View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4943-Insertion-1 (Length: 1038)

Name: NF4943-Insertion-1
Description: NF4943
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4943-Insertion-1
NF4943-Insertion-1
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (8-570)||(15840975-15841528)
chr8 (611-1031)||(39914911-39915338)
chr8 (611-1032)||(3648136-3648565)
chr8 (611-1031)||(9877615-9878041)
chr8 (611-1032)||(29727728-29728153)
chr8 (611-1013)||(42231351-42231758)
chr8 (611-1032)||(15838681-15839096)
chr8 (611-1031)||(16787371-16787797)
chr8 (611-1031)||(4404403-4404829)
chr8 (611-1031)||(23402504-23402931)
chr8 (611-999)||(34136147-34136539)
chr8 (612-952)||(7278499-7278845)
chr8 (674-1031)||(2728603-2728965)
chr8 (611-1018)||(378834-379247)
chr8 (611-945)||(3435729-3436068)
chr8 (612-842)||(36409092-36409319)
chr8 (611-752)||(28523882-28524022)
chr8 (845-1031)||(40470121-40470312)
chr8 (633-840)||(32539845-32540051)
chr8 (611-701)||(24019734-24019824)
chr8 (611-666)||(2728166-2728220)
chr8 (966-1031)||(36408935-36409002)
chr8 (615-718)||(9175840-9175942)
chr8 (967-1031)||(34136531-34136597)
chr8 (974-1018)||(3435678-3435723)
chr8 (700-754)||(29352041-29352095)
chr8 (722-755)||(3072879-3072912)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (11-570)||(31994515-31995075)
chr5 (611-1032)||(13818373-13818800)
chr5 (611-1032)||(36292964-36293392)
chr5 (611-1032)||(39435092-39435520)
chr5 (611-1031)||(26282661-26283088)
chr5 (611-1032)||(1775722-1776147)
chr5 (611-1018)||(31501063-31501476)
chr5 (615-1032)||(16333248-16333672)
chr5 (611-1032)||(39656871-39657302)
chr5 (611-1018)||(12278202-12278614)
chr5 (611-1031)||(31680762-31681187)
chr5 (611-1031)||(33430716-33431141)
chr5 (611-1031)||(15959292-15959717)
chr5 (611-1031)||(17331963-17332391)
chr5 (612-952)||(43069333-43069676)
chr5 (611-907)||(37255128-37255426)
chr5 (611-1031)||(36291766-36292190)
chr5 (611-845)||(10036497-10036730)
chr5 (727-1032)||(16155393-16155704)
chr5 (845-1032)||(10034298-10034491)
chr5 (611-741)||(192515-192644)
chr5 (791-1018)||(38268945-38269166)
chr5 (823-1016)||(192318-192517)
chr5 (675-885)||(23034521-23034731)
chr5 (634-753)||(24793102-24793220)
chr5 (700-839)||(1050663-1050802)
chr5 (845-907)||(28801724-28801788)
chr5 (700-838)||(30297404-30297542)
chr5 (706-780)||(8788473-8788546)
chr5 (703-753)||(30922358-30922408)
chr5 (633-753)||(35066237-35066358)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (11-570)||(24008967-24009527)
chr6 (611-1031)||(399014-399441)
chr6 (611-1032)||(13838192-13838622)
chr6 (628-1018)||(34948144-34948539)
chr6 (611-1031)||(33228683-33229108)
chr6 (611-1031)||(28997125-28997550)
chr6 (611-1031)||(29743679-29744104)
chr6 (611-773)||(34252793-34252955)
chr6 (611-741)||(31028304-31028433)
chr6 (700-780)||(28931663-28931743)
chr6 (934-1031)||(18339489-18339588)
chr6 (727-784)||(29341686-29341742)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (611-1032)||(36381692-36382118)
chr4 (611-1031)||(34406627-34407054)
chr4 (611-1031)||(43356301-43356728)
chr4 (611-1031)||(47501170-47501597)
chr4 (611-1032)||(6235904-6236331)
chr4 (611-1031)||(20129710-20130137)
chr4 (611-1031)||(26438622-26439049)
chr4 (611-1031)||(13012585-13013012)
chr4 (611-1032)||(17510572-17511004)
chr4 (612-1032)||(25931104-25931530)
chr4 (611-1030)||(28876660-28877085)
chr4 (611-1031)||(43142930-43143356)
chr4 (611-1031)||(29995328-29995755)
chr4 (611-1031)||(30216091-30216514)
chr4 (611-1031)||(30076983-30077408)
chr4 (611-1031)||(3292243-3292668)
chr4 (611-1031)||(30110358-30110784)
chr4 (615-1031)||(10352235-10352656)
chr4 (611-1031)||(33135790-33136216)
chr4 (614-1031)||(48989724-48990148)
chr4 (611-1031)||(6689582-6690007)
chr4 (611-1031)||(35546348-35546772)
chr4 (611-1031)||(50204433-50204850)
chr4 (611-1031)||(42333119-42333547)
chr4 (611-894)||(13390793-13391078)
chr4 (611-860)||(40529659-40529908)
chr4 (611-1013)||(48130392-48130798)
chr4 (611-873)||(44157182-44157445)
chr4 (611-863)||(26449285-26449537)
chr4 (612-840)||(1818264-1818489)
chr4 (611-753)||(13398875-13399016)
chr4 (611-840)||(29133976-29134204)
chr4 (849-1032)||(40529411-40529600)
chr4 (914-1031)||(1818112-1818233)
chr4 (966-1018)||(26448461-26448514)
chr4 (699-754)||(26546737-26546792)
chr4 (966-1031)||(44157042-44157109)
chr4 (700-754)||(39994538-39994592)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (614-1032)||(36631212-36631635)
chr7 (611-1032)||(8394521-8394947)
chr7 (611-1018)||(5555873-5556285)
chr7 (611-1031)||(14776450-14776877)
chr7 (611-1018)||(3113466-3113878)
chr7 (611-1031)||(33685958-33686384)
chr7 (611-1031)||(8867077-8867503)
chr7 (611-1031)||(43183815-43184240)
chr7 (611-1031)||(40919367-40919793)
chr7 (611-1031)||(26625141-26625565)
chr7 (611-907)||(38637728-38638026)
chr7 (611-1018)||(36658588-36658989)
chr7 (611-907)||(37001585-37001884)
chr7 (814-1031)||(7003120-7003344)
chr7 (814-1031)||(7048991-7049215)
chr7 (611-753)||(11020154-11020293)
chr7 (764-1012)||(11020529-11020781)
chr7 (611-666)||(7003393-7003448)
chr7 (611-666)||(7049264-7049319)
chr7 (615-783)||(8722695-8722861)
chr7 (819-952)||(34388633-34388771)
chr7 (674-753)||(8723841-8723918)
chr7 (611-666)||(34468678-34468733)
chr7 (699-753)||(23581687-23581741)
chr7 (709-779)||(32073261-32073330)
chr7 (822-981)||(49010181-49010345)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (611-1032)||(40081085-40081512)
chr3 (611-1032)||(34083465-34083891)
chr3 (611-1031)||(22967787-22968214)
chr3 (611-1031)||(39772187-39772614)
chr3 (611-1031)||(6268769-6269196)
chr3 (611-1032)||(19390542-19390970)
chr3 (611-1031)||(27935572-27935997)
chr3 (611-1018)||(6930240-6930651)
chr3 (611-1031)||(6502914-6503341)
chr3 (611-1031)||(19564848-19565273)
chr3 (611-1031)||(45183376-45183800)
chr3 (611-1031)||(45336268-45336693)
chr3 (615-1031)||(5135683-5136107)
chr3 (611-1031)||(33041348-33041771)
chr3 (615-951)||(11017619-11017959)
chr3 (611-777)||(35514655-35514819)
chr3 (611-806)||(38282998-38283192)
chr3 (615-858)||(8257417-8257657)
chr3 (42-134)||(7286779-7286871)
chr3 (225-312)||(7285994-7286081)
chr3 (748-846)||(1185696-1185795)
chr3 (618-755)||(34337604-34337740)
chr3 (674-780)||(43041935-43042040)
chr3 (131-216)||(7286462-7286547)
chr3 (709-784)||(30122739-30122813)
chr3 (642-780)||(53311762-53311901)
chr3 (698-753)||(219040-219096)
chr3 (314-385)||(7285723-7285795)
chr3 (914-1018)||(38282826-38282931)
chr3 (450-508)||(7285121-7285179)
chr3 (634-663)||(2591492-2591521)
chr3 (700-840)||(3159244-3159384)
chr3 (700-753)||(19814597-19814650)
chr3 (716-753)||(29564598-29564635)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (611-1031)||(479800-480227)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (611-1031)||(6403147-6403574)
chr2 (611-1032)||(17444384-17444812)
chr2 (611-1031)||(41250976-41251404)
chr2 (611-1018)||(35963101-35963513)
chr2 (611-999)||(42442415-42442808)
chr2 (674-1032)||(31581028-31581392)
chr2 (611-1018)||(45418992-45419403)
chr2 (611-1031)||(26162048-26162473)
chr2 (611-1031)||(4554539-4554964)
chr2 (611-1031)||(12756184-12756609)
chr2 (611-1032)||(7071880-7072307)
chr2 (689-1032)||(2286185-2286532)
chr2 (611-952)||(32126532-32126878)
chr2 (674-1032)||(18981985-18982350)
chr2 (611-1031)||(8058689-8059104)
chr2 (612-935)||(45121703-45122029)
chr2 (790-999)||(2957668-2957882)
chr2 (611-773)||(771396-771555)
chr2 (849-1031)||(44084185-44084373)
chr2 (845-1012)||(26238357-26238528)
chr2 (611-691)||(2286648-2286728)
chr2 (611-666)||(16405897-16405952)
chr2 (700-841)||(26591634-26591775)
chr2 (967-1032)||(42442356-42442423)
chr2 (699-753)||(15512176-15512230)
chr2 (967-1032)||(2957874-2957941)
chr2 (699-779)||(17373278-17373357)
chr2 (966-1031)||(8147747-8147814)
chr2 (704-754)||(816494-816544)
chr2 (699-753)||(40653965-40654019)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (611-1018)||(7433831-7434243)
chr1 (612-1032)||(42310286-42310712)
chr1 (611-1016)||(17445705-17446114)
chr1 (611-1018)||(23313404-23313816)
chr1 (611-1031)||(3829378-3829803)
chr1 (612-1032)||(32981402-32981828)
chr1 (611-952)||(35908004-35908350)
chr1 (611-1031)||(41971602-41972029)
chr1 (611-988)||(11957695-11958076)
chr1 (611-882)||(28463486-28463758)
chr1 (612-831)||(321024-321243)
chr1 (845-1031)||(33490101-33490293)
chr1 (699-780)||(17744779-17744859)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (611-952)||(18036-18382)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (611-1031)||(53302-53728)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (611-753)||(31896-32037)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (634-753)||(35485-35603)
[»] scaffold2142 (1 HSPs)
scaffold2142 (966-1031)||(919-986)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (633-840)||(17900-18104)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (700-784)||(1890-1973)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 473; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15841528 - 15840975
Alignment:
Q  8 attacaacactataactgtccagctctgtctgagcaagaaattccctcaacaacattccatccgtcatatatttcacaatggtcttttccgatgtgcaat 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||||    
T  15841528 attataacactataactgtccagctcaggctgagcaagaaattccctcaacaacattccatccgtcatat----------ggtcttttccgacgtgcaat 15841439  T
Q  108 cctcaaatcgtatggagtaaccaacctcatgtcctagtttaacacccatttcttcagaaactcgggtagcaacactcatagcagcaacacgtagtggctg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15841438 cctcaaatcgtatggagtaaccaacctcatgtcctagtttaacacccatttcttcagaaactcgggcagcaacactcatagcagcaacacgtcgtggctg 15841339  T
Q  208 agtacatgctatcattcttccatgctttgtgtatccagcttcacgaagatattgaggaatctgtgtagttttcccagtaccagtttcaccaacaatcaca 307  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15841338 agtacatgcaagcattcttccatgctttatgtatccagcttcatgaagatattgaggaatctgtgtagttttcccagaaccagtttcaccaacaatcaca 15841239  T
Q  308 agtacttggtgatcatgaacagcttggagaaattcatcccgaaaaggatagataggtag-attttcctctcctcctgaagtgcctcgaaaactgatctct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15841238 agtacttggtgatcatgaacagcttggagaaattcatcccgaaaaggatagataggtagctttttcctctcctcctgaagtgcctcgaaaactgatctct 15841139  T
Q  407 ttgcgctagattttttcaatgcaatctcttgtccataatcaaacttatgtccatccattactgatgccttgatacaatcaatctgctcctcaaacacaaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15841138 ttgcgctagattttttcaatgcaatctcttgtccataatcaaacttatgtccatccattactgatgccttgatacaatcaatctgctcctcaaacacaaa 15841039  T
Q  507 ccgataatcatcagagacttgtcgcttatttttcgaaccatatttcagctttgcctttctaatt 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15841038 ccgataatcatcagagacttgtcgcttatttttcgaaccatatttcagctttgcctttctaatt 15840975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 39915338 - 39914911
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39915338 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 39915240  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  39915239 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 39915141  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  39915140 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 39915041  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39915040 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 39914942  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39914941 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 39914911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 3648136 - 3648565
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3648136 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgatctat-aaatagaattt 3648234  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctat--aaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgatttta 807  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  3648235 tgagctcattatttgcagagaaatctataaaaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcaaagtcgtttaaatttattttgattttt 3648333  T
Q  808 caattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataa 904  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3648334 caactaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataa 3648433  T
Q  905 gaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-at 1000  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3648434 gaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagataaaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataat 3648532  T
Q  1001 taatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3648533 taatttatccctggtcgaagaaatttaattttg 3648565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 9878041 - 9877615
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9878041 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 9877943  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  9877942 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 9877844  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  9877843 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcatatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 9877744  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaatggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
    |   ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||   || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9877743 accttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattatgaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaa 9877644  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9877643 tttatccctggtcgaagaaatttaatttt 9877615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 29727728 - 29728153
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29727728 ttataaatttttgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatcttgatctataaa-tcgaattt 29727826  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  29727827 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaaatcatttaaatttattttgatttttca 29727925  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    ||||    
T  29727926 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgcaggcatgactagaaca--cgaaga 29728023  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29728024 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 29728122  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29728123 attgatccctggtcgaagaaatttaattttg 29728153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 611 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 42231758 - 42231351
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42231758 ttataaattttcaacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 42231660  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  42231659 tgcgctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagttttatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 42231561  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  42231560 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 42231461  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42231460 accttcacgatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 42231362  T
Q  1003 atttatccctg 1013  Q
    |||||||||||    
T  42231361 atttatccctg 42231351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 15839096 - 15838681
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15839096 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctataaa-tcgaattt 15838998  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  15838997 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatttgtaaagtttcatagaatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 15838899  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcg-tagcgtatactcacaagcaaatttagttccttaattttgtagaatgactagaacattataagaa- 907  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||     
T  15838898 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgaaaacgtatactcacaagcaaatttagttccctaattttgtag----------gcatgataagaac 15838809  T
Q  908 tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaat 1004  Q
      ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15838808 cttcacaataaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatacaaattcataattaat 15838710  T
Q  1005 ttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  15838709 ttatccctagtcgaagaaatttaattttg 15838681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 16787371 - 16787797
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16787371 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaatgaaaatctcgacctataaa-tcgaattt 16787469  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  16787470 tgagctcattacttgcagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 16787568  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  16787569 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagcatgataaga 16787668  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    | | ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16787669 actttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 16787767  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  16787768 atttatctctggtcgaagaaatttaatttt 16787797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 4404829 - 4404403
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  4404829 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 4404731  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  4404730 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaggtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 4404632  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4404631 accaagacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 4404532  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   | | | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4404531 acctttacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 4404433  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  4404432 atttatctgtggtcgaagaaatttaatttt 4404403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 23402931 - 23402504
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||       ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23402931 ttataaattttcgacaaacgacaaattgattttgaatttttaaaatgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 23402833  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||||| |    
T  23402832 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaaaacacataaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattatgatttttc 23402733  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  23402732 aaccaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatgctcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataag 23402633  T
Q  906 aa-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataa-atggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcatatta 1002  Q
    ||   ||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| ||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23402632 aaccttcatagtgaaattttgtagtctttaaacaagatacaaattaa-ttataagttgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataata 23402534  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  23402533 atttatctctggtcgaagaaatttaatttt 23402504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 611 - 999
Target Start/End: Original strand, 34136147 - 34136539
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  34136147 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 34136245  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  34136246 tgagctcactatttgtagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaactttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 34136344  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  34136345 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagcatgataaga 34136444  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcata 999  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34136445 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcata 34136539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 612 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 7278845 - 7278499
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7278845 tataaattttcgacatacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaatcgaatttt 7278747  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctat--aaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  7278746 gagctcattatttgcatagacatctataaaaaaatacat-aaaacggatctgtaaagtttcattgcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttc 7278648  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  7278647 aatcaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataag 7278548  T
Q  906 aa-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatt 952  Q
    ||   ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  7278547 aaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaatt 7278499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 674 - 1031
Target Start/End: Original strand, 2728603 - 2728965
Alignment:
Q  674 caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcata 773  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  2728603 caaatcaacagaaatctcgacctataaa-tcgaattttgagctcattatttgca-agacatctataaaaatacat-aaaaaggatctctaaagtttcata 2728699  T
Q  774 acatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagt 870  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  2728700 gcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaaccaaaacgttcaaaattgaaattttgttctgcgtaagtgtatactcacaagttaaatttagt 2728799  T
Q  871 tccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttagg 966  Q
    ||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||   ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |    
T  2728800 tccctaattttataggcatgactagaacatgataagaaccttcacagtgaaattttatagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaag 2728898  T
Q  967 aaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2728899 aaattcataattatgatggaacaaaaaatcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 2728965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 379247 - 378834
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  379247 ttataaattttcggcaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctat-aaatcaaattt 379149  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctat---aaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgatttt 806  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  379148 tgagttcattatttgcagagatatctataaaaaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttcaatttattttaatttt 379050  T
Q  807 acaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattata 903  Q
      ||   |||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| | | |||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| |||    
T  379049 -gaaccaaaacgtgcaaaattgaatttttgttccgagtaagtgtatactcataggtcaaatttaattccctaattttgcaggcatgactagaacatgata 378951  T
Q  904 ag-aatatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-a 999  Q
    || ||  ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  378950 agaaacttcacaataaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatga-ggaataaaaattcataa 378853  T
Q  1000 ttaatttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  378852 ttaatttgtccctggtcga 378834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 611 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 3436068 - 3435729
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn-caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||        ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||    
T  3436068 ttataaattttcaaaaaacaacaaattaattatgaatttttaaagtgtaaaaaactcaaaaaagcaaaacaacggaaatctcgacttctaaa-tcgaatt 3435970  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  3435969 ttgaactcattattggcagagacatctataaaaatacata-aaaatgatctgtaaagtttcataacatttcaaagtcgtttaaatttattttgatttttc 3435871  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    ||   ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||    
T  3435870 aaccaaaacgcgcaaaactgaaattttgttccgcgtaagcatatactcacaagtcaaatttagttccctaattatgtaggcatgactagaacatgataag 3435771  T
Q  906 aata-tcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaa 945  Q
    || | ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3435770 aacattcacaattaaattttgtagtttttaaacgagatacaa 3435729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 612 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 36409319 - 36409092
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  36409319 tataatttttcgacaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctcgacctataaa-tcgaatttt 36409221  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaat 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||     
T  36409220 gagctcattatttgcagagacatctataaaaataca-caaaaagaatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgt-ttatttattttgatttttcaac 36409123  T
Q  812 tgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgc 842  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36409122 caaaacatgcaaaattgaaattttgttccgc 36409092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 611 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 28524022 - 28523882
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28524022 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 28523924  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaa 752  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28523923 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacataaaa 28523882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 845 - 1031
Target Start/End: Original strand, 40470121 - 40470312
Alignment:
Q  845 agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat-cataatgaaattttgtaatttttaac-gaga 940  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  40470121 agcgtataatcacaaggcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactaaaacatgataagaatattcacaatgaaattttgtagtttttaaatgaga 40470220  T
Q  941 tacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcatattaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40470221 tacaaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataataatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 40470312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 633 - 840
Target Start/End: Original strand, 32539845 - 32540051
Alignment:
Q  633 aaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagac 732  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |        ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  32539845 aaattaattatgaatttttaaagcgacaaaaacacaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattttgagtttattgtttgcagaaac 32539943  T
Q  733 atctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaa 831  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||| ||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  32539944 atttataaaaatacat-aaaaaggatctccaaagtttcatagcatttcgaagacgtttcaatttatttttatttttcaaccaaaacatgtaaaattgaaa 32540042  T
Q  832 ttttgttcc 840  Q
    |||||||||    
T  32540043 ttttgttcc 32540051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 611 - 701
Target Start/End: Original strand, 24019734 - 24019824
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaa 701  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24019734 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctataaa 24019824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 666
Target Start/End: Original strand, 2728166 - 2728220
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 666  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2728166 ttataaattttcgacaaacgacaa-ttaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 2728220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 966 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 36409002 - 36408935
Alignment:
Q  966 gaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  36409002 gaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctagtcgaagaaatttaatttt 36408935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 9175942 - 9175840
Alignment:
Q  615 aaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgag 714  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |        |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9175942 aaatttttgacaagtgaaaaattaattatgaatttttaaagcgtcaaaaacccaaaaaacaaaacaacgaaaatctcgacctat-aaatcgaattttgag 9175844  T
Q  715 ctca 718  Q
    ||||    
T  9175843 ctca 9175840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 967 - 1031
Target Start/End: Original strand, 34136531 - 34136597
Alignment:
Q  967 aaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  34136531 aaattcataattatgagggaatgaaaattcataattaatttatctctggtcgaagaaatttaatttt 34136597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 974 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 3435723 - 3435678
Alignment:
Q  974 taattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3435723 taattatgaaggaataaaaattcataattaatttatccctggtcga 3435678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 700 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 29352095 - 29352041
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa 754  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29352095 aaatcgacttttgagttgattgtttgcagagacatctatataaatacatgaaaaa 29352041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 722 - 755
Target Start/End: Original strand, 3072879 - 3072912
Alignment:
Q  722 tttgcagagacatctataaaaatacataaaaaag 755  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3072879 tttggagagacatctataaaaatacataaaaaag 3072912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 31995075 - 31994515
Alignment:
Q  11 acaacactataactgtccagctctgtctgagcaagaaattccctcaacaacattccatccgtcatatatttcacaatggtcttttccgatgtgcaatcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||    
T  31995075 acaacactataactgtccagctcaggctgagtaaggaattccctcaacagcattccatccgtcatatacttaacaatggttttctcggatgtgcaatcct 31994976  T
Q  111 caaatcgtatggagtaaccaacctcatgtcctagtttaacacccatttcttcagaaactcgggtagcaacactcatagcagcaacacgtagtggctgagt 210  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31994975 caaagcgtatggagtagccaacctcgtgtcctagcttaacacccatttcttgagaaactcgggcagcaacactcatagcagcaacacgtcgtggctgagt 31994876  T
Q  211 acatgctatcattcttccatgctttgtgtatccagcttcacgaagatattgaggaatctgtgtagttttcccagtaccagtttcaccaacaatcacaagt 310  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31994875 acatgcaatcattcttccatccttcgtataaccagcttcgtgaagatattggggaatctgtgtagtttttccagaaccagtttcaccaacaatgacaagt 31994776  T
Q  311 acttggtgatcatgaacagcttggagaaattcatcccgaaaaggatagataggtag-attttcctctcctcctgaagtgcctcgaaaactgatctctttg 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||    
T  31994775 acttggtgatcatgaacagcctggagaaattcatccttaaaaggatatataggtagctttttcctctcctccttaagtgcctcataagccgatctctttg 31994676  T
Q  410 cgctagattttttcaatgcaatctcttgtccataatcaaacttatgtccatccattactgatgccttgatacaatcaatctgctcctcaaacacaaaccg 509  Q
    | | ||||||||   |||||||||||| |  | |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31994675 ctcgagatttttcagatgcaatctcttcttgacaatcaaacttatctccacccatcactgattccttgataacatcaatctgatcctcaaacacaaactg 31994576  T
Q  510 ataatcatcagagacttgtcgcttatttttcgaaccatatttcagctttgcctttctaatt 570  Q
    ||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  31994575 ataatcatcagagacatttgttttatttttcgaaccaaatttcatcgttgcctttctaatt 31994515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 13818800 - 13818373
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13818800 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcagaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgatctataaa-tcgaattt 13818702  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  13818701 tgagctcattatttgtagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 13818603  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  13818602 attgaaacgtgcaaaattgaagttttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 13818503  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13818502 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaactgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 13818404  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13818403 atttatccctggtcgaagaaatttaattttg 13818373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 36292964 - 36293392
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36292964 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 36293062  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  36293063 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 36293161  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  36293162 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagtttcctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 36293261  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36293262 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattatttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 36293360  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36293361 aatttatccctggtcgaagaaatttaattttg 36293392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 39435520 - 39435092
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39435520 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaagaaaacaacagaaatctcgatctataaa-tcaaattt 39435422  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  39435421 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacataaaag-ggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 39435323  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  39435322 actgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcttatacccacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggtatgactagaacatgataaga 39435223  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39435222 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 39435124  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39435123 aatttatccctggtcgaagaaatttaattttg 39435092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 26282661 - 26283088
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26282661 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 26282759  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  26282760 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 26282858  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  26282859 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 26282958  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26282959 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattacgagggaataaaaattcataatt 26283057  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26283058 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 26283088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 1775722 - 1776147
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1775722 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaat-aaaacaacataaatctcgatctataaa-tcgaattt 1775819  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  1775820 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 1775918  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaagcaaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || | ||||||||||||| |||||||    
T  1775919 actcaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagcaaatttaattctctaattttttaggcatgactagaacatgataagaa 1776018  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1776019 ccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacagattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaa 1776117  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  1776118 tttatccctagtcgaagaaatttaattttg 1776147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Original strand, 31501063 - 31501476
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31501063 ttataaattttcgacaaacaacaaattaattatgaatttttaaaatgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgacctataaa-tcgaattt 31501161  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  31501162 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagttgtttaaatttattttgatttttca 31501261  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  31501262 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 31501361  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |  |||| ||||||||| |||| | ||| ||| |||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31501362 accatcacaatgaaattatgtagtctttaaacaagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 31501460  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||||||||||    
T  31501461 atttatccctggtcga 31501476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 615 - 1032
Target Start/End: Original strand, 16333248 - 16333672
Alignment:
Q  615 aaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgag 714  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16333248 aaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgatctataaa-tcgaattttgag 16333346  T
Q  715 ctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattg 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||    
T  16333347 ctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatctgtaaagtttcatagcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaactg 16333446  T
Q  814 aaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgt-agaatgactagaacattataagaa-ta 909  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || || |||||||       
T  16333447 aaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaagcatgactaaaatatgataagaacct 16333546  T
Q  910 tcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaattt 1006  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16333547 tcccaatgaaattttgtaatttttaaacaagatacaaattaa-ttataaattttttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaattt 16333645  T
Q  1007 atccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  16333646 atctctggttgaagaaatttaattttg 16333672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 39656871 - 39657302
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaattttta-aagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||    
T  39656871 ttataaattttcaacaaacgacaaattaattatgaatttttataagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatgaaaatctcaatctataaa-tcgaatt 39656969  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  39656970 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctataaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttt 39657068  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag----caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattat 902  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  39657069 aactgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtgatcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgat 39657168  T
Q  903 aagaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat- 998  Q
    |||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  39657169 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaataaattcataattatgagggaataaaaattcata 39657267  T
Q  999 attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  39657268 attaatttatccatggtcgaagaaatttaattttg 39657302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Original strand, 12278202 - 12278614
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  12278202 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 12278300  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  12278301 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcgttttgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 12278399  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  12278400 accaaaacgtgcaaaattaaaattttgttccgcgtaagcgaatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 12278499  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12278500 accttcacagtgaaattttgtaatctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 12278598  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12278599 atttatctctggtcga 12278614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 31681187 - 31680762
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  31681187 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcgaattt 31681090  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  31681089 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 31680991  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  31680990 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 31680891  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||  | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31680890 accttcgcagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 31680792  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  31680791 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 31680762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 33431141 - 33430716
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  33431141 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcgaattt 33431044  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  33431043 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 33430945  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  33430944 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 33430845  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||  | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33430844 accttcgcagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 33430746  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  33430745 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 33430716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 15959292 - 15959717
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15959292 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaac-acaaaaacaatacagcggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 15959389  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  15959390 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctttaaagtttcatagcatttcaaagttgtttaaatttattttgatttttca 15959488  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  15959489 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcataagcgtatactcacaggtcaaatttagttcccaaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 15959588  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15959589 accttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagctgcaaattaa-ttataaattgattaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 15959687  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15959688 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 15959717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 17331963 - 17332391
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaa-gctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||    
T  17331963 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctggacctataaa-tcgaatt 17332061  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctat-aaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgatttta 807  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||     
T  17332062 ttgagctcattatttgcagagatatctataaaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcattttgaagtcgtttaaatttattatgattttt 17332160  T
Q  808 caattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataa 904  Q
    |||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17332161 caaccaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcatatactcgcaagtcaaatttagttccttaattttgtaggcatgactagaacatgataa 17332260  T
Q  905 gaa-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-at 1000  Q
    |||   ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  17332261 gaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacaagatacaaattaa-ttataaattgcttaagaaattcataattatgagggaatgaaaaatcataat 17332359  T
Q  1001 taatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  17332360 taatttatctctggtcgaagaaatttaatttt 17332391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 612 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 43069676 - 43069333
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||    
T  43069676 tataaattttcgacaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctctacctataaa-tcgaatttt 43069578  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaat 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||| |   |||||||||| |||| |||     
T  43069577 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaaaaaatgtaaagtttcatagcatttcaaagtcgt-ttatttattttgttttttcaac 43069479  T
Q  812 tgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaa- 907  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||     
T  43069478 caaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgcagacatgactagaacatgataagaac 43069379  T
Q  908 tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatt 952  Q
      ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  43069378 cttcaaaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaatt 43069333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 611 - 907
Target Start/End: Complemental strand, 37255426 - 37255128
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  37255426 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 37255328  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||    
T  37255327 tgagctcattatttacagatacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaactttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattatgatttttca 37255229  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  37255228 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 37255129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 36292190 - 36291766
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||||||||||       ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  36292190 ttataaattttcgacaaatgacaaactaattatgaatttttataatgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctcgacctataaa-tcgaattt 36292092  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||| |||    
T  36292091 tgagcttattatttgcagaaacatctataaaaatacata-aaaagaatctgtaaagtttcatagcatttcgaagt-tgtttatttattttgatttttcaa 36291994  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  36291993 ccaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcataagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaa 36291894  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
       ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||| |  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  36291893 ccttcacaataaaattttatagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataagttagtttaag-aattcataattatgagggaataaaaatttataatta 36291796  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36291795 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 36291766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 611 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 10036730 - 10036497
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10036730 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaaaggaaatctcgatctat-aaatcgaattt 10036632  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  10036631 tgagctcattatttgtagagacatctataaaaatacat-aaaaatgatctgtaaagtttcatagcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 10036533  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta 845  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10036532 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgta 10036497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 727 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 16155704 - 16155393
Alignment:
Q  727 agagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaa 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  16155704 agagacatctataaaaatacataaaaacg-atctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaactgaaacgtgcaaaa 16155606  T
Q  826 ttgaa-attttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-tatcataatgaaa 920  Q
    |||||  |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||   ||| ||| | |    
T  16155605 ttgaatttttttttccgtgtgagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaaccttcacaataata 16155506  T
Q  921 ttttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg 1017  Q
    |||| |||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16155505 ttttataatttttaaacgag--acaaattaa-ttataaattggttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctggtcg 16155409  T
Q  1018 -agaaatttcattttg 1032  Q
     |||||||| ||||||    
T  16155408 aagaaatttaattttg 16155393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 845 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 10034491 - 10034298
Alignment:
Q  845 agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgaga 940  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10034491 agcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaaccttcacaatgaaattttataatttttaaacgaga 10034392  T
Q  941 tacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10034391 tacaaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaatattcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaattttg 10034298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 611 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 192644 - 192515
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  192644 ttataaattttcgacaaacaacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaaatcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 192546  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaa 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  192545 tgagctcattatttgcagagacatctgtaaa 192515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 791 - 1018
Target Start/End: Original strand, 38268945 - 38269166
Alignment:
Q  791 aatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtagaat 888  Q
    |||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||       
T  38268945 aatttattttgatttttcaaccaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgagtaagcgtatacttacaggtcaaatttagttccctaattttgtag--- 38269041  T
Q  889 gactagaacattataagaa-tatcataatgaaattttgtaattttta-acgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgaggg 985  Q
            ||| |||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||    
T  38269042 -------gcatgataagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttatacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatg-ggg 38269132  T
Q  986 aataaaaattcat-attaatttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38269133 aataaaaattcataattaatttgtccctggtcga 38269166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 823 - 1016
Target Start/End: Complemental strand, 192517 - 192318
Alignment:
Q  823 aaattgaaattttgttccgcgtag-cgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatatcat-aatga 918  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||  | |  |||||    
T  192517 aaattgaaattttgttccgagtaaacgtatactcataggtcaaatttagttccctaattttataggcatgacgagaacatgataagaaccttaacaatga 192418  T
Q  919 aattttgtaatttttaac-gagatacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggt 1015  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  192417 aattttgtagtttttaaatgagatacaaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggt 192319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 675 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 23034731 - 23034521
Alignment:
Q  675 aaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataa 774  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| | |||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||     
T  23034731 aaaacaacggaaatctcgacctataaatt-gaatattaagctcattttttgcagaaatatctataaaaatacata-aaaatgatcagcaaagtttcatag 23034634  T
Q  775 catttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttc 872  Q
     ||||| |||   |   |||| |||| ||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||  |||    
T  23034633 tatttcaaagatatttcatttttttttatttttcaatcagaacatgcaaaattaaaattttgttcctagtaagcgtatactcacaggtcaaatttcattc 23034534  T
Q  873 cttaattttgtag 885  Q
    |||||||||||||    
T  23034533 cttaattttgtag 23034521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 634 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 24793220 - 24793102
Alignment:
Q  634 aattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagaca 733  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||       |||||||||| |||  || | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  24793220 aattaattatgaatttttaaagcgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaacaaaaacttcaacctat-aaatcgaattttgtgctaattatttgcagtgaca 24793122  T
Q  734 tctataaaaatacataaaaa 753  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24793121 tctatagaaatacataaaaa 24793102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 700 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 1050802 - 1050663
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttatt 798  Q
    ||||| ||||||||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||   || ||||||| |    
T  1050802 aaatcaaattttgagttgattgttcgcagcgacaactataaaaatacata-aaaaggatttgcaaagtttcataacattttgaagaagtttaaatttaat 1050704  T
Q  799 ttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttc 839  Q
    || | ||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1050703 tttagttttcaaccaaaacatgcaaaattgcaattttgttc 1050663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 845 - 907
Target Start/End: Complemental strand, 28801788 - 28801724
Alignment:
Q  845 agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgt-agaatgactagaacattataagaa 907  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  28801788 agcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaagcatgactagaacatgataagaa 28801724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 700 - 838
Target Start/End: Original strand, 30297404 - 30297542
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttatt 798  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||||   ||  ||||||||    
T  30297404 aaatcaaattgtgagctcactatttgtagaggcatctataaaaataca-caaaaaggatctacaaagtttcatagcgtttagaagaagtttcaatttatt 30297502  T
Q  799 ttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgtt 838  Q
    ||  |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  30297503 tttgttttccaactaaaacgtgcaaaattgaaattttgtt 30297542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 706 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 8788546 - 8788473
Alignment:
Q  706 aattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttc 780  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  8788546 aattttgagctaattgcttgcagaggcatctatagaaatacata-aaaaggatatgcaaaatttcgtaacatttc 8788473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 703 - 753
Target Start/End: Original strand, 30922358 - 30922408
Alignment:
Q  703 tcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30922358 tcgaattttgagttgattgtttgcagagacatctatagaaatacataaaaa 30922408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Original strand, 35066237 - 35066358
Alignment:
Q  633 aaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttg--cagag 730  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||        ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||   ||||    
T  35066237 aaattaattacgaatttttaaagcgccaaaaactcaaagaataaaacaacataaatctcgatcta-aaaatcaaattttgagataattatttgtagagag 35066335  T
Q  731 acatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  35066336 agatatataaaaatacataaaaa 35066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 289; Significance: 1e-161; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24009527 - 24008967
Alignment:
Q  11 acaacactataactgtccagctctgtctgagcaagaaattccctcaacaacattccatccgtcatatatttcacaatggtcttttccgatgtgcaatcct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||    
T  24009527 acaacactataactgtccagctcaggttgagcaaggaactccctcaacaacattccatccgtcatatatttaacaatggtcttcttggacgtgcaatcct 24009428  T
Q  111 caaatcgtatggagtaaccaacctcatgtcctagtttaacacccatttcttcagaaactcgggtagcaacactcatagcagcaacacgtagtggctgagt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24009427 caaagcgtatggagtaaccaacctcgtgtcctagtttaacacccatttcttgagaaactcgggcagcaacactcatagcagcaacacgccgtggctgagt 24009328  T
Q  211 acatgctatcattcttccatgctttgtgtatccagcttcacgaagatattgaggaatctgtgtagttttcccagtaccagtttcaccaacaatcacaagt 310  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  24009327 acatgcaatcatttttccatgcttcgtataaccagcttcgtgaagatattggggaatctgtgtagtttttccggaaccagtttcgccaacaatgacaagt 24009228  T
Q  311 acttggtgatcatgaacagcttggagaaattcatcccgaaaaggatagataggtag-attttcctctcctcctgaagtgcctcgaaaactgatctctttg 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||| ||| ||| || ||| |||| ||||| |    
T  24009227 acctggtgatcatgaacagcttggagaaatttatcccgaacagcatagacaggtagttttttcctctcctcccgaattgcgtctaaagctgacctcttag 24009128  T
Q  410 cgctagattttttcaatgcaatctcttgtccataatcaaacttatgtccatccattactgatgccttgatacaatcaatctgctcctcaaacacaaaccg 509  Q
    | ||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24009127 ctctagatttttctaatgcaacctctttctcataatcaaacttaacaccatccattaccgacgccttgattaaatcaatctggtcctcaaacacaaactg 24009028  T
Q  510 ataatcatcagagacttgtcgcttatttttcgaaccatatttcagctttgcctttctaatt 570  Q
     ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  24009027 gtaatcatcacagacttgtcttttatctttcgaaccaaatttcagtgttgcctttctaatt 24008967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 399441 - 399014
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  399441 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 399343  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  399342 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 399244  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  399243 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 399144  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  399143 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 399045  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  399044 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 399014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 13838622 - 13838192
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13838622 ttataaattttcgacaaacaacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatgaaaatctcaatctataaa-tcgaattt 13838524  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  13838523 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 13838425  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag----caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattata 903  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   |||    
T  13838424 actaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtgatcgaatttagttccctaattttgtagacatgactggaactagata 13838325  T
Q  904 agaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-a 999  Q
    ||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13838324 agaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgatatacaaattaa-ttataaattgtttaataaattcataattatgagggaataaaaattcataa 13838226  T
Q  1000 ttaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  13838225 ttaatttatccatggtcgaagaaatttaattttg 13838192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 628 - 1018
Target Start/End: Original strand, 34948144 - 34948539
Alignment:
Q  628 acgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgca 727  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34948144 acgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgatctataaa-tcgaattttgagttcattatttgca 34948242  T
Q  728 gagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaat 826  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  34948243 gagacatctataaaaatgcat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaactgaaacgtgcaaaat 34948341  T
Q  827 tgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-tatcataatgaaatt 922  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||    
T  34948342 tgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgacaagaaccttcacaatgaaatt 34948441  T
Q  923 ttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34948442 ttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattacgagggaataaaaattcataattaatttatccctggtcga 34948539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 33228683 - 33229108
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  33228683 ttataaattttcgacaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaagagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctcgacctataaa-tcgaattt 33228781  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||    
T  33228782 tgagctcattatttgcagagagatctataaaaatacataaaaaa-aatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgt-ttatttattttgatttttcaa 33228879  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  33228880 ccaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtacactcacaagtcaaatttagttccctaattttgcaggcatgactagaacatgataagaa 33228979  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
       ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33228980 ccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattagtttaagaaattcataattatgagggaatacaaattcataatta 33229078  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33229079 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 33229108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 28997550 - 28997125
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  28997550 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcaacctataaa-tcgaattt 28997453  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  28997452 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 28997354  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  28997353 accaaaatgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 28997254  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||  | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28997253 accttcgcagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 28997155  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  28997154 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 28997125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 29744104 - 29743679
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  29744104 ttataaattttagacaaacgacaaactaattgtgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctcgacctataaa-tcgaattt 29744006  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||| |||    
T  29744005 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa-gaatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgttta-tttattttgatttttcaa 29743908  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaa 907  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||| | |||||| |||||||    
T  29743907 ccaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttaattccctaattttgtaggcatgattggaacatgataagaa 29743808  T
Q  908 tat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
     || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29743807 cattcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaatt-ataagttagtttaagaaattcataattatgagtgaataaaaattcataatta 29743709  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  29743708 atttatccctagtcgaagaaatttaatttt 29743679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 611 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 34252955 - 34252793
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn--caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaat 708  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||    
T  34252955 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaacataaaaaaaacaaaacaacggaaatctcaatctataaa-tcaaat 34252857  T
Q  709 tttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  34252856 tttgagctcattatttgcagagatatctataaaaatacataaaaga-gatctataaagtttcata 34252793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 611 - 741
Target Start/End: Original strand, 31028304 - 31028433
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  31028304 ttataaattttcgaaaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaacgaaaatctcgacctat-aaatcgaattt 31028402  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaa 741  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31028403 tgagctcatcatttgtagagacatctataaa 31028433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 700 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 28931743 - 28931663
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttc 780  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||    
T  28931743 aaatcgaattttgagctgattgtttgcagagacatctatagaaatacatacaaaaggatctgcaaagtttcgtagcatttc 28931663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 934 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 18339588 - 18339489
Alignment:
Q  934 aacgagatacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattt 1030  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  18339588 aacgagatacaaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataattaatttatctctggtcgaagaaatttaattt 18339490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 29341742 - 29341686
Alignment:
Q  727 agagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag 784  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29341742 agagacatctataaaaatgcat-aaaatggaaatgcaaagtttcatagcatttcgaag 29341686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-130; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 36381692 - 36382118
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36381692 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcgaattt 36381790  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  36381791 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatttgtaaagtttcatagcatttcgaattcgtttaaatttattttgatttttca 36381889  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaagcaaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  36381890 actgaaacgtgcaaaattgaaattttattccgcgtaagcgtatactcacaagcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaa 36381989  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36381990 ccttcacaataaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaa 36382088  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  36382089 tttatccctagtcgaagaaatttaattttg 36382118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 34406627 - 34407054
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34406627 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 34406725  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  34406726 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 34406824  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  34406825 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 34406924  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34406925 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 34407023  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34407024 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 34407054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 43356728 - 43356301
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43356728 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 43356630  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  43356629 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 43356531  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  43356530 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 43356431  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43356430 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 43356332  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43356331 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 43356301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 47501597 - 47501170
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47501597 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 47501499  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  47501498 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 47501400  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  47501399 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 47501300  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47501299 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 47501201  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47501200 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 47501170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 6236331 - 6235904
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||       | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6236331 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattgtgaatttttaaagtgttaaaagctcaaaaaactaaacaacggaaatctcgatctataaa-tcgaattt 6236233  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagt-cttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  6236232 tgagctcattatttgcagagatatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtggtttaaatttattttgatttttca 6236134  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6236133 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 6236034  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6236033 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataatta 6235935  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6235934 atttatccctggtcgaagaaatttaattttg 6235904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 20130137 - 20129710
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20130137 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 20130039  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||    
T  20130038 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgttttaatttattttgatttttca 20129940  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  20129939 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 20129840  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20129839 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 20129741  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20129740 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 20129710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 26438622 - 26439049
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26438622 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 26438720  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  26438721 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 26438819  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  26438820 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 26438919  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26438920 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 26439018  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  26439019 aatttatctctggtcgaagaaatttaatttt 26439049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 13013012 - 13012585
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13013012 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 13012914  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  13012913 taagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 13012815  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  13012814 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 13012715  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13012714 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattatttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 13012616  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13012615 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 13012585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 17510572 - 17511004
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn-caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17510572 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctataaa-tcgaatt 17510670  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||      
T  17510671 ttaagctcattatttgcagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttcaatttattttgatttttg 17510769  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactag----aacatta 901  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    ||||| |    
T  17510770 aactgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggtatgactagaacaaacatga 17510869  T
Q  902 taagaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat 998  Q
    ||||||   ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17510870 taagaaccttcacaatgaaattttataatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcat 17510968  T
Q  999 -attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  17510969 aattaatttatccctggttgaagaaatttaattttg 17511004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 612 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 25931530 - 25931104
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||     
T  25931530 tataaattttcgacaaacgacaatttaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctagatctataaa-tcgaatttg 25931432  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  25931431 gagctcattatttgcagagacatatataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaa 25931333  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||    
T  25931332 ctgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtattctcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactaaaacatgataagaa 25931233  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25931232 ccttcacagttaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaa 25931134  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  25931133 tttatctctggtcgaagaaatttaattttg 25931104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 611 - 1030
Target Start/End: Original strand, 28876660 - 28877085
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28876660 ttataaatttttgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgatctataaa-tcgaattt 28876758  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  28876759 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcaaagtcgtttaaatttattttgatttttca 28876857  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  28876858 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcttatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 28876957  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| || |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28876958 accttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatagaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgaggaaataaaaattcataatta 28877056  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcattt 1030  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  28877057 atttatccctgatcgaagaaatttaattt 28877085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 43142930 - 43143356
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  43142930 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaattgaattt 43143028  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  43143029 tgagctcattatttgtagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgttaaaatttattatgatttttca 43143127  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  43143128 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagcatgataaga 43143227  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43143228 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 43143326  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  43143327 atttatctctggtcgaagaaatttaatttt 43143356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 29995328 - 29995755
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  29995328 ttataaattttcgacaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatttcgacctataaa-tcgaattt 29995426  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  29995427 tgagctcattatttgcagagatatttataaaaatacataaaaa-gaatatgtaaattttcataccatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 29995525  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  29995526 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 29995625  T
Q  907 atat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |  | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29995626 accttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaatt-ataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 29995724  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29995725 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 29995755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 30216091 - 30216514
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||   ||||||||| |||| |||| ||||||    
T  30216091 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatgaaaatctcgacctat-aaattgaattt 30216189  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||    
T  30216190 taagctcattatttgcagagacatccataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagttgtttaaatttattatgatttttca 30216288  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  30216289 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 30216388  T
Q  907 atatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaatggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaat 1004  Q
    |  |   | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30216389 acct-tcagtgaaattttgtagtctttaaatgagatacaagttaa-ttataaattgtttagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataattaat 30216486  T
Q  1005 ttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  30216487 ttatctctggtcgaagaaatttaatttt 30216514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 30076983 - 30077408
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  30076983 ttataaattttcgacaagcgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctcgacctataaa-tcgaattt 30077081  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||| |||    
T  30077082 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa-gaatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgttta-tttattttgatttttcaa 30077179  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaa 907  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
T  30077180 ccaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatattcacaagtcaaatttagttcccaaattttgtaggcatgattataacatgataagaa 30077279  T
Q  908 tat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
      | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077280 ccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaatt-ataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 30077378  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30077379 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 30077408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 3292243 - 3292668
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  3292243 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcgaattt 3292340  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||    
T  3292341 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgattaaatttattatgatttttca 3292439  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||    
T  3292440 accaaaacgtggaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgattagaacatgataaga 3292539  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3292540 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 3292638  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  3292639 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 3292668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 30110784 - 30110358
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||       ||||| ||| |||||||| || |||||| || |||||    
T  30110784 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattataaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaataacggaaatctcaatatataaa-tcaaattt 30110686  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  30110685 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcatttaaatttattttgatttttca 30110587  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||| |    
T  30110586 accaaaacgtgcaaaattgaaattttattctgcgtaagcgcatactcacaggtcaaatttagttccttaattttgtaggcatgacaataacatgataata 30110487  T
Q  907 ata-tcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    | | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30110486 acattcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaatt-agttataaagtgtttaagaaatttataattatgagggaataaaaactcataatta 30110388  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30110387 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 30110358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 615 - 1031
Target Start/End: Original strand, 10352235 - 10352656
Alignment:
Q  615 aaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgag 714  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10352235 aaattttcgaaaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctcgacctataaa-tcaaattttgag 10352333  T
Q  715 ctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaattga 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||| |||   |    
T  10352334 ctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa-gaatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgttta-tttattttgatttttcaaccaa 10352431  T
Q  815 aacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat- 910  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||  |     
T  10352432 aacatgcaaaattgaaattttgttccgtgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgattagaacatgataagaacctt 10352531  T
Q  911 cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaattt 1006  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10352532 cacaatgaaattttgtactttttaaacgagatacaaattaatt-ataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaattt 10352630  T
Q  1007 atccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||    
T  10352631 atcccttgtcgaagaaatttaatttt 10352656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 33135790 - 33136216
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  33135790 ttataaattttcgacaaacaataaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctaaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 33135888  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  33135889 tgagcttattatttgcagagacatctataaaaataaat-aaaaaggatctgtaaagtttcatatcatttcaaagtcgtttaaaattattttgatttttca 33135987  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  33135988 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaaacgtatactcataagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 33136087  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  33136088 accttcacaatgaaatttcgtagtttttaaacaagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattacgagggagtaaaaattcataatta 33136186  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  33136187 atttatccttgatcgaagaaatttaatttt 33136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 614 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 48990148 - 48989724
Alignment:
Q  614 taaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn-caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttg 712  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48990148 taaaatttcgacaaacaacaaattaattatgaatttttaaagtgtctaaagctcaaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattttg 48990050  T
Q  713 agctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaat 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||     
T  48990049 agctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaatgatctgtaaagtttcatagcattttgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaac 48989951  T
Q  812 tgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa- 907  Q
      |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||     
T  48989950 caaaacgtgccaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatacccacaagtcaaatttaattccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaac 48989851  T
Q  908 tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaat 1004  Q
      ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| | ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48989850 cttcacagtgaaattttttagtttttaaacgagatacaaattaa-tcataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataattaat 48989752  T
Q  1005 ttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48989751 ttatccctggtcgaagaaatttaatttt 48989724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 6689582 - 6690007
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| || |||||    
T  6689582 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcaaattt 6689679  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||    
T  6689680 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgattaaatttattatgatttttca 6689778  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||    
T  6689779 accaaaacgtggaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttaattccctaattttgtaggcatgattagaacatgataaga 6689878  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6689879 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagattcaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 6689977  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  6689978 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 6690007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 35546772 - 35546348
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  35546772 ttataaattttcaacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcgaattt 35546675  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  35546674 tgagttcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 35546576  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  35546575 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaa-tttgtaggcatgactaaaacatgataaga 35546477  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35546476 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattatttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 35546378  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  35546377 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 35546348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 50204433 - 50204850
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50204433 ttataaattttcgacaaacaacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacagcggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 50204531  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  50204532 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcatttaaatttattttgatttttca 50204630  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaa-ttttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtagaatgactagaacattataaga 906  Q
        |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||    
T  50204631 tccaaaacatgcaaaattgaaatttttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtag----------gcatgataaga 50204720  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaat-aaaaattcat-att 1001  Q
    |   ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| || |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50204721 accttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatataaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaattcataatt 50204819  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50204820 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 50204850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 42333119 - 42333547
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn-caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||   ||||||||| ||||||| || ||||    
T  42333119 ttataaattttcgacaaaggacaaattaattatgaatttttaaagtgacaaaagctcaaaaaaacaaaacaatgaaaatctcgacctataaa-tcaaatt 42333217  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |    
T  42333218 ttgagctcattattcgtagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttc 42333316  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  42333317 aaccaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagcatgataag 42333416  T
Q  906 aa-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaatgg--ttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-at 1000  Q
    ||   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  42333417 aaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgttttaagaaattcataattatgaggggatgaaaattcataat 42333515  T
Q  1001 taatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  42333516 taatttatctctggtcgaagaaatttaatttt 42333547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 611 - 894
Target Start/End: Original strand, 13390793 - 13391078
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13390793 ttataaattttcgacaaatgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaactgaaatctcgacctataaa-tcgaattt 13390891  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  13390892 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttcttttgatttttca 13390990  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactag 894  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13390991 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactaacaagtcaaatttagttccctaattttgtagacatgactag 13391078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 611 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 40529908 - 40529659
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  40529908 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgatctataaa-tcaaattt 40529810  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||| ||    
T  40529809 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa-gatctgtaaagtttcatagcatttcgaattcgtttaaatttattttgttttttca 40529711  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag 860  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40529710 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaag 40529659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 611 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 48130798 - 48130392
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||       ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  48130798 ttataaattttcgacaaacgacaaattgattatgaatttttaaaatgtcaaaaactaaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaatt-gaattt 48130700  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||| |||    
T  48130699 taagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacataaaaa-ggatctgtaaagtttcataacatttcaaagtcgtttaaattattttgatttttcaa 48130601  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtag--aatgactagaacattataaga 906  Q
       |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  48130600 ccaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaaattagttccctaattttgtaggcaat-actagaacatgataaga 48130502  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48130501 accttcacaataaaatattgtagtttttaaacgacatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataatta 48130403  T
Q  1003 atttatccctg 1013  Q
     ||||||||||    
T  48130402 ttttatccctg 48130392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 611 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 44157445 - 44157182
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  44157445 ttataaatttttgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcaacctataaa-tcgaattt 44157347  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  44157346 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 44157248  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttcc 873  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44157247 accaaaacatgcaaaattgaaattttattccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttcc 44157182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 611 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26449537 - 26449285
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26449537 ttataaattttcgacaaatggcaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagttcaaaaactaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 26449439  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  26449438 tgagctcattatttgcaaagacatctacaaaaatacataaaaaa-gatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgttttttca 26449340  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaagcaa 863  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26449339 atcaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagcaa 26449285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 612 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 1818489 - 1818264
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  1818489 tataaattttcgacaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggcaatctcgacctat-aaatcgaatatt 1818391  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaat 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||| |||     
T  1818390 gagctcattatttgcagagacatctataaaagtaca-caaaaagaatctgtaaagtttcatagtatttcgaagtcgt-ttatttattttgatttttcaac 1818293  T
Q  812 tgaaacatgcaaaattgaaattttgttcc 840  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1818292 caaaacatacaaaattgaaattttgttcc 1818264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 611 - 753
Target Start/End: Original strand, 13398875 - 13399016
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13398875 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacgcaaatctcgacctataaa-tcgaattt 13398973  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13398974 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 13399016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 611 - 840
Target Start/End: Original strand, 29133976 - 29134204
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| ||       |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29133976 ttataaattttcgacaaacaacaaattaattatgaatttttaaagtatgaaaaactcaaaaaacaaaacaatagaaatcttgacctataaa-tcgaattt 29134074  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||| | ||  |||||||||| ||||| ||    
T  29134075 tgagctcattgtttgaaaagatatctataaaaatacat-aaaaagaatctgtaaagtttcatttcatttcgaagatgtttcaatttatttttatttttca 29134173  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttcc 840  Q
    |   |||| |  |||||||||||||||||||    
T  29134174 accaaaacgtttaaaattgaaattttgttcc 29134204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 849 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 40529600 - 40529411
Alignment:
Q  849 tatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagataca 944  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40529600 tatactcacaagtcaaatttagttccataattttgtaggcatgactagaacatgataaaaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacaagataca 40529501  T
Q  945 agttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    | |||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40529500 aattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaattttg 40529411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 914 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 1818233 - 1818112
Alignment:
Q  914 aatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatc 1009  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1818233 aatgaaattttgtagttttcaaacgagatacaaattaatt-ataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 1818135  T
Q  1010 cctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||| |||| |||||||| |||||    
T  1818134 cctagtcgaagaaatttaatttt 1818112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 966 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 26448514 - 26448461
Alignment:
Q  966 gaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcga 1018  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26448514 gaaattcataattatgagggaataaaaaatcataattaatttatccctggtcga 26448461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 754
Target Start/End: Original strand, 26546737 - 26546792
Alignment:
Q  699 aaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa 754  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26546737 aaaatcgaattttgaggtgattgtttgcatagacatctatagaaatacataaaaaa 26546792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 44157109 - 44157042
Alignment:
Q  966 gaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  44157109 gaaattcataattatgagagaataaaaattcataattaatttatccctggttgaagaaatttaatttt 44157042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 700 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 39994592 - 39994538
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa 754  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39994592 aaattgaattttgagatgattgtttgcagagacatctataaaaatataaaaaaaa 39994538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 614 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 36631635 - 36631212
Alignment:
Q  614 taaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttga 713  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36631635 taaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaataaaacaacataaatcttgatctataaa-tcgaattttga 36631537  T
Q  714 gctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaatt 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |    
T  36631536 gctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaact 36631438  T
Q  813 gaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaagcaaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-ta 909  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |     
T  36631437 gaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagcaaatttagttctctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaactt 36631338  T
Q  910 tcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaatggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaattta 1007  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36631337 tcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaatttaattatcaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaattta 36631238  T
Q  1008 tccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  36631237 tccctagtcgaagaaatttaattttg 36631212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 8394947 - 8394521
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8394947 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcgaattt 8394849  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  8394848 tgagctgattatttgcagagacatctataaaaatagat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 8394750  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaagcaaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  8394749 actgaaacgtgccaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagaaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaa 8394650  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       |||  ||||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8394649 ccttcacgatgaaattttgtaatttttaaatgagatataaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaa 8394551  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  8394550 tttatccctagtcgaagaaatttaattttg 8394521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 5556285 - 5555873
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5556285 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgatctat-aaatcgaattt 5556187  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  5556186 tgagttcattatttgcagagacatctataaaaatgcat-aaaaaggatctgtaaagtttcataacatatcaaagtcgtttaaatttattttgatttttca 5556088  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  5556087 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgacaaga 5555988  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5555987 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 5555889  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||||||||||    
T  5555888 atttatccctggtcga 5555873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 14776450 - 14776877
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14776450 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 14776548  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  14776549 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacataaaaga-gatttgtaaagtttcatagcatttcaaagtcgtttaaatttattttaatttttca 14776647  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  14776648 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaatatgataaga 14776747  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14776748 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 14776846  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14776847 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 14776877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Original strand, 3113466 - 3113878
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3113466 ttataaattttcgacaaacgacgaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgatctat-aaatcgaattt 3113564  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  3113565 tgagttcattatttgcagagacatctataaaaatgcat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 3113663  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  3113664 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgacaaga 3113763  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3113764 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 3113862  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||| ||||||||    
T  3113863 atttatctctggtcga 3113878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 33686384 - 33685958
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33686384 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagcgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacgaaaatctcgacctataaa-tcgaattt 33686286  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  33686285 tgagctcattatttgcagagacatctataaaagtacat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcattttgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 33686187  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  33686186 accaaaacatgcaaaattaaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctacttttgtaggcatgactagaacatgataaga 33686087  T
Q  907 at-atcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    ||  ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  33686086 atcttcacaataaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaggtcataatta 33685988  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  33685987 atttatccctagtcgaagaaatttaatttt 33685958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 8867077 - 8867503
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8867077 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaataaaacaattgaaatctcggcctataaa-tcgaattt 8867175  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  8867176 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgttaaaatttattatgatttttca 8867274  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  8867275 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 8867374  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  8867375 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacaagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaatgaaaattcataatta 8867473  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  8867474 atttatctctggtcgaagaaatttaatttt 8867503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 43183815 - 43184240
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  43183815 ttataaattttcaacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcgaattt 43183912  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  43183913 tgagttcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 43184011  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  43184012 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 43184111  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43184112 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 43184210  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  43184211 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 43184240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 40919367 - 40919793
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40919367 ttataaattttcgacaaacgataaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaataatggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 40919465  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  40919466 tgagctcattatttgcagagacatttataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 40919564  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  40919565 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagcatgataaga 40919664  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  40919665 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatca 40919763  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  40919764 atttatctctggtcgaagaaatttaatttt 40919793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 26625565 - 26625141
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26625565 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatgaaaatctcgacctat-aaatcgaattt 26625467  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||    
T  26625466 tgagctcattatttccagagacatctataaaaat--atataaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagttgtttaaatttattatgatttttca 26625369  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  26625368 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagttaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 26625269  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaatggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||| ||| ||||  ||| |||||    
T  26625268 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaatgagatacaaattaa-ttataaattgtttagagattcataattatgaggaaatgaaaaaacataattaa 26625170  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  26625169 tttatctctggtcgaagaaatttaatttt 26625141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 611 - 907
Target Start/End: Original strand, 38637728 - 38638026
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38637728 ttataaattttcgacaaacgacaaattagttatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatgaaaatctcgacctataaa-tcgaattt 38637826  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  38637827 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 38637925  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  38637926 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 38638025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 36658989 - 36658588
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  36658989 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtgaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 36658891  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  36658890 tgaactcattatctgcagagacatctataaaaatacat-aaaaagtatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 36658792  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||| |           
T  36658791 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtgaaatttaattccctaattctgtaggcaagactagaacct------- 36658699  T
Q  907 atatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       ||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36658698 ---tcacaataaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaa 36658603  T
Q  1004 tttatccctggtcga 1018  Q
    |||||||||| ||||    
T  36658602 tttatccctgttcga 36658588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 611 - 907
Target Start/End: Original strand, 37001585 - 37001884
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||    
T  37001585 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcataagctcaaaaaacaaaacaatgaaaatctcgacctat-aaatcgaattt 37001683  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctat-aaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |    
T  37001684 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttc 37001782  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  37001783 aaccaaaatgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataag 37001882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 814 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 7003344 - 7003120
Alignment:
Q  814 aaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat 910  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |    
T  7003344 aaacgtgcaaaattgaaattttgttccgtgtaagcgtatactaacaagtcaagtttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaacct 7003245  T
Q  911 -cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaattt 1006  Q
     || |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7003244 tcacaatgaaattttgtagtctttaaacgatatacaaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgtgggaataaaaattcataattaattt 7003146  T
Q  1007 atccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7003145 atccctggtcgaagaaatttaatttt 7003120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 814 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 7049215 - 7048991
Alignment:
Q  814 aaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat 910  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |    
T  7049215 aaacgtgcaaaattgaaattttgttccgtgtaagcgtatactaacaagtcaagtttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaacct 7049116  T
Q  911 -cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaattt 1006  Q
     || |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7049115 tcacaatgaaattttgtagtctttaaacgatatacaaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgtgggaataaaaattcataattaattt 7049017  T
Q  1007 atccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7049016 atccctggtcgaagaaatttaatttt 7048991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 611 - 753
Target Start/End: Original strand, 11020154 - 11020293
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||  |       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11020154 ttataaattttcgacaaacaacaaattaattatgaattttta--gtgtcaaaaattcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 11020250  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11020251 tgagctcattatttgcagagaagtctataaaaatacataaaaa 11020293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 764 - 1012
Target Start/End: Original strand, 11020529 - 11020781
Alignment:
Q  764 aagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag- 860  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||   |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||     
T  11020529 aagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaattt---ttgatttttcaaccaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtataatcataagt 11020625  T
Q  861 caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataa 957  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  || |||||||   ||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  11020626 caaatttagttccctaatcttgtaggcatgactagacaatgataagaaccttcacaacgaaattttggagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataa 11020724  T
Q  958 a-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccct 1012  Q
    | || ||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11020725 attgtttaagaaatttataattacgagataataaaaattcataattaatttatccct 11020781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 7003448 - 7003393
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7003448 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaacttttaaagtgtcaaaagct 7003393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 7049319 - 7049264
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7049319 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaacttttaaagtgtcaaaagct 7049264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 615 - 783
Target Start/End: Original strand, 8722695 - 8722861
Alignment:
Q  615 aaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgag 714  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||       ||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  8722695 aaatttttgacaagcgacaaattaattataaatttttaaagcgtcaaaaactcaaaaagcaaaacaacggaaatttcgacctat-aaatcaaattttgag 8722793  T
Q  715 ctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaa 783  Q
    || | | | |||||||||| ||||||||||| || |||||  || || ||||||||||| |||||||||    
T  8722794 cttactgtatgcagagacacctataaaaataaat-aaaaataatttgcaaagtttcatagcatttcgaa 8722861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 819 - 952
Target Start/End: Original strand, 34388633 - 34388771
Alignment:
Q  819 tgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-tatcata 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||   ||| |    
T  34388633 tgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcatatattcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactggaacatgataagaaccttcaca 34388732  T
Q  915 atgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatt 952  Q
     |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  34388733 gtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaatt 34388771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 753
Target Start/End: Original strand, 8723841 - 8723918
Alignment:
Q  674 caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8723841 caaaacaacggaaatctcgacctataa--ttgaattttgagctcactatatgcagagacacctataaaaatacataaaaa 8723918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 666
Target Start/End: Original strand, 34468678 - 34468733
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 666  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34468678 ttataaattttcgacaaataacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 34468733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 699 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 23581741 - 23581687
Alignment:
Q  699 aaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23581741 aaaatcaatttttgagttgattatttgcagagacatctatagaaatacataaaaa 23581687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 709 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 32073330 - 32073261
Alignment:
Q  709 tttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacattt 779  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||    
T  32073330 tttgagctgattgtttgcagagacatctatagaaatacata-aaaaggatctgtaaaatttcgtagcattt 32073261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 822 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 49010345 - 49010181
Alignment:
Q  822 aaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgt-agaatgactagaacattataagaat-atcataatg 917  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| | || |||  |||||||| ||||||||  ||| ||||    
T  49010345 aaaattgaaattttgttcctaataagcgtatactcacaggtcaaatttcgttccctaattttataagcatggttagaacataataagaatcttcacaatg 49010246  T
Q  918 aaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatg 981  Q
    || ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  49010245 aagttttgcaatttttaaacgagagacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatg 49010181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 40081085 - 40081512
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40081085 ttataaattttcgacaaacgaccaattaattatcaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgatctataaa-tcgaattt 40081183  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  40081184 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa-gatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 40081282  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  40081283 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 40081382  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40081383 accttcacaatgaaattttataatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 40081481  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40081482 atttatccctggtcgaagaaatttaattttg 40081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 34083465 - 34083891
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34083465 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 34083563  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  34083564 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 34083662  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaagcaaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34083663 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtgtactcagaagcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaa 34083762  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34083763 ccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatataaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaa 34083861  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  34083862 tttctccctagtcgaagaaatttaattttg 34083891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 22967787 - 22968214
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22967787 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacataaatctcgatctat-aaatcaaattt 22967885  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  22967886 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaataca-aaaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 22967984  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22967985 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 22968084  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22968085 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 22968183  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22968184 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 22968214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 39772614 - 39772187
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39772614 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 39772516  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  39772515 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 39772417  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataa-g 905  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  39772416 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagg 39772317  T
Q  906 aata-tcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    || | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39772316 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 39772218  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39772217 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 39772187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 6268769 - 6269196
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6268769 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaataaaacaacagaaatctcgatctataaa-tcaaattt 6268867  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  6268868 tgagctcattatttgtaaagacatctataaaaatacataaaag-ggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 6268966  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6268967 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 6269066  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6269067 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 6269165  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6269166 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 6269196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 19390970 - 19390542
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19390970 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 19390872  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  19390871 tgaactcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcattacatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 19390773  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  19390772 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcaccagtcaaatttagtttcctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 19390673  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19390672 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 19390574  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  19390573 aatttatcgctggtcgaagaaatttaattttg 19390542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 27935997 - 27935572
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27935997 ttataaattttcgacaaaccacaaattaattatgaatttttaaagcgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 27935899  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  27935898 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaaatttcataacatttcgaattcgtttaaatttattttgatttttca 27935800  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27935799 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacattataaga 27935700  T
Q  907 at-atcataatgaaattttgtaatttttaacgagatacaagttaatttataaatggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaat 1004  Q
    ||  ||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||   || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27935699 atcttcacaatgaaattttgtagtttttaaacggatacaaattaattacaaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataattaat 27935600  T
Q  1005 ttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27935599 ttatccctggtcgaagaaatttaatttt 27935572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Original strand, 6930240 - 6930651
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| | |||| ||||||| | ||||||    
T  6930240 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tatcgacctataaatt-gaattt 6930337  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  6930338 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa-gatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 6930436  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6930437 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 6930536  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6930537 accttcacaaggaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaagttcataattatgagggaatgaaaattcataatta 6930635  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||| || |||||    
T  6930636 atttatctctagtcga 6930651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 6502914 - 6503341
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn-caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  6502914 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaaacaaaacaatggaaatatcgacctataaa-tcgaatt 6503012  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |    
T  6503013 ttgagctcattatttgtagagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatatcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttc 6503111  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  || |||||    
T  6503112 aaccaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagtatgataag 6503211  T
Q  906 aa-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    ||   ||| | |||||||| ||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  6503212 aaccttcacagtgaaatttcgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagagaatgaaaattcataatt 6503310  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  6503311 aatttatctctagtcgaagaaatttaatttt 6503341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 19564848 - 19565273
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||    ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  19564848 ttataaattttcgacaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaactaaacaatgtcaatttcgacctataaa-tcgaattt 19564946  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||| |||    
T  19564947 tgagctcattatttgcagagacatctatataaatacataaaaa-gaatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgttta-tttattttgatttttcaa 19565044  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaa 907  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  19565045 ccaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttctctaattttgtaggcatgattagaacatgataagaa 19565144  T
Q  908 tat-cataatgaaattttgtaatttttaac-gagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
      | || |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19565145 ccttcacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaatt-ataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 19565243  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19565244 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 19565273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 45183800 - 45183376
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||       ||||||||  ||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  45183800 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaaactcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacatataaa-tcgaattt 45183703  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  45183702 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 45183604  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  45183603 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaa-tttgtaggcatgactaaaacatgataaga 45183505  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45183504 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattttttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 45183406  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  45183405 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 45183376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 45336693 - 45336268
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  45336693 ttataaattttcgacaaacgacaaactaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaactaaacaatggcaatctcgacctataaa-tcgaattt 45336595  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtcttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||    
T  45336594 tgagctcattatttgcagagtcatctataaaaatacata-aaaagaatctgtaaagtatcatagcatttcgaagtcgt-ttatttattttgatttttcaa 45336497  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
       ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  45336496 ccaaaacatgtaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttcccaaattttgtaggcatgattagaacatgataagaa 45336397  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaat--ggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
       | | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45336396 cctttacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaa-ttataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 45336298  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45336297 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 45336268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 615 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 5136107 - 5135683
Alignment:
Q  615 aaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnnca--aaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttg 712  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||        |  ||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  5136107 aaatttttgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaggtgtcaaaaactcaaaaaaaataaaacaacggaaatcttaacctataaa-tcgaattttg 5136009  T
Q  713 agctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaat 811  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
T  5136008 agctcattatttgcagagacacctataaaaatacataaaaaa-gatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcatttaaatttattttgatttttcaac 5135910  T
Q  812 tgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa- 907  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||     
T  5135909 caaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctattttcgtaggcatgactataacatgataagaac 5135810  T
Q  908 tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaat 1004  Q
      ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5135809 cttcacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataattaat 5135711  T
Q  1005 ttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  5135710 ttatccctagtcgaagaaatttaatttt 5135683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 33041771 - 33041348
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33041771 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaataaaacaatgaaaatctcgacctataaa-tcgaattt 33041673  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||| ||||| ||||||| ||    
T  33041672 tgagctcattatttgcagagatatctataaaaatatat-aataaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagttgtttaaagttattatgatttttca 33041574  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  33041573 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtata--cacaggtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 33041476  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaatggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  33041475 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaatgagatacaaattaa-ttataaattgtttagaaattcataattatgaggaaatgaaaattcataattaa 33041377  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  33041376 tttatctctggtcgaagaaatttaatttt 33041348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 615 - 951
Target Start/End: Original strand, 11017619 - 11017959
Alignment:
Q  615 aaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgag 714  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  11017619 aaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaatcaaattttgag 11017717  T
Q  715 ctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattg 813  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||       
T  11017718 ctcattattcgtagagacatctataattttatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgattttttaacca 11017816  T
Q  814 aaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-ta 909  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||       
T  11017817 aaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatacttacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagcatgataagaacct 11017916  T
Q  910 tcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaat 951  Q
    ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  11017917 tcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaat 11017959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 611 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 35514819 - 35514655
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  35514819 ttataaattttccacaaaccacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgacttat-aaatcgaattt 35514721  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacat 777  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35514720 tgaactcattatttgcagagatatttataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcataacat 35514655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 611 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 38283192 - 38282998
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||| ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||       |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  38283192 ttattaattttcgataagcaacaaattaattatgaatttttaaagtgttaaaaacttaaaaaacaaaacaacagaaatctcgacctataaa-tcaaattt 38283094  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttattttgatttt 806  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  38283093 tgaactcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa-gatatgtaaagtttaatagcatttcgaagctatttcaatttattttgatttt 38282998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 615 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 8257657 - 8257417
Alignment:
Q  615 aaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgag 714  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||    ||||| |||| ||||||| |  |||||||||    
T  8257657 aaatttttgacaagcgaaaaataaattatgaatttttaaagtgacaaaaactcaaaaaacaaaacg---gaaatttcgacctataaatta-aattttgag 8257562  T
Q  715 ctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattg 813  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||  |||||||||| ||||| |||       
T  8257561 ctcattgtttgcaaagacatctataaaaatatat-aaaaaggatatgcaaagtttcatagcatttcaaagacgtttcaatttatttttatttttcaacca 8257463  T
Q  814 aaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcaca 858  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8257462 aaacgtgcaaaattgaaattttgttcctagtaagcgtatactcaca 8257417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7286871 - 7286779
Alignment:
Q  42 caagaaattccctcaacaacattccatccgtcatatatttcacaatggtcttttccgatgtgcaatcctcaaatcgtatggagtaaccaacct 134  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  7286871 caagaaattccctcagtaacattccatctgtcatatatttcagaatagtcttgtctgatgtgcaatcctcaaaacggatggagtacccaacct 7286779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7286081 - 7285994
Alignment:
Q  225 ttccatgctttgtgtatccagcttcacgaagatattgaggaatctgtgtagttttcccagtaccagtttcaccaacaatcacaagtac 312  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7286081 ttccatgttttgtgtagccagcttcatgaagatattgaggaatttgtgtagtctttccagaaccggtttcaccaacaattacaagtac 7285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 748 - 846
Target Start/End: Original strand, 1185696 - 1185795
Alignment:
Q  748 taaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtag 846  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1185696 taaaaaaggatctataaagtttcagagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaacaaaaacgtgcaaaattaaaattttgttccgcgtag 1185795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 618 - 755
Target Start/End: Original strand, 34337604 - 34337740
Alignment:
Q  618 ttttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctc 717  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||     
T  34337604 ttttcgacaaaagacagattaattatgagtttttaaagtgtcaaaaactcaaaaatcaaaacaacggaaatctcaaccta-aaaattgaattttgaactg 34337702  T
Q  718 attatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaag 755  Q
    ||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34337703 attgttttctgagacatatataaaaatacatagaaaag 34337740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 780
Target Start/End: Original strand, 43041935 - 43042040
Alignment:
Q  674 caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcata 773  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||   || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  43041935 caaaacaaccgaaatctcgaccta-aaaattgaattttgagccgcttgtttgtagagatatctataaaaatacataaaaaaaggtatgcaaactttcata 43042033  T
Q  774 acatttc 780  Q
     ||||||    
T  43042034 gcatttc 43042040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7286547 - 7286462
Alignment:
Q  131 acctcatgtcctagtttaacacccatttcttcagaaactcgggtagcaacactcatagcagcaacacgtagtggctgagtacatgc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| | || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7286547 acctcgtgtcctagtttaacacctaattcgtgagcaactcgagcagccacactcatagcagcaacacgacgtggctgagtacatgc 7286462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 709 - 784
Target Start/End: Original strand, 30122739 - 30122813
Alignment:
Q  709 tttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag 784  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  30122739 tttgagtttattgtttgcggagacatctataaaaatacataaaaaa-gatctgcaaagtttcatatcatttcgaag 30122813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 642 - 780
Target Start/End: Original strand, 53311762 - 53311901
Alignment:
Q  642 atgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaa 741  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||    
T  53311762 atgaatttttaaagtgtcaaaacctcaaaaaacaaaacaatagaaatctcaatct-tgaaatcgaattttgagctgattgtttatatagacatctataaa 53311860  T
Q  742 aata---cataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttc 780  Q
    || |   ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  53311861 aacaacacataaaacag-ataagcaaagtttcataacatttc 53311901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 698 - 753
Target Start/End: Original strand, 219040 - 219096
Alignment:
Q  698 taaaatcgaattttgagctcattatttg-cagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  219040 taaaatcaaattttgagctcattgtttgacaaagacatctatagaaatacataaaaa 219096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7285795 - 7285723
Alignment:
Q  314 tggtgatcatgaacagcttggagaaattcatcccgaaaaggatagataggt-agattttcctctcctcctgaa 385  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  7285795 tggtggtcatgaacagcttggagcaattcatcccgataagtataaatgggtaactttttcctctcctcctgaa 7285723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 914 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 38282931 - 38282826
Alignment:
Q  914 aatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatcc 1010  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  38282931 aatgaaatcttgtagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatg-ggaaataaaaattcataattaatttgtcc 38282834  T
Q  1011 ctggtcga 1018  Q
    || |||||    
T  38282833 cttgtcga 38282826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 7285179 - 7285121
Alignment:
Q  450 cttatgtccatccattactgatgccttgatacaatcaatctgctcctcaaacacaaacc 508  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  7285179 cttatctccatccatcacagatgccttgataaaatcaatttggtcctcgaacacaaacc 7285121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 663
Target Start/End: Original strand, 2591492 - 2591521
Alignment:
Q  634 aattaattatgaatttttaaagtgtcaaaa 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2591492 aattaattatgaatttttaaagtgtcaaaa 2591521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 840
Target Start/End: Original strand, 3159244 - 3159384
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttatt 798  Q
    |||| |||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |  ||| ||||||| ||||| |||| | ||  ||||||||    
T  3159244 aaatagaatgttgagttcattgtctgcaaagacatctataaatatacataaaaacg-atctacaaattttcatagcattttgaagacgtttcaatttatt 3159342  T
Q  799 ttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttcc 840  Q
    || ||||| |||   |||  ||||||||||||||||||||||    
T  3159343 tttatttttcaaccaaaatgtgcaaaattgaaattttgttcc 3159384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 753
Target Start/End: Original strand, 19814597 - 19814650
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  19814597 aaatcgaattttgagatgattgtttgcaaagacatctatagaaatacaaaaaaa 19814650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 716 - 753
Target Start/End: Original strand, 29564598 - 29564635
Alignment:
Q  716 tcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29564598 tcattgtttgcagagacatctataaaaatacatgaaaa 29564635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 479800 - 480227
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  479800 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 479898  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  479899 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 479997  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  479998 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 480097  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  480098 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 480196  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  480197 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 480227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 6403147 - 6403574
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6403147 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 6403245  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  6403246 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattttgatttttca 6403344  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6403345 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 6403444  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6403445 aacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 6403543  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6403544 aatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 6403574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 17444384 - 17444812
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17444384 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacgaaacaacagaaatctcgatctataaa-tcaaattt 17444482  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  17444483 tgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 17444581  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  17444582 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 17444681  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17444682 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 17444780  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  17444781 aatttatccctgttcgaagaaatttaattttg 17444812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 41250976 - 41251404
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaatt-atgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  41250976 ttataaattttcgacaaacgacaaattaatttatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctggatctataaa-tcaaatt 41251074  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  41251075 ttgagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttc 41251173  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  41251174 aactgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataag 41251273  T
Q  906 aa--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-at 1000  Q
    ||    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41251274 aaacattcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataat 41251372  T
Q  1001 taatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41251373 taatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 41251404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 35963513 - 35963101
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35963513 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgatctat-aaatcgaattt 35963415  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  35963414 tgagttcattatttgcagagacgtctataaaaatgcat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 35963316  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  35963315 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgacaaga 35963216  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35963215 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaataaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 35963117  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||||||||||    
T  35963116 atttatccctggtcga 35963101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 611 - 999
Target Start/End: Complemental strand, 42442808 - 42442415
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42442808 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatagaaatctcgatctat-aaatcgaattt 42442710  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctat-aaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  42442709 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaaatacat-aaaaaggatttgtaaagtttcatagcatatcgaattcgtttaaatttattttgatttttc 42442611  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  42442610 aactgaaacgtgcaaaattgaaattttgttctgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccataattttgtaggcatgactagaacatgataag 42442511  T
Q  906 aata-tcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcata 999  Q
    || | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42442510 aacattcacaatgaaattttataatttttaaacgagatataaattaa-ctataaattgtttaagaaattcataaatatgagggaataaaaattcata 42442415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 674 - 1032
Target Start/End: Original strand, 31581028 - 31581392
Alignment:
Q  674 caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcata 773  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31581028 caaaacaacggaaatctcgatctataaa-tcgaattttaagctcgttatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaagtttcata 31581125  T
Q  774 acatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagt 870  Q
     |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31581126 ccatttcgaagtcgtttaaatttgttttgatttttcaactgaaacgtgcaaaattgaaattttgtttcgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagt 31581225  T
Q  871 tccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttagg 966  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |    
T  31581226 tccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaag 31581324  T
Q  967 aaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  31581325 aaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctagtcgaagaaatttaattttg 31581392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 45419403 - 45418992
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  45419403 ttataaattttcaacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcgaattt 45419306  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  45419305 tgagttcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 45419207  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  45419206 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 45419107  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45419106 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 45419008  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||| || |||||    
T  45419007 atttatctctagtcga 45418992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 26162048 - 26162473
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  26162048 ttataaatttttgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagagtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctat-aaatcaaattt 26162146  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  26162147 tgagttcattatttgcatagacatctataaaaatacataaaaaa-gatctgtaaagtttcatatcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 26162245  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataa-g 905  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  26162246 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatagtcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggtatgactagaacatgataagg 26162345  T
Q  906 aatatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcatattaa 1003  Q
    |   ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||    
T  26162346 accttcagaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaatt-agttataaattgtttaaaaaattcataattatgagggaataaaaattataattaa 26162444  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26162445 tttatccctggtcgaagaaatttaatttt 26162473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 4554539 - 4554964
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4554539 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 4554637  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  4554638 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaagtatctgtaaagtttcataacatttcgatgtcgtttaaatttatttttatttt-ca 4554735  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcg-tagcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4554736 accaaaaagtgcaaaattgaaattttgttccacgcaagcgtatactaacaagtcaaatttaattctctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 4554835  T
Q  907 ata-tcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    | | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4554836 acattcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcttaattacgagggaataaaaattcataatta 4554934  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  4554935 atttatccatggtcgaagaaatttaatttt 4554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 12756184 - 12756609
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  12756184 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtatcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaa-tctcgacctataaa-tcgaattt 12756281  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  12756282 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatatgtaaaatttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 12756380  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  12756381 accaaaacgtggaaaattgaaattttgttccgcataagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 12756480  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12756481 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatta 12756579  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  12756580 atttatctctagtcgaagaaatttaatttt 12756609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 611 - 1032
Target Start/End: Original strand, 7071880 - 7072307
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |       |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  7071880 ttataaattttcgacaaacgataaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaagtcaaaaaacaaaacaacagaaaactcgaccaataaa-tcgaattt 7071978  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||    
T  7071979 taagctcattatttgcagagatatctataaaaatacat-aaaaataatatgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgattaaatttattttgatttttca 7072077  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  7072078 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttcagcgtaagcgtatacccacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 7072177  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaatt-tttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||  |||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7072178 accttcccaatgaaattttgtagttattaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattacgagggaataaaaattcataatta 7072276  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7072277 atttatccctggtcgaagaaatttaattttg 7072307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 689 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 2286532 - 2286185
Alignment:
Q  689 ctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-t 787  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  2286532 ctcgatctataaa-tcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgtaaagtttcatagcattttgaagtcgt 2286435  T
Q  788 taaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaagcaaatttagttccttaattttgta-g 885  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  2286434 ttaaatttattttgatttttcaactgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgtgtaagcgtatactcacaagcaaatttagtttcctaattttgtagg 2286335  T
Q  886 aatgactagaacattataagaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatga 982  Q
     ||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  2286334 catgactagaacatgataagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaacttaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatga 2286236  T
Q  983 gggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  2286235 ggggat-aaaattcataattaatttatccctagtcgaagaaatttaattttg 2286185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 611 - 952
Target Start/End: Original strand, 32126532 - 32126878
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn-caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  32126532 ttataaattttcgactaatgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaaacaaaacaataaaaatctcaatctataaa-tcgaatt 32126630  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  32126631 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttc 32126729  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||     
T  32126730 aactgaaacgtgaaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataat 32126829  T
Q  906 aa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatt 952  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32126830 aaccttcaaagtgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaatt 32126878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 674 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 18982350 - 18981985
Alignment:
Q  674 caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcata 773  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  18982350 caaaacaatggaaatctcgatctataaa-tcaaattttccgctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-gaaaatgatctgtaaagtttcata 18982253  T
Q  774 acatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaac-atgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttag 869  Q
     ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18982252 gcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaactgaaacgttgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttag 18982153  T
Q  870 ttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttag 965  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| || |||     
T  18982152 ttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaaccttcacgatgaaattttgtaatttttaaacgagataaaaattaa-ttataaattgtttaa 18982054  T
Q  966 gaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  18982053 gaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatctctggtcgaagaaatttaattttg 18981985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 8058689 - 8059104
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8058689 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactaaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 8058787  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  8058788 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa-ggatctgtaaagtttcatatctgttcaaagtcgtttaaaattattttgatttttca 8058886  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgta-gcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtagaatgactagaacattataagaa 907  Q
    |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||    
T  8058887 accaaaacgtgcaaaattaaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtagg----------catgataagaa 8058976  T
Q  908 tat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagatacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcata-ttaa 1003  Q
      | |  |||||||||| ||| | ||||| | |||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8058977 ccttcccaatgaaatttcgtagtctttaaacaagatgcaaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcatatttaa 8059075  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  8059076 tttatccctggtagaagaaatttaatttt 8059104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 612 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 45122029 - 45121703
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| || ||       ||||||||| |||||||||| | ||| | | |||||||    
T  45122029 tataaatttccgacaaacgacaagttaattatgaattttcaaagtgtcagaaactcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgaccaatatatt-gaatttt 45121931  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  45121930 gagctcattttttgcaaagacatctataaaaatacata-aaaatgatctgttaagtttcatagcattttgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaa 45121832  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag-a 906  Q
       |||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |    
T  45121831 ccaaaacgtgaaaaattgaaattttgttccaagtaagcgtatactcacatgtcaaatttagttccctaattttgtacgtatgactaaaacatgataagaa 45121732  T
Q  907 atatcataatgaaattttgtaatttttaa 935  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||    
T  45121731 acttcacaatgaaattttgtagtttttaa 45121703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 790 - 999
Target Start/End: Original strand, 2957668 - 2957882
Alignment:
Q  790 aaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-ga 886  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |     
T  2957668 aaatttattttgatttttcaactgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagggtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggc 2957767  T
Q  887 atgactagaacattataagaatat-cataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgag 983  Q
    ||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||| ||||||    
T  2957768 atgactagaacatgataagaacctacacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataaatatgag 2957866  T
Q  984 ggaataaaaattcata 999  Q
    ||||||||||||||||    
T  2957867 ggaataaaaattcata 2957882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 611 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 771555 - 771396
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  771555 ttataaattttcgacaaacaacaaattaattatgaatttttaa-gtgtcaaaagctcaaaaaacaaaataacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 771458  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcata 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  771457 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatttgtagagtttcata 771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 849 - 1031
Target Start/End: Original strand, 44084185 - 44084373
Alignment:
Q  849 tatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgagataca 944  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||| ||  | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44084185 tatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaaaatgataataaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagataca 44084284  T
Q  945 agttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    | |||||| ||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44084285 aattaatt-ataaattatttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 44084373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 845 - 1012
Target Start/End: Complemental strand, 26238528 - 26238357
Alignment:
Q  845 agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat-cataatgaaattttgtaatttttaac-gaga 940  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  26238528 agcgtatactcacaaggcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaatgaga 26238429  T
Q  941 tacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcatattaatttatccct 1012  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26238428 tacaaattaatt-ataaattgtttataaaattcataattacgaggggataaaaattcataataatttatccct 26238357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 611 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 2286728 - 2286648
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctc 691  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  2286728 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctc 2286648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16405952 - 16405897
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 666  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405952 ttataaattttcgacaaatgataaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagct 16405897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 700 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 26591775 - 26591634
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag-tcttaaaatttatt 798  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||| | ||  ||||||||    
T  26591775 aaatcaaattttgagctaattgtttgtagagacatctataaaaatacata-aaaaggatctgcaaagtttcgtagcatttcaaagatatttcaatttatt 26591677  T
Q  799 ttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccg 841  Q
    || ||||| |||   |||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  26591676 tttatttttcaaccaaaacgtgcgaaattgcaattttgatccg 26591634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 967 - 1032
Target Start/End: Complemental strand, 42442423 - 42442356
Alignment:
Q  967 aaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  42442423 aaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctggttgaagaaatttaattttg 42442356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 15512230 - 15512176
Alignment:
Q  699 aaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15512230 aaaatctaattttgagttgattttttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 15512176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 967 - 1032
Target Start/End: Original strand, 2957874 - 2957941
Alignment:
Q  967 aaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  2957874 aaattcataattatgaggaaataaaaattcataattaatttatccctggttgaagaaatttaattttg 2957941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 699 - 779
Target Start/End: Original strand, 17373278 - 17373357
Alignment:
Q  699 aaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacattt 779  Q
    ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  17373278 aaaattgaattttgagttgattgtttgcagagacatatatagaaatacat-aaaaaggatatgataaatttcatagcattt 17373357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 966 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 8147814 - 8147747
Alignment:
Q  966 gaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  8147814 gaaattcataattatgaggaaatgaaaattcataattaatttatctctggtcgaagaaatttaatttt 8147747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 704 - 754
Target Start/End: Original strand, 816494 - 816544
Alignment:
Q  704 cgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaa 754  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  816494 cgaattttgatctgattgtttgcagagatatccataaaaatacataaaaaa 816544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 699 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40654019 - 40653965
Alignment:
Q  699 aaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40654019 aaaattgaattttgagttgattgtttgcagagacatatatagaaatacataaaaa 40653965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 7434243 - 7433831
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7434243 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatcttgatctat-aaatcgaattt 7434145  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  7434144 tgagttcattatttgcagagacatctataaaaatgcat-aaaaaggttctgtaaagtttcatagcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 7434046  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  7434045 actgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgacaaga 7433946  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7433945 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgttaaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 7433847  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||||||||||    
T  7433846 atttatccctggtcga 7433831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 612 - 1032
Target Start/End: Original strand, 42310286 - 42310712
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  42310286 tataaattttcgacaaacgacaaattaattatgattttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcaatcaataaa-tcgaatttt 42310384  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  42310385 gagctcattatttgcagagagatctataaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaa 42310483  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  42310484 ctgaaacatgtaaaattgaaattttgtttcgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataagaa 42310583  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42310584 ccttcacaatgaaattttgtaatttttaaactagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgatggaataaaaattcataattaa 42310682  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42310683 tttatccctggtcgaagaaatttaattttg 42310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 611 - 1016
Target Start/End: Complemental strand, 17446114 - 17445705
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  17446114 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 17446016  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  17446015 cgagctcattatttgcatagacatctat-aaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcataacatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 17445918  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  17445917 accaaaacttgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccttaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 17445818  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17445817 accttcataatgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataatta 17445719  T
Q  1003 atttatccctggtc 1016  Q
    ||||||||||||||    
T  17445718 atttatccctggtc 17445705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 611 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 23313816 - 23313404
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23313816 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaatggaaatctcgatctat-aaatcaaattt 23313718  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  23313717 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatatcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 23313619  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  23313618 actgaaacgttcaaaattgaaattttgttctgcgtaagcgtatactcataagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataaga 23313519  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23313518 accttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaataaattcataattataagggaataaaaattcataatta 23313420  T
Q  1003 atttatccctggtcga 1018  Q
    ||||||||||||||||    
T  23313419 atttatccctggtcga 23313404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 3829803 - 3829378
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3829803 ttataaattttcgccaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 3829705  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  3829704 tgaactcattatttgcagagacatctataaaaatacata-aaaaggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 3829606  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  3829605 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaactttgtaggcatgactagaacatgataaga 3829506  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3829505 accttcacaatgaaa-tttgtagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataatta 3829408  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3829407 atttatccctggtcgaagaaatttaatttt 3829378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 612 - 1032
Target Start/End: Original strand, 32981402 - 32981828
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatttt 711  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32981402 tataaatcttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagcgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgatctataaa-tcgaatttt 32981500  T
Q  712 gagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  32981501 gagctcattatttgcagagacatctaaaaaaatacat-aaaaaggatctgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttcaa 32981599  T
Q  811 ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataagaa 907  Q
       |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  32981600 caaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcatttactcacaagtcaaatttagttcccaaattttgtaggcatgactagaacatgataagaa 32981699  T
Q  908 -tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaa 1003  Q
       ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  32981700 ccttcacaataaaattttataatttttcaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagagaataaaaatttataattaa 32981798  T
Q  1004 tttatccctggtcg-agaaatttcattttg 1032  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32981799 tttatccctggtcgaagaaatttaattttg 32981828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 611 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 35908350 - 35908004
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnn-caaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaatt 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  35908350 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaaacaaaacaatggaaatctcgacctataaa-tcgaatt 35908252  T
Q  710 ttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttac 808  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||||| |    
T  35908251 ttgagctcattattttcagatacatctataaaaatacata-aaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaaatcgtttaaatttattatgatttttc 35908153  T
Q  809 aattgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  35908152 aaccaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtatgcatgactagaacatgataag 35908053  T
Q  906 aa-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatt 952  Q
    ||   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  35908052 aaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaatt 35908004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Original strand, 41971602 - 41972029
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |        |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  41971602 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaacttttaaagtgtcaaaaattcaaaaaataaaacaacggaaatttcgacctataaa-tcgaattt 41971700  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  41971701 tgagctcattatttgcagagacgtctataaaaatacat-aaaaaggatttgtaaagttttatagcatttcaaagtcgtttaaatttattttgatttttca 41971799  T
Q  810 a-ttgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataag 905  Q
    |    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  41971800 accaaaaacgtgcaaaattgaaattttgttcagcgtaagcgtatactcacaggtcaaatttaattccctaattttgtaggcatgactagaacatgataag 41971899  T
Q  906 aa-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-att 1001  Q
    ||   ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || || |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41971900 aaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgaggtataaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatt 41971998  T
Q  1002 aatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    | ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  41971999 actttatcccttgtcgaagaaatttaatttt 41972029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 611 - 988
Target Start/End: Original strand, 11957695 - 11958076
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  11957695 ttataaatttttgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctat-aaatcgaattt 11957793  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  11957794 tgagctcattacttgcaaggacatctataaaaatacat-aaaaaggatacgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 11957892  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||| || | |||| |||||||| ||||||    
T  11957893 acaaaaacgtgcaaaattgcaattttgttccgcataagcgtatactcacaagtcaaattcaattcactaattttctaggcatgattagaacatgataaga 11957992  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaattttt-aacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaat 988  Q
    |   ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11957993 accttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaa-ttataaattatttaagaaattcataattatgagggaat 11958076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 611 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 28463758 - 28463486
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||  |||| |||| ||||||| || |||||    
T  28463758 ttataaattttcgacaaaagacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaacgaaaatatcgacctataaa-tcaaattt 28463660  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||    
T  28463659 tgagctcattatttgcagagacatctattaaaatacata-aaaatgatatgtgaaatttcatagcattttgaagtcgtttcaatttattttgatttttca 28463561  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttg 882  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||    
T  28463560 accaaaacatgcaaaattgaaattttgttccgaataagcgtatactcacaggtcaaaattaattccctaattttg 28463486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 612 - 831
Target Start/End: Original strand, 321024 - 321243
Alignment:
Q  612 tataaattttcgacaaac-gaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  321024 tataaatttttgacaaaatgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 321122  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  |    
T  321123 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacat-aaaaatgatccgtaaagtttcataacatttcgaagtcgtttacatttattttgatttttta 321221  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaa 831  Q
    |    |||||||||||||||||    
T  321222 accagaacatgcaaaattgaaa 321243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 845 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 33490293 - 33490101
Alignment:
Q  845 agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgtaga-atgactagaacattataagaatat-cataatgaaattttgtaatttttaa-cgaga 940  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33490293 agcgtatacccgcaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagaacatgataataaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgaga 33490194  T
Q  941 tacaagttaatttataaatggtt-aggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||| | |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  33490193 tacgaattaatt-ataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattaataattaatttatccctagtcgaagaaatttaatttt 33490101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 17744859 - 17744779
Alignment:
Q  699 aaaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttc 780  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  17744859 aaaatcaaattttgagctgattgtttgcagagacatctataagaatacata-aaaaggatttgaaaaatttcatagcatttc 17744779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 611 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 18382 - 18036
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18382 ttataaattttcgacaaacgacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcgatctat-aaatcaaattt 18284  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  18283 taagctcattatttgcaaagacatctataaaaatacat-aaaagggatttgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattttgatttttca 18185  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgt-agaatgactagaacattataaga 906  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18184 actgaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagcgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaagcatgactagaacatgataaga 18085  T
Q  907 a--tatcataatgaaattttgt-aatttttaacgagatacaagttaatt 952  Q
    |    ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  18084 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgatatacaaattaatt 18036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 611 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 53728 - 53302
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53728 ttataaattttcgacaaacgataaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaaactcaaaaaacaaaataatggaaatctcgacctataaa-tcgaattt 53630  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttaca 809  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  53629 tgagctcattatttgcagagacatttataaaaatatat-aaaaaggatatgtaaagtttcatagcatttcgaagtcgtttaaatttattatgatttttca 53531  T
Q  810 attgaaacatgcaaaattgaaattttgttccgcgt-agcgtatactcacaag-caaatttagttccttaattttgta-gaatgactagaacattataaga 906  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    
T  53530 accaaaacgtgcaaaattgaaattttgttccgcgtaagtgtatactcacaagtcaaatttagttccctaattttgtaggcatgactagagcatgataaga 53431  T
Q  907 a-tatcataatgaaattttgtaat-ttttaacgagatacaagttaatttataaa-tggttaggaaattaataattatgagggaataaaaattcat-atta 1002  Q
    |   ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  53430 accttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaa-ttataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataatca 53332  T
Q  1003 atttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  53331 atttatctctggtcgaagaaatttaatttt 53302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 611 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 32037 - 31896
Alignment:
Q  611 ttataaattttcgacaaacgaaaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattt 710  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  32037 ttataaattttccaaaaacaacaaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctcaaaaaacaaaacaacagaaatctcaacttataaa-tcgaattt 31939  T
Q  711 tgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaa 753  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31938 tgagctcattatttgcaaagacatttataaaaatacataaaaa 31896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 634 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 35603 - 35485
Alignment:
Q  634 aattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagaca 733  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||       |||||||||| |||  || | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35603 aattaattatgaatttttaaagcgtcaaaaactcaaaaaacaaaacaacaaaaacttcaacctat-aaatcgaattttgtgctaattatttgcagtgaca 35505  T
Q  734 tctataaaaatacataaaaa 753  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  35504 tctatagaaatacataaaaa 35485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2142 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2142
Description:

Target: scaffold2142; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 966 - 1031
Target Start/End: Complemental strand, 986 - 919
Alignment:
Q  966 gaaattaataattatgagggaataaaaattcat-attaatttatccctggtcg-agaaatttcatttt 1031  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  986 gaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaatttt 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 18104 - 17900
Alignment:
Q  633 aaattaattatgaatttttaaagtgtcaaaagctnnnnnnncaaaacaacagaaatctcgatctataaaatcgaattttgagctcattatttgcagagac 732  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||        ||||||| | ||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |     
T  18104 aaattaattatgaatttttaaagtatcaaaaactcaaaaat-aaaacaataaaaatctcaaccta-aaagtcgaattttaagctcattgtttgcagataa 18007  T
Q  733 atctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaagtc-ttaaaatttattttgattttacaattgaaacatgcaaaattgaaa 831  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||||| | ||  ||||| |||| ||||| |||   |||| |||||||||||||    
T  18006 atctataaaattacataaaag-ggatctccaaagtttcatatcatttcgaagacgttgcaatttgtttttatttttcaa-ccaaacgtgcaaaattgaaa 17909  T
Q  832 ttttgttcc 840  Q
    |||||||||    
T  17908 ttttgttcc 17900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 784
Target Start/End: Original strand, 1890 - 1973
Alignment:
Q  700 aaatcgaattttgagctcattatttgcagagacatctataaaaatacataaaaaaggatatgtaaagtttcataacatttcgaag 784  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  1890 aaatcgaatttcgaggtgattgtttgcaaagacatctataaaaatagat-aaaaaggatatgtgaactttcatagaatttcgaag 1973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University