View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5040-Insertion-1 (Length: 1131)

Name: NF5040-Insertion-1
Description: NF5040
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5040-Insertion-1
NF5040-Insertion-1
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (344-960)||(15389214-15389835)
chr6 (344-990)||(33299834-33300485)
chr6 (344-960)||(27537162-27537776)
chr6 (344-960)||(27551371-27551985)
chr6 (344-960)||(23927335-23927952)
chr6 (344-974)||(5486923-5487553)
chr6 (345-947)||(35090139-35090743)
chr6 (344-974)||(5996386-5997019)
chr6 (343-979)||(20530497-20531139)
chr6 (344-947)||(30822981-30823584)
chr6 (344-960)||(19826377-19826994)
chr6 (344-989)||(14475297-14475951)
chr6 (345-974)||(25713475-25714111)
chr6 (342-960)||(25993324-25993945)
chr6 (342-960)||(25552158-25552779)
chr6 (344-960)||(13491776-13492392)
chr6 (344-803)||(16302770-16303224)
chr6 (344-804)||(16588922-16589377)
chr6 (344-804)||(16606003-16606458)
chr6 (344-803)||(21708370-21708825)
chr6 (339-960)||(12451316-12451922)
chr6 (342-803)||(18204937-18205397)
chr6 (344-803)||(18219938-18220396)
chr6 (344-803)||(16635319-16635775)
chr6 (344-803)||(16645276-16645732)
chr6 (342-804)||(27047045-27047506)
chr6 (344-804)||(27057291-27057750)
chr6 (344-803)||(24920381-24920835)
chr6 (353-804)||(24485252-24485701)
chr6 (541-947)||(13827522-13827924)
chr6 (344-803)||(30995327-30995785)
chr6 (344-804)||(18111832-18112289)
chr6 (344-804)||(18126377-18126834)
chr6 (344-756)||(27960228-27960637)
chr6 (590-974)||(25692740-25693131)
chr6 (590-974)||(25699381-25699772)
chr6 (353-804)||(25653891-25654339)
chr6 (344-803)||(28304133-28304591)
chr6 (353-804)||(21358422-21358873)
chr6 (353-804)||(23962404-23962855)
chr6 (353-804)||(23982514-23982965)
chr6 (344-578)||(13827922-13828156)
chr6 (344-573)||(28267593-28267822)
chr6 (344-573)||(28346342-28346571)
chr6 (344-538)||(8719657-8719848)
chr6 (344-532)||(25699770-25699958)
chr6 (463-803)||(28266420-28266758)
chr6 (463-803)||(28345169-28345507)
chr6 (343-558)||(11063824-11064035)
chr6 (344-520)||(5008128-5008304)
chr6 (353-563)||(16097687-16097898)
chr6 (353-476)||(18587362-18587485)
chr6 (427-532)||(25693129-25693234)
chr6 (352-445)||(335295-335388)
chr6 (344-416)||(15141656-15141728)
chr6 (740-965)||(18753564-18753793)
chr6 (352-414)||(18842945-18843007)
chr6 (764-804)||(16089648-16089688)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (344-960)||(6855957-6856574)
chr2 (344-960)||(17684935-17685555)
chr2 (342-960)||(35039696-35040315)
chr2 (344-960)||(34527846-34528468)
chr2 (344-960)||(34541820-34542442)
chr2 (344-947)||(41232315-41232920)
chr2 (344-960)||(20364529-20365152)
chr2 (344-947)||(35147967-35148572)
chr2 (344-960)||(44374794-44375413)
chr2 (344-960)||(44390375-44390994)
chr2 (344-947)||(35139626-35140231)
chr2 (344-947)||(42564376-42564982)
chr2 (344-947)||(42573000-42573606)
chr2 (344-943)||(15942988-15943591)
chr2 (344-943)||(15951498-15952102)
chr2 (342-960)||(25495590-25496209)
chr2 (344-947)||(24293198-24293802)
chr2 (344-960)||(26731633-26732248)
chr2 (344-960)||(26717500-26718115)
chr2 (346-947)||(24286630-24287231)
chr2 (344-899)||(26896528-26897083)
chr2 (347-792)||(42247477-42247923)
chr2 (344-960)||(20920463-20921089)
chr2 (343-803)||(34068673-34069123)
chr2 (614-974)||(20623328-20623692)
chr2 (342-803)||(28481147-28481602)
chr2 (344-804)||(16274574-16275032)
chr2 (344-804)||(16283750-16284208)
chr2 (344-803)||(21151235-21151689)
chr2 (353-804)||(30524527-30524972)
chr2 (344-803)||(15600531-15600991)
chr2 (343-803)||(34436891-34437348)
chr2 (342-803)||(29855142-29855602)
chr2 (365-804)||(33306576-33307011)
chr2 (344-804)||(42385921-42386377)
chr2 (344-804)||(42400805-42401261)
chr2 (344-804)||(3754885-3755340)
chr2 (344-803)||(10681324-10681785)
chr2 (344-804)||(2652834-2653289)
chr2 (344-804)||(3764936-3765391)
chr2 (353-804)||(27680932-27681385)
chr2 (343-804)||(21850121-21850582)
chr2 (344-804)||(21858557-21859017)
chr2 (352-804)||(31354719-31355171)
chr2 (353-803)||(22187134-22187585)
chr2 (344-804)||(34685499-34685959)
chr2 (353-804)||(42245347-42245798)
chr2 (344-804)||(34707922-34708380)
chr2 (344-653)||(35304648-35304954)
chr2 (352-804)||(11622049-11622504)
chr2 (344-933)||(21111029-21111613)
chr2 (335-534)||(38153990-38154189)
chr2 (560-960)||(17095633-17096027)
chr2 (344-573)||(19655563-19655789)
chr2 (344-552)||(30683105-30683312)
chr2 (344-511)||(25493307-25493474)
chr2 (344-573)||(21320618-21320845)
chr2 (344-573)||(14630437-14630662)
chr2 (633-960)||(17069159-17069484)
chr2 (633-960)||(17075152-17075477)
chr2 (343-477)||(38611414-38611545)
chr2 (874-960)||(44374464-44374551)
chr2 (411-510)||(39842078-39842174)
chr2 (355-417)||(23283970-23284032)
chr2 (546-615)||(17069048-17069117)
chr2 (484-533)||(17881341-17881390)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (344-947)||(18302861-18303466)
chr7 (344-947)||(13832510-13833113)
chr7 (344-947)||(13840540-13841143)
chr7 (344-960)||(24185927-24186542)
chr7 (344-960)||(1886732-1887344)
chr7 (344-960)||(1900833-1901445)
chr7 (343-958)||(4661688-4662305)
chr7 (344-960)||(17739183-17739806)
chr7 (342-804)||(5198978-5199436)
chr7 (344-804)||(5208097-5208553)
chr7 (344-718)||(10449321-10449693)
chr7 (572-960)||(10441955-10442350)
chr7 (344-804)||(16545360-16545813)
chr7 (344-804)||(16619849-16620302)
chr7 (353-804)||(17211194-17211638)
chr7 (353-803)||(16909646-16910089)
chr7 (335-804)||(29096635-29097100)
chr7 (344-804)||(17514148-17514604)
chr7 (344-804)||(17538610-17539066)
chr7 (344-804)||(29081876-29082332)
chr7 (340-804)||(27965753-27966214)
chr7 (344-804)||(15185445-15185903)
chr7 (344-804)||(27975210-27975667)
chr7 (343-804)||(16889548-16890005)
chr7 (344-654)||(4940091-4940401)
chr7 (344-804)||(15200065-15200523)
chr7 (353-804)||(40679867-40680317)
chr7 (353-804)||(29023320-29023770)
chr7 (354-974)||(43600318-43600939)
chr7 (353-804)||(16227657-16228108)
chr7 (344-803)||(16120492-16120954)
chr7 (344-803)||(16147232-16147694)
chr7 (344-804)||(44075014-44075472)
chr7 (353-804)||(16244535-16244986)
chr7 (344-803)||(558254-558712)
chr7 (344-803)||(568164-568622)
chr7 (344-804)||(2548852-2549310)
chr7 (344-804)||(2562738-2563196)
chr7 (353-804)||(27435152-27435605)
chr7 (353-804)||(27444182-27444635)
chr7 (428-804)||(29031758-29032133)
chr7 (343-622)||(19383909-19384187)
chr7 (344-573)||(13491880-13492106)
chr7 (344-802)||(36476574-36477026)
chr7 (643-989)||(33533462-33533812)
chr7 (423-960)||(4323545-4324083)
chr7 (344-535)||(13478068-13478255)
chr7 (353-504)||(38255625-38255777)
chr7 (353-504)||(38263200-38263352)
chr7 (339-538)||(48498506-48498706)
chr7 (352-547)||(43139053-43139246)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (344-947)||(43596506-43597112)
chr5 (344-947)||(43629300-43629906)
chr5 (344-947)||(31423517-31424125)
chr5 (339-940)||(31412620-31413224)
chr5 (343-947)||(28853556-28854163)
chr5 (344-947)||(1726619-1727224)
chr5 (343-947)||(24955293-24955898)
chr5 (344-947)||(28844946-28845552)
chr5 (344-947)||(24963754-24964358)
chr5 (344-974)||(20396266-20396878)
chr5 (339-960)||(19225613-19226231)
chr5 (344-803)||(41093548-41094010)
chr5 (344-974)||(20370578-20371175)
chr5 (344-804)||(33835130-33835586)
chr5 (344-804)||(33843829-33844285)
chr5 (344-804)||(20377654-20378111)
chr5 (344-804)||(20386443-20386900)
chr5 (344-803)||(26088336-26088791)
chr5 (344-803)||(26078357-26078812)
chr5 (340-653)||(23348538-23348851)
chr5 (344-803)||(11812423-11812880)
chr5 (344-803)||(11802347-11802804)
chr5 (344-803)||(12170129-12170587)
chr5 (344-803)||(12179558-12180016)
chr5 (344-802)||(3476764-3477221)
chr5 (344-802)||(3491534-3491991)
chr5 (352-804)||(23038996-23039445)
chr5 (344-804)||(36458526-36458981)
chr5 (352-804)||(17642366-17642815)
chr5 (358-804)||(21850650-21851093)
chr5 (630-959)||(21931210-21931546)
chr5 (339-804)||(27063970-27064433)
chr5 (344-803)||(27220141-27220602)
chr5 (353-804)||(23827754-23828206)
chr5 (344-803)||(27223148-27223607)
chr5 (344-803)||(27232619-27233078)
chr5 (353-804)||(31548052-31548501)
chr5 (342-804)||(21986163-21986628)
chr5 (353-804)||(23637226-23637678)
chr5 (353-804)||(23835212-23835664)
chr5 (353-804)||(26176970-26177419)
chr5 (344-804)||(21994813-21995276)
chr5 (353-804)||(23984641-23985093)
chr5 (352-653)||(21856805-21857108)
chr5 (344-570)||(21931541-21931765)
chr5 (358-653)||(21858564-21858861)
chr5 (344-573)||(29190253-29190478)
chr5 (344-573)||(344880-345105)
chr5 (344-573)||(359519-359744)
chr5 (353-804)||(23762288-23762740)
chr5 (660-804)||(23025805-23025946)
chr5 (470-533)||(27586827-27586890)
chr5 (463-529)||(19071767-19071833)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (344-960)||(30062629-30063245)
chr3 (343-969)||(27338858-27339479)
chr3 (344-960)||(50826299-50826913)
chr3 (344-947)||(4435381-4435984)
chr3 (344-947)||(4456172-4456775)
chr3 (343-947)||(41016345-41016951)
chr3 (344-960)||(50848940-50849561)
chr3 (344-960)||(27550643-27551267)
chr3 (344-958)||(18949441-18950058)
chr3 (342-947)||(51922058-51922666)
chr3 (344-963)||(17364650-17365275)
chr3 (344-960)||(39706788-39707403)
chr3 (343-947)||(8153127-8153733)
chr3 (344-963)||(17360008-17360633)
chr3 (344-947)||(8196217-8196823)
chr3 (344-989)||(17934976-17935628)
chr3 (344-960)||(3711538-3712152)
chr3 (343-940)||(13507238-13507842)
chr3 (344-940)||(2256387-2256984)
chr3 (344-803)||(14425728-14426188)
chr3 (475-947)||(18900462-18900937)
chr3 (344-804)||(15711119-15711578)
chr3 (344-804)||(15694516-15694975)
chr3 (344-764)||(8204028-8204447)
chr3 (344-799)||(18351134-18351585)
chr3 (429-974)||(18040821-18041373)
chr3 (344-889)||(43468073-43468620)
chr3 (336-803)||(2214911-2215374)
chr3 (396-804)||(15696829-15697236)
chr3 (522-960)||(16814560-16814998)
chr3 (536-947)||(18890340-18890754)
chr3 (344-804)||(10720700-10721157)
chr3 (353-804)||(6293524-6293970)
chr3 (344-804)||(27978685-27979139)
chr3 (344-804)||(6563701-6564158)
chr3 (344-804)||(6577370-6577827)
chr3 (595-947)||(41007566-41007920)
chr3 (344-804)||(5144265-5144721)
chr3 (352-803)||(16290794-16291242)
chr3 (344-650)||(17630358-17630664)
chr3 (343-804)||(1004108-1004567)
chr3 (338-804)||(11918191-11918656)
chr3 (344-804)||(11932767-11933226)
chr3 (342-804)||(22965768-22966228)
chr3 (343-804)||(17562686-17563147)
chr3 (344-804)||(22951794-22952252)
chr3 (352-804)||(31278579-31279028)
chr3 (344-804)||(25264700-25265155)
chr3 (344-804)||(25274194-25274649)
chr3 (352-804)||(15675078-15675525)
chr3 (353-804)||(13274799-13275250)
chr3 (352-804)||(15683620-15684067)
chr3 (353-804)||(1479978-1480429)
chr3 (344-653)||(13847669-13847977)
chr3 (341-840)||(21185412-21185907)
chr3 (655-960)||(9183894-9184200)
chr3 (353-804)||(4503364-4503815)
chr3 (353-801)||(7063629-7064077)
chr3 (353-801)||(7096476-7096924)
chr3 (344-804)||(24215984-24216430)
chr3 (585-960)||(27958025-27958396)
chr3 (353-803)||(17616482-17616932)
chr3 (371-948)||(27884533-27885101)
chr3 (352-631)||(27957185-27957459)
chr3 (344-552)||(10713426-10713634)
chr3 (344-552)||(29730411-29730621)
chr3 (344-910)||(27880175-27880733)
chr3 (355-960)||(9567282-9567888)
chr3 (344-511)||(18881928-18882095)
chr3 (344-572)||(13555526-13555750)
chr3 (339-491)||(14520707-14520859)
chr3 (782-947)||(18886343-18886511)
chr3 (779-947)||(8223119-8223291)
chr3 (353-589)||(12468968-12469207)
chr3 (809-947)||(14536879-14537015)
chr3 (634-764)||(27957882-27958011)
chr3 (531-756)||(30102060-30102286)
chr3 (342-449)||(18900357-18900464)
chr3 (344-433)||(22094837-22094926)
chr3 (343-402)||(18041375-18041434)
chr3 (752-804)||(30101998-30102049)
chr3 (344-386)||(15697231-15697273)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (344-947)||(3431401-3432007)
chr1 (344-947)||(31540958-31541563)
chr1 (344-947)||(31549527-31550132)
chr1 (344-960)||(28991106-28991730)
chr1 (344-933)||(32135108-32135698)
chr1 (344-974)||(13803853-13804486)
chr1 (344-987)||(13451788-13452437)
chr1 (344-947)||(41744502-41745101)
chr1 (343-960)||(43455824-43456450)
chr1 (344-941)||(2384976-2385571)
chr1 (344-940)||(23355413-23356014)
chr1 (344-947)||(28459583-28460189)
chr1 (344-803)||(21496882-21497340)
chr1 (343-974)||(51055114-51055746)
chr1 (8-343)||(4519528-4519863)
chr1 (344-709)||(13477078-13477442)
chr1 (344-803)||(20502063-20502516)
chr1 (344-803)||(31553306-31553763)
chr1 (344-803)||(31562440-31562897)
chr1 (352-800)||(22479580-22480025)
chr1 (353-804)||(32608539-32608986)
chr1 (344-764)||(21054866-21055280)
chr1 (344-646)||(23952221-23952522)
chr1 (353-804)||(22472503-22472952)
chr1 (342-804)||(38123425-38123882)
chr1 (353-804)||(3350534-3350982)
chr1 (353-804)||(16135066-16135514)
chr1 (345-709)||(8240865-8241229)
chr1 (353-803)||(34336620-34337070)
chr1 (352-947)||(36848507-36849106)
chr1 (353-803)||(12464053-12464506)
chr1 (343-581)||(35097377-35097615)
chr1 (344-653)||(52101236-52101542)
chr1 (344-538)||(13461138-13461332)
chr1 (342-552)||(21244869-21245079)
chr1 (344-537)||(46776801-46776994)
chr1 (677-979)||(11950084-11950392)
chr1 (526-803)||(18702405-18702676)
chr1 (352-476)||(22495867-22495991)
chr1 (353-504)||(8513942-8514094)
chr1 (354-468)||(18780118-18780232)
chr1 (344-511)||(25337131-25337294)
chr1 (353-538)||(27311794-27311980)
chr1 (344-708)||(4282507-4282866)
chr1 (357-492)||(2248397-2248532)
chr1 (465-533)||(17018892-17018961)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (344-989)||(17662267-17662918)
chr8 (343-960)||(4837361-4837984)
chr8 (344-989)||(17681396-17682047)
chr8 (344-947)||(30939287-30939892)
chr8 (344-974)||(17528802-17529435)
chr8 (344-947)||(39836010-39836616)
chr8 (344-947)||(39844052-39844658)
chr8 (344-948)||(25584851-25585454)
chr8 (344-960)||(16775019-16775641)
chr8 (344-960)||(16760582-16761204)
chr8 (335-960)||(26871203-26871849)
chr8 (344-974)||(17975401-17976043)
chr8 (344-803)||(22103424-22103884)
chr8 (341-803)||(36248655-36249115)
chr8 (344-960)||(23922855-23923476)
chr8 (352-803)||(19850723-19851177)
chr8 (352-803)||(19856759-19857213)
chr8 (348-803)||(36252300-36252750)
chr8 (344-804)||(36576543-36576999)
chr8 (343-658)||(4842806-4843121)
chr8 (344-803)||(25718966-25719418)
chr8 (344-713)||(4583602-4583972)
chr8 (344-653)||(15832007-15832315)
chr8 (352-804)||(6582682-6583131)
chr8 (353-804)||(23092654-23093102)
chr8 (352-965)||(26912534-26913155)
chr8 (344-804)||(14204439-14204901)
chr8 (344-804)||(14219080-14219542)
chr8 (344-803)||(31000605-31001064)
chr8 (353-804)||(31207505-31207957)
chr8 (353-804)||(16190398-16190849)
chr8 (344-588)||(25796693-25796937)
chr8 (339-578)||(1388087-1388326)
chr8 (352-803)||(17129206-17129677)
chr8 (353-653)||(22418206-22418509)
chr8 (352-653)||(22366732-22367038)
chr8 (342-573)||(14335741-14335968)
chr8 (341-570)||(23600856-23601082)
chr8 (463-533)||(17809453-17809523)
chr8 (623-746)||(22023032-22023149)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (339-955)||(27341507-27342122)
chr4 (344-974)||(772923-773553)
chr4 (343-965)||(10640127-10640751)
chr4 (343-865)||(52297571-52298095)
chr4 (343-947)||(8092735-8093339)
chr4 (344-947)||(8101541-8102144)
chr4 (344-960)||(1875344-1875966)
chr4 (344-960)||(12425216-12425835)
chr4 (344-960)||(12998315-12998935)
chr4 (344-960)||(1889459-1890081)
chr4 (344-989)||(21530105-21530762)
chr4 (344-797)||(55584160-55584607)
chr4 (344-804)||(4747401-4747858)
chr4 (344-804)||(18009988-18010442)
chr4 (344-707)||(20865659-20866021)
chr4 (344-676)||(4522214-4522545)
chr4 (340-654)||(26033957-26034271)
chr4 (353-804)||(26210390-26210839)
chr4 (353-804)||(26219150-26219599)
chr4 (353-804)||(19644871-19645320)
chr4 (352-804)||(21398827-21399278)
chr4 (344-804)||(10786565-10787024)
chr4 (353-804)||(34842605-34843054)
chr4 (353-804)||(19759730-19760183)
chr4 (353-804)||(19774486-19774939)
chr4 (342-650)||(25652447-25652753)
chr4 (353-804)||(25247163-25247613)
chr4 (353-804)||(14718505-14718963)
chr4 (344-644)||(21810865-21811167)
chr4 (353-625)||(14736790-14737064)
chr4 (738-960)||(20866022-20866240)
chr4 (694-803)||(24924531-24924638)
chr4 (685-804)||(14737083-14737205)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (344-960)||(4140-4759)
[»] scaffold0015 (3 HSPs)
scaffold0015 (344-947)||(188326-188931)
scaffold0015 (344-804)||(194662-195118)
scaffold0015 (344-653)||(159154-159462)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (345-898)||(109202-109754)
scaffold0002 (699-960)||(122936-123197)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (344-856)||(29778-30286)
scaffold0056 (344-447)||(11481-11584)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (344-960)||(10167-10782)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (344-803)||(9802-10255)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (343-749)||(10139-10546)
[»] scaffold1804 (1 HSPs)
scaffold1804 (342-702)||(1-361)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (352-804)||(63135-63581)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (486-960)||(19545-20028)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (585-965)||(38672-39054)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (343-677)||(4297-4629)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (344-653)||(80338-80648)
scaffold0044 (344-653)||(63938-64246)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (349-799)||(46457-46902)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (405-803)||(1-396)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (344-753)||(4491-4899)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (344-653)||(21451-21760)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (353-804)||(83332-83783)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (344-803)||(14775-15236)
[»] scaffold0545 (1 HSPs)
scaffold0545 (664-960)||(8011-8313)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (344-653)||(145283-145591)
scaffold0023 (344-641)||(136321-136617)
[»] scaffold0455 (1 HSPs)
scaffold0455 (352-804)||(3579-4028)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (714-969)||(25358-25616)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (684-960)||(12474-12753)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (344-579)||(29569-29803)
scaffold0156 (779-947)||(33162-33321)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (344-552)||(21929-22138)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (472-653)||(421-603)
scaffold0031 (344-421)||(346-423)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (524-817)||(32325-32622)
scaffold0077 (344-517)||(29775-29945)
scaffold0077 (344-477)||(32642-32772)
[»] scaffold1481 (1 HSPs)
scaffold1481 (454-803)||(1402-1751)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (339-504)||(16390-16555)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (344-517)||(9796-9966)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (665-947)||(19404-19683)
scaffold0007 (370-573)||(63287-63488)
scaffold0007 (697-960)||(26354-26618)
[»] scaffold1199 (1 HSPs)
scaffold1199 (339-552)||(2205-2417)
[»] scaffold1120 (1 HSPs)
scaffold1120 (779-947)||(1252-1419)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (344-508)||(172567-172731)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (353-615)||(22717-22980)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (353-527)||(15382-15557)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (344-490)||(13635-13781)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (353-564)||(7744-7957)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (353-549)||(1-199)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (352-504)||(55757-55910)
scaffold0046 (764-804)||(37844-37884)
[»] scaffold0945 (1 HSPs)
scaffold0945 (353-504)||(27-180)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (352-453)||(8432-8533)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (343-417)||(1-75)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (342-417)||(1-76)
[»] scaffold1547 (1 HSPs)
scaffold1547 (624-803)||(1485-1662)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (338-402)||(9942-10006)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (470-533)||(708-771)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (470-533)||(164724-164787)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 535; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 15389214 - 15389835
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatg-agtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15389214 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatggagtaaaa 15389313  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15389314 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 15389413  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15389414 atcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 15389513  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15389514 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtaattcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 15389613  T
Q  743 attttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15389614 attttaagatttttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaaa 15389713  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15389714 tcaagtctatcatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 15389813  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  15389814 tggagttttgcatatttgattt 15389835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 990
Target Start/End: Complemental strand, 33300485 - 33299834
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33300485 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 33300386  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33300385 cccttgtcgagactttggattcgggggttagttacgcgaagggaaggtactagcaccctaagcgtctatggtattccatatgaacctcttacctaattta 33300286  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300285 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgg-gggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 33300187  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33300186 tttggaaggataaaaatctcatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 33300088  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatc 841  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33300087 ttttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatc 33299990  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg---aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299989 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 33299890  T
Q  939 ttggag-tttgcatatttga-tttgttgg--aaaatgattatttttagactaacga 990  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33299889 ttggagtttttcatatttgacttttttggaaaaaatgattatttttagactaacga 33299834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 27537776 - 27537162
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27537776 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27537677  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27537676 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 27537577  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537576 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 27537477  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  27537476 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggttga 27537379  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatc 841  Q
    |||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27537378 tttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaagtc 27537282  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27537281 aagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttgg 27537182  T
Q  942 gag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27537181 gagttttgcatatttgattt 27537162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 27551985 - 27551371
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27551985 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27551886  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27551885 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 27551786  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551785 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 27551686  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  27551685 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggttga 27551588  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatc 841  Q
    |||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27551587 tttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaagtc 27551491  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27551490 aagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttgg 27551391  T
Q  942 gag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27551390 gagttttgcatatttgattt 27551371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 23927952 - 23927335
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23927952 tgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatttttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 23927853  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927852 acccttatcgggactttggattcgggggttggttacgcgaagagaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 23927753  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatta-ttacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927752 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattaattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 23927654  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttcttttt-ggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23927653 gatttggaaggatacaaatcccatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttcttttttggtgggtt-ggt 23927555  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 839  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927554 tgattttaa-attttagaaaatgg-ttttaagaagggataagaagcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 23927457  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927456 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaagaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 23927357  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  23927356 tggagttttgcatatttgattt 23927335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Original strand, 5486923 - 5487553
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5486923 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaataagtaaaaa 5487022  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5487023 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaaacgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 5487122  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5487123 tcttgtgctaaaatca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaaatgaaagaatggagggggaagaagtatgtttttggttatttttatttga 5487221  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5487222 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccactgtagttcacctcaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 5487320  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatc 841  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5487321 tttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatc 5487418  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5487419 aagtctactatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatattttt 5487518  T
Q  941 ggag-tttgcatatttgatttgttggaaaatgatt 974  Q
    |||| |||||||||||||||| | | |||||||||    
T  5487519 ggagttttgcatatttgatttttggtaaaatgatt 5487553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 345 - 947
Target Start/End: Original strand, 35090139 - 35090743
Alignment:
Q  345 gtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaac 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35090139 gtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaac 35090238  T
Q  445 ccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttat 544  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35090239 ccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaatttat 35090338  T
Q  545 cttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 644  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090339 cttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 35090438  T
Q  645 ttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgat 744  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  35090439 ttggaaggataaaaattttatgcctacatatctttaaaaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgat 35090536  T
Q  745 tttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatc 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  35090537 tttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaatc 35090636  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090637 aagtctaatatgaatattaattcaattaaacatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 35090736  T
Q  941 ggagttt 947  Q
    |||||||    
T  35090737 ggagttt 35090743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 5997019 - 5996386
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5997019 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 5996920  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5996919 cccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 5996820  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5996819 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaaattttacctaaaaatctaagtgaaagaatgaggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 5996721  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5996720 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta-gttga 5996622  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagag-aaagaggcctccaggcatgagataaaat-aaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5996621 ttttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggaaaagaagcctcaaggcatgagataaaataaaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaat 5996524  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5996523 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaagcacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatattt 5996424  T
Q  939 ttggag-tttgcatatttgatttgttgg-aaaatgatt 974  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  5996423 ttggagttttgcatatttgatcttttggtaaaatgatt 5996386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 979
Target Start/End: Original strand, 20530497 - 20531139
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20530497 gtgtgctcttgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 20530596  T
Q  443 a-cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20530597 aaccctcatcgagactttggattcgggggttggtcacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatt 20530696  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20530697 tatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 20530795  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20530796 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggt 20530894  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aa 838  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20530895 tgatttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtaaaattttaattacaagaaa 20530992  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa----acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaat 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20530993 atcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaagacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaat 20531092  T
Q  935 atttttggag-tttgcatatttgatttgttgg-aaaatgattatttt 979  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  20531093 atttttggagttttgcatatttgtttttttggtaaaatgattttttt 20531139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 30822981 - 30823584
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30822981 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 30823080  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30823081 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 30823180  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30823181 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 30823279  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30823280 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctgaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 30823378  T
Q  744 ttttaagattttt-gaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  30823379 tttt-agatttttagaaaat-ggtttcaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt-gtcgaattttaattacaaagaaat 30823475  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30823476 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatattt 30823575  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  30823576 ttggagttt 30823584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 19826377 - 19826994
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19826377 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 19826476  T
Q  444 c----ccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 539  Q
         ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19826477 aaaaacctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaa 19826576  T
Q  540 tttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
     ||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19826577 cttatcttgtgctacattcatt-gcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggaaaagaagtatgtttttggtcatttttat 19826675  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  19826676 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttagg 19826773  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aaga 837  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19826774 ttgatttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaaga 19826870  T
Q  838 aatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826871 aatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 19826970  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  19826971 tttggagttttgcatatttgattt 19826994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 14475951 - 14475297
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14475951 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatctgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 14475852  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  14475851 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 14475752  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatta-ttacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475751 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattaattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 14475653  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14475652 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaataaaatggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggt 14475554  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac--aaga 837  Q
    ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  14475553 tgatttt-agatttcagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaaaaa 14475456  T
Q  838 aatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaat 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14475455 aatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaat 14475356  T
Q  935 atttttggag-tttgcatatttgatttgtt---ggaaaatgattatttttagactaacg 989  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||| || |||||||    
T  14475355 gtttttggagttttgcatatttgattttttttgggaaaatgattttttctaaactaacg 14475297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 345 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 25714111 - 25713475
Alignment:
Q  345 gtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaac 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25714111 gtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaagtctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaac 25714012  T
Q  445 ccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttat 544  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25714011 cctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctttggtattccgtaggaacctcttacctaatttat 25713912  T
Q  545 cttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttgg----ttatttttatt 640  Q
    |||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||    
T  25713911 cttgtgctaaattca-ttgcttatctgaaagttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttttttttttttatt 25713813  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25713812 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaatcaatgtagttcacctaaaaagtttttttttggtgggtt-ggt 25713714  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-a 837  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| || ||  | |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25713713 tgattttca-attttagaaaat-ggttttaagaagggataattgtcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaa 25713616  T
Q  838 aatcaagtctattatgaatattaattcaa-taaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 935  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25713615 aatcaggtccaatatgaatattaattcaatttaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaagatttattaagaaaata 25713516  T
Q  936 tttttggag-tttgcatatttgatttgtt-ggaaaatgatt 974  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25713515 tttttgaagttttgcatatttgattttttgggaaaatgatt 25713475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 342 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25993945 - 25993324
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25993945 tgtgtgctcttgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaa-tgagtaaa 25993847  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25993846 aacccttgtcgagactttggattcgggggttgtttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatt 25993747  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg-tttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25993746 tatcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaattgggggagaagaagtatgttttttgattatttttatt 25993648  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||| | |    
T  25993647 tgatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaaaatc-ttttgatgggttggat 25993549  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag- 836  Q
    ||||||||| | ||||  |||   |||||  |||||||  ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25993548 tgattttaacaattttagaaaaaagttttacgaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcaaattttaattacaaga 25993449  T
Q  837 aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25993448 aaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 25993349  T
Q  937 ttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  25993348 ttttggagttttgcatatttgattt 25993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 342 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25552779 - 25552158
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25552779 tgtgcgctcgtgattttcggatatcaaactattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 25552680  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25552679 aacccttatcgagactttggattcgggggttgtttacgtgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccttaggaacctcttacctaatt 25552580  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg-tttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25552579 tatcttgtgctaaattca-ttgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaattgggggagaagaagtatgttttttgattatttttatt 25552481  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||   |    
T  25552480 tgatttggaaggataaaaatgctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct--aaattttttttttggtgggttgaat 25552383  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag- 836  Q
    ||||||||| | |||| ||||     ||| ||||||||  ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||     
T  25552382 tgattttaacaatttt-aaaaaaaaatttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggttgcgttgttcaaattttaattgcaaga 25552284  T
Q  837 aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 935  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25552283 aaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 25552184  T
Q  936 tttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25552183 tttttggagttttacatatttgattt 25552158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 13492392 - 13491776
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  13492392 tgtgctcgtgatttttgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcacgatttttattcatgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 13492293  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13492292 accctta---agactttggattcgggggttggttacgggaagggaatgtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaattt 13492196  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttat-ttttattt 641  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13492195 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtgtttggttattttttattt 13492096  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13492095 gatttggaaggat-tgactcctttgcctacatacccttaaatgaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggttagatt 13491997  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatga-gataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 839  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13491996 gattttaatatttttgaaaat--gttttaagaagagataagaggccccaaggcatgaggaaaaaatgagatgaggttggtcaaatttt-attacaagaaa 13491900  T
Q  840 -tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa-acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
     ||||||||| |||| || |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  13491899 ttcaagtctaatatggatgttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaggcacttgggttaaaatccaaggtttactaagaaaatatt 13491800  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  13491799 tttgaagttttgcatatttgattt 13491776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 16302770 - 16303224
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16302770 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaaatgagtaaaaa 16302869  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  16302870 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccttaagcgtctttggtattccataggaacctcttatctagatta 16302966  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16302967 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 16303066  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||   | |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  16303067 atttggaaggatttgactcccctacctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 16303163  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16303164 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 16303224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16589377 - 16588922
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16589377 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16589278  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||  |||    
T  16589277 cccttttcgagactttgaattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtatcccgtaggaacctcttacctagatta 16589178  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16589177 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 16589079  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  16589078 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagattga 16588983  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16588982 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16588922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 16606003 - 16606458
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16606003 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16606102  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||  |||    
T  16606103 cccttttcgagactttgaattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtatcccgtaggaacctcttacctagatta 16606202  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16606203 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 16606301  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  16606302 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagattga 16606397  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16606398 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16606458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 21708370 - 21708825
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21708370 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaaatgagtaaaaa 21708469  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  21708470 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgcagggaaggtgctagaaccctaagcgtctatggtattccatagaaacctcttacctagatta 21708566  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21708567 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaacaagtatgtttttggttacttttatttg 21708666  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  21708667 atttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 21708762  T
Q  743 attttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21708763 attttaagatttttttggaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 21708825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 339 - 960
Target Start/End: Original strand, 12451316 - 12451922
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12451316 atatatgtgctcgtgattttcagatatcaaatcattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctaaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 12451415  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12451416 aaaaaccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 12451512  T
Q  539 atttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct--aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttt 636  Q
    | |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12451513 aattattttgtgctaaatcaatttgcttatttgaaaattattacctagaaatatttaagtgagagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttt 12451612  T
Q  637 tatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt 736  Q
    ||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||||    
T  12451613 tatttgatttggaaggat-tgactcctttgcctacatacccttaaagaaaatggatcaaaaccaatgtagttcccctaaaaaaattc--tttggtgggtt 12451709  T
Q  737 aggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaa 835  Q
     | ||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12451710 ggattgattttaaagtttatgaaaat-agttttgagaagagataagaagcctcaaggcatgaga-aaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaa 12451807  T
Q  836 gaaa-tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaat 934  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||            | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  12451808 gaaattcaagtctaatatggacatta------------aattgattaagaaaataaaagg-aaaacacttgggttaaagtccaaggtttactaagaaaat 12451894  T
Q  935 atttttgga--gtttgcatatttgattt 960  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||    
T  12451895 attttttgaagttttgcatatttgattt 12451922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 342 - 803
Target Start/End: Original strand, 18204937 - 18205397
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18204937 tgtgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 18205036  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18205037 aaccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagat 18205135  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18205136 tattttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 18205235  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  18205236 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagg 18205331  T
Q  740 ttgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18205332 ttgattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 18205397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 18219938 - 18220396
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18219938 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18220037  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18220038 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 18220136  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18220137 ttttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 18220236  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  18220237 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 18220332  T
Q  742 gattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18220333 gattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 18220396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 16635775 - 16635319
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16635775 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16635676  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  16635675 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 16635576  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    | ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16635575 ttttgtgctaaattca-ttgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttttattga 16635477  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||||    
T  16635476 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggttga 16635381  T
Q  744 ttttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16635380 ttttaagatttttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 16635319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 16645732 - 16645276
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16645732 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16645633  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  16645632 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 16645533  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    | ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16645532 ttttgtgctaaattca-ttgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttttattga 16645434  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||||    
T  16645433 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggttga 16645338  T
Q  744 ttttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16645337 ttttaagatttttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 16645276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 342 - 804
Target Start/End: Original strand, 27047045 - 27047506
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaa 440  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27047045 tgtgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaaatgagtaa 27047144  T
Q  441 aaa-cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 539  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27047145 aaaacccttttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttag 27047244  T
Q  540 tttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 638  Q
     |||||||||||| | || | ||| ||| ||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047245 attatcttgtgctaagtt-acttgtttacttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 27047342  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  27047343 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttag 27047440  T
Q  739 gttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
     |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27047441 attgatttttagactttttgaaaat-ggttttaagaagaggaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27047506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 27057291 - 27057750
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  27057291 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 27057390  T
Q  443 a-cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27057391 aacccttttcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagat 27057490  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| | || | ||| ||| ||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27057491 tatcttgtgctaagtt-acttgtttacttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27057588  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |    
T  27057589 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttagat 27057686  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27057687 tgatttttagactttttgaaaat-ggttttaagaagaggaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27057750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 24920835 - 24920381
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24920835 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 24920736  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  24920735 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatta 24920639  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24920638 tcttgtgttaaatttatttgcttacttgaaaaattattacttaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtcatttttatttg 24920539  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  24920538 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 24920444  T
Q  743 attttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24920443 attttaagatttttttgaaaatgggttctaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 24920381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 24485252 - 24485701
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485252 gattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 24485351  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24485352 agactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgct 24485451  T
Q  553 gaattgattt-gcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
     || | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485452 aaaatcattttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 24485551  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    |||  ||  |||| ||||||| | |||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24485552 ggacgaa--tcctctgcctacgtgcccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaag 24485647  T
Q  751 atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24485648 atttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggccttacggcatgagataaaa 24485701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 541 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 13827924 - 13827522
Alignment:
Q  541 ttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
    ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827924 ttancttgtgctaaattcatt-gcttatttgaacatttattacctaaaaatctaagtgaaagaatgacgggagaagaagtatgtttttggttatttttat 13827826  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  13827825 ttgatttggaagtataaaaatctcatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttagg 13827728  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaa 838  Q
    |||||||||| | |||||||||   ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13827727 ttgattttaataattttgaaaaaaagttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaa-tttaattacaagaa 13827629  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13827628 atcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaagcacttgggttacaaaccaaggtttattaa-aaaatattt 13827531  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    ||| |||||    
T  13827530 ttgaagttt 13827522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 30995327 - 30995785
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30995327 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 30995426  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30995427 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 30995526  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| ||   | ||| |||||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30995527 tcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 30995624  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  30995625 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 30995720  T
Q  741 tgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30995721 tgattttaaggttttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 30995785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 18112289 - 18111832
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18112289 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18112190  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18112189 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 18112091  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    | ||||||| || | | ||| |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18112090 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 18111993  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagtt-cacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||| |||  ||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  18111992 gatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaaatttc--tttagtgggttagg 18111897  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18111896 ttgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 18111832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 18126834 - 18126377
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18126834 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18126735  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18126734 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 18126636  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    | ||||||| || | | ||| |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126635 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 18126538  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagtt-cacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||| |||  ||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  18126537 gatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaaatttc--tttagtgggttagg 18126442  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18126441 ttgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 18126377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 344 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 27960637 - 27960228
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  27960637 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa- 27960539  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27960538 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 27960439  T
Q  544 tcttgtgctgaattga-tttgctta-tttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||| |||| |||| | || ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27960438 tcttatgctaaattcacttggcttactttgaaaaattatttcct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27960340  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  27960339 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 27960244  T
Q  741 tgattttaagattttt 756  Q
    ||||||||||||||||    
T  27960243 tgattttaagattttt 27960228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 590 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 25693131 - 25692740
Alignment:
Q  590 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt---atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25693131 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 25693032  T
Q  687 agggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggc 785  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  25693031 agggatcaaaatcaatgtagttcacctaaaaagtttttttttggtgggtt-ggttgattttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggc 25692935  T
Q  786 ctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaa-taaagcatttgattaa 882  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25692934 ctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaggtccaatatgaatattaattcaatttaagcatttgattaa 25692835  T
Q  883 gaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgatttgtt-ggaaaatgatt 974  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25692834 gaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaagatttattaagaaaatatttttgaagttttgcatatttgattttttgggaaaatgatt 25692740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 590 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 25699772 - 25699381
Alignment:
Q  590 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt---atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25699772 tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttttttttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaa 25699673  T
Q  687 agggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggc 785  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  25699672 agggatcaaaatcaatgtagttcacctaaaaagtttttttttggtgggtt-ggttgattttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggc 25699576  T
Q  786 ctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaa-taaagcatttgattaa 882  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25699575 ctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaggtccaatatgaatattaattcaatttaagcatttgattaa 25699476  T
Q  883 gaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgatttgtt-ggaaaatgatt 974  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25699475 gaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaagatttattaagaaaatatttttgaagttttgcatatttgattttttgggaaaatgatt 25699381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 25654339 - 25653891
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25654339 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcatcaatctttgaactttcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 25654240  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||| ||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25654239 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggtaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaacctcttacctagattatcttgtgc 25654140  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25654139 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatttaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 25654040  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25654039 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaaattc--tttggtgggttaggttgattttaag 25653944  T
Q  751 atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25653943 atttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 25653891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 28304591 - 28304133
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28304591 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28304492  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  28304491 cccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagaatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 28304392  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt-tggttatttttatt 640  Q
    ||||||||| || | | ||| | |||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28304391 tcttgtgctaaaat-acttgttcatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttcttgttatttttatt 28304294  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||   | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  28304293 tgatttggaag--aacaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 28304198  T
Q  741 tgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28304197 tgattttaagatttttttggaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 28304133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 21358422 - 21358873
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatt-tttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21358422 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 21358521  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  21358522 gagactttggattcgggtgttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 21358621  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21358622 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 21358720  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    ||||  | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  21358721 aagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattt 21358816  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21358817 taagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagagacctcaaggcatgagataaaa 21358873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 23962404 - 23962855
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatt-tttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23962404 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 23962503  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23962504 gagactttggattcgggtgttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 23962603  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23962604 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 23962702  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    ||||  | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23962703 aagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattt 23962798  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23962799 taagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagagacctcaaggcatgagataaaa 23962855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 23982514 - 23982965
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatt-tttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23982514 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 23982613  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23982614 gagactttggattcgggggttggtttcaaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 23982713  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23982714 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 23982812  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    ||||  | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23982813 aagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattt 23982908  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23982909 taagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 23982965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 344 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13828156 - 13827922
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13828156 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13828057  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13828056 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 13827957  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatta 578  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  13827956 atcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaatta 13827922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Original strand, 28267593 - 28267822
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28267593 tgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28267692  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28267693 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 28267792  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28267793 tcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 28267822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Original strand, 28346342 - 28346571
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28346342 tgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28346441  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28346442 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 28346541  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28346542 tcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 28346571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 344 - 538
Target Start/End: Original strand, 8719657 - 8719848
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8719657 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8719756  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8719757 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatgttatcccataggaacctctttccta 8719848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 344 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 25699958 - 25699770
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  25699958 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatctttaatctttgaactctcgatttttatttttgggaagagaaaaaatgagtaaaaa 25699859  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctct 532  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  25699858 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaaactct 25699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 463 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 28266758 - 28266420
Alignment:
Q  463 ttcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgattt 562  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||    
T  28266758 ttcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaat-actt 28266660  T
Q  563 gcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaat 660  Q
    | | |||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | || |    
T  28266659 gttcatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttctgttatttttatttgatttggaag--aacaagt 28266563  T
Q  661 cctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaaga--tttttga 758  Q
    ||| ||||||| ||||||    | ||||||||||||||| | ||||||   || || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  28266562 cctctgcctacgtaccctgttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttacactcaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaagatttttttgg 28266465  T
Q  759 aaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28266464 aaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 28266420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 463 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 28345507 - 28345169
Alignment:
Q  463 ttcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgattt 562  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||    
T  28345507 ttcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaat-actt 28345409  T
Q  563 gcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaat 660  Q
    | | |||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | || |    
T  28345408 gttcatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttctgttatttttatttgatttggaag--aacaagt 28345312  T
Q  661 cctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaaga--tttttga 758  Q
    ||| ||||||| ||||||    | ||||||||||||||| | ||||||   || || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  28345311 cctctgcctacgtaccctgttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttacactcaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaagatttttttgg 28345214  T
Q  759 aaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28345213 aaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 28345169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 11064035 - 11063824
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  11064035 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaa 11063938  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  11063937 aaccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaatt 11063841  T
Q  542 tatcttgtgctgaattg 558  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11063840 tatcttgtgctaaattg 11063824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 344 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5008304 - 5008128
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  5008304 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatatttattcataagaagggaaaaaatgagtaaaaa 5008205  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattcc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5008204 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattcc 5008128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 353 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16097898 - 16097687
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097898 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 16097799  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  16097798 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 16097699  T
Q  552 tgaattgatttg 563  Q
    | |||| |||||    
T  16097698 taaattcatttg 16097687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 353 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18587485 - 18587362
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587485 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 18587386  T
Q  453 agactttggattcgggagttggtt 476  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  18587385 agactttggattcgggggttggtt 18587362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 25693234 - 25693129
Alignment:
Q  427 gaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccatagga 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25693234 gaaaaaatgagtaaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtagga 25693135  T
Q  527 acctct 532  Q
    | ||||    
T  25693134 aactct 25693129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 445
Target Start/End: Original strand, 335295 - 335388
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacc 445  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  335295 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtggaaagggaaaaaatgagtaaaaacc 335388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15141728 - 15141656
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttatt 416  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15141728 tgtgctcgcgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttatt 15141656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 740 - 965
Target Start/End: Original strand, 18753564 - 18753793
Alignment:
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaa-gaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaga 837  Q
    |||||||||| |||| ||||||   ||||||| || |||| ||||||| || || ||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  18753564 ttgattttaacatttgtgaaaaaaagtttttaaaaagagataagaggcatcaagacatgagagaaaataagatgaagtttttcaaattttaattataaga 18753663  T
Q  838 aatc-aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa-cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 935  Q
    || | |||||   |||| ||||||| |  || || |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  18753664 aacccaagtca--tatggatattaaattgattaaacatttgattaaagaaataaaaggaaaaaacatttgagttaaaatccaaggtttattaagcaaata 18753761  T
Q  936 tttttgga--gtttgcatatttgatttgttgg 965  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||| ||||    
T  18753762 ttttttgaagttttgcatatttgattttttgg 18753793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18843007 - 18842945
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgattttta 414  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  18843007 tgattttcggatatcaaaccattaattggtttaaatcgtcaatctttgaactctcaattttta 18842945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 764 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16089688 - 16089648
Alignment:
Q  764 ggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16089688 ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16089648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 527; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 6855957 - 6856574
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6855957 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 6856056  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6856057 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 6856156  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856157 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 6856256  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856257 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 6856356  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatca 842  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856357 ttttatgatttttgaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatca 6856455  T
Q  843 agtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgg 942  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856456 agtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgg 6856555  T
Q  943 ag-tttgcatatttgattt 960  Q
    || ||||||||||||||||    
T  6856556 agttttgcatatttgattt 6856574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 17684935 - 17685555
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17684935 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17685034  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17685035 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacatgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 17685134  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685135 ccttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 17685234  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685235 attggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 17685334  T
Q  744 ttttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17685335 ttttaagatttttttgaaaatgagtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaaat 17685434  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17685435 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatactttt 17685534  T
Q  941 ggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  17685535 ggagttttgcatatttgattt 17685555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 342 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 35040315 - 35039696
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35040315 tgtgtgctcgtgattttcggatatcaaacaattaattgatttgaaccgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 35040216  T
Q  442 aa-cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 540  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35040215 aaacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaat 35040116  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35040115 ttatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagcat-tttttggttatttttatt 35040018  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040017 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcatctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 35039918  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  35039917 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcggattttaattacaaagaaa 35039818  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35039817 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaatcaaggtttattaagaaaatatttt 35039718  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35039717 tggagttttgcatatttgattt 35039696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 34527846 - 34528468
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34527846 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 34527945  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34527946 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 34528045  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528046 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 34528145  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528146 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 34528245  T
Q  744 ttttaagatttttg--aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    |||||| | |||||  ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528246 ttttaacaattttgaaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 34528345  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528346 caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 34528445  T
Q  939 ttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  34528446 ttggagttttgcatatttgattt 34528468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 34541820 - 34542442
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34541820 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 34541919  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34541920 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 34542019  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542020 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 34542119  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542120 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 34542219  T
Q  744 ttttaagatttttg--aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    |||||| | |||||  ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542220 ttttaacaattttgaaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 34542319  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542320 caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 34542419  T
Q  939 ttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  34542420 ttggagttttgcatatttgattt 34542442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 41232315 - 41232920
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41232315 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 41232414  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41232415 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 41232514  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232515 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 41232614  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  41232615 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 41232712  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  41232713 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaat 41232812  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232813 caagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 41232912  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  41232913 tggagttt 41232920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 20364529 - 20365152
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20364529 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatctgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 20364628  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364629 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaaggaaatgtgctagcaccctaagcgtctacggtattccataggaacctcttacctaattta 20364728  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20364729 tcttgtgctaaattca-ttggttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggaggagaagaagtatgtttttggtcatttttatttg 20364827  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20364828 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccaaaaaagttactttttggtgggttaggttg 20364927  T
Q  743 attttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20364928 attttaagattttttaaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaaaaaat 20365027  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa----acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20365028 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagggacacttgggttaccagccaaggtttattaagaaaatat 20365127  T
Q  937 ttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  20365128 ttttggagttttgcatatttgattt 20365152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 35148572 - 35147967
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35148572 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 35148473  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35148472 cccttattgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 35148373  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148372 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 35148273  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  35148272 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 35148175  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  35148174 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgagattgttcacgttttaattacaagaaaat 35148075  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148074 caagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 35147975  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  35147974 tggagttt 35147967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 44375413 - 44374794
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44375413 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 44375314  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44375313 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 44375214  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaa--tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375213 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaactgttacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatt 44375115  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44375114 tgatttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttcttttttgtgggttaggt 44375015  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 839  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44375014 tgattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaaaggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcagattttaattacaagaaa 44374916  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374915 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 44374816  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  44374815 tggagttttgcatatttgattt 44374794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 44390994 - 44390375
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44390994 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 44390895  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44390894 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 44390795  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaa--tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44390794 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaactgttacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatt 44390696  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44390695 tgatttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttcttttttgtgggttaggt 44390596  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 839  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44390595 tgattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaaaggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcagattttaattacaagaaa 44390497  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44390496 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 44390397  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  44390396 tggagttttgcatatttgattt 44390375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 35140231 - 35139626
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35140231 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 35140132  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35140131 cccttattgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 35140032  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35140031 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 35139932  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  35139931 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 35139834  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  35139833 ttttacgatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgagattgttcacgttttaattacaagaaaat 35139734  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35139733 caagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 35139634  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  35139633 tggagttt 35139626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 42564376 - 42564982
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42564376 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 42564475  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42564476 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 42564575  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42564576 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 42564675  T
Q  644 tttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  42564676 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 42564773  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  42564774 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaa 42564873  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42564874 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 42564973  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  42564974 ttggagttt 42564982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 42573000 - 42573606
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42573000 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 42573099  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42573100 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 42573199  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42573200 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 42573299  T
Q  644 tttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  42573300 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 42573397  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  42573398 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaa 42573497  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42573498 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 42573597  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  42573598 ttggagttt 42573606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 943
Target Start/End: Original strand, 15942988 - 15943591
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15942988 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15943087  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15943088 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 15943187  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943188 tcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 15943287  T
Q  644 tttggaaggat--aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15943288 cttggaaggataaaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 15943385  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aa 838  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||    
T  15943386 gattttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgagattgttcacgttttaattacaagaaa 15943485  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15943486 atcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 15943585  T
Q  938 tttgga 943  Q
    ||||||    
T  15943586 tttgga 15943591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 943
Target Start/End: Original strand, 15951498 - 15952102
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15951498 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15951597  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15951598 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 15951697  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951698 tcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 15951797  T
Q  644 tttggaaggat---aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  15951798 tttggaaggataaaaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 15951895  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-a 837  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |    
T  15951896 tgattttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggtatgagagaaaaaataaggtgagattgttcacgttttaattacaagaa 15951995  T
Q  838 aatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951996 aatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 15952095  T
Q  937 ttttgga 943  Q
    |||||||    
T  15952096 ttttgga 15952102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 342 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25496209 - 25495590
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25496209 tgtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 25496110  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  25496109 aaccttcatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattacataggaacctcttacctagat 25496010  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25496009 tatcttgtgctaaattcatttgctta-ctgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 25495911  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  25495910 gatttggaaagataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggtt 25495813  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25495812 gattttaa-ttttttgaaaat-ggttttaagaagagataagaagcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaa 25495715  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata-t 936  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  25495714 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaaggaaataaaaggaaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaaaaaaatatt 25495615  T
Q  937 ttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  25495614 ttttggagttttgcatatttgattt 25495590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 24293802 - 24293198
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24293802 tgtgctcgtgattttcggatctcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 24293703  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  24293702 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgcagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaagaacctcttacctaaatta 24293603  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293602 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaacggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 24293503  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24293502 tttgaaaggataacaatcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 24293404  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatc 841  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24293403 ttttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatc 24293306  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24293305 aagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttgggttacaaaccaagttttattaagaaaatatttt 24293206  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    || |||||    
T  24293205 tgaagttt 24293198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 26731633 - 26732248
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26731633 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 26731732  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26731733 ccctcatcaagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattta 26731832  T
Q  544 tc-ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    || ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26731833 tctttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttactt 26731931  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  26731932 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggtt 26732029  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26732030 gatttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaag 26732126  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26732127 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 26732226  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  26732227 gggagttttgcatatttgattt 26732248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 26717500 - 26718115
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26717500 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctttatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 26717599  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26717600 ccctcatcaagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattta 26717699  T
Q  544 tc-ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    || ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26717700 tctttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttactt 26717798  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  26717799 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggtt 26717896  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26717897 gatttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaag 26717993  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717994 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 26718093  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  26718094 gggagttttgcatatttgattt 26718115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 346 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 24287231 - 24286630
Alignment:
Q  346 tgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacc 445  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24287231 tgctcgtgattttcggatctcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgagaagggaaaaa-tgagtaaaaacc 24287133  T
Q  446 cttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatc 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  24287132 cttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgcagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaagaacctcttacctaaattatc 24287033  T
Q  546 ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 645  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287032 ttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaacggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 24286933  T
Q  646 tggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatt 745  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24286932 tgaaaggataacaatcctctgcctacatacctttaaagaaaagggatcaaaaccaatatagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgatt 24286834  T
Q  746 ttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaa 843  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24286833 ttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaa 24286736  T
Q  844 gtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24286735 gtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttgggttacaaaccaagttttattaagaaaatatttttg 24286636  T
Q  942 gagttt 947  Q
     |||||    
T  24286635 aagttt 24286630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 899
Target Start/End: Original strand, 26896528 - 26897083
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26896528 tgtgctcgtgatttttggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttatttgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 26896627  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  26896628 cccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctatggtatcccataggaacctcttacctagatta 26896727  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896728 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaatttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 26896827  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26896828 atttggaaggataaaagtcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttg 26896926  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26896927 attttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaat 26897024  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa 899  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26897025 caagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa 26897083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 347 - 792
Target Start/End: Original strand, 42247477 - 42247923
Alignment:
Q  347 gctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaa-aatgagtaaaaacc 445  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42247477 gctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaattctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaaacc 42247576  T
Q  446 cttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatc 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247577 cttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccataggaacctcttacctaatttatc 42247676  T
Q  546 ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 645  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247677 ttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 42247776  T
Q  646 tggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatt 745  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247777 tggaaggataaaaatcctatgcatacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatt 42247876  T
Q  746 ttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccagg 792  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42247877 ttaagatttttgaaaatgagttttaagaagagaaagaggcctccagg 42247923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 20921089 - 20920463
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  20921089 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggaaaacaatgagtaaaaa 20920990  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20920989 ccctta---agattttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttgcctaattta 20920893  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20920892 tcttgtgctaaatcaatttgcttatttgaaaattattgcctaaacatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 20920793  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20920792 tttggaaggacaaaaatcctttccctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcgcctaaaaaatttctttttggtgggttagattga 20920694  T
Q  744 ttttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagaga-------aagaggcctccaggcatgag------ataaaataaggtgaggttggtcaaattttaa 829  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||       |||||||||| |||||| ||      | |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20920693 ttttaatattttttgaaaaaaggttttaagaagagataagaataagaggcctcaaggcataagagaaaaaaaaaaaaagatgatgttggtcaaattttaa 20920594  T
Q  830 ttacaagaaa-tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaa 928  Q
    |||||||||| | ||||||| |||| || |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  20920593 ttacaagaaatttaagtctaatatggatgttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacactt--gctgcaaaccaaggtttattaa 20920496  T
Q  929 gaaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20920495 gaaaatatttttgaagttttgcatatttgattt 20920463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 343 - 803
Target Start/End: Original strand, 34068673 - 34069123
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  34068673 gtgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttatccgtgggaatggaaaaaatgagtaaaa 34068772  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34068773 accctta---agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtactagcgtcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 34068869  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34068870 atcttgtgctaaattcatttgcaaa----aaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 34068964  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||   | |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34068965 atttggaaggat-tgactcccctgcctatatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 34069062  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34069063 attttaagatttttgaaaataggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 34069123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 614 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 20623692 - 20623328
Alignment:
Q  614 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623692 agaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcccatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 20623593  T
Q  714 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20623592 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagggaaagaggcctcaaggcgtgagataaaataaggtgag 20623493  T
Q  814 gttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttac 911  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20623492 gttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctactatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttac 20623393  T
Q  912 aaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgatttgttgg-aaaatgatt 974  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20623392 aagccaaggtttattaagaaaatatttttggagttttgcatatttgattttttggtaaaatgatt 20623328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 342 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 28481602 - 28481147
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  28481602 tgtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggggaaaaatgagttaa 28481503  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  28481502 aaccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagat 28481406  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481405 tatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 28481306  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  28481305 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 28481210  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28481209 tgattttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 28481147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16275032 - 16274574
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16275032 tgtgctcacgattttcggatgtcaaatcattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16274933  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  16274932 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 16274833  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274832 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggag----aagaagtatgtttttggttatttttattt 16274737  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16274736 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 16274639  T
Q  742 gattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16274638 gattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16274574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16284208 - 16283750
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16284208 tgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16284109  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  16284108 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 16284009  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16284008 atcttgtgcaaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggag----aagaagtatgtttttggttatttttattt 16283913  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16283912 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 16283815  T
Q  742 gattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16283814 gattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16283750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 21151689 - 21151235
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21151689 tgtgctcgcgattttcggatatcacaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21151590  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21151589 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 21151493  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151492 tattgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 21151394  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagtt-cacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  21151393 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaatcgacgtagttccacccaaaaa-tttc--tatggtgggttaggtt 21151299  T
Q  742 gattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21151298 gattttaagatttttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 21151235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 30524527 - 30524972
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30524527 gattttcggatatcagaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggacaaaatgagtaaaaacccttattg 30524626  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30524627 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgct 30524726  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttgg-ttatttttatttgatttggaag 651  Q
      ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30524727 acattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttatttgatttggaag 30524825  T
Q  652 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaaga 751  Q
    |  | ||  ||| ||||||| |||||||   |  |||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30524826 g--acaagccctctgcctacgtaccctt-ttgggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaaga 30524920  T
Q  752 tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30524921 tttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 30524972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 15600991 - 15600531
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15600991 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15600892  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  15600891 cctttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaaccgcttacctagatta 15600792  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta-tttttattt 641  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15600791 tcttgtgctaaatttatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttttattt 15600692  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||   ||||||||||||||    
T  15600691 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--cttggtgggttaggt 15600596  T
Q  741 tgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15600595 tgattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 15600531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 343 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 34437348 - 34436891
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34437348 gtgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 34437249  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  34437248 acccttatcgagactttggattcgggggttgattatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 34437149  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| ||   | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34437148 atcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 34437051  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  34437050 gatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 34436955  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34436954 tgattttaagattttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 34436891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 342 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 29855602 - 29855142
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  29855602 tgtgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaaggtaaaaaatgagtaaa 29855503  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29855502 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtccatggtattccataggaacctcttacctaaat 29855403  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
    ||| ||||||| || | | ||| |||||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855402 tattttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 29855305  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    |||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||  | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||    
T  29855304 ttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaactgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttag 29855209  T
Q  739 gttgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29855208 gttgattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 29855142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 365 - 804
Target Start/End: Original strand, 33306576 - 33307011
Alignment:
Q  365 tcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggatt 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33306576 tcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggatt 33306675  T
Q  465 cgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgc 564  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | ||||    
T  33306676 cgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattatcttgtgctaaaaaaaattgc 33306775  T
Q  565 ttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcct 663  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||    
T  33306776 ttatttgaaaaattattacct-gaactctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttagttatttttatttgatttggaagg--acaagtcct 33306872  T
Q  664 atgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaat 762  Q
     ||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33306873 ctgcctacgtaccctttttaggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggttgattttaagattttttgaaat 33306970  T
Q  763 gggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33306971 gggtttcaagaagag-aagaggcctcaaggcatgagataaaa 33307011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 42386377 - 42385921
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42386377 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 42386278  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42386277 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagatt 42386178  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386177 atcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 42386080  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  42386079 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 42385984  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42385983 tgattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 42385921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 42401261 - 42400805
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42401261 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 42401162  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42401161 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagatt 42401062  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42401061 atcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 42400964  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  42400963 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 42400868  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42400867 tgattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 42400805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 3754885 - 3755340
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3754885 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 3754984  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  3754985 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 3755084  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3755085 tcttgtgct-aagttacttgtttatttgaaaaattatcgcct-aatgtctaaatgaaagaatggagggagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 3755182  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||     ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3755183 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 3755278  T
Q  743 attttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3755279 attttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 3755340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 10681324 - 10681785
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10681324 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 10681423  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  10681424 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 10681523  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10681524 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattatcacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 10681623  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  10681624 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 10681719  T
Q  741 tgattttaagattttt---gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10681720 tgattttaagatttttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 10681785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 2653289 - 2652834
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2653289 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 2653190  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  2653189 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 2653090  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2653089 tcttgtgct-aagttacttgtttatttgaaaaattatcgcct-aatgtctaaatgaaaggatggagggagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 2652992  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||     ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  2652991 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 2652896  T
Q  743 attttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2652895 attttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 2652834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 3764936 - 3765391
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3764936 tgtgctcgcgattttcggatgttaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 3765035  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  3765036 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 3765135  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3765136 tcttgtgct-aagttacttgtttatttgaaaaattatcgcct-aatgtctaaatgaaagaatggagggagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 3765233  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||     ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3765234 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 3765329  T
Q  743 attttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3765330 attttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 3765391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 27680932 - 27681385
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27680932 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 27681031  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  27681032 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 27681131  T
Q  552 tgaatt-gatttgcttatttg--aaaattattacc-taaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 647  Q
    | |||| | || ||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681132 taaattcgtttggcttacttgaaaaaattattaccaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 27681231  T
Q  648 gaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    |||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27681232 gaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattt 27681327  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27681328 taagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27681385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 343 - 804
Target Start/End: Original strand, 21850121 - 21850582
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21850121 gtgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 21850220  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||| ||| |    
T  21850221 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacttaaat 21850320  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850321 tatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 21850420  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||    
T  21850421 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttag 21850516  T
Q  739 gttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21850517 gctgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 21850582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 21858557 - 21859017
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21858557 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21858656  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  21858657 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacttaaatt 21858756  T
Q  543 atcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858757 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 21858856  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| ||||||||||    
T  21858857 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttagg 21858952  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21858953 ctgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 21859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Original strand, 31354719 - 31355171
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaaacccttat 450  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31354719 tgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaaacccttat 31354818  T
Q  451 cgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgt 549  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  31354819 cgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgt 31354918  T
Q  550 gctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354919 gctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 31355018  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    ||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  31355019 aagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaagttgatttta 31355114  T
Q  749 aga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31355115 agatttttttgaaaat-ggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcttgagataaaa 31355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 353 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 22187585 - 22187134
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa-cccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22187585 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaacccttatc 22187486  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22187485 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtg 22187386  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22187385 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagcaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 22187286  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| | ||||| ||||| ||   | ||||||||||||||  | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22187285 aagg--acaagtcctctacctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaactgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttt 22187190  T
Q  748 aagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22187189 aagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 22187134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 34685959 - 34685499
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34685959 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 34685860  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| |    
T  34685859 acccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaat 34685760  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685759 tatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 34685661  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  34685660 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagg 34685565  T
Q  740 ttgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34685564 ttgattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 34685499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 42245798 - 42245347
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42245798 gattttcggatatcaaaccatcgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatctttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttttcg 42245699  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  ||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  42245698 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtattccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 42245599  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245598 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 42245500  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc---ttaaaga-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||   ||   || ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  42245499 gg--acaagtcctctgcctacgtacccctttttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttggttt 42245404  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42245403 taagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 42245347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 34708380 - 34707922
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34708380 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 34708281  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||    
T  34708280 cccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaatt 34708181  T
Q  543 atcttgtgctgaattga-tttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| | || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34708180 atcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 34708082  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  |||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  34708081 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 34707987  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34707986 tgattttaagattttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 34707922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 35304954 - 35304648
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35304954 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaac--tcgatttttatttgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 35304857  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||| ||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  35304856 accccta---agtctttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 35304760  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35304759 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaatttattacctaaaaatttaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 35304660  T
Q  642 gatttggaagga 653  Q
    ||||||||||||    
T  35304659 gatttggaagga 35304648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Original strand, 11622049 - 11622504
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11622049 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 11622148  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||| || | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  11622149 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaagatgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacttagattatcttgtg 11622248  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  11622249 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgtttttatttgatttggg 11622348  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacc--cttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    |||  | || |||| ||||||| ||||   ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11622349 agg--acaagtcctctgcctacgtaccattttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttt 11622444  T
Q  748 aaga---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11622445 aagattttttttgaaaatggtttttaagaagagaaagatgcctcaaggcatgagataaaa 11622504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 344 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 21111613 - 21111029
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21111613 tgtgctcttgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaa 21111514  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||     |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  21111513 ccct-----agactttgaattcagaggttggttacgcgaagggaaggtgctagaaccctaagcgtctatggtattccgtaggaacctcttgcctaaatta 21111419  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg--tttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||| ||| || ||||||    
T  21111418 tcttgtgctaaattattttgcttatttgaaaattatt-gctaagagtctaggtggaagaatgggggtagaagaaatatgttttttttgttgttgttattt 21111320  T
Q  642 ga-tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ct-aaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    || |||| ||||||  ||||| | ||||||| ||| ||     || ||||||||||| ||| ||||||| | || |||||  || |||||||||||||||    
T  21111319 gattttgtaaggat--aaatcatttgcctacgtactct----caagagggatcaaaatcaa-gtagttctctctcaaaaaaattatttttggtgggttag 21111227  T
Q  739 gttgattttaagatttttg--aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaa 835  Q
     |||||||||| |||||||  ||||   ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21111226 attgattttaacatttttgaaaaaaaatgttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattataa 21111127  T
Q  836 gaaa-tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 933  Q
    ||||  ||| |||| |||  ||||||| |  || || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  21111126 gaaacccaaatctaatatagatattaaattgattaaacatttgattaagaaaa-aaaaggaaaaacaattgggttaaaatccaaagtttaataagaaaa 21111029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 335 - 534
Target Start/End: Original strand, 38153990 - 38154189
Alignment:
Q  335 atggatatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaat 434  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38153990 atggataattgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaat 38154089  T
Q  435 gagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctta 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  38154090 gagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctctta 38154189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 560 - 960
Target Start/End: Original strand, 17095633 - 17096027
Alignment:
Q  560 tttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaa 659  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  17095633 tttgcttatttgaaaattattgc-taagagtctaagtgaaagaatggggg---aagaagtatgtcttttgttgtttttatttgatttggaaggattaac- 17095727  T
Q  660 tcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaa 759  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  17095728 tcttttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcctgtaaagaatttcttt--ggtgggttggattgattttaa-atttttgaa 17095824  T
Q  760 aatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctattatgaata 857  Q
    ||| | |||| ||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| ||     
T  17095825 aattg-ttttaagaagggataagaggcctcaagacatgagagaaaataagatgaggttgatcaaattttaattataagaaacccaagtctaatatggatg 17095923  T
Q  858 ttaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttg 956  Q
    |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  17095924 ttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaacatttgggttaaaatcgaaggtttattaagaaaatatttttgaagttttgcataattg 17096023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Original strand, 19655563 - 19655789
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  19655563 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggagggaaaaaaatgagtaaaaa 19655662  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  19655663 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacataattta 19655759  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19655760 tcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 19655789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 344 - 552
Target Start/End: Original strand, 30683105 - 30683312
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30683105 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 30683204  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  30683205 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagatta 30683303  T
Q  544 tcttgtgct 552  Q
    |||||||||    
T  30683304 tcttgtgct 30683312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 344 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 25493474 - 25493307
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25493474 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 25493375  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25493374 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 25493307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Original strand, 21320618 - 21320845
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21320618 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccatttaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtggga-gggaaaaaatgagtaaa 21320716  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  21320717 aaccctta---agactttggattcaggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacctaatt 21320813  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21320814 tatcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 21320845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14630662 - 14630437
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14630662 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 14630565  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  14630564 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaattt 14630468  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14630467 atcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 14630437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 633 - 960
Target Start/End: Original strand, 17069159 - 17069484
Alignment:
Q  633 tttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtg 732  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||  ||||    
T  17069159 tttttatttgatttggaaggattaac-tcttttccctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttctcgtgaagaatttcttt--ggtg 17069255  T
Q  733 ggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaa-gaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaatt 831  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| || |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17069256 ggttggattgattttaa-atttttgaaaatgg-ttttaagaagagatatgaggcctcaagacatgggagaaaataagatgaggttgatcaaattttaatt 17069353  T
Q  832 acaagaaatc-aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaaga 930  Q
    | |||||| | ||||||| |||| || |||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  17069354 ataagaaacccaagtctaatatggatgttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttaaactcgaaggtttattaaga 17069453  T
Q  931 aaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  17069454 aaatatttttgaagttttgcataattgattt 17069484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 633 - 960
Target Start/End: Original strand, 17075152 - 17075477
Alignment:
Q  633 tttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtg 732  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||  ||||    
T  17075152 tttttatttgatttggaaggattaac-tcttttccctacatacccttcaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttctcgtgaagaatttcttt--ggtg 17075248  T
Q  733 ggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaa-gaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaatt 831  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| || |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17075249 ggttggattgattttaa-atttttgaaaatgg-ttttaagaagagatatgaggcctcaagacatgggagaaaataagatgaggttgatcaaattttaatt 17075346  T
Q  832 acaagaaatc-aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaaga 930  Q
    | |||||| | ||||||| |||| || |||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  17075347 ataagaaacccaagtctaatatggatgttaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttaaactcgaaggtttattaaga 17075446  T
Q  931 aaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  17075447 aaatatttttgaagttttgcataattgattt 17075477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 477
Target Start/End: Original strand, 38611414 - 38611545
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38611414 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 38611513  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggtta 477  Q
    |||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  38611514 accctta---agactttggattcgggggttggtta 38611545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 874 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 44374551 - 44374464
Alignment:
Q  874 tttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44374551 tttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttttgcatatttgattt 44374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 411 - 510
Target Start/End: Original strand, 39842078 - 39842174
Alignment:
Q  411 tttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtct 510  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39842078 tttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta---agaatttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtct 39842174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 417
Target Start/End: Original strand, 23283970 - 23284032
Alignment:
Q  355 ttttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattc 417  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23283970 ttttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattc 23284032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 546 - 615
Target Start/End: Original strand, 17069048 - 17069117
Alignment:
Q  546 ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 615  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  17069048 ttgtgctaaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaagtgaaagaatgggggaagaag 17069117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 17881390 - 17881341
Alignment:
Q  484 gggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctt 533  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17881390 gggaaggtattagcaccctaaacgtctatagtattctataggaacctctt 17881341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 522; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 18302861 - 18303466
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18302861 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18302960  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18302961 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgtgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattcagtaggaacctcttacctaattta 18303060  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303061 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 18303160  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303161 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 18303260  T
Q  744 ttttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatc 841  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18303261 ttttaaaattttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaatc 18303360  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303361 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 18303460  T
Q  942 gagttt 947  Q
    ||||||    
T  18303461 gagttt 18303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 13833113 - 13832510
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13833113 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13833014  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13833013 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 13832914  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13832913 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta-ttttatttga 13832816  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  13832815 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 13832718  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13832717 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaat 13832618  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832617 caagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 13832518  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  13832517 tggagttt 13832510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 13841143 - 13840540
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13841143 tgtgctcgtgattttcagatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13841044  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13841043 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 13840944  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13840943 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta-ttttatttga 13840846  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  13840845 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 13840748  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13840747 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaat 13840648  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13840647 caagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 13840548  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  13840547 tggagttt 13840540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 24185927 - 24186542
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24185927 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 24186026  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24186027 ccctcatcaagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattta 24186126  T
Q  544 tc-ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    || ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24186127 tctttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttactt 24186225  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  24186226 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggtt 24186323  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24186324 gatttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaag 24186420  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186421 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 24186520  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  24186521 gggagttttgcatatttgattt 24186542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 1886732 - 1887344
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1886732 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1886831  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1886832 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattta 1886931  T
Q  544 tc-ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    || ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1886932 tctttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaat---gggggaagaagtatgtttttggttatttttactt 1887027  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  1887028 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggtt 1887125  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1887126 gatttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaag 1887222  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1887223 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 1887322  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  1887323 gggagttttgcatatttgattt 1887344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 1900833 - 1901445
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1900833 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1900932  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1900933 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaattta 1901032  T
Q  544 tc-ttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    || ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1901033 tctttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaatttattacctaaaaaatctaagtgaaagaat---gggggaagaagtatgtttttggttatttttactt 1901128  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  1901129 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggtt 1901226  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1901227 gatttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaag 1901323  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901324 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 1901423  T
Q  940 tggag-tttgcatatttgattt 960  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  1901424 gggagttttgcatatttgattt 1901445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 958
Target Start/End: Original strand, 4661688 - 4662305
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4661688 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgt----ctgtgaactctcgatttt-attcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 4661782  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  4661783 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 4661882  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4661883 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttatttttatttg 4661981  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||     
T  4661982 atttggaaggataaaaattctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggttggatta 4662081  T
Q  743 attttaagatttttg----aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag 836  Q
    ||||||| | |||||    ||||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4662082 attttaacaattttgtaaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcataagagaaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaag 4662181  T
Q  837 aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggttta-ttaagaaaata 935  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4662182 aaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttatttaagaaaata 4662281  T
Q  936 tttttggag-tttgcatatttgat 958  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4662282 tttttggagttttgcatatttgat 4662305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 17739183 - 17739806
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  17739183 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgagaagggaaaaaaatgagtaaaa 17739282  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  17739283 accctta---agattttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttgcctaattt 17739379  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739380 atcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 17739479  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  17739480 gatttggaaggattaac-tccttttcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaagttctttttggtgggttagatt 17739578  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatg----ggtttttagaagagaa-agaggcctccaggcatgagataaaa-taaggtgaggttggtcaaattttaattacaa 835  Q
    |||||||| | |||||||||      |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17739579 gattttaataattttgaaaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattaaaa 17739678  T
Q  836 g--aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 933  Q
       |||| ||||||| |||| || |||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17739679 agaaaattaagtctaatatggatgttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaagaaaaaacaattgggttacaaagcaaggtttattaagaaaa 17739778  T
Q  934 tatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17739779 tatttttggagttttgcatatttgattt 17739806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 342 - 804
Target Start/End: Original strand, 5198978 - 5199436
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  5198978 tgtgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgagaagggaaaaaatgagtaaa 5199077  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5199078 aaccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagat 5199176  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199177 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 5199274  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  5199275 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 5199371  T
Q  741 tgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    || ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5199372 tggttttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 5199436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 5208097 - 5208553
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5208097 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 5208196  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5208197 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagagaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 5208295  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208296 tcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 5208393  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  5208394 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 5208490  T
Q  743 attttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
     ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5208491 gttttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 5208553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 344 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 10449693 - 10449321
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  10449693 tgtgctcgcgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgaatgaaaa 10449594  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  10449593 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagatgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaatctcttacctagatta 10449497  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10449496 tcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 10449397  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaa 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10449396 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaa 10449321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 572 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 10442350 - 10441955
Alignment:
Q  572 aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctac 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442350 aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctac 10442251  T
Q  672 atacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa-gatttttgaaaatgggttttt 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||  ||||||     
T  10442250 atacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgattttaacaatttaaaaaaaaaggtttta 10442152  T
Q  771 agaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaata 868  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10442151 agaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaatt 10442052  T
Q  869 aagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata--tttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  10442051 aagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaataattttttgaagttttgcatatttgattt 10441955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16545813 - 16545360
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16545813 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16545714  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16545713 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctatatta 16545617  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16545616 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttctgattatttttatttg 16545517  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  16545516 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 16545421  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16545420 attttaatatttctgaaaat-gtttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16545360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 16619849 - 16620302
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16619849 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16619948  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16619949 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctatatta 16620045  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16620046 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttctgattatttttatttg 16620145  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  16620146 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 16620241  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16620242 attttaatatttctgaaaat-gtttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16620302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 17211638 - 17211194
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  17211638 gattttcggatatcaaaccattaattggtttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta--- 17211542  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||| ||||||    
T  17211541 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaatgtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataaaaccctcttacctagattatcctgtgct 17211442  T
Q  553 gaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 651  Q
     |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211441 aaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 17211342  T
Q  652 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaaga 751  Q
    || |  | |||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  17211341 ga-atgattcccctgcctacatacccttgaag-aaacggatcaaaacccatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtggattaggttgattttaaga 17211246  T
Q  752 tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17211245 tttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 17211194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 353 - 803
Target Start/End: Original strand, 16909646 - 16910089
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  16909646 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta--- 16909742  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16909743 agactctgacttcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaacttatcttgtgct 16909842  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg 652  Q
     || | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16909843 aaaatcatttgcttacttgaaaattgttagctaaaaatctaagtgaaagagtggagggggaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg 16909942  T
Q  653 ataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagat 752  Q
      | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16909943 --acaagtcctttgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttcccctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttatgat 16910038  T
Q  753 ttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16910039 ttttgaaaataggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 16910089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 335 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 29097100 - 29096635
Alignment:
Q  335 atggatatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaat 434  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29097100 atggatatatgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaat 29097001  T
Q  435 gagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctta 534  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29097000 gagtaaaaacccct-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctta 29096902  T
Q  535 cctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta 632  Q
    ||||  |||||||||||| || |   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29096901 cctagattatcttgtgct-aactttgttgcttatttgaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta 29096804  T
Q  633 tttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggt 731  Q
    ||||||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| ||    
T  29096803 tttttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagt 29096708  T
Q  732 gggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29096707 gggttaggttgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 29096635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 17514148 - 17514604
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17514148 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17514247  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17514248 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaaacgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 17514347  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17514348 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatggttttggttatttttatttg 17514445  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  17514446 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 17514541  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17514542 gattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 17514604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 17539066 - 17538610
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17539066 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17538967  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17538966 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaaacgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 17538867  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17538866 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatggttttggttatttttatttg 17538769  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  17538768 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 17538673  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17538672 gattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 17538610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 29082332 - 29081876
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29082332 tgtgctcacgattttcagatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 29082233  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29082232 cccct-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 29082134  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| || |   |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29082133 tcttgtgct-aactttgttgcttatttgaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 29082036  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||    
T  29082035 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggt 29081940  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29081939 tgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 29081876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 340 - 804
Target Start/End: Original strand, 27965753 - 27966214
Alignment:
Q  340 tatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagta 439  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27965753 tatgtgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaacctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagta 27965852  T
Q  440 aaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27965853 aaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctag 27965952  T
Q  540 tttatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 638  Q
     |||| ||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27965953 attattttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 27966050  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta 737  Q
    ||||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||    
T  27966051 tttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggtta 27966146  T
Q  738 ggttgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27966147 ggttgattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27966214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15185903 - 15185445
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15185903 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 15185804  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15185803 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtccatggtattccataggaacctcttacctaaatt 15185704  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    || ||||||| || | | ||| |||||||  |||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185703 attttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaaatattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 15185606  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  |||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  15185605 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 15185510  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15185509 tgattttaagattttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 15185445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 27975210 - 27975667
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27975210 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaacctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27975309  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27975310 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 27975409  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27975410 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 27975507  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  27975508 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 27975603  T
Q  742 gattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27975604 gattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27975667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 343 - 804
Target Start/End: Original strand, 16889548 - 16890005
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16889548 gtgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 16889647  T
Q  443 -acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16889648 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagat 16889747  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||| ||||||| ||   | ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889748 tattttgtgct-aagctacttgtttacttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 16889845  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  16889846 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagg 16889941  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16889942 ttgattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16890005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 344 - 654
Target Start/End: Original strand, 4940091 - 4940401
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaa-aatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4940091 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 4940190  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4940191 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcttctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 4940290  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4940291 atcttgtgctaagttca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 4940389  T
Q  643 atttggaaggat 654  Q
    ||||||||||||    
T  4940390 atttggaaggat 4940401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15200523 - 15200065
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15200523 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 15200424  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15200423 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtccatggtattccataggaacctcttacctaaatt 15200324  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    || ||||||| || | | ||  |||||||  |||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15200323 attttgtgctaaact-acttctttatttgaaaaaaatattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 15200226  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   |  |||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  15200225 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 15200130  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15200129 tgattttaagattttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 15200065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 40680317 - 40679867
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680317 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 40680218  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  40680217 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 40680118  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680117 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 40680018  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  40680017 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggctaggttgattttaag 40679922  T
Q  751 a--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40679921 atttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 40679867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 29023770 - 29023320
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29023770 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttgtcg 29023671  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  29023670 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 29023571  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29023570 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 29023472  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    |||||  || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  |  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29023471 aggat--aagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttta 29023376  T
Q  749 agatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29023375 agatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 29023320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 354 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 43600939 - 43600318
Alignment:
Q  354 attttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcga 453  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  43600939 attttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatcttcgaactctcaacttttatccgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccttaa--ga 43600842  T
Q  454 gactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||   | ||||||||  || ||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  43600841 gactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtttgacgcaccctacacgactacggtattccgtaggaacctattgcctaacttatcttgtgct 43600742  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgt-ttttggttatttttatttgatttggaag 651  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43600741 aaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttttgttgtttttatttgatttggaag 43600642  T
Q  652 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaaga 751  Q
    |||  ||||||| || |||| ||||| |||||  ||||||||||||||   |||||||  || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  43600641 gat--aaatcctttgactacgtaccc-taaagggaagggatcaaaaccgtcgtagttccactcaaaag-ttctttttggtgggttggattgattttaaca 43600546  T
Q  752 tttttgaaaatgggtttttagaagag-aaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctat 849  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  43600545 tttttgaaaaaaagttttaagaagagctaagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgagattggctaaattttaattataagaaatccaagtctaa 43600446  T
Q  850 tatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-ttt 947  Q
    |||| |  |||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  43600445 tatggaggttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttaaaatccaaggtttcttaagaaaatatttttgaagtttt 43600346  T
Q  948 gcatatttga-tttgttggaaaatgatt 974  Q
      |||||||| ||| |||||||||||||    
T  43600345 atatatttgatttttttggaaaatgatt 43600318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16228108 - 16227657
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgattttt-attcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16228108 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcaattttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 16228009  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16228008 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 16227909  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227908 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 16227809  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16227808 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttt 16227713  T
Q  748 aagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16227712 aagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16227657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 16120492 - 16120954
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt--aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16120492 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 16120591  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| |||||||||     
T  16120592 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaa 16120691  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 638  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120692 ttatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 16120790  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta 737  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||    
T  16120791 tttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggtta 16120886  T
Q  738 ggttgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16120887 ggttgattttaagatttttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 16120954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 16147232 - 16147694
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt--aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16147232 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 16147331  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| |||||||||     
T  16147332 aacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaa 16147431  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 638  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16147432 ttatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 16147530  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta 737  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||    
T  16147531 tttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggtta 16147626  T
Q  738 ggttgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16147627 ggttgattttaagatttttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 16147694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 44075014 - 44075472
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44075014 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 44075113  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||  |||    
T  44075114 cccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagtgaaagtgctagcatcctaagcatctacggtatttcgtaggaacctcttacctagatta 44075213  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| ||   | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44075214 tcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctgagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 44075311  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||| |||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  44075312 atttgggagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 44075407  T
Q  742 gattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44075408 gattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 44075472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16244986 - 16244535
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgattttt-attcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16244986 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttaaactctcaattttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 16244887  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16244886 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 16244787  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16244786 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 16244687  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16244686 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttt 16244591  T
Q  748 aagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16244590 aagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16244535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 558254 - 558712
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  558254 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 558353  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  558354 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 558453  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  558454 atcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttattt 558551  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  558552 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 558647  T
Q  741 tgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  558648 tgattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 558712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 568164 - 568622
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  568164 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 568263  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  568264 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 568363  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  568364 atcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttattt 568461  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  568462 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 568557  T
Q  741 tgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  568558 tgattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 568622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 2549310 - 2548852
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaa-aaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2549310 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 2549211  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |    
T  2549210 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 2549111  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2549110 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttatt 2549013  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  2549012 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagg 2548917  T
Q  740 ttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2548916 ttgattttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 2548852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 2563196 - 2562738
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaa-aaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2563196 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 2563097  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |    
T  2563096 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 2562997  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2562996 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttatt 2562899  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  2562898 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagg 2562803  T
Q  740 ttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2562802 ttgattttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 2562738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27435605 - 27435152
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaa-ttgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27435605 gattttcggatatcaaaccatttacttgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 27435506  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  27435505 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 27435406  T
Q  551 ctgaattga-tttgcttatttg-aaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 647  Q
    || |||| | |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27435405 ctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaattatgtttttggttatttttatttgatttg 27435306  T
Q  648 gaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    |||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27435305 gaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggttgattt 27435210  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27435209 taagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27435152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27444635 - 27444182
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaa-ttgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27444635 gattttcggatatcaaaccatttacttgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagagaaaaaatgagtaaaaacccttatc 27444536  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  27444535 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 27444436  T
Q  551 ctgaattga-tttgcttatttg-aaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 647  Q
    || |||| | |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444435 ctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaattatgtttttggttatttttatttgatttg 27444336  T
Q  648 gaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    |||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27444335 gaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggttgattt 27444240  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27444239 taagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27444182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 428 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 29032133 - 29031758
Alignment:
Q  428 aaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccatagga 526  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  | ||    
T  29032133 aaaaaatgagtaaaaacccttgtcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaacga 29032034  T
Q  527 acctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtt 624  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29032033 accgcttacctagattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtt 29031935  T
Q  625 tttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttc 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  |  |||| ||||    
T  29031934 tttggttatttttatttgatttggaaggat--aagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaatttc 29031837  T
Q  724 tttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29031836 --tttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 29031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 343 - 622
Target Start/End: Original strand, 19383909 - 19384187
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaatt-gatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19383909 gtgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattgatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 19384008  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19384009 aacccttatcgagactt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagat 19384107  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 622  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384108 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 19384187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Original strand, 13491880 - 13492106
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13491880 tgtgctcgtgattttcggatatcaaacaattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13491979  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13491980 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacctaattca 13492076  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13492077 tcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 13492106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 344 - 802
Target Start/End: Original strand, 36476574 - 36477026
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36476574 tgtgctcgtgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 36476673  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||  |||||||||  | |||||||||| || ||  |||| |||  | ||||| ||||||||| ||    
T  36476674 cccttat-gagactttagatccgggggttggtttcgcatagggaaggtattaagcaccctaaacgacttcggtactccgaatgaaccgcttacctaaatt 36476772  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt-tggtta-tttttat 639  Q
    ||| | |||| |||| | ||| | ||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  36476773 atcatttgctaaatt-acttgttcatttgaaaaattattgcc-caatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttgttgttattttttat 36476870  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||||  |  | || | ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| |  ||||||  || ||||     ||||||||||||||||    
T  36476871 ttgatttggaagg--acgagtcatttgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacatagttccactcaaaa-----tttttggtgggttagg 36476963  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataa 802  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36476964 ttgattttattaattttgaaaatgggttttaagaagagaaaggggcctcaaggcatgagataa 36477026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 643 - 989
Target Start/End: Original strand, 33533462 - 33533812
Alignment:
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||||||||||| | |||    
T  33533462 atttggaaggattaac-tcctttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcccctaaggaatttc--tttggtgggttggattg 33533558  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-t 840  Q
    ||||||  | |||||||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33533559 attttagaagttttgaaaat-ggtttgaagaagagataagaggcttcaaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatt 33533657  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa-cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  33533658 caagtctaatatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcacttgggttaaaatccaaggtttactaagaaaatatttt 33533757  T
Q  940 tgga--gtttgcatatttgatttgtt---ggaaaatgattatttttagactaacg 989  Q
    | ||   |||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||| || |||||||    
T  33533758 ttgaagttttgcatatttgattttttttgggaaaatgattttttctaaactaacg 33533812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 423 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 4324083 - 4323545
Alignment:
Q  423 aagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattcca 521  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||| |   ||||||||||| || |||||| || || ||| | |||||      
T  4324083 aagggaaaaaat-agtaaaaatccttat-gagactttggatccaggggttggtttcaataagggaaggtgttaagcacccgaatcgactacgatattctg 4323986  T
Q  522 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 621  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  4323985 taggaacctcttgcctactttaacttttgctaaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctagatgaaagaaaggggggagaagaagtat 4323886  T
Q  622 gtttttggttatttttatttgatt----tggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ctaaa 716  Q
    ||||||| || |||||||||||||    ||||||||   ||||||| |||||||||| ||    | ||| || ||||||| || |||||||| | || ||    
T  4323885 gtttttg-ttgtttttatttgattgatttggaaggaatgaaatcctttgcctacatatcc----acaaatggaatcaaaatcattgtagttctctctcaa 4323791  T
Q  717 aagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatg-ggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaa-taaggtgag 813  Q
    || ||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||     
T  4323790 aaatta---tttggtgggttagattgattttaacatttttgaaaaaaaggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaa 4323694  T
Q  814 gttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa-cacttgggttac 911  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4323693 gttggttaa-ttttaattgcaagaaatccaagcctaatatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttaa 4323595  T
Q  912 aaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagtttg-catatttgattt 960  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4323594 aatccaaggtttaataagaaaatatttttggagtttgacatatttgattt 4323545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 344 - 535
Target Start/End: Original strand, 13478068 - 13478255
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  13478068 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttatttgtgg-gagggaaaaaatgagtaaaaa 13478166  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttac 535  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  13478167 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttac 13478255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 353 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 38255777 - 38255625
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38255777 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 38255678  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaa 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||    
T  38255677 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaa 38255625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 353 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 38263352 - 38263200
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38263352 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 38263253  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaa 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||    
T  38263252 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaa 38263200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 339 - 538
Target Start/End: Original strand, 48498506 - 48498706
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48498506 atatttgtgttcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 48498605  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacct 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| |||||||    
T  48498606 aaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacct 48498705  T
Q  538 a 538  Q
    |    
T  48498706 a 48498706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 352 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 43139246 - 43139053
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgat-ttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttat 450  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| | | ||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||     
T  43139246 tgattttcgggtatcaaaccatcaattggtattgaaccttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaaaggaaaaagtgagtaaaaaccctta- 43139148  T
Q  451 cgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatctt 547  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  43139147 -gagactt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctacggtatttcgtaggaacctcttgcctaatttatctt 43139053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 511; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 43596506 - 43597112
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43596506 tgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 43596605  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43596606 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 43596705  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43596706 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttgtttatttttatttg 43596805  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43596806 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 43596905  T
Q  743 attttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43596906 attttaagattttttgaaaatgggtttttagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaat 43597005  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43597006 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 43597105  T
Q  941 ggagttt 947  Q
    |||||||    
T  43597106 ggagttt 43597112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 43629300 - 43629906
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43629300 tgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 43629399  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43629400 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 43629499  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43629500 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttgtttatttttatttg 43629599  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629600 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 43629699  T
Q  743 attttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43629700 attttaagattttttgaaaatgggtttttagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaat 43629799  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629800 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 43629899  T
Q  941 ggagttt 947  Q
    |||||||    
T  43629900 ggagttt 43629906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 31424125 - 31423517
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31424125 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31424026  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31424025 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttatctaattta 31423926  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31423925 tcttgtgtttaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagtctaaatgaaagaatggagggagaaaaagtgtgtttttggttatttttatttga 31423827  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423826 tttggaaggataaaaatcctatgcctgcatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 31423727  T
Q  744 ttttaagat-ttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatc 841  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31423726 ttttaagattttttgaaaatgggtttttagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatc 31423627  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa----cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31423626 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaagtgacttggattacaaaccaagttttattaagaaaacatt 31423527  T
Q  938 tttggagttt 947  Q
    |||| |||||    
T  31423526 tttgaagttt 31423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 339 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 31413224 - 31412620
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31413224 atatatgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 31413125  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31413124 aaaaacccttatcgagactttggattcgggggtcggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccta 31413025  T
Q  539 atttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattaccta-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt 637  Q
    | |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31413024 acttatcttgtgctaagttca-ttgcttatttgaaaattattacctagaaaatctaagtgaaagaatg--gggagaagaagtatgtttttggttattttt 31412928  T
Q  638 atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412927 atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta 31412828  T
Q  738 ggttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat-gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-a 834  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31412827 ggttgattttaagattttttgaaaatggatttttagaagagaaagaggcctcaaggcatagagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaa 31412728  T
Q  835 agaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagca-tttgattaagaaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaa 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412727 agaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcattttgattaagaaaataaaaggaaaagcaacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaa 31412628  T
Q  933 atattttt 940  Q
    ||||||||    
T  31412627 atattttt 31412620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 28854163 - 28853556
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28854163 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 28854064  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28854063 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 28853964  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853963 accttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 28853864  T
Q  643 atttggaaggata-aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  28853863 atttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 28853766  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aa 838  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  28853765 gattttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacgttttaattacaagaaa 28853666  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853665 atcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 28853566  T
Q  938 tttggagttt 947  Q
    ||||||||||    
T  28853565 tttggagttt 28853556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 1726619 - 1727224
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1726619 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaactgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1726718  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1726719 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 1726818  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct--aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1726819 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 1726917  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1726918 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggtt 1727016  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1727017 gatttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaa 1727114  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1727115 tcaggtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 1727214  T
Q  938 tttggagttt 947  Q
    ||||||||||    
T  1727215 tttggagttt 1727224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 947
Target Start/End: Original strand, 24955293 - 24955898
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24955293 gtgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 24955392  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24955393 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 24955492  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24955493 a-cttgtgctaaactgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 24955591  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  24955592 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 24955689  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  24955690 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaa 24955789  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24955790 tcaagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 24955889  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  24955890 ttggagttt 24955898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 28845552 - 28844946
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28845552 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28845453  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28845452 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 28845353  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28845352 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 28845253  T
Q  644 tttggaaggata-aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  28845252 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 28845155  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  28845154 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaa 28845055  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28845054 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 28844955  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  28844954 ttggagttt 28844946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 24963754 - 24964358
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24963754 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 24963853  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24963854 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 24963953  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24963954 -cttgtgctaaactgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 24964052  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  24964053 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 24964150  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24964151 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaat 24964250  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24964251 caagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 24964350  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  24964351 tggagttt 24964358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Original strand, 20396266 - 20396878
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20396266 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtgaaa 20396365  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20396366 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttgcctaattt 20396465  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||||             |||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396466 atcttgtgct-------------tattt------tattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 20396546  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20396547 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttg 20396645  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 841  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396646 attttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaagcctcaaggcatcagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 20396743  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396744 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 20396843  T
Q  942 gag-tttgcatatttgatttgttg-gaaaatgatt 974  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  20396844 gagttttgcatgtttgattttttgagaaaatgatt 20396878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 339 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 19226231 - 19225613
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19226231 atatatgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 19226132  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19226131 aaaaaccctta----gactttggattcgggggttggttacgcgaaggggaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttaccta 19226036  T
Q  539 atttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt 637  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19226035 atttatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttattttt 19225937  T
Q  638 atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta 737  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||    
T  19225936 atttgatttgaaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--ttcggtgggtta 19225839  T
Q  738 ggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaa 835  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19225838 ggttgatttta--atttttgaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaa 19225742  T
Q  836 g-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaag-aaaa 933  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19225741 gaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaatacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaaa 19225642  T
Q  934 ta-tttttggagttt-gcatatttgattt 960  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  19225641 tattttttgaagtttcgcatatttgattt 19225613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 41093548 - 41094010
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa--tgagtaaa 441  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  41093548 tgtgctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaaatgagtaaa 41093647  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41093648 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaaggggaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaatt 41093747  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41093748 tatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaaattattacctaaaagtataattgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 41093847  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41093848 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 41093947  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41093948 tgattttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 41094010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Original strand, 20370578 - 20371175
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20370578 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaagggaaaaaaatgagtgaaa 20370677  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |               ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20370678 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaaag---------------ctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 20370762  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||             ||||||||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20370763 atctt-------------ttgcttattt------tattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 20370843  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20370844 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttg 20370942  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 841  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20370943 attttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaagcctcaaggcatcagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 20371040  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20371041 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 20371140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 33835130 - 33835586
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33835130 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 33835229  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  33835230 cccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaaaggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 33835329  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |  | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33835330 tcttgtgctaagct-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 33835427  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33835428 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 33835524  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33835525 attttaagatttttttaaaatggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 33835586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 33843829 - 33844285
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33843829 tgtgctcccgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 33843928  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  33843929 cccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 33844028  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |  | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33844029 tcttgtgctaagct-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttacttttatttg 33844126  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33844127 atttggaaggataaaaatcatatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 33844223  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33844224 attttaagatttttttaaaatggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 33844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20378111 - 20377654
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20378111 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcttgggaagg-aaaaaatgagtaaaaa 20378013  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  20378012 cccttttcgagactttggattcgagggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 20377913  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |  | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20377912 tcttgtgctaagct-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttagttatttttatttg 20377815  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  20377814 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 20377717  T
Q  742 gattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20377716 gattttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 20377654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20386900 - 20386443
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20386900 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcaatttttattcttgggaagg-aaaaaatgagtaaaaa 20386802  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  20386801 cccttttcgagactttggattcgagggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 20386702  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |  | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20386701 tcttgtgctaagct-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttagttatttttatttg 20386604  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  20386603 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 20386506  T
Q  742 gattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20386505 gattttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 20386443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 26088336 - 26088791
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26088336 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 26088435  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26088436 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 26088535  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgctta-tttgaaa-attattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    | ||||||| || |  || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26088536 ttttgtgctaaactacttggcttactttgaaagattattacct-aaaatctaagtgaaaaaatggagggagaagaagtatgtttttggctatttttattt 26088634  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||    
T  26088635 gatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggtt 26088730  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26088731 gattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaatagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 26088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 26078357 - 26078812
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26078357 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtgaaaa 26078456  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26078457 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatta 26078556  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgctta-tttgaaa-attattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    | ||||||| || |  || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26078557 ttttgtgctaaactacttggcttactttgaaagattattacct-aaaatctaagtgaaaaaatggagggagaagaagtatgtttttggctatttttattt 26078655  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||    
T  26078656 gatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggtt 26078751  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26078752 gattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaatagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 26078812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 340 - 653
Target Start/End: Original strand, 23348538 - 23348851
Alignment:
Q  340 tatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagta 439  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23348538 tatgtgtgctcgtgaatttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactatcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagta 23348637  T
Q  440 aaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23348638 aaaacccttatcgagactttggattcgagggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaa 23348737  T
Q  540 tttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23348738 attatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattactacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttat 23348837  T
Q  640 ttgatttggaagga 653  Q
    ||||||||||||||    
T  23348838 ttgatttggaagga 23348851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 11812423 - 11812880
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11812423 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 11812522  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11812523 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 11812622  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| || | | ||| ||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11812623 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 11812720  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||    
T  11812721 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggtt 11812816  T
Q  742 gattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11812817 gattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 11812880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 11802347 - 11802804
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11802347 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 11802446  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11802447 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 11802546  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| || | | ||| ||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11802547 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 11802644  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||    
T  11802645 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaatggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggtt 11802740  T
Q  742 gattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11802741 gattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 11802804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 12170129 - 12170587
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12170129 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 12170228  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  12170229 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtatttcataggaacctcttacctagatta 12170328  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| || | | ||| ||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12170329 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 12170426  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||    
T  12170427 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggtt 12170522  T
Q  742 gattttaagattttt---gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12170523 gattttaagatttttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 12170587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 12179558 - 12180016
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12179558 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 12179657  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  12179658 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtatttcataggaacctcttacctagatta 12179757  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | ||||||| || | | ||| ||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12179758 ttttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaaatattgcct-aacgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 12179855  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||||    
T  12179856 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggtt 12179951  T
Q  742 gattttaagattttt---gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12179952 gattttaagatttttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 12180016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 344 - 802
Target Start/End: Original strand, 3476764 - 3477221
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3476764 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 3476863  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  3476864 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 3476963  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| ||   | ||| |||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3476964 atcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 3477061  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   |  |||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  3477062 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttggggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagg 3477157  T
Q  740 ttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataa 802  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3477158 ttgattttaagattttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataa 3477221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 344 - 802
Target Start/End: Original strand, 3491534 - 3491991
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3491534 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 3491633  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  3491634 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 3491733  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| ||   | ||| |||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491734 atcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 3491831  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   |  |||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||    
T  3491832 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttggggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttagg 3491927  T
Q  740 ttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataa 802  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3491928 ttgattttaagattttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataa 3491991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 23039445 - 23038996
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23039445 tgattttcggatatcaaactattaattgatttgaatcgtcaatttttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 23039346  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23039345 gagactttgaattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 23039246  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23039245 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 23039146  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||| ||   |||| ||||||| |||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23039145 aggacaag--tcctctgcctacgtaccattttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaa 23039050  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23039049 gatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaagacatgagataaaa 23038996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 36458981 - 36458526
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36458981 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 36458882  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  36458881 cccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 36458782  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttgg-ttatttttattt 641  Q
    ||||||||| || | | ||| | ||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36458781 tcttgtgctaaaat-acttgttcatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttattt 36458684  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||     ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  36458683 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 36458588  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36458587 gattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 36458526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 17642815 - 17642366
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17642815 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaatggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 17642716  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||  | |||||||||| || ||  |||| |||  |||||||  |||||||  ||||||||||    
T  17642715 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtattaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgtttacctagattatcttgtg 17642616  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17642615 ctaaattcattcgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 17642516  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17642515 agg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 17642420  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17642419 gatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 17642366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 358 - 804
Target Start/End: Original strand, 21850650 - 21851093
Alignment:
Q  358 tcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagact 457  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21850650 tcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaaaaagtaaaaacccttatcgagact 21850749  T
Q  458 ttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaat 556  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||    
T  21850750 ttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaat 21850849  T
Q  557 tgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggata 655  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21850850 tcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg--a 21850947  T
Q  656 aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttt 755  Q
     || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850948 caagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatt--tatttggtgggttaggttgattttaagatttt 21851045  T
Q  756 tgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21851046 tgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 21851093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 630 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 21931546 - 21931210
Alignment:
Q  630 ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttg 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21931546 ttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgcagttcacctaaaaagtttctttttg 21931447  T
Q  730 gtgggttaggttgattttaagat-ttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgag--ataaaataaggtgaggttggtcaaatt 825  Q
    ||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||    
T  21931446 gtgggttggattgattttaatatgttttgaaaat-ggttttaagaagaaataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaaacaaggtgaggttggtcaaatt 21931348  T
Q  826 ttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggttt 923  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21931347 ttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttactaaccaaggttt 21931248  T
Q  924 attaagaaaatatttttgga--gtttgcatatttgatt 959  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  21931247 attaagaaaatattttttgaagttttgcatatttgatt 21931210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 339 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27064433 - 27063970
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27064433 atatatgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagt 27064334  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacct 537  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| |||||||    
T  27064333 aaaaacccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacct 27064234  T
Q  538 aatttatcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattt 635  Q
    || |||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064233 aaattatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattt 27064135  T
Q  636 ttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggt 735  Q
    |||||||||||||||||  |  | |||| |||||||||||||||   |  |||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||    
T  27064134 ttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacataccctt-ttgggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggt 27064040  T
Q  736 taggttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27064039 taggttgattttaagattttttgaaaatgagttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27063970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 27220141 - 27220602
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27220141 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27220240  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27220241 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagatt 27220340  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| ||   | ||| |||||||||||   |||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220341 atcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aatgtctaagtgaaagtatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27220438  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc---ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtta 737  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||   ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||    
T  27220439 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggtta 27220534  T
Q  738 ggttgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27220535 ggttgattttaagattttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 27220602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 23827754 - 23828206
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827754 gattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 23827853  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23827854 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtg 23827953  T
Q  551 ctgaattgattt-gctta-tttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827954 ctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 23828052  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23828053 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttggtttt 23828148  T
Q  748 aaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23828149 aagatttttttgaaaat-ggttttaagaatagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 23828206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 27223148 - 27223607
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27223148 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27223247  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27223248 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagatt 27223347  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| ||   | ||| |||||||||||   |||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223348 atcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aatgtctaagtgaaagtatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27223445  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||    
T  27223446 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttagg 27223541  T
Q  740 ttgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27223542 ttgattttaaggttttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 27223607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 27232619 - 27233078
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27232619 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27232718  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27232719 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagatt 27232818  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| ||   | ||| |||||||||||   |||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27232819 atcttgtgct-aagctacttgtttatttgaaaaatatattgcct-aatgtctaagtgaaagtatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 27232916  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||||    
T  27232917 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttagg 27233012  T
Q  740 ttgattttaagattttt--gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27233013 ttgattttaaggttttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 27233078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 31548052 - 31548501
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa-cccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31548052 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttatttgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaaacccttatc 31548151  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  31548152 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 31548251  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31548252 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgtttttatttgatttgga 31548351  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    | |  | || |||| |||| || |||||||   | | ||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31548352 atg--acaagtcctctgcccacgtacccttttgggacagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 31548447  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31548448 gatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagatgcctcaaggcatgagataaaa 31548501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 342 - 804
Target Start/End: Original strand, 21986163 - 21986628
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaa 440  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21986163 tgtgtgctcacgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 21986262  T
Q  441 aaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| |||||||||    
T  21986263 aaacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaa 21986362  T
Q  540 tttatcttgtgctgaattga-tttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt 637  Q
     |||||||||||| |||| | || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21986363 attatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattatta-cttaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttt 21986461  T
Q  638 atttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt 736  Q
    |||||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||    
T  21986462 atttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggtt 21986557  T
Q  737 aggttgattttaaga---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21986558 aggttgattttaagattctttttgaaaatggtttttaagaagagaaagatgcctcaaggcatgagataaaa 21986628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 23637678 - 23637226
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23637678 gattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtagaaacccttatc 23637579  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23637578 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtg 23637479  T
Q  551 ctgaattgattt-gctta-tttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637478 ctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 23637380  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23637379 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttggtttt 23637284  T
Q  748 aaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23637283 aagatttttttgaaaat-ggttttaagaatagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 23637226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 23835212 - 23835664
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23835212 gattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtagaaacccttatc 23835311  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23835312 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtg 23835411  T
Q  551 ctgaattgattt-gctta-tttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835412 ctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 23835510  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  23835511 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttggtttt 23835606  T
Q  748 aaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23835607 aagatttttttgaaaat-ggttttaagaatagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 23835664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 26177419 - 26176970
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa-cccttatc 451  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26177419 gattttcggatatcaaacccttgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaacccttatc 26177320  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  26177319 gagactttggattcggg-gttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 26177221  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26177220 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtatgttttgggttatttttatttgatttgga 26177121  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26177120 agg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 26177025  T
Q  750 ga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26177024 gattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcttgagataaaa 26176970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 21994813 - 21995276
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21994813 tgtgctcacgattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatttttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 21994912  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| |    
T  21994913 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaat 21995012  T
Q  542 tatcttgtgctgaattga-tttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995013 tatcttgtgctaaattcacttggcttacttgaaaaattatta-cttaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 21995111  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||    
T  21995112 ttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttag 21995207  T
Q  739 gttgattttaaga---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21995208 gttgattttaagattctttttgaaaatggtttttaagaagagaaagatgcctcaaggcatgagataaaa 21995276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 23985093 - 23984641
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt--at 450  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  23985093 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaaacttttat 23984994  T
Q  451 cgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgt 549  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  23984993 cgagaccttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgt 23984894  T
Q  550 gctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 647  Q
    ||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984893 gctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttg 23984794  T
Q  648 gaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    |||||  | |  |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23984793 gaagg--acaggtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattt 23984698  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23984697 tatgatttttgaaaat-ggttttaagaagagtaagaggcctcaaggcatgagataaaa 23984641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 352 - 653
Target Start/End: Original strand, 21856805 - 21857108
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856805 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 21856904  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  21856905 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 21857004  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21857005 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 21857104  T
Q  650 agga 653  Q
    ||||    
T  21857105 agga 21857108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 344 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21931765 - 21931541
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21931765 tgtgctcgtgattttcgga-atcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21931667  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21931666 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 21931567  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttattt 570  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  21931566 tcttgtgctaaattca-ttgcttattt 21931541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 653
Target Start/End: Original strand, 21858564 - 21858861
Alignment:
Q  358 tcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagact 457  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21858564 tcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaaaaagtaaaaacccttatcgagact 21858663  T
Q  458 ttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaat 556  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||    
T  21858664 ttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgctaaat 21858763  T
Q  557 tgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 653  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858764 tcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatttaagtgaaagaatggaaggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 21858861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 29190478 - 29190253
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29190478 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaa-tgagtaaaaa 29190380  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29190379 ccctca---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 29190283  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29190282 tcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 29190253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Original strand, 344880 - 345105
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  344880 tgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 344977  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  344978 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaattt 345074  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  345075 atcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 345105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 344 - 573
Target Start/End: Original strand, 359519 - 359744
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  359519 tgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 359616  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  359617 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagatgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaattt 359713  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  359714 atcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 359744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 23762288 - 23762740
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  23762288 gattttcggatataaaaccatttaattgatttgaatcgacaatctttgaactctctatttttattcgtggaaagataaaaaatgagaaaaaacccttatc 23762387  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| |    ||| |||||| || ||||||||| |  ||   ||| |||| | ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  23762388 aagactttgtattcgggggttggtttctaataggaaaggtgttaagcaccctaaacaacttcagtactccaaaagaaccgcttatctaaattatcttgtg 23762487  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23762488 ctaaattcatttggcttacttaaaaaattattacctaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttatttttatttgatttga 23762586  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    |||   | || |||| ||||||||||||| ||   | |||||||| |||||| |  || |||  ||||||| | ||  ||||| ||| ||||||| ||||    
T  23762587 aag--aacaagtcctctgcctacataccctttttgggaaagggataaaaaccgacatatttccactaaaaaatatc--tttggagggataggttggtttt 23762682  T
Q  748 aagatttt--tgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| | || | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23762683 aagatttttatgaaaat-ggttttaaaaatataaagaggcctctaggcataagataaaa 23762740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 660 - 804
Target Start/End: Original strand, 23025805 - 23025946
Alignment:
Q  660 tcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaa 759  Q
    |||| ||||||| |||||||   | |||||||| |||||| | |||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23025805 tcctctgcctacgtacccttttgggaaagggattaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaagatttttgaa 23025902  T
Q  760 aatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23025903 aat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 23025946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 27586890 - 27586827
Alignment:
Q  470 gttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctt 533  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||    
T  27586890 gttggttacgcaaagggaaggtgttagcaccctaaatgtctatagtactctataggaacctctt 27586827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 19071833 - 19071767
Alignment:
Q  463 ttcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacc 529  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  19071833 ttcgggggttggttacgcaaagggaaggtattagccccctaaacgtctatagtactctataggaacc 19071767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 30062629 - 30063245
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30062629 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaattgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagg-aaaaaatgagtaaaaa 30062727  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30062728 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 30062827  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaa-atctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30062828 tcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 30062926  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30062927 atttggaaggataaaaatcccatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 30063026  T
Q  743 attttaag--atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30063027 attttaagatatttttgaaaatgggtttttagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 30063126  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30063127 caaatctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaa-aaaatattttt 30063224  T
Q  941 ggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  30063225 ggagttttgcatatttgattt 30063245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 969
Target Start/End: Original strand, 27338858 - 27339479
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27338858 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgactcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 27338957  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27338958 acccttattgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctatgcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 27339057  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339058 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 27339156  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339157 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccaaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 27339256  T
Q  743 attttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27339257 attttaagattttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtctaattttaattacaaagaaat 27339356  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339357 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaa------aaaagg-aaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 27339449  T
Q  941 ggag-tttgcatatttgatttgttggaaaa 969  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||    
T  27339450 ggagttttgcatatttgatttttttgaaaa 27339479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 50826913 - 50826299
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50826913 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 50826814  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50826813 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 50826714  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826713 tcttgtgctaaatt-cgttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 50826615  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50826614 cttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 50826516  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatca 842  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826515 tttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatca 50826418  T
Q  843 agtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgg 942  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826417 agtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgg 50826318  T
Q  943 ag-tttgcatatttgattt 960  Q
    || ||||||||||||||||    
T  50826317 agttttgcatatttgattt 50826299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 4435984 - 4435381
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt-aaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4435984 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcgtggaaagggaaaaaatgagtgaaaa 4435885  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4435884 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 4435785  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4435784 atcttgtgctacattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 4435686  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4435685 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 4435586  T
Q  743 attttaag--atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4435585 attttaagatatttttgaaaatgggtttttagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 4435486  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4435485 caaatctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaa-aaaatattttt 4435388  T
Q  941 ggagttt 947  Q
    | |||||    
T  4435387 gaagttt 4435381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 4456775 - 4456172
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt-aaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4456775 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtgaaaa 4456676  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  4456675 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacgctatttcgtaggaacctcttacctaattt 4456576  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4456575 atcttgtgctacattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatatttttggttatttttatttg 4456477  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456476 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 4456377  T
Q  743 attttaag--atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456376 attttaagatatttttgaaaatgggtttttagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 4456277  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4456276 caaatctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaa-aaaatattttt 4456179  T
Q  941 ggagttt 947  Q
    | |||||    
T  4456178 gaagttt 4456172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 41016951 - 41016345
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41016951 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 41016852  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41016851 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 41016752  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41016751 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 41016652  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  41016651 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 41016554  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  41016553 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaa 41016454  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41016453 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 41016354  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  41016353 ttggagttt 41016345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 50848940 - 50849561
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50848940 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 50849039  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50849040 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctttggtattccgtaggaacctcttacctaattta 50849139  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50849140 tcttgtgctaaatt-cgttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 50849238  T
Q  644 tttggaaggat--aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50849239 tttggaaggattgaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggtt 50849337  T
Q  742 gattttaagattttt---gaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaga 837  Q
    |||||| ||||||||   |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50849338 gatttt-agatttttttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaga 50849435  T
Q  838 aatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 935  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50849436 aatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 50849535  T
Q  936 tttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50849536 tttttggagttttgcatatttgattt 50849561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 27550643 - 27551267
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaaggg-aaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  27550643 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtggggaggggaaaaaatgagtaaaa 27550742  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27550743 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 27550842  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27550843 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatatctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttacttg 27550942  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27550943 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 27551042  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 841  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551043 attttaagatttttgaaaat-ggttttaagaaaggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 27551141  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa------acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 935  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27551142 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaatgaaaggaaaaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaata 27551241  T
Q  936 tttttgga-gtttgcatatttgattt 960  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||    
T  27551242 tttttgaacttttgcatatttgattt 27551267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 958
Target Start/End: Original strand, 18949441 - 18950058
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18949441 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18949540  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18949541 ccctcatcgagactttggattcgggaattggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccataggaacctcttacctaatcta 18949640  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18949641 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatagggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 18949739  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18949740 acttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttg 18949838  T
Q  743 attttaagattttt-gaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18949839 atttt-agatttttagaaaat-ggttttgagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaa 18949936  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18949937 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaaggaaataaaaggaaaaaagcacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 18950036  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgat 958  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  18950037 tttggagttttgcatatttgat 18950058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 342 - 947
Target Start/End: Original strand, 51922058 - 51922666
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51922058 tgtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 51922157  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |    
T  51922158 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaagaacctcttacctagat 51922257  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51922258 tatcttgtgctaaattgatttgtttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttcttt 51922357  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51922358 gatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacctttaaagaaaggggatcaaaaccaacgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggtt 51922456  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  51922457 gattttaaatttttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggccttaaggcatgagagaaaataaggtgaggttagtcaaattttaattacaagaaaa 51922555  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51922556 tcaagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaaacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 51922655  T
Q  937 ttttggagttt 947  Q
    ||||| |||||    
T  51922656 ttttgaagttt 51922666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 17365275 - 17364650
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17365275 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17365176  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17365175 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 17365076  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17365075 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaataatggagggagaagaagtatgttttt-gttttttttatttga 17364977  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||  | ||| ||||||||||||||    
T  17364976 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccattgtagctcacctcaaaaatt--tatttagtgggttaggttga 17364879  T
Q  744 ttttaaga---tttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aa 838  Q
    |||||| |   ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17364878 ttttaatattttttttgaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 17364780  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg---aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaag-aaaat 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17364779 atcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttactaaccaaggtttattaagaaaaat 17364680  T
Q  935 atttttggag-tttgcatatttgatttgtt 963  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  17364679 atttttgaagttttgtatatttgatttgtt 17364650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 39707403 - 39706788
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39707403 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcttcaatctgtgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 39707304  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  39707303 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatt 39707204  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39707203 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaggaagtatgtttttgattatttttatttg 39707104  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  39707103 atttggaaggatgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggttaggttg 39707006  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  39707005 atttta--atttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaagt 39706909  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39706908 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttg 39706809  T
Q  941 ggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  39706808 ggagttttgcatatttgattt 39706788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 947
Target Start/End: Original strand, 8153127 - 8153733
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8153127 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 8153226  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8153227 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 8153326  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153327 accttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 8153426  T
Q  643 atttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8153427 atttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaacaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctgaaaagtttctttttggtgggtt-ggtt 8153525  T
Q  742 gattttaagattttt-gaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaa 838  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  8153526 gatttt-agatttttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt-gtcgaattttaattacaaagaa 8153622  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8153623 atcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatat 8153722  T
Q  937 ttttggagttt 947  Q
    |||||||||||    
T  8153723 ttttggagttt 8153733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 17360633 - 17360008
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17360633 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17360534  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17360533 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 17360434  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17360433 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaataatggagggagaagaagtatgttttt-gttttttttatttga 17360335  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||  | ||| ||||||||||||||    
T  17360334 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccattgtagctcacctcaaaaatt--tatttagtgggttaggttga 17360237  T
Q  744 ttttaaga---tttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aa 838  Q
    |||||| |   ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17360236 ttttaatattttttttgaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 17360138  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg---aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaag-aaaat 934  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17360137 atcaagactaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttactaaccaaggtttattaagaaaaat 17360038  T
Q  935 atttttggag-tttgcatatttgatttgtt 963  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  17360037 atttttgaagttttgtatatttgatttgtt 17360008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 8196217 - 8196823
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8196217 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattatttgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8196316  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8196317 cccttctcgagactttggattcgggggttggttatgcgaaggtaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 8196416  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196417 tcttgtgctaaattgattttcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 8196516  T
Q  644 tttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8196517 tttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggt-ggtttggttg 8196615  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8196616 atttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaatttcaagaaaat 8196713  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8196714 caagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaaacttgggttacaaaccaagttttattaagaaaatact 8196813  T
Q  938 tttggagttt 947  Q
    |||| |||||    
T  8196814 tttgaagttt 8196823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 17935628 - 17934976
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17935628 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcaatttttatttgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17935529  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17935528 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattta 17935432  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17935431 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 17935332  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  17935331 tttggaaggat-taactcctttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatt--tttttggtgggtttggttga 17935236  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatc 841  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17935235 ttttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaagttttaattacaagaaaatc 17935138  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg------------aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaag 929  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17935137 aagtctaatatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaaaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaag 17935038  T
Q  930 aaaatatttttggag-tttgcatatttgatttgttgg-aaaatgattatttttagactaacg 989  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  17935037 aaaatatttttggagttttgcatatttaattttttggtaaaatgattttttctaaactaacg 17934976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 3712152 - 3711538
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3712152 tgtgctcgagattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 3712053  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||||||||    
T  3712052 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtatggacctcttacctaattta 3711953  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3711952 tcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 3711853  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3711852 tttggaaggataaaaatcctgtgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 3711754  T
Q  744 ttttaagatttttg---aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 839  Q
    |||||| ||||| |   ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3711753 ttttaa-attttagaaaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaa- 3711656  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg---aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
            | |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3711655 --------aatcggaatattaattcaattaagcatttgattaaaaaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatat 3711564  T
Q  937 ttttgga--gtttgcatatttgattt 960  Q
    |||| ||   ||||||||||||||||    
T  3711563 tttttgaagttttgcatatttgattt 3711538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 940
Target Start/End: Original strand, 13507238 - 13507842
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13507238 gtgtgcttgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 13507337  T
Q  443 a-cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13507338 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatt 13507437  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13507438 tatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaggtatgtttttggttatttttattc 13507536  T
Q  642 gatttggaaggata-aaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13507537 gatttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgcagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggt 13507635  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 839  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| |||   || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13507636 tgatttta-gattttagaaaatgg-ttttaagagaggataagaggcctcaaggaatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 13507733  T
Q  840 -tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-------aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaa 931  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13507734 atcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaagaa 13507833  T
Q  932 aatattttt 940  Q
    |||||||||    
T  13507834 aatattttt 13507842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 2256984 - 2256387
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattc-gtggcaagggaaaaaa-tgagtaaa 441  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  2256984 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgcatcgtcaatatttgaactctcaatttttattccgtgggaagggaaaaaaatgagtaaa 2256885  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  2256884 aacccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattctgtaggaacctcttacctaaat 2256785  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2256784 tatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatatttttggttatttttattt 2256686  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | |||| |||    
T  2256685 gatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggcgagttaagtt 2256588  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaa-gaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  2256587 gattttaagatttttgaaaataggttttaagaagagaaaggaagcctcaaggcatgagagaaaatgaggtgaggttggtcaagttttaattagaagaaaa 2256488  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2256487 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaat-aaaggaaaagcaacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 2256389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 14426188 - 14425728
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14426188 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgttggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 14426089  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  14426088 tccttatcgagactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacatagatta 14425989  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425988 tcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 14425889  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14425888 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaagttg 14425789  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14425788 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 14425728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 475 - 947
Target Start/End: Original strand, 18900462 - 18900937
Alignment:
Q  475 ttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaa 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  18900462 ttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaa 18900560  T
Q  575 attattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt-tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacat 673  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900561 attattacctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaaggagtatgttttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacat 18900660  T
Q  674 acccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttaga 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900661 acccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttgatgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttaga 18900760  T
Q  774 agagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagca 873  Q
    || |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18900761 agggaaaaaggcctcgaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaataagtctagtatgaatattaattcaattaagca 18900860  T
Q  874 tttgattaagaaaataaaaggaaaaa---cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18900861 tttgattaagaaaataaaaggaaaaaagcaacttggattacaaaccaagttttattaagaaaatatttttgaagttt 18900937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15711578 - 15711119
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15711578 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15711479  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15711478 cccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccattggaacctcttgcctaattta 15711379  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatta-ttacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15711378 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatggttttggttatttttatttg 15711280  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15711279 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggttgggttg 15711180  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15711179 attttaaggtttttgaaaat-ggttttaagaaaagaaagaggcctctaggcatgagataaaa 15711119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15694975 - 15694516
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15694975 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15694876  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  15694875 cccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattatataggaacctcttgcctaattta 15694776  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatta-ttacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15694775 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatggttttggttatttttatttg 15694677  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15694676 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggttgggttg 15694577  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15694576 attttaaggtttttgaaaat-ggttttaagaaaagaaagaggcctctaggcatgagataaaa 15694516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 764
Target Start/End: Original strand, 8204028 - 8204447
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8204028 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8204127  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8204128 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 8204227  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8204228 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 8204327  T
Q  644 tttggaagga-taaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8204328 tttggaaggattgaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttg 8204426  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgg 764  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  8204427 atttt-agattttagaaaatgg 8204447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 18351585 - 18351134
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18351585 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaattgtcaatctctgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18351486  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  18351485 ccctta---agactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatta 18351389  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18351388 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattta 18351289  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    | ||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351288 aattggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 18351191  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgaga 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18351190 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggccttaaggcatgaga 18351134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 429 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 18041373 - 18040821
Alignment:
Q  429 aaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaac 528  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18041373 aaaaatgagtaaaaaccccta---agactttggattcgggggttggttacacgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaac 18041277  T
Q  529 ctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttg 628  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18041276 ctcttaactaaattatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaatattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagcatgttcttg 18041177  T
Q  629 gttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttcttttt 728  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18041176 gttatttatatttgatttggaaggat-taactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagttttttttt 18041079  T
Q  729 ggtgggttaggttgattttaagatttttg---aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga---taaaataaggtgaggttggtca 821  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||   ||||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||| |||    
T  18041078 ggtgggttggattgattttaacaattttgtaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgacagagaaaaataaggtgaggttgttca 18040979  T
Q  822 aattttaattacaag--aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaag 919  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||    
T  18040978 aattttaattacaagaaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacatttgggttacgaaccaag 18040879  T
Q  920 gtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgatttgtt--ggaaaatgatt 974  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18040878 gtttattaagaaaatatttttgaagttttgcatatttgatttttttgggaaaatgatt 18040821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 344 - 889
Target Start/End: Original strand, 43468073 - 43468620
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43468073 tgtgctcgtaattttcgaatatcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 43468172  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  43468173 ccctta---agactttggattcaggggttggttacgcgaagggaatgtgctagcaccctaagcgtctatggtattccatatgaacctcttacctaaatta 43468269  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43468270 tcttgtgttaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaaaggggggagaaaaagtatg-ttttggttatttttatttga 43468368  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43468369 tttggaaggat-taactcctttgcctacatacccttaaaagaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 43468467  T
Q  744 ttttaagatttttg------aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag 836  Q
    |||||| | |||||      ||||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||    
T  43468468 ttttaacaattttgaagaaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgaggttgat-taattttaattgcaag 43468566  T
Q  837 aaat-caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaata 889  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||    
T  43468567 aaatccaagtctaatatgaatattaagttgattaaacatttgattaagaaaata 43468620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 336 - 803
Target Start/End: Original strand, 2214911 - 2215374
Alignment:
Q  336 tggatatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-t 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  2214911 tggatatttgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaatggaaaaaaat 2215010  T
Q  435 gagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctta 534  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215011 gagtaaaaatcctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctta 2215107  T
Q  535 cctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttat 633  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2215108 cctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaataagtatgtttttggttat 2215207  T
Q  634 ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgg 733  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  2215208 ttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgg 2215303  T
Q  734 gttaggttgattttaagatttttg-aaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2215304 gttaggttgattttaagatttttgaaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 2215374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 396 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15697236 - 15696829
Alignment:
Q  396 tttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta 495  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15697236 tttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgcta 15697137  T
Q  496 gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattatt-acctaaaaatctaa 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15697136 gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaatttatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaagttatttacctaaaaatctaa 15697038  T
Q  595 gtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatca 694  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697037 gtgaaagaatgggggaagaagaagtatggttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatca 15696938  T
Q  695 aaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggca 794  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  15696937 aaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggttgggttgattttaaggtttttgaaaat-ggttttaagaaaagaaagaggcctctaggca 15696839  T
Q  795 tgagataaaa 804  Q
    ||||||||||    
T  15696838 tgagataaaa 15696829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 522 - 960
Target Start/End: Original strand, 16814560 - 16814998
Alignment:
Q  522 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtat 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16814560 taggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgaagggagaaaaagtat 16814659  T
Q  622 gtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtt 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16814660 gtttttggttatttttatttgatttggaaggat-taacttctttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaataatt 16814757  T
Q  722 tctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtc 820  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16814758 tctttttgatgggtttggttgattttaa-attttagaaaat-ggttttgagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtc 16814855  T
Q  821 aaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaa 918  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16814856 aagttttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaa 16814955  T
Q  919 ggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16814956 ggtttattaagaaaatatttttggagttttgcatatttgattt 16814998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 536 - 947
Target Start/End: Original strand, 18890340 - 18890754
Alignment:
Q  536 ctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt-tggttatt 634  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18890340 ctaaattatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatgggaggagaaggagtatgttttttggttatt 18890438  T
Q  635 tttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtggg 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18890439 tttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtggg 18890538  T
Q  735 ttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattaca 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18890539 ttaggttgattttaagatttttgaaaatgggattttagaagggaaagaggcctcgaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattaca 18890638  T
Q  835 agaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa---cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaa 931  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18890639 agaaaataagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaagcaacttggattacaaaccaagttttattaagaa 18890738  T
Q  932 aatatttttggagttt 947  Q
    |||||||||| |||||    
T  18890739 aatatttttgaagttt 18890754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 10720700 - 10721157
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10720700 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 10720799  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  10720800 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 10720899  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtt-atttttattt 641  Q
    ||||||||| || | | ||| | ||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10720900 tcttgtgctaaaat-acttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttattt 10720997  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||| ||    
T  10720998 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtggtttagatt 10721095  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10721096 gattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 10721157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 6293524 - 6293970
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6293524 gattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 6293623  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  6293624 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagattattttgtgct 6293723  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 651  Q
     | || | | | ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6293724 aagtt-actcgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 6293821  T
Q  652 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaaga 751  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  6293822 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttgatgggttaggttgattttaaga 6293918  T
Q  752 tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6293919 tttttgaagat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 6293970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27979139 - 27978685
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27979139 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 27979040  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27979039 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 27978943  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978942 tcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatataaatgaaagaatgaagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 27978843  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27978842 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 27978747  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27978746 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 27978685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 6564158 - 6563701
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6564158 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 6564059  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6564058 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 6563960  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttt-ggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| |  | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6563959 tcttgtgctaagct-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatgtt-taagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttggttatttttattt 6563862  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  6563861 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 6563765  T
Q  742 gattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6563764 gattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 6563701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 6577827 - 6577370
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6577827 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 6577728  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6577727 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 6577629  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttt-ggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| |  | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6577628 tcttgtgctaagct-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatgtt-taagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttggttatttttattt 6577531  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  6577530 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 6577434  T
Q  742 gattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6577433 gattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 6577370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 595 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 41007920 - 41007566
Alignment:
Q  595 gtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatca 694  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007920 gtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatca 41007821  T
Q  695 aaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggca 794  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  41007820 aaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggca 41007723  T
Q  795 t--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aa 890  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  41007722 tgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaa 41007623  T
Q  891 aaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007622 aaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 41007566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 5144265 - 5144721
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5144265 tgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 5144364  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5144365 ccctt-tcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 5144463  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| || |   |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144464 tcttgtgct-aactttgttgcttatttgaaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 5144561  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||    
T  5144562 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggt 5144657  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5144658 tgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 5144721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 352 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 16291242 - 16290794
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16291242 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 16291143  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  16291142 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaactgcttacctagattatcttgtg 16291043  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16291042 ctaaattcatttgtttacttgaaaaattataacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 16290943  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16290942 aggat-tgactcccctgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaattttc--tttggtgggttaggttgattttaa 16290847  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16290846 gatttttgaaaat-ggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 16290794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 344 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 17630664 - 17630358
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17630664 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtttatctttgttctctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17630565  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17630564 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 17630465  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17630464 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 17630365  T
Q  644 tttggaa 650  Q
    |||||||    
T  17630364 tttggaa 17630358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 343 - 804
Target Start/End: Original strand, 1004108 - 1004567
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1004108 gtgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 1004207  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctag-caccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||  |||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |    
T  1004208 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaaacaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagat 1004307  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1004308 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttatt 1004405  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |    
T  1004406 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttagat 1004503  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1004504 tgatttttagactttttgaaaat-ggttttaagaagaggaagaggcctcaaggcatgagataaaa 1004567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 338 - 804
Target Start/End: Original strand, 11918191 - 11918656
Alignment:
Q  338 gatatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgag 437  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11918191 gatatctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgag 11918290  T
Q  438 taaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacc 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||    
T  11918291 taaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacc 11918390  T
Q  537 taatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattt 635  Q
    ||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11918391 tagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattt 11918490  T
Q  636 ttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtggg 734  Q
    |||||||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||    
T  11918491 ttatttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtggg 11918586  T
Q  735 ttaggttgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11918587 ttaggttgattttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 11918656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 11932767 - 11933226
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11932767 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 11932866  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  11932867 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 11932966  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11932967 atcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 11933066  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  11933067 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgagaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 11933162  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11933163 tgattttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 11933226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 342 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 22966228 - 22965768
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22966228 tgtgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 22966129  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  22966128 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagat 22966029  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22966028 tatcttgtgct-aagttacttgtttacttgaaaaaattattgcct-aatgtctaaatgagagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 22965931  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    |||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||    
T  22965930 ttgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttag 22965835  T
Q  739 gttgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22965834 gttgattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 22965768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 343 - 804
Target Start/End: Original strand, 17562686 - 17563147
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17562686 gtgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 17562785  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  ||||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  17562786 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtattccgaaggaaccgcttacctaaat 17562885  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtta-ttttta 638  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17562886 tatcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttta 17562984  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||    
T  17562985 tttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttggaaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttag 17563080  T
Q  739 gttgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17563081 gttgattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 17563147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 22952252 - 22951794
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22952252 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 22952153  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22952152 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacttagatta 22952053  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| || | | ||| ||| |||  ||||||||| ||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22952052 tcttgtgct-aagttacttgtttacttgaaaaaattattgcct-aatgtctaaatgagagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 22951955  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  22951954 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 22951859  T
Q  741 tgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22951858 tgattttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 22951794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 31279028 - 31278579
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31279028 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 31278929  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  31278928 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 31278829  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31278828 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattatttcctaaaaatctaagtgaaagaatgaagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 31278729  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||  |  | |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | | |||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31278728 agg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgcagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 31278633  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31278632 gatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 31278579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 25265155 - 25264700
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25265155 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 25265056  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||    
T  25265055 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttatctagatta 25264956  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| || | | ||| | ||||||||| |  |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25264955 tcttgtgctaaaat-acttgttcatttgaaaaatcattgcttaatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttagttatttttatttga 25264857  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  25264856 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggttg 25264761  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25264760 attttaagatttttgaagat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 25264700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 25274649 - 25274194
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25274649 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 25274550  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||    
T  25274549 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttatctagatta 25274450  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| || | | ||| | ||||||||| |  |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25274449 tcttgtgctaaaat-acttgttcatttgaaaaatcattgcttaatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttagttatttttatttga 25274351  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  25274350 tttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggttg 25274255  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25274254 attttaagatttttgaagat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 25274194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Original strand, 15675078 - 15675525
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15675078 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgattcttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttttc 15675177  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15675178 gaaactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgc 15675277  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | || | | ||| | ||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675278 taaact-acttgttcatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 15675375  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    |   | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15675376 g--aacaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtggattaggttgattttaag 15675471  T
Q  751 atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15675472 atttttcgaaataggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 15675525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 13275250 - 13274799
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13275250 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 13275151  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  13275150 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 13275051  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13275050 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 13274951  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    |||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  13274950 agg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatat-tctttggtgggttaggttgatttta 13274854  T
Q  749 agatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13274853 agatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagagacctcaaggcatgagataaaa 13274799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Original strand, 15683620 - 15684067
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15683620 tgattttcggatatcaaacctttaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgattcttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttttc 15683719  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15683720 gaaactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacgatattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgc 15683819  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | || | | ||| | ||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683820 taaact-acttgttcatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 15683917  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    |   | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15683918 g--aacaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtggattaggttgattttaag 15684013  T
Q  751 atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15684014 atttttcgaaataggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 15684067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 1480429 - 1479978
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1480429 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 1480330  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1480329 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtgc 1480230  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1480229 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 1480131  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    |||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1480130 agg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttta 1480035  T
Q  749 aga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1480034 agatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 1479978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Original strand, 13847669 - 13847977
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13847669 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 13847768  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  13847769 accctta---agactttggattcgggggttggttatgcaaaggaaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctagatt 13847865  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg-tttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13847866 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacttaagaatctaaatgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgattatttttattt 13847965  T
Q  642 gatttggaagga 653  Q
    ||||||||||||    
T  13847966 gatttggaagga 13847977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 341 - 840
Target Start/End: Original strand, 21185412 - 21185907
Alignment:
Q  341 atgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagt 438  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21185412 atgtgtgctcatgaaattcgggtatcaaaccattaattgattttgaaccttcaatatttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaaagtgagt 21185511  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||    
T  21185512 aaaaaccctta---agactttggattcaggggttgattacgcgaagggaaggtgctggcatcctaagcgtctacggtacttcgtaggaacctcttgccta 21185608  T
Q  539 atttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 638  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21185609 atttatcttgtgttaaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaggtctaagtgaaagaatgaagggagaagaagtatgttttttgttgttttta 21185708  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    ||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||  |||||   |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||| ||| |    
T  21185709 tttgatttggaaggat-taactcctttgcctacatatcc-aaaagatttgggatcaaaaccaatgcagttcccctaaagaatttc--tttggtgagttgg 21185804  T
Q  739 gttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgag-ataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag 836  Q
     ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21185805 attgattttaaattttttgaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaataagatgaggttgatcaaattttaattacaag 21185903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 655 - 960
Target Start/End: Original strand, 9183894 - 9184200
Alignment:
Q  655 aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattt 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9183894 aaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagatcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgattttaa-attt 9183991  T
Q  755 ttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattat 852  Q
    | |||||||| |||| ||||| || ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9183992 tagaaaatgg-ttttaagaagggataagaggcttcaaggcatgagagaatataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattat 9184090  T
Q  853 gaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata-tttttggagt-ttgca 950  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  9184091 gaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttttgaagtcttgca 9184190  T
Q  951 tatttgattt 960  Q
    ||||||||||    
T  9184191 tatttgattt 9184200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 4503364 - 4503815
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503364 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 4503463  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4503464 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 4503563  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4503564 taaattcatttggcttacttgaaaaattattatct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttttttttatttgatttgga 4503662  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    |||  | || |||| | ||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4503663 agg--acaagtcctctacctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttt 4503758  T
Q  748 aagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4503759 aagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcacggcatgagataaaa 4503815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 353 - 801
Target Start/End: Original strand, 7063629 - 7064077
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7063629 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 7063728  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| | |  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  7063729 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtacttcgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 7063828  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7063829 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatataaaagaatggagggagaataagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 7063928  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||   | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7063929 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccaatcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttta 7064024  T
Q  749 aga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagata 801  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7064025 agattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagata 7064077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 353 - 801
Target Start/End: Original strand, 7096476 - 7096924
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7096476 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 7096575  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  7096576 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 7096675  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7096676 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatataaaagaatggacggagaataagtatgtttttggttaattttatttgatttggaa 7096775  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||   | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7096776 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccaatcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttta 7096871  T
Q  749 aga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagata 801  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7096872 agattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagata 7096924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 24215984 - 24216430
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24215984 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 24216083  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24216084 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagatt 24216183  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  24216184 atcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagta----------tatttttattt 24216271  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  24216272 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 24216367  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24216368 tgattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 24216430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 585 - 960
Target Start/End: Original strand, 27958025 - 27958396
Alignment:
Q  585 aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 684  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||      
T  27958025 aaaaatctaagtgaaagaatgg--ggagaagaaacatgtttttggtt----ttatttgatttggaatgataaaaatcctttgcctacatacctttaaatg 27958118  T
Q  685 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagag 783  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  27958119 aaagggatcaaaatcaatgtcgttcacctaaaaaatttctttttagtgggttgaattgattttaa-atttttgaaaat-ggttctaagaagagataagag 27958216  T
Q  784 gcctccaggcatg--agataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgatt 880  Q
    ||||| | |||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27958217 gcctcaaagcatggaaaaaagaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaataaagtctaatgtgaatattaattcaattaagcatttgatt 27958316  T
Q  881 aagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27958317 aagaaaataaaagg-aaaacacttgggttaccaaccaaggtttattaagaaaatatttttgaagttttgcatatttgattt 27958396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 353 - 803
Target Start/End: Original strand, 17616482 - 17616932
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17616482 gattttcggatatcaaaccattggttgatttgaatcttcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 17616581  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  17616582 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 17616681  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17616682 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtatg-ttttggttatttttatttgatttggaa 17616780  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc---ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||  | || |||| | ||||| |||||   ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17616781 gg--acaagtcctctacctacgtaccctttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttagattgatttt 17616876  T
Q  748 aagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17616877 attttttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggtatgagataaa 17616932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 371 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 27885101 - 27884533
Alignment:
Q  371 cattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggag 470  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||| |    
T  27885101 cattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctctacttttatttgtgggaagggaaaaaatgag-aaaaaccattat-gagattttggatccggggg 27885004  T
Q  471 ttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgctta-t 568  Q
    |||||| ||   |||||||||| | ||||||| || || |||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  27885003 ttggtttcgattagggaaggtgttaagcacccgaatcgactactgtattccgtaggaacctcttgcctactttatcttgtgct-aatt-atttgcttatt 27884906  T
Q  569 ttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcc 668  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27884905 ttgaaaatgcttacttaaaagtctaagtgaaagaatggatggagaagaagtatgttttt-gttgtttttatttgatttggaaggat-tagatcctttgcc 27884808  T
Q  669 tacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ct-aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggt 766  Q
    |||||| ||    | ||  || |||||||||| |||||||| | || ||||||    | ||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||| |||    
T  27884807 tacatatcc----acaagcggaatcaaaaccattgtagttctctctcaaaaag----tatttggtgggttggattgattttaaaagttttggaaat-ggt 27884717  T
Q  767 ttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatattaattc 864  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| |     
T  27884716 tttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgaagttggt-taattttaattacaaaaaatacaagtctaatatggatattaaatt 27884618  T
Q  865 aataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagtttg 948  Q
     || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27884617 gattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttaaaatccaaggcttattaggaaaatatttttgaagtttg 27884533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 352 - 631
Target Start/End: Original strand, 27957185 - 27957459
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  27957185 tgatttacggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatttttgaac--tcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaccctta-- 27957280  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
     | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27957281 -aaactttagattcgggtgttggttacgcgaaggaaaggtgctagcattctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaattatcttgtgc 27957379  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtt 631  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27957380 taaattgatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaaatataagtgaaagaatgg-gggagaagaagtatgtttttggtt 27957459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 344 - 552
Target Start/End: Original strand, 10713426 - 10713634
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10713426 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 10713525  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  10713526 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 10713625  T
Q  544 tcttgtgct 552  Q
    |||||||||    
T  10713626 tcttgtgct 10713634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 344 - 552
Target Start/End: Original strand, 29730411 - 29730621
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa- 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  29730411 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 29730510  T
Q  443 -acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29730511 aacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagat 29730610  T
Q  542 tatcttgtgct 552  Q
    ||| |||||||    
T  29730611 tattttgtgct 29730621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 344 - 910
Target Start/End: Complemental strand, 27880733 - 27880175
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27880733 tgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcttcaatctttgaactctctacttttattcgtgggaagggaaaaagtgag-aaaaa 27880635  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||| |||||||||||| || | ||||||| ||   |||||||||| | ||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  27880634 cccttat-gagactttggatccgagggttggtttcgattagggaaggtgttaagcacccgaatcgactacggtattccgtaggaacctcttgcctacttt 27880536  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgctta-tttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27880535 atcttgtgct-aatt-atttgcttattttgaaaatgcttacttaaaagtctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgttttt-gttgtttttattt 27880439  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ct-aaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||   |||| ||    | ||  || |||||||||| |||||||| | || ||||||    | ||||||||||| |     
T  27880438 gatttggaaggat-tagatcctttgc---catatcc----acaagtggaatcaaaaccattgtagttctctctcaaaaag----tatttggtgggttgga 27880351  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaa----ataaggtgaggttggtcaaattttaattaca 834  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||    ||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  27880350 ttgattttaaaagttttgaaaat-agttttaagaagagataagaggcctcagggcatgagagaaaatatataagatgaagttggt-taattttaattaca 27880253  T
Q  835 agaaa-tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggtta 910  Q
    |||||  |||||||| |||| ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27880252 agaaacccaagtctaatatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggtta 27880175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 355 - 960
Target Start/End: Original strand, 9567282 - 9567888
Alignment:
Q  355 ttttcggctatcaaaccattaatt-gatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcga 453  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | |||||  | | |||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  9567282 ttttcgggtatcaaaacattaattagttttgagccttcaatctttggactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaaccctta-cga 9567380  T
Q  454 gactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||  | || ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  9567381 gactttggattcgggggttggtttcgattagggaaggtgttaagcacccacatcgactacggtatcccataggaacctcttgcctactttatcttgtgtt 9567480  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg-tttttggttatttttatttgatttggaag 651  Q
     |||| ||||||||||||||||| || |  |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  9567481 aaattaatttgcttatttgaaaa-taatgtctaagagtctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttttgtttctttta-ttgatttggaag 9567578  T
Q  652 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcac-ctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    |||    ||| | |||||||||| ||    | ||  || ||||||| |  |||||||| | || |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  9567579 gat-tggatcgtttgcctacatatcc----acaagtggaatcaaaatcgttgtagttctctcttaaaaatt--tatttggtgggttagattgattttaac 9567671  T
Q  751 atttttgaaaat-gggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtct 847  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||    
T  9567672 atttttgaaaataaagttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattataagaaacccaaatct 9567771  T
Q  848 attatgaatatt-aattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag 944  Q
    | |||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9567772 aatatggatattaaattgattaaag-atttgattaagaaaatataaagaaaaaggcacttggattaaaattcaaggtttcttaagaaaatatttttgaag 9567870  T
Q  945 --tttgcatatttgattt 960  Q
      ||||||||||||||||    
T  9567871 tttttgcatatttgattt 9567888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 344 - 511
Target Start/End: Original strand, 18881928 - 18882095
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18881928 tgtgctcatgattttcagataccaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18882027  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18882028 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 18882095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 344 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 13555750 - 13555526
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  13555750 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attagtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 13555653  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||    
T  13555652 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgcaggaaccttttacttaattt 13555556  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttga 572  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13555555 atcttgtgctaaattgctttgcttatttga 13555526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 339 - 491
Target Start/End: Original strand, 14520707 - 14520859
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14520707 atatatgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 14520806  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggt 491  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14520807 aaaaacccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggt 14520859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 782 - 947
Target Start/End: Original strand, 18886343 - 18886511
Alignment:
Q  782 aggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgatta 881  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18886343 aggcctcgaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaataagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgatta 18886442  T
Q  882 agaaaataaaaggaaaaa---cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18886443 agaaaataaaaggaaaaaagcaacttggattacaaaccaagttttattaagaaaatatttttgaagttt 18886511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 779 - 947
Target Start/End: Original strand, 8223119 - 8223291
Alignment:
Q  779 aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttg 877  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  8223119 aagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaatttcaagaaaatcaagtctagtatgaatattaattcaattatgcatttg 8223218  T
Q  878 attaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8223219 attaagaaaataaaaggaaaaagcaaacttgggttacaaaccaagttttattaagaaaatatttttgaagttt 8223291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 353 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12469207 - 12468968
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12469207 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggaaaaaaataagtaaaaacccttatcg 12469108  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  12469107 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 12469008  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaa 589  Q
    | |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12469007 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaa 12468968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 809 - 947
Target Start/End: Original strand, 14536879 - 14537015
Alignment:
Q  809 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggt 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14536879 gtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaacacttgggt 14536977  T
Q  909 tacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14536978 tacgaaccaaggtttattaa-aaaatatttttgaagttt 14537015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 634 - 764
Target Start/End: Original strand, 27957882 - 27958011
Alignment:
Q  634 ttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgg 733  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27957882 ttttatttgatttggaatgataaaaatcctttgcctacatacccttaaatgaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttcttttttgtgg 27957981  T
Q  734 gttaggttgattttaagatttttgaaaatgg 764  Q
    |||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  27957982 gttgaattgattttaa-atttttgaaaatgg 27958011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 531 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 30102286 - 30102060
Alignment:
Q  531 cttacctaatttatcttgtgctgaattgatttg-cttatttgaaaa--ttattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt 626  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30102286 cttacctagattatcttgtgctaaattcgtttggcttacttgaaaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttt 30102187  T
Q  627 tggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc---ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttc 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||   ||   | ||| ||||||||||| | |||||||  |||||||  |||    
T  30102186 tggttatttttatttgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttttgggaaaaggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaa--ttc 30102091  T
Q  724 tttttggtgggttaggttgattttaagattttt 756  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30102090 --tttggtgggttaggttgattttaagattttt 30102060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 18900357 - 18900464
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18900357 tgtgtgctcgtgatttttggataccaaaccattaattgatttgaatcgtcaatcattgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 18900456  T
Q  442 aaccctta 449  Q
    ||||||||    
T  18900457 aaccctta 18900464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 344 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22094926 - 22094837
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22094926 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaa 22094837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 343 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18041434 - 18041375
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaac 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18041434 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaatcattaattgatttgaatcgttaatctttgaac 18041375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 752 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 30102049 - 30101998
Alignment:
Q  752 tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30102049 tttttgaaaatgg-ttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 30101998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15697273 - 15697231
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaa 386  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15697273 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaa 15697231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 496; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 3431401 - 3432007
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431401 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 3431500  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3431501 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 3431600  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431601 tcttgtgctaaattcattgg-ttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 3431699  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3431700 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttgttgggttaggttga 3431799  T
Q  744 ttttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatc 841  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3431800 ttttaagattttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaatc 3431899  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3431900 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttt 3431999  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  3432000 tggagttt 3432007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 31541563 - 31540958
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31541563 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31541464  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31541463 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 31541364  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541363 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 31541264  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  31541263 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 31541166  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31541165 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaat 31541066  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541065 caagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 31540966  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  31540965 tggagttt 31540958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 31550132 - 31549527
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31550132 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31550033  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31550032 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 31549933  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549932 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 31549833  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  31549832 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 31549735  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31549734 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaat 31549635  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549634 caagtttaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 31549535  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  31549534 tggagttt 31549527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 28991106 - 28991730
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28991106 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtaaatctttgaactctcgatctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28991205  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28991206 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 28991305  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991306 tcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 28991404  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28991405 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 28991503  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatc 841  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28991504 tttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatc 28991601  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa--------acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 933  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28991602 aggtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaaagacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaa 28991701  T
Q  934 tatttttggag--tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28991702 tatttttggagtttttgcatatttgattt 28991730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 933
Target Start/End: Original strand, 32135108 - 32135698
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32135108 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 32135207  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32135208 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 32135307  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32135308 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatatttttggttatttttatttg 32135406  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32135407 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggtta 32135505  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    ||||||| | ||||| |||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32135506 attttaacaattttggaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaat 32135605  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 933  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135606 caagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 32135698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Original strand, 13803853 - 13804486
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13803853 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13803952  T
Q  444 --cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
      |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13803953 aaccctcatcgagactttggatccgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaat 13804052  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13804053 tatcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattactacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaaatatgttttttgttatttttattt 13804152  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13804153 gatttggaaggataaaaatcctatgcttacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggtt 13804251  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13804252 gatttt-aggttttagaaaat-ggttttaagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaat 13804349  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13804350 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacccttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 13804449  T
Q  941 gga--gtttgcatatttgatttgtt-ggaaaatgatt 974  Q
     ||   |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13804450 tgaagttttgcatatttgattttttaggaaaatgatt 13804486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 13452437 - 13451788
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13452437 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13452338  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13452337 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 13452238  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13452237 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagcatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 13452138  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13452137 ttttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctctttggtgggtt-ggttg 13452039  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  13452038 attttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgagcttggtcaaattttaattacaagaaaa 13451941  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg---aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13451940 tcgagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaataaaataaaaggaaaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 13451841  T
Q  937 ttttggag-tttgcatatttgatttgttgg-aaaatgattatttttagactaa 987  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||    
T  13451840 ttttggagttttgcatatttgattttttggtaaaatgattttttctaaactaa 13451788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 41744502 - 41745101
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41744502 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 41744601  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41744602 tccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaaacgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 41744701  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744702 tcctgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 41744800  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41744801 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttc-ttttggtgggtt-ggttg 41744898  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 841  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744899 attttaa-attttagaaaaatggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 41744997  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41744998 aagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaa-aaaatatttttg 41745095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 43456450 - 43455824
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43456450 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 43456351  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  43456350 acccttatcaagactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaggcgtctatggtatttcataggaacctcttacctaaatt 43456251  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattaccta--aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43456250 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatatttttggttatttttatt 43456151  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||| |||||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  43456150 tgattttgaaggat-taactcctttgcctatatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggttggat 43456052  T
Q  741 tgattttaagatttttg--aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag 836  Q
    ||||||||| | |||||  ||||  | |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43456051 tgattttaacaattttgtaaaaaaagattttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaag 43455952  T
Q  837 -aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg--aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 933  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43455951 aaaatcaagtctaatatgaatattaagtcaattaagcatttgattaagaaagtaaaaggaaaaaaacacttgggttaccaaccaaggtttattaagaaaa 43455852  T
Q  934 tatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||    
T  43455851 tatttctgaagttttgcatatttgattt 43455824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 2385571 - 2384976
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2385571 tgtgctcatgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 2385472  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  2385471 ccctta---agactttggattcgggggttggttacacgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttatctaaatta 2385375  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385374 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 2385275  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct-aaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2385274 tttggaaggattaaa--cctttgcctacatacccttaaaggaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaagtttcttttgggtgggtt-ggttg 2385178  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2385177 attttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttgatcaaattttaattacaagaaaat 2385080  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaag---gaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385079 caagtctaatatgaatattaattcaaataagcatttgattaagagaataaaagaaaaaaaaaaacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 2384980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 940
Target Start/End: Original strand, 23355413 - 23356014
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23355413 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgataatctttgaactctcgatttttattcgtggaaagggaaaaaatgagtaaaaa 23355512  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23355513 ccctta---agactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatgatatttcatatgaacctcttacctaattta 23355609  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaat----ctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23355610 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctactatgcgaaagaatgggcggagaagaagtatgtttttggttatttttat 23355709  T
Q  640 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  23355710 ttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaaattctttttggtgggttaga 23355809  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgag----ataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattaca 834  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    | |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  23355810 ttgattttaatatttttgaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaaaaacaaggtgaggttggt-taattttaattgca 23355907  T
Q  835 ag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 933  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23355908 agaaaatcaaatctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttggattacaaaccaaggtttatcaagaaaa 23356007  T
Q  934 tattttt 940  Q
    |||||||    
T  23356008 tattttt 23356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 28460189 - 28459583
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28460189 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattgattgaattgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 28460090  T
Q  444 cccttatcgagactttggatt------cgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacct 537  Q
    |||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  28460089 cccttatcgagactttggatttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaaacgtctacggtattccgcaggaacctcttacct 28459990  T
Q  538 aatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttt 636  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459989 aaattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattgttacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttt 28459890  T
Q  637 tatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  28459889 tatttgatttggaaggataaaaatcctatgtctacatacccttaaagaaaagggatcaaaatcaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggtgggtt 28459792  T
Q  737 aggttgattttaagatttttg-aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattaca 834  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28459791 aggttgattttaacaattttgaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgag--aaaataaagtgaggttggtcaaattttaattaca 28459694  T
Q  835 agaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaat 934  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  28459693 agaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaacacttaggttacaaaccaaggtttattaa-aaatt 28459596  T
Q  935 atttttggagttt 947  Q
    ||||||| |||||    
T  28459595 atttttgaagttt 28459583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 21496882 - 21497340
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21496882 tgtgctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtca-tctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 21496980  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  21496981 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaatcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaactta 21497080  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497081 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 21497180  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497181 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 21497280  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21497281 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 21497340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 974
Target Start/End: Original strand, 51055114 - 51055746
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  51055114 gtgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgattcgaatcgtcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaacgtgagtaaaa 51055213  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||   |||||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  51055214 accctt---gagactttggattttggggttaattacgcgaagggaagatgctagcaccctaaacgtctacggtactccataggaacctcttgcctaattt 51055310  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51055311 atcttgtgctaaattaatttgcttatttaaaaattattgcctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 51055410  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||  || | || || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  51055411 atttggaaggat-taacttctttggctacatacccttaaaagaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaggttctttttggtgggttagattg 51055509  T
Q  743 attttaa-gatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa- 839  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51055510 attttaacaattttggaaaacaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaac 51055609  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacactt-gggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  51055610 tcaagtctaatatggatattaaattgattaagcatttgattgagaaaataaaagg-aaaacacttggggttaaagtccaaggtttattaagaaaatattt 51055708  T
Q  939 ttggag-tttgcatatttga-tttgttggaaaatgatt 974  Q
    |||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  51055709 ttgacgttttgcatatttgatttttttggaaaatgatt 51055746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4519863 - 4519528
Alignment:
Q  8 agctcgtgatattctgagggcatgcaatgcatacatggaagttcctcacgtggaggtatggatgcgcttgttgaagagtttgcaaaagttggagtttgga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4519863 agctcgtgatattctgagggcatgcaatgcatacatggaagttcctcacgtggaggtatggatgcgcttgttgaagagtttgcaaaaattggagtttgga 4519764  T
Q  108 gctaaggactgaaaattttgcatgattcaaaagaatgtaatctatgaaaacctaaatttaagacttgatccagaagtcttcttacatccggtgttttaca 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4519763 gctaaggactgaaaattttgcttgattcaaaagaatgtaatctatgaaaacctaaatttaagacttgatccagaagtcttcttacatccggtgttttaca 4519664  T
Q  208 aattggctcgaattggcttattggatcggatactggactagtaaccggtttataacacacatttaaaaaagttatttattgtaaatacttttttaagatg 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4519663 aattggttcgaattggcttattggatcggatactggaccagtaaccggtttataatacacatttaaaaaagttatttattgtaaatacttttttaagatg 4519564  T
Q  308 actagagcgatttaatattagttgaatatggatatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4519563 actagagcgatttaatattagttgaatatggatatg 4519528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 344 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 13477442 - 13477078
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13477442 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgattagaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaa 13477343  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  13477342 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgtagggaaggtgttagcaccctaagcatctacggtatcccgtaggaacctcttacctaaatta 13477243  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13477242 tcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 13477144  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13477143 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 13477078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 20502516 - 20502063
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20502516 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 20502417  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||     
T  20502416 ccctta---agactctgaattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctagattg 20502320  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502319 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtggaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 20502220  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||| ||   |||| | ||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  20502219 atttggaaggacaag--tcctctacctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttcttt--ggtgggttaggttg 20502124  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20502123 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 20502063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 31553763 - 31553306
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31553763 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31553664  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31553663 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 31553564  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31553563 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 31553466  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  31553465 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 31553369  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31553368 tggttttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 31553306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 31562897 - 31562440
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31562897 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaaacgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31562798  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31562797 acccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactatggtattccataggaacctcttacctagat 31562698  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31562697 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 31562600  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  31562599 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 31562503  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31562502 tggttttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 31562440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 352 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22480025 - 22479580
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22480025 tgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctttatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 22479926  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22479925 gagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtactagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctaa-ttatcttgtgc 22479827  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22479826 taaaattatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 22479727  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    ||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22479726 gg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 22479631  T
Q  750 ga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagat 800  Q
    || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22479630 gattttttgaaaat-ggtttaaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagat 22479580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 32608986 - 32608539
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaaggga-aaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  32608986 gattttcggatatcaaatcattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggacaaaaatgagtaaaaacccttatt 32608887  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608886 gagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgc 32608787  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttgg-ttatttttatttgatttggaa 650  Q
    |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32608786 tacattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtttatttttatttgatttggaa 32608688  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    ||  | ||  ||| ||||||| |||||||   |  |||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32608687 gg--acaagccctctgcctacgtaccctt-ttgggaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaag 32608593  T
Q  751 a-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32608592 attttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 32608539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 344 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 21055280 - 21054866
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  21055280 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagtgaaaaagttagtaaaaa 21055181  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  21055180 ccctt---gagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcactctaagcgtctacggtactctgtaggaacctcttgcctaattta 21055084  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21055083 tcctgtgctaaattaattcgcttatttgaaaattattgcctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 21054984  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct-aaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||| |||  ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  21054983 tttggaatgat-taacgccttttcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcccctgaaaaaatttctttttggtgggttggattg 21054885  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgg 764  Q
    |||   | ||||||||||||||    
T  21054884 att---aaatttttgaaaatgg 21054866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 344 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23952522 - 23952221
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23952522 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaatcgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggatgggaaaaaatgagtaaaaa 23952423  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23952422 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 23952323  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23952322 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 23952224  T
Q  644 ttt 646  Q
    |||    
T  23952223 ttt 23952221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 22472952 - 22472503
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22472952 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 22472853  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  22472852 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 22472753  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22472752 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 22472653  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22472652 agg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 22472557  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22472556 gatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 22472503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 342 - 804
Target Start/End: Original strand, 38123425 - 38123882
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38123425 tgtgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 38123524  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||||   | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38123525 aacccttaaaaaaaatt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagat 38123623  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38123624 tatcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 38123721  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| ||||||||||    
T  38123722 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttagg 38123817  T
Q  740 ttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38123818 ttgattttaagatttttcgaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 38123882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 3350534 - 3350982
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3350534 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 3350633  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  | ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  3350634 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaagaaccgcttacttagattatcttgtgc 3350733  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3350734 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgtttttatttgatttggaa 3350833  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||||   |  |||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3350834 gg--acaagtcctctgcctacgtaccctt-ttgggaagggatcaaaaccaacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaag 3350928  T
Q  751 a-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3350929 attttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 3350982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16135514 - 16135066
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16135514 gattctcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaaggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 16135415  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  16135414 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 16135315  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16135314 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 16135216  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    ||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16135215 gg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 16135120  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16135119 gatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16135066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 345 - 709
Target Start/End: Original strand, 8240865 - 8241229
Alignment:
Q  345 gtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8240865 gtgcttgtgattttcgagtatcaagccattgattggttttgaaccttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaa 8240964  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  8240965 ccctta--gagactttggattcaggggttgattacgcgaagggaaggtgatagcaccctaagcatctacggtactccgtaggaatctcttgcctaattta 8241062  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg-tttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8241063 tcttgtgctaaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaagtctaagtgaaagaatggggggagaagaagtaagttttttggttatttttatttg 8241162  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8241163 atttggaaggataaaaatcctttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttc 8241229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 353 - 803
Target Start/End: Original strand, 34336620 - 34337070
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34336620 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 34336719  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  34336720 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 34336819  T
Q  552 tgaatt-gatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    | |||| | || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34336820 taaattcgtttggcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 34336919  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |   | ||||||||||||||||||||||    
T  34336920 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaat---tctttggtgggttaggttgatttt 34337014  T
Q  748 aaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34337015 aagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 34337070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 352 - 947
Target Start/End: Original strand, 36848507 - 36849106
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa-cccttat 450  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  36848507 tgattttcgaatatcaaaccattaattgatttaaatcttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaatcccttaa 36848606  T
Q  451 cgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgt 549  Q
     ||||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||   | || |||||   | |||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||    
T  36848607 -gagactttggattcgggggttggttttgaatagggaaggtttgacgccccctacatgactatggtactccgtagaaaccttttgcctaacttattttgt 36848705  T
Q  550 gctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    ||| || |  |||  |||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36848706 gctaaaatattttatttatatgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatggagggagaagaagtatgttttttgttgtttttatttgatttgga 36848805  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    | |||  |||| || ||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||   |||| ||  || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36848806 atgat--aaattctttgcctacgtaccc-taaacggaagggatcaaaaccgtcgtagatccactcaaaag-ttctttttggtgggttggattgattttaa 36848901  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtct 847  Q
     |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36848902 aatttttgaaaaaaagtttttagaagagataagaggcctcaaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattataagaaatccaagtct 36849001  T
Q  848 attatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-----aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgg 942  Q
    | |||| | ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||     
T  36849002 aatatggagattaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaacacttgggttaaaatccaaggtttcttaagaaaatatttttga 36849101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 353 - 803
Target Start/End: Original strand, 12464053 - 12464506
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12464053 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 12464152  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  12464153 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 12464252  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12464253 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaataagtatg-ttttggttatttttatttgatttggaa 12464351  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc---ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||  | || |||| | ||||| |||||   ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12464352 gg--acaagtcctctacctacgtaccctttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttagattgatttt 12464447  T
Q  748 aaga---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12464448 aagattttttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggtatgagataaa 12464506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 343 - 581
Target Start/End: Original strand, 35097377 - 35097615
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  35097377 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtatgaagggaaaaaatgagtaaaa 35097476  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35097477 acccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 35097576  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattatta 581  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35097577 atcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattatta 35097615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 52101542 - 52101236
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  52101542 tgtgctcgtgattttcgggtatcaagccattgattggttttgaaccttcaatctttgaactctcgatttttattcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 52101444  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||| |||   |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  52101443 accttta---agacct-ggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatgatattccataggaacctcttacctagatt 52101348  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52101347 atcttgtgctaaattcatttgcttatttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttatttttattt 52101248  T
Q  642 gatttggaagga 653  Q
    ||||||||||||    
T  52101247 gatttggaagga 52101236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 344 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13461332 - 13461138
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13461332 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13461233  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13461232 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccta 13461138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 342 - 552
Target Start/End: Original strand, 21244869 - 21245079
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21244869 tgtgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaa 21244968  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  21244969 aacccttttcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagat 21245068  T
Q  542 tatcttgtgct 552  Q
    |||||||||||    
T  21245069 tatcttgtgct 21245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 344 - 537
Target Start/End: Original strand, 46776801 - 46776994
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46776801 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaacctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 46776900  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacct 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46776901 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacct 46776994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 677 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 11950392 - 11950084
Alignment:
Q  677 cttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa-gatttttg-aaaatgggtttttagaa 774  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||    
T  11950392 cttaaagaaaaggtatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttggattgattttaacaatttttgtaaaaaaggttttaagaa 11950293  T
Q  775 gaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctattatgaatattaattcaataaag 871  Q
    ||||  |||| |||| |||||| |||  |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  || ||     
T  11950292 gagattagagacctcaaggcataagagaaaaataagatgaggttgat-taattttaattgcaagaaatcaaagtctagtatgaatgttaagttgattaaa 11950194  T
Q  872 catttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttga--tttgttggaaa 968  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||||    
T  11950193 catttgattaagaaaataaaagg-aaaacgcttatgttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgaagttttgcatatttgattttttttggaaa 11950095  T
Q  969 atgattatttt 979  Q
    |||||| ||||    
T  11950094 atgattttttt 11950084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 526 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 18702676 - 18702405
Alignment:
Q  526 aacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtt 624  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| | || | ||| | ||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18702676 aaccgcttacctaaattatcttgtgctaagtt-acttgttcatttgaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggagaaaaagtatgtt 18702579  T
Q  625 tttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttct 724  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||| ||   |||  ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | ||||||  ||| |||| |||||    
T  18702578 tttggtattttttatt-gatttggaaggacaag--tcccttgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagtttccctcaaaaatttct 18702482  T
Q  725 ttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18702481 tt--ggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgagttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 18702405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 352 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22495991 - 22495867
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22495991 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 22495892  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggtt 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  22495891 gagactttggattcgggggttggtt 22495867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 353 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 8514094 - 8513942
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514094 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 8513995  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaa 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||    
T  8513994 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaa 8513942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 354 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18780232 - 18780118
Alignment:
Q  354 attttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcga 453  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18780232 attttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcga 18780133  T
Q  454 gactttggattcggg 468  Q
    |||||||||||||||    
T  18780132 gactttggattcggg 18780118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 344 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 25337294 - 25337131
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25337294 tgtgctcgtgagtttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaaaa 25337197  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcta 511  Q
    |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25337196 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtcta 25337131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 353 - 538
Target Start/End: Original strand, 27311794 - 27311980
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27311794 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 27311893  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||    
T  27311894 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttaccta 27311980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 344 - 708
Target Start/End: Original strand, 4282507 - 4282866
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  4282507 tgtgctcttgaaattcgggtatcaaaccattaattggttttgaaccttcaatctttgaactctcaacttttattcgtgggaagagaaaaagtgagtaaaa 4282606  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa-t 540  Q
     |||||||  | ||||||||| |||| ||||||| ||    | ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  4282607 -cccttataaa-actttggatccgggggttggttccgaatcgtgaaggtgttaagcaccctaaacgactacggtattccgtaggaacctcctacctaact 4282704  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgatttgcttattt--gaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 638  Q
    |||  ||||||| |||| ||| || |||||  |||||| |||   || |||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  4282705 ttaatttgtgctaaattaatt-gcctattttcgaaaataattgtttacaaaattaagtgaa-gaatggagggagaagaaacatgttttttgttgttttta 4282802  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagtt 708  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||    
T  4282803 tttgatttggaaggat--aaatcatttgcctacataccct----aaaaagggatcaaaaccattgtagtt 4282866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 357 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2248532 - 2248397
Alignment:
Q  357 ttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgaga 455  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| | | | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2248532 ttcgggtatcaaaccattaattggttttgaaccttcaatctttgaactcccaacttttattcgtgagaagggaaaaagtgagtaaaaacccttat-gaga 2248434  T
Q  456 ctttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtg 492  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  2248433 ctttggattcgggggttggtttcgaaaagggaaggtg 2248397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 465 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 17018961 - 17018892
Alignment:
Q  465 cgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctt 533  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17018961 cgggggttggttacgcaaagagaaggttttaagcaccctaaacgtctatggtattctataggaagctctt 17018892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 492; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 989
Target Start/End: Original strand, 17662267 - 17662918
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17662267 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaactgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17662366  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17662367 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattt 17662466  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662467 atcttgtgctaaattcattgg-ttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 17662565  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662566 atttggaaggataaaaaacctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 17662665  T
Q  743 attttaag--atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662666 attttaagatatttttgaaaatgggtttttagaggggaaagaggcctcaaggcatgaaagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 17662765  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662766 caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttataaaccaaggtttattaagaaaatattttt 17662865  T
Q  941 ggag-tttgcatatttga---tttgttggaaaatgattatttttagactaacg 989  Q
    |||| |||||||||||||   ||| | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  17662866 ggagttttgcatatttgatcttttttgggaaaatgattttttttaaactaacg 17662918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 960
Target Start/End: Original strand, 4837361 - 4837984
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4837361 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 4837460  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837461 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 4837560  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837561 atcttgtgct-aatttcattgcttatttgaaaattatcacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 4837659  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837660 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttacagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 4837759  T
Q  742 gattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4837760 gattttaagattttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaagaaa 4837859  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa----cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata 935  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  4837860 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagaaaaaaaagcaacttgggttacaaaccaaggtttattaaaaatat- 4837958  T
Q  936 tttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||| || ||||||||||||||||    
T  4837959 tttttgaagttttgcatatttgattt 4837984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 989
Target Start/End: Original strand, 17681396 - 17682047
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17681396 tgtgctcgtgattttcgaatatcaagccattaactgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 17681495  T
Q  444 -cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17681496 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattt 17681595  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681596 atcttgtgctaaattcattgg-ttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 17681694  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681695 atttggaatgataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 17681794  T
Q  743 attttaag--atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681795 attttaagatatttttgaaaatgggtttttagaggggaaagaggcctcaaggcatgaaagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 17681894  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattttt 940  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681895 caagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttataaaccaaggtttattaagaaaatattttt 17681994  T
Q  941 ggag-tttgcatatttga---tttgttggaaaatgattatttttagactaacg 989  Q
    |||| |||||||||||||   ||| | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  17681995 ggagttttgcatatttgatcttttttgggaaaatgattttttttaaactaacg 17682047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 30939892 - 30939287
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30939892 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 30939793  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30939792 ctcttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 30939693  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939692 tcttgtgctaaattgatttgcttatttgaaaattattatctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 30939593  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  30939592 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttga 30939495  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  30939494 ttttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacattttaattacaagaaaat 30939395  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 939  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939394 caagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttt 30939295  T
Q  940 tggagttt 947  Q
    ||||||||    
T  30939294 tggagttt 30939287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 17529435 - 17528802
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17529435 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaac 17529336  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17529335 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 17529236  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17529235 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgg-gggagaagaagtatatttttggttatttttatttga 17529138  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17529137 tttggaaggataaaaatcctatgcctgcatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 17529039  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatca 842  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17529038 tttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagaaaaagaggcctcaaggcatgagagaaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaatca 17528941  T
Q  843 agtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-----aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17528940 agtctattatgaatattaattcaattaagcattagattaagaaaataaaaggaaaaaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 17528841  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgatttgttgg-aaaatgatt 974  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17528840 tttggagttttgcatatttgattttttggtaaaatgatt 17528802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 39836010 - 39836616
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39836010 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 39836109  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39836110 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaaacatctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 39836209  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39836210 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 39836309  T
Q  644 tttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  39836310 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 39836407  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  39836408 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaa 39836507  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39836508 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 39836607  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  39836608 ttggagttt 39836616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 39844052 - 39844658
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39844052 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 39844151  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39844152 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattctgtaggaacctcttacctaattta 39844251  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39844252 ccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 39844351  T
Q  644 tttggaaggat-aaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  39844352 tttggaaggataaaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 39844449  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcat--gagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  39844450 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagagaaaaaataaggtgaggttgttcacgttttaattacaagaaaa 39844549  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39844550 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaagacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 39844649  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  39844650 ttggagttt 39844658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 948
Target Start/End: Original strand, 25584851 - 25585454
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25584851 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 25584950  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  25584951 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccataagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 25585050  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
     |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25585051 ccttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagagtggagggagaagaagtatatttttggttatttttatttga 25585149  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||    
T  25585150 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttc--tttggcgggttaggttga 25585247  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatc 841  Q
    ||||||  |||||   ||   ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25585248 ttttaattttttttttaaatagttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcgaattttaattacaaagaaatc 25585347  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25585348 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaactatttttg 25585447  T
Q  942 gagtttg 948  Q
    || ||||    
T  25585448 gattttg 25585454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 16775641 - 16775019
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16775641 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16775542  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16775541 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 16775442  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16775441 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 16775343  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775342 atttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 16775243  T
Q  743 attttaagatttttg-aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775242 attttaacaattttgaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgcggttggtcaaattttaattacaagaaat 16775143  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16775142 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 16775043  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16775042 tttggagttttgcctatttgattt 16775019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 16761204 - 16760582
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16761204 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 16761105  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16761104 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 16761005  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16761004 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 16760906  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760905 atttggaaggatacaaatcccatgcctatatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 16760806  T
Q  743 attttaagatttttg-aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760805 attttaacaattttgaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgcggttggtcaaattttaattacaagaaat 16760706  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16760705 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 16760606  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16760605 tttggagttttgcctatttgattt 16760582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 335 - 960
Target Start/End: Original strand, 26871203 - 26871849
Alignment:
Q  335 atggatatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaat 434  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26871203 atggatgtttgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaat 26871302  T
Q  435 gagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctta 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26871303 gagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctctta 26871402  T
Q  535 cctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatt 634  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26871403 cctaatttatcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatt 26871501  T
Q  635 tttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtggg 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26871502 tttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtggg 26871601  T
Q  735 ttaggttgattttaaga---tttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgag--------------ataaaataaggtgaggtt 816  Q
    || | |||||||||| |   ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||              | |||| || ||||||||    
T  26871602 ttggattgattttaatattttttttgaaaat-ggttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgagaaaaaaaaaaacaaaaaaaacaaagtgaggtt 26871700  T
Q  817 ggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaag--gaaaaacacttgggttacaa 913  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |    
T  26871701 ggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtataatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagaaaaaaaacacttgggttacta 26871800  T
Q  914 accaaggtttattaag-aaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26871801 accaaggtttattaagaaaaatatttttgaagttttgcatatttgattt 26871849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 17976043 - 17975401
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17976043 tgtgctcgtgattttcggataacaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 17975944  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17975943 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaattt 17975844  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17975843 atcttgtgctaaattcatt-gcttatctgaaagttattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 17975745  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcaccta-aaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17975744 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaatagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaaatttctttttggtgggttaggtt 17975645  T
Q  742 gattttaagatttttg--aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgag---ataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaa 835  Q
    |||||||| | |||||  ||||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17975644 gattttaacaattttgaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaaaataaggtgaggttgttcaaattttaattacaa 17975545  T
Q  836 g-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggttta-ttaagaaaa 933  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  17975544 gcaaatcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacgaaccaagttttacttaagaaaa 17975445  T
Q  934 tatttttggag-tttgcatatttgatttgt--tggaaaatgatt 974  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17975444 tatttttgaagttttgcatatttgattttttctggaaaatgatt 17975401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 22103424 - 22103884
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22103424 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 22103523  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22103524 cccttatcgagaccttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacatagatta 22103623  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22103624 tcttgtgctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttagttttatttg 22103723  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22103724 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaagttg 22103823  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22103824 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 22103884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 341 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 36249115 - 36248655
Alignment:
Q  341 atgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36249115 atgtgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 36249016  T
Q  441 aaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 540  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36249015 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaat 36248916  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36248915 ttatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgttttttgttatttttatt 36248817  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36248816 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttgaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggttaagt 36248717  T
Q  741 tgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36248716 tgattttaagatttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 36248655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 23922855 - 23923476
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23922855 tgtgctcatgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagagaaaaaatgagtaaaaa 23922954  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    | ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23922955 ctctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtactagcatcctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttgcctaattta 23923051  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaa-tctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23923052 tcttgtgctaaattaatttgcttatttgaaaattattgcctaaaaggtctaagtgaaagaatggagggaggagaaatatgtttttggttatttttatttg 23923151  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| |||    
T  23923152 atttggaaggataaaaattctttgcctacataccgttaaaagaaagggatcaaaaccaatgtagttcatctaaaaaatatctttttggtgggctagattg 23923251  T
Q  743 attttaa-gatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaa 838  Q
    |||||||  | ||| |||||  |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23923252 attttaacaagtttggaaaaaaggttttaagaagagattagagacctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaaagaa 23923351  T
Q  839 at-caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    || |||||||| |||  || |||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23923352 atccaagtctaatattgatgttaaattgattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 23923451  T
Q  937 ttttg-gagtttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||    
T  23923452 ttttgaggttttgcatatttgattt 23923476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 352 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 19851177 - 19850723
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19851177 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaacactcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 19851078  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||| ||| || ||  |||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  19851077 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccttaaacgacttcggtactccaaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 19850978  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19850977 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 19850878  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19850877 aggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgcttttaa 19850778  T
Q  750 gat-ttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19850777 gatttttttgaaattggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 19850723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 352 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 19857213 - 19856759
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857213 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaacactcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 19857114  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||| ||| || ||  |||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  19857113 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccttaaacgacttcggtactccaaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 19857014  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857013 ctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 19856914  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19856913 aggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgcttttaa 19856814  T
Q  750 gat-ttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19856813 gatttttttgaaattggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 19856759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 348 - 803
Target Start/End: Original strand, 36252300 - 36252750
Alignment:
Q  348 ctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaaccct 447  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36252300 ctcgtgattttcggatattaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgagaagggaaaaaatgagtaaaaaccct 36252399  T
Q  448 tatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatctt 547  Q
    |    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  36252400 tc---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtatcccgtaggaacctcttacctagattatctt 36252496  T
Q  548 gtgctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatt 645  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36252497 gtgctaaattcatttgcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagtagtatgcttttggttatttttatttgatt 36252596  T
Q  646 tggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatt 745  Q
    |||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36252597 tggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttc--tttggtgggttaggttgatt 36252693  T
Q  746 ttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36252694 ttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcct-aaggcatgagataaa 36252750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 36576543 - 36576999
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36576543 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 36576642  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36576643 cccttatcgagactttggattcgggggttgattacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaattta 36576742  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaa-attattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36576743 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaagattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 36576840  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||||    
T  36576841 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccaacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggttg 36576936  T
Q  743 attttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36576937 attttaagatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcataagataaaa 36576999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 343 - 658
Target Start/End: Original strand, 4842806 - 4843121
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4842806 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 4842905  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4842906 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccttaggaacctcttacctaattt 4843005  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4843006 atcttgtgct-aatttcattgcttatttgaaaattatcacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 4843104  T
Q  642 gatttggaaggataaaa 658  Q
    |||||||||||||||||    
T  4843105 gatttggaaggataaaa 4843121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 25719418 - 25718966
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25719418 tgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 25719319  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  25719318 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccttaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 25719222  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25719221 tcttgtgctaaattcatttgcttactcgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 25719123  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||| | |||||||   | |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  25719122 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaaggaatcaaaaccgacgtagttccaatcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 25719027  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25719026 attttaagatttttgaaaatgggttttaattagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 25718966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 344 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 4583972 - 4583602
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgtta---atctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaa 440  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4583972 tgtgctcgtgatttccggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcatcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaa 4583873  T
Q  441 aaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  4583872 aaacccttatcgagactttggattcggg-gttggttacacgaagagaaggtgctagcaccctaagtgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaa 4583774  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583773 ttatcctgtgctaaattgatttgcttacatgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagtatgtttttggttatttttatt 4583674  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 713  Q
    ||||||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583673 tgatttggaaggat-tgactcccctgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacct 4583602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 15832315 - 15832007
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15832315 tgtgctcgcgattttcggttatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15832216  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15832215 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 15832116  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15832115 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttttttttatttga 15832017  T
Q  644 tttggaagga 653  Q
    ||||||||||    
T  15832016 tttggaagga 15832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Original strand, 6582682 - 6583131
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6582682 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 6582781  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||  | ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6582782 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactttggtactccgaatgaaccgcttacctagattatcttgtg 6582881  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttg--aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6582882 ctaaattcatttgcttacttgaaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 6582981  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    ||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||| | | |||||||  ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||    
T  6582982 aagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaatcgacgtagttccactaaaaaatttctt----gtgggttaggttgatttta 6583075  T
Q  749 aga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6583076 agattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 6583131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 23093102 - 23092654
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23093102 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatttttgaactctcaatttttattcgtgggaaaggaaaaaatgagtaaaa-cccttatcg 23093004  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  23093003 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttaggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 23092904  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23092903 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 23092804  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  |  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23092803 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaag 23092708  T
Q  751 atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23092707 atttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 23092654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 352 - 965
Target Start/End: Original strand, 26912534 - 26913155
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  26912534 tgattttcggatatcaactcattaattgatttgaatattcaatctttgaactctctacttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaaacccttat- 26912632  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26912633 gagattttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctatcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttgcctaa-ttatcttgtgc 26912731  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 651  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26912732 taaattattttgcttatttgaaaattattgcctaagagtctaggtgaaagaatgg-gggagaagaagtatgttttt-gttgtttttatttgatttggaag 26912829  T
Q  652 gataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaa-ccaatgtagttc-acctaaaaag--tttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   || |||||   |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  26912830 gat--aaatcctttgcctacatactcttaaagaaaagggatcaaaacccaacgtagttcgttctcaaaagaaatgatttttggtgggttagattgatttt 26912927  T
Q  748 aagatttttg-------aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 839  Q
    || |||||||       ||||  |||||| |||||||| |||||||||| || |||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26912928 aacatttttgaaaagaaaaaaaaggttttaagaagagataagaggcctcaagacat--gaaagaataagatgaggttggtcaaattttaattatacgaaa 26913025  T
Q  840 -tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaat-aaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat- 936  Q
     |||| |||| |||| ||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||     
T  26913026 ctcaactctaatatggatattaaattgattaaacatttgattaagaaaataaaaagaaaaaacacttggattaaaatcaaaggtttattaagaaaatatg 26913125  T
Q  937 ttttggagtttg-catatttgatttgttgg 965  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  26913126 ttttgaagtttgatatatttgattttttgg 26913155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 14204901 - 14204439
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14204901 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttgttcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 14204802  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  14204801 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 14204702  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    || ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14204701 attttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 14204602  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  14204601 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 14204506  T
Q  741 tgattttaaga----tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14204505 tgattttaagatttttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 14204439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 14219542 - 14219080
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14219542 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttgttcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 14219443  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||    
T  14219442 cccttatcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagatt 14219343  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    || ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14219342 attttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 14219243  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||    
T  14219242 gatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggt 14219147  T
Q  741 tgattttaaga----tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14219146 tgattttaagatttttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 14219080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 31000605 - 31001064
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31000605 tgtgctcgcgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 31000704  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||    
T  31000705 cccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaatt 31000804  T
Q  543 atcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31000805 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 31000903  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttagg 739  Q
    ||||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||  | |||||||  || || | ||  | ||||||||||||||    
T  31000904 tgatttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaactgacgtagttccactcaagaatt--tatttggtgggttagg 31000999  T
Q  740 ttgattttaagattttt-gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31001000 ttgattttaagatttttcgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 31001064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 31207505 - 31207957
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31207505 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 31207604  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  31207605 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 31207704  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31207705 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggggaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 31207804  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31207805 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgatttta 31207900  T
Q  749 aga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31207901 agatttttttgaaaat-ggttttaagaatagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 31207957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 16190398 - 16190849
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16190398 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatcttcgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 16190497  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16190498 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtgc 16190597  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16190598 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 16190696  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    |||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||| ||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16190697 agg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaaggaatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggttgatttta 16190792  T
Q  749 aga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16190793 agatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 16190849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 344 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 25796937 - 25796693
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25796937 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 25796838  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25796837 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtaatccgtaggaacctcttacctaattt 25796738  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaa 588  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25796737 atcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaa 25796693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 339 - 578
Target Start/End: Original strand, 1388087 - 1388326
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1388087 atatttgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 1388186  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1388187 aaaaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccta 1388286  T
Q  539 atttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatta 578  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1388287 atttaccttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaatta 1388326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 352 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 17129677 - 17129206
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17129677 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgagggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 17129578  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||   | |||||||| || ||||||||| |  ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17129577 gagactttggattcggggcttggtttcgaatatggaaggtgttaagcaccctaaacaacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 17129478  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta---------- 638  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  17129477 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttagtatgttttt 17129378  T
Q  639 -----------tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttt 727  Q
               ||||||||||||||| ||   | || ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| |||||||     
T  17129377 ggttatttttatttgatttggaaggacaag--ttctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttcttt- 17129281  T
Q  728 tggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17129280 -ggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 17129206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 353 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 22418509 - 22418206
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22418509 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaaggggaaaaatgagtaaaaacccttatcg 22418410  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  22418409 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 22418310  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22418309 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 22418210  T
Q  650 agga 653  Q
    ||||    
T  22418209 agga 22418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 352 - 653
Target Start/End: Original strand, 22366732 - 22367038
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt-aaaaacccttat 450  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22366732 tgattttcggatgtcaacccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaaacccttat 22366831  T
Q  451 cgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgt 549  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  22366832 cgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgt 22366931  T
Q  550 gctgaattga-tttgcttatttg-aaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgattt 646  Q
    ||| |||| | |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366932 gctaaattcattttgcttactcgaaaaattattacctaaaaaatctaagtaaaagaatggagagagaagaattatgtttttggttatttttatttgattt 22367031  T
Q  647 ggaagga 653  Q
    |||||||    
T  22367032 ggaagga 22367038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 342 - 573
Target Start/End: Original strand, 14335741 - 14335968
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  14335741 tgtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttt-attcgtggga-gggaaaaaatgagtaa 14335838  T
Q  441 aaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 540  Q
    |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||     
T  14335839 aaaccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaac 14335935  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaa 573  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14335936 ttatcttgtgctaaattgctttgcttatttgaa 14335968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 341 - 570
Target Start/End: Original strand, 23600856 - 23601082
Alignment:
Q  341 atgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgattt-gaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagta 439  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  23600856 atgtgtgctcgtgattttcggatgtcaaaccattaattgattttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttttttgtggga-gggaaaaaatgagta 23600954  T
Q  440 aaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 539  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  23600955 aaaaccctta---agactttggtttcgtgggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaaccttttacttaa 23601051  T
Q  540 tttatcttgtgctgaattgatttgcttattt 570  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23601052 tttatcttgtgctaaattgctttgcttattt 23601082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 17809523 - 17809453
Alignment:
Q  463 ttcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctt 533  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  17809523 ttcggaagttggttacgcaaagggaatgtattagcaccttaaacgtctatagtactctataggaacctctt 17809453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 623 - 746
Target Start/End: Original strand, 22023032 - 22023149
Alignment:
Q  623 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagttt 722  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||||||| ||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||     
T  22023032 ttttttgttgtttttatt-gatttggaaggatagaattctt-tgcctacatatcc--aaggaaaatggatcaaaatcaatgtagttcacctcaaaaatt- 22023126  T
Q  723 ctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
     | ||||||||||| | |||||||    
T  22023127 -tatttggtgggttggattgattt 22023149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 339 - 955
Target Start/End: Original strand, 27341507 - 27342122
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27341507 atatctgtgctcgtgatttttggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtccatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 27341606  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341607 aaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 27341706  T
Q  539 atttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 638  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341707 gattatcttgtgctaaattcatttgctta-ctgaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttattttta 27341805  T
Q  639 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttag 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27341806 tttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaaatttctttttggtgggtt-g 27341904  T
Q  739 gttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aaga 837  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27341905 gttgcttttaa-attttagaaaatggtttttaagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaaaga 27342003  T
Q  838 aatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27342004 aatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 27342103  T
Q  938 tttggag-tttgcatattt 955  Q
    |||| || |||||||||||    
T  27342104 tttgaagttttgcatattt 27342122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 773553 - 772923
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  773553 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 773454  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  773453 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccataggaacctcttacctaaatta 773354  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773353 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 773255  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  773254 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttatttttggtgggtt-ggttga 773156  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatc 841  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  773155 tttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcacgagataaaataaggtgaggttagtcaaattttaattacaagaaaatc 773058  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttg 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  773057 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacccttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaata-ttttg 772959  T
Q  942 gag-tttgcatatttgatttgtt--ggaaaatgatt 974  Q
     || |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  772958 aagttttgcatatttgatttttttgggaaaatgatt 772923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 10640751 - 10640127
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10640751 gtgtgctcgtgattttcggatatccaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 10640652  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10640651 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 10640552  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640551 atcttgtgctacattca-ttgcttatttgaaaattattacttaaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 10640453  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10640452 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttg 10640354  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    | ||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10640353 acttt-agattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaat 10640256  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaag---gaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10640255 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagaaaaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 10640156  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgatttgttgg 965  Q
    |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  10640155 ttttaagttttgcatatttgattttttgg 10640127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 52298095 - 52297571
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  52298095 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaagtgagtaaaa 52297996  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52297995 acccttatcgtgactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 52297896  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52297895 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 52297796  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52297795 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccttttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaagttg 52297696  T
Q  743 attttaagat--ttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52297695 attttaagatttttttgaaaatggggttttagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaataaat 52297596  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattca 865  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52297595 caagtctattatgaatattaattca 52297571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 947
Target Start/End: Original strand, 8092735 - 8093339
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8092735 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 8092834  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8092835 accctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattt 8092934  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092935 atcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 8093033  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8093034 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctgaaaagtttctttttggtgggtt-ggttg 8093132  T
Q  743 attttaagattttt-gaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaa 839  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  8093133 atttt-agatttttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt-gtcgaattttaattacaaagaaa 8093229  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8093230 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 8093329  T
Q  938 tttggagttt 947  Q
    ||||||||||    
T  8093330 tttggagttt 8093339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Original strand, 8101541 - 8102144
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8101541 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 8101640  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8101641 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 8101740  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8101741 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 8101839  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8101840 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctgaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 8101938  T
Q  744 ttttaagattttt-gaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaat 840  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  8101939 tttt-agatttttagaaaat-ggtttcaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggtt-gtcgaattttaattacaaagaaat 8102035  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaag-aaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8102036 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaaataaaaggaaaagcaacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatattt 8102135  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    |||||||||    
T  8102136 ttggagttt 8102144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 1875344 - 1875966
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1875344 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1875443  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  1875444 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 1875543  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1875544 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 1875642  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1875643 atttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 1875742  T
Q  743 attttaagatttttg-aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    ||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1875743 attttaacaattttgaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 1875842  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1875843 caagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatt 1875942  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  1875943 tttggagttttgcctatttgattt 1875966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 12425216 - 12425835
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  12425216 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 12425315  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12425316 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 12425415  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12425416 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaaaagtatgtttttggttatttttatttg 12425514  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  12425515 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttgatgggttaggttg 12425612  T
Q  743 attttaag-atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12425613 attttaagaatttttgaaaat-ggttttaagaaaagaaagaggcctcaagtcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaa 12425711  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12425712 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttgggttacgaaccacggtttattaagaaaatatt 12425811  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  12425812 tttgaagttttgcatatttgattt 12425835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 12998935 - 12998315
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12998935 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgcactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 12998836  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12998835 ccctcatcaagactttggaatcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctactgtattccgtaggaacctcttacctaattta 12998736  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12998735 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttaaaaattattacctaaaagtctaagtgaaagaatggagggataagaagtatgtttttggttatttttatttga 12998637  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12998636 tttggaaggataaaattcttttgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttga 12998538  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattac-aagaaatc 841  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12998537 ttttaa-attttagaaaat-ggttttaagaagggataagaagcctcaaggcatgagataaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaaagaaatc 12998440  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa----cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12998439 aagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaagcaacttgggttacaaaccaaggtttattaaaaaaatatt 12998340  T
Q  938 tttgga--gtttgcatatttgattt 960  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||    
T  12998339 ttttgaagttttgcatatttgattt 12998315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Original strand, 1889459 - 1890081
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1889459 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 1889558  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  1889559 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 1889658  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1889659 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttg 1889757  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1889758 atttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 1889857  T
Q  743 attttaagatttttg-aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    ||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1889858 attttaacaattttgaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtc-aattttaattacaagaaaa 1889956  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa---acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1889957 tcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatat 1890056  T
Q  937 ttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  1890057 ttttggagttttgcctatttgattt 1890081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 989
Target Start/End: Original strand, 21530105 - 21530762
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21530105 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 21530204  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacc-taattt 542  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  21530205 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccctaaatt 21530304  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattat-tacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21530305 atcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttattt 21530403  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21530404 gatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 21530503  T
Q  742 gattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aa 838  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21530504 gattttaagattttttgaaaat-ggttttaagaaaggataagaggcctcgaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaa 21530602  T
Q  839 atcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa-----acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaa 933  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21530603 atcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaa 21530702  T
Q  934 tatttttggagttt--gcatatttgatttgtt--ggaaaatgattatttttagactaacg 989  Q
    |||||||| | |||   |||||||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||||||    
T  21530703 tatttttgaacttttgacatatttgatttttttgggaaaatgattttttctaaactaacg 21530762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 344 - 797
Target Start/End: Original strand, 55584160 - 55584607
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55584160 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaaatatcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 55584259  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  55584260 ccctta---agactctggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 55584356  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgctta-tttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55584357 tcttgtgctaaattcatttgcttacttggaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaggaagtatgtttttggttatttttatttg 55584456  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||| |||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  55584457 atttcgaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggttggttaggttg 55584552  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatga 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  55584553 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaaaaggcctcaaggcatga 55584607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Original strand, 4747401 - 4747858
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  4747401 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagagaaaaaatgagtaaaaa 4747500  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4747501 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtactagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttgcctaaatta 4747600  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa--ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| | || | ||| |||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4747601 tcttgtgctaagtt-acttgtttatttgaaaaaattattgcctaatg-tctaagtgaaagaatggagggaggagaagtatgtttttggttatttttattt 4747698  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  4747699 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 4747795  T
Q  742 gattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4747796 ggttttaagattttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 4747858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 18010442 - 18009988
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18010442 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 18010343  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18010342 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 18010246  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18010245 tcttgtgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatataaatgaaagaatgaagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 18010146  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  18010145 atttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 18010050  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18010049 attttaagatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 18009988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 344 - 707
Target Start/End: Original strand, 20865659 - 20866021
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20865659 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 20865758  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20865759 cccttatcgaaactttggattcgggggttggttatgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 20865858  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20865859 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaaaagtatgtttttggttatttttatttga 20865957  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagt 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20865958 tttggaaggataaaaatcctatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaatcaatgtagt 20866021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 344 - 676
Target Start/End: Original strand, 4522214 - 4522545
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4522214 tgtgctcgtgattttcggatatcaagccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 4522313  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4522314 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 4522413  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    |||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522414 tcttgtgctacattca-ttggttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 4522512  T
Q  644 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacc 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522513 tttggaaggataaaaatcctatgcctacatacc 4522545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 340 - 654
Target Start/End: Original strand, 26033957 - 26034271
Alignment:
Q  340 tatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagta 439  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26033957 tatgtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaaggaaaaaatgagta 26034056  T
Q  440 aaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 539  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26034057 aaaacccttgtcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgttagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaa 26034156  T
Q  540 tttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttat 639  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26034157 attatcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaagaagaatgtttttggttatttttat 26034256  T
Q  640 ttgatttggaaggat 654  Q
    |||||||||||||||    
T  26034257 ttgatttggaaggat 26034271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 26210390 - 26210839
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26210390 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccct-tcg 26210488  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26210489 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagattatcttgtgct 26210588  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg 652  Q
     |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26210589 aaattcatt-gtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg 26210687  T
Q  653 ataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
      | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  26210688 --acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttggttttaag 26210783  T
Q  751 a---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |   ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26210784 attttttttgaaaat-ggttttaataatagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 26210839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 26219150 - 26219599
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26219150 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccct-tcg 26219248  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26219249 agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagattatcttgtgct 26219348  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg 652  Q
     |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219349 aaattcatt-gtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagg 26219447  T
Q  653 ataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
      | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  26219448 --acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttggttttaag 26219543  T
Q  751 a---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |   ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26219544 attttttttgaaaat-ggttttaataatagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 26219599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 19644871 - 19645320
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19644871 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 19644970  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  19644971 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 19645070  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19645071 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 19645169  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  |  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19645170 agg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 19645265  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19645266 gatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 19645320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Original strand, 21398827 - 21399278
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21398827 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 21398926  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||   |||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  21398927 gagactttggattcgggggttgatttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgactttggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 21399026  T
Q  551 ctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    ||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21399027 ctagattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaaatatgtttttggttatttttatttgatttgga 21399126  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21399127 agg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaa 21399222  T
Q  750 ga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21399223 gatttttttgaaaat-ggttttaagaagggaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 21399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10787024 - 10786565
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10787024 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 10786925  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||    
T  10786924 cccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgagtagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaatt 10786825  T
Q  543 atcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10786824 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 10786726  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||| |||||||||||    
T  10786725 tgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttagtgggttaggt 10786630  T
Q  741 tgattttaaga-tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10786629 tgattttaagatttttttgaaataggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 10786565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 34843054 - 34842605
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34843054 gattttcggatattaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctaaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 34842955  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  34842954 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacatagattatcttgtgc 34842855  T
Q  552 tgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 649  Q
    | |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842854 taaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggaagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgga 34842755  T
Q  650 aggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaa 749  Q
    |||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34842754 agg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaaattc--tttggtgggttaggttgattttaa 34842659  T
Q  750 gatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  34842658 gatttttgaaaat-ggttttaagaagaaaaagagacctcaaggcatgagataaaa 34842605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 19760183 - 19759730
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19760183 gattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 19760084  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19760083 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtg 19759984  T
Q  551 ctgaatt-gatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19759983 ctaaattcaattggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 19759885  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19759884 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaagttgatttt 19759789  T
Q  748 aaga---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19759788 aagattttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcttgagataaaa 19759730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 19774939 - 19774486
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774939 gattttcggatatcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 19774840  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19774839 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaattatcttgtg 19774740  T
Q  551 ctgaatt-gatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774739 ctaaattcaattggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 19774641  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19774640 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaagttgatttt 19774545  T
Q  748 aaga---tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19774544 aagattttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcttgagataaaa 19774486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 342 - 650
Target Start/End: Original strand, 25652447 - 25652753
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaa 441  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25652447 tgtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgattttaatcgttaatctttgaactttcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaa 25652546  T
Q  442 aacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatt 541  Q
    |||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |    
T  25652547 aaccc---tcaagactttggattcgggagctggttacgcgaagggaaagtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtagaaacctcttacctagat 25652643  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| |||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25652644 tatcttgtgctaaattcatttgggtacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagagaaaagaaatatgtttttgattatttttatt 25652743  T
Q  641 tgatttggaa 650  Q
    ||||||||||    
T  25652744 tgatttggaa 25652753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 25247163 - 25247613
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa-cccttatc 451  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  25247163 gattttcggatattaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaa-tgagtaaaaaacccttatt 25247261  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  25247262 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 25247361  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25247362 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 25247461  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttt 747  Q
    ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  25247462 aagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaaattc--tttggtgggttaggttgatttt 25247557  T
Q  748 aagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25247558 aagatttttgaaaat-ggttttaagaagaaaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 25247613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Original strand, 14718505 - 14718963
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14718505 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaacacttatcg 14718604  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  14718605 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 14718704  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14718705 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 14718804  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc----ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||    ||   | ||||||||||||||| | |||||||  |||||||  || | ||||||||||||||||| |||    
T  14718805 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaaatt-tctttggtgggttaggttggttt 14718901  T
Q  747 taagattttt----gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||     ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14718902 taagattttttttgaaaaaaaggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 14718963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 344 - 644
Target Start/End: Original strand, 21810865 - 21811167
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21810865 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 21810964  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||    
T  21810965 cccttttcgagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaaatt 21811064  T
Q  543 atcttgtgctgaattgattt-gcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21811065 atcttgtgctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 21811163  T
Q  641 tgat 644  Q
    ||||    
T  21811164 tgat 21811167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 353 - 625
Target Start/End: Original strand, 14736790 - 14737064
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736790 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggcagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 14736889  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  14736890 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 14736989  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgttt 625  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736990 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctatgtaaaagaatggagggagaagaagtatgttt 14737064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 738 - 960
Target Start/End: Original strand, 20866022 - 20866240
Alignment:
Q  738 ggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag 836  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20866022 ggttgatttta-gattttagaaaatgg-ttttaagaaggaataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttagtcaaattttaattacaag 20866119  T
Q  837 aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 936  Q
    |||     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20866120 aaaa----tcaattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacccttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatat 20866215  T
Q  937 ttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  20866216 ttttgaagttttgcatatttgattt 20866240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 694 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 24924638 - 24924531
Alignment:
Q  694 aaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggc 793  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  24924638 aaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggttttaagaagaaaaagaggcctcaaggc 24924541  T
Q  794 atgagataaa 803  Q
    ||||||||||    
T  24924540 atgagataaa 24924531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 685 - 804
Target Start/End: Original strand, 14737083 - 14737205
Alignment:
Q  685 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttg----aaaatgggtttttagaagagaaa 780  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||  |||||| ||||||||||    
T  14737083 aaagggatcaaaaccgacgtagttccactaaaaaaatt-tctttggtgggttaggttggttttaagattttttttgaaaaaaaggttttaagaagagaaa 14737181  T
Q  781 gaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  14737182 gaggcctcaaggcatgagataaaa 14737205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 4759 - 4140
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  4759 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcatgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 4660  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4659 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaaatta 4560  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4559 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaaaaagtatgtttttggttatttttatttg 4461  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  4460 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttgatgggttaggttg 4363  T
Q  743 attttaag-atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaa 839  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4362 attttaagaatttttgaaaat-ggttttaagaaaagaaagaggcctcaagtcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaaa 4264  T
Q  840 tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4263 tcaagtctaatatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaagcaacttgggttacgaaccacggtttattaagaaaatatt 4164  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  4163 tttgaagttttgcatatttgattt 4140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 188931 - 188326
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  188931 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccgttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 188832  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  188831 cccttgttgagactttggattcgggggttggttacgcaaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccatatgatcctcttacctaaatta 188732  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattaccta-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188731 tcttgtgctaaattcatttgctaacttgaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 188632  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  188631 ttttggaaagataaaaatcccttgcctacatacccttaaagaaaatggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-cgttg 188533  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaat 840  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  188532 attttaa-attttagaaaat-agttttaagaagggataagatgcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaaat 188435  T
Q  841 caagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaa--cacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 938  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188434 caagtctagtatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaagaaaaagcaacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatattt 188335  T
Q  939 ttggagttt 947  Q
    ||| |||||    
T  188334 ttgaagttt 188326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 344 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 195118 - 194662
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  195118 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 195019  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  195018 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagagaaggtgctagcaccctaagcatctatggtattccataggaacctcttacctagatta 194922  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  194921 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 194822  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    ||||||||||  |  | |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  194821 atttggaagg--acgagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggtt 194726  T
Q  742 gattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  194725 gattttaaaatttttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 194662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 159462 - 159154
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaatt-gatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  159462 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgatttgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaa 159363  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  159362 acccttatcgagactt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 159264  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  159263 atcttgtgctaaact-acttgtttatttgaaaaattattgcct-aatgtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgcttttggttatttttattt 159166  T
Q  642 gatttggaagga 653  Q
    ||||||||||||    
T  159165 gatttggaagga 159154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 345 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 109754 - 109202
Alignment:
Q  345 gtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaac 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  109754 gtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaac 109655  T
Q  445 ccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttat 544  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  109654 cctt-tcgagactttggattcgtgggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattccgtaggaacctcttacctaatttat 109556  T
Q  545 cttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgat 644  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  109555 cttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctgagtgaaagaatggagggagaagaagcattttttttgttatttttatttggt 109457  T
Q  645 ttggaaggataaaaa-tcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttga 743  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  109456 tttgaaggataaaaaatcatatgcctacataccctttaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttga 109359  T
Q  744 ttttaagatttttgaaaatg-ggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 841  Q
    |||||| | |||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109358 ttttaacaattttgaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc 109259  T
Q  842 aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109258 aagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa 109202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 699 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 123197 - 122936
Alignment:
Q  699 caatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatg-ggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatg 796  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  123197 caatgtagttcacctaaagaatttcttt--ggtgggttaggttgattttaacaattttgaaaaaaaggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatg 123100  T
Q  797 agataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaa 896  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  123099 agagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaagg-a 123001  T
Q  897 aaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  123000 aaacacttggtttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttttgcaaatttgattt 122936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 30286 - 29778
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30286 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaac--tcgatttttattcgtgggaagagaaaaaatgagtaaaaa 30189  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  30188 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagttgctagcaccctaagtgtctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 30089  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacct--aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30088 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattattacctaaaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagtatgtttttggttatttttattt 29990  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggtt 741  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29989 gatttggaaggataaaaatcctctgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgaggttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggtt 29892  T
Q  742 gattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 840  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29891 gatttt-atattttagaaaat-ggttttaagaagggataagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat 29794  T
Q  841 caagtctattatgaat 856  Q
    ||||||||||||||||    
T  29793 caagtctattatgaat 29778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 344 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11584 - 11481
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11584 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctctgaacactcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 11485  T
Q  444 ccct 447  Q
    ||||    
T  11484 ccct 11481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 344 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 10782 - 10167
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  10782 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtggaaagggagaaaatgaataaaaa 10683  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   || ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10682 ccctta---agcctttatattcgggggttcgttacgcgaagggaaggtgctagcaccttaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 10586  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10585 tcttgtgctaaattcatttgcatacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 10486  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||  | |||    
T  10485 atttggaaggattaac-tcctttgcctacatacccttaaggaaa-gggatcaaaaccaatgtagcttacctaaaaagtttctttgt--tgggtaggattg 10390  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgg--gtttttagaagagaa-agaggcctccaggcatgagataaaa-taaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaa 838  Q
    ||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10389 attttaacaattttgaaaaaaaaagttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaa 10290  T
Q  839 a-tcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatt 937  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  10289 aatcaagtctaatatgaacattaattcaattaagcatttaattaagaaaataaaagg-aaaacacttgggttaaagtccaaggtttattaagaaaatatt 10191  T
Q  938 tttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  10190 tttgaagttttgcatatttgattt 10167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Original strand, 9802 - 10255
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9802 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 9901  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  9902 ccctta---agactttggattcgggcgttggttacgcgaagggaatgtgttagcaccctaagcgtctatggtattccatagaaacctcttacctagatta 9998  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9999 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggctatttttatttg 10098  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttg 742  Q
    ||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  10099 atttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaagaaaaaggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaatttc--tttggtgggttaggttg 10195  T
Q  743 attttaagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10196 attttaagatttttgaaaat-ggttttaagaaaagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 10255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 343 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10139
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10546 gtgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaa 10447  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctta-cctaatt 541  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  10446 accctcatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttaccctaaat 10347  T
Q  542 tatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaatt-attacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10346 tatcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattaactacctaaaaatctaagtgaaagaatgggggaagaagaagcatgtttttggttatttttatt 10248  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247 tgatttggaaggatacaaatcccatgcctacatacccttgaagagaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 10148  T
Q  741 tgattttaa 749  Q
    |||||||||    
T  10147 tgattttaa 10139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1804 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold1804
Description:

Target: scaffold1804; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 342 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 361 - 1
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  361 tgtgtgctcgtgattttcggatattaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactcttgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaa 262  T
Q  441 aaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaat 540  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  261 aaaccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacggtattctgtaggaacctcttacctaat 162  T
Q  541 ttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 640  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161 ttatcttgtgctaaattcatt-gcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaatgaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatt 63  T
Q  641 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62 tgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 63581 - 63135
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  63581 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaatatgagtaaaaacccttatc 63482  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  63481 ga--ctttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagattatcttgtgc 63384  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63383 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 63284  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    ||  |  | |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  63283 gg--acgagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaag 63188  T
Q  751 atttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  63187 atttttgaaaat-ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 63135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 486 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 20028 - 19545
Alignment:
Q  486 gaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacct 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20028 gaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacct 19929  T
Q  585 aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  19928 aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggattgactccct-tgcctacatacccttaaaga 19830  T
Q  685 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttg--aaaatgggtttttagaagaga-aag 781  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||  |||||| ||||||||  ||    
T  19829 aaagggatcaacaccaatgtagttcacctaaaaaaattctttttggtgagttgggttgattttaacaattttgtaaaaaaaggttttaagaagagattag 19730  T
Q  782 aggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgat 879  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19729 aggcctcaaggcataagagaaaaataagatgaggttgttcaaattttaattacaagcaaatcaagtctaatatgaatgttaattcaatttagcatttgat 19630  T
Q  880 taagaaaataaaag---gaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19629 taagaaaataaaagaaaaaaaaacacttgggttacagaccaaggtttattaagaaaatatttttgaagttttgcatatttgattt 19545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 585 - 965
Target Start/End: Original strand, 38672 - 39054
Alignment:
Q  585 aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 684  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38672 aaaagtctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga 38771  T
Q  685 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagag 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  38772 aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggtt-ggttgacttt-agattttagaaaat-agttttaagaagggataagag 38868  T
Q  784 gcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaag-aaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaa 882  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38869 gcctcaaggcatgagataaaataaggttaggttggtcaaattttaattacaagaaaatcaagtctattatgaatcttaattcaattaagcatttgattaa 38968  T
Q  883 gaaaataaaag--gaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgatttgttgg 965  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  38969 gaaaataaaagaaaaaaaacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatattttttaagttttgcatatttgattttttgg 39054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 343 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4629 - 4297
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4629 gtgtgctcgtgatattcggatatcaaaccattaattgatttgagtcgtcaatctttgaac--tcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaa 4532  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4531 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacacgaagggaaggtgctagcactctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaaatt 4432  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4431 atcttgtgctaaattcatttgcttacttaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggggggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 4332  T
Q  643 atttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc 677  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4331 atttggaaggataaaaatcctttgcctacgtaccc 4297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80648
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  80338 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 80437  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  80438 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaacgtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatta 80537  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 642  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80538 tcttgttctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttg 80637  T
Q  643 atttggaagga 653  Q
    |||||||||||    
T  80638 atttggaagga 80648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Original strand, 63938 - 64246
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaa-tgagtaaaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  63938 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaa 64037  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  64038 accctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaaaggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtatcccataggaacctcttacctagatt 64134  T
Q  543 atcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  64135 atcttgtgctaaattcctttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaactgaaagaatggaggaagaagaagtatatttttggttatttttattt 64234  T
Q  642 gatttggaagga 653  Q
    ||||||| ||||    
T  64235 gatttggtagga 64246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 349 - 799
Target Start/End: Original strand, 46457 - 46902
Alignment:
Q  349 tcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaaccctt 448  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46457 tcgtgattttcggatattaaaccattatttgatttaaatcgtcaatatttgaactatcgatttttattcgtgggaagcgaaaaaatgagtaaaaatcctt 46556  T
Q  449 atcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttg 548  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46557 a---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtataccataggaacctcttacctagattatcttg 46653  T
Q  549 tgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 647  Q
    |||| |||| ||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46654 tgctaaattcatttaattgcttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttg 46753  T
Q  648 gaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattt 746  Q
    |||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||  ||||||||||||||    
T  46754 gaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggcaggttaggttgattt 46849  T
Q  747 taagatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgaga 799  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46850 taagatttttgaaaatgagttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgaga 46902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 405 - 803
Target Start/End: Original strand, 1 - 396
Alignment:
Q  405 tcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 504  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 100  T
Q  505 gcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaat 604  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 gcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagattattttgtgctaaattca-ttgtttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaat 199  T
Q  605 ggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||| | ||    
T  200 ggagggagaagaagtatgtttttggttattttttattgatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtacccttttgggaaagggatcaaaaccgacgt 297  T
Q  705 agttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaaga--tttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataa 802  Q
    |||||  || || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  298 agttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggttgattttaagatttttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataa 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 344 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 4899 - 4491
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  4899 tgtgctcgcgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaat 4800  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  4799 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacctagatta 4700  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatgga-gggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4699 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggaggggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 4600  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    |||||||||||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  4599 gatttggaagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 4504  T
Q  741 tgattttaagatt 753  Q
    |||||||||||||    
T  4503 tgattttaagatt 4491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Original strand, 21451 - 21760
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21451 tgtgctcttgattttcagatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaaggaaaaaaatgagtaaaaa 21550  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  21551 accttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctacaatattccgtaggaacctcttacctaaatta 21650  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttga 643  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21651 tcttgtgctaaattgatttgcttacttgaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggaggaagaagaagcatgtttttggttatttttatttga 21750  T
Q  644 tttggaagga 653  Q
    ||||| ||||    
T  21751 tttgggagga 21760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 353 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 83783 - 83332
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83783 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattttcattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 83684  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  83683 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 83584  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 650  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83583 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaaaaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaa 83484  T
Q  651 ggataaaaatcctatgcctacataccc--ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    ||  | || |||| ||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||| | |||||||  |  |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  83483 gg--acaagtcctctgcctacgtacccttttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaatttc--tttggtgagttaggttgatttta 83388  T
Q  749 agatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  83387 agatttttgaaaatgggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 83332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 222; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 344 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 14775
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15236 tgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcgatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 15137  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  15136 cccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaacctcttacttagatta 15037  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggtt-atttttattt 641  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15036 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtaaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttgttttttattt 14937  T
Q  642 gatttggaaggataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggt 740  Q
    ||||||| |||  | || |||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||  || || | ||||  |||||||||||||||    
T  14936 gatttgggagg--acaagtcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtatttccactcaagaatttc--tttggtgggttaggt 14841  T
Q  741 tgattttaagattttt---gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||||||||||||||    ||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14840 tgattttaagatttttttaaaaaaatagtgttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaa 14775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0545 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0545
Description:

Target: scaffold0545; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 664 - 960
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8313
Alignment:
Q  664 atgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatg 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8011 atgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatg 8110  T
Q  764 ggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaat 862  Q
    | |||| ||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 g-ttttaagaaaggataagaggcctcgaggcatgagagaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaat 8209  T
Q  863 tcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaa-----acacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgga-gtttgcatatttg 956  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8210 tcaattaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaaaaggacacttgggttacaagccaaggtttattaagaaaatatttttgaacttttgcatatttg 8309  T
Q  957 attt 960  Q
    ||||    
T  8310 attt 8313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 344 - 653
Target Start/End: Original strand, 145283 - 145591
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145283 tgtgctcatgattttcggatatcaaaccattaattgatttgagtcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 145382  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  145383 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcggagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccaaaggaacctcttacctagatta 145479  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145480 tcttgtgctaaattcatttgcttacatgaaaaattattacctaaaaaagctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 145579  T
Q  642 gatttggaagga 653  Q
    ||||||||||||    
T  145580 gatttggaagga 145591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 344 - 641
Target Start/End: Original strand, 136321 - 136617
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136321 tgtgctcgtgattttcagatatcaaaccattaattgatttgagtcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 136420  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  136421 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcacgctaagtgtctatggtattccataggaacctcttacctagatta 136517  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttg-aaaattattacct-aaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttattt 641  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  136518 tcttgtgctaaattcatttgcttacttgaaaaattattacctaaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatatttattt 136617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0455 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0455
Description:

Target: scaffold0455; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 352 - 804
Target Start/End: Original strand, 3579 - 4028
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttaaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 3678  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| |||||||   ||||||||||    
T  3679 gagactttggattcggg-gttggtttcaaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctggattatcttgtg 3777  T
Q  551 ctgaattgatttg-cttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 648  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3778 ctaaattcatttggcttacttgaaaaattattacctaaaaatctaaatgaaagaatggagggagaaggagtatgtttttggttatttttatttgatttgg 3877  T
Q  649 aaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgatttta 748  Q
    ||||| ||   |||| ||||||| |||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||  |  |||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3878 aaggacaag--tcctctgcctacgtacctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacacaaaaatttcttt--gatgggttaggttgatttta 3973  T
Q  749 agatttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3974 agatttttgaaaatggg-tttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 4028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 714 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 25616 - 25358
Alignment:
Q  714 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttt-gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaataaggtga 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25616 aaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagattttttgaaaatgggtttttagaagaggaagaggcctcaaggcatgagataaaataaggtga 25517  T
Q  813 ggttggtcaaattttaattacaa-gaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttac 911  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25516 ggttggtcgaattttaattacaaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaattaagcatttgattaagaaaataaaaaggaaaacacttgggttac 25417  T
Q  912 aaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgatttgttggaaaa 969  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  25416 aaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttttgcatatttgatttttttgaaaa 25358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 684 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 12753 - 12474
Alignment:
Q  684 aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aaga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  12753 aaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttttttttggtgggttaggttgattttaat-tttttgaaaatgg-ttttaagaagagataaga 12656  T
Q  783 ggcctccaggcatg--agataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgatt 880  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12655 ggcctcaaggcatgggagaaaaaataagatgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttgatt 12556  T
Q  881 aagaaaataaaaggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggag-tttgcatatttgattt 960  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12555 aagaaaataaaaggaaaaacaacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgaagttttgcatatttgattt 12474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 344 - 579
Target Start/End: Original strand, 29569 - 29803
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29569 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatatgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 29668  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattta 543  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29669 cccttatcaagactttggatttgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtcgacggtattccgtaggaacctcttacctaattta 29768  T
Q  544 tcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaattat 579  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  29769 tcttgtgctaaattca-ttgcttatttgaaaattat 29803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 779 - 947
Target Start/End: Original strand, 33162 - 33321
Alignment:
Q  779 aagaggcctccaggcatgagataaaa-taaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaat-caagtctattatgaatattaattcaataaagcattt 876  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || || || |||||    
T  33162 aagaggcctcaaggcatgagagaaaaataaggtgaggttggt-tagttttaattacaagaaatccaagtctaatatggatattaaatcgattaaacattt 33260  T
Q  877 gattaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    ||| |||||||       ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33261 gataaagaaaa-------aaaaacacttgggttacga---aaggtttattaagaaaatatttttgaagttt 33321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 158; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 344 - 552
Target Start/End: Original strand, 21929 - 22138
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaa- 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  21929 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 22028  T
Q  443 acccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaattt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22029 acccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagatt 22128  T
Q  543 atcttgtgct 552  Q
    || |||||||    
T  22129 attttgtgct 22138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 147; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 472 - 653
Target Start/End: Original strand, 421 - 603
Alignment:
Q  472 tggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttg 571  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  421 tggttacccgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctagattatcttgtgctaaattcatttgcttacttg 520  T
Q  572 -aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 653  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  521 aaaaattattacctaaaaatctaagtgaatgaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaagga 603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 421
Target Start/End: Original strand, 346 - 423
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtgg 421  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  346 tgtgctcgtgattttcgaatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgg 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 142; Significance: 6e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 524 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 32622 - 32325
Alignment:
Q  524 ggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatg 622  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32622 ggaacctcttacttagattatcttatgctaaattcatttgattacttgaaaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaataagtatg 32523  T
Q  623 tttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagttt 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32522 tttttggttatttttatttgatttggaaggat-tgactcccttgcctacatacccttaaag-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctcaaaaattt 32425  T
Q  723 ctttttggtgggttaggttgattttaagatttttg---aaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgaga-taaaataaggtgaggttg 817  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||   ||||  |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32424 ctttttggtgggttggattgattttaacaattttgtaaaaaaaaggttttaagaagagattagaggcctcaaggcatgagagaaaaataaggtgaggttg 32325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 344 - 517
Target Start/End: Original strand, 29775 - 29945
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29775 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctctatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 29874  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtat 517  Q
     |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29875 tcctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtat 29945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 344 - 477
Target Start/End: Original strand, 32642 - 32772
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  32642 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccatttattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgttggaagggaaaaaatgagtaaaaa 32741  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggtta 477  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  32742 ccctta---agactttggattcgggggttggtta 32772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1481 (Bit Score: 140; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1481
Description:

Target: scaffold1481; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 454 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 1751 - 1402
Alignment:
Q  454 gactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgcta-gcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgct 552  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1751 gactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctaagttatcttgtgct 1652  T
Q  553 gaattgatttgcttatttgaaaa-ttattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 651  Q
     |||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651 aaattcatttggttacttgaaaaattaatacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaagaagtatgtttttggttatttttatttgatttggaag 1552  T
Q  652 gataaaaatcctatgcctacataccc-ttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaag 750  Q
    |  |  | |||| ||||||| ||||| ||     ||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1551 g--actagtcctctgcctacgtaccctttttttgaaagggatcaaaaccgacgtagttccactcaaaaatttc--tttggtgggttaggttgattttaag 1456  T
Q  751 attttt-gaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  1455 atttttcgaaaatgggttttaagaagaggaagaggcctcaaggcataagataaa 1402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 339 - 504
Target Start/End: Original strand, 16390 - 16555
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16390 atatatgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagt 16489  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16490 aaaaacccttatcgagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaa 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 344 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9966 - 9796
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9966 tgtgctcctgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 9867  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtat 517  Q
    ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9866 ccctta---agactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtat 9796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 135; Significance: 9e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 665 - 947
Target Start/End: Original strand, 19404 - 19683
Alignment:
Q  665 tgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgg 764  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |    
T  19404 tgcctacatacccttaaagaaaagggatcaaaaccaatgtagttcccctaaagaatttc--tttggtgggttggattgattttaa-atttttg-aaattg 19499  T
Q  765 gtttttagaagaga-aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaa-tcaagtctattatgaatattaat 862  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||     
T  19500 gttttaagaagagataagaggcctcaaggcatgaga-aaaataagttaaggttggtcaaattttaattacaagaaattcaagtctaatatggatattaaa 19598  T
Q  863 tcaataaagcatttgattaagaaaataaaagg-aaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    |  || || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19599 ttgattaaacatttgattaaggaaataaaaggaaaaaacacttgggtta-aatccaaggtttactaagaaaatatttttgaagttt 19683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 370 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 63488 - 63287
Alignment:
Q  370 ccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa-cccttatcgagactttggattcggg 468  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  63488 ccattaatcgatttggatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaaaccctta---agactttggattcggg 63392  T
Q  469 agttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgctgaattgatttgcttat 568  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  63391 ggttggttacgcgaagggaaggtattagcaccctaagcgtctacggtactccgtaggaacctcttacctaatttatcttgtgctaaattgctttgcttat 63292  T
Q  569 ttgaa 573  Q
    |||||    
T  63291 ttgaa 63287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 697 - 960
Target Start/End: Original strand, 26354 - 26618
Alignment:
Q  697 accaatgtagttcacctaaaaagtttctttttggtgggttaggttgattttaagatttttgaaaatgggtttttagaagaga-aagaggcctccaggcat 795  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  26354 accaatgtagttcccctaaagaatttcttt--ggtgggttggattgattttaa-atttttgaaaatgg-ttttaagaagagataagaggcctcaaggcat 26449  T
Q  796 gagataaaataa--ggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatc-aagtctattatgaatattaattcaataaagcatttgattaagaaaataaaa 892  Q
    |||| |||| ||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||    || || |||||||||||| ||||||||    
T  26450 gagaaaaaaaaaaagatgagattggtcaaattttaattgcaagaaatccaagtctaatatggatattaaaatgattaaacatttgattaaggaaataaaa 26549  T
Q  893 ggaaaaac-acttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagtttg-catatttgattt 960  Q
    | |||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  26550 gaaaaaagtacttgggtta-aatccaaggtttactaagaaaatatttttgaagtttgatatatttgattt 26618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1199 (Bit Score: 134; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1199
Description:

Target: scaffold1199; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 339 - 552
Target Start/End: Original strand, 2205 - 2417
Alignment:
Q  339 atatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagt 438  Q
    |||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2205 atatctgtgctcacgattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagt 2304  T
Q  439 aaaaacccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 538  Q
    |||||||||||   | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2305 aaaaacccttaaaaaaaatt-ggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgtctatggtattccataggaacctcttaccta 2403  T
Q  539 atttatcttgtgct 552  Q
      ||||||||||||    
T  2404 gattatcttgtgct 2417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1120 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1120
Description:

Target: scaffold1120; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 779 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 1419 - 1252
Alignment:
Q  779 aagaggcctccaggcatgagataaaataaggtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatattaattcaataaagcatttga 878  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1419 aagaggcctcaagacatgagagaaaataaagtgaggttggtcaaattttaattacaagaaatcaagtctattatgaatgttaattcaattaagcatttga 1320  T
Q  879 ttaagaaaataaaaggaaaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttggagttt 947  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1319 ttaagaaaataaaagg-aaaacacttgggttacaaaccaaggtttattaagaaaatatttttgaagttt 1252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 344 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 172731 - 172567
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  172731 tgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 172632  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgt 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  172631 cccttatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaaggtgctagcatcctaagcgt 172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 353 - 615
Target Start/End: Original strand, 22717 - 22980
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22717 gattttcggatatcaaaccatcgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatctttattcttgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttttcg 22816  T
Q  453 agactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtgc 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  22817 agactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtgc 22916  T
Q  552 tgaattgatttgcttatttg-aaaattattacctaaaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 615  Q
    | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22917 taaattcatttgcttacttgaaaaattattacct-aaaatctaagtgaaagaatggagggagaag 22980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 353 - 527
Target Start/End: Original strand, 15382 - 15557
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaa-aatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15382 gattttcggatgtcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaaatgagtaaaaacccttatc 15481  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaa 527  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  15482 gagactttggattcgggggttggttatgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcatctacggtattccgtaggaa 15557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 127; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 344 - 490
Target Start/End: Original strand, 13635 - 13781
Alignment:
Q  344 tgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaa 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13635 tgtgctcgtgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaactctcgatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaa 13734  T
Q  444 cccttatcgagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaagg 490  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13735 ccctcatcgagactttggattcgggggttggttacgcgaagggaagg 13781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 353 - 564
Target Start/End: Original strand, 7744 - 7957
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaaggg-aaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7744 gattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaaaagagtaaaaacccttatc 7843  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgtg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  7844 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgtg 7943  T
Q  551 ctgaattgatttgc 564  Q
    || |||| ||||||    
T  7944 ctaaattcatttgc 7957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 95; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 353 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 1
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccatt-aattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  199 gattttcggatgtcaaaccatttaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 100  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctcttacctaatttatcttgt 549  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| || ||  |||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  99 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaaacgacttcggtactccgaaggaaccgcttacctagattatcttgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 94; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 352 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 55910 - 55757
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55910 tgattttcggatatcaaacaattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 55811  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaa 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||    
T  55810 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaa 55757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 764 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 37884 - 37844
Alignment:
Q  764 ggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaaa 804  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37884 ggttttaagaagagaaagaggcctcaaggcatgagataaaa 37844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0945 (Bit Score: 90; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0945
Description:

Target: scaffold0945; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 353 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 180 - 27
Alignment:
Q  353 gattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatt-tttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  180 gattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaattctttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 81  T
Q  452 gagactttggattcgggagttggttacgcgaagggaaggtgct-agcaccctaa 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||    
T  80 gagactttggattcgggggttggtttcgaatagggaaggtgttaagcaccctaa 27  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 82; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 453
Target Start/End: Original strand, 8432 - 8533
Alignment:
Q  352 tgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattcgtggcaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8432 tgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcaatttttattcgtgggaagggaaaaaatgagtaaaaacccttatc 8531  T
Q  452 ga 453  Q
    ||    
T  8532 ga 8533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 75 - 1
Alignment:
Q  343 gtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattc 417  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  75 gtgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattgattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 76 - 1
Alignment:
Q  342 tgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaaccctcgatttttattc 417  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  76 tgtgtgctcgcgattttcggatatccaaccatttattgatttgaatcgtcaatctttgaactctcgatttttattc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1547 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1547
Description:

Target: scaffold1547; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 624 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 1662 - 1485
Alignment:
Q  624 ttttggttatttttatttgatttggaaggataaaaatcctatgcctacatacccttaaaga-aaagggatcaaaaccaatgtagttcacctaaaaagttt 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| | |||||||  | |||||  ||    
T  1662 ttttggttatttttatttgatttggaaggacaag--tcctctgcctacgtaccctttttgggaaagggatcaaaaccgacgtagttccacaaaaaa--tt 1567  T
Q  723 ctttttggtgggttaggttgattttaagat----ttttgaaaatgggtttttagaagagaaagaggcctccaggcatgagataaa 803  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1566 cttt--ggtgggttaggttgattttaagatttttttttgaaaat-ggttttaagaaggtaaagaggcctcaaggcatgagataaa 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 402
Target Start/End: Original strand, 9942 - 10006
Alignment:
Q  338 gatatgtgtgctcgtgattttcggctatcaaaccattaattgatttgaatcgttaatctttgaac 402  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9942 gatatctgtgctcgcgattttcggatatcaaaccattaattgatttgaatcgtcaatctttgaac 10006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Original strand, 708 - 771
Alignment:
Q  470 gttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctt 533  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  708 gttggttacgtgaagggaaggtgttagcaccctaaacgtctatattattctataggaacctctt 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 164787 - 164724
Alignment:
Q  470 gttggttacgcgaagggaaggtgctagcaccctaagcgtctatggtattccataggaacctctt 533  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  164787 gttggttacgtgaagggaaggtgttagcaccctaaacgtctatattattctataggaacctctt 164724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University