View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4987_high_14 (Length: 309)

Name: NF4987_high_14
Description: NF4987
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4987_high_14
NF4987_high_14
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (1-244)||(16753044-16753287)
chr6 (1-244)||(13295681-13295924)
chr6 (1-244)||(15421050-15421293)
chr6 (1-244)||(22931614-22931857)
chr6 (1-244)||(23854059-23854302)
chr6 (1-244)||(26921600-26921843)
chr6 (1-244)||(16677363-16677606)
chr6 (1-244)||(27022359-27022602)
chr6 (1-244)||(29552780-29553023)
chr6 (1-244)||(24866939-24867182)
chr6 (1-244)||(27179679-27179922)
chr6 (1-244)||(27269317-27269560)
chr6 (1-244)||(27626441-27626684)
chr6 (1-244)||(27287094-27287337)
chr6 (1-244)||(3699306-3699549)
chr6 (1-244)||(4760986-4761229)
chr6 (1-244)||(26113142-26113385)
chr6 (1-244)||(27010954-27011197)
chr6 (1-244)||(27060729-27060972)
chr6 (1-244)||(28210677-28210920)
chr6 (1-244)||(4542504-4542747)
chr6 (1-244)||(4720865-4721108)
chr6 (1-244)||(27488356-27488599)
chr6 (1-244)||(29504639-29504882)
chr6 (1-244)||(34461236-34461479)
chr6 (4-244)||(30554749-30554989)
chr6 (1-244)||(4528508-4528751)
chr6 (1-244)||(16940757-16941000)
chr6 (1-244)||(29576237-29576480)
chr6 (1-244)||(4776103-4776346)
chr6 (4-239)||(17089176-17089411)
chr6 (1-166)||(26992096-26992261)
chr6 (4-236)||(20171778-20172010)
chr6 (4-236)||(22163981-22164213)
chr6 (1-150)||(33373161-33373310)
chr6 (1-131)||(26775357-26775487)
chr6 (1-131)||(27358840-27358970)
chr6 (1-131)||(27449183-27449313)
chr6 (1-131)||(28163827-28163957)
chr6 (4-131)||(14142127-14142254)
chr6 (4-131)||(26789152-26789279)
chr6 (4-131)||(27197521-27197648)
chr6 (4-131)||(27251587-27251714)
chr6 (4-131)||(8902436-8902563)
chr6 (4-131)||(22455847-22455974)
chr6 (4-131)||(13520925-13521051)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-244)||(14560849-14561092)
chr8 (1-244)||(18712709-18712952)
chr8 (1-244)||(18793929-18794172)
chr8 (1-244)||(27605653-27605896)
chr8 (1-244)||(2134008-2134251)
chr8 (1-239)||(19691328-19691566)
chr8 (1-244)||(29832551-29832794)
chr8 (1-239)||(9357855-9358093)
chr8 (4-244)||(19205113-19205353)
chr8 (1-244)||(12089471-12089714)
chr8 (1-244)||(19677672-19677915)
chr8 (4-244)||(28358703-28358943)
chr8 (4-244)||(31357753-31357993)
chr8 (1-239)||(33261964-33262202)
chr8 (1-244)||(31486619-31486862)
chr8 (4-242)||(22077662-22077900)
chr8 (4-131)||(15770912-15771039)
chr8 (4-131)||(21344922-21345049)
chr8 (4-131)||(44564322-44564449)
chr8 (177-244)||(16286626-16286694)
chr8 (135-235)||(16768557-16768657)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-244)||(10913541-10913784)
chr7 (1-244)||(22145418-22145661)
chr7 (1-244)||(2106835-2107078)
chr7 (1-244)||(5144012-5144255)
chr7 (1-244)||(2157797-2158040)
chr7 (1-244)||(5131219-5131462)
chr7 (1-244)||(11421451-11421694)
chr7 (1-236)||(16515102-16515337)
chr7 (1-244)||(26534545-26534788)
chr7 (4-236)||(10844851-10845083)
chr7 (4-244)||(26271761-26272001)
chr7 (4-244)||(26316523-26316763)
chr7 (1-244)||(11444110-11444353)
chr7 (1-244)||(26438480-26438723)
chr7 (1-244)||(26516015-26516258)
chr7 (4-244)||(4141921-4142161)
chr7 (4-244)||(4202612-4202852)
chr7 (4-244)||(45390443-45390683)
chr7 (1-244)||(3448529-3448772)
chr7 (1-244)||(31561062-31561305)
chr7 (4-236)||(10842669-10842901)
chr7 (4-236)||(16044550-16044781)
chr7 (4-244)||(26666589-26666829)
chr7 (4-236)||(16446681-16446913)
chr7 (1-244)||(24589206-24589449)
chr7 (1-230)||(16748189-16748418)
chr7 (89-244)||(9621873-9622028)
chr7 (4-131)||(2776590-2776717)
chr7 (4-131)||(26512371-26512498)
chr7 (4-131)||(26681781-26681908)
chr7 (4-131)||(31127243-31127370)
chr7 (4-131)||(45734649-45734776)
chr7 (4-131)||(31087297-31087424)
chr7 (4-131)||(39209814-39209941)
chr7 (143-244)||(16287193-16287294)
chr7 (135-235)||(1893381-1893481)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-244)||(8299158-8299401)
chr3 (1-244)||(21677890-21678133)
chr3 (1-244)||(35883953-35884196)
chr3 (1-244)||(15737924-15738167)
chr3 (1-244)||(15889535-15889778)
chr3 (1-244)||(18054449-18054692)
chr3 (1-244)||(18273882-18274125)
chr3 (1-244)||(18289183-18289426)
chr3 (1-244)||(18304484-18304727)
chr3 (1-244)||(18333817-18334060)
chr3 (1-244)||(22384408-22384651)
chr3 (1-237)||(4793465-4793701)
chr3 (1-244)||(6205090-6205333)
chr3 (1-236)||(8286300-8286535)
chr3 (1-244)||(4686842-4687085)
chr3 (1-244)||(4724818-4725061)
chr3 (1-244)||(10399331-10399574)
chr3 (1-244)||(29145586-29145829)
chr3 (1-244)||(7076393-7076636)
chr3 (1-244)||(29661800-29662043)
chr3 (1-244)||(20069227-20069470)
chr3 (1-244)||(32442338-32442581)
chr3 (1-244)||(8214922-8215165)
chr3 (4-244)||(28112787-28113027)
chr3 (1-244)||(5470175-5470418)
chr3 (1-244)||(5593187-5593430)
chr3 (1-244)||(5606144-5606387)
chr3 (4-234)||(19697687-19697917)
chr3 (4-236)||(16621323-16621555)
chr3 (4-244)||(28342364-28342604)
chr3 (1-244)||(6539572-6539815)
chr3 (1-244)||(28024469-28024712)
chr3 (4-244)||(47026640-47026880)
chr3 (1-244)||(4343506-4343749)
chr3 (1-244)||(4420102-4420345)
chr3 (1-244)||(7999747-7999990)
chr3 (1-244)||(10646260-10646503)
chr3 (1-244)||(22867678-22867921)
chr3 (1-244)||(22882737-22882980)
chr3 (4-244)||(24331350-24331590)
chr3 (1-244)||(18245928-18246171)
chr3 (1-244)||(31961285-31961528)
chr3 (1-244)||(48469114-48469357)
chr3 (4-239)||(5016906-5017141)
chr3 (1-244)||(17981779-17982022)
chr3 (1-244)||(18228383-18228626)
chr3 (1-244)||(20573673-20573916)
chr3 (1-244)||(51785210-51785453)
chr3 (1-239)||(11107189-11107420)
chr3 (1-131)||(4627085-4627215)
chr3 (1-131)||(5714373-5714503)
chr3 (1-131)||(5725283-5725413)
chr3 (1-131)||(5766955-5767085)
chr3 (4-131)||(32293928-32294055)
chr3 (4-131)||(17992764-17992891)
chr3 (4-131)||(31033069-31033196)
chr3 (135-227)||(15918721-15918813)
chr3 (142-227)||(15592882-15592967)
chr3 (142-227)||(20443321-20443406)
chr3 (142-227)||(41440447-41440532)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-244)||(30519-30762)
scaffold0143 (4-236)||(19304-19536)
scaffold0143 (4-131)||(7299-7426)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (1-244)||(33295761-33296004)
chr5 (1-244)||(15655442-15655685)
chr5 (1-244)||(22995801-22996044)
chr5 (1-244)||(24684829-24685072)
chr5 (1-244)||(24973139-24973382)
chr5 (1-244)||(41677938-41678181)
chr5 (4-244)||(23629203-23629443)
chr5 (1-244)||(11552588-11552831)
chr5 (1-236)||(23895447-23895682)
chr5 (1-244)||(33780722-33780965)
chr5 (1-244)||(28652475-28652718)
chr5 (1-244)||(18497409-18497652)
chr5 (1-244)||(30937868-30938111)
chr5 (4-244)||(9320709-9320949)
chr5 (4-244)||(12135408-12135648)
chr5 (4-244)||(26483627-26483867)
chr5 (4-244)||(43081488-43081728)
chr5 (1-244)||(37355327-37355570)
chr5 (4-244)||(31434697-31434937)
chr5 (1-244)||(37668170-37668413)
chr5 (4-233)||(22891707-22891936)
chr5 (4-244)||(8662162-8662402)
chr5 (4-236)||(25203519-25203751)
chr5 (4-236)||(25267674-25267906)
chr5 (4-244)||(30032661-30032901)
chr5 (4-244)||(30155264-30155504)
chr5 (4-244)||(33519613-33519853)
chr5 (4-244)||(34619751-34619991)
chr5 (1-244)||(2514295-2514538)
chr5 (1-244)||(3792774-3793017)
chr5 (1-244)||(18372218-18372461)
chr5 (1-244)||(24586607-24586850)
chr5 (1-244)||(31823091-31823334)
chr5 (1-244)||(32592958-32593201)
chr5 (1-244)||(37758216-37758459)
chr5 (1-244)||(13321514-13321757)
chr5 (1-244)||(37767675-37767918)
chr5 (1-244)||(5641021-5641264)
chr5 (1-244)||(15755536-15755779)
chr5 (1-244)||(24727202-24727445)
chr5 (1-244)||(28956469-28956712)
chr5 (1-244)||(30171702-30171945)
chr5 (1-244)||(6877538-6877781)
chr5 (1-244)||(40470234-40470477)
chr5 (1-150)||(13183477-13183626)
chr5 (1-128)||(13439367-13439494)
chr5 (1-131)||(18125100-18125230)
chr5 (4-131)||(9547396-9547523)
chr5 (4-131)||(29887884-29888011)
chr5 (4-131)||(33878477-33878603)
chr5 (4-131)||(11326983-11327110)
chr5 (143-244)||(34468855-34468956)
chr5 (135-223)||(36375780-36375868)
chr5 (135-223)||(37000434-37000522)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-244)||(14760093-14760336)
chr4 (1-244)||(17016285-17016528)
chr4 (1-239)||(34185747-34185985)
chr4 (1-244)||(24589148-24589391)
chr4 (1-244)||(36341304-36341547)
chr4 (1-244)||(54836630-54836873)
chr4 (1-244)||(5009114-5009357)
chr4 (1-244)||(6573097-6573340)
chr4 (1-244)||(14668255-14668498)
chr4 (1-244)||(20335208-20335451)
chr4 (1-244)||(24115901-24116144)
chr4 (1-244)||(18313965-18314208)
chr4 (1-244)||(30756999-30757242)
chr4 (4-244)||(15231111-15231351)
chr4 (4-236)||(15281727-15281959)
chr4 (1-244)||(33670587-33670830)
chr4 (1-244)||(27160104-27160347)
chr4 (1-239)||(21972945-21973183)
chr4 (4-237)||(1903500-1903733)
chr4 (4-244)||(31123302-31123542)
chr4 (1-244)||(14101782-14102025)
chr4 (1-244)||(40102424-40102667)
chr4 (1-244)||(18797401-18797644)
chr4 (1-244)||(39853876-39854119)
chr4 (13-242)||(15388177-15388406)
chr4 (95-150)||(24459636-24459691)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-244)||(34294379-34294622)
chr2 (1-239)||(12658766-12659004)
chr2 (1-244)||(20841138-20841381)
chr2 (1-244)||(37380902-37381145)
chr2 (4-244)||(11631963-11632203)
chr2 (1-244)||(23125344-23125587)
chr2 (1-236)||(27431217-27431452)
chr2 (1-244)||(28885432-28885675)
chr2 (1-244)||(13933323-13933566)
chr2 (1-244)||(12590033-12590276)
chr2 (1-244)||(37948638-37948881)
chr2 (1-244)||(9346762-9347005)
chr2 (1-244)||(39048595-39048838)
chr2 (1-244)||(40236733-40236976)
chr2 (4-244)||(39893294-39893534)
chr2 (1-244)||(19413277-19413520)
chr2 (1-236)||(21699947-21700181)
chr2 (1-239)||(32053033-32053271)
chr2 (4-236)||(19453202-19453434)
chr2 (4-244)||(37682674-37682914)
chr2 (4-244)||(37697939-37698179)
chr2 (4-244)||(37928594-37928834)
chr2 (4-239)||(16826117-16826352)
chr2 (4-239)||(16895128-16895363)
chr2 (1-244)||(21673951-21674194)
chr2 (1-244)||(27806928-27807171)
chr2 (1-244)||(34864909-34865152)
chr2 (1-244)||(257429-257672)
chr2 (1-244)||(12713377-12713620)
chr2 (4-239)||(31879516-31879751)
chr2 (4-242)||(27394789-27395027)
chr2 (4-131)||(27119862-27119989)
chr2 (4-131)||(16164818-16164945)
chr2 (4-131)||(27779572-27779699)
chr2 (4-131)||(27819329-27819456)
chr2 (12-131)||(34158182-34158301)
chr2 (4-131)||(3785831-3785958)
chr2 (4-131)||(31890270-31890397)
chr2 (4-131)||(22924927-22925054)
chr2 (1-88)||(27827841-27827928)
chr2 (135-223)||(12383906-12383994)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-244)||(9262-9505)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-236)||(3301-3536)
scaffold0089 (94-244)||(43871-44021)
scaffold0089 (165-236)||(32096-32167)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-239)||(21894536-21894774)
chr1 (1-235)||(16204821-16205055)
chr1 (1-230)||(41790097-41790326)
chr1 (4-244)||(10948305-10948545)
chr1 (4-244)||(10965893-10966133)
chr1 (9-233)||(20339096-20339320)
chr1 (1-244)||(51641446-51641689)
chr1 (4-236)||(20464212-20464444)
chr1 (1-244)||(3644360-3644606)
chr1 (1-239)||(28588218-28588456)
chr1 (4-131)||(28153077-28153204)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-244)||(15807-16050)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-244)||(12797-13040)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-244)||(11175-11418)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-244)||(9248-9491)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-244)||(11715-11958)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (9-233)||(1419-1643)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (4-244)||(22981-23221)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-244)||(5966-6209)
scaffold0159 (166-244)||(23105-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (12-236)||(9279-9503)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-235)||(43515-43762)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (27-236)||(5484-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (127-244)||(1149-1266)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (142-227)||(35168-35253)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (163-231)||(33699-33770)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16753287 - 16753044
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753287 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 16753188  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16753187 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16753088  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16753087 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 16753044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 13295681 - 13295924
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13295681 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagc 13295780  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13295781 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 13295880  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13295881 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 13295924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 15421050 - 15421293
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15421050 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 15421149  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15421150 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15421249  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15421250 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15421293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 22931614 - 22931857
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931614 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 22931713  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22931714 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 22931813  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22931814 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 22931857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 23854059 - 23854302
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854059 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 23854158  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23854159 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 23854258  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23854259 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23854302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26921843 - 26921600
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921843 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 26921744  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26921743 attcattattccaaacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 26921644  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26921643 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 26921600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16677606 - 16677363
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16677606 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 16677507  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16677506 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16677407  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16677406 acgcccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 16677363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27022602 - 27022359
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27022602 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27022503  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27022502 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaa 27022403  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27022402 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27022359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29553023 - 29552780
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29553023 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 29552924  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29552923 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 29552824  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  29552823 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 29552780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24867182 - 24866939
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24867182 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggc 24867083  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24867082 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24866983  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24866982 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24866939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27179922 - 27179679
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27179922 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggc 27179823  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27179822 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27179723  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27179722 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27179679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 27269317 - 27269560
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27269317 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggc 27269416  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27269417 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27269516  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27269517 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 27626441 - 27626684
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27626441 aatactgccaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27626540  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27626541 attcatcattccacacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27626640  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  27626641 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtggagctg 27626684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 27287094 - 27287337
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27287094 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27287193  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27287194 attcatcattccatacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27287293  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27287294 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27287337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3699549 - 3699306
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3699549 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 3699450  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3699449 attcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 3699350  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3699349 acgcccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 3699306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4761229 - 4760986
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4761229 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4761130  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4761129 attcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4761030  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4761029 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4760986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26113142 - 26113385
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26113142 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 26113241  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26113242 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 26113341  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26113342 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26113385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27011197 - 27010954
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27011197 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27011098  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27011097 attcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27010998  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27010997 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27010954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27060972 - 27060729
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27060972 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27060873  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  27060872 attcatcgttccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcag 27060773  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27060772 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27060729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28210920 - 28210677
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28210920 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 28210821  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28210820 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 28210721  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28210720 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28210677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 4542504 - 4542747
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4542504 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4542603  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4542604 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4542703  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4542704 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 4720865 - 4721108
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4720865 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4720964  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4720965 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4721064  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4721065 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4721108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27488599 - 27488356
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27488599 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27488500  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27488499 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27488400  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27488399 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27488356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29504882 - 29504639
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29504882 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 29504783  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29504782 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 29504683  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  29504682 acgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29504639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 34461236 - 34461479
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34461236 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 34461335  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34461336 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 34461435  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  34461436 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 34461479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 30554749 - 30554989
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30554749 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 30554848  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30554849 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 30554948  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  30554949 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30554989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4528751 - 4528508
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4528751 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4528652  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4528651 attcatcatcccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4528552  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4528551 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4528508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 16940757 - 16941000
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16940757 aatactgctaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 16940856  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16940857 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16940956  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16940957 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 16941000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29576480 - 29576237
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29576480 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 29576381  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29576380 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 29576281  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  29576280 acgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29576237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4776346 - 4776103
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4776346 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4776247  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4776246 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4776147  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4776146 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 17089176 - 17089411
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17089176 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 17089275  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17089276 catcgttccacacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 17089375  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17089376 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtgg 17089411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26992261 - 26992096
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992261 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 26992162  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992161 attcatcattccatagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20172010 - 20171778
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20172010 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcatt 20171911  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20171910 catcgttccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 20171811  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20171810 tccgaggaaacctctaacttgtttctcagtctg 20171778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 22163981 - 22164213
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22163981 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcatt 22164080  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22164081 catcgttccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 22164180  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22164181 tccgaggaaacctctaacttgtttctcagtctg 22164213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 33373161 - 33373310
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33373161 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggc 33373260  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33373261 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatc 33373310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 26775357 - 26775487
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26775357 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 26775456  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26775457 attcatcgttccatacaataggctgattctt 26775487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27358840 - 27358970
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27358840 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 27358939  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27358940 attcatcgttccatacaataggctgattctt 27358970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27449183 - 27449313
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27449183 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 27449282  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27449283 attcatcgttccatacaataggctgattctt 27449313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28163957 - 28163827
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28163957 aatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 28163858  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28163857 attcatcattccatacaataggccgattctt 28163827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 14142127 - 14142254
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14142127 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 14142226  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14142227 catcgttccatacaataggctgattctt 14142254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26789279 - 26789152
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26789279 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 26789180  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26789179 catcgttccatacaataggctgattctt 26789152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27197648 - 27197521
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27197648 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 27197549  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27197548 catcgttccatacaataggctgattctt 27197521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 27251587 - 27251714
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27251587 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 27251686  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27251687 catcgttccatacaataggctgattctt 27251714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 8902436 - 8902563
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  8902436 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcatt 8902535  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8902536 catcattccatacaataggccgattctt 8902563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 22455847 - 22455974
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22455847 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 22455946  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  22455947 cattattccacacaataggttgattctt 22455974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 13520925 - 13521051
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  13520925 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcatt 13521023  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13521024 catcgttccatacaataggctgattctt 13521051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14561092 - 14560849
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561092 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 14560993  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14560992 attcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 14560893  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14560892 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14560849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18712952 - 18712709
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18712952 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgac 18712853  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18712852 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18712753  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18712752 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 18712709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18794172 - 18793929
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18794172 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18794073  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18794072 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaa 18793973  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18793972 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18793929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 27605653 - 27605896
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27605653 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27605752  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27605753 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27605852  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27605853 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27605896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 2134008 - 2134251
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2134008 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggc 2134107  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2134108 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 2134207  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2134208 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 2134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19691566 - 19691328
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19691566 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 19691467  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19691466 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 19691367  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19691366 tcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtgg 19691328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29832794 - 29832551
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29832794 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 29832695  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29832694 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 29832595  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  29832594 acgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29832551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9358093 - 9357855
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9358093 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 9357994  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9357993 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 9357894  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9357893 gcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 9357855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 19205113 - 19205353
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19205113 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 19205212  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19205213 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 19205312  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  19205313 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 19205353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 12089471 - 12089714
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12089471 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 12089570  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12089571 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 12089670  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12089671 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12089714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19677915 - 19677672
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19677915 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggc 19677816  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  19677815 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaa 19677716  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19677715 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 19677672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 28358703 - 28358943
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28358703 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 28358802  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28358803 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 28358902  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  28358903 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 28358943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31357993 - 31357753
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31357993 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31357894  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31357893 catcattccatacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 31357794  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31357793 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31357753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33262202 - 33261964
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33262202 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 33262103  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33262102 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 33262003  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33262002 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 33261964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 31486619 - 31486862
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31486619 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31486718  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  31486719 attcatcattccatacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcag 31486818  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31486819 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31486862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 22077662 - 22077900
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22077662 actgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 22077761  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22077762 cattattccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 22077861  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgc 242  Q
     ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22077862 cccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 22077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15771039 - 15770912
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15771039 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 15770940  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15770939 catcgttccatacaataggctgattctt 15770912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 21344922 - 21345049
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344922 actgacaaatacaaaatcgaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 21345021  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21345022 catcattccctacaagaggctaattctt 21345049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44564449 - 44564322
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  44564449 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 44564350  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44564349 catcgttctatacaataggctgattctt 44564322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286626
Alignment:
Q  177 tatgaatcgggagatgtaattcaagcgtc-cgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 16286626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16768657 - 16768557
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 234  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  16768657 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctctgtc 16768558  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  16768557 t 16768557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 10913541 - 10913784
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913541 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 10913640  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10913641 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 10913740  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10913741 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 10913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22145661 - 22145418
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22145661 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 22145562  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22145561 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 22145462  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22145461 gcgtccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctgtggagctg 22145418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 2106835 - 2107078
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106835 aatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 2106934  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2106935 attcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 2107034  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2107035 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtatgtggagctg 2107078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 5144012 - 5144255
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144012 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 5144111  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5144112 attcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaa 5144211  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5144212 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 5144255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2158040 - 2157797
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2158040 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 2157941  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2157940 attcatcattccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 2157841  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2157840 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 2157797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5131462 - 5131219
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5131462 aatactgccaaatacataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5131363  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5131362 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 5131263  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5131262 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5131219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 11421451 - 11421694
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421451 aatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 11421550  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11421551 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 11421650  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11421651 acgcccgaggaaccctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 11421694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16515102 - 16515337
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16515102 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggc 16515201  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16515202 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16515301  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16515302 tcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26534545 - 26534788
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26534545 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 26534644  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26534645 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaa 26534744  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26534745 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtggagctg 26534788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10845083 - 10844851
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10845083 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 10844984  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10844983 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 10844884  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844883 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 26271761 - 26272001
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26271761 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcatt 26271860  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26271861 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 26271960  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26271961 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26272001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 26316523 - 26316763
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26316523 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 26316622  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26316623 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 26316722  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26316723 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26316763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11444353 - 11444110
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11444353 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 11444254  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11444253 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 11444154  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11444153 gcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11444110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26438723 - 26438480
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26438723 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 26438624  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26438623 attcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 26438524  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26438523 acgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 26438480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26516258 - 26516015
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26516258 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 26516159  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26516158 attcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 26516059  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  26516058 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 26516015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 4141921 - 4142161
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4141921 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4142020  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4142021 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4142120  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4142121 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4142161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4202852 - 4202612
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4202852 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4202753  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4202752 catcattccatacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 4202653  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4202652 tccgaggaagcctctaacttgcttctctgtctgtggagctg 4202612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45390683 - 45390443
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45390683 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 45390584  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45390583 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 45390484  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  45390483 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 45390443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3448772 - 3448529
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3448772 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 3448673  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3448672 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 3448573  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  3448572 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3448529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 31561062 - 31561305
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31561062 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31561161  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31561162 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 31561261  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  31561262 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 31561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 10842669 - 10842901
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10842669 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 10842768  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  10842769 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcg 10842868  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10842869 cccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16044781 - 16044550
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16044781 actgacaaatacataatcaaaggc-ttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcatt 16044683  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16044682 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 16044583  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044582 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 26666589 - 26666829
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26666589 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 26666688  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26666689 catcattccatacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 26666788  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26666789 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26666829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 16446681 - 16446913
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  16446681 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcatt 16446780  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  16446781 catcgttccatacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatca 16446880  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16446881 cccgaggaaacctcttacttgtgtctcggtctg 16446913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 24589206 - 24589449
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24589206 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 24589305  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24589306 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24589405  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24589406 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24589449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16748189 - 16748418
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16748189 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggc 16748288  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16748289 attcatcattccatacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 16748388  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctc 230  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16748389 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctc 16748418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621873
Alignment:
Q  89 aagcttcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcggga 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  189 gatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9621873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2776717 - 2776590
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2776717 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 2776618  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2776617 catcgttccatacaataggctgattctt 2776590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 26512371 - 26512498
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26512371 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 26512470  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26512471 catcgttccatacaataggctgattctt 26512498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 26681781 - 26681908
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26681781 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 26681880  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26681881 catcgttccatacaataggctgattctt 26681908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31127370 - 31127243
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31127370 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 31127271  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31127270 catcgttccatacaataggctgattctt 31127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45734776 - 45734649
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45734776 actgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 45734677  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45734676 catcattccatacaataggccgattctt 45734649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 31087297 - 31087424
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31087297 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31087396  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31087397 catcgttccatacaataggctgattctt 31087424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 39209814 - 39209941
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  39209814 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 39209913  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39209914 catcgttccatacaataggttgattctt 39209941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 244
Target Start/End: Original strand, 16287193 - 16287294
Alignment:
Q  143 tgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgc 242  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||| || || ||||| ||    
T  16287193 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgtggagc 16287292  T
Q  243 tg 244  Q
    ||    
T  16287293 tg 16287294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 1893381 - 1893481
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 234  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||  | ||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  1893381 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctctgtc 1893480  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  1893481 t 1893481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8299401 - 8299158
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299401 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 8299302  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8299301 attcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 8299202  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8299201 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 8299158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21678133 - 21677890
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678133 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 21678034  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21678033 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 21677934  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21677933 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 21677890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35884196 - 35883953
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35884196 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 35884097  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35884096 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 35883997  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35883996 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 35883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 15737924 - 15738167
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737924 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 15738023  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15738024 attcatcattccatacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15738123  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15738124 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15738167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 15889535 - 15889778
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15889535 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 15889634  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15889635 attcatcattccatacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15889734  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15889735 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15889778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18054692 - 18054449
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054692 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 18054593  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18054592 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18054493  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18054492 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18054449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18273882 - 18274125
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18273882 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18273981  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18273982 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18274081  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18274082 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18274125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18289183 - 18289426
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18289183 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18289282  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18289283 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18289382  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18289383 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18289426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18304484 - 18304727
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18304484 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18304583  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18304584 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18304683  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18304684 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18304727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18334060 - 18333817
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334060 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18333961  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18333960 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18333861  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18333860 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 18333817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 22384408 - 22384651
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384408 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 22384507  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22384508 attcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 22384607  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22384608 acgttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 22384651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 4793465 - 4793701
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4793465 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4793564  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4793565 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4793664  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgt 237  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4793665 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6205333 - 6205090
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6205333 aatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 6205234  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6205233 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 6205134  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6205133 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 6205090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 8286300 - 8286535
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8286300 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 8286399  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8286400 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 8286499  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8286500 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4687085 - 4686842
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4687085 aatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4686986  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4686985 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4686886  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4686885 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 4686842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4725061 - 4724818
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4725061 aatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4724962  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4724961 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4724862  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4724861 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 4724818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10399574 - 10399331
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10399574 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 10399475  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10399474 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 10399375  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10399374 acgtccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 10399331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 29145586 - 29145829
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29145586 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 29145685  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29145686 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 29145785  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29145786 acgcccgaggaaacctctaacttgcttctcggtctgtggagctg 29145829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7076636 - 7076393
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7076636 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 7076537  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7076536 attcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 7076437  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7076436 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 7076393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 29661800 - 29662043
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29661800 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 29661899  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29661900 attcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 29661999  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29662000 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggggctg 29662043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20069470 - 20069227
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20069470 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 20069371  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20069370 attcatcattccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 20069271  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  20069270 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 20069227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32442581 - 32442338
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32442581 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 32442482  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32442481 attcatcattccatacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 32442382  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  32442381 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcgatccgtggagctg 32442338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8215165 - 8214922
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8215165 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 8215066  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8215065 attcatcattccacacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 8214966  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  8214965 gcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 8214922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 28112787 - 28113027
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28112787 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 28112886  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28112887 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 28112986  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28112987 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28113027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5470418 - 5470175
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5470418 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5470319  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5470318 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 5470219  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5470218 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5470175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 5593187 - 5593430
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5593187 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 5593286  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5593287 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 5593386  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5593387 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5593430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 5606144 - 5606387
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5606144 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5606243  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5606244 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 5606343  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5606344 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5606387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19697917 - 19697687
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19697917 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcatt 19697818  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19697817 catcgttccatacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcg 19697718  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19697717 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 16621323 - 16621555
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16621323 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 16621422  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16621423 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 16621522  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621523 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28342604 - 28342364
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28342604 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 28342505  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28342504 catcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 28342405  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28342404 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28342364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 6539572 - 6539815
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6539572 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 6539671  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6539672 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 6539771  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6539772 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6539815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28024712 - 28024469
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28024712 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggc 28024613  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28024612 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 28024513  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28024512 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28024469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47026880 - 47026640
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47026880 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 47026781  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47026780 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 47026681  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  47026680 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 47026640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 4343506 - 4343749
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4343506 aatactaccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4343605  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4343606 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4343705  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4343706 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4343749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4420345 - 4420102
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4420345 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4420246  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4420245 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4420146  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4420145 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4420102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7999990 - 7999747
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7999990 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 7999891  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7999890 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 7999791  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  7999790 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 7999747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10646503 - 10646260
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10646503 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 10646404  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10646403 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 10646304  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10646303 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 10646260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 22867678 - 22867921
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22867678 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 22867777  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22867778 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 22867877  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22867878 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 22867921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 22882737 - 22882980
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22882737 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 22882836  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22882837 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 22882936  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22882937 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 22882980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24331590 - 24331350
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24331590 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcatt 24331491  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24331490 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24331391  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24331390 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24331350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18246171 - 18245928
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18246171 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18246072  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18246071 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18245972  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  18245971 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctatctgtggagctg 18245928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 31961285 - 31961528
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31961285 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31961384  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31961385 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 31961484  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31961485 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31961528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48469357 - 48469114
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48469357 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 48469258  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48469257 attcattattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 48469158  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48469157 acgcccgaggaaacctatgacttgtttctctgtctgtggagctg 48469114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5017141 - 5016906
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5017141 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5017042  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5017041 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 5016942  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5016941 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 5016906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 17981779 - 17982022
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17981779 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 17981878  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17981879 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 17981978  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  17981979 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 17982022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18228626 - 18228383
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18228626 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18228527  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18228526 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18228427  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  18228426 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18228383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 20573673 - 20573916
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573673 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 20573772  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20573773 attcctcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 20573872  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  20573873 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 20573916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51785453 - 51785210
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51785453 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 51785354  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51785353 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 51785254  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  51785253 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 51785210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 11107189 - 11107420
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11107189 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttcca-------gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 11107281  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11107282 attcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 11107381  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11107382 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 11107420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4627215 - 4627085
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4627215 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4627116  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627115 attcatcattccatacaataggctgattctt 4627085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5714503 - 5714373
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5714503 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5714404  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5714403 attcatcgttccatacaataggctgattctt 5714373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5725413 - 5725283
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5725413 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5725314  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5725313 attcatcgttccatacaataggctgattctt 5725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 5766955 - 5767085
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5766955 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5767054  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5767055 attcatcgttccatacaataggctgattctt 5767085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32294055 - 32293928
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  32294055 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 32293956  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32293955 catcgttccatacaataggctgattctt 32293928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 17992764 - 17992891
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17992764 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 17992863  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17992864 catcgttccatacaataggttgattctt 17992891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 31033069 - 31033196
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31033069 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 31033168  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31033169 catcgttccatataataggctgattctt 31033196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15918813 - 15918721
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgttt 227  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||    
T  15918813 gagtagtttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 15918721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 15592882 - 15592967
Alignment:
Q  142 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgttt 227  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||    
T  15592882 ttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 15592967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20443406 - 20443321
Alignment:
Q  142 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgttt 227  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||    
T  20443406 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 20443321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41440532 - 41440447
Alignment:
Q  142 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgttt 227  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||    
T  41440532 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgttt 41440447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30762 - 30519
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30762 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 30663  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30662 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 30563  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30562 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 30519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19536 - 19304
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19536 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 19437  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19436 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 19337  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19336 cccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7426 - 7299
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7426 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 7327  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326 catcattccatacaataggctgattctt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33296004 - 33295761
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33296004 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 33295905  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33295904 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 33295805  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33295804 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 33295761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 15655442 - 15655685
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15655442 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 15655541  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15655542 attcatcattccatacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15655641  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15655642 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15655685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 22995801 - 22996044
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995801 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 22995900  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22995901 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 22996000  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22996001 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 22996044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 24684829 - 24685072
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24684829 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggc 24684928  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24684929 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24685028  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24685029 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24685072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24973382 - 24973139
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24973382 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 24973283  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24973282 attcattattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaa 24973183  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24973182 gcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24973139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41678181 - 41677938
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41678181 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 41678082  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41678081 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 41677982  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  41677981 acgtccgaggaaacctctaacttgcttctcggtctgtggagctg 41677938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23629443 - 23629203
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23629443 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 23629344  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23629343 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 23629244  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23629243 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23629203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11552831 - 11552588
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11552831 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 11552732  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11552731 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 11552632  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11552631 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 11552588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23895682 - 23895447
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  23895682 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggc 23895583  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23895582 attcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 23895483  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895482 tcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33780965 - 33780722
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33780965 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 33780866  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33780865 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 33780766  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33780765 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 33780722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28652718 - 28652475
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28652718 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 28652619  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28652618 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 28652519  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28652518 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 28652475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18497409 - 18497652
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18497409 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18497508  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18497509 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18497608  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18497609 acgcccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 18497652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30938111 - 30937868
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30938111 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggc 30938012  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30938011 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 30937912  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30937911 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 30937868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9320949 - 9320709
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9320949 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 9320850  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9320849 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 9320750  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9320749 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9320709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12135648 - 12135408
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12135648 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 12135549  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12135548 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 12135449  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12135448 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12135408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26483867 - 26483627
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26483867 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 26483768  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26483767 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 26483668  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26483667 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26483627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43081728 - 43081488
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43081728 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 43081629  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43081628 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 43081529  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43081528 tccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 43081488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 37355327 - 37355570
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37355327 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37355426  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37355427 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37355526  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37355527 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37355570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31434937 - 31434697
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31434937 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31434838  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31434837 catcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 31434738  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31434737 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31434697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 37668170 - 37668413
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37668170 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37668269  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37668270 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37668369  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37668370 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37668413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22891936 - 22891707
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22891936 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 22891837  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22891836 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 22891737  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggt 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22891736 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 8662162 - 8662402
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8662162 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 8662261  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8662262 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 8662361  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  8662362 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 8662402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25203751 - 25203519
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  25203751 actgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagt 25203652  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25203651 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 25203552  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203551 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25267906 - 25267674
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  25267906 actgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagt 25267807  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25267806 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 25267707  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25267706 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30032901 - 30032661
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30032901 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 30032802  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30032801 catcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 30032702  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  30032701 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30032661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30155504 - 30155264
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30155504 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 30155405  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30155404 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 30155305  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  30155304 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30155264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33519853 - 33519613
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33519853 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 33519754  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33519753 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 33519654  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33519653 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 33519613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34619991 - 34619751
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34619991 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcatt 34619892  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34619891 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacg 34619792  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  34619791 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 34619751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2514538 - 2514295
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2514538 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggc 2514439  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2514438 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 2514339  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2514338 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 2514295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3793017 - 3792774
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3793017 aataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 3792918  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3792917 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 3792818  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  3792817 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3792774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18372218 - 18372461
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18372218 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 18372317  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18372318 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 18372417  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  18372418 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18372461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24586850 - 24586607
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24586850 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 24586751  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24586750 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24586651  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24586650 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24586607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 31823091 - 31823334
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31823091 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31823190  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31823191 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 31823290  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31823291 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31823334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 32592958 - 32593201
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32592958 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggc 32593057  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  32593058 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaa 32593157  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  32593158 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 32593201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37758459 - 37758216
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37758459 aataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37758360  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37758359 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37758260  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37758259 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 13321514 - 13321757
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13321514 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 13321613  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13321614 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 13321713  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  13321714 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 13321757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 37767675 - 37767918
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37767675 aatactgccagatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37767774  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37767775 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37767874  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37767875 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37767918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5641264 - 5641021
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5641264 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5641165  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5641164 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 5641065  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5641064 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5641021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 15755536 - 15755779
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15755536 aatactgctaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 15755635  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15755636 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15755735  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  15755736 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 15755779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24727445 - 24727202
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24727445 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 24727346  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24727345 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24727246  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24727245 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24727202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 28956469 - 28956712
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28956469 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggc 28956568  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28956569 attcatcattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 28956668  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28956669 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28956712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30171945 - 30171702
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30171945 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 30171846  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30171845 actcatcattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 30171746  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  30171745 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30171702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6877781 - 6877538
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6877781 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 6877682  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6877681 attcatcatcccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 6877582  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6877581 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6877538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 40470234 - 40470477
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40470234 aataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 40470333  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40470334 attcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 40470433  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  40470434 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 40470477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 13183477 - 13183626
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  13183477 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctgga 13183576  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183577 attcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 13183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13439367 - 13439494
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13439367 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 13439466  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13439467 attcatcgttccatacaataggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18125100 - 18125230
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18125100 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 18125199  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18125200 attcatcgttccatacaataggctgattctt 18125230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 9547396 - 9547523
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  9547396 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcatt 9547495  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9547496 catcgttccatacaataggctgattctt 9547523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 29887884 - 29888011
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29887884 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 29887983  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29887984 catcgttccatacaataggctgattctt 29888011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33878603 - 33878477
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  33878603 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcatt 33878505  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33878504 catcgttccatacaataggctgattctt 33878477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11327110 - 11326983
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11327110 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 11327011  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11327010 catcgttccatacaataggttgattctt 11326983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34468956 - 34468855
Alignment:
Q  143 tgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgc 242  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||| || || ||||| ||    
T  34468956 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgtggagc 34468857  T
Q  243 tg 244  Q
    ||    
T  34468856 tg 34468855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 36375780 - 36375868
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgactt 223  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||    
T  36375780 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacctcttactt 36375868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 37000434 - 37000522
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgactt 223  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||    
T  37000434 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacctcttactt 37000522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 14760093 - 14760336
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14760093 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 14760192  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14760193 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 14760292  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14760293 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14760336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17016528 - 17016285
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17016528 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 17016429  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17016428 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 17016329  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17016328 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 17016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 34185747 - 34185985
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185747 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 34185846  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34185847 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 34185946  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34185947 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 34185985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 24589148 - 24589391
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589148 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 24589247  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24589248 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24589347  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24589348 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 24589391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 36341304 - 36341547
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36341304 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 36341403  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36341404 tttcatcattccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 36341503  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36341504 acgtccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 36341547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 54836873 - 54836630
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54836873 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 54836774  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  54836773 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcag 54836674  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  54836673 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 54836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5009357 - 5009114
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5009357 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5009258  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5009257 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 5009158  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5009157 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5009114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6573340 - 6573097
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6573340 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 6573241  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6573240 attcatcattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 6573141  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6573140 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6573097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14668498 - 14668255
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14668498 aatacttccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 14668399  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14668398 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 14668299  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14668298 acgcccgaggaaatctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14668255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 20335208 - 20335451
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20335208 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 20335307  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20335308 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 20335407  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  20335408 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtggagctg 20335451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24116144 - 24115901
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24116144 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 24116045  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24116044 attcatcattccatacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24115945  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24115944 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24115901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18313965 - 18314208
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18313965 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 18314064  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18314065 attcatcgttccatacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18314164  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  18314165 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18314208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30757242 - 30756999
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30757242 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 30757143  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30757142 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 30757043  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  30757042 gcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30756999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15231351 - 15231111
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15231351 actgacaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 15231252  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15231251 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 15231152  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15231151 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 15231111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 15281727 - 15281959
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15281727 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 15281826  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15281827 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 15281926  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281927 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 33670587 - 33670830
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33670587 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggc 33670686  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  33670687 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaa 33670786  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33670787 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 33670830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 27160104 - 27160347
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27160104 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27160203  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27160204 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27160303  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27160304 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27160347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21973183 - 21972945
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21973183 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 21973084  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21973083 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 21972984  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21972983 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 21972945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1903733 - 1903500
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1903733 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 1903634  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1903633 caacgttccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 1903534  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgt 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903533 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 31123302 - 31123542
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31123302 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31123401  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31123402 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 31123501  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31123502 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14102025 - 14101782
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14102025 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 14101926  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14101925 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 14101826  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14101825 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 14101782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 40102424 - 40102667
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40102424 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 40102523  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40102524 attcatcattccatacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 40102623  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  40102624 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 40102667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18797401 - 18797644
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18797401 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggc 18797500  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18797501 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 18797600  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  18797601 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 18797644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39854119 - 39853876
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39854119 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 39854020  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39854019 attcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 39853920  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  39853919 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 39853876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 15388177 - 15388406
Alignment:
Q  13 tacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  15388177 tacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcc 15388276  T
Q  113 atacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaa 212  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15388277 acacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaa 15388376  T
Q  213 acctctgacttgtttctcggtctgtggtgc 242  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  15388377 acctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 15388406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 150
Target Start/End: Original strand, 24459636 - 24459691
Alignment:
Q  95 cttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24459636 cttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatc 24459691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34294622 - 34294379
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34294622 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 34294523  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34294522 attcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 34294423  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34294422 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 34294379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12659004 - 12658766
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12659004 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 12658905  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12658904 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 12658805  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12658804 tcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtgg 12658766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20841381 - 20841138
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20841381 aatactgccaagtacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 20841282  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20841281 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 20841182  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20841181 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 20841138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37381145 - 37380902
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37381145 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37381046  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37381045 attcatcattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 37380946  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37380945 gtgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 37380902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 11631963 - 11632203
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11631963 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 11632062  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11632063 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 11632162  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11632163 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11632203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 23125344 - 23125587
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23125344 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggc 23125443  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23125444 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 23125543  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23125544 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23125587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 27431217 - 27431452
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27431217 aatactaccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27431316  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27431317 attcatcattccatacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27431416  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27431417 tcgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28885675 - 28885432
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28885675 aatactgccaaatacataaccaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgac 28885576  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28885575 attcatcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 28885476  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28885475 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 28885432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 13933323 - 13933566
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13933323 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 13933422  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13933423 attcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 13933522  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  13933523 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 13933566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12590276 - 12590033
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12590276 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 12590177  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12590176 attcatcgttccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 12590077  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  12590076 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 12590033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 37948638 - 37948881
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37948638 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37948737  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37948738 attcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37948837  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37948838 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 37948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 9346762 - 9347005
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9346762 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggc 9346861  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9346862 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 9346961  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  9346962 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 9347005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 39048595 - 39048838
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39048595 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 39048694  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39048695 attcatcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 39048794  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  39048795 acgcccgaggaaacctcttacttgcttctcagtctgtggagctg 39048838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40236976 - 40236733
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40236976 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggc 40236877  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40236876 attcattattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 40236777  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  40236776 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 40236733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39893534 - 39893294
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39893534 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 39893435  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39893434 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacg 39893335  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  39893334 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 39893294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 19413277 - 19413520
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19413277 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 19413376  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19413377 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 19413476  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19413477 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 19413520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21699947 - 21700181
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  21699947 aatactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 21700046  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21700047 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 21700146  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21700147 tcgcccgaggaaacctctga-ttgtttctcggtctg 21700181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32053271 - 32053033
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32053271 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 32053172  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32053171 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 32053072  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32053071 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 32053033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 19453202 - 19453434
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  19453202 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcatt 19453301  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19453302 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 19453401  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453402 cccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 37682674 - 37682914
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37682674 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 37682773  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37682774 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 37682873  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37682874 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37682914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 37697939 - 37698179
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37697939 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 37698038  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37698039 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 37698138  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37698139 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37698179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37928834 - 37928594
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37928834 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 37928735  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37928734 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 37928635  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  37928634 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37928594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 16826117 - 16826352
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16826117 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 16826216  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826217 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 16826316  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16826317 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 16826352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16895363 - 16895128
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16895363 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 16895264  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16895263 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 16895164  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16895163 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 16895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 21673951 - 21674194
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21673951 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 21674050  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21674051 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 21674150  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21674151 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 21674194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27807171 - 27806928
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27807171 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27807072  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27807071 attcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27806972  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  27806971 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 27806928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34865152 - 34864909
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34865152 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 34865053  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34865052 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 34864953  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  34864952 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 34864909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 257429 - 257672
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  257429 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 257528  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  257529 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 257628  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  257629 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 257672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 12713377 - 12713620
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12713377 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 12713476  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12713477 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 12713576  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12713577 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12713620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31879751 - 31879516
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31879751 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31879652  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31879651 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 31879552  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31879551 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 31879516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27395027 - 27394789
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27395027 actgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 27394928  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27394927 cattattccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27394828  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgc 242  Q
     ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  27394827 cccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 27394789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27119989 - 27119862
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27119989 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27119890  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119889 catcattccatacaataggctgattctt 27119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16164945 - 16164818
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16164945 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 16164846  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16164845 catcgttccatacaataggctgattctt 16164818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27779699 - 27779572
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27779699 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 27779600  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27779599 catcgttccatacaataggctgattctt 27779572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27819456 - 27819329
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27819456 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 27819357  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27819356 catcgttccatacaataggctgattctt 27819329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34158301 - 34158182
Alignment:
Q  12 atacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  34158301 atacaaaatcagaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttc 34158202  T
Q  112 catacaataggctgattctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34158201 catacaataggctgattctt 34158182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3785958 - 3785831
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3785958 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 3785859  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3785858 catcgttccatacaataggctgattctt 3785831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 31890270 - 31890397
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31890270 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 31890369  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  31890370 cattgttccatacaataggctgattctt 31890397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 22924927 - 22925054
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22924927 actgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 22925026  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22925027 catcgttccatacaataggttgattctt 22925054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27827928 - 27827841
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27827928 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12383994 - 12383906
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgactt 223  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||    
T  12383994 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacctcttactt 12383906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9505 - 9262
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9505 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgac 9406  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9405 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 9306  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9305 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 9262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3536 - 3301
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3536 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 3437  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3436 attcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 3337  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3336 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Original strand, 43871 - 44021
Alignment:
Q  94 tcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43871 tcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgt 43970  T
Q  194 aattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  43971 aattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtggagctg 44021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  165 ggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 21894536 - 21894774
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21894536 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 21894635  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21894636 attcatcattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 21894735  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21894736 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtgg 21894774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16204821 - 16205055
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16204821 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggc 16204920  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16204921 agtcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16205020  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtct 235  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16205021 tcgtctgaggaaacctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 41790097 - 41790326
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41790097 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 41790196  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41790197 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 41790296  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctc 230  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41790297 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctc 41790326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10948545 - 10948305
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10948545 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 10948446  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10948445 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 10948346  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10948345 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 10948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10966133 - 10965893
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10966133 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 10966034  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10966033 catcattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 10965934  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  10965933 tccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 10965893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 20339096 - 20339320
Alignment:
Q  9 caaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatca 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20339096 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatca 20339195  T
Q  109 ttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20339196 ttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccga 20339295  T
Q  209 ggaaacctctgacttgtttctcggt 233  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  20339296 ggaaacctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51641689 - 51641446
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  51641689 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 51641590  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  51641589 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 51641490  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  51641489 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 51641446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20464444 - 20464212
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20464444 actgacaaatacataattaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 20464345  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20464344 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 20464245  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20464244 cccgaggaaacctcagacttgtttctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3644606 - 3644360
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattctt-gatgctatcaaaagcttctt-g 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3644606 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttg 3644507  T
Q  99 acattcatcattccatacaataggctgattcttt-ctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3644506 gcattcatcattccatacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 3644407  T
Q  198 caagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  3644406 caaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28588456 - 28588218
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28588456 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 28588357  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  28588356 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcag 28588257  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtgg 239  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28588256 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 28588218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28153204 - 28153077
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28153204 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 28153105  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctt 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28153104 catcgttccatacaataggctgattctt 28153077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16050 - 15807
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16050 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 15951  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15950 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15851  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15850 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13040 - 12797
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13040 aatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 12941  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12940 attcatcattccatacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 12841  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12840 gcgtcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11418 - 11175
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11418 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 11319  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11318 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 11219  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11218 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9491 - 9248
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9491 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 9392  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9391 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 9292  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  9291 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 11715 - 11958
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11715 aatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 11814  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11815 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 11914  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11915 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 1419 - 1643
Alignment:
Q  9 caaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatca 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1419 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatca 1518  T
Q  109 ttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1519 ttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccga 1618  T
Q  209 ggaaacctctgacttgtttctcggt 233  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  1619 ggaaacctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 22981 - 23221
Alignment:
Q  4 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22981 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 23080  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23081 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 23180  T
Q  204 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23181 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 23221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 5966 - 6209
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  5966 aatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggc 6065  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6066 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 6165  T
Q  201 gcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6166 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23105
Alignment:
Q  166 gtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 23105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9503 - 9279
Alignment:
Q  12 atacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattc 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  9503 atacataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttc 9404  T
Q  112 catacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgagga 211  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9403 catacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagga 9304  T
Q  212 aacctctgacttgtttctcggtctg 236  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9303 agcctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 43515 - 43762
Alignment:
Q  1 aatactgccaaatacataa-tcaga-ggccttccttccacgggtgggacaaggata-ggtggtttcagcaggtaatt-cttgatgctatc--aaaagctt 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||    
T  43515 aatactgccaaatacataaatcaaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagctt 43614  T
Q  95 cttgacattca--tcattccatacaatagg-ctgattctttctga-gtagcttgaagatcggcccgcaggtt-gcggtcatgtgaaatatgaatcgggag 189  Q
    |||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43615 cttggcattcaattaattccatacaataggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggag 43714  T
Q  190 atgtaa-ttcaagcgtccgaggaaacctctgacttg-tttctcggtct 235  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43715 atgtaattttaagcgtccgaggaaacctctgacttgctttctcggtct 43762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 5484 - 5693
Alignment:
Q  27 ccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggctga 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||    
T  5484 ccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttcataccacaggttga 5583  T
Q  127 ttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtt 226  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  5584 tttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaacctctgacttgct 5683  T
Q  227 tctcggtctg 236  Q
    |||| |||||    
T  5684 tctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1266 - 1149
Alignment:
Q  127 ttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgtt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |    
T  1266 ttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgct 1167  T
Q  227 tctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  1166 tctcggtctgtggagctg 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 35168 - 35253
Alignment:
Q  142 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgaaatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttgttt 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||    
T  35168 ttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaaccctcttacttgttt 35253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33699
Alignment:
Q  163 gcggtcatgtgaaatat-gaa-tcgggagatgtaattcaagcgtcc-gaggaaacctctgacttgtttctcg 231  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttgtttctcg 33699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University