View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5011_high_5 (Length: 391)

Name: NF5011_high_5
Description: NF5011
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5011_high_5
NF5011_high_5
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (162-373)||(34245194-34245404)
chr2 (208-369)||(12160859-12161020)
chr2 (209-369)||(39241106-39241266)
chr2 (211-369)||(30523605-30523763)
chr2 (212-369)||(1875978-1876135)
chr2 (209-369)||(16496561-16496721)
chr2 (215-369)||(8875673-8875827)
chr2 (209-367)||(36936020-36936178)
chr2 (215-369)||(42519714-42519868)
chr2 (211-369)||(14958116-14958274)
chr2 (211-369)||(5774089-5774247)
chr2 (219-369)||(38324242-38324392)
chr2 (216-374)||(43568364-43568522)
chr2 (239-369)||(7454556-7454686)
chr2 (212-373)||(6432167-6432328)
chr2 (212-369)||(42097857-42098014)
chr2 (209-372)||(10361387-10361550)
chr2 (211-301)||(11018045-11018135)
chr2 (211-357)||(45376905-45377051)
chr2 (215-368)||(43496162-43496315)
chr2 (209-369)||(35422037-35422197)
chr2 (9-102)||(34245102-34245198)
chr2 (211-365)||(3147443-3147597)
chr2 (280-374)||(18239383-18239477)
chr2 (232-373)||(28014482-28014620)
chr2 (216-368)||(18109661-18109813)
chr2 (211-368)||(26339980-26340137)
chr2 (210-270)||(7183326-7183386)
chr2 (210-270)||(8341199-8341259)
chr2 (212-268)||(24520264-24520320)
chr2 (210-366)||(40862152-40862307)
chr2 (214-365)||(33178960-33179111)
chr2 (215-270)||(38928534-38928589)
chr2 (212-373)||(44525928-44526089)
chr2 (216-368)||(39532063-39532215)
chr2 (215-270)||(10247427-10247482)
chr2 (212-270)||(36600934-36600992)
chr2 (209-270)||(1086037-1086098)
chr2 (216-373)||(38245840-38245998)
chr2 (215-374)||(6322080-6322239)
chr2 (215-270)||(14452300-14452355)
chr2 (212-270)||(36602776-36602834)
chr2 (215-267)||(11447240-11447292)
chr2 (218-270)||(32482289-32482341)
chr2 (215-270)||(6319537-6319592)
chr2 (215-270)||(33182613-33182668)
chr2 (215-270)||(38928608-38928663)
chr2 (217-368)||(15265287-15265438)
chr2 (215-259)||(18239339-18239383)
chr2 (212-268)||(37240946-37241002)
chr2 (229-268)||(28125052-28125091)
chr2 (334-368)||(11017991-11018025)
chr2 (337-374)||(30523759-30523796)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (212-373)||(41734210-41734371)
chr5 (212-374)||(6789554-6789716)
chr5 (210-369)||(37530690-37530849)
chr5 (211-369)||(12280777-12280935)
chr5 (215-369)||(36761062-36761216)
chr5 (211-369)||(42709307-42709465)
chr5 (212-369)||(15498642-15498799)
chr5 (212-369)||(29525266-29525423)
chr5 (210-369)||(34589871-34590030)
chr5 (211-368)||(24171361-24171518)
chr5 (215-373)||(76414-76572)
chr5 (211-373)||(27812942-27813104)
chr5 (209-374)||(12953772-12953937)
chr5 (211-369)||(13359426-13359584)
chr5 (211-367)||(42422803-42422961)
chr5 (211-369)||(10815059-10815217)
chr5 (217-354)||(16218268-16218405)
chr5 (209-373)||(23590633-23590797)
chr5 (209-374)||(12939822-12939987)
chr5 (213-369)||(7614947-7615103)
chr5 (209-369)||(11784139-11784298)
chr5 (217-373)||(35638766-35638922)
chr5 (215-369)||(25881507-25881661)
chr5 (212-325)||(5050091-5050204)
chr5 (238-372)||(17540284-17540418)
chr5 (212-369)||(17645303-17645460)
chr5 (210-365)||(35766554-35766709)
chr5 (202-368)||(7157444-7157610)
chr5 (209-373)||(2890915-2891079)
chr5 (207-356)||(4559438-4559587)
chr5 (209-270)||(1923941-1924002)
chr5 (217-323)||(3703454-3703560)
chr5 (215-323)||(5102694-5102802)
chr5 (215-268)||(11575622-11575675)
chr5 (215-368)||(13018994-13019147)
chr5 (215-270)||(3033393-3033448)
chr5 (209-284)||(36944270-36944345)
chr5 (212-368)||(3078487-3078643)
chr5 (209-284)||(36959460-36959535)
chr5 (212-270)||(8520494-8520552)
chr5 (209-368)||(24463511-24463670)
chr5 (218-270)||(20017350-20017402)
chr5 (215-270)||(8520567-8520622)
chr5 (211-246)||(7948486-7948521)
chr5 (215-267)||(15524362-15524414)
chr5 (215-270)||(20768912-20768967)
chr5 (336-374)||(15524485-15524523)
chr5 (234-270)||(3033338-3033374)
chr5 (334-366)||(5101959-5101991)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (213-374)||(42328963-42329124)
chr7 (212-369)||(27826706-27826863)
chr7 (212-369)||(46536119-46536276)
chr7 (210-369)||(28494221-28494380)
chr7 (215-369)||(4060352-4060506)
chr7 (215-369)||(28958067-28958221)
chr7 (208-372)||(46672499-46672663)
chr7 (215-366)||(42265221-42265372)
chr7 (209-369)||(46350781-46350941)
chr7 (215-374)||(29994156-29994315)
chr7 (210-365)||(31031843-31031998)
chr7 (217-373)||(35647418-35647574)
chr7 (214-369)||(43337632-43337787)
chr7 (212-357)||(43156565-43156710)
chr7 (214-367)||(46615626-46615779)
chr7 (212-358)||(6243864-6244009)
chr7 (213-373)||(21920738-21920897)
chr7 (211-369)||(31226816-31226974)
chr7 (216-369)||(48935236-48935389)
chr7 (211-368)||(28235281-28235438)
chr7 (219-369)||(14792062-14792212)
chr7 (212-324)||(46534405-46534517)
chr7 (210-369)||(46349829-46349988)
chr7 (213-326)||(25696031-25696144)
chr7 (238-369)||(42328109-42328241)
chr7 (214-366)||(981336-981488)
chr7 (211-369)||(3370445-3370603)
chr7 (209-372)||(42997508-42997671)
chr7 (215-316)||(6476926-6477027)
chr7 (209-368)||(35670300-35670459)
chr7 (246-365)||(47479817-47479936)
chr7 (212-365)||(44103661-44103814)
chr7 (212-368)||(40061160-40061316)
chr7 (219-373)||(30523895-30524049)
chr7 (215-368)||(37658061-37658214)
chr7 (215-364)||(43158142-43158292)
chr7 (211-270)||(30582667-30582726)
chr7 (219-368)||(39869967-39870116)
chr7 (212-372)||(33979613-33979773)
chr7 (213-368)||(9806535-9806690)
chr7 (211-270)||(44570928-44570987)
chr7 (210-373)||(44818716-44818879)
chr7 (214-374)||(596052-596212)
chr7 (214-362)||(44104528-44104676)
chr7 (225-368)||(31619515-31619658)
chr7 (215-374)||(33982255-33982414)
chr7 (210-253)||(35747020-35747063)
chr7 (215-270)||(36121431-36121486)
chr7 (209-267)||(31436294-31436352)
chr7 (212-270)||(31969510-31969568)
chr7 (215-365)||(43544845-43544995)
chr7 (213-270)||(42329599-42329656)
chr7 (212-368)||(43467956-43468112)
chr7 (215-267)||(47252217-47252269)
chr7 (215-270)||(1602024-1602078)
chr7 (212-270)||(41406185-41406243)
chr7 (215-270)||(585934-585989)
chr7 (212-267)||(37708138-37708193)
chr7 (216-270)||(1602170-1602224)
chr7 (212-270)||(8932544-8932602)
chr7 (209-270)||(39709888-39709950)
chr7 (217-270)||(31030808-31030861)
chr7 (207-260)||(35670456-35670509)
chr7 (212-249)||(38224585-38224622)
chr7 (215-267)||(25483592-25483644)
chr7 (231-270)||(1602097-1602136)
chr7 (215-270)||(30999388-30999443)
chr7 (257-373)||(35669624-35669740)
chr7 (334-369)||(46614366-46614401)
chr7 (336-374)||(41406309-41406347)
chr7 (212-270)||(42833768-42833826)
chr7 (211-300)||(36820322-36820411)
chr7 (215-256)||(42826000-42826041)
chr7 (334-366)||(47252963-47252995)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (208-369)||(24119184-24119345)
chr6 (211-369)||(12130477-12130635)
chr6 (212-369)||(25023400-25023557)
chr6 (210-369)||(20645653-20645812)
chr6 (209-369)||(22707285-22707445)
chr6 (217-366)||(20992213-20992362)
chr6 (211-366)||(13756268-13756423)
chr6 (215-358)||(21860234-21860377)
chr6 (208-365)||(21778035-21778192)
chr6 (211-369)||(21459018-21459176)
chr6 (209-374)||(6833987-6834151)
chr6 (211-368)||(1789783-1789940)
chr6 (208-368)||(18368680-18368840)
chr6 (211-368)||(18801696-18801853)
chr6 (275-374)||(32986824-32986923)
chr6 (211-368)||(4976520-4976677)
chr6 (212-270)||(15508346-15508404)
chr6 (215-267)||(13866264-13866316)
chr6 (215-268)||(32562457-32562510)
chr6 (212-268)||(5090130-5090186)
chr6 (212-270)||(31603956-31604014)
chr6 (211-323)||(12815645-12815756)
chr6 (215-374)||(24159238-24159396)
chr6 (208-270)||(5956415-5956477)
chr6 (219-270)||(190927-190978)
chr6 (215-270)||(1290382-1290437)
chr6 (336-374)||(15508470-15508508)
chr6 (229-270)||(31259592-31259633)
chr6 (334-374)||(34574536-34574576)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (209-369)||(43800714-43800874)
chr8 (212-373)||(25100156-25100317)
chr8 (215-373)||(35160211-35160369)
chr8 (209-374)||(14911759-14911924)
chr8 (211-369)||(40529497-40529655)
chr8 (209-369)||(20697451-20697611)
chr8 (215-369)||(38746902-38747057)
chr8 (212-369)||(5838253-5838410)
chr8 (217-369)||(17121817-17121969)
chr8 (215-358)||(22215111-22215254)
chr8 (212-369)||(5574599-5574756)
chr8 (209-373)||(2773524-2773688)
chr8 (231-374)||(36859244-36859387)
chr8 (212-324)||(284815-284927)
chr8 (212-324)||(630950-631062)
chr8 (212-324)||(816762-816874)
chr8 (215-369)||(3512471-3512625)
chr8 (209-369)||(35057246-35057406)
chr8 (210-369)||(16786476-16786635)
chr8 (210-303)||(39733721-39733814)
chr8 (211-369)||(24804432-24804590)
chr8 (210-284)||(25099408-25099482)
chr8 (211-354)||(21266824-21266967)
chr8 (212-368)||(12208803-12208959)
chr8 (212-368)||(12453231-12453387)
chr8 (210-368)||(43150247-43150405)
chr8 (228-324)||(41355624-41355720)
chr8 (219-322)||(16785621-16785724)
chr8 (211-366)||(18146338-18146493)
chr8 (211-362)||(45237745-45237896)
chr8 (214-365)||(34903327-34903478)
chr8 (208-369)||(43873951-43874112)
chr8 (215-368)||(45069765-45069918)
chr8 (289-369)||(25100320-25100400)
chr8 (215-374)||(34618654-34618807)
chr8 (261-373)||(35397960-35398060)
chr8 (209-368)||(39104124-39104283)
chr8 (211-268)||(4477665-4477722)
chr8 (263-322)||(16785863-16785922)
chr8 (209-268)||(53516-53575)
chr8 (215-270)||(31642793-31642848)
chr8 (215-374)||(38364411-38364570)
chr8 (209-368)||(40532052-40532210)
chr8 (209-268)||(42353736-42353795)
chr8 (208-270)||(35253074-35253136)
chr8 (214-267)||(43129589-43129642)
chr8 (215-367)||(35019487-35019639)
chr8 (215-270)||(38760854-38760909)
chr8 (229-368)||(41356304-41356443)
chr8 (262-369)||(7303365-7303472)
chr8 (212-270)||(29725738-29725796)
chr8 (211-365)||(35004563-35004717)
chr8 (213-322)||(41206527-41206636)
chr8 (209-266)||(45237012-45237069)
chr8 (336-372)||(11189771-11189807)
chr8 (213-261)||(23625907-23625955)
chr8 (302-374)||(15825577-15825649)
chr8 (334-369)||(16786648-16786683)
chr8 (215-270)||(19142966-19143021)
chr8 (334-369)||(39733832-39733867)
chr8 (212-246)||(7303335-7303369)
chr8 (336-374)||(29725892-29725930)
chr8 (220-250)||(42803469-42803499)
chr8 (290-322)||(284927-284959)
chr8 (290-322)||(630918-630950)
chr8 (290-322)||(816730-816762)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (209-369)||(27747601-27747761)
chr1 (215-369)||(50586124-50586278)
chr1 (211-369)||(39325607-39325765)
chr1 (215-369)||(11823584-11823738)
chr1 (211-369)||(30358070-30358228)
chr1 (215-369)||(47326529-47326683)
chr1 (211-368)||(1190089-1190246)
chr1 (208-369)||(38624061-38624222)
chr1 (208-358)||(38815504-38815655)
chr1 (211-369)||(45900165-45900323)
chr1 (209-369)||(28955500-28955660)
chr1 (215-369)||(12014642-12014796)
chr1 (212-373)||(2459587-2459748)
chr1 (212-369)||(41865284-41865441)
chr1 (208-372)||(44277907-44278071)
chr1 (215-373)||(25365760-25365918)
chr1 (213-369)||(36739551-36739707)
chr1 (211-369)||(28314799-28314957)
chr1 (231-354)||(46315648-46315771)
chr1 (215-373)||(38058749-38058907)
chr1 (215-373)||(33076605-33076762)
chr1 (209-368)||(11332836-11332995)
chr1 (209-368)||(11490857-11491016)
chr1 (218-366)||(46742459-46742607)
chr1 (212-373)||(28343687-28343847)
chr1 (212-368)||(2937334-2937490)
chr1 (211-309)||(31657105-31657203)
chr1 (209-270)||(14390416-14390477)
chr1 (211-270)||(3796008-3796067)
chr1 (212-270)||(5698123-5698181)
chr1 (217-368)||(9423001-9423152)
chr1 (209-368)||(9223834-9223993)
chr1 (211-266)||(30899470-30899525)
chr1 (212-270)||(5698505-5698563)
chr1 (210-268)||(35179815-35179873)
chr1 (226-368)||(39325463-39325605)
chr1 (211-368)||(42628164-42628321)
chr1 (211-368)||(31496606-31496763)
chr1 (215-270)||(4640137-4640192)
chr1 (215-270)||(31656369-31656424)
chr1 (208-270)||(44502554-44502616)
chr1 (214-274)||(11756912-11756972)
chr1 (212-268)||(34086196-34086252)
chr1 (214-270)||(42330194-42330250)
chr1 (217-365)||(4361009-4361157)
chr1 (213-368)||(27667673-27667828)
chr1 (215-270)||(44109976-44110031)
chr1 (219-270)||(44299988-44300039)
chr1 (212-270)||(43847473-43847531)
chr1 (215-268)||(23259085-23259138)
chr1 (215-264)||(42159612-42159661)
chr1 (339-373)||(31656328-31656362)
chr1 (291-373)||(29092678-29092760)
chr1 (215-256)||(29092602-29092643)
chr1 (336-373)||(30899363-30899400)
chr1 (336-372)||(4638513-4638549)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (210-369)||(19801808-19801967)
chr4 (211-369)||(33984084-33984242)
chr4 (212-369)||(6238185-6238342)
chr4 (216-369)||(37114379-37114532)
chr4 (212-369)||(53284004-53284161)
chr4 (211-369)||(44448443-44448601)
chr4 (214-367)||(43374594-43374747)
chr4 (212-369)||(49335136-49335293)
chr4 (212-373)||(55001685-55001846)
chr4 (215-364)||(19800925-19801075)
chr4 (209-354)||(39840155-39840300)
chr4 (209-369)||(45561261-45561420)
chr4 (212-374)||(36181310-36181472)
chr4 (207-369)||(2943597-2943758)
chr4 (228-369)||(47633789-47633930)
chr4 (213-368)||(54683595-54683750)
chr4 (208-373)||(25686979-25687144)
chr4 (213-369)||(6287835-6287991)
chr4 (215-365)||(20356650-20356801)
chr4 (214-365)||(37498202-37498353)
chr4 (209-373)||(24152670-24152834)
chr4 (209-373)||(53431624-53431788)
chr4 (211-374)||(28778552-28778715)
chr4 (238-365)||(32012570-32012697)
chr4 (209-368)||(30653237-30653396)
chr4 (210-308)||(44525944-44526042)
chr4 (211-368)||(202286-202443)
chr4 (215-368)||(40674747-40674901)
chr4 (209-368)||(19912667-19912826)
chr4 (209-369)||(40685777-40685932)
chr4 (215-368)||(30411198-30411351)
chr4 (208-368)||(55610656-55610816)
chr4 (208-368)||(2390216-2390376)
chr4 (213-368)||(30653497-30653651)
chr4 (212-284)||(55496067-55496139)
chr4 (276-372)||(21234552-21234648)
chr4 (212-270)||(45549650-45549708)
chr4 (208-257)||(7141179-7141228)
chr4 (214-270)||(7113559-7113615)
chr4 (215-374)||(48953030-48953189)
chr4 (212-270)||(14269867-14269925)
chr4 (212-268)||(43590531-43590587)
chr4 (215-323)||(51941103-51941211)
chr4 (217-368)||(1771786-1771937)
chr4 (215-270)||(51924026-51924081)
chr4 (212-270)||(50792460-50792518)
chr4 (212-369)||(49646022-49646177)
chr4 (218-270)||(49648864-49648916)
chr4 (215-265)||(318443-318493)
chr4 (212-270)||(10658927-10658985)
chr4 (212-270)||(10873072-10873130)
chr4 (212-270)||(19869957-19870015)
chr4 (212-270)||(27531827-27531885)
chr4 (212-270)||(36824441-36824499)
chr4 (212-270)||(36824610-36824668)
chr4 (217-267)||(55660548-55660598)
chr4 (214-267)||(19871020-19871073)
chr4 (211-268)||(48369015-48369072)
chr4 (217-270)||(50790826-50790879)
chr4 (214-270)||(7113633-7113689)
chr4 (211-267)||(20986270-20986326)
chr4 (213-325)||(47092907-47093019)
chr4 (215-270)||(26923583-26923638)
chr4 (258-373)||(7141084-7141198)
chr4 (215-277)||(49491543-49491605)
chr4 (290-373)||(55495130-55495213)
chr4 (215-270)||(28459612-28459667)
chr4 (221-268)||(38005551-38005598)
chr4 (336-374)||(31624338-31624376)
chr4 (212-270)||(31624442-31624500)
chr4 (212-270)||(31997829-31997887)
chr4 (209-246)||(318740-318777)
chr4 (215-268)||(45618061-45618114)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (208-369)||(34435920-34436081)
chr3 (212-369)||(41991629-41991786)
chr3 (215-374)||(2557842-2558001)
chr3 (211-369)||(8321376-8321534)
chr3 (211-369)||(52184772-52184930)
chr3 (217-369)||(54463401-54463553)
chr3 (209-325)||(12055504-12055620)
chr3 (210-366)||(1361666-1361822)
chr3 (209-369)||(17666796-17666956)
chr3 (209-372)||(12764665-12764828)
chr3 (212-366)||(30317892-30318046)
chr3 (211-369)||(48050990-48051148)
chr3 (209-369)||(19274724-19274884)
chr3 (213-369)||(36237834-36237990)
chr3 (214-369)||(51062909-51063064)
chr3 (210-352)||(8879359-8879501)
chr3 (211-366)||(9558808-9558963)
chr3 (211-358)||(35405535-35405682)
chr3 (211-373)||(42527997-42528159)
chr3 (214-365)||(32999606-32999757)
chr3 (215-366)||(52959292-52959442)
chr3 (211-373)||(51980728-51980889)
chr3 (211-368)||(55226291-55226448)
chr3 (214-373)||(12122115-12122274)
chr3 (212-358)||(30742970-30743116)
chr3 (212-373)||(12122822-12122983)
chr3 (212-369)||(4070813-4070972)
chr3 (217-373)||(6124713-6124869)
chr3 (215-373)||(51760471-51760629)
chr3 (211-373)||(42292971-42293135)
chr3 (209-368)||(45356364-45356523)
chr3 (211-368)||(40374454-40374611)
chr3 (212-373)||(25999111-25999271)
chr3 (211-368)||(36660082-36660239)
chr3 (215-270)||(32111604-32111659)
chr3 (212-368)||(48747401-48747557)
chr3 (216-270)||(46114989-46115043)
chr3 (212-368)||(5505929-5506085)
chr3 (210-270)||(46668336-46668396)
chr3 (238-373)||(43968293-43968428)
chr3 (215-368)||(17666615-17666768)
chr3 (211-322)||(10809491-10809602)
chr3 (207-270)||(34785922-34785985)
chr3 (215-270)||(39129374-39129429)
chr3 (215-270)||(42167376-42167431)
chr3 (210-368)||(40980086-40980244)
chr3 (212-270)||(41888806-41888864)
chr3 (212-269)||(42877237-42877294)
chr3 (210-267)||(45355125-45355182)
chr3 (211-270)||(6586261-6586320)
chr3 (215-270)||(7041730-7041785)
chr3 (211-254)||(13353412-13353455)
chr3 (219-270)||(22978083-22978134)
chr3 (219-270)||(36806926-36806977)
chr3 (215-270)||(43860726-43860781)
chr3 (215-270)||(50935713-50935768)
chr3 (211-270)||(32390158-32390219)
chr3 (208-270)||(39534985-39535047)
chr3 (214-267)||(50938284-50938337)
chr3 (215-268)||(54598192-54598245)
chr3 (215-270)||(41889465-41889520)
chr3 (215-270)||(48071976-48072031)
chr3 (208-246)||(49918248-49918286)
chr3 (336-374)||(50938175-50938213)
chr3 (216-325)||(50197995-50198104)
chr3 (336-372)||(22978199-22978235)
chr3 (214-270)||(39129299-39129355)
chr3 (336-374)||(2229109-2229147)
chr3 (232-322)||(10802677-10802767)
chr3 (336-374)||(41888929-41888967)
chr3 (208-317)||(36544470-36544578)
chr3 (208-317)||(36563746-36563854)
chr3 (340-369)||(45355198-45355227)
chr3 (340-368)||(10809443-10809471)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (208-368)||(6984-7144)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (212-326)||(57837-57951)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (210-323)||(14182-14295)
[»] scaffold1391 (1 HSPs)
scaffold1391 (209-374)||(1436-1600)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (215-374)||(157555-157714)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (209-368)||(4143-4302)
scaffold0115 (209-368)||(11883-12042)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (278-369)||(18439-18530)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (213-267)||(76242-76296)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (212-267)||(94451-94506)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Original strand, 34245194 - 34245404
Alignment:
Q  162 tattttaaccaagtaatcataaagtaattctttatgcaattgaacgcttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagc 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34245194 tatttgaaccaagtaatcataaagtaattctttatgcaattgaa-gtttaggctgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggattagc 34245292  T
Q  262 ttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagct 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34245293 ttataagctcgttagatgaaaacgtggtttgtttggtaacaagcttttttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttaact 34245392  T
Q  362 tatagctgatag 373  Q
    ||||||||||||    
T  34245393 tatagctgatag 34245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 208 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12161020 - 12160859
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12161020 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctt 12160921  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160920 ttttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 12160859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39241266 - 39241106
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39241266 ttagactgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaaacttt 39241167  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241166 tttcatgagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 39241106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 30523605 - 30523763
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30523605 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttt 30523704  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30523705 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagttatttcaagtagctttttagcctatagctg 30523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1876135 - 1875978
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1876135 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 1876036  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1876035 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 1875978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16496721 - 16496561
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16496721 ttaggatgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagtttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggcaacaagcttt 16496622  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16496621 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaggtagctttttagcttatagctg 16496561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 8875673 - 8875827
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8875673 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttataacttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcat 8875772  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8875773 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 8875827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36936178 - 36936020
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36936178 ttaggcagtgtttggtaacaaaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttt 36936079  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagc 367  Q
    ||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36936078 tttaatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagc 36936020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 42519714 - 42519868
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42519714 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgcattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcat 42519813  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42519814 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagttttttagcttatagctg 42519868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 14958116 - 14958274
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14958116 aggctgtgtttggtaatacaaagaagctaatttatagcttgttggattagtttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 14958215  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14958216 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 14958274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 5774089 - 5774247
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5774089 aggctgcgtttgataatacaaaaaagctagtttatagcttgttggattagcttataagcttgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagtttttt 5774188  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5774189 tcatgagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 5774247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 219 - 369
Target Start/End: Original strand, 38324242 - 38324392
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagc 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  38324242 tttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttgaattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttgataacaagtttttttcatgagc 38324341  T
Q  319 ttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38324342 ttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcttattagcttatagctg 38324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 374
Target Start/End: Original strand, 43568364 - 43568522
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43568364 gtgtttggtaacacaaaaaagttaacttatagcttgttggattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttatcatg 43568463  T
Q  316 agcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |||||||||||       |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43568464 agcttatagcgttttttgaaaagctatttcgagtagcttttgagcttatagctggtagt 43568522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 369
Target Start/End: Original strand, 7454556 - 7454686
Alignment:
Q  239 agcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||    
T  7454556 agcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcatgagcttatagcgttttttgaaaag 7454655  T
Q  339 ctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7454656 ctatttcaagtagctttttagcttatagctg 7454686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Original strand, 6432167 - 6432328
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  6432167 ggctgtatttggtaacacaaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagctagttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttct 6432266  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||| ||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432267 catgagcttataacgttttttgaaaaactatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 6432328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42098014 - 42097857
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  42098014 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttcttggattagcttataagcttattggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttct 42097915  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42097914 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagcagcttttgagcttatagctg 42097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 10361387 - 10361550
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| || ||||    
T  10361387 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagctcattggatgaaaacatgatgtgtttggtaataagcttt 10361486  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    ||||| ||||||||| |        | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10361487 tttcacgagcttataactttttttaagaagctatttcaagtagttttttagcttatagctgata 10361550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11018135 - 11018045
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11018135 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaac 11018045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 357
Target Start/End: Original strand, 45376905 - 45377051
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||     
T  45376905 aggctgtgtttggtaacacaaataagctagtttatagcttgttggactagcttataagctagttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttc 45377004  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttt 357  Q
    ||||||||||||||||       |||| ||||||||||||| |||||    
T  45377005 tcatgagcttatagcgttttttgaaaaactatttcaagtagtttttt 45377051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 43496162 - 43496315
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||| | ||    
T  43496162 tgtgtttggtaacataaataagctagcttatagcttgttgcattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttagtaacaagtttttcttat 43496261  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||||||||        | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43496262 gagcttatagctttttgtaagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 43496315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Original strand, 35422037 - 35422197
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  35422037 ttaggttgtgtttagtaacacaaaaaagctagtttatagttttttggattagcttataaacttgttggttgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttt 35422136  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    | ||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35422137 tctcatgagcttatagcgttttttaaaaagctatttcaagtagtttttgagcttatagctg 35422197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Original strand, 34245102 - 34245198
Alignment:
Q  9 agcacagactgaagatacaacttggaaactagattgaaat---ctccttttcatcgttgatttatgtgtattttcttaatgttgttgatatgtattt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34245102 agcaaagactgaagatacaacttggaaactagattgaaattatctccttttcatcgttgatttatgtgtattttcttaatgttgttgatatgtattt 34245198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 365
Target Start/End: Original strand, 3147443 - 3147597
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||     
T  3147443 aggctgtgtttggtaacataaataagttagcttataacttgttagattagcttataagcttcttggatgaaaatgtgacgtgtttggtaacaagtttttc 3147542  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    |||||||||||||| |       |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  3147543 tcatgagcttatagtgttttttgaaaagctaattcaagtaactttttagtttata 3147597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 374
Target Start/End: Original strand, 18239383 - 18239477
Alignment:
Q  280 aaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18239383 aaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcaagagtttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctggtagt 18239477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 373
Target Start/End: Original strand, 28014482 - 28014620
Alignment:
Q  232 aaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnn 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||            
T  28014482 aaaagctagcttatagcttattgaattagcttataagtttgttggatcaaaacatgacgtgtttgacaacaaacttttctcatgagcttata---atttt 28014578  T
Q  332 nnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28014579 tgaaaagctatttcaagtagctttcaagcttatagctgatag 28014620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18109813 - 18109661
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||     
T  18109813 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctcac 18109715  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
      ||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18109714 tcgcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 18109661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26340137 - 26339980
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |   |||||||||| || |||||    
T  26340137 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctaacttataacttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatatgtttggtaaaaagctttt 26340039  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26340038 ctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 26339980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7183386 - 7183326
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  7183386 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggactagtttataagct 7183326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8341259 - 8341199
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8341259 taggctgtgtttggtaacacaaataagctagcttataacttgttggactagcttataagct 8341199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24520320 - 24520264
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24520320 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggattagcttataag 24520264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40862307 - 40862152
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||    
T  40862307 taggctgtgtttggtaacacaaaaa-gctagtttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttt 40862210  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    | |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40862209 tctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatag 40862152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 365
Target Start/End: Original strand, 33178960 - 33179111
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| | ||   |  ||||||||||| || ||||||||    
T  33178960 ctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaatcttttttc 33179058  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    |  |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33179059 actagcttatagcgttttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttata 33179111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38928589 - 38928534
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38928589 tgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 38928534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44526089 - 44525928
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || | || ||| | || |    ||||||||||| || ||||||    
T  44526089 ggctgtgtttggtaacataaataagctagcttttagcttgttggacaagcttataaacttgttttgat-agaatgaaatgtgtttggtaaaaagcttttt 44525991  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||| |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44525990 tcattagcttatagcgttttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagcttatag 44525928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Original strand, 39532063 - 39532215
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||     
T  39532063 gtgtttggtaacacaaaaaaattagcttatagcttgttggactagcttataagtttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctcac 39532161  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39532162 tagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 39532215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10247482 - 10247427
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10247482 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagtttgttggactagcttataagct 10247427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 36600934 - 36600992
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36600934 ggctgtgtttgataacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 36600992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 270
Target Start/End: Original strand, 1086037 - 1086098
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  1086037 ttaggctgtgtttggtaacacaaataagctagcttatagcttgttaaactaacttataagct 1086098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38245998 - 38245840
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggt-aacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||     | || | | |||||||||| || |||||||| | ||    
T  38245998 gtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagtttattggactaacttataagcttgttttgaaagaatgcgacgtgtttggtaaaaaaacttttcttat 38245899  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
      ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38245898 tcgcttatagcgtttttttaaaagctatttcaagtagctttttaacttataactgatag 38245840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6322239 - 6322080
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | || ||| | ||   |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  6322239 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttagaaacttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaaacttttttca 6322141  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
      |||||||||||       | |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  6322140 ctagcttatagcgtgttttgagaagctatttcaagtaatttttgagcttatagctggtagt 6322080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 14452300 - 14452355
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14452300 tgtgtttggtaacacgaattagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 14452355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36602834 - 36602776
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36602834 ggctgtgtttggtaacattaataagctagcttatagcttgttggactagctgataagct 36602776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Original strand, 11447240 - 11447292
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11447240 tgtgtttagtaacacaaataagctagcttatagcttgctggactagcttataa 11447292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32482341 - 32482289
Alignment:
Q  218 gtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32482341 gtttggtaacacaaaaaagctagtttatagtttgctggactagcttataagct 32482289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 6319537 - 6319592
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6319537 tgtgtttggtaacaagaataagctagcttacagcttgttggactagcttataagct 6319592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33182668 - 33182613
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  33182668 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagctcgtaggactagcttataagct 33182613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38928663 - 38928608
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38928663 tgtgtttggtaacatgaataagctagcttatagtttgttggactagcttataagct 38928608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15265438 - 15265287
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |  | || | | |||||||||||| ||  |||||| || |    
T  15265438 tgtttggtaacacaaataagttagcttatagcttcttgggctagcttataagcttgttttaatagaatgagacgtgtttggtaaaaacttttttttatta 15265339  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||||| ||       |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15265338 acttataacgttttttgaaaaactatttcaagtaacttttgagcttatagct 15265287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 259
Target Start/End: Original strand, 18239339 - 18239383
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggatta 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  18239339 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagttttttggatta 18239383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 37240946 - 37241002
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  37240946 ggctgtgttcggtaatacaaataagctagcttataacttgttagactagcttataag 37241002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28125091 - 28125052
Alignment:
Q  229 caaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28125091 caaataagctagcttatagcttgttggactagcttataag 28125052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11018025 - 11017991
Alignment:
Q  334 aaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11018025 aaaagctatttcaagtagttttttagcttatagct 11017991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 374
Target Start/End: Original strand, 30523759 - 30523796
Alignment:
Q  337 agctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30523759 agctgtttcaagtagctttttagcttatagctggtagt 30523796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41734371 - 41734210
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41734371 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttttt 41734272  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41734271 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 41734210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6789716 - 6789554
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6789716 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 6789617  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6789616 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctggtagt 6789554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 210 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37530849 - 37530690
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37530849 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttt 37530750  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37530749 ttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 37530690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 12280777 - 12280935
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12280777 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttt 12280876  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12280877 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctattttaagtagctttttagcttatagctg 12280935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 36761062 - 36761216
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36761062 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttataggttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcat 36761161  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36761162 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 36761216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 42709307 - 42709465
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42709307 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 42709406  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709407 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 42709465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 15498642 - 15498799
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15498642 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 15498741  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15498742 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 15498799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29525423 - 29525266
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29525423 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 29525324  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29525323 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 29525266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34590030 - 34589871
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34590030 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacatggcgtgtttggtaacaagctttt 34589931  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||| ||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34589930 ttcatgagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtagttttttagcttatagctg 34589871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 24171361 - 24171518
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24171361 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaatcgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 24171460  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24171461 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttaacttatagct 24171518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Original strand, 76414 - 76572
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  76414 tgtgtttgataacacaaaaaagctagcttatagctttttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttccc 76513  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76514 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 76572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27813104 - 27812942
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27813104 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgaattagtttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 27813005  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27813004 tcatgagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtaactttttagcttatagctgatag 27812942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12953937 - 12953772
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12953937 ttaggctgtatttggtaacacaaaaaagctagcttataatttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttgataacaagcttt 12953838  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12953837 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaaatagctttttagcttatagctggtagt 12953772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13359584 - 13359426
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13359584 aggctgtgtttgataacacaaaaaagctagcatatagcttgttggattagcttataagcttgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 13359485  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13359484 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtaactttttagcttatagctg 13359426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 42422803 - 42422961
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttgg--taacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  42422803 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagcttgttgaattaacttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtataacaagcttt 42422902  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagc 367  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422903 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagc 42422961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 10815059 - 10815217
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||    
T  10815059 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatatgacgtgtttagtaacaagcttttt 10815158  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10815159 tcatgagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 10815217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16218405 - 16218268
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16218405 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcatga 16218306  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctt 354  Q
    ||||||||||       |||||||||||||| ||||||    
T  16218305 gcttatagcgttttttgaaaagctatttcaaatagctt 16218268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Original strand, 23590633 - 23590797
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23590633 ttaggttgtgtttggtaacacaaaaaagatagtttataacttgttggattagcttataaactcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttt 23590732  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23590733 tttcatgagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagcattttagcttacagctgatag 23590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12939987 - 12939822
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||    
T  12939987 ttaggctgtatttggtaacacaaaaaagctagcttataatttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacctggcgtgtttgataacaagtttt 12939888  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  12939887 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaaatagctttttaacttatagctggtagt 12939822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7615103 - 7614947
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7615103 gctgtgtttggtaatacaaaaaagctaccttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacatggcgtgtttggtaacaagcttttttc 7615004  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |  ||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7615003 acaagcttatagcattttttgaaaagatatttcaagtagctttttatcttatagctg 7614947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11784298 - 11784139
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| | ||    
T  11784298 ttagactgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatatgtcgtggttggtaacaagc-tt 11784200  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11784199 tttcatgagcttatagcgttttctgaaaagcaatttcaagtagctctttagcttatagctg 11784139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 35638766 - 35638922
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  35638766 tgtttggtaacacaaaaaaactagcttatagtttgttggattaacttataagctcgttagatgaaaatgtggcgtgtttgataacaagcttttttcacga 35638865  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||||       ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35638866 gcttatagcgttttttgaaaagttatttcaaatagttttttagcttatagctgatag 35638922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 25881507 - 25881661
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25881507 tgtgtttggtaacataaataggctagcttatagcttgttagattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaaacttttctcat 25881606  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       | || ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25881607 gagcttatagcgttttttgagaaactatttcaagtagattttgagcttatagctg 25881661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5050204 - 5050091
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  5050204 ggctgtgtttggtaacataaataagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacgaacttttct 5050105  T
Q  312 catgagcttatagc 325  Q
     |||||||||||||    
T  5050104 tatgagcttatagc 5050091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 17540284 - 17540418
Alignment:
Q  238 tagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||    
T  17540284 tagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttggattaaaacgtgacgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagctttttgtgagaa 17540383  T
Q  338 gctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17540384 gctatttcaagtagcttttgaacttatagctgata 17540418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 17645303 - 17645460
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  17645303 ggctgtgtttggtaacataaataagctagcttatagcttgttagattagcttataagttcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttct 17645402  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||| ||       | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17645403 catgagcttataacgttttttgagaagctaattcaagtatctttttaacttatagctg 17645460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 365
Target Start/End: Original strand, 35766554 - 35766709
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  35766554 taggttgtgtttgataatacaaaaaagctagcttatagcttcttggattagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagctttt 35766653  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
     |||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  35766654 ctcatgagcttatagcattttttgaaaaactatttcaagtagcttttgaacttata 35766709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7157610 - 7157444
Alignment:
Q  202 tgaacgcttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaac 301  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  7157610 tgaacacttagactgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactaacttataagcttgttggatgaaaacgtgatgcgtttggtaac 7157511  T
Q  302 aaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    || ||||| ||| |||||||||||        | |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  7157510 aagcttttctcacgagcttatagctttttttgagaagctatttcaaatagcttttaaacttatagct 7157444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2891079 - 2890915
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||    
T  2891079 ttagggtgtgtttggtaacacaaataatctagcttatagtttgttggactaacttataagcttgttggatgaaaatgtgatgtgtttgataataaacttt 2890980  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    | ||| |||||||||||        | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2890979 tctcacgagcttatagctttttttgagaaactatttcaaatagctttttagcttatagctgatag 2890915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4559587 - 4559438
Alignment:
Q  207 gcttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgt-tagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaac 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||| | || | |  ||||||||||| ||||    
T  4559587 gcttaggctgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggacaagcttataagcttgtcttgat-agaatgagatgtgtttggtaaaaaac 4559489  T
Q  306 ttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttt 356  Q
    ||||||||| |||||||||||       ||||| |||||||||||||||||    
T  4559488 ttttttcattagcttatagcgttttttgaaaagttatttcaagtagctttt 4559438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 270
Target Start/End: Original strand, 1923941 - 1924002
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1923941 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 1924002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 323
Target Start/End: Original strand, 3703454 - 3703560
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  3703454 tgtttggtaacataaataagctagtttatagcttgttatattagcttataagcttattggatgaaaacgtgacgtgtttgataacaagtttttctcatga 3703553  T
Q  317 gcttata 323  Q
    |||||||    
T  3703554 gcttata 3703560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5102802 - 5102694
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5102802 tgtgtttggtaacacgaataagctagcgtatagattgttggactagcttataagtttgttggatcaaaacatgatgtgtttgataacaaacttttctcat 5102703  T
Q  315 gagcttata 323  Q
    |||||||||    
T  5102702 gagcttata 5102694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Original strand, 11575622 - 11575675
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11575622 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataag 11575675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 13018994 - 13019147
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  13018994 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttataacttgttggactagcttataagtttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctca 13019092  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
      |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13019093 ctagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 13019147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 3033393 - 3033448
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3033393 tgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 3033448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36944345 - 36944270
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaac 284  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||    
T  36944345 ttaggttgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttagactaacttataagcttgttggatgaaaac 36944270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3078643 - 3078487
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || | || ||| |||| | | |||||||||||| ||  ||||     
T  3078643 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttataacttgttggactagcttataaacttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagtttttc 3078545  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||  |||||||||||       | |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  3078544 tcactagcttatagcgttttttaagaagctaatctaagtagctttttagcttatagct 3078487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 36959460 - 36959535
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaac 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||||| ||| |||||||||    
T  36959460 ttaggttgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttaaactagtttacaagcttgttggatgaaaac 36959535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 8520494 - 8520552
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8520494 ggctgtgtttggtaacacgaataagctaacttatagcttgttggactagcttataagct 8520552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 24463511 - 24463670
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||  || |||||||||||  |||    
T  24463511 ttaggttgtgtttggtaacaacgagaagctagcttataggttattgaattagcttataagtttgttggatcaaaacatgatgtatttggtaacaattttt 24463610  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | |||||||||||||||        | || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24463611 tctcatgagcttatagctttttgtgagaaactatttcaagtagcttttgagcttaaagct 24463670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20017402 - 20017350
Alignment:
Q  218 gtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20017402 gtttgataacacaaaaaaactagcttatagcttgttggactagcttataagct 20017350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 8520567 - 8520622
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8520567 tgtgtttggtaacataaaaaagctagcatatagcttgttagactagcttataagct 8520622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7948521 - 7948486
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttata 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7948521 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttata 7948486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Original strand, 15524362 - 15524414
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15524362 tgtgtttcgtaacacgaataagctagcttatagcttgttagactagcttataa 15524414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20768967 - 20768912
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  20768967 tgtgtttggcaacacaaaaaagttagtttatagtttgttggactatcttataagct 20768912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Original strand, 15524485 - 15524523
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15524485 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagctggtagt 15524523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 270
Target Start/End: Original strand, 3033338 - 3033374
Alignment:
Q  234 aagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3033338 aagctagcttatagcttgttagactagcttataagct 3033374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5101991 - 5101959
Alignment:
Q  334 aaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5101991 aaaagctatttcaagtagcttttgagcttatag 5101959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 213 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42329124 - 42328963
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42329124 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttc 42329025  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42329024 atgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctggtagt 42328963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 27826706 - 27826863
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27826706 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 27826805  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826806 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 27826863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 46536119 - 46536276
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46536119 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttgtagcttgttggattagcttataaactcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttttt 46536218  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46536219 catgagcttatagcgttttctgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 46536276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28494380 - 28494221
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28494380 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttt 28494281  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28494280 ttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatatcaagtagctttttagcttatagctg 28494221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 4060352 - 4060506
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4060352 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttttccat 4060451  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4060452 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 4060506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28958221 - 28958067
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28958221 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattaacttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcat 28958122  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28958121 gagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 28958067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Original strand, 46672499 - 46672663
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  46672499 cttaggctgtgtttgataacacaaaaaagctagcttataacttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatgtgacgtgtttggtaacaagctt 46672598  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46672599 ttttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttataactgata 46672663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42265372 - 42265221
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42265372 tgtgtttggtaactcaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaaacttttttcat 42265273  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42265272 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagaagctttttagcttatag 42265221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46350941 - 46350781
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46350941 ttagactgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttgttggattagtttataagctcgttagatgaaaacatgacgtgtttggtaacaaacttt 46350842  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46350841 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaaactatttcaagtagctttttagcttatagctg 46350781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29994315 - 29994156
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29994315 tgtgtttggtaacataaaaaagctcgcttatagtttgttagattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcat 29994216  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29994215 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctggtagt 29994156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 210 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31031998 - 31031843
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31031998 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagcttgttggattaacttataagctcgttaaatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttt 31031899  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31031898 ttcataagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 31031843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 35647418 - 35647574
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35647418 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggatttgcttataagctcgttagatgaaaatgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcatga 35647517  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||| |       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35647518 gcttatagtgttttttgaaaagctatttcaagcagctttttagcttatagctgatag 35647574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 214 - 369
Target Start/End: Original strand, 43337632 - 43337787
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43337632 ctgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagacgaaaacgttgcgtgtttggtaacaagcttttttca 43337731  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43337732 tgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaaatagttttttagcttatagctg 43337787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Original strand, 43156565 - 43156710
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  43156565 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatgtggcgtgtttgataacaagctttttt 43156664  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttt 357  Q
    ||||||||||||| |       |||||||||||||||||| |||||    
T  43156665 catgagcttatagtgttttctgaaaagctatttcaagtagtttttt 43156710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46615779 - 46615626
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46615779 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctaatttatagtttgttagattagcttataagctcgttagatgaaaacgtagcgtgtttggtaacaagcttttttca 46615680  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagc 367  Q
    |||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46615679 tgagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttaacttatagc 46615626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 358
Target Start/End: Original strand, 6243864 - 6244009
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6243864 ggctgtgtttggtaacacaacaaagctagtttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacgagctttttt 6243963  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttta 358  Q
     |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  6243964 -atgagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagcttttta 6244009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21920897 - 21920738
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  21920897 gctgtgtttggtaacacaaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagctagttgaatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttctc 21920798  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21920797 atgagcttatagcgttttttaaaaa-ctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 21920738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31226974 - 31226816
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31226974 aggctctgtttggtaacacaaaaaagttagcttataacttgttgaattagtttataagctcattagatgaaaatgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 31226875  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    | ||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31226874 ttatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagttttttagcttatagctg 31226816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Original strand, 48935236 - 48935389
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48935236 gtgtttggtaacacaaataagctagcttatagcttgttggattagtttataagctcgttggatagaaacgtgacgtgtttggtaacaaacttttttcatg 48935335  T
Q  316 agcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||        | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48935336 agcttatagctttttgtgagaagctattttaagtagcttttgagcttatagctg 48935389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 28235281 - 28235438
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  28235281 aggctgtgtttgataacataaataagctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttc 28235380  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | |||||||||||||        | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28235381 ttatgagcttatagctttttgtaagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 28235438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14792212 - 14792062
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagc 318  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14792212 tttggtaacacaaataagttagcttatagcttgttagattagcttataagctcgttggattaaaacgtgatgtgtttggtaacaaacttttttcatgagc 14792113  T
Q  319 ttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||        | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14792112 ttatagctttttgtgagaagctatttcaagtagcttttgaacttatagctg 14792062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 46534405 - 46534517
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  46534405 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtatggtaacaaacttttct 46534504  T
Q  312 catgagcttatag 324  Q
    || ||||||||||    
T  46534505 cacgagcttatag 46534517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 210 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46349988 - 46349829
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |    ||||||||||  | |||||    
T  46349988 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttcttggattaacttataagcttgttggatgaaaacataatatgtttggtaatgagctttt 46349889  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
     ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46349888 ctcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctg 46349829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 326
Target Start/End: Original strand, 25696031 - 25696144
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  25696031 gctgtgtttggtaacataaataaactagcttatagcttgttagattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttctc 25696130  T
Q  313 atgagcttatagcg 326  Q
    ||||||||||||||    
T  25696131 atgagcttatagcg 25696144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 238 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42328241 - 42328109
Alignment:
Q  238 tagcttata-gcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaa 336  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||       |||    
T  42328241 tagcttataagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatgtgacgagtttggtaataagctttttttatgagcttatagcgttttttgaaa 42328142  T
Q  337 agctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42328141 agctatttcaagtagctttttagcttatagctg 42328109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 366
Target Start/End: Original strand, 981336 - 981488
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  981336 ctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagtttgttggattagcttataagctagttgaatgaaaacgtgatgtgtttgataacaagcttttttca 981435  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
     |||||||||||        | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  981436 cgagcttatagctttttttgagaagctatttcaagtagccttttatcttatag 981488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 3370445 - 3370603
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| || ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||     
T  3370445 aggctgtgtttggtaatacaaaaaagttaatttatagttttttggattagtttataagtttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttc 3370544  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3370545 tcatgagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctg 3370603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 42997508 - 42997671
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  42997508 ttaggctgtgtttagtaacactaaaaagttactttatagtttgttggactagcttataagctcgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttt 42997607  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    | ||| ||||||||||         |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42997608 tctcacgagcttatagatttttttgaaaagctaattcaagtagctttttaccatatagctgata 42997671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 316
Target Start/End: Original strand, 6476926 - 6477027
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||    
T  6476926 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttcttggattagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagtttttctcat 6477025  T
Q  315 ga 316  Q
    ||    
T  6477026 ga 6477027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 35670459 - 35670300
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  35670459 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaaactt 35670361  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    || |||  ||||||||||        | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35670360 ttctcactagcttatagcattttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 35670300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Original strand, 47479817 - 47479936
Alignment:
Q  246 agcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttc 345  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||       |||||||| |||    
T  47479817 agctagttagattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttctcatgaacttatatcgttttttgaaaagctaattc 47479916  T
Q  346 aagtagctttttagcttata 365  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47479917 aagtagctttttagcttata 47479936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 365
Target Start/End: Original strand, 44103661 - 44103814
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  44103661 ggctgtgtttggtaacacaaaaaaacaaccatatagtttgttggattagcttataaactaattggatgaaaatgtgatgtgtttgataacaaattttttt 44103760  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    || ||||||||||||       | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44103761 cacgagcttatagcgttttttgagaagctatttcaagtacctttttagtttata 44103814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Original strand, 40061160 - 40061316
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| || ||||| |    
T  40061160 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttaataaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttct 40061259  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||  ||||||||| |       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40061260 cactagcttatagtgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 40061316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30524049 - 30523895
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagc 318  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||  |||| ||| ||||    
T  30524049 tttggtgacacaaataagctagcttatagcttgttggattaactcataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtatggtaacaagtttttctcacgagc 30523950  T
Q  319 ttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||          | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30523949 ttataattttttttgagaagttatttcatgtagctttttagcttatagctgatag 30523895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37658214 - 37658061
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37658214 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctca 37658116  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
      |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37658115 ctagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 37658061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43158292 - 43158142
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagct-tgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  43158292 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatatctctgttagattagtttataagctcgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaagaagcttttctca 43158193  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttat 364  Q
     ||| |||||||        | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43158192 cgagtttatagcttttttttagaatctatttccagtagctttttagcttat 43158142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 270
Target Start/End: Original strand, 30582667 - 30582726
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30582667 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 30582726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39870116 - 39869967
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||  ||    
T  39870116 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctcactag 39870018  T
Q  318 cttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||| ||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39870017 cttataacgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 39869967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 372
Target Start/End: Original strand, 33979613 - 33979773
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagc-tcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  || ||| | ||   |  ||||||||||| |||||||||    
T  33979613 ggctgcgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactaccttataagcatgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaaacttttt 33979711  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    |||  |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33979712 tcactagcttatagcgttttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctgata 33979773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9806690 - 9806535
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |    
T  9806690 gctgtgtttggtaacataaaaaagttagtttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttct 9806592  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||  |||||||||||       | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9806591 cactagcttatagcgttttttaagaagctaattcaagtagctttttaacttatagct 9806535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 270
Target Start/End: Original strand, 44570928 - 44570987
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44570928 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttattggactagcttataagct 44570987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 373
Target Start/End: Original strand, 44818716 - 44818879
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||     | || | | | |||||||||| || |||||    
T  44818716 taggctgtgtttggtaacataaaaaagctagcttataatttgttggactagcttataaacttgtttttgtagaatgagacatgtttggtaaaaagctttt 44818815  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||| |||||||||||       | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  44818816 ttcattagcttatagcgttttttgataagctaattcaagtaacttttgagcttatagcttatag 44818879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 596212 - 596052
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| | ||  |   ||||||||||| |||||||||||    
T  596212 ctgtgtttggtaacacgaataagctaggatataacttgttggactagcttataagcttgttttgat-ataatataatgtgtttggtaaaaaacttttttc 596114  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |  |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  596113 actagcttatagcgttttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagccgatagt 596052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44104676 - 44104528
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgt-tagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| || | ||| | || | |  ||||||||||| || ||||||||    
T  44104676 ctgtgtttggtaacaaaaaaaagctagcttatagtttgttggacaaacttataagcttgtcttgat-agaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttttc 44104578  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagctt 362  Q
    || ||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44104577 attagcttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagctt 44104528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 368
Target Start/End: Original strand, 31619515 - 31619658
Alignment:
Q  225 aacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttata 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || ||||| |||  ||||||||    
T  31619515 aacacaaaaaagctagtttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagcttttatcactagcttata 31619613  T
Q  324 gcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||       | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  31619614 gcgttttttaagaagctaatccaaatagctttttagcttatagct 31619658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33982414 - 33982255
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||| | ||   |  ||||||||||| || |||||||||    
T  33982414 tgtgtttggtgacacgaataagctagcttatagcttgttagactagcttataagcttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaagcttttttca 33982316  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
      |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33982315 ctagcttatagcgttttttgataagctatttcaagtagcttttgagcttatagctggtagt 33982255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 253
Target Start/End: Original strand, 35747020 - 35747063
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgtt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35747020 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgtt 35747063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 36121431 - 36121486
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36121431 tgtgtttggtaacacaaagaagatagcttatagcttattggattagcttataagct 36121486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31436352 - 31436294
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31436352 ttaggttgtgtttcgtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactaacttataa 31436294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31969568 - 31969510
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  31969568 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagattgttggactaacttataagct 31969510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43544995 - 43544845
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| | ||   |  ||||||||||| || |||||||||    
T  43544995 tgtgtttggtaacacgaataagctaacttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaagcttttttca 43544897  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
      |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43544896 ctagcttatagcgctttttgataagctatttcaagtagcttttgagcttata 43544845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42329656 - 42329599
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42329656 gctgtgtttggtaacacaaaaaaaccagcttatagcttgttggactagtttataagct 42329599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43468112 - 43467956
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | | || ||| |||| | |  ||||||||||| || |||||     
T  43468112 ggctgtgtttggtaaccgaaaaaagctagcttatagtttgttggactggcttataagtttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttc 43468014  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||| |||||||||||       | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43468013 tcattagcttatagcgttttttaagaagctaatccaaatagctttttagcttatagct 43467956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Original strand, 47252217 - 47252269
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47252217 tgtgtttggtaacacgaataagctaccttatagcttgttggattagcttataa 47252269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1602078 - 1602024
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1602078 tgtgtttggtaacataaaaa-gctagcttatagcttgttggactagcttataagct 1602024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 41406185 - 41406243
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  41406185 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttattggactatcttataagct 41406243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 585989 - 585934
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  585989 tgtgtttagtaacacgaataagctaacttatagcttgttggactagcttataagct 585934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37708193 - 37708138
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37708193 ggctgtgtttcgtaacacgaataagctaccttatagcttgttggactagcttataa 37708138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1602224 - 1602170
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1602224 gtgtttgataacacgaataagatagcttatagcttgttggactagcttataagct 1602170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8932602 - 8932544
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8932602 ggctgtgtttggtaacacaaataaattagtttataacttgttggactagcttataagct 8932544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39709950 - 39709888
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaa-aagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  39709950 ttaggctgtgtttggtaacaaaaaagaagctagcgtataggttgttggactagcttatgagct 39709888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31030861 - 31030808
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31030861 tgtttggtaacataaaaaagctaatttatagtttgttggactagcttataagct 31030808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35670509 - 35670456
Alignment:
Q  207 gcttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattag 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35670509 gcttaggttgtgtttggtaacaacaagaagctagcttatagcttgttgaattag 35670456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 249
Target Start/End: Original strand, 38224585 - 38224622
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagct 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38224585 ggctgtgtttggtaacacaaataagctagcttatagct 38224622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Original strand, 25483592 - 25483644
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  25483592 tgtgtttggaaacacaaataagctagctaatagcttattgtattagcttataa 25483644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1602136 - 1602097
Alignment:
Q  231 aaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1602136 aaaaagctaacttatagcttgttggactagcttataagct 1602097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30999443 - 30999388
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  30999443 tgtgtttggtaacacaaataagttagtttatagcttattggactagctcataagct 30999388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35669740 - 35669624
Alignment:
Q  257 ttagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttt 356  Q
    |||||||||||||| |||  || |||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| |        | ||||||||||||||| |||||    
T  35669740 ttagcttataagcttgttgtatcaaaatgtgacgtgtttgctaacaaacttttctcgtgagcttataactttttttgagaagctatttcaagtatctttt 35669641  T
Q  357 tagcttatagctgatag 373  Q
     | ||||||||| ||||    
T  35669640 gaacttatagcttatag 35669624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 369
Target Start/End: Original strand, 46614366 - 46614401
Alignment:
Q  334 aaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46614366 aaaagctatttcaagtagctttttagtttatagctg 46614401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Original strand, 41406309 - 41406347
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41406309 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagctggtagt 41406347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42833826 - 42833768
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42833826 ggctgtgtttggtaatacgaataagctgacttatagcttgttggactagctgataagct 42833768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 300
Target Start/End: Original strand, 36820322 - 36820411
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaa 300  Q
    |||||| |||||||||||   | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| | | ||||| || ||||||||||||    
T  36820322 aggctgcgtttggtaacagcgagaagctatcttatagcttattgaattagcttataagtttgttgggtcaaaacatgacgtgtttggtaa 36820411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Original strand, 42826000 - 42826041
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgga 256  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  42826000 tgtgtttggtaacacaaataagttagtttatagcttgttgga 42826041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 366
Target Start/End: Original strand, 47252963 - 47252995
Alignment:
Q  334 aaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47252963 aaaagctatttcaagtagcttttgagcttatag 47252995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 208 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24119345 - 24119184
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24119345 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctt 24119246  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24119245 ttttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 24119184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 12130477 - 12130635
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130477 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttgttggattagcttataaatttgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 12130576  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130577 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 12130635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25023557 - 25023400
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25023557 ggctttgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagcttgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttttt 25023458  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25023457 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagttttttagcttatagctg 25023400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 210 - 369
Target Start/End: Original strand, 20645653 - 20645812
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  20645653 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatgtgacgtgtttggtaacaagctttt 20645752  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    || ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20645753 tttatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 20645812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Original strand, 22707285 - 22707445
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22707285 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagtttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgattggtaacaagcttt 22707384  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    || ||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707385 ttccatgagcttatagtgttttttaaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 22707445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20992362 - 20992213
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20992362 tgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcatga 20992263  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    ||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20992262 gcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtatctttttagcttatag 20992213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13756423 - 13756268
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13756423 aggctgtgtttggtaacacgaaaaagctagtttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttt 13756324  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    |||||||||||||| |       ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13756323 tcatgagcttatagtgttttttgaaaagctatttcaagtaggattttagcttatag 13756268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 358
Target Start/End: Original strand, 21860234 - 21860377
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21860234 tgtgtttagtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagacgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagtttttttcat 21860333  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttta 358  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  21860334 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttta 21860377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 208 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21778192 - 21778035
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||    
T  21778192 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagcctgttggattaacttataagctcgttagatgaaaatctggtgtgtttggtaacaagctt 21778093  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    |||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778092 ttttcacgagcttatagcgtttttcgaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 21778035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 21459018 - 21459176
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||     
T  21459018 aggctgtgtttggtaacatagataagctagcttatagcttgttagattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttgataacaagcttttc 21459117  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    | ||||||||||||||       ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21459118 ttatgagcttatagcgttttttgaaaagttaattcaagtaactttttagcttatagctg 21459176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6834151 - 6833987
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6834151 ttaggctctgtttggtaacataaataagctatcttatagtttgttgaactagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaaacttt 6834052  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    | ||||||||||||| |        | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6834051 tctcatgagcttataac-ttttttgagaagctatttcaagtagctttttaacttatagctgatagt 6833987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 1789783 - 1789940
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || |||||    
T  1789783 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagctttt 1789881  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  |||||||||||       | |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  1789882 ctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttaacttatagct 1789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18368840 - 18368680
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||    
T  18368840 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagct 18368742  T
Q  307 tttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||| |||  |||||||||||       | |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18368741 tttctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatctaagtagctttttagcttatagct 18368680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 18801696 - 18801853
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || |||||    
T  18801696 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactaacttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagctttt 18801794  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  || ||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18801795 ctcactagtttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 18801853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32986923 - 32986824
Alignment:
Q  275 agatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32986923 agatgaaaacgtggcgtgtttgataacaagcttttttcatgagcttatagaattttttgaaaagctattttaagtagctttttagcttatagctggtagt 32986824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 4976520 - 4976677
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || |||||    
T  4976520 aggctgtgtttggtaacacaaaaaaactagcttatagcctgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagctttt 4976618  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  |||||||||||       | |||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4976619 ctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttgtagct 4976677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 15508346 - 15508404
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15508346 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 15508404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Original strand, 13866264 - 13866316
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13866264 tgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataa 13866316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32562510 - 32562457
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32562510 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataag 32562457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5090186 - 5090130
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5090186 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttcttggactagcttataag 5090130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31604014 - 31603956
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  31604014 ggctgtgtttgataacacaaataagctagcttatagtttgctggactagcttataagct 31603956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Original strand, 12815645 - 12815756
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| | | ||| ||||   |  |||||||||||||||||||||    
T  12815645 aggctgtgtttggtaacgtaaataaactagtttatagttttttgaattagtttataagcttgcttgat-aaaattagatgtgtttggtaacaaacttttt 12815743  T
Q  311 tcatgagcttata 323  Q
    |||||||||||||    
T  12815744 tcatgagcttata 12815756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Original strand, 24159238 - 24159396
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgtta-gatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||| | ||   |  ||||||||||| || |||||| ||    
T  24159238 tgtgtttggtaacacgaataaggtagcttatagtttgttggactagcttataagcttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaagcttttt-ca 24159335  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
      |||||||||||       | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24159336 ctagcttatagcgttatttgagaagctatttcaagtagtttttgagcttatagctgatagt 24159396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 270
Target Start/End: Original strand, 5956415 - 5956477
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||    
T  5956415 cttaggctgtgtttggtaacatagataagctagcttataacttcttggactagtttataagct 5956477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 270
Target Start/End: Original strand, 190927 - 190978
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  190927 tttgataacacaaaaaagttagtttatagcttgttggactagtttataagct 190978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 1290382 - 1290437
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1290382 tgtgtttggtaaaataaataagttagcttatagcttgttagaatagcttataagct 1290437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Original strand, 15508470 - 15508508
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15508470 aagctatttcaagtagcttttgagcttataactgatagt 15508508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31259633 - 31259592
Alignment:
Q  229 caaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31259633 caaaaaagctagattatagcttgttgggctagcttataagct 31259592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34574576 - 34574536
Alignment:
Q  334 aaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  34574576 aaaagctatttcaagtagcttttgagcttataactggtagt 34574536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43800874 - 43800714
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43800874 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttt 43800775  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43800774 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 43800714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25100317 - 25100156
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25100317 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttagcttagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 25100218  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25100217 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 25100156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35160369 - 35160211
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  35160369 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttattggattagcttataagttcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcaa 35160270  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
     |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35160269 tagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 35160211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 14911759 - 14911924
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  14911759 ttaggctgtgtttagtaacacaaaaaatctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatgtggcgtgtttggtaacaagtttt 14911858  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14911859 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctggtagt 14911924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 40529497 - 40529655
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40529497 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgtttgtttagcttataagcttgttagatgaaaatgtgtcgtgtttggtaacaagcttttt 40529596  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40529597 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 40529655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20697611 - 20697451
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  20697611 ttaggctgtgtttggtaatacaaaaaagttagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacataacgtgtttggtaacaagcttt 20697512  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20697511 tttcatgagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 20697451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38747057 - 38746902
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaa-gctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38747057 tgtgtttggtaacacaaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtggttggtaacaagcttttttca 38746958  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38746957 tgaacttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttaacttatagctg 38746902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 5838253 - 5838410
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5838253 ggctgtgtttggtaatacaaaaaagctaacttatagcttgttggattagcttataagcttgttagatgaaaatgtggcatgtttggtaacaagctttttt 5838352  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5838353 catgagcttattgcgtgttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 5838410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 369
Target Start/End: Original strand, 17121817 - 17121969
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17121817 tgtttggtaacacaaaaaagctagtttataggttgttggattaacttataagttcgttagatgaaaacgtagcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 17121916  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
     |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17121917 tcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 17121969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 358
Target Start/End: Original strand, 22215111 - 22215254
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22215111 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcat 22215210  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttta 358  Q
    ||||||||| ||       ||||||||||||||||| |||||||    
T  22215211 gagcttataacgttttttaaaaagctatttcaagtaacttttta 22215254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 5574599 - 5574756
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5574599 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagtttgttgaattaacttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagttttttt 5574698  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||| ||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5574699 catgagcttataccgttttttgaaaagctatttcaaatagctttttagcttatagctg 5574756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2773688 - 2773524
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2773688 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttggatgaaaacgtgacgtgcttggtaacaagcttt 2773589  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    | ||| ||||||||| |        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2773588 tctcacgagcttataactttttttgagaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 2773524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 231 - 374
Target Start/End: Original strand, 36859244 - 36859387
Alignment:
Q  231 aaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnn 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||        
T  36859244 aaaaagttagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacctatttggtaacaagtttttttcatgagcttatagcgtttt 36859343  T
Q  331 nnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36859344 ttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 36859387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 284815 - 284927
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  284815 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagtttatagcttgttggattagcttataagttcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttttt 284914  T
Q  312 catgagcttatag 324  Q
    |||||||||||||    
T  284915 catgagcttatag 284927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 631062 - 630950
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  631062 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagtttatagcttgttggattagcttataagttcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttttt 630963  T
Q  312 catgagcttatag 324  Q
    |||||||||||||    
T  630962 catgagcttatag 630950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 816874 - 816762
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  816874 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagtttatagcttgttggattagcttataagttcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttttt 816775  T
Q  312 catgagcttatag 324  Q
    |||||||||||||    
T  816774 catgagcttatag 816762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 3512471 - 3512625
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||    
T  3512471 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttcttggattagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagtttttctcat 3512570  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
     |||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3512571 tagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctg 3512625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35057406 - 35057246
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  35057406 ttaggttgtgtttggtaacataaataagatagcttatagcttgttagattagcttataagctcgttggatgcaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttt 35057307  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    | ||||||||||||||||       |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35057306 tctcatgagcttatagcgatttttgaaaagctaattcaagtagttttttagcttatagctg 35057246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16786635 - 16786476
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16786635 taggctgtgtttggcaacacaaaaaagctaacttatagcttcttggattagcttataagcttgttgaatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaaactttt 16786536  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
     | ||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16786535 cttatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaactagcttttgagcttatagctg 16786476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Original strand, 39733721 - 39733814
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39733721 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttataccttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggtgtgtttggtaacaa 39733814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24804590 - 24804432
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||     
T  24804590 aggctgtgttcggtaacacaaaaaagctagcttatagcttcttggattagcctataagcttgttggatgaaaatgtgatgtgtttggtaacaagcttttc 24804491  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||| ||||||||        |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  24804490 tcatgaccttatagcattttttgaaaagctatttcaaatagctttagagcttatagctg 24804432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 284
Target Start/End: Original strand, 25099408 - 25099482
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaac 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25099408 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttataacttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaac 25099482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21266967 - 21266824
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  21266967 aggctatgtttggtaacataaataagctagcttaaagcttgttagattagcttagaagctcattggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttc 21266868  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctt 354  Q
    ||| ||||||||| ||       |||||||| ||||||||||||    
T  21266867 tcacgagcttataacgttttttaaaaagctaattcaagtagctt 21266824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Original strand, 12208803 - 12208959
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || |||||     
T  12208803 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagcttttc 12208901  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12208902 tcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 12208959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Original strand, 12453231 - 12453387
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || |||||     
T  12453231 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagcttttc 12453329  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12453330 tcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 12453387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Original strand, 43150247 - 43150405
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||    
T  43150247 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaaacttt 43150345  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||  |||||||||||       | ||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43150346 tttcactagcttatagcgttttttaagaagttaatccaaatagctttttagcttatagct 43150405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 324
Target Start/End: Original strand, 41355624 - 41355720
Alignment:
Q  228 acaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatag 324  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41355624 acaaaaaaactagcttatagctccttggattagcttataagtttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaaacttttctcatgagcttatag 41355720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 322
Target Start/End: Original strand, 16785621 - 16785724
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagc 318  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16785621 tttgataacataaataagctagcttataacttattaaattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttatcatgagc 16785720  T
Q  319 ttat 322  Q
    ||||    
T  16785721 ttat 16785724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 18146338 - 18146493
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  18146338 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagctttt 18146436  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
     |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18146437 ctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatag 18146493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45237896 - 45237745
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgt-tagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | ||| | || | |  ||||||||||| || |||||    
T  45237896 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgaacaagcttataagcttgtcttgat-agaatgagatgtgtttggtaaaaagctttt 45237798  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagctt 362  Q
    ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45237797 ttcattagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagctt 45237745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34903478 - 34903327
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||| |||    
T  34903478 ctgtgtttggtaacacaaataaactagcttacaccttgttggactagcttataagcttgttggatgaaaacatgatgtgttggataacaagcttttctca 34903379  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
     ||||||||| |        | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34903378 cgagcttataacttttttttagaagctatttcaagtagctttttagcttata 34903327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 369
Target Start/End: Original strand, 43873951 - 43874112
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaact 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| |||||    
T  43873951 cttaggctgtgtttggtaccacaaaaaagctagtttatagcttgttgaactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaaact 43874049  T
Q  307 tttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||  ||||| ||| |       | |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43874050 tttttcactagcttttagtgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagctg 43874112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45069918 - 45069765
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  45069918 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctca 45069820  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
      |||||||||||       | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  45069819 ctagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagttttttagcttatagct 45069765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 369
Target Start/End: Original strand, 25100320 - 25100400
Alignment:
Q  289 cgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25100320 cgtgtttggtaataagcttttttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 25100400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34618807 - 34618654
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||   ||   ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| ||||    
T  34618807 tgtgtttggtaacacaaaaaagttaacttatagtttatt---tt---ttataagctcgttggatgaaaatgtgacgtgtttaataacaagcttttctcat 34618714  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |||||||||| |       | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34618713 gagcttatagtgttttttgataagctatttgaagtagcttttgagcttatagctggtagt 34618654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35398060 - 35397960
Alignment:
Q  261 cttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            |||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  35398060 cttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctttt------------tagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagc 35397973  T
Q  361 ttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||    
T  35397972 ttatagctgatag 35397960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39104283 - 39104124
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||     |||| | |  ||||||||||| |||||||    
T  39104283 ttagactgtgtttggtaacacaagaaagctagcttataatttgttggactagcttataagcttgtttttataaaatgagatgtgtttggtaaaaaacttt 39104184  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||  |||||||||||       | |||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  39104183 tttcactagcttatagcgttttttaagaagctaatcaaagtagctttttaacttatagct 39104124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4477722 - 4477665
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4477722 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttgttggactagattataag 4477665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Original strand, 16785863 - 16785922
Alignment:
Q  263 tataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttat 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16785863 tataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttctcatgagcttat 16785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53575 - 53516
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  53575 ttaggctgtgttttgtaacacaaataagctagcttatagctttttgaattaacttataag 53516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31642848 - 31642793
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31642848 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagattataagct 31642793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38364570 - 38364411
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || ||| | ||   |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  38364570 tgtgtttggtaacacgaataaactagcttatagcttgttggactagtttataagcttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaaacttttttca 38364472  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
      ||||| |||||       | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38364471 ctagcttgtagcgttttttgagaagttatttcaagtagcttttgagcttatagctggtagt 38364411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 40532052 - 40532210
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| | || ||| |||| | |  ||||| ||||| || |||    
T  40532052 ttaggctgtgtttggtaacac-aaaaagctagcttatagtttattggactaacttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgttcggtaaaaagctt 40532149  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    || |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40532150 ttctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 40532210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42353795 - 42353736
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42353795 ttaggttgtgtttggtaatacaaaaaagttagtttatagtttgttggattagcttataag 42353736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35253136 - 35253074
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  35253136 cttaggttgtgtttggtaacacaaacaagctagcttatagtttgctggacaagcttataagct 35253074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Original strand, 43129589 - 43129642
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43129589 ctgtgtttggtaacacgaataagctagtttatagcttgttggactagcttataa 43129642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 367
Target Start/End: Original strand, 35019487 - 35019639
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| | ||   |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  35019487 tgtgttagataacacaaataagatagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaaacttttttca 35019585  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagc 367  Q
      |||||||||||       | ||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  35019586 ctagcttatagcgtttttttagaagttatttcaagtagcttttgaggttatagc 35019639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38760909 - 38760854
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38760909 tgtgtttggtaatacaaataaactagtttatagcttgttggactagcttataagct 38760854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 368
Target Start/End: Original strand, 41356304 - 41356443
Alignment:
Q  229 caaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgn 327  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||     
T  41356304 caaaaaagttagcatatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaacaagcttttctcattggcttatagcgt 41356402  T
Q  328 nnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
          | || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41356403 tttttaagaaactaatccaagtagctttttagcttatagct 41356443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 369
Target Start/End: Original strand, 7303365 - 7303472
Alignment:
Q  262 ttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagct 361  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||       |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  7303365 ttataagtttgttggatgaaaatgtgatgtgtttggtaccaagcttttctcatgagcttataacgttttttgaaaaactatttcaaatagcttttgagct 7303464  T
Q  362 tatagctg 369  Q
    ||||||||    
T  7303465 tatagctg 7303472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 29725738 - 29725796
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29725738 ggctgtgtttcgtaatacggataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 29725796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35004717 - 35004563
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||  || ||||  || |||||||| |||||| ||||||    
T  35004717 aggctgtgtttggtaacaacaaaaggttagcttatagcttgttgaatt-gcttataagtttgttgaatcaaaatatgccgtgtttgataacaagcttttt 35004619  T
Q  311 -tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
     ||   ||||||||||        | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35004618 ctcgcaagcttatagctgtttttgagaagctatttcaagtagctttttaccttata 35004563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41206636 - 41206527
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| | | ||||  || |||||||| | |||| ||||| ||    
T  41206636 gctgtgtttgataacaacaaaaagctagtttatagcttgttgaattaacttataagtttgttgggtcaaaatatgccgtgtttgattacaagcttttctc 41206537  T
Q  313 atgagcttat 322  Q
     |||||||||    
T  41206536 gtgagcttat 41206527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45237069 - 45237012
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttata 266  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  45237069 ttaggttgtgtttgataacacaaaaaagctagcttataactttttgtactagcttata 45237012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 372
Target Start/End: Original strand, 11189771 - 11189807
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11189771 aagctatttcaagtagctttttagcttataactgata 11189807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 261
Target Start/End: Original strand, 23625907 - 23625955
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagc 261  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23625907 gctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttattggactagc 23625955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15825649 - 15825577
Alignment:
Q  302 aaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15825649 aaacttttttcactagcttatagcgtttttttagaagctatttcaagtagcttttgagtttatagctgatagt 15825577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 369
Target Start/End: Original strand, 16786648 - 16786683
Alignment:
Q  334 aaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16786648 aaaagctaattcaagtagctttttagcttatagctg 16786683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19143021 - 19142966
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19143021 tgtgtttggtaacacgaataaactagcttatagcttgttggactgacttataagct 19142966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 369
Target Start/End: Original strand, 39733832 - 39733867
Alignment:
Q  334 aaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39733832 aaaagctatttcaaatagctttttagcttatagctg 39733867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 246
Target Start/End: Original strand, 7303335 - 7303369
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttata 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7303335 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttata 7303369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Original strand, 29725892 - 29725930
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29725892 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagctggtagt 29725930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 250
Target Start/End: Original strand, 42803469 - 42803499
Alignment:
Q  220 ttggtaacacaaaaaagctagcttatagctt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42803469 ttggtaacacaaaaaagctagcttatagctt 42803499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 322
Target Start/End: Original strand, 284927 - 284959
Alignment:
Q  290 gtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttat 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  284927 gtgtttggtaacaagcttttttcatgagcttat 284959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 630950 - 630918
Alignment:
Q  290 gtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttat 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  630950 gtgtttggtaacaagcttttttcatgagcttat 630918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 816762 - 816730
Alignment:
Q  290 gtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttat 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  816762 gtgtttggtaacaagcttttttcatgagcttat 816730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Original strand, 27747601 - 27747761
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27747601 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttt 27747700  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    | |||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27747701 tatcatgaacttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 27747761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50586278 - 50586124
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50586278 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcat 50586179  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    || |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50586178 gaccttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 50586124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 39325607 - 39325765
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39325607 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 39325706  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39325707 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatatcaagtagctttttagcttatagctg 39325765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 11823584 - 11823738
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11823584 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgttcggtaacaagtttttttcat 11823683  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823684 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 11823738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 30358070 - 30358228
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30358070 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 30358169  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30358170 tcatgagcttataacattttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 30358228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47326683 - 47326529
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47326683 tgtgtttggtaacccaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggtgtgtttggtaacaaactattttcat 47326584  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47326583 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 47326529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1190246 - 1190089
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1190246 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttataacttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaatttttt 1190147  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1190146 tcatgagcttataacattttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 1190089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 369
Target Start/End: Original strand, 38624061 - 38624222
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38624061 cttaggctttgtttggtagcacaaaaaagctaacttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagctt 38624160  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38624161 ttttcatgagcttatagctttttttgaaaagctatttcaagtagctttttaacttatagctg 38624222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38815655 - 38815504
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38815655 cttaggctgtatttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaatgtggcgtgtttggtaacaagctt 38815556  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcg-nnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttta 358  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  38815555 ttttcatgagcttatagcgtttttttgaaaagctatttcaagtagcttttta 38815504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 45900165 - 45900323
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45900165 aggctgtgtttggtaacacagaaaagctagtttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgatgtgtttggtaacaaacttttt 45900264  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  45900265 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatatcaggtagctttttagcttatagctg 45900323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28955660 - 28955500
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  28955660 ttaggctgtgtttggtaacataaaaaagctaacttatagcttgttagattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttt 28955561  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28955560 tttcatgagcttataacattttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 28955500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 12014642 - 12014796
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  12014642 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttataacttgttggattagtttataagctcgttagatgaaaacgtggtgtgtgtggtaacaagtttttttcat 12014741  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12014742 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaggtagctttttagcttatagctg 12014796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2459748 - 2459587
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  2459748 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagcttattggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttct 2459649  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    || ||||||||| |        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2459648 cacgagcttatatctttttttgagaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 2459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 41865284 - 41865441
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||| |    
T  41865284 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttcttggattagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacgagcttttct 41865383  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41865384 catgagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctg 41865441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44278071 - 44277907
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  44278071 cttagtctgtgtttgataacacaaataagctaacttatagcttgttggactagcttataagctagttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagctt 44277972  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    || |||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44277971 ttctcatgagcttattgcgttttttaaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 44277907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Original strand, 25365760 - 25365918
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  25365760 tgtgtttggtaacataaataagttagcttatagcttgttagattaacttataagctcgttggatgaaaacgtgacatgtttggtaacaaacttttcttat 25365859  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25365860 gagcttatagcgttttttgaaaagctaattcaagtagctttttagcttatagctgatag 25365918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 369
Target Start/End: Original strand, 36739551 - 36739707
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  36739551 gctgtgtttggtaatacaaaaaagttagtttatagtttgttggattaacttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacgagcttttttc 36739650  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||        ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36739651 atgagcttatagcatttttcgaaaagctattttaagtagttttttagcttatagctg 36739707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28314957 - 28314799
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  28314957 aggctgtgtttggtaacccaaaaaaactagtttataatttgttggattaacttataagctcattagataaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttt 28314858  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28314857 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttaacttatagctg 28314799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 231 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 46315771 - 46315648
Alignment:
Q  231 aaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnn 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        
T  46315771 aaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcatgagcttataacgtttt 46315672  T
Q  331 nnnaaaagctatttcaagtagctt 354  Q
       | |||||||||||||||||||    
T  46315671 ttgataagctatttcaagtagctt 46315648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Original strand, 38058749 - 38058907
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||     
T  38058749 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataaccttgttggttgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttctcac 38058848  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||        | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38058849 gagcttatagctttttttgagaagctatttcaaatagctttttagcttatagctgatag 38058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Original strand, 33076605 - 33076762
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33076605 tgtgtttggtaacataaataagctagcttatagtttgttagattagct-ataagctcgttggatgaaaatgtgacgtgtttggtaacaagcttttctcat 33076703  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||| |        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33076704 gagcttataacattttttgaaaagctaattcaagtagctttttagcttatagctgatag 33076762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 11332836 - 11332995
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||  |||||| ||||||| ||||    
T  11332836 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagtttgttggactagcttataagctcgtgggatgaaaaattgatgtgtttagtaacaagcttt 11332935  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | ||| |||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11332936 tctcaggagcttatagctttttttaagaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 11332995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 11490857 - 11491016
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||  |||||| ||||||| ||||    
T  11490857 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagtttgttggactagcttataagctcgtgggatgaaaaattgatgtgtttagtaacaagcttt 11490956  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | ||| |||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11490957 tctcaggagcttatagctttttttaagaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 11491016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 366
Target Start/End: Original strand, 46742459 - 46742607
Alignment:
Q  218 gtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgag 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||| |||||||    
T  46742459 gtttggtaacacaaaaaaactagcttatagtttcttggattagattataagcttgttggatgaaaacatgatgcgtttggtaacaagcttttctcatgag 46742558  T
Q  318 cttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46742559 cttatagcattttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatag 46742607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Original strand, 28343687 - 28343847
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    
T  28343687 ggctgtgtttgctaacacaaaaa-gctagtttatagtttgttggagtaacttataagttcgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagttttttt 28343785  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||         | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28343786 catgagcttatagtttttttttagaagctatttcaaatagctttttagattatagctgatag 28343847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Original strand, 2937334 - 2937490
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |    
T  2937334 ggctgagtttgataacagcaagaagctagcttatagcttgttgaattagcttataagtttgttggatcaaaatgtgatgtgtttggtaacaaacttttct 2937433  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2937434 tatgagcttatagcattttttaaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 2937490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 211 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31657203 - 31657105
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  31657203 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttataatttgttggattagcttataagctcgtcggatgaaaacgtgatgtgtttggcaacaagctttt 31657105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 270
Target Start/End: Original strand, 14390416 - 14390477
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14390416 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 14390477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3796067 - 3796008
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3796067 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 3796008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 5698123 - 5698181
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5698123 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 5698181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9423152 - 9423001
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    ||||||||||||  || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| |  |||    
T  9423152 tgtttggtaacagcaagaagccaacttatagcttgttgaattagcttataagcttgttggatcaaaatgtgatgtgtttggtaacaagcttttcttgtga 9423053  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||||||| ||       ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9423052 gcttataacgttttttgaaaagctattttaagtagcttttgagcttatagct 9423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 9223834 - 9223993
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | || ||| ||||   |  ||||||||||| || |||    
T  9223834 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctaacttatagcttgttggactaacttataagcttgttttgat-aaaataagatgtgtttggtaaaaagctt 9223932  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    || |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9223933 ttctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 9223993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30899525 - 30899470
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttata 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30899525 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttata 30899470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 5698505 - 5698563
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5698505 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactaacttataagct 5698563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Original strand, 35179815 - 35179873
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35179815 taggctgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataag 35179873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39325605 - 39325463
Alignment:
Q  226 acacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || ||||| |||  |||||||||    
T  39325605 acacaaaaaagctagcttatagcttgttgaactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagcttttctcactagcttatag 39325507  T
Q  325 cgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39325506 cgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 39325463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42628321 - 42628164
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  42628321 aggctctgtttggtaatacaaaaaagctagtttatagcttgttggactagcttataagcttgctttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagctttt 42628223  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  |||||||||||       | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  42628222 ctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaaatagctttttagcttatagct 42628164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 31496606 - 31496763
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||  |  | || | |  ||||||||||| ||  ||||     
T  31496606 aggctgtgtttggtaacacagataagctagcttatagcttcttggactagcttataaacttgttttaatagaatgagatgtgtttggtaaaaagtttttc 31496705  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||| |||||||| ||       |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31496706 tcattagcttatatcgttttttgaaaagctaattcaagtagcttttgagcttatagct 31496763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4640192 - 4640137
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4640192 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 4640137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 31656369 - 31656424
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31656369 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagcttgttggactagcttacaagct 31656424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 270
Target Start/End: Original strand, 44502554 - 44502616
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  44502554 cttaggttgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttattggattgacttataagct 44502616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11756972 - 11756912
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgtt 274  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11756972 ctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatgacttgttggactagcttataagctcgtt 11756912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 34086196 - 34086252
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34086196 ggctttgtttggtaacacaaaaaacctagcttatagtttgtcggattagcttataag 34086252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Original strand, 42330194 - 42330250
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42330194 ctgtgtttgctaacacaaaaaaactaacttatagtttgttggattagcttataagct 42330250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4361157 - 4361009
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  |  | || | |  ||||||||||| |||||||| | || |    
T  4361157 tgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagtttattggactagcttataagcttgttttaatagaatgagatgtgtttggtaaaaaacttttcttatta 4361058  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    |||||||||        | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4361057 gcttatagcattttttaagaagctaattcaaatagctttttagcttata 4361009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 368
Target Start/End: Original strand, 27667673 - 27667828
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| | | || ||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||    
T  27667673 gctgtgtttggtaacacaaaatagttagtttatagcttattgaactagcttataagtttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaaactttttt 27667771  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||  ||||| |||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27667772 cactagcttttagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 27667828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44110031 - 44109976
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44110031 tgtgttagataacacaaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 44109976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44300039 - 44299988
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44300039 tttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 44299988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43847531 - 43847473
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  43847531 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagtttgtcggactagcttataagct 43847473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Original strand, 23259085 - 23259138
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23259085 tgtgtttggtaacacgaataagttagcttatagcttgttggactagcttataag 23259138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 264
Target Start/End: Original strand, 42159612 - 42159661
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagctta 264  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42159612 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggaatagctta 42159661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31656362 - 31656328
Alignment:
Q  339 ctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31656362 ctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 31656328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Original strand, 29092678 - 29092760
Alignment:
Q  291 tgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29092678 tgtttgataaaaaacttttctcattagtttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcattttagcttatagccgatag 29092760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Original strand, 29092602 - 29092643
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgga 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  29092602 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagctcatagctttttgga 29092643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30899400 - 30899363
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30899400 aagctaattcaagtagctttttagcttatagcttatag 30899363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 372
Target Start/End: Original strand, 4638513 - 4638549
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4638513 aagctatttcaactagcttttgagcttatagctgata 4638549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 210 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19801967 - 19801808
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19801967 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttt 19801868  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19801867 ttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 19801808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 33984084 - 33984242
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33984084 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgaattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 33984183  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33984184 tcatgagcttatagtgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 33984242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 6238185 - 6238342
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6238185 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 6238284  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6238285 catgagcttataacattttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 6238342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37114532 - 37114379
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37114532 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttatatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagtttttttcatg 37114433  T
Q  316 agcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114432 agcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 37114379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 53284004 - 53284161
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  53284004 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 53284103  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53284104 catgagcttgtagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 53284161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 44448443 - 44448601
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44448443 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctaacttatagcttgttggattaacttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttt 44448542  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||| ||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44448543 tcatgagcttataacgttttttgaaaagttatttcaagtagctttttagcttatagctg 44448601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Original strand, 43374594 - 43374747
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43374594 ctgtgtttggtaacacaaaaatgctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttca 43374693  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagc 367  Q
    |||| ||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43374694 tgagtttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagttttttagcttatagc 43374747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49335293 - 49335136
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  49335293 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagttcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaataagctttttt 49335194  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49335193 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 49335136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 55001846 - 55001685
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  55001846 ggctgtgtttggtaacacaaaaaaactagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggtgtgtttggtaacaggctttttt 55001747  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  55001746 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaaatagctttttaacttatagctgatag 55001685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Original strand, 19800925 - 19801075
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaa-gctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19800925 tgtgtttggtaacacaaaaaaagttagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttacatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttca 19801024  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttat 364  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19801025 tgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttat 19801075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39840300 - 39840155
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39840300 ttaggttgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttt 39840201  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctt 354  Q
    |||||||| |||||||||       ||||||||||| |||||||||    
T  39840200 tttcatgaacttatagcgttttttgaaaagctatttaaagtagctt 39840155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45561420 - 45561261
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  45561420 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaa-gctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttaataacaagcttt 45561322  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45561321 tttcatgagcttatagcgttttttgaaaaattatttcaagtaactttttagcttatagctg 45561261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 212 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36181472 - 36181310
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  36181472 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctaacttatagtttgttaaattagcttataaactcgttagatgaaaacgtgtcgtgtttggtaataagctttttt 36181373  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36181372 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagttgatagt 36181310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 207 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2943758 - 2943597
Alignment:
Q  207 gcttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaact 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2943758 gcttaggttgtgtttggtaacacaaaaaa-ctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagct 2943660  T
Q  307 tttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2943659 tttttcatgagcttatagcattttttgaaaagctattttaaatagttttttagcttatagctg 2943597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47633930 - 47633789
Alignment:
Q  228 acaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgn 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||     
T  47633930 acaaaaaagttagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcatgagtttataacgt 47633831  T
Q  328 nnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47633830 tttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 47633789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 368
Target Start/End: Original strand, 54683595 - 54683750
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  54683595 gctgtgtttggtaacataaataagctagcttataacttgttagattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttctc 54683694  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||||||||||| ||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54683695 atgagcttataacgttttttgaaaagctaattcaagtagctttttagcttatagct 54683750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Original strand, 25686979 - 25687144
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  25686979 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctaatttatagttttttggattagcttataagcttgttgtatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagctt 25687078  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    || ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25687079 ttctcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttgaacttatagctgatag 25687144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 369
Target Start/End: Original strand, 6287835 - 6287991
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6287835 gctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttcttagattagcttataagtttattggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaaacttttttc 6287934  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6287935 atgagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctg 6287991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20356801 - 20356650
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaag-ctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  20356801 tgtgtttggtaacacaaaaaaaactagcttataacttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggcaacaagtttttttca 20356702  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    |||||||||||||       ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20356701 tgagcttatagcgttttttgaaaagttatttcaagtagttttttagcttata 20356650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 365
Target Start/End: Original strand, 37498202 - 37498353
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  37498202 ctgtgtttggtaacacaaaaaggctaacttatagtttgttggattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaaacttttctca 37498301  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    |||||||||| ||       | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37498302 tgagcttataccgttttttgagaagctatttgaagtagcttttgagcttata 37498353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Original strand, 24152670 - 24152834
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||    
T  24152670 ttaggttgtgtttggtaacacaaataagctagcttatagcttgttggactagtttataagctagttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaataagtttt 24152769  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    | |||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24152770 tctcataagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagcttttttgcttatagctgatag 24152834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Original strand, 53431624 - 53431788
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  53431624 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaatgtagcttatagcttgttggactagcttataagtttgttggatgaaaacatgatgtgtttggtaacaaacttt 53431723  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    | ||| |||||||||||        | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53431724 tctcacgagcttatagcttttcttgagaagctaattcaagtagctttttagcttatagctgatag 53431788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 374
Target Start/End: Original strand, 28778552 - 28778715
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  28778552 aggctgtgtttggtaacataaataagctagtttatagcttgttagattaacttataagttcattggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttc 28778651  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||| |||| |||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28778652 tcacgagcatatagcgttttttgaaaagctaattcaagtagctttttagcttataactgatagt 28778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 238 - 365
Target Start/End: Original strand, 32012570 - 32012697
Alignment:
Q  238 tagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaa 337  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||       ||||    
T  32012570 tagcttatagcttgttagattagcttataagtttgttagatgaaaatgtggcgtgtttcgtaacaagcttttttcatgagctcatagcgttttttgaaaa 32012669  T
Q  338 gctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32012670 gctatttcaagtagctttttagcttata 32012697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30653396 - 30653237
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  30653396 ttaggttgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatggcttgttggactagcttataagcttgttggatgaaaacatgatgtgtttggtaacaagcttt 30653297  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||||| ||||||||| |        | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30653296 tttcacgagcttataacttttcttgagaagctatttcaagtaactttttagcttgtagct 30653237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44526042 - 44525944
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  44526042 taggctgtgtttggtaacttaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagttcgttaaatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttt 44525944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 202286 - 202443
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||   | |||||||||||| || |||||    
T  202286 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagcttgctttgat-aaaataagacgtgtttggtaaaaagctttt 202384  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  202385 ctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 202443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 40674747 - 40674901
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttata-gcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  40674747 tgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttataagcttgttggactagcttataagcttattggatgaaaacatgatgtgtttggtaataagcttttttca 40674846  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     || |||||| |        | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40674847 cgatcttataacttttcttgagaagctatttcaagtagctttttagcttgtagct 40674901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 19912667 - 19912826
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| ||  ||    
T  19912667 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagttt 19912765  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    || |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19912766 ttctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 19912826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Original strand, 40685777 - 40685932
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||     || ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  40685777 ttaggctgtgtttggtaacataaataagctagcttacagcttgtt-----agtttataagttcgttggatgaaaacatgatgtgtttggtaacaaacttt 40685871  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
      ||||||||||||||||       ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40685872 gctcatgagcttatagcgtttcttgaaaagttaattcaaatagctttttaccttatagctg 40685932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30411351 - 30411198
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30411351 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctca 30411253  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
      |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30411252 ctagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 30411198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Original strand, 55610656 - 55610816
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaact 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| |||||    
T  55610656 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaaactagcttatagcttgttgtactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaaact 55610754  T
Q  307 tttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||| |||  |||||||||||       | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  55610755 tttctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaattagctttttagcttatagct 55610816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2390376 - 2390216
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||     | || | | |||||||||||| ||  ||    
T  2390376 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttcttggactaacttataagtttgttttgaaagaatgagacgtgtttggtaaaaagttt 2390277  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    || |||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2390276 ttctcattagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttaatttatagct 2390216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 368
Target Start/End: Original strand, 30653497 - 30653651
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| | | |||||||||||| || ||||| |    
T  30653497 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctag-ttatagcttgttggattagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacgtgtttggtaaaaagcttttct 30653594  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||  | |||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30653595 cactatcttatagcgttttttaataagctaatccaagtagctttttagcttatagct 30653651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 55496139 - 55496067
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaac 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  55496139 ggctgtttttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttggatgaaaac 55496067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21234648 - 21234552
Alignment:
Q  276 gatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21234648 gatgagaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttatcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaaatagctttttagcttatagctgata 21234552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 45549650 - 45549708
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45549650 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgggctagcttataagct 45549708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7141228 - 7141179
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7141228 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggat 7141179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7113615 - 7113559
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7113615 ctgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 7113559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Original strand, 48953030 - 48953189
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| | ||   |  ||||||||||| ||  ||||||||    
T  48953030 tgtgtttggtaacacggataagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-ataataagatgtgtttggtaaaaagtttttttca 48953128  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
      |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48953129 ctagcttatagcgttttttaagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctgatagt 48953189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14269925 - 14269867
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14269925 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 14269867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 43590531 - 43590587
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43590531 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataag 43590587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Original strand, 51941103 - 51941211
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||| ||||| ||   |||||||||||||  |||| ||||    
T  51941103 tgtgtttagtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactaacttataagtttgttggatcaaaacatgatatgtttggtaacaagtttttctcat 51941202  T
Q  315 gagcttata 323  Q
    |||||||||    
T  51941203 gagcttata 51941211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1771937 - 1771786
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||| |||      
T  1771937 tgtttgataacacaaaaaagatagcttatagcttgttggactagcttataagcttgctttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttttctcact 1771839  T
Q  316 agcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||||||||       | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  1771838 agcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagttttttagcttatagct 1771786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 51924026 - 51924081
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51924026 tgtgtttggtaacacaaaaaaactagtttatagcttgttggactagcttataagct 51924081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 50792518 - 50792460
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50792518 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagtttatagcttgttggactagcttataagct 50792460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 49646022 - 49646177
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||| |   |   ||||||||||| || |||||||    
T  49646022 ggctatgtttggtaacacgaataagttagcttatagcctgttggattagcttataagcttgtt--ttgatataataatgtgtttggtaaaaagctttttt 49646119  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||  |||||||||||       | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  49646120 cactagcttatagcgttttttgagaagctatttcaagtagcttttgaacttatagctg 49646177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49648916 - 49648864
Alignment:
Q  218 gtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49648916 gtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 49648864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 318493 - 318443
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  318493 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttataacttattggactagcttat 318443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10658985 - 10658927
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10658985 ggctgtgtttggtaacacgaattagctagcttatagcttattggactagcttataagct 10658927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10873130 - 10873072
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10873130 ggctgtgtttggtaacacgaattagctagcttatagcttattggactagcttataagct 10873072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 19869957 - 19870015
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  19869957 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttattgaactagcttataagct 19870015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 27531827 - 27531885
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27531827 ggctgtgtttggtaacacaaataggctaacttatagcttgttggactagtttataagct 27531885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 36824441 - 36824499
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36824441 ggctctgtctggtaacacaaaaaagctaggttatagtttgtttgattagcttataagct 36824499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 36824610 - 36824668
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36824610 ggctctgtctggtaacacaaaaaagctaggttatagtttgtttgattagcttataagct 36824668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 267
Target Start/End: Original strand, 55660548 - 55660598
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55660548 tgtttggtaacataaataagctagcttatagcttgttggactagcttataa 55660598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19871073 - 19871020
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19871073 ctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgctggactagcttataa 19871020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48369072 - 48369015
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  48369072 aggctgtgtctggtaacacaaataagctagtgtatagcttgttggactagcttataag 48369015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Original strand, 50790826 - 50790879
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50790826 tgtttggtaacacgaataagctagcttataacttgttggactagcttataagct 50790879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7113689 - 7113633
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7113689 ctgtgtttgctaacaccaatacgctagcttatagcttgttggactagcttataagct 7113633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 267
Target Start/End: Original strand, 20986270 - 20986326
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  20986270 aggctgtgtttggtaacataaataagctaacttatagcttgttggactaacttataa 20986326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Original strand, 47092907 - 47093019
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||  ||||  |||||| || ||| ||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  47092907 gctgtatttggtaacaacaaaaatctagtttatagtttgtttaattaatttataaacttgttggattaaaatttgacgtctttggtaacaaacttttttc 47093006  T
Q  313 atgagcttatagc 325  Q
     ||||||||||||    
T  47093007 gtgagcttatagc 47093019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26923638 - 26923583
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  26923638 tgtgtttggtaacataaaaaagctagcttataacttgttaaactagcttataagct 26923583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7141198 - 7141084
Alignment:
Q  258 tagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttt 357  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| |        | ||||||||||||||||||||||    
T  7141198 tagcttata-gcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttgttaacaagcttttctcgcgagcttataactttttttgagaagctatttcaagtagcttttt 7141100  T
Q  358 agcttatagctgatag 373  Q
    | ||||||||||||||    
T  7141099 aacttatagctgatag 7141084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49491605 - 49491543
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttaga 277  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  49491605 tgtgtttggtaacaacaagaagctagcttatagtttgttgaattagcttataagtttgttaga 49491543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 55495213 - 55495130
Alignment:
Q  290 gtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||         | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55495213 gtgtttggtaacgagcttttttcacgagcttatagttttttttgagaagctatttcaagtagctttttaacttatagctgatag 55495130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 28459612 - 28459667
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  28459612 tgtgtttggcaacacaaaaaagttagtttatagtttgttggactatcttataagct 28459667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 268
Target Start/End: Original strand, 38005551 - 38005598
Alignment:
Q  221 tggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  38005551 tggtaacataaaaaagttagcttatagcttgttggactagtttataag 38005598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31624376 - 31624338
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31624376 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagctggtagt 31624338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31624500 - 31624442
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  31624500 ggctatgtttggtaacacgaataagcgagcttatagtttgttagactagcttataagct 31624442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 31997829 - 31997887
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  31997829 ggctgtgtttagtaacacaaacaagttagattataatttgttggactagcttataagct 31997887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 318777 - 318740
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttata 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  318777 ttaggttgtgtttggtaacacaaataagctagcttata 318740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Original strand, 45618061 - 45618114
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  45618061 tgtgtttggtaacataaataagctagcttatggtttgttagactagcttataag 45618114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 208 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34436081 - 34435920
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  34436081 cttagggtgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctt 34435982  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34435981 ttttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 34435920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41991786 - 41991629
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41991786 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagctttttt 41991687  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41991686 catgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 41991629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2558001 - 2557842
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2558001 tgtgtttggtaacacaaaaaagctaacttatagcttgtttgattaacttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttttcat 2557902  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2557901 gagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 2557842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8321534 - 8321376
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8321534 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttt 8321435  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8321434 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatatcaaatagctttttagcttatagctg 8321376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52184930 - 52184772
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52184930 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttgttagattaacttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttttt 52184831  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52184830 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagctattttaagtagctttttagcttatagctg 52184772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 54463553 - 54463401
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54463553 tgtttggtaacacaaaaaagttaacttatagtttgttggattatcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcatga 54463454  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54463453 gcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 54463401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 209 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12055620 - 12055504
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12055620 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagctccttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaagcttt 12055521  T
Q  309 tttcatgagcttatagc 325  Q
    |||||||||||||||||    
T  12055520 tttcatgagcttatagc 12055504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Original strand, 1361666 - 1361822
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  1361666 taggctgtgtttcgtaacacaaaaaggctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagataaaaatgtggcgtgtttgataacaagctttt 1361765  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    |||||||||||||| ||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1361766 ttcatgagcttataacgtttattgaaaagctatttcaagtagttttttagcttatag 1361822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Original strand, 17666796 - 17666956
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17666796 ttaggctgtgtttggtaacccaaaaaagctagcttatagcttattggattaacttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaaacttt 17666895  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||       | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17666896 tttcatgagcttatagcgttttttgagaaactatttcaagtaacttttgagcttatagctg 17666956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 12764665 - 12764828
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  12764665 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagctttttggattagcttataagcttgctggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttt 12764764  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    | ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12764765 tctcatgagcttatagcgatttttgaaaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctgata 12764828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30318046 - 30317892
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||    
T  30318046 ggctgtgtttggtaacacaaaaatgctagcttatagtttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttgataacaagatttttt 30317947  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    |||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30317946 catgagcttatagcgttttttgaaaatctatttcaagtagctttttaacttatag 30317892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 369
Target Start/End: Original strand, 48050990 - 48051148
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  48050990 aggctgtgtttgttaacccaaaaaagctagcttatagcttgttggattaacttataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacacgtttttt 48051089  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48051090 tcatgagcttatagcgttttttaaaaagttatttcaagtaactttttagcttatagctg 48051148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 209 - 369
Target Start/End: Original strand, 19274724 - 19274884
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  19274724 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttggatgaaaatgtgacgtgtttggtaacaagcttt 19274823  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    | ||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  19274824 tctcacgaggttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtaatttttgagcttatagctg 19274884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 369
Target Start/End: Original strand, 36237834 - 36237990
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttc 312  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36237834 gctgtgtttggtaacataaaaaaactagcttatagtttgttggattaacttataagctcgttagataaaaatgtggcgtatttggtaacaagcttttttc 36237933  T
Q  313 atgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36237934 atgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagttttttagcttatagctg 36237990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 214 - 369
Target Start/End: Original strand, 51062909 - 51063064
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  51062909 ctgtgtttgttaacacaaaaaagctagcttatagcttgttgaattatcttataagttcgttagatgaaaacgtgacgtgtttgataacaagcttttttca 51063008  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51063009 tgagcttatagcgttttctgaaaagctatttcaaatagctttttagtttatagctg 51063064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 352
Target Start/End: Original strand, 8879359 - 8879501
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8879359 taggctatgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagttcgttagatgaaaacgtgacgtatttggtaacaagctttt 8879458  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagc 352  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  8879459 ttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagc 8879501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9558963 - 9558808
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  9558963 aggctgtgtttggtaacataaataagctagcttatagcttgttagattagcttataagctcgttggaagaaaacgtgacgtgtttggtaacaagcttttc 9558864  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    ||||||||||||||||       | || ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9558863 tcatgagcttatagcgttttttgataatctaattcaagtaactttttagcttatag 9558808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 358
Target Start/End: Original strand, 35405535 - 35405682
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  35405535 aggctgtatttgataacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagtttataaactcgttagatgaaaacgtgacgtatttgataacaaacttttt 35405634  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttta 358  Q
    ||||||||||||||||       ||||| |||||||||||| ||||||    
T  35405635 tcatgagcttatagcgttttttgaaaagttatttcaagtagtttttta 35405682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42528159 - 42527997
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||     
T  42528159 aggccgtgtttgataacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagtttttc 42528060  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||| ||||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42528059 tcacgagctcatagcttttattaagaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 42527997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 214 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32999757 - 32999606
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||    
T  32999757 ctgtgtttgataacacaaaaaagctagcttatagcttcttggattagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacgagcttttctca 32999658  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttata 365  Q
    |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32999657 tgagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtaacttttaagcttata 32999606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 215 - 366
Target Start/End: Original strand, 52959292 - 52959442
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  52959292 tgtgtttggtaacacaaataagctagcttatagtttgttggattaacttataagctcgttggatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaagc-tttttcat 52959390  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatag 366  Q
    ||||||||| |        |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  52959391 gagcttataactttttatgaaaaactatttcaagtagctttttaacttatag 52959442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 373
Target Start/End: Original strand, 51980728 - 51980889
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||    
T  51980728 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagtttatagcttgttggactagcttataagcttgttggatgaaaacatgatgtgtttggtaacgagcttttt 51980827  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||| |||||||||||        | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51980828 tcacgagcttatagc-ttttttcagaagctatttcaagtagctttttaacttatagctgatag 51980889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Original strand, 55226291 - 55226448
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||| |||||     
T  55226291 aggctctgtttggtaacatagataagctaacttatagctcgttagattagcttataagctcgttggatgaaaacgtgacatatttgataacaagcttttc 55226390  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55226391 ttatgagcttatagcgttttttgaaaagctaattcaagtagctttttagcttatagct 55226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12122274 - 12122115
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttca 313  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  12122274 ctgtgtttggtaacaacaagaagctagcttatagcttgttgaattagcttataagcttgttgtatcaaaatgtgacgtgtttggtaacaagcttttttcg 12122175  T
Q  314 tgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||||||        | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12122174 tgagcttatagctttttttgagaagctatttcaagtagcttttaaacttatagcttatag 12122115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30743116 - 30742970
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  30743116 ggctgtgtttgataatataaaaaagttagtttatagtttgttggattagcttataagctggttagatgaaaatgtggtgtgtttggtaacaagctttttt 30743017  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagcttttta 358  Q
    |||| |||||||| |       ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30743016 catgtgcttatagtgttttttgaaaagttatttaaagtagcttttta 30742970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12122983 - 12122822
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     | || | | |||||||||||| ||||||||||    
T  12122983 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgtttttgtagaatgagacgtgtttggtaaaaaactttttt 12122884  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||| |||||||||||       | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  12122883 cattagcttatagcgttttttgataagctaattcaagtagcttttgagcttattgcttatag 12122822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 4070813 - 4070972
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |    
T  4070813 ggctgtgtttggtaacacaaataagctagtttatagtttgttgaactagcttataagttagttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaataaacttttct 4070912  T
Q  312 catgagct--tatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    || ||| |  |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4070913 cacgagtttatatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttacagctg 4070972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 6124713 - 6124869
Alignment:
Q  217 tgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatga 316  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6124713 tgtttgataacacaaaaaagatagcttataacttgttggactatcttataagcttgtttgatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaaacttttctcacga 6124812  T
Q  317 gcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||         | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6124813 gcttatagttttttttaagaaattatttcaaatagctttttagcttatagctgatag 6124869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Original strand, 51760471 - 51760629
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||     
T  51760471 tgtgtttagtaacacaaaaaagttagcttacaatttattggattaacttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttttctcac 51760570  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    |||||||||||        ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51760571 gagcttatagctttttttgaaaagttttttcaagtagcattttagcttatagctgatag 51760629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 373
Target Start/End: Original strand, 42292971 - 42293135
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaag--ctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||| | ||||||   |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  42292971 aggctgtgtttggtaaaaaaaaaaaaaactagtttatagtttgttggactagcttataagttcgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaagcttt 42293070  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    | ||| |||||||||||        | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42293071 tctcacgagcttatagctttttttgagaagttatttcaagtaactttttaacttatagctgatag 42293135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45356523 - 45356364
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  || ||| ||||||| ||||    
T  45356523 ttaggctgtgtttggtaacatcaagaagctaacttatagcttgttgaattagcttataagcttgttggatcaaaatgtgatgtatttagtaacaagcttt 45356424  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | |  | |||||||||||       ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45356423 tcttgtaagcttatagcgttttttaaaaagctatttcaagtagcttttgagtttatagct 45356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 40374611 - 40374454
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  40374611 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctaacttatagcttgttggactagcttataagcttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagctttt 40374513  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  |||||||||||       | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40374512 ctcactagcttatagcgttttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagct 40374454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25999271 - 25999111
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |    
T  25999271 ggctatgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagcttattgaactaatttataagtttgttggatgaaaacgtgatgtgtttgg-aacaagcttttct 25999173  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    || |||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25999172 cacgagcttatagctttttttgagaagctatttcaagtacctttttaacttatagctgatag 25999111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36660239 - 36660082
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |||| | | | |||||||||| || |||||    
T  36660239 aggctatgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttggattagcttataagcttgttttgat-aaaatgagacttgtttggtaaaaagctttt 36660141  T
Q  310 ttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
     |||  |||||||||||       | ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  36660140 ctcactagcttatagcgttttttaagaagttaatccaagtagctttttagcttatagct 36660082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32111659 - 32111604
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32111659 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 32111604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Original strand, 48747401 - 48747557
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||     | || | | |||||||||||| ||||||||||    
T  48747401 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttatagtttattggactagcttataagcttgtttttgtagaatgagacgtgtttggtaaaaaactttttt 48747500  T
Q  312 catgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||| |||||||||         | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  48747501 cattagcttatagtattttttgagaagctaattcaagtagcttttaagcttatagct 48747557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Original strand, 46114989 - 46115043
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46114989 gtgtttggtaacacaaataagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 46115043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Original strand, 5505929 - 5506085
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgtta-gatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||  ||| | || | |  ||||||||||| ||||||||     
T  5505929 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttataacttgttggactagcttataagtttgttttgat-agaatgagatgtgtttggtaaaaaacttttc 5506027  T
Q  311 tcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | |  ||||| || ||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5506028 ttactagcttctaacgttttttaaaaagctaattcaagtagctttttagcttatagct 5506085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 270
Target Start/End: Original strand, 46668336 - 46668396
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  46668336 taggctgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggactaacttataagct 46668396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43968428 - 43968293
Alignment:
Q  238 tagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaa 337  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |        | ||    
T  43968428 tagcttataatttgttgaattagcttataagcttgttggatcaaaacatgacgtgtttggtaacaagtttttctcatgagcttataactttttgtgataa 43968329  T
Q  338 gctatttcaagtagctttttagcttatagctgatag 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  43968328 gctatttcaagtagcttttgagcttgtagcttatag 43968293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 17666615 - 17666768
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    ||| ||||||||||| ||||  | ||    
T  17666615 tgtgtttggtaacaacgagaagctagcttatagcttgttgaattagcttataagcttgttggatcaaaacacaacgtatttggtaacaagctttccttat 17666714  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    ||||||||||         ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17666715 gagcttatagttttttgtgaaaagatatttcaagtagcttttgagcttagagct 17666768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10809602 - 10809491
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttt 310  Q
    ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||| ||| ||  ||||     
T  10809602 aggctgtgtttggtaatgacgaaaagctagcttatagcttcttgaattagcttataagcttgttggatcaaaacatgacgtgtttgataataagtttttc 10809503  T
Q  311 tcatgagcttat 322  Q
    ||||||||||||    
T  10809502 tcatgagcttat 10809491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34785985 - 34785922
Alignment:
Q  207 gcttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34785985 gctttggctgtgtttggtaacacacataagctagcttatagcttattggactagcttataagct 34785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 39129374 - 39129429
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  39129374 tgtgtttggtaacataaaaaagctagcttatagcttgttggactatcttataagct 39129429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42167431 - 42167376
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42167431 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 42167376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 40980244 - 40980086
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcg-ttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| || | || ||| |||| | |  ||||||||||| || ||||    
T  40980244 taggttgtgtttggtaacacaaaaaaactagcttatagtttgttgaactagcttataaacttgttttgat-aaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttt 40980146  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | |||  |||||||||||       |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  40980145 tctcactagcttatagcgttttttaaaaagctaatccaagtagctttttagctcatagct 40980086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 41888806 - 41888864
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41888806 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagtttgttggactagcttataagct 41888864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 42877237 - 42877294
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagc 269  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42877237 ggctgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttcttggactagcttataagc 42877294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 45355125 - 45355182
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  45355125 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagcttcttggactaggttataa 45355182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 270
Target Start/End: Original strand, 6586261 - 6586320
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6586261 aggctgtgtttggtaacataaaaaagttagtttatagtttgttggactagcttataagct 6586320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 7041730 - 7041785
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7041730 tgtgtttggtaacaagaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 7041785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 254
Target Start/End: Original strand, 13353412 - 13353455
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13353412 aggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagtttatagcttgttg 13353455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 270
Target Start/End: Original strand, 22978083 - 22978134
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22978083 tttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 22978134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 270
Target Start/End: Original strand, 36806926 - 36806977
Alignment:
Q  219 tttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  36806926 tttggtaacacaaaaaagctagtttttagcttgttggactagcttataagct 36806977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 43860726 - 43860781
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43860726 tgtgtttggtaatacgaataagctagcttatagcttgttggactagcttataagct 43860781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 50935713 - 50935768
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50935713 tgtgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttattggactagcttataagct 50935768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32390219 - 32390158
Alignment:
Q  211 aggctgtgtttggtaacacaaaaaa--gctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32390219 aggctgtgtttggtaacataaaaaaaagttagcttatagcttgttggactagcttataagct 32390158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39535047 - 39534985
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  39535047 cttaggctgtgtttggtaacagaaataagctagcttgtagcttattggacaagcttataagct 39534985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 50938337 - 50938284
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50938337 ctgtgtttggtaacacgaataagttagcttatagcttgttggactagcttataa 50938284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Original strand, 54598192 - 54598245
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataag 268  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54598192 tgtgttttgtaacataaataaggtagcttatagcttgttggattagcttataag 54598245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41889520 - 41889465
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41889520 tgtgtttggtaacacgaataaactagcttatagcttgttggactagtttataagct 41889465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 48071976 - 48072031
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48071976 tgtgtttgttaacacgaataaactagcttatagcttgttggactagcttataagct 48072031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 246
Target Start/End: Original strand, 49918248 - 49918286
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttata 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49918248 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagttagcttata 49918286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50938213 - 50938175
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50938213 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagctgatagt 50938175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50198104 - 50197995
Alignment:
Q  216 gtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatg 315  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||  ||||||  | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||  |||| |||||    
T  50198104 gtgtttgataatacaaataagctagtttatagttaattggattaatttataaatttgttggatgaaaacgtgatgtgtttagtaacaagtttttctcatg 50198005  T
Q  316 agcttatagc 325  Q
    ||||||||||    
T  50198004 agcttatagc 50197995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 372
Target Start/End: Original strand, 22978199 - 22978235
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgata 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22978199 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagctgata 22978235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Original strand, 39129299 - 39129355
Alignment:
Q  214 ctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagct 270  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39129299 ctgtgtgtggtaacacgaataagctagtctatagcttgttggactagcttataagct 39129355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2229147 - 2229109
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2229147 aagctatttcaagtagcttttgaacttatagctgatagt 2229109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10802767 - 10802677
Alignment:
Q  232 aaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttat 322  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||  || |||||||  ||||||  |||| ||||||||||||    
T  10802767 aaaagttagcttatagcttcttgaattagcttataagtttgtttgatcaaaatatgacgtgtttaataacaagtttttctcatgagcttat 10802677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Original strand, 41888929 - 41888967
Alignment:
Q  336 aagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41888929 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagctggtagt 41888967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Original strand, 36544470 - 36544578
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||    | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||  || ||||| || ||||||||  ||| || ||    
T  36544470 cttaggctgtgtttggtaacgatgagaagttagcttatagcttattgaattaacttataagcttgttgaatcaaaacatgacgtgtttgagaac-aagtt 36544568  T
Q  308 ttttcatgag 317  Q
    ||||||||||    
T  36544569 ttttcatgag 36544578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36563854 - 36563746
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||    | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||  || ||||| || ||||||||  ||| || ||    
T  36563854 cttaggctgtgtttggtaacgatgagaagttagcttatagcttattgaattaacttataagcttgttgaatcaaaacatgacgtgtttgagaac-aagtt 36563756  T
Q  308 ttttcatgag 317  Q
    ||||||||||    
T  36563755 ttttcatgag 36563746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 369
Target Start/End: Original strand, 45355198 - 45355227
Alignment:
Q  340 tatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45355198 tatttcaagtagctttttagcttatagctg 45355227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10809471 - 10809443
Alignment:
Q  340 tatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10809471 tatttcaagtagctttttagcttatagct 10809443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7144
Alignment:
Q  208 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6984 cttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttgttgaattagcttataaattcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactt 7083  T
Q  308 ttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7084 ttttcatgagcttatagcgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 7144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 57951 - 57837
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  57951 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagacgaaaatgtggcgtgtttggtaacaagctttttt 57852  T
Q  312 catgagcttatagcg 326  Q
    |||||||||||||||    
T  57851 catgagcttatagcg 57837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14295 - 14182
Alignment:
Q  210 taggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaactttt 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14295 taggttgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagtttattggattagattataagctcgttagatgaaaacgtgacgtgtttggtaacaaactttt 14196  T
Q  310 ttcatgagcttata 323  Q
    ||||||||||||||    
T  14195 ttcatgagcttata 14182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1391 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1391
Description:

Target: scaffold1391; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1600 - 1436
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1600 ttaggctctgtttggtaacataaataagctatcttatagtttgttgaactagcttataagcttgttggatgaaaacgtgatgtgtttggtaacaaacttt 1501  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    | ||||||||||||| |        | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1500 tctcatgagcttataac-ttttttgagaagctatttcaagtagctttttatcttatagctgatagt 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 157714 - 157555
Alignment:
Q  215 tgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcat 314  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  157714 tgtgtttggtaacataaataagctagcttatagtttgttagattagcttataagctcgttggatgaaaatgtgacgtgtttggtaaaaagcttttctcat 157615  T
Q  315 gagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagt 374  Q
    ||| ||||| ||       | |||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  157614 gagtttataacgttttttgagaagctaattcaactaactttttagcttatagctggtagt 157555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 4143 - 4302
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| || ||||    
T  4143 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttaataaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttt 4242  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | |||  |||||||| ||       | ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  4243 tctcactagcttataacgttttttaagaagttaatccaagtagctttttagcttatagct 4302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Original strand, 11883 - 12042
Alignment:
Q  209 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataagctcgttagatgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |  |||| | |  ||||||||||| || ||||    
T  11883 ttaggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggactagcttataagcttgttttaataaaatgagatgtgtttggtaaaaagcttt 11982  T
Q  309 tttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagct 368  Q
    | |||  |||||||| ||       | ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  11983 tctcactagcttataacgttttttaagaagttaatccaagtagctttttagcttatagct 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 369
Target Start/End: Original strand, 18439 - 18530
Alignment:
Q  278 tgaaaacgtggcgtgtttggtaacaaacttttttcatgagcttatagcgnnnnnnnaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 369  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18439 tgaaaatgtgacatgtttgataacaaacttttttcatgagcttataacgttttttgaaaagctatttcaagtagctttttagcttatagctg 18530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 267
Target Start/End: Original strand, 76242 - 76296
Alignment:
Q  213 gctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  76242 gctgtgtttggtaacataaaaaaggtagcttatagtttgttggactagcttataa 76296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 94506 - 94451
Alignment:
Q  212 ggctgtgtttggtaacacaaaaaagctagcttatagcttgttggattagcttataa 267  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  94506 ggctatgtttggtaacacgaataagctagcttatagcttgttgaactagcttataa 94451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University