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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF5004_low_1 (Length: 415)
Name: NF5004_low_1
Description: NF5004
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5004_low_1 |
 | |
|
| [»] scaffold0516 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0182 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5768236 - 5767986
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5768236 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
5768137 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5768136 |
aatgaatgcattataatcaattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
5768037 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5768036 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
5767986 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25419746 - 25419497
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25419746 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
25419648 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25419647 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaaatttattacta |
25419548 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25419547 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
25419497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39067041 - 39066831
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39067041 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
39066943 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39066942 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacatacaagtttattacta |
39066843 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctca |
229 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |
|
|
| T |
39066842 |
taaggctcctca |
39066831 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47233964 - 47233744
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47233964 |
ttactatctatctttcattttccatcagttgcaaaaacacttcatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
47233865 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
247 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47233864 |
attaaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttataagcttata |
47233765 |
T |
|
| Q |
248 |
tatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47233764 |
tatatgttgcttatattatcc |
47233744 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Original strand, 44393667 - 44393882
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44393667 |
ttactatctaatctttcatttcccatcaattggaaaaactctctatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtattataatccattttattaa |
44393766 |
T |
|
| Q |
147 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttat |
246 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
44393767 |
tagtgaggggtttcattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca---ttttctaagctcat |
44393860 |
T |
|
| Q |
247 |
atatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44393861 |
atatatgttgcttatgttatcc |
44393882 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 47933019 - 47932975
Alignment:
| Q |
90 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47933019 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
47932975 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Original strand, 36991013 - 36991263
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36991013 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
36991112 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36991113 |
aatgaatgcattataatctattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
36991212 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36991213 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
36991263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21605209 - 21604991
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605209 |
ttactatctatctttcattttccattggctgcaaaaacacttcatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
21605110 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
21605109 |
attgaggggttaaattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagct--ta |
21605012 |
T |
|
| Q |
248 |
tatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605011 |
tatatgttgcttatgttatcc |
21604991 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37302125 - 37301929
Alignment:
| Q |
53 |
atctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattga |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37302125 |
atctatctttcatttcccatcatttgcaaaaacactccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaataatgg |
37302026 |
T |
|
| Q |
153 |
ggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatat |
252 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37302025 |
agggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatccacttacacacacaagt---ttactataaaactcctcatttttttctaagcttatatatat |
37301929 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13433624 - 13433375
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13433624 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
13433526 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13433525 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaaatttattacta |
13433426 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13433425 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
13433375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16712155 - 16712036
Alignment:
| Q |
144 |
taatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagct |
243 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16712155 |
taatagtgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcatcttacacacac--gt---tcaccataaaactcctcatttttttctaagct |
16712061 |
T |
|
| Q |
244 |
tatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16712060 |
catatatatgttgcttatgttatcc |
16712036 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Original strand, 16857246 - 16857290
Alignment:
| Q |
90 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16857246 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
16857290 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26615377 - 26615320
Alignment:
| Q |
79 |
caaaaactctccatttacttcacttcatgcaa--gttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26615377 |
caaaaacacttcatttacttcacttcatgcaattgttgtacaatgaatgcattataat |
26615320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26721305 - 26721248
Alignment:
| Q |
79 |
caaaaactctccatttacttcacttcatgcaa--gttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26721305 |
caaaaacacttcatttacttcacttcatgcaattgttgtacaatgaatgcattataat |
26721248 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2505172 - 2504923
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2505172 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
2505074 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2505073 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaaatttattacta |
2504974 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2504973 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
2504923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Original strand, 46092273 - 46092523
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46092273 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttcctatctatctttcattttccatcggttacaaaaacttgccatttacttcacttcatgcaagttacac |
46092372 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46092373 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
46092472 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46092473 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
46092523 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Original strand, 46134798 - 46135048
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46134798 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttcctatctatctttcattttccatcggttacaaaaacttgccatttacttcacttcatgcaagttacac |
46134897 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46134898 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
46134997 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46134998 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
46135048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53830644 - 53830427
Alignment:
| Q |
51 |
ctatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatatt |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53830644 |
ctatctatctttcattttccatcggttgcaaaaacactctatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatatt |
53830545 |
T |
|
| Q |
151 |
gaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatat |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53830544 |
gaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatat |
53830445 |
T |
|
| Q |
251 |
atgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53830444 |
atgttgcttatgttatcc |
53830427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34737936 - 34737724
Alignment:
| Q |
53 |
atctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattga |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
34737936 |
atctatctttcattttccatcagttgcaaaaacactccatctacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaacaatga |
34737837 |
T |
|
| Q |
153 |
ggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatat |
252 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34737836 |
ggggttacattttaaaattattcatattcttgatcaatcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatat |
34737740 |
T |
|
| Q |
253 |
gttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
34737739 |
gttgcttatgttatcc |
34737724 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Original strand, 21802896 - 21803112
Alignment:
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48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21802896 |
ttactatctatctttcatttcctatcagttgcaaaaacatttcatttacttcacttcttgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
21802995 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21802996 |
attgaggggttacgttttaaaattgttcatattcttaatcaataatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctcatttttttctaagcttat- |
21803091 |
T |
|
| Q |
248 |
tatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21803092 |
tatgtgttgcttatgttatcc |
21803112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2500786 - 2500569
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2500786 |
ttactatttatctttcatttcccatccgttgcaaaaatacaccatttacttcacttcatgcaagttgcacaatgaatgcattataatccattttattaat |
2500687 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
247 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
2500686 |
attgtgcggttacattttaaaattatttgtattcttgatcaatcctcttacacacacaagttta---ctataaatctactcatttttttctaagcttaca |
2500590 |
T |
|
| Q |
248 |
tatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2500589 |
tatatgttgcttatattatcc |
2500569 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 266
Target Start/End: Original strand, 5430709 - 5430927
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttat--- |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5430709 |
ttactatctaatctttcatttcccatcaattggaaaaactctccatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtattataatccattttattaa |
5430808 |
T |
|
| Q |
144 |
taatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagct |
243 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5430809 |
taatagtgaggggttacattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaaactcctca-ttttttctaagct |
5430904 |
T |
|
| Q |
244 |
tatatatatgttgcttatgttat |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5430905 |
catatatatgttgcttatgttat |
5430927 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21632912 - 21632733
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaa-ctctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21632912 |
ttactatctatctttcattttctatcagttgcaaaaaacatttcatttacttcacttcttgcaagttacacgatgaatgcattatgatccattttattaa |
21632813 |
T |
|
| Q |
147 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21632812 |
tattgaggggttatgttttaaaattgttcatattcttaatcaatcttcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca |
21632733 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Original strand, 20036282 - 20036446
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaa-ctctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20036282 |
ttactatctatctttcatttcccatcagatgtaaaaaacacttcagttacttcacttcatgcaagttgcataatgaatgcattataattcattttattaa |
20036381 |
T |
|
| Q |
147 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagttta |
211 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20036382 |
tattgagcagttacattttaaaattaatcatattcttaatcaatcctcttacactcacaagttta |
20036446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Original strand, 43943476 - 43943520
Alignment:
| Q |
90 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43943476 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
43943520 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7574262 - 7574013
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7574262 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
7574164 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7574163 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaaatttattacta |
7574064 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7574063 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
7574013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16668857 - 16668608
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16668857 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacat |
16668759 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16668758 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttgatcaatcctcttacacacacaaatttattacta |
16668659 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16668658 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
16668608 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41646842 - 41646633
Alignment:
| Q |
56 |
tatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41646842 |
tatctttcattttccatcggttgcaaaaacactccatttacttcatttcatgcaagttacacaatgaatgtattttaatccattttattaatattgaggg |
41646743 |
T |
|
| Q |
156 |
gttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca-nnnnnnnctaagcttatatatatgt |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41646742 |
gttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcattttttttctaagcttatatatatgt |
41646643 |
T |
|
| Q |
255 |
tgcttatgtt |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
41646642 |
tgcttatgtt |
41646633 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Original strand, 43564238 - 43564304
Alignment:
| Q |
127 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcct |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43564238 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcct |
43564304 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 29455448 - 29455517
Alignment:
| Q |
127 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctctt |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29455448 |
attataatccattttattaatatcgaggggttacattttaaaattattcatattcttaattaatcctctt |
29455517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 268
Target Start/End: Original strand, 29455527 - 29455558
Alignment:
| Q |
237 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29455527 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
29455558 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 268
Target Start/End: Original strand, 43564317 - 43564348
Alignment:
| Q |
237 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43564317 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
43564348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Original strand, 13786200 - 13786449
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13786200 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
13786298 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13786299 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaaatttattacta |
13786398 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13786399 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
13786449 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25807943 - 25807693
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25807943 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcaattacaaaaactttccatttacttcacttcatgcaagttacac |
25807845 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25807844 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
25807745 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctca-nnnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25807744 |
taaagctcctcattttttttctaagcttatatatatgtttcttatgttatcc |
25807693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22912662 - 22912455
Alignment:
| Q |
56 |
tatctttcattttccatcag-ttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgagg |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22912662 |
tatctttcatttcccatcaggttgcagaaacactccatttacttcacttcttgcatgttacaaaatgaatgcattataaaccattttattaatat-gagg |
22912564 |
T |
|
| Q |
155 |
ggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgt |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22912563 |
agttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacgaat---ttactattaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgt |
22912467 |
T |
|
| Q |
255 |
tgcttatgttat |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
22912466 |
tgcttatgttat |
22912455 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23726167 - 23725991
Alignment:
| Q |
47 |
tttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23726167 |
tttactatctatctttcatttttcatctgttgcaaaaacacttcatttacttcatttcatgcaagttgcacaatgaatgaattataatccattttattaa |
23726068 |
T |
|
| Q |
147 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
229 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23726067 |
tattaaacggttacatttt-aaattattcatattcttaatcaatcctctt--gcacacaagt---ttactataaagctcctca |
23725991 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Original strand, 52349697 - 52349946
Alignment:
| Q |
18 |
ataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52349697 |
ataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacac |
52349795 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattacta |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52349796 |
aatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattatttatattcttaatcaatcctcttacacacacaaatttattacta |
52349895 |
T |
|
| Q |
218 |
taaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52349896 |
taaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
52349946 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Original strand, 48266265 - 48266484
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48266265 |
ttactatctatctttcattttccatcagttgcaaaaactctccatttactt-acttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
48266363 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48266364 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttata |
48266463 |
T |
|
| Q |
248 |
tatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48266464 |
tatatgttgcttatgttatcc |
48266484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Original strand, 35870343 - 35870563
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35870343 |
ttactatctatctttcattttccatcagttgcgaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
35870442 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
247 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
35870443 |
attgagaggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaaggtcctcatttttttctaaacttata |
35870542 |
T |
|
| Q |
248 |
tatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35870543 |
tatatgttgcttatgttatcc |
35870563 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 183
Target Start/End: Original strand, 26215284 - 26215420
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26215284 |
ttactatctaatctttcattttccatcaattggaaaaactctccatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtgttataatccattttattaa |
26215383 |
T |
|
| Q |
147 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattctt |
183 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26215384 |
tagcgaggggttacattttaaaattattcatattctt |
26215420 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 268
Target Start/End: Original strand, 26215432 - 26215530
Alignment:
| Q |
166 |
aaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgtta |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26215432 |
aaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca-ttttttctaagctcatatatatgttgcttatgtta |
26215527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5884467 - 5884423
Alignment:
| Q |
90 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5884467 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
5884423 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 54945821 - 54945777
Alignment:
| Q |
90 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54945821 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
54945777 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8150633 - 8150455
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8150633 |
ttactatctatctttcatttcccatcagttgcaaaaacactccatttacttcactttatgcgagttacacaatgaatgcattataatcaattttattaat |
8150534 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8150533 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcagtcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca |
8150455 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Original strand, 10186354 - 10186570
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10186354 |
ttactatctatctttcatttcctatcagttgcaaaaacatttcatttacctcacttcttgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
10186453 |
T |
|
| Q |
148 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
10186454 |
attgaggggttacattttaaaattgttcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctcatttttttccaagcttat- |
10186549 |
T |
|
| Q |
248 |
tatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10186550 |
tatgtgttgcttatgttatcc |
10186570 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Original strand, 20171957 - 20172172
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20171957 |
ttactatctaatctttcatttcccatcaattggaaaaactctctatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtattataatccattttattaa |
20172056 |
T |
|
| Q |
147 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttat |
246 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
20172057 |
tagtgaggggtttcattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca---ttttctaagctcat |
20172150 |
T |
|
| Q |
247 |
atatatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20172151 |
atatatgttgcttatgttatcc |
20172172 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Original strand, 4138333 - 4138487
Alignment:
| Q |
57 |
atctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgagggg |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4138333 |
atctttcatttcctatccgttgcaaaaacatttcatttacttcacttcttgcaagttacacaatgaatgcattataatctattttattaatattgagggg |
4138432 |
T |
|
| Q |
157 |
ttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagttta |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4138433 |
ttacgttttaaaattgttcatattcttaatcaagactcttacacacacaagttta |
4138487 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 919018 - 918949
Alignment:
| Q |
127 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctctt |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
919018 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctctt |
918949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11428182 - 11428068
Alignment:
| Q |
150 |
tgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatata |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
11428182 |
tgaggggttacattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacagaagt---ttacgataaagctcctca-ttttttctaagctcatata |
11428087 |
T |
|
| Q |
250 |
tatgttgcttatgttatcc |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11428086 |
tatgttgcttatgttatcc |
11428068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11428260 - 11428184
Alignment:
| Q |
48 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaa |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11428260 |
ttactatctaatctttcattttccatcaattggaaaaactatccatttacttcacttcatggaagttacacaatgaa |
11428184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0516 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:
Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 229
Target Start/End: Original strand, 3246 - 3425
Alignment:
| Q |
47 |
tttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3246 |
tttactatttatctttcatttcccatcagttgcaaaaacacttcatttacttcacttcatgcaagttgcacaatgattgaattataatccattttattaa |
3345 |
T |
|
| Q |
147 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
229 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3346 |
tattaagcggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca |
3425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0182 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:
Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10215 - 10171
Alignment:
| Q |
90 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10215 |
catttacttcacttcatgcaagttgtgcaatgaatgcattataat |
10171 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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