View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4994-Insertion-2 (Length: 913)

Name: NF4994-Insertion-2
Description: NF4994
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4994-Insertion-2
NF4994-Insertion-2
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (9-903)||(4677830-4678718)
chr1 (39-595)||(34466367-34466923)
chr1 (65-595)||(15595098-15595631)
chr1 (546-591)||(52549098-52549143)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (27-595)||(8659389-8659957)
chr7 (27-595)||(1301486-1302058)
chr7 (9-596)||(8667427-8668014)
chr7 (28-594)||(8654477-8655043)
chr7 (40-595)||(13333030-13333585)
chr7 (31-594)||(10493949-10494512)
chr7 (21-595)||(8585280-8585854)
chr7 (78-595)||(8628609-8629126)
chr7 (29-595)||(8646905-8647468)
chr7 (193-582)||(8671217-8671606)
chr7 (29-595)||(6789540-6790106)
chr7 (28-502)||(8636010-8636484)
chr7 (58-595)||(17267996-17268533)
chr7 (21-594)||(3147284-3147865)
chr7 (27-594)||(27830450-27831017)
chr7 (50-364)||(17260290-17260604)
chr7 (27-382)||(29581628-29581983)
chr7 (291-584)||(8640133-8640425)
chr7 (76-382)||(8590713-8591019)
chr7 (27-211)||(8545659-8545843)
chr7 (64-382)||(8602037-8602355)
chr7 (27-368)||(8382677-8383018)
chr7 (53-382)||(8576378-8576707)
chr7 (30-382)||(7877520-7877872)
chr7 (64-595)||(8581763-8582294)
chr7 (27-212)||(29577629-29577814)
chr7 (10-382)||(8570320-8570692)
chr7 (233-377)||(39985878-39986022)
chr7 (247-356)||(8538282-8538391)
chr7 (63-344)||(8559395-8559676)
chr7 (243-362)||(8610159-8610278)
chr7 (64-199)||(39985709-39985844)
chr7 (250-382)||(8017200-8017332)
chr7 (308-377)||(8102974-8103043)
chr7 (486-595)||(17260726-17260835)
chr7 (45-125)||(8609961-8610041)
chr7 (244-347)||(29577491-29577594)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (31-595)||(16657091-16657655)
chr2 (64-595)||(16661566-16662097)
chr2 (29-595)||(43625440-43626004)
chr2 (69-595)||(12234757-12235283)
chr2 (27-594)||(7542252-7542819)
chr2 (52-595)||(12258155-12258698)
chr2 (64-419)||(14703471-14703826)
chr2 (52-595)||(12244980-12245523)
chr2 (85-595)||(11999478-11999988)
chr2 (236-377)||(17716485-17716626)
chr2 (236-375)||(17717748-17717887)
chr2 (169-199)||(17716657-17716687)
chr2 (169-199)||(17717918-17717948)
chr2 (286-375)||(17703843-17703932)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (31-596)||(9335464-9336029)
chr4 (27-595)||(35132474-35133040)
chr4 (29-595)||(30775280-30775846)
chr4 (233-377)||(23596377-23596521)
chr4 (233-377)||(23587525-23587669)
chr4 (307-380)||(54396729-54396802)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (149-595)||(43744997-43745441)
chr8 (29-121)||(43744844-43744936)
chr8 (64-197)||(12528567-12528700)
chr8 (244-382)||(12528747-12528885)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (149-595)||(28220099-28220545)
chr5 (29-128)||(28219946-28220045)
chr5 (514-583)||(42555530-42555599)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (69-377)||(28910650-28910958)
chr6 (433-595)||(28911014-28911176)
chr6 (246-295)||(11314610-11314659)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 752; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 752; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 4678718 - 4677830
Alignment:
Q  9 taagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctagg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678718 taagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctagg 4678619  T
Q  109 tgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatat 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678618 tgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatat 4678519  T
Q  209 ttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggc 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678518 ttcgtttacaatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggc 4678419  T
Q  309 accagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4678418 accagcatctatggtagcttttcgttgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacgacattcttcacagacgaagttagatatgtttcggcaact 4678319  T
Q  409 tctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcac 508  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678318 tctctcatctttgtaaggatcatcgatgatatttcctcaacactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcac 4678219  T
Q  509 cagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctgc-nnnnnnnnnnn 607  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  4678218 cagtgatgaccctaaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctgcaaaaaaaaataa 4678119  T
Q  608 nnnttaatagtaaattcccatcatccatttatctagctaataaaatcgcaattgcattataatcaagataatcaagattttaaataaaggttagcaacca 707  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678118 aaattaatagtaaattcccatcatccatttatctagctaataaaatcgcaattgcatt---------ataatcaagattttaaataaaggttagcaacca 4678028  T
Q  708 caactctataatttattttcgttgttgtaatcacatcgcatctacgattgagattgcaacaattgtatttgatagtcattaatgacaatatcaagaatag 807  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678027 caagtctataatttattttcgttgttgtaatcacatcgcatctacgattgagattacaacaattgtatttgatagtcattaatgacaatatcaagaatag 4677928  T
Q  808 ctacacaacttcattagagtagcttttctttgtcaatagatgattttt-aaaatagaaataaaataattttcattatgataaac-aaacaactttttt 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4677927 ctacacaacttcattagagtagcttttctttgtcaatagatgatttttaaaaatagaaataaaataattttcattatgataaacaaaacaactttttt 4677830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34466923 - 34466367
Alignment:
Q  39 attattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttca 138  Q
    ||||| |||| | |||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||    
T  34466923 attatgcttcctcttgaactcctttgcaaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttca 34466824  T
Q  139 aagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtt-tacgatcactttcacttctcttg 237  Q
    ||||||  | |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || | | | ||   |||  |||||||    
T  34466823 aagacattatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttcca-caaagtcagctctcttg 34466725  T
Q  238 tcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgag 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  34466724 tcaagtccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgag 34466625  T
Q  338 aatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatga 437  Q
    ||||||| || || |||||||| || | ||| |||||||| |  |  ||    | ||||   || |||   || | |||||||| |||||| || |||||    
T  34466624 aatcattaaaataagcaggcacggtgataactgcattcttaattggtgattccaaatattcctctgcagtatcccgcatctttgaaaggatcatagatga 34466525  T
Q  438 tatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatg 537  Q
     |||||||||||||  |  |||||||| |||||||| |||||||    |||||| || || |||||  ||||||| || ||  |||||||||| |||||     
T  34466524 gatttcctcagcacataggtgcttctcctgacccttatacttaagggaaatcattggcttgtcattaacaccagcaataactttgaatggccataacatc 34466425  T
Q  538 atgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    || ||| |||||||| ||| ||||||| |  | || ||||||||||||||||||||||    
T  34466424 atatctgtttgaacatcaggatcactaaattttctgccaattaacctcttagcatctg 34466367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 595
Target Start/End: Original strand, 15595098 - 15595631
Alignment:
Q  65 caaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggat 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||| || ||||  |||||     |||| ||| | |||||    
T  15595098 caaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtggccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggat 15595197  T
Q  165 agacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagca 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | | |||  | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  15595198 agacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacagttaatcctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagct 15595297  T
Q  265 gta-------ggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggc 357  Q
    ||        ||||| |||||||   | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  15595298 gtcagctgtcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattgagataagcaggc 15595397  T
Q  358 acagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaactt 457  Q
    || |||||||| ||||| || || |  ||   || | || | || ||||| |||| ||||||| | || || || || |||||||||||||||| ||       
T  15595398 acggtaacaactgcattgtttacgggagac--taaaaatttctctgcaacctctcgcatctttttgagaatcatagacgatatttcctcagcacaaaagc 15595495  T
Q  458 gcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaac-aacag 556  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||   |||||| |||||||||||||| | || || |||||||| |||||    
T  15595496 gcttttcttgacccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacacca---atgaccttgaatggccacaactttatatcattttgaacaaacag 15595592  T
Q  557 aatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  15595593 aatcactaaacttcctactgattaatctcttagcatctg 15595631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 546 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 52549143 - 52549098
Alignment:
Q  546 ttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagca 591  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  52549143 ttgaacaacaggatcactaaacttcttaccaattaacctcttagca 52549098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 595
Target Start/End: Original strand, 8659389 - 8659957
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  8659389 actaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaagtg 8659488  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||  |    
T  8659489 gcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattttgtttaccatcacagt 8659588  T
Q  227 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagc 326  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  8659589 cacctctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccggaatctatggtggc 8659688  T
Q  327 ttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaagg 426  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||     
T  8659689 ttttcgctgagaatcattgaactatgcaggcactgtaacaacagcattcttcacaggtgacattagatatgtctctgcaacttctcgcatttttgtaagt 8659788  T
Q  427 attatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatg 526  Q
    |  || |||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||| || ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  8659789 accatagatgatatttcctccgcacaaaagtgcttctcctgacccttgtactgaacattaatcatgagtttgtcgttcacaccagcgataaccttgaatg 8659888  T
Q  527 gccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8659889 gccacaacatcatgtctttttgaacaactgaatcactaaacttcctaccaattaatctctttgcatctg 8659957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 595
Target Start/End: Original strand, 1301486 - 1302058
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  1301486 actaatgtccactttattcttctttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtg 1301585  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 226  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||  |    
T  1301586 gcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagt 1301685  T
Q  227 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcag----taggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatgg 322  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  1301686 cacttctcttgtcaaaaccatacgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatgg 1301785  T
Q  323 tagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgt 422  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||  |||||||||| || |||| ||||| |||||| ||    
T  1301786 tggcttttcgctgagaatcattgaaatgtgcaggcacagtaacaacagcatttgtcactggtgacattagatatgtctctgcaatttctcgcatcttcgt 1301885  T
Q  423 aaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctg 522  Q
    |||||  || ||||||||||||||  | | ||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  1301886 aaggaccatagatgatatttcctccacgcaaaagtgcttctcctgacccttgtacttaacaacaatcacgggtttgtcattcacaccggcgatgaccttg 1301985  T
Q  523 aatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1301986 aatggccacaacatcatgtctttttgaacaactgaatcactaaacttcctaccaattaatctcttagcatctg 1302058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 596
Target Start/End: Original strand, 8667427 - 8668014
Alignment:
Q  9 taagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctagg 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||    
T  8667427 taaggattttgggttctgactgatgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaagg 8667526  T
Q  109 tgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatat 208  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  8667527 tgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatat 8667626  T
Q  209 ttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggc 308  Q
    ||||  ||| |||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |     
T  8667627 ttcggctaccatcacagtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgccgcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagt 8667726  T
Q  309 accagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaact 408  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||    |||||||  || |||||     
T  8667727 accagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacggcattcttgaccggcgaccccagatatgcctccgcaacc 8667826  T
Q  409 tctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcac 508  Q
    |||| |||||||||||| |  || || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||    
T  8667827 tctcgcatctttgtaagcaccatagaagatatttcctcagcacaaaagtgcttctcttgacccttgtacttaacagtaatcataggtttgtcattaacac 8667926  T
Q  509 cagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctgc 596  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8667927 cagaaataaccttgaatggccacaacaatatatctctttgaacaacggggtcactaaacttcctaccaattaacctcttagcatctgc 8668014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 594
Target Start/End: Original strand, 8654477 - 8655043
Alignment:
Q  28 ctaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtgg 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8654477 ctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtgg 8654576  T
Q  128 cttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttc 227  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||| ||||   |     
T  8654577 cttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagtt 8654676  T
Q  228 acttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagct 327  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8654677 acttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgct 8654776  T
Q  328 tttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaagga 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |  ||    || ||||  || ||||  |||| |||||||||||| |    
T  8654777 tttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggtgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaa 8654876  T
Q  428 ttatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatgg 527  Q
         ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||   | ||| |||||||    
T  8654877 ccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttgacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatgg 8654976  T
Q  528 ccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatct 594  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8654977 ccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaacctcttagcatct 8655043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 40 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 13333585 - 13333030
Alignment:
Q  40 ttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13333585 ttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtgagtgtttcctgcggtggcttttacttcaa 13333486  T
Q  140 agacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtc 239  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||| |||||||||    
T  13333485 agacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcgcttaccatcacaatcacgtctcttgtc 13333386  T
Q  240 aaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaa 339  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13333385 aaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggccagcaatagcaccagcatctatggtggcctttcgctgagaa 13333286  T
Q  340 tcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgata 439  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  ||    | |||||  || ||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||    
T  13333285 tcattgaagtaagccggcacagtaacaacggcattcttgactggtgaccccatatatgcctctgcaacctctcgcatctttgtaaggaccatagatgata 13333186  T
Q  440 tttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgat 539  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| || || || ||  ||||||   | ||| |||||||||||||||| ||    
T  13333185 tttcctcggcacaaaagtgcttctcttgacccttgcacttagcggtaatcataggcttgtcgttgacaccagaagtaaccttgaatggccacaacattat 13333086  T
Q  540 gtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
     || ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13333085 atcattttgaacaaccggatcactaaacttcctaccaattaacctcttagcatctg 13333030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 31 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 10494512 - 10493949
Alignment:
Q  31 atgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggctt 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  10494512 atgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggctt 10494413  T
Q  131 ttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcact 230  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||    
T  10494412 ttacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccctcacaatcact 10494313  T
Q  231 tctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctttt 330  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10494312 tctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagccttt 10494213  T
Q  331 cgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggatta 430  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |  ||    | |||||  || ||||| |||| ||||||| ||||||  |    
T  10494212 cgttgagaatcgttgaagtaagccggcacagtaacaacagcattcttgactggtgaccccaaatatgcctctgcaacctctcgcatctttataaggacca 10494113  T
Q  431 tcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggcca 530  Q
    | |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||  |||| |   | ||| ||||||||||    
T  10494112 tagatgatatttcctcggcacaaaagtgcttctcttgacccttgtacttagcggtaatcataggtttgtcattgacacctgaagtaaccttgaatggcca 10494013  T
Q  531 caacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatct 594  Q
    |||||| || || ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  10494012 caacattatatcgttttgaacaaccggatcactaaacttcctgccaattaacctcttagcatct 10493949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 8585854 - 8585280
Alignment:
Q  21 gttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttcca 120  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||  | || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||    
T  8585854 gttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttcca 8585755  T
Q  121 gcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgat 220  Q
    || || ||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||    
T  8585754 gcggttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccat 8585655  T
Q  221 cactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctat 320  Q
    |||  | || | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  8585654 cacagttacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccat 8585555  T
Q  321 ggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaa-cttctctcatctt 419  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||  ||  | | |||||| || |||| ||||| |||| ||    
T  8585554 ggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacagtcacaactgcattttgaacaggtgatttcaaatatgtctctgcaatcttct-tcatgtt 8585456  T
Q  420 tgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgacc 519  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||    
T  8585455 tgtgaggatgatagatgatatttcctcagcacataggttcttttcttgacccttgtacttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagagataacc 8585356  T
Q  520 ctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
     |||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8585355 ttgaatggccacaacattatatcattttgaacaacgggatcactaaacttcctaccaattaacctcttggcatctg 8585280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 78 - 595
Target Start/End: Original strand, 8628609 - 8629126
Alignment:
Q  78 cattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||    
T  8628609 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 8628708  T
Q  178 gtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttga 277  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||    || | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  8628709 gtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattga 8628808  T
Q  278 ttatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 377  Q
    ||||    || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  8628809 ttatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcattttt 8628908  T
Q  378 cacagacgaagttagatatgtttcagcaa-cttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgta 476  Q
     ||||  ||  | | ||| |  || |||| ||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||    
T  8628909 tacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttct-tcatatttgcaaggataatagatgatatttcctcagcacataggttcttctcttgacccttgta 8629007  T
Q  477 cttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctacca 576  Q
    |||||||  |||||| || || |||||   |||||  || ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  8629008 cttaacagcaatcataggcttgtcattaagaccagaaataaccttgaatggccagaacatgatatccttttgaacaacaggatcactaaacttcctacca 8629107  T
Q  577 attaacctcttagcatctg 595  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  8629108 attaacctcttggcatctg 8629126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 595
Target Start/End: Original strand, 8646905 - 8647468
Alignment:
Q  29 taatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 128  Q
    |||||||||| || |||||||| || || || | | |||||| || |||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  8646905 taatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggc 8647004  T
Q  129 ttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttca 228  Q
    ||| || | ||||||   | |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||    | |||  |      
T  8647005 tttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatatttcgttcttcagcacaattt 8647104  T
Q  229 cttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctt 328  Q
     ||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  8647105 gttctcttgtcaaggccatatgcgagagcagcagctgttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggctt 8647204  T
Q  329 ttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggat 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||| |||| | || ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8647205 ttcgctgataatcattgaagtatgcaggcacagtaacaactgcattctttacaggggacattaaatatttctctgcaacctctcgcatctttgtgaggat 8647304  T
Q  429 tatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggc 528  Q
     |||||||||||||||||||||| |    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||   |||||| ||||||||    
T  8647305 catcgatgatatttcctcagcacaataacgcttctcttcacccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacccca---atgaccttgaatggc 8647401  T
Q  529 cacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||||| |  | || || |||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8647402 cacaacttcttatcattctgaacaacagaatcaaaaaacttcctaccgattaacctcttagcatctg 8647468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 8671606 - 8671217
Alignment:
Q  193 tcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacat 292  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  8671606 tcaaagacaaaaatatttcggttaccttcacggtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacat 8671507  T
Q  293 taagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttag 392  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |  ||    ||    
T  8671506 taagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattcttgaccggtgactccag 8671407  T
Q  393 atatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatc 492  Q
    |||||  || ||||| |||| |||||||||||| |  || || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||     
T  8671406 atatgcctccgcaacctctcgcatctttgtaagcaccatagaagatatttcctcagcacaaaattgcttctctagaccttcgtacttgacagtaatcata 8671307  T
Q  493 ggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaac 582  Q
    ||||| |||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  8671306 ggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaacaatatatctctttgaacaaccggatcactaaacttcctaccaattaac 8671217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 595
Target Start/End: Original strand, 6789540 - 6790106
Alignment:
Q  29 taatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 128  Q
    |||| ||||| || |||||| | || ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||    
T  6789540 taatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtggc 6789639  T
Q  129 ttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttca 228  Q
     || ||||  |||||   | | |||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||  ||  | | |    | |    
T  6789640 cttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaatta 6789739  T
Q  229 cttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctt 328  Q
     ||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  6789740 gttctcttatcaaggccatatgcaagagcagcagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtggctt 6789839  T
Q  329 ttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggat 428  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |     ||    | |||| | |||||||  || | |||||| || |||||    
T  6789840 tccgttgagaatcattgaaataagcaggcacagtaataactgcattttttatctctgactgcaaatatttctcagcaatctcccgcatcttggtgaggat 6789939  T
Q  429 tatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggc 528  Q
     || || || | ||||||| |||  | ||||||||| | |||||| |||| ||||  |||||| || || |||||  | ||||| |||||| ||||||||    
T  6789940 catagacgaaacttcctcaacacatagttgcttctcctcacccttatactcaacaacaatcatgggcttgtcattgacgccagcaatgaccttgaatggc 6790039  T
Q  529 cacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    || ||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6790040 caaaacatcatatcattttgaacaacagaatcactaaacttcctaccaattaacctcttagcatctg 6790106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8636484 - 8636010
Alignment:
Q  28 ctaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtgg 127  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||    
T  8636484 ctaatgtctaccttgttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtgg 8636385  T
Q  128 cttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttc 227  Q
    |||| |||||||||||  |||| || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||  |    | |||  |     
T  8636384 ctttaacttcaaagacttcacctttaattttgagtatagacacgtcgaatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacacagtt 8636285  T
Q  228 acttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagct 327  Q
    || |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |    
T  8636284 acctctcttttgaagtccatacgcaaaagctgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggat 8636185  T
Q  328 tttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaagga 427  Q
    || ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || |||||||| ||||| ||    |||||||  |||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  8636184 ttacgctgagaatcattgaaataagcgggcacagtaatgactgcattcttgacagatgattccagatatgcctcagcaatctctcgcatctttgtcagga 8636085  T
Q  428 ttatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcat 502  Q
      || || ||||||||||||| |  || |||||| | || ||||||||| || |||  |||||| ||||| ||||    
T  8636084 ccatagacgatatttcctcaggaaaaagttgcttttgttcacccttgtatttcacaacaatcatgggtttgtcat 8636010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 595
Target Start/End: Original strand, 17267996 - 17268533
Alignment:
Q  58 tcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattt 157  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || || || |||| |||| | ||||| || ||||| |||||   | |||| |||     
T  17267996 tcctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattg 17268095  T
Q  158 taaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagc 257  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    | |||  | | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  17268096 taacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttcaacacagttagttctcttgccaaggccatatgcaatagc 17268195  T
Q  258 tgcagcagtaggttcgttgattat-ttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcagg 356  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17268196 tgcagcagttggttcattgattaccttcaat-acattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcgttgaagtaagccgg 17268294  T
Q  357 cacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaact 456  Q
     |||||||  || |||||| | || || ||   |||||||   |||||||  || | ||||||||| || |  || || || |||||||| |||| ||      
T  17268295 gacagtaatgacagcattcataaccgatgattctagatattcctcagcaatctcccgcatctttgtgagtaccatagacgaaatttcctctgcacaaaag 17268394  T
Q  457 tgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacag 556  Q
    || |||||  | ||||||||||| |    |||||| ||||| ||||||  | | || |||||| ||||||||||| |||| || |||||||| || ||||    
T  17268395 tgtttctcccgtcccttgtacttgagggaaatcattggtttgtcattcatatccgcaatgaccttgaatggccacgacattatatctttttggaccacag 17268494  T
Q  557 aatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
     ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  17268495 gatcactaaacttcctaccaattagtctcttagcatctg 17268533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 594
Target Start/End: Original strand, 3147284 - 3147865
Alignment:
Q  21 gttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttcca 120  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  3147284 gttctcactaatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcct 3147383  T
Q  121 gcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg------tt 214  Q
    ||  |||| || |||| ||||||   | |||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||| ||      |     
T  3147384 gcgatggccttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacccaagtcaaagataaaaatattacgctcctcta 3147483  T
Q  215 tacgat--cactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcacca 312  Q
     || ||  |||  | | |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || | |||||| ||||||||  |||||    
T  3147484 cacaattacacaattagttctcttgtccagtccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacacca 3147583  T
Q  313 gcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctc 412  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||| | |   || | |    || |||   |  |    
T  3147584 gcatctattgtcgctttccgctgagcatcattgaaataagcaggtacggtaacaactgcattcttgacaggcaattctaaaaactcctctgcagtcttgc 3147683  T
Q  413 tcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagc 512  Q
     ||||||||| || |  || ||||| ||||| |||||||  |  |||||||| || |||||| |||||||   |||||| ||||| |||||| | ||       
T  3147684 gcatctttgttagaaccatagatgagatttcttcagcacataggtgcttctcctgtcccttgcacttaaccgaaatcatgggtttgtcattcactccgca 3147783  T
Q  513 gatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatct 594  Q
     |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3147784 aatgaccttgaatggccacaacatcatatcattttgaacaacagaatcaccaaacttcctaccaattaacctctttgcatct 3147865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27831017 - 27830450
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  27831017 actaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagtt 27830918  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 226  Q
    || || ||||  |||||   | |||| ||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  | |  |  ||    
T  27830917 gccttaacttggaagaccttatccttaattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtatatt 27830818  T
Q  227 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagc 326  Q
       ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  | || |||||||| |||||||||||||| | |||||  || ||    
T  27830817 ttgttcccgtgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggc 27830718  T
Q  327 ttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaagg 426  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |  || |||||||| || |  ||    | |||||  || || |  |||| |||||||||||||    
T  27830717 ttttcgttgagagtcattgaaataagctggcacggttattactgcattcttaaccggtgattgcaaatatgcctccgcgatctctcgcatctttgtaagg 27830618  T
Q  427 attatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatg 526  Q
    |  || ||||| |||||||| ||||  |  || ||||| |||| |||||||||||||  || ||| ||||| |  ||  || |||  |||||  |||||     
T  27830617 accattgatgaaatttcctccgcacataagtgtttctcctgactcttgtacttaacaacaaacatgggtttgttgtttacatcagtaatgactttgaata 27830518  T
Q  527 gccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatct 594  Q
    |||||||  | || |||||||||||||||  ||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27830517 gccacaagtttatatctttttgaacaacatcatcgctgaacttcctaccaattaacctcttagcatct 27830450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 364
Target Start/End: Original strand, 17260290 - 17260604
Alignment:
Q  50 ttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacc 149  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || || || || |||| |||| | ||||| || ||||| |||||   | |    
T  17260290 ttttgatctcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatc 17260389  T
Q  150 cttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatat 249  Q
    ||| ||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||     | |||  | | |||||||| |||  ||||||    
T  17260390 cttaattgtaacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaaacacaattagttctcttgacaaggccatat 17260489  T
Q  250 gcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagt 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||  |  |  |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17260490 gcaatagctgcagcaataggttcattaattaacttcaaaacataaaggccagcaataacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaat 17260589  T
Q  350 atgcaggcacagtaa 364  Q
    | ||||| |||||||    
T  17260590 aagcaggaacagtaa 17260604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29581983 - 29581628
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||    
T  29581983 actaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcgcaaagtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtg 29581884  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 226  Q
    || || ||||||||   | || |||||| | | || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | ||   |    
T  29581883 gccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaatatatttcgttttccaacaaaat 29581784  T
Q  227 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagc 326  Q
     || || ||| | || |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||    || ||||| || ||||| ||    ||||||||| |||| ||    
T  29581783 tacctcccttttgaataccatatgcaagtgcagcagcagttggttcgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccagcatctttggtggc 29581684  T
Q  327 ttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  29581683 ttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtaatcactgcattctttacag 29581628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 8640425 - 8640133
Alignment:
Q  291 attaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcac-agacgaagt 389  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||  |  ||  |    
T  8640425 attaaggccagcaatggccccggcatctatggtggctttttgctgataatcattgaagtaagcaggcatagtaacaactgcattctttacggggggacat 8640326  T
Q  390 tagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatc 489  Q
    || |||| | || ||||| |||| |||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  8640325 taaatatttctctgcaacctctcgcatcttcgaaaggatcatagatgatatttcctcggcacaaaaacgcttctcttcacccttgtatttaacaataatc 8640226  T
Q  490 atcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacc-tcctaccaattaacct 584  Q
     | ||||| |||||| | |||   |||||| |||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||    
T  8640225 gtgggtttgtcattcacccca---atgaccttgaatggccacaacttcatatcattttgaacaacagaaacaaaaaaccttcctaccaattaacct 8640133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 382
Target Start/End: Original strand, 8590713 - 8591019
Alignment:
Q  76 accattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||  | |||| |||| | | || | |||||||||||    
T  8590713 accattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagagacacatcaa 8590812  T
Q  176 aagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg-tttacga--tcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttc 272  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  || | |||||| ||| |||  | ||||||   |||||| | ||  ||||||||||   | || ||||| |||||    
T  8590813 aagtgccaccaccaagatcaaagatgaacacatttcgttttccgatgttactttc---tctcttttgaaggccatatgcaaggccagcggcagttggttc 8590909  T
Q  273 gttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggca 372  Q
     || |||||  | || ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  8590910 attaattatccgcattacattcaagccagcaatgacaccagcatctttggtagctttcctctgagaatcattaaaataagctggcacagtaacaactgca 8591009  T
Q  373 ttcttcacag 382  Q
    ||||| ||||    
T  8591010 ttcttgacag 8591019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 8545659 - 8545843
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    |||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| ||||||||||    
T  8545659 actaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaaagtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagtg 8545758  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 211  Q
    || || || ||||||||   |   || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  8545759 gccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8545843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 382
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602355
Alignment:
Q  64 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 163  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || |||||||||| |  |  ||| ||| | || |    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaa 8602136  T
Q  164 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagc 263  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||  |    | |||  | |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || ||    
T  8602137 gagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctgc 8602236  T
Q  264 agtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagta 363  Q
    ||| || || ||||||||  | || ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  8602237 agttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcacagta 8602336  T
Q  364 acaacggcattcttcacag 382  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  8602337 acaactgcattcttgacag 8602355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8383018 - 8382677
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||| ||| ||||||    
T  8383018 actaatgtccttattatgcttcctcttgaactcgtcaacaaagtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtg 8382919  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 226  Q
    || || ||  ||||||||  |  ||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||  |    |  ||  |    
T  8382918 gccttcacaacaaagacattattcttaattgtgaggagagacacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctctcttcaagacaat 8382819  T
Q  227 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagc 326  Q
     |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || ||||| || || ||||||||  | || ||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||    
T  8382818 tagctctcttctgaaggccatatgcaagagcagcggcagttggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggc 8382719  T
Q  327 ttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaac 368  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8382718 tttccgttgagaatcattgaaatatgcaggcacggtaacaac 8382677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Original strand, 8576378 - 8576707
Alignment:
Q  53 tgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccaccctt 152  Q
    |||||||||  |||||||  | ||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| ||||||     |||    
T  8576378 tgaactccttaacaaagtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttctt 8576477  T
Q  153 gattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgca 252  Q
     | | | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||  | |||  | |  |||||| | ||  ||||| |||    
T  8576478 aactgtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgca 8576577  T
Q  253 atagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatg 352  Q
    | |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || ||| |||| || |||||||| || || |    
T  8576578 agagctgccgcagtcggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataag 8576677  T
Q  353 caggcacagtaacaacggcattcttcacag 382  Q
    ||||||||| ||  || |||||||| ||||    
T  8576678 caggcacagaaatcactgcattcttaacag 8576707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7877872 - 7877520
Alignment:
Q  30 aatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggct 129  Q
    ||||||||| ||||||||| | || ||||||   || || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||    
T  7877872 aatgtccactttattcttcctcttaaactccatcactaaatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagct 7877773  T
Q  130 tttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttac-gatcactttca 228  Q
     |||| ||||||  | || | || | | | || | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  || | ||||||||| | |||    || |    
T  7877772 attacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagagacacatcgaaagtgccaccaccaagatcaatgatgaacacatttcgttttccgatgttattta 7877673  T
Q  229 cttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctt 328  Q
     ||||||| | ||  ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||  | || ||||| || || ||||  |||||||||||| | || ||||    
T  7877672 -ttctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagttggttcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggctt 7877574  T
Q  329 ttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 382  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7877573 ttcgttgagaatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacag 7877520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 595
Target Start/End: Original strand, 8581763 - 8582294
Alignment:
Q  64 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 163  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||| |||||||||||| || |||||| || |   |  ||| | | | || |    
T  8581763 acaaagtgattcaccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgagaa 8581862  T
Q  164 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagc 263  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||  | |||  | |  |||||| | ||  |||||||||| |||||| ||    
T  8581863 tagacacatcaaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgc 8581962  T
Q  264 agtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagta 363  Q
    ||| ||||| ||||||||  | || ||||| || || |||||  |||| |||||| | || ||| |||| || |||||||| || || ||||| ||||||    
T  8581963 agtcggttcattgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagta 8582062  T
Q  364 acaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttct 463  Q
    |  || |||||||| ||||  ||    | | |||  || ||||  |||| ||||| ||| || || |  ||||||||||| ||||||  ||  || || |    
T  8582063 atcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgtcagaataacagatgatatttcttcagcaagaaagtgttttt 8582162  T
Q  464 cttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcact 563  Q
    | | ||||||||| || |||   ||  ||||||| |||||  |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||    
T  8582163 ccttacccttgtagttcacaacgattgtcggtttgtcattagcacctgcggtgaccttgaagggccacaacttgatatccttttgaacaatggaatcact 8582262  T
Q  564 atacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  8582263 atatttccttccaattaacctctttgcatctg 8582294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29577814 - 29577629
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||    
T  29577814 actaatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtg 29577715  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg 212  Q
    || |||||||||||   | || |||| | | | || | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  29577714 gcctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagagacacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaagatgaatacatttcg 29577629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 8570320 - 8570692
Alignment:
Q  10 aagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggt 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||  |||||||   ||| ||||||||||||||| || || || || ||||    
T  8570320 aaggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaaagtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggt 8570419  T
Q  110 gggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatt 209  Q
    | |||| |||||||||||| || |||||| ||     | |||| | | | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  8570420 gagtgtctccagcagtggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatt 8570519  T
Q  210 tcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggca 309  Q
    ||  |||  | ||   | |  |||||| | ||  |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||  | || ||||| || ||||||||  ||    
T  8570520 tctcttatcaacaaaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttca 8570619  T
Q  310 ccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 382  Q
    || |||||| | || ||| |||| || |||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| ||||    
T  8570620 cctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacag 8570692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 377
Target Start/End: Original strand, 39985878 - 39986022
Alignment:
Q  233 tcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcg 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||||  ||    
T  39985878 tcttgtcaagaccataagcaatggcagcagcagtgggctcattgataattcgcatgacattaagaccggcaataactccagcatccttggtagcttgacg 39985977  T
Q  333 ctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 377  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39985978 ctgggagtcattaaagtaagcagggacagtaacaacagcattctt 39986022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 356
Target Start/End: Original strand, 8538282 - 8538391
Alignment:
Q  247 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 346  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  8538282 tatgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaatcattga 8538381  T
Q  347 agtatgcagg 356  Q
    | || |||||    
T  8538382 aataagcagg 8538391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 344
Target Start/End: Original strand, 8559395 - 8559676
Alignment:
Q  63 tacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagg 162  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || |||||||||| |  |  ||| ||| | ||     
T  8559395 tacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgaga 8559494  T
Q  163 atagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcag 262  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  || |||||||  |    | |||  | |  |||||| | ||  |||||||||| ||| || |    
T  8559495 agagaaacatcaaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttctctctttaacacaattagatctcttttgaagtccatatgcaagagcagctg 8559594  T
Q  263 cagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcatt 344  Q
    |||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| |||||| |||| ||| |||  |||||||||||    
T  8559595 cagttggttcattgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaatcatt 8559676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Original strand, 8610159 - 8610278
Alignment:
Q  243 accatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatca 342  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  8610159 accatatgcaagagccgcagccgttggttcattgataatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaatca 8610258  T
Q  343 ttgaagtatgcaggcacagt 362  Q
    || || || |||||||||||    
T  8610259 ttaaaataagcaggcacagt 8610278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Original strand, 39985709 - 39985844
Alignment:
Q  64 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||| ||| || |||||||| || ||||||| |||  | |  ||  | || |    
T  39985709 acaaagtggttcaccattctgttgtcaaaatcctcacctccaagatgggtgtctccggctgtggctttcacctcaaagataccctcttcaatagttagca 39985808  T
Q  164 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39985809 aagagacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 39985844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8017332 - 8017200
Alignment:
Q  250 gcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagt 349  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||   |  ||||| ||||| |||||| |||| |||||  | || ||||  ||||| |||||||||||||    
T  8017332 gcaatagctgcagctgttggctcgttgataattctcaaaacattgagtcctgcaatgacaccggcatcctttgtggcttgacgctgcgaatcattgaagt 8017233  T
Q  350 atgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 382  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||    
T  8017232 aagctggaactgtaacaacggcattcttcacag 8017200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 377
Target Start/End: Original strand, 8102974 - 8103043
Alignment:
Q  308 caccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 377  Q
    ||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  8102974 caccagcatctttagttgcttgacgctgagaatcattgaagtaagcagggacagtgacgacggcattctt 8103043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 595
Target Start/End: Original strand, 17260726 - 17260835
Alignment:
Q  486 aatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctc 585  Q
    |||||| ||||| ||||||  | | || |||||| ||||||||||| |||| || |||||||| || |||| ||||||| || ||||||||| ||  |||    
T  17260726 aatcattggtttgtcattcatatccgcaatgaccttgaatggccacgacattatatctttttggaccacaggatcactaaacttcctaccaactagtctc 17260825  T
Q  586 ttagcatctg 595  Q
    ||||||||||    
T  17260826 ttagcatctg 17260835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 125
Target Start/End: Original strand, 8609961 - 8610041
Alignment:
Q  45 cttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagt 125  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  8609961 cttccttttgaactccttcacaaagtgattaaccattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagt 8610041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29577594 - 29577491
Alignment:
Q  244 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcat 343  Q
    ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| || ||||||||    || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29577594 ccatatgcaagtgcagcagcagttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataatgccggcatctttggtggcttttcgctgagaatcat 29577495  T
Q  344 tgaa 347  Q
    ||||    
T  29577494 tgaa 29577491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16657655 - 16657091
Alignment:
Q  31 atgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggctt 130  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  16657655 atgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggctt 16657556  T
Q  131 ttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcact 230  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||    
T  16657555 ttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcact 16657456  T
Q  231 tctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctttt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16657455 tctcttgtcaagaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcaccagcatctatggtggctttt 16657356  T
Q  331 cgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggatta 430  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||    | | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16657355 cgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttgacaggcgactccataaatgcctcagcaacttctcgcatctttgtaaggatca 16657256  T
Q  431 tcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggcca 530  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||| |||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  16657255 tagatgatatttcctcagcacaaaattggctctcttgacccttatactgaagagtaatcattggtttgtcattcactccggcaatgaccttgaatggcca 16657156  T
Q  531 caacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16657155 caagatgatatcattttgaacaacaggatcactaaacttcctaccgattaaccttttagcatctg 16657091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 64 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16662097 - 16661566
Alignment:
Q  64 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | ||||    
T  16662097 acaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgagga 16661998  T
Q  164 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagc 263  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||  | |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  16661997 gagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaattacttcttttgtcaaggccatatgcaatagctgctgc 16661898  T
Q  264 agtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagta 363  Q
    ||| ||||| ||||||||    |  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||     
T  16661897 agtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgttaaaataagcaggaacagtg 16661798  T
Q  364 acaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttct 463  Q
    ||||| ||||| || || |  ||    | ||| |  || ||||| ||  |||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| |||| ||   ||||||    
T  16661797 acaactgcatttttaaccggtgattccaaataagcctctgcaacctccttcatgtttgtgaggacaatagatgagatttcctcggcacaaaggagcttct 16661698  T
Q  464 cttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcact 563  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||| |  |||||    
T  16661697 cctgacccttgtacttaacactaatcgtaggtttgtcattaacaccagcaataaccttgaacggccacaacagtatatctttttgaacaacggggtcact 16661598  T
Q  564 atacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16661597 aaatttcctaccaattaacctcttagcatctg 16661566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 595
Target Start/End: Original strand, 43625440 - 43626004
Alignment:
Q  29 taatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 128  Q
    |||| |||||||| |||||||| |  || || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  43625440 taatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggc 43625539  T
Q  129 ttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttca 228  Q
    ||| ||    |||||     |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  | | |||  | |    
T  43625540 tttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctccaacacaatta 43625639  T
Q  229 cttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctt 328  Q
     ||||||||| ||  || ||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||| | | |  |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  43625640 attctcttgttaaggccgtatgctagagcagcagctgttggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatctatggtggctt 43625739  T
Q  329 ttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaag-ttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaagga 427  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  | |  ||| | || | || ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  43625740 ttcgctgagaatcattgaagtaagcaggcacggtaacaactgcattctttacggggggacattaaaaatttctctgcaacctctcgcatctttgtgagga 43625839  T
Q  428 ttatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatgg 527  Q
    | || || ||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||| | | |||   ||||||||||||||    
T  43625840 tcatagacgatatttcctcaggacaaaaacgcttctcttgacccttgtattttacaataatcattggtttgtcatccacccca---atgaccctgaatgg 43625936  T
Q  528 ccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43625937 ccacaacatgatatcattttgaacaacagaatcactaaacttcctaccgattaacctcttagcatctg 43626004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 595
Target Start/End: Original strand, 12234757 - 12235283
Alignment:
Q  69 gtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagac 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||  ||||||  ||| |||||| | |||| ||||    
T  12234757 gtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagac 12234856  T
Q  169 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtag 268  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||  | | |||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||  | |    
T  12234857 acatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaatcagttctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgg 12234956  T
Q  269 gttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaac 368  Q
    ||||||| ||||     || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  12234957 gttcgttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttgcttttcgttgagaatcattgaaataagcaggcacggtaacaac 12235056  T
Q  369 ggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttga 468  Q
     |||||||| || |   |   || |||||  ||||| | ||||| ||||||||| || |  || ||||||| ||| || | ||  |  ||||||||| ||    
T  12235057 tgcattcttaactggaaattgtaaatatgcctcagcgatttctcgcatctttgtgagtaccatagatgatacttcttcgggacatagctgcttctctcga 12235156  T
Q  469 cccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacc 568  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||||||   |||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||   ||||||| ||     
T  12235157 cccttgtacttgacaataatcatgggtttgtcattgacaccagcagcgaccttgaatggccacaacatcacatcatcttgaacaacttgatcactaaact 12235256  T
Q  569 tcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12235257 tcctaccaattaacctcttagcatctg 12235283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 594
Target Start/End: Original strand, 7542252 - 7542819
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    |||||||||||| || |||||  | |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  7542252 actaatgtccactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtg 7542351  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 226  Q
    || || ||||  |||      ||||| ||  | || | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  | ||||   |    
T  7542352 gccttaacttggaagttgttgcccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataat 7542451  T
Q  227 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagc 326  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||      || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7542452 cagttctcttgtcaaggccatatgcaacagctgcggcagtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggc 7542551  T
Q  327 ttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaagg 426  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |    || ||| |  ||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  7542552 ttttcgttgagaatcattaaaataagcaggtacagtaacaactgcattcgtcacagttgtttctaaatacgactcagcaatttctcgcatctttgtgagt 7542651  T
Q  427 attatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatg 526  Q
    |  || |||||||  || ||||||   | ||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||| ||||| ||  | ||| ||||||    
T  7542652 accatagatgatacctcttcagcatggagttgtttctcctgatccttgtacttaacggtaatcatgggtctgtcattgtcacccgcagtcaccttgaatg 7542751  T
Q  527 gccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatct 594  Q
    |||| ||||  || || | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7542752 gccataacagtatatcatcttgaacaacaggatcactaaacttcctaccaattaacctcttagcatct 7542819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 12258698 - 12258155
Alignment:
Q  52 ttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccaccct 151  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||  | |||    
T  12258698 ttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatcct 12258599  T
Q  152 tgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcg-tttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatg 250  Q
    | ||  | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| |||  | | |||| |||||||  |||||||    
T  12258598 taatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattccgtttttcga-cacaattaattcttttgtcaaggccatatg 12258500  T
Q  251 caatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagta 350  Q
    ||| |||||||||||||||||| || | ||| |  || ||||| || ||| ||||   |||  ||||||| || ||||| |  || |||||| | || ||    
T  12258499 caaaagctgcagcagtaggttcatttaatatcttcataacattcaggccaacaatattacccacatctatagtggctttcctttgtgaatcactaaaata 12258400  T
Q  351 tgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagca 450  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |  ||   || |||||  ||||||| ||||| ||||||||| |  |  |  ||||||| |||||| |||    
T  12258399 tgcaggcacagtaacaactgcattcttaacgggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatctttgtcaataccacagatgatacttcctcggca 12258300  T
Q  451 ctaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaa 550  Q
    | ||  ||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||  ||||  |||||||  ||||  | |||||||||||||| || || | |||||    
T  12258299 caaagctgcttctcttgattcttgtactttaccgtaatcatgggtttgccattgacaccagcagtgactttaaatggccacaacattatatcatcttgaa 12258200  T
Q  551 caacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    | ||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12258199 ctacttgatcactaaacttcctaccaattaacctcttagcatctg 12258155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 419
Target Start/End: Original strand, 14703471 - 14703826
Alignment:
Q  64 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || | ||  |||||    ||||| ||| | ||||    
T  14703471 acaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcagtagccttaatttggaagacggtgcccttaattgttagga 14703570  T
Q  164 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagc 263  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | | ||   ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14703571 gagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatattacgttctccaccataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagc 14703670  T
Q  264 agtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagta 363  Q
     |||||||| || ||||     || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||  ||||||||| | || || |||||||| |||    
T  14703671 tgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtggcttttctttgagaatcactaaaataagcaggcaccgta 14703770  T
Q  364 acaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctt 419  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  14703771 acaactgcattcttaacagttgactctaaatatgtctcagcaatttctcgcatctt 14703826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 12245523 - 12244980
Alignment:
Q  52 ttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccaccct 151  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||    | |||    
T  12245523 ttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttggaagatgttatcct 12245424  T
Q  152 tgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgc 251  Q
    | ||  | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||  | | |||  |||  |||||| ||||  ||||||||    
T  12245423 taatagttaggatagaaacgtcaaaagtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttcaaggccatatgc 12245324  T
Q  252 aatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtat 351  Q
    || |||||||||||| ||||| || ||||     || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || ||     
T  12245323 aacagctgcagcagtgggttcattcattaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaatcactaaaataa 12245224  T
Q  352 gcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcac 451  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||   || |||||  ||||||| ||||| ||||||||| || |  || ||||||| ||| |||||||    
T  12245223 gcaggtacagtaacaacagcattctttaccggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatctttgttagtaccatagatgatacttcttcagcac 12245124  T
Q  452 taacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaac 551  Q
      |  |||||||| || || ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  |||||||  ||||| |||| ||||| || |     || |   ||||    
T  12245123 atagctgcttctcctggcctttgtagttaacagtaattattggtttgtcattgacaccagcagtgaccttgaacggccataataatgcatcatccagaac 12245024  T
Q  552 aacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    || || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12245023 aataggatcactaaacttcctaccaattaatctcttagcatctg 12244980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 595
Target Start/End: Original strand, 11999478 - 11999988
Alignment:
Q  85 ttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccac 184  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||    |||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||    
T  11999478 ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccac 11999577  T
Q  185 caccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttg 284  Q
    | ||||| |||||||| || || |||| ||  | | |||  |||  |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||        
T  11999578 cgccaagatcaaagactaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattcattaccct 11999677  T
Q  285 aatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagac 384  Q
     || ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || || || || |||||||||||  ||||||| || |      
T  11999678 tataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagctggtacagtaacaacaacattctttaccggt 11999777  T
Q  385 gaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacac 484  Q
    ||   || |||||  ||||||| ||||| |||||| || || |  || ||||||| ||| |||||||  |  |||||||| || || ||||||||||||     
T  11999778 gattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatcttcgttagtaccatagatgatacttcttcagcacatagctgcttctcctggcctttgtacttaacag 11999877  T
Q  485 taatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacct 584  Q
    |||| || ||||| |||||  || ||||  ||||| |||||||||| ||||     || | ||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  11999878 taattattggtttgtcattgacatcagcagtgaccttgaatggccataacaatccatcatcttgaacaacaagatcactaaacttccaaccaattaacct 11999977  T
Q  585 cttagcatctg 595  Q
    |||||||||||    
T  11999978 cttagcatctg 11999988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17716626 - 17716485
Alignment:
Q  236 tgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctg 335  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||   |||| |||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||| || |||    
T  17716626 tgtcaaaaccataagcaatggctgcagcagtgggctcattaataattctcatgaaattaagaccagcaatagcaccagcatgcttagtagcttgtctctg 17716527  T
Q  336 agaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 377  Q
    ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17716526 agaaaaattaaagtaagcagggacagtaacaacggcattctt 17716485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17717887 - 17717748
Alignment:
Q  236 tgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctg 335  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||| ||||  ||||||||||| |||||||    | | |||||  | ||| ||| |  |||    
T  17717887 tgtcaaaaccataagcaatggctgcagcagtgggctcatcgataatttccatgacattaagaccagcaaaaagagcggcatccttagtaacttgtatctg 17717788  T
Q  336 agaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattc 375  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17717787 agaatcattaaagtaagcagggacagtaacaacggcattc 17717748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17716687 - 17716657
Alignment:
Q  169 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17716687 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 17716657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17717948 - 17717918
Alignment:
Q  169 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17717948 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaaga 17717918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17703932 - 17703843
Alignment:
Q  286 atgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattc 375  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||||  | ||||||| || |||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  17703932 atgacattaagttcagcaataacagcagcatccttagtagcttgtctctgagaattattaaagtaaacagggacagtaacaacagcattc 17703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 9336029 - 9335464
Alignment:
Q  31 atgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggctt 130  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||    
T  9336029 atgtccactttattcttcttttttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggctt 9335930  T
Q  131 ttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcact 230  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| |    
T  9335929 ttacttcaaatagatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatt 9335830  T
Q  231 tctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctttt 330  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||    
T  9335829 tctcttatcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggccttt 9335730  T
Q  331 cgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggatta 430  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | |||    | |||||  || ||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  9335729 cgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattcttgaccggcgaccccaaatatgcctccgcaacctctctcatctttgtaagcaaca 9335630  T
Q  431 tcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggcca 530  Q
    | || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||  || ||| ||||||||||    
T  9335629 tagaagatatttcctcagcacaaaagtgcttctcttgacccttgtagttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggcca 9335530  T
Q  531 caacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctgc 596  Q
    |||||  || ||| ||||||||||   ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9335529 caacaatatatctctttgaacaaccagatcactaaacttcctaccagttaatctcttagcatctgc 9335464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 595
Target Start/End: Original strand, 35132474 - 35133040
Alignment:
Q  27 actaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtg 126  Q
    ||||||||| || || |||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  35132474 actaatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttccggcagtg 35132573  T
Q  127 gcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcacttt 226  Q
    || || ||||  ||||||  | |||| ||  |||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||  | | |||  |    
T  35132574 gccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaatattttgttctccagcacaat 35132673  T
Q  227 cacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagc 326  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||| |   || |||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  35132674 cagatctcttgtcaaggccatatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaatagcaccagcatctatagtggc 35132773  T
Q  327 ttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaagg 426  Q
    |||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||   || |||||   | |||| ||||| ||||||||| ||     
T  35132774 ttttcgttgagaatcactaaaataagcaggcacagtaacaactgcattcttaacagttgattctaaatatg--cctgcaatttctcgcatctttgtgagt 35132871  T
Q  427 attatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatg 526  Q
    |  || ||||||| ||| || |||   | |||||| || | | |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||  |||| ||  ||||| ||||||    
T  35132872 accatggatgatacttcttccgcatagagttgcttttcctcatccttgtacttaaccgtaatcatgggtttgtcatttacaccggcagtgaccttgaatg 35132971  T
Q  527 gccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||| | ||  || || | |||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35132972 gccatagcagtatatcatcttgaacaataggatcactaaacttcctaccaattaaccttttagcatctg 35133040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 595
Target Start/End: Original strand, 30775280 - 30775846
Alignment:
Q  29 taatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 128  Q
    |||||||||| || |||||| | || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||    
T  30775280 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagcagttgc 30775379  T
Q  129 ttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttca 228  Q
    ||| |||||||| ||| || |  | ||  | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | |  |||||    |    
T  30775380 tttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacaccta 30775479  T
Q  229 cttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagctt 328  Q
    | |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||   || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  30775480 cctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctt 30775579  T
Q  329 ttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggat 428  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||| || || |  ||    | |||  | || ||||  |||||||| ||||| ||||     
T  30775580 ttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacagtgataactgcatttttaactggggattccaaatacatctctgcaatctctctcatatttgtgaggac 30775679  T
Q  429 tatcgatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggc 528  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||  |   | ||||| || |||||| ||||||    |||||| ||||| |||||  ||||||  |  ||| ||||||||    
T  30775680 tattgatgaaatttcctcggcacagaggagtttctcctggcccttgaacttaagggaaatcatgggtttgtcattaacaccagaaacaaccttgaatggc 30775779  T
Q  529 cacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||  || ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30775780 cacaacaaaatatctttttgaacaacagggtcgctaaatttcctaccaattaaccttttagcatctg 30775846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23596521 - 23596377
Alignment:
Q  233 tcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcg 332  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||   || ||||| ||||||| |||| ||||||||||  | |||||||  ||    
T  23596521 tcttatcaagaccataagcaatagcggcagcagtgggctcgttaataattctcatcacattgagtccagaaatgacaccagcatccttagtagcttgacg 23596422  T
Q  333 ctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 377  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23596421 ttgtgaatcgttgaagtatgcaggcacggttacaacggcattctt 23596377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23587669 - 23587525
Alignment:
Q  233 tcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcg 332  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||   |  ||||| ||||||| |||| |||| |||||| | |||||||  ||    
T  23587669 tcttatcaagaccataagcaatagcagcagcggtaggttcattaataattctcaacacattgagtccagaaatgacaccggcatcttttgtagcttgacg 23587570  T
Q  333 ctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattctt 377  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23587569 ttgtgaatcgttgaagtaagcaggcacagttacaacggcattctt 23587525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 380
Target Start/End: Original strand, 54396729 - 54396802
Alignment:
Q  307 gcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcac 380  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  54396729 gcaccagcatctttcgtagcttgacgttgagaatcattgaaataagcaggaacagtaacaacagcattcttcac 54396802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 595
Target Start/End: Original strand, 43744997 - 43745441
Alignment:
Q  149 ccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccata 248  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |   ||  ||   | | ||||||| || | ||||||    
T  43744997 ccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctcgcacagagttagttctcttttccagaccata 43745096  T
Q  249 tgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaag 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||     
T  43745097 tgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatcta--gtggctttccgctgataatcattgaaa 43745194  T
Q  349 tatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagttagatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcctcag 448  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| |||| | |    | | |||| || ||||  || | ||||||||| || || || ||||| ||||| || |    
T  43745195 taagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggcaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgagatttcttcgg 43745294  T
Q  449 cactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttg 548  Q
    |||  |  |||||||| || |||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||   || |  |||||| |||| ||||||||| | || || |||||    
T  43745295 cacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttcatatcattttg 43745394  T
Q  549 aacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43745395 aacatcagaatcattaaacttcctaccaattaacctcttagcatctg 43745441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 43744844 - 43744936
Alignment:
Q  29 taatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccag 121  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  43744844 taatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttccag 43744936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 197
Target Start/End: Original strand, 12528567 - 12528700
Alignment:
Q  64 acaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaagga 163  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || ||||| ||||||  |  ||| | | |||| |    
T  12528567 acaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattattctttactgtaagaa 12528666  T
Q  164 tagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaa 197  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12528667 gagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaa 12528700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 382
Target Start/End: Original strand, 12528747 - 12528885
Alignment:
Q  244 ccatatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcat 343  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||  |||||| |||||||    
T  12528747 ccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacattgaggccagcaatgacaccagcatccttggtggctcgtcgctgcgaatcat 12528846  T
Q  344 tgaagtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacag 382  Q
    |||| || || ||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  12528847 tgaaatacgctggcaccgtaatcactgcattcttaacag 12528885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 595
Target Start/End: Original strand, 28220099 - 28220545
Alignment:
Q  149 ccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtt-tacgat-cactttcacttctcttgtcaaaacca 246  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||| | | || || ||  | |||| ||||| || |||    
T  28220099 cctttattctaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcgttctcccatgcagtt--agttcttttgtccaatcca 28220196  T
Q  247 tatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattga 346  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||    |  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  28220197 tatgcaatagcagcagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcattga 28220296  T
Q  347 agtatgcaggcacagtaacaacggcattcttcacagacgaagtt--agatatgtttcagcaacttctctcatctttgtaaggattatcgatgatatttcc 444  Q
    | || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||| ||  | | | |  || ||||  || | ||||||||| || |  || ||||| |||||     
T  28220297 aataagcaggcacagtaataactgcattcttgacag--gaaattccaaaaaggcctctgcaatctcacgcatctttgttagaaccatagatgagatttct 28220394  T
Q  445 tcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccacaacatgatgtctt 544  Q
    || ||||  |  |||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||   || |  |||||| |||||||||||||| | || || |    
T  28220395 tcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcatgggtttgtcgttcgttccggaaatgaccttgaatggccacaactttatatcat 28220494  T
Q  545 tttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
     |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28220495 cttgaacaacagagtcactaaacttcctaccaattaacctcttagcatctg 28220545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 128
Target Start/End: Original strand, 28219946 - 28220045
Alignment:
Q  29 taatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 128  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  28219946 taatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtggc 28220045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 514 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 42555599 - 42555530
Alignment:
Q  514 atgaccctgaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacc 583  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  42555599 atgaccttgaatggccacaacttcatgtcattttgaacaacataatcattaaacttcctaccaattaacc 42555530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 377
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28910958
Alignment:
Q  69 gtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagac 168  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||   | |||  ||| |||||| |||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  169 acatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacgatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtag 268  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||  ||  |||||||||  | | |||  |||  ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||      
T  28910750 acatcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtga 28910849  T
Q  269 gttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggtagcttttcgctgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaac 368  Q
    | || ||||||||  | || |||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||  ||| || ||||||||     
T  28910850 gctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataaccagtcaaagtaacaat 28910949  T
Q  369 ggcattctt 377  Q
     ||||||||    
T  28910950 tgcattctt 28910958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 595
Target Start/End: Original strand, 28911014 - 28911176
Alignment:
Q  433 gatgatatttcctcagcactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccagcgatgaccctgaatggccaca 532  Q
    ||||| |||||||||||||  | || |||||| ||| |||||||||| |||   ||||| || || |||||  |||| || |||||| |||| ||| |||    
T  28911014 gatgagatttcctcagcacataatttcttctcctgatccttgtacttgacagatatcatggggttgtcattgacaccggcaatgaccttgaacggcgaca 28911113  T
Q  533 acatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaacctcttagcatctg 595  Q
    ||||    || ||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28911114 acattgaatcgttttgaacaacgggatcactaaacttcctatcaattatcctcttagcatctg 28911176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11314659 - 11314610
Alignment:
Q  246 atatgcaatagctgcagcagtaggttcgttgattatttgaatgacattaa 295  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11314659 atatgcaatggctgcagcactaggttcattgattatttgcatgacattaa 11314610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University