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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5037-Insertion-4 (Length: 718)

Name: NF5037-Insertion-4
Description: NF5037
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5037-Insertion-4
NF5037-Insertion-4
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (10-718)||(54013685-54014388)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 669; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 669; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 54014388 - 54013685
Alignment:
Q  10 aggaagaccagttgcatatttattccggttcatgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacat 109  Q
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T  54014388 aggaagaccagttacatatttattccggttcatgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacat 54014289  T
Q  110 ttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgtacataaatatctatctgattatatggttagatg 209  Q
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T  54014288 ttttacacacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgttcataaatatctatatgattatatggttagatg 54014189  T
Q  210 tgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggacctatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaat 309  Q
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T  54014188 tgattgaatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggaccgatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaat 54014089  T
Q  310 attgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctt 409  Q
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T  54014088 attgtattggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctt 54013989  T
Q  410 tggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaata 509  Q
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T  54013988 tggggcttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaata 54013889  T
Q  510 atcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatatacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaattt 609  Q
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T  54013888 atcccacacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatacacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaattt 54013789  T
Q  610 agattacagttaatgcacccttgaggttgagtaacaaaacaaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaata 709  Q
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T  54013788 agattacagttaatgcacccttgaggttgagtaa-----caaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaata 54013694  T
Q  710 gccccctca 718  Q
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T  54013693 gccccctca 54013685  T

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