View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5039-Insertion-11 (Length: 437)

Name: NF5039-Insertion-11
Description: NF5039
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5039-Insertion-11
NF5039-Insertion-11
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (8-437)||(4574560-4574989)
chr6 (8-437)||(4560758-4561185)
chr6 (9-437)||(4266618-4267046)
chr6 (8-437)||(4489806-4490235)
chr6 (9-437)||(4480945-4481373)
chr6 (8-437)||(4503848-4504277)
chr6 (8-437)||(3171993-3172422)
chr6 (9-425)||(4457858-4458275)
chr6 (9-435)||(4514573-4514999)
chr6 (9-437)||(4461375-4461803)
chr6 (9-437)||(4470055-4470483)
chr6 (9-436)||(4506110-4506537)
chr6 (75-437)||(4563963-4564325)
chr6 (9-433)||(4598427-4598851)
chr6 (9-437)||(4613170-4613598)
chr6 (33-436)||(4516574-4516977)
chr6 (31-437)||(4585888-4586294)
chr6 (9-437)||(4579684-4580112)
chr6 (78-436)||(4602042-4602400)
chr6 (33-437)||(4626203-4626607)
chr6 (60-437)||(4617274-4617651)
chr6 (78-437)||(4592483-4592842)
chr6 (31-437)||(4259628-4260034)
chr6 (31-437)||(4622394-4622798)
chr6 (72-437)||(4557377-4557742)
chr6 (31-409)||(4299295-4299673)
chr6 (72-437)||(4571224-4571589)
chr6 (31-437)||(4256098-4256491)
chr6 (184-436)||(4568309-4568561)
chr6 (298-436)||(4493208-4493346)
chr6 (315-426)||(4391885-4391996)
chr6 (73-113)||(4835531-4835571)
chr6 (33-105)||(4568628-4568700)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (9-437)||(24103251-24103679)
chr5 (211-434)||(27999753-27999976)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (23-437)||(20863309-20863723)
chr8 (75-437)||(1674478-1674840)
chr8 (72-437)||(16685782-16686147)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (60-437)||(1281366-1281743)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (9-437)||(3086672-3087100)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (72-437)||(3234-3599)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (59-437)||(4188-4566)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (315-425)||(3443-3552)
scaffold0475 (210-256)||(3162-3208)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (75-148)||(4-77)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (299-340)||(1351057-1351098)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4574989 - 4574560
Alignment:
Q  8 aattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574989 aattggtccattagcttcttttgtaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 4574890  T
Q  108 cttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggcca 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574889 attgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggcca 4574790  T
Q  208 acagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574789 acagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 4574690  T
Q  308 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574689 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 4574590  T
Q  408 tgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574589 tgtgctggagttccaatgttatgttggcca 4574560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4561185 - 4560758
Alignment:
Q  8 aattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561185 aattggtccattagcttcttttgtaaatcaaagtccacaaaatcacttgacatctttagactgtaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 4561086  T
Q  108 cttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggcca 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4561085 cttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttaagtctcaagagaagc-cttagagtttgcttggggtttggcca 4560987  T
Q  208 acagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 307  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4560986 acagcaagaaaccatttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctga-tttttgaaagaaatttcagatagagg 4560888  T
Q  308 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560887 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacccatcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 4560788  T
Q  408 tgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4560787 tgtgctggagttccaatgttgtgttggcca 4560758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Original strand, 4266618 - 4267046
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4266618 attggcccatttgcttcttttttaaatcaaagtccacaaaatcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggc 4266717  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4266718 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggtagcatcacagttatgtcacgagagaagctcttagagtttgcttggggtttggccaa 4266817  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4266818 cagcaagaacccttttttgtggataattaggcctgatcttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaaatttcagatagagga 4266917  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4266918 ctaatagcaagttggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagcatat 4267017  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4267018 gtgctggagtgccaatgttgtgttggcca 4267046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 437
Target Start/End: Original strand, 4489806 - 4490235
Alignment:
Q  8 aattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 107  Q
    |||||| |||||  |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4489806 aattggcccattttcttcttttttagatcaaattccagaaaatcacttgaaatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 4489905  T
Q  108 cttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggcca 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  4489906 cttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctattagagtttgcatggggtttggcca 4490005  T
Q  208 acagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4490006 acagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgttattggtggctcacaggtgttgtcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 4490105  T
Q  308 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || || |||    
T  4490106 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaggtattgaatcacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaatcatggagagtata 4490205  T
Q  408 tgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4490206 tgtgctggagtgccaatgttgtgttggcca 4490235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4481373 - 4480945
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4481373 attggtccattggcttcttttttaaatcaaagtccacaatatcacttggaaacattagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 4481274  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4481273 ttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcacaattatgtctcaagagaaactcttagagtttgcttggggttttgccaa 4481174  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     |||||||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||||||     
T  4481173 tagcaaaaaaaactttttgtggattattaggtctaatcttgtcattggtggctcagtggtgttgtcatctgagtatttgaaagaaatttcaaatagaggc 4481074  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4481073 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaatcggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagtgtat 4480974  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4480973 gtgctggagtgccaatgttgtgttggcca 4480945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 437
Target Start/End: Original strand, 4503848 - 4504277
Alignment:
Q  8 aattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4503848 aattggtccattagcttcttttgtaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgattgg 4503947  T
Q  108 cttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggcca 207  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  4503948 cttgaattaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcattacagttatgtcttaagataaattgttagagtttgcttggggtttggcca 4504047  T
Q  208 acagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 307  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| |||| |||  |||||||    
T  4504048 atagcaagaaaccttttttgtggattattaggcctgatcttgttattggtggctcagaggtgttgtcatctgattttgtgaatgaaacttctaatagagg 4504147  T
Q  308 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 407  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |     
T  4504148 acttgtagcaagttggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagtgtt 4504247  T
Q  408 tgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4504248 tgtgctggagtgccaatgttgtgttggcca 4504277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3172422 - 3171993
Alignment:
Q  8 aattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 107  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172422 aattggtccgttcgcttcgtttttaagtcaaagtccgcaaaatcacttggcatctttagattctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatgg 3172323  T
Q  108 cttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggcca 207  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  3172322 cttgaaacaaaagaatcaaaatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcatagttatgtctcaagagaaattattagagtttgcttggggtttagcca 3172223  T
Q  208 acagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  3172222 acagcaagaaaccctttttgtggattattaggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagagg 3172123  T
Q  308 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 407  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  3172122 cctaatagcaagttggtgtccgcaagagaaagtgttgaaccatccttcaattggcggattcttgactcactgcggatggaactcaaccacggaaagtgta 3172023  T
Q  408 tgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  3172022 tgtgctggaatgccaatgttgtgtaggcca 3171993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4458275 - 4457858
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4458275 attggcccatttgcttcttttataaatcaaagtccacaaaatcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaatatactaaatgtcttgagtggc 4458176  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  4458175 ttgaatcaaaagaaccaaagtctgttatttatgtaaattttggaagcatcacagttatgtctcaagagaagctcttagaatttgcttgggttttggccaa 4458076  T
Q  209 cagcaa-aaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagg 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  4458075 cagcaagaaaaccttttttgtggataactaggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggattttgtgaatgaaacttctgatagagg 4457976  T
Q  308 actaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcata 407  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4457975 cttaatagcaagttggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgtggatgaaactcaaccactgaaagcata 4457876  T
Q  408 tgtgctggagttccaatg 425  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4457875 tgcgctggagtgccaatg 4457858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 4514573 - 4514999
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4514573 attggcccatttgcttcgtttttgaatcaaagtccacaaaatcacttggaatctttaggttccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 4514672  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  |||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  4514673 ttgaatcaaaagaatcaggatctgttgtttatgttaattttggtagcatcacgattatgtctccggagaaattgttagagtttgcttggggtttggccaa 4514772  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||     
T  4514773 tagcaagaaaacctttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcgtctgagtttgtgaatgaaattgcagatagaggc 4514872  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4514873 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgagagcatat 4514972  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggc 435  Q
    | |||||||| |||||| | |||||||    
T  4514973 gcgctggagtgccaatgctttgttggc 4514999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4461803 - 4461375
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4461803 attggtccactttcttcttttataaatcaaagtccacaaaatcacctggcatctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 4461704  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||  | ||  ||||||||||||||||||||||  |    
T  4461703 ttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtctatgtaaattttggcagcatcacagttatgactcctgatcaactgttagagtttgcttggggtttggctga 4461604  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||     
T  4461603 tagcaagaaaccctttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgtgaatgaaatttcagatagaggc 4461504  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4461503 ctaatagcaagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccactgaaagcatat 4461404  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  4461403 gtgctggagtgccgatgttgtgttggcca 4461375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4470483 - 4470055
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4470483 attggtccactttcttcttttttaaatcaaagtccacaaaatcatctagcatctttaaatttcaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggc 4470384  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  4470383 ttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtctatgtaaatttcggcagcgtcacagttatgtctccagagaaactgttagagtttgcttggggtttggcaaa 4470284  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  || | || | |||||||||||||||     
T  4470283 tagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggcggctcggtagttttctcatcagagattgtaaatggaatttcagatagaggc 4470184  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    ||||| |  |  |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4470183 ctaatcgtgaactggtgtcctcaagagcaagtactgaaccacccttcaatcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 4470084  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  4470083 gcgctggagtgccaatgttgtgttggcca 4470055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4506537 - 4506110
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||  || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4506537 attggccctttaacttcatttgtaaatcaaagtccacaaaatcagtttgcaactttagattcaaatctttggaaagaggatactaaatgtctcgaatggc 4506438  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    | ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  |||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  4506437 tggaatcaaaagaaccggcttctgttgtttatgtgaattttggaagcatcacaattatgtctccggagaaatttttagagtttgcttggggtttggccaa 4506338  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||   || ||||||||||||||| |     
T  4506337 tagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtaattggtggctcagtggttttgtcttcagagtttgcaaatgaaatttcagatagaagc 4506238  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4506237 cttatagcaagctggtgttcacaagagaaagtgttaaatcacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 4506138  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcc 436  Q
    | |||||||| |||||| | ||||||||    
T  4506137 gcgctggagtgccaatgctgtgttggcc 4506110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 75 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4564325 - 4563963
Alignment:
Q  75 ctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgag 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | | |     
T  4564325 ctttggaaagaagatactaagtgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatccgttgtttatgtgaattttggaagcattacagttatgacaccaa 4564226  T
Q  175 agaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctc 274  Q
    |  | ||  | || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  4564225 aacaactgttggaatttgcttgggggttggccaattgcaataaaccctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggtggctcagtcgttttgtc 4564126  T
Q  275 atctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgact 374  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  4564125 atctgagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcttaattgcaagttggtgtccacaggagaaagtattgaaccacccttcaattggcggattcttgact 4564026  T
Q  375 cattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4564025 cattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttgtgttggcca 4563963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4598851 - 4598427
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| || ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||   | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4598851 attggccctttatcttcgtttttaaatcaaagtcaacaaaagcatttggcatctttaggtaccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgactggc 4598752  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| ||  ||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  4598751 ttgaatccaatgaaccaaggtctgttgtttatgtgaattttgggagcataacggtgatgactgcagaaaagttgttagactttgcttggggtttggccaa 4598652  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||     
T  4598651 tagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggc 4598552  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
     || | ||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4598551 ttagttgcaagctggtgtctgcaagagcaagtattaaaccatccttcaattggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccactgaaagtatat 4598452  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttg 433  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||    
T  4598451 gtgccggagtgccaatgttgtgttg 4598427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Original strand, 4613170 - 4613598
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    |||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||    | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4613170 attggtcctttatcttcacttttaagtcaaagtccacaaaatcacttggcaagtttaagtaccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgattggc 4613269  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||| || ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||  ||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  4613270 ttgaatccaaggaaccgaagtccgttgtttatgtgaattttgggagcatgaccgttatgactgcagaaaaactattagagtttgcttggggtttggcgaa 4613369  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||     
T  4613370 tagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcagttgttttgtcatcagagtttgtgaatgaaatttcagatagaggc 4613469  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4613470 ctaatcgcgagctggtgtcctcaagagcaagtattaaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatat 4613569  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4613570 gtgctggagtgccaatgttgtgttggcca 4613598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 33 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4516977 - 4516574
Alignment:
Q  33 aatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctg 132  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||    
T  4516977 aatcaaagtccgcaaaataacttggcttctataggttctaatctttggaaagaagatatgaaatgtcttgaatggcttgaatctaaggaacaaggttctg 4516878  T
Q  133 ttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggat 232  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||| |||  | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4516877 tagtttatgtgaattttggaagcatcacggtcatgactccagatcaactgttagagttcgcttggggtttggccaacagcaagaaaccttttttgtggat 4516778  T
Q  233 cattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaa 332  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||    
T  4516777 tattaggcctgaccttgtcattggtggctcggttattttgtcatccgattttgtgaatgaaacttcggatagaggcgtaatagcaagctggtgtccgcaa 4516678  T
Q  333 gagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgtt 432  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4516677 gagaaagtgttgaaccatccttcagttggaggattcttgactcattgtggatggaactccacaatggaaagcatctgtgccggagtaccaatgttgtgtt 4516578  T
Q  433 ggcc 436  Q
    ||||    
T  4516577 ggcc 4516574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4586294 - 4585888
Alignment:
Q  31 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 130  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||    | |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  4586294 taaatcaaagtccacaaaaccacttagcatctttaagtacaaatctttggaaagaggataccaagtgtcttgattggcttgaatcaaaggaaccgaggtc 4586195  T
Q  131 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 230  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||| ||  ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||| |||    
T  4586194 cgttgtttatgtgaattttgggagcacaacagttatgactacagaaaaactattagagtttgcttggggtttggccaatagcaagcaacattttttatgg 4586095  T
Q  231 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  4586094 atcattagacctgatcttgtcattggtggttccttggttttgtcatctgagtttaagaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgggttggtgcccgc 4585995  T
Q  331 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4585994 aagagcaagtattgaaccacccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtg 4585895  T
Q  431 ttggcca 437  Q
    |||||||    
T  4585894 ttggcca 4585888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4580112 - 4579684
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||    
T  4580112 attggccctttatcttcgtttttaaatcaaagtccagaaaaccatttgacatctttaagcaccaatttttggaaagaagataccaagtgtctttattggc 4580013  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| ||  ||| || ||  |||||||||| |||||||| || ||    
T  4580012 ttgaatccaaggaacctaggtctgttgtttatgtgaattttgggagcttgacagttatgactgcagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaa 4579913  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||     
T  4579912 tagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggcggctcagctgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggc 4579813  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    |||||| | || |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4579812 ctaataacgagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaatcactgaaagcatat 4579713  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4579712 ctgctggagttccaatgttgtgttggcca 4579684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 78 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4602400 - 4602042
Alignment:
Q  78 tggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagaga 177  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |   |      
T  4602400 tggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatccgttgtttatgtgaattttggcagcattacagttatgacaccccatc 4602301  T
Q  178 agctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatc 277  Q
    |  |  |||| || |||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  4602300 aattattagaattcgcttggggtttggccaattgccataaaccatttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttgtcatc 4602201  T
Q  278 tgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcat 377  Q
    ||| |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  4602200 tgagtttacaaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtgttgaaccacccttcgatcggcggattcttgactcat 4602101  T
Q  378 tgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 436  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4602100 tgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccgatgttgtgttggcc 4602042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4626607 - 4626203
Alignment:
Q  33 aatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctg 132  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||    
T  4626607 aatcgaagtccacaaaaccagttgatatctttaggttccaatctttggaaagaagacaccaattgtcttgaatggcttgaattcaaggaaccaaagtctg 4626508  T
Q  133 ttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggat 232  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |  |||||| ||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  4626507 ttgtttatgtgaactttggcagcgttatagttatgactccacagaaactgttagagtttgcttggggtttggctgatagcaagaaaccctttttgtggat 4626408  T
Q  233 cattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaa 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||  ||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4626407 cattaggcctgatcttgtgattggtggctcatttatttcgtcatccgagtttgagaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcaagctggtgtccgcaa 4626308  T
Q  333 gagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgtt 432  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  4626307 gagaaagtactgaaccatccttcaattggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattgaaagcatatgcgctggagttccaatgctgtgtt 4626208  T
Q  433 ggcca 437  Q
    |||||    
T  4626207 ggcca 4626203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4617651 - 4617274
Alignment:
Q  60 tctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatca 159  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4617651 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagccgggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 4617552  T
Q  160 ctgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtgg 259  Q
    | |||||| | |  ||| |  |  | || ||||||||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4617551 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaatcatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 4617452  T
Q  260 ctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtc 359  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||   || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||    
T  4617451 ctcagtgattttctcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagacaaagtgttgaaccacccttcaatc 4617352  T
Q  360 ggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  4617351 ggaggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagtatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggcca 4617274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4592842 - 4592483
Alignment:
Q  78 tggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagaga 177  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||| |  | || ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||  |  |||||    
T  4592842 tggaaagaagatactgagtgtcttaaatggcttgaatcgaaggaatcgggttccgttgtttatgtgaatttcggcagccttacagttatgaatgaagaga 4592743  T
Q  178 agctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatc 277  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||    
T  4592742 aaatgttagagtttgcttggggtttggccaattgcaataaaccttttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggcacaattgttttgtcatc 4592643  T
Q  278 tgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcat 377  Q
     || ||| |||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  4592642 ggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcgtaatcgcgagctggtgtcctcaagagcaagtattaaaccacccttcaattggtggattcttgactcat 4592543  T
Q  378 tgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4592542 tgtggatggaactcaaccactgaaagtatatgtgctggaattccaatgttgtgttggcca 4592483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 437
Target Start/End: Original strand, 4259628 - 4260034
Alignment:
Q  31 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 130  Q
    ||||||||| |||||| ||| || || |||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||    ||    
T  4259628 taaatcaaactccacataatcacctggcatcgttaggttccaatctttggaaagaagataccaaatgtcttgaatggcttgaatttaaggaacctgagtc 4259727  T
Q  131 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||| |||  |  |  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4259728 tgttgtttacgtgaattttggcagcattacagttatgactccagatcaatttttagagtttgcttggggattggccaatagcaagaaaccctttttgtgg 4259827  T
Q  231 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 330  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||  |  |||| |||||||| |||  ||  |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  4259828 atcattaggcctgacctcattattggtggctcctttattttgtcatctgagtttgagagtgaaatttcggatagaggcctaatcgcgagctggtgtccgc 4259927  T
Q  331 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 430  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  4259928 aagagcaagtactgaaccactcttcagttggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatttgtgccgaagttccaatgttgtg 4260027  T
Q  431 ttggcca 437  Q
    |||||||    
T  4260028 ttggcca 4260034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4622798 - 4622394
Alignment:
Q  31 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 130  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| || |||||  || |    
T  4622798 taaatcaaactccacataatcacttggcatctctaggttccaatctttggaaagaagatatcaagtgtcttgagtggcttgaatccaaggaacct-ga-c 4622701  T
Q  131 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 230  Q
    | ||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  4622700 tcttgtttacgtgaattttggcagcattacagtgatgactcgagatcaactattagagtttgcttggggtttggctgatagcaagaaaccctttttgtgg 4622601  T
Q  231 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 330  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| |  |||| |||||||| |||  ||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  4622600 atcattaggcctgaccttgtcatgggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaggtagaggcctaatcgcaggttggtgtccac 4622501  T
Q  331 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 430  Q
    ||||| ||||| | ||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  4622500 aagaggaagtacttaaccaccctgcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccaccgaaagcatatgtgctggagtttcaatgctgtg 4622401  T
Q  431 ttggcca 437  Q
    |||||||    
T  4622400 ttggcca 4622394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4557742 - 4557377
Alignment:
Q  72 aatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctc 171  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |      
T  4557742 aatctttggaaagaagataacaagtgtcttggttggcttgaatccaaggaaccgaggtccgttgtttatgtgaattttgggagcatgacagttatgacgg 4557643  T
Q  172 gagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggtttt 271  Q
     ||| || ||  |||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4557642 cagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaatagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggtggctcagttgtttt 4557543  T
Q  272 ctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttg 371  Q
     ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||    
T  4557542 gtcatcggagtttgtcaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgggctggtgcccgcaagagcaagtattaaaccatccttcaattggtggattcttg 4557443  T
Q  372 actcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4557442 actcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatctgctggagttccaatgttgtgttggcca 4557377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 409
Target Start/End: Original strand, 4299295 - 4299673
Alignment:
Q  31 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 130  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||    
T  4299295 taaatcaaactccacataatcacttggaatctttaggttccaatctttggaaagaagataccaaatgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatc 4299394  T
Q  131 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 230  Q
     ||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||| |||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||    
T  4299395 ggttgtttatgtgaattttggcagcgttacagttatgactccagagcaactgttagagattgcttggggtttggccaattgcaggaaaccatttttgtgg 4299494  T
Q  231 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 330  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||| | |  |||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||| | ||||||||    
T  4299495 atcattaggccagaccttgtcattggcggcttgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaaatagaggcctaaccgcaagctagtgtccac 4299594  T
Q  331 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatg 409  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4299595 aagaacaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccattgaaagcatatg 4299673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4571589 - 4571224
Alignment:
Q  72 aatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctc 171  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||| ||     
T  4571589 aatctttggaaagaagataacaagtgtcttgattggcttgaatcaaaggaaccgaggtccgttgtttatgtgaattttgggagcaggacagttatgactt 4571490  T
Q  172 gagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggtttt 271  Q
     ||| || ||  |||||||||| |||||||| || || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  4571489 cagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaatagcaagcaactctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggtggctcagttgtttt 4571390  T
Q  272 ctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttg 371  Q
     ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||    
T  4571389 gtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaattgctggttggtgctcgcaagagaaagtattgaaccatccttcaattggtggtttcttg 4571290  T
Q  372 actcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    ||||| || |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||    
T  4571289 actcactgtggatggaactcaacgaccgaaagcatatctactggagttccaatgttgtgttagcca 4571224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 437
Target Start/End: Original strand, 4256098 - 4256491
Alignment:
Q  31 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 130  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    ||    
T  4256098 taaatcaaactccacatagtcacttggcatcgttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggcttgaatccaaggaacctgagtc 4256197  T
Q  131 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||| |||  | ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  4256198 tgttgtttacgtgaattttggcagcattacagttatgactccagatcaactgttagagtttgcttggggattggccaatagcaagaaaccatttttgtgt 4256297  T
Q  231 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 330  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||  |  |||| |||||||             | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  4256298 atcattaggcctgacctcgtcattggtggctcctttattttgtcatctg-------------agtttcggatagaggactaatcgagagttggtgtccgc 4256384  T
Q  331 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 430  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  4256385 aagagcaagtactgaaccactcttcagttggtggattcttgactcattgaggatggaactcaaccattgaaagcatttgtgccggagttccaatgttgtg 4256484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4568561 - 4568309
Alignment:
Q  184 tagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattt 283  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||    
T  4568561 tagagttctcttgaggttttgccaacagcaagaaaccttttttgtggatcattaggccttagcttgtcattggtggctcagttattttgtcatccgagtt 4568462  T
Q  284 tttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcgga 383  Q
    | |||| | || ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  4568461 tgtgaatggaacttcggatagaggccaaatagcaagctggtgtccgcaagagcaagtgttgaaccacccttcagttggacgattcttgactcattgtgga 4568362  T
Q  384 tggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 436  Q
    |||||||| ||    |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  4568361 tggaactccacattggaaagcatttgtgccagagtaccaatgttatgttggcc 4568309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 298 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4493346 - 4493208
Alignment:
Q  298 cagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccac 397  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4493346 cagatagaggcctaattgctagttggtgtccacaagagaaactgctgaaccaccattcgattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaactac 4493247  T
Q  398 tgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 436  Q
      ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4493246 caaaaacatatgtgccggagtgccaatgttgtgttggcc 4493208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 426
Target Start/End: Original strand, 4391885 - 4391996
Alignment:
Q  315 gcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctg 414  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || | |  |||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||     
T  4391885 gcaagatggtgtccgaaagagcaagtattgaaccacccttgaatttgtggattcttaacgcattgtggatgaaactcacccattgaaagcatttgttcta 4391984  T
Q  415 gagttccaatgt 426  Q
    ||||||||||||    
T  4391985 gagttccaatgt 4391996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Original strand, 4835531 - 4835571
Alignment:
Q  73 atctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaa 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4835531 atctttggaaggaagatacaaaatgtcttgaatggcttgaa 4835571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4568700 - 4568628
Alignment:
Q  33 aatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaat 105  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4568700 aatcaaaatccccaaaagcacttggcttctttaggttccaatctttggaaagaagatatgaaatgtcttgaat 4568628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24103679 - 24103251
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24103679 attggcccatttgcttcttttttaaatcaaagtccacaaaatcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggc 24103580  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24103579 ttgaatcaaaagaaccaagatcagttgtttatgtaaattttggtagcatcacagttatgtcacgagagaagctcttagagtttgcttggggtttggccaa 24103480  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24103479 tagcaagaacccttttttgtggataattaggcctgatcttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaagtttcagatagagga 24103380  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24103379 ctaatagcaagttggtgtccacaagataaagtgttaaaccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 24103280  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24103279 gtgctggagtgccaatgttgtgttggcca 24103251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 434
Target Start/End: Original strand, 27999753 - 27999976
Alignment:
Q  211 gcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggact 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  27999753 gcaagaaaccttttttgtggatcactaggcctaatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcatctgagtttaggaaagaaatttcagatagaggcct 27999852  T
Q  311 aatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgt 410  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27999853 aatatcaaattggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaatcagcgggttcttgactcactgcggatggaactcaaccaccgaaagcatatgc 27999952  T
Q  411 gctggagttccaatgttatgttgg 434  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  27999953 gctggagtgccaatgttgtgttgg 27999976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 437
Target Start/End: Original strand, 20863309 - 20863723
Alignment:
Q  23 ttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaa 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20863309 ttcttttttaaatcaaagtccacagaatcacttggcgtctttagattcaagtctttggaaagaagacactgaatgtcttgcatggcttgaatcgaaagaa 20863408  T
Q  123 ccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccct 222  Q
    ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||  ||| ||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20863409 ccgggatctattgtatatgtaaattttggcagtaccacagtcatgtctgtagaaaaattgttagagtttgcatggggtttggccaacagcaagaaaccct 20863508  T
Q  223 ttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20863509 ttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtgattttttcatctgcgtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgagttg 20863608  T
Q  323 gtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttcca 422  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | |||| | ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  20863609 gtgtccacaagagaaggtgttgaaccatccttcaattggtggatttctaactcattgtggatggaactcaaccattgagagcatatgtgctggagtgcca 20863708  T
Q  423 atgttatgttggcca 437  Q
    ||||| || ||||||    
T  20863709 atgttgtgctggcca 20863723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 75 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1674840 - 1674478
Alignment:
Q  75 ctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgag 174  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||| ||| ||    
T  1674840 ctttggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaacgaaccgggatcggttgtttatgtgaatttcggtagcattattgttatgactccag 1674741  T
Q  175 agaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctc 274  Q
    |  | ||  | ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1674740 atcaactattggagtttgcttggggtttggccgattgcaagaaaccttttttgtggatcactaggcctgatcttgtcattggtggctcagtggttttgtc 1674641  T
Q  275 atctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgact 374  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||     
T  1674640 atctgagtttatgaaagaaatttcagatagaggcctaatatcaaattggtgtccacaagagaaagtgttgaaccacccttcaatcggcggattcttgaca 1674541  T
Q  375 cattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  1674540 cactgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggcca 1674478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 437
Target Start/End: Original strand, 16685782 - 16686147
Alignment:
Q  72 aatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctc 171  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||     
T  16685782 aatctttggaaataagataccaagtgtcttgattggcttgaatccaaggaaccgagttccgttgtttatgtgaattttgggagcatgacagttatgactg 16685881  T
Q  172 gagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggtttt 271  Q
     ||| || ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||  |||   |||||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||||    
T  16685882 cagaaaaactattagagtttgcttggggtttgaccaatagcaagcaacattttcaatggatcattaggtctgatcttgtcatttgcggttccgtggtttt 16685981  T
Q  272 ctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttg 371  Q
     |||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||     
T  16685982 gtcatctgagtttaagaatgaaatctcagatagaagcctaatcgcgagctggtgcccgcaagagcaagtattaaaccatccttcaatcggtggattctta 16686081  T
Q  372 actcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16686082 actcattgtggatggaactcaaccactgaaagtatatatgctggagttccaatgttgtgttggcca 16686147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 60 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1281743 - 1281366
Alignment:
Q  60 tctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatca 159  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  1281743 tctttagattccaacctttggaaagaagatatcgagtgtcttcaatggcttgaatcgaaggaaccgagatctgttgtttatgtgaatttcggaagcatta 1281644  T
Q  160 ctgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtgg 259  Q
    | |||||| ||| |||| | ||    || |||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1281643 cagttatgactccagagcaacttcaggaatttgcttggggtctggctaatagcaagaaaccatttttgtggatcactaggcctgatcttgtcattggcgg 1281544  T
Q  260 ctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtc 359  Q
    ||| ||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  1281543 ctcagtgattttgtcatctgactttgcgaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtgttgaaccacccttcaatc 1281444  T
Q  360 ggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1281443 ggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggcca 1281366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3087100 - 3086672
Alignment:
Q  9 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 108  Q
    ||||| |||||| ||||  | |||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3087100 attggaccattaccttcactactaaatcaaacttcacataatcacttggcatctttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggc 3087001  T
Q  109 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 208  Q
    |||||||||| | ||     |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3087000 ttgaatcaaagggacttgagtctgttgtttatgtgagttttggcagcattacagttatgactcaagagcaactattagagtttgcttggggtttggccaa 3086901  T
Q  209 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 308  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  3086900 tagcaagaaaccatttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcctttattatgtcatctgagtttgagaaagaaatttcagatagaggt 3086801  T
Q  309 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 408  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||     
T  3086800 ctaatcgcaagctggtgtccgcaagagcaagtattgaatcacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaacggttgaaagcgtac 3086701  T
Q  409 gtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3086700 ttgctggagtgccaatgttgtgttggcca 3086672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 437
Target Start/End: Original strand, 3234 - 3599
Alignment:
Q  72 aatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctc 171  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||    
T  3234 aatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggctcgaatccaaggaacctgagtctgttgtttatgtgaatttcggcagcattacagttatgactc 3333  T
Q  172 gagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggtttt 271  Q
     | |  | ||  |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||    
T  3334 caaatcaactgttagaatttgcttggggtttggccgatagcaagaaaccgtttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcgtttatttt 3433  T
Q  272 ctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttg 371  Q
     ||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  3434 gtcatcagaatttgagaatgaaatttcagatagaggcctaatcacaagctggtgtccacaagagcaagtactgatccacccttcaattggtggattcttg 3533  T
Q  372 actcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||    
T  3534 actcattgtggatggaattcaaccactgaaagcatatgcgctggagtaccaatgctttgttggcca 3599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 59 - 437
Target Start/End: Original strand, 4188 - 4566
Alignment:
Q  59 atctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatc 158  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| || |||||    || ||||||||||| |||||||| |||||     
T  4188 atctttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgagtggcttgcatccaaggaacctgagtcggttgtttatgtgaattttggaagcatt 4287  T
Q  159 actgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtg 258  Q
    || |||||| ||| |||  | ||  ||||||||||||||| |||| ||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4288 acagttatgactccagatcaactgttagagtttgcttgggttttgaccaattgtaagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcg 4387  T
Q  259 gctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagt 358  Q
    ||||| |  |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  4388 gctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcagatagaggcctaattgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaat 4487  T
Q  359 cggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 437  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||    
T  4488 tggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgtaggagtgccaatgttgtgttggcca 4566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 425
Target Start/End: Original strand, 3443 - 3552
Alignment:
Q  315 gcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctg 414  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  3443 gcaagatggtgtccgtaagagcaagtgttgaaccaccctt-agttggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattgaaagcatttgttctg 3541  T
Q  415 gagttccaatg 425  Q
    |||||||||||    
T  3542 gagttccaatg 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 256
Target Start/End: Original strand, 3162 - 3208
Alignment:
Q  210 agcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattgg 256  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3162 agcaagaaaccctttgtgtggatcattaggtctgaccttgtcattgg 3208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 77 - 4
Alignment:
Q  75 ctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattt 148  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  77 ctttggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaacgaaccgggatcggttgtttatgtgaattt 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 340
Target Start/End: Original strand, 1351057 - 1351098
Alignment:
Q  299 agatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagt 340  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  1351057 agatagaggactaatggtaggttggtgtccacaagagaaagt 1351098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University