View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4970-Insertion-14 (Length: 420)

Name: NF4970-Insertion-14
Description: NF4970
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4970-Insertion-14
NF4970-Insertion-14
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (46-420)||(44686348-44686720)
chr2 (46-416)||(28224932-28225298)
chr2 (39-420)||(27502287-27502663)
chr2 (34-420)||(4412871-4413253)
chr2 (39-420)||(41867713-41868090)
chr2 (40-420)||(17344564-17344940)
chr2 (34-408)||(3825646-3826017)
chr2 (34-408)||(9685232-9685602)
chr2 (34-326)||(5532341-5532627)
chr2 (54-370)||(18744809-18745121)
chr2 (34-381)||(19161627-19161970)
chr2 (188-420)||(23484743-23484975)
chr2 (34-407)||(16351657-16352031)
chr2 (71-351)||(20142614-20142875)
chr2 (116-403)||(2888518-2888797)
chr2 (79-218)||(34814826-34814960)
chr2 (54-163)||(13413291-13413400)
chr2 (252-420)||(9674978-9675146)
chr2 (35-190)||(32029117-32029272)
chr2 (282-386)||(13146973-13147077)
chr2 (35-163)||(8036540-8036670)
chr2 (285-420)||(10579584-10579719)
chr2 (34-235)||(13147087-13147287)
chr2 (34-327)||(7760744-7761032)
chr2 (116-327)||(33612445-33612652)
chr2 (6-107)||(27494203-27494304)
chr2 (188-374)||(44720393-44720577)
chr2 (54-124)||(44684955-44685025)
chr2 (112-190)||(2886646-2886724)
chr2 (191-244)||(1296031-1296084)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (34-420)||(34644486-34644868)
chr1 (40-325)||(2764405-2764686)
chr1 (40-420)||(28040932-28041308)
chr1 (74-420)||(29169599-29169940)
chr1 (51-379)||(45659493-45659816)
chr1 (40-407)||(4861807-4862170)
chr1 (132-420)||(19035465-19035749)
chr1 (118-381)||(37932062-37932320)
chr1 (79-361)||(20259662-20259939)
chr1 (46-327)||(22346827-22347102)
chr1 (60-236)||(21472949-21473121)
chr1 (34-245)||(31737303-31737509)
chr1 (112-381)||(25375677-25375942)
chr1 (171-326)||(50161316-50161467)
chr1 (114-272)||(16500034-16500188)
chr1 (86-396)||(42919832-42920137)
chr1 (41-165)||(47459609-47459733)
chr1 (34-245)||(2898622-2898832)
chr1 (34-213)||(38731529-38731704)
chr1 (39-163)||(24177569-24177693)
chr1 (187-419)||(37200051-37200281)
chr1 (50-163)||(7213186-7213299)
chr1 (251-420)||(38731713-38731882)
chr1 (238-386)||(43831436-43831585)
chr1 (39-129)||(48841174-48841264)
chr1 (34-81)||(45835326-45835373)
chr1 (34-84)||(4611109-4611159)
chr1 (304-386)||(35387156-35387238)
chr1 (344-420)||(22347103-22347179)
chr1 (341-381)||(22375481-22375521)
chr1 (188-232)||(35387653-35387697)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (34-420)||(50000730-50001113)
chr4 (34-370)||(53619506-53619838)
chr4 (99-419)||(31847072-31847388)
chr4 (34-381)||(55933306-55933647)
chr4 (7-407)||(132278-132676)
chr4 (51-393)||(56461939-56462276)
chr4 (247-420)||(3330079-3330252)
chr4 (34-420)||(26521409-26521790)
chr4 (112-418)||(12918179-12918481)
chr4 (34-190)||(3329916-3330072)
chr4 (39-408)||(53170437-53170791)
chr4 (39-386)||(25504220-25504561)
chr4 (34-318)||(46440795-46441076)
chr4 (34-161)||(4419183-4419310)
chr4 (34-420)||(30940544-30940919)
chr4 (34-165)||(39001317-39001448)
chr4 (74-407)||(6865631-6865967)
chr4 (34-242)||(23255633-23255828)
chr4 (188-417)||(16957612-16957835)
chr4 (188-396)||(12053483-12053689)
chr4 (46-266)||(600651-600867)
chr4 (261-420)||(25706652-25706811)
chr4 (34-246)||(34107673-34107883)
chr4 (39-269)||(48656866-48657097)
chr4 (41-145)||(16955387-16955491)
chr4 (46-162)||(38535628-38535744)
chr4 (38-190)||(7536602-7536754)
chr4 (112-190)||(50483227-50483305)
chr4 (187-296)||(45385990-45386099)
chr4 (275-325)||(54927613-54927663)
chr4 (112-290)||(50462881-50463055)
chr4 (54-162)||(28739845-28739953)
chr4 (37-320)||(46391220-46391496)
chr4 (85-256)||(43849317-43849484)
chr4 (39-165)||(54190907-54191033)
chr4 (35-136)||(42455692-42455793)
chr4 (112-164)||(53098419-53098471)
chr4 (238-355)||(53098527-53098643)
chr4 (303-378)||(18534585-18534660)
chr4 (45-108)||(18981652-18981714)
chr4 (34-92)||(22449815-22449872)
chr4 (34-90)||(8738125-8738181)
chr4 (37-162)||(49354125-49354254)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (34-420)||(35310368-35310750)
chr5 (42-420)||(13166715-13167089)
chr5 (34-409)||(27336615-27336984)
chr5 (51-420)||(33691861-33692224)
chr5 (41-355)||(32269667-32269977)
chr5 (197-420)||(433371-433594)
chr5 (116-408)||(43129536-43129823)
chr5 (39-271)||(37873592-37873820)
chr5 (34-245)||(25663012-25663219)
chr5 (112-351)||(14423680-14423912)
chr5 (225-420)||(38446271-38446468)
chr5 (8-190)||(430496-430678)
chr5 (36-395)||(34335259-34335614)
chr5 (34-420)||(15291831-15292212)
chr5 (59-420)||(26212387-26212745)
chr5 (121-354)||(35455963-35456192)
chr5 (188-386)||(3114003-3114200)
chr5 (34-266)||(42921618-42921845)
chr5 (112-324)||(43115359-43115566)
chr5 (188-326)||(8858986-8859124)
chr5 (34-303)||(8100474-8100737)
chr5 (34-189)||(22188687-22188842)
chr5 (34-165)||(23423927-23424058)
chr5 (45-245)||(38875570-38875765)
chr5 (34-108)||(23023515-23023589)
chr5 (188-302)||(32230430-32230544)
chr5 (34-122)||(2566194-2566282)
chr5 (282-405)||(9841146-9841270)
chr5 (121-190)||(14723275-14723344)
chr5 (282-371)||(27355570-27355659)
chr5 (35-98)||(22819761-22819824)
chr5 (94-159)||(26010276-26010340)
chr5 (40-77)||(34475967-34476004)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (34-420)||(28517092-28517474)
chr7 (34-408)||(5825193-5825561)
chr7 (56-386)||(19277235-19277561)
chr7 (46-420)||(4501191-4501560)
chr7 (5-354)||(21326709-21327054)
chr7 (39-386)||(43856799-43857142)
chr7 (45-420)||(982880-983251)
chr7 (34-326)||(22197907-22198194)
chr7 (34-326)||(22239627-22239914)
chr7 (40-327)||(32584526-32584810)
chr7 (34-359)||(27521391-27521710)
chr7 (34-408)||(45613659-45614029)
chr7 (34-327)||(24527509-24527798)
chr7 (152-420)||(3676677-3676942)
chr7 (34-229)||(40726476-40726667)
chr7 (35-243)||(30216040-30216244)
chr7 (34-190)||(48539101-48539257)
chr7 (43-420)||(10905047-10905405)
chr7 (117-327)||(2904368-2904574)
chr7 (112-420)||(47679123-47679427)
chr7 (101-266)||(9281091-9281251)
chr7 (101-266)||(9292062-9292222)
chr7 (197-323)||(33202368-33202493)
chr7 (46-243)||(42295166-42295359)
chr7 (34-110)||(45003008-45003084)
chr7 (39-158)||(41117833-41117952)
chr7 (34-138)||(23037465-23037569)
chr7 (127-327)||(38839337-38839536)
chr7 (250-325)||(9266173-9266247)
chr7 (51-316)||(34772719-34772977)
chr7 (56-136)||(25187016-25187096)
chr7 (190-267)||(1249658-1249735)
chr7 (34-91)||(5714960-5715017)
chr7 (298-386)||(38596635-38596723)
chr7 (46-144)||(5972293-5972391)
chr7 (188-318)||(34067769-34067899)
chr7 (117-190)||(6634994-6635067)
chr7 (94-190)||(10032202-10032298)
chr7 (361-420)||(32585390-32585449)
chr7 (39-190)||(36558899-36559049)
chr7 (64-107)||(38766259-38766302)
chr7 (198-325)||(43383249-43383376)
chr7 (34-84)||(41071738-41071788)
chr7 (39-92)||(27027759-27027812)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (34-381)||(33220555-33220898)
chr6 (39-420)||(34304421-34304798)
chr6 (34-420)||(357522-357903)
chr6 (34-420)||(4206401-4206783)
chr6 (34-332)||(17249198-17249492)
chr6 (34-370)||(959501-959832)
chr6 (133-370)||(28543394-28543627)
chr6 (40-386)||(29337922-29338260)
chr6 (79-420)||(45474-45819)
chr6 (205-420)||(32115776-32115991)
chr6 (199-420)||(12401412-12401633)
chr6 (34-228)||(4165919-4166109)
chr6 (39-326)||(28008886-28009169)
chr6 (34-349)||(34554153-34554463)
chr6 (86-349)||(34415408-34415667)
chr6 (39-257)||(28625856-28626070)
chr6 (39-130)||(32115643-32115734)
chr6 (215-407)||(20693419-20693610)
chr6 (95-327)||(24016318-24016545)
chr6 (199-272)||(34168949-34169022)
chr6 (34-106)||(3137362-3137434)
chr6 (34-190)||(13398213-13398369)
chr6 (34-162)||(26225638-26225766)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (34-420)||(39434587-39434969)
chr8 (10-357)||(3187866-3188208)
chr8 (40-302)||(38815220-38815478)
chr8 (53-417)||(24124967-24125327)
chr8 (59-420)||(35739792-35740148)
chr8 (34-420)||(25021619-25022001)
chr8 (94-386)||(500208-500495)
chr8 (34-304)||(6592496-6592760)
chr8 (188-354)||(37517164-37517330)
chr8 (112-317)||(8619812-8620013)
chr8 (142-386)||(42921966-42922206)
chr8 (43-160)||(3821153-3821270)
chr8 (53-314)||(4699810-4700064)
chr8 (139-420)||(10189568-10189845)
chr8 (43-190)||(37514150-37514297)
chr8 (34-117)||(42659147-42659230)
chr8 (34-163)||(22589395-22589523)
chr8 (187-243)||(8882396-8882452)
chr8 (34-327)||(4073454-4073741)
chr8 (34-136)||(9259377-9259479)
chr8 (34-249)||(28196112-28196323)
chr8 (34-217)||(6618205-6618383)
chr8 (36-160)||(3863236-3863363)
chr8 (52-165)||(43823927-43824040)
chr8 (194-327)||(11611146-11611275)
chr8 (39-176)||(121766-121903)
chr8 (40-326)||(8115738-8116019)
chr8 (34-147)||(18804533-18804645)
chr8 (252-376)||(39671036-39671159)
chr8 (192-243)||(22589336-22589387)
chr8 (46-160)||(3825567-3825681)
chr8 (212-354)||(8390234-8390376)
chr8 (34-162)||(8540436-8540567)
chr8 (199-265)||(6792257-6792323)
chr8 (34-84)||(8882264-8882314)
chr8 (45-99)||(24451051-24451105)
chr8 (61-163)||(39671230-39671332)
chr8 (94-147)||(40223477-40223530)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (34-420)||(39583034-39583416)
chr3 (34-370)||(53785629-53785961)
chr3 (34-420)||(44198687-44199069)
chr3 (53-354)||(7900797-7901094)
chr3 (74-420)||(52741316-52741659)
chr3 (34-271)||(26772678-26772911)
chr3 (34-327)||(38145976-38146265)
chr3 (34-406)||(49017887-49018251)
chr3 (41-350)||(13582437-13582741)
chr3 (34-218)||(38670887-38671067)
chr3 (54-326)||(37132898-37133166)
chr3 (34-326)||(5338566-5338855)
chr3 (34-381)||(54508229-54508571)
chr3 (34-280)||(3443257-3443499)
chr3 (34-223)||(32546715-32546900)
chr3 (38-326)||(46940669-46940956)
chr3 (34-418)||(37992253-37992632)
chr3 (79-318)||(51234581-51234803)
chr3 (270-386)||(29861949-29862065)
chr3 (34-298)||(4472982-4473241)
chr3 (39-375)||(7501861-7502192)
chr3 (35-162)||(7257616-7257742)
chr3 (40-190)||(26856793-26856943)
chr3 (34-213)||(52411903-52412078)
chr3 (228-325)||(35236316-35236413)
chr3 (34-280)||(25324949-25325193)
chr3 (46-126)||(4763888-4763967)
chr3 (59-137)||(44781-44859)
chr3 (53-163)||(21552603-21552717)
chr3 (282-407)||(52411720-52411845)
chr3 (50-190)||(38978830-38978970)
chr3 (46-161)||(25094632-25094747)
chr3 (38-91)||(4669793-4669846)
chr3 (34-162)||(42205987-42206116)
chr3 (41-89)||(46320049-46320097)
chr3 (36-68)||(53502607-53502639)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (34-420)||(33170-33552)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (59-327)||(6279-6542)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (46-407)||(2-359)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (118-300)||(10364-10546)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (34-287)||(103026-103274)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (193-395)||(47369-47571)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (86-396)||(18194-18499)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (34-217)||(7523-7701)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (145-326)||(49442-49622)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (188-325)||(8416-8553)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (191-291)||(16207-16307)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (199-265)||(4300-4366)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 420
Target Start/End: Original strand, 44686348 - 44686720
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44686348 aatcctcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaaactctgatgctagg 44686447  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttagg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44686448 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac-cagcttttagg 44686546  T
Q  246 actgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtaca 345  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44686547 actgtctgtcctatcgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaa-catttgtaca 44686645  T
Q  346 ccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44686646 ccataacatccgcaggcctaagtgtcaatcttctatctagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 44686720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 46 - 416
Target Start/End: Original strand, 28224932 - 28225298
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28224932 aatcttcataaacacaacattcattgacctaggagacataatattgtcatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgaagctagg 28225031  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttagg 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  28225032 aagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg----ttgattgtcagaatacgctttctcatatttggtcactttgcttgacgcagcttttaaa 28225127  T
Q  246 actgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtaca 345  Q
      ||  |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28225128 gttgtttgtcctaccgtaaaagccctaactcctaagcccacaagtagtgaaaccccattcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtaca 28225227  T
Q  346 ccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctcc 416  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||| | | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  28225228 ccataacatccgtaggcctaagtgtcgatattctatctagtgggtaagtcagaaagttcacaggcacctcc 28225298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 420
Target Start/End: Original strand, 27502287 - 27502663
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||    
T  27502287 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcatagatctaggagacatgatattgctatgcataaccctttggattctatgtagaaggtcaacagtatatga 27502386  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||   ||||||||||||||| |||    || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27502387 tgctaggaagtcgaaagtgtcaaaaagcaattgtataaaagcatgttgtttg----tcggaacacgttttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagc 27502482  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccat 338  Q
    |||||||  |   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27502483 ttttagggttat-tgtcctatcgtaaaagctctgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccattcaggtccacacatgcatgttttcctccaacccat 27502581  T
Q  339 ctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27502582 ccgtacaccataacatccgcaggcctaagtgtcgatcttgcatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggcgcctccttct 27502663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4413253 - 4412871
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  4413253 gatggcaaaatcaatcctcatgaacacaacattcatggacctaggagacatgactttgctatgcatgaccttttgaaccctatgtagaaggtcaacaatc 4413154  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4413153 tctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 4413058  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
     |||||||||||  |||||||||||| |||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |    
T  4413057 acagcttttagggttgcctgtcctacggtaaaaggtctgacacttaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttccaccta 4412958  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  4412957 cccatccgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttcacaggtgcctccttct 4412871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 41868090 - 41867713
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||     
T  41868090 caaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctgggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgg 41867991  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41867990 tgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacatgctttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagc 41867895  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccat 338  Q
    ||||| | |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||    
T  41867894 ttttaaggctgcctgtcctacgataaaaggtccgacacctaatcccacaagtcgtgaaatctcagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccat 41867795  T
Q  339 ctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  41867794 ctgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttcacaggtgcctccttct 41867713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 420
Target Start/End: Original strand, 17344564 - 17344940
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| || |    
T  17344564 aaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctatggt 17344663  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagct 239  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    | | |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  17344664 gctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tgaaaacacgttttctcgtgtttggccaccttacttgacgcagct 17344759  T
Q  240 tttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatc 339  Q
    || ||||||| || |||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||    
T  17344760 ttaaggactggctttcctacggtaaaaggtctgacacctaatcccacaagttgtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatc 17344859  T
Q  340 tgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17344860 cgtacaccataacatccgcatgcctgagtgttgatcttctttctagcgggtcagtcagaaagttcacaggcgcctccttct 17344940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 408
Target Start/End: Original strand, 3825646 - 3826017
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  3825646 gatgacaaaatcgatcttcataaacacaacatttatggtcctagaagacatgacattgctatgcatgattctttgaactcgatgttgaaggtcaacaacc 3825745  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcag-aacacgctttctcatgtttggccacattgcttga 232  Q
    | ||||||||||||   |||||||||  |||| ||  | |||||| ||||| |||||    |||| || |  |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  3825746 tttgatgctaggaaattgaaagtgtctgaagcaaatgaaataaaaacatgtagattg----tcaggaaaaaactttttcatgtttgaccactttgcttga 3825841  T
Q  233 cgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtcca 332  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||     
T  3825842 cgcagcttttagggctctctgtcataccgtaaaagtcctgacccctaatcccacaaggggtgaaacctcaatcaagtccacacatgcatgtttttctcct 3825941  T
Q  333 aaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacag 408  Q
    |  ||| |||||||| |||||||| || || |||  ||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  3825942 actcatttgtacaccttaacatccacaagcataaaggtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacag 3826017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9685602 - 9685232
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||| | ||||| ||||||||| ||| ||    
T  9685602 gatggcaaaaacaatctttgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatccatgaccttttgaactctatatagaaggtccacagcc 9685503  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  |||||| ||  | |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9685502 tctagtgctagaaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacgctttttcatgtttggccactttgcttgac 9685407  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    || | ||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  || |    
T  9685406 gcggattttagggctgcctatcctacggtaaaaggtctgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaatcatgttttccaccta 9685307  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacag 408  Q
     |||| || |||||||||  |  ||| |||| |||||  | ||||||| |||| | |||||||  ||||||||||    
T  9685306 cccatatgcacaccataatgtttgcaggcctgagtgttgaccttctatctagtgggtcagtcaggaagttcacag 9685232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 326
Target Start/End: Original strand, 5532341 - 5532627
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| | || ||| || |||  |||||   ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  5532341 gatgagaaaatcaatccttgtaaacaca-cattcatgaacttaggagtcatggcattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaagctcaacaacc 5532439  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    | || |||||||||||  |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5532440 tatggtgctaggaagct-aaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagcatgttgattg----tcacaacacgttttctcatgtttgaccactttgcttgac 5532534  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||    
T  5532535 gcagcttttagggctgcatgtcctaccgtaaaatccccgacccctaatcctatgagtggtgaaactccggttaagttcacacatgcatgtttt 5532627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18745121 - 18744809
Alignment:
Q  54 taaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaa 153  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | | || ||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||  ||||    
T  18745121 taaacacaacattcatagacctaggaaatatgacattgctatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggccaacagcctatggtgctagaaaatcgaa 18745022  T
Q  154 agtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctg 253  Q
    | |||||||||| ||   |||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||| || ||||    
T  18745021 aatgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattg----tcagaacacgctttctcgtgtttggccacctaacttgacgctgctttaagggcttcctg 18744926  T
Q  254 tcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataaca 353  Q
    |  ||| ||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  18744925 tgttacggtaaatggcctgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataaca 18744826  T
Q  354 tccgcatgcctaagtgt 370  Q
     ||||| |||| |||||    
T  18744825 cccgcaggcctgagtgt 18744809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19161970 - 19161627
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||  ||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || ||    
T  19161970 gatgacaaaatcaatcctcgaaaacacactattcattgacctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtaagcagcc 19161871  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  || ||  || ||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  19161870 tctagtgttacaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattg----tcagaacacgctttttcatgtttgcccacttttcttgac 19161775  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    |||| |||||||  ||  ||||||||| |||||| || |||  |||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  19161774 gcagattttagggatgtatgtcctaccataaaaggcctgacatctaatctcacaagtggtgaaaccctattcaagtctacacatgcatgttttcctccta 19161675  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  19161674 cccatccttacatcataacatccgcatgcctgagtgttgatcttctat 19161627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 188 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23484975 - 23484743
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||   ||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||||    
T  23484975 ttgattgtcagaacatgctttctcatatttggccactttgtttgacgtagcttttagggctagttgtcccaccgttaaaggcccgacacttaatcccaca 23484876  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagta 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||  |||||| | |||||  ||||||||| |||||    
T  23484875 agtggtgaaaccccaatcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacatcataacatatgcatgcttgagtgttgatcttctatatagta 23484776  T
Q  388 gatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    | ||| |||  |||||||||| | |||||||||    
T  23484775 ggtcaatcaggaagttcacagacgcctccttct 23484743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16352031 - 16351657
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||| | |||||  |||||| ||||||   ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16352031 gatggcaaaaacaatcatcgtaaacataatattcatgtacctaagagacatgacattgttgtgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 16351932  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaa---agtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgctt 230  Q
    ||||||| ||   |||| ||   | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    | |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  16351931 tctgatgataaagagccaaacaaaatgtcaaaagcaaacaatataaaattatgttgattg----tgagaacacattttctcatgtttgaccactttgctt 16351836  T
Q  231 gacgcagcttttaggactgcctgtc---ctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
    ||| || ||||||||| || |||||   ||| ||||||  | ||||| | |||  |||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  16351835 gacacaacttttaggattgtctgtctacctatcgtaaatactccgacacataattccacaaatggtgaaactct-gtcaagtctacacatgcatgttgtc 16351737  T
Q  328 gtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcaca 407  Q
     ||||| ||||  ||| ||||||||||   ||   ||||||||  ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  16351736 ttccaacccattcgtataccataacatttacagatctaagtgttgatcttctatatagtaagtcagtcaaaaagttcaca 16351657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20142875 - 20142614
Alignment:
Q  71 gacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaaca 170  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||| || ||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||  ||      
T  20142875 gacctaggagacatgacattgttatgtatgaccttttgaactctatgtataaggtcaacaacctttgatgctagaaaaccaaaagtgtcaaaagaaaatg 20142776  T
Q  171 atataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccc 270  Q
     |||||||||||||||||||                   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||       
T  20142775 gtataaaagcatgttgattg-------------------tcatgtttggccactttgcttgacgaagcttttagagctgcctgtcctacggtaaaaggta 20142695  T
Q  271 cgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataa 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||| |||||||||||    
T  20142694 cgacacctaatcccacaagtggtgaagccccaatcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccgtacaccataa 20142614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 2888518 - 2888797
Alignment:
Q  116 tgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| || ||||   ||||||| ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||    
T  2888518 tgtagaaggtcaacaacctcttgtgttaggaagccaaaagtgtcataaacgaatggtataaaaacatgttga----ttgtcagaacacgttttctcatgt 2888613  T
Q  216 ttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacac 315  Q
    ||| |||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||  ||||| |||     ||||||||||| || | |||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  2888614 ttgtccactttgctagacgcaacttttagggttgtttgcactaccataa----tccgacccctaatcctataagtggcgaaattccagttaagtccacac 2888709  T
Q  316 atgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagtt 403  Q
    |||||||||| | ||  | |||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||  || || ||| || ||||||||| | ||||||    
T  2888710 atgcatgtttacctcttacccatatgtataccataacatctgcagacctaagtgtatattttatatctaatagatcagttaaaaagtt 2888797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34814960 - 34814826
Alignment:
Q  79 agacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaa 178  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||    
T  34814960 agacataacattgttatgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctggtgttaggaa-ccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaa 34814862  T
Q  179 gcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 218  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34814861 gcat----attgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 34814826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 13413291 - 13413400
Alignment:
Q  54 taaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaa 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| | || |||||    
T  13413291 taaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgctgcttgaaaaccgaa 13413390  T
Q  154 agtgtcaaaa 163  Q
    ||||||||||    
T  13413391 agtgtcaaaa 13413400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 420
Target Start/End: Original strand, 9674978 - 9675146
Alignment:
Q  252 tgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataa 351  Q
    ||||||||| ||||||  | || |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| |  |||  ||||| |||||    
T  9674978 tgtcctaccataaaaggtctgatccctaatcccatgagtggtgaaaccccaatcaagttcatacatgcatgttttcctcctactcattcgtacatcataa 9675077  T
Q  352 catccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| | | || |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  9675078 catctgcatgtctaagtgtcgatcttttatttaatcggtcggtcagaaagttcacaggcgcctcattct 9675146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32029272 - 32029117
Alignment:
Q  35 atgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacct 134  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |  |||| ||||||| ||||||  ||| || || ||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  32029272 atgacagaattaatcttcgtaaacacgatattcatgatcctataagacatgacattgttatggatgactctttgaactctatgtagaaggtcaacagcct 32029173  T
Q  135 ctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||| | | |||||| ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||    
T  32029172 ctgaagttgggaagctgaaagtgtcaaaaacaaatgatatgaaagcatgttgattg 32029117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13147077 - 13146973
Alignment:
Q  282 cccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  13147077 cccataagtggtgaaaccacagtcaagttcacacatccgtgttttcttcctacccatgcgtacaccataacatctacatgcctaaatgtcgatcttctat 13146978  T
Q  382 ttagt 386  Q
     ||||    
T  13146977 ctagt 13146973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8036670 - 8036540
Alignment:
Q  35 atgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgat--gcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaac 132  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| ||  |||||||||| |||||| ||||||  ||  |||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  8036670 atgacaaaatcaatcattgtaaagacaatatctacggacctaggagacatgacattgatatatgcataaacctttgaactctatgtaaaaggtcaacaac 8036571  T
Q  133 ctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaa 163  Q
    |||||||| || |||||| ||| | ||||||    
T  8036570 ctctgatgttacgaagccaaaaatatcaaaa 8036540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10579719 - 10579584
Alignment:
Q  285 acaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctattta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||   ||||||||||||||  |   ||||||||||| |||||| || |     
T  10579719 acaagtggtgaaaccccagtcaagtccacaaatgcatgttttcctcctacccactcgtacaccataacatttgttggcctaagtgtcgatcttccatctg 10579620  T
Q  385 gtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| ||| ||| ||||    
T  10579619 gtaggtcagacaagaagttcacatgcctctctttct 10579584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13147287 - 13147087
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | || |||||||||  ||||||   ||||  |||||||| | | |||| ||||||||||||| |    
T  13147287 gatgacaaaatcaattttcgtaaatacaatattcatgaacttagaagacaagacattgttgtgcacgaccctttgtactatatgaagaaggtcaacaatc 13147188  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatat-aaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttga 232  Q
    |||| || ||| || || |||||||||||| | ||   ||| ||||| || |    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  13147187 tctggtgttagaaaaccaaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaagtatat--gctgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccacttttcttga 13147090  T
Q  233 cgc 235  Q
    |||    
T  13147089 cgc 13147087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7761032 - 7760744
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||  | || ||  |||||| ||||||| | |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7761032 gatgtcaaaatcaattttcgtaagcacatcattcttgaacttatgagacatcacattgctacgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 7760933  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| || ||| || || || ||||| || || ||   ||  |||  |||     ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  7760932 tctggtgatagaaaaccaaaggtgtctaatgcaaatcgtaagaaaatatg-----tgattgttagatcacgttttctcatgattggccactttacttgac 7760838  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
    ||  |||| |||  ||| ||||| ||| |||||| |  |   | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  7760837 gcgactttgagggttgcttgtcccaccataaaagtcttggttcataatcccacaagtggtgaaaccctagtcaagttcacacatgtatgttttc 7760744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33612652 - 33612445
Alignment:
Q  116 tgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgt 215  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||  | ||   ||||||| ||||    |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33612652 tgtagaatgtcaacaacctccggtgttaggaagccaaaagtgtcaaatacaaattgtataaaatcatg----ttgattgtcaaaacacgttttctcatgt 33612557  T
Q  216 ttggccacattgcttg-acgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccaca 314  Q
    ||  |||  ||||||| |||  |||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  33612556 tt-accattttgcttgcacgtggcttttagggttgcatgtcctaccataatagcctagacccttactcccacaagcggtgaaacctcagtcaagtctata 33612458  T
Q  315 catgcatgttttc 327  Q
     ||||||| ||||    
T  33612457 tatgcatgctttc 33612445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Original strand, 27494203 - 27494304
Alignment:
Q  6 caacaagctgcaccgttagacnnnnnnngatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccct 105  Q
    ||||||||||| |||||||||       |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  27494203 caacaagctgcgccgttagacctttttggatggcaaaaccaatattcgtaaacacaatattcatagacttaggagacataacattgctatacataaccct 27494302  T
Q  106 tt 107  Q
    ||    
T  27494303 tt 27494304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 374
Target Start/End: Original strand, 44720393 - 44720577
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||   | ||||||||| ||||||    
T  44720393 ttgattgtcataacacgttttttcatgtttggccatcttacttgacgcggcttttagcgttgcatgttctaacgtaaaattgctgacccctaatcccaca 44720492  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaat 374  Q
    |  ||||||||| || |||| |  |||||  ||| ||||| ||| | ||||  ||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  44720493 aacggtgaaacctcaatcaattttacaca--catattttcatcctatccattcgtacatcaaaacatccgcagacctaagtgtcaat 44720577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 44685025 - 44684955
Alignment:
Q  54 taaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaagg 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  44685025 taaacacaacattcatggacttataagacataatattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaagg 44684955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2886724 - 2886646
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  2886724 tctatgtaaaagatcaacagcctctgatgcttggaaaccgaaaatatcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgattg 2886646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1296084 - 1296031
Alignment:
Q  191 attgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttag 244  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  1296084 attgtcagaacatattttctcatgtttggccattttgtttgacgcagcttttag 1296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Original strand, 34644486 - 34644868
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34644486 gatggcaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacc 34644585  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34644586 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatg----taggttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttgac 34644681  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34644682 gcaacttttagggttgcttgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccag 34644781  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| || | |||||||    
T  34644782 cccatccatacaccataacatccgcatacctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacacgcgcttccttct 34644868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 325
Target Start/End: Original strand, 2764405 - 2764686
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2764405 aaaatcaatcatcgtaaacacaacatttatggacctaagagacataacattgatttgcataaccctttggactttatgtagaaggtcaacaacctctgat 2764504  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagct 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||    |||||||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||| || ||    
T  2764505 gctaggaagctgaaagtgtcaaaagaaaatggcataaaagcatg----ttgattgtcggaacacgttttctcatgtttgaccactttgtctgacacaact 2764600  T
Q  240 tttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttt 325  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  2764601 tttaggactgcctatcctaccataaaagcaccaacccctaaacccacaagtggtgaaacctcaatcaagttcacacatgcatgttt 2764686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28041308 - 28040932
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||| |    
T  28041308 aaaatcaatcctcatgagcacaacattcatggacttagaggacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctggt 28041209  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagct 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||| | ||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |    
T  28041208 gctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacctg----ttgattgtcagaacacactttctcatgtttggccactttgtttgacgcggat 28041113  T
Q  240 tttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatc 339  Q
    |||||  |||||| |||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | |||||    
T  28041112 tttagagctgcctatcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtagtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatc 28041013  T
Q  340 tgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||| |||| | | |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  28041012 tgtacaccataacatctgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggttagtcaggaagttcacagacgcctccttct 28040932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 29169940 - 29169599
Alignment:
Q  74 ctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaata 173  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||    
T  29169940 ctaggagacatgacattgctgtgcatgaccttttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggta 29169841  T
Q  174 taaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccga 273  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  29169840 taaaagcatgttgattg----tcagaacacgttttctcgtgtttggccaccttacttgacacaactttaagggctgtctgtcctacggtaaaaggcccga 29169745  T
Q  274 cccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaa 373  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  29169744 cacctaatccca-aagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacctatccgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttga 29169646  T
Q  374 tcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||||| | |||  | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  29169645 tcttctttctagcgggtcagtcaggaagttcacaggcgcctccttct 29169599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45659816 - 45659493
Alignment:
Q  51 tcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagcc 150  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||||||| |||||| | | |||| | |||||  |||||||||||| |||||| || ||||||  |    
T  45659816 tcgtaaacacgacatttattgacctaggagacatgacattgctatgcatgatcttttgaactctat--agaaggtcaacagcctctggtgataggaaatc 45659719  T
Q  151 gaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagctttta-ggactg 249  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || |||    
T  45659718 gaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacgctttctcgtgtttggccaccttacttgacgcagcttttaagggctg 45659623  T
Q  250 cctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccat 349  Q
    | |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||    
T  45659622 catgtcctacggtaaaaggcccgatacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacgcatgcatgttttcctcctacccatctgtacactat 45659523  T
Q  350 aacatccgcatgcctaagtgtcaatcttct 379  Q
    |||||  |||||||| |||||  |||||||    
T  45659522 aacatgtgcatgcctgagtgttgatcttct 45659493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4862170 - 4861807
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||   ||| | ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | || |    
T  4862170 aaaatcaatcctcgtaatcacaacattcatggatctaagggacgtgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacttttggt 4862071  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagct 239  Q
    | ||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||| |||||| |||    |||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||    
T  4862070 gttaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgcttg----tcagaagacgctttctcatgtttgaccattttacttgacgcaact 4861975  T
Q  240 tttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatc 339  Q
    |||| | ||| |||||||||| |||| | |  ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  4861974 tttaaggctgtctgtcctaccataaatgtcaagacccctaatccaacaagtggtgaaacaccagtcaaatccacacatgcatgtttttctcctacccatc 4861875  T
Q  340 tgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcaca 407  Q
     ||||||||||||||| | | ||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  4861874 cgtacaccataacatctgtaggctgaagtgtcgatcttctatttaatagatcaatcaagaagttcaca 4861807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 420
Target Start/End: Original strand, 19035465 - 19035749
Alignment:
Q  132 cctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttg 231  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  ||   ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19035465 cctctggtgctaggaaaccgtaagtgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttg 19035560  T
Q  232 acgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtcc 331  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||    
T  19035561 acgcagcttttagggctgcctgccctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaactggtgaaatcccagtcaagtctacacaagcatgtgttccacc 19035660  T
Q  332 aaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     | ||||| |||||||| ||| ||| ||| ||| |||||  ||||| ||| |||| | || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19035661 tacccatccgtacaccaaaacgtccacatacctgagtgttgatcttttatctagtgggtcggtcaggaagttcacaggcacctccttct 19035749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37932320 - 37932062
Alignment:
Q  118 tagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgttt 217  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||| ||||| || |    |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  37932320 tagaatgtcaacatcctctggtgctaggaagccgaaagtgtaaaaaaataataatgtaaaaacacg----ttgattgtcagaacac-ctttctcgtattt 37932226  T
Q  218 ggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacat 317  Q
    | |||  ||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  37932225 gaccattttgcttgacacaacttttagggctgtctgtcttactgtaaaagccttggcccctaatcccacaagtggtgaaacctcaatcaagtccacgcat 37932126  T
Q  318 gcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
    |||||||||| |||   |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  37932125 gcatgttttcctcctgtccatatgtacatcataacatccgcaggcctaagtgtcgattttctat 37932062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20259939 - 20259662
Alignment:
Q  79 agacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaa 178  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |   ||   |||||||    
T  20259939 agacatgacattactatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaacaataaatggtataaaa 20259840  T
Q  179 gcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccct 278  Q
     |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||| || |||||  | | |||||||  | ||| |||    
T  20259839 acatgttgattg----tcagaacacgctttctcatttttaaccactttgcttgacgtagcttttagggctacctgttttccggtaaaaggtctgacacct 20259744  T
Q  279 aaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatg 361  Q
    || |||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20259743 aatcccacaagcggtaaaaccctagtcatgtctacacatgcatgtttttc-cctacccatctgtacaccataacatccacatg 20259662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 327
Target Start/End: Original strand, 22346827 - 22347102
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| |||| |||||||||||||   |||||| |||||| ||||| | |||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22346827 aatcctcgtgaacacaacattcataaacctaggagacatgacatttctatgcatgaccttttgaactctgtgtagaaggtcaacaacctctgctactagg 22346926  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttagg 245  Q
    || ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  22346927 aaaccgaaagtgtcaaaagcaaaaggtataaacgcatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatatttggccactttgcttgacataacttttagg 22347022  T
Q  246 actgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
      ||  |||||||| ||||||   ||||   || || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  22347023 -ttgtttgtcctacggtaaaaagtccgaaatct-aatccacaagtggtgaaacaccaatcaagtctacagaagcatgttttc 22347102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 21472949 - 21473121
Alignment:
Q  60 caacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtc 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||    
T  21472949 caacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgcaagtgtc 21473048  T
Q  160 aaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgca 236  Q
    |||||| ||   ||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  21473049 aaaagcaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccattttacttgacgca 21473121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31737509 - 31737303
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||| | |||||||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||| | ||    
T  31737509 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacta-attcatggatctaggaaacataacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaatagcc 31737411  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||    |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31737410 tctaatgctagaaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaatatgttttctcatgtttggccactttgcttgac 31737315  T
Q  234 gcagcttttagg 245  Q
    || |||||||||    
T  31737314 gccgcttttagg 31737303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25375942 - 25375677
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc 211  Q
    |||| |||||||| |||||| ||  | || ||||||||| |||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| |    | |||||| | ||| ||    
T  25375942 tctacgtagaaggccaacaatcttcggtgataggaagccaaaagtgtcaatagcaaatggtataaaaacatgttgatgg----taagaacatgttttgtc 25375847  T
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtcc 311  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |   || |||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||||||||  ||||| |||    
T  25375846 atgtttggtcactttgcttgacgcaacttttggagttgtctgtcctaccgtaaaagctctgacccctaatccgacgagtagtgaaaccctggtcaaatcc 25375747  T
Q  312 acacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
    || | ||||||||||| | | | ||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  25375746 acgcttgcatgttttccttctacccatccgtataccataacatctgcagacctaagtgtcaatcttctat 25375677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 50161467 - 50161316
Alignment:
Q  171 atataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccc 270  Q
    ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |     
T  50161467 atataaaagcatgttg----attgtgagaacacgctttctcatgtttgtccactttgcttgacgcaacttttagggttgtctgtcctaccgtaaaagtct 50161372  T
Q  271 cgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    |  |||||||  |||| ||||||||||   | || |||||||||||||||||||||    
T  50161371 cagcccctaattccacgagtggtgaaatatcggttaagtccacacatgcatgtttt 50161316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 272
Target Start/End: Original strand, 16500034 - 16500188
Alignment:
Q  114 tatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcat 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||||    || ||||| |||||| | ||||| ||    
T  16500034 tatgtagaaggtcaacagcctctaatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaggcatg----ttaattgttagaacatgttttcttat 16500129  T
Q  214 gtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccg 272  Q
     ||||||||| || | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16500130 atttggccactttacgtgacgcaacttttaggattgtctgtcctaccgtaaaagccccg 16500188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 396
Target Start/End: Original strand, 42919832 - 42920137
Alignment:
Q  86 acattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgtt 185  Q
    |||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||  | ||||||||||||||  |  | |||||| ||||      
T  42919832 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatg-- 42919929  T
Q  186 gattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaaccca 285  Q
      |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||  ||  ||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  42919930 --ttgattgtgagaacacg-tttctcatgtttggccgctttgtttgatgcaacttttagggttgtttgtcctatcataaaagctccgacccgtaatccca 42920026  T
Q  286 caagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttag 385  Q
    | ||| |||||| | || ||||| |||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||  ||||| |||||||    
T  42920027 cgagtagtgaaatctcaatcaagcccacacaaatatgttttcctcctacccatctgtacaccttaacatctgcaagcctaaatgttgatcttttatttag 42920126  T
Q  386 tagatcagtca 396  Q
    | |||| ||||    
T  42920127 tggatcggtca 42920137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 165
Target Start/End: Original strand, 47459609 - 47459733
Alignment:
Q  41 aaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatg 140  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||     
T  47459609 aaatcaattctcgtaaacacaacatttatagacttaggagacataacattgctatgcatattcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgata 47459708  T
Q  141 ctaggaagccgaaagtgtcaaaagc 165  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  47459709 ctaggaagccaaaagtatcaaaagc 47459733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 2898622 - 2898832
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | ||  |||||| | ||||  |||||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2898622 gatggcaaaatcaatcctcttaaacacaacattcatgatcgtatgagacatgatattgttatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 2898721  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacg----ctttctcatgtttggccacattgct 229  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||| |      ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||    
T  2898722 tctggtgctaggaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaaac-----tattgattgtcagaacacgctcactttctcatgtttggccactttgct 2898816  T
Q  230 tgacgcagcttttagg 245  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  2898817 tgatgcatcttttagg 2898832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 38731529 - 38731704
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||    ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  38731529 gatgacaaagtcaaatctcgtaaacacaatattcatggacctaggagtcatgacattattgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggttaacaacc 38731628  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcat 213  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||   |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38731629 tctggtgctaagaagccaaaagtttcaaaagcaaattgtataaaagtatg----ttgattgtcagaacacgctttctcat 38731704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24177693 - 24177569
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||||||| |||| |||||||    
T  24177693 caaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagatatgacattgctatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtaaacagcctctga 24177594  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaa 163  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||    
T  24177593 tgctaggaaaccgaaactgtcaaaa 24177569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 419
Target Start/End: Original strand, 37200051 - 37200281
Alignment:
Q  187 attgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccac 286  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||| | |||||| | |||| |||||||  |||||||| |||  || ||| |||||    
T  37200051 attgattgttagcacatgctttcttatgtttgaccactttacttgacgtaacttttatggctgcatgtcctattgtaaaagctccggtccttaatcccac 37200150  T
Q  287 aagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||  |||| |||||||||   ||  | |||||||||||||||||| ||||    
T  37200151 gagtggtgaaacatcagtcaagt-cacacatgcatgttttcctcttacccattggtaccccataacat-ttcaaacttaagtgtcaatcttctatctagt 37200248  T
Q  387 agatcagtcacaaagttcacaggcccctccttc 419  Q
     | |||| || |||||||| ||||  |||||||    
T  37200249 gggtcagacagaaagttcataggcgtctccttc 37200281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 163
Target Start/End: Original strand, 7213186 - 7213299
Alignment:
Q  50 ttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagc 149  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||| ||  |||| | | |||| ||||| ||||||  |||| |||||||||| |    
T  7213186 ttcgtgaacacaacattcatggacctagaagacatgacattattatgcatgacattttgaactttatgcagaagctcaacagtctctaatgctaggaaac 7213285  T
Q  150 cgaaagtgtcaaaa 163  Q
    ||||||||||||||    
T  7213286 cgaaagtgtcaaaa 7213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 420
Target Start/End: Original strand, 38731713 - 38731882
Alignment:
Q  251 ctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccata 350  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| ||| | ||||| | ||||||||    
T  38731713 ctgtcataccataaaagacccgacccctaaatcaacgagtggtgaaaccctagtcaaatccacatttgcatattttcctcctacccatccgcacaccata 38731812  T
Q  351 acatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    | ||| ||| |  ||| | || ||||||||| |||| | ||||| |  ||||||| |||  |||||||||    
T  38731813 atatctgcaagtttaactatcgatcttctatctagtgggtcagtaaggaagttcatagggacctccttct 38731882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43831585 - 43831436
Alignment:
Q  238 cttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtg-aaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaacc 336  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |  | ||||| ||||||| |||||||   |||| |||||||| ||||| ||| | | | ||    
T  43831585 cttttagggctgcctgtcccaccgtaaaatccccgacctcgcatcccacgagtggtgcaaaccccgaccaaggccacacatccatgtattccttctaccc 43831486  T
Q  337 atctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
     || ||||||||||||||  | | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  43831485 gtccgtacaccataacatatgtaagcctaaatgtcgatcttctatttagt 43831436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 48841264 - 48841174
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaac 129  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||  ||  ||| ||||||||||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  48841264 caaaatcaatcctcgtaaacataatattcatagatttaggagacataacattattatgcataactctttagactctatgtagaaggtcaac 48841174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 45835373 - 45835326
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaaga 81  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45835373 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatagacctagaaga 45835326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Original strand, 4611109 - 4611159
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacat 84  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  4611109 gatgacaaaatcaatcatcgtgaacacaatattcatggacctaggagacat 4611159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 35387238 - 35387156
Alignment:
Q  304 tcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  35387238 tcaagttcacacatgcatgtttacctcttacacatctgtacatcataacatctgcatgcttaactgtagatcttctatttagt 35387156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 420
Target Start/End: Original strand, 22347103 - 22347179
Alignment:
Q  344 caccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22347103 caccataacgtctgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggtgcctccttct 22347179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22375521 - 22375481
Alignment:
Q  341 gtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  22375521 gtacaccataacattcgcaggcctaagtgtcgatcttctat 22375481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35387697 - 35387653
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttga 232  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35387697 ttgatcgtcagaacacactttttcatgtttggccactttgcttga 35387653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 50001113 - 50000730
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||    
T  50001113 gatggcaaaatcaatcttcgtaaacacaacatttatggatctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaactgcc 50001014  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaata-taaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttga 232  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   || ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50001013 tctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaagcaaattgtattaaaagcatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccactttgcttga 50000918  T
Q  233 cgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtcca 332  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50000917 cgcagcttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagcccccaccccttaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctcca 50000818  T
Q  333 aaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  50000817 acccatccgtacaccataacatccgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggcgcctccttct 50000730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 370
Target Start/End: Original strand, 53619506 - 53619838
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||    
T  53619506 gatggcaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatggacctaagagacataacattgttatgcataaccctttagactctatgtagaaggtcaactgcc 53619605  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||   ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  53619606 tctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgcttgac 53619701  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53619702 gcagcttttagggttgcctgtcctactgtaaaagcccccacctctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaa 53619801  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgt 370  Q
      |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  53619802 ctcatccgtacaccataacatatgcaggcctaagtgt 53619838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 99 - 419
Target Start/End: Original strand, 31847072 - 31847388
Alignment:
Q  99 taaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcag 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   || |||| |||||||| ||    ||||    
T  31847072 taaccgtttggactctatgtagaaggtcaaccgcttctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtaaaaaaacatgttgactg----tcag 31847167  T
Q  199 aacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 298  Q
    |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31847168 aacatggtttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctactgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaac 31847267  T
Q  299 cccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcaca 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |    
T  31847268 cctagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaatccatctgtacaccataatatctgcaggcctaagtgtcaatcttttatctagtgggtcagtcaga 31847367  T
Q  399 aagttcacaggcccctccttc 419  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  31847368 aagttcacaggcgcctccttc 31847388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 55933647 - 55933306
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55933647 gatggcaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataatattgttatgtataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacc 55933548  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |    ||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  55933547 t--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtt----agaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgac 55933454  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || || | || |||| ||||||||| |||||    
T  55933453 gcaacttttagggctgactgtcctaccgtaaaagccctgacccttaaacccacaaggggtgaaaccccggttaaattcagacattcatgttttcctccaa 55933354  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||    
T  55933353 cccatccgtagaccataacatctgcggacctaagtgtcgatcttctat 55933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 407
Target Start/End: Original strand, 132278 - 132676
Alignment:
Q  7 aacaagctgcaccgttagacnnnnnnngatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||       ||||| |||||| ||  | |||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||  |||| | ||||||    
T  132278 aacaagctgcaccgttatacctttttagatgataaaatcgattcttgtaaacacaacaatcatgaacctaaaagacatgacattgttatgcttgaccctt 132377  T
Q  107 tggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgct 206  Q
    |  | ||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||||| |||| | ||   |||||||||||||||||||    |||||||||| |    
T  132378 taaactctgtgtagaatgtcaacaatctctgatattaggaaaccgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacgat 132473  T
Q  207 ttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctac--cgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagt 304  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  132474 ttctcatgttttgccattttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacaccgtaaaagtcccgacccctaatccaacaagtggtgaaaccccagt 132573  T
Q  305 caagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttc 404  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||    
T  132574 caagttcacacatgcatattttcctcctacgtatctgtacaccataacatctgcatgccgaagtgtcgatcttctatctagtggaccagtcaagaagttc 132673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 56462276 - 56461939
Alignment:
Q  51 tcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagcc 150  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||  |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  56462276 tcgtaaacacaacatttatggacttaggagacatgacattgtcatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaacc 56462177  T
Q  151 gaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgc 250  Q
     |||||||| ||| | ||   ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||   |     
T  56462176 aaaagtgtctaaaacaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcagaacacgctttatcatgttt-gccactttgtttgacgcaacttttagggtggt 56462082  T
Q  251 ctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccata 350  Q
    || | | |||||||||| | |||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |  |||| ||||||||||    
T  56462081 ctatacaaccgtaaaagtctcgacccctaatccaacaaatggtgaaacctcagtcaagtccacacatgcatgttttccacctactcatccgtacaccata 56461982  T
Q  351 acatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcag 393  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  56461981 acattcgcatgcttaagtgtcgatcttctatctagtggatcag 56461939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 420
Target Start/End: Original strand, 3330079 - 3330252
Alignment:
Q  247 ctgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacac 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3330079 ctgcctgtcctaccgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcacgttttcctccaatccatccgtacac 3330178  T
Q  347 cataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  3330179 cataacatctgcatgcctaagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggtgcctccttct 3330252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Original strand, 26521409 - 26521790
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||||| | |||| ||||||| | |||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  26521409 gatgacaaaaccaatcctcgtaaacacaacat-catgggcctaggatacatgacattgctacgcatgaccctttgaactgtatgtagaaggtcaacagcc 26521507  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||| || |||||||  |||||  |  ||||||||||||||||||||    ||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  26521508 tctggtgctaggaaaccaaaagtgttgaaagcatatgatataaaagcatgttgattg----tcataacacgttttttcatgtttagccactttgtttgac 26521603  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| ||||||||  ||  ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  26521604 gcaacttttagggttgtttgtcctaccataaaaggtctgacccctaatcccacaagtgatgaaactccagtcaagtccatacatgcatgttttcctccta 26521703  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     || ||||||||||||||| | || | || ||| |||| ||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  26521704 cccgtctgtacaccataaccttcgtaggcttaaatgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagctcacatgcgcctcattct 26521790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12918481 - 12918179
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc 211  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||  ||    ||||||||||||||||| |||||     
T  12918481 tctatctagaaggtcaacaatctctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagtgtg----ttgattgtcagaacacgatttctt 12918386  T
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtcc 311  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||| |||||||| | |    
T  12918385 atgtttgaccactttgtttgacgcaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaagccccgaatcttaatcccacaagtgatgaaactccagtcaactac 12918286  T
Q  312 acacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcc 411  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||  |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| |    
T  12918285 acacatgcatgttttcctcttacccatccatacaccatgacatccacaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagttagaaagttcacaggtc 12918186  T
Q  412 cctcctt 418  Q
    | |||||    
T  12918185 catcctt 12918179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 3329916 - 3330072
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  3329916 gatggcaaaaccaatcatcgtaaacacagcattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcc 3330015  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  3330016 tctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaagcatgttgattg 3330072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 408
Target Start/End: Original strand, 53170437 - 53170791
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctaga--agacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctct 136  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |  |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  53170437 caaaatcaatcctcgtgaacacaacattcatg-acctataggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctct 53170535  T
Q  137 gatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgca 236  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||| ||  |      |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||| || || | | || |     
T  53170536 ggtgctagcaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatca------agcatgttgactg----tcagaacacgctttctcatgtttggctactttacctaacacg 53170625  T
Q  237 gcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaacc 336  Q
     |||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||    
T  53170626 acttttagggctgcctgtcatactgtaaaaggtccgacacctaatcccacgagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctaccc 53170725  T
Q  337 atctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacag 408  Q
    ||      |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  53170726 at------accataacgtctgcatgcctaagtgttgatcttctatctagtaggtcagtcaggaagttcacag 53170791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 386
Target Start/End: Original strand, 25504220 - 25504561
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||| | |||||| ||| |||  | ||||| || ||||||||||  ||||      
T  25504220 caaaagcaatcctcataaacacaatattcatggacctatgagacatgacattactatgcatgaccttttaaactctatttaaaaggtcaacagtctctag 25504319  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||| |    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||| |    
T  25504320 tgctaggaaaccaaaaatgtcaaaagcaaacggtataaaaacatgtcgattgtt----agaacacgttttctcatgtttgaccat-ttgcttgatgcaac 25504414  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccat 338  Q
    ||| |||  |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||| | ||||    
T  25504415 ttt-agggttgcctgtcataccgtaaaaggcctgacgcctaatcccacaagtggtgaaacctcagtcaagtctatacatgcatgtttttctcctacccat 25504513  T
Q  339 ctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||    
T  25504514 ccgtacaccataacatccgcatgtctgagtgttaaacttctatctagt 25504561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 46441076 - 46440795
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||  |||| | |||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |     
T  46441076 gatgacaaaatcaatcatcgtaaatataattttcatgaacctatgagacatagcattgctatgcacaaccctttggactctatgtagaaggtcagcagct 46440977  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||    || ||||| ||||||| |||| | ||||||| |||| ||| |||||    
T  46440976 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaaacgtg----ttaattgttagaacacacttttttatgtttgaccactttgtttgac 46440881  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgt-aaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatg 318  Q
    |   |||||||||||   | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||| ||||||||||    
T  46440880 gttacttttaggactatttatcctactgtaaaaagccccgacccctaaacctacaagtggtaaaatctcaatcaaatccacacatg 46440795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 161
Target Start/End: Original strand, 4419183 - 4419310
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4419183 gatggcaaaaccaatcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 4419282  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaa 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4419283 tctgatgctacgaagccgaaagtgtcaa 4419310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30940919 - 30940544
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||| | | || ||||||  |||||| ||| |||| | |||||||||||      || ||    
T  30940919 gatggcaaaatcaatcctcatgaacacaacattcatagacctaggatatatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaa------cagcc 30940826  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    || | |||||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  30940825 tcaggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaagc-aatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacgctttctcatgtttgaccactttacttgac 30940731  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| ||||||||  || ||||||||  |||||||    ||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || |    
T  30940730 gcaacttttagggttgtctgtcctatggtaaaaggtttgacacttaatcccacaagtggcgaaacctcagtcaagtctacacaagcatgttttccaccta 30940631  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||  |||||||||||||| || | |||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  30940630 cccattcgtacaccataacattcgtaggccttagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttcacaggtgcctccttct 30940544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Original strand, 39001317 - 39001448
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  39001317 gatgacaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgttatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcc 39001416  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagc 165  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39001417 tctgatcctaggaagccaaaagtgtcaaaagc 39001448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6865967 - 6865631
Alignment:
Q  74 ctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaata 173  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||  ||||| |||||  |||||||||||||| ||  |||    
T  6865967 ctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtaaaaggttaacaacatctagtgctatgaagctcaaagtgtcaaaagcaaatgata 6865868  T
Q  174 taaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc-------atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaa 266  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| ||||||       |||||||| ||| ||| |   || |||||||| | |||  ||| |||||||||||    
T  6865867 taaaagcatgttgatag----tcagaacacgttttctcgtgtttcatgtttggacactttgttaatcgtagcttttatggctgtttgttctaccgtaaaa 6865772  T
Q  267 gccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaa 366  Q
    ||| |||||  ||  | ||||| ||||||||| || |  || | ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6865771 gccacgacctttagtctcacaaatggtgaaactcccgataaatacacacatgcatgttttcctcctacccatacgtacatcataacatccgcatacctaa 6865672  T
Q  367 gtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcaca 407  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  6865671 gtgtcaatcttctatctaatagatcagttagaaagttcaca 6865631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 242
Target Start/End: Original strand, 23255633 - 23255828
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  23255633 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaatattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcc 23255732  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    | |||||||| |||         ||||||| | ||   ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23255733 tatgatgctaagaa---------gtcaaaaacaaatggtataaaagcatg----ttaattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 23255819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 417
Target Start/End: Original strand, 16957612 - 16957835
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| || |||    
T  16957612 ttgattatcagagcacactttctcatgtttggtcattttgctctacgcaacttttaggactgcctatcctactgtaagaggcccgacccctaatccaaca 16957711  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagta 387  Q
    ||||||      || ||||||||||||||||||||||||   || | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||| |||      
T  16957712 agtggt------cccgtcaagtccacacatgcatgttttacacctacccatccgtacaccataacatctgcaggcctaagtgttgatcttttatctagcg 16957805  T
Q  388 gatcagtcacaaagttcacaggcccctcct 417  Q
    | |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  16957806 ggtcagtcaggaagttcacaggcgcctcct 16957835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 396
Target Start/End: Original strand, 12053483 - 12053689
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||| |  |||||| || || ||     
T  12053483 ttgattgttagaacacgatttctcatgtttgacaactttgtttgacgcagcttttagagctgtttgtcctactgtaaaagtc--gacccccaatccaact 12053580  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagta 387  Q
    | ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||  || |||| || ||||||||| ||||     
T  12053581 aatggtgaaaccccaataatgtccacacatgcatgttttcctcctacccatctgtacaacataacatctgcagaccaaagtctcgatcttctatctagtg 12053680  T
Q  388 gatcagtca 396  Q
    |||||||||    
T  12053681 gatcagtca 12053689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 600867 - 600651
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||| |  || ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  600867 aatcatcgtaaacacagcattaatggacctaggagacatgacatagttatacatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttagg 600768  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttagg 245  Q
    || ||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||    || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||    
T  600767 aaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaagcatg----ttaattgttagaacacgttttctcatgtttggtcactttgcttgacataacttttagg 600672  T
Q  246 actgcctgtcctaccgtaaaa 266  Q
      || ||||||||| ||||||    
T  600671 gttgtctgtcctacagtaaaa 600651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 261 - 420
Target Start/End: Original strand, 25706652 - 25706811
Alignment:
Q  261 gtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcat 360  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| || |     
T  25706652 gtaaaagccctgacccttaatccgacaggtagtgaaacccaaatcaagtccacacatgcatgtttttctcctacccatctgtacaccataacatacgtag 25706751  T
Q  361 gcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    || |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  25706752 gcttaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacatgcgcctccttct 25706811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34107883 - 34107673
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  34107883 gatgacaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggatctaggagacataacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcc 34107784  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||| | ||   ||||||| ||||||||||   | | |  ||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  34107783 tctggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgatt--atctgaacacacgttttctcatgtttggccacttcgtttgac 34107686  T
Q  234 gcagcttttagga 246  Q
    |||  ||||||||    
T  34107685 gcaatttttagga 34107673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 48657097 - 48656866
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtag----aaggtcaacaacct 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||    ||||||||||||||    
T  48657097 caaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatagacctatgagacataacattgctatgcataatcatttggactctatgtagaaggaaggtcaacaacct 48656998  T
Q  135 ctgat-gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||| | ||   ||||||| ||| ||||||||    || ||||| |||||||||||||| |||  || |||||     
T  48656997 ctaatcgctaagaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacattttgattga----cataacacactttctcatgtttgtccattttacttgat 48656902  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagcc 269  Q
    | | |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||    
T  48656901 gaaacttttagggctgtctgtcatactgtaaaagcc 48656866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 145
Target Start/End: Original strand, 16955387 - 16955491
Alignment:
Q  41 aaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16955387 aaatcaatcctcgtaaacacaacattcatgggcctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcagcaacctctggtg 16955486  T
Q  141 ctagg 145  Q
    |||||    
T  16955487 ctagg 16955491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38535744 - 38535628
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  38535744 aatcctcgtaaacacaacatccatggacctataagacatgacattgctatgcatgactctttgaactctatgtagagggtgaacaacctctggtgctagg 38535645  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaa 162  Q
    ||| | |||||||||||    
T  38535644 aagtcaaaagtgtcaaa 38535628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7536754 - 7536602
Alignment:
Q  38 acaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctg 137  Q
    |||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||||| |||||  | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7536754 acaaaaccaatcattgtaaacataacattcatggatctacgagacataaaattgctatgcacgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 7536655  T
Q  138 atgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
     ||||||||| | |||| |||||||| | ||   ||||||| |||||||||||    
T  7536654 gtgctaggaaactgaaattgtcaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattg 7536602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50483305 - 50483227
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||||    
T  50483305 tctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaatcatgttgattg 50483227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45386099 - 45385990
Alignment:
Q  187 attgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||| |||||   ||  |||||| |||||    
T  45386099 attgattgtcagaacacgctttcttatgtttgaccactttccttgacttagcttttagggttgcatgtcctaccgcaaaagtttcgggccctaatcccac 45386000  T
Q  287 aagtggtgaa 296  Q
    ||||||||||    
T  45385999 aagtggtgaa 45385990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 325
Target Start/End: Original strand, 54927613 - 54927663
Alignment:
Q  275 ccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttt 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54927613 ccctaaacccacaagtggggaaaccccaatcaagtccacacatgcatgttt 54927663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50463055 - 50462881
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc 211  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||  |||||  | |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||    || ||| || |||||||    
T  50463055 tctacgtagaaggtcaacagtctctggtgtaaggaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtatgaaagcatgttgattg----tcggaagacactttctc 50462960  T
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagt 290  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||| || ||||||    
T  50462959 atgtttggtcatcttgcttgacgcaacttttaaggctgtctgtcctaccgtagaagtaccgacacctaatccaacaagt 50462881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Original strand, 28739845 - 28739953
Alignment:
Q  54 taaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaa 153  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||  | | ||| | |||||||| |||||||||||| | || || ||||||| ||||    
T  28739845 taaacacaacatttatggacctaggagacataacattgttatgcattgcacgttgaactctatgtaaaaggtcaacaacttgtggtgttaggaagtcgaa 28739944  T
Q  154 agtgtcaaa 162  Q
    |||||||||    
T  28739945 agtgtcaaa 28739953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 46391496 - 46391220
Alignment:
Q  37 gacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctct 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||| ||||||   ||||| | | |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  46391496 gacaatatcaatcttcgtaaatacaacattcatggatttaggagacatgacattgt--tgcatgatcttttgaactttatgtagaaggtcaacaacctct 46391399  T
Q  137 gatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgca 236  Q
      || ||||||  ||||| ||| | |||| ||   ||||||| |||||||  ||    | |||||| | |||||| |||||  || | ||| | |||| |    
T  46391398 actgataggaaatcgaaaatgttacaagc-aatggtataaaaacatgttggctg----tgagaacatgttttctcgtgtttaaccgctttgttcgacgta 46391304  T
Q  237 gcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgca 320  Q
    ||||||||| |  | | ||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  46391303 gcttttaggtcaacatatcctaccgtaaaagatccgacctctaatcctacaagtggtgaaaccccaatcaaattcacacatgca 46391220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43849484 - 43849317
Alignment:
Q  85 aacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgt 184  Q
    |||||||  |||||| ||| |||| | ||| |||||||| || ||||||| || | |||||||||| |||||||||||  | || | |||||||||||||    
T  43849484 aacattgttatgcatgaccatttgaactctttgtagaagatccacaacctttggttctaggaagccaaaagtgtcaaacacaaatagtataaaagcatgt 43849385  T
Q  185 tgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcc 256  Q
    || ||     || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||| ||| || |||||||    
T  43849384 tggtta----tctgaacacgctttctcgtgtttggccacactgcttaaagcggctttgagggcttcctgtcc 43849317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 54191033 - 54190907
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| ||| | |||| ||  || ||| ||||||  ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54191033 caaaaccaatctttgtaaatacaatatttatggacttaagagtcatgacattgttatgcatggccctttgaactctatgtggaaggtcaacaacctctga 54190934  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagc 165  Q
    | |||| ||| | ||||||||||||||    
T  54190933 tactagaaagtcaaaagtgtcaaaagc 54190907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42455793 - 42455692
Alignment:
Q  35 atgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacct 134  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||  || ||| | | |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  42455793 atgacaaagtcaattctcgtaaaaacaacattcatggacctagaaaacatgacattgttatccatgatcatttgaactctatgtagaaggttaacaacct 42455694  T
Q  135 ct 136  Q
    ||    
T  42455693 ct 42455692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 164
Target Start/End: Original strand, 53098419 - 53098471
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaag 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  53098419 tctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaaaccaaaaatgtcaaaag 53098471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 355
Target Start/End: Original strand, 53098527 - 53098643
Alignment:
Q  238 cttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccag-tcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaacc 336  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||| || |  ||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||| | ||    
T  53098527 cttttaggattgcatgtcctaccgtaaaaatcc-gacccctaatcc-atgagtagtgaaacccccgatcaagtccacatttgcatgttttcctcctaccc 53098624  T
Q  337 atctgtacaccataacatc 355  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  53098625 atccgtacaccataacatc 53098643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 18534585 - 18534660
Alignment:
Q  303 gtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| ||| ||||||||||  | | ||||||||||| ||||||    
T  18534585 gtcaagtccacacatgcatgttttccttctacccatccgtataccataacatttgtaggcctaagtgtcgatcttc 18534660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18981714 - 18981652
Alignment:
Q  45 caatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttg 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  18981714 caatcatcgtaaacacaacattcatggacctag-agacatgacattactatgcatgaccctttg 18981652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22449872 - 22449815
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgc 92  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||    
T  22449872 gatgacaaaatcaatct-cgtaaacacaacattcatggatctataagatatgacattgc 22449815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 90
Target Start/End: Original strand, 8738125 - 8738181
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacatt 90  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||  |||||| |||||    
T  8738125 gatgacaaaatcaatctttgtatacacaacattcatgaacctaagagacatgacatt 8738181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 49354254 - 49354125
Alignment:
Q  37 gacaaaatcaatcttcgtaaacacaacatt----cacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaac 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||  ||| |||||| ||||||| ||| || ||| |||  | |||||| |||||||||   ||    
T  49354254 gacaaaatcaatcatcgtaaacacaacattaattcatggatttaggagacattacattgctatgaatgaccatttaaattctatgcagaaggtcagttac 49354155  T
Q  133 ctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaa 162  Q
    ||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  49354154 ctctagtgctaggaagccaaaaatgtcaaa 49354125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Original strand, 35310368 - 35310750
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35310368 gatggcaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcaaaaccctttggactctatgtagaaggttaacagcc 35310467  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35310468 tctgatgccaggaagccgaaagtgtcaaaagcagatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacatgctttctcatgtttggccactttgcttgac 35310563  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35310564 gcatcttttagggttgtctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccaatcaagtccacacatgcatgttttcctccaa 35310663  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| | ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  35310664 cccatccgtacatcataacatccgcaagcctaagtgttgatcttctatctagtgggtcagttaggaagttcacaggcgcctccttct 35310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13167089 - 13166715
Alignment:
Q  42 aatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgc 141  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13167089 aatcaatcatcgtaaacccaacattcatggacctaggagacataccattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgc 13166990  T
Q  142 taggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  13166989 taggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttg----attgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgacgcagattt 13166894  T
Q  242 taggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccct-aaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatct 340  Q
    ||||  || |||||| |||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  13166893 tagggttgtctgtcccaccgtaaaagccctaacccataaaatccacaagtggtgaaa-cccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatcc 13166795  T
Q  341 gtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13166794 gtagaccataacatccgcatgcttaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggcgcttccttct 13166715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Original strand, 27336615 - 27336984
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||    ||||||||||||||||||  ||    
T  27336615 gatggcaaaatcaatccttgtaaaaacaacattcatggacttaggagacataacattgctatacataaccattttc--tctatgtagaaggtcaactgcc 27336712  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27336713 tctgatgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttga----ttgtcagaacacgatttctcatgtttgaccactttgcttgac 27336808  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27336809 gcaacttttagggctgtctgtcctattgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaa 27336908  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacagg 409  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  27336909 cccatccgtacaccataacatccgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacagg 27336984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33692224 - 33691861
Alignment:
Q  51 tcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagcc 150  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  33692224 tcgtaaacagaacattcatgaacctatgagacataacattgttatgcata-ccctttggacactatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaagaagcc 33692126  T
Q  151 gaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgc 250  Q
    ||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||    ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33692125 gaaagtgtcaaaagcaaatggtacaaaagcatgttgattg----tcataacacgttttgtcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttaggcctgc 33692030  T
Q  251 ctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccata 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  33692029 ctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaacctcagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacaccata 33691930  T
Q  351 acatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||  ||| || |||||||| ||||||||| |||  | ||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  33691929 acatttgcaggcttaagtgtcgatcttctatctag-gggtcagtcagaaagttcgcaagcgcctccttct 33691861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32269977 - 32269667
Alignment:
Q  41 aaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatg 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |  ||| ||||||||||||||||||  ||    
T  32269977 aaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaacttcatgcagaaggtcaacaacctctagtg 32269878  T
Q  141 ctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagctt 240  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||   ||||||||| |||||||||    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  32269877 ctaggaaatcgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcgtgttgattg----tcagaacacactttctcatgtttgaccactttggttgatgcagctt 32269782  T
Q  241 ttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatct 340  Q
    |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||     
T  32269781 ttagggttgcatgtcctaccataaaaggcccgacacctaattccagaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatcc 32269682  T
Q  341 gtacaccataacatc 355  Q
    |||||||||||||||    
T  32269681 gtacaccataacatc 32269667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 197 - 420
Target Start/End: Original strand, 433371 - 433594
Alignment:
Q  197 agaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  433371 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacacagcttttaaggttgtctatcctaccgtaaaagcccctacccttaaacccacaggtggtgaa 433470  T
Q  297 accccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtca 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||    
T  433471 accccggtcaagtccacacatgcatattttcctccaacccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtggatcttctatttagtgggccagtca 433570  T
Q  397 caaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||||||| ||| |||| ||||    
T  433571 gaaagttcacgggcgcctctttct 433594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 116 - 408
Target Start/End: Original strand, 43129536 - 43129823
Alignment:
Q  116 tgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgt 215  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||||| |||||||||| ||   || |||| ||||    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43129536 tgtagaaggtcaaaaacatctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatggtagaaaaacatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgt 43129631  T
Q  216 ttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacac 315  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  43129632 ttgaccactttgcttgacgcatcttttaggactgaatgtccaaccgtaaaagttccgacccctaatccaacaagtggtgaaaccccagtcaatttcacac 43129731  T
Q  316 atgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacag 408  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  43129732 atgcat-ttttcctcctatccatccgtacatcataacatctgcatgcctaagtgtcgatcttctatctagtagatcagtaagaaagttcacag 43129823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37873820 - 37873592
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||   ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  37873820 caaaatcaatcctcttaaacacaacattcatagacctagaagtcatgacattgttctgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgg 37873721  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37873720 tgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttg----attgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaac 37873625  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagcccc 271  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37873624 ttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagcccc 37873592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25663219 - 25663012
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  25663219 gatgacaaagccaatcctcgtaaactcaacattcatggacctaggggacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaacaact 25663120  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  25663119 tctgatgctaggaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgatta----tcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttgat 25663024  T
Q  234 gcagcttttagg 245  Q
    ||||||||||||    
T  25663023 gcagcttttagg 25663012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 351
Target Start/End: Original strand, 14423680 - 14423912
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  14423680 tctatgtagaaggtcaacagcctctgatgctagga----gaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgctttctc 14423771  T
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtcc 311  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14423772 atgttcggtcactttgcttgacgcattttttagggttgcctgtcctacggttaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccaatcaagtct 14423871  T
Q  312 acacatgcatgttttcgtcc-aaaccatctgtacaccataa 351  Q
     |||| |||| |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  14423872 tcacaagcatattttccacctaaaccatccgtacaccataa 14423912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 420
Target Start/End: Original strand, 38446271 - 38446468
Alignment:
Q  225 ttgcttgacgcagctttt--aggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatg 322  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38446271 ttgcttgacgcagcttttttagggatgcatgtcataccgtaaaagccccaactcctaaacccacaagtggtgaaacctcagtcaagtccacacatgcatg 38446370  T
Q  323 ttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||  | ||||||| ||| |||||| || |||||||||    
T  38446371 ttttactccaacccatccgtacaccataacatttgcatgcctaagtgtcgatattctatctagagggtcagtcagaaaattcacatgcgcctccttct 38446468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 430496 - 430678
Alignment:
Q  8 acaagctgcaccgttagacnnnnnnngatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataacccttt 107  Q
    ||||||||||||| |||||       |||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  430496 acaagctgcaccgatagacctttttggatggcataatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattactatgcataacccttt 430595  T
Q  108 ggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  430596 ggaatctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctatgaagacaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg 430678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 395
Target Start/End: Original strand, 34335259 - 34335614
Alignment:
Q  36 tgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctc 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  |||| |||||| | ||||  | |||| | || ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  34335259 tgacaaaatcaatcatcgtaaacacaatatttatgggtctaggagacatgagattgttacgcatgatccgttgaactctatgtagaaggtcaacagcctc 34335358  T
Q  136 tgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgc 235  Q
    || ||  || ||| |||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||      
T  34335359 tggtgtcagaaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcaggacacgctttctcatgtttggcccttttgcttgacat 34335454  T
Q  236 agcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaac 335  Q
     |||||||||  || || |||||| ||||||||   ||||| ||| || ||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |      
T  34335455 ggcttttagggttgtctatcctacagtaaaagctttgacccttaatcctacaagtgatagaaccccagtgaattccacacatgcatgttttcctcctact 34335554  T
Q  336 catctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtc 395  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  34335555 catttgtacaccataacatatgcaagcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtc 34335614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15292212 - 15291831
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||| |||||| | ||||| |||  | |||||||| |||| ||||    
T  15292212 gatggcaaaatcaatcctcataaacacaacattcatggacctaggagatgtgacattgctatgcatga-ccttttgaacttttgtagaagatcaataacc 15292114  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  |||||| || |  ||||||| |||| | ||   ||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15292113 tctagtgctagaaaactaaaagtgtaaaaaacaaattgtataaaaacatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgtttgac 15292018  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||  ||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||| ||| |    
T  15292017 gccacttttagggttgtctgtcataccgcaaaaggcccgacacttaatccaacaagtggtgaaacctcattcaagtctacacaaacatgttttcctccta 15291918  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||| | |||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||| |||| | |||||    |||||||||||| | |||||||    
T  15291917 cccagccgtacaccataacattcgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagttgggaagttcacaggcgcttccttct 15291831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26212745 - 26212387
Alignment:
Q  59 acaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgt 158  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||| ||  |||| | |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||| | ||||| ||    
T  26212745 acaacattcatggacttaggagacataatattgccatacatgacattttgaactctatgtagaaggttaatagcctctggtgctaagaaactgaaagggt 26212646  T
Q  159 caaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtccta 258  Q
     |||| | ||   ||||||||||||||||| |    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |    
T  26212645 aaaaaacaaatggtataaaagcatgttgatcg----tcagaatacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttagaactgccattccaa 26212550  T
Q  259 ccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt-cgtccaaaccatctgtacaccataacatccg 357  Q
    |  ||||||  || || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |  || | ||| | ||||||||| ||||| |    
T  26212549 cgataaaaggtccaacacctaatctcacaagtgatgaaaccccagtcaaatctacacatgcatttttttccacctagccacccgtacaccatcacatctg 26212450  T
Q  358 catgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26212449 catgcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttcacaggcgcctccttct 26212387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 121 - 354
Target Start/End: Original strand, 35455963 - 35456192
Alignment:
Q  121 aaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggc 220  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||| |    
T  35455963 aaggtcaacatcctctggtgctaggaagccaaaattgtcaaaagcaaaaggtataaaagcatgttgattgtt----agaacacgctttctcatgtttgac 35456058  T
Q  221 cacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgca 320  Q
    ||  || ||| || || ||||| || || |||  ||||||||||||| || ||||||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35456059 cattttacttaacacaactttttgggctacctaccctaccgtaaaaggccggacccctaatcctacgagtggcaaaaccccggtcaagtccacacatgca 35456158  T
Q  321 tgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacat 354  Q
    | ||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  35456159 tatttacctcctacccatctgtacaccataacat 35456192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 188 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3114200 - 3114003
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  3114200 ttgactgtcagaacatgctttctcatgtttggccactttgtttgatgcaacttttagggctgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaatcccatg 3114101  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    ||||||||||  |  |||||||| ||| |||  || |||| ||  | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||    
T  3114100 agtggtgaaatactggtcaagtctacaaatgagtg-tttcctcttacccatttgtacaccataacatctgcatgactaagtgttgatcttctatctagt 3114003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 42921618 - 42921845
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| | |||| ||| |||||| ||||||  |||||| ||| | || | ||||||||||||| ||||||||    
T  42921618 gatggcaaaaccaatccttgtaaacacaatatt-atggacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttctgaactctatgtagaaggccaacaacc 42921716  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||   ||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  | ||| ||    
T  42921717 tctggtgctaggaaaccgaaagtgtcataagcaaatggtataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttgaccaccatacttaac 42921812  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaa 266  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  42921813 gtagtttttagggctgcctgtcttacggtaaaa 42921845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43115566 - 43115359
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc 211  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || || |||| |  ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||    ||| |||||||||||||    
T  43115566 tctacgtagaaggtcaacaatctctggtgttacgaagtcagaagtgtcaaaagcaaatgctatgaaagcatgttgattg----tcaaaacacgctttctc 43115471  T
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtcc 311  Q
    || |||| || | ||  || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||    
T  43115470 atatttgaccgctttattt-acgcaacttttagggctgtctatcctaccgtaaaagccccgacctctaatcccatgagtggtgaaaccccgatcaaatcc 43115372  T
Q  312 acacatgcatgtt 324  Q
    | |||||||||||    
T  43115371 atacatgcatgtt 43115359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 326
Target Start/End: Original strand, 8858986 - 8859124
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||  ||  ||| ||||| |||||||||||   |  |||||| | || |    
T  8858986 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgactactttgcttgacgcagttttgtgggttgcttgtcccaccgtaaaagctatggtccctaatctcaga 8859085  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8859086 agtaatgaaacctcagtcaagtccacacatgcatgtttt 8859124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 303
Target Start/End: Original strand, 8100474 - 8100737
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |  ||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  8100474 gatggcaaaatcaatcatcgcaaa-acaacatttacg-acctagaagacatgacattgatatgcatgaatctttaaactctacgtagaaggtcaacaacc 8100571  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  ||  ||||||  |||||||||| || | ||   ||||||||||||    |  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  || |||||     
T  8100572 tctagtggaaggaagttgaaagtgtcacaaacaaatggtataaaagcatg----taaattgtcacaacacgttttctcatgtttgaccattttacttgat 8100667  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccag 303  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||  | |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8100668 gcagcgtttagggatgcatgtcctactattaaagtcccgactcttaatcccacaagtggtgaaaccccag 8100737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22188842 - 22188687
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  22188842 gatgacaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgatattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcc 22188743  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgatt 189  Q
    |||| |||||  ||  |||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||    
T  22188742 tctggtgctaaaaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaatcatgttgatt 22188687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23424058 - 23423927
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||  ||| | |||| ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23424058 gatgacaaaatcaatcttcataaacacaatattgatagaagtaggatacatgacattgcaatgaatgatcctttgaaatctatgtagaaggtcaacaaca 23423959  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagc 165  Q
    | ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23423958 tttgatgttaggaagttgaaagtgtcaaaagc 23423927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 245
Target Start/End: Original strand, 38875570 - 38875765
Alignment:
Q  45 caatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctag 144  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  ||||||  |||||| ||| |||| | |||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  38875570 caatcatcgtaaacacaacat-cattgacctaggagacaagacattgttatgcatgaccttttgaactctacgtagaaggtcagcagcctctggtgctag 38875668  T
Q  145 gaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttag 244  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||   || |||| ||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||| |||| ||||||    
T  38875669 gaagctgaaagtgtcaaaaacaaatggtacaaaaacatg----ttgattgtcagaacacactttctcatgtttggtcgctttgtttgatgcagtttttag 38875764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 23023515 - 23023589
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  23023515 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcatcgacctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttg 23023589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32230544 - 32230430
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   || | |||| |||||||||||  | ||||||||| | ||||    
T  32230544 ttgattgtcagaacacattttctcatgtttggtcactttgcttgacgcaacttttaaagctacttgtcttaccgtaaaagttctgacccctaatctcaca 32230445  T
Q  288 agtggtgaaacccca 302  Q
    | || ||||||||||    
T  32230444 actgatgaaacccca 32230430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2566282 - 2566194
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  2566282 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattgatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaa 2566194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 9841270 - 9841146
Alignment:
Q  282 cccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatct-gtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttcta 380  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||  | | | |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9841270 cccacaagtggtgaaaccctactcaagtttacacacgcatgtttttcttctacccatcccgcacaccataacatccgcaggcctaagtgtcgatcttcta 9841171  T
Q  381 tttagtagatcagtcacaaagttca 405  Q
    | |||||| | |||||  |||||||    
T  9841170 tctagtaggtaagtcaggaagttca 9841146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14723344 - 14723275
Alignment:
Q  121 aaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  14723344 aaggtcaacaacctctgatgctaaaaaaccaaaagtgtaaaaaacaaatgatataaaagcatgttgattg 14723275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27355659 - 27355570
Alignment:
Q  282 cccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtc 371  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| | | |  ||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  27355659 cccacaagtggtgaaaccccattcaattcaacacatccatgttttcctcctaccgacatgtacaccataacgtccgtttgtctaagtgtc 27355570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22819824 - 22819761
Alignment:
Q  35 atgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgca 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  22819824 atgacaaaatcaatcttcataaacacaacattcatagatttaacagacataacattgctatgca 22819761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26010340 - 26010276
Alignment:
Q  94 atgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtc 159  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| || ||||||||    
T  26010340 atgcataatcctttg-aatctacgtagaaggtcaataacctctggtgataggaaaccaaaagtgtc 26010276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Original strand, 34475967 - 34476004
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctag 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34475967 aaaaacaatcttcgtaaacacaacattcatggacctag 34476004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28517474 - 28517092
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  28517474 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgtc 28517375  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||    ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28517374 tctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattg----tctaaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 28517279  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28517278 gcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatacatgttttcctccaa 28517179  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28517178 cccatccgtacaccataacatttgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggcgcctccttct 28517092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 408
Target Start/End: Original strand, 5825193 - 5825561
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5825193 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacatccatagacctaggagacataacattgctatgcataaccctttcgactctatgtagaaggtcaacaacc 5825292  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||   ||||||| ||||    |||||||||| ||||||| || |||||||||  ||| ||||||||     
T  5825293 tctggtgctaggatgccgaaagtgtcaaaagtaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcataacacgcattgtcatgtttg--cactttgcttgat 5825386  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5825387 gcagcttttagggcttcctgtcctgccgtaaaagcctcgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaa 5825486  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacag 408  Q
     ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| | ||| ||| |||||||||||    
T  5825487 cccattcgtacaccataacatccgcaggcctatgtgtcgatcttctatctagtgggtcaatcagaaagttcacag 5825561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 386
Target Start/End: Original strand, 19277235 - 19277561
Alignment:
Q  56 aacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaag 155  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19277235 aacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaag 19277334  T
Q  156 tgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtc 255  Q
    |||||||||| ||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19277335 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggctactttgcttgacgcagcttttaggactgcctgtc 19277430  T
Q  256 ctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatc 355  Q
    |||| | |||||  | ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||| ||| |||||||||||    
T  19277431 ctacggcaaaaggtctgaaacctaatccgacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccgtagaccataacatc 19277530  T
Q  356 cgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||| ||||    
T  19277531 cgcaggcctgagtgttgatcttctatctagt 19277561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 420
Target Start/End: Original strand, 4501191 - 4501560
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||| ||||||| |||||| | | |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4501191 aatcctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaga 4501290  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttagg 245  Q
    || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4501291 aaacc-aaagtgtcaaaagcaaattatataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttgacgcagcttttagg 4501385  T
Q  246 actgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtaca 345  Q
      ||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||| |||||    
T  4501386 gttgtttgtcctacggtaaaaggcccgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacctatccgtaca 4501485  T
Q  346 ccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||||||||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| | ||| |||  ||||||||| || |||| ||||    
T  4501486 ccataacatccgctggcctgagtgtttatcttctatctagtgggtcattcaggaagttcacaagcacctctttct 4501560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21327054 - 21326709
Alignment:
Q  5 acaacaagctgcaccgttagacnnnnnnngatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccc 104  Q
    |||||||||||| |||||||||       |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||     
T  21327054 acaacaagctgcgccgttagacctttttggatggcaaaatcaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcatgacct 21326955  T
Q  105 tttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacg 204  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  21326954 tttgaactctatgtaaaaggtcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacg 21326859  T
Q  205 ctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagt 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  21326858 ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcggcttttagggctgtttgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaactccaat 21326759  T
Q  305 caagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacat 354  Q
    ||| || ||||| | ||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  21326758 caaatctacacaagtatgttttccacctacccatctgtacaccataacat 21326709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 386
Target Start/End: Original strand, 43856799 - 43857142
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||   ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  43856799 caaaatcaattctcgtaaacataacattcatggacctaggagtcatgacattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgg 43856898  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    || |||||| || ||| |||||||||| ||   |||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |    
T  43856899 tgttaggaaaccaaaaatgtcaaaagcaaattgtataaacgcatgttgattg----tcaaaacacgctttctcatgtctagccactttgattgacgcatc 43856994  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccat 338  Q
    |||||    || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||| | ||||    
T  43856995 ttttaatgttgtctgtcctactgtaaaagccccgacccctaatcccacaagtggtgaaacccccgtcaagtccacgcatgtatgtttttctcctacccat 43857094  T
Q  339 ctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  43857095 ccgtacaccataacatctgcaggcctaagtgttgatcttctatctagt 43857142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 420
Target Start/End: Original strand, 982880 - 983251
Alignment:
Q  45 caatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctag 144  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  982880 caatcctcgtgaacacaacattcatggacatagaagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctag 982979  T
Q  145 gaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttag 244  Q
     || |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  982980 aaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgatttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttat 983075  T
Q  245 gactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtac 344  Q
    | |||||||||||||  ||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||   || |  |||  ||||    
T  983076 ggctgcctgtcctacaataaaaggtcccacacctaatcccacaagtggttaaaccctagtcaagtctacacaagcatgtttttcacctactcattcgtac 983175  T
Q  345 accataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    | |||||| |||| |||||| |||||  ||||||||| |||| | ||||| |  |||||||| | | |||||||||    
T  983176 atcataacttccggatgcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagttaggaagttcaccgacgcctccttct 983251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 326
Target Start/End: Original strand, 22197907 - 22198194
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22197907 gatgacaaaatcaattatcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 22198005  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22198006 tctgatgctaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattg-ttg---gaacacactttctcatgtttggtcactttgcttgac 22198101  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    || ||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  22198102 gccgcttttagggctgcgcgtcctaccataaaaggcccgacacctaatcgcacaagtggcgaaaccccaatcaaatctacacatgcatgtttt 22198194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22239914 - 22239627
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22239914 gatgacaaaatcaattatcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 22239816  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22239815 tctgatgctaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattg-ttg---gaacacactttctcatgtttggtcactttgcttgac 22239720  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    || ||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  22239719 gccgcttttagggctgcgcgtcctaccataaaaggcccgacacctaatcgcacaagtggcgaaaccccaatcaaatctacacatgcatgtttt 22239627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 327
Target Start/End: Original strand, 32584526 - 32584810
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaa-tctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||  |||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  32584526 aaaatcaatctttgtaaacacaacattcatcgatctatgagacataacattgatatgcatgatcttttggaactctatctagaaggtcaacaacctctgg 32584625  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| ||   | |||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |||      
T  32584626 tgctaggaaacataaagtgtcaaaagcaaatggtgtaaaagcat----cttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttgtttgatgcaat 32584721  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32584722 ttttagggttgcatgtcctaccgtaaaatccccgacccctaatcccacaagaggtgaaacccgagtcaagtccacacatgcatgttttc 32584810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 27521391 - 27521710
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27521391 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatagacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 27521490  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||   |||||| |||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  27521491 tctgatgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagtaaattgtataaatgcatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttgtttaac 27521586  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| |||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||  ||| |    
T  27521587 gcaacttttaagggtgcatgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccacaaatggtgaaatctcagtcaagtctacacat--atgtttttctccta 27521684  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgca 359  Q
     ||||| ||| || ||||||||||||    
T  27521685 cccatccgtagacaataacatccgca 27521710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45614029 - 45613659
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||  |||||| | | |||| | |||||||||||||  |||| ||    
T  45614029 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagatttgacattgttatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggctaacagcc 45613930  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||   ||||||| ||||    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| || ||||||    
T  45613929 tctggtgcttggaaaccgaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcagaacacactttcccgtgtttggtcaccttacttgac 45613834  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| ||||||||  || ||||||||| | ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  45613833 gcaacttttagggttgtctgtcctacggaaaaaggcccgacacctaatcctacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctccta 45613734  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacag 408  Q
     ||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||  | |||||||  ||||||||||    
T  45613733 cccattcgtacatcataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctttctagcgggtcagtcaggaagttcacag 45613659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 327
Target Start/End: Original strand, 24527509 - 24527798
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||| || ||| || ||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  24527509 gatgacaaaaccaatcctcgtgaatacaacattcatggaccaaggagaaatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcc 24527608  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||||||    
T  24527609 tctcgtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgttttcccactttacttgac 24527704  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
     | ||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  24527705 actgcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaaatgatgagaccctagtcaagtctacacaaacatgttttc 24527798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 420
Target Start/End: Original strand, 3676677 - 3676942
Alignment:
Q  152 aaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactg-c 250  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||    |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3676677 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcat----attgatagtaagaacacgctttctgatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctggc 3676772  T
Q  251 ctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccata 350  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | |||||  |||||||||    
T  3676773 ctgtcctacggtaaaaggaccgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccctacaccata 3676872  T
Q  351 acatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||||  || |||| |||||  || |||||| || | | |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  3676873 acatctacaagcctgagtgttgattttctatctattgggtcagtcaggaagttcacaggtgcctccttct 3676942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40726667 - 40726476
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40726667 gatggcaaaatcaatcctcataaacacaacattcatggatctaggagacatagcattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacc 40726568  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgct 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||||| ||||    ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||    
T  40726567 tctgatgctatgaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcagaacacattttattatgtttggccactttgct 40726476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30216244 - 30216040
Alignment:
Q  35 atgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacct 134  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||| |||||| ||| |||| | | ||||| |||| ||||||| ||    
T  30216244 atgacaaaatcgatcctcgtgaacacaacattcatagacctaggagatatgacattgctatgcatgaccatttgaactttatgtggaagatcaacaaact 30216145  T
Q  135 ctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacg 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  30216144 ctgatgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttg----attgtcaaaacacgctttctcatatttgaccattttgcttgacg 30216049  T
Q  235 cagctttta 243  Q
    |||||||||    
T  30216048 cagctttta 30216040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 48539101 - 48539257
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||| ||    
T  48539101 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttggactctatgtagacgatcaacagcc 48539200  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  48539201 tctggtgctagaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg 48539257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 420
Target Start/End: Original strand, 10905047 - 10905405
Alignment:
Q  43 atcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgct 142  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  10905047 atcaatccttgtaaacacgacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatggctctttgaactctatgtagaaggtcaacatactctggtgct 10905146  T
Q  143 aggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagctttt 242  Q
    ||| | || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||    |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10905147 aggcaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtat-aaagcatg----ttgagtgtcagaacactttttctcatatttggccactttgcttgacgcagctttt 10905241  T
Q  243 aggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtg-aaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctg 341  Q
    |||              | |||||| ||  || | ||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  10905242 agg-------------gcataaaagtcctaactcttaatccaacaagtggtgaaaacctcagtcaagttcacacatgcatgttttcctcctatccatccg 10905328  T
Q  342 tacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||   | |||||||| |||| |||||||||    
T  10905329 tacacc--aacatctgcaggcctaagtgtcgatcttatatctagtggatcaacaagaaagttcataggctcctccttct 10905405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 327
Target Start/End: Original strand, 2904368 - 2904574
Alignment:
Q  117 gtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||| || | ||  |||||||| ||||    ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2904368 gtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaagccaaacatgtcacaaacaaatgatataaaatcatg----ttgattgtcggaacatgctttctcatgtt 2904463  T
Q  217 tggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacaca 316  Q
    || | |  |||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  2904464 tgactattttgcttgacgtaacttttaggactgtctatcctaccgtaaatgcctcatcccctaacctcacaagtggtgaaaccccgatgaaatccacaca 2904563  T
Q  317 tgcatgttttc 327  Q
    | ||| |||||    
T  2904564 tacatattttc 2904574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 420
Target Start/End: Original strand, 47679123 - 47679427
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || || | |||||||| ||    ||||||||| ||||||| |||||||    
T  47679123 tctatttagaaggtcaacaacctgtgatgctaggaaaccgaaaatgtcaaacgcaaatagtataaaagtat----attgattgtgagaacacactttctc 47679218  T
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaa-acccacaagtggtgaaaccccagtcaagtc 310  Q
    || ||| | ||| |||| ||||||| |||||||   | |  |||||   ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47679219 atattttgtcactttgc-tgacgcaacttttagagatactcgtccttttgtaaaagccgctacccctaacccccacaagtggtgaaaccctagtcaagtc 47679317  T
Q  311 cacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggc 410  Q
     | ||||| |||||||| ||| | ||||  | || |||| |||| || | | | ||||||| ||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||    
T  47679318 tagacatgtatgttttcctcctacccattcgcacgccattacattcgtaagtcaaagtgtcgatcttctatctagtgcgtcagtcagaaagttcacacgc 47679417  T
Q  411 ccctccttct 420  Q
      ||||||||    
T  47679418 gactccttct 47679427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9281251 - 9281091
Alignment:
Q  101 accctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaa 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| |||||||  | || | |||||||||||||||    ||||| ||||    
T  9281251 accctttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttg----attgttagaa 9281156  T
Q  201 cacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  9281155 cacgctttctcatgttt-gctagtttgcttgatgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaa 9281091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9292222 - 9292062
Alignment:
Q  101 accctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaa 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| |||||||  | || | |||||||||||||||    ||||| ||||    
T  9292222 accctttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttg----attgttagaa 9292127  T
Q  201 cacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaa 266  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  9292126 cacgctttctcatgttt-gctagtttgcttgatgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaa 9292062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33202493 - 33202368
Alignment:
Q  197 agaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaa 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | | |||||| |||  ||| ||  || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  33202493 agaacacgcgttctcatgtttggccacttagttggacgcaacttccagggctttctatcctactgtaaaagccccaacccctaatcccacaagcggtgaa 33202394  T
Q  297 accccagtcaagtccacacatgcatgt 323  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  33202393 a-cccagtcaagtccacacatgcatgt 33202368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42295359 - 42295166
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||  |||||| |   |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  42295359 aatcatcgtaaacacaagattcatggacctaggagacatgacaatgttatgcatgatattttgaacgctatgtagaaggtcaacaacccctggtgttagg 42295260  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagctttta 243  Q
    || |||||||| | |||| | ||   ||||||| ||||    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  42295259 aaaccgaaagtataaaaaacaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcagaagaagctttcttatgtttggccattttgcttgacgccgctttta 42295166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 45003084 - 45003008
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttgga 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  45003084 gatggcaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcatggtcctatgagacataacattgctatgcataactctttgga 45003008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41117952 - 41117833
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| | | |||  | |||||||||||||| |||||| ||||     
T  41117952 caaaatcaatcatcgtgaacacaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgatcttttaaactctatgtagaaggttaacaacatctgg 41117853  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgt 158  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  41117852 tgttaggaaaccgaaagtgt 41117833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 138
Target Start/End: Original strand, 23037465 - 23037569
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||    
T  23037465 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaaaattcatagacctaagagaaatgacattgctatgcataaccctttgaaccctacgtagatggtcaacaacc 23037564  T
Q  134 tctga 138  Q
    |||||    
T  23037565 tctga 23037569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 327
Target Start/End: Original strand, 38839337 - 38839536
Alignment:
Q  127 aacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacatt 226  Q
    ||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||| ||||    ||||||| || |||| ||||||||||||||| | |  ||    
T  38839337 aacaacctctcgtgttaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaattatataaaaacatgcatgttgattgacataacatgctttctcatgtttgacgatttt 38839436  T
Q  227 gcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
      || ||||| |||||||   || |||| || ||||||||| | ||||||| || ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38839437 attttacgcaacttttagagttgtctgttcttccgtaaaagacacgaccccaaatcccacaa-tgatgaaatctcagtcaagtccacacatgcatgtttt 38839535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9266247 - 9266173
Alignment:
Q  250 cctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttt 325  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9266247 cctgtcctacagtaaaagccctaacccctaatcccacaagtggtgaaa-cccggtcaaatccacacatgcatgttt 9266173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 316
Target Start/End: Original strand, 34772719 - 34772977
Alignment:
Q  51 tcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagcc 150  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||  |||||| ||  |||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||| |||       
T  34772719 tcgtaaacacaatattcatggacctagaaaacatgacattgatatgcatgactttttgaagtttatgtagaaggtcaacaacctctaat-ctaagaaatt 34772817  T
Q  151 gaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgc 250  Q
    |||||| |||||||| ||   ||||||| |||    ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||  || |||||||  ||||    
T  34772818 gaaagtttcaaaagcaaatggtataaaaacat----attaattgtccgaacacactttctcatatttggctactttgattga--caacttttagagctgc 34772911  T
Q  251 ctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacaca 316  Q
    || || ||||||||||  ||| || | ||| ||||||| || | ||||| || ||||||| |||||    
T  34772912 ctatcataccgtaaaaagcccaacacataatcccacaaatgataaaacctcaatcaagtctacaca 34772977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25187096 - 25187016
Alignment:
Q  56 aacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctct 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  25187096 aacacaacattcatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatatagaaggtcaacaacctct 25187016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 267
Target Start/End: Original strand, 1249658 - 1249735
Alignment:
Q  190 gattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaag 267  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1249658 gattatcaaaacacgctttctcatgtttgaccactttatttgacgcaggttttagggctgtctatcctaccgtaaaag 1249735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 5714960 - 5715017
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattg 91  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  5714960 gatgacaaaaccaatcttcataaacacaacatttatggacctaggagacataacattg 5715017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 386
Target Start/End: Original strand, 38596635 - 38596723
Alignment:
Q  298 ccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  | | |  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  38596635 ccccagtcaagtccatacatgcatatttttcttctacacatccgtacaccataacatccacatgcttaagtgtcgatcttttatttagt 38596723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5972391 - 5972293
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctag 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || || | ||| || ||||| | |||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5972391 aatcctcgtaaacacaacattcatagatctgggagaaatgacattactatgcatgacattttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatactag 5972293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34067899 - 34067769
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||  |||  ||| ||| |||||| || ||||||| ||    ||| || ||||||    
T  34067899 ttgattgtcaaaacacactttctcatgtttggtcacttggcttgaagcgacttcgagggctgtctgtcccacagtaaaagtcctagtccccaatcccaca 34067800  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatg 318  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  34067799 agtgggaaaaccccggtcaagtccacacatg 34067769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6635067 - 6634994
Alignment:
Q  117 gtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||    
T  6635067 gtagaaggtcaacaacctctgatgctaaaaaatcgaaactgtcaaaagcaaatgatataaaaatatgttgattg 6634994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10032298 - 10032202
Alignment:
Q  94 atgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||| |||||||    
T  10032298 atgcatgatcctttgaactctatgtagaaggttaacaacatctaatgctaagaagctgaaaatatcaaaagcaaatagtataaaaacatattgattg 10032202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 420
Target Start/End: Original strand, 32585390 - 32585449
Alignment:
Q  361 gcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||    
T  32585390 gcctaagtgtcaatcttttatctagtaggtcattcagaaagttcacatgcgcctccttct 32585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36559049 - 36558899
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||   |||||| ||| |||  | |||||| |||| |||||| || | ||     
T  36559049 caaaatcattcatcgtaaacacaacattcatggacctataagacatgatatttatatgcatgaccattt-aactctatggagaaagtcaacgacttttgg 36558951  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||||| || || ||| ||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  36558950 tgctagaaaaccaaaaatgtcaaatgcaaattatataaaaacatgttgattg 36558899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 107
Target Start/End: Original strand, 38766259 - 38766302
Alignment:
Q  64 attcacggacctagaagacataacattgcgatgcataacccttt 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38766259 attcatggacctaggagacataacattgctatgcataacccttt 38766302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 43383249 - 43383376
Alignment:
Q  198 gaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |  |||||  || |||||||||| |  || ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||    
T  43383249 gaacatgctttctcatggttggccactttatttgaagtggctttgtgggctgcctgtcccatagttaaagccccgattctcaatcccacaagtggggaaa 43383348  T
Q  298 ccccagtcaagtccacacatgcatgttt 325  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43383349 ccccagtcaagtcgacgtatgcatgttt 43383376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 41071788 - 41071738
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacat 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||||    
T  41071788 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacataacattcataaatctagaagacat 41071738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27027812 - 27027759
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgc 92  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  27027812 caaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgc 27027759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33220898 - 33220555
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33220898 gatggcaaaaccaattatcgtaaacgcaacattcatggacctagaagacacaacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaacaacc 33220799  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  33220798 tcggatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcaacacacgctttctcatgtttggccactttgcttgat 33220703  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  33220702 gcagcttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaaattcacacatgcatgttttcctccaa 33220603  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
      |||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  33220602 ctcatccgtacatcataacatctgcaggcctgagtgtcaatcttctat 33220555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 420
Target Start/End: Original strand, 34304421 - 34304798
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  34304421 caaaatcaatcctcgtaaatacaacattcatagacctatgagacatgatattgctatgcataactctttggactctatgtagaaggtcaacatcatctga 34304520  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  34304521 tgctaggaagcccaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgctttctcatgtttggttattttgcttgacgcagc 34304616  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccat 338  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  34304617 ttttagggctagctgtccaaccgtaaaagccccgactcctaaacccacaagtggtgaaaccccaatcaagtccacacatgcatgttttcctccagcccat 34304716  T
Q  339 ctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  34304717 ccgtacaccataacatccgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacatgcgtctccttct 34304798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 357903 - 357522
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  357903 gatggcaaaattaatcttcgtaaacacaacattcatggacctaggagagataacattgctatgcttaatcatttggactctatgtagaaggtcatcaacc 357804  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||| ||| |||||| |  ||||||| |||| | ||   |||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  357803 tctaatgttaggaaaca-aaagtgttaaaaacaaaggttataaaagcatgttcattg----tcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 357709  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  357708 gaagcttttagggctgcctgtcctaccgtaaaagcaccgacccctaaacccacaagtggtgaaactccagtcaagtccacacatgcatgttttgctccaa 357609  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  357608 cccatccatacaccataacatctgcatacctaagtgtcgatcttctatctagtgtgtcagtcaaaaagttcacaagggcctccttct 357522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4206783 - 4206401
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||  ||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4206783 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacactatattcattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 4206684  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4206683 tctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatg----ttcattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgac 4206588  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||  |||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4206587 gccacttttaaggctgcatgtcctaccgtaaaaggtctgatgcctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctccaa 4206488  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     |||| |||||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||| |||| | ||| |||  |||||||| ||  |||||||||    
T  4206487 cccatttgtacaccataacatccgcaggcttgagtgttgatcttttatctagtgggtcaatcaagaagttcacgggtgcctccttct 4206401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17249492 - 17249198
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  17249492 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatgaacttaggagacataacattgctatacataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcc 17249393  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17249392 tctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacactttctcatgtttggccactttgtttgac 17249297  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtcca 332  Q
    ||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17249296 gcaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaagcgcccactccgaaacccacaaatggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatattttcctcca 17249198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 370
Target Start/End: Original strand, 959501 - 959832
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  959501 gatgacaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgctatgcatga-ccttttgaacttacgtagaaggtcaacaacc 959599  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||   ||||||  ||||    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  959600 tctggtgctaggaaaccgaaaatgtcaaaaacaaatggtataaagacatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatggttagccactttgcttgac 959695  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
     || ||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  959696 acaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccataagtggtgaaacttcaatcaagtccacacatgcatgttttcctccta 959795  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgt 370  Q
     ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  959796 cccatccgtacactgtaacatccgcatgcctgagtgt 959832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 133 - 370
Target Start/End: Original strand, 28543394 - 28543627
Alignment:
Q  133 ctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttga 232  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||| |||||    | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28543394 ctctaatgctaggaagctgaaagtgtcaaaatcaaatagtataagagcat----agtgattttcaaaacacgatttctcatgtttggccactttgcttga 28543489  T
Q  233 cgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtcca 332  Q
    |||  |||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28543490 cgcgacttttaaggctgcctgtcttaccgtaaaagtcctgacctctaatcccacaagtggtgaaacctcagtcaaatccacacatgcatgttttcctcct 28543589  T
Q  333 aaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgt 370  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  28543590 atccatctgtacatcataacatctgcatgcctgagtgt 28543627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29338260 - 29337922
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||   ||||| |||||||| |   |||||||||||||||| | ||||| |    
T  29338260 aaaatcaatccttgtaaacacaacattcatggacctaggagtcatgacattgatgtgcatgaccctttgaaccatatgtagaaggtcaacgatctctggt 29338161  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagct 239  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||   ||||| |||||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| || ||    
T  29338160 gctaggaagtcagaagtgtcaaaagcaaatggtataagagcatgttg----attgttagaacacgttttctcatgtttggcagctttgcttgacacatct 29338065  T
Q  240 tttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatc 339  Q
    |||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||     | |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  29338064 tttatgattgtttgtcctaccgtaaaagccccgaccactaa----tcgagtggtaaaacctcgatcaagtccacacatgcatgttttcctcctacccatc 29337969  T
Q  340 tgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29337968 tgcacaccataacatctgcaggcctaagtgtcgaacttctatctagt 29337922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 45819 - 45474
Alignment:
Q  79 agacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaa 178  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||    ||||||    
T  45819 agacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatggaataaaa 45720  T
Q  179 gcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccct 278  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||| |||    
T  45719 gcatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgatcactttgcttgatgcagcttttagagctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacct 45624  T
Q  279 aaacccacaagtggtgaaaccc--------cagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgt 370  Q
    || ||||||||||||||||| |        | |||||||| ||||| ||||||||||   | | ||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  45623 aatcccacaagtggtgaaacacctgtcaagctgtcaagtctacacaagcatgttttccatctacccatccgtacaccatcacatctgcaggcctgagtgt 45524  T
Q  371 caatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
      ||||||||| |||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  45523 tgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcaaagacgcctccttct 45474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 205 - 420
Target Start/End: Original strand, 32115776 - 32115991
Alignment:
Q  205 ctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagt 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||    
T  32115776 ctttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaaggctgcatgtcctaacgtaaaatgcccgacacctaatcccataagtgatgaaaccccggt 32115875  T
Q  305 caagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttc 404  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  32115876 caagtctacacatgcatgttttcctcctactcatctgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtaggtcagtcaggaagttc 32115975  T
Q  405 acaggcccctccttct 420  Q
    ||| || |||| ||||    
T  32115976 acatgcgcctctttct 32115991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 420
Target Start/End: Original strand, 12401412 - 12401633
Alignment:
Q  199 aacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 298  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||| || || ||| |||| ||||||||||||    
T  12401412 aacacgctatcttatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagtgctgcttgtcctaccataaaagccctgaaccataatcccataagtggtgaaac 12401511  T
Q  299 cccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcaca 398  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  |||  | ||||| |  |||| |||| |||||| |||||||      
T  12401512 cccaatcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataacatttgcagacttaagtcttgatctgctatctagtaggtcagtcagg 12401611  T
Q  399 aagttcacaggcccctccttct 420  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  12401612 aagttcacaggcgcctccttct 12401633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4166109 - 4165919
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| |  |||||||  ||||| ||||||  |||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  4166109 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacactatatttattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacc 4166010  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgc 228  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4166009 tctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttg----attgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgc 4165919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28009169 - 28008886
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||   || || |||||||| | | |||  |||||||||||||| | ||     
T  28009169 caaaatcaattctggtaaagacaacgttcatggacctaggagtcatgacattgttgtgtatgaccctttgaactatatacagaaggtcaacaacttttgg 28009070  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    || ||   |||| |||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||| |||    
T  28009069 tgtta---agccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaccatattc-ttgattgttagaacaagctttctcatgtttgaccgctttgcttgacgtagc 28008974  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||    
T  28008973 ttttagggttgcatgtcctaccgtaaaagccccgacccctaatcccacgagtggtgaaactccagtcaagttcacctgtgcatgtttt 28008886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34554463 - 34554153
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||  |||||| | ||||| || ||| ||| |||  | ||||||||||| ||||| | |     
T  34554463 gatgacaaaatcaatcctcgtaaacacaaaattcatg-acttacgagacatgatattgctatacatgaccttttaaactctatgtagaaagtcaatagca 34554365  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||   ||||||| ||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  34554364 tctggtgctaggaagccgaatgtgtcaaaagtaaatggtataaaaacatcttgatta----tcagaacacgctttctcatgtttggtcgttttgcttgac 34554269  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| |||||||   || ||| |||||  ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||| |    
T  34554268 gcaacttttagtgttgtctgacctactttaaaagccctgatccctaatcccacaattggtgaaaccccaatcaaatccacatatgcttgttttcctccta 34554169  T
Q  334 accatctgtacaccat 349  Q
     | ||||||| |||||    
T  34554168 tctatctgtaaaccat 34554153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 349
Target Start/End: Original strand, 34415408 - 34415667
Alignment:
Q  86 acattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgtt 185  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||  | | || || |||||| || |||||||||||| | ||    |||||||||||      
T  34415408 acattgctatgcatgaccatttgaactctatatagaaggtcaactgcatttggtgttaggaaacctaaagtgtcaaaaacaaatggcataaaagcatg-- 34415505  T
Q  186 gattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaaccca 285  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |    
T  34415506 --ttgattgtcagaacacactttctcatgtttcgccattttgcttgacgcagcttgtaaggatgcctatcctaccgtaaaagtcctgacccctaatccaa 34415603  T
Q  286 caagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccat 349  Q
    |  |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||| | |||||  ||||||||    
T  34415604 cgtgtggtgaaaccccaatcaagttcacaaatgtatgttttcctcctacccatccatacaccat 34415667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 28625856 - 28626070
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| || |||| |  |||||| ||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||     
T  28625856 caaaatcaatctccgtaaacacaacattcatagacctatgagatatgacat-gttatgcatgaccttttgaactttatgtagaagctcaacaacctctgg 28625954  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    |||||||||   |||||||| |||| | ||   |||||||  |   || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  28625955 tgctaggaaattgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaaaaaa--tg-ttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttagccaccttacttgacgcagc 28626051  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcct 257  Q
    ||| ||| |||||| ||||    
T  28626052 tttaagggctgcctatcct 28626070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Original strand, 32115643 - 32115734
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaaca 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||    
T  32115643 caaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctttgtagaaggtcaaca 32115734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20693610 - 20693419
Alignment:
Q  215 tttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccaca 314  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| | |||||| | |  ||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||   |||||| ||||    
T  20693610 tttggccactttgtttgatgcaacctttagggccgtatgttctactgtaaaagctcagacctctaatcccacgagtggtgaaaccctgatcaagttcaca 20693511  T
Q  315 catgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcaca 407  Q
     | |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||| ||| |||| | ||| ||| ||||||||||    
T  20693510 ta-gcatgttttcctcctacccatctgtacaccataatatctgcaggcctaagtgtggatcttttatctagttggtcaatcaaaaagttcaca 20693419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 327
Target Start/End: Original strand, 24016318 - 24016545
Alignment:
Q  95 tgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattg 194  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||| || ||| | |||| ||| ||   ||||||| |||||||||||        
T  24016318 tgcatgaccctttgaactctatgtaaaaaatcaacaacatctggtgctaggaaaccaaaactatcaatagcaaatggtataaaaacatgttgattg---- 24016413  T
Q  195 tcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtg 294  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | |  || ||||| ||| |||||| |  || ||||| | ||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  24016414 tgagaacaagctttctcatgtttgactattttacttgatgcaacttttacggttgtctgtcttccca-aaaagccccgactcctaatcccacaagtgggg 24016512  T
Q  295 aaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
    |||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  24016513 aaactccggtcaaattcacacatgcatgttttc 24016545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Original strand, 34168949 - 34169022
Alignment:
Q  199 aacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccg 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  34168949 aacatgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaaattttagggttgcatgtcctacggtaaaagccccg 34169022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3137434 - 3137362
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctt 106  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  3137434 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctt 3137362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13398369 - 13398213
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| | | | ||||||| | | ||||||  |||||| | | |||| | ||||||||||| |||||||||     
T  13398369 gatgacaaaatcaaccatcgtaaacacaacatttatgcatctagaagtcgtgacattgttatgcatcatcttttgaactctatgtagaatgtcaacaact 13398270  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    ||||||| ||||||| | ||| | |||||||  || | |||||||  ||||||||||    
T  13398269 tctgatgttaggaagtcaaaaatatcaaaagtaaatagtataaaaatatgttgattg 13398213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26225766 - 26225638
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||  || |  ||||| | |||||| | ||||||| ||||| |||||||     
T  26225766 gatgacaaaaccaatcctcataaacacaaaatccatcgacctagaagacataatgtttctctgcatgagcctttgaactctatgttgaaggccaacaaca 26225667  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaa 162  Q
    |||  |||||| ||||| ||| |||||||    
T  26225666 tctagtgctagaaagccaaaaatgtcaaa 26225638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Original strand, 39434587 - 39434969
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||    
T  39434587 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggatctaagagacattacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaaatgcc 39434686  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||   ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39434687 tctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 39434782  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| |||||||  || |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39434783 gcaacttttagagcttcctgtcctactgtaaaagcctccacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtacacacatgcatgttttcctccaa 39434882  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39434883 cccatccgtacaccataacatcgacagacctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggcgcctccttct 39434969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 357
Target Start/End: Original strand, 3187866 - 3188208
Alignment:
Q  10 aagctgcaccgttagacnnnnnnngatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttgg 109  Q
    |||||||||||||||||       |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3187866 aagctgcaccgttagacctttttggatggcaaaaccaattctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttg- 3187964  T
Q  110 aatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttc 209  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |    
T  3187965 actctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtttcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaacacgcttcc 3188060  T
Q  210 tcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttag-gactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaag 308  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3188061 tcatgttttgccactttgcttgatgcaacttttagaggcttcctgtcctaccgtaaaagccccgaccc-taaacccacaagtggtgaaaccccacacaag 3188159  T
Q  309 tccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccg 357  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3188160 gccacacatgcatgttttcctccaatccatccgtacaccataacatccg 3188208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 38815220 - 38815478
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  38815220 aaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaccctctggt 38815319  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagct 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||    
T  38815320 gctaggaagcggaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgtttggcgtggct 38815415  T
Q  240 tttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaacccca 302  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38815416 tttagggctgtctgtcctaccataaaagccccgacccctaatcccacaagtggtgatacccca 38815478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 417
Target Start/End: Original strand, 24124967 - 24125327
Alignment:
Q  53 gtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccga 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | |    
T  24124967 gtaaacacaacattcatggacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactttatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaatcaa 24125066  T
Q  153 aagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcct 252  Q
    || |||||||||| ||   ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |    
T  24125067 aattgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagagcacgctttctcatgtttggccattttgcttgatgcagcttttagggctgctt 24125162  T
Q  253 gtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataac 352  Q
    |||| |||||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||||    
T  24125163 gtcccaccgtaaaaggcacgacgcataatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcttcctacccgtcagtagaccataac 24125262  T
Q  353 atccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctcct 417  Q
    ||  ||| |||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  24125263 atatgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttgacagacgcctcct 24125327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 35740148 - 35739792
Alignment:
Q  59 acaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgt 158  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||  |||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  35740148 acaacatttacaaacctaggggacatgacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaactgaaagtgt 35740049  T
Q  159 caaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtccta 258  Q
    ||||||| ||   ||||||| |||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||  || ||||||||    
T  35740048 caaaagctaattgtataaaaacatgttgattg----tcagaacccgctttctcatgtttggccactttgcttaacacaacttttagggatgtctgtccta 35739953  T
Q  259 ccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgc 358  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||   |||||||||||||| ||    
T  35739952 ccgtaaaaggcccgacct-taatcccactagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctcctacccattcatacaccataacatctgc 35739854  T
Q  359 atgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||||||||  ||||||||   | | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35739853 atgcctaagtgttgatcttctaccaaatgggtcagtcagaaagttcacaggcacctccttct 35739792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25022001 - 25021619
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||   ||||| |||||||| | | | ||| || |||||||||||    
T  25022001 gatgataaaatcaatcattgtaaacacaacattcctggacctaggagatatgacattgttgtgcatgaccctttgaactttgtgtggatggtcaacaacc 25021902  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||   ||||||| ||||    |||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  25021901 tctggtgctaggaagccaaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaacatg----ttgattgtgagaacacactttctcatatttcaccactttgcttgac 25021806  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
     || |||||||| |||  |||| ||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25021805 acaacttttagggctgtatgtcatactgtaaaaacatcgacccctaatcccacaagtggtgaaactccggtcaagtccacacatgcatgttttcctccta 25021706  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| | |||| ||  ||||||||| || | |||||||    
T  25021705 cccatccgtacaccataacatctgcaggcctaagtgacgatcttctatctagtgggtcagacaagaagttcacatgcgcttccttct 25021619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 386
Target Start/End: Original strand, 500208 - 500495
Alignment:
Q  94 atgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgatt 193  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||  ||   ||||||||||||||||    ||    
T  500208 atgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaaca-cctctcatactaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttga----tt 500302  T
Q  194 gtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  500303 gtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttagggctgtcggtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccacaagtggt 500402  T
Q  294 gaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||| | | | |||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||    
T  500403 gaaacctcactcaagtctacacatgcatgttttccttctacccatccatacaacataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagt 500495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 6592496 - 6592760
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||   |||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  6592496 gatgacaaaaccaatactcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattat-atgcatgaccttttgaactctatgcagaaggtcaacaacc 6592594  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||   | ||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6592595 tctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatg----ttgattgtgagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 6592690  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagt 304  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  6592691 gcagcttttacgactgtctatcctatcgtaaaag-gccgacacctaatcccacaaacggtgaaaacccagt 6592760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 354
Target Start/End: Original strand, 37517164 - 37517330
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  || || ||||| || |||    
T  37517164 ttgattgtcggaacaccctttctcatgtttggccactttgcttgatgcagcttttagagctgtctgtcctacggtaaaaggtcctacgcctaatccaaca 37517263  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacat 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||  || | ||||| ||||||||| ||||    
T  37517264 agtggcgaaaccccagtcaagtctacacaaacatattttccacctacccatccgtacaccatcacat 37517330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 8619812 - 8620013
Alignment:
Q  112 tctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctc 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| |||| | ||   |||||||||| |    |||||||||| || ||||||| ||    
T  8619812 tctatgtcgaaagtcaacaacctctggtgttagaaagccaaaaatgttaaaaacaaatggtataaaagcacg----ttgattgtcaaaatacgctttttc 8619907  T
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtcc 311  Q
    ||||||| |||  || ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8619908 atgtttgaccattttacttgacgcaacttttagggctgtctgttctatcgtaaaagtcacgatctctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagttc 8620007  T
Q  312 acacat 317  Q
    ||||||    
T  8620008 acacat 8620013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 42922206 - 42921966
Alignment:
Q  142 taggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttt 241  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||  || ||||||||| |||||||    ||| |||||| |||||||  |||| |||  ||| |||||||| ||||    
T  42922206 taggaagccaaaagtgtcaaaggcaaatgatttaaaagcattttgattg----tcaaaacacgttttctcaaatttgaccattttgtttgacgcaacttt 42922111  T
Q  242 taggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctg 341  Q
    || | |||| |||| |||| ||||||| | ||||  ||| | |||   || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||    
T  42922110 tatggctgcatgtcttaccataaaagctctgaccattaatctcacgtttgatgaaactccagtcaagtccacacatgtttgttttcctcctacccatctg 42922011  T
Q  342 tacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagt 386  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  42922010 tacaccataacatctacatacgtaagtgtcaatcttctatatagt 42921966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Original strand, 3821153 - 3821270
Alignment:
Q  43 atcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgct 142  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3821153 atcaatcctcgtaaacataacatttatgaacctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggttct 3821252  T
Q  143 aggaagccgaaagtgtca 160  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  3821253 aggatgccaaaagtgtca 3821270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 314
Target Start/End: Original strand, 4699810 - 4700064
Alignment:
Q  53 gtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccga 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||| ||| |||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |    
T  4699810 gtaaacacaacattcatggacctaggtgacataatattgctattcatgacc-tttgaactttatatagaaggtcaacagcctctggtgctatgaagccaa 4699908  T
Q  153 aagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcct 252  Q
    |||||| || | | ||   | ||||| |||||| ||||    | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  || ||    
T  4699909 aagtgttaaca-caaatggtgtaaaaacatgttaattg----tgagaacacgctta-tcatgtttggccactttgcttgacacaactttgagggttgtct 4700002  T
Q  253 gtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccaca 314  Q
     ||| |  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4700003 atccgattgtaaaagccgcgatccttaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaaatccaca 4700064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 420
Target Start/End: Original strand, 10189568 - 10189845
Alignment:
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc 238  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || ||  |||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||  ||| |||| |    
T  10189568 tgctaggaagccaaaaatgtcaaatgcaaatgatataaaaacatgttga----ttgtcagaacatgctttctcttgtttgactactttaattggcgcaac 10189663  T
Q  239 ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccat 338  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||   |||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  10189664 ttttaggaatgtatgtcctaccataaaagccttaacccctaatctcacaagcggtgaaatcccaatcaagtccacacatacatgttttcctcctaccaat 10189763  T
Q  339 ctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    | ||| | ||||||||  ||| ||| |  | |||||||||||| ||||   ||||| | |||| ||||| |||| |||||||    
T  10189764 ccgtaaaacataacatttgcaagcccatatttcaatcttctatctagtgagtcagttagaaagatcacatgcccatccttct 10189845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Original strand, 37514150 - 37514297
Alignment:
Q  43 atcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgct 142  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| |||||||  |||| ||||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  37514150 atcaatcctcgtgaatacaacattcatggacctaagagacgtaacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggcgct 37514249  T
Q  143 aggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    |||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||    
T  37514250 aggaaattgaaagtgtcaaaagcaaatagtataaacgcatgttgattg 37514297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 117
Target Start/End: Original strand, 42659147 - 42659230
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatg 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  42659147 gatgacaaaattaatcctcgtaaacacaacattcatgaacctagaagacataatattgctatgcataaccctttagactctatg 42659230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22589523 - 22589395
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||||||| || ||||||| ||    
T  22589523 gatggcaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatagacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgta-aaagtcaacagcc 22589425  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaa 163  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22589424 tctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaa 22589395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 8882396 - 8882452
Alignment:
Q  187 attgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagctttta 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8882396 attgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaggtttta 8882452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 327
Target Start/End: Original strand, 4073454 - 4073741
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||| |||||| || | |||   ||| ||||||||||||||||||    
T  4073454 gatgataaaatcaattctcgtaaacacaacattcacggatcttggaaacatgacattgctatgcatgactcattgatttctctgtagaaggtcaacaacc 4073553  T
Q  134 tctgatgctaggaa-gccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttga 232  Q
    |||| | |||  || | | ||||||||||| || ||   ||||||| ||||||||||| |    | |||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  4073554 tctggtactaaaaatggcaaaagtgtcaaatgcaaattgtataaaatcatgttgattggt----aaaacacgttttctcttgtttgaccactttgtttga 4073649  T
Q  233 cgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
     ||| ||||||||  || |||| | |||||||||||   || |||||| |  ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  4073650 tgcaacttttagggttgtctgttccaccgtaaaagcatgga-ccctaatcttacaagtggtgaa--cccagtcaagaccacacaagcatgctttc 4073741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9259479 - 9259377
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | | || ||||||| |||||| |  || || | ||||||||||||||||||||||    
T  9259479 gatgacaaaatcaatcttcgtaaatacaacattcatggacttaggatatatgacattgctatgcatgagtctgtgaactctatgtagaaggtcaacaacc 9259380  T
Q  134 tct 136  Q
    |||    
T  9259379 tct 9259377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 28196112 - 28196323
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| |  ||| |||| |||||| ||||||   ||||| | |||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  28196112 gatgacaaaatcaattcccgtaaacacaacatccgtggatctaggagacatgacattgttgtgcatgatcctttgaactctacgtagatggtcaacaacc 28196211  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||| | ||   ||||||| ||||    || ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | || |||||     
T  28196212 tatggtgctaggaagacaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatg----tttattatcataacacactttctcatgtttagccgctttacttgat 28196307  T
Q  234 gcagcttttaggactg 249  Q
    |||| |||||||||||    
T  28196308 gcagtttttaggactg 28196323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 217
Target Start/End: Original strand, 6618205 - 6618383
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||   |||||| ||| |||| |  ||||| | ||||||||||| |    
T  6618205 gatgacaaaaccaatactcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacattat-atgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatc 6618303  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgttt 217  Q
    ||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||   | ||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6618304 tctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatg----ttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 6618383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Original strand, 3863236 - 3863363
Alignment:
Q  36 tgacaaaatcaatcttcgtaaacacaaca---ttcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaac 132  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||  ||| ||| | | || ||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  3863236 tgacaatatcaatcctcgtaaacacaacaatattcatagacttaggaaagatgacattgctatgcactaccctttgaactctatgtagaaggtcaataac 3863335  T
Q  133 ctctgatgctaggaagccgaaagtgtca 160  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  3863336 ctctggtcctaggaagccaaaagtgtca 3863363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 165
Target Start/End: Original strand, 43823927 - 43824040
Alignment:
Q  52 cgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccg 151  Q
    ||||||||||||||| | ||| || | |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||||||  |||||||| | ||||| |||| ||||||||     
T  43823927 cgtaaacacaacattaatggatctcggagacatgacattgctatgcatgaccatttgaactctatgtgaaaggtcaatagcctctaatgcaaggaagcca 43824026  T
Q  152 aaagtgtcaaaagc 165  Q
    ||||||||||||||    
T  43824027 aaagtgtcaaaagc 43824040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11611275 - 11611146
Alignment:
Q  194 gtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggt 293  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||||||  || || || || |||||||||||  |    ||| ||||| ||||||    
T  11611275 gtcagaacatgctttctcatatttggccactttatttgacacaacttttagggatgtctatcttatcgtaaaagccctca----taatcccacgagtggt 11611180  T
Q  294 gaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11611179 gaaacccctgtgaagtccacacatgcatgttttc 11611146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 121903 - 121766
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||  |||||| | | |||  | | | ||||||| |||||||| ||||||    
T  121903 caaaatcaatcctcgtaaacacaacatccatggacttagatgacatgacattgatatgcatgatcttttaaactttgtgtagaatgtcaacaatctctga 121804  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataa 176  Q
     |||||||||   ||||| |||||||| || |||||||    
T  121803 ggctaggaagttaaaagtttcaaaagcaaataatataa 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Original strand, 8115738 - 8116019
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| |||| |   | |||| ||||||| |||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8115738 aaaatcaatcatcataaacataacattcatggactttataaacatgacattgcaatgcatgatcctttgaactttatgtagaaggtcaacaacctctcat 8115837  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagct 239  Q
      ||  || || ||||||||||| || ||   |||||||| ||    ||||||| | |||||| | ||||| | ||||| ||||  || |||||  | ||    
T  8115838 -ttaaaaaaccaaaagtgtcaaatgcaaatggtataaaagtat----attgattattagaacaagatttcttacgtttgaccactctgattgacataact 8115932  T
Q  240 tttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||  |  ||||  ||| || |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  8115933 tttaggactgcttgttctaccgaaaaaatcatgaccattaatcctacaagtggtgaaaccttagtcaagttcacaaatgcatgtttt 8116019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 18804533 - 18804645
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||  | |||||| || ||| ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18804533 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacaaaacactct-gaacctaggagtcatgacattgttatgcatgaccttttgaaatctatgtagaaggtcaacagcc 18804631  T
Q  134 tctgatgctaggaa 147  Q
    |||| |||||||||    
T  18804632 tctggtgctaggaa 18804645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39671159 - 39671036
Alignment:
Q  252 tgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataa 351  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| || | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||  ||||| |||    
T  39671159 tgtcctaccgtaaaagcctcaatccccaatctcacaaatggtgaaactc-agtcaagtccacacatgcatatttttctcctacccatctagacaccgtaa 39671061  T
Q  352 catccgcatgcctaagtgtcaatct 376  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||    
T  39671060 catccgcagacctaaatgtcgatct 39671036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22589387 - 22589336
Alignment:
Q  192 ttgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagctttta 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  22589387 ttgtcagaacacgctttctcatgttcagccattttgcttgacgcagctttta 22589336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Original strand, 3825567 - 3825681
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||  | |||| || |||| |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  3825567 aatcatcgtaaacacaatattcatggatctatgaaacatgacgttgctatgcattactctttgaattctgtgtagaaggtcaacaacctatggttctagg 3825666  T
Q  146 aagccgaaagtgtca 160  Q
    ||||| || ||||||    
T  3825667 aagccaaaggtgtca 3825681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 354
Target Start/End: Original strand, 8390234 - 8390376
Alignment:
Q  212 atgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtcc 311  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||  |||||||  || ||| |||| | ||||||||  |||| |||||||||| |||| | ||| || |||||||| |    
T  8390234 atgtttggtcactttgttttacgcaatttttagggttgtctgccctatcataaaagccatgaccgctaaacccacgagtgataaaatcctagtcaagttc 8390333  T
Q  312 acacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacat 354  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||| | |||||||    
T  8390334 acacatgcatgtttttctcctacccatctgtactctataacat 8390376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8540567 - 8540436
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctat---gtagaaggtcaaca 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |  ||||| |||| ||||||  | |||| |||||||| | | |||   |||||| |||||||    
T  8540567 gatgataaaatcaatcatcgtaaacacaacatttatgaaaatagaaaacatgacattgttaagcatgaccctttgaactttattatgtagaaagtcaaca 8540468  T
Q  131 acctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaa 162  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  8540467 acctctgatgttagaaagttgaaagtgtcaaa 8540436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Original strand, 6792257 - 6792323
Alignment:
Q  199 aacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  6792257 aacacgttttctcatgtttggccactctgtttgacgtagcttttacgactgtctatccaaccgtaaa 6792323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Original strand, 8882264 - 8882314
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacat 84  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8882264 gatggcaaaattaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacat 8882314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 99
Target Start/End: Original strand, 24451051 - 24451105
Alignment:
Q  45 caatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcat 99  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24451051 caatcatcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcat 24451105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39671332 - 39671230
Alignment:
Q  61 aacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtca 160  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| |||||   || ||| |||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  39671332 aacattcatggatctaggagacatgacatttttattcatgacccttttaactctacgtaaaaggttaacaacctctggtgctaggaagccgaaaatgtaa 39671233  T
Q  161 aaa 163  Q
    |||    
T  39671232 aaa 39671230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40223530 - 40223477
Alignment:
Q  94 atgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaa 147  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40223530 atgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctccggtgctaggaa 40223477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 39583416 - 39583034
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  39583416 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacgacattcatgaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgcagaaggtcaacaacc 39583317  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39583316 tatgatgctaggaaaccgaaagtgtcgaaaacaaatgatataaaagcatgttgattg----tcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 39583221  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  39583220 gcagcttttagggctgcctatcctaccataaatggcccgacccttaatcccacaagtggtaaaacctaagtcaagtccacgcatgcatgttttcctccta 39583121  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||  | |||||||||    
T  39583120 cccatccgtacactataacatccgcatgcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcaatcagaaagttcacatacgcctccttct 39583034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 370
Target Start/End: Original strand, 53785629 - 53785961
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53785629 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacataacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 53785728  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  53785729 tctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttga----ttgtcagaacacgctttctcgtgtttggccaccttacttgac 53785824  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  53785825 gcggctttaagggctgcctatcctacggtaaaaggcccgacacctaatcccactagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctccta 53785924  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgt 370  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  53785925 cccatccgtacaccaaaacatccgcatgcctgagtgt 53785961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Original strand, 44198687 - 44199069
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||    
T  44198687 gatggcaaaatcaattatcgcaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcataaccttctgaactctatgtagaaggtcaacagcc 44198786  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    || | || || ||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44198787 tcgggtgttaagaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattc----tcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 44198882  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    ||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||  || |    
T  44198883 gcaacttttagagctgcctgacctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacactaacatgttttccaccta 44198982  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
      ||||  ||||||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44198983 ctcatccatacaccataatgtccacaagcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcacgaagttcacaggcacctccttct 44199069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 354
Target Start/End: Original strand, 7900797 - 7901094
Alignment:
Q  53 gtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccga 152  Q
    ||||||| || ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7900797 gtaaacaaaatattgatggacctaggaaacataacattgctatgtataatccttcaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccga 7900896  T
Q  153 aagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcct 252  Q
    ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||  |  |     
T  7900897 aagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattg----tcagaaaacgctttctcatgttcggctattttgcttgacgcagtttttagggatatcc 7900992  T
Q  253 gtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataac 352  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||    
T  7900993 gtcctaccgtaaaagacccaacccctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctcctacacatctatacaccataac 7901092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 52741659 - 52741316
Alignment:
Q  74 ctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaata 173  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||   ||    
T  52741659 ctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggta 52741560  T
Q  174 taaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagc-ttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccg 272  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||  ||     
T  52741559 taaaagcatgttg----attgtcagaacacgctttctcatgtttggtcaatttgtttgactcagctttttagggctgcctgtcctacaataaaaggtcct 52741464  T
Q  273 acccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtca 372  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||| ||| |||| |||||| ||| | || |||||      
T  52741463 acatctaatcccacaagtggtgaaacctcagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccgtataccacaacatctgcaagtctgagtgttg 52741364  T
Q  373 atcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
    ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||  | |||||||||    
T  52741363 atcttctatctagtgggtcagtcaggaagttcacatacgcctccttct 52741316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 26772678 - 26772911
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  ||    
T  26772678 gatggcaaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataatcctttgtactctatatagaaggtcaactgcc 26772777  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26772778 tctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgttttctgatgtttggccactttgcttgac 26772873  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagcccc 271  Q
     || ||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||    
T  26772874 acaacttttagggatgcatgtcctactgtaaatgcccc 26772911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 327
Target Start/End: Original strand, 38145976 - 38146265
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||| |||||| || |||||||    
T  38145976 gatgacaaaatcaatcatcgtaaacacaacgttcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctaagtagaatgtaaacaacc 38146075  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| |  ||   ||||||| ||||    |||||||||| |||||| | ||||  ||||| |||| ||| ||||     
T  38146076 tctggtgctaggaagtcaaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcaaaacacgttgtctcgcgtttgaccactttgattgat 38146171  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  38146172 gccgcttttagggctgcatgtcctaccctcaaagctccgacccctaatcccacaagtcgtgaaaccccatgcaagtcctcacatgcatattttc 38146265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 406
Target Start/End: Original strand, 49017887 - 49018251
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    |||| |||||   |||||| ||| |||| | | || ||||||| |||||||||    
T  49017887 gatggcaaaatcaatcctcataaacacaacattcattgaccta----acatgacatttatatgcatgaccttttgaactttacgtagaagatcaacaacc 49017982  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    || | ||||||||| |||||||||| ||||   ||   ||||||| ||||||||||| |    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  49017983 tcgggtgctaggaaaccgaaagtgtaaaaaaaaaatggtataaaaacatgttgattgtt----agaacacactttctcatgtttggtcactttgttttac 49018078  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
    | | |||| |||  ||| |||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||  |    
T  49018079 gtaactttcagggttgcttgtcctaccgtaaaaggctcgacacctaattccacaagtggtgaaactccagtcaagtttacacatgcatgttttcctcgta 49018178  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcac 406  Q
     | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||||||    
T  49018179 ccaatccgtacaccataacatctgcatgcctgagtgttaatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttcac 49018251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 350
Target Start/End: Original strand, 13582437 - 13582741
Alignment:
Q  41 aaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||    || ||    
T  13582437 aaatcaatcttcgtaaacacaacattcatggtcctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctctgtagaaggtcaacaattgttggtg 13582536  T
Q  141 ctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagctt 240  Q
    |||||||  | ||||||| |||| | ||   ||||||| || |||||    |||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  13582537 ctaggaaatcaaaagtgtaaaaa-caaatggtataaaaacacgttga----ttgtcagaacacactttcttatgtttgatcactttgattgacgcagctt 13582631  T
Q  241 ttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatct 340  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||     
T  13582632 ttagggctgcttgtcctacggtaaaaggcctgacacctaatcccacaagtgttgaaacctcggtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatcc 13582731  T
Q  341 gtacaccata 350  Q
     |||||||||    
T  13582732 atacaccata 13582741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38671067 - 38670887
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |  ||    
T  38671067 gatggcaaaaccaatcctcgtacacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcataactctttagactctatgtagaaggtcatccgcc 38670968  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 218  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||   ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38670967 tctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaaacaaattgtataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 38670887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37133166 - 37132898
Alignment:
Q  54 taaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaa 153  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||| ||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  37133166 taaacacaacattcattaacttaggagacatgacattgctatgcatgacctttagaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaa 37133067  T
Q  154 agtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctg 253  Q
    ||||| |||| | ||   ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  37133066 agtgtaaaaaacaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttaaccactttgcttgacgtagcttttagggctgtctg 37132971  T
Q  254 tcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    | || |  ||||||  | ||| | ||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  37132970 ttctccgataaaaggtctgacacttaatcccacaggtggtaaaacctcaatcatgtctacacatgcatgtttt 37132898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 326
Target Start/End: Original strand, 5338566 - 5338855
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||  |||||  ||||||| | |||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||| |    
T  5338566 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattc---gacctatgagacaagacattgctacgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaacaatc 5338662  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| || |   |  ||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  5338663 tctagtgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagcatgttgactg-tcaacgcaacgcactttctcatgtttggcaattttgtttgac 5338761  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagc-cccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||| |   | |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  5338762 gcaactcttagggctttctgtcctaccgtaaaagctctaaatccctaatcccacaagtggtgtaacccaaatcaagtccacagatgcatgtttt 5338855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54508571 - 54508229
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||| || | ||||  | |||| | |||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  54508571 gatgacaaaaccaattatcttaaacacaacattcatggacctagcagatatgatattgttacgcatgatcctttgtaccttatgcagaaggtcaacaacc 54508472  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgcttt-ctcatgtttggccacattgcttga 232  Q
    |||| |||||| ||  | ||| |||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||    |||||||| | ||| ||||||||| ||||  ||| ||||    
T  54508471 tctggtgctagaaaatcaaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaaacatgttaattg----tcagaacaagtttttctcatgtttagccattttgtttga 54508376  T
Q  233 cgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtcca 332  Q
    |||| ||||  || |||| |||| ||  ||||||  || ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |     
T  54508375 cgcaactttatgg-ctgcttgtcttattgtaaaaatcctgacacctaatccaacaagtggtgaaaccccaatcaagtacacacatgcatgttttc-ttct 54508278  T
Q  333 aaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  54508277 acccatccgtacaccataacatccgcatgccgaaatgtcaaccttctat 54508229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3443499 - 3443257
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||  ||||| | | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3443499 gatggcaaaaccaatcatcgtaaacacaacattcatagatttaggagacaagacattcctacgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 3443400  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  ||||||||| | ||||||||||| ||  ||   ||||||||||||||||||| |    |||| || |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  3443399 tctagtgctaggaaactgaaagtgtcaacagaaaatggtataaaagcatgttgattgtt----agaatacactttttcatgtttggccattttgcttgac 3443304  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaa 280  Q
    ||| |||||||||||  |||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  3443303 gcaacttttaggactctctgtcctatcgtaaaagtcctgacacctaa 3443257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Original strand, 32546715 - 32546900
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||  |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  32546715 gatggcaaaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattactatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcc 32546814  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 223  Q
    | || ||||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32546815 tttggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatg----ttgattgtccgaacacgctttctcatgtttggccac 32546900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 46940956 - 46940669
Alignment:
Q  38 acaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaag---gtcaacaacct 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  || ||| ||||||   ||||| | |||||| | ||||||||||||   ||||| |  ||    
T  46940956 acaaaatcaattttcgtaaacacaacattcatgaacctatgagtcatgacattgtcgtgcatgatcctttgaactctatgtagaagctggtcaatagtct 46940857  T
Q  135 ctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacg 234  Q
     || |||||||| | | |||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||    || ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46940856 atggtgctaggacgtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattg----tcggaacatgttttctaatgtttggccactttgcttgacg 46940761  T
Q  235 cagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    || |||||||   || |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46940760 catcttttagagttgtctgtcctaccataaaatcctcgacccctaatcccacgagtaatgaaacctcagtcaagttcacacatacatgtttt 46940669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 418
Target Start/End: Original strand, 37992253 - 37992632
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||  || ||| ||||| |  ||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  37992253 gatgataaaaccaatcttcgaaaacacaacattcatgcacgtacgagtcatgacattactgtgcatgaccctt-gaactctttgtagaaggtcaacaacc 37992351  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||  ||||| |||||| |||   |||||||  ||  |||||||| ||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  37992352 tctagtgctatgaagccaaaaccatcaaaagtaaatgatataaaatcatg----ttgattgtcagaacatgcttcctcatgtttggtcactttgtttgac 37992447  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaa 333  Q
     || |||  ||| ||   |||||||||||||||  | ||||| |||| | ||  |||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  37992448 acaacttgcagggctatatgtcctaccgtaaaaatctcgacctctaatctcatgagtgatgaaaccccgatcaagtccacacacacatgttttcctccta 37992547  T
Q  334 accatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctcctt 418  Q
     ||||| ||||| |||||||||  ||  |||||||||| |||||||||  ||| | ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  37992548 cccatccgtacatcataacatctacagacctaagtgtccatcttctatcaagtgggtcagtgagaaagttcacatgaccctcctt 37992632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 318
Target Start/End: Original strand, 51234581 - 51234803
Alignment:
Q  79 agacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaa 178  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||   |||||||    
T  51234581 agacataacattgttatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagaaagtcgaaagtgtcaaaaataaatggtataaaa 51234680  T
Q  179 gcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccct 278  Q
    |||||    ||| |||||| |||| ||||| ||||||             ||||||||| |||||||  ||  ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  51234681 gcatg----ttggttgtcataacatgctttttcatgt-------------ttgacgcagtttttagggttgtttgtcctatcgtaaaagtctcgacccct 51234763  T
Q  279 aaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatg 318  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  51234764 aaacccacaagtggtgaaaccttaatcaagtccacacatg 51234803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 386
Target Start/End: Original strand, 29861949 - 29862065
Alignment:
Q  270 ccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtg 369  Q
    ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29861949 ccgacccctaatctaacaagtgtttaaaccccagtcaagttcacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataacatctgcatgcctaagtg 29862048  T
Q  370 tcaatcttctatttagt 386  Q
    || ||||||||| ||||    
T  29862049 tcgatcttctatctagt 29862065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 298
Target Start/End: Original strand, 4472982 - 4473241
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||| |||||| |  ||||| | | |||||||||||| || ||      
T  4472982 gatgacaaaaccaattctcgtaaacacaatattcatagacctaggagacatgaaattgctatgcatgattctttgaactttatgtagaaggttaagaat- 4473080  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||| |||    |||||| || |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  4473081 tctggtgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaacat----attgatggttagaacacgctttttcatgttttgacactttgcttgac 4473176  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaac 298  Q
    |||  ||||| | ||  |||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||| || ||||||    
T  4473177 gcaatttttaaggctctctgtcctaccgtaaaaaccccaaccactaattccacaaatgatgaaac 4473241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7502192 - 7501861
Alignment:
Q  39 caaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctga 138  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||  || ||| ||||||   ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||     
T  7502192 caaaatcaattatcgtaaacataatattcatggatctatgagtcatgacattgttgtgcatgacccttt--aaactctgtagaaggtcaacaacctctgg 7502095  T
Q  139 tgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaag-catgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcag 237  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||  ||   |||||||  ||||||||||| | |    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||  |     
T  7502094 tgctaggaaaccaaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaaacatgttgattgttcg----aacacgctttctcatgtttgaccactttacttgacaaaa 7501999  T
Q  238 -cttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaacc 336  Q
     |||||| |   || ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| | | | |     
T  7501998 acttttacggtagcttgtcctatcgtaacagccc-gacccctagacccacgagtggtgaaaccctggttaagtctacacatgcatgttttccttctacca 7501900  T
Q  337 atctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatc 375  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  7501899 atccgtataccataacatctgcaggcctaaatgttaatc 7501861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7257742 - 7257616
Alignment:
Q  35 atgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacct 134  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||| ||| ||||||| | | ||||||||| | |  |||| |    
T  7257742 atgacaaaactaatcttcgtaaacacaacattcatggacctagaatacatgatattgctatggatagccctttgaactatatgtagaatgac-gcaacat 7257644  T
Q  135 ctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaa 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7257643 ctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaa 7257616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26856943 - 26856793
Alignment:
Q  40 aaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgat 139  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||||   |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||  |    
T  26856943 aaaaccaatcctcgcaagcacaacattcataaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctagt 26856844  T
Q  140 gctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||  |   |||||||||||||||||||    
T  26856843 gctaggaaatcgaaagcgtcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattg 26856793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52412078 - 52411903
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||| ||| | ||  |||| |||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||     
T  52412078 gatggcaaaatcaatcattgtaaacacaatatttatgggtctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacgaca 52411979  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcat 213  Q
    |||  || ||| |||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  52411978 tctagtgttagaaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgctctctcat 52411903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 325
Target Start/End: Original strand, 35236316 - 35236413
Alignment:
Q  228 cttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttt 325  Q
    ||||||||| |||||||  || ||| ||||||| |||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35236316 cttgacgcaacttttagagctacctatcctaccataaaaggctcgatccctaatcccacaggtggtgaaacctcaatcaagtccacacatgcatgttt 35236413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 280
Target Start/End: Original strand, 25324949 - 25325193
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||  ||| | || | ||||||| |||||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |    
T  25324949 gatggcaaaagcaatcatcgtaagcacaatattcatggatttaggaaacttgacattgctatgcatgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaatc 25325048  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    | || |||||||||  |||||||||  ||||| ||   ||||||| ||| |   ||||||| || || ||| ||| | |||||| | ||| |||||||||    
T  25325049 tatggtgctaggaaatcgaaagtgttgaaagcaaatggtataaaaacatat--gttgattgccaaaatacgttttataatgttttgtcactttgcttgac 25325146  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaa 280  Q
    ||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  25325147 gcaacttttagaactacatgtcctaccataaaaggcccaacccctaa 25325193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4763967 - 4763888
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtc 126  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4763967 aatcctcgtaaacacaacattcatggacc-aggagacatgacattgctatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtc 4763888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 44781 - 44859
Alignment:
Q  59 acaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctg 137  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44781 acaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctg 44859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Original strand, 21552603 - 21552717
Alignment:
Q  53 gtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcg----atgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaag 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| || | ||| ||    |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  21552603 gtaaacacaacattcatggacctaggagatatgatattacgtactatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaaa 21552702  T
Q  149 ccgaaagtgtcaaaa 163  Q
    | |||| ||||||||    
T  21552703 ctgaaaatgtcaaaa 21552717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52411845 - 52411720
Alignment:
Q  282 cccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctat 381  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |||||| |||   ||||  | ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  52411845 cccacaagtggtaaaacctcagtcgagtccacatatgtaagttttcctcctgtccattcggacatcataacatctgcaggcctaagcgtcaatcttctat 52411746  T
Q  382 ttagtagatcagtcacaaagttcaca 407  Q
     |||| | ||||| | ||||||||||    
T  52411745 ctagtgggtcagttaaaaagttcaca 52411720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38978970 - 38978830
Alignment:
Q  50 ttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagc 149  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||  |||||| ||||||  |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |    
T  38978970 ttcgtaaacacaacattgataaacctatgagacatgacattgttatgcatcaccttttgaactatatgtagaaggtcaacggcctcaggtgctaggaaac 38978871  T
Q  150 cgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattg 190  Q
    | |||||||||||| | || | ||||||| ||| |||||||    
T  38978870 caaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaacatattgattg 38978830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25094747 - 25094632
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||| || ||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||| | | | || ||||||     
T  25094747 aatcttcgtgaacacaacattcatggacttaaaagatattacattgctatgcatgaccatttgaactatatgtagaaggtcaatatcttttggtgctaga 25094648  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaa 161  Q
    ||| | ||||||||||    
T  25094647 aagtcaaaagtgtcaa 25094632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4669846 - 4669793
Alignment:
Q  38 acaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  4669846 acaaaatcaatcatcgtaaacacaacattcatggaccaaggagacatgacattg 4669793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 42205987 - 42206116
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtc-aacaac 132  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||| | |||| ||||| | |||||| ||| |||  | ||||||||||| ||| ||  ||    
T  42205987 gatgataaaatcaatcatcgtaaacacaacgtttatggatctaggatacattacatttctatgcatgaccatttaaactctatgtagaatgtcaaattac 42206086  T
Q  133 ctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaa 162  Q
    || ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  42206087 ctttgatgctagaaagtcaaaagtgtcaaa 42206116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 46320097 - 46320049
Alignment:
Q  41 aaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacat 89  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  46320097 aaataaatcttcgtaaacacgacattcatggacctagaagtcatgacat 46320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 53502639 - 53502607
Alignment:
Q  36 tgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattca 68  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53502639 tgacaaaatcaattttcgtaaacacaacattca 53502607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 420
Target Start/End: Original strand, 33170 - 33552
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33170 gatgacaaaatcaatcctcgtaaacacgacgttcatggacctaggagacataaaattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacc 33269  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| || |||||| |||||| |||||||||  ||   ||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  33270 tctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaaacatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgat 33365  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgc--atgttttcgtcc 331  Q
    ||  |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||||||| |||    
T  33366 gccactttaagg-ttgcctgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccataagtggtgaaaccccaatcaagtttgcacatgcatatgttttcctcc 33464  T
Q  332 aaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcacaggcccctccttct 420  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33465 tacccatccgtacaccataacatccgcatgcctgagtgttgatcttctatctagtag-gcagtcaagaagttcacaggcgcctccttct 33552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 327
Target Start/End: Original strand, 6279 - 6542
Alignment:
Q  59 acaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgt 158  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  6279 acaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgaaagtgt 6378  T
Q  159 caaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtccta 258  Q
    ||||||| ||   |||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  6379 caaaagcaaatggtatagaagcatg----ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttacttgacgcaacttttagggctgtctgtccta 6474  T
Q  259 ccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttc 327  Q
    | |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6475 cggtaaaaggtccga-ccctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttc 6542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 2
Alignment:
Q  46 aatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagg 145  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  || |||| |||||| ||||||| ||| || ||  |||| | | |||| |||||||||||||||| || | ||||     
T  359 aatcctcgtaaacacaacgttcatcgatctaggagacatgacattgctatgtatgactttttgaactttatgcagaaggtcaacaacctttggtactaga 260  T
Q  146 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttagg 245  Q
    || || |||||||||||  | ||   ||||||||||||||||| |    ||| ||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  259 aaaccaaaagtgtcaaacacaaatggtataaaagcatgttgatgg----tcataacccactgtctcatgtttggccactttgcttgacgcagtttttagg 164  T
Q  246 actgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtaca 345  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  163 gctgcctgtcctacagtaaaaggcccgacacttaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctatacatgcatgttttcctcctacccatccgtaca 64  T
Q  346 ccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatcagtcacaaagttcaca 407  Q
     ||||||||||||  ||||  ||||  ||| ||||| |||| | |||||||  |||||||||    
T  63 tcataacatccgcgggcctgcgtgttgatcatctatctagtgggtcagtcaggaagttcaca 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 300
Target Start/End: Original strand, 10364 - 10546
Alignment:
Q  118 tagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgttt 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10364 tagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgcattatcatgttt 10463  T
Q  218 ggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccc 300  Q
    |||||  || ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10464 ggccattttacttgacgcaacttttagggctgcttgtccaactgtaaaagccccaacccctaatcccacgagtggtgaaaccc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 103026 - 103274
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||  |||||| ||| ||||   || |||||||||||||||| ||    
T  103026 gatggcaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacgacattgttatgcatgaccttttgagctcgatgtagaaggtcaacagcc 103125  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  103126 tctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg----ttgattgtcag-acacgctttctcgtgtttggccatcttacttgac 103220  T
Q  234 gcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  103221 gcagctttgagggctgcctgtcctacggtaaaaggcccgacaccttatcccaca 103274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47571 - 47369
Alignment:
Q  193 tgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtgg 292  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||    
T  47571 tgtcagaacacattttctcatgtttggccattttacttgacgcaacttttaggtttatttgtcctaccgtaaaagtctcaatccctaatcccacaagtgg 47472  T
Q  293 tgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttagtagatca 392  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||  |  ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  47471 tgaaaccccaatcaagtccacacttgcatttttttctcatactcatttgtacaccataacatttgcatccctaagtgttgatcttctatttagtggatga 47372  T
Q  393 gtc 395  Q
    |||    
T  47371 gtc 47369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18194
Alignment:
Q  86 acattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgtt 185  Q
    |||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||  | ||||||||||||||  |  | |||||| ||||      
T  18499 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatg-- 18402  T
Q  186 gattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaaccca 285  Q
      |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||  ||  ||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  18401 --ttgattgtgagaacacg-tttctcatgtttggccgctttgtttgatgcaacttttagggttgtttgtcctatcataaaagctccgacccgtaatccca 18305  T
Q  286 caagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtccaaaccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtcaatcttctatttag 385  Q
    | ||| |||||| | || ||||| |||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||  ||||| |||||||    
T  18304 cgagtagtgaaatctcaatcaagcccacacaaatatgttttcctcctacccatctgtacaccttaacatctgcaagcctaaatgttgatcttttatttag 18205  T
Q  386 tagatcagtca 396  Q
    | |||| ||||    
T  18204 tggatcggtca 18194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 217
Target Start/End: Original strand, 7523 - 7701
Alignment:
Q  34 gatgacaaaatcaatcttcgtaaacacaacattcacggacctagaagacataacattgcgatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaacc 133  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||   |||||| ||| |||| |  ||||| | ||||||||||| |    
T  7523 gatgacaaaaccaatactcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacattat-atgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatc 7621  T
Q  134 tctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgttt 217  Q
    ||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||   | ||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7622 tctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatg----ttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 326
Target Start/End: Original strand, 49442 - 49622
Alignment:
Q  145 gaagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttag 244  Q
    |||| |||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||| ||| |||||||    
T  49442 gaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcacgttgattg----tcagaacacgatttctcacatttgaccactttgtttgatgcaacttttag 49537  T
Q  245 gactgcctgtcctaccgtaaaagccc----cgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgtttt 326  Q
    | |||| ||||   | | |||||| |    |||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  49538 ggctgcttgtctagctgcaaaagctctgaccgacccctaatcccacaagtagtgaaactcaa-tcaagtccacacatgcatgtttt 49622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8553 - 8416
Alignment:
Q  188 ttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccaca 287  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||| |||| |||||||| | |  ||| ||||| || || ||||||||| | |  || || |||    
T  8553 ttgattgtcagaacatgttttctcatgttcaaccaaattgtttgaagcagctttgaaggttgcttgtcccacagtgaaagccccgtctctcaatcctaca 8454  T
Q  288 agtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttt 325  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8453 agtggggaaaccccagtccagtccaaacatgcatgttt 8416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 291
Target Start/End: Original strand, 16207 - 16307
Alignment:
Q  191 attgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagt 290  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||  |||| |||||| || ||||||    
T  16207 attgtcagaacatgttttctcatgtttggccattttgtttgacgcagcttttagcgttgtctgtcctactataaaagttccgatccctaatccaacaagt 16306  T
Q  291 g 291  Q
    |    
T  16307 g 16307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4366 - 4300
Alignment:
Q  199 aacacgctttctcatgtttggccacattgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctaccgtaaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  4366 aacacgttttctcatgtttggccactctgtttgacgtagcttttacgactgtctatccaaccgtaaa 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University