View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4957_low_9 (Length: 399)

Name: NF4957_low_9
Description: NF4957
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4957_low_9
NF4957_low_9
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-394)||(15069325-15069718)
chr8 (1-399)||(18811461-18811856)
chr8 (1-399)||(27827738-27828133)
chr8 (12-399)||(43080355-43080739)
chr8 (12-393)||(31577488-31577868)
chr8 (12-387)||(34255656-34256032)
chr8 (39-387)||(4732300-4732648)
chr8 (19-370)||(17848308-17848659)
chr8 (68-387)||(5591527-5591846)
chr8 (12-249)||(41366144-41366383)
chr8 (210-399)||(21481249-21481438)
chr8 (192-389)||(41383416-41383613)
chr8 (219-378)||(10684838-10684997)
chr8 (219-378)||(35744744-35744903)
chr8 (12-117)||(29542940-29543045)
chr8 (273-380)||(18853735-18853842)
chr8 (54-134)||(4819484-4819564)
chr8 (54-134)||(16756505-16756585)
chr8 (54-134)||(28328764-28328844)
chr8 (55-134)||(33033496-33033575)
chr8 (68-134)||(15945514-15945580)
chr8 (42-134)||(18853981-18854073)
chr8 (54-134)||(28891620-28891700)
chr8 (219-378)||(6813047-6813206)
chr8 (209-294)||(10380449-10380534)
chr8 (42-134)||(26300515-26300607)
chr8 (319-367)||(26300792-26300840)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-399)||(44725282-44725680)
chr7 (1-399)||(38394693-38395086)
chr7 (12-399)||(1048486-1048870)
chr7 (1-399)||(7093647-7094042)
chr7 (12-399)||(22135510-22135894)
chr7 (12-399)||(40550537-40550921)
chr7 (1-399)||(36157-36552)
chr7 (12-394)||(7350848-7351227)
chr7 (18-393)||(13289699-13290074)
chr7 (12-387)||(48490047-48490422)
chr7 (12-387)||(24816557-24816933)
chr7 (12-393)||(26213433-26213813)
chr7 (12-387)||(18391322-18391697)
chr7 (12-387)||(6593684-6594059)
chr7 (39-390)||(47675315-47675666)
chr7 (12-387)||(6047203-6047578)
chr7 (165-399)||(31159049-31159270)
chr7 (192-399)||(24749294-24749501)
chr7 (204-399)||(7471367-7471562)
chr7 (12-169)||(31157482-31157636)
chr7 (192-384)||(21678781-21678973)
chr7 (204-391)||(28486280-28486467)
chr7 (215-373)||(20298048-20298206)
chr7 (144-369)||(6570647-6570872)
chr7 (68-365)||(3890642-3890938)
chr7 (286-379)||(4295409-4295502)
chr7 (219-378)||(12405691-12405850)
chr7 (219-378)||(24261897-24262056)
chr7 (68-247)||(3903694-3903869)
chr7 (206-378)||(16884268-16884440)
chr7 (192-271)||(4294091-4294170)
chr7 (192-266)||(9679498-9679572)
chr7 (54-339)||(7070446-7070731)
chr7 (273-378)||(5817759-5817864)
chr7 (54-339)||(25352003-25352288)
chr7 (54-134)||(3324032-3324112)
chr7 (42-134)||(21988097-21988189)
chr7 (54-134)||(25406270-25406350)
chr7 (305-366)||(3903917-3903978)
chr7 (273-378)||(18413066-18413171)
chr7 (68-129)||(44015924-44015985)
chr7 (42-134)||(18412835-18412927)
chr7 (42-87)||(5818051-5818096)
chr7 (42-87)||(9186022-9186067)
chr7 (42-87)||(21645202-21645247)
chr7 (42-87)||(49090854-49090899)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (2-399)||(6745766-6746163)
chr5 (12-399)||(18467382-18467769)
chr5 (1-399)||(34478605-34479000)
chr5 (42-399)||(10750396-10750753)
chr5 (42-399)||(15356073-15356430)
chr5 (42-399)||(23665744-23666101)
chr5 (12-399)||(31543431-31543815)
chr5 (12-387)||(29721017-29721392)
chr5 (39-387)||(9788399-9788747)
chr5 (39-387)||(16407977-16408325)
chr5 (1-276)||(20505389-20505664)
chr5 (12-387)||(40380758-40381133)
chr5 (12-387)||(16545079-16545457)
chr5 (12-367)||(42427582-42427937)
chr5 (103-387)||(26171409-26171693)
chr5 (13-387)||(13694293-13694667)
chr5 (111-367)||(534421-534677)
chr5 (207-399)||(658716-658908)
chr5 (207-371)||(20043710-20043874)
chr5 (192-399)||(27911130-27911337)
chr5 (39-183)||(13486871-13487015)
chr5 (215-391)||(25806167-25806343)
chr5 (192-359)||(18510788-18510955)
chr5 (12-108)||(26173701-26173797)
chr5 (219-378)||(33790669-33790828)
chr5 (219-378)||(37557198-37557357)
chr5 (191-317)||(13294851-13294977)
chr5 (224-378)||(27449181-27449335)
chr5 (206-378)||(31397566-31397738)
chr5 (39-179)||(32584706-32584846)
chr5 (273-378)||(43598140-43598245)
chr5 (273-378)||(43603632-43603737)
chr5 (273-378)||(43609124-43609229)
chr5 (39-95)||(534672-534728)
chr5 (54-129)||(28788583-28788658)
chr5 (273-373)||(34842024-34842124)
chr5 (54-134)||(43596310-43596390)
chr5 (54-134)||(43629104-43629184)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (1-399)||(18098354-18098752)
chr3 (12-399)||(4309704-4310091)
chr3 (1-399)||(43226754-43227152)
chr3 (1-394)||(5898091-5898484)
chr3 (1-399)||(10957509-10957904)
chr3 (12-399)||(456584-456968)
chr3 (1-399)||(5192327-5192722)
chr3 (42-399)||(6065017-6065374)
chr3 (12-394)||(11168783-11169162)
chr3 (1-393)||(7769238-7769630)
chr3 (68-399)||(23634123-23634453)
chr3 (12-387)||(23199289-23199664)
chr3 (53-387)||(27421327-27421661)
chr3 (39-387)||(37407331-37407679)
chr3 (39-387)||(5259500-5259848)
chr3 (12-387)||(10209843-10210218)
chr3 (12-387)||(29811511-29811886)
chr3 (12-387)||(4599870-4600245)
chr3 (12-387)||(7762913-7763288)
chr3 (39-387)||(9635301-9635649)
chr3 (12-387)||(6717155-6717530)
chr3 (12-387)||(10056887-10057262)
chr3 (12-387)||(10059109-10059484)
chr3 (12-387)||(10061331-10061706)
chr3 (12-387)||(10063553-10063928)
chr3 (12-387)||(10065775-10066150)
chr3 (68-387)||(22834215-22834534)
chr3 (39-367)||(32891752-32892080)
chr3 (37-345)||(15821861-15822169)
chr3 (12-387)||(15830392-15830767)
chr3 (192-394)||(28101382-28101584)
chr3 (192-399)||(3315359-3315566)
chr3 (192-394)||(42990981-42991183)
chr3 (192-399)||(43422844-43423049)
chr3 (12-141)||(5192816-5192942)
chr3 (192-389)||(53917048-53917245)
chr3 (225-393)||(1619882-1620049)
chr3 (250-364)||(25634589-25634703)
chr3 (291-387)||(53597915-53598011)
chr3 (206-371)||(32479681-32479846)
chr3 (54-339)||(54189161-54189446)
chr3 (206-378)||(8516435-8516607)
chr3 (54-134)||(10612022-10612102)
chr3 (273-387)||(23409743-23409857)
chr3 (54-339)||(10897656-10897941)
chr3 (54-134)||(6304167-6304247)
chr3 (54-134)||(10204936-10205016)
chr3 (54-134)||(22625224-22625304)
chr3 (54-134)||(29913200-29913280)
chr3 (54-134)||(47882133-47882213)
chr3 (55-134)||(10098041-10098120)
chr3 (194-367)||(30844876-30845049)
chr3 (68-134)||(16458322-16458388)
chr3 (42-87)||(9602711-9602756)
chr3 (42-87)||(16263540-16263585)
chr3 (54-134)||(28489992-28490072)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (12-399)||(51750735-51751119)
chr1 (1-399)||(27338316-27338714)
chr1 (1-399)||(28841120-28841515)
chr1 (1-399)||(28202883-28203280)
chr1 (12-399)||(16226866-16227250)
chr1 (1-399)||(20300829-20301224)
chr1 (12-399)||(47178060-47178444)
chr1 (97-399)||(51758232-51758534)
chr1 (12-394)||(8348265-8348641)
chr1 (12-393)||(13126931-13127310)
chr1 (40-392)||(3805353-3805712)
chr1 (17-387)||(50168506-50168875)
chr1 (12-387)||(31657846-31658221)
chr1 (12-387)||(28222572-28222947)
chr1 (192-399)||(25250655-25250862)
chr1 (192-392)||(16429653-16429853)
chr1 (204-399)||(6996282-6996477)
chr1 (198-399)||(50078174-50078375)
chr1 (192-391)||(31736850-31737049)
chr1 (192-399)||(29003345-29003552)
chr1 (198-399)||(28997635-28997836)
chr1 (115-387)||(16456360-16456632)
chr1 (233-387)||(3157305-3157459)
chr1 (192-399)||(31424408-31424603)
chr1 (219-378)||(41397593-41397752)
chr1 (17-83)||(776019-776085)
chr1 (64-130)||(45654910-45654976)
chr1 (54-134)||(2400469-2400549)
chr1 (68-134)||(14997891-14997957)
chr1 (313-378)||(19359412-19359477)
chr1 (42-87)||(19359703-19359748)
chr1 (273-378)||(47099392-47099497)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-399)||(72700-73098)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-399)||(22133803-22134198)
chr4 (12-399)||(16933345-16933729)
chr4 (12-399)||(22781934-22782318)
chr4 (1-399)||(11007754-11008149)
chr4 (1-399)||(22045901-22046296)
chr4 (1-390)||(12402279-12402668)
chr4 (1-399)||(12400004-12400402)
chr4 (42-399)||(9175696-9176053)
chr4 (12-387)||(52094513-52094888)
chr4 (12-387)||(8394060-8394435)
chr4 (144-399)||(12395186-12395440)
chr4 (50-387)||(5872457-5872794)
chr4 (39-387)||(7123350-7123698)
chr4 (12-387)||(5136734-5137109)
chr4 (12-390)||(26558348-26558726)
chr4 (39-363)||(5206841-5207165)
chr4 (137-387)||(12743204-12743454)
chr4 (39-358)||(4588623-4588942)
chr4 (205-399)||(47563507-47563701)
chr4 (211-393)||(18536898-18537079)
chr4 (204-391)||(36920884-36921071)
chr4 (207-387)||(3578083-3578263)
chr4 (207-387)||(10113622-10113802)
chr4 (192-389)||(22802111-22802308)
chr4 (192-399)||(14788807-14789014)
chr4 (12-134)||(12749089-12749211)
chr4 (192-399)||(16454055-16454262)
chr4 (12-134)||(12740883-12741005)
chr4 (291-399)||(36379036-36379144)
chr4 (219-378)||(9224978-9225137)
chr4 (42-134)||(15313174-15313266)
chr4 (54-129)||(4559067-4559142)
chr4 (46-134)||(9225222-9225310)
chr4 (47-179)||(18913739-18913871)
chr4 (273-378)||(16624579-16624684)
chr4 (42-134)||(5147078-5147170)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-399)||(21519877-21520275)
chr2 (42-399)||(36560365-36560722)
chr2 (1-399)||(19503522-19503917)
chr2 (12-399)||(35217167-35217551)
chr2 (12-387)||(28569617-28569994)
chr2 (205-399)||(22405317-22405511)
chr2 (13-340)||(42019041-42019368)
chr2 (192-387)||(6263528-6263723)
chr2 (291-393)||(34574631-34574733)
chr2 (219-378)||(19348631-19348790)
chr2 (54-129)||(17932982-17933057)
chr2 (54-339)||(2736856-2737141)
chr2 (273-378)||(25403058-25403163)
chr2 (54-134)||(39680902-39680982)
chr2 (273-371)||(23079048-23079146)
chr2 (54-134)||(20054005-20054085)
chr2 (42-134)||(25402827-25402919)
chr2 (68-339)||(22716492-22716763)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (42-399)||(22824-23181)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-399)||(34248-34651)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (42-399)||(33309587-33309944)
chr6 (12-394)||(26067592-26067971)
chr6 (12-393)||(25462660-25463040)
chr6 (12-387)||(16651578-16651954)
chr6 (12-387)||(16553318-16553693)
chr6 (12-387)||(16629874-16630249)
chr6 (39-387)||(5408247-5408595)
chr6 (39-387)||(5412572-5412920)
chr6 (12-392)||(30443998-30444378)
chr6 (12-387)||(12157961-12158336)
chr6 (12-387)||(34165526-34165901)
chr6 (174-399)||(26931919-26932144)
chr6 (127-393)||(12936558-12936824)
chr6 (12-282)||(16567733-16568003)
chr6 (127-338)||(12910882-12911093)
chr6 (211-394)||(17012766-17012948)
chr6 (192-394)||(15533976-15534178)
chr6 (255-399)||(3395094-3395238)
chr6 (187-394)||(3631312-3631519)
chr6 (218-392)||(26944229-26944403)
chr6 (219-378)||(14738146-14738305)
chr6 (226-371)||(33331027-33331172)
chr6 (54-134)||(17694096-17694176)
chr6 (54-339)||(25942320-25942605)
chr6 (64-200)||(10456883-10457019)
chr6 (54-134)||(13879595-13879675)
chr6 (32-123)||(22350194-22350285)
chr6 (54-134)||(14738390-14738470)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (12-399)||(322-706)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (39-387)||(115245-115593)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (43-258)||(137-352)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (211-394)||(26284-26466)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (13-365)||(26568-26920)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (192-399)||(80564-80771)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (192-399)||(50716-50923)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (192-391)||(826-1025)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (219-378)||(14883-15042)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (219-375)||(454-610)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (206-378)||(149529-149701)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (54-134)||(17181-17261)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (313-378)||(18518-18583)
scaffold0188 (42-134)||(18757-18849)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (42-87)||(4059-4104)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15069718 - 15069325
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069718 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 15069619  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069618 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcgatagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 15069519  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15069518 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtagagttg 15069419  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  15069418 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcagttggttcatttgctact 15069325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18811856 - 18811461
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811856 ccctcttgagacacttaggctctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 18811760  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18811759 gtaacagtgccttccttgccatagaccatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaaaagtatagctttatcctcatcctcaa 18811660  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  18811659 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttg 18811560  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18811559 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 18811461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27828133 - 27827738
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828133 ccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 27828037  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27828036 gtaacagtgccttccttgccatatagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataacttgatcctcatcctcaa 27827937  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |    
T  27827936 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcg 27827837  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27827836 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 27827738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 43080739 - 43080355
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080739 cacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 43080643  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080642 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 43080543  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| |||  |||||||    
T  43080542 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgttttagga 43080443  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43080442 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 43080355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 393
Target Start/End: Original strand, 31577488 - 31577868
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||||||||  | || || || ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31577488 cacttaggccttcaccattttaatcaattctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgcc 31577587  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31577588 ttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattcaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctca 31577687  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  31577688 atattctccaagtcatcatggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccattgactccaccatcttgaat-agtagagttgttgctttagga 31577786  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  31577787 attgccgaagagccaaagactttgtcatatacacagactccaactttgaccacatcgatgacgcaattggttccttcgctac 31577868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 34255656 - 34256032
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34255656 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 34255755  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcct-catcctcaagttgcacctc 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||||    
T  34255756 ttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgttcttcgtcctcaagttgcacctc 34255855  T
Q  211 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 310  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  34255856 aatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagg 34255955  T
Q  311 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34255956 aattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgttgcggttggttcctt 34256032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4732648 - 4732300
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4732648 ctctcatgtccttggacttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgctatagagcatggtatcctt 4732549  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4732548 gaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagtcttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttg 4732449  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4732448 ttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtca 4732349  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| |  |||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||    
T  4732348 tatacaatgtctccaactttgaccacatcgacgccacggtaggttcctt 4732300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17848659 - 17848308
Alignment:
Q  19 gccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttg 118  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  17848659 gccttcaccgttttcatcagctctcaagtccttggacttggtttgctccttggttctcaaagcagcttgaacttcttccaaggtgacagtgcctttttag 17848560  T
Q  119 ccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattct 218  Q
    ||||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17848559 ccataaagcatgatatccttgaaagattcaaatgatctcggtagagcacacaagaagagtataattttatcttcatccttaagatgcacctcaatattct 17848460  T
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17848459 ccaagtcatcaaggattgtattgaacttcgtaagttactccatgatgaactttgactccaacatcttcaatgagtagagttgttgctttaggaatttccg 17848360  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgat 370  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17848359 atgagccaaagagattgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgat 17848308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 68 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5591846 - 5591527
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcac 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  5591846 ttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcac 5591747  T
Q  168 acaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggc 267  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | | ||     
T  5591746 acaacaagagtatagttttatcttcgtcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctctgtcacggt 5591647  T
Q  268 ctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  5591646 ctttaactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatc 5591547  T
Q  368 gatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    || | |||||||||||||||    
T  5591546 gacgccgcggttggttcctt 5591527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Original strand, 41366144 - 41366383
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41366144 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgcc 41366243  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    || ||||||||||||||||||||  || || ||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  41366244 ttttttgccatagagcatggtatccttaaaggatccaaatgatctcggtaaaacacacaacaagagtatagctttatcttcgtcctcaatttgcacctca 41366343  T
Q  212 atattctccaagtc--atcaaggattttgttgaactccgt 249  Q
    || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41366344 atgttctccaaatcatatcaaggattttgttgaactccgt 41366383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 210 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21481438 - 21481249
Alignment:
Q  210 caatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttag 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||  |||| |||| | ||||| ||||||    
T  21481438 caatatactccaagtcatcaaggattctgttgaactccgcaaggttctccatgatggtctttgactctaccatcttgaatgagtaaaattgtttctttag 21481339  T
Q  310 gaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21481338 gaattggcgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttggttcattcgctacttctct 21481249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41383613 - 41383416
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  |||||| | ||| |    
T  41383613 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatctcaaatga 41383514  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttg 389  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41383513 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacatcgatgtcgcggttgtttcctttg 41383416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10684997 - 10684838
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  10684997 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 10684898  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10684897 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 10684838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 35744744 - 35744903
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | || ||| |     
T  35744744 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtct 35744843  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35744844 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 35744903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29543045 - 29542940
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  29543045 cacttaggccttcactgttttcatccgctctcaagttcttggacttggtcaactccttgggtcttaaagccgcttgaacttcctccatggtgacagtgcc 29542946  T
Q  112 ttcttt 117  Q
    ||||||    
T  29542945 ttcttt 29542940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18853842 - 18853735
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||     
T  18853842 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaatttagcccacatcgatgc 18853743  T
Q  373 cgcggttg 380  Q
    ||||||||    
T  18853742 cgcggttg 18853735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 4819484 - 4819564
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  4819484 acttggttaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 4819564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 16756505 - 16756585
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16756505 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 16756585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28328844 - 28328764
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  28328844 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 28328764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33033575 - 33033496
Alignment:
Q  55 cttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33033575 cttggttaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccttctttgccataaagcattgtat 33033496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15945580 - 15945514
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  15945580 ttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcattgtat 15945514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18854073 - 18853981
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  18854073 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 18853981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28891700 - 28891620
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  28891700 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgctctctttgccataaagcatagtat 28891620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 6813047 - 6813206
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  || | ||||||| |||| |  ||  |||||||||||   ||| ||||||||||||  || | || || ||     
T  6813047 ccaagtcatcaagaattttgttaaattttgtcaattgctccgtgattgatttagactccaccatcttcaatgagtagagttgttgtttcaagagtttcct 6813146  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6813147 atgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacattgatgtcgcggt 6813206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 294
Target Start/End: Original strand, 10380449 - 10380534
Alignment:
Q  209 tcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagta 294  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||  | |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10380449 tcaatgttcaccaaatcatcaaagattttgttgaattgcgccaattgctttatgatggcttttgactccaccatcccgaatgagta 10380534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 26300515 - 26300607
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  26300515 tcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 26300607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 367
Target Start/End: Original strand, 26300792 - 26300840
Alignment:
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  26300792 atgagccaaagattttgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatc 26300840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 44725680 - 44725282
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725680 ccctcttaagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 44725581  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725580 ataacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtatagcacaaaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 44725481  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44725480 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccataagttgctctatgatggcctttgactccaccatcctgaataagtagagttg 44725381  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44725380 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccgcggttggttcctttgctacttctct 44725282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38395086 - 38394693
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38395086 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 38394990  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394989 gtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcg--agagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 38394892  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  38394891 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtagagttg 38394792  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38394791 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 38394693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Original strand, 1048486 - 1048870
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048486 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 1048582  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048583 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcgatagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 1048682  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1048683 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 1048782  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1048783 attgccgatgcgccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 1048870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 7093647 - 7094042
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||     ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093647 ccctcttgagacacttaggccttcaccatgttcatggg---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 7093743  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7093744 gtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataaatttatcctcatcctcaa 7093843  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  7093844 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttg 7093943  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7093944 ttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctct 7094042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22135894 - 22135510
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135894 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 22135798  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22135797 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 22135698  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22135697 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 22135598  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22135597 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 22135510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40550921 - 40550537
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40550921 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 40550825  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550824 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 40550725  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  40550724 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 40550625  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40550624 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 40550537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36552 - 36157
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36552 ccctcttgagacacttaggccttcatcgtgttcatgag---tcaagtccttggagttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaag 36456  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36455 gtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatttttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaataagagtatagctttatcctcatcctcaa 36356  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36355 gttgtacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtagagttg 36256  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  36255 ttgctttaggaattgccgatgagctaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttcctttgctacttctct 36157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Original strand, 7350848 - 7351227
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350848 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 7350944  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7350945 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 7351044  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  7351045 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgactctaccatcttgaatgagtagagttgttgctttagga 7351144  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7351145 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctact 7351227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Original strand, 13289699 - 13290074
Alignment:
Q  18 ggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttcttt 117  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13289699 ggccttcaaagttttcatcatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagttgtttgaacttcttccaatgtgacagtgccttcttt 13289798  T
Q  118 gccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattc 217  Q
    |||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13289799 gccatagaacatggtatccatgaaagattaaaaagatctcggtatagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcgtcaagatgcacctccatattc 13289898  T
Q  218 tccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgcc 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13289899 tccaagtcatcaaggaatttgttgaactccataagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattacc 13289998  T
Q  318 gatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13289999 gatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcaatgtcccggttggttcctttgctac 13290074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 48490422 - 48490047
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48490422 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 48490323  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || || |||||||||| |||||||    
T  48490322 ttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacgacaagagtacagccttttcttcgtcctcaagtttcacctca 48490223  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  48490222 atgttctccaaatcattaaggattttgttgaactccgttaaatgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 48490123  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||    
T  48490122 attgcctatgagccaaagattttgtaatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcagtaggttcctt 48490047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 24816557 - 24816933
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||| |||||| | || ||||| | || ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816557 cacttatgccttccccgttttcatcagctttcaagttcttggactgggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 24816656  T
Q  112 ttctttgccat-------agagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttg 204  Q
    |||||| ||||       |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||    
T  24816657 ttcttttccatagtccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaatatcttggtagagaacacaacaagagtatagctttaacttcatcttcaagatg 24816756  T
Q  205 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttac 304  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  24816757 caccttaatcatctccaagtcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgaatccaccatcttgaatgagtagagttgttgc 24816856  T
Q  305 tttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||      |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24816857 tttaggaattgtagatgagccaaagactttgt------caaaaattccaactttgaccgcatcgatgtcgcggttggttcctt 24816933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26213813 - 26213433
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| ||||||||||  | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26213813 cactaaggccttcaccattttcataagctctcaagtccttggacttggtcagctcattggttcttaaagccacttgaacttcttccatggtgacagtgcc 26213714  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||    
T  26213713 ttctttgccatagatcatggtattcttgaaggattcaaaagatctcggtagagcacacaacaagagtataactttatctttatcctcaataggcacctca 26213614  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  26213613 atattctccaagtcatcaaagattttgttgaactctgtaagtttctccatga-ggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttagga 26213515  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    |||||  |||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| |||| |||||| |||  | || |||||||||| |||||    
T  26213514 attgcaaatgagccaaagatttggtcctatacaatgactccaaatttgaccacattgattccacgattggttccttcgctac 26213433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 18391322 - 18391697
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18391322 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 18391421  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  18391422 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 18391521  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  18391522 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 18391621  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18391622 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 18391697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 6593684 - 6594059
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6593684 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 6593783  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||  ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  6593784 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcaatacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 6593883  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  6593884 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 6593983  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6593984 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 6594059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 39 - 390
Target Start/End: Original strand, 47675315 - 47675666
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  47675315 ctctcaagtccttagacttggtcaactccctggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccacagagcatggtatcctt 47675414  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || || || | || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47675415 gaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtataaccttgtcttcgttcttaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttg 47675514  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |  | |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  47675515 ttgaactccgttaattgctccatcacagtctttgactccaccatcttgaatgattagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtca 47675614  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 390  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  47675615 tatacaatgactcaaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctttgc 47675666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6047578 - 6047203
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||  ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6047578 cacttaggcgttcaccgttttcatcagttctcaagttcttggacttggtaaactcgttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgcc 6047479  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||    
T  6047478 ttctttgccatatagaatggtatccttgaaggattcaaaagatctcggtagagcacacaacaagagaataactttatcttcatcctaaaaatgcatctca 6047379  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6047378 atgttctccaagtcatcaaggatattgtttaactccgtaagttactgaatgatggactttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttagga 6047279  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||  |||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||    
T  6047278 attgcgtatgagccaaagatttgttcatatacaacgactccaaatttgatcgcattgatgccgcgattggttcctt 6047203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 399
Target Start/End: Original strand, 31159049 - 31159270
Alignment:
Q  165 cacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31159049 cacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgat 31159148  T
Q  265 ggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccac 364  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  31159149 ggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatac-------------ttgcccac 31159235  T
Q  365 atcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31159236 atcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 31159270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24749501 - 24749294
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  24749501 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatga 24749402  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  24749401 gtagagttattgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacatcgatgccatggttggttcttttgct 24749302  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  24749301 acttctct 24749294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 399
Target Start/End: Original strand, 7471367 - 7471562
Alignment:
Q  204 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 303  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |||| |||||||     
T  7471367 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagccttttactttaccatcttgaatgagtaaagttgttg 7471466  T
Q  304 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  7471467 ctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgaccacatcgatgccgcggttgtatcctttgttacttctct 7471562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Original strand, 31157482 - 31157636
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31157482 cacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttagttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 31157578  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacac 169  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31157579 ttccttgccatagagcatgatatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacac 31157636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21678973 - 21678781
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| | |  ||||||  |||| |    
T  21678973 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgattgccttttattttaccatcttgaatga 21678874  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttc 384  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21678873 gtaaagttgttgctttaggaactgccgatgagccaaagactttgtaaaatacaaagattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttc 21678781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28486467 - 28486280
Alignment:
Q  204 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 303  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |||| |||||||     
T  28486467 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttg 28486368  T
Q  304 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  28486367 ctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcggttgtttccgttgct 28486280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20298206 - 20298048
Alignment:
Q  215 ttctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaatt 314  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||| |||  ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| ||    
T  20298206 ttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagcagctccatgaaggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactt 20298107  T
Q  315 gccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtc 373  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20298106 gtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccgactttgcccacatcgatgtc 20298048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6570872 - 6570647
Alignment:
Q  144 attcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaa 243  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6570872 attcaaatgatctcggtagagcacacaataagagtatcgctttgtcttcgccctcaggtttcacctcaatgttctccaaatcatcaagtattttattgaa 6570773  T
Q  244 ctccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatac 343  Q
    |||||| | ||||||  | | || |||| ||||||| |||  |||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  6570772 ctccgttaattgctctgttacggtctttgactccacaatcttgaatgaggagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatac 6570673  T
Q  344 aaagattccaactttgcccacatcga 369  Q
    || || | |||||||| |||||||||    
T  6570672 aatgactgcaactttgaccacatcga 6570647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 365
Target Start/End: Original strand, 3890642 - 3890938
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcac 167  Q
    |||||| ||||||||| || |||||  || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  3890642 ttggttttcaaagccgtttaaactttctctaaggtgacagtgtcttcgttgccatagagcatggact-tttgaacgattcaaacgatctaggtagagcac 3890740  T
Q  168 acaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggc 267  Q
    | ||||||||| || |||| |  | ||| | ||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |    
T  3890741 aaaacaagagtttaactttgtttttatctttaagatgcacctcaatgttctccatatcattaaggattttgttgaactctattagttgcttcatgatgac 3890840  T
Q  268 ctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaca 365  Q
    |||| ||||| ||||    ||| | ||||||| |   ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||||||    
T  3890841 ctttgactcccccatatttaatgaatagagttttggttttaggaattgcctatgagtcaaaggcttggtcatatacaataacttcaactttgcccaca 3890938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 379
Target Start/End: Original strand, 4295409 - 4295502
Alignment:
Q  286 gaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggtt 379  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4295409 gaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgccgcggtt 4295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 12405691 - 12405850
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  12405691 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 12405790  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12405791 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggt 12405850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24262056 - 24261897
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  24262056 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 24261957  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24261956 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 24261897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Original strand, 3903694 - 3903869
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcac 167  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  || ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |  | ||| |||||||| ||||| |||| |   |    
T  3903694 ttggttttcaaagccacttaaactttctctaaggtgacaatgtcttctttgccatagagaatggtctcct-gaaggattcaaacgatttaggtata---c 3903789  T
Q  168 acaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactcc 247  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  3903790 acaacaagagtataactttgtcttcatcttcaagatgcacctcaatgttctccaaattatcaagaattttgttgaactcc 3903869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 378
Target Start/End: Original strand, 16884268 - 16884440
Alignment:
Q  206 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 305  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  16884268 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 16884367  T
Q  306 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16884368 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 16884440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Original strand, 4294091 - 4294170
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttt 271  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  4294091 catccccaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagtagctccatgaaggccttt 4294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9679572 - 9679498
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgg 266  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9679572 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatgg 9679498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7070731 - 7070446
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaaga 153  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||    ||||| ||    
T  7070731 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 7070632  T
Q  154 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 253  Q
      | |||| ||||||||  | | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  7070631 cctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 7070532  T
Q  254 tgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcat 339  Q
    |||||||| || |  ||| |||||||||| |   | |||||||||||||  || ||  |||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  7070531 tgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagacattgcctatgtgccaaagacttggtcat 7070446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5817864 - 5817759
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||  || | || || || ||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  5817864 actccaccatcttgaatgagtagagttgttgtttcaagagtttcctatgagtcaacgattttgtcatatacaatgactccaacttagcccacatcgatgc 5817765  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  5817764 cgcggt 5817759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25352288 - 25352003
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaaga 153  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||    ||||| ||    
T  25352288 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 25352189  T
Q  154 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 253  Q
      | |||| ||||||||  | | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  25352188 cctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 25352089  T
Q  254 tgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcat 339  Q
    |||||||| || |  ||| |||||||||| | | | |||||||||||||  || ||  |||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  25352088 tgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcat 25352003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 3324032 - 3324112
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3324032 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 3324112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 21988097 - 21988189
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||  |||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21988097 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacttccttcaaagtagtagtgccctctttaccataaaggatggtat 21988189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25406350 - 25406270
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25406350 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 25406270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 366
Target Start/End: Original strand, 3903917 - 3903978
Alignment:
Q  305 tttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacat 366  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3903917 tttaggaattgtctaggagtcaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgcccacat 3903978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 18413066 - 18413171
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||     
T  18413066 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagctcacatcgatgc 18413165  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  18413166 cgcggt 18413171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 129
Target Start/End: Original strand, 44015924 - 44015985
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcat 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||    
T  44015924 ttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 44015985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 18412835 - 18412927
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  18412835 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 18412927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 5818096 - 5818051
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5818096 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 5818051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 9186067 - 9186022
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9186067 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 9186022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 21645202 - 21645247
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21645202 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 21645247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 49090854 - 49090899
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  49090854 tcaagtcattgaacttggtcaattccttgtttctcaaagccgcttg 49090899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6746163 - 6745766
Alignment:
Q  2 cctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagg 101  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6746163 cctcttgagacacttaggccttcatcgtgttcacgaactctcaagtcattggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagg 6746064  T
Q  102 taacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6746063 taacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttttcctcatcctcaag 6745964  T
Q  202 ttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6745963 ttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgt 6745864  T
Q  302 tactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6745863 tgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattacaactttgcccacattgatgccgcggttcgttcctttgctacttctct 6745766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18467769 - 18467382
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18467769 cacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtccc 18467670  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18467669 ttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatccttatccacaagttgcacctca 18467570  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  18467569 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaaattgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 18467470  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18467469 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggttcgttcctttgctacttctct 18467382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 34478605 - 34479000
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478605 ccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 34478701  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478702 gtaacaatgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagattttggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 34478801  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  34478802 gttgcacctcaatattttccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttg 34478901  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34478902 ttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctct 34479000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10750753 - 10750396
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10750753 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 10750654  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10750653 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 10750554  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750553 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 10750454  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  10750453 acaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttcctacttctct 10750396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Original strand, 15356073 - 15356430
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15356073 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 15356172  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15356173 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 15356272  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356273 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 15356372  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15356373 acaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 15356430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23666101 - 23665744
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23666101 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23666002  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23666001 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 23665902  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665901 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 23665802  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23665801 acaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 23665744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31543815 - 31543431
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543815 cacttaggccctcactgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 31543719  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543718 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 31543619  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  31543618 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcttgaatgagtagagtcgttgctttagga 31543519  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31543518 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattctaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctct 31543431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29721392 - 29721017
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29721392 cactaaggccttcactgttttcatctgctcttaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 29721293  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  29721292 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagcgcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 29721193  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  29721192 atgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 29721093  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29721092 attgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccacatcgatgccgcggttggttcctt 29721017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Original strand, 9788399 - 9788747
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||    
T  9788399 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttctttcaaggtgacagtgcattatttgccatagagcatggtatcctt 9788498  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
     || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9788499 aaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttg 9788598  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9788599 ttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtca 9788698  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9788699 tatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccgcggttggttcctt 9788747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16408325 - 16407977
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16408325 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 16408226  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
     || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16408225 aaaggattcaaatgatctcggtagcgcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttg 16408126  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16408125 ttgaactccgccaattgctccatcacggtcttttactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtca 16408026  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||    
T  16408025 tatacaacgattccaactttgatcatatcgattccgcggttggttcctt 16407977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 20505389 - 20505664
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505389 ccctcttgagacacttaagacttcaccgtgttcatgaattctcaagtccttggacttggtcaactccttagttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 20505488  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20505489 gtaacagtgccttctttcccatagagcatagtatctttgaacgattcaaaagatttcagtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatactcaa 20505588  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactc 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  20505589 gttgcaccttaatattctccaagtcattaaggattttgttaaactccgtaagttgctccataatgtcctttgactc 20505664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 40381133 - 40380758
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40381133 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 40381034  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  40381033 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 40380934  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || ||||||||  | || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  40380933 atgttctccaaaccgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 40380834  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40380833 attgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 40380758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16545457 - 16545079
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16545457 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 16545358  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  16545357 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 16545258  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16545257 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 16545158  T
Q  312 attgccgatgagccaaagac---tttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| |||   || ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16545157 attgcctatgagccaacgacttgttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16545079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 367
Target Start/End: Original strand, 42427582 - 42427937
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42427582 cactaaggccttcactgttttcatccgctctgaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagtcgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 42427681  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    || ||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42427682 ttttttgccatagagtgtggtatagttgaaggattcaaatgatctcggtagagcatacaacaagagtatagctttgtcttcatcctcaagttgcacctca 42427781  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | | || |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||    
T  42427782 atgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactctgttaattgttccgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaagga 42427881  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  42427882 attgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacatc 42427937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26171693 - 26171409
Alignment:
Q  103 aacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||| |    
T  26171693 aacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagcgcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaatt 26171594  T
Q  203 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtt 302  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  26171593 tgcaccttaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgtt 26171494  T
Q  303 actttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  26171493 gcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccacggttggttcctt 26171409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 13694293 - 13694667
Alignment:
Q  13 acttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcct 112  Q
    |||||||||||||  || ||||| | ||||||| || ||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||| || ||    
T  13694293 acttaggccttcattgttttcattagctctcaactccttgaacttggttaactcattggtcctcaaagccgcttggacttccttcaaagtgacaatgtct 13694392  T
Q  113 tctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||| || |||||| | |||||||||||||| | || || ||||| |  || ||||||||||    
T  13694393 tctttgccatagagcatggcatccttgaaggattcaaatgatctcagtagagaaaacaacaagagtataaccttgtcttcatcttagagatgcacctcaa 13694492  T
Q  213 tattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaa 312  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||||    
T  13694493 tgttttccaactcatcaaggattttgttgaactccgttagttgctccatgatgacatttgactccaccatcttaaataagtagagttgttgatataggaa 13694592  T
Q  313 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13694593 ttgcatatgagccaaagatttggtcatatacaacgactccaaatttgaccacatcaatatcgcggtaggttcctt 13694667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 534677 - 534421
Alignment:
Q  111 cttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  534677 cttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctctgtagagcacacaacaacagtatagccttgtcttcatcctcaagttgcacctc 534578  T
Q  211 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 310  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  534577 aatgttctccaaatcatcaagtattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagg 534478  T
Q  311 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  534477 aattgcctatcaaccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatc 534421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 207 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 658908 - 658716
Alignment:
Q  207 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 306  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||| |||  ||||||  |||| |||| ||||||| |||    
T  658908 cctcaatattctccaaatcaccaatgattttgttgaactctacaagtaggtccatgatggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctt 658809  T
Q  307 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  658808 taggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctacttctct 658716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20043874 - 20043710
Alignment:
Q  207 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| ||||||| |||    
T  20043874 cctcaatgttctccaagtcatcaaggattgttttgaactccacaagttgctccatgatggcctttgactctgccatcttgaatgagtaaagttgttgctt 20043775  T
Q  307 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  20043774 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgactacatcgatg 20043710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27911337 - 27911130
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  27911337 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 27911238  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27911237 gtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcagttgattcctttgct 27911138  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  27911137 acttctct 27911130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13487015 - 13486871
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  13487015 ctcttaagtccttagacttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacatattccaaggtgacagtgccttctttaccatagagcatggtatcctt 13486916  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagc 183  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13486915 gaatgattcaaatgatctcggtagaacacacaacaagagtatagc 13486871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 215 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25806343 - 25806167
Alignment:
Q  215 ttctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaatt 314  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| ||    
T  25806343 ttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactt 25806244  T
Q  315 gccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  25806243 tccaatgagccaaagactttgtaatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgctgcggttgtttccattgct 25806167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 359
Target Start/End: Original strand, 18510788 - 18510955
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  18510788 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactgcacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 18510887  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttg 359  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18510888 gtaaagttgttgctttaggacttgccgataagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttg 18510955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26173797 - 26173701
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagt 108  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26173797 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagt 26173701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 33790669 - 33790828
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | || ||| |     
T  33790669 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtct 33790768  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33790769 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 33790828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37557357 - 37557198
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  37557357 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 37557258  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37557257 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggt 37557198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13294977 - 13294851
Alignment:
Q  191 tcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaata 290  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||     
T  13294977 tcatccttaagatgcactccaatgttctccaaatcatcaaggcttctactgaactcagtaagttgctccatgatgccctttgactccaccatcatgaatg 13294878  T
Q  291 agtagagttgttactttaggaattgcc 317  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13294877 agtagagttgttgctttctgaattgcc 13294851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 378
Target Start/End: Original strand, 27449181 - 27449335
Alignment:
Q  224 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgag 323  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| | |||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||    
T  27449181 tcatcaagaatcttgttaaactccgtcaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 27449280  T
Q  324 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27449281 ctaaagattttgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 27449335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31397738 - 31397566
Alignment:
Q  206 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 305  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  31397738 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 31397639  T
Q  306 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    | | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  31397638 tcaagagttgcctatgagccaaagattttgtcatatagaatgactccaacttttcccacattgatgccgcggt 31397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32584846 - 32584706
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| | ||||||||   |    
T  32584846 ctctcaagtccatggacttggttaactctttggttctcaattccgcttggacttcctcaaaggtgatagttccttccttgccataaatcatggtatccat 32584747  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagta 179  Q
    ||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  32584746 gaaggactcaaaagatctaggtaaagcacacaacaagagta 32584706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 43598140 - 43598245
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  43598140 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgc 43598239  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  43598240 cgcggt 43598245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 43603632 - 43603737
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  43603632 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgc 43603731  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  43603732 cgcggt 43603737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 43609124 - 43609229
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  43609124 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgc 43609223  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  43609224 cgcggt 43609229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 534728 - 534672
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttctt 95  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  534728 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttctt 534672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28788658 - 28788583
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcat 129  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||| |||||    
T  28788658 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgtcttctttgccataaagcat 28788583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 373
Target Start/End: Original strand, 34842024 - 34842124
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| || |  ||||| | | |||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  34842024 actccaccatcttgaatgagtagagttgttatttcaaaaattgtctacgagctaaagattttgtcatgtacaatggctccaacttagcccacatcgatgt 34842123  T
Q  373 c 373  Q
    |    
T  34842124 c 34842124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 43596310 - 43596390
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  43596310 acttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 43596390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 43629104 - 43629184
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  43629104 acttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 43629184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 18098354 - 18098752
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18098354 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 18098453  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18098454 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcgtaagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 18098553  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18098554 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcaaccatcctgaataagtagagttg 18098653  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18098654 ttgctttaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacattgatgccgcggttggttcctttgctacttctct 18098752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Original strand, 4309704 - 4310091
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309704 cacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 4309803  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309804 ttctttgccatatagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 4309903  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4309904 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 4310003  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4310004 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccatattgatgccgcggttcgttcctttgctacttctct 4310091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 43227152 - 43226754
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43227152 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaag 43227053  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43227052 gtaacagtgtcttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagaacacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 43226953  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  43226952 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttg 43226853  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43226852 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttcgttcctttgctacttctct 43226754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5898484 - 5898091
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898484 ccctcttgagacactaaggccttcaccgtgttcatgatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 5898385  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898384 gtaacagtgccttctttgccatagagaatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 5898285  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||   ||| ||||||||||    
T  5898284 gttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtcttcgactccaccatcttaaatgagtagagttg 5898185  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5898184 ttgctttaagaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggttcgttcctttgctact 5898091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 10957509 - 10957904
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957509 ccctcttgagacacttagaccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 10957605  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957606 gtaacaatgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 10957705  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  10957706 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttg 10957805  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  10957806 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccacggttggttcctttgctacttctct 10957904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 456968 - 456584
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  456968 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactcattggttctcaaagccgctcgaacttcttccaaggtaacagtgcc 456872  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  456871 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 456772  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  456771 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtagagttgttgctttagga 456672  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  456671 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctct 456584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5192722 - 5192327
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||| |||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5192722 ccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcgtgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 5192626  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5192625 gtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgatttaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 5192526  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |    
T  5192525 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctcaatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcg 5192426  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  5192425 ttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcagttgcttcctttgctacttctct 5192327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Original strand, 6065017 - 6065374
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6065017 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 6065116  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6065117 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 6065216  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6065217 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctacgatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcgtat 6065316  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6065317 acaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 6065374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11169162 - 11168783
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11169162 cacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaaaccggttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 11169066  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11169065 ttccttgccacagagcatggtatctttgaatgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcctcaagttgcacctca 11168966  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  11168965 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatccagaatgagtagagtagttgctttagga 11168866  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  11168865 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgctgcggttgcttcctctgctact 11168783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7769630 - 7769238
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || ||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7769630 ccctcttaaaacacttaggccttcaccgttttcatcatctctcaagtccttagactttgcctactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctag 7769531  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7769530 ataacattgccttctttgccatagagcatggtaactttgaaagatttaaaagatctcggtagagcacacaacaagaatatagctttatcttcatcctcaa 7769431  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  7769430 gatgcacctcaatattctccacgtcatcaaggattttttagaactccgtaagttgctccatgatagcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttg 7769331  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7769330 tttctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatgtcgcaattggttccttttctac 7769238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 68 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23634453 - 23634123
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23634453 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagttccttcttttccatatagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtaaagcac 23634354  T
Q  168 acaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggc 267  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  23634353 acaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctataaattgctccatgatggc 23634254  T
Q  268 ctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23634253 ctttgactccaccatcttgaatgactagagttgttgctttagaaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgacctcatc 23634154  T
Q  368 gatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||  || ||||||||||| |||||| ||||    
T  23634153 gatgatgc-gttggttccttcgctacttctct 23634123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 23199289 - 23199664
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23199289 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 23199388  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||    
T  23199389 ttctttgccatagagcatggtatctttaaaggattcaaatgatctcggtagcacacacaacaagagtataactttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 23199488  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||    
T  23199489 atgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcatggtctttgactccaccatcttgaatgattagagttgttgcttaagga 23199588  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23199589 attgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgtcgcggttggttcctt 23199664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27421661 - 27421327
Alignment:
Q  53 gacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaag 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27421661 gacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttctttcaaagtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaaag 27421562  T
Q  153 atttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaag 252  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27421561 atttcagtagagcacacaaaaagagtatagctttatcttcatctgcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgtaag 27421462  T
Q  253 ttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattcc 352  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || |||    
T  27421461 ttgctccatgatgacctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgttttaggaattgccgatgagccaaagattttgtcaataacaacgactcc 27421362  T
Q  353 aactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27421361 aactttgaccacatcaatgtcgcggttggttcctt 27421327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 37407679 - 37407331
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  37407679 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccggttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatcctt 37407580  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  37407579 gaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttttccaaatcatcaaggattttg 37407480  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37407479 ttgaactccgccaattgctccatcacggtctttaactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtca 37407380  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37407379 tatacaacgactccaactttgaccacattgatgccgcggttggttcctt 37407331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Original strand, 5259500 - 5259848
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5259500 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatcctt 5259599  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
     || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5259600 aaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttg 5259699  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    |||||||| |  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5259700 ttgaactctgccaattgctccatcaaggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtca 5259799  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  5259800 tatacaacgactccaactttgaccacatagatgccgcggttggttcctt 5259848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10210218 - 10209843
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10210218 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 10210119  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  10210118 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 10210019  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || |||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10210018 atgttctccaaatcgtcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 10209919  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10209918 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaatgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 10209843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29811886 - 29811511
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29811886 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgtc 29811787  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  29811786 ttatttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 29811687  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  29811686 atgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 29811587  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||  ||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||| || |  ||||| ||||||||    
T  29811586 attgcttatgagccaaagacctggttatatacaatgactccaactttgaccacatggacgctgcggtaggttcctt 29811511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 4599870 - 4600245
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4599870 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 4599969  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  4599970 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 4600069  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||| || | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  4600070 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctctatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 4600169  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4600170 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 4600245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7763288 - 7762913
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7763288 cactaaggccttcaccgttttcatccgctctcaagtccttggacttggttaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgcc 7763189  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  7763188 ttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcatacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 7763089  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||   ||| | |||||||||| ||| | ||    
T  7763088 atgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttaaaga 7762989  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  7762988 attgcttatgagccaaagacttggtcatatataatgactccaactttgaccacatcgattccgcggttagttcctt 7762913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Original strand, 9635301 - 9635649
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9635301 ctctcaagtccttggacttggtcaactcattggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 9635400  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
     || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9635401 aaaggattcaaatgatctcggtaaagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttg 9635500  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||| ||  | ||||||||| | || |||| | | |||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9635501 ttgaactacgccaattgctccatcacggtctttgaatgcaccatcttgaatgagtagatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtca 9635600  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| |  |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  9635601 tatacaacggctccaactttgaccacgtagatgccgcggttggttcctt 9635649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6717530 - 6717155
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6717530 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 6717431  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||   | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  6717430 ttctttgccatagagcatggtatccataaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 6717331  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||| ||||    
T  6717330 atgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctctatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgtcgcttaagga 6717231  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6717230 aatgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 6717155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10057262 - 10056887
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10057262 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 10057163  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  10057162 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 10057063  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10057062 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 10056963  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10056962 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10056887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10059484 - 10059109
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10059484 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 10059385  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  10059384 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 10059285  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10059284 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttaaatccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 10059185  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10059184 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10059109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10061706 - 10061331
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10061706 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 10061607  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  10061606 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 10061507  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10061506 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 10061407  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10061406 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10061331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10063928 - 10063553
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10063928 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 10063829  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  10063828 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 10063729  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10063728 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 10063629  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10063628 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10063553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10066150 - 10065775
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10066150 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 10066051  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  10066050 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 10065951  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10065950 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 10065851  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  10065850 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 10065775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 68 - 387
Target Start/End: Original strand, 22834215 - 22834534
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcac 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22834215 ttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcac 22834314  T
Q  168 acaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggc 267  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | | ||     
T  22834315 acaacaagagtatagttttatcttcgtcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctctgtcacggt 22834414  T
Q  268 ctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  22834415 ctttaactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatc 22834514  T
Q  368 gatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    || | |||||||||||||||    
T  22834515 gacgccgcggttggttcctt 22834534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32892080 - 32891752
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  32892080 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccggttgaacttcttccaaggtggcagtgccttctttcccatagagcatggtatcctt 32891981  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  32891980 gaaggattcaaatgatctcgatagagcaaacaacaagagtatcgctttgtcttcgtcctcaagatccacctcaatgttctccaaatcatcatggattttg 32891881  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    |||||| |||| | |||||   | | || |||| ||||||||| |   ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  32891880 ttgaaccccgttaattgctttgtcacggtctttgactccaccaccttaaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtca 32891781  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  32891780 tatacaatgactccaactttgaccacatc 32891752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 345
Target Start/End: Original strand, 15821861 - 15822169
Alignment:
Q  37 aactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgt 136  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||      
T  15821861 aactctcaagtccttggactcggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttctatgccatagggcatggtatca 15821960  T
Q  137 ttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattt 236  Q
    ||||| |||||||| | | |  ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15821961 ttgaaagattcaaatggtctaagtagagcacacaacaagagtatagtcttgtcttcatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcattaaggattt 15822060  T
Q  237 tgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgt 336  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  | | || |||| ||||||||||    ||  |||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||| ||    
T  15822061 tgttgaacttcgttagttgctctgttaaggtctttgactccaccattttaaacgagtagagttgttgctttaggaattacatatgagctaaagacttagt 15822160  T
Q  337 catatacaa 345  Q
    |||||||||    
T  15822161 catatacaa 15822169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 15830392 - 15830767
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||    
T  15830392 cacttagaccttcaccgttttcatcagctctcaagtccttggactgtgttaactccttggttctcaaagccgcttgaactttttccaaggtggcagttcc 15830491  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||   |||| |||||||||||| ||||||||  | || | ||||||||| ||| |||||    
T  15830492 ttctttgccatagaccatggtatctttgaaggattcaaatgatcgtggtatagcacacaacaaaagtatagccatgtctttatcctcaagatgcgcctca 15830591  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    | || |||| |||||||||||   ||| |||| |||| || ||||||||    
T  15830592 atgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactctgttggttgctctgctacggtctttgactccaccatcttaaatgagtaaagttcttgctttagga 15830691  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  15830692 attgcctatgaaccatagacttagtcatatacaataactccaactttgaccacctcgatgtcgtggtaggttcctt 15830767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 28101382 - 28101584
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |    
T  28101382 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagtagctccatgatggcctttaactttaccatcttgaatga 28101481  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28101482 gtagagttgttactttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttggttcttttgct 28101581  T
Q  392 act 394  Q
    |||    
T  28101582 act 28101584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3315566 - 3315359
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  3315566 catcctcaagatgcacctcaatgttctctaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccgtgatggcctttgactctaccatcttgaatga 3315467  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315466 ataaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattccaactttgcacacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 3315367  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  3315366 acttctct 3315359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42991183 - 42990981
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||  |||||| || ||||||| |||  |||||   |||| |    
T  42991183 catcctcaagtcgcaacttaatgttctccaaatcagcaatgattttgttgaactccacaagcagctccaagaaggcctttgactttaccatattgaatga 42991084  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42991083 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttcgttcctttgct 42990984  T
Q  392 act 394  Q
    |||    
T  42990983 act 42990981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Original strand, 43422844 - 43423049
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||  ||| |    
T  43422844 catcctcaagatgcacctcaatgttcttcaaatcaccaatgattttgttgaactcgacaagtagctccatgatggcctttgactttacaatcc--aatga 43422941  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  43422942 gtaaagttgttgatttgggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgtaacctttgct 43423041  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  43423042 acttctct 43423049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5192942 - 5192816
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5192942 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 5192846  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5192845 ttccttgccatagagcatggtatctttgaa 5192816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 389
Target Start/End: Original strand, 53917048 - 53917245
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||   ||| |    
T  53917048 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggtctttgactttaccatcttaaatga 53917147  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttg 389  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  53917148 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcagttgtttcctttg 53917245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 393
Target Start/End: Original strand, 1619882 - 1620049
Alignment:
Q  225 catcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | |  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1619882 catcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggattttgt-tgcttcatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattaccaatgagc 1619980  T
Q  325 caaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |||| |||||    
T  1619981 caaagactttgtcatatgcaaagactccaactttgaccacatcgatgccgcagtttgtaccttcgctac 1620049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25634703 - 25634589
Alignment:
Q  250 aagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagat 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  25634703 aagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgtggctttaggaattgctgatgagtcaaagactttgtcatatataaagac 25634604  T
Q  350 tccaactttgcccac 364  Q
    || ||||||| ||||    
T  25634603 tctaactttgaccac 25634589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 53598011 - 53597915
Alignment:
Q  291 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53598011 agtagagttcttgctttagaaattgccgatgaggtaaagactttgtcatatacaaagacttcaattttgaccacatcgatgccgcggttgattcctt 53597915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 371
Target Start/End: Original strand, 32479681 - 32479846
Alignment:
Q  206 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 305  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  32479681 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 32479780  T
Q  306 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 371  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32479781 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 32479846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 54189446 - 54189161
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaaga 153  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||    ||||| ||    
T  54189446 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 54189347  T
Q  154 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 253  Q
      | |||| ||||||||||| | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| | |||||  || || ||||||||||| |||    
T  54189346 cctaggtaaagcacacaacaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaattatcaataatcttattgaactccgtcagt 54189247  T
Q  254 tgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcat 339  Q
    |||||||| || |  ||| |||||||||| | | | |||||||||||||  || ||  |||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  54189246 tgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcat 54189161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 378
Target Start/End: Original strand, 8516435 - 8516607
Alignment:
Q  206 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 305  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  8516435 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 8516534  T
Q  306 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8516535 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatataatgactctaactttgcccacatcgatgccgcggt 8516607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 10612022 - 10612102
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10612022 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccgtctttgccatagagcatagtat 10612102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 387
Target Start/End: Original strand, 23409743 - 23409857
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || || || |||| ||| ||||| |     
T  23409743 actccaccatcttaaataagtagagttgttgcttaaggagttgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactcaaaatttgaccatatcgacgc 23409842  T
Q  373 cgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||    
T  23409843 cgcggtaggttcctt 23409857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10897941 - 10897656
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaaga 153  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||    ||||| ||    
T  10897941 acttggtcaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 10897842  T
Q  154 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 253  Q
      | |||| ||||||||  | | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  10897841 cctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 10897742  T
Q  254 tgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcat 339  Q
    ||||| || || |  ||| |||||||||| | | | |||||||||||||  || ||  |||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10897741 tgctcgattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgcctatgggccaaagacttggtcat 10897656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6304247 - 6304167
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  6304247 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 6304167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 10204936 - 10205016
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  10204936 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 10205016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 22625224 - 22625304
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22625224 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 22625304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 29913200 - 29913280
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  29913200 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctatttgccataaagcatagtat 29913280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 47882133 - 47882213
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  47882133 acttggtcaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 47882213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 10098041 - 10098120
Alignment:
Q  55 cttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  10098041 cttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 10098120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 367
Target Start/End: Original strand, 30844876 - 30845049
Alignment:
Q  194 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagt 293  Q
    ||||||| || ||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||  ||  | |||||||| | |||| |||    
T  30844876 tcctcaattttcacttcaatgtgcaccaaatcatcaaggattttgttgaactttgtcaattgctctatgatggttttagattccaccattctgaatgagt 30844975  T
Q  294 agagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatc 367  Q
    |||||| ||   | | |||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| || ||||||||    
T  30844976 agagtttttgtatgatgaattgtctatgagccaatgacttggttatatacaacgactccaacctttcccacatc 30845049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16458388 - 16458322
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16458388 ttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 16458322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 9602756 - 9602711
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9602756 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 9602711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 16263540 - 16263585
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16263540 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 16263585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28490072 - 28489992
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  28490072 acttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 28489992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51751119 - 51750735
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751119 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 51751023  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751022 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 51750923  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  51750922 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 51750823  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  51750822 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 51750735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 27338316 - 27338714
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338316 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcttgaattctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 27338415  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338416 gtaacagtgccttctttcccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 27338515  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27338516 gttgcacctcaatattatccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttg 27338615  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  27338616 ttgctttaggaattgccaatgagtcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcgattcattcctttgctacttctct 27338714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28841515 - 28841120
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28841515 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaag 28841419  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28841418 gtaacagtgtcttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcctcaa 28841319  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  28841318 gtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttg 28841219  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28841218 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 28841120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 28202883 - 28203280
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28202883 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaattctcaagttcttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcatccaag 28202982  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28202983 gta-cagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcctcaa 28203081  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  28203082 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtcagttgctccatgatggcttttgactccaccatcttgaatgagtagagttg 28203181  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28203182 ttgctttaggaattgtcgatgagtcaaagactttgtcttatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttggttcctttgctacttctct 28203280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16227250 - 16226866
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227250 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 16227154  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227153 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcagtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 16227054  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  16227053 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgctttagga 16226954  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16226953 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgttacttctct 16226866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20301224 - 20300829
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301224 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 20301128  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20301127 gtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattgaaaagatttcagtagaccacacaacaggagtatagctttatcctcatcctcaa 20301028  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  20301027 gttgcacctcaatattctccaagtcttcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttg 20300928  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  20300927 ttgctttaggaattgacgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccacggtttgttcctttgctacttctct 20300829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47178444 - 47178060
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47178444 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaatgtaacagtgcc 47178348  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47178347 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 47178248  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| |||  |||||||    
T  47178247 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgttttagga 47178148  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  47178147 attgccgatgagccaatgactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcgattgcttcctttgctacttctct 47178060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 97 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51758534 - 51758232
Alignment:
Q  97 caaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcc 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51758534 caaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaaagattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcc 51758435  T
Q  197 tcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtaga 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||    
T  51758434 tcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttactccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtaga 51758335  T
Q  297 gttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcc 396  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  51758334 gttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcgtatacaaagattccaattttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttc 51758235  T
Q  397 tct 399  Q
    |||    
T  51758234 tct 51758232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Original strand, 8348265 - 8348641
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8348265 cacttaggccttcactgttttcaccaactatcaagttcttggacttggttaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataatagtgcc 8348364  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||| |||||||||    
T  8348365 ttatttgccatagagcatgatatctttgaacgattcaaaagatctcggtagagcacacaacaagagtatatctt------catcctcaagatgcacctca 8348458  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  8348459 ttattttccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctacatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttagga 8348558  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||    
T  8348559 attgtcgatgtcccaaagactttgtcatatacaaagactctaactttgaccacatcgacgccacggttggtttcttcgctact 8348641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 393
Target Start/End: Original strand, 13126931 - 13127310
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||| ||||||||  | ||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13126931 cacttacgccttcaccattttcatcagctctcaagtccttggatttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtacc 13127030  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13127031 ttctttgccatagagcatggtatcttcgatagattcaaaatatctcggtagagcacacaacaag--tatagctttatcttcatcctcaagatgcacctca 13127128  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||   |||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  13127129 atattctccaagtcatcaaggattttgttaaactccataagttgctacatgatgatctttgactccgccatattgaatgagtatagttgtttctttaaga 13127228  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  13127229 attgtcgatgagccaaagaatttgtcatatacaaagactccaactttgaagacatcgatgtcgcggttagttacttcgctac 13127310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 392
Target Start/End: Original strand, 3805353 - 3805712
Alignment:
Q  40 tctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgt--- 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |       
T  3805353 tctcaagtcataggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttctaaggtgacagtgtcttctttgccatagagcatggtatatggt 3805452  T
Q  137 ----ttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaagg 232  Q
        ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3805453 atccttgaaagattcaaaagatctcggtagaatacacaacaagagtatagctttatcttaatcctcaagatgcacctcaatgttctccaagtcatcaaga 3805552  T
Q  233 attttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagact 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3805553 attttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctgccatcttgaatgattacagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagatt 3805652  T
Q  333 ttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgcta 392  Q
    | |||||| ||||  | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3805653 tggtcataaacaacaactctaacgttgaccacatcgatgtcgcggttggttccttcgcta 3805712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 387
Target Start/End: Original strand, 50168506 - 50168875
Alignment:
Q  17 aggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctt 116  Q
    |||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  50168506 aggccttcactgttttcatttgctctcaagtcattggacttgatcaactccttggttctcaaagccgtttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctt 50168605  T
Q  117 tgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatatt 216  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  50168606 ttccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtataaaattatcttcgtcctcaagttgcacctcaatgtt 50168705  T
Q  217 ctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgc 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  50168706 ctccaaatcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgc 50168805  T
Q  317 cgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  50168806 ctatgagccaaaaacttggtcatatac-aagactccaactttgaccatatcgacgtcgtggttggttcctt 50168875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31658221 - 31657846
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31658221 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgcc 31658122  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||    
T  31658121 ttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagctttatctttgtcctcaagcttcacctca 31658022  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | | || |||| |||||||||||  |||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  31658021 atgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctctgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttaagga 31657922  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||| || || ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  31657921 atttcctataagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttcctt 31657846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 28222572 - 28222947
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28222572 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcctgaacttcttccaaggtgacagtgcc 28222671  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||| |||||||    
T  28222672 ttcttttccatatagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaaaagtattgctttgtctttgtcctcaagtttcacctca 28222771  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||  | | || |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||    
T  28222772 atgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgtcaattgctctgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaagga 28222871  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28222872 attgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgacaccaactttgaccacatcgatgctgcggttggttcctt 28222947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Original strand, 25250655 - 25250862
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| |||| || ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  25250655 catcctcaaggtgcagcttaatgttgtccaaatcatcaatgattttgttgaactccgtaagtttctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 25250754  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25250755 gtagagttgttgctttaggaattaccgaagagccaaagactttgccatatacaaatatttgaactttaaccacatcgataccgcggttgtttcctttgct 25250854  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  25250855 acttctct 25250862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16429853 - 16429653
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  16429853 catcctcaagatgcacctcaataatctccaaatcatcaagggttttgttgaactccacaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 16429754  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  ||||||||| | |||||| | |||||| |||    
T  16429753 gtaaagttgttactttaggaatttctgatgagccaaagactttgtcatatacaaacacttgaactttaaccacatcgacgccgcggtagattccttcgct 16429654  T
Q  392 a 392  Q
    |    
T  16429653 a 16429653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6996477 - 6996282
Alignment:
Q  204 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 303  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||   ||| |||| |||||||     
T  6996477 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggtctttgactttaccatcttaaatgagtaaagttgttg 6996378  T
Q  304 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6996377 ctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggatcctttgttacttctct 6996282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 198 - 399
Target Start/End: Original strand, 50078174 - 50078375
Alignment:
Q  198 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagag 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||  |||| |||| ||    
T  50078174 caagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctataatcttgaatgagtaaag 50078273  T
Q  298 ttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcct 397  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||| |||||| ||    
T  50078274 ttgttgctttaggacttgccgatgagcccaagattttgtcatatacaaatattcaaactttgaccacattgatgccgcagttgtttccttcgctacttct 50078373  T
Q  398 ct 399  Q
    ||    
T  50078374 ct 50078375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 391
Target Start/End: Original strand, 31736850 - 31737049
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  31736850 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 31736949  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31736950 gtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcggttcgttcctttgct 31737049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Original strand, 29003345 - 29003552
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  | | |||||| |||||| |||  |||||| ||||| |    
T  29003345 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagttgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 29003444  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  29003445 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgtggttgtatcctttgct 29003544  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  29003545 acttctct 29003552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 399
Target Start/End: Original strand, 28997635 - 28997836
Alignment:
Q  198 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagag 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  | | |||||| |||||| |||  |||||| ||||| |||| ||    
T  28997635 caagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagttgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaag 28997734  T
Q  298 ttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcct 397  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||    
T  28997735 ttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgtggttgtatcctttgctacttct 28997834  T
Q  398 ct 399  Q
    ||    
T  28997835 ct 28997836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16456632 - 16456360
Alignment:
Q  115 tttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||| |||| || | || ||||  ||||| ||||||     
T  16456632 tttgccatagagcatggtatccttgaatgattcaaatgatcacggtaaagcacataacaagagtatatctttgtctttattctcatattgcaactcaatg 16456533  T
Q  215 ttctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaatt 314  Q
    |||||||| |||| ||| |||||  | |||||||| | ||||||  | || | |||| |||| | ||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  16456532 ttctccaaatcattaagtattttaataaactccgttaattgctctgtcattgtctttgactctatcatcttgaatgagtagagttgttgctttaggattt 16456433  T
Q  315 gccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||| | | ||| |||||||||||    
T  16456432 gcctatgagccaaagtcttggtcatatacaatgactccaactttgatcacatcaacgccgcagttggttcctt 16456360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3157459 - 3157305
Alignment:
Q  233 attttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagact 332  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | | || |||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  3157459 attttgttgaactccgtcaattgctccgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagact 3157360  T
Q  333 ttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    | |||||||| || || |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3157359 tggtcatatagaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctt 3157305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Original strand, 31424408 - 31424603
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  31424408 catcctcaagacacacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagatccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 31424507  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| |  |||| |||||| |||||  ||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31424508 gtaaatatgttgctttagaaattgttgatgagccaaag------------acaaagattccaactttgcccacatctatgtcgtggttggttcctttgct 31424595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 41397593 - 41397752
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||| ||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  41397593 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagatcgatttagactccatcatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 41397692  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41397693 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 41397752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 776085 - 776019
Alignment:
Q  17 aggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccg 83  Q
    |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  776085 aggccttcactgttttcattcgctctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttctcaaagccg 776019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 45654910 - 45654976
Alignment:
Q  64 ctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatg 130  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  45654910 ctccttggttctcaaagccttttgaacttcttccaatttgacaatgtcttttttgccatagagcatg 45654976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 2400469 - 2400549
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  2400469 acttggttaactctttggttttcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccatctttgccataaagcatagtat 2400549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14997957 - 14997891
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  14997957 ttggttctcaaagccgcttagacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 14997891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19359477 - 19359412
Alignment:
Q  313 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19359477 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgacttcaacttagcccacatcgatgccgcggt 19359412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19359748 - 19359703
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19359748 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 19359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47099497 - 47099392
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| ||||||||| || || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||     
T  47099497 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcacgagttgcctatgagccaacgatttcgtcatgtaaaatgactccaacttagcccacatcgatgc 47099398  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  47099397 cgcggt 47099392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 72700 - 73098
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72700 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 72799  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  72800 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcgatagagcacataacaagagtatagttttatcctcatcctcaa 72899  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  72900 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttg 72999  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  73000 ttgctttaggaattgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatagatgccgcagttcgttcctttgctacttctct 73098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 22133803 - 22134198
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133803 ccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactgcttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 22133899  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133900 gtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 22133999  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  22134000 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttg 22134099  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22134100 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatataaaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 22134198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Original strand, 16933345 - 16933729
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933345 cacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 16933441  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933442 ttccttgccatagagcatgatatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 16933541  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| |||  |||||||    
T  16933542 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgttttagga 16933641  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16933642 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 16933729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Original strand, 22781934 - 22782318
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22781934 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 22782030  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22782031 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcgcacaacaagagtatatctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 22782130  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22782131 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 22782230  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22782231 attgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 22782318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 11007754 - 11008149
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11007754 ccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttagtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttccaag 11007850  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007851 gtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 11007950  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| | |    
T  11007951 gtcgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagattcg 11008050  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11008051 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatcttttcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 11008149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 22045901 - 22046296
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045901 ccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 22045997  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045998 gtaacaatgccttccttgccaaagagcatggtatctttaaacgattcaatagatttcggtagagcagacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 22046097  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |    
T  22046098 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcg 22046197  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||    
T  22046198 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaaatttgcccacatcgatgccgaggttgcttactttgctacttctct 22046296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 12402279 - 12402668
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || || ||||||||||||  | ||||| || | | || || ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  12402279 ccctcttgagacatttaggccttcaccattttcataaaatatgaaatccttggacttggtcaacttcttggttctcaaatccgcttgaacttcttcaaag 12402378  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12402379 gtaatagtgccttctttgccgtagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatccttaa 12402478  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12402479 gttgcacctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgactccaccatcctgaatgagtagagttg 12402578  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12402579 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttggttcctttgc 12402668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 12400004 - 12400402
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12400004 ccctcttgagacatttaggccttcaccgttttcataaattctcaagtccttggacttggtcaacttcctggttctcaaagccgcttgaactttttccaag 12400103  T
Q  101 gtaaca-gtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctca 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12400104 gtaacaagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcctca 12400203  T
Q  200 agttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagtt 299  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  12400204 agttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatgagtagagtt 12400303  T
Q  300 gttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12400304 gttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttggctcctttgctacttctct 12400402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Original strand, 9175696 - 9176053
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9175696 tcaagtccttggacttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtagcagtgccttccttgccattgagcatggtatctttgaa 9175795  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9175796 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 9175895  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9175896 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgagtcttccatcctgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatat 9175995  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  9175996 acaaagattcccacttttcccacatcgatgtcgtggttgcttcctttgctacttctct 9176053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 52094513 - 52094888
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52094513 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtcattggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgcc 52094612  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||    
T  52094613 ttctttgccatagagcatggtatctttgaagaattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtataaccttgtctttgtcctcaagttgcacctca 52094712  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||| | |||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  52094713 atgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgtcaattgctccatcacggtctttgaatccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 52094812  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52094813 attgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgccgcggtaggttcctt 52094888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 8394435 - 8394060
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8394435 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 8394336  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  8394335 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 8394236  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  8394235 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttgagga 8394136  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8394135 attgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 8394060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 144 - 399
Target Start/End: Original strand, 12395186 - 12395440
Alignment:
Q  144 attcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12395186 attcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcctcaagttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaa 12395285  T
Q  244 ctccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatac 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12395286 ctccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atac 12395384  T
Q  344 aaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12395385 aaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttggctcctttgctacttctct 12395440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5872794 - 5872457
Alignment:
Q  50 ttggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaa 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  5872794 ttggacttgttcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattcaa 5872695  T
Q  150 aagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgt 249  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5872694 atgatctcggtagagcacacaacaagggtatagttttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccat 5872595  T
Q  250 aagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagat 349  Q
     | ||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||     
T  5872594 taattgctccatcatggtctttgactccaccatcttgaatgagtagatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatgcaacgac 5872495  T
Q  350 tccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  5872494 tccaactttgaccacatcgacggcgcggttggttcctt 5872457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7123698 - 7123350
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7123698 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 7123599  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
     || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  7123598 aaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttg 7123499  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  7123498 ttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtca 7123399  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  7123398 tatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcgtttggttcctt 7123350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5137109 - 5136734
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5137109 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 5137010  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  5137009 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 5136910  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  5136909 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 5136810  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5136809 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 5136734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26558726 - 26558348
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||  |||||||    
T  26558726 cacttaggtcttcactgttttcatcaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagtcgtttgaacttcttcctgggtggcagtgcc 26558627  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    || |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26558626 ttttttgccttagagcatggtatccttgaaagattcgaaagatctcgataaagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcctcaagatgcacctca 26558527  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| | |||| | |    
T  26558526 atattttccaaatcttcaaggaatttgttgaactatgtgagttgctcagtgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgatgctttcgaa 26558427  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 390  Q
    |||||  || |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26558426 attgcatataagccaaggatatggtcatatacaacgactccaactttgaccatatccatgccgcggttggttcctttgc 26558348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 363
Target Start/End: Original strand, 5206841 - 5207165
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||  |     
T  5206841 ctctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttcttaaagctgcttggacttcctccaaggtgatagtgtcttcttttccatagaggatggtatcctg 5206940  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  5206941 gaaggattcaaatgatcttggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcatccttaagatgcacctcaatgttctctaaatcataaaggattttg 5207040  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| | || |||||||  ||| |||   ||| |||||| |||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5207041 ttgaacgtcgttagttgctccattacggtctttaacctcactatcttaaatgagtagatttgttgatttaggatttgtctatgagccaaagactttgtca 5207140  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgccca 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  5207141 tatacaaagactccaactttgccca 5207165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 137 - 387
Target Start/End: Original strand, 12743204 - 12743454
Alignment:
Q  137 ttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattt 236  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12743204 ttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaagattt 12743303  T
Q  237 tgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgt 336  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||    
T  12743304 tgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtatagttgtttcttaaggaattgcctataagccaaagacttggt 12743403  T
Q  337 catatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12743404 catatacaatgatttcaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctt 12743454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4588942 - 4588623
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||    
T  4588942 ctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcgttcatggtgacagtgtcttatttgcaatagagcatggtatcctt 4588843  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | || |||||||| | ||| | ||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  4588842 gaaggattcaaatgatctcggtagagaacagaacaagagtatagcttttccttcgtcctcaagattcacttgaatgttctcctaatcatcaacgattttg 4588743  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    |||||||| || | ||||||  | |  | |||| |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  4588742 ttgaactctgttaattgctctgttacagtctttgactccaccatcttgaatgagtagaattgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtca 4588643  T
Q  339 tatacaaagattccaacttt 358  Q
    ||||||| || |||||||||    
T  4588642 tatacaatgactccaacttt 4588623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47563701 - 47563507
Alignment:
Q  205 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttac 304  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||| |    
T  47563701 cacctcaatgctctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggcctttaaatttaccatcttgaatgagtaaagttgttgc 47563602  T
Q  305 tttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  47563601 tttaggaattgtcgatgagccaacgactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgtcgcggttgtatcctttgctacttctct 47563507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 211 - 393
Target Start/End: Original strand, 18536898 - 18537079
Alignment:
Q  211 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||  |||| |||| ||||||| |||||||    
T  18536898 aatattttccaagtcatcaag-attctgttgaactccgcaagttgctccatgatggccttcgactcttccatcttgaatgagtaaagttgttgctttagg 18536996  T
Q  311 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  18536997 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatatacgaactttgaccacatcgatgccgcgattggttccttcgctac 18537079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 391
Target Start/End: Original strand, 36920884 - 36921071
Alignment:
Q  204 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgtta 303  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |||| |||| |||||||     
T  36920884 gcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttg 36920983  T
Q  304 ctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  36920984 ctttaagacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcaaactttgaccacatcgatgccgcgattggatcctttgct 36921071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 387
Target Start/End: Original strand, 3578083 - 3578263
Alignment:
Q  207 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 306  Q
    ||||||| |||||||| | |||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  3578083 cctcaatgttctccaaataatcaggaatatttttgaactctgtaagttgctccatgatggactttgtctccaccatcttgaatgagtagagttgttgctt 3578182  T
Q  307 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3578183 taaaagttggcgatgatccaaagactttgtcatatataaagactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttcctt 3578263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10113802 - 10113622
Alignment:
Q  207 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactt 306  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||  ||    
T  10113802 cctcaatgttttccaaatcatcaaggattttgttgaactctgttagtcgctccatgatggcctttgactccaccgtcttgaatgagtagagttgttgatt 10113703  T
Q  307 taggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||    
T  10113702 taggaattgcctgtgagccaaagacttagtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatattgcggaaggttcctt 10113622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 389
Target Start/End: Original strand, 22802111 - 22802308
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||| || | ||||| |||  ||||||  |||| |    
T  22802111 catcctcaagatgcaacttaatgttctcaaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccacgacgacctttgactttaccatcttgaatga 22802210  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttg 389  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22802211 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtttcctttg 22802308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Original strand, 14788807 - 14789014
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  14788807 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 14788906  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| |  || ||||||    
T  14788907 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcggtagtatcttttgct 14789006  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  14789007 acttctct 14789014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 12749089 - 12749211
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12749089 cactaaggccttcactgttttcatccactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgcc 12749188  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12749189 ttctttgccatagagcatggtat 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16454262 - 16454055
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  || | |||| ||| |||||||| |||  ||||||  |||| |    
T  16454262 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaattagctctatggtggcctttgactttaccatcttgaatta 16454163  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  16454162 gtaaagttgttgctttaggacttgtcgatgagccaaagtctttgtcgtatacaaatattcaaaatttgaccacatcgatgtcgcggttgtatactttgct 16454063  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  16454062 acttctct 16454055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 12740883 - 12741005
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12740883 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgcc 12740982  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12740983 ttctttgccatagagcatggtat 12741005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36379144 - 36379036
Alignment:
Q  291 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 390  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  36379144 agtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgactacatcgatgccacggttggttccttcgc 36379045  T
Q  391 tactcctct 399  Q
    |||| ||||    
T  36379044 tacttctct 36379036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9225137 - 9224978
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  9225137 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 9225038  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9225037 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 9224978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15313266 - 15313174
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  15313266 tcaagtctttgaacttggtcaactctttggttatcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 15313174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4559142 - 4559067
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcat 129  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||| |||||    
T  4559142 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctcttttccataaagcat 4559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9225310 - 9225222
Alignment:
Q  46 gtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  9225310 gtcattgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 9225222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18913871 - 18913739
Alignment:
Q  47 tcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgatt 146  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||  | ||||  ||||| || ||| | ||| ||||||| |||||||| | ||||||||  |||||  | |    
T  18913871 tcattggacttggttaactccttagttctcaacactgcttagacttcctctaagttgacaatgccttccttgccatatatcatggtatccttgaagaact 18913772  T
Q  147 caaaagatttcggtagagcacacaacaagagta 179  Q
    |||||||| | |||| |||||| ||||||||||    
T  18913771 caaaagatctaggtaaagcacaaaacaagagta 18913739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16624684 - 16624579
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || || || ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  16624684 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagtttcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgc 16624585  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  16624584 cgcggt 16624579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 5147078 - 5147170
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  5147078 tcaagtccttgaacttggtcaattgtttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 5147170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 21519877 - 21520275
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519877 ccctcttgagacacttaggccttcactgtgttaataaactctcaagtccttggactgggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 21519976  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21519977 gtaacagtgccttctttgccatagagcatgatatctttgaatgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatccttaa 21520076  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  21520077 gttgcaccttaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcatttaactccaccatcctaaatgagtagagttg 21520176  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21520177 ttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttggccacatcgatgctgcggttggttcctttgctacttctct 21520275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Original strand, 36560365 - 36560722
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36560365 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 36560464  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36560465 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 36560564  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36560565 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 36560664  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36560665 acaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 36560722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 19503522 - 19503917
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503522 ccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaag 19503618  T
Q  101 gtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503619 gtaacagtgccttacttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 19503718  T
Q  201 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||      
T  19503719 gttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctatcatcctgaatgagtagagtca 19503818  T
Q  301 ttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19503819 ttgctttaggaattgccgatgaggcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 19503917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Original strand, 35217167 - 35217551
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35217167 cacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaaatccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 35217263  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35217264 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 35217363  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  35217364 atattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttagga 35217463  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35217464 attgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 35217551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Original strand, 28569617 - 28569994
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaaca--gtg 109  Q
    |||||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||  |||    
T  28569617 cacttaggtcttcaccgttttcatcagctctcaagtccttggacttggtcatctccttggttctcaaagtcacttgaacttcttctaagttgacaatgtg 28569716  T
Q  110 ccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacct 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28569717 ccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggatttaaaagatctcggtagagcacacaacaagagtataactttatcttcatcctcaagatgcacct 28569816  T
Q  210 caatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttag 309  Q
     |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| |||| ||  |||||    
T  28569817 taatagtcttcatgtcttcaaggattttgttgaactccgtaagttgatccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagtttttgttttag 28569916  T
Q  310 gaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||  || |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||    
T  28569917 gatctgtcgatgagctaaagatttggtcatataccacgactccaactttgatcatatcgattccgcggttggttcctt 28569994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 205 - 399
Target Start/End: Original strand, 22405317 - 22405511
Alignment:
Q  205 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttac 304  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| | ||| |    
T  22405317 caccttaatattctctaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagaatcgttgc 22405416  T
Q  305 tttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22405417 tttaggaattgctgataagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttccttcgctacttctct 22405511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Original strand, 42019041 - 42019368
Alignment:
Q  13 acttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcct 112  Q
    ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||| | ||| |||||||| ||| |||||    
T  42019041 acttatgccttcactattttcatcaactctcaagtccttggacttggttaacttcttggttctaaaagtcgattggaattcctccaaggtgacaatgcct 42019140  T
Q  113 tctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaa 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||    
T  42019141 tctttgaaatagagcatggtatccttgaagaattcaaatgatctcggtatagcatacaacaagagtataactttgtctttatccttaagatgcacctcaa 42019240  T
Q  213 tattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaa 312  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||   |||   || ||||| |  ||||||||    
T  42019241 tgttctccaagtcatcatggattttgttgaactttgttagttactccacgatgacctttgactccaccatcttaaatgtataaagttggtgttttaggaa 42019340  T
Q  313 ttgccgatgagccaaagactttgtcata 340  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  42019341 ttgcctataagccaaagacttggtcata 42019368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Original strand, 6263528 - 6263723
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |    
T  6263528 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaactgttttgttgaactccataagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 6263627  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6263628 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatatctgaactttgaccacatcgatgccgcggttgtttcctt 6263723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 393
Target Start/End: Original strand, 34574631 - 34574733
Alignment:
Q  291 agtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgc 390  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34574631 agtagagttgttgcatttggaattgcctatgagccaaaggctttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatgccgcggttggttcctttgc 34574730  T
Q  391 tac 393  Q
    |||    
T  34574731 tac 34574733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 19348631 - 19348790
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | || ||| |     
T  19348631 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtct 19348730  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348731 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 19348790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17933057 - 17932982
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcat 129  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||    
T  17933057 acttggtcaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 17932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2737141 - 2736856
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaaga 153  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||    ||||| ||    
T  2737141 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttaaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 2737042  T
Q  154 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 253  Q
      | |||| ||||||||  | | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  2737041 cctgggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 2736942  T
Q  254 tgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcat 339  Q
    |||||||| || |  ||| |||||||||| |   | |||||||||||||  || || ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  2736941 tgctccattataggttttgactccaccatacgataaaagtagagttgttgtttcagaaattgcctatgtgccaaagacttggtcat 2736856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 25403058 - 25403163
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgt 372  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||     
T  25403058 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgc 25403157  T
Q  373 cgcggt 378  Q
    ||||||    
T  25403158 cgcggt 25403163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39680982 - 39680902
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  39680982 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 39680902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23079146 - 23079048
Alignment:
Q  273 actccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 371  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  23079146 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatg 23079048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 20054005 - 20054085
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20054005 acttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 20054085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Original strand, 25402827 - 25402919
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  25402827 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttggacctcttccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 25402919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 339
Target Start/End: Original strand, 22716492 - 22716763
Alignment:
Q  68 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcac 167  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||    ||||| ||  | |||| |||||    
T  22716492 ttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaaggacctaggtaaagcac 22716591  T
Q  168 acaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggc 267  Q
    |||  | | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| || |     
T  22716592 acagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagttgctccattatagg 22716691  T
Q  268 ctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcat 339  Q
     ||| |||||||||| | | | |||||||||||||  || ||  |||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  22716692 ttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcat 22716763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23181 - 22824
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23181 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23082  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23081 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 22982  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 22882  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22881 acaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 22824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34651 - 34248
Alignment:
Q  1 ccctcttaagccacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaa- 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34651 ccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaaccccttggttctcaaagccacttgaacttcttccaat 34552  T
Q  100 ----ggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatc 195  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34551 gcaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacaattcaaaagattttggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatc 34452  T
Q  196 ctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtag 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |    
T  34451 ctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgtttaactccgtgagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtgg 34352  T
Q  296 agttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactc 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||     
T  34351 agttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgttgttgtttcctttgctactt 34252  T
Q  396 ctct 399  Q
    ||||    
T  34251 ctct 34248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33309944 - 33309587
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33309944 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 33309845  T
Q  142 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33309844 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 33309745  T
Q  242 aactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33309744 aactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 33309645  T
Q  342 acaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33309644 acaaagattccaactttgcccatatcgatgctgcggttgcttcctttgctacttctct 33309587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Original strand, 26067592 - 26067971
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26067592 cacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgcc 26067688  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26067689 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctca 26067788  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  26067789 atattctccaagtcatctaggatttttttgaactccgtaagttgctcaatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgctttagga 26067888  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26067889 attgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctact 26067971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 393
Target Start/End: Original strand, 25462660 - 25463040
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25462660 cacttaggccttcactgttttcatcaattctcaagtccttgaactcggtcaactccttggttctcaaagtcgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 25462759  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25462760 ttctttaccataaagcatgatatctttgaaagattcaaaag-tctcggtagggtacacaacaagagtataaatttatcttcatcctcaagatgcacctca 25462858  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  25462859 atattctccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttagga 25462958  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  25462959 attgccgatgagcctaagactttgtcatatacaaagactataactttaactacatcgatgccgcgtttggttctttcgctac 25463040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16651954 - 16651578
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16651954 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 16651855  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16651854 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcatcctcaagttgcacctca 16651755  T
Q  212 atat-tctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 310  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  16651754 atgtgtctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagg 16651655  T
Q  311 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16651654 aattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16651578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16553693 - 16553318
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16553693 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccctggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 16553594  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  16553593 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcagtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 16553494  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16553493 atgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 16553394  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16553393 attgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16553318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16630249 - 16629874
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16630249 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccctggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 16630150  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  16630149 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcagtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 16630050  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16630049 atgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 16629950  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16629949 attgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttcctt 16629874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Original strand, 5408247 - 5408595
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5408247 ctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatcctt 5408346  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  5408347 gaaggattcaaatgatatcaatagagtacacaacaatagtatagtcttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttg 5408446  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5408447 ttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtca 5408546  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5408547 tatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttagttcctt 5408595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Original strand, 5412572 - 5412920
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  5412572 ctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatcctt 5412671  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  5412672 gaaggattcaaatgatatcaatagagtacacaacaatagtatagtcttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttg 5412771  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    ||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5412772 ttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtca 5412871  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5412872 tatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttagttcctt 5412920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30444378 - 30443998
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||   |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30444378 cacttaggccttcaccgttttcatcggctctcaagcccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctaggtgacagtgcc 30444279  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||    
T  30444278 ttctttgccatagagcatggtatcgttgacaaattcaaaagatctcggtagagcacacaagtagagtataactttatcttcatgctcaagatacacctca 30444179  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||   ||| |||||||||||  |||||| |    
T  30444178 atgttctccaaattataaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggtgtataaatccatcatcttaaatgagtagagttgtggctttagaa 30444079  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgcta 392  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30444078 attgtctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgccgtggttggttccttcgcta 30443998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12158336 - 12157961
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| | || |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12158336 cacttagaccttcaccgttttcatcagctatcaaatccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgtttgaacatcttctaaggtgacagtgcc 12158237  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||| | ||| ||||  | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  12158236 ttctttgccataaatcattgtatcctcgaaagattccaataatctcggtagcgcacagaacaagagtatatctttatcttcatccacaagatgcacctca 12158137  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||  || ||||||||    
T  12158136 atgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactctgtaagtttctccatggtggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagtgcttgctttagga 12158037  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12158036 attgccaatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgtcgcgtttggttcctt 12157961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34165901 - 34165526
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34165901 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgcc 34165802  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  34165801 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 34165702  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | ||||||||| | || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34165701 atgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaagga 34165602  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34165601 attgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttcctt 34165526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 174 - 399
Target Start/End: Original strand, 26931919 - 26932144
Alignment:
Q  174 agagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaa 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26931919 agagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttga 26932018  T
Q  274 ctccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtc 373  Q
    |||  |||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  26932019 ctcttccatcttgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacaacgatgcc 26932118  T
Q  374 gcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26932119 gcggttgcttcctttgctacttctct 26932144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 12936558 - 12936824
Alignment:
Q  127 catggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtca 226  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||| | | ||||||||  |||||||||||| |||  ||||||    
T  12936558 catggtatctttgaatgattcataagttctcggtagagcacacaacatgagtataattttacctttatcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtca 12936657  T
Q  227 tcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagcca 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12936658 tcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttaaatgagtagagttgttgctttaggaattgccaatgagcca 12936757  T
Q  327 aagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctac 393  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  12936758 aagattttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatggcgcggttggttctttcgctac 12936824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16568003 - 16567733
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    |||| |||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16568003 cactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgcc 16567904  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||    
T  16567903 ttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagtcttgtcttcgtcctcaagttgcacctca 16567804  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccat 282  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  16567803 atgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccat 16567733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 338
Target Start/End: Original strand, 12910882 - 12911093
Alignment:
Q  127 catggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtca 226  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |||| | | ||||||||  |||||||||||| |||  ||||||    
T  12910882 catggtatctttgaaagattcataagttctcggaagagcacacaacatgagtataattttacctttatcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtca 12910981  T
Q  227 tcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagcca 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12910982 tcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattcccaatgagcca 12911081  T
Q  327 aagactttgtca 338  Q
    ||||||||||||    
T  12911082 aagactttgtca 12911093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17012948 - 17012766
Alignment:
Q  211 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||| ||    
T  17012948 aatattctccaagtcatcaaggatttt-ttgaactccgcaagtttctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttgg 17012850  T
Q  311 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17012849 aattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcagttggttcctttgctact 17012766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 394
Target Start/End: Original strand, 15533976 - 15534178
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||  |||| |    
T  15533976 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgtcgaactccacaagtagctccatgatggtttttgactctaccatcttgaatga 15534075  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534076 gtaaagttgttgctttaggacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 15534175  T
Q  392 act 394  Q
    |||    
T  15534176 act 15534178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3395238 - 3395094
Alignment:
Q  255 gctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaa 354  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395238 gctccgtgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaa 3395139  T
Q  355 ctttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3395138 ctttgcacacatcgatgcggcggttggttcctttgccacttctct 3395094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 394
Target Start/End: Original strand, 3631312 - 3631519
Alignment:
Q  187 atcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccg 286  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  |    
T  3631312 atccacatcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttattgaactctacaagtagctccatgatggcctttgactttaccatcttg 3631411  T
Q  287 aataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcct 386  Q
    ||| |||| |||| || ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||    
T  3631412 aatgagtaaagttattgctttaggaattgttgatgagtcaaagactttgtcatatacaaagcttccaactttggccacatcgatgctgcggtggattcct 3631511  T
Q  387 ttgctact 394  Q
    | ||||||    
T  3631512 tcgctact 3631519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26944403 - 26944229
Alignment:
Q  218 tccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgcc 317  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  ||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||  |||| | || ||||||  |||||||||||| |    
T  26944403 tccaagttatcaaggattctgttgaactccacaaagttctctatgatggcctttgactctaccatcttgaattattaaagttgtcgctttaggaattgtc 26944304  T
Q  318 gatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgcta 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26944303 gataagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatggcgcggttggttccttcgcta 26944229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14738305 - 14738146
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||  |||||| ||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  14738305 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagatcgatttagactccatcatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 14738206  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14738205 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgccaacatcgatgccgcggt 14738146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33331172 - 33331027
Alignment:
Q  226 atcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagcc 325  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||||    
T  33331172 atcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagcc 33331073  T
Q  326 aaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 371  Q
    ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33331072 aaagatttcatcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 33331027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 17694096 - 17694176
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17694096 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 17694176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25942605 - 25942320
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaaga 153  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||    ||||| ||    
T  25942605 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 25942506  T
Q  154 tttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 253  Q
      | |||| ||||||||  | | |||  ||||||||||| || || || |  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  25942505 cctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 25942406  T
Q  254 tgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcat 339  Q
    |||||||| || |  ||| |||||||||| | | | |||||||||||||  || ||  |||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  25942405 tgctccattataggttttgactccaccattcggtaaaagtagagttgttgtttcagacattgtctatgtgccaaagacttggtcat 25942320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Original strand, 10456883 - 10457019
Alignment:
Q  64 ctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtaga 163  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||| | |||| |    
T  10456883 ctccttggttcaaaatgccgcttggacttcctctaaggtgacactgccttcgttgtcataaagcatggtatcattgaaggacccaaaagatctaggtaaa 10456982  T
Q  164 gcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaa 200  Q
    | |||||||||| ||| || ||| || ||||||||||    
T  10456983 gtacacaacaagggtagagttttgtcttcatcctcaa 10457019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13879675 - 13879595
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  13879675 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtat 13879595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 123
Target Start/End: Original strand, 22350194 - 22350285
Alignment:
Q  32 tcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccata 123  Q
    |||| |||| |||| || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||    
T  22350194 tcatcaactttcaactctttgaacttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgataatgccatctttgccata 22350285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14738470 - 14738390
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| || || ||||| || |||||||    
T  14738470 acttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagcagtgccctccttaccataaaggatggtat 14738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 706 - 322
Alignment:
Q  12 cacttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  706 cacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtcctttgacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgcc 610  T
Q  112 ttctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctca 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  609 ttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcctcaagtttcacctca 510  T
Q  212 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  509 atattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcgttgctttagga 410  T
Q  312 attgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactcctct 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  409 attgccgatgagccaaaggctttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccacggttgcttcctttgctacttctct 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 39 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 115593 - 115245
Alignment:
Q  39 ctctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  115593 ctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcctt 115494  T
Q  139 gaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttg 238  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || || | || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  115493 gaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagcctgttcttcgttctaaagtttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttg 115394  T
Q  239 ttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtca 338  Q
    |||||||| || | ||||||||| | || |||| | |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  115393 ttgaactctgtcaattgctccatcacggtctttgaatccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtca 115294  T
Q  339 tatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctt 387  Q
    ||||||| || | |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  115293 tatacaatgactacaactttgaccacgtcgatgccgcggttggttcctt 115245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 352 - 137
Alignment:
Q  43 caagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatgtttgaac 142  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||     
T  352 caagtccttggacctggtcaactctttggttctcaaagttgattgaacttcttccaaggtgacactgcgttctttgccatagagcatggtatccttgaag 253  T
Q  143 gattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttga 242  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  252 gattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagctttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttga 153  T
Q  243 actccgtaagttgctc 258  Q
    ||||||| | ||||||    
T  152 actccgttaattgctc 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 394
Target Start/End: Original strand, 26284 - 26466
Alignment:
Q  211 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||| ||    
T  26284 aatattctccaagtcatcaaggatttt-ttgaactccgcaagtttctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttgg 26382  T
Q  311 aattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgctact 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26383 aattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcagttggttcctttgctact 26466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 26568 - 26920
Alignment:
Q  13 acttaggccttcacagtgttcatgaactctcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcct 112  Q
    |||||| |||||||  | ||||| | || ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||    
T  26568 acttagaccttcactattttcatcatctatcaagtccttggacttagttaactccttggttctcaaatccgcttggacgtccttcaaggtggcagtgcct 26667  T
Q  113 tctttgccatagagcatggtatgtttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaa 212  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  26668 tctttaccatagagcatggtacccttgaaggattcaaatgatcacggtagagcacacaaaaagagtatagctttgccttcatcctcaagatgcacatcaa 26767  T
Q  213 tattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaa 312  Q
    | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||| ||   ||||| |||||||||||   ||  ||||||| |||   ||||||||    
T  26768 tgttctccaaatcatcaagaatttgtttgaactccattagttgctccaagacaacctttgactccaccatcttaaacgagtagagatgtagttttaggaa 26867  T
Q  313 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaca 365  Q
    |||   |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  26868 ttgtgtatgagccaaagaatttgtcacatacaacgactccaactttgaccaca 26920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 80771 - 80564
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  80771 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 80672  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  80671 gtaaagttgttgctttaggactttccgttgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatggcgcggttgtttcctttgct 80572  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  80571 acttctct 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 50923 - 50716
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  50923 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 50824  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| |  || ||||||    
T  50823 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcggtagtatcttttgct 50724  T
Q  392 actcctct 399  Q
    ||| ||||    
T  50723 acttctct 50716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 391
Target Start/End: Original strand, 826 - 1025
Alignment:
Q  192 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataa 291  Q
    ||||||||||  ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||| |||  ||||||  |||| |    
T  826 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagcaccatgatagcctttgactttaccatcttgaatga 925  T
Q  292 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttcctttgct 391  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  926 gtaaagttgttgctttaggactttccgataagccaaagactttgtcatatacaaaaattcaaaatttgaccacatcgatgacgcggttgtttcctttgct 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15042 - 14883
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | || |||||     
T  15042 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcct 14943  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14942 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 14883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 610 - 454
Alignment:
Q  219 ccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttactttaggaattgccg 318  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||  |||| | || ||||||| ||| | || |||||     
T  610 ccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaataaagttgttgcttcaagagttgcct 511  T
Q  319 atgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgc 375  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  510 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgc 454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 149701 - 149529
Alignment:
Q  206 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcccgaataagtagagttgttact 305  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||    
T  149701 acctcaatgttggccaaatcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgct 149602  T
Q  306 ttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    | | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  149601 tcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacattgatgccgcggt 149529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17261 - 17181
Alignment:
Q  54 acttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17261 acttggtcaattctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtaatagtgccctctttgccatagagcatagtat 17181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18583 - 18518
Alignment:
Q  313 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 378  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18583 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggt 18518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18757
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||||    
T  18849 tcaagtccttgaacttggtcaattcgttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 18757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4104 - 4059
Alignment:
Q  42 tcaagtcattggacttggtcatctccttggttctcaaagccgcttg 87  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4104 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University