment:
Q  49 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 148  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||| |    
T  11904905 tataagtcaccacccccaccatccccatcacctcctccaccatactattacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattaca 11905004  T
Q  149 aatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 247  Q
    | || || |||||||||||||| || || || || ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||    
T  11905005 agtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactat-tataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagt 11905103  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Original strand, 11904935 - 11905122
Alignment:
Q  31 cctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccac 130  Q
    ||||||||||| ||   ||| ||||| || || || ||||| || ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  11904935 cctcctccaccatactattacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattacaagtcaccacctccaccatctccatctcctc 11905034  T
Q  131 cacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccc 218  Q
    | || ||||||  |||||| || || ||||||||||| || || || || || ||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  11905035 ctccaccatactattataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtcaccagctccaccatcccc 11905122  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 11882300 - 11882484
Alignment:
Q  49 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 148  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||   |||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||| |    
T  11882300 tataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactattaca 11882399  T
Q  149 aatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11882400 aatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccatactat-tacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctcc 11882484  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 11891534 - 11891718
Alignment:
Q  49 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 148  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||   |||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||| |    
T  11891534 tataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactattaca 11891633  T
Q  149 aatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11891634 aatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccatactat-tacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctcc 11891718  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 11879493 - 11879677
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||   || ||      
T  11879493 aagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactactacaaga 11879592  T
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||   |||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879593 gtcctccaccaccttctccttcacctccacctccttactactacaaatctcctccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879677  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52819016 - 52818800
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtc 119  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||   ||| || || || || ||||| ||    
T  52819016 catcaccatcccctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatcaccatcccctccccctccatactattataaatctcctccaccaccctc 52818917  T
Q  120 tccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatcccct 219  Q
     ||||||||||| || || |||  |||  |||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||  |||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  52818916 accatccccacctccaccgtactattaccaatcccctccaccaccatcaccatctccaccacctccttattactacaaatcacctccaccaccaacccca 52818817  T
Q  220 tcaccaccccctccata 236  Q
    ||||| || ||||||||    
T  52818816 tcacctccacctccata 52818800  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 226
Target Start/End: Original strand, 11905079 - 11905274
Alignment:
Q  31 cctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccac 130  Q
    ||||||||||| |||   |||||||| ||| | || ||||| || || ||||| ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  11905079 cctcctccaccatattactataagtcaccagctccaccatccccatcccctcctccaccatactattataagtccccacctccaccgtcaccagctccac 11905178  T
Q  131 cacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccac 226  Q
    |||| || |||  |||||| || || || |||||||| || || || || |||||||||   ||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  11905179 caccaccttactattataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatattattacaaatctcctccaccaccatccccatcaccac 11905274  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52818774 - 52818611
Alignment:
Q  70 tctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctc 169  Q
    |||||||||||||| || |||||   |||||||   || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||  |||| | || || || |||||||| |    
T  52818774 tctccctctcctccacctccatactattacaagagtccccctccaccctctccctccccccctcctccatactattatcattccccaccaccaccatcgc 52818675  T
Q  170 cttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    |||| ||||| ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  52818674 cttctccaccacctccctactactacaaatcacctccaccaccatccccgtcacctccacctcc 52818611  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 11905028 - 11905237
Alignment:
Q  28 tctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccc 127  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||   || ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  11905028 tctcctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtcaccagctccaccatccccatccc 11905127  T
Q  128 caccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccac 226  Q
    | || || ||||||  |||||| || || |||||||| || ||  | ||||| || || || ||| || ||||||||||| |||||||| || || || |    
T  11905128 ctcctccaccatactattataagtccccacctccaccgtcaccagctccaccaccaccttactat-tataagtcaccacccccaccatcaccatcccctc 11905226  T
Q  227 cccctccatat 237  Q
    |||||||||||    
T  11905227 cccctccatat 11905237  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 11882491 - 11882628
Alignment:
Q  96 ttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctac 195  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||   || |||  ||| |||||||||||||| || || ||  | ||||||  ||||    
T  11882491 ttacaaatcacctccaccaccatccccatcaccaccacctccatactactacaaaagtccccctccaccatctccatctcctccatccccatattactac 11882590  T
Q  196 aagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    || || |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  11882591 aaatctccaccaccaccatcaccatccccaccccctcc 11882628  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 11891725 - 11891862
Alignment:
Q  96 ttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctac 195  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||   || |||  ||| |||||||||||||| || || ||  | ||||||  ||||    
T  11891725 ttacaaatcacctccaccaccatccccatcaccaccacctccatactactacaaaagtccccctccaccatctccatctcctccatccccatattactac 11891824  T
Q  196 aagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    || || |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  11891825 aaatctccaccaccaccatcaccatccccaccccctcc 11891862  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 11905192 - 11905380
Alignment:
Q  48 ttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttat 147  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||||||  |||||| || || || ||||| || ||||| |||| || ||| |||  |||     
T  11905192 ttataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatattattacaaatctcctccaccaccatccccatcaccacaacatccctactattac 11905291  T
Q  148 aaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata-tatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  11905292 aaatcacctccaccaccatcgccatcaccaccacctccctactat-tacaaatcacctccaccaccatcaccatcgcctccacctccata 11905380  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  124 tccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccacc 212  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 188
Target Start/End: Original strand, 11902137 - 11902273
Alignment:
Q  52 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 151  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||  ||| || |    
T  11902137 aagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccatactattacaagt 11902236  T
Q  152 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccata 188  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  11902237 ctcctccaccaccctcgccttccccaccgccaccata 11902273  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52821546 - 52821398
Alignment:
Q  85 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctc 184  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||   ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |    
T  52821546 ccaccatatgagtacaagtcacccccaccaccatctccctcacccccacctccttactactataaatctccaccaccaccctctccctcacctccaccac 52821447  T
Q  185 catatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    | ||   ||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  52821446 cttactactacaagtccccaccaccaccctctccctcacctccacctcc 52821398  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 248
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879497
Alignment:
Q  193 tacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 248  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtc 11879497  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 11882408 - 11882535
Alignment:
Q  61 ccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctc 160  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||   |||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| |    
T  11882408 ccaccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactattacaaatcacctccac 11882507  T
Q  161 caccatctccttcaccaccgcctccata 188  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11882508 caccatccccatcaccaccacctccata 11882535  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 11891642 - 11891769
Alignment:
Q  61 ccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctc 160  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||   |||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| |    
T  11891642 ccaccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactattacaaatcacctccac 11891741  T
Q  161 caccatctccttcaccaccgcctccata 188  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11891742 caccatccccatcaccaccacctccata 11891769  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52821486 - 52821311
Alignment:
Q  49 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 148  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||   || |    
T  52821486 tataaatctccaccaccaccctctccctcacctccaccaccttactactacaagtccccaccaccaccctctccctcacctccacctccttactactaca 52821387  T
Q  149 aatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcacc 224  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  52821386 agtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccttcaccttcacc 52821311  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 171
Target Start/End: Original strand, 11902563 - 11902661
Alignment:
Q  73 ccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctcct 171  Q
    |||||||| |||||||| ||   ||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11902563 ccctctccacccccaccttactattacaagtctcctccaccaccttcaccatctcctccaccaccatactattacaaatctcctcctcctccatctcct 11902661  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 11902080 - 11902225
Alignment:
Q  91 tatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatata 190  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| || || || || || || || || ||||| || ||||| || ||||| ||      
T  11902080 tatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacg 11902179  T
Q  191 tctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  11902180 tgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccata 11902225  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Original strand, 11902380 - 11902429
Alignment:
Q  151 tctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  11902380 tctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatattactacaagtc 11902429  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 11905336 - 11905473
Alignment:
Q  96 ttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctac 195  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||   || |||   || |||||||| ||||| || || || || ||||||  ||||    
T  11905336 ttacaaatcacctccaccaccatcaccatcgcctccacctccatactactacaaaagcccccctccaccttctccctctcctcctcccccatattactac 11905435  T
Q  196 aagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 233  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11905436 aaatctccaccaccaccatcaccatcaccaccccctcc 11905473  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52819176 - 52819136
Alignment:
Q  196 aagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  52819176 aagtcaccacctccaccatccccatcacctccccctccata 52819136  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52821645 - 52821593
Alignment:
Q  85 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcc 137  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  52821645 ccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctcc 52821593  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52821879 - 52821811
Alignment:
Q  97 tacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccacca 165  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||    
T  52821879 tacaagtcaccccctccaccctctccttcaccgccacctccttacatttacaaatcaccccctccacca 52821811  T

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Target: scaffold1918 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1918
Description:

Target: scaffold1918; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 425
Alignment:
Q  20 catcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatg 94  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  499 catcaccatcacctccaccaccttacatttacaagtcaccaccacctccatcaccgtcacctccaccaccatatg 425  T

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