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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5039_low_6 (Length: 668)

Name: NF5039_low_6
Description: NF5039
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5039_low_6
NF5039_low_6
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-653)||(32272314-32272963)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 622; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 622; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 32272963 - 32272314
Alignment:
Q  1 tttttctttattttgtcacctttgtgtctgtcacaagatcttttcttaggttgttattatttgtgttaatgtaatgttttgtcctagatcttgctacctt 100  Q
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T  32272963 tttttctttattttgtcacctttgtgtctgtcacaagatcttttcttaggttgttattatttgtgttaatgtaatgttttgtcctagatcttgctacctt 32272864  T
Q  101 attttattagtatatgccacaattcttatagtattattcttaatctcattctttctcttgtttaatatgtctgcatgtgtatagaaaaacacacaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32272863 attttattagtatatgccacaattcttatagtattattcttaatctcattctttctcttgtttaatatgtctgcatgtgtatagaaaaacacacaagatt 32272764  T
Q  201 tcattcatgtacaattgaatattctatatttgagaatgttctatggatttaatattcttttattattttctcaattgaaaagcacagatccttttgttaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32272763 tcattcatgtacaattgaatattctatatttgagaatgttctatggatttaatattcttttattattttctcaattgaaaagcacagatccttttgttaa 32272664  T
Q  301 attaaaaaatcatactattcagcattgcatagatactgacatattgttacttttataaataatagtgttattagtacatatgatttccgacaccgtatct 400  Q
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T  32272663 attaaaaaatcatactattcagcattgcatagatactgacatattgttacttttataaata--agtgttattagtacatatgatttccgacaccgtatct 32272566  T
Q  401 tgacaccatataacattgagtgtgatcttgtcaaaagaaaacatttagtatgaacaatggtcccgaggagagagaacaaacatcggatgataaagataat 500  Q
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T  32272565 tgacaccatataacattgagtgtgatcttgtcaaaagaaaacattgagtatgaacaatggtcccgaggagagagaacaaacatcggatgagaaagataat 32272466  T
Q  501 ataatttaaaactcgcaaaccttataaacatgttgtgtctgtgtctagatccgtgtcaagaaacatttcgcttttataaattatattattttcatgttca 600  Q
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T  32272465 ataatttaaaacttgcaaaccttataaacatgttgtgtctgtgtctagatccgtgtcaagaaacatttcgcttttataaattatattattttcatgttca 32272366  T
Q  601 ttaaattattcaattttggtcttaaccaataataagcatttcaaagtaatata 653  Q
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T  32272365 -taaattattcaattttggtcttaaccaataataagcatttcaaagtaatata 32272314  T

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