View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5039_1D_low_70 (Length: 201)

Name: NF5039_1D_low_70
Description: NF5039_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5039_1D_low_70
NF5039_1D_low_70
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (6-201)||(18752904-18753098)
chr4 (1-201)||(18763514-18763713)
chr4 (1-201)||(5022382-5022581)
chr4 (1-201)||(17917697-17917897)
chr4 (1-201)||(17928345-17928545)
chr4 (1-201)||(450222-450421)
chr4 (1-201)||(15561494-15561693)
chr4 (1-201)||(19955377-19955576)
chr4 (1-201)||(21996059-21996258)
chr4 (1-201)||(22006657-22006856)
chr4 (1-201)||(30926909-30927108)
chr4 (1-201)||(27656244-27656445)
chr4 (1-201)||(27666817-27667018)
chr4 (1-201)||(29042071-29042271)
chr4 (1-201)||(36017981-36018181)
chr4 (1-201)||(36028534-36028734)
chr4 (1-201)||(49517780-49517980)
chr4 (1-201)||(4947983-4948182)
chr4 (1-201)||(14844068-14844267)
chr4 (1-201)||(19944742-19944941)
chr4 (1-201)||(30937487-30937686)
chr4 (1-201)||(48370777-48370976)
chr4 (1-201)||(24028500-24028702)
chr4 (1-201)||(18130654-18130856)
chr4 (1-201)||(24639893-24640093)
chr4 (1-201)||(460803-461002)
chr4 (1-201)||(27815360-27815559)
chr4 (1-196)||(52703434-52703628)
chr4 (1-201)||(10741009-10741209)
chr4 (1-201)||(10954778-10954978)
chr4 (1-201)||(55745667-55745867)
chr4 (1-201)||(40471002-40471201)
chr4 (1-201)||(10751583-10751783)
chr4 (1-201)||(10965352-10965552)
chr4 (1-201)||(16255512-16255711)
chr4 (1-201)||(16266105-16266304)
chr4 (1-201)||(18078321-18078522)
chr4 (1-201)||(55756278-55756478)
chr4 (1-201)||(40454764-40454963)
chr4 (1-201)||(25656781-25656980)
chr4 (1-185)||(3370359-3370543)
chr4 (1-185)||(3390099-3390283)
chr4 (1-201)||(10909053-10909252)
chr4 (1-181)||(4986845-4987024)
chr4 (1-182)||(10695287-10695466)
chr4 (1-181)||(16316976-16317155)
chr4 (1-181)||(16304752-16304931)
chr4 (1-201)||(5873017-5873215)
chr4 (1-201)||(14836517-14836716)
chr4 (1-177)||(15207827-15208001)
chr4 (6-150)||(25008546-25008689)
chr4 (1-185)||(10300179-10300363)
chr4 (1-185)||(11535489-11535673)
chr4 (1-171)||(19580886-19581054)
chr4 (1-137)||(47152528-47152662)
chr4 (21-185)||(31267223-31267386)
chr4 (21-181)||(11514701-11514859)
chr4 (1-164)||(24713072-24713234)
chr4 (1-116)||(19143504-19143618)
chr4 (21-173)||(19241689-19241838)
chr4 (21-181)||(49002416-49002573)
chr4 (23-181)||(55650992-55651147)
chr4 (21-137)||(23508813-23508926)
chr4 (21-137)||(16819825-16819938)
chr4 (1-69)||(8183486-8183554)
chr4 (21-137)||(14711253-14711368)
chr4 (21-137)||(14778917-14779032)
chr4 (21-173)||(18775123-18775272)
chr4 (21-173)||(18007529-18007678)
chr4 (1-75)||(10290270-10290345)
chr4 (37-137)||(17994267-17994364)
chr4 (22-135)||(36210587-36210699)
chr4 (32-171)||(33377860-33377997)
chr4 (20-115)||(8997740-8997831)
chr4 (1-50)||(19570662-19570711)
chr4 (78-137)||(18773578-18773637)
chr4 (135-181)||(4987052-4987098)
chr4 (78-137)||(19889514-19889574)
chr4 (77-135)||(1671907-1671966)
chr4 (108-173)||(1671908-1671974)
chr4 (77-162)||(9266768-9266854)
chr4 (80-173)||(19889508-19889602)
chr4 (78-175)||(32491346-32491444)
chr4 (135-185)||(39532227-39532277)
chr4 (94-166)||(14154528-14154601)
chr4 (77-133)||(24619174-24619231)
chr4 (125-173)||(16819819-16819867)
chr4 (21-99)||(18775515-18775589)
chr4 (123-167)||(22223290-22223334)
chr4 (125-173)||(23508884-23508932)
[»] chr3 (150 HSPs)
chr3 (1-201)||(6490758-6490957)
chr3 (1-201)||(6501412-6501611)
chr3 (1-201)||(9994302-9994501)
chr3 (1-201)||(9982294-9982493)
chr3 (1-201)||(12238022-12238221)
chr3 (1-201)||(12249848-12250047)
chr3 (1-201)||(24383928-24384129)
chr3 (1-201)||(13557201-13557400)
chr3 (1-201)||(19778012-19778211)
chr3 (1-201)||(19788649-19788848)
chr3 (1-201)||(23647375-23647575)
chr3 (1-201)||(23756925-23757124)
chr3 (1-201)||(23767521-23767720)
chr3 (1-201)||(5580043-5580244)
chr3 (1-201)||(5628427-5628628)
chr3 (1-201)||(5866105-5866306)
chr3 (1-201)||(5876704-5876905)
chr3 (1-201)||(18483670-18483870)
chr3 (1-201)||(20720738-20720939)
chr3 (1-201)||(6180937-6181136)
chr3 (1-201)||(6221111-6221310)
chr3 (1-196)||(12297216-12297412)
chr3 (1-201)||(13121289-13121488)
chr3 (1-201)||(13131531-13131730)
chr3 (1-201)||(14475848-14476047)
chr3 (1-201)||(39673292-39673491)
chr3 (1-201)||(504577-504777)
chr3 (1-201)||(526943-527143)
chr3 (1-201)||(4743364-4743564)
chr3 (1-201)||(4753951-4754151)
chr3 (1-201)||(8774283-8774483)
chr3 (1-201)||(10098694-10098894)
chr3 (1-201)||(16385701-16385901)
chr3 (1-201)||(35187003-35187203)
chr3 (1-201)||(38194350-38194550)
chr3 (1-201)||(38204886-38205086)
chr3 (1-201)||(39382316-39382516)
chr3 (1-201)||(41683304-41683504)
chr3 (1-201)||(41693873-41694073)
chr3 (1-201)||(4175166-4175365)
chr3 (1-201)||(5537430-5537629)
chr3 (1-201)||(5548014-5548213)
chr3 (1-196)||(12287394-12287590)
chr3 (1-201)||(37866072-37866271)
chr3 (1-201)||(37885205-37885404)
chr3 (1-201)||(5510322-5510522)
chr3 (1-201)||(5520500-5520700)
chr3 (1-201)||(11272793-11272994)
chr3 (1-201)||(24659526-24659726)
chr3 (1-201)||(24670106-24670306)
chr3 (1-201)||(39371679-39371879)
chr3 (1-201)||(20673603-20673802)
chr3 (1-201)||(20684188-20684386)
chr3 (1-201)||(37759296-37759495)
chr3 (1-201)||(28314641-28314842)
chr3 (1-201)||(13373075-13373276)
chr3 (1-201)||(13394263-13394464)
chr3 (1-201)||(10627350-10627550)
chr3 (1-201)||(23635336-23635535)
chr3 (1-201)||(24706964-24707164)
chr3 (1-201)||(10655672-10655872)
chr3 (1-201)||(13383669-13383870)
chr3 (1-201)||(28325257-28325456)
chr3 (1-199)||(1794895-1795092)
chr3 (1-182)||(11163457-11163636)
chr3 (11-201)||(29472474-29472663)
chr3 (1-181)||(9391633-9391812)
chr3 (1-185)||(13262098-13262281)
chr3 (1-201)||(29461622-29461821)
chr3 (1-181)||(48336868-48337047)
chr3 (1-181)||(933253-933433)
chr3 (1-181)||(11217154-11217333)
chr3 (1-181)||(19887783-19887962)
chr3 (11-181)||(7795036-7795206)
chr3 (1-179)||(7804949-7805127)
chr3 (1-199)||(1784482-1784679)
chr3 (1-182)||(4403900-4404079)
chr3 (1-182)||(4433387-4433566)
chr3 (11-181)||(9381087-9381256)
chr3 (1-174)||(17910441-17910614)
chr3 (1-181)||(11206503-11206682)
chr3 (6-185)||(8740551-8740729)
chr3 (1-177)||(14258499-14258673)
chr3 (6-182)||(38314326-38314500)
chr3 (1-181)||(9535235-9535415)
chr3 (1-185)||(8996382-8996566)
chr3 (11-185)||(14322117-14322289)
chr3 (21-185)||(16076575-16076738)
chr3 (1-185)||(9006934-9007118)
chr3 (1-185)||(27883008-27883192)
chr3 (1-137)||(8784897-8785034)
chr3 (21-181)||(29933990-29934148)
chr3 (21-181)||(29983144-29983302)
chr3 (21-177)||(1053355-1053510)
chr3 (6-185)||(16671587-16671766)
chr3 (21-173)||(2246013-2246162)
chr3 (21-181)||(17281864-17282022)
chr3 (21-177)||(1063784-1063939)
chr3 (11-133)||(15194516-15194638)
chr3 (21-181)||(29906611-29906769)
chr3 (21-181)||(29947776-29947934)
chr3 (21-181)||(29996930-29997088)
chr3 (1-115)||(13601860-13601973)
chr3 (11-119)||(18857426-18857532)
chr3 (1-134)||(28168737-28168870)
chr3 (116-201)||(14465332-14465417)
chr3 (21-181)||(13199676-13199833)
chr3 (21-173)||(51989587-51989736)
chr3 (21-167)||(15663180-15663323)
chr3 (78-173)||(15663144-15663240)
chr3 (11-75)||(24393356-24393420)
chr3 (122-201)||(8784989-8785068)
chr3 (22-173)||(17006638-17006788)
chr3 (21-173)||(31114428-31114577)
chr3 (1-75)||(33650827-33650901)
chr3 (21-173)||(41045186-41045337)
chr3 (22-173)||(22150690-22150840)
chr3 (21-173)||(14580786-14580937)
chr3 (80-173)||(15651509-15651603)
chr3 (21-144)||(15651568-15651688)
chr3 (1-75)||(19121375-19121449)
chr3 (21-132)||(27172514-27172622)
chr3 (22-135)||(17017474-17017586)
chr3 (21-135)||(10528818-10528931)
chr3 (32-173)||(13953718-13953857)
chr3 (106-179)||(17961073-17961149)
chr3 (106-185)||(28168811-28168891)
chr3 (1-51)||(11530424-11530474)
chr3 (32-173)||(15832863-15833002)
chr3 (32-136)||(37412091-37412193)
chr3 (77-173)||(49989758-49989855)
chr3 (77-173)||(51340508-51340605)
chr3 (32-135)||(45862162-45862263)
chr3 (32-173)||(11909606-11909745)
chr3 (32-173)||(12753187-12753326)
chr3 (78-135)||(18006023-18006081)
chr3 (78-173)||(15848700-15848796)
chr3 (135-173)||(21735868-21735906)
chr3 (21-104)||(21735817-21735896)
chr3 (78-136)||(4243694-4243753)
chr3 (123-162)||(11074019-11074058)
chr3 (77-163)||(15848669-15848756)
chr3 (77-115)||(8710417-8710455)
chr3 (77-115)||(9062304-9062342)
chr3 (123-173)||(52919976-52920026)
chr3 (78-134)||(13410623-13410680)
chr3 (106-163)||(18005989-18006049)
chr3 (123-163)||(8710404-8710444)
chr3 (123-163)||(9062291-9062331)
chr3 (78-137)||(22770433-22770493)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (1-201)||(36292557-36292758)
chr8 (1-201)||(36303160-36303361)
chr8 (1-196)||(241460-241656)
chr8 (1-196)||(252045-252241)
chr8 (1-196)||(794815-795011)
chr8 (1-196)||(849415-849611)
chr8 (1-201)||(26110869-26111068)
chr8 (1-201)||(13689011-13689212)
chr8 (1-196)||(210601-210797)
chr8 (1-196)||(724224-724420)
chr8 (1-201)||(9856920-9857119)
chr8 (1-201)||(43247963-43248162)
chr8 (1-201)||(26120544-26120746)
chr8 (1-201)||(3349070-3349270)
chr8 (1-201)||(3359667-3359867)
chr8 (1-201)||(9340781-9340981)
chr8 (1-201)||(9367925-9368125)
chr8 (1-201)||(36077574-36077774)
chr8 (1-201)||(36088160-36088360)
chr8 (1-201)||(44480728-44480928)
chr8 (1-201)||(44491344-44491544)
chr8 (1-201)||(3220270-3220469)
chr8 (1-201)||(6318959-6319158)
chr8 (1-201)||(15791742-15791942)
chr8 (1-201)||(18449008-18449207)
chr8 (1-201)||(19128386-19128585)
chr8 (1-201)||(32078139-32078338)
chr8 (1-201)||(32088712-32088911)
chr8 (1-201)||(29076368-29076568)
chr8 (1-201)||(29086619-29086819)
chr8 (1-201)||(6150707-6150905)
chr8 (1-201)||(6160662-6160860)
chr8 (1-201)||(19138918-19139117)
chr8 (11-201)||(15781153-15781343)
chr8 (1-199)||(31214650-31214847)
chr8 (1-201)||(20161674-20161873)
chr8 (1-201)||(23469904-23470103)
chr8 (1-201)||(19224572-19224771)
chr8 (1-181)||(19417989-19418169)
chr8 (1-181)||(19428564-19428744)
chr8 (1-201)||(16746638-16746837)
chr8 (1-178)||(18153375-18153550)
chr8 (1-178)||(18157894-18158069)
chr8 (3-177)||(18769605-18769778)
chr8 (1-138)||(13697185-13697323)
chr8 (1-201)||(30315139-30315343)
chr8 (1-185)||(40213628-40213811)
chr8 (21-173)||(22167495-22167644)
chr8 (21-173)||(22136330-22136479)
chr8 (1-118)||(20195623-20195739)
chr8 (21-181)||(3843181-3843338)
chr8 (21-181)||(20260082-20260239)
chr8 (21-181)||(21046712-21046869)
chr8 (21-167)||(7018894-7019037)
chr8 (21-153)||(23363790-23363920)
chr8 (21-135)||(19460656-19460767)
chr8 (21-135)||(19558334-19558445)
chr8 (21-135)||(23271689-23271800)
chr8 (106-201)||(20195697-20195793)
chr8 (21-137)||(22211869-22211982)
chr8 (32-173)||(40002674-40002814)
chr8 (78-173)||(7018854-7018954)
chr8 (22-173)||(17519623-17519772)
chr8 (32-181)||(45568473-45568620)
chr8 (31-135)||(29379054-29379157)
chr8 (32-173)||(21287851-21287990)
chr8 (22-173)||(28902905-28903054)
chr8 (1-60)||(23290538-23290596)
chr8 (1-51)||(15998808-15998858)
chr8 (1-51)||(23270531-23270581)
chr8 (21-137)||(8031492-8031608)
chr8 (77-173)||(21298503-21298600)
chr8 (77-135)||(21540473-21540532)
chr8 (1-48)||(26735573-26735620)
chr8 (83-136)||(24678970-24679024)
chr8 (94-181)||(15934189-15934277)
chr8 (77-127)||(17879154-17879205)
chr8 (78-181)||(1210299-1210405)
chr8 (80-173)||(18557523-18557617)
chr8 (77-173)||(21540443-21540540)
chr8 (125-173)||(22211863-22211911)
chr8 (80-136)||(27739408-27739464)
[»] chr6 (99 HSPs)
chr6 (1-201)||(26043789-26043988)
chr6 (1-201)||(12717256-12717457)
chr6 (1-201)||(12727905-12728106)
chr6 (1-201)||(16930027-16930227)
chr6 (1-201)||(17982921-17983122)
chr6 (1-201)||(17985130-17985331)
chr6 (1-201)||(32962354-32962553)
chr6 (1-201)||(32972973-32973172)
chr6 (11-201)||(16959208-16959398)
chr6 (1-201)||(4630447-4630647)
chr6 (1-201)||(25985657-25985858)
chr6 (1-201)||(26025035-26025235)
chr6 (1-201)||(26035609-26035809)
chr6 (1-201)||(27341270-27341470)
chr6 (1-201)||(27402010-27402210)
chr6 (1-201)||(27412669-27412869)
chr6 (1-201)||(31983046-31983246)
chr6 (1-201)||(32301463-32301663)
chr6 (1-201)||(32312152-32312352)
chr6 (1-201)||(34818212-34818413)
chr6 (1-201)||(9123552-9123751)
chr6 (1-201)||(12854598-12854797)
chr6 (1-201)||(12865124-12865323)
chr6 (1-201)||(27372409-27372608)
chr6 (1-201)||(27462759-27462958)
chr6 (1-201)||(27505519-27505718)
chr6 (1-201)||(34807580-34807782)
chr6 (11-201)||(9112915-9113104)
chr6 (1-201)||(26864362-26864562)
chr6 (1-201)||(26874986-26875186)
chr6 (1-201)||(29384328-29384528)
chr6 (1-201)||(3660960-3661159)
chr6 (1-201)||(3671624-3671823)
chr6 (11-201)||(33198914-33199104)
chr6 (1-185)||(16123972-16124155)
chr6 (1-201)||(28251983-28252181)
chr6 (1-201)||(28357130-28357328)
chr6 (1-180)||(20030345-20030523)
chr6 (1-180)||(20063096-20063274)
chr6 (1-181)||(25787279-25787457)
chr6 (1-181)||(18926204-18926382)
chr6 (14-201)||(7751655-7751841)
chr6 (1-181)||(12827269-12827448)
chr6 (14-201)||(27384024-27384209)
chr6 (1-181)||(7376198-7376378)
chr6 (1-185)||(32756977-32757158)
chr6 (1-185)||(27166878-27167062)
chr6 (1-185)||(31571991-31572175)
chr6 (1-185)||(17746220-17746404)
chr6 (1-181)||(29765112-29765292)
chr6 (14-167)||(27474408-27474559)
chr6 (14-167)||(27503906-27504057)
chr6 (1-185)||(5844662-5844846)
chr6 (1-118)||(12353160-12353277)
chr6 (1-185)||(18826674-18826858)
chr6 (1-185)||(18835069-18835253)
chr6 (21-181)||(22308385-22308544)
chr6 (1-117)||(10404043-10404158)
chr6 (1-113)||(25583489-25583600)
chr6 (93-201)||(27504013-27504121)
chr6 (31-181)||(25687190-25687338)
chr6 (21-173)||(11235095-11235244)
chr6 (21-173)||(25518285-25518434)
chr6 (1-104)||(11147708-11147810)
chr6 (21-173)||(21127676-21127825)
chr6 (93-201)||(27474515-27474622)
chr6 (21-173)||(7586711-7586860)
chr6 (21-137)||(31931050-31931163)
chr6 (21-135)||(17047186-17047297)
chr6 (21-173)||(17742152-17742302)
chr6 (21-137)||(18554897-18555010)
chr6 (21-135)||(11205572-11205683)
chr6 (1-76)||(12416901-12416975)
chr6 (21-137)||(12953586-12953699)
chr6 (21-137)||(19289837-19289950)
chr6 (120-182)||(4292420-4292482)
chr6 (23-173)||(19453076-19453225)
chr6 (20-173)||(14070627-14070778)
chr6 (122-201)||(12353252-12353331)
chr6 (21-132)||(17063827-17063935)
chr6 (77-173)||(17608861-17608958)
chr6 (32-173)||(20635177-20635316)
chr6 (78-136)||(24719301-24719360)
chr6 (78-136)||(24729086-24729145)
chr6 (135-201)||(11147670-11147736)
chr6 (80-173)||(14051946-14052039)
chr6 (78-135)||(14051954-14052012)
chr6 (78-175)||(18027272-18027370)
chr6 (32-173)||(22386260-22386399)
chr6 (106-173)||(31931101-31931169)
chr6 (80-173)||(23006561-23006655)
chr6 (80-173)||(23781711-23781805)
chr6 (21-104)||(9934131-9934211)
chr6 (123-155)||(10820696-10820728)
chr6 (125-173)||(18554968-18555016)
chr6 (21-69)||(22292490-22292538)
chr6 (78-137)||(23006567-23006627)
chr6 (78-137)||(23781739-23781799)
chr6 (78-137)||(32335364-32335424)
[»] chr1 (95 HSPs)
chr1 (1-201)||(33084116-33084316)
chr1 (1-201)||(35404845-35405046)
chr1 (1-201)||(35649144-35649345)
chr1 (1-201)||(38094629-38094830)
chr1 (1-201)||(38105254-38105455)
chr1 (1-201)||(51629640-51629841)
chr1 (1-201)||(51656901-51657102)
chr1 (1-201)||(4177470-4177669)
chr1 (1-201)||(7689912-7690114)
chr1 (1-201)||(7506855-7507056)
chr1 (1-201)||(7517452-7517653)
chr1 (1-201)||(36236882-36237083)
chr1 (1-201)||(36247429-36247630)
chr1 (1-201)||(5640163-5640362)
chr1 (1-201)||(10998237-10998436)
chr1 (1-201)||(12730102-12730301)
chr1 (1-201)||(12740695-12740894)
chr1 (1-201)||(12898434-12898633)
chr1 (1-201)||(21863216-21863415)
chr1 (1-201)||(3171176-3171376)
chr1 (1-201)||(3181778-3181978)
chr1 (1-201)||(5832772-5832972)
chr1 (1-201)||(5843374-5843574)
chr1 (1-201)||(5650720-5650919)
chr1 (1-201)||(12614769-12614968)
chr1 (1-201)||(12624234-12624433)
chr1 (1-201)||(19178514-19178713)
chr1 (1-201)||(19187393-19187592)
chr1 (1-201)||(35012483-35012682)
chr1 (1-201)||(2538090-2538290)
chr1 (1-201)||(21877321-21877521)
chr1 (1-201)||(47608384-47608584)
chr1 (1-201)||(47618992-47619192)
chr1 (1-201)||(35638492-35638690)
chr1 (1-201)||(148666-148866)
chr1 (1-201)||(154741-154941)
chr1 (56-201)||(4166869-4167013)
chr1 (1-201)||(4251017-4251220)
chr1 (1-201)||(5973313-5973512)
chr1 (1-181)||(20441789-20441968)
chr1 (11-177)||(18382381-18382545)
chr1 (1-185)||(17956793-17956977)
chr1 (1-180)||(39586526-39586703)
chr1 (11-181)||(39194566-39194737)
chr1 (1-201)||(7677399-7677598)
chr1 (1-185)||(12944763-12944947)
chr1 (1-134)||(23580816-23580948)
chr1 (23-185)||(11195537-11195698)
chr1 (1-185)||(20196160-20196345)
chr1 (1-163)||(47194758-47194919)
chr1 (21-173)||(22610456-22610605)
chr1 (1-118)||(9050994-9051110)
chr1 (81-181)||(47194896-47194996)
chr1 (21-173)||(14388608-14388760)
chr1 (21-173)||(18311454-18311605)
chr1 (21-181)||(675022-675179)
chr1 (21-178)||(41133095-41133249)
chr1 (21-173)||(5929154-5929302)
chr1 (21-137)||(46181367-46181480)
chr1 (21-173)||(28379437-28379588)
chr1 (21-137)||(20884370-20884483)
chr1 (21-137)||(28473705-28473818)
chr1 (1-70)||(16710388-16710457)
chr1 (78-143)||(19965760-19965825)
chr1 (21-173)||(23926506-23926657)
chr1 (22-173)||(22018775-22018925)
chr1 (32-173)||(34256004-34256142)
chr1 (106-185)||(9050956-9051036)
chr1 (32-163)||(22642318-22642448)
chr1 (21-137)||(45071117-45071230)
chr1 (21-135)||(20251248-20251361)
chr1 (77-173)||(22642391-22642488)
chr1 (32-171)||(17370496-17370633)
chr1 (78-173)||(19037504-19037600)
chr1 (33-173)||(26548744-26548883)
chr1 (122-201)||(23580779-23580857)
chr1 (37-137)||(52351174-52351271)
chr1 (1-51)||(4717686-4717736)
chr1 (21-137)||(44200487-44200604)
chr1 (21-173)||(19170813-19170963)
chr1 (78-136)||(9346299-9346358)
chr1 (78-136)||(16233624-16233683)
chr1 (77-135)||(21543565-21543624)
chr1 (78-175)||(31358825-31358923)
chr1 (106-173)||(46181361-46181429)
chr1 (80-173)||(17025451-17025545)
chr1 (96-137)||(20867341-20867383)
chr1 (80-181)||(26280531-26280633)
chr1 (78-135)||(26280547-26280605)
chr1 (78-166)||(7309312-7309401)
chr1 (80-132)||(22639779-22639832)
chr1 (93-173)||(22654989-22655070)
chr1 (125-173)||(20867335-20867383)
chr1 (123-163)||(23190824-23190864)
chr1 (106-173)||(28473756-28473824)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (1-201)||(30738-30939)
scaffold0133 (1-201)||(42969-43173)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (1-201)||(2706102-2706303)
chr7 (1-201)||(24931093-24931293)
chr7 (1-201)||(26294519-26294719)
chr7 (1-201)||(8627558-8627759)
chr7 (1-201)||(26390586-26390787)
chr7 (1-201)||(26401228-26401429)
chr7 (1-201)||(40042598-40042799)
chr7 (1-201)||(40053147-40053348)
chr7 (1-201)||(166506-166705)
chr7 (1-201)||(177098-177297)
chr7 (1-201)||(9084895-9085094)
chr7 (1-201)||(9094609-9094808)
chr7 (1-201)||(48710981-48711180)
chr7 (6-201)||(37343816-37344010)
chr7 (1-201)||(1987150-1987350)
chr7 (1-201)||(1997771-1997971)
chr7 (1-201)||(2716706-2716907)
chr7 (1-201)||(11004795-11004995)
chr7 (1-201)||(17961214-17961415)
chr7 (1-201)||(24734362-24734563)
chr7 (1-201)||(24744309-24744510)
chr7 (1-201)||(42865437-42865637)
chr7 (1-201)||(42876063-42876263)
chr7 (1-201)||(468071-468270)
chr7 (1-201)||(6867715-6867914)
chr7 (1-201)||(6878347-6878546)
chr7 (1-201)||(8616996-8617196)
chr7 (1-201)||(9432875-9433074)
chr7 (1-201)||(26653815-26654014)
chr7 (1-201)||(26700144-26700343)
chr7 (1-201)||(17950608-17950809)
chr7 (1-201)||(5685130-5685329)
chr7 (1-201)||(9443471-9443670)
chr7 (1-201)||(21003498-21003697)
chr7 (1-201)||(22099349-22099548)
chr7 (1-201)||(4222218-4222418)
chr7 (1-201)||(8002555-8002755)
chr7 (1-201)||(8013200-8013400)
chr7 (1-201)||(20989264-20989463)
chr7 (1-201)||(22088734-22088933)
chr7 (1-201)||(14746159-14746359)
chr7 (1-201)||(588824-589023)
chr7 (1-181)||(31117020-31117199)
chr7 (1-201)||(1367241-1367440)
chr7 (1-201)||(3165346-3165545)
chr7 (1-198)||(20490618-20490814)
chr7 (1-181)||(15888838-15889017)
chr7 (1-181)||(21770452-21770631)
chr7 (1-201)||(30049131-30049330)
chr7 (1-181)||(9159342-9159521)
chr7 (1-181)||(9169797-9169976)
chr7 (1-181)||(40055263-40055442)
chr7 (60-201)||(455289-455429)
chr7 (1-185)||(17064035-17064219)
chr7 (55-201)||(11095717-11095864)
chr7 (1-137)||(4211649-4211785)
chr7 (21-183)||(38403719-38403880)
chr7 (1-134)||(540724-540857)
chr7 (21-173)||(48381818-48381969)
chr7 (21-181)||(18418746-18418904)
chr7 (21-181)||(18440827-18440985)
chr7 (21-181)||(8933196-8933353)
chr7 (21-181)||(13681952-13682109)
chr7 (21-173)||(29589624-29589773)
chr7 (1-118)||(44280135-44280251)
chr7 (21-173)||(3476859-3477008)
chr7 (21-176)||(15215949-15216101)
chr7 (1-118)||(38594256-38594371)
chr7 (21-175)||(12734681-12734832)
chr7 (21-173)||(8999458-8999609)
chr7 (21-137)||(24882945-24883058)
chr7 (21-181)||(26210059-26210216)
chr7 (22-173)||(11087568-11087718)
chr7 (106-201)||(540798-540895)
chr7 (1-69)||(25212471-25212539)
chr7 (106-201)||(44280209-44280305)
chr7 (1-64)||(457618-457681)
chr7 (32-173)||(4412532-4412671)
chr7 (106-201)||(4211724-4211819)
chr7 (106-181)||(38594222-38594298)
chr7 (78-175)||(23125439-23125537)
chr7 (32-173)||(4433105-4433244)
chr7 (1-51)||(19986159-19986209)
chr7 (78-137)||(16308289-16308349)
chr7 (1-49)||(20967280-20967328)
chr7 (22-145)||(13175157-13175279)
chr7 (77-162)||(9802670-9802756)
chr7 (20-167)||(602204-602348)
chr7 (106-173)||(24882939-24883007)
chr7 (78-175)||(11572762-11572860)
chr7 (78-143)||(20094640-20094706)
chr7 (77-136)||(3779277-3779337)
chr7 (108-163)||(9802671-9802727)
chr7 (77-136)||(15304134-15304194)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (1-201)||(18393065-18393266)
chr2 (1-201)||(24338832-24339031)
chr2 (1-201)||(11395600-11395801)
chr2 (1-201)||(11405916-11406117)
chr2 (1-201)||(1099623-1099822)
chr2 (1-201)||(4099415-4099614)
chr2 (1-201)||(4209490-4209689)
chr2 (1-201)||(7006235-7006434)
chr2 (1-201)||(9773732-9773931)
chr2 (1-201)||(11389237-11389436)
chr2 (1-201)||(22915292-22915491)
chr2 (1-201)||(22960760-22960959)
chr2 (1-201)||(24328162-24328361)
chr2 (1-201)||(34477529-34477729)
chr2 (1-201)||(10266594-10266794)
chr2 (1-201)||(10277171-10277371)
chr2 (1-201)||(32217473-32217674)
chr2 (1-201)||(35263191-35263391)
chr2 (1-201)||(35273816-35274016)
chr2 (1-201)||(4220082-4220281)
chr2 (1-201)||(9763196-9763395)
chr2 (1-201)||(16768544-16768743)
chr2 (1-201)||(17857865-17858064)
chr2 (1-201)||(30489252-30489451)
chr2 (1-201)||(40221933-40222132)
chr2 (1-201)||(40250794-40250993)
chr2 (1-201)||(43082255-43082454)
chr2 (1-201)||(27220981-27221181)
chr2 (1-193)||(35252582-35252774)
chr2 (1-201)||(39170523-39170723)
chr2 (1-194)||(9898009-9898204)
chr2 (1-201)||(29243823-29244022)
chr2 (1-201)||(29254402-29254601)
chr2 (1-201)||(34790645-34790844)
chr2 (1-201)||(34804788-34804987)
chr2 (1-201)||(36252272-36252471)
chr2 (1-201)||(43092864-43093063)
chr2 (1-201)||(9908590-9908792)
chr2 (1-201)||(43345008-43345208)
chr2 (1-201)||(43354623-43354823)
chr2 (1-201)||(24415449-24415648)
chr2 (1-201)||(24428014-24428213)
chr2 (1-181)||(28732350-28732529)
chr2 (1-181)||(2561089-2561268)
chr2 (1-181)||(18769353-18769531)
chr2 (1-181)||(21172914-21173095)
chr2 (1-181)||(28721764-28721943)
chr2 (1-159)||(21650975-21651133)
chr2 (1-177)||(26866673-26866847)
chr2 (1-185)||(38586531-38586716)
chr2 (1-177)||(26879262-26879436)
chr2 (1-185)||(27978826-27979009)
chr2 (1-185)||(28065355-28065538)
chr2 (23-185)||(36785243-36785404)
chr2 (33-181)||(22763288-22763434)
chr2 (31-181)||(22773990-22774138)
chr2 (21-181)||(967952-968110)
chr2 (21-181)||(17970718-17970875)
chr2 (21-173)||(19355942-19356091)
chr2 (21-181)||(24274648-24274805)
chr2 (31-181)||(1041781-1041929)
chr2 (21-135)||(19302918-19303029)
chr2 (21-135)||(19498457-19498568)
chr2 (21-137)||(38033296-38033410)
chr2 (21-137)||(19313482-19313595)
chr2 (21-173)||(20647068-20647217)
chr2 (1-88)||(30794410-30794497)
chr2 (32-173)||(23393179-23393318)
chr2 (32-173)||(24802059-24802198)
chr2 (32-173)||(24815026-24815165)
chr2 (33-173)||(1083465-1083603)
chr2 (38-135)||(19300477-19300571)
chr2 (81-166)||(16587510-16587596)
chr2 (78-181)||(21911368-21911473)
chr2 (21-137)||(22754939-22755054)
chr2 (78-136)||(21845679-21845738)
chr2 (78-137)||(22383002-22383062)
chr2 (123-162)||(21548821-21548860)
chr2 (80-173)||(22382974-22383068)
chr2 (21-70)||(38040521-38040569)
chr2 (106-181)||(19313468-19313544)
[»] chr5 (134 HSPs)
chr5 (1-201)||(10755021-10755220)
chr5 (1-201)||(40401548-40401747)
chr5 (1-201)||(14446532-14446732)
chr5 (1-201)||(14457144-14457344)
chr5 (1-201)||(14557547-14557748)
chr5 (1-201)||(14568184-14568385)
chr5 (1-201)||(23296806-23297007)
chr5 (1-201)||(23307374-23307575)
chr5 (1-201)||(23707971-23708172)
chr5 (1-201)||(30227026-30227227)
chr5 (1-201)||(30237553-30237754)
chr5 (1-201)||(39490480-39490681)
chr5 (1-201)||(39501670-39501871)
chr5 (1-201)||(40513519-40513720)
chr5 (1-201)||(5290107-5290307)
chr5 (1-201)||(5300678-5300878)
chr5 (1-201)||(15992861-15993060)
chr5 (1-201)||(16003423-16003622)
chr5 (1-196)||(22676651-22676847)
chr5 (1-196)||(22686542-22686738)
chr5 (1-201)||(27602950-27603149)
chr5 (1-201)||(39353017-39353216)
chr5 (1-201)||(39365010-39365209)
chr5 (1-201)||(40390886-40391085)
chr5 (1-196)||(42043318-42043514)
chr5 (1-196)||(42053893-42054089)
chr5 (1-201)||(9376993-9377193)
chr5 (1-201)||(14041126-14041326)
chr5 (1-201)||(15693563-15693763)
chr5 (1-201)||(15740497-15740697)
chr5 (1-201)||(15769657-15769857)
chr5 (1-201)||(17607588-17607788)
chr5 (1-201)||(17618203-17618403)
chr5 (1-201)||(17719446-17719646)
chr5 (1-201)||(17730098-17730298)
chr5 (1-201)||(23697313-23697514)
chr5 (1-201)||(24567618-24567818)
chr5 (1-201)||(24808441-24808641)
chr5 (1-201)||(24816417-24816617)
chr5 (1-201)||(24827005-24827205)
chr5 (1-201)||(27041743-27041943)
chr5 (1-201)||(27052367-27052567)
chr5 (1-201)||(27460690-27460890)
chr5 (1-201)||(27471089-27471289)
chr5 (1-201)||(31349062-31349262)
chr5 (1-201)||(31359676-31359876)
chr5 (1-201)||(33951330-33951531)
chr5 (1-201)||(35216035-35216235)
chr5 (1-201)||(35226619-35226819)
chr5 (1-201)||(37728783-37728983)
chr5 (1-201)||(37740099-37740299)
chr5 (1-201)||(6131320-6131519)
chr5 (1-196)||(6976343-6976539)
chr5 (1-196)||(6986833-6987029)
chr5 (1-201)||(9347071-9347270)
chr5 (1-201)||(23362640-23362839)
chr5 (1-201)||(27622299-27622498)
chr5 (1-201)||(30069435-30069635)
chr5 (1-201)||(14030573-14030773)
chr5 (1-201)||(31834012-31834215)
chr5 (1-201)||(31844490-31844693)
chr5 (1-201)||(36582089-36582289)
chr5 (1-201)||(36592644-36592844)
chr5 (1-201)||(36688223-36688423)
chr5 (1-201)||(36698789-36698989)
chr5 (1-201)||(9336484-9336683)
chr5 (1-201)||(22147052-22147250)
chr5 (1-201)||(22157635-22157833)
chr5 (6-201)||(34772439-34772633)
chr5 (6-201)||(34783384-34783578)
chr5 (1-201)||(27204321-27204520)
chr5 (1-201)||(22559966-22560165)
chr5 (1-201)||(31419192-31419391)
chr5 (1-201)||(43043203-43043402)
chr5 (1-201)||(8522370-8522570)
chr5 (13-201)||(20798225-20798412)
chr5 (1-201)||(31449083-31449282)
chr5 (1-201)||(1121434-1121633)
chr5 (1-201)||(42395513-42395712)
chr5 (1-201)||(1108676-1108875)
chr5 (1-181)||(23406995-23407174)
chr5 (1-181)||(36085010-36085189)
chr5 (1-181)||(36229288-36229467)
chr5 (1-177)||(17446228-17446402)
chr5 (1-177)||(34052514-34052688)
chr5 (1-177)||(34063175-34063349)
chr5 (1-185)||(37407193-37407375)
chr5 (1-181)||(43621425-43621605)
chr5 (1-181)||(21702656-21702835)
chr5 (1-181)||(23392950-23393129)
chr5 (1-181)||(20552364-20552544)
chr5 (1-181)||(24925669-24925850)
chr5 (1-181)||(24982950-24983131)
chr5 (1-177)||(17456844-17457018)
chr5 (1-181)||(19464520-19464700)
chr5 (1-181)||(20562874-20563054)
chr5 (1-181)||(19478550-19478730)
chr5 (1-137)||(7031688-7031823)
chr5 (1-181)||(21705496-21705682)
chr5 (21-181)||(20625315-20625474)
chr5 (21-181)||(106669-106827)
chr5 (21-181)||(20417453-20417610)
chr5 (23-181)||(32753501-32753656)
chr5 (21-137)||(13522666-13522779)
chr5 (22-173)||(20215662-20215812)
chr5 (21-173)||(40228099-40228250)
chr5 (21-135)||(40033321-40033434)
chr5 (21-137)||(13403702-13403817)
chr5 (22-173)||(23477817-23477966)
chr5 (21-134)||(35543694-35543804)
chr5 (21-137)||(36096215-36096328)
chr5 (21-137)||(36097672-36097785)
chr5 (21-137)||(20168630-20168743)
chr5 (21-139)||(21420315-21420431)
chr5 (106-201)||(7031762-7031857)
chr5 (21-135)||(1914887-1915000)
chr5 (32-173)||(25112423-25112562)
chr5 (32-173)||(25171514-25171653)
chr5 (20-171)||(11208557-11208706)
chr5 (77-135)||(32160273-32160332)
chr5 (22-135)||(23487993-23488104)
chr5 (32-173)||(32160201-32160340)
chr5 (123-181)||(20550432-20550490)
chr5 (77-133)||(12078356-12078413)
chr5 (106-173)||(13403755-13403823)
chr5 (78-137)||(23589238-23589298)
chr5 (135-173)||(13533474-13533512)
chr5 (80-173)||(20567302-20567396)
chr5 (21-54)||(13533423-13533456)
chr5 (77-137)||(20567329-20567390)
chr5 (106-181)||(1914940-1915016)
chr5 (125-173)||(13522737-13522785)
chr5 (125-181)||(36096201-36096257)
chr5 (125-181)||(36097658-36097714)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (1-201)||(11965-12164)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (1-201)||(7567-7768)
scaffold0105 (1-201)||(37407-37608)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-201)||(40902-41101)
scaffold0047 (1-201)||(33351-33550)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-201)||(2298-2497)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-201)||(7291-7490)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-201)||(7333-7532)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-201)||(37183-37382)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (1-201)||(14191-14390)
scaffold0028 (1-181)||(54592-54771)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-181)||(11075-11254)
scaffold0068 (1-181)||(8228-8414)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (1-181)||(2687-2867)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (23-185)||(12582-12743)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (21-185)||(40130-40292)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (31-181)||(127284-127433)
scaffold0012 (21-173)||(16233-16384)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (21-173)||(1623-1772)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (21-181)||(4925-5082)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (21-181)||(57252-57411)
scaffold0084 (77-121)||(927-971)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (21-173)||(35167-35316)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (21-181)||(10757-10915)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (21-181)||(15356-15514)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (21-173)||(29103-29251)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-77)||(23379-23455)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (21-173)||(32435-32586)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (21-137)||(955-1068)
scaffold2071 (125-173)||(949-997)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (21-137)||(10275-10388)
scaffold0544 (125-173)||(10269-10317)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (21-137)||(1525-1638)
scaffold0443 (106-173)||(1519-1587)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (21-173)||(59374-59523)
scaffold0017 (21-173)||(40828-40979)
scaffold0017 (23-88)||(175011-175074)
scaffold0017 (135-185)||(175062-175112)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-137)||(29282-29395)
scaffold0001 (125-173)||(29276-29324)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (21-140)||(1-118)
scaffold0570 (22-171)||(2192-2339)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (6-98)||(1-91)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (21-137)||(60698-60813)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (21-137)||(376-489)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (1-177)||(18817-19005)
scaffold0099 (86-164)||(17445-17525)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (21-135)||(304-415)
scaffold0090 (21-135)||(4684-4795)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (22-171)||(475770-475918)
scaffold0002 (22-171)||(482290-482438)
scaffold0002 (1-47)||(100226-100272)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-68)||(8650-8717)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (21-137)||(57994-58107)
scaffold0073 (125-173)||(58065-58113)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (21-173)||(61175-61327)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (32-173)||(4572-4712)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (22-181)||(165140-165298)
scaffold0011 (81-173)||(59060-59153)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (1-65)||(1-65)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (32-173)||(4415-4554)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (21-121)||(5331-5427)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (32-173)||(20890-21029)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (21-132)||(38487-38594)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (77-173)||(6970-7067)
scaffold0018 (32-163)||(7010-7139)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (32-135)||(2338-2439)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (21-118)||(13975-14068)
scaffold0349 (106-163)||(14026-14084)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (77-135)||(1-60)
scaffold0211 (77-165)||(1-90)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (32-173)||(1645-1784)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (77-173)||(35144-35241)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-46)||(155682-155727)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (32-163)||(20018-20147)
scaffold0207 (80-172)||(20123-20216)
scaffold0207 (77-135)||(10249-10308)
scaffold0207 (77-135)||(20150-20209)
scaffold0207 (108-173)||(10250-10316)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (77-135)||(38609-38668)
scaffold0132 (80-173)||(38601-38695)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (32-173)||(1452-1591)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (113-150)||(4829-4866)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (78-173)||(3914-4011)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (78-173)||(4528-4625)
scaffold0040 (78-117)||(8279-8318)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (80-179)||(13542-13642)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (77-135)||(9496-9557)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (1-39)||(4437-4475)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (1-38)||(1819-1856)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (77-173)||(11258-11355)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (59-137)||(59775-59851)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (84-135)||(22546-22598)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 5e-95; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18753098 - 18752904
Alignment:
Q  6 caagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18753098 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 18753000  T
Q  106 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18752999 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 18752904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18763713 - 18763514
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18763713 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagt 18763615  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18763614 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 18763515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5022382 - 5022581
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5022382 acttccaaggagatttcactataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagt 5022480  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5022481 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 5022580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17917697 - 17917897
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17917697 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagt 17917796  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17917797 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 17917896  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  17917897 a 17917897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17928345 - 17928545
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17928345 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagt 17928444  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17928445 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 17928544  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  17928545 a 17928545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 450222 - 450421
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  450222 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 450320  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  450321 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 450420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15561693 - 15561494
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15561693 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 15561595  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15561594 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 15561495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19955576 - 19955377
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19955576 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19955478  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19955477 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 19955378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21996059 - 21996258
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21996059 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 21996157  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21996158 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 21996257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22006657 - 22006856
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22006657 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 22006755  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22006756 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 22006855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30927108 - 30926909
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30927108 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 30927010  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30927009 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 30926910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27656244 - 27656445
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27656244 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagag 27656343  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27656344 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27656443  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27656444 ga 27656445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27666817 - 27667018
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27666817 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagag 27666916  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27666917 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27667016  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27667017 ga 27667018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29042271 - 29042071
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29042271 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 29042173  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29042172 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 29042073  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  29042072 ga 29042071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36017981 - 36018181
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36017981 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 36018079  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36018080 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36018179  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36018180 ga 36018181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36028534 - 36028734
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36028534 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 36028632  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36028633 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36028732  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36028733 ga 36028734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 49517780 - 49517980
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49517780 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 49517878  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  49517879 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 49517978  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  49517979 ga 49517980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4947983 - 4948182
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4947983 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 4948081  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4948082 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 4948181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14844267 - 14844068
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14844267 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 14844169  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14844168 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 14844069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19944941 - 19944742
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19944941 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19944843  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19944842 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 19944743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30937686 - 30937487
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30937686 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 30937588  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  30937587 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacggagaattgagtttgaattg 30937488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 48370777 - 48370976
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48370777 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 48370875  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48370876 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 48370975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24028702 - 24028500
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact--tgctcaagcacacacgcaaga 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  24028702 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 24028603  T
Q  99 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  24028602 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 24028503  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  24028502 tga 24028500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18130856 - 18130654
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18130856 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 18130757  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18130756 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 18130657  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  18130656 tga 18130654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24639893 - 24640093
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24639893 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 24639991  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24639992 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24640091  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24640092 ga 24640093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 460803 - 461002
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  460803 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 460901  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  460902 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagaattctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 461001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27815559 - 27815360
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27815559 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 27815461  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27815460 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 27815361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 52703434 - 52703628
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52703434 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 52703532  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52703533 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatgaaacaaaaatacagagaattgagtttga 52703628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10741209 - 10741009
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10741209 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 10741111  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  10741110 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaatt 10741011  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10741010 ga 10741009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10954978 - 10954778
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10954978 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 10954880  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  10954879 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaatt 10954780  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10954779 ga 10954778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55745867 - 55745667
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  55745867 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 55745769  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  55745768 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 55745669  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  55745668 ga 55745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40471201 - 40471002
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40471201 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 40471103  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40471102 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttg 40471003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10751783 - 10751583
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10751783 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 10751685  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  10751684 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaatt 10751585  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10751584 ga 10751583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10965552 - 10965352
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10965552 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 10965454  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  10965453 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttgaatt 10965354  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10965353 ga 10965352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16255512 - 16255711
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16255512 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 16255609  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  16255610 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaatt 16255709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16266105 - 16266304
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16266105 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 16266202  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  16266203 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaatt 16266302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18078522 - 18078321
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18078522 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 18078423  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  18078422 gcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgactt 18078323  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  18078322 ga 18078321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55756478 - 55756278
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  55756478 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 55756380  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  55756379 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgaatt 55756280  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  55756279 ga 55756278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40454963 - 40454764
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40454963 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 40454865  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40454864 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttg 40454765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25656781 - 25656980
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25656781 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 25656879  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25656880 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttg 25656979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 3370359 - 3370543
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3370359 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 3370458  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3370459 cttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagaga 3370543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 3390099 - 3390283
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3390099 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 3390198  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3390199 cttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagaga 3390283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10909053 - 10909252
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10909053 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 10909151  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  10909152 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 10909251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4987024 - 4986845
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  4987024 acttccaagcagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaaacacacacgcaagagt 4986926  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4986925 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 4986845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 10695287 - 10695466
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10695287 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaagcaagagt 10695384  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10695385 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacag 10695466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 16316976 - 16317155
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  16316976 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacaggcaagagt 16317074  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16317075 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 16317155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 16304752 - 16304931
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  16304752 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacaggcaagagt 16304850  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  16304851 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaataaaaataca 16304931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5873017 - 5873215
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||| || ||||||||    
T  5873017 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tactcaagcacgcaggcaagagt 5873114  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |  ||||||||||    
T  5873115 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaatatgtttgacttg 5873214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14836716 - 14836517
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  14836716 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaata-cttaagcacacacgcaagagt 14836618  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  14836617 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttg 14836518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15208001 - 15207827
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||  || ||||||||    
T  15208001 acttccaaggagatttcaccataatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcatgcaggcaagagt 15207904  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15207903 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 15207827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Original strand, 25008546 - 25008689
Alignment:
Q  6 caagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25008546 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 25008644  T
Q  106 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25008645 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgca 25008689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 10300179 - 10300363
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  10300179 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggctagag 10300276  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10300277 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 10300363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 11535489 - 11535673
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  11535489 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagag 11535586  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11535587 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 11535673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 19580886 - 19581054
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  19580886 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggaaagagt 19580983  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||||    
T  19580984 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcgggcaagagtcttttgatcaaa 19581054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 47152662 - 47152528
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  47152662 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 47152565  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47152564 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 47152528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31267386 - 31267223
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  31267386 ataatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 31267289  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31267288 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 31267223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 11514701 - 11514859
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  11514701 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 11514797  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  11514798 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaataca 11514859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 24713072 - 24713234
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||  ||||||||||| || | |||||    
T  24713072 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttcaaaa--tgctcaagcacgcaggaaagag 24713169  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttct 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  24713170 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcagacgagaggcttct 24713234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19143618 - 19143504
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  19143618 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaaacacacacgcaagagt 19143520  T
Q  101 cttccaatgctcaagc 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  19143519 cttccaatgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 19241689 - 19241838
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19241689 ataatcacacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 19241784  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  19241785 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 19241838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49002573 - 49002416
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  49002573 ataatcacacagattacagatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcacta 49002478  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49002477 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattaca 49002416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 55650992 - 55651147
Alignment:
Q  23 aatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa- 121  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||     
T  55650992 aatcacacagattacagatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 55651087  T
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  55651088 gcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagagacttctattcaaacaaaattaca 55651147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 23508813 - 23508926
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  23508813 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 23508908  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23508909 aagcaagagacttctaat 23508926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16819938 - 16819825
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  16819938 ataatcacacagattacaactgctcaatactaacta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 16819843  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16819842 aagcaagagacttctaat 16819825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8183554 - 8183486
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttc 69  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8183554 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttc 8183486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14711368 - 14711253
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  14711368 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 14711272  T
Q  120 -aagcaagagacttctaat 137  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14711271 aaagcaagagacttctaat 14711253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14779032 - 14778917
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  14779032 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 14778936  T
Q  120 -aagcaagagacttctaat 137  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14778935 aaagcaagagacttctaat 14778917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18775272 - 18775123
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||  |||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||      
T  18775272 ataatcacacagattacaactgctcaatactgccta-gtgggagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacgc 18775177  T
Q  121 ag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    || |||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  18775176 aggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 18775123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18007678 - 18007529
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  18007678 ataatcacacagattacaactgcttaatactaccta-gtatgagacttc-caaa--ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 18007583  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    || |||||||||||  |||||||||| |  | | |||||||||||| |||||||    
T  18007582 aatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaaca 18007529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 10290270 - 10290345
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 75  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10290270 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10290345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17994364 - 17994267
Alignment:
Q  37 caactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17994364 caactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17994269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36210699 - 36210587
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||| ||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  36210699 taatcacacagattacaactgctcaagactacacctagtatgagaattcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 36210603  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  36210602 aagcaagagacttcta 36210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 171
Target Start/End: Original strand, 33377860 - 33377997
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  33377860 gattacaacttctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 33377955  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaa 171  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||    
T  33377956 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 33377997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8997831 - 8997740
Alignment:
Q  20 tataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  8997831 tataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtacgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 19570662 - 19570711
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatac 50  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19570662 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 18773578 - 18773637
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  18773578 tgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcacaaatcaatagacttctaat 18773637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 4987052 - 4987098
Alignment:
Q  135 aatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4987052 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 4987098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19889574 - 19889514
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19889574 tgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 19889514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 1671907 - 1671966
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1671907 ttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1671966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1671974
Alignment:
Q  108 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 1671974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 9266768 - 9266854
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagactt 162  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||    
T  9266768 ttgctcaagcacacatacaagagactttcaatactcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 9266854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19889602 - 19889508
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  19889602 ctcaagcacaaaatcaagaggtttcctatgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaaca 19889508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32491444 - 32491346
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 175  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||| | |  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  32491444 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagctcataagcaagagatttcctatgctcaaacacaaaaacaagagacttctaaacaaacaaa 32491346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39532277 - 39532227
Alignment:
Q  135 aatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  39532277 aatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacagaga 39532227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14154601 - 14154528
Alignment:
Q  94 caagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaa 166  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  14154601 caagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaaatgcaagagacttctaa 14154528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Original strand, 24619174 - 24619231
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24619174 ttgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24619231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16819867 - 16819819
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  16819867 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 16819819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18775589 - 18775515
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || |||||||    
T  18775589 ataatcacacagattacaactgctcaatact-gcctagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcaagag 18775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22223334 - 22223290
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22223334 caagagacttctattgctcaagagcgcaggaaaaagacttctaat 22223290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Original strand, 23508884 - 23508932
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  23508884 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 23508932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 150)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6490957 - 6490758
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6490957 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagt 6490859  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6490858 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 6490759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6501611 - 6501412
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6501611 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagt 6501513  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6501512 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 6501413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9994501 - 9994302
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9994501 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagt 9994403  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9994402 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 9994303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9982493 - 9982294
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9982493 acttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagt 9982395  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9982394 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 9982295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12238221 - 12238022
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12238221 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagaacacacgcaagagt 12238123  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12238122 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 12238023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12250047 - 12249848
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12250047 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaagagt 12249949  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12249948 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttataatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 12249849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24384129 - 24383928
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24384129 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 24384030  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24384029 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24383930  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24383929 ga 24383928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13557201 - 13557400
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13557201 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 13557299  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13557300 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 13557399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19778012 - 19778211
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19778012 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19778110  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19778111 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 19778210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19788649 - 19788848
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19788649 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19788747  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19788748 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 19788847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 23647375 - 23647575
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23647375 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 23647474  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23647475 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 23647574  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  23647575 a 23647575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 23756925 - 23757124
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23756925 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 23757023  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23757024 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 23757123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 23767521 - 23767720
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23767521 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 23767619  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23767620 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 23767719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5580244 - 5580043
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5580244 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 5580145  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5580144 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5580045  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5580044 ga 5580043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5628628 - 5628427
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5628628 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 5628529  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5628528 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5628429  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5628428 ga 5628427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5866306 - 5866105
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  5866306 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 5866207  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5866206 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5866107  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5866106 ga 5866105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5876905 - 5876704
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  5876905 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 5876806  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5876805 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5876706  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5876705 ga 5876704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18483670 - 18483870
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18483670 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 18483768  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18483769 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 18483868  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  18483869 ga 18483870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 20720738 - 20720939
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  20720738 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 20720837  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20720838 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 20720937  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  20720938 ga 20720939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6181136 - 6180937
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6181136 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6181038  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6181037 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 6180938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6221310 - 6221111
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6221310 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6221212  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6221211 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 6221112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12297412 - 12297216
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12297412 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 12297313  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12297312 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 12297216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13121289 - 13121488
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13121289 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 13121387  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13121388 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 13121487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13131531 - 13131730
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13131531 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 13131629  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13131630 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 13131729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14475848 - 14476047
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14475848 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 14475946  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14475947 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 14476046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39673491 - 39673292
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39673491 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 39673393  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39673392 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 39673293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 504777 - 504577
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  504777 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 504679  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  504678 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 504579  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  504578 ga 504577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 527143 - 526943
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  527143 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 527045  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  527044 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 526945  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  526944 ga 526943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4743364 - 4743564
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4743364 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 4743462  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4743463 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 4743562  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  4743563 ga 4743564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4753951 - 4754151
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4753951 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 4754049  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4754050 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 4754149  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  4754150 ga 4754151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8774283 - 8774483
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8774283 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 8774381  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8774382 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 8774481  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  8774482 ga 8774483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10098694 - 10098894
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10098694 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 10098792  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10098793 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 10098892  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10098893 ga 10098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16385701 - 16385901
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16385701 acttccaaggagattttactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 16385799  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16385800 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 16385899  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  16385900 ga 16385901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35187003 - 35187203
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35187003 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 35187101  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35187102 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 35187201  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  35187202 ga 35187203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 38194350 - 38194550
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38194350 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 38194448  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38194449 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 38194548  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  38194549 ga 38194550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 38204886 - 38205086
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38204886 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 38204984  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38204985 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 38205084  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  38205085 ga 38205086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 39382316 - 39382516
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39382316 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 39382414  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39382415 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 39382514  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  39382515 ga 39382516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 41683304 - 41683504
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41683304 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 41683402  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41683403 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 41683502  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  41683503 ga 41683504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 41693873 - 41694073
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41693873 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 41693971  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41693972 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 41694071  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  41694072 ga 41694073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4175365 - 4175166
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4175365 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 4175267  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4175266 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 4175167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5537629 - 5537430
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5537629 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 5537531  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  5537530 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattg 5537431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5548213 - 5548014
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5548213 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 5548115  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  5548114 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattg 5548015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12287590 - 12287394
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12287590 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 12287491  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12287490 tcttccaatgctcaagcactaaccaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 12287394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37866072 - 37866271
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37866072 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 37866170  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37866171 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 37866270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37885205 - 37885404
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37885205 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 37885303  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37885304 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 37885403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5510322 - 5510522
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5510322 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 5510420  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5510421 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5510520  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5510521 ga 5510522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5520500 - 5520700
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5520500 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 5520598  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5520599 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5520698  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5520699 ga 5520700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11272994 - 11272793
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11272994 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagag 11272895  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11272894 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 11272795  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  11272794 ga 11272793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24659526 - 24659726
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24659526 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 24659624  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  24659625 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaatt 24659724  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24659725 ga 24659726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24670106 - 24670306
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24670106 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 24670204  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  24670205 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaatt 24670304  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24670305 ga 24670306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 39371679 - 39371879
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39371679 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaagag 39371777  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39371778 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 39371877  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  39371878 ga 39371879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20673802 - 20673603
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20673802 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 20673704  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20673703 cttccaatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 20673604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20684386 - 20684188
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20684386 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 20684289  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20684288 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 20684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37759296 - 37759495
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37759296 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 37759394  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37759395 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 37759494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28314842 - 28314641
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28314842 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 28314744  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  28314743 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaat 28314644  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  28314643 tga 28314641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13373276 - 13373075
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  13373276 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagag 13373177  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13373176 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 13373077  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  13373076 ga 13373075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13394464 - 13394263
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  13394464 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagag 13394365  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13394364 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 13394265  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  13394264 ga 13394263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10627550 - 10627350
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10627550 acttccaaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagt 10627452  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10627451 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgactt 10627352  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10627351 ga 10627350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 23635336 - 23635535
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23635336 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 23635434  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23635435 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttg 23635534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24707164 - 24706964
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24707164 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 24707065  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24707064 cttccaatgctcaagcactaagcaagagatttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacagtgaattaagtttgacttg 24706965  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  24706964 a 24706964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10655872 - 10655672
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  10655872 acttccaaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaaacacacacgcaagagt 10655774  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10655773 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgactt 10655674  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10655673 ga 10655672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13383870 - 13383669
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||    
T  13383870 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagag 13383771  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13383770 tcttccaatgctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 13383671  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  13383670 ga 13383669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28325456 - 28325257
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28325456 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 28325358  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  28325357 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaa--gcacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaat 28325260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1795092 - 1794895
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1795092 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 1794994  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  1794993 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgactt 1794895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 11163457 - 11163636
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11163457 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacacgcaagagt 11163554  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11163555 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacag 11163636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29472663 - 29472474
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472663 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 29472565  T
Q  111 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  29472564 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttga 29472474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9391812 - 9391633
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9391812 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9391714  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9391713 cttcccatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 9391633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13262281 - 13262098
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  13262281 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacaggcaagagt 13262183  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13262182 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagaga 13262098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29461821 - 29461622
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29461821 acttccaaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 29461723  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  29461722 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 29461623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 48336868 - 48337047
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48336868 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 48336966  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48336967 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 48337047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 933253 - 933433
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  933253 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 933351  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  933352 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 933433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11217333 - 11217154
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  11217333 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcactcacgcaagagt 11217235  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11217234 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 11217154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19887962 - 19887783
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19887962 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19887864  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19887863 cttccaatgctcaagcactaagcaagaatcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 19887783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7795206 - 7795036
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattaca-actgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795206 agatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 7795108  T
Q  110 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7795107 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 7795036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7805127 - 7804949
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattaca-actgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7805127 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 7805029  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7805028 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 7804949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1784679 - 1784482
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1784679 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 1784581  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  1784580 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgattaaacaaaaatacaaagaaataagtttgactt 1784482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 4403900 - 4404079
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  4403900 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 4403997  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4403998 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacag 4404079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 4433387 - 4433566
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  4433387 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 4433484  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4433485 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacag 4433566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9381256 - 9381087
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9381256 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagt-gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9381158  T
Q  111 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9381157 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 9381087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17910614 - 17910441
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaa-ctgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17910614 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 17910516  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17910515 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaa 17910441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11206682 - 11206503
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  11206682 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacatacgcaagagt 11206584  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11206583 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 11206503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8740729 - 8740551
Alignment:
Q  6 caagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttc 104  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8740729 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagtcttc 8740632  T
Q  105 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8740631 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 8740551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14258673 - 14258499
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  14258673 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 14258576  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14258575 cttccaatgctcaagcactaagcaggagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 14258499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 38314326 - 38314500
Alignment:
Q  6 caagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  38314326 caaggagatttcactataaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacagacaagagtctacc 38314423  T
Q  106 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacag 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38314424 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacag 38314500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 9535235 - 9535415
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  9535235 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 9535333  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9535334 tcttccaatgctcaagcgctaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 9535415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8996566 - 8996382
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||    
T  8996566 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagag 8996469  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8996468 ttttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 8996382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14322289 - 14322117
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  14322289 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaactatgagacttctcaaaa--tgctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgc 14322192  T
Q  111 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14322191 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggctagaggcttctgttcaaacaaaaatacagaga 14322117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 16076575 - 16076738
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16076575 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcacta 16076672  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16076673 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 16076738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9007118 - 9006934
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||  || |||||||    
T  9007118 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcatgcaggcaagag 9007021  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9007020 tcttccaatgctcaagctctaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 9006934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 27883008 - 27883192
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  27883008 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagag 27883105  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  27883106 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagaga 27883192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 8784897 - 8785034
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8784897 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 8784995  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  8784996 tcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaat 8785034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29934148 - 29933990
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29934148 ataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 29934052  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29934051 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaaattaca 29933990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29983302 - 29983144
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29983302 ataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 29983206  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29983205 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaaattaca 29983144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Original strand, 1053355 - 1053510
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  1053355 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcacta 1053452  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  1053453 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacgaaaa 1053510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16671766 - 16671587
Alignment:
Q  6 caagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttc 104  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||  |||||||||||||| || |||| ||||    
T  16671766 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctctaaa--tgctcaagcacacaggcgagagacttc 16671669  T
Q  105 caatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | || || |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  16671668 caatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacatgcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagaga 16671587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 2246013 - 2246162
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  2246013 ataatcacacagattacaactgctcaatactctcaa-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 2246108  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2246109 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 2246162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17282022 - 17281864
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  17282022 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 17281926  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17281925 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaataca 17281864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Original strand, 1063784 - 1063939
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||     
T  1063784 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcacta 1063881  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  1063882 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagaggcttctaatcaaacgaaaa 1063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15194638 - 15194516
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15194638 agatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacacaagagtcttccaatg 15194540  T
Q  110 ctcaagcactaagcaagagacttc 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  15194539 ctcaagcactaagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29906769 - 29906611
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29906769 ataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcccta 29906673  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  29906672 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattaca 29906611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29947934 - 29947776
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29947934 ataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcccta 29947838  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  29947837 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattaca 29947776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29997088 - 29996930
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29997088 ataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcccta 29996992  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  29996991 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattaca 29996930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 13601860 - 13601973
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13601860 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcacacacgcaagagt 13601958  T
Q  101 cttccaatgctcaag 115  Q
    |||||||||||||||    
T  13601959 cttccaatgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18857532 - 18857426
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18857532 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 18857435  T
Q  111 tcaagcact 119  Q
    |||||||||    
T  18857434 tcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 28168737 - 28168870
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  28168737 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcacgcacgcaagagt 28168835  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 134  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28168836 cttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttct 28168870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 14465332 - 14465417
Alignment:
Q  116 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14465332 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 14465417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13199833 - 13199676
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  13199833 ataatcacacagattacaaatgcttaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 13199738  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13199737 aagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaattaca 13199676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51989736 - 51989587
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  51989736 ataatcatacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 51989641  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||    
T  51989640 aagcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaaca 51989587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15663323 - 15663180
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  15663323 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 15663228  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaat 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||    
T  15663227 aagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 15663180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15663240 - 15663144
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15663240 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 15663144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24393420 - 24393356
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24393420 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 24393356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Original strand, 8784989 - 8785068
Alignment:
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8784989 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 8785068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Original strand, 17006638 - 17006788
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  17006638 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 17006734  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||||||||| || |||||||    
T  17006735 aagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaaca 17006788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31114577 - 31114428
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  31114577 ataatcacacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcaataa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 31114482  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  31114481 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 31114428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 33650827 - 33650901
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 75  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33650827 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 33650901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 41045186 - 41045337
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   || |||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41045186 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgttcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 41045282  T
Q  120 -aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||    | ||||||||||||||||||||||    
T  41045283 aaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctaatcaaaca 41045337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Original strand, 22150690 - 22150840
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || | ||||| |||||  ||||||||||||     
T  22150690 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcacta 22150786  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  22150787 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 22150840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 14580786 - 14580937
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagcac 118  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||    
T  14580786 ataatctcacagattacaactgctcaatactttcaa-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttctcaaatgctcaagcac 14580881  T
Q  119 taag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
      || ||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  14580882 gcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 14580937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15651603 - 15651509
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  15651603 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagagacttctaatcaaaca 15651509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15651688 - 15651568
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||  | || |||| |||||||| ||||||||||     
T  15651688 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcacta 15651593  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaag 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  15651592 aagcaagagtcttctaatgctcaag 15651568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19121449 - 19121375
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 75  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19121449 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 19121375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Original strand, 27172514 - 27172622
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  27172514 ataatcacacagattacaactgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 27172609  T
Q  120 aagcaagagactt 132  Q
    |||||||||||||    
T  27172610 aagcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 17017474 - 17017586
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  17017474 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 17017570  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  17017571 aagcaagagacttcta 17017586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 10528818 - 10528931
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  10528818 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcataaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 10528914  T
Q  120 -aagcaagagacttcta 135  Q
     ||||||||||||||||    
T  10528915 aaagcaagagacttcta 10528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 13953718 - 13953857
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  13953718 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 13953813  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  13953814 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 13953857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 17961073 - 17961149
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttct--aatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17961073 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcaaatgctcaagcacacaggcaagagacttctattcaaacaaaaata 17961149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Original strand, 28168811 - 28168891
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28168811 aatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagaga 28168891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 11530424 - 11530474
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 51  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11530424 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 15832863 - 15833002
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  15832863 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 15832958  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||  |  | |||||||||||||| |||||||    
T  15832959 cttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaaca 15833002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 136
Target Start/End: Original strand, 37412091 - 37412193
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  37412091 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 37412186  T
Q  130 cttctaa 136  Q
    |||||||    
T  37412187 cttctaa 37412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 49989758 - 49989855
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  49989758 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 49989855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 51340508 - 51340605
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||    | |||||||||||||| |||||||    
T  51340508 ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctattcaaaca 51340605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45862263 - 45862162
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45862263 gattacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagaga 45862168  T
Q  130 cttcta 135  Q
    ||||||    
T  45862167 cttcta 45862162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11909745 - 11909606
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||    
T  11909745 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagaga 11909650  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  11909649 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 11909606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12753326 - 12753187
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||    
T  12753326 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagaga 12753231  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  12753230 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 12753187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006081
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 18006081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 15848700 - 15848796
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||    
T  15848700 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctattcaaaca 15848796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 173
Target Start/End: Original strand, 21735868 - 21735906
Alignment:
Q  135 aatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21735868 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 21735906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Original strand, 21735817 - 21735896
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttc 104  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  21735817 ataatcacacaaattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4243753 - 4243694
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  4243753 tgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttctaa 4243694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 162
Target Start/End: Original strand, 11074019 - 11074058
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagactt 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11074019 caagagacttctattgctcaagcacgcaggcaagagactt 11074058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 163
Target Start/End: Original strand, 15848669 - 15848756
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||    
T  15848669 ttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 115
Target Start/End: Original strand, 8710417 - 8710455
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8710417 ttgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 115
Target Start/End: Original strand, 9062304 - 9062342
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9062304 ttgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 173
Target Start/End: Original strand, 52919976 - 52920026
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  52919976 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaaca 52920026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13410680 - 13410623
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttct 134  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13410680 tgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttct 13410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Original strand, 18005989 - 18006049
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaa--tgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18005989 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcagatgctcaagcacacaggcaagagacttc 18006049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Original strand, 8710404 - 8710444
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  8710404 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 8710444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Original strand, 9062291 - 9062331
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  9062291 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 9062331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22770493 - 22770433
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22770493 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 22770433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36292557 - 36292758
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36292557 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 36292656  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36292657 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaatt 36292756  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36292757 ga 36292758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36303160 - 36303361
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36303160 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 36303259  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36303260 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgaatt 36303359  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36303360 ga 36303361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 241460 - 241656
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  241460 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 241559  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  241560 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 241656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 252045 - 252241
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  252045 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 252144  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  252145 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 252241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 794815 - 795011
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  794815 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 794914  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  794915 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 795011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 849611 - 849415
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  849611 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 849512  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  849511 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 849415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26110869 - 26111068
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26110869 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 26110967  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26110968 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 26111067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13689212 - 13689011
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13689212 actttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagag 13689113  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13689112 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 13689013  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  13689012 ga 13689011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 210797 - 210601
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  210797 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 210698  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  210697 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattga 210601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 724420 - 724224
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  724420 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 724321  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  724320 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattga 724224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9857119 - 9856920
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9857119 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9857021  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9857020 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 9856921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43247963 - 43248162
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43247963 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 43248061  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43248062 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 43248161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26120544 - 26120746
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--ttgctcaagcacacacgcaaga 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  26120544 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaaga 26120643  T
Q  99 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26120644 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 26120743  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  26120744 tga 26120746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3349270 - 3349070
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3349270 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 3349172  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3349171 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 3349072  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  3349071 ga 3349070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3359867 - 3359667
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3359867 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 3359769  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3359768 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 3359669  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  3359668 ga 3359667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 9340781 - 9340981
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9340781 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 9340879  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9340880 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 9340979  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  9340980 ga 9340981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 9367925 - 9368125
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9367925 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 9368023  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9368024 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 9368123  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  9368124 ga 9368125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36077574 - 36077774
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36077574 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 36077672  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36077673 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36077772  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36077773 ga 36077774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36088160 - 36088360
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36088160 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 36088258  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36088259 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36088358  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36088359 ga 36088360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 44480728 - 44480928
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44480728 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 44480826  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  44480827 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 44480926  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  44480927 ga 44480928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 44491344 - 44491544
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44491344 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 44491442  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  44491443 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 44491542  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  44491543 ga 44491544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3220270 - 3220469
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3220270 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 3220368  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3220369 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaaacacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 3220468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6319158 - 6318959
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6319158 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6319060  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6319059 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 6318960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15791942 - 15791742
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15791942 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagt 15791843  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15791842 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 15791743  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  15791742 a 15791742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18449008 - 18449207
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18449008 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 18449106  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18449107 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 18449206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19128386 - 19128585
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19128386 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19128484  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19128485 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 19128584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32078338 - 32078139
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32078338 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 32078240  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  32078239 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattg 32078140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32088911 - 32088712
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32088911 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 32088813  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  32088812 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattg 32088713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 29076368 - 29076568
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29076368 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 29076466  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29076467 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 29076566  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  29076567 ga 29076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 29086619 - 29086819
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29086619 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 29086717  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29086718 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 29086817  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  29086818 ga 29086819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6150707 - 6150905
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6150707 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6150804  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6150805 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 6150904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6160662 - 6160860
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6160662 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6160759  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6160760 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 6160859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19138918 - 19139117
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19138918 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatt-ctcaagcacacacgcaagagt 19139016  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19139017 cttccaatgctcaagcgctaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 19139116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15781343 - 15781153
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15781343 agatttcactataatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgc 15781244  T
Q  111 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15781243 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 15781153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 31214650 - 31214847
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31214650 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 31214748  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  31214749 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgactt 31214847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20161873 - 20161674
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20161873 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 20161775  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  20161774 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 20161675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23470103 - 23469904
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23470103 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 23470005  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  23470004 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 23469905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19224572 - 19224771
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19224572 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaat-gcttaagcacacacgcaagagt 19224670  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  19224671 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 19224770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 19417989 - 19418169
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19417989 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 19418087  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19418088 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 19418169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 19428564 - 19428744
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19428564 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 19428662  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19428663 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 19428744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16746638 - 16746837
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16746638 acttccaaggagattttactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 16746736  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  16746737 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagactcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttg 16746836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 18153375 - 18153550
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18153375 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaagcaagagt 18153472  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18153473 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaat 18153550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 18157894 - 18158069
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18157894 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaagcaagagt 18157991  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18157992 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaat 18158069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18769778 - 18769605
Alignment:
Q  3 tttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtct 102  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  18769778 tttcaaggagatttcaccataatcacaaagattaaaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacagacgcaagagtct 18769680  T
Q  103 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769679 tccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 18769605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13697323 - 13697185
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13697323 actttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagag 13697224  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697223 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13697185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30315343 - 30315139
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  30315343 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagat-gctcaagcacacacgcaagagt 30315245  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggc-----aagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttg 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||    
T  30315244 cttccgatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagataagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttg 30315145  T
Q  196 acttga 201  Q
    ||||||    
T  30315144 acttga 30315139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40213811 - 40213628
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || |||| |||    
T  40213811 acttccaaggagatttcactataatcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacgcaggcaaaagt 40213713  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  40213712 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatattcaaacaaaaatacagaga 40213628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22167644 - 22167495
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22167644 ataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 22167549  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22167548 aagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 22167495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22136479 - 22136330
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22136479 ataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 22136384  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  22136383 aagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgagagacttctaatcaaaca 22136330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 20195623 - 20195739
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20195623 acttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcacacacgcaagagt 20195721  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac 118  Q
    |||| |||||||||||||    
T  20195722 cttctaatgctcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 3843181 - 3843338
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  3843181 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 3843276  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  3843277 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaattaca 3843338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20260239 - 20260082
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||  | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  20260239 ataatcacacagattacaaatgctcagtactcacta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 20260144  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20260143 aagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 20260082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21046869 - 21046712
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||  | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  21046869 ataatcacacagattacaaatgctcagtactcacta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 21046774  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21046773 aagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 21046712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7019037 - 7018894
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  7019037 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 7018942  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaat 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||    
T  7018941 aagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 7018894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 23363790 - 23363920
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||||     
T  23363790 ataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 23363886  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggc 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23363887 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 23363920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 19460656 - 19460767
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  19460656 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactc 19460751  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
     |||||||||||||||    
T  19460752 gagcaagagacttcta 19460767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 19558334 - 19558445
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  19558334 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactc 19558429  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
     |||||||||||||||    
T  19558430 gagcaagagacttcta 19558445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23271800 - 23271689
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  23271800 ataatcacacagattacaactactcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 23271705  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  23271704 aagcaagagacttcta 23271689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 20195697 - 20195793
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  20195697 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttga 20195793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22211982 - 22211869
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   |||||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  22211982 ataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 22211887  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22211886 aagcaagagacttctaat 22211869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 40002674 - 40002814
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||   |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  40002674 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaa---ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 40002770  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  40002771 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 40002814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7018954 - 7018854
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcagg----caagagacttctaatcaaac 172  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    | ||||||||||||||||||    
T  7018954 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgatcgagagacttctaatcaaac 7018855  T
Q  173 a 173  Q
    |    
T  7018854 a 7018854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17519772 - 17519623
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  |||| |||||||     
T  17519772 taatcacacagattacaactgatcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcacta 17519676  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  17519675 aagcaaaagacttct-atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 17519623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45568620 - 45568473
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  45568620 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 45568525  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45568524 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattaca 45568473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Original strand, 29379054 - 29379157
Alignment:
Q  31 agattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagag 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  29379054 agattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 29379150  T
Q  129 acttcta 135  Q
    |||||||    
T  29379151 acttcta 29379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 21287851 - 21287990
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  21287851 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 21287946  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  21287947 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 21287990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Original strand, 28902905 - 28903054
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  || ||||||||| | |    |||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||||    
T  28902905 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagcatgagactttaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcacta 28903000  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  28903001 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 28903054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 23290538 - 23290596
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagta 60  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23290538 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagta 23290596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15998858 - 15998808
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 51  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15998858 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23270581 - 23270531
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 51  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23270581 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 8031492 - 8031608
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-c 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   ||||| |||||  |||||||||| |    
T  8031492 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcagc 8031588  T
Q  119 t-aagcaagagacttctaat 137  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  8031589 taaagcaagagacttctaat 8031608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 21298503 - 21298600
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  21298503 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 21298600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 21540473 - 21540532
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21540473 ttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttcta 21540532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 26735620 - 26735573
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaat 48  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26735620 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678970
Alignment:
Q  83 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc-actaagcaagagacttctaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttctaa 24678970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15934277 - 15934189
Alignment:
Q  94 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15934277 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattaca 15934189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 127
Target Start/End: Original strand, 17879154 - 17879205
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaaga 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17879154 ttgctcaagcacacaagcaagagactttcaatgctcaagcacataagcaaga 17879205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1210405 - 1210299
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt-cta-atgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 174  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||| |  | |||| |||||||||| |||||||    
T  1210405 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatatgctcaagcacagaagcaaaagacttctaaacaaacaa 1210306  T
Q  175 aaataca 181  Q
    || ||||    
T  1210305 aattaca 1210299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Original strand, 18557523 - 18557617
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| ||| |||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  18557523 ctcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgttcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaaca 18557617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 21540443 - 21540540
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |  | | |||||||||||| |||||||    
T  21540443 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttctattcaaaca 21540540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22211911 - 22211863
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  22211911 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 22211863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 136
Target Start/End: Original strand, 27739408 - 27739464
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 136  Q
    |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27739408 ctcaagcacacaagtaagagatttcctatgctcaagcagaaagcaagagacttctaa 27739464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 99)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26043789 - 26043988
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26043789 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagct-gctcaagcacacacgcaagagt 26043887  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26043888 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 26043987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12717457 - 12717256
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12717457 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 12717358  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  12717357 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 12717258  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  12717257 ga 12717256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12728106 - 12727905
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12728106 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 12728007  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  12728006 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 12727907  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  12727906 ga 12727905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16930027 - 16930227
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16930027 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 16930125  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16930126 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 16930225  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  16930226 ga 16930227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17983122 - 17982921
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17983122 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 17983023  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17983022 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17982923  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17982922 ga 17982921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17985331 - 17985130
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17985331 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 17985232  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17985231 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17985132  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17985131 ga 17985130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32962553 - 32962354
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32962553 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 32962455  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32962454 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 32962355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32973172 - 32972973
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32973172 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 32973074  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32973073 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 32972974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Original strand, 16959208 - 16959398
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959208 agatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 16959306  T
Q  110 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16959307 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 16959398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4630447 - 4630647
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4630447 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 4630545  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4630546 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 4630645  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  4630646 ga 4630647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25985657 - 25985858
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25985657 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 25985756  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25985757 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 25985856  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  25985857 ga 25985858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26025035 - 26025235
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26025035 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 26025133  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26025134 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 26025233  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  26025234 ga 26025235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26035609 - 26035809
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26035609 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 26035707  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26035708 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 26035807  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  26035808 ga 26035809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27341270 - 27341470
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27341270 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 27341368  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27341369 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27341468  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27341469 ga 27341470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27402010 - 27402210
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27402010 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 27402108  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27402109 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27402208  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27402209 ga 27402210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27412669 - 27412869
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27412669 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 27412767  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27412768 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27412867  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27412868 ga 27412869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31983246 - 31983046
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31983246 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 31983148  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31983147 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 31983048  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  31983047 ga 31983046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32301663 - 32301463
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32301663 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 32301565  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  32301564 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 32301465  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  32301464 ga 32301463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32312352 - 32312152
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32312352 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 32312254  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  32312253 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 32312154  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  32312153 ga 32312152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34818413 - 34818212
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34818413 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 34818314  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  34818313 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 34818214  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  34818213 ga 34818212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9123751 - 9123552
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9123751 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9123653  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9123652 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 9123553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 12854598 - 12854797
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12854598 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12854696  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12854697 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12854796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 12865124 - 12865323
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12865124 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12865222  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12865223 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12865322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27372409 - 27372608
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27372409 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagt 27372507  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27372508 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 27372607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27462759 - 27462958
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27462759 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagt 27462857  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27462858 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 27462957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27505519 - 27505718
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27505519 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagt 27505617  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27505618 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 27505717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34807782 - 34807580
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact--tgctcaagcacacacgcaaga 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  34807782 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 34807683  T
Q  99 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  34807682 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 34807583  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  34807582 tga 34807580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9113104 - 9112915
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113104 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9113006  T
Q  111 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9113005 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 9112915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26864362 - 26864562
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26864362 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 26864460  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26864461 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 26864560  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  26864561 ga 26864562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26874986 - 26875186
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26874986 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 26875084  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26875085 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 26875184  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  26875185 ga 26875186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 29384328 - 29384528
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29384328 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 29384426  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29384427 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 29384526  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  29384527 ga 29384528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3660960 - 3661159
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3660960 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 3661058  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3661059 cttccaatgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 3661158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3671624 - 3671823
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3671624 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 3671722  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3671723 cttccaatgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 3671822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Original strand, 33198914 - 33199104
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198914 agatttgactataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 33199013  T
Q  111 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33199014 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttga 33199104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16124155 - 16123972
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16124155 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 16124057  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16124056 cttccaatgctaaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctattcaaacaaaaatacagaga 16123972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28252181 - 28251983
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  28252181 acttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagaga 28252083  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28252082 cttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagacaattgagtttgacttg 28251984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28357328 - 28357130
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  28357328 acttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagaga 28357230  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28357229 cttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagacaattgagtttgacttg 28357131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20030523 - 20030345
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20030523 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 20030425  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20030424 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatac 20030345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20063274 - 20063096
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20063274 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 20063176  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20063175 cttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatac 20063096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 25787279 - 25787457
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25787279 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctcaaaa--tgctcaagcacacacgcaagagt 25787376  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25787377 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 25787457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18926382 - 18926204
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  18926382 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatt--ctcaagcacacaggcaagagt 18926285  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18926284 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 18926204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7751841 - 7751655
Alignment:
Q  14 tttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7751841 tttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctca 7751743  T
Q  114 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  7751742 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgaattga 7751655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 12827269 - 12827448
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12827269 acttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12827367  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12827368 cttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 12827448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 27384024 - 27384209
Alignment:
Q  14 tttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27384024 tttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctca 27384122  T
Q  114 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  27384123 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgatttga 27384209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7376378 - 7376198
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  7376378 acttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gcttaagcacacacgcaagag 7376280  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7376279 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 7376198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 32756977 - 32757158
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  32756977 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactct--aagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacaggcaagagt 32757073  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32757074 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagtacgcagacaagagacttctgttcaaacaaaaatacagaga 32757158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27167062 - 27166878
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  27167062 actttcaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagag 27166965  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27166964 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 27166878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 31571991 - 31572175
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  31571991 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagag 31572088  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31572089 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 31572175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17746404 - 17746220
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  17746404 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagag 17746307  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17746306 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 17746220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 29765112 - 29765292
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  29765112 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagag 29765209  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  29765210 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaataca 29765292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 27474408 - 27474559
Alignment:
Q  14 tttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27474408 tttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctca 27474506  T
Q  114 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  27474507 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27474559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 27503906 - 27504057
Alignment:
Q  14 tttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27503906 tttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctca 27504004  T
Q  114 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  27504005 agcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27504057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 5844662 - 5844846
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||    
T  5844662 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagag 5844759  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  5844760 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagactctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagaga 5844846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 12353160 - 12353277
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12353160 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagt 12353259  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12353260 cttccaatgctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18826858 - 18826674
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| || ||||    
T  18826858 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcgagag 18826761  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18826760 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactcaagcacacaggcgacagacttcttttcaaacaaaaatacagaga 18826674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18835253 - 18835069
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||    
T  18835253 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcgagag 18835156  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | || |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  18835155 acttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacagaagcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagaga 18835069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 22308385 - 22308544
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22308385 ataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 22308482  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22308483 aagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaacagaaataca 22308544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10404158 - 10404043
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10404158 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcacacacgcaagagt 10404060  T
Q  101 cttccaatgctcaagca 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  10404059 cttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 25583489 - 25583600
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  25583489 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa-atgctcaagcacacacgcatgagt 25583587  T
Q  101 cttccaatgctca 113  Q
    |||||||||||||    
T  25583588 cttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 27504013 - 27504121
Alignment:
Q  93 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagt 192  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  27504013 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagacaattgagt 27504112  T
Q  193 ttgacttga 201  Q
    |||| ||||    
T  27504113 ttgatttga 27504121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25687338 - 25687190
Alignment:
Q  31 agattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25687338 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagt 25687242  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25687241 cttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaaacaaaattaca 25687190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 11235095 - 11235244
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11235095 ataatcacacaaattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 11235190  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  11235191 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 11235244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 25518285 - 25518434
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||   |||||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  25518285 ataatcacacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcacta 25518380  T
Q  121 -agcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25518381 cagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 25518434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11147810 - 11147708
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11147810 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgcttaatactctctaagtatgagacttcacaaaa-atgctcaagcacacacgcaagagt 11147712  T
Q  101 cttc 104  Q
    ||||    
T  11147711 cttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 21127676 - 21127825
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21127676 ataatcacacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcacta 21127771  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  21127772 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 21127825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 27474515 - 27474622
Alignment:
Q  93 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagt 192  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  27474515 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagt 27474613  T
Q  193 ttgacttga 201  Q
    |||| ||||    
T  27474614 ttgatttga 27474622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7586860 - 7586711
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7586860 ataatcacactgattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcacta 7586765  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  7586764 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 7586711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 31931050 - 31931163
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  31931050 ataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 31931145  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31931146 aagcaagagacttctaat 31931163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 17047186 - 17047297
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  17047186 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-aagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcatgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 17047281  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  17047282 aagcaagagacttcta 17047297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17742302 - 17742152
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  17742302 ataatcgcacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcacta 17742207  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc-taatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17742206 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaaca 17742152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 18554897 - 18555010
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  18554897 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 18554992  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18554993 aagcaagagacttctaat 18555010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 11205572 - 11205683
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  11205572 ataatcacacatattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 11205667  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  11205668 aagcaagagacttcta 11205683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12416975 - 12416901
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 76  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12416975 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaac 12416901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12953699 - 12953586
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  12953699 ataatcacacagattacaattgctcaatactatcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcacta 12953604  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  12953603 aagcaagaggcttctaat 12953586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19289950 - 19289837
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||     
T  19289950 ataatcacacatattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcacta 19289855  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  19289854 aaggaagagacttctaat 19289837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 182
Target Start/End: Original strand, 4292420 - 4292482
Alignment:
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacag 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4292420 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacag 4292482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19453225 - 19453076
Alignment:
Q  23 aatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||  ||||   |||||||||||| |    
T  19453225 aatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaa 19453129  T
Q  121 agcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19453128 agcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaagagacttctattcaaaca 19453076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14070778 - 14070627
Alignment:
Q  20 tataatcacaaa-gattacaactgctcaatactatcaa--agtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  14070778 tataatcacaactgattacaactgctcaatact-tcaacaagtacgagacttcaaaa----tgctcaagcacacaa-caagagacttcctatgctcaagc 14070685  T
Q  117 act-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  14070684 acacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 14070627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Original strand, 12353252 - 12353331
Alignment:
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  12353252 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgaattga 12353331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Original strand, 17063827 - 17063935
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||| || ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||   ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  17063827 ataatctcacagattacaattgttcaatactatcat-gtatgagacttctcaaa---tgctcaaacacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 17063922  T
Q  120 aagcaagagactt 132  Q
    |||||||||||||    
T  17063923 aagcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17608958 - 17608861
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  17608958 ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 17608861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 20635177 - 20635316
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||   |||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||| ||| ||||||||||    
T  20635177 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaac-tgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagaga 20635272  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  20635273 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 20635316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24719360 - 24719301
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24719360 tgctcaagcccacacacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24719301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24729145 - 24729086
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24729145 tgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24729086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11147736 - 11147670
Alignment:
Q  135 aatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    ||||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  11147736 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttcttatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttga 11147670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14052039 - 14051946
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  14052039 ctcaagcacacaa-caagagacatcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 14051946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14052012 - 14051954
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14052012 tgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 14051954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18027370 - 18027272
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 175  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  18027370 tgctcaagcacacaagcaagggacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaa 18027272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 22386260 - 22386399
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||| |    ||||||||| || || ||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22386260 gattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 22386355  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  22386356 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 22386399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Original strand, 31931101 - 31931169
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  31931101 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 31931169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23006655 - 23006561
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||    
T  23006655 ctcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaaca 23006561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Original strand, 23781711 - 23781805
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||    
T  23781711 ctcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaaca 23781805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9934211 - 9934131
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttc 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||   ||||||||||| || || |||||||||    
T  9934211 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 10820696 - 10820728
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10820696 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 10820728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Original strand, 18554968 - 18555016
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  18554968 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 18555016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Original strand, 22292490 - 22292538
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttc 69  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22292490 ataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 22292538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23006627 - 23006567
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23006627 tgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaat 23006567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 23781739 - 23781799
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23781739 tgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaat 23781799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 32335364 - 32335424
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  32335364 tgctcaagcacaaacgcaatagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttataat 32335424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 95)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 33084116 - 33084316
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33084116 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 33084215  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33084216 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 33084315  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  33084316 a 33084316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35405046 - 35404845
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35405046 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 35404947  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35404946 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 35404847  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  35404846 ga 35404845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35649345 - 35649144
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35649345 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 35649246  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35649245 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 35649146  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  35649145 ga 35649144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 38094629 - 38094830
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38094629 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 38094728  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38094729 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 38094828  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  38094829 ga 38094830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 38105254 - 38105455
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38105254 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 38105353  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38105354 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 38105453  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  38105454 ga 38105455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51629841 - 51629640
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  51629841 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 51629742  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  51629741 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 51629642  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  51629641 ga 51629640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51657102 - 51656901
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  51657102 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 51657003  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  51657002 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 51656903  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  51656902 ga 51656901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4177470 - 4177669
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4177470 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 4177568  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4177569 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 4177668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7690114 - 7689912
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact--tgctcaagcacacacgcaaga 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7690114 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaaga 7690015  T
Q  99 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7690014 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 7689915  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  7689914 tga 7689912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7506855 - 7507056
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7506855 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 7506954  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7506955 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 7507054  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  7507055 ga 7507056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7517452 - 7517653
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7517452 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 7517551  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7517552 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 7517651  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  7517652 ga 7517653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36237083 - 36236882
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36237083 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 36236984  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36236983 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36236884  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36236883 ga 36236882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36247630 - 36247429
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36247630 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 36247531  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36247530 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36247431  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36247430 ga 36247429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5640362 - 5640163
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5640362 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 5640264  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5640263 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 5640164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10998436 - 10998237
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10998436 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 10998338  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10998337 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 10998238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 12730102 - 12730301
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12730102 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12730200  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12730201 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12730300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 12740695 - 12740894
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12740695 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12740793  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12740794 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12740893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12898633 - 12898434
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12898633 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12898535  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12898534 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12898435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21863216 - 21863415
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21863216 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 21863314  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21863315 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 21863414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3171176 - 3171376
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3171176 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 3171274  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3171275 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 3171374  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  3171375 ga 3171376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3181778 - 3181978
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3181778 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 3181876  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3181877 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 3181976  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  3181977 ga 3181978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5832772 - 5832972
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5832772 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 5832870  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5832871 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5832970  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5832971 ga 5832972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5843374 - 5843574
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5843374 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 5843472  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5843473 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 5843572  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  5843573 ga 5843574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5650919 - 5650720
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  5650919 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaat-gctcaagcacacacgcaagagt 5650821  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5650820 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 5650721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12614968 - 12614769
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12614968 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12614870  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12614869 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12614770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12624433 - 12624234
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12624433 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12624335  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12624334 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12624235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19178514 - 19178713
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19178514 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19178612  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19178613 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 19178712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19187393 - 19187592
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19187393 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 19187491  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19187492 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 19187591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35012483 - 35012682
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35012483 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 35012581  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35012582 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 35012681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 2538090 - 2538290
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2538090 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 2538188  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  2538189 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 2538288  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  2538289 ga 2538290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21877321 - 21877521
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21877321 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 21877419  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21877420 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 21877519  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  21877520 ga 21877521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47608584 - 47608384
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47608584 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 47608486  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47608485 tcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 47608386  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  47608385 ga 47608384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47619192 - 47618992
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47619192 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 47619094  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47619093 tcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 47618994  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  47618993 ga 47618992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35638690 - 35638492
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35638690 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 35638592  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  35638591 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat-cagagaattgagtttgaattg 35638493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 148866 - 148666
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  148866 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 148767  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  148766 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 148667  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  148666 a 148666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 154941 - 154741
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  154941 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagt 154842  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  154841 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 154742  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  154741 a 154741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 4166869 - 4167013
Alignment:
Q  56 aagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaa 155  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4166869 aagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 4166967  T
Q  156 gagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4166968 gagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 4167013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4251220 - 4251017
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttc---acaaaacttgctcaagcacacacgcaag 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  4251220 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 4251121  T
Q  98 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  4251120 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgac 4251021  T
Q  198 ttga 201  Q
    ||||    
T  4251020 ttga 4251017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5973313 - 5973512
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5973313 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 5973411  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  || || |||||||||||    
T  5973412 cttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatgcaatgaattaagtttgacttg 5973511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20441968 - 20441789
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20441968 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 20441870  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20441869 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttataatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 20441789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18382545 - 18382381
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18382545 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgc 18382448  T
Q  111 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18382447 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 18382381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 17956793 - 17956977
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaa-gcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17956793 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaaagcacacacgcaagag 17956891  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17956892 tcttccaatgctcaaacactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagaga 17956977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 39586526 - 39586703
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  39586526 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 39586623  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39586624 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttttaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttatgatcaaacaaaaatac 39586703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39194737 - 39194566
Alignment:
Q  11 agatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194737 agatttcactacaatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 39194638  T
Q  110 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39194637 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 39194566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7677399 - 7677598
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  7677399 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaaacacacacgcaagagt 7677497  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  7677498 tttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttg 7677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 12944763 - 12944947
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||| || |||||||    
T  12944763 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tactcaagcacgcaggcaagag 12944860  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12944861 acttacaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 12944947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23580948 - 23580816
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  23580948 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa-atgcttaagcacacacgcaagagt 23580850  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580849 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11195698 - 11195537
Alignment:
Q  23 aatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa- 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11195698 aatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgatcaagcactaaa 11195601  T
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11195600 gcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 11195537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20196345 - 20196160
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||    
T  20196345 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagag 20196248  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  20196247 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaaatacagaga 20196160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 47194758 - 47194919
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  47194758 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacataggcaagagt 47194855  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||| ||||    
T  47194856 cttccaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcacataggcaagagtcttc 47194919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22610605 - 22610456
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22610605 ataatcacacagattacaactgctcaatactttcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 22610510  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22610509 aagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 22610456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9051110 - 9050994
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  9051110 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcacacaggcaagagt 9051012  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9051011 cttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 181
Target Start/End: Original strand, 47194896 - 47194996
Alignment:
Q  81 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 180  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  47194896 tcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 47194995  T
Q  181 a 181  Q
    |    
T  47194996 a 47194996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14388760 - 14388608
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  14388760 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 14388663  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc-taatcaaaca 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  14388662 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttcttaatcaaaca 14388608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18311605 - 18311454
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  18311605 ataatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 18311508  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  18311507 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaaca 18311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 675022 - 675179
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  675022 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 675117  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  675118 aagcaagagtcttctaacgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 675179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41133249 - 41133095
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||    
T  41133249 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcacta 41133154  T
Q  121 ag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 178  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41133153 aaacaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacataaat 41133095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 5929154 - 5929302
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  5929154 ataatcacacagatta-aactgctcaatactaccta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 5929248  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  5929249 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 5929302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 46181480 - 46181367
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  46181480 ataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcacta 46181385  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46181384 aagcaagagacttctaat 46181367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 28379437 - 28379588
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||    
T  28379437 ataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgctcaagcact 28379533  T
Q  120 aa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  28379534 aaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 28379588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20884483 - 20884370
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||     
T  20884483 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcacta 20884388  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20884387 aagcaagagacttctaat 20884370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 28473705 - 28473818
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  28473705 ataatcacacagattacaactactcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 28473800  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28473801 aagcaagagacttctaat 28473818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 16710388 - 16710457
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttca 70  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16710388 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttca 16710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19965825 - 19965760
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaa 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19965825 tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagacttctaatgctcaa 19965760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 23926506 - 23926657
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||   ||||||||| || || ||||||| |||||  |||||||||||     
T  23926506 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaa---ttgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacg 23926602  T
Q  120 aag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  23926603 caggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 23926657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Original strand, 22018775 - 22018925
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||  |||||  ||||||||||||     
T  22018775 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcacta 22018871  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  22018872 aagaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 22018925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34256142 - 34256004
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagac 130  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  34256142 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacagcaagagac 34256047  T
Q  131 ttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||| |||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||    
T  34256046 ttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcttatcaaaca 34256004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9051036 - 9050956
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9051036 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagaga 9050956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 22642318 - 22642448
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22642318 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagaga 22642414  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    ||||  |||||||||| |  | ||||||||||||    
T  22642415 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45071230 - 45071117
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||     
T  45071230 ataatcacacaaattacaactgctcaatacta-cgtagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcacta 45071135  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45071134 aagcaagagacttctaat 45071117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 20251248 - 20251361
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  20251248 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 20251344  T
Q  120 -aagcaagagacttcta 135  Q
     ||||||||||||||||    
T  20251345 aaagcaagagacttcta 20251361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 22642391 - 22642488
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  22642391 ttgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 22642488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 171
Target Start/End: Original strand, 17370496 - 17370633
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  17370496 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 17370591  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaa 171  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||    
T  17370592 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 17370633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 19037504 - 19037600
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  19037504 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 19037600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26548883 - 26548744
Alignment:
Q  33 attacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagac 130  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26548883 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagac 26548787  T
Q  131 ttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||  |||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||    
T  26548786 ttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaaca 26548744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23580857 - 23580779
Alignment:
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23580857 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 23580779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52351271 - 52351174
Alignment:
Q  37 caactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52351271 caactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 52351176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 4717686 - 4717736
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 51  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717686 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 44200487 - 44200604
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagca----cacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||||    | |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  44200487 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcatgcgcgcacgcaagagacttcatatgctcaagc 44200582  T
Q  117 act-aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||| |||||||||| |||||||    
T  44200583 actaaagcaagagatttctaat 44200604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19170963 - 19170813
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac- 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||     
T  19170963 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacg 19170868  T
Q  119 taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
     | ||||||||||||   ||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  19170867 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 19170813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Original strand, 9346299 - 9346358
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9346299 tgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaa 9346358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16233683 - 16233624
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16233683 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaacttctaa 16233624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 21543565 - 21543624
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21543565 ttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 21543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 175
Target Start/End: Original strand, 31358825 - 31358923
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 175  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  31358825 tgctcaagcacacaagcaaaaaacttcaaattctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcgcaaaagcaagagacttctaaacaaacaaa 31358923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 46181429 - 46181361
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  46181429 aatgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 46181361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17025545 - 17025451
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  17025545 ctcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaaca 17025451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867341
Alignment:
Q  96 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20867341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26280633 - 26280531
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 178  Q
    |||||||||| | |||||||  |||  |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26280633 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaaatt 26280534  T
Q  179 aca 181  Q
    |||    
T  26280533 aca 26280531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26280605 - 26280547
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 135  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26280605 tgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 26280547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 166
Target Start/End: Original strand, 7309312 - 7309401
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaa 166  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||||    
T  7309312 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgttcaagcacaaatgcaagagacttctaa 7309401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 132
Target Start/End: Original strand, 22639779 - 22639832
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt 132  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22639779 ctcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactt 22639832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 173
Target Start/End: Original strand, 22654989 - 22655070
Alignment:
Q  93 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||    
T  22654989 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaaca 22655070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867335
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 20867335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Original strand, 23190824 - 23190864
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23190824 caagagacttccaatgctcaagcgcccaagcaagagacttc 23190864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Original strand, 28473756 - 28473824
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  28473756 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 28473824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30738 - 30939
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30738 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 30837  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30838 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 30937  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  30938 ga 30939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43173 - 42969
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaact-gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact---tgctcaagcacacacgcaa 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||    
T  43173 actttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaacgcttaatactctctaagtatgagacttcaaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 43074  T
Q  97 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||  | |||||||    
T  43073 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggccagaggcttctgatcaaacaaaaataccaagaaataagtttga 42974  T
Q  197 cttga 201  Q
    |||||    
T  42973 cttga 42969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2706303 - 2706102
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2706303 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 2706204  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  2706203 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 2706104  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  2706103 ga 2706102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24931293 - 24931093
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24931293 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagt 24931194  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24931193 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 24931094  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  24931093 a 24931093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26294719 - 26294519
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26294719 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 26294620  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26294619 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 26294520  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  26294519 a 26294519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8627558 - 8627759
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattaca-actgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8627558 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 8627657  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8627658 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 8627757  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  8627758 ga 8627759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26390787 - 26390586
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  26390787 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 26390688  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26390687 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 26390588  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  26390587 ga 26390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26401429 - 26401228
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  26401429 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 26401330  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26401329 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 26401230  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  26401229 ga 26401228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40042799 - 40042598
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40042799 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 40042700  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  40042699 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 40042600  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  40042599 ga 40042598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40053348 - 40053147
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40053348 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 40053249  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  40053248 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 40053149  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  40053148 ga 40053147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 166506 - 166705
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  166506 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 166604  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  166605 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 166704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 177098 - 177297
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  177098 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 177196  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  177197 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 177296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 9084895 - 9085094
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9084895 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9084993  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9084994 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 9085093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 9094609 - 9094808
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9094609 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9094707  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9094708 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 9094807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48711180 - 48710981
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48711180 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 48711082  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  48711081 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 48710982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 37343816 - 37344010
Alignment:
Q  6 caagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37343816 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 37343914  T
Q  106 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37343915 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttga 37344010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1987150 - 1987350
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1987150 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 1987248  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1987249 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 1987348  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  1987349 ga 1987350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1997771 - 1997971
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1997771 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 1997869  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1997870 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 1997969  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  1997970 ga 1997971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2716907 - 2716706
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2716907 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 2716808  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  2716807 tcttccaatggtcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 2716708  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  2716707 ga 2716706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11004795 - 11004995
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11004795 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 11004893  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11004894 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 11004993  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  11004994 ga 11004995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17961415 - 17961214
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17961415 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 17961316  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17961315 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17961216  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17961215 ga 17961214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24734362 - 24734563
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  24734362 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 24734461  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24734462 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24734561  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24734562 ga 24734563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24744309 - 24744510
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  24744309 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 24744408  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24744409 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24744508  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24744509 ga 24744510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 42865437 - 42865637
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42865437 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 42865535  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  42865536 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 42865635  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  42865636 ga 42865637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 42876063 - 42876263
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42876063 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 42876161  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  42876162 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 42876261  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  42876262 ga 42876263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 468270 - 468071
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  468270 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 468172  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  468171 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 468072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6867914 - 6867715
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6867914 acttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6867816  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6867815 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 6867716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6878546 - 6878347
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6878546 acttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6878448  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6878447 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 6878348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8616996 - 8617196
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  8616996 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaagagt 8617095  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8617096 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 8617195  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  8617196 a 8617196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 9432875 - 9433074
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  9432875 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9432973  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9432974 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 9433073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26654014 - 26653815
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26654014 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 26653916  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26653915 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 26653816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26700343 - 26700144
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26700343 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 26700245  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26700244 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 26700145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17950809 - 17950608
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17950809 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 17950710  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17950709 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17950610  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17950609 ga 17950608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5685130 - 5685329
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5685130 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 5685228  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5685229 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcacaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 5685328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 9443471 - 9443670
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  9443471 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9443569  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9443570 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggaaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 9443669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21003697 - 21003498
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21003697 acttccaaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 21003599  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21003598 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 21003499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22099349 - 22099548
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  22099349 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacgcatgcaagagt 22099447  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22099448 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 22099547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4222218 - 4222418
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  4222218 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 4222316  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4222317 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 4222416  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  4222417 ga 4222418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8002755 - 8002555
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8002755 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagag 8002657  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8002656 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 8002557  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  8002556 ga 8002555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8013400 - 8013200
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8013400 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagag 8013302  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8013301 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 8013202  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  8013201 ga 8013200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 20989264 - 20989463
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20989264 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 20989362  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20989363 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 20989462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22088734 - 22088933
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||    
T  22088734 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcatgcatgcaagagt 22088832  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22088833 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 22088932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14746359 - 14746159
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaa-gcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  14746359 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaaagcacacacgcaagag 14746261  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14746260 tcttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagttttactt 14746161  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  14746160 ga 14746159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 588824 - 589023
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  588824 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 588922  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||  ||||||||||    
T  588923 cttccaatgttcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattatgtttgacttg 589022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31117199 - 31117020
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31117199 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 31117101  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31117100 cttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 31117020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1367241 - 1367440
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1367241 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 1367339  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  1367340 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 1367439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3165346 - 3165545
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3165346 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 3165444  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  3165445 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 3165544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20490618 - 20490814
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20490618 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 20490716  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  20490717 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 20490814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15889017 - 15888838
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15889017 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 15888919  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15888918 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 15888838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21770631 - 21770452
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21770631 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 21770533  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21770532 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 21770452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30049131 - 30049330
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30049131 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 30049229  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  30049230 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttg 30049329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 9159342 - 9159521
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9159342 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9159440  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9159441 cttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 9159521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 9169797 - 9169976
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9169797 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9169895  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9169896 cttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 9169976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40055442 - 40055263
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  40055442 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacgcaggcaagagt 40055344  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40055343 cttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaataca 40055263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 455289
Alignment:
Q  60 atgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagaga 159  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  455429 atgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaaaga 455331  T
Q  160 cttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  455330 cttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 455289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17064219 - 17064035
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||    
T  17064219 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaagcaagag 17064122  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17064121 tcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 17064035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Original strand, 11095717 - 11095864
Alignment:
Q  55 aaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggc 153  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11095717 aaagtatgagaattcacaaatttatgttcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttataatgctcaagcacgcaggc 11095816  T
Q  154 aagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11095817 gagagacttgtaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 11095864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 4211649 - 4211785
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  4211649 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 4211747  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211748 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 4211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38403880 - 38403719
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38403880 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcacta 38403783  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaga 183  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  38403782 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacaga 38403719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 540724 - 540857
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  540724 acttccaaggagatttcgctataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa-atgctcaagcacacacgcaagagt 540822  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 134  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  540823 cttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 48381818 - 48381969
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||    
T  48381818 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcacta 48381915  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48381916 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaaca 48381969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 18418746 - 18418904
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  18418746 ataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 18418842  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  18418843 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaataca 18418904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 18440827 - 18440985
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  18440827 ataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 18440923  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  18440924 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaataca 18440985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 8933196 - 8933353
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  8933196 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 8933291  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8933292 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattaca 8933353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 13681952 - 13682109
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  13681952 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 13682047  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13682048 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 13682109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 29589624 - 29589773
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  29589624 ataatcacacagatcacaaatgctcaatactatcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 29589719  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29589720 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 29589773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 44280135 - 44280251
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44280135 acttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcacacacgcaagagt 44280233  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac 118  Q
    |||| |||||||||||||    
T  44280234 cttctaatgctcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3477008 - 3476859
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  3477008 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgcttaagcacta 3476913  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3476912 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 3476859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 15215949 - 15216101
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  15215949 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctaaagcacta 15216044  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 176  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15216045 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctattcaaacaaaa 15216101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 38594371 - 38594256
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  38594371 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagt 38594274  T
Q  101 cttccaatgctcaagcac 118  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38594273 cttctaatgctcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12734832 - 12734681
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  12734832 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 12734737  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 175  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  12734736 aagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 12734681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8999609 - 8999458
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8999609 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcact 8999513  T
Q  120 aa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  8999512 aaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 8999458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24883058 - 24882945
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  24883058 ataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 24882963  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24882962 aagcaagagacttctaat 24882945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26210216 - 26210059
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  26210216 ataatcacacagattacagatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 26210121  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  26210120 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggggagagactactattcaaacaaaattaca 26210059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11087718 - 11087568
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  11087718 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 11087622  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  11087621 aagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 11087568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 540798 - 540895
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  540798 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttga 540895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25212539 - 25212471
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttc 69  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25212539 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 44280209 - 44280305
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  44280209 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttga 44280305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 457681 - 457618
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgag 64  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  457681 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 457618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4412671 - 4412532
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  4412671 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 4412576  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||   |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  4412575 ctttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4412532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 4211724 - 4211819
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4211724 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 4211819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38594298 - 38594222
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38594298 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaataca 38594222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 175
Target Start/End: Original strand, 23125439 - 23125537
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 175  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  23125439 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttctaatgctcaagcccaaaagtaagagacttctaaacaaacaaa 23125537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4433244 - 4433105
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  4433244 gattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 4433149  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
     ||   |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  4433148 atttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4433105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 19986209 - 19986159
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 51  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19986209 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16308349 - 16308289
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16308349 tgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagagacttctaat 16308289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 20967280 - 20967328
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaata 49  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20967280 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13175279 - 13175157
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||||   ||||||||||| || || | || |||||  ||||||||||||     
T  13175279 taatcacacagattacaactgctcagtactacacctagtctgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggctatagacttcctttgctcaagcacta 13175183  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagc 145  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13175182 aagcaagagacttcctatgctcaagc 13175157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 9802670 - 9802756
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagactt 162  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| | || |||||| ||||    
T  9802670 ttgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagacactt 9802756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 602204 - 602348
Alignment:
Q  20 tataatcaca-aagattacaactgctcaatac-tatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||    
T  602204 tataatcacacaagattacaactgctcaatacttaaacaagtatgagacttcaga----ttgctcaagcacaca-gcaagagactt-ctatgctcaaaca 602297  T
Q  118 c-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaat 167  Q
    |  ||| ||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  602298 cacaagtaagagacttcagatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 602348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24883007 - 24882939
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  24883007 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 24882939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11572860 - 11572762
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 175  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  |||||||| | |  | |||||| |||||||| ||||||||    
T  11572860 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaatcacaaaagcaagacacttctaaacaaacaaa 11572762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Original strand, 20094640 - 20094706
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaa 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  20094640 tgctcaagcacacaaacaagagtctttcaatgctcgagcacacaagcaatagacttctaatactcaa 20094706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3779337 - 3779277
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3779337 ttgctcaagcaaacaagcaagatacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctaa 3779277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 163
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802727
Alignment:
Q  108 tgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||    
T  9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Original strand, 15304134 - 15304194
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15304134 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacacaagcaagaaacttctaa 15304194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18393266 - 18393065
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18393266 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 18393167  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18393166 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 18393067  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  18393066 ga 18393065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24339031 - 24338832
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24339031 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa-ttgctcaagcacacacgcaagagt 24338933  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24338932 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 24338833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11395801 - 11395600
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  11395801 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 11395702  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11395701 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 11395602  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  11395601 ga 11395600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11406117 - 11405916
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  11406117 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagag 11406018  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11406017 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 11405918  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  11405917 ga 11405916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1099822 - 1099623
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1099822 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 1099724  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1099723 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 1099624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4099415 - 4099614
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4099415 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 4099513  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4099514 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 4099613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4209490 - 4209689
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4209490 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 4209588  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4209589 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 4209688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7006434 - 7006235
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7006434 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 7006336  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7006335 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 7006236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9773931 - 9773732
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9773931 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9773833  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9773832 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 9773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11389436 - 11389237
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11389436 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 11389338  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11389337 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 11389238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22915491 - 22915292
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22915491 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 22915393  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22915392 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 22915293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22960959 - 22960760
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22960959 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 22960861  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22960860 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 22960761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24328361 - 24328162
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24328361 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 24328263  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24328262 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 24328163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 34477529 - 34477729
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34477529 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 34477628  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  34477629 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattg 34477728  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  34477729 a 34477729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10266594 - 10266794
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10266594 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 10266692  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10266693 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 10266792  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10266793 ga 10266794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10277171 - 10277371
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10277171 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 10277269  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10277270 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 10277369  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  10277370 ga 10277371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 32217473 - 32217674
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  32217473 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 32217572  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  32217573 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 32217672  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  32217673 ga 32217674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35263191 - 35263391
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35263191 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 35263289  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35263290 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 35263389  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  35263390 ga 35263391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35273816 - 35274016
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35273816 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 35273914  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35273915 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 35274014  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  35274015 ga 35274016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4220082 - 4220281
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4220082 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 4220180  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4220181 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 4220280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9763395 - 9763196
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9763395 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9763297  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9763296 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 9763197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16768544 - 16768743
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16768544 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 16768642  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16768643 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 16768742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17858064 - 17857865
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17858064 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 17857966  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17857965 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 17857866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30489451 - 30489252
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30489451 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagact-gctcaagcacacacgcaagagt 30489353  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  30489352 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatactgagaattgagtttgaattg 30489253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 40221933 - 40222132
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40221933 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 40222031  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40222032 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 40222131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 40250794 - 40250993
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40250794 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 40250892  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40250893 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 40250992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43082255 - 43082454
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43082255 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 43082353  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43082354 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 43082453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27220981 - 27221181
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27220981 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 27221079  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  27221080 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttgaatt 27221179  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27221180 ga 27221181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 35252582 - 35252774
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35252582 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 35252680  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35252681 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtt 35252774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39170723 - 39170523
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39170723 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 39170625  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  39170624 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttgaatt 39170525  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  39170524 ga 39170523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9898204 - 9898009
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact--tgctcaagcacacacgcaaga 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  9898204 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9898105  T
Q  99 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagttt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9898104 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 9898009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 29243823 - 29244022
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29243823 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 29243921  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29243922 cttccaatgctcaagcactaagaaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 29244021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 29254402 - 29254601
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29254402 acttccaaggagatttcactataataacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 29254500  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29254501 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 29254600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34790844 - 34790645
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  34790844 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacaagcaagagt 34790746  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34790745 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 34790646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34804987 - 34804788
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  34804987 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacaagcaagagt 34804889  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34804888 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 34804789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36252471 - 36252272
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  36252471 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgtaagagt 36252373  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36252372 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 36252273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43092864 - 43093063
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43092864 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 43092962  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43092963 cttccaatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 43093062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9908792 - 9908590
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact--tgctcaagcacacacgcaaga 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  9908792 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9908693  T
Q  99 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9908692 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 9908593  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  9908592 tga 9908590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43345008 - 43345208
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43345008 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 43345106  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43345107 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 43345206  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  43345207 ga 43345208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43354623 - 43354823
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43354623 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 43354721  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43354722 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 43354821  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  43354822 ga 43354823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24415648 - 24415449
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24415648 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 24415550  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  24415549 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttg 24415450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24428213 - 24428014
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24428213 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 24428115  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  24428114 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttg 24428015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28732529 - 28732350
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28732529 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 28732431  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28732430 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 28732350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 2561089 - 2561268
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2561089 acttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 2561187  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2561188 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 2561268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18769531 - 18769353
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18769531 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 18769434  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18769433 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 18769353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21173095 - 21172914
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21173095 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagag 21172996  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  21172995 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatgatcaaacaaaaataca 21172914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28721943 - 28721764
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28721943 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 28721845  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  28721844 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaaaggcttctgatcaaacaaaaataca 28721764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21651133 - 21650975
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21651133 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 21651035  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagaga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21651034 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagaga 21650975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 26866673 - 26866847
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  26866673 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 26866770  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26866771 cttccaatcctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 26866847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38586716 - 38586531
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||| || |||||||    
T  38586716 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaagtgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaaatgctcaagcacgcaggcaagag 38586617  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  38586616 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttatgttcaaacaaaaatacagaga 38586531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 26879262 - 26879436
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  26879262 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacataggcaagagt 26879359  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26879360 cttccaatgctcaagcactaagcaagagttttctaatgctcaagcacgtaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 26879436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27979009 - 27978826
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||    
T  27979009 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagag 27978912  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  27978911 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaatacagaga 27978826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28065538 - 28065355
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcacta-taatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||    
T  28065538 acttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagag 28065441  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  28065440 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaatacagaga 28065355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36785404 - 36785243
Alignment:
Q  23 aatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa- 121  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36785404 aatcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatggtcaagcactaaa 36785307  T
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  36785306 gcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 36785243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Original strand, 22763288 - 22763434
Alignment:
Q  33 attacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagact 131  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22763288 attacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtct 22763384  T
Q  132 tctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22763385 tctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttccaatcaaacaaaattaca 22763434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Original strand, 22773990 - 22774138
Alignment:
Q  31 agattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22773990 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagt 22774086  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22774087 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaattaaacaaaattaca 22774138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 968110 - 967952
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  968110 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 968014  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  968013 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 967952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17970875 - 17970718
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  17970875 ataatcacacagattacaaatgctcaatactaacta-gtatgaaacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 17970780  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17970779 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 17970718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 19355942 - 19356091
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||   ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19355942 ataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcctaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaggcacta 19356037  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  19356038 aagcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 19356091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 24274648 - 24274805
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  24274648 ataatcacacagattacaaatgctcaatactcacta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 24274743  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24274744 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattaca 24274805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Original strand, 1041781 - 1041929
Alignment:
Q  31 agattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1041781 agattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagt 1041877  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1041878 cttataatgctcaagcacacaggcgagaggcttctaatcaaacaacaataca 1041929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19303029 - 19302918
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  19303029 ataatcacacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 19302934  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  19302933 aagcaagagacttcta 19302918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19498568 - 19498457
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  19498568 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 19498473  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  19498472 aagcaagagacttcta 19498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38033410 - 38033296
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||| || |||||  ||||||||||||     
T  38033410 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcaaaaaa--tgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgctcaagcacta 38033314  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38033313 aagcaagagacttctaat 38033296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19313595 - 19313482
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||     
T  19313595 ataatcacacagattataactgctcaatactaccga-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcacta 19313500  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19313499 aagcaagagacttctaat 19313482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20647217 - 20647068
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  20647217 ataatcacacagattacaactgcttaatactaccta-gtatgagacttc-caaa--ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 20647122  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    || |||||||||||  |||||||||| |  | | |||||||||||| |||||||    
T  20647121 aatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaaca 20647068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 30794410 - 30794497
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattac-aactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcac 88  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  30794410 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcac 30794497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23393318 - 23393179
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  23393318 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 23393223  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | | |||||||||||| |||||||    
T  23393222 cttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaaca 23393179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24802198 - 24802059
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||    |||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24802198 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaa----tgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 24802103  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  24802102 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 24802059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24815165 - 24815026
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24815165 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 24815070  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  24815069 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 24815026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Original strand, 1083465 - 1083603
Alignment:
Q  33 attacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagac 130  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  1083465 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagac 1083560  T
Q  131 ttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  1083561 ttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 1083603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19300571 - 19300477
Alignment:
Q  38 aactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19300571 aactgctcaatactaccta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19300477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16587596 - 16587510
Alignment:
Q  81 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaa 166  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16587596 tcaagcacacaaacaagagacttccaatgctcaatcacaaatgaaacagacttccaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaa 16587510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21911473 - 21911368
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 175  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  21911473 tgctcaagcacactagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaa 21911374  T
Q  176 aataca 181  Q
    | ||||    
T  21911373 attaca 21911368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 22754939 - 22755054
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |  |||||||||||||||| |   |||| |||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  22754939 ataatcacacagattacaacttctcaacactacacctagtatgagacttcacaga---tgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 22755035  T
Q  120 -aagcaagagacttctaat 137  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22755036 aaagcaagagacttctaat 22755054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Original strand, 21845679 - 21845738
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21845679 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttctaa 21845738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 22383002 - 22383062
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22383002 tgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 22383062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21548860 - 21548821
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagactt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21548860 caagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagactt 21548821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Original strand, 22382974 - 22383068
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  22382974 ctcaagcacaaaagcaagacgtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaaca 22383068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 38040569 - 38040521
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttca 70  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  38040569 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttca 38040521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19313544 - 19313468
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19313544 aatgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattaca 19313468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 134)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10755220 - 10755021
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10755220 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-gctcacgcacacacgcaagagt 10755122  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10755121 cttccaatgctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 10755022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40401747 - 40401548
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40401747 actttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 40401649  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40401648 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 40401549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14446532 - 14446732
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14446532 actttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 14446630  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14446631 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 14446730  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  14446731 ga 14446732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14457144 - 14457344
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14457144 actttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 14457242  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14457243 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 14457342  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  14457343 ga 14457344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14557547 - 14557748
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14557547 acttccaaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 14557646  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14557647 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 14557746  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  14557747 ga 14557748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14568184 - 14568385
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14568184 acttccaaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 14568283  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14568284 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 14568383  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  14568384 ga 14568385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23297007 - 23296806
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23297007 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 23296908  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23296907 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 23296808  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  23296807 ga 23296806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23307575 - 23307374
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23307575 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 23307476  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23307475 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 23307376  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  23307375 ga 23307374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23708172 - 23707971
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23708172 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 23708073  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23708072 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 23707973  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  23707972 ga 23707971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30227026 - 30227227
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30227026 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 30227125  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30227126 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 30227225  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  30227226 ga 30227227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30237553 - 30237754
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30237553 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 30237652  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30237653 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 30237752  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  30237753 ga 30237754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 39490480 - 39490681
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39490480 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 39490579  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39490580 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 39490679  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  39490680 ga 39490681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 39501670 - 39501871
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39501670 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 39501769  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39501770 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 39501869  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  39501870 ga 39501871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 40513519 - 40513720
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40513519 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 40513618  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  40513619 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 40513718  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  40513719 ga 40513720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5290107 - 5290307
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5290107 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 5290206  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5290207 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 5290306  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  5290307 a 5290307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5300678 - 5300878
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5300678 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 5300777  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5300778 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 5300877  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  5300878 a 5300878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15992861 - 15993060
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15992861 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 15992959  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15992960 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 15993059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16003423 - 16003622
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16003423 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 16003521  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16003522 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 16003621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22676847 - 22676651
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22676847 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 22676748  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22676747 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 22676651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22686738 - 22686542
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22686738 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 22686639  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22686638 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 22686542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27602950 - 27603149
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27602950 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 27603048  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27603049 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 27603148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39353216 - 39353017
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39353216 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 39353118  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39353117 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 39353018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39365209 - 39365010
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39365209 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 39365111  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39365110 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 39365011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40391085 - 40390886
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40391085 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 40390987  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40390986 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 40390887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42043514 - 42043318
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42043514 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 42043415  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42043414 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 42043318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42054089 - 42053893
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42054089 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 42053990  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42053989 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 42053893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 9376993 - 9377193
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9376993 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 9377091  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9377092 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 9377191  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  9377192 ga 9377193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14041326 - 14041126
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14041326 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 14041228  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14041227 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 14041128  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  14041127 ga 14041126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15693563 - 15693763
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15693563 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 15693661  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15693662 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 15693761  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  15693762 ga 15693763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15740697 - 15740497
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15740697 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 15740599  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15740598 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 15740499  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  15740498 ga 15740497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15769857 - 15769657
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15769857 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 15769759  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15769758 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 15769659  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  15769658 ga 15769657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17607788 - 17607588
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17607788 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 17607690  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17607689 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17607590  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17607589 ga 17607588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17618403 - 17618203
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17618403 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 17618305  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17618304 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17618205  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17618204 ga 17618203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17719646 - 17719446
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17719646 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 17719548  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17719547 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17719448  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17719447 ga 17719446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17730298 - 17730098
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17730298 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 17730200  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17730199 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 17730100  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  17730099 ga 17730098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23697514 - 23697313
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23697514 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagag 23697415  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23697414 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 23697315  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  23697314 ga 23697313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24567818 - 24567618
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24567818 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 24567720  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24567719 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24567620  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24567619 ga 24567618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24808641 - 24808441
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24808641 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 24808543  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24808542 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24808443  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24808442 ga 24808441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24816417 - 24816617
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24816417 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 24816515  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24816516 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24816615  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24816616 ga 24816617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24827005 - 24827205
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24827005 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 24827103  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24827104 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 24827203  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  24827204 ga 24827205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27041743 - 27041943
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27041743 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 27041841  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27041842 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27041941  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27041942 ga 27041943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27052367 - 27052567
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27052367 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 27052465  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27052466 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27052565  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27052566 ga 27052567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27460890 - 27460690
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27460890 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 27460792  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27460791 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27460692  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27460691 ga 27460690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27471289 - 27471089
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27471289 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 27471191  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27471190 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 27471091  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  27471090 ga 27471089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31349262 - 31349062
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31349262 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 31349164  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31349163 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 31349064  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  31349063 ga 31349062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31359876 - 31359676
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31359876 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 31359778  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31359777 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 31359678  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  31359677 ga 31359676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 33951330 - 33951531
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33951330 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagag 33951429  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  33951430 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 33951529  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  33951530 ga 33951531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35216235 - 35216035
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35216235 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 35216137  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35216136 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 35216037  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  35216036 ga 35216035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35226819 - 35226619
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35226819 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 35226721  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35226720 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 35226621  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  35226620 ga 35226619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37728783 - 37728983
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37728783 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 37728881  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37728882 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 37728981  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  37728982 ga 37728983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37740099 - 37740299
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37740099 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 37740197  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37740198 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 37740297  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  37740298 ga 37740299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6131519 - 6131320
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6131519 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 6131421  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6131420 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 6131321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6976539 - 6976343
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6976539 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 6976440  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6976439 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttga 6976343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6987029 - 6986833
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6987029 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 6986930  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6986929 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttga 6986833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9347270 - 9347071
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9347270 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9347172  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  9347171 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattg 9347072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23362839 - 23362640
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23362839 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 23362741  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  23362740 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttgaattg 23362641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27622299 - 27622498
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27622299 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 27622397  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27622398 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 27622497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30069435 - 30069635
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  30069435 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcacgcacacacgcaagagt 30069534  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30069535 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 30069634  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  30069635 a 30069635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14030773 - 14030573
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14030773 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagag 14030675  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14030674 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttttaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 14030575  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  14030574 ga 14030573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31834215 - 31834012
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact---tgctcaagcacacacgcaag 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  31834215 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 31834116  T
Q  98 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31834115 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 31834016  T
Q  198 ttga 201  Q
    ||||    
T  31834015 ttga 31834012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31844693 - 31844490
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact---tgctcaagcacacacgcaag 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  31844693 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 31844594  T
Q  98 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31844593 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 31844494  T
Q  198 ttga 201  Q
    ||||    
T  31844493 ttga 31844490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36582089 - 36582289
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36582089 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 36582187  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36582188 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36582287  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36582288 ga 36582289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36592644 - 36592844
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36592644 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 36592742  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36592743 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36592842  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36592843 ga 36592844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36688423 - 36688223
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  36688423 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagag 36688325  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36688324 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36688225  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36688224 ga 36688223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36698989 - 36698789
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  36698989 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagag 36698891  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36698890 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 36698791  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  36698790 ga 36698789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9336683 - 9336484
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9336683 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 9336585  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  9336584 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagatacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaattg 9336485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22147250 - 22147052
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22147250 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 22147153  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22147152 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 22147053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22157833 - 22157635
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22157833 acttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 22157736  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22157735 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 22157636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34772633 - 34772439
Alignment:
Q  6 caagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34772633 caaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 34772535  T
Q  106 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34772534 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 34772439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34783578 - 34783384
Alignment:
Q  6 caagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34783578 caaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttcc 34783480  T
Q  106 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34783479 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 34783384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27204520 - 27204321
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  27204520 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaaacacacacgcaagagt 27204422  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27204421 cttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 27204322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22560165 - 22559966
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560165 acttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 22560067  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22560066 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgacttg 22559967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31419391 - 31419192
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  31419391 acttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaagcacacacgcaagagt 31419293  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  31419292 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttg 31419193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43043203 - 43043402
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43043203 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 43043301  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  43043302 cttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaggaattaagtttgacttg 43043401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8522570 - 8522370
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8522570 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 8522471  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  8522470 cttccaatgctcaagcattaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 8522371  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  8522370 a 8522370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20798412 - 20798225
Alignment:
Q  13 atttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798412 atttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc 20798314  T
Q  113 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  20798313 aagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttga 20798225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31449282 - 31449083
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  31449282 acttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat-gctcaaccacacacgcaagagt 31449184  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  31449183 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagaacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttg 31449084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1121434 - 1121633
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1121434 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 1121532  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  1121533 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 1121632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42395712 - 42395513
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  42395712 acttccaagaagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagat-gctcaagcacacacgcaagagt 42395614  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  42395613 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 42395514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1108676 - 1108875
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1108676 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 1108774  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  1108775 cttccaatgctcaagcactaagcaaaagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 1108874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23407174 - 23406995
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23407174 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 23407076  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  23407075 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttttgatcaaacaaaaataca 23406995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36085189 - 36085010
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36085189 acttccaaggagatttcactataatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 36085091  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36085090 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaataca 36085010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36229467 - 36229288
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  36229467 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacatgcaagagt 36229369  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36229368 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 36229288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 17446228 - 17446402
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  17446228 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 17446325  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17446326 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 17446402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34052688 - 34052514
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  34052688 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 34052591  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34052590 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 34052514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34063349 - 34063175
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  34063349 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 34063252  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34063251 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 34063175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37407375 - 37407193
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  37407375 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagt 37407278  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37407277 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 37407193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 43621425 - 43621605
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43621425 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 43621523  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43621524 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 43621605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 21702656 - 21702835
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  21702656 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaat-gctcatgcacacacgcaagagt 21702754  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21702755 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 21702835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23393129 - 23392950
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  23393129 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaaaagt 23393031  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23393030 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 23392950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20552544 - 20552364
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20552544 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 20552446  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20552445 tcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 20552364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 24925669 - 24925850
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24925669 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagag 24925768  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24925769 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 24925850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 24982950 - 24983131
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24982950 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagag 24983049  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24983050 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 24983131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 17456844 - 17457018
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  17456844 acttccaaggagatttcacgataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacacaggcaagagt 17456941  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17456942 cttccaatgctcaagcactaagtaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 17457018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19464700 - 19464520
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19464700 acttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagactactcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 19464602  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19464601 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 19464520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20563054 - 20562874
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  20563054 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacaagcaagag 20562956  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20562955 tcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 20562874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19478730 - 19478550
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19478730 acttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgttcaatactctctaagtatgagactactcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 19478632  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19478631 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 19478550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 7031688 - 7031823
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7031688 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 7031786  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031787 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7031823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 21705496 - 21705682
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaat-------actatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacg 93  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  21705496 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaat-gctcatgcacacacg 21705594  T
Q  94 caagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21705595 caagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 21705682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20625474 - 20625315
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  20625474 ataatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcacta 20625377  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20625376 aagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcatgcgagaggcttctattcaaacaaaaataca 20625315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 106827 - 106669
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   | ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  106827 ataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 106731  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  106730 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaataca 106669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20417610 - 20417453
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  20417610 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcacta 20417515  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20417514 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattaca 20417453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 32753501 - 32753656
Alignment:
Q  23 aatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa- 121  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||     
T  32753501 aatcacacagattacagatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 32753596  T
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32753597 gcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctattcaaacaaaattaca 32753656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 13522666 - 13522779
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  13522666 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 13522761  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13522762 aagcaagagacttctaat 13522779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20215812 - 20215662
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  20215812 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 20215716  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||| || |||||||    
T  20215715 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttttattcaaaca 20215662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 40228099 - 40228250
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||    
T  40228099 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcact 40228195  T
Q  120 -aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  40228196 aaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 40228250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40033434 - 40033321
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40033434 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 40033338  T
Q  120 -aagcaagagacttcta 135  Q
     ||||||||||||||||    
T  40033337 aaagcaagagacttcta 40033321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 13403702 - 13403817
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac- 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||     
T  13403702 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacg 13403798  T
Q  119 taagcaagagacttctaat 137  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13403799 aaagcaagagacttctaat 13403817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Original strand, 23477817 - 23477966
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  23477817 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 23477912  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  23477913 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 23477966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35543804 - 35543694
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||     
T  35543804 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 35543709  T
Q  120 aagcaagagacttct 134  Q
    |||||||||||||||    
T  35543708 aagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36096328 - 36096215
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||     
T  36096328 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcacta 36096233  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36096232 aagcaagagacttctaat 36096215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36097785 - 36097672
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||     
T  36097785 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcacta 36097690  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36097689 aagcaagagacttctaat 36097672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20168743 - 20168630
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||     
T  20168743 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcacta 20168648  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20168647 aagcaagagacttctaat 20168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 21420315 - 21420431
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||| ||||   || |||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  21420315 ataatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctcaaa---tggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 21420411  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgc 139  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  21420412 aagcaagagtcttctaatgc 21420431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 7031762 - 7031857
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttga 201  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7031762 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttga 7031857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 1914887 - 1915000
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||| |||||  | ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  1914887 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcact 1914983  T
Q  120 -aagcaagagacttcta 135  Q
     ||||||||||||||||    
T  1914984 aaagcaagagacttcta 1915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25112562 - 25112423
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25112562 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 25112467  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  25112466 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 25112423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25171653 - 25171514
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25171653 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 25171558  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  25171557 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 25171514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11208706 - 11208557
Alignment:
Q  20 tataatcacaaa-gattacaactgctcaatactatcaa--agtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||  |||||  | |||||||    
T  11208706 tataatcacaactgattacaactgctcaatacta-caactagtatgagacttcaaaa----tgctcaagcacaca-gcaagatacttcctttactcaagc 11208613  T
Q  117 act-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaa 171  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||    
T  11208612 acacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 11208557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 32160273 - 32160332
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32160273 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 32160332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 23487993 - 23488104
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  23487993 taatcacgcagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 23488088  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  23488089 aagcaagagacttcta 23488104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 32160201 - 32160340
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    || |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  32160201 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttactcaagcacacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 32160296  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  32160297 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 32160340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Original strand, 20550432 - 20550490
Alignment:
Q  123 caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20550432 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacaaaattaca 20550490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Original strand, 12078356 - 12078413
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12078356 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 12078413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Original strand, 13403755 - 13403823
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  13403755 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaaagcaagagacttctaatcaaaca 13403823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 23589238 - 23589298
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23589238 tgctcaagcacaaacgcaaaagtcttcctaagctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 23589298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 173
Target Start/End: Original strand, 13533474 - 13533512
Alignment:
Q  135 aatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13533474 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 13533512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Original strand, 20567302 - 20567396
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||| | |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||    
T  20567302 ctcaagcacaaaagcaagaggtttcctttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaatcaaaca 20567396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 54
Target Start/End: Original strand, 13533423 - 13533456
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatc 54  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13533423 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc 13533456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 137
Target Start/End: Original strand, 20567329 - 20567390
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  20567329 ttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaat 20567390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Original strand, 1914940 - 1915016
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1914940 aatgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattaca 1915016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Original strand, 13522737 - 13522785
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  13522737 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 13522785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36096257 - 36096201
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36096257 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattaca 36096201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36097714 - 36097658
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36097714 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattaca 36097658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 161; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11965 - 12164
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11965 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 12063  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12064 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7567 - 7768
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7567 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 7666  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7667 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 7766  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  7767 ga 7768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37608 - 37407
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact-tgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37608 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagag 37509  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgactt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37508 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaatt 37409  T
Q  200 ga 201  Q
    ||    
T  37408 ga 37407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41101 - 40902
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41101 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 41003  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41002 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 40903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33550 - 33351
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  33550 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaata-cttaagcacacacgcaagagt 33452  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  33451 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttg 33352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 2298 - 2497
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2298 acttccaaggagatttcactataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 2396  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2397 cttccaatgctcaagcactatgcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7490 - 7291
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7490 actttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 7392  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7391 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgatcaagcacgcaggcaagaaacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 7292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7532 - 7333
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7532 acttccaaggagatttgactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 7434  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7433 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttg 7334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37382 - 37183
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37382 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 37284  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  37283 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttg 37184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14191 - 14390
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14191 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 14289  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttgacttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  14290 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttg 14389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 54771 - 54592
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  54771 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagagt 54673  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  54672 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 54592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11254 - 11075
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  11254 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaat-gctcatgcacacacgcaagagt 11156  T
Q  101 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11155 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 11075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8414 - 8228
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaat-------actatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacg 93  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  8414 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaat-gctcatgcacacacg 8316  T
Q  94 caagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8315 caagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaataca 8228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2687
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaac-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagag 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2867 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat-gctcaagcacacacgcaagag 2769  T
Q  100 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2768 tcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaataca 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12743 - 12582
Alignment:
Q  23 aatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12743 aatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaaggactaaa 12646  T
Q  122 gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12645 gcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 12582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 40130 - 40292
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||    
T  40130 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcacta 40226  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40227 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 40292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Original strand, 127284 - 127433
Alignment:
Q  31 agattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagag 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  127284 agattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 127380  T
Q  129 acttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  127381 tcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaattaca 127433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 16233 - 16384
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  16233 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 16329  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc-taatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16330 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaaca 16384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 1623 - 1772
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  1623 ataatcacacagattacaaatgctcaatactcacta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 1718  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1719 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 1772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 4925 - 5082
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  4925 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 5020  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  5021 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaataca 5082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 75; Significance: 9e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 57411 - 57252
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  57411 ataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctcaaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 57314  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  57313 atgcaagagtcttctaatgcacaagcacgcaggcgagaggcttctattaaaacaaaaataca 57252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 971 - 927
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  971 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaa 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 35167 - 35316
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| || | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  35167 ataatcacacagattacaaatgttcaatactctcta-gtatgagacttctcaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 35262  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35263 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 35316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10915 - 10757
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |   ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  10915 ataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaga---tgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcacta 10819  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  10818 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaataaaaataca 10757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 64; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 15356 - 15514
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  15356 ataatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa---tgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 15452  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15453 aagcaagagtcttctaatggtcaagcacgcaggcgagaggcttctgatcaaacaaaattaca 15514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 64; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 29103 - 29251
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  29103 ataatcacacagattacaactgctcaatac-atcta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggagagagacttccaatgctcaagcacta 29197  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29198 aagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 29251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 23379 - 23455
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact 77  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23379 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaact 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 32435 - 32586
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32435 ataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 32531  T
Q  120 aa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  32532 aaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 32586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 60; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1068 - 955
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  1068 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 973  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  972 aagcaagagacttctaat 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 949
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  997 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 60; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10388 - 10275
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||     
T  10388 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 10293  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10292 aagcaagagacttctaat 10275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10317 - 10269
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  10317 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 10269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 60; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1638 - 1525
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  1638 ataatcacacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 1543  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1542 aagcaagagacttctaat 1525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1519
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  1587 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 8e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 59523 - 59374
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  59523 ataatcacacagattacaaatgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 59428  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  59427 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 59374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40979 - 40828
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||   |||||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||| |    
T  40979 ataatcacacagattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaat 40883  T
Q  120 aa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  40882 aaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 40828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Original strand, 175011 - 175074
Alignment:
Q  23 aatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcac 88  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  175011 aatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcac 175074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Original strand, 175062 - 175112
Alignment:
Q  135 aatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagaga 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  175062 aatgctcaagcacgtaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagaga 175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29395 - 29282
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||     
T  29395 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcatgcatgctagagacttccaatgctcaagcacta 29300  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29299 aagcaagagacttctaat 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29324 - 29276
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  29324 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 29276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 118 - 1
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  118 ataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcacta 22  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgct 140  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  21 aaacaagagtcttctaatgct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2339 - 2192
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||  || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  2339 taatcacactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcatgcatgcaagagacttcctttgctcaagcacta 2243  T
Q  120 aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaa 171  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||    
T  2242 aagcaagaggcttct-atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 1
Alignment:
Q  6 caagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||    
T  91 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa--tgctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 60698 - 60813
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  60698 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 60794  T
Q  120 -aagcaagagacttctaat 137  Q
     ||||||||||||||||||    
T  60795 aaagcaagagacttctaat 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 376 - 489
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||     
T  376 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcacta 471  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  472 aagcaagagacttctaat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 18817 - 19005
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatca-caaagattac--aactgctc-aatactatcaaagtatgagacttcacaaaactt--gctcaagcacacacgc 94  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||   || ||||| |||||| || |||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18817 acttccaaggagatttcactataatcaacaaagattaacaaaatgctctaatactctctaagtatgagatttctcaaaaattatgctcaagcacacacgc 18916  T
Q  95 aagagtcttcc--aatgctcaagc-actaag-caagagacttctaat-gctcaagcgcgcaggc-aagagacttctaatcaaacaaaaa 177  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18917 aagagtcttcccaaatgctcaagcaactaagacaagagtcttctaatagctcaagcacacaggcaaagaggcttctgatcaaacaaaaa 19005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17525 - 17445
Alignment:
Q  86 cacacacgcaa-gagtcttccaatgct-caagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttct 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  17525 cacacacgcaaagagtcttccaatgctacaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttct 17445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 304 - 415
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  304 ataatcacacatattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaacta 399  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  400 aagcaagagacttcta 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 4684 - 4795
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  4684 ataatcacacatattacaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcccaaa---tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaacta 4779  T
Q  120 aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  4780 aagcaagagacttcta 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 475918 - 475770
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||||    
T  475918 taatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcacta 475822  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaa 171  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||    
T  475821 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 475770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 482438 - 482290
Alignment:
Q  22 taatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||||    
T  482438 taatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcacta 482342  T
Q  121 a-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaa 171  Q
    | ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||    
T  482341 aagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 482290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 100226 - 100272
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaa 47  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  100226 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8717 - 8650
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagactt 68  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8717 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 57994 - 58107
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||   | || |||| |||||||||||||||||||     
T  57994 ataatcacacagattataactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa---tgctcaagcatgtaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 58089  T
Q  120 aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||||||||||    
T  58090 aagcaagagacttctaat 58107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 173
Target Start/End: Original strand, 58065 - 58113
Alignment:
Q  125 agagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  58065 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 58113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 61175 - 61327
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||     
T  61175 ataatcacacagattataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgcaaa---tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaca 61271  T
Q  120 aa--gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||  ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  61272 aaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 61327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 4572 - 4712
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||   |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  4572 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaa---ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagaga 4668  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  4669 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 165298 - 165140
Alignment:
Q  22 taatcacaaa-gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||     
T  165298 taatcacaaatgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcaca 165203  T
Q  120 aagcaa-gagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 181  Q
     || || ||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  165202 caggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattaca 165140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59153
Alignment:
Q  81 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||    
T  59060 tcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagatacttcctatgctcaaccacaaaagcaagagacttctaatcaaaca 59153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 1
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgaga 65  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  65 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4554 - 4415
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  4554 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagaga 4459  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
     |||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  4458 tttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5427 - 5331
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   | ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  5427 ataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttcccaaa---ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 5332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21029 - 20890
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21029 gattacaactactcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 20934  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  20933 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 20890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38594 - 38487
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||     
T  38594 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtataagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagactt-caatgctcaagcacta 38500  T
Q  120 aagcaagagactt 132  Q
    |||||||||||||    
T  38499 aagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7067 - 6970
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  7067 ttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 6970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7139 - 7010
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  7139 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 7044  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    ||||  |||||||||| |  | ||||||||||||    
T  7043 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2439 - 2338
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2439 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagaga 2344  T
Q  130 cttcta 135  Q
    ||||||    
T  2343 cttcta 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Original strand, 13975 - 14068
Alignment:
Q  21 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 118  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||  ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13975 ataatcacacagattacagatgctcaatactctcta-gtatgagacttatcaaa---tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Original strand, 14026 - 14084
Alignment:
Q  106 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14026 aatgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 60 - 1
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60 ttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 90 - 1
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttcta 165  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  90 ttgctcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1784 - 1645
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  1784 gattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagaga 1689  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  1688 cttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 1645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 35144 - 35241
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  35144 ttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 35241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 155727 - 155682
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaactgctca 46  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155727 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctca 155682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000004; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 20018 - 20147
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  20018 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagaga 20113  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttc 163  Q
    || |   | ||||||| |||||||||||||||||    
T  20114 ctcccttttctcaagcacgcaggcaagagacttc 20147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20216
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaac 172  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||    
T  20123 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 20216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 10249 - 10308
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10249 ttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 20150 - 20209
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    |||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20150 ttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10316
Alignment:
Q  108 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 10316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38668 - 38609
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38668 ttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 38609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38695 - 38601
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||   |||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||    
T  38695 ctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 38601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1452
Alignment:
Q  32 gattacaactgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |    |||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  1591 gattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttcaaa----ttgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagaga 1496  T
Q  130 cttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||  |||||||||| |  | | |||||||||||| |||||||    
T  1495 cttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaaca 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4866 - 4829
Alignment:
Q  113 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcgcgca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4866 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgca 4829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3914
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc-aatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||    
T  4011 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacataagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaaca 3914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4625 - 4528
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||    
T  4625 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacaaaca 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8318 - 8279
Alignment:
Q  78 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8318 tgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagca 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Original strand, 13542 - 13642
Alignment:
Q  80 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 178  Q
    ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  13542 ctcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagtacacaagcaagagacttctattaaaacaaaaat 13641  T
Q  179 a 179  Q
    |    
T  13642 a 13642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Original strand, 9496 - 9557
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact---aagcaagagacttcta 135  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9496 ttgctcaagcacacagacaagagacttcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttcta 9557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 4475 - 4437
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattacaa 39  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4475 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 1819 - 1856
Alignment:
Q  1 actttcaagcagatttcactataatcacaaagattaca 38  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1819 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 11258 - 11355
Alignment:
Q  77 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagacttctaatcaaaca 173  Q
    ||||||||||||  | |||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  | |||| ||||||||| |||||||    
T  11258 ttgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttctattcaaaca 11355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 59851 - 59775
Alignment:
Q  59 tatgagacttcacaaaacttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 137  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  59851 tatgagacttcccaaa---tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaat 59775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Original strand, 22546 - 22598
Alignment:
Q  84 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 135  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22546 agcacaaacgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 22598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University