View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4988_low_6 (Length: 295)

Name: NF4988_low_6
Description: NF4988
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4988_low_6
NF4988_low_6
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (100-263)||(40362604-40362767)
chr3 (101-263)||(48725271-48725433)
chr3 (100-276)||(46352633-46352810)
chr3 (100-263)||(858588-858751)
chr3 (101-256)||(4168183-4168338)
chr3 (100-263)||(52520680-52520843)
chr3 (98-263)||(272217-272382)
chr3 (99-263)||(49893329-49893493)
chr3 (101-263)||(43786871-43787033)
chr3 (97-263)||(41304001-41304165)
chr3 (101-263)||(39074419-39074580)
chr3 (99-263)||(41553964-41554127)
chr3 (102-260)||(42964276-42964434)
chr3 (105-276)||(7468417-7468585)
chr3 (101-260)||(20923992-20924151)
chr3 (101-263)||(10617308-10617469)
chr3 (128-257)||(22248913-22249042)
chr3 (101-263)||(53489848-53490012)
chr3 (100-263)||(18014671-18014834)
chr3 (101-263)||(2505350-2505511)
chr3 (103-276)||(43269749-43269923)
chr3 (128-276)||(50359196-50359345)
chr3 (101-261)||(28139309-28139469)
chr3 (101-263)||(38852216-38852379)
chr3 (101-264)||(52246582-52246746)
chr3 (100-263)||(11308235-11308397)
chr3 (100-259)||(13159896-13160055)
chr3 (134-261)||(42548128-42548255)
chr3 (107-259)||(50395591-50395742)
chr3 (133-255)||(41993652-41993773)
chr3 (153-276)||(33140937-33141061)
chr3 (132-254)||(29241668-29241790)
chr3 (158-263)||(6842676-6842781)
chr3 (152-259)||(50298973-50299080)
chr3 (128-249)||(2119458-2119577)
chr3 (128-276)||(24488393-24488542)
chr3 (134-262)||(49529291-49529422)
chr3 (133-255)||(2938072-2938194)
chr3 (139-276)||(31514829-31514965)
chr3 (151-225)||(2362882-2362955)
chr3 (176-265)||(52552549-52552637)
chr3 (100-186)||(52718167-52718252)
chr3 (134-273)||(53054834-53054975)
chr3 (128-182)||(2391634-2391688)
chr3 (128-182)||(2393395-2393449)
chr3 (145-232)||(21010041-21010124)
chr3 (145-259)||(25743854-25743967)
chr3 (162-200)||(6842604-6842642)
chr3 (115-192)||(36953207-36953285)
chr3 (96-161)||(2362796-2362861)
chr3 (95-180)||(23925274-23925359)
chr3 (152-259)||(17752736-17752842)
chr3 (152-259)||(19054056-19054162)
chr3 (145-192)||(26966540-26966588)
chr3 (101-192)||(27994394-27994486)
chr3 (102-192)||(16990728-16990818)
chr3 (152-232)||(31436313-31436393)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (100-276)||(13661807-13661984)
chr5 (100-263)||(35132521-35132683)
chr5 (101-263)||(6283562-6283724)
chr5 (101-263)||(12506296-12506458)
chr5 (101-263)||(34650857-34651018)
chr5 (101-276)||(35504251-35504426)
chr5 (101-263)||(11957991-11958153)
chr5 (102-261)||(20175228-20175387)
chr5 (100-263)||(8787338-8787501)
chr5 (99-257)||(40564434-40564590)
chr5 (104-263)||(11846075-11846234)
chr5 (133-259)||(21547422-21547548)
chr5 (133-254)||(9721640-9721761)
chr5 (100-263)||(10054377-10054539)
chr5 (100-259)||(31909631-31909784)
chr5 (101-225)||(10069969-10070092)
chr5 (100-233)||(13470150-13470283)
chr5 (104-225)||(19647720-19647841)
chr5 (104-260)||(19436865-19437019)
chr5 (127-249)||(39066973-39067096)
chr5 (98-259)||(10955948-10956109)
chr5 (134-260)||(40057340-40057466)
chr5 (102-209)||(2619635-2619742)
chr5 (100-213)||(4837257-4837369)
chr5 (94-250)||(39069374-39069527)
chr5 (159-256)||(4268620-4268716)
chr5 (127-198)||(6284821-6284892)
chr5 (100-192)||(21944954-21945048)
chr5 (101-202)||(40608619-40608722)
chr5 (229-263)||(10955975-10956009)
chr5 (155-249)||(22973739-22973832)
chr5 (128-192)||(6042142-6042207)
chr5 (145-192)||(5302374-5302422)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (100-276)||(27988510-27988686)
chr8 (100-276)||(28045812-28045988)
chr8 (100-263)||(11112638-11112801)
chr8 (100-263)||(33357153-33357316)
chr8 (101-263)||(34228682-34228844)
chr8 (100-263)||(4537768-4537931)
chr8 (98-276)||(36730442-36730619)
chr8 (100-263)||(168465-168628)
chr8 (101-256)||(37373206-37373360)
chr8 (103-261)||(20831579-20831737)
chr8 (101-263)||(30675597-30675758)
chr8 (100-276)||(9063062-9063238)
chr8 (102-263)||(16888568-16888728)
chr8 (91-263)||(16785077-16785248)
chr8 (101-263)||(16394085-16394247)
chr8 (99-260)||(12203853-12204013)
chr8 (99-260)||(12448281-12448441)
chr8 (101-276)||(2805270-2805446)
chr8 (96-263)||(3930257-3930423)
chr8 (134-261)||(7304544-7304671)
chr8 (98-257)||(43119214-43119373)
chr8 (132-262)||(16890505-16890635)
chr8 (104-273)||(29444153-29444323)
chr8 (114-255)||(42035013-42035154)
chr8 (104-263)||(13643015-13643173)
chr8 (104-263)||(13743440-13743598)
chr8 (102-260)||(21595848-21596005)
chr8 (133-276)||(28626800-28626943)
chr8 (128-257)||(9253932-9254060)
chr8 (101-261)||(32113908-32114069)
chr8 (100-259)||(4648194-4648352)
chr8 (101-276)||(29235235-29235411)
chr8 (100-250)||(40831280-40831426)
chr8 (133-276)||(9537834-9537978)
chr8 (104-235)||(17467606-17467737)
chr8 (100-206)||(9278211-9278317)
chr8 (164-263)||(39406905-39407004)
chr8 (133-244)||(10870384-10870495)
chr8 (173-276)||(24843290-24843393)
chr8 (145-248)||(42433583-42433685)
chr8 (104-206)||(10618021-10618123)
chr8 (135-225)||(34192809-34192899)
chr8 (101-178)||(12652630-12652707)
chr8 (152-234)||(22451835-22451916)
chr8 (145-264)||(22956749-22956870)
chr8 (155-233)||(30933376-30933453)
chr8 (195-262)||(14191035-14191102)
chr8 (173-234)||(36057904-36057967)
chr8 (81-168)||(36923782-36923869)
chr8 (101-262)||(39751496-39751658)
chr8 (133-210)||(33124570-33124648)
chr8 (100-192)||(42655370-42655464)
chr8 (109-154)||(2270658-2270703)
chr8 (100-198)||(4811556-4811656)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (95-261)||(22887744-22887910)
chr2 (101-263)||(20552931-20553093)
chr2 (100-262)||(26387089-26387251)
chr2 (101-263)||(31438646-31438808)
chr2 (100-276)||(561528-561705)
chr2 (96-263)||(1859157-1859324)
chr2 (95-265)||(34442554-34442723)
chr2 (100-276)||(2898071-2898247)
chr2 (100-261)||(31390011-31390172)
chr2 (104-263)||(4381798-4381957)
chr2 (100-263)||(30486209-30486372)
chr2 (91-276)||(38590885-38591070)
chr2 (100-263)||(22068344-22068506)
chr2 (96-263)||(44587897-44588064)
chr2 (98-263)||(32360893-32361058)
chr2 (99-263)||(6580187-6580351)
chr2 (100-260)||(32860101-32860260)
chr2 (100-263)||(27856420-27856583)
chr2 (127-261)||(22567628-22567762)
chr2 (104-263)||(3668137-3668295)
chr2 (104-260)||(25782860-25783012)
chr2 (104-254)||(5881221-5881374)
chr2 (101-276)||(5093550-5093724)
chr2 (101-263)||(8969431-8969591)
chr2 (133-276)||(27584770-27584913)
chr2 (100-250)||(11021259-11021408)
chr2 (133-262)||(35851776-35851905)
chr2 (128-261)||(28600994-28601126)
chr2 (101-261)||(43637165-43637324)
chr2 (99-225)||(26891725-26891851)
chr2 (100-276)||(4022489-4022665)
chr2 (133-263)||(13574053-13574183)
chr2 (102-259)||(25772112-25772269)
chr2 (98-255)||(34123057-34123213)
chr2 (96-241)||(38296173-38296317)
chr2 (100-257)||(29102313-29102469)
chr2 (145-260)||(39531868-39531981)
chr2 (145-234)||(15079012-15079100)
chr2 (152-259)||(15146683-15146789)
chr2 (145-249)||(10820528-10820630)
chr2 (127-263)||(20431463-20431600)
chr2 (100-234)||(20252739-20252874)
chr2 (103-192)||(16807318-16807409)
chr2 (103-192)||(16846599-16846690)
chr2 (104-241)||(30834409-30834545)
chr2 (103-192)||(44331741-44331832)
chr2 (133-198)||(30217652-30217718)
chr2 (101-234)||(28012007-28012140)
chr2 (96-179)||(44854305-44854387)
chr2 (145-179)||(35506740-35506774)
chr2 (91-140)||(35470367-35470416)
chr2 (100-192)||(44854434-44854527)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (100-276)||(43202394-43202570)
chr4 (100-264)||(43944506-43944670)
chr4 (100-276)||(47231882-47232059)
chr4 (101-276)||(32217045-32217220)
chr4 (100-276)||(789540-789717)
chr4 (100-260)||(12356243-12356403)
chr4 (101-254)||(3783534-3783687)
chr4 (99-263)||(4089140-4089304)
chr4 (101-276)||(54897308-54897484)
chr4 (100-263)||(16536047-16536210)
chr4 (140-263)||(36395138-36395261)
chr4 (99-262)||(55882682-55882843)
chr4 (100-276)||(33108683-33108859)
chr4 (99-263)||(4268846-4269010)
chr4 (100-263)||(29591188-29591351)
chr4 (91-256)||(52533816-52533981)
chr4 (101-259)||(24679671-24679827)
chr4 (94-256)||(28755614-28755774)
chr4 (99-256)||(18067910-18068067)
chr4 (101-254)||(32202514-32202666)
chr4 (104-276)||(50619089-50619261)
chr4 (128-260)||(54655903-54656035)
chr4 (100-263)||(7768937-7769100)
chr4 (100-247)||(15186242-15186389)
chr4 (133-255)||(4220227-4220348)
chr4 (102-255)||(19503137-19503289)
chr4 (99-257)||(42898774-42898934)
chr4 (106-254)||(39843912-39844060)
chr4 (128-259)||(6164121-6164251)
chr4 (128-263)||(30154187-30154321)
chr4 (127-276)||(53655888-53656038)
chr4 (100-260)||(46148940-46149098)
chr4 (133-257)||(37987967-37988091)
chr4 (101-225)||(54054548-54054672)
chr4 (150-254)||(30387167-30387271)
chr4 (128-259)||(50603254-50603386)
chr4 (100-263)||(41265458-41265620)
chr4 (95-276)||(5091622-5091802)
chr4 (128-261)||(54945805-54945937)
chr4 (145-257)||(53268764-53268875)
chr4 (153-262)||(31517217-31517327)
chr4 (104-256)||(31680494-31680645)
chr4 (99-243)||(49915157-49915301)
chr4 (99-225)||(42815108-42815234)
chr4 (165-263)||(39877271-39877371)
chr4 (100-225)||(46688267-46688397)
chr4 (133-265)||(52697084-52697215)
chr4 (161-263)||(16820912-16821014)
chr4 (128-276)||(1432558-1432701)
chr4 (176-257)||(8133782-8133862)
chr4 (95-265)||(10110021-10110194)
chr4 (180-260)||(53003983-53004063)
chr4 (99-193)||(50167589-50167681)
chr4 (95-192)||(16572581-16572680)
chr4 (145-260)||(17344686-17344800)
chr4 (104-276)||(34151124-34151297)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (101-261)||(5694321-5694481)
chr1 (100-263)||(18043161-18043324)
chr1 (100-276)||(15227738-15227915)
chr1 (100-261)||(47009992-47010153)
chr1 (99-263)||(29657769-29657933)
chr1 (104-263)||(12072086-12072245)
chr1 (100-263)||(51065772-51065935)
chr1 (99-261)||(13961210-13961371)
chr1 (94-263)||(42770014-42770183)
chr1 (108-259)||(6770344-6770495)
chr1 (101-263)||(38162850-38163012)
chr1 (96-276)||(3784723-3784904)
chr1 (100-276)||(9266738-9266915)
chr1 (101-276)||(17333294-17333467)
chr1 (101-259)||(3097659-3097817)
chr1 (95-261)||(30294407-30294573)
chr1 (100-276)||(47532681-47532856)
chr1 (100-259)||(30657607-30657760)
chr1 (96-263)||(45431274-45431440)
chr1 (101-263)||(24178487-24178649)
chr1 (100-261)||(12306917-12307077)
chr1 (96-256)||(19031846-19032006)
chr1 (101-249)||(38335170-38335317)
chr1 (100-263)||(35985645-35985807)
chr1 (98-261)||(48071480-48071642)
chr1 (100-260)||(29683194-29683355)
chr1 (100-276)||(14350289-14350464)
chr1 (100-263)||(41730304-41730470)
chr1 (98-225)||(29210410-29210537)
chr1 (103-263)||(38701961-38702117)
chr1 (100-262)||(51368810-51368972)
chr1 (104-260)||(43286725-43286881)
chr1 (133-260)||(8472941-8473068)
chr1 (134-276)||(50128182-50128325)
chr1 (103-260)||(36446352-36446508)
chr1 (104-262)||(48383136-48383294)
chr1 (133-263)||(45449268-45449398)
chr1 (145-263)||(52431625-52431743)
chr1 (145-255)||(37315300-37315409)
chr1 (102-272)||(30217763-30217932)
chr1 (133-276)||(15282529-15282668)
chr1 (133-261)||(23473490-23473618)
chr1 (133-256)||(52749634-52749757)
chr1 (134-224)||(39497340-39497430)
chr1 (100-208)||(26228194-26228300)
chr1 (133-260)||(35700679-35700804)
chr1 (151-249)||(37503264-37503361)
chr1 (196-263)||(19010711-19010778)
chr1 (101-217)||(28481844-28481955)
chr1 (127-234)||(3838831-3838937)
chr1 (101-259)||(39081803-39081958)
chr1 (102-175)||(19011108-19011180)
chr1 (100-263)||(28725929-28726093)
chr1 (134-203)||(39912363-39912432)
chr1 (102-181)||(10976008-10976087)
chr1 (101-276)||(38595762-38595939)
chr1 (180-230)||(14881036-14881086)
chr1 (152-234)||(16590269-16590349)
chr1 (159-193)||(19011061-19011095)
chr1 (128-193)||(49867456-49867522)
chr1 (107-140)||(12326107-12326140)
chr1 (104-232)||(33644390-33644517)
chr1 (95-167)||(14881086-14881158)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (100-263)||(22960-23123)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (101-263)||(392096-392258)
chr6 (101-276)||(12145127-12145303)
chr6 (101-276)||(35043890-35044064)
chr6 (100-260)||(1391205-1391364)
chr6 (100-276)||(23402137-23402314)
chr6 (99-263)||(29451139-29451302)
chr6 (100-263)||(32929532-32929695)
chr6 (133-276)||(25165423-25165567)
chr6 (100-263)||(3515765-3515928)
chr6 (104-263)||(32985217-32985376)
chr6 (128-276)||(13416970-13417121)
chr6 (103-259)||(2350654-2350810)
chr6 (100-263)||(4215694-4215857)
chr6 (100-255)||(7851191-7851346)
chr6 (101-276)||(29978233-29978407)
chr6 (133-276)||(26467134-26467278)
chr6 (100-260)||(3026036-3026194)
chr6 (99-256)||(27433490-27433647)
chr6 (100-263)||(12525718-12525881)
chr6 (143-256)||(961051-961164)
chr6 (100-225)||(20897947-20898072)
chr6 (128-263)||(18276636-18276774)
chr6 (101-260)||(28225221-28225379)
chr6 (100-216)||(34396598-34396714)
chr6 (105-260)||(34851876-34852030)
chr6 (101-235)||(21878399-21878533)
chr6 (133-257)||(2580984-2581108)
chr6 (128-225)||(34477612-34477709)
chr6 (128-263)||(11115121-11115254)
chr6 (128-263)||(1840271-1840406)
chr6 (101-256)||(23629607-23629761)
chr6 (97-276)||(31280317-31280491)
chr6 (134-263)||(5323433-5323562)
chr6 (103-235)||(9660988-9661120)
chr6 (3-100)||(9524661-9524758)
chr6 (99-200)||(13529453-13529554)
chr6 (211-263)||(22417303-22417355)
chr6 (134-262)||(24227413-24227546)
chr6 (134-210)||(11633951-11634028)
chr6 (100-172)||(14559921-14559993)
chr6 (145-192)||(10431780-10431827)
chr6 (103-192)||(22021633-22021724)
chr6 (151-263)||(1127866-1127978)
chr6 (134-210)||(11616208-11616285)
chr6 (102-193)||(28562682-28562772)
chr6 (96-142)||(34712271-34712317)
chr6 (100-263)||(34706719-34706883)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (101-260)||(43594063-43594222)
chr7 (100-263)||(24798427-24798589)
chr7 (101-263)||(24438477-24438639)
chr7 (99-255)||(5239283-5239439)
chr7 (101-255)||(8754617-8754771)
chr7 (96-276)||(1736975-1737155)
chr7 (94-263)||(12218460-12218629)
chr7 (100-276)||(29993497-29993674)
chr7 (96-276)||(34606256-34606437)
chr7 (100-263)||(7689224-7689387)
chr7 (104-276)||(11686333-11686507)
chr7 (102-257)||(28587911-28588065)
chr7 (128-263)||(30810682-30810817)
chr7 (100-262)||(4628565-4628727)
chr7 (133-263)||(45045802-45045932)
chr7 (99-263)||(23363191-23363354)
chr7 (122-257)||(47083076-47083211)
chr7 (102-276)||(47656981-47657153)
chr7 (100-262)||(5729345-5729507)
chr7 (100-276)||(18485960-18486137)
chr7 (99-275)||(28262029-28262201)
chr7 (98-263)||(47839490-47839654)
chr7 (100-263)||(34333283-34333445)
chr7 (141-276)||(42044304-42044439)
chr7 (104-272)||(18117147-18117314)
chr7 (96-226)||(27456174-27456303)
chr7 (101-261)||(13064902-13065061)
chr7 (151-265)||(37674126-37674240)
chr7 (128-262)||(33636479-33636613)
chr7 (128-276)||(525086-525234)
chr7 (99-263)||(23357734-23357895)
chr7 (100-225)||(34546376-34546501)
chr7 (105-261)||(46716642-46716798)
chr7 (99-228)||(37631601-37631730)
chr7 (133-255)||(29835735-29835858)
chr7 (128-262)||(22739851-22739985)
chr7 (133-255)||(4100557-4100678)
chr7 (133-232)||(36437409-36437507)
chr7 (101-234)||(18469993-18470126)
chr7 (151-234)||(20116940-20117022)
chr7 (145-263)||(18220695-18220812)
chr7 (102-232)||(4087626-4087752)
chr7 (176-239)||(47118037-47118100)
chr7 (103-170)||(22973600-22973667)
chr7 (133-211)||(3021923-3022000)
chr7 (103-275)||(19434495-19434668)
chr7 (133-232)||(18220495-18220592)
chr7 (163-243)||(13556474-13556553)
chr7 (145-193)||(18220625-18220673)
chr7 (104-140)||(48256749-48256785)
chr7 (101-156)||(47118095-47118150)
chr7 (96-207)||(30924069-30924182)
chr7 (91-265)||(34556912-34557086)
chr7 (98-232)||(45842827-45842962)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (101-263)||(825-987)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (95-263)||(116198-116366)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (101-263)||(14896-15058)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (98-255)||(675-832)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (101-261)||(50548-50708)
scaffold0045 (127-276)||(53367-53506)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (102-263)||(6134-6295)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (99-256)||(53716-53873)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (100-268)||(68309-68477)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (100-259)||(146933-147092)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (101-260)||(25719-25877)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (134-277)||(40952-41096)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (128-276)||(69253-69401)
scaffold0050 (101-260)||(33709-33866)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (133-276)||(19595-19739)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (138-256)||(17502-17619)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (128-225)||(7959-8056)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (128-225)||(7315-7412)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (99-259)||(291-450)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (162-262)||(10771-10871)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (104-256)||(95616-95767)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (97-225)||(11032-11158)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (166-256)||(233918-234008)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (101-234)||(74526-74659)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (133-198)||(5071-5136)
[»] scaffold1128 (1 HSPs)
scaffold1128 (145-192)||(1415-1462)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (129-257)||(66426-66555)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40362767 - 40362604
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40362767 agggaaatgctaacccgtgcctccggggcactgattaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataat 40362668  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40362667 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 40362604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 48725271 - 48725433
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48725271 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 48725370  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48725371 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 48725433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 46352633 - 46352810
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46352633 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 46352732  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  46352733 aaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtt 46352810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 858588 - 858751
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  858588 agggaaatgcaaaccggtgcccccagtgcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 858687  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  858688 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccc 858751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Original strand, 4168183 - 4168338
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4168183 gggaaatgctaaccggtgcctccggggaactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 4168282  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168283 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacc 4168338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 52520680 - 52520843
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52520680 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 52520779  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52520780 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccc 52520843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 272217 - 272382
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  272217 ttagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 272316  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  272317 ataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcggtgccc 272382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 49893329 - 49893493
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  49893329 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataa 49893428  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49893429 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgccc 49893493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 43786871 - 43787033
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43786871 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43786970  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43786971 atatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccc 43787033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 41304001 - 41304165
Alignment:
Q  97 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41304001 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaat--tgtaattaattgat 41304098  T
Q  197 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41304099 aataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccaatgccc 41304165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 39074419 - 39074580
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39074419 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 39074518  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39074519 atgtc-aaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 39074580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41554127 - 41553964
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41554127 taggaaaatgctaactggtgcc-ccggtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 41554029  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  41554028 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattattttttatggtatgcttaacaagtgccc 41553964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42964434 - 42964276
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42964434 ggaaatgttaactggtgcttccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 42964335  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42964334 agtcaaaaacagttttcttttatagtaataattcacttttatgatatgcttaaccagtg 42964276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Original strand, 7468417 - 7468585
Alignment:
Q  105 aatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagt 204  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7468417 aatgctaaccgg--cccccgggacactggttaaggaaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagt 7468514  T
Q  205 caaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  7468515 caaaagcagttttcttttatgataataa-tcccttttatggtatgcttaatcagtgccccggagcaccggtt 7468585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 260
Target Start/End: Original strand, 20923992 - 20924151
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20923992 gggaaatgctaaccggtgcttccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgtaattaatttataata 20924091  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20924092 atatcaaaaacagtttccttttaaggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtg 20924151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10617469 - 10617308
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10617469 gggaaatgttaaccggtgcccccgga-cactgattaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 10617371  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10617370 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 10617308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 257
Target Start/End: Original strand, 22248913 - 22249042
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22248913 cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttattgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatggt 22249012  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  22249013 aataattcccttttatagtatgcttgacca 22249042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53490012 - 53489848
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctcc--ggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53490012 gggaaatgctaatcggtgcccccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa 53489913  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53489912 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattctattttatggtatgcttaaccaatgccc 53489848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 18014671 - 18014834
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18014671 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactgattaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataat 18014770  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18014771 aaagttaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaatcagtgccc 18014834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 2505350 - 2505511
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2505350 gggaaatgctaaccgctgc-tcctggacattggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaattgtgtaattaattcataata 2505448  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2505449 aagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgccc 2505511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43269923 - 43269749
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 202  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43269923 gaaatgttaaccggtgccttcggagcactggttaaggatatgaaaagggaaattacatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaa 43269824  T
Q  203 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
     ||||| ||||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43269823 atcaaacacagtttccttttatagtaataattatcctttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggtt 43269749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 128 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50359345 - 50359196
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  50359345 cactggttaaggttaagaaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgggtaattaatatataataaagtcaaaaacagttttcttttgtggt 50359246  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50359245 aataattatcttctatggtatgcttaaccagtgtcccggaagcaccggtt 50359196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Original strand, 28139309 - 28139469
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28139309 gggaaatgctaactggtgcccccaagacactggttaaggatatgaaaaaagaaattaaatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 28139408  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  28139409 aagtcaaaagcagattccttttatggtaataattcccttttatggtatacttaaacagtgc 28139469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 38852216 - 38852379
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagt---taatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38852216 gggaaatgctaaccggtccc--cgggacattcgttaaggatataaaaaatgaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 38852313  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38852314 ataaagtcaaaaacagttttattttatgataataattcacttttatggtatgtttaacccgtgccc 38852379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Original strand, 52246582 - 52246746
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52246582 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagttgttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 52246681  T
Q  201 aagtcaaaaac-agttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccg 264  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52246682 aagtcaaaaacaattttttttttatagtaataatttccttttatggtatgcttaactagtgcccg 52246746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11308397 - 11308235
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11308397 agggaaatgctaaccggtgtttccgggacactgattaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataat 11308298  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11308297 aaaatcaaaaatagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccaatgccc 11308235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Original strand, 13159896 - 13160055
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13159896 agggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataat 13159995  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  13159996 aaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagt 13160055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Original strand, 42548128 - 42548255
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||    
T  42548128 ttaaagatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttcattttatggtaataat 42548227  T
Q  234 tctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  42548228 tcccttttatggtatgcttaaccagtgc 42548255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 50395742 - 50395591
Alignment:
Q  107 tgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtca 206  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50395742 tgctaaccggtgcccccgggacactggttagggatatgaaaaagaaaattatacagtagttaatgcatagaaattgtgtaattaattgataataaagtc- 50395644  T
Q  207 aaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  50395643 aaaacaatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgattaatcagt 50395591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41993773 - 41993652
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41993773 gttaagtatattaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttat-ataataa 41993675  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41993674 ttctcttttatggtatgcttaac 41993652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 276
Target Start/End: Original strand, 33140937 - 33141061
Alignment:
Q  153 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgctt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  33140937 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatggtaataattcccttttatgatatgctt 33141036  T
Q  253 aaccagt-gcccggaagcaccggtt 276  Q
    || ||||  ||||||||||||||||    
T  33141037 aatcagtaccccggaagcaccggtt 33141061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Original strand, 29241668 - 29241790
Alignment:
Q  132 agttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataata 231  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  29241668 agttaaggatatgaaaatggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattctttttatgataata 29241767  T
Q  232 attctcttttatggtatgcttaa 254  Q
    ||||  |||||| ||||||||||    
T  29241768 attccgttttatagtatgcttaa 29241790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 263
Target Start/End: Original strand, 6842676 - 6842781
Alignment:
Q  158 tatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6842676 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaacca 6842775  T
Q  258 gtgccc 263  Q
    ||||||    
T  6842776 gtgccc 6842781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 50299080 - 50298973
Alignment:
Q  152 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgct 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  50299080 aaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataataattcactcttatggtatact 50298981  T
Q  252 taaccagt 259  Q
    ||||||||    
T  50298980 taaccagt 50298973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 2119458 - 2119577
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  2119458 cactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgagtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatg-t 2119556  T
Q  228 aataattctcttttatggtatg 249  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  2119557 aataattc-cttttatggtatg 2119577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 276
Target Start/End: Original strand, 24488393 - 24488542
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| |||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  24488393 cactggttaagaatgtaaaaaaggaaattatataatagttaatgcatggaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttctttttatggt 24488492  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  24488493 aataattctcttttatgatatgctgaactagtgctccgggagcaccggtt 24488542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49529422 - 49529291
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatata---gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  49529422 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatactagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacattttccttttatggtaat 49529323  T
Q  231 aattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49529322 aatttccttttatggtatgtttaaccagtgcc 49529291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2938194 - 2938072
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  2938194 gttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacaatttcattttatggtaataa 2938095  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  2938094 ttcacttttatggtatgcttaac 2938072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 276
Target Start/End: Original strand, 31514829 - 31514965
Alignment:
Q  139 gatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctct 238  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||  ||    
T  31514829 gatatgaaaaataaaattatatagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttt-ttttatagtaataatttcct 31514927  T
Q  239 tttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  31514928 tttatagtatacttaaccagtacccagaagtaccggtt 31514965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 2362882 - 2362955
Alignment:
Q  151 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2362882 gaaattatata-tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagttttcttttatg 2362955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Original strand, 52552549 - 52552637
Alignment:
Q  176 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgg 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  52552549 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacag-tatcttttatggtaataattctcttttatggtatatttaaccagtgtccgg 52552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 186
Target Start/End: Original strand, 52718167 - 52718252
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgta 186  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52718167 agggaaatactaatcggtgctcccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattaaaattgtgta 52718252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 273
Target Start/End: Original strand, 53054834 - 53054975
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagtt---aatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 230  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||   |||||  |||||    
T  53054834 ttaatgatatgaataatgaaattatatagtaattcttaatgcattgagattgtgtaatttatctataataaagccaaaaatagttca-ttttacaataat 53054932  T
Q  231 aattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccg 273  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  53054933 aattctcttttatagtatgtttaaccaatgcccgagagcaccg 53054975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 182
Target Start/End: Original strand, 2391634 - 2391688
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 182  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2391634 cactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2391688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 182
Target Start/End: Original strand, 2393395 - 2393449
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 182  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2393395 cactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2393449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 232
Target Start/End: Original strand, 21010041 - 21010124
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  21010041 aaaaaggaaattatatagtagttaa--cattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaa-agtttctttttatggtaataa 21010124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 25743854 - 25743967
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttat 243  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  |||| |  ||||||||  ||||| |    
T  25743854 aaaaaggaaattatatagtaattattgcattaaaaattgtgtaattaattcataa-aaagtcaaaatc-gtttcattttttagtaataatttcctttttt 25743951  T
Q  244 ggtatgcttaaccagt 259  Q
    ||||||||||||||||    
T  25743952 ggtatgcttaaccagt 25743967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 200
Target Start/End: Original strand, 6842604 - 6842642
Alignment:
Q  162 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6842604 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36953285 - 36953207
Alignment:
Q  115 ggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   || ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36953285 ggtgcctccggagcactagttaaggatgctaagaaagagataatataatagttattgcattgaaaattgtgtaattaat 36953207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 161
Target Start/End: Original strand, 2362796 - 2362861
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatata 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2362796 tttttgggaaatgctaaccggtgctcccggtgcaatggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 2362861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 23925274 - 23925359
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaat 180  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||   ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23925274 atttttgggaaatgctaactggtacccccggggaactggttaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaat 23925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Original strand, 17752736 - 17752842
Alignment:
Q  152 aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 250  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||  ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17752736 aaatcatatagtatttattgcgttgaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcataat-agttttcttttacaataataattcccttttttggtatgc 17752833  T
Q  251 ttaaccagt 259  Q
    |||| ||||    
T  17752834 ttaatcagt 17752842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Original strand, 19054056 - 19054162
Alignment:
Q  152 aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 250  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||  ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19054056 aaatcatatagtatttattgcgttgaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcataat-agttttcttttacaataataattcccttttttggtatgc 19054153  T
Q  251 ttaaccagt 259  Q
    |||| ||||    
T  19054154 ttaatcagt 19054162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Original strand, 26966540 - 26966588
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  26966540 aaaaaagaaattatatagtagttattgcattgaaaattgtttaattaat 26966588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27994486 - 27994394
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||    
T  27994486 gggaaatgttaaccgatgcccccggggcactggttaaggatactaaaaaagaaattttatagtaattaatgtagtgaaaattatgtaattaat 27994394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16990818 - 16990728
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 192  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  16990818 ggaaatgctaaccggtacctacagaacacg-gttaaggatgataaaaaaggaaattagataatagttattgcattaaaaatgtgtaattaat 16990728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Original strand, 31436313 - 31436393
Alignment:
Q  152 aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  31436313 aaattatatagtaattattgcattaaaaattgtgtaattaattcataaataagtcaacaa-aattttcttttatggtaataa 31436393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 13661807 - 13661984
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13661807 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 13661906  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  13661907 aaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtt 13661984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 35132521 - 35132683
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35132521 agggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 35132620  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35132621 aaagtcaaaaacagttttc-tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccc 35132683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 6283562 - 6283724
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6283562 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactagttaaagatatgaaaaagaaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6283661  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6283662 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcatttttatggtatgcttaaccagtgccc 6283724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 12506296 - 12506458
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12506296 gggaaatgctaaccggtgcctctggagcactcgttaagagtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 12506395  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12506396 atgtcaaaaacagtttccttttatagtaataattctcttttatggaatgcttaaccagtgccc 12506458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34651018 - 34650857
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34651018 gggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 34650920  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34650919 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 34650857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35504426 - 35504251
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35504426 gggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 35504327  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    | |||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  35504326 atgtcaaaaacagttcccttttatggcaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgtccgggggcaccggtt 35504251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11958153 - 11957991
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11958153 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcaatgaaattgtgtaattaattgataata 11958054  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11958053 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggcatgcttaaccagtgccc 11957991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 261
Target Start/End: Original strand, 20175228 - 20175387
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20175228 ggaaatgctaaccggtgtctccgagacactggttaaaaatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 20175327  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  20175328 agtcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttataatatgcttaactagtgc 20175387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 8787338 - 8787501
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8787338 agggaaatgctaaccggtgtccccggggcattggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 8787437  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8787438 aatatcaaaaacagtttccttttatgataataattccattttatggtatgcttaacctgtgccc 8787501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40564590 - 40564434
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40564590 tagggaaatgctaaccggtg--tccgggacatcgattaaggatttgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 40564493  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40564492 taaagtcaaaaacaatttttttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacca 40564434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 11846075 - 11846234
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11846075 aaatgctaagcggtgtccccgggacactagctaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaag 11846174  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||  ||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11846175 tcaaaagtagtttccttttatggtaataaatcccttttatagtatgcttaaccagtgccc 11846234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21547548 - 21547422
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||    
T  21547548 gttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttaagttaataa 21547449  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21547448 ttctcatttatggtatgcttaaccagt 21547422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9721761 - 9721640
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9721761 gttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 9721662  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaa 254  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  9721661 ttcccttttatggtatgtttaa 9721640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10054539 - 10054377
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10054539 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 10054440  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  10054439 aatgtc-aaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccc 10054377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Original strand, 31909631 - 31909784
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31909631 agggaaatgttaaccggtgcctccggat-actggttaaggatattaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataat 31909729  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    ||||||||||||||||| |     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31909730 aaagtcaaaaacagtttcc-----tgataataattttcttttatggtatgcttaaccagt 31909784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 225
Target Start/End: Original strand, 10069969 - 10070092
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10069969 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataata 10070067  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    
T  10070068 aagtcaaaaacagtttctttttatg 10070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 13470150 - 13470283
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13470150 agggaaatgctaaccggtgcctatggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaataatatagtagtcaatgcattgaaattgtataattaatttataat 13470249  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13470250 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 13470283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19647841 - 19647720
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19647841 aaatgctaaccggtatctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaag 19647742  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  19647741 tcataaacagtttccttttatg 19647720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19437019 - 19436865
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||| |||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  19437019 aaatgttaaccgatgtctctgggacactcgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtggttaaagcattgaaattgtataattaatttat-ataaag 19436921  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19436920 ttaaaaatagtttt-ttttatggtaataattctcttttatggtatgtttcaccagtg 19436865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39067096 - 39066973
Alignment:
Q  127 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagt-agttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  39067096 acactggttaaggatatgaaaaaagaaattatataattagttaatatattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatatccttttatg 39066997  T
Q  226 ataataattctcttttatggtatg 249  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  39066996 gtaataattctcttttatgttatg 39066973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 259
Target Start/End: Original strand, 10955948 - 10956109
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaaga-aattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||| |||  | |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10955948 ttagggaaatgctaactgttgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattataaagtagttaatgcattgaaattgt-taattaatttat 10956046  T
Q  197 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  10956047 aacaaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaaccagt 10956109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Original strand, 40057340 - 40057466
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  40057340 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaatagtataattaatttataataaaatcaaaagcagttttcttttatagtaatatt 40057439  T
Q  234 tctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    || |||||||| | || ||||||||||    
T  40057440 tcccttttatgatgtgtttaaccagtg 40057466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2619742 - 2619635
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2619742 ggaaatgctaactggtgtctccgggacacttgttaaggatatgaaaaagaaaattatttagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 2619643  T
Q  202 agtcaaaa 209  Q
    ||| ||||    
T  2619642 agttaaaa 2619635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Original strand, 4837257 - 4837369
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4837257 agggaaatgttaaccggtgcc-ccggggcaccggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 4837355  T
Q  200 aaagtcaaaaacag 213  Q
    ||||||||| ||||    
T  4837356 aaagtcaaatacag 4837369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Original strand, 39069374 - 39069527
Alignment:
Q  94 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  39069374 aatttaagggaaatgctaaccggtgcttccagggcactggttaagggtatgaaaag-gaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattatat 39069472  T
Q  194 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 250  Q
     |||||   || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39069473 aataat--tgtgaaaaacaatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgc 39069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 4268620 - 4268716
Alignment:
Q  159 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4268620 atagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataaaaaa-taaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatgcttaacc 4268716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Original strand, 6284821 - 6284892
Alignment:
Q  127 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6284821 acactggttaaggatactaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtataattaatttataa 6284892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21945048 - 21944954
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  21945048 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatattaattattgcattaaaaattgtttaattaat 21944954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40608722 - 40608619
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  40608722 gggaaatgctaaccggtgctcccgggacactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 40608623  T
Q  199 taaa 202  Q
    ||||    
T  40608622 taaa 40608619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10956009 - 10955975
Alignment:
Q  229 ataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10956009 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 10955975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 249
Target Start/End: Original strand, 22973739 - 22973832
Alignment:
Q  155 ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 249  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||    
T  22973739 ttatatagtaactaatgaattaaaattgtgtaattaatttatca-aaagtataaaagagtttccttttatgataataaatttcatttttggtatg 22973832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6042207 - 6042142
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    |||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6042207 cactggttaaagatactaaaaaaaaaattatatagtaattattgcattgaaaattgtgtaattaat 6042142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5302422 - 5302374
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  5302422 aaaaaagaaattatataatagttattgtattgaaaattgtgtaattaat 5302374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27988686 - 27988510
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27988686 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 27988587  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27988586 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggtt 27988510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28045988 - 28045812
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28045988 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 28045889  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28045888 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggtt 28045812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 11112638 - 11112801
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11112638 agggaaatgctaactggtgcatccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 11112737  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11112738 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcacttttatggtatgcttaacctgtgccc 11112801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33357316 - 33357153
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33357316 agggaaatgctaactggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 33357217  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33357216 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaactagtgccc 33357153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 34228682 - 34228844
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34228682 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 34228781  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34228782 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 34228844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4537931 - 4537768
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4537931 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaataggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattgataat 4537832  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4537831 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccc 4537768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 36730442 - 36730619
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36730442 ttaggggaatgctaactggtgccccagga-cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 36730540  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  36730541 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatagtatgcttaacctgtgccccgtggcaccggtt 36730619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 168465 - 168628
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  168465 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 168564  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  168565 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccaatgccc 168628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Original strand, 37373206 - 37373360
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373206 gggaaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 37373304  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37373305 aagtcgaaaacagttttcttttatggtaataattccctttcatggtatgcttaacc 37373360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20831737 - 20831579
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 202  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  20831737 gaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtataattaatttataataaa 20831638  T
Q  203 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20831637 gtcaaaagcagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgc 20831579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30675758 - 30675597
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30675758 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 30675659  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30675658 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtgccc 30675597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9063238 - 9063062
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  9063238 agggaaatgctaaccggtgtc-ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtgcaattaatttataat 9063140  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9063139 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttgtgatatgcttaaccagtgccccggaagcaccggtt 9063062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 102 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16888728 - 16888568
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16888728 ggaaatgctaaccggtgcccccggg-cacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 16888630  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16888629 agtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttgtggtatgcttaaccaatgccc 16888568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 16785077 - 16785248
Alignment:
Q  91 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatta 190  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16785077 ataattttaagggaaatgctaaccggtgc-tccagggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaatta 16785175  T
Q  191 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16785176 atttataataaagtcaaaaacagtttccttttataataataattctcttttatggtatgattaacccgtgccc 16785248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16394247 - 16394085
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16394247 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataata 16394148  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16394147 aagtcaaaaacagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccc 16394085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 260
Target Start/End: Original strand, 12203853 - 12204013
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12203853 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggt-accggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 12203951  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12203952 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtg 12204013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 260
Target Start/End: Original strand, 12448281 - 12448441
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12448281 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggt-accggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 12448379  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12448380 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtg 12448441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2805446 - 2805270
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  2805446 gggaaatgttaaccagtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaacctataata 2805347  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2805346 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggtt 2805270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3930423 - 3930257
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3930423 ttttagggaaatgctaatcggtgcccccggg-cactagttaataatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgcattgaagttgtgtaattaattga 3930325  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3930324 taataaagtcaaaaacagtttccttttttgataataatttccttttatgatatgcttaaccagtgccc 3930257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7304671 - 7304544
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7304671 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgaaaataat 7304572  T
Q  234 tctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7304571 tctcttttatggtatgcttaaccagtgc 7304544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Original strand, 43119214 - 43119373
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43119214 ttagggaaatgctaaccggtgccctcggggcactgattaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttata 43119313  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43119314 ataaagtcaaaaacagttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaacca 43119373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16890635 - 16890505
Alignment:
Q  132 agttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataata 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16890635 agttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 16890536  T
Q  232 attctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16890535 attcctttttatggtatgcttaaccggtgcc 16890505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29444323 - 29444153
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||| ||||||||||  ||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29444323 aaatgttaaccggtgctcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaacgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 29444224  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  29444223 tcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccg 29444153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42035154 - 42035013
Alignment:
Q  114 cggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag 213  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42035154 cggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaa 42035055  T
Q  214 ttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42035054 ttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 42035013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 13643015 - 13643173
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13643015 aaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaag 13643114  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13643115 tcaaaaa-aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 13643173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 13743440 - 13743598
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13743440 aaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaag 13743539  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743540 tcaaaaa-aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 13743598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Original strand, 21595848 - 21596005
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21595848 ggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataggagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 21595946  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21595947 tgtcaaaaacagtttccttttatggtattaattcccttttatggtatgcttaaccagtg 21596005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Original strand, 28626800 - 28626943
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28626800 gttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataataa 28626899  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  28626900 ttcccttttatggtatgcttaatcagtgtccgggagcaccggtt 28626943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 128 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9254060 - 9253932
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  9254060 cactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat-gataataaagtcaaaaacagtttccttttatagt 9253962  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9253961 aataattctcttttatggtatgcttaacca 9253932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Original strand, 32113908 - 32114069
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32113908 gggagatgctaaccggtgtctccggagtattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtttaattaatttataata 32114007  T
Q  201 aagtcaaaaacagttt-tcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  32114008 aagtaaaaaacagtttcccttttatgataataattcccttttatagtatgtttaaccagtgc 32114069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Original strand, 4648194 - 4648352
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4648194 agggaaatgctaaccggtgtc-ccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 4648292  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    || ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4648293 aatgtcaaaaacagtttcttttgatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagt 4648352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 29235235 - 29235411
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  29235235 gggaaatgctaaccggtgttcccggagcattgattaaggatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaatttgtgtaattaatttataata 29235334  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    || ||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  29235335 aaatcaaaaataggttccttttatgataataatttccttttataggatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggtt 29235411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 250
Target Start/End: Original strand, 40831280 - 40831426
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40831280 agggaaatgctaaccagtgcc--cgg--cactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 40831375  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  40831376 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattttcttttatagtatgc 40831426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9537978 - 9537834
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||||  ||||||    
T  9537978 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaggagtttctttttatagtaataa 9537879  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  9537878 tttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacaccggtt 9537834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 17467606 - 17467737
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17467606 aaatgctaaccggtacccccgaaacactagttaatgatatgaaaaaggaaattatgcagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaaa 17467705  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattc 235  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  17467706 tcaaaaacaatttccttttactataataattc 17467737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 9278211 - 9278317
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9278211 agggaaatgctaactggtgcctcagggacactcgttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 9278310  T
Q  200 aaagtca 206  Q
    |||||||    
T  9278311 aaagtca 9278317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 263
Target Start/End: Original strand, 39406905 - 39407004
Alignment:
Q  164 agttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39406905 agttaatgcgttaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaactagtgccc 39407004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 244
Target Start/End: Original strand, 10870384 - 10870495
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10870384 gttaatgatataaaaaagaaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggtaataa 10870483  T
Q  233 ttctcttttatg 244  Q
    ||| ||||||||    
T  10870484 ttcccttttatg 10870495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24843393 - 24843290
Alignment:
Q  173 attgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcacc 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||    
T  24843393 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttccttttatgacaataattctcttttatggtatgcttaatcagtattcgggagcacc 24843294  T
Q  273 ggtt 276  Q
    ||||    
T  24843293 ggtt 24843290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42433685 - 42433583
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 244  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  42433685 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttttg 42433587  T
Q  245 gtat 248  Q
    ||||    
T  42433586 gtat 42433583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 10618021 - 10618123
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10618021 aaatgctaaccggtgcctctagggcacaggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcaattaaattgtgtaattaattgataataaag 10618120  T
Q  204 tca 206  Q
    |||    
T  10618121 tca 10618123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 225
Target Start/End: Original strand, 34192809 - 34192899
Alignment:
Q  135 taaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  34192809 taagaatatgaaaaaggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataattttattttatg 34192899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 178
Target Start/End: Original strand, 12652630 - 12652707
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12652630 gggaaatgctaaccggtgcccctggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaa 12652707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 22451835 - 22451916
Alignment:
Q  152 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  22451835 aaattatatagcagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaatagcttccttttatggtaataatt 22451916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 264
Target Start/End: Original strand, 22956749 - 22956870
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt--ctctttta 242  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  || |||||    
T  22956749 aaaaaaggaatcatatggtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaaaaattccctttttta 22956848  T
Q  243 tggtatgcttaaccagtgcccg 264  Q
    ||||||| ||||  ||||||||    
T  22956849 tggtatgtttaataagtgcccg 22956870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30933453 - 30933376
Alignment:
Q  155 ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30933453 ttatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagttaaaaacatttttcttttacgataataat 30933376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14191102 - 14191035
Alignment:
Q  195 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14191102 ataataaaatcaaaaacagttttattttatgataataattctcttttatagtatttttaaccagtgcc 14191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36057967 - 36057904
Alignment:
Q  173 attgaaattgtgtaattaattgataataa--agtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36057967 attgaaattgtataattaatttataaaaagtagtcaaaaaaagttttcttttatgataataatt 36057904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36923869 - 36923782
Alignment:
Q  81 aatgttgtggataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagtta 168  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36923869 aatgatgtgaataaagtttggggaaatactaaccgctgcctccgaggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtta 36923782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39751658 - 39751496
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||  ||||    
T  39751658 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatattatttattgcattaaaaattgtttaattaatctataa 39751559  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
      ||||||| || |  || |||||||| ||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  39751558 ataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcc 39751496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33124648 - 33124570
Alignment:
Q  133 gttaaggata-tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 210  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  33124648 gttaaggatacttaaaaaggaagttatatagtagttattgcattgaaaattgtgtaatcaatttataa-aaagtcaaaaa 33124570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42655464 - 42655370
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  42655464 agggaaatgctaagtggtgcctccggagcacttgttaaggataatgaaaaggtaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaat 42655370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2270703 - 2270658
Alignment:
Q  109 ctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||    
T  2270703 ctaaccggtgcctccggagcactcgttaagcatataaaaaaagaaa 2270658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Original strand, 4811556 - 4811656
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |  |||  |||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  4811556 agggaaatgctaatcggtgcctcaagggcaccggttaagaatactaaaaaagaaaattatatagtaattattgcattgaaaattgtataattaattcata 4811655  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  4811656 a 4811656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 95 - 261
Target Start/End: Original strand, 22887744 - 22887910
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22887744 attttagggaaatgctaaccgatgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattt 22887843  T
Q  195 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22887844 ataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 22887910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 20552931 - 20553093
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20552931 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 20553030  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20553031 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 20553093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26387251 - 26387089
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26387251 agggaaatgctaactggtgcctccgaagtacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 26387152  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26387151 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcc 26387089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 31438646 - 31438808
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31438646 gggaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 31438745  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31438746 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 31438808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 561705 - 561528
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  561705 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 561606  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  561605 aaagtcaaaatcagtttccttttataataataattctcttttatggtatgcttaatcagtaccccggaggcaccggtt 561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 1859157 - 1859324
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||   | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1859157 ttttagggaaatgctaactggtgcccccggggtaatggttaaggatataaaaaaagaaattgtatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattta 1859256  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859257 taataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 1859324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34442723 - 34442554
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34442723 atttaagggaaatgctaaccggtgcc-ccggggcacatgttaaggatatgaaaaagaagattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 34442625  T
Q  195 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34442624 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgg 34442554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 2898071 - 2898247
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2898071 agggaaatgttaaccggtgtc-ccggaacactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 2898169  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  2898170 aaagtcaaaaacagttttcttctatcataataattctcttttatggtatgtttaatcagtgtcccggaggcaccggtt 2898247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 261
Target Start/End: Original strand, 31390011 - 31390172
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31390011 agggaaatgctaactggtgcctccggggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataat 31390110  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31390111 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgc 31390172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 4381798 - 4381957
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4381798 aaatgctaaccggtgcccccggtgcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 4381897  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4381898 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgccc 4381957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 30486209 - 30486372
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||    
T  30486209 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 30486308  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30486309 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 30486372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38591070 - 38590885
Alignment:
Q  91 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatta 190  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38591070 ataaaattaagggaaatgctaaccggtgtccctggggcactggttaagaatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgtattaaaattgtgtaatta 38590971  T
Q  191 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  38590970 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgaggcaccggtt 38590885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22068506 - 22068344
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22068506 agggaaatgctaacaagtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattatatagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataat 22068408  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22068407 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 22068344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 44587897 - 44588064
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44587897 tttttgggaaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattta 44587996  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44587997 taataaagtaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccc 44588064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32361058 - 32360893
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  32361058 ttagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatataattaattgata 32360959  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32360958 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccc 32360893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 6580187 - 6580351
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6580187 tagggaaatgctaaccagtgccccgggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 6580286  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6580287 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 6580351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Original strand, 32860101 - 32860260
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32860101 agggaaatgttaaccggtgccccgggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 32860200  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32860201 aaagtcaaaaacagtttccttttatg-taataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 32860260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27856583 - 27856420
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27856583 agggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 27856484  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27856483 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccc 27856420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 127 - 261
Target Start/End: Original strand, 22567628 - 22567762
Alignment:
Q  127 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  22567628 acactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatgg 22567727  T
Q  227 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22567728 taataattctcttttatggtatgcttaacccgtgc 22567762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3668295 - 3668137
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3668295 aaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaagggtatggaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 3668197  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3668196 tcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgtttaaccagtgccc 3668137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25783012 - 25782860
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25783012 aaatgctaaccggtgccccaaga-cactagttaagaatatgaaaaaggaaattatatagt---taatgcattgaaattgtgtaattattttataataaag 25782917  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25782916 tcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtg 25782860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 254
Target Start/End: Original strand, 5881221 - 5881374
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgc----attgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5881221 aaatgctaaccggtgtc-ccggagcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 5881319  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaa 254  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5881320 aaagtcaaaaagagtttccttttatgataataattatcttttatggtatgcttaa 5881374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5093724 - 5093550
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5093724 gggaaatgctaactggtttctc-ggagcactagttaaggatatgaaaaaggaaattaaatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 5093626  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||    
T  5093625 aagtcaaaagcaatttccttttatgataataatttccttttatggtatgtttaactagtgccccggggcaccggtt 5093550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8969591 - 8969431
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8969591 gggaaatgctaaccagtgccccggg--cactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtaattaatttataata 8969494  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8969493 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgcttaactagtgccc 8969431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Original strand, 27584770 - 27584913
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  27584770 gttaaggatatgaaaagggaaattatatagtagttaaagcattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaagcagtttccttttatggtaataa 27584869  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27584870 ttctcattcatggtatacttaaccagtgcccggaagcagcggtt 27584913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11021408 - 11021259
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11021408 agggaaatgttaactggtgcctc-ggagcactgattaaagatatgaaaaaagaaattatatggtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatatataat 11021310  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  11021309 aaagtcaaaaacagttttcttttgtggtaataattcccttttatggtatgc 11021259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35851905 - 35851776
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  35851905 gttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcattttatggtaataa 35851806  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35851805 ttctcttttatggtatgcttaaccaatgcc 35851776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Original strand, 28600994 - 28601126
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |    
T  28600994 cactggttaaggatatgaaaaagggaattataaagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagttaaaaacagtttctttttatggt 28601092  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28601093 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 28601126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Original strand, 43637165 - 43637324
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43637165 gggaaatgctaaccggtgcc-ccgagacactggttaaggatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43637263  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  43637264 aagtcaaaaacaatttctttttatggtaataatttccttttacagtatgtttaacccgtgc 43637324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26891851 - 26891725
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26891851 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 26891752  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26891751 taaagtcaaaaatagtttccttttatg 26891725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4022665 - 4022489
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| | |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4022665 agggaaatgctaactggtgcccacgggatactgattaagaatatgaaaaaagaaatta-atagtagttaatgtattgaaattctgtaattaatttataat 4022567  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||    
T  4022566 aaagtcagaaacagtttccttttatgataataatttccttttatgatatgtttaaccagtgtcccgggggcaccggtt 4022489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13574183 - 13574053
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13574183 gttaaggatatgaaaaaggaaaatatataaaaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatggtaataa 13574084  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13574083 tttccttttatggtatgcttaacccgtgccc 13574053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 259
Target Start/End: Original strand, 25772112 - 25772269
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatag-tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25772112 ggaaatgttaatcggtgtctccg-aacactagttaagaatatgaaaaaggaaattataaaaataattaatgcaatgaaattgtgtaattaatttataata 25772210  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  25772211 aagtcaaaaataatttccctttatgataataattcccttttatggtatacttaatcagt 25772269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34123213 - 34123057
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| || |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  34123213 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttgagcatactaaaaaagaaattatataatagttaatgctttgaatttgtgtaattaatttata 34123114  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |  ||||||||||    
T  34123113 a-aaagtcaaaaacagtttccttttatggtcataattttcttttttaatatgcttaac 34123057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Original strand, 38296173 - 38296317
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  38296173 tttttgggaaatgctaaccggtgtcttgggg-cactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaattta 38296271  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  38296272 taataaagtcaaaaacagtttctttttatggtaataattttctttt 38296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29102469 - 29102313
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||| ||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29102469 agggaaatgctgaccggtatc-ccgggacattggttaagaatatcaaaaagaaaattatatagcggttaatacattgaaattttataattaatttataat 29102371  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  29102370 aaagtcaaaaacagttttcttttatagtaataattatcttttatgatatgtttaacca 29102313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 39531868 - 39531981
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  39531868 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-agagtcaaaaccagttttcttttatggtaat-attttctttttcg 39531965  T
Q  245 gtatgcttaaccagtg 260  Q
     |||||||||||||||    
T  39531966 atatgcttaaccagtg 39531981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15079100 - 15079012
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15079100 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaatttccttttatgataataatt 15079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Original strand, 15146683 - 15146789
Alignment:
Q  152 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgct 251  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  15146683 aaattatataatagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaataatttccttttatgataataattttcctttttggtatgtt 15146781  T
Q  252 taaccagt 259  Q
    ||||||||    
T  15146782 taaccagt 15146789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 249
Target Start/End: Original strand, 10820528 - 10820630
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  10820528 aaaaaagaaattataaaatagttaatacattgagattgt-taattaatttataa-aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttg 10820625  T
Q  245 gtatg 249  Q
    |||||    
T  10820626 gtatg 10820630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 20431463 - 20431600
Alignment:
Q  127 acactagttaaggatatgaaaaaa-gaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 224  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    || |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  20431463 acactagttaaggatgtcaaaaaaggaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaatactaaaaaaagtc-aaaagtgttatcttttat 20431561  T
Q  225 gataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  20431562 gataataatttccttttttggcatacttaaccagtgccc 20431600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 20252739 - 20252874
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaa-aaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgata 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||| | || ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    |    
T  20252739 agggaaatgctaactggtgcctccgtgacactggttaaagatgtcaagaaaggaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaatactaa 20252838  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20252839 aaaaaatcaaaaata-ttttcttttatgataataatt 20252874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16807409 - 16807318
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||   || | ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16807409 gaaatgctaaccggtgcctccgaggcattggttaaggatgtttaaaaagaaaattatatagtagttattgcattgaaaactgtgtaattaat 16807318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16846690 - 16846599
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||   || | ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16846690 gaaatgctaaccggtgcctccgaggcattggttaaggatgtttaaaaagaaaattatatagtagttattgcattgaaaactgtgtaattaat 16846599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30834545 - 30834409
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaat-tgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||   ||| ||    
T  30834545 aaatgctaaccagtgcctctggg-cacaagttaaggatgctaaaaaaggaaattatataatagttattgcattgaaaactgtgtaattaatac-taaaaa 30834448  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctttt 241  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30834447 aataaaaaaca-ttttcttttatgataataattttctttt 30834409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Original strand, 44331741 - 44331832
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggata-tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaat 192  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44331741 gaaatgttaatcggtgcccccggggcactagttaaggttactaaaaaaagaatttatatagtaattattgcattgaaacttgtgtaattaat 44331832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30217718 - 30217652
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30217718 gttaaggatactaaaaaagaaaattatatagtatttattgcattgaaattgtgtaatcaatcgataa 30217652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28012140 - 28012007
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||    
T  28012140 gggaaatgataaccggtgcc-ccgggatactggttaaggatattaaaaaggaaaattatatagtaattattgcattcaaaattgtggaattaatctataa 28012042  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
      ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||    
T  28012041 ataagtcaacaa-agtttctttttatgataagaatt 28012007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 44854305 - 44854387
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  44854305 tttttgggaaatgctaaccggtgcccccgggtc-ctggttaaggataataaaaaggaaattatatattaattattgcattgaaa 44854387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 179
Target Start/End: Original strand, 35506740 - 35506774
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35506740 aaaaaagaaattatatagtagttattgcattgaaa 35506774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35470416 - 35470367
Alignment:
Q  91 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaagga 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  35470416 ataatttttagggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaagga 35470367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44854527 - 44854434
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  44854527 agggaaatgctaaccggtactcccggggcactggttaaggataataaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaat 44854434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43202570 - 43202394
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43202570 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 43202471  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  43202470 aatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtaagcttaaccagtgcccgggggcaccggtt 43202394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 264
Target Start/End: Original strand, 43944506 - 43944670
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43944506 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 43944605  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccg 264  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43944606 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttgtatggtatgcttaaccagtgcccg 43944670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47232059 - 47231882
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47232059 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataat 47231960  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  47231959 aaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccggaagcaccggtt 47231882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 32217045 - 32217220
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32217045 gggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32217144  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  32217145 aagtcaaaaacagtttt-ttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccggaggcaccggtt 32217220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 789717 - 789540
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  789717 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 789618  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggtt 276  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  789617 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtagcccagaggcaccggtt 789540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Original strand, 12356243 - 12356403
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  12356243 agggaaatgctaaccggtgcccctgagatactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattatataattaatttataat 12356342  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12356343 aaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 12356403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3783687 - 3783534
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3783687 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcaccggttaaacatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtttaattaattgataata 3783588  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3783587 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaa 3783534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 4089140 - 4089304
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4089140 tagggaaatgctaaccggtgcccctggggcactgattaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 4089239  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4089240 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccc 4089304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 54897308 - 54897484
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54897308 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgagaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 54897407  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  54897408 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccggtt 54897484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 16536047 - 16536210
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16536047 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcacggattaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 16536146  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16536147 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtattcttaaccagtgccc 16536210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 263
Target Start/End: Original strand, 36395138 - 36395261
Alignment:
Q  140 atatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctt 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36395138 atatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgataataattccctt 36395237  T
Q  240 ttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36395238 ttatggtatgcttaaccagtgccc 36395261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Original strand, 55882682 - 55882843
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55882682 tagggaaatgctaaccggtgtctccggggcactcgttaaggatatgaaaaaa-aaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 55882780  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  55882781 taaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa-aattcacttttatggtatacttaacccgtgcc 55882843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33108859 - 33108683
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33108859 agggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaag-atatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaatagtataattaattgataat 33108761  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  33108760 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtt 33108683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4269010 - 4268846
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4269010 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 4268911  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4268910 taatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccc 4268846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 29591188 - 29591351
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29591188 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaagaatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataat 29591287  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29591288 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaactagtgccc 29591351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52533981 - 52533816
Alignment:
Q  91 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatta 190  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  52533981 ataaattaaagggaaatgttaaccggtgcctccaggacactggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcactgaaattgaataatta 52533882  T
Q  191 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52533881 attgataataaagtcgaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 52533816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24679827 - 24679671
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24679827 gggaaatgctaaccggtgtctcgggg-cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 24679729  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24679728 aagttaaaaaca-atttcctttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagt 24679671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 256
Target Start/End: Original strand, 28755614 - 28755774
Alignment:
Q  94 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28755614 aatttttgggaaatgctaaccggtgtcccaggg-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 28755712  T
Q  194 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  28755713 gataataaagttagaaacagtttccttttatgataatacttc-cttttatagtatgcttaacc 28755774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18068067 - 18067910
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  18068067 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 18067968  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18067967 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 18067910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32202666 - 32202514
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32202666 gggaaatgttaaccggtgtccccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32202567  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaa 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32202566 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataattc-cttttatgatatgcttaa 32202514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 50619089 - 50619261
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||||||| |||||  ||||  ||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50619089 aaatgctaactggtgctcccggggcactgattaagaatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaag 50619188  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  50619189 taaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccaggggcaccggtt 50619261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54656035 - 54655903
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  54656035 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttaggat 54655936  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  54655935 aataattctctcttatgatatgcttaaccagtg 54655903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 7768937 - 7769100
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7768937 agggaaatgctaatcggtacccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 7769036  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  7769037 aatgttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggcatacttaacccgtgccc 7769100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 15186242 - 15186389
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15186242 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataat 15186341  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggta 247  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  15186342 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggta 15186389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Original strand, 4220227 - 4220348
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4220227 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatg-taataa 4220325  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4220326 ttcccttttatggtatgcttaac 4220348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19503289 - 19503137
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19503289 ggaaatgctaaccggtgctcccgggt-actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa 19503191  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19503190 agtcaaaaacagtttccttttattgtaataattcccttttatggtatgcttaac 19503137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 42898934 - 42898774
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42898934 tagggaaatgttaatcggtgcttccagggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 42898835  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttctttta--tgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42898834 taaagtcaaaaatagtttctttttatgtggtaataattctcttttatggtatgcttaacca 42898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 254
Target Start/End: Original strand, 39843912 - 39844060
Alignment:
Q  106 atgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtc 205  Q
    ||||||| |||||||| | || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39843912 atgctaatcggtgccttcagagcattggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtc 39844011  T
Q  206 aaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaa 254  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  39844012 aaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttagggtatgcttaa 39844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 259
Target Start/End: Original strand, 6164121 - 6164251
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| |    
T  6164121 cactggttaaggatatcaaaaga-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagcaaaaaacagtttccttttatggt 6164219  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6164220 aataattctcttttatggtatgcttaaccagt 6164251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30154321 - 30154187
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  30154321 cactagttaag-atatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttccttatatgat 30154223  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30154222 aataattctcttttatggtgtgcttaaccagtgccc 30154187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53656038 - 53655888
Alignment:
Q  127 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||     
T  53656038 acacttgttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaataattttattttatgg 53655939  T
Q  227 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  53655938 taataatttcattttatggtatgcttaatcagtgcctcggaggcaccggtt 53655888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Original strand, 46148940 - 46149098
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  || | | |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46148940 agggaaatgctaaccggtgccccggg--catttgataagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 46149037  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46149038 aaagtcaaaaacaatttctttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 46149098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 257
Target Start/End: Original strand, 37987967 - 37988091
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  37987967 gttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttccttttattgtaataa 37988066  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  37988067 ttctcttttatagtatgcttaacca 37988091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 225
Target Start/End: Original strand, 54054548 - 54054672
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54054548 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataata 54054647  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  54054648 aagtcaaaaacaatttccttttatg 54054672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30387271 - 30387167
Alignment:
Q  150 agaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  30387271 agaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatgatatg 30387172  T
Q  250 cttaa 254  Q
    |||||    
T  30387171 cttaa 30387167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 259
Target Start/End: Original strand, 50603254 - 50603386
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag-ttttcttttatga 226  Q
    |||| ||||||| | || |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  50603254 cactggttaagggtgtggaaaaggaaattgtataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttttttttatga 50603353  T
Q  227 taataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50603354 taataattctcttttatggtatgcttaaccagt 50603386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 41265458 - 41265620
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||  ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  41265458 agggaaatgttaatcggtgtccccgggacactagttaagcatactaaaatgaaaattatatagtagttaatgcagtgaaattgtgtaattaatttataa- 41265556  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41265557 aaaatcaaaaacagttttcttttattgtaataattttcttttttggtatgtttaaccagtgccc 41265620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5091802 - 5091622
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 194  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |  ||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||     
T  5091802 atttaagggaaatactaaccggtactcccggggcactggttaagaatatgaaaaataaaattatataataattaatatattaaaattgtgtaattaattt 5091703  T
Q  195 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5091702 ataataaagtcataaacagtttccttttatagtaataattcccttttat-gtatgcttaaccagtgtccgggagcaccggtt 5091622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54945937 - 54945805
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  54945937 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcgttttatggt 54945838  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  54945837 -ataattcctttttatggtatacttaaccagtgc 54945805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 257
Target Start/End: Original strand, 53268764 - 53268875
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  53268764 aaaaaagaaattatatattagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaattttcttttataataataattttcttttttg 53268862  T
Q  245 gtatgcttaacca 257  Q
    |||||||||||||    
T  53268863 gtatgcttaacca 53268875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 31517217 - 31517327
Alignment:
Q  153 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagt-tttcttttatgataataattctcttttatggtatgct 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31517217 aattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaataatgttttttttatggtaataattctcttatatggtatgct 31517316  T
Q  252 taaccagtgcc 262  Q
    |||||||||||    
T  31517317 taaccagtgcc 31517327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31680645 - 31680494
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31680645 aaatactaaccgctgtctccgga-cactggttaagggtatgaaaaagaaagttacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaag 31680547  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  31680546 tcaaaaacaatttccttttatggtaataattcatttttatgatatgtttaacc 31680494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 243
Target Start/End: Original strand, 49915157 - 49915301
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||  ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49915157 tagggaaatgcaaaccggcgcccctggtgcactgattaaggatatgaaaaagaaatttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa 49915256  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttat 243  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  49915257 taaagtaaaaaacagtttccttttataataataatttccttttat 49915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 42815108 - 42815234
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42815108 taggaaaatgctaaccggtgc-tctggagtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatcatagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataa 42815206  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttt-tcttttatg 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42815207 taaagtcaaaaacagtttctcttttatg 42815234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39877371 - 39877271
Alignment:
Q  165 gttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatgg--tatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39877371 gttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattctcttttatggtatatgcttaaccagtgcc 39877272  T
Q  263 c 263  Q
    |    
T  39877271 c 39877271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46688397 - 46688267
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaa----aaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 194  Q
    |||||||||||||| |||||| |||   |||| |||||||||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46688397 agggaaatgctaactggtgcccccgaggcactggttaaggatatgaaaaattaaagaaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 46688298  T
Q  195 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  46688297 ataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 46688267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 265
Target Start/End: Original strand, 52697084 - 52697215
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||    
T  52697084 gttaaggatatgaaaaacaaaattatatagtagttaatacattaaaattatataat-aatttataataaagtcaaaaataattttcctttattgtaataa 52697182  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgg 265  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  52697183 ttctcttttatgatatgtttaacgagtgtccgg 52697215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 263
Target Start/End: Original strand, 16820912 - 16821014
Alignment:
Q  161 agtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16820912 agtaattaatgcattgaaattctgtaattaacttataataaagtcatacgcagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 16821011  T
Q  261 ccc 263  Q
    |||    
T  16821012 ccc 16821014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1432701 - 1432558
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||      || |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  1432701 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatacattg------tg-aattaatttataataaaataaaaaacagttt-cttttatgat 1432610  T
Q  228 aataa--ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggtt 276  Q
    |||||  |||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  1432609 aataaaattctcttttataatatgcttaaccagtacctcagaagcaccggtt 1432558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 8133782 - 8133862
Alignment:
Q  176 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8133782 gaaaatgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataattatcttttat-gtatgtttaacca 8133862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10110194 - 10110021
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg---aaattgtgtaatta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| |||||||   ||||||| ||||||    
T  10110194 attttagggaaatgctaaccggtgcctccgggacactgattaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaaaattgtttaatta 10110095  T
Q  191 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgg 265  Q
    ||  ||||  ||||||| || |  ||||||||||| ||| |||  |||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  10110094 atctataaataagtcaacaa-aactttcttttatggtaagaatcttctttttttgtatgcttaacccgtgcccgg 10110021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 53004063 - 53003983
Alignment:
Q  180 ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53004063 ttgtgtaattaatgtataataaagtcaaaaataatttccttttaaaataataattctcttttatgatatgcttaatcagtg 53003983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 50167589 - 50167681
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||    |||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167589 tagggaaatgctaaccggtgttctcggggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 50167681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16572680 - 16572581
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 192  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16572680 atttaaggaaaatgctaaccggtgcctccgaggcactggttaaggataataaaaagagaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaat 16572581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17344800 - 17344686
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 244  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | |||||| |     
T  17344800 aaaaatgaaattatataatagttaatgcatttaaattatataattaaattataa-aaatttaaaaaaagtttctttttatggtaataactttcttttctt 17344702  T
Q  245 gtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||| ||||| |||||    
T  17344701 gtatccttaaacagtg 17344686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 34151124 - 34151297
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataa 201  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  |    
T  34151124 aaatgctaaccgatgcc-ccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaata 34151222  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg-gtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||| || | ||| |||||||| ||| |||| |||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34151223 agtcaacaaaacttt-cttttatggtaagaattttcttttttttgtatgcttaacccgtgcccgggagcaccggtt 34151297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Original strand, 5694321 - 5694481
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5694321 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 5694420  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5694421 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgc 5694481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 18043161 - 18043324
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18043161 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 18043260  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18043261 aatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccc 18043324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 15227738 - 15227915
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227738 agggaaatgctaaccggtaccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 15227837  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15227838 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggtt 15227915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 261
Target Start/End: Original strand, 47009992 - 47010153
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47009992 agggaaatgctaatcggtgcatccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 47010091  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47010092 aaattcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 47010153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 29657769 - 29657933
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29657769 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataa 29657868  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29657869 taaagtcaaaaacagtttccttttttggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 29657933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12072245 - 12072086
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12072245 aaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatgtagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 12072146  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12072145 tcaaaaacagttttcttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaaccagtgccc 12072086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51065935 - 51065772
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51065935 agggaaatgctaaccggtgtccccgggacactggttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 51065836  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51065835 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 51065772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 261
Target Start/End: Original strand, 13961210 - 13961371
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13961210 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggatataaaaaaa-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 13961308  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13961309 taaagtcaaaaacagtttcattttatggtaataattttcttttatggtatgcttaaccagtgc 13961371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42770183 - 42770014
Alignment:
Q  94 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42770183 aatttaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 42770084  T
Q  194 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
     |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42770083 tataataatatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccc 42770014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 259
Target Start/End: Original strand, 6770344 - 6770495
Alignment:
Q  108 gctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6770344 gctaaccggtgcctccggggcactaattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaa 6770443  T
Q  208 aaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6770444 aaacagtttcattttatgataataattcccttttatgatatgcttaaccagt 6770495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 38162850 - 38163012
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38162850 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 38162949  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38162950 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 38163012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3784904 - 3784723
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784904 tttttgggaaatgcaaatcggtgcccccagtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 3784805  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  3784804 taataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgtcccgggggcaccggtt 3784723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9266915 - 9266738
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9266915 agggaaatgttaaccggtgtccccgcggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataat 9266816  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  9266815 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcgcttttatggtatacttaaccagtgctccagaagcaccggtt 9266738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17333467 - 17333294
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17333467 gggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataata 17333369  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||||    
T  17333368 aagtcaaaaacagtttccttttatgataatacttcccttttatggta--cttaaccaatgccccggaggcaccggtt 17333294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 259
Target Start/End: Original strand, 3097659 - 3097817
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3097659 gggaaatgctaattggtgcccccggagtcctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 3097758  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3097759 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagt 3097817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30294573 - 30294407
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 194  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30294573 atttttgggaaatgctaatcggtgtccccggagcattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 30294474  T
Q  195 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30294473 ataataatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgc 30294407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47532856 - 47532681
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47532856 agggaaatgctaaccggtgtctccggagtact-gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataat 47532759  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggtt 276  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  47532758 aaagtcaaaaataatttccttttataataataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgaagacaccggtt 47532681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Original strand, 30657607 - 30657760
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30657607 agggaaatgctaaccggtgctcccggggcactagttaagcatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 30657706  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    ||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30657707 aaagtcaaaaacag------tttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagt 30657760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 45431274 - 45431440
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45431274 ttttagggaaatgctaaccggtgcccccagggc-ctgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattta 45431372  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45431373 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatgatatacttaaccagtgccc 45431440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24178649 - 24178487
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24178649 gggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataata 24178550  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  24178549 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccc 24178487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 261
Target Start/End: Original strand, 12306917 - 12307077
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12306917 agggaaatgctaaccggtgcctctggggctctagttaatgatacgaaaaagaaaattatat-gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 12307015  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307016 aaagtcaaaaacagattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 12307077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19032006 - 19031846
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  19032006 ttttagggaaatgctaaccggtgctccgggggcattagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaaaacattgaaattgtgtaattaattta 19031907  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19031906 taataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaacc 19031846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Original strand, 38335170 - 38335317
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38335170 gggaaatgctaaccggtgtcttggga-cactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgtaattgtgtaattaatttataata 38335268  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38335269 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcacttttatggtatg 38335317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35985807 - 35985645
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35985807 agggaaatgttaaccggtgcc-ccggatcactgtttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 35985709  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  35985708 aaagtgaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatagtatacttaaccagtgccc 35985645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Original strand, 48071480 - 48071642
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48071480 ttagggaaatgctaaccgatgc-tccggggtactggttaaggatatgtaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 48071578  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  48071579 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattatcttttatagtatgcttaaccggtgc 48071642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Original strand, 29683194 - 29683355
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  29683194 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaagatataaaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtataattaatttataa 29683293  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29683294 taaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattcacttttatggtatgcttaaccagtg 29683355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14350464 - 14350289
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14350464 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcaccggttaagggtatgaaaaaggaaattatattgtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 14350365  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  14350364 aatgtcaaaaacaatttccttttatggtaataattc-ccttaatggtatgcttaaccagtgccccggggcaccggtt 14350289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 41730304 - 41730470
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagt---taatgcattgaaattgtgtaattaattgat 196  Q
    ||||||||  ||||||||||| | ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41730304 agggaaatcttaaccggtgccccaggggcacgggttaagaatatgaaaaaagaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttat 41730403  T
Q  197 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41730404 aataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccc 41730470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Original strand, 29210410 - 29210537
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29210410 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 29210509  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29210510 ataatgtcaaaaacagtttccttttatg 29210537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38702117 - 38701961
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  38702117 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataat 38702018  T
Q  203 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  38702017 gtcaaaaacagttttcttttatggtaataattc----ttatggtatgcttaaccagtgccc 38701961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51368972 - 51368810
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |   ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51368972 agggaaatgctaaccggtacctccagggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtagttaatttataat 51368873  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    || |||||||| ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51368872 aatgtcaaaaatagtttccttttatagtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgcc 51368810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 260
Target Start/End: Original strand, 43286725 - 43286881
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||||||||| || | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43286725 aaatgctaaccgatgtccctgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgttttgaaattatgtaattaatttataataaag 43286824  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43286825 tcaaaaatagtttccttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 43286881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8473068 - 8472941
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  8473068 gttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttataataataa 8472969  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8472968 ttctcttttatggtatacttaaccagtg 8472941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50128325 - 50128182
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  50128325 ttaaggatatgaaaaagaaaattacatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagtttcattttatggtaataat 50128226  T
Q  234 tctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  50128225 tctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccagaaacaccggtt 50128182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36446508 - 36446352
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 202  Q
    |||||| |||| |||||| |||   |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36446508 gaaatgttaactggtgcccccgaggcactggttaagaatat-aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 36446410  T
Q  203 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36446409 gtcaaaaacagtttccttttatagtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtg 36446352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48383294 - 48383136
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48383294 aaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatatgaaagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaag 48383195  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48383194 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgcc 48383136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45449398 - 45449268
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  45449398 gttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaatagtgtaattaaattataataaagtcaaaagcagtttccttttatggtaataa 45449299  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45449298 ttgccttttatggtatgtttaaccagtgccc 45449268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Original strand, 52431625 - 52431743
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa-ttctcttttat 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  |||| |    
T  52431625 aaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaattttcttttatggtaataatttccttttttt 52431723  T
Q  244 ggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52431724 ggtatgcttaaccagtgccc 52431743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37315409 - 37315300
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||| ||    
T  37315409 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa-aaagtcaaagacagttttcttttatgctaataatttctttttttg 37315311  T
Q  245 gtatgcttaac 255  Q
    |||||||||||    
T  37315310 gtatgcttaac 37315300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 30217763 - 30217932
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaa--gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  30217763 ggaaatgctaaccgatgc-tccggg-cactggctaaggatatgaaaaaaagggaattagagagtagttaatgcatttaaattatttaattaatttataat 30217860  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcacc 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  30217861 aaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataatttctttttatggtatgcttaa-cagtgccccgaggcacc 30217932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15282668 - 15282529
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    
T  15282668 gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaaa----taatttatgataataa 15282573  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggtt 276  Q
    ||| || |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15282572 ttccctattattgtatgcttaa-cagtgccctggaaacaccggtt 15282529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23473618 - 23473490
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  23473618 gttaaggatatgaaaaaggagattatatagcagttaatgtattgaaattgtataattaatttataataaagtttaaagcagtttccttttatggtaataa 23473519  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||   ||||||  ||||||||||| ||||    
T  23473518 tttctttttataatatgcttaacctgtgc 23473490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Original strand, 52749634 - 52749757
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  52749634 gttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaattgtatactaaatttacaataaagttaaaaacaatttttttttatggtaataa 52749733  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    |||  |||||||||||| ||||||    
T  52749734 ttcctttttatggtatgtttaacc 52749757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Original strand, 39497340 - 39497430
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 224  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39497340 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaattatataattaatttataataaagtcaaaaataattttcttttat 39497430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 26228194 - 26228300
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||| ||||||||||||  || ||| | |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26228194 agggtaatgctaaccgg--cccccgaagcactggttaaggagataaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 26228291  T
Q  200 aaagtcaaa 208  Q
    ||| |||||    
T  26228292 aaaatcaaa 26228300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35700804 - 35700679
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  35700804 gttaaggatactaaaaaggaaattatacagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaaattt-ttttatgataataa 35700707  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
     |  ||||| || ||| |||||||||||    
T  35700706 cttccttttttgatatccttaaccagtg 35700679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 249
Target Start/End: Original strand, 37503264 - 37503361
Alignment:
Q  151 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  37503264 gaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaatattttccttttatggtaacaattgtcttttttggtatg 37503361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19010778 - 19010711
Alignment:
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19010778 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccc 19010711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 28481844 - 28481955
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28481844 gggaaatgctaaccggtgcctcttgggccctggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagta----atgcattaaaattgtgtaattaatttataata 28481939  T
Q  201 aagtcaaaaacagtttt 217  Q
    || | ||||||||||||    
T  28481940 aaat-aaaaacagtttt 28481955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3838937 - 3838831
Alignment:
Q  127 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 226  Q
    ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||| |||||||     
T  3838937 acactggttaagcatactaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaatttttttttatgg 3838839  T
Q  227 taataatt 234  Q
     |||||||    
T  3838838 caataatt 3838831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 259
Target Start/End: Original strand, 39081803 - 39081958
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  39081803 gggaaatgctaaccggtgt-tccggg-cactggttaagcatactaaaaatgaaattatatactagttaatgtattgaaattttataattaatttataa-a 39081899  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |  | |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||    
T  39081900 atattaaaagcagtttcattttatgataataattttcttttttaatatgcttaatcagt 39081958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19011180 - 19011108
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcatt 175  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19011180 ggaaatgctaaccggtgtc-ccggggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatt 19011108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28726093 - 28725929
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||    
T  28726093 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 28725994  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |  ||||||| || |  || |||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  28725993 aataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccc 28725929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39912432 - 39912363
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  39912432 ttaaggatataaaaagggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtgattaatttataaaaaag 39912363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10976087 - 10976008
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaatt 181  Q
    |||||||||| |||||| ||| |   |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10976087 ggaaatgctagccggtgtctctgaggcacttgttaaggatatgaaaaaggagattatatagtagttaatgcattaaaatt 10976008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38595939 - 38595762
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  38595939 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 38595840  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
      ||||||| || |  || |||||||| ||| |||| |||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38595839 ataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaattttctttttttgcatgcttaaccagtgccccggaggcaccggtt 38595762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14881086 - 14881036
Alignment:
Q  180 ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 230  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14881086 ttgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 14881036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16590349 - 16590269
Alignment:
Q  152 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    ||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16590349 aaattatataacaattaatgtatt-aaattgtgtaattaatttataa-aatgtcagaaacaattttcttttatgataataatt 16590269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19011095 - 19011061
Alignment:
Q  159 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19011095 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 19011061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 49867456 - 49867522
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49867456 cactggttaatgatactaaaaaagaaagttatatagtaattaatgttttgaaattgtgtaattaatt 49867522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 140
Target Start/End: Original strand, 12326107 - 12326140
Alignment:
Q  107 tgctaaccggtgcctccggaacactagttaagga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12326107 tgctaaccggtgcctccggaacactaattaagga 12326140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33644517 - 33644390
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaa 202  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||| ||| |||||  |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |     
T  33644517 aaatgctaaccagtgc-tctggagcacaggttaaggctataaaaaagaaaattatataataattattgcattgaaaattgtgtaattaattcataaatat 33644419  T
Q  203 gtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  33644418 gtcatcaa-agtttccttttatgataataa 33644390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14881158 - 14881086
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagtt 167  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||| |||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14881158 atttttggaaaatgttaactggtgcccccgtgatactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtt 14881086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 22960 - 23123
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22960 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 23059  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23060 aaagtcaaaaacagtttccttttatgttaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccc 23123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 392096 - 392258
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  392096 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 392195  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  392196 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 392258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12145303 - 12145127
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12145303 gggaaatgctaaccggtgcccccagtgcacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 12145204  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12145203 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatagtatgcttaaccagtgctccggaggcaccggtt 12145127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 35043890 - 35044064
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35043890 gggaaatgctaactggtgtccacgggacactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgta-ttaatttataata 35043988  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  35043989 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccggggcaccggtt 35044064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1391364 - 1391205
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1391364 agggaaatgctaaccggtgc-tccggggtactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 1391266  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1391265 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtg 1391205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 23402137 - 23402314
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23402137 agggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataat 23402236  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  23402237 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtt 23402314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29451302 - 29451139
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29451302 tagggaaatgctaactggtgcctccggg-caccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaattataa 29451204  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29451203 taaagtcaaacacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 29451139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32929695 - 32929532
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32929695 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatattaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 32929596  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32929595 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 32929532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25165567 - 25165423
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25165567 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 25165468  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  25165467 ttctcttttacgatatgcttaaccaatgccctgggagcaccggtt 25165423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 3515765 - 3515928
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3515765 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 3515864  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3515865 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacctgtgccc 3515928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32985376 - 32985217
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||| ||||||||||  |||  || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32985376 aaatgcaaaccggtgccctcggggcattggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaag 32985277  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32985276 tcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 32985217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 128 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13417121 - 13416970
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa---agtcaaaaacagttttcttttat 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  13417121 cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataataaagtcaaaaacagttttcttttat 13417022  T
Q  225 gataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13417021 ggtaataattctcttttataatatgcttaaccagtgcccggaggcaccggtt 13416970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 259
Target Start/End: Original strand, 2350654 - 2350810
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2350654 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaa 2350753  T
Q  203 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2350754 gtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagt 2350810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 4215694 - 4215857
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4215694 agggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 4215793  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4215794 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccc 4215857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7851346 - 7851191
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7851346 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 7851247  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7851246 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 7851191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 29978233 - 29978407
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  29978233 gggaaatgctaaccggtgcctccgga-cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgtattgaaattatgtaatatatttataata 29978331  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  29978332 aagtcaaaaacagtttaattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagcgccctggaacaccggtt 29978407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26467278 - 26467134
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26467278 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataa 26467179  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  26467178 ttcccttttatggtatgtctaaccagtgccccggaggcaccggtt 26467134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3026194 - 3026036
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3026194 agggaaatgctaactggtgccccggg--cactggttaagggtatgaaaaatgaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 3026097  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3026096 aatgtcaaaaacagttttcttttatcgtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtg 3026036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 256
Target Start/End: Original strand, 27433490 - 27433647
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  27433490 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 27433589  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27433590 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 27433647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 12525718 - 12525881
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12525718 agggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaaatgtgtaattaatttataat 12525817  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  12525818 aatgtcaaacacagtttcattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaactagtgccc 12525881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Original strand, 961051 - 961164
Alignment:
Q  143 tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctttta 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  961051 tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacaatttccttttatgataataattctctttta 961150  T
Q  243 tggtatgcttaacc 256  Q
    ||||||||||||||    
T  961151 tggtatgcttaacc 961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 20897947 - 20898072
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20897947 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 20898046  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20898047 aaagtcagaaacagtttccttttatg 20898072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18276774 - 18276636
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18276774 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 18276675  T
Q  228 aataattctcttttatgg---tatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18276674 aataatttccttttatggtattatgcttaaccagtgccc 18276636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 260
Target Start/End: Original strand, 28225221 - 28225379
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28225221 gggaaatgctaactggtgcctctgggatacgggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 28225319  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  28225320 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatccttaaacagtg 28225379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34396714 - 34396598
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34396714 agggaaatgctaaccggtgcccccaggacacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 34396615  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  34396614 aaagtcaaaaacagttt 34396598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34852030 - 34851876
Alignment:
Q  105 aatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagt 204  Q
    |||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34852030 aatgctaaccggtgctcctgggacact-gttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagt 34851932  T
Q  205 caaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34851931 caaaaataatttccttttatagtaataattctcttttataatatgcttaaccagtg 34851876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21878533 - 21878399
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  21878533 gggaaatgctaaccggtgcctcccgggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatttaattaatttataata 21878434  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattc 235  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  21878433 aagtcaaaaacagtttctttttatggtaataattc 21878399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 257
Target Start/End: Original strand, 2580984 - 2581108
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  2580984 gttaatgatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatggtaataa 2581083  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  2581084 ttcccttttatggtatgcttaacca 2581108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34477709 - 34477612
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34477709 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatg 34477612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11115254 - 11115121
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  11115254 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa--tcaaaaatagttttcttttatggt 11115157  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  11115156 aataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccc 11115121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1840406 - 1840271
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  1840406 cactggttaaggatataaaaaaagaaattatataataattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcctttcatggt 1840307  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  1840306 aataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccc 1840271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23629761 - 23629607
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  23629761 gggaaatgttaaccgatgcc-ccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattactttataata 23629663  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  23629662 aagtcaaaaacaatttccttttatgacaataattttcttttatgttatacttaacc 23629607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Original strand, 31280317 - 31280491
Alignment:
Q  97 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||   ||||  |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31280317 tttagggaaatgctaaccggtgctcccgaggcactgattaagagaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttat 31280416  T
Q  197 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31280417 aataatgtcaaaaacggtttccttttatagtaataattc-----tatggtatgcttaacgagtgcccggaggcaccggtt 31280491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Original strand, 5323433 - 5323562
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  5323433 ttaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaaagcattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataat 5323532  T
Q  234 tctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5323533 tcccttttatggtatgcgtaaccggtgccc 5323562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 235
Target Start/End: Original strand, 9660988 - 9661120
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  9660988 gaaatgctaaccggtgccctcgtggcaccagttaaggatatgaaaaaagaaattacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttaaaataaa 9661087  T
Q  203 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattc 235  Q
    || |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  9661088 gttaaaagcagtttccttttatggtaataattc 9661120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 9524758 - 9524661
Alignment:
Q  3 tccttatataaaattatgattgtttcattatgattctgatcacaatcgcttgtgatatcaaatatacactaaactgataatgttgtggataaatttta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9524758 tccttatataaaatgatgattgtttcattatgactctgatcacaatcaactgtgatatcaaatatacactaaactgataatgctgtggatagatttta 9524661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 13529453 - 13529554
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13529453 tagggaaatgctaacttgtgccttcggggcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 13529552  T
Q  199 ta 200  Q
    ||    
T  13529553 ta 13529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 263
Target Start/End: Original strand, 22417303 - 22417355
Alignment:
Q  211 cagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22417303 cagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgccc 22417355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24227546 - 24227413
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaa-----tgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaaca-gttttcttttatgat 227  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||     ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24227546 ttaaggatactaaaaaagaaattatatagtatataaattcatgcattgaatttatgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaagttttcttttatgat 24227448  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||| |  ||||| |||||  ||||| |||||||    
T  24227447 aataacttccttttttggtacccttaaacagtgcc 24227413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 11633951 - 11634028
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 210  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  11633951 ttaaggatactaaaaaagtaattatatagtagttattgcattgaaaattgtgtaattaatacataaaaatgtcaaaaa 11634028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Original strand, 14559921 - 14559993
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgc 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14559921 agggaaatgctaaccggtgccttcggggaactgattaaagatatgaaaaaagaaaatatataatagttaatgc 14559993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Original strand, 10431780 - 10431827
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10431780 aaaaaagaaattatataatagttattacattgaaattgtgtaattaat 10431827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Original strand, 22021633 - 22021724
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggata-tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaat 192  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22021633 gaaatgttaatcggtgcccccggggcactagttaaggttactaaaaaaagaatttatatagtaattattgcattgaaacttgtgtaattaat 22021724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 263
Target Start/End: Original strand, 1127866 - 1127978
Alignment:
Q  151 gaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 249  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| || | |||| ||||||| ||| |||| |||||| | |||||    
T  1127866 gaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatttataaataagtcaacaaaactttt-ttttatggtaagaattttctttttttgtatg 1127964  T
Q  250 cttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||    
T  1127965 cttaaccagtgccc 1127978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11616285 - 11616208
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 210  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||| || ||||||||    
T  11616285 ttaaggatactaaaaaagtaattatatagtagttattgcattgaaaattgtataattaatacataaaaatgtcaaaaa 11616208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 193
Target Start/End: Original strand, 28562682 - 28562772
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  28562682 ggaaatgctaatcggtgcc-ccgggacaccggttaatgatattaaaatagaaactatatagtaattaacgtattaaaattctgtaattaatt 28562772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34712317 - 34712271
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggata 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  34712317 tttttgggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggata 34712271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 34706719 - 34706883
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||  ||||| | |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  34706719 agggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 34706818  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |  ||||||| || | ||  |||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34706819 aataagtcaacaaaacttc-cttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccc 34706883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43594222 - 43594063
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43594222 gggaaatgctaaccggtgtccccggaacactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 43594123  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594122 aagtcaaaaacagtttcctcttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 43594063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24798589 - 24798427
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24798589 agggaaatgctaaccggtgcccccggg-cacttgttgaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 24798491  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24798490 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatagtatgcttaaccagtgccc 24798427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 24438477 - 24438639
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24438477 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 24438576  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24438577 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 24438639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 255
Target Start/End: Original strand, 5239283 - 5239439
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5239283 tagggaaatgctaaccggtgcctccggagcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 5239382  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5239383 taatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 5239439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8754771 - 8754617
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8754771 gggaaatgctaaccggtgccctgggagcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 8754672  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8754671 aagtcaaaaacagttttgttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaac 8754617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 1736975 - 1737155
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1736975 tttttgggaaatgctaaccggtgcttctggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattga 1737074  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1737075 taataaagttaaaaacattttccatttatgataataattc-attttatggtatgcttaaccagtgccccggaagcaccggtt 1737155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12218629 - 12218460
Alignment:
Q  94 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12218629 aatttaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggataagtatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 12218530  T
Q  194 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
     |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12218529 tataataaaataaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccc 12218460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29993674 - 29993497
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29993674 agggaaatgctaacgggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 29993575  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  29993574 aaagtcaaaatcaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggaggcatcggtt 29993497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 34606256 - 34606437
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34606256 ttttggggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaattta 34606355  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  34606356 taataaagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggagcaccggtt 34606437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7689387 - 7689224
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7689387 agggaaatgttaaccggtgtctctgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattttacagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 7689288  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7689287 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtgccc 7689224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11686507 - 11686333
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11686507 aaatgctaactggtgcttccgggatactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 11686408  T
Q  204 tcaaaaacag--ttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  11686407 tcaaaaacagtttttttttttatggtaataattctcttttatgatatgcttaacctgtacccggaggcaccggtt 11686333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Original strand, 28587911 - 28588065
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28587911 ggaaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtcaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 28588009  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28588010 agtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacca 28588065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Original strand, 30810682 - 30810817
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30810682 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggt 30810781  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30810782 aataattttcttttatggtatgtttaaccaatgccc 30810817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 262
Target Start/End: Original strand, 4628565 - 4628727
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4628565 agggaaatgctaaccgatgcccctggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtttaattaatttataat 4628664  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4628665 aaagtcagaaacagtttacttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcc 4628727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 263
Target Start/End: Original strand, 45045802 - 45045932
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045802 gttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataataa 45045901  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45045902 ttcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 45045932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23363354 - 23363191
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23363354 taggaaaatgttaaccggtgtc-ccggagcactcgttaaggataagaaaaaggaaattgtatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 23363256  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23363255 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaatatttctcttttatggtatgtttaaccagtgccc 23363191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 122 - 257
Target Start/End: Original strand, 47083076 - 47083211
Alignment:
Q  122 ccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttt 221  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47083076 ccggaacaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagttaaaaacagtttccttt 47083175  T
Q  222 tatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  47083176 tatggtaataattcccttttatgatatgtttaacca 47083211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Original strand, 47656981 - 47657153
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47656981 ggaaatgctaaccggtgcttcgggggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 47657080  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  47657081 agttaaaagcagttt--ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgcctcgaagcaccggtt 47657153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 262
Target Start/End: Original strand, 5729345 - 5729507
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5729345 agggaaatgttaaccggtgttcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataat 5729444  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5729445 aaagtcaaaaataattttcttttatagtaataattctcttttatggcatgcttaaccagtgcc 5729507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 18485960 - 18486137
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18485960 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatattgaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 18486059  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggtt 276  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  18486060 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaacccgtgccccgaagacaccggtt 18486137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 275
Target Start/End: Original strand, 28262029 - 28262201
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  28262029 taggaaaatgctaaccggtgcctccgggtcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtta-----ttgaaattatgtaattaattgataa 28262123  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggt 275  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28262124 taaaatcaaaaacagtttccttttatagtaataattcttttttatggtatgcttaaccaatgccctggaagcaccggt 28262201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 47839490 - 47839654
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||   ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  47839490 ttagggaaatgctaaccggtgtc-ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaatttatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttata 47839588  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  47839589 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgaataaccagtgccc 47839654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 34333283 - 34333445
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34333283 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 34333382  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  34333383 aatgtc-aaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccc 34333445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42044439 - 42044304
Alignment:
Q  141 tatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42044439 tatgaaaaaagaaattatatagtagttaatagattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttt 42044340  T
Q  241 tatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||    
T  42044339 tatggtatgtttaaccagtgccccggggcaccggtt 42044304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Original strand, 18117147 - 18117314
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18117147 aaatgctaaccgatgc-tccgggacatttgttaagtatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaag 18117245  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcacc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18117246 tcaaaaacagtttttttttatagtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccctggagcacc 18117314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27456303 - 27456174
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27456303 ttttagggaaatgctaactggtgcccccggg-cactggttaaggatatggaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 27456205  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatga 226  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27456204 taataaagtcaaaagcagtttccttttatga 27456174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13065061 - 13064902
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |   | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13065061 gggaaatgctaaccggtgcccacggtat--tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatatttaatgtattgaatttgtgtaattaatttataata 13064964  T
Q  201 aagtca-aaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13064963 aagtcaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgc 13064902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37674240 - 37674126
Alignment:
Q  151 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||    
T  37674240 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgatataattttttttttatggtatgc 37674141  T
Q  251 ttaaccagtgcccgg 265  Q
    |||||||||| ||||    
T  37674140 ttaaccagtgtccgg 37674126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 262
Target Start/End: Original strand, 33636479 - 33636613
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |    
T  33636479 cactagttaagaatatgaaaaagaaaattatataataattaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaatagtttatttttatggt 33636578  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33636579 aataattctattttatggtatgcttaaccagtgcc 33636613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 525234 - 525086
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  525234 cactggttaaagatatgaaaaagaaaagtatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggt 525135  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | | ||||||||||    
T  525134 aataattctcttttatgatatgtttaaccagtactccggagcaccggtt 525086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23357895 - 23357734
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |   || ||||||||| ||||    
T  23357895 tagggaaatgttaaccggttcctctggagtactcgttaaggatatgaaaaagaaaattgtatagtagttaatgcatttca---gtataattaatttataa 23357799  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23357798 aaaagtcaaaaacagtttccatttatgataataattctcttctatgatatgcttaaccagtgccc 23357734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34546501 - 34546376
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||||| |||| |||    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34546501 agggaaatgctaaccgatgcccccgaggtaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttatagt 34546402  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34546401 aaagtcaaaaacagtttacttttatg 34546376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 261
Target Start/End: Original strand, 46716642 - 46716798
Alignment:
Q  105 aatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagt 204  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46716642 aatgctaactggtgccctcggagcattggttaaagatataaaaaaggaaattatataatacttaatgcactgaaattatgtaattaatttataataaagt 46716741  T
Q  205 caaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  46716742 caaaaatattttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccggtgc 46716798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37631730 - 37631601
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  37631730 tagggaaatgttaaccggtgcttccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatataataattaatgcattaaaattatgtaattaatttataa 37631631  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgata 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37631630 taaaatcaaaaacagtttccttttatgata 37631601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29835858 - 29835735
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag-ttttcttttatgataata 231  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  29835858 gttaaagatatgaaaaaggaagttatatactagttaatgtattaaaattgcgtaattaatttgtaataaagttaaaaacagttttttttttatggtaata 29835759  T
Q  232 attctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  29835758 attctattttatggtatgcttaac 29835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 262
Target Start/End: Original strand, 22739851 - 22739985
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat-aataaagtcaaaaacagttttcttttatga 226  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||     
T  22739851 cactagttaaggatactaaaag-gaaagtatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataaaaaaaattaaaaacagttttcttttatgg 22739949  T
Q  227 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 262  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||| | ||||||    
T  22739950 taataattttatttttttgtatgcttagctagtgcc 22739985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4100678 - 4100557
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4100678 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattaaaattatgttattaatttataatcaaatcaaaaacagtttt-atttatgataataa 4100580  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    |||  |||||| |||||| ||||    
T  4100579 ttcatttttatagtatgcctaac 4100557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 232
Target Start/End: Original strand, 36437409 - 36437507
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36437409 gttaaggatactaaaaaggtaattatatagtaggtaattcattgaaattgtttaattaatttataa-aaagtcaaaaatagttttcttttatgataataa 36437507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18470126 - 18469993
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaa-cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||  |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |     
T  18470126 gggaaatgctaaccggtgcccccgggggcaccggttaagcatactaaaaaggaaattatatagcagttaatacattgaaattgtgtaattaatttatga- 18470028  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  18470027 aaagtcaaaaacagttacattttatggtaataatt 18469993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 234
Target Start/End: Original strand, 20116940 - 20117022
Alignment:
Q  151 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20116940 gaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtagtaaatttttaa-aaggccaaaaacagttttcttttatgataataatt 20117022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18220812 - 18220695
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 244  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||| ||    
T  18220812 aaaaaggaaattatatagtaattaatgtatagaaattgtgtaattaatttataa-aatggcaaaaatagttttcttttatggtaataaattccttttttg 18220714  T
Q  245 gtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||| ||||| | ||||||    
T  18220713 gtatccttaatcggtgccc 18220695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Original strand, 4087626 - 4087752
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    |||||||||||| |||| |||   |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |     
T  4087626 ggaaatgctaactggtgtctca--aacactggttaagcatactaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtgattaatttataa-ag 4087722  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
      |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4087723 tttcaaaaacag-tttcttttatggtaataa 4087752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 47118100 - 47118037
Alignment:
Q  176 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctt 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47118100 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaagagcagtttccttttatggtaataattctctt 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Original strand, 22973600 - 22973667
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaat 170  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22973600 gaaatgctaactagtgcctccggggcactggttaatgatataaaaaaagaaattatatagtagttaat 22973667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Original strand, 3021923 - 3022000
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 211  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  3021923 gttaagcatattaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcataaac 3022000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 275
Target Start/End: Original strand, 19434495 - 19434668
Alignment:
Q  103 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||| | |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||      
T  19434495 gaaatgttaaccggtgcctccggggcactgattaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaat 19434594  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggt 275  Q
    ||||||| || | ||  |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19434595 aagtcaacaaaacttc-cttttatggtaagaattttctttttttgtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggt 19434668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18220592 - 18220495
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18220592 gttaaggatactaaaaagaaaattatatagtaattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataa-attgtcaaaaaca-atttcttttataataataa 18220495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Original strand, 13556474 - 13556553
Alignment:
Q  163 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttat 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |  ||||||| ||||||||  |||||||    
T  13556474 tagtcaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaataacaatatctttttatggtaataatttccttttat 13556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18220673 - 18220625
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 193  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  18220673 aaaaaggaaattatatagtaattactgtattgaaattgtgtaattaatt 18220625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48256785 - 48256749
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaagga 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256785 aaatgttaaccggtgcctccggaacactagttaagga 48256749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47118150 - 47118095
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaatt 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  47118150 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaatt 47118095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30924182 - 30924069
Alignment:
Q  96 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaatt 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  30924182 ttttaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattagtgcattgaaaattgtttaattaatt 30924083  T
Q  194 gataataaagtcaa 207  Q
     ||||  |||||||    
T  30924082 cataaataagtcaa 30924069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34557086 - 34556912
Alignment:
Q  91 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaat 188  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||  || | ||||||||||  ||||| | |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||    
T  34557086 ataattttaagggaaatgctaactggtgcc-ccggggcattggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaat 34556988  T
Q  189 taattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgg 265  Q
    ||||  ||||  ||||||| || | ||| |||||| | ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34556987 taatccataaataagtcaacaaaacttt-cttttagggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcccgg 34556912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45842962 - 45842827
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaattga 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||  ||||||| |||||||||  || ||| ||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  45842962 ttagggaaatgctaaccggtg-ctctggggcactggttagggataataaaaaagaaaattatatgttaattattgcattaaaaattatttaattaattca 45842864  T
Q  196 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    |||  ||||||| || | |||| ||||||||||||||    
T  45842863 taaataagtcaacaaaactttttttttatgataataa 45842827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 825 - 987
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  825 gggaaatgctagccggtgcttccggagcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 924  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  925 aagtcaaaatcaatttccttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 263
Target Start/End: Original strand, 116198 - 116366
Alignment:
Q  95 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 194  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116198 atttaaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 116297  T
Q  195 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  116298 ataataaagtcagaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaacccgtgccc 116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Original strand, 14896 - 15058
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  14896 gggaaatgctaaccggtgtccccggggcactggttaaagatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtagttaatttataata 14995  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14996 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 15058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1152 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 675 - 832
Alignment:
Q  98 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  675 ttagggaaatgctaatcggtgcccccagagcacgggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttata 774  T
Q  198 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  775 ataaagtcaaaaactgttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaac 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Original strand, 50548 - 50708
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50548 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgttttgaaattgtataattaatttataata 50647  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  50648 aagtcaaaatcaattttcttttatgataataattctcttttatagtatgtttaaccagtgc 50708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53506 - 53367
Alignment:
Q  127 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||               
T  53506 acactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatt----------- 53418  T
Q  227 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  53417 taataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccggaggcaccggtt 53367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6295 - 6134
Alignment:
Q  102 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 201  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6295 ggaaatgctaaccggtgcccctggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattggaattgtgtaattaaattataataa 6196  T
Q  202 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6195 agtcaaaaacagtttccttttatggtaataatccccttttatggtatgtttaacccgtgccc 6134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53716
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  53873 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 53774  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  53773 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 53716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 68477 - 68309
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  68477 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaaataaattataat 68378  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag 268  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  68377 aaagttaaaatcagtttccttttaaggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccgaag 68309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 147092 - 146933
Alignment:
Q  100 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147092 agggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataat 146993  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  146992 aaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagt 146933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 260
Target Start/End: Original strand, 25719 - 25877
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25719 gggaaatgctaactggtgcctctgggatacgggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 25817  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  25818 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatccttaaacagtg 25877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Original strand, 40952 - 41096
Alignment:
Q  134 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 233  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40952 ttaagaatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataatgaagtcaaaaacagtttccttttatgataataat 41051  T
Q  234 tctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttg 277  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  41052 ttccttttatgatatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttg 41096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 276
Target Start/End: Original strand, 69253 - 69401
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 227  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |    
T  69253 cactcgttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttttttttaaggt 69352  T
Q  228 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggtt 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  69353 aataatt-tcttttatggtatgcttaaccagtgcctcgggagcaccggtt 69401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33866 - 33709
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 200  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33866 gggaaatgctaatccatgcctc-ggagcacttgttaagtatattaaaatggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-a 33769  T
Q  201 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 260  Q
    |  | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||| ||||    
T  33768 agataaaaaatagttttcttttatgctaataattttctcttttgatatgcttaactagtg 33709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19739 - 19595
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 232  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  19739 gttaagcatatgaaaaaagaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaatgaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttacgataatag 19640  T
Q  233 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggtt 276  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  19639 ttctcttttatgatatgattaatcagtgtcccggaaactccggtt 19595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17619 - 17502
Alignment:
Q  138 ggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctc 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17619 ggatatgaaaaagaaaattatatagtagctaatgcattgaaattgtg-aattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcct 17521  T
Q  238 ttttatggtatgcttaacc 256  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  17520 ttttatggtatgtttaacc 17502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8056 - 7959
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8056 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatg 7959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Original strand, 7315 - 7412
Alignment:
Q  128 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7315 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatg 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 259
Target Start/End: Original strand, 291 - 450
Alignment:
Q  99 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  291 tagggaaatcctaaccggtgccccaggg-cactggttaagcatatgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaataaatttataa 389  T
Q  199 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 259  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  390 taaagtcaaaaacagtttccttctacggtaataattctcttttatgatatgattaatcagt 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 262
Target Start/End: Original strand, 10771 - 10871
Alignment:
Q  162 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10771 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgc 10870  T
Q  262 c 262  Q
    |    
T  10871 c 10871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 95767 - 95616
Alignment:
Q  104 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 203  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  95767 aaatgctaaccggtgcccccgaggtactggttaagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatgaattgaaattatgtaattaatttataataaag 95668  T
Q  204 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  95667 tc-aaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 95616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11158 - 11032
Alignment:
Q  97 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  11158 tttagggaaatgctaactggtgcc-ccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactat 11061  T
Q  197 aataaagtcaaaaacagttttcttttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11060 aataaagtcaaaaacagtttcattttatg 11032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 256
Target Start/End: Original strand, 233918 - 234008
Alignment:
Q  166 ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  233918 ttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgaaaataatttccttttatggtatgtttaacc 234008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 74659 - 74526
Alignment:
Q  101 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtag-ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 199  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  74659 gggaaatactaaccggtacc-ccggaatactgattaaagatatgaaaaaaaaaattatatagtaaattaatgtagtgaaattgtataattaattgataat 74561  T
Q  200 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 234  Q
    ||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  74560 aaattaaaaaacaaatttcttttatggtaataatt 74526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Original strand, 5071 - 5136
Alignment:
Q  133 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 198  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5071 gttaagaatattaaaaaaaaaattatatagtagttaatttattgaaattgtgtaattaatttataa 5136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1128 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1128
Description:

Target: scaffold1128; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Original strand, 1415 - 1462
Alignment:
Q  145 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1415 aaaaaagaaattatataatagttattgcattgaaattgtgtaattaat 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Original strand, 66426 - 66555
Alignment:
Q  129 actagttaaggatatgaaaaaa-gaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| | ||||| |||| | |||| | |    
T  66426 actagttaaggatacgaaaaaatgaagttatataatagttattgcattgaaaattgtgtaattaatccataa-aaaataaaaaaaagttatattttttaa 66524  T
Q  227 taataattctcttttatggtatgcttaacca 257  Q
    |||||| | |||||| || ||| ||||||||    
T  66525 taataactttcttttttgttatccttaacca 66555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University