View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5039_1D_low_41 (Length: 232)

Name: NF5039_1D_low_41
Description: NF5039_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5039_1D_low_41
NF5039_1D_low_41
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (28-230)||(27126206-27126408)
chr6 (28-223)||(15891432-15891627)
chr6 (28-190)||(31733869-31734031)
chr6 (28-190)||(17318851-17319014)
chr6 (84-230)||(7825767-7825913)
chr6 (29-108)||(18708743-18708821)
chr6 (28-108)||(23150995-23151075)
chr6 (28-159)||(24441112-24441243)
chr6 (29-191)||(31735657-31735821)
chr6 (28-89)||(7827234-7827295)
chr6 (53-108)||(27322172-27322227)
chr6 (29-159)||(13751088-13751219)
chr6 (29-104)||(18658448-18658524)
chr6 (121-167)||(16245370-16245416)
chr6 (29-191)||(22212242-22212407)
chr6 (29-159)||(610927-611058)
chr6 (29-159)||(29848239-29848370)
chr6 (29-104)||(19444016-19444092)
chr6 (65-159)||(5110534-5110628)
chr6 (29-104)||(16133406-16133482)
chr6 (177-230)||(25920781-25920834)
chr6 (65-159)||(5289893-5289987)
chr6 (45-104)||(13764592-13764652)
chr6 (196-230)||(30674292-30674326)
chr6 (36-104)||(19829695-19829764)
chr6 (29-159)||(24266952-24267083)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (28-230)||(20585477-20585679)
chr7 (28-224)||(46386816-46387012)
chr7 (28-230)||(44374067-44374269)
chr7 (28-230)||(44382932-44383134)
chr7 (28-230)||(12465989-12466191)
chr7 (28-230)||(19282213-19282415)
chr7 (28-191)||(37785094-37785257)
chr7 (28-173)||(18875654-18875799)
chr7 (28-173)||(43277554-43277699)
chr7 (28-173)||(3287100-3287239)
chr7 (28-108)||(11066711-11066791)
chr7 (28-108)||(12127893-12127973)
chr7 (28-108)||(13148201-13148281)
chr7 (28-108)||(12371521-12371601)
chr7 (28-101)||(32434319-32434392)
chr7 (29-191)||(11053785-11053948)
chr7 (29-159)||(8757130-8757261)
chr7 (29-159)||(40555477-40555608)
chr7 (29-104)||(15281505-15281579)
chr7 (29-159)||(3289556-3289687)
chr7 (36-131)||(33001177-33001271)
chr7 (30-125)||(21735237-21735331)
chr7 (29-92)||(4325310-4325374)
chr7 (29-104)||(13408014-13408090)
chr7 (29-104)||(13865120-13865196)
chr7 (29-155)||(832757-832884)
chr7 (29-155)||(1197937-1198064)
chr7 (48-115)||(14161683-14161749)
chr7 (31-92)||(12755442-12755504)
chr7 (196-230)||(43747595-43747629)
chr7 (36-104)||(17071030-17071099)
chr7 (45-92)||(11309537-11309585)
chr7 (45-92)||(14191839-14191887)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (28-230)||(37018719-37018921)
chr4 (28-226)||(42874924-42875122)
chr4 (28-229)||(16997649-16997850)
chr4 (28-230)||(11425075-11425278)
chr4 (28-230)||(25090774-25090976)
chr4 (30-204)||(14548773-14548947)
chr4 (28-191)||(19435506-19435669)
chr4 (36-190)||(10357173-10357328)
chr4 (39-173)||(33243995-33244129)
chr4 (42-173)||(3485091-3485221)
chr4 (28-108)||(19609567-19609647)
chr4 (56-173)||(19734471-19734589)
chr4 (29-191)||(21061680-21061844)
chr4 (29-159)||(2584945-2585076)
chr4 (29-131)||(4615800-4615901)
chr4 (29-159)||(27027922-27028053)
chr4 (29-158)||(6511762-6511892)
chr4 (29-104)||(14933175-14933251)
chr4 (29-159)||(13446642-13446770)
chr4 (29-159)||(14942381-14942512)
chr4 (29-159)||(15448145-15448276)
chr4 (30-104)||(18229899-18229974)
chr4 (133-190)||(50160165-50160222)
chr4 (36-104)||(9638247-9638316)
chr4 (29-159)||(20899494-20899625)
chr4 (65-159)||(49547996-49548090)
chr4 (196-230)||(25512660-25512694)
chr4 (196-230)||(26922555-26922589)
chr4 (36-131)||(51992738-51992832)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (28-230)||(28653231-28653433)
chr2 (28-230)||(36839295-36839497)
chr2 (28-229)||(24515308-24515509)
chr2 (28-230)||(17306608-17306810)
chr2 (28-230)||(23969352-23969554)
chr2 (30-190)||(9975089-9975249)
chr2 (28-173)||(19358110-19358254)
chr2 (28-187)||(27485199-27485359)
chr2 (29-178)||(14693380-14693528)
chr2 (28-108)||(24781569-24781649)
chr2 (28-173)||(10897520-10897666)
chr2 (28-91)||(5031859-5031922)
chr2 (36-191)||(5985236-5985396)
chr2 (29-92)||(31520371-31520435)
chr2 (29-161)||(27860469-27860601)
chr2 (29-161)||(44071676-44071808)
chr2 (29-104)||(6478034-6478110)
chr2 (29-88)||(18391064-18391124)
chr2 (29-88)||(27851836-27851895)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (28-230)||(19675872-19676074)
chr1 (28-230)||(42912171-42912373)
chr1 (30-230)||(21046780-21046980)
chr1 (28-230)||(4596574-4596776)
chr1 (28-230)||(16059043-16059245)
chr1 (28-171)||(20634364-20634507)
chr1 (28-190)||(20587838-20588001)
chr1 (28-190)||(20592376-20592539)
chr1 (42-173)||(7052797-7052927)
chr1 (42-173)||(14238354-14238484)
chr1 (42-173)||(38887869-38887999)
chr1 (29-108)||(41227434-41227513)
chr1 (36-131)||(42696937-42697031)
chr1 (29-104)||(18275157-18275233)
chr1 (29-159)||(52983332-52983463)
chr1 (36-131)||(1642657-1642750)
chr1 (29-191)||(51476131-51476294)
chr1 (29-104)||(7792586-7792662)
chr1 (29-104)||(13528528-13528604)
chr1 (29-92)||(44822855-44822919)
chr1 (43-104)||(21181073-21181135)
chr1 (29-89)||(18270518-18270579)
chr1 (29-159)||(18823793-18823924)
chr1 (36-104)||(38057394-38057463)
chr1 (45-104)||(10813273-10813333)
chr1 (29-92)||(24815586-24815647)
chr1 (196-230)||(6833382-6833416)
chr1 (196-230)||(45496142-45496176)
chr1 (36-104)||(19761968-19762037)
chr1 (29-88)||(13302045-13302104)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (32-230)||(154-352)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (28-230)||(35065309-35065511)
chr3 (28-226)||(11258592-11258790)
chr3 (28-230)||(19884252-19884454)
chr3 (28-230)||(35353720-35353922)
chr3 (28-190)||(14508012-14508174)
chr3 (28-224)||(17519602-17519799)
chr3 (28-224)||(17534464-17534661)
chr3 (28-226)||(2842191-2842379)
chr3 (28-190)||(41173100-41173263)
chr3 (28-190)||(15932236-15932398)
chr3 (28-173)||(14153199-14153344)
chr3 (28-179)||(5206383-5206535)
chr3 (28-191)||(16728443-16728606)
chr3 (28-173)||(50348835-50348977)
chr3 (57-190)||(5215026-5215159)
chr3 (28-190)||(17693236-17693391)
chr3 (28-173)||(45531350-45531496)
chr3 (112-230)||(44269650-44269768)
chr3 (28-120)||(44273705-44273797)
chr3 (28-108)||(22307312-22307392)
chr3 (36-173)||(10562881-10563019)
chr3 (28-108)||(17538350-17538430)
chr3 (28-108)||(40807239-40807319)
chr3 (151-224)||(40811913-40811986)
chr3 (29-191)||(20417233-20417396)
chr3 (29-159)||(13523145-13523276)
chr3 (29-159)||(3394736-3394867)
chr3 (29-159)||(14818211-14818342)
chr3 (27-104)||(10550510-10550588)
chr3 (29-159)||(18367492-18367623)
chr3 (29-159)||(23395794-23395925)
chr3 (29-173)||(13179314-13179459)
chr3 (177-230)||(1208848-1208901)
chr3 (177-230)||(11258560-11258613)
chr3 (29-159)||(13520515-13520646)
chr3 (65-159)||(3803066-3803160)
chr3 (29-88)||(6819367-6819427)
chr3 (65-159)||(11850414-11850508)
chr3 (29-104)||(17548285-17548361)
chr3 (196-230)||(50756254-50756288)
chr3 (36-104)||(6158637-6158706)
chr3 (36-104)||(14642293-14642362)
chr3 (42-91)||(42353415-42353463)
chr3 (29-104)||(179441-179517)
chr3 (107-158)||(13516530-13516582)
chr3 (36-131)||(14250861-14250952)
chr3 (29-104)||(52338699-52338775)
chr3 (65-159)||(54520668-54520762)
chr3 (179-230)||(50351983-50352034)
chr3 (42-87)||(13519549-13519593)
chr3 (197-230)||(22842513-22842546)
chr3 (36-104)||(37038058-37038127)
chr3 (36-104)||(42324964-42325033)
chr3 (29-89)||(52213211-52213272)
chr3 (65-159)||(12275785-12275879)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (28-230)||(20179250-20179452)
chr8 (28-230)||(42818636-42818829)
chr8 (36-173)||(22259106-22259243)
chr8 (62-190)||(24713329-24713457)
chr8 (28-108)||(19140008-19140088)
chr8 (28-108)||(39936739-39936819)
chr8 (42-173)||(20084379-20084508)
chr8 (29-171)||(23947374-23947517)
chr8 (29-161)||(17217771-17217905)
chr8 (29-191)||(17907703-17907867)
chr8 (29-191)||(22244557-22244721)
chr8 (29-161)||(22584469-22584602)
chr8 (29-191)||(23888879-23889042)
chr8 (45-159)||(20454426-20454541)
chr8 (29-92)||(15635914-15635978)
chr8 (45-104)||(19882207-19882267)
chr8 (45-104)||(20455238-20455298)
chr8 (45-104)||(20460216-20460276)
chr8 (196-230)||(22344202-22344236)
chr8 (196-230)||(22355862-22355896)
chr8 (196-230)||(36304877-36304911)
chr8 (196-230)||(38988466-38988500)
chr8 (196-230)||(39019563-39019597)
chr8 (177-226)||(12577009-12577058)
chr8 (193-230)||(12577033-12577070)
chr8 (36-104)||(39695271-39695340)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (28-230)||(13263-13465)
scaffold0111 (28-230)||(19530-19732)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (28-230)||(126-327)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (36-230)||(23517-23711)
scaffold0146 (42-89)||(22322-22368)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (28-190)||(5442-5604)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (28-218)||(19920767-19920957)
chr5 (54-173)||(21406443-21406562)
chr5 (42-173)||(36509558-36509688)
chr5 (36-191)||(25250632-25250789)
chr5 (36-191)||(25314417-25314574)
chr5 (36-105)||(23200299-23200368)
chr5 (29-104)||(24277340-24277416)
chr5 (29-104)||(24384797-24384873)
chr5 (32-159)||(8952787-8952915)
chr5 (42-127)||(32608106-32608188)
chr5 (65-159)||(41876320-41876414)
chr5 (45-104)||(17812638-17812698)
chr5 (29-83)||(22357692-22357747)
chr5 (196-230)||(22110893-22110927)
chr5 (36-104)||(10953214-10953283)
chr5 (196-228)||(8504636-8504668)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (28-190)||(57908-58071)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (28-190)||(327-488)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (28-173)||(47298-47442)
scaffold0042 (36-191)||(28433-28589)
[»] scaffold1815 (1 HSPs)
scaffold1815 (42-173)||(1196-1326)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (54-173)||(7155-7274)
scaffold0546 (54-173)||(10975-11094)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (82-178)||(1653-1749)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (54-173)||(6033-6152)
scaffold0109 (54-173)||(730-849)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (42-173)||(33530-33660)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (28-108)||(9487-9567)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (42-173)||(15251-15381)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (28-108)||(8114-8195)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (42-190)||(145895-146043)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (42-173)||(388-518)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (42-173)||(11340-11470)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (28-108)||(9955-10035)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (28-102)||(9032-9106)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (81-173)||(10695-10787)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (36-173)||(20821-20958)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (36-131)||(677-771)
scaffold0083 (36-131)||(5981-6075)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (29-159)||(6807-6938)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (29-104)||(34125-34201)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (29-157)||(3224-3353)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (27-159)||(369-502)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (29-159)||(297-428)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (27-131)||(6123-6226)
scaffold0309 (27-131)||(8275-8378)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (29-161)||(411-545)
scaffold0409 (29-161)||(8666-8800)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (27-159)||(40957-41090)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (27-104)||(5066-5144)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (29-159)||(8244-8375)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (42-159)||(1276-1394)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (174-230)||(1970-2026)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (30-104)||(2013-2088)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (48-115)||(764-830)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (29-173)||(127529-127674)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (29-130)||(2724-2824)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (121-190)||(4616-4685)
scaffold0379 (121-190)||(14662-14731)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (29-131)||(127152-127252)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (29-159)||(2893-3024)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (31-161)||(66196-66326)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (29-92)||(1549-1613)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (65-159)||(143-237)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (29-92)||(6053-6117)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (29-104)||(59585-59661)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (36-131)||(53378-53471)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (36-104)||(8304-8373)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (29-159)||(10863-10994)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (177-230)||(27435-27488)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (178-230)||(18843-18894)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (29-104)||(3120-3196)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (42-104)||(16004-16067)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (54-93)||(78322-78361)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (196-230)||(10066-10100)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (36-104)||(19387-19456)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (197-230)||(4210-4243)
scaffold0174 (197-230)||(10332-10365)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (36-104)||(5657-5726)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (45-159)||(12260-12375)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (29-88)||(2667-2727)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (65-159)||(159723-159817)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 27126206 - 27126408
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126206 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 27126305  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27126306 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtctttaaagttgtaagttgttgtcg 27126405  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  27126406 atg 27126408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 15891432 - 15891627
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15891432 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 15891531  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgtt 223  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15891532 tctgctatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgtt 15891627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31734031 - 31733869
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31734031 tttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 31733932  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733931 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 31733869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Original strand, 17318851 - 17319014
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17318851 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 17318950  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17318951 tctgctgtattgattattatatcattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 17319014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7825913 - 7825767
Alignment:
Q  84 attattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaag 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825913 attattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgattactaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaag 7825814  T
Q  184 ttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7825813 ttgtaagttgttgtcaatgttgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 7825767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18708821 - 18708743
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18708821 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt-ttattattaatgatgctatgttgtgaa 18708743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 23150995 - 23151075
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23150995 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttattattaattatgctatgttgtgaa 23151075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24441243 - 24441112
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  24441243 tttatgtggaaaaggtatgatattgaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 24441146  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24441145 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 24441112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 31735657 - 31735821
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  31735657 ttatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaaattgttattattaatgttgctatgtt-acaagttgttttatgttgctgtc 31735755  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  31735756 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 31735821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 7827295 - 7827234
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattatt 89  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827295 tttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattatt 7827234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 108
Target Start/End: Original strand, 27322172 - 27322227
Alignment:
Q  53 aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27322172 aaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatgatgctatgttgtgaa 27322227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 13751088 - 13751219
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  13751088 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 13751185  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  13751186 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 13751219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18658524 - 18658448
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18658524 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 18658448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16245416 - 16245370
Alignment:
Q  121 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtt 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16245416 tgctgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtt 16245370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 22212242 - 22212407
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  22212242 ttatgtgaaaattgtatgatatagaaaataattttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgttgtgttg-caagttgttttatgttgctgcc 22212340  T
Q  128 tctg-atgtattgatta-ttaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    ||||  | | ||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22212341 tctgcttttgttgattatttatatcataaagttgcaagtgttggtctaagttgtctaagttgtaagt 22212407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 611058 - 610927
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  611058 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 610961  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  610960 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 610927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 29848239 - 29848370
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  29848239 ttatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 29848336  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  29848337 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 29848370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 19444016 - 19444092
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  19444016 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 19444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 5110534 - 5110628
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5110534 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 5110628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 16133406 - 16133482
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16133406 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 16133482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25920834 - 25920781
Alignment:
Q  177 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25920834 gttaaagttataagttgtggtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 25920781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 5289893 - 5289987
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5289893 ttatatcattcgagttgttattattaccgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 5289987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13764652 - 13764592
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13764652 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13764592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Original strand, 30674292 - 30674326
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30674292 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 30674326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 19829695 - 19829764
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  19829695 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgatattattgatgttgctatgttg 19829764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24267083 - 24266952
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  24267083 ttatgtgaaaaatgtatgatataaaaaatgtccttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 24266986  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24266985 tctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 24266952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20585679 - 20585477
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20585679 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtcgtgaagttgttgtatgttgttgtc 20585580  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20585579 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 20585480  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  20585479 atg 20585477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 46386816 - 46387012
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46386816 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 46386915  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 224  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  46386916 tctgctgtattaattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 46387012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44374269 - 44374067
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44374269 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 44374170  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44374169 tttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 44374070  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  44374069 atg 44374067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44383134 - 44382932
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44383134 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 44383035  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44383034 tttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 44382935  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  44382934 atg 44382932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 12465989 - 12466191
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12465989 tttatgtggaaaatgtatgatatagtaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgttaagttgttgtatgttgctgtc 12466088  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12466089 tctgctgtattgattaataaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgcaagttgttgtcg 12466188  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  12466189 atg 12466191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19282415 - 19282213
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19282415 tttatatggaaaagatataatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaacgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 19282316  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19282315 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtttgtcaagttgttaaaattgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 19282216  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  19282215 atg 19282213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 37785094 - 37785257
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37785094 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 37785193  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  37785194 tctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaagattgtcaagttgtaagt 37785257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 18875654 - 18875799
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18875654 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 18875753  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18875754 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 18875799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 43277554 - 43277699
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43277554 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttactgtc 43277653  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43277654 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 43277699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3287239 - 3287100
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3287239 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt- 3287141  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3287140 -----tgtattgattattaaatcattaagtttcatatgttagtcaa 3287100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11066791 - 11066711
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066791 tttatgtggaaaatgtatgatatggaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 11066711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 12127893 - 12127973
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12127893 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaa 12127973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 13148201 - 13148281
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13148201 tttatgcggaaaaggtatgatatagaaaataatatttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 13148281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12371601 - 12371521
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371601 tttacgtggaaaaagtatgatatagaaaataaagtttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 12371521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 32434319 - 32434392
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32434319 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatgatgttatg 32434392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11053948 - 11053785
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| || ||||||| ||||    
T  11053948 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatattg-caagttctt-tatgttgttgtc 11053851  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    | || || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11053850 tatgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 11053785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 8757130 - 8757261
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  8757130 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 8757227  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8757228 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 8757261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 40555477 - 40555608
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  40555477 ttatatggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 40555574  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  40555575 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 40555608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15281579 - 15281505
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15281579 ttatgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttatta-taatgttgctatgttg 15281505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 3289556 - 3289687
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  3289556 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattgacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttgtc 3289653  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| | ||||||||||    
T  3289654 tctgttgttgttgattattaataccattaagttg 3289687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33001271 - 33001177
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| || ||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  33001271 gaaaatgtatgatatagaaaattatgttgttgtatcatccaagttattgttattaacgttgctatgttg-caagttgttttatgttgctgtctctg 33001177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Original strand, 21735237 - 21735331
Alignment:
Q  30 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctg 125  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  21735237 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctg 21735331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4325374 - 4325310
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 92  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4325374 ttatgttgaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 4325310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13408090 - 13408014
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13408090 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13408014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 13865120 - 13865196
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13865120 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattgaagttgttattattaatattgctatgttg 13865196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 155
Target Start/End: Original strand, 832757 - 832884
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  832757 ttatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 832854  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaa 155  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  832855 tctgttgttgttgattattaatatcattaa 832884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 155
Target Start/End: Original strand, 1197937 - 1198064
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  1197937 ttatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 1198034  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaa 155  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  1198035 tctgttgttgttgattattaatatcattaa 1198064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 115
Target Start/End: Original strand, 14161683 - 14161749
Alignment:
Q  48 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  14161683 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgtcatgttgt-aagttgttg 14161749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Original strand, 12755442 - 12755504
Alignment:
Q  31 atgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12755442 atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatataattcaagttgttatgattaat 12755504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43747629 - 43747595
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43747629 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 43747595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 17071030 - 17071099
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17071030 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 17071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11309585 - 11309537
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 92  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11309585 tgatatagaaaatattgttgtttatattattcaagttgttattattaat 11309537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 92
Target Start/End: Original strand, 14191839 - 14191887
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 92  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14191839 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 14191887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37018921 - 37018719
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37018921 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 37018822  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37018821 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtccagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 37018722  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  37018721 atg 37018719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42875122 - 42874924
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875122 tttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 42875023  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 226  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42875022 tctgttatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttggtgtc 42874924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16997850 - 16997649
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16997850 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 16997751  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16997750 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcacatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcattaaagttgtaagttgttgtcg 16997651  T
Q  228 at 229  Q
    ||    
T  16997650 at 16997649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11425278 - 11425075
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaa-taatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11425278 tttatgtggaataggtatgatatagaaaaataatattgttatatcattcatgttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgatgtatgttgttgt 11425179  T
Q  127 ctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11425178 ctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtc 11425079  T
Q  227 gatg 230  Q
    ||||    
T  11425078 gatg 11425075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25090976 - 25090774
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25090976 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtgtgttgttttc 25090877  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25090876 tctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcattgtcattaaagttgtaagttgttgtcg 25090777  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  25090776 atg 25090774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14548947 - 14548773
Alignment:
Q  30 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14548947 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctc 14548848  T
Q  130 tgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtc 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  14548847 tgttgtattgattattaaatcattaagttgcatttgttgtttatgttgttaaagttgtaagttgttgtcgatgtc 14548773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 19435506 - 19435669
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19435506 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 19435605  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||    
T  19435606 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaaatttgtcaagttgtaagt 19435669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Original strand, 10357173 - 10357328
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  10357173 gaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgt 10357272  T
Q  136 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10357273 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 10357328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 33243995 - 33244129
Alignment:
Q  39 aaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtatt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33243995 aaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttattgtatgttgatgtctctgctgtatt 33244094  T
Q  139 gattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33244095 gattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 33244129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3485221 - 3485091
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  3485221 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctgttgttattga 3485124  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485123 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 3485091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19609647 - 19609567
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609647 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttaaaccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 19609567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19734589 - 19734471
Alignment:
Q  56 ataatgttgttataccattcaa-gttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcatt 153  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19734589 ataatgttgttataccatccaaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctgttgttattgattattaaatcatt 19734491  T
Q  154 aagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19734490 aagttgcatatgatggtcaa 19734471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21061844 - 21061680
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  21061844 ttatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgatgtttatatcattcaagttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtc 21061746  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  21061745 tctactgttattgattattaatatcgttaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 21061680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 2584945 - 2585076
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  2584945 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtc 2585042  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  2585043 tctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 2585076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Original strand, 4615800 - 4615901
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  4615800 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 4615897  T
Q  128 tctg 131  Q
    ||||    
T  4615898 tctg 4615901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27028053 - 27027922
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  27028053 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 27027956  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27027955 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 27027922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6511892 - 6511762
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| || | |||||||| ||||||| || |    
T  6511892 ttatgtagaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatatt-tcaagttgtt-tatgttgttgcc 6511795  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagtt 158  Q
    |||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  6511794 tctgttgttgttgattattaatatcattaagtt 6511762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 14933175 - 14933251
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14933175 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 14933251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13446770 - 13446642
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  13446770 ttatgtgaaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 13446673  T
Q  128 tctgatgtattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13446672 tctgttg--ttgattattaatatcattaagttg 13446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 14942381 - 14942512
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  14942381 ttatgtggaaaatgtatgatctagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 14942478  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  14942479 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 14942512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 15448145 - 15448276
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  15448145 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagtttttattattaatatttctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 15448242  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || |  |||||||||| ||||||||||||    
T  15448243 tctgctgttgctgattattaatatcattaagttg 15448276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18229974 - 18229899
Alignment:
Q  30 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  18229974 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttaatattaatattgctatgttg 18229899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50160222 - 50160165
Alignment:
Q  133 tgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  50160222 tgtattgattattaaatcattaaattgcatatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 50160165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9638316 - 9638247
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9638316 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 9638247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 20899494 - 20899625
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  20899494 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 20899591  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||  || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  20899592 tctactgttgttgattattaatatcattaagttg 20899625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 49547996 - 49548090
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||    
T  49547996 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatattattaagttg 49548090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25512694 - 25512660
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25512694 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 25512660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Original strand, 26922555 - 26922589
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26922555 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 26922589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51992832 - 51992738
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  51992832 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 51992738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 28653231 - 28653433
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28653231 tttatgtggaaaaggtatgatatagataataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 28653330  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28653331 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 28653430  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  28653431 atg 28653433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36839497 - 36839295
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36839497 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatagtgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtcgtatgttgttgtc 36839398  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36839397 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 36839298  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  36839297 atg 36839295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24515509 - 24515308
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24515509 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattgaagttgttatgattaatgatgctatgttgcgaagttgttgtatgttgttgtc 24515410  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24515409 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgcaagttgttgtcg 24515310  T
Q  228 at 229  Q
    ||    
T  24515309 at 24515308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17306810 - 17306608
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17306810 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataaaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 17306711  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17306710 tctgctgtattaattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtatgttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 17306611  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  17306610 atg 17306608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 23969352 - 23969554
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||     
T  23969352 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgtagtatgttgatgta 23969451  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969452 tctgctatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtaaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 23969551  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  23969552 atg 23969554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9975249 - 9975089
Alignment:
Q  30 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctc 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9975249 tatgtggaaaatgtatggtatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaagttgttgtatgttgttgtctc 9975150  T
Q  130 tgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9975149 tgctgtattgattattaaatcattaagttacatatgttggtcaaattgttaaagttgtaag 9975089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19358254 - 19358110
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19358254 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaagttgttgtatgttgatgtc 19358155  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358154 tctactgtattg-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 19358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 27485199 - 27485359
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  27485199 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtgatatgttgatgtc 27485298  T
Q  128 tctgatgtattg-attattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgt 187  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27485299 tctgttgtattgaattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttg-taaagttgt 27485359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14693528 - 14693380
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtct 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||| || |||||    
T  14693528 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgatgttatatcattcaagttgttatgattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatg-tgatgtct 14693431  T
Q  129 ctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 178  Q
    |||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14693430 ctgccgttattgattatttaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 14693380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 24781569 - 24781649
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781569 tttatgtggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 24781649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 10897520 - 10897666
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 126  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||    
T  10897520 tttatgtggaaaagatatgttatacaaaatattcatgtttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgttgt 10897618  T
Q  127 ctctgatgt-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10897619 ctctgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatattggtcaa 10897666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Original strand, 5031859 - 5031922
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5031859 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaa 5031922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5985396 - 5985236
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatg---ctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctga 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||   |||||| |  |||||||| | ||||||||||||||     
T  5985396 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttgttattattgatgttgctatgtggc-aagttgttttctgttgctgtctctgt 5985298  T
Q  133 tg-tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5985297 tgttgttgaattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 5985236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31520435 - 31520371
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 92  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31520435 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgttattatcattcaagttgttattattaat 31520371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27860601 - 27860469
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | || || |||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  27860601 ttatgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttatgttg-caagttgttg-atgttgttgtc 27860505  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 161  Q
    | || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27860504 tttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 27860469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44071808 - 44071676
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  44071808 ttatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcgttcaagttgttattattagtgttgttatgttg-caagttgttg-atgttgttgtc 44071712  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 161  Q
    | || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44071711 tttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 44071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 6478034 - 6478110
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6478034 ttatgtggaaaatggatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 6478110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Original strand, 18391064 - 18391124
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 88  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18391064 ttatgtggaaaatatatgatatcggaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 18391124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27851895 - 27851836
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 88  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27851895 ttatgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 27851836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19676074 - 19675872
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19676074 tttatgtgcaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 19675975  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19675974 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 19675875  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  19675874 atg 19675872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42912373 - 42912171
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42912373 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 42912274  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42912273 tttgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcattaaagttgtaagttgttgtcg 42912174  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  42912173 atg 42912171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 21046780 - 21046980
Alignment:
Q  30 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21046780 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctc 21046879  T
Q  130 tgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgat 229  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21046880 ttctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgat 21046979  T
Q  230 g 230  Q
    |    
T  21046980 g 21046980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 4596574 - 4596776
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4596574 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaactaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtc 4596673  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4596674 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttgatcgagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatttcgttaaagttgtaagttgttgtcg 4596773  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  4596774 atg 4596776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 16059043 - 16059245
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  16059043 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttggtgtatgtgtttgtc 16059142  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  16059143 tctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtagttaaagttgtaagttgttatcg 16059242  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  16059243 atg 16059245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 171
Target Start/End: Original strand, 20634364 - 20634507
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634364 tttatgtggaaaaggcatgatataaaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 20634463  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634464 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc 20634507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20588001 - 20587838
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20588001 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 20587902  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  20587901 tctgctatattgattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttgtttaagctgtaag 20587838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20592539 - 20592376
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20592539 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 20592440  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  20592439 tctgctatattgattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttgtttaagctgtaag 20592376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 7052797 - 7052927
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  7052797 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctgtgctgttattga 7052894  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052895 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 7052927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 14238354 - 14238484
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14238354 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgttatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattga 14238451  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238452 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 14238484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 38887869 - 38887999
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  38887869 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtttctgctgttattga 38887966  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38887967 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 38887999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 41227434 - 41227513
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41227434 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaatttgttatcattaatgatgctatgttgtgaa 41227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42697031 - 42696937
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  42697031 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgctacgttg-caagttgttttatgttgttgtctctg 42696937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18275233 - 18275157
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18275233 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaacgttgctatgttg 18275157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52983463 - 52983332
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  52983463 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgttatgttg-caagttgct-tatgttgatgtc 52983366  T
Q  128 tctg-atgtattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| |  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  52983365 tctgcagttgttgattattaatatcattaagttg 52983332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1642750 - 1642657
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  1642750 gaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctg 1642657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51476294 - 51476131
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| | ||    
T  51476294 ttatgtggaaaatgtatgatatagataataccgttgtttatattattcaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttctc 51476197  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||  || | ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  51476196 tctactgttgttgattattaatatcattaagctgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 51476131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 7792586 - 7792662
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7792586 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaaatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 7792662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 13528528 - 13528604
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  13528528 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 13528604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 44822855 - 44822919
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 92  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44822855 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 44822919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 21181073 - 21181135
Alignment:
Q  43 tatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21181073 tatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 21181135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18270579 - 18270518
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattatt 89  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18270579 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattctagttgttattatt 18270518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18823924 - 18823793
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  18823924 ttatgtggaaaatatatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 18823827  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| |||| |||||||    
T  18823826 tctgctgttgttgattattaatatcagtaagttg 18823793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 38057394 - 38057463
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38057394 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 38057463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Original strand, 10813273 - 10813333
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10813273 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10813333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 24815586 - 24815647
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaat 92  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24815586 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgtt--tatatcattcaagttgttattattaat 24815647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6833416 - 6833382
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6833416 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 6833382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45496176 - 45496142
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45496176 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 45496142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 19761968 - 19762037
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19761968 gaaaatgtatgatatggaaattattattgattatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 19762037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13302104 - 13302045
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 88  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13302104 ttatgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 13302045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 154 - 352
Alignment:
Q  32 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  154 tgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctg 253  T
Q  132 atgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  254 ctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 35065309 - 35065511
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35065309 tttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 35065408  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35065409 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttataagttgttgtcg 35065508  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  35065509 atg 35065511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11258790 - 11258592
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||     
T  11258790 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgtagtatgttgatgtt 11258691  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11258690 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtc 11258592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 19884252 - 19884454
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  19884252 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttatggagttgttgtatgttgatgtc 19884351  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19884352 tctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgtcaaagttttaagttgttgtcg 19884451  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  19884452 atg 19884454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35353922 - 35353720
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35353922 tttatgtggaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttataccttttaagttgttattattaattatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 35353823  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35353822 tctgttgtatttattattaaatcattaagttgtatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttatcg 35353723  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  35353722 atg 35353720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14508174 - 14508012
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14508174 tttatgtggaaaaggtattatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgtttttgtc 14508075  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508074 ttttttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 14508012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 17519602 - 17519799
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17519602 tttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttatattgtgaagttgttgtatgttgctgtc 17519701  T
Q  128 tctgatgtattga-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 224  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17519702 tctgctgtattgatttattaaatcattaagttgcatatgttggtgaagttgttaaagttgtaagttgttttcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 17519799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 17534464 - 17534661
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17534464 tttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttatattgtgaagttgttgtatgttgctgtc 17534563  T
Q  128 tctgatgtattga-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 224  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17534564 tctgctgtattgatttattaaatcattaagttgcatatgttggtgaagttgttaaagttgtaagttgttttcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 17534661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Original strand, 2842191 - 2842379
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |    
T  2842191 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagtttttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgt----------c 2842280  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2842281 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtc 2842379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Original strand, 41173100 - 41173263
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41173100 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 41173199  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41173200 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 41173263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Original strand, 15932236 - 15932398
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15932236 tttatgtggaaattgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgctgctgtc 15932335  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15932336 tctactgtattgattattaaatcattaagttgtatatgttggtcaagttgtttaaattgtaag 15932398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 14153199 - 14153344
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14153199 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttactgtc 14153298  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14153299 tctgatgtattcattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 14153344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 5206383 - 5206535
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5206383 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtc 5206482  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtt 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5206483 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatattggtctaagttgtt 5206535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16728606 - 16728443
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16728606 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 16728507  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  16728506 tctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaaggttgtcaagttgtaagt 16728443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 50348835 - 50348977
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  50348835 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa---gttgtatgttgctgtc 50348931  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50348932 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 50348977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5215159 - 5215026
Alignment:
Q  57 taatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5215159 taatgttgttataccattcaagttgttattatttatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaag 5215060  T
Q  157 ttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215059 ttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 5215026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17693391 - 17693236
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17693391 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgatgtc 17693292  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |        ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17693291 t--------ttgattattaaattattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 17693236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 45531350 - 45531496
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  45531350 tttatgtggaaaatgtatgatataaaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttattgtc 45531449  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45531450 tctgctgttattgattatttaatcattaagttgcatatgtaggtcaa 45531496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44269768 - 44269650
Alignment:
Q  112 gttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaat 211  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  44269768 gttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaag 44269669  T
Q  212 ttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44269668 ttgtaagttgttgtcgatg 44269650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 44273797 - 44273705
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgt 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44273797 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtggagttgttgtatgt 44273705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 22307312 - 22307392
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307312 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 22307392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10563019 - 10562881
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg 134  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  10563019 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcgttcaagttgttatttttaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttatctctgctg 10562920  T
Q  135 tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10562919 tattgatgattaaatcattaagtttcatatgttagtcaa 10562881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17538430 - 17538350
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17538430 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttgttattattaatgaagctatgttgtgaa 17538350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40807319 - 40807239
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40807319 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttattattattaatgatgctatgttgtgaa 40807239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40811986 - 40811913
Alignment:
Q  151 attaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40811986 attaagttgtatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 40811913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20417396 - 20417233
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  20417396 ttatgtggaaaatgtatgatataaaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatgttg-caagttgtt-tatgttgttgtc 20417299  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  20417298 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 20417233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 13523145 - 13523276
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13523145 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtc 13523242  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13523243 tctgctgttgttgattagtaatatcattaagttg 13523276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 3394736 - 3394867
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  3394736 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 3394833  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3394834 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 3394867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14818342 - 14818211
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||  |||||| | ||||||||||||    
T  14818342 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctgtattg-caagttgct-tatgttgctgtc 14818245  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  14818244 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 14818211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10550588 - 10550510
Alignment:
Q  27 ttttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10550588 ttttatgtggaaaatgtatgatatagaaattatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10550510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 18367492 - 18367623
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  18367492 ttatgtggaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgttatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 18367589  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | || |||||||| ||||||||||||    
T  18367590 tctgctgttgttaattattaatatcattaagttg 18367623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 23395794 - 23395925
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| |||  |||||||| ||||||| ||||    
T  23395794 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatattg-caagttgtt-tatgttgttgtc 23395891  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23395892 tctgctgttgttgattattaatatcatgaagttg 23395925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13179459 - 13179314
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |  |  |||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  13179459 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttgtatgttg-caagttgttg-atgttgctatc 13179362  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    | || || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13179361 tttgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaa 13179314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Original strand, 1208848 - 1208901
Alignment:
Q  177 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1208848 gttaaagttgtaagttggtgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 1208901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11258613 - 11258560
Alignment:
Q  177 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11258613 gttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgacgatg 11258560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 13520515 - 13520646
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  13520515 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 13520612  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13520613 tctgctgttgttgattagtaatatcattaagttg 13520646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3803160 - 3803066
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3803160 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 3803066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6819427 - 6819367
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattat 88  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6819427 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattat 6819367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 11850414 - 11850508
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  11850414 ttatatcattctagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 11850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 17548285 - 17548361
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17548285 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaaaatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 17548361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Original strand, 50756254 - 50756288
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50756254 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 50756288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6158706 - 6158637
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6158706 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 6158637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 14642293 - 14642362
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14642293 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 14642362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 91
Target Start/End: Original strand, 42353415 - 42353463
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 91  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42353415 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaa 42353463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 179441 - 179517
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  179441 ttatgtgcaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttactattaatattgctatgttg 179517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13516582 - 13516530
Alignment:
Q  107 aagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagtt 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13516582 aagttcttgtatgttgctgtctctgctgttattggttattaaatcattaagtt 13516530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Original strand, 14250861 - 14250952
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  14250861 gaaaatgtatgatatggaaattattattgttata--attcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 14250952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 52338699 - 52338775
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtt-gttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  52338699 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttatttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 52338775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54520762 - 54520668
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  54520762 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctttgttgttgttgattattaatatcattaagttg 54520668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 230
Target Start/End: Original strand, 50351983 - 50352034
Alignment:
Q  179 taaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50351983 taaagttataagttgttgtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 50352034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13519593 - 13519549
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttatta 87  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13519593 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttatta 13519549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 230
Target Start/End: Original strand, 22842513 - 22842546
Alignment:
Q  197 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22842513 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22842546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 37038127 - 37038058
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37038127 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaaattgttattattgatgttgctatgttg 37038058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 42324964 - 42325033
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42324964 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattcatgttgctatgttg 42325033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Original strand, 52213211 - 52213272
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattatt 89  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  52213211 ttatgtggaaaatgtattatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattatt 52213272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12275879 - 12275785
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||| || | || |||||||| ||||||||||||    
T  12275879 ttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgtt-tcaagttgct-tatgttgctgtttctgctgttgttaattattaatatcattaagttg 12275785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 20179250 - 20179452
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20179250 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 20179349  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20179350 tttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 20179449  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  20179450 atg 20179452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 42818636 - 42818829
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42818636 tttatgaggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtttttattattaacgatgatatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 42818735  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42818736 tctagtgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt--aagttg-------ttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcg 42818826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 22259106 - 22259243
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22259106 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgccatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgt 22259205  T
Q  136 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22259206 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 22259243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24713457 - 24713329
Alignment:
Q  62 ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgca 161  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713457 ttgttatatcattcaaattgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgca 24713358  T
Q  162 tatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24713357 tatgttggtcaagttgtttaagttgtaag 24713329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19140088 - 19140008
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19140088 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 19140008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 39936739 - 39936819
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936739 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtggttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 39936819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 20084379 - 20084508
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  20084379 gtatgatata-aaaataatgttgttataccat-caagtggttattattaatgttgttatgat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctgctgttattga 20084475  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20084476 ttattaaattattaagttgcatatgttggtcaa 20084508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23947517 - 23947374
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  23947517 ttatgtggaaatg-tatgatatagaaaatattattgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgctgtc 23947420  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc 171  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  23947419 tctgctgttattgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtc 23947374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17217905 - 17217771
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtct 128  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  17217905 ttatgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatctaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgctgtct 17217807  T
Q  129 ctgatg-tattg-attattaa-atcattaagttgca 161  Q
    ||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17217806 ctgctgttgttgaattattaatatcattaagttgca 17217771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 17907703 - 17907867
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  17907703 ttatgtggaaaaagtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgatattattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtc 17907801  T
Q  128 tctgatg-tattgattatt-aaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||| || | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  17907802 tctgctgttgttgattattgatatcattaagttgcaaatgttagtctaagttg-caaagttgtaagt 17907867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22244721 - 22244557
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  22244721 ttatgttgaaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatctttcaagttgttattattaatgtttctatgttg-caagttgttttatgttgatgtc 22244623  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  22244622 tctgctgttattgattattaatatcattaaattgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 22244557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 22584469 - 22584602
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  22584469 ttatgtgaaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagtggttattattaatgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtc 22584566  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 161  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22584567 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 22584602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23889042 - 23888879
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  23889042 ttatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcgttcaagttgttattattaatgtagctgtgttg-caagttgtt-tatgttgctgtc 23888945  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    |||  || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  23888944 tctattgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 23888879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20454541 - 20454426
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgatt 142  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||| ||| || | ||||||    
T  20454541 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtccctgctgttgttgatt 20454444  T
Q  143 attaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  20454443 attaatatcattaagttg 20454426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 15635914 - 15635978
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 92  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15635914 ttatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 15635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19882267 - 19882207
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19882267 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 19882207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20455298 - 20455238
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20455298 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20455238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20460276 - 20460216
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20460276 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20460216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22344236 - 22344202
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22344236 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22344202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22355896 - 22355862
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22355896 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22355862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36304911 - 36304877
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36304911 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 36304877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38988500 - 38988466
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38988500 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 38988466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39019597 - 39019563
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39019597 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 39019563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12577058 - 12577009
Alignment:
Q  177 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 226  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12577058 gttaaagttgtaagttgttgtcgatgtcgataaagttgtaagttgttgtc 12577009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12577070 - 12577033
Alignment:
Q  193 tttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12577070 tttgtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 12577033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 39695271 - 39695340
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39695271 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 39695340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 13263 - 13465
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13263 tttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttattgtc 13362  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  13363 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcattaaagctgtaagttgttgtcg 13462  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  13463 atg 13465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 19530 - 19732
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19530 tttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttcttgtc 19629  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19630 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcattaaagctgtaagttgttgtcg 19729  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  19730 atg 19732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 126 - 327
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  126 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtc 225  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcg 227  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  226 tctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcatgtt-ttaaagttgtaagttgttgtcaatgtagttaaagttttaagttgttgtcg 324  T
Q  228 atg 230  Q
    |||    
T  325 atg 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23711 - 23517
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||    
T  23711 gaaaaggtatgatgtagaaaataatgttgttataccatttaagttgttatcattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctcaattgt 23612  T
Q  136 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23611 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttttaagttgttgtcgatg 23517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22368 - 22322
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattatt 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22368 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattatt 22322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Original strand, 5442 - 5604
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5442 tttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgttgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 5541  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5542 tctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgtttaagttgtaag 5604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19920957 - 19920767
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19920957 tttatgtggaaaaactatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttattattattaatgatgatatgttgtgaagttgttgtgtgttgctgtc 19920858  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaag 218  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| || |||||||    
T  19920857 tctgctgtattgtttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatattgtttaagttgtaag 19920767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 21406443 - 21406562
Alignment:
Q  54 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcat 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21406443 aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgctgttattgattattaaatcat 21406541  T
Q  153 taagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21406542 ttagttgcatatgttggtcaa 21406562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 36509558 - 36509688
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  36509558 gtatgatatagaaa-taacgttattataccatccaagtgattattattaatgttgccatgat-tcaagttgttgtacgttgctgtctctgttgttattga 36509655  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36509656 ttattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 36509688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Original strand, 25250632 - 25250789
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgat-g 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |      
T  25250632 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctctactat 25250730  T
Q  135 tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25250731 tgttgaattattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 25250789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Original strand, 25314417 - 25314574
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgat-g 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |      
T  25314417 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctctactat 25314515  T
Q  135 tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25314516 tgttgaattattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 25314574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 105
Target Start/End: Original strand, 23200299 - 23200368
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  23200299 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt 23200368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 24277340 - 24277416
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24277340 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24277416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24384873 - 24384797
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24384873 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24384797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 159
Target Start/End: Original strand, 8952787 - 8952915
Alignment:
Q  32 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctct 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||    
T  8952787 tgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtctct 8952884  T
Q  131 gatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    | || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8952885 gttgttgttgattattaatatcattaagttg 8952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 32608106 - 32608188
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  32608106 gtatgatatagaaa-taatgttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgta-gttgctgtc 32608188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 41876320 - 41876414
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41876320 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 41876414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17812698 - 17812638
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17812698 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 17812638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 22357692 - 22357747
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22357692 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgttgttgtttatatcattcaagttgtt 22357747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22110927 - 22110893
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22110927 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22110893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10953283 - 10953214
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  10953283 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttataccattcaagttgttattgttgatgttgctatgttg 10953214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Original strand, 8504636 - 8504668
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcga 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8504636 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcga 8504668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 58071 - 57908
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  58071 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtcgtgaagttgttgtatgttgttgtc 57972  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  57971 tctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 57908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 327
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  488 tttatatggaaaaggtatgatatagaaaataacgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgttgtacgttgttgtc 389  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 190  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  388 tctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgtt-aagttgtaag 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 47298 - 47442
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47298 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaa-aatgttgttataccattcaagttgttataattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 47396  T
Q  128 tctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47397 tctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 47442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28589 - 28433
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg- 134  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| ||     
T  28589 gaaaatgtatgatacagaaactaatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgtgactatgctg-caagttgttttatgttgctatctctgctgt 28491  T
Q  135 tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 191  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  28490 tattgattattaacatcatttagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 28433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1196
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  1326 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctgtgctgttattga 1229  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1228 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7274 - 7155
Alignment:
Q  54 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcat 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7274 aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcat 7176  T
Q  153 taagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7175 taagttgcatatgttggtcaa 7155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11094 - 10975
Alignment:
Q  54 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11094 aaataatgttgttataccatcgaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctttctctgttgttattgattattaaatcat 10996  T
Q  153 taagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10995 taagttgcatatgttggtcaa 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1749 - 1653
Alignment:
Q  82 ttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1749 ttattattaatgatgctatgttgttaagttgttgtattttgctatctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 1653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 6033 - 6152
Alignment:
Q  54 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcat 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6033 aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcat 6131  T
Q  153 taagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6132 taagttgcatatgttggtcaa 6152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 730 - 849
Alignment:
Q  54 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  730 aaataatgttgttataccatcgaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctttctctgttgttattgattattaaatcat 828  T
Q  153 taagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  829 taagttgcatatgttggtcaa 849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33660 - 33530
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  33660 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgatgtctctgttgttattga 33563  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33562 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 9487 - 9567
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacctttcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 9567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 15251 - 15381
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  15251 gtatgatatagaaa-taatgtttttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgatgtctctgttgttattga 15348  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15349 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 15381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 8114 - 8195
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaa-ggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8114 tttatgtggaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 8195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 146043 - 145895
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||||| ||||  || ||| |||||    
T  146043 gtatgatatagaaa-taatgttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctacggt-tcaagttgttgtatgttgttgtcattgttgttattga 145946  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  145945 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 145895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 518 - 388
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  518 gtatgatatagaaa-taatattgttataccatccaagtggttattattaatgtttctatgat-tcaagttgttgtatattggtgtctctgttgttattga 421  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  420 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11470 - 11340
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  11470 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaaatggttattattaatgttgctatggt-tcaagttgttgtatgttgttgtctgtgctgttattga 11373  T
Q  141 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11372 ttgttaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 11340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 9955 - 10035
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9955 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttattattaattatgctatgttgtgaa 10035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 102
Target Start/End: Original strand, 9032 - 9106
Alignment:
Q  28 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9032 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10787
Alignment:
Q  81 gttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695 gttattattaatgttgctatgat-tgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20958 - 20821
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg 134  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||| |||| ||    
T  20958 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgc-aagatgtt-tatgttgttgtttctgctg 20861  T
Q  135 t-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20860 ttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 20821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Original strand, 677 - 771
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  677 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatgttg-gaagttgttttatgttgctctctctg 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Original strand, 5981 - 6075
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5981 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatgttg-gaagttgttttatgttgctctctctg 6075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6938 - 6807
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  6938 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcatttgagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 6841  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  6840 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Original strand, 34125 - 34201
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34125 ttatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttg 34201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3353 - 3224
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  3353 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataacattcaagttgttattgttaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttgtc 3256  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagt 157  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  3255 tctgctgttgttgattattaatatcattaagt 3224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 369 - 502
Alignment:
Q  27 ttttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctg 125  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  369 ttttatgtgaaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctg 466  T
Q  126 tctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  467 tctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 297
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  428 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 331  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  330 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6226 - 6123
Alignment:
Q  27 ttttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctg 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  6226 ttttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttg 6129  T
Q  126 tctctg 131  Q
    ||||||    
T  6128 tctctg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8378 - 8275
Alignment:
Q  27 ttttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctg 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  8378 ttttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttg 8281  T
Q  126 tctctg 131  Q
    ||||||    
T  8280 tctctg 8275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 545 - 411
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  545 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aagttgttttatgttgttgtc 447  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 161  Q
    |||  || || |||||||||| |||| |||||||||    
T  446 tctactgttactgattattaatatcactaagttgca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8800 - 8666
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  8800 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aagttgttttatgttgttgtc 8702  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 161  Q
    |||  || || |||||||||| |||| |||||||||    
T  8701 tctactgttactgattattaatatcactaagttgca 8666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 40957 - 41090
Alignment:
Q  27 ttttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctg 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||    
T  40957 ttttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatgttg-caagttgct-tatgttgctg 41054  T
Q  126 tctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    || ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41055 tcactgctgttgttgattattaatatcattaagttg 41090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5144 - 5066
Alignment:
Q  27 ttttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5144 ttttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8375 - 8244
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  8375 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 8278  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
     ||| || | ||||||||||| |||| |||||||    
T  8277 cctgctgttgttgattattaatatcaataagttg 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1394
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattg 139  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || | |||    
T  1276 gtatgatatataaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgt-aagttgct-tatgttgctgtctctactgttgttg 1373  T
Q  140 attattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  1374 attattaatatcattaagttg 1394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2026 - 1970
Alignment:
Q  174 gttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2026 gttgttaaagttgtaagttgtcgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2088
Alignment:
Q  30 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2013 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 830 - 764
Alignment:
Q  48 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  830 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgctgctatgttgt-aagttgttg 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Original strand, 127529 - 127674
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |  |  |||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  127529 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttgtatgttg-caagttgttg-atgttgctatc 127626  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtcaa 173  Q
    | || || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  127627 tttgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaa 127674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Original strand, 2724 - 2824
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  2724 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgtttatatcattcaagttgttatttttaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 2821  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  2822 tct 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 190
Target Start/End: Original strand, 4616 - 4685
Alignment:
Q  121 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  4616 tgctgtctctgctgtattgattaataaatcattaagttgcttatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 4685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 190
Target Start/End: Original strand, 14662 - 14731
Alignment:
Q  121 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 190  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  14662 tgctgtctctgctgtactgattaataaatcattaagttgcttatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 14731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Original strand, 127152 - 127252
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtct 128  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||    
T  127152 ttatgtggaaa-ggtatgatagggaaaataatgttattatatcatccaagttgttgttattaaagttgctatgttg-caagctgttttatgttgttgtct 127249  T
Q  129 ctg 131  Q
    |||    
T  127250 ctg 127252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3024 - 2893
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  3024 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattactatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 2927  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  2926 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 2893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 66326 - 66196
Alignment:
Q  31 atgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctc 129  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||| |||||     
T  66326 atgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattaaagttgttattattaatgttgttatgttg-caagttgttg-atgttgttgtctt 66230  T
Q  130 tgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 161  Q
    || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  66229 tgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 66196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 1549 - 1613
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 92  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1549 ttatgtggaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 143 - 237
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  143 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 6053
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 92  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6117 ttatgtggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 6053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 59661 - 59585
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  59661 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg 59585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Original strand, 53378 - 53471
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 131  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  53378 gaaaatgtatgatatggaaattattatttttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 53471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8373 - 8304
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8373 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10994 - 10863
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  10994 ttatgtggaaaatgtatgatatatatgatattgttctttatatcattcaagttgttattattaatgtttctatgttg-caagttg-tctatgttgttgtc 10897  T
Q  128 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    |||| || | ||||||||||| |||||| |||||    
T  10896 tctgctgttgttgattattaatatcattgagttg 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27488 - 27435
Alignment:
Q  177 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27488 gttaaagttgtaagttgttgtcaatgtagttaaagttgtaagttgttatcgatg 27435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18894 - 18843
Alignment:
Q  178 ttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18894 ttaaagttgtaagttgttatcaatgtcgttaaa-ttgtaagttgttgtcgatg 18843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3196 - 3120
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3196 ttatggggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 3120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16067 - 16004
Alignment:
Q  42 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16067 gtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 16004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 78361 - 78322
Alignment:
Q  54 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatg 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  78361 aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatg 78322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 230
Target Start/End: Original strand, 10066 - 10100
Alignment:
Q  196 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10066 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 10100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 19387 - 19456
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  19387 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttg 19456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4243 - 4210
Alignment:
Q  197 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4243 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10365 - 10332
Alignment:
Q  197 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10365 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 10332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5726 - 5657
Alignment:
Q  36 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 104  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5726 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatataattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 12260 - 12375
Alignment:
Q  45 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgatt 142  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||| ||| || | ||||||    
T  12260 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtccctgctgttgttgatt 12357  T
Q  143 attaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12358 attaatatcattaagttg 12375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Original strand, 2667 - 2727
Alignment:
Q  29 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 88  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  2667 ttatgtggaaattgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaaatcgttattat 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 159723 - 159817
Alignment:
Q  65 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  159723 ttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgctgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 159817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University