View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4968_low_8 (Length: 394)

Name: NF4968_low_8
Description: NF4968
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4968_low_8
NF4968_low_8
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (19-384)||(2071702-2072067)
chr7 (19-384)||(2124776-2125141)
chr7 (21-384)||(2064596-2064959)
chr7 (21-387)||(2103705-2104071)
chr7 (22-338)||(2137293-2137609)
chr7 (44-384)||(2121409-2121749)
chr7 (19-376)||(2246741-2247098)
chr7 (21-356)||(2134175-2134510)
chr7 (21-373)||(2097408-2097760)
chr7 (21-384)||(2692920-2693283)
chr7 (23-373)||(2055308-2055658)
chr7 (22-369)||(1697875-1698222)
chr7 (156-197)||(2054331-2054372)
chr7 (156-197)||(2119623-2119664)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Original strand, 2071702 - 2072067
Alignment:
Q  19 aaaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2071702 aaaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtattggacccgtgagattgttaaaggacacatttaagaatt 2071801  T
Q  119 ccaaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2071802 ccaaaaaggtgatttgtgccaactgttggggaattttccctgaaagactgttgacagaaagatctaacgcttcaaggttagaaagcttccctaaggaaga 2071901  T
Q  219 tggaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgctt 318  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2071902 tggtatgcttccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgctt 2072001  T
Q  319 gaaatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttgccagccctttg 384  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  2072002 gaaatatcaatggctatcaagctgtaaaatttttgaagcttcacataaaccctggccagtcctttg 2072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Original strand, 2124776 - 2125141
Alignment:
Q  19 aaaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2124776 aaaccttggttaccctcaaatgaatcatctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagtact 2124875  T
Q  119 ccaaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaaga 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2124876 ccaaaaaggtgatttctgccaactgttggggaatttttcctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagattccctaaggaaga 2124975  T
Q  219 tggaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgctt 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2124976 tggtatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagtaaaacaagtcccttcaactcgcctataacatgtggtatctctccactgattttgttgctt 2125075  T
Q  319 gaaatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttgccagccctttg 384  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2125076 gaaatatcaatggctattaagctgtagaaattttgaagcttctcataaacccttgcaaaccctttg 2125141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 384
Target Start/End: Original strand, 2064596 - 2064959
Alignment:
Q  21 accttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattcc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2064596 accttgattaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaatgacacatttaagaactcc 2064695  T
Q  121 aaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatg 220  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2064696 aaaaaggtgatttcagccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatg 2064795  T
Q  221 gaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttga 320  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2064796 gaatgctgccaataagcatattatttgacaagtttagcaaaacaagaccctttaactcgcctatcatttgtggtatctctccgctgattttgttgcttga 2064895  T
Q  321 aatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttgccagccctttg 384  Q
    ||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2064896 aatatcaatggctatcaagctgtaaaatttttgaagcttctcataaaccctggccagtcctttg 2064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 387
Target Start/End: Original strand, 2103705 - 2104071
Alignment:
Q  21 accttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattcc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2103705 accttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagtactcc 2103804  T
Q  121 aaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatg 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2103805 aaaaaggtgatttctgccaactgttcgggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatg 2103904  T
Q  221 gaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttga 320  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2103905 gaatgctgccaataagattgttattcgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcgtctatgatttgtggtatttctccactgattttgttgcttga 2104004  T
Q  321 aatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttgccagccctttgctt 387  Q
    ||||||||| ||||| ||  | ||||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  2104005 aatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagcttctcataaaccctgtccatccctttgctt 2104071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 2137293 - 2137609
Alignment:
Q  22 ccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattcca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2137293 ccttggttaccctcaaatgaatcacttttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaacgcca 2137392  T
Q  122 aaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatgg 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2137393 aaaaggtgatttctgccaactgttggggaatttttcctgaaagactgttgcgagaaagatctagtgcttcaaggttcgaaagcttccctaaggaagatgg 2137492  T
Q  222 aatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttgaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2137493 aatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcgccaatcacttgtggtatctctccactgattttgttgcttgaa 2137592  T
Q  322 atatcaattgctattaa 338  Q
    |||||||| ||||||||    
T  2137593 atatcaatggctattaa 2137609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 2121409 - 2121749
Alignment:
Q  44 cacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattccaaaaaggtgatttgtgccaactg 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2121409 cacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtaagattgttaaatgacacatttaagtattccaaaaaggtgatttgtgccaactg 2121508  T
Q  144 ttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatggaatgctgccaataaggtggtta 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  2121509 ttggggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatggaatgctgccaataagcatatta 2121608  T
Q  244 tttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttgaaatatcaattgctattaaatttt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |    
T  2121609 tttgacaagtttagcaaaacaagaccctttaattcgcctatcatttgtggtatctctccgctgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgt 2121708  T
Q  344 aaaaattttgaagcttctcataaacccttgccagccctttg 384  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2121709 aaaatttttgaagcttctcataaaccctggccagtcctttg 2121749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2247098 - 2246741
Alignment:
Q  19 aaaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2247098 aaaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattatgttctggtataggacctgtgagattgttaaaagacacatttaagtatt 2246999  T
Q  119 ccaaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||    
T  2246998 ccaaaaaggtgatttgtgccaactgttggggtattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttcgcaattgaaga 2246899  T
Q  219 tggaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgctt 318  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  2246898 tggaatgctgccaataagattgttattcgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcacctatgacttgtggtatttctccactgattttattgctt 2246799  T
Q  319 gaaatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttgcca 376  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2246798 gaaatatcaatggctattaaactgtaaaatttttgaagcttttcataaaccctggcca 2246741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 2134175 - 2134510
Alignment:
Q  21 accttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattcc 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  2134175 accttgattaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacaaatttaagaactgc 2134274  T
Q  121 aaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatg 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2134275 aaaaaggtaatttgtgccaactgttggggaattttccctgaaagactgttgacagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatt 2134374  T
Q  221 gaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttga 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2134375 gaatgctgccaataaggaggttattagagaagttgagcaaaacaaggcccttcaactcgcctatgccttgtggtatttctccactgattttgttgcttga 2134474  T
Q  321 aatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaag 356  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||    
T  2134475 aatatcaatggctattaagttgtaaattttttgaag 2134510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 373
Target Start/End: Original strand, 2097408 - 2097760
Alignment:
Q  21 accttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattcc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2097408 accttggttaccctcaaatgaatcatctttgaatgtggaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagtactcc 2097507  T
Q  121 aaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatg 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2097508 aaaaaggtgatttctgccaactgtttgggaatttttcctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaagttttgaaagcttccctaaggaagatg 2097607  T
Q  221 gaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttga 320  Q
    | ||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2097608 gtatgcttccaataagcatattattcgacaagttgagcaaaacaagaccctttaactcgcctatcacttgtggtatctctccactgattttgttgcttga 2097707  T
Q  321 aatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttg 373  Q
    ||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2097708 aatatcaatggctattaagctgtagaaattctgaaggttctcataaacccttg 2097760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2693283 - 2692920
Alignment:
Q  21 accttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattcc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||    
T  2693283 accttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctctgagtttattaaaggacacatttaagtactcc 2693184  T
Q  121 aaaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatg 220  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2693183 aaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagcttccctactgaagatg 2693084  T
Q  221 gaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttga 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2693083 gaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccaccgattttgttgcttga 2692984  T
Q  321 aatatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttgccagccctttg 384  Q
    ||||||||| ||||| ||  | ||||| | |||||| |||||||||||||| | || |||||||    
T  2692983 aatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttg 2692920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 2055308 - 2055658
Alignment:
Q  23 cttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattccaa 122  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2055308 cttgattaccctcaaacgagtcatctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctctgagattgttaaaggacacatttaagaactccaa 2055407  T
Q  123 aaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatgga 222  Q
    || |||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  2055408 aatggtgatttctgtcaactgttagggaactttccctgaaagactgttgagggaaagatctagtgcttcaaggtttataagcttccctaaggatgatggt 2055507  T
Q  223 atgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttgaaa 322  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2055508 atgctaccagtaaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcttctatcacttgcggtatctctccactgattttgttgcttgaaa 2055607  T
Q  323 tatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacccttg 373  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||    
T  2055608 tatcaatggctattaaattgtacaaattttgaagcttgatataaacccttg 2055658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1698222 - 1697875
Alignment:
Q  22 ccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggacacatttaagaattcca 121  Q
    |||||||| || |||||||||| | |||  || ||||| ||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||    
T  1698222 ccttggttgccttcaaatgaattatcttgaaatgtagagaactgctgattctgcggtataggacctgagagattgttgaaggacacattaaggaactcca 1698123  T
Q  122 aaaaggtgatttgtgccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatgg 221  Q
    ||||||| |  ||||  |||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1698122 aaaaggtaaggtgtgttaactgttgaggaatcttccccgacagattgttgaaagaaagatccagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatgg 1698023  T
Q  222 aatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagtcccttcaagtcgcctatcacttgtggtatctctccgctgattttgttgcttgaa 321  Q
     ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  1698022 tatgttgccagtaaggatgttatttgacaagttgagcaaaacaaggcccttcaattcgcctatcgctcttggtatctctccacttatttggttgcttgaa 1697923  T
Q  322 atatcaattgctattaaattttaaaaattttgaagcttctcataaacc 369  Q
    |||||||| ||||| |  || ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  1697922 atatcaatggctatcattttataaaactcttgaagcctctcataaacc 1697875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Original strand, 2054331 - 2054372
Alignment:
Q  156 ccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtt 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2054331 ccctgaacaactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtt 2054372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Original strand, 2119623 - 2119664
Alignment:
Q  156 ccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtt 197  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2119623 ccctgaacgaatgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtt 2119664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University