View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5067-Insertion-3 (Length: 872)

Name: NF5067-Insertion-3
Description: NF5067
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5067-Insertion-3
NF5067-Insertion-3
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (22-872)||(1204521-1205378)
chr8 (436-819)||(37970318-37970701)
chr8 (439-840)||(23854209-23854610)
chr8 (425-840)||(43643372-43643788)
chr8 (425-834)||(16222860-16223273)
chr8 (488-819)||(1149431-1149762)
chr8 (426-819)||(27082637-27083030)
chr8 (427-827)||(12876108-12876510)
chr8 (426-827)||(16446665-16447067)
chr8 (425-819)||(36694765-36695159)
chr8 (427-833)||(10554988-10555393)
chr8 (427-811)||(6098320-6098709)
chr8 (417-819)||(30654382-30654784)
chr8 (427-840)||(5299723-5300137)
chr8 (417-789)||(9864137-9864509)
chr8 (424-819)||(34894963-34895353)
chr8 (425-827)||(38643975-38644378)
chr8 (459-819)||(11727055-11727415)
chr8 (429-827)||(7890747-7891137)
chr8 (425-819)||(40862416-40862811)
chr8 (426-819)||(8803615-8803998)
chr8 (429-819)||(465843-466223)
chr8 (427-834)||(33906223-33906617)
chr8 (459-827)||(31933676-31934045)
chr8 (428-828)||(35459500-35459888)
chr8 (427-742)||(13307622-13307936)
chr8 (527-819)||(1953787-1954081)
chr8 (427-827)||(44869495-44869897)
chr8 (500-819)||(39098918-39099237)
chr8 (553-840)||(4132463-4132750)
chr8 (622-782)||(1149756-1149912)
chr8 (658-819)||(12587812-12587973)
chr8 (417-633)||(1150090-1150306)
chr8 (654-827)||(35859160-35859334)
chr8 (655-827)||(34951847-34952020)
chr8 (578-819)||(18259233-18259470)
chr8 (609-818)||(24823194-24823395)
chr8 (527-712)||(41910895-41911079)
chr8 (459-698)||(43025733-43025972)
chr8 (689-819)||(33198063-33198193)
chr8 (427-620)||(41362517-41362707)
chr8 (457-621)||(34952028-34952192)
chr8 (729-840)||(41362723-41362835)
chr8 (658-749)||(34463704-34463792)
chr8 (728-819)||(43025974-43026065)
chr8 (427-551)||(4133077-4133199)
chr8 (629-705)||(7998479-7998555)
chr8 (535-621)||(7998401-7998488)
chr8 (427-492)||(15009241-15009306)
chr8 (609-665)||(12585297-12585353)
chr8 (527-582)||(33197948-33198003)
chr8 (425-491)||(24823399-24823465)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (425-834)||(18797302-18797710)
chr7 (425-819)||(32820847-32821241)
chr7 (423-811)||(30055497-30055886)
chr7 (427-812)||(37109847-37110234)
chr7 (426-840)||(31578836-31579256)
chr7 (425-827)||(9355611-9356014)
chr7 (425-812)||(17842385-17842774)
chr7 (422-827)||(24211711-24212118)
chr7 (429-834)||(23111167-23111575)
chr7 (427-819)||(7334769-7335160)
chr7 (459-807)||(27283751-27284100)
chr7 (426-827)||(21991610-21992003)
chr7 (467-840)||(10481619-10481994)
chr7 (426-827)||(32432431-32432828)
chr7 (427-827)||(15612544-15612944)
chr7 (427-827)||(37346997-37347397)
chr7 (427-819)||(4582894-4583286)
chr7 (429-819)||(25691338-25691729)
chr7 (427-827)||(5657265-5657667)
chr7 (427-827)||(8861260-8861661)
chr7 (459-807)||(11071213-11071558)
chr7 (425-819)||(41764872-41765266)
chr7 (457-834)||(29173545-29173905)
chr7 (427-819)||(10359008-10359400)
chr7 (427-827)||(6546494-6546895)
chr7 (441-819)||(22687228-22687598)
chr7 (427-827)||(31520526-31520909)
chr7 (459-723)||(38258552-38258816)
chr7 (443-819)||(48928091-48928466)
chr7 (513-819)||(37703292-37703590)
chr7 (426-742)||(43686015-43686330)
chr7 (457-783)||(12165757-12166074)
chr7 (466-813)||(43925120-43925456)
chr7 (545-827)||(15672544-15672830)
chr7 (516-827)||(46480914-46481218)
chr7 (464-856)||(35353120-35353517)
chr7 (422-812)||(12390450-12390821)
chr7 (457-827)||(26980328-26980682)
chr7 (428-758)||(33688117-33688446)
chr7 (571-827)||(26587877-26588126)
chr7 (428-704)||(48928473-48928748)
chr7 (527-819)||(44598741-44599033)
chr7 (429-680)||(27421313-27421563)
chr7 (644-808)||(44411345-44411509)
chr7 (629-819)||(32593001-32593190)
chr7 (536-682)||(37704241-37704387)
chr7 (459-742)||(38053493-38053751)
chr7 (657-806)||(37704387-37704536)
chr7 (467-641)||(44413351-44413525)
chr7 (668-819)||(34361970-34362123)
chr7 (425-577)||(26524363-26524515)
chr7 (740-839)||(38258867-38258967)
chr7 (427-557)||(34362205-34362334)
chr7 (474-613)||(32593189-32593327)
chr7 (695-759)||(27421219-27421283)
chr7 (778-827)||(12166215-12166265)
chr7 (429-493)||(8299192-8299256)
chr7 (461-507)||(44598373-44598419)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (429-839)||(46297534-46297945)
chr3 (426-827)||(40552043-40552445)
chr3 (426-839)||(26941032-26941446)
chr3 (473-811)||(42505876-42506214)
chr3 (425-819)||(48354930-48355324)
chr3 (426-812)||(52040722-52041109)
chr3 (421-819)||(47481507-47481906)
chr3 (427-827)||(37203058-37203460)
chr3 (422-812)||(53228952-53229343)
chr3 (417-789)||(34132916-34133288)
chr3 (427-827)||(37157699-37158100)
chr3 (427-827)||(4015451-4015851)
chr3 (425-819)||(4761441-4761838)
chr3 (425-818)||(22450957-22451350)
chr3 (425-827)||(39282642-39283044)
chr3 (426-819)||(3654992-3655388)
chr3 (466-827)||(21009585-21009948)
chr3 (426-819)||(7327275-7327669)
chr3 (437-819)||(29099356-29099729)
chr3 (442-812)||(11357181-11357535)
chr3 (421-827)||(33378569-33378973)
chr3 (459-812)||(3362276-3362631)
chr3 (425-827)||(21193595-21193999)
chr3 (427-827)||(44891498-44891889)
chr3 (427-819)||(54505799-54506191)
chr3 (466-813)||(24488761-24489108)
chr3 (496-819)||(24707908-24708231)
chr3 (428-819)||(25579731-25580122)
chr3 (550-819)||(22622511-22622780)
chr3 (467-827)||(2007964-2008331)
chr3 (424-819)||(32373460-32373852)
chr3 (429-839)||(43975664-43976068)
chr3 (548-827)||(33698265-33698545)
chr3 (519-783)||(46994490-46994754)
chr3 (426-827)||(11466814-11467202)
chr3 (429-767)||(54828546-54828883)
chr3 (427-751)||(45174494-45174821)
chr3 (459-812)||(22445865-22446217)
chr3 (426-813)||(44186316-44186687)
chr3 (585-839)||(1089842-1090097)
chr3 (530-827)||(29163912-29164194)
chr3 (488-827)||(14586464-14586794)
chr3 (440-819)||(40935995-40936356)
chr3 (424-685)||(35844314-35844575)
chr3 (543-827)||(36012244-36012532)
chr3 (469-789)||(38591727-38592051)
chr3 (497-742)||(43348319-43348563)
chr3 (427-638)||(51212955-51213166)
chr3 (427-819)||(27480151-27480564)
chr3 (640-840)||(51212548-51212743)
chr3 (457-666)||(53176076-53176284)
chr3 (593-840)||(20373034-20373263)
chr3 (421-605)||(20373303-20373487)
chr3 (538-751)||(11835494-11835702)
chr3 (622-839)||(11356930-11357140)
chr3 (646-813)||(50475021-50475195)
chr3 (641-749)||(53811597-53811701)
chr3 (424-493)||(55343403-55343472)
chr3 (427-507)||(33698183-33698259)
chr3 (428-522)||(11835701-11835790)
chr3 (425-475)||(40640634-40640684)
chr3 (766-819)||(35844577-35844630)
chr3 (428-483)||(29163839-29163894)
chr3 (429-475)||(53818509-53818555)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (426-840)||(879345-879760)
chr4 (424-839)||(35020829-35021249)
chr4 (427-811)||(19089280-19089664)
chr4 (426-819)||(37663560-37663951)
chr4 (426-840)||(25184112-25184527)
chr4 (425-814)||(55477715-55478108)
chr4 (427-827)||(19440458-19440860)
chr4 (427-827)||(28002796-28003197)
chr4 (425-827)||(34361301-34361704)
chr4 (430-839)||(6864038-6864448)
chr4 (424-819)||(25700875-25701271)
chr4 (425-827)||(32912389-32912793)
chr4 (429-819)||(36493508-36493897)
chr4 (422-839)||(3042606-3043032)
chr4 (422-813)||(29584025-29584414)
chr4 (429-810)||(34947923-34948306)
chr4 (422-827)||(55240915-55241320)
chr4 (427-827)||(7703517-7703910)
chr4 (535-834)||(1815409-1815708)
chr4 (457-839)||(17173320-17173703)
chr4 (429-827)||(47253751-47254141)
chr4 (429-819)||(33341397-33341790)
chr4 (444-839)||(23761089-23761484)
chr4 (457-827)||(17167743-17168114)
chr4 (424-827)||(50697239-50697643)
chr4 (427-827)||(49375966-49376368)
chr4 (429-827)||(27396618-27397015)
chr4 (456-827)||(46887968-46888339)
chr4 (424-819)||(50764732-50765112)
chr4 (459-819)||(37775701-37776050)
chr4 (424-813)||(30002466-30002838)
chr4 (424-828)||(32579441-32579848)
chr4 (426-820)||(42199728-42200123)
chr4 (430-839)||(32592096-32592497)
chr4 (429-827)||(33816326-33816742)
chr4 (459-819)||(5047785-5048144)
chr4 (426-819)||(37287732-37288121)
chr4 (428-827)||(4597994-4598383)
chr4 (464-837)||(4934012-4934375)
chr4 (526-813)||(17272067-17272350)
chr4 (421-742)||(38011848-38012169)
chr4 (425-812)||(9139245-9139612)
chr4 (624-828)||(7152013-7152218)
chr4 (569-819)||(46883933-46884177)
chr4 (629-819)||(26896289-26896480)
chr4 (426-704)||(35025530-35025800)
chr4 (655-827)||(39400236-39400409)
chr4 (659-839)||(4205216-4205397)
chr4 (689-825)||(35025379-35025515)
chr4 (457-682)||(54499193-54499420)
chr4 (698-827)||(23431826-23431956)
chr4 (427-633)||(39397918-39398115)
chr4 (417-532)||(4205106-4205221)
chr4 (733-819)||(38012568-38012654)
chr4 (666-731)||(56050169-56050234)
chr4 (425-507)||(4396324-4396406)
chr4 (429-483)||(52516599-52516653)
chr4 (425-475)||(2704510-2704560)
chr4 (425-507)||(7152237-7152319)
chr4 (425-483)||(17272009-17272067)
chr4 (425-475)||(38812260-38812310)
chr4 (429-481)||(20097485-20097537)
chr4 (468-541)||(23518400-23518473)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (428-840)||(10922724-10923137)
chr1 (464-839)||(32216088-32216464)
chr1 (429-839)||(15752027-15752438)
chr1 (424-819)||(32267027-32267422)
chr1 (427-820)||(23999343-23999737)
chr1 (426-819)||(2959743-2960136)
chr1 (425-819)||(16415639-16416034)
chr1 (426-827)||(30254419-30254820)
chr1 (427-827)||(27227265-27227657)
chr1 (467-819)||(28564571-28564921)
chr1 (426-812)||(10181802-10182189)
chr1 (425-819)||(15382927-15383322)
chr1 (426-812)||(19899563-19899950)
chr1 (457-788)||(51128885-51129216)
chr1 (417-819)||(238301-238702)
chr1 (427-827)||(38823210-38823611)
chr1 (429-819)||(28769651-28770041)
chr1 (457-819)||(9902842-9903204)
chr1 (457-819)||(37451312-37451673)
chr1 (425-834)||(8222125-8222532)
chr1 (427-827)||(27266980-27267376)
chr1 (433-819)||(47279191-47279577)
chr1 (428-827)||(14758038-14758429)
chr1 (427-819)||(7078851-7079254)
chr1 (427-834)||(42721035-42721439)
chr1 (424-827)||(34012161-34012560)
chr1 (466-827)||(46931446-46931807)
chr1 (514-814)||(25160715-25161016)
chr1 (427-840)||(47682260-47682673)
chr1 (426-791)||(18422646-18423004)
chr1 (466-819)||(27763098-27763451)
chr1 (422-819)||(11742156-11742535)
chr1 (427-807)||(30326751-30327132)
chr1 (423-827)||(1547279-1547668)
chr1 (440-812)||(4330288-4330662)
chr1 (424-819)||(15168082-15168484)
chr1 (457-819)||(27532770-27533130)
chr1 (466-812)||(27563700-27564046)
chr1 (424-839)||(3534925-3535332)
chr1 (424-819)||(39393376-39393772)
chr1 (422-813)||(3309139-3309536)
chr1 (526-819)||(22170806-22171099)
chr1 (427-827)||(31621327-31621733)
chr1 (422-779)||(37618729-37619081)
chr1 (459-819)||(40884841-40885202)
chr1 (429-812)||(41926161-41926537)
chr1 (623-839)||(1359703-1359919)
chr1 (527-819)||(33725399-33725680)
chr1 (623-819)||(48353735-48353930)
chr1 (421-709)||(48620627-48620906)
chr1 (487-744)||(38759583-38759846)
chr1 (645-840)||(21289817-21290010)
chr1 (668-827)||(31962853-31963014)
chr1 (427-575)||(21289661-21289816)
chr1 (467-558)||(1359932-1360022)
chr1 (758-827)||(48620916-48620986)
chr1 (426-526)||(30254853-30254952)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (430-839)||(6090953-6091363)
chr6 (426-819)||(3879731-3880124)
chr6 (425-819)||(5627389-5627784)
chr6 (425-827)||(1945831-1946237)
chr6 (418-807)||(4318626-4319016)
chr6 (427-819)||(7234824-7235218)
chr6 (457-816)||(21016913-21017266)
chr6 (428-819)||(20768087-20768474)
chr6 (426-827)||(8513232-8513622)
chr6 (429-819)||(29182165-29182553)
chr6 (427-827)||(33892795-33893186)
chr6 (429-813)||(6088910-6089282)
chr6 (427-819)||(33618834-33619225)
chr6 (426-685)||(7055141-7055400)
chr6 (429-713)||(30353256-30353540)
chr6 (457-696)||(15491645-15491884)
chr6 (680-839)||(7054543-7054704)
chr6 (421-557)||(18498427-18498564)
chr6 (753-808)||(33724062-33724117)
chr6 (423-475)||(11084152-11084204)
chr6 (425-475)||(19631747-19631797)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (429-812)||(699152-699535)
chr5 (439-840)||(27318249-27318650)
chr5 (428-840)||(22980794-22981207)
chr5 (425-819)||(35826269-35826660)
chr5 (425-819)||(38528020-38528413)
chr5 (423-840)||(22973843-22974261)
chr5 (425-827)||(22255179-22255583)
chr5 (425-839)||(36860421-36860837)
chr5 (427-839)||(36866762-36867175)
chr5 (424-840)||(24886099-24886501)
chr5 (428-839)||(31705374-31705785)
chr5 (422-827)||(19119854-19120260)
chr5 (427-827)||(31786420-31786821)
chr5 (441-819)||(30969107-30969485)
chr5 (424-819)||(8741668-8742065)
chr5 (466-819)||(17157814-17158166)
chr5 (426-827)||(39572818-39573212)
chr5 (427-839)||(40133385-40133798)
chr5 (459-839)||(5829929-5830305)
chr5 (425-840)||(12910348-12910769)
chr5 (425-813)||(27330304-27330690)
chr5 (439-828)||(33908245-33908634)
chr5 (489-819)||(35504427-35504757)
chr5 (459-827)||(7208638-7209006)
chr5 (429-819)||(25500709-25501099)
chr5 (427-827)||(7693230-7693622)
chr5 (427-827)||(35511256-35511652)
chr5 (429-840)||(5837557-5837969)
chr5 (427-819)||(23116013-23116397)
chr5 (510-827)||(15992314-15992632)
chr5 (426-819)||(9200232-9200616)
chr5 (427-819)||(15724490-15724880)
chr5 (426-819)||(35933901-35934288)
chr5 (427-827)||(22019632-22020024)
chr5 (459-828)||(21088541-21088908)
chr5 (424-827)||(14919313-14919707)
chr5 (428-827)||(32563150-32563541)
chr5 (435-827)||(43308434-43308819)
chr5 (440-827)||(8436979-8437366)
chr5 (427-819)||(14409124-14409501)
chr5 (469-827)||(42342775-42343122)
chr5 (578-839)||(2888207-2888469)
chr5 (426-778)||(1428983-1429321)
chr5 (425-777)||(13956187-13956522)
chr5 (485-840)||(23954563-23954907)
chr5 (425-666)||(5112250-5112490)
chr5 (578-819)||(25669737-25669968)
chr5 (488-754)||(6824329-6824595)
chr5 (440-685)||(26268087-26268332)
chr5 (425-819)||(8466743-8467118)
chr5 (641-812)||(25889584-25889755)
chr5 (689-819)||(28416334-28416464)
chr5 (466-639)||(28416490-28416663)
chr5 (692-827)||(26269074-26269210)
chr5 (726-812)||(43254154-43254240)
chr5 (464-582)||(25668687-25668804)
chr5 (429-563)||(11898004-11898138)
chr5 (427-504)||(16004474-16004552)
chr5 (427-507)||(26317779-26317859)
chr5 (430-481)||(13380498-13380549)
chr5 (424-475)||(22616491-22616542)
chr5 (426-475)||(36055874-36055923)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (424-811)||(7884-8271)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (423-819)||(2325189-2325577)
chr2 (464-819)||(43648056-43648411)
chr2 (427-833)||(33550778-33551189)
chr2 (426-819)||(11366191-11366585)
chr2 (425-839)||(4166920-4167335)
chr2 (419-827)||(3176931-3177340)
chr2 (427-819)||(26357577-26357969)
chr2 (427-827)||(4763628-4764033)
chr2 (459-819)||(37905740-37906103)
chr2 (426-827)||(19424444-19424832)
chr2 (425-827)||(31570536-31570939)
chr2 (423-827)||(19289125-19289525)
chr2 (425-828)||(39167170-39167568)
chr2 (526-819)||(41960939-41961232)
chr2 (459-819)||(33709043-33709403)
chr2 (429-827)||(33660179-33660569)
chr2 (425-821)||(29241954-29242343)
chr2 (427-819)||(44913662-44914059)
chr2 (427-832)||(35958909-35959298)
chr2 (426-721)||(17071646-17071941)
chr2 (423-839)||(18494071-18494475)
chr2 (426-789)||(27349789-27350143)
chr2 (426-721)||(17054005-17054300)
chr2 (427-828)||(41465509-41465903)
chr2 (426-780)||(4263926-4264281)
chr2 (523-827)||(31861948-31862253)
chr2 (464-779)||(4478406-4478717)
chr2 (423-819)||(13711460-13711851)
chr2 (429-827)||(43770650-43771039)
chr2 (426-813)||(5881533-5881915)
chr2 (429-761)||(44285951-44286283)
chr2 (429-732)||(36641988-36642293)
chr2 (427-766)||(19313852-19314186)
chr2 (497-819)||(7006749-7007054)
chr2 (524-732)||(45327817-45328025)
chr2 (622-840)||(19500706-19500923)
chr2 (427-680)||(33902068-33902319)
chr2 (429-701)||(41463779-41464051)
chr2 (568-719)||(18258198-18258349)
chr2 (692-818)||(41051112-41051238)
chr2 (700-824)||(41463396-41463520)
chr2 (730-819)||(33902317-33902406)
chr2 (715-827)||(18257340-18257453)
chr2 (765-827)||(45328028-45328091)
chr2 (457-572)||(41051263-41051379)
chr2 (424-475)||(19093410-19093461)
chr2 (756-829)||(17053931-17054005)
chr2 (756-801)||(17071601-17071646)
chr2 (530-597)||(19501773-19501839)
chr2 (422-475)||(22963395-22963448)
chr2 (422-475)||(22998029-22998082)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (426-813)||(133-514)
scaffold0002 (488-839)||(408203-408552)
scaffold0002 (656-820)||(93893-94056)
scaffold0002 (457-664)||(94331-94538)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (429-834)||(43959-44364)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (429-834)||(154423-154828)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (429-819)||(11908-12300)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (429-819)||(145808-146199)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (475-840)||(267331-267690)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (426-507)||(42347-42428)
scaffold0009 (648-772)||(100948-101058)
scaffold0009 (423-500)||(100817-100894)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 692; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 692; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 872
Target Start/End: Original strand, 1204521 - 1205378
Alignment:
Q  22 atataactaaccttttaagcaatcaaccagtgatgaagatgacaaagtgttacacaagtaaaactatcacgttagaacacttatgaccaacgacgaagaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1204521 atataactaaccttttaagcaatcaaccagtgatgaagatgacaaagtgttacacaagtaaaactatcacgttagaacacttatgaccaacaacgaaaaa 1204620  T
Q  122 gatgagatagaaagaatatgagagagcgatgaattagaaacggatttattgacataagttaattannnnnnnattagagacggaagttagagacgcaatc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  1204621 gatgagatagaaagaatatgagagagcgatgaattagaaacggatttattgacataagttaattatttttttattagagacggaagcaagagacgcagtc 1204720  T
Q  222 acaacagtatttcgtgtccaaattcgtctctattgggtcaaatttctgtttttataaagtcaacaattattcggagacgacatttagagacataattgtt 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1204721 acaacagtatttcgtgtccacattcgtctctattgggtcaaatttctgtttttataaagtcaacaattatacggagacgacatttacagacataattgtt 1204820  T
Q  322 ccgtgtcaaatgagcttcatctctagttccatctccaactaaaaaactaaactataaggcaagtttttccactattttggctccaaacacctgatttaat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204821 ccgtgtcaaatgagcttcatctctagttccatctccaactaaaaaaataaactataaggcaattttttccactattttggctccaaacacctgatttaat 1204920  T
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204921 aaaaaggaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 1205020  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1205021 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacac 1205120  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205121 cccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 1205220  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaag 820  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1205221 tgcaagtattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttttaaaaaag 1205320  T
Q  821 tcagttttttgactacacc----aagctcccaaaat-aaaacac-aaattccctccaa 872  Q
    ||| |||| ||||||||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1205321 tcaattttctgactacaccgtagaagctcccaaaataaaaacacaaaattccctccaa 1205378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 436 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 37970701 - 37970318
Alignment:
Q  436 tatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaag 535  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  37970701 tatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaag 37970602  T
Q  536 ttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaa 635  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  37970601 ttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37970502  T
Q  636 cacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970501 cacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 37970402  T
Q  736 gatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37970401 gatgaattactgttgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 37970318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 439 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 23854610 - 23854209
Alignment:
Q  439 ggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 538  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23854610 ggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttc 23854511  T
Q  539 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacac 638  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  23854510 agtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacac 23854411  T
Q  639 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 738  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854410 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 23854311  T
Q  739 gaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtcagttttttgactacac 838  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||    
T  23854310 gaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaatcaatttcctgactacac 23854211  T
Q  839 ca 840  Q
    ||    
T  23854210 ca 23854209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 425 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 43643788 - 43643372
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  43643788 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaat 43643689  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |    
T  43643688 gacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctc 43643589  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43643588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 43643489  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43643488 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 43643389  T
Q  824 gttttttgactacacca 840  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  43643388 gttttctgactgcacca 43643372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 425 - 834
Target Start/End: Original strand, 16222860 - 16223273
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||   |  ||| |||||||||||    
T  16222860 aaggaaaattctacggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaat 16222959  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  16222960 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacacccc 16223059  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16223060 aaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgc 16223159  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt----aaaaag 820  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    ||||||    
T  16223160 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttttttcaaaaag 16223259  T
Q  821 tcagttttttgact 834  Q
    |||||||| |||||    
T  16223260 tcagttttctgact 16223273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 488 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 1149762 - 1149431
Alignment:
Q  488 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 587  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1149762 aaaaatgtaatgagtaacaacccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaat 1149663  T
Q  588 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattt 687  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1149662 ctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattc 1149563  T
Q  688 taacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatca 787  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1149562 caacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatca 1149463  T
Q  788 aacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1149462 aacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaa 1149431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 27083030 - 27082637
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  27083030 aggaaaattctatggtgaagtcatcagactgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtg 27082931  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||     
T  27082930 gcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccg 27082831  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27082830 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 27082731  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27082730 agcattactagatgaattactacttatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 27082637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 12876108 - 12876510
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12876108 ggaaaattctatggttaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatga 12876207  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 12876307  T
Q  627 agagtgtaacactt-aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12876308 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttaca 12876407  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcag 824  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  12876408 ggcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttttaaaaaagtcag 12876507  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  12876508 ttt 12876510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 16447067 - 16446665
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16447067 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgataaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatg 16446968  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16446967 gcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 16446868  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446867 caaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 16446768  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16446767 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 16446668  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  16446667 ttt 16446665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 36695159 - 36694765
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36695159 aaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 36695060  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  36695059 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc 36694960  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36694959 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgc 36694860  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||    
T  36694859 aagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaa 36694765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 427 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 10555393 - 10554988
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10555393 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatga 10555294  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||    
T  10555293 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcac 10555194  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10555193 aaaacgtaacactt--gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaa 10555096  T
Q  727 gcattactagatgaatt--actattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt--aaaaagtc 822  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  10555095 gcattactagatgaattacactattgatcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttttcaaaaaagtc 10554999  T
Q  823 agttttttgac 833  Q
    | |||| ||||    
T  10554998 aattttctgac 10554988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 427 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 6098709 - 6098320
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  6098709 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 6098610  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccac 6098510  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacg-----ataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||     ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6098509 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgt 6098410  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  6098409 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatgattaacttt 6098320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 417 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 30654784 - 30654382
Alignment:
Q  417 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 516  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  30654784 ttaaaaaataggaaaattttatggtgaagtcataagagtgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtt 30654685  T
Q  517 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 616  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  30654684 tgttgaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgt 30654585  T
Q  617 aacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 716  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30654584 aacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 30654485  T
Q  717 gatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta 815  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |    
T  30654484 gatgttgcaagcattactaaatgaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttca 30654386  T
Q  816 aaaa 819  Q
    ||||    
T  30654385 aaaa 30654382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 427 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 5300137 - 5299723
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |  ||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||   |||||||||||| ||     
T  5300137 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtgg 5300038  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5300037 catcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccac 5299938  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5299937 aaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 5299838  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  5299837 gcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 5299738  T
Q  826 tttttgactacacca 840  Q
    ||  ||||| |||||    
T  5299737 ttcatgactgcacca 5299723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 417 - 789
Target Start/End: Original strand, 9864137 - 9864509
Alignment:
Q  417 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 516  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||  |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9864137 ttaataaaaaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtt 9864236  T
Q  517 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  9864237 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgt 9864336  T
Q  617 aacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 716  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9864337 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaa 9864436  T
Q  717 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9864437 gatgttgcaagcattactagatgaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Original strand, 34894963 - 34895353
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  34894963 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaag 34895062  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||    
T  34895063 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34895162  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| | ||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34895163 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 34895257  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34895258 caagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaa 34895353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Original strand, 38643975 - 38644378
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||  | |    
T  38643975 aaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagt 38644074  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  38644075 ggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactcc 38644174  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    | | ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38644175 ataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 38644274  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  38644275 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 38644374  T
Q  824 gttt 827  Q
    ||||    
T  38644375 gttt 38644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 459 - 819
Target Start/End: Original strand, 11727055 - 11727415
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11727055 ttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaa 11727154  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11727155 ttcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatat 11727254  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    || |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727255 caacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 11727354  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11727355 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaa 11727415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 429 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 7891137 - 7890747
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||         |||||  ||| |||||||||||| ||    
T  7891137 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgactttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaat---------aacactccaccgtttgtacaatggca 7891047  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||     
T  7891046 tcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaa 7890947  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  7890946 cgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagc 7890847  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7890846 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 7890747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Original strand, 40862416 - 40862811
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatat-aaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  40862416 aaggaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 40862515  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  | | | |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||| |    
T  40862516 tggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactc 40862614  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40862615 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 40862714  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaattt-aaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  40862715 caagcattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaactttttcaaaaa 40862811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 8803998 - 8803615
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  8803998 aggaaaattctatggtgaagtcatatg----acttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatg 8803903  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||||| |       |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |    
T  8803902 acatcaaaagttcagcc-------tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacccta 8803810  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8803809 aaaagtgtaacacttaatactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 8803710  T
Q  726 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8803709 agcattaccagatgaatatactattgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 8803615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Original strand, 465843 - 466223
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |  |||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  465843 aaaattttatggtgaagtcattaaaatgacttttgtggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggca 465942  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||     
T  465943 tcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaa 466042  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    |||||||||||         |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  466043 agtgtaacact---------cacata-tatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagc 466132  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  466133 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttattcaaaaa 466223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 427 - 834
Target Start/End: Original strand, 33906223 - 33906617
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||          
T  33906223 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagtattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttata------ 33906316  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
          |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||     
T  33906317 ------aagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaa 33906410  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33906411 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 33906510  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33906511 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 33906608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 459 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 31934045 - 31933676
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  31934045 ttttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaa 31933946  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31933945 ttcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatat 31933846  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31933845 catcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatgaattattattgatcattaa 31933746  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  31933745 tcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 31933676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 428 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 35459888 - 35459500
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |             |||||| ||||||||||||    
T  35459888 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttcgtaaagttaatactataatataaaaaatct-------------tcactgattgtacaatgac 35459802  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| ||||||    
T  35459801 attaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccaca 35459702  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  35459701 gattataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaa 35459602  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagtt 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35459601 cattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 35459502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 427 - 742
Target Start/End: Original strand, 13307622 - 13307936
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  13307622 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtga 13307721  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccac 13307821  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13307822 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaa 13307920  T
Q  727 gcattactagatgaat 742  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13307921 gcattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 527 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 1954081 - 1953787
Alignment:
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatc-atcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-cccc 624  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1954081 catcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatcccc 1953982  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1953981 acaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgc 1953882  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1953881 aagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaa 1953787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 44869495 - 44869897
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaa--atgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||| || |||||| | || || | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || | |||||| |  |  ||||||||| |||||    
T  44869495 ggaaaattctacggtgaaattataagaataacttttttggtgaagttaacactataacattaaaagtattttgtgagtgatccc-cactgtttgcacaat 44869593  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    |||    
T  44869594 gacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-ccc 44869692  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  44869693 cacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattg 44869792  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  44869793 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtc 44869892  T
Q  823 agttt 827  Q
    |||||    
T  44869893 agttt 44869897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 500 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 39099237 - 39098918
Alignment:
Q  500 agtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatct 599  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39099237 agtaacaccccactctttgtacactagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatct 39099138  T
Q  600 taccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaat 699  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  39099137 taccctgttttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaat 39099038  T
Q  700 agtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatc 799  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||     
T  39099037 agtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaatt 39098938  T
Q  800 aaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  39098937 aaaattaatttttttaaaaa 39098918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 553 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132463
Alignment:
Q  553 catcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcaca 652  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
Q  653 taatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 752  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 4132552  T
Q  753 cattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt-ttaaaaagtcagttttttgactacacca 840  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||| |||||    
T  4132551 cattaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttgctgactgcacca 4132463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 622 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 1149912 - 1149756
Alignment:
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1149912 cccacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgt 1149817  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1149816 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 1149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 658 - 819
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12587973
Alignment:
Q  658 tcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 757  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587812 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 12587911  T
Q  758 atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12587912 atcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaa 12587973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 417 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 1150306 - 1150090
Alignment:
Q  417 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 516  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||   |||||||    
T  1150306 ttaataattaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgtt 1150207  T
Q  517 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 616  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  1150206 tgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgt 1150107  T
Q  617 aacaccccacagagtgt 633  Q
    ||||||||||| |||||    
T  1150106 aacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 654 - 827
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859334
Alignment:
Q  654 aatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatc 753  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 35859259  T
Q  754 attaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35859260 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 35859334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 655 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 34952020 - 34951847
Alignment:
Q  655 atatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 754  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  34952020 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatca 34951921  T
Q  755 ttaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34951920 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 34951847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 578 - 819
Target Start/End: Original strand, 18259233 - 18259470
Alignment:
Q  578 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatg 677  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||    |||||  |||||| ||| ||  ||||||||    
T  18259233 tacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttgcatg 18259328  T
Q  678 ttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaa 777  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18259329 ttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaacaatttaa 18259428  T
Q  778 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||| || ||| || ||||||||| |||| |||||    
T  18259429 aaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaa 18259470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 609 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823194
Alignment:
Q  609 ttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgt 708  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||        ||||||   |||||||||||||||| |||    
T  24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagatgccaacgataaaatagtacatgt 24823304  T
Q  709 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24823303 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaac 24823204  T
Q  809 ttttttaaaa 818  Q
    ||||||||||    
T  24823203 ttttttaaaa 24823194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 527 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 41911079 - 41910895
Alignment:
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41911079 catcaaaaattcagtcaacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 41910980  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagt 712  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  41910979 aaagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaaga-tgcaacgataaaatattacctgtaagt 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 698
Target Start/End: Original strand, 43025733 - 43025972
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||  || ||||||||||| |  ||| ||||||||     
T  43025733 ttttatggtgaagttaacgatatagtatcaaaagtgttgtgattaataccccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaa 43025832  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43025833 ttcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatat 43025932  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaa 698  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43025933 catcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 43025972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 689 - 819
Target Start/End: Original strand, 33198063 - 33198193
Alignment:
Q  689 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 788  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33198063 aacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaa 33198162  T
Q  789 acaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
     || |||||| || ||||||||||| |||||    
T  33198163 tcattaagattaagattaactttttcaaaaa 33198193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 427 - 620
Target Start/End: Original strand, 41362517 - 41362707
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |  |||||| |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||    
T  41362517 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactagcata---aaaatgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtga 41362613  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 457 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 34952192 - 34952028
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  34952192 acttttctggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccctttagtatcatc 34952093  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    | ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  34952092 aattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 729 - 840
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362835
Alignment:
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 41362822  T
Q  828 tttgactacacca 840  Q
      ||||| |||||    
T  41362823 cctgactgcacca 41362835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 658 - 749
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463792
Alignment:
Q  658 tcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 728 - 819
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026065
Alignment:
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttcaaaa 43026065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 427 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4133199 - 4133077
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||  ||||||||| || | |||||||||||| ||     
T  4133199 ggaaaattttatggtcaagtcatcagaatgacttttttggtgaagttaacactagcataaaaaagat--agtgagtaatacctgactgtttgtacagtgg 4133102  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagta 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4133101 catcaaaagttcagtcctcatagta 4133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 629 - 705
Target Start/End: Original strand, 7998479 - 7998555
Alignment:
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacc 705  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  7998479 agtgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagtacc 7998555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 621
Target Start/End: Original strand, 7998401 - 7998488
Alignment:
Q  535 gttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  7998401 gttcggtccccataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 492
Target Start/End: Original strand, 15009241 - 15009306
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaa 492  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15009241 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaa 15009306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 665
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585353
Alignment:
Q  609 ttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacataacatcatcaac 12585353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 582
Target Start/End: Original strand, 33197948 - 33198003
Alignment:
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacac 582  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33197948 catcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac 33198003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 24823465 - 24823399
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaa 491  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24823465 aaggaaaatactatggtaaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaa 24823399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 425 - 834
Target Start/End: Original strand, 18797302 - 18797710
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18797302 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaat 18797399  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |    
T  18797400 gacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctc 18797499  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797500 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 18797599  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtca 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18797600 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 18797699  T
Q  824 gttttttgact 834  Q
    ||||| |||||    
T  18797700 gttttctgact 18797710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 32821241 - 32820847
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |  | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32821241 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaat 32821142  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32821141 ggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacacccc 32821042  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32821041 ataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgc 32820942  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32820941 aagcattactagatgaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaa 32820847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 423 - 811
Target Start/End: Original strand, 30055497 - 30055886
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctgg-tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  30055497 aaaaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgactttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 30055596  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  30055597 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacac 30055696  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055697 cctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 30055796  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  30055797 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 30055886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 427 - 812
Target Start/End: Original strand, 37109847 - 37110234
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  37109847 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 37109946  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatctta--ccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||    
T  37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacacccc 37110046  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37110047 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 37110146  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  37110147 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 37110234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 426 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 31579256 - 31578836
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttg-----ta 520  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||      ||    
T  31579256 aggaaaattctatggtgaagtcataagaataatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttata 31579157  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||    
T  31579156 caatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataaca 31579057  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31579056 ccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatg 31578957  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  31578956 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 31578857  T
Q  820 gtcagttttttgactacacca 840  Q
    ||||||||  ||||| |||||    
T  31578856 gtcagtttcctgactgcacca 31578836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 9356014 - 9355611
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |    
T  9356014 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgaccattttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagt 9355915  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9355914 gacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 9355815  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9355814 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgc 9355715  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  9355714 aagcattactagatgaattgctattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 9355615  T
Q  824 gttt 827  Q
    ||||    
T  9355614 gttt 9355611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 425 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 17842774 - 17842385
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  17842774 aaggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaat 17842675  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatctta--ccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| || ||||||||||| |    
T  17842674 gacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatc 17842575  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17842574 ccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 17842475  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  17842474 gcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 17842385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 422 - 827
Target Start/End: Original strand, 24211711 - 24212118
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||     
T  24211711 aaaaaagaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatag 24211810  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||     
T  24211811 aatggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacat 24211910  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24211911 cctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgt 24212010  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24212011 tgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 24212110  T
Q  820 gtcagttt 827  Q
    ||||||||    
T  24212111 gtcagttt 24212118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 429 - 834
Target Start/End: Original strand, 23111167 - 23111575
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| | ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  23111167 aaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggca 23111266  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatct--taccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  23111267 tcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccac 23111366  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  23111367 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaa 23111466  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23111467 gcattactagaagaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttttaaaaaagtcagt 23111566  T
Q  826 tttttgact 834  Q
    ||| |||||    
T  23111567 tttctgact 23111575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Original strand, 7334769 - 7335160
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |  |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7334769 ggaaaattctacggtgaagtcgtgagaatgacttttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatga 7334868  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  7334869 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 7334968  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7334969 agagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaac-tagtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaa 7335067  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7335068 gcattactagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaa 7335160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 459 - 807
Target Start/End: Original strand, 27283751 - 27284100
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27283751 ttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgaaatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaa 27283850  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27283851 tttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatat 27283950  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283951 tatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 27284050  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacaataagatcaaaattaa 807  Q
    ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27284051 tcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaa 27284100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Original strand, 21991610 - 21992003
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21991610 aggaaaattctagggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtg 21991709  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  21991710 tcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 21991809  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991810 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 21991909  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa-cttttttaaaaagtcag 824  Q
    ||||     |||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  21991910 agca-----agatgaattactattgatc----atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaccttttcaaaaaagtcag 21992000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 467 - 840
Target Start/End: Original strand, 10481619 - 10481994
Alignment:
Q  467 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  10481619 tgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatca 10481718  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481719 gattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 10481818  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 765  Q
    | | ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10481819 tctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcgttaatcagtaa 10481918  T
Q  766 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacca 840  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  10481919 ttaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcacca 10481994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Original strand, 32432431 - 32432828
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  |  | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  32432431 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatca-----aaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatg 32432525  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  32432526 acatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacacccca 32432625  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32432626 caaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgca 32432725  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcag 824  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  32432726 agcattactagatgaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttttaaaaaagtcag 32432825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 15612944 - 15612544
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||  |||  ||||||||||  || |||||||| | ||     
T  15612944 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataacgtttcttgtgaagttaacactataacatcaaag-tgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtgg 15612846  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15612845 catcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 15612746  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15612745 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaa 15612646  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  15612645 gcattactagatgaattattgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtcagt 15612546  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  15612545 tt 15612544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 37346997 - 37347397
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  | |||| |||||||||||| ||||||  || |||||| || ||||||||||  || |||||||||| |||    
T  37346997 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtga 37347096  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || ||||    
T  37347097 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccac 37347195  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37347196 aaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaa 37347295  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  37347296 gcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagt 37347395  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  37347396 tt 37347397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Original strand, 4582894 - 4583286
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4582894 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 4582993  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 4583093  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  4583094 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaa 4583193  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  4583194 gcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 4583286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 25691729 - 25691338
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaac-acatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||  || |||||||||||||| || |    
T  25691729 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggc 25691630  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25691629 atcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccaca 25691530  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||     
T  25691529 aagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaa 25691430  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25691429 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttttaaaaa 25691338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 5657667 - 5657265
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  5657667 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 5657568  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||    
T  5657567 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccac 5657468  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5657467 aaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaa 5657368  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaat-aagatcaaaattaacttttttaaaaa-gtcag 824  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  5657367 gcattactagatgaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaactttttcaaaaatgtcag 5657268  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  5657267 ttt 5657265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 8861260 - 8861661
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||  || |||| |||  ||| ||||||  ||||||||||||| ||     
T  8861260 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgcgaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtgg 8861359  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  8861360 catcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgc 8861459  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  8861460 aaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcat 8861559  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  8861560 gcattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 8861659  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  8861660 tt 8861661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 459 - 807
Target Start/End: Original strand, 11071213 - 11071558
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||  || |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11071213 ttttttggtaaagttagtactatatcatcaaaaatatagcgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaa 11071312  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11071313 ttcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatat 11071412  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11071413 catcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaa 11071509  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa 807  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  11071510 tcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 11071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 41765266 - 41764872
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| | |||| || ||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  |    
T  41765266 aaggaaaattccatggtgaagtcatgagaatgacttttctgataaagtcaatactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggt 41765167  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  41765166 ggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacacccc 41765067  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41765066 agaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgc 41764967  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  41764966 aagcattactggatgaattattattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaa 41764872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 457 - 834
Target Start/End: Original strand, 29173545 - 29173905
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173545 acttttctggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 29173644  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||                 ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29173645 aattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaag-----------------tgttacacttaagactatcacataat 29173727  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29173728 atcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatg 29173826  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgact 834  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29173827 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgact 29173905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 10359400 - 10359008
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||| || ||||   ||||  || |||| ||||||||||||||    ||| ||| |||| |||    
T  10359400 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtaaaattaatcttatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcctactatttatacagtga 10359301  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaa-tctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  10359300 catcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacccca 10359202  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  10359201 caaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgca 10359102  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  10359101 agcattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaactttttcaaaaa 10359008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 6546494 - 6546895
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  | |||||| |||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| | |    
T  6546494 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttctagtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaa 6546593  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||| | |   ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6546594 catcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 6546693  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  6546694 aaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaa 6546793  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6546794 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 6546893  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  6546894 tt 6546895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 441 - 819
Target Start/End: Original strand, 22687228 - 22687598
Alignment:
Q  441 tgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 540  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22687228 tgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcag 22687327  T
Q  541 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacactt 640  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  22687328 tccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 22687427  T
Q  641 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 740  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||         |||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22687428 aagactatctcatgatatcaacaact--------ctgttaaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatga 22687519  T
Q  741 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22687520 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 22687598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 31520909 - 31520526
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |  |||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||    
T  31520909 ggaaaattttatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtga 31520810  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||                 
T  31520809 catcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaag------------- 31520724  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31520723 ----tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 31520628  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  31520627 gcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagt 31520528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 459 - 723
Target Start/End: Original strand, 38258552 - 38258816
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  38258552 ttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaa 38258651  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258652 ttcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 38258751  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258752 catcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 443 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 48928466 - 48928091
Alignment:
Q  443 aagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 542  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  48928466 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtc 48928367  T
Q  543 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaa 642  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| || | |||||||  |||||    
T  48928366 c-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaa 48928268  T
Q  643 gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 742  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48928267 gactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat 48928168  T
Q  743 tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  48928167 tactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttttaaaaa 48928091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 513 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 37703590 - 37703292
Alignment:
Q  513 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaa 612  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||        ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37703590 tgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcag--------attaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaa 37703499  T
Q  613 gcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagt 712  Q
    | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  37703498 gtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagt 37703399  T
Q  713 ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37703398 ccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 37703299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 426 - 742
Target Start/End: Original strand, 43686015 - 43686330
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43686015 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgactttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacacc-cactgtttgtacaatg 43686113  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  43686114 gcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 43686213  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  43686214 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgca 43686313  T
Q  726 agcattactagatgaat 742  Q
    ||||||||| |||||||    
T  43686314 agcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 457 - 783
Target Start/End: Original strand, 12165757 - 12166074
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    |||||||||    
T  12165757 acttttctggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtcccttaagtatcatc 12165856  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||         ||||||||    
T  12165857 aattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cacataat 12165947  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12165948 atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 12166047  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatga 783  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12166048 aatcagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 466 - 813
Target Start/End: Original strand, 43925120 - 43925456
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || |    
T  43925120 gtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacacctcactgt----acaatgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atca 43925214  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||  || ||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  43925215 gactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaac 43925314  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 765  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43925315 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcactaa 43925408  T
Q  766 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43925409 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 43925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 545 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672544
Alignment:
Q  545 catagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaaga 644  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
Q  645 ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa---aatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa 741  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15672730 ctatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaa 15672631  T
Q  742 ttactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  15672630 ttactattgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 15672544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 516 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 46481218 - 46480914
Alignment:
Q  516 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcg 615  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||        |||||||||| || |||| || |||||||||  ||| || ||||||| |    
T  46481218 ttgtacaatgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag--------attaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtg 46481127  T
Q  616 taacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcca 715  Q
    ||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |    
T  46481126 taacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtcta 46481027  T
Q  716 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-t 814  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||      
T  46481026 agatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaactttttca 46480927  T
Q  815 aaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||    
T  46480926 aaaaagtcagttt 46480914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 464 - 856
Target Start/End: Original strand, 35353120 - 35353517
Alignment:
Q  464 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagtt-cagtcctcatagtatcatcagttca 562  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  || ||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||||| || ||||    
T  35353120 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattca 35353219  T
Q  563 ttagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 662  Q
    | |||||||||||| | || ||| |  |  |    |||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35353220 tcagattaacaagactgca-ttactagatgtaacacttaccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatc 35353318  T
Q  663 aactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcac 762  Q
    |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  35353319 aactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcag 35353418  T
Q  763 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacc----aagctcccaaaataaaa 856  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||    |||||||||||||||||    
T  35353419 caatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccttagaagctcccaaaataaaa 35353517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 422 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 12390821 - 12390450
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||   |||||||||| |    
T  12390821 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcatcagatcgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgc 12390722  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||            
T  12390721 agtgacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaag-------- 12390630  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
             ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12390629 ---------tgtaacacttaagact--cacataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 12390541  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12390540 tgcaaccattactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgacaatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaactttt 12390450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 457 - 827
Target Start/End: Original strand, 26980328 - 26980682
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26980328 acttttatggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatcatc 26980427  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||                 ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26980428 aattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacatgat 26980510  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  26980511 atcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattattgttgatcatt 26980610  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26980611 aatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 26980682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 428 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 33688446 - 33688117
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    ||||||||| || || |    
T  33688446 gaaaattatatggtgaagttatgagaatgacttttctggt-aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggc 33688348  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||| |    
T  33688347 atcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccata 33688248  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33688247 aagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 33688148  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33688147 cattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 571 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587877
Alignment:
Q  571 acaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgt 670  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgt 26588027  T
Q  671 ttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaac 770  Q
    |        ||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26588026 t--------aaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaac 26587935  T
Q  771 aatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26587934 aatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 26587877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 428 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 48928748 - 48928473
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||  || |    
T  48928748 gaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgcc 48928649  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |    
T  48928648 atcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcaga 48928550  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtac 704  Q
     |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  48928549 aagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtac 48928473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 527 - 819
Target Start/End: Original strand, 44598741 - 44599033
Alignment:
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44598741 catcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 44598840  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  44598841 aaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaa 44598940  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatc---actaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44598941 gcattactagatgaa--actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaattttttcaaaaa 44599033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 429 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 27421563 - 27421313
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27421563 aaaattctatggtgaagtcgtgataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgaca 27421464  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  27421463 tcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaa 27421365  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgtta 680  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  27421364 agtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 644 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411345
Alignment:
Q  644 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 44411410  T
Q  744 actattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac 808  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  44411409 aatattgaccattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataattaac 44411345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 629 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 32593190 - 32593001
Alignment:
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  32593190 agtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaat 32593091  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32593090 attactagataaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 32593001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 536 - 682
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704387
Alignment:
Q  536 ttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaa 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
Q  636 cacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaa 682  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37704341 cacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 459 - 742
Target Start/End: Original strand, 38053493 - 38053751
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  38053493 ttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatgtaatgagtaaaaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaa 38053592  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
            |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38053593 --------attaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatat 38053667  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 742  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  38053668 catcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 657 - 806
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704536
Alignment:
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcatt 37704486  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaatta 806  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  37704487 aattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaaaatcaagatta 37704536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 467 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 44413525 - 44413351
Alignment:
Q  467 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattag 566  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||| |     
T  44413525 tgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaaatcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaa 44413426  T
Q  567 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacactta 641  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44413425 attaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 668 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 34362123 - 34361970
Alignment:
Q  668 tgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatc 767  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||     
T  34362123 tgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtcatt 34362024  T
Q  768 aacaatttaaaaatgaatcaaacaat-aaga-tcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||||    
T  34362023 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaactttttcaaaaa 34361970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 425 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 26524515 - 26524363
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |    
T  26524515 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgcagt 26524416  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagat 577  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  26524415 ggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaagat 26524363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 740 - 839
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258967
Alignment:
Q  740 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacac 838  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||    
T  38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcac 38258966  T
Q  839 c 839  Q
    |    
T  38258967 c 38258967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 34362334 - 34362205
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||||| |  ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  34362334 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctaggaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 34362235  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 557  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34362234 catc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 32593327 - 32593189
Alignment:
Q  474 aacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaaca 573  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  32593327 aacactatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatca 32593229  T
Q  574 agattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 613  Q
    | | | || |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32593228 aaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaag 32593189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
Q  695 aaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 759  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaat 27421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 778 - 827
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166265
Alignment:
Q  778 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagttt 12166265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 493
Target Start/End: Original strand, 8299192 - 8299256
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaat 493  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8299192 aaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaat 8299256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 507
Target Start/End: Original strand, 44598373 - 44598419
Alignment:
Q  461 ttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 507  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44598373 ttctcgtgaagttaatactataatatcaaaaatgttgtgagtaacac 44598419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 429 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 46297945 - 46297534
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  46297945 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcg 46297846  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  46297845 tcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 46297746  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46297745 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagc 46297646  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46297645 attactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 46297546  T
Q  828 tttgactacacc 839  Q
    ||||||| ||||    
T  46297545 tttgactgcacc 46297534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 40552445 - 40552043
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  40552445 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatg 40552346  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  40552345 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatccca 40552246  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40552245 caacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgca 40552146  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40552145 agcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 40552046  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  40552045 ttt 40552043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 426 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 26941446 - 26941032
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26941446 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatg 26941347  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||    
T  26941346 acatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctca 26941247  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
     | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26941246 taaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 26941147  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26941146 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 26941047  T
Q  825 ttttttgactacacc 839  Q
    |||| ||||| ||||    
T  26941046 ttttctgactgcacc 26941032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 473 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 42506214 - 42505876
Alignment:
Q  473 taacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaac 572  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42506214 taacactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 42506115  T
Q  573 aagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgttt 672  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  42506114 aagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttc 42506015  T
Q  673 gcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaa 772  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42506014 gcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 42505915  T
Q  773 tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 811  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  42505914 tttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 42505876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Original strand, 48354930 - 48355324
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  48354930 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaat 48355029  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||  ||||||  ||    
T  48355030 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacatacc 48355129  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48355130 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgc 48355229  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48355230 aagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 48355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 426 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 52041109 - 52040722
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcac-tgtttgtacaat 524  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |  ||  |||||||| | |    
T  52041109 aggaaaattctgaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagt 52041010  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  52041009 ggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccc 52040910  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52040909 acatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 52040810  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52040809 aaacattactagatgaatgattattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 52040722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 421 - 819
Target Start/End: Original strand, 47481507 - 47481906
Alignment:
Q  421 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |  |  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  47481507 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcataggaatgatgtttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgta 47481606  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  47481607 gaatgacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataaca 47481706  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47481707 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatg 47481806  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47481807 ttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 47481906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 37203058 - 37203460
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |  | |||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  37203058 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 37203157  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  37203158 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccac 37203257  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact-ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  37203258 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgca 37203357  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37203358 agcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 37203457  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  37203458 ttt 37203460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 422 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 53229343 - 53228952
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-tcactgtttgta 520  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  53229343 aaaaagaaaaattttaaggtgaagtcatgaaaattatttttctggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgta 53229244  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    || |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  53229243 cagttgcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaact 53229144  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  53229143 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatg 53229044  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53229043 ttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 53228952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 417 - 789
Target Start/End: Original strand, 34132916 - 34133288
Alignment:
Q  417 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 516  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||  |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34132916 ttaataaaaaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtt 34133015  T
Q  517 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  34133016 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgt 34133115  T
Q  617 aacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 716  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133116 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 34133215  T
Q  717 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34133216 gatgttgcaagcattactagatgaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 37157699 - 37158100
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |   ||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||     
T  37157699 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggcttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtgg 37157797  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37157798 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccac 37157897  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact-ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  37157898 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgca 37157997  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37157998 agcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 37158097  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  37158098 ttt 37158100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 4015451 - 4015851
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||   |||||||||| | |||    
T  4015451 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtga 4015550  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | ||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 4015650  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4015651 aaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaactt-gtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 4015749  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4015750 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 4015849  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  4015850 tt 4015851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 4761838 - 4761441
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttct--ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    |||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4761838 aaggaaaattctatggtgaattcatgagattgacttttttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtaca 4761739  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||    
T  4761738 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacc 4761639  T
Q  623 cc-acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4761638 cccacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgt 4761539  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4761538 tgcaaacattaccagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaa 4761441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 425 - 818
Target Start/End: Original strand, 22450957 - 22451350
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||   |    
T  22450957 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtatggt 22451056  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22451057 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacacccc 22451156  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    |   ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22451157 agtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 22451256  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa 818  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22451257 aagcattactagatgaattattattgatcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaa 22451350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Original strand, 39282642 - 39283044
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |  | ||||||| | || |||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||  |||||||| |||| |    
T  39282642 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgataaaattaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaataccccactgtttatacagt 39282740  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  39282741 ggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccc 39282840  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  39282841 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgc 39282940  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  39282941 aagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 39283040  T
Q  824 gttt 827  Q
    ||||    
T  39283041 gttt 39283044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 3655388 - 3654992
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |  |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3655388 aggaaaattttatggtgaagtcataaaaatgacttttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 3655289  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||    
T  3655288 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacacca 3655189  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  3655188 caaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgca 3655089  T
Q  726 agcattactag--atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  3655088 agcattactagatatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaa 3654992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 466 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 21009948 - 21009585
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  21009948 gtgaatttgacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatca 21009849  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009848 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 21009749  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcacta 764  Q
      | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21009748 aatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagta 21009649  T
Q  765 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21009648 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaagtcagttt 21009585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 7327669 - 7327275
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa-cactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| | |||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||  || | |||||||| |    
T  7327669 aggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagt 7327570  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||  || ||||||||||    
T  7327569 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacacccc 7327470  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7327469 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgc 7327370  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7327369 aagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaa 7327275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 437 - 819
Target Start/End: Original strand, 29099356 - 29099729
Alignment:
Q  437 atggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt 536  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29099356 atggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagt 29099455  T
Q  537 tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaac 636  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29099456 tcagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 29099555  T
Q  637 acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 736  Q
             | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099556 ---------tttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactag 29099646  T
Q  737 atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  29099647 atgaattaccattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttcaaaaa 29099729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 442 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 11357535 - 11357181
Alignment:
Q  442 gaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 540  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||  | |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11357535 gaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcag 11357436  T
Q  541 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacactt 640  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||                 ||||||||||    
T  11357435 tcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaag-----------------tgtaacactt 11357353  T
Q  641 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357352 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 11357253  T
Q  741 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11357252 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 11357181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 421 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 33378973 - 33378569
Alignment:
Q  421 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 520  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||||| |  ||||||   ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||  || | ||||||    
T  33378973 taaaaaggaaaattctatggcaaagttatgagaatgactttt---gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgta 33378877  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33378876 cggtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 33378777  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33378776 ccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatg 33378677  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaa 819  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||    
T  33378676 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaa 33378577  T
Q  820 gtcagttt 827  Q
    ||||||||    
T  33378576 gtcagttt 33378569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 459 - 812
Target Start/End: Original strand, 3362276 - 3362631
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  3362276 ttttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaa 3362375  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacact--taatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3362376 ttcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataac 3362475  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3362476 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggatgaattactattgatcatt 3362575  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3362576 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 3362631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Original strand, 21193595 - 21193999
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |   || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | |    
T  21193595 aaggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagagt 21193694  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  21193695 gacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactcc 21193794  T
Q  625 acagagtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    | | ||  |||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  21193795 ataaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttg 21193894  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  21193895 caaccattactaaatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtc 21193994  T
Q  823 agttt 827  Q
    |||||    
T  21193995 agttt 21193999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 44891498 - 44891889
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| || |||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||   ||||||         |     
T  44891498 ggaaaattatacggtgaagtcatgaaaatgactttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------gg 44891587  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  44891588 catcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccac 44891687  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44891688 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaa 44891787  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagt 825  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44891788 gcattactagatgaattactgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 44891887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Original strand, 54505799 - 54506191
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    ||||||||||||| |||||||   || |  |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  || | ||| || |||||    
T  54505799 ggaaaattttatgatgaagtcgcaagaatgacttttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatga 54505898  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||| | ||    
T  54505899 catcaaaaattcag-cctcatagtatcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctac 54505997  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  54505998 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaa 54506097  T
Q  727 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54506098 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 54506191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 466 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 24489108 - 24488761
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  24489108 gtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcaattcatca 24489009  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24489008 gactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaac 24488909  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 765  Q
    | | ||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||    
T  24488908 tctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgcattactattaatcatgaatcaataa 24488809  T
Q  766 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  24488808 tcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaacttttt 24488761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 496 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 24708231 - 24707908
Alignment:
Q  496 agtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacactta--atctaatt 593  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  24708231 agtgagtaacacctcactgt--gtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaatt 24708134  T
Q  594 ttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacga 693  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||    
T  24708133 ttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacga 24708034  T
Q  694 taaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaat 793  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24708033 taaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaagcattattagataaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 24707934  T
Q  794 aagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    || || |||||||||||||| |||||    
T  24707933 aaaattaaaattaactttttcaaaaa 24707908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 428 - 819
Target Start/End: Original strand, 25579731 - 25580122
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |  | ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||| |||| |||||    ||| ||| |||| ||||    
T  25579731 gaaaattttatggttaagttatgagaatgatttttctggtgaagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgac 25579830  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||    
T  25579831 atcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccaca 25579930  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||| || ||||| |||||||    
T  25579931 aagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaag 25580030  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  25580031 cattactagatgaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttttttaaaaa 25580122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 550 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622511
Alignment:
Q  550 tatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatc 649  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
Q  650 acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 749  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 22622581  T
Q  750 gatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22622580 gatcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 22622511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 467 - 827
Target Start/End: Original strand, 2007964 - 2008331
Alignment:
Q  467 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattag 566  Q
    ||||||||||||||||   | |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  2007964 tgaagttaacactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcag 2008063  T
Q  567 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 666  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2008064 attaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 2008162  T
Q  667 ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat-------taat 759  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||       ||||    
T  2008163 ctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatcagtaat 2008262  T
Q  760 cactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2008263 cattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 2008331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Original strand, 32373460 - 32373852
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |  |||||||   | ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||     
T  32373460 aaagggaaattctatgatgaagtcatgagaatgacttttccaataaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaactc--cactgtttgtacag 32373557  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    || ||||||||||||   ||  || ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  32373558 tggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 32373657  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32373658 cacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttg 32373757  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32373758 caagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaactttttcaaaaa 32373852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 429 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 43976068 - 43975664
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||   |||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||    
T  43976068 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttttg---aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgaca 43975972  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |     
T  43975971 tcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaa 43975872  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact---ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    |||||||||||       ||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43975871 agtgtaacact-------atcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgca 43975779  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa-agtcag 824  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  43975778 agcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcag 43975679  T
Q  825 ttttttgactacacc 839  Q
    |||| ||||| ||||    
T  43975678 ttttctgactgcacc 43975664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 548 - 827
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698545
Alignment:
Q  548 agtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagacta 647  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
Q  648 tcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 747  Q
    || ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaata 33698464  T
Q  748 ttgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33698465 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 33698545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 519 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 46994754 - 46994490
Alignment:
Q  519 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaa 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  46994754 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaa 46994655  T
Q  619 caccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaaga 718  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46994654 cgccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaaga 46994555  T
Q  719 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatga 783  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46994554 tattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Original strand, 11466814 - 11467202
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||   || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  11466814 aggaaaattctatggtgaagtcttgagaatgacttttctgatgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 11466913  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  11466914 gcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccca 11467013  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11467014 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgca 11467113  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |       ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11467114 a-------tagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaactttttcaaaaaagtcag 11467199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 429 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 54828883 - 54828546
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||  |||| ||||    
T  54828883 aaaattttatggtgaagtcataaaaataatttttttggtaaagttaacactataacataaaaa-tgtaatgagtaacaccccaccgtttaaacaacgaca 54828785  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||     
T  54828784 tcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaa 54828685  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54828684 agtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 54828585  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatc 767  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54828584 attactagataaattactattgatcattaatcagtaatc 54828546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 427 - 751
Target Start/End: Original strand, 45174494 - 45174821
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtg--agtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  45174494 ggaaaattttatggtgaagttgtgagaataacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagt 45174593  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  45174594 agcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 45174693  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
     ||| |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45174694 tacaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttg 45174793  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattga 751  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45174794 caagcattactagatgaattactattga 45174821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 459 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 22446217 - 22445865
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcc-tcatagtatcatca 557  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22446217 ttttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggcatcaaaagttcaaaccctcatagtatcatca 22446119  T
Q  558 gttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataata 657  Q
     ||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| | |||  || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22446118 attcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacactc-acaatgtataacactcaagactatcatataata 22446020  T
Q  658 tcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 757  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22446019 tcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatgaattactattgatcatta 22445920  T
Q  758 atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22445919 atcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 22445865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 426 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 44186687 - 44186316
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| |  | |||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  | |||||| |||| ||    
T  44186687 aggaaaattctatgatgaagtcgagagaatgatttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtg 44186588  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  44186587 acatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacacccca 44186488  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    ||                |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44186487 ca----------------actatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgca 44186404  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  44186403 agcattactagataaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacatttt 44186316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 585 - 839
Target Start/End: Original strand, 1089842 - 1090097
Alignment:
Q  585 aatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaag 683  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  1089842 aatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaacaactctatttgcatgttaaag 1089941  T
Q  684 attttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatga 783  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1089942 atgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 1090040  T
Q  784 atcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  1090041 atcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactacacc 1090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 530 - 827
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164194
Alignment:
Q  530 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaga 629  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
Q  630 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca 729  Q
    ||||||||||         ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  29164012 gtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagca 29164102  T
Q  730 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29164103 ttactagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagttt 29164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 488 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 14586794 - 14586464
Alignment:
Q  488 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 587  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14586794 aaaagtgttgtgagtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaat 14586695  T
Q  588 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattt 687  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||         |  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||      
T  14586694 ctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgc 14586604  T
Q  688 taacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatca 787  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14586603 caacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatca 14586505  T
Q  788 aacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  14586504 aacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 14586464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 440 - 819
Target Start/End: Original strand, 40935995 - 40936356
Alignment:
Q  440 gtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 539  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40935995 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagttca 40936094  T
Q  540 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacact 639  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||                 |||||||||    
T  40936095 gtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttt-ttttaag-----------------tgtaacact 40936176  T
Q  640 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 739  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40936177 taagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagata 40936276  T
Q  740 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  40936277 aattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttcaaaaa 40936356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 685
Target Start/End: Original strand, 35844314 - 35844575
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  35844314 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacag 35844413  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  35844414 tgacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacacc 35844513  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 685  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35844514 ctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaaagat 35844575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 543 - 827
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012532
Alignment:
Q  543 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacactta 641  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||| |||||| | |||||||||||    
T  36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacactta 36012343  T
Q  642 agactatcacataatatcatcaact-ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 740  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36012344 agactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatga 36012443  T
Q  741 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaa-ttaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  36012444 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaactttttcaaaaaagtcagttt 36012532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 469 - 789
Target Start/End: Original strand, 38591727 - 38592051
Alignment:
Q  469 aagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgt----ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatt 564  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||  ||| |||    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  ||||     
T  38591727 aagttaacactataacatcaaaattatagggagtaacatctcattgtattgttgtacaatggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatc 38591826  T
Q  565 agattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaa 664  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591827 agattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaa 38591926  T
Q  665 ctttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcacta 764  Q
     | | ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  38591927 atctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaatcagta 38592026  T
Q  765 atcaacaatttaaaaatgaatcaaa 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38592027 atcaacaatttaaaaatgaatcaaa 38592051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 497 - 742
Target Start/End: Original strand, 43348319 - 43348563
Alignment:
Q  497 gtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttta 596  Q
    ||||| |||||  ||||||||||  | || |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43348319 gtgagcaacaccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 43348417  T
Q  597 tcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa 696  Q
    || |||||| ||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  43348418 tcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataa 43348517  T
Q  697 aatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 742  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43348518 aatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 427 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 51213166 - 51212955
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||     
T  51213166 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgg 51213067  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  51213066 catcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 51212967  T
Q  627 agagtgtaacac 638  Q
    | ||||||||||    
T  51212966 aaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 27480564 - 27480151
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |  |  ||| |||| |||| |||||||||| || |||| | || |||||| ||    | |||||||||  |||    
T  27480564 ggaaaattctatgatgaagtcatgagaatgatatttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtga 27480465  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc--- 623  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||       
T  27480464 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccaga 27480365  T
Q  624 ---------cacaga-gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacttt----gtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgta 709  Q
             | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  27480364 agtgtaacacccagaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgta 27480265  T
Q  710 agtccaagatgttg----caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaatt 805  Q
    ||||||| |||||     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  27480264 agtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaatt 27480165  T
Q  806 aacttttttaaaaa 819  Q
    |  ||||| |||||    
T  27480164 atatttttaaaaaa 27480151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 640 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212548
Alignment:
Q  640 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 739  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 51212644  T
Q  740 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa-gtcagttttttgactacac 838  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  51212643 aattactattgatcattaattaaaaatcaacaatttaaaaatgaa------attaagatcaaaattaactttttcaaaaatgtcagttttctgactgcac 51212550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 457 - 666
Target Start/End: Original strand, 53176076 - 53176284
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || |||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53176076 acttttctgatgaagttaacatcataacatcaaaaatgttgtaagtaatgtc-cactgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 53176174  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53176175 aattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgat 53176274  T
Q  657 atcatcaact 666  Q
    |||| |||||    
T  53176275 atcagcaact 53176284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 593 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373034
Alignment:
Q  593 tttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacg 692  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
Q  693 ataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaa 792  Q
    |||||||||||| | |||||||||                   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20373163 ataaaatagtacatataagtccaa-------------------gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 20373083  T
Q  793 taagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacca 840  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||    
T  20373082 taaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcacca 20373034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 421 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 20373487 - 20373303
Alignment:
Q  421 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 520  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| || |  | |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  20373487 taaaatggaaaattttatagtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgta 20373388  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttacctt 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20373387 caatgacatcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 20373303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 11835702 - 11835494
Alignment:
Q  538 cagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaat-tttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaac 636  Q
    |||||| ||||||||||||| || || | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  11835702 cagtccccatagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaac 11835603  T
Q  637 acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 736  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||      ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11835602 aattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcat------gatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaa 11835509  T
Q  737 atgaattactattga 751  Q
    |||||||||||||||    
T  11835508 atgaattactattga 11835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 622 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356930
Alignment:
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||   || ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgt 11357041  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaag 820  Q
    ||||||||||        |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11357040 tgcaagcatt--------aattactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 11356949  T
Q  821 tcagttttttgactacacc 839  Q
    |||||| | ||||| ||||    
T  11356948 tcagttgtctgactgcacc 11356930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 646 - 813
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475195
Alignment:
Q  646 tatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 745  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattag 50475120  T
Q  746 tattg-------atcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||||       ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  50475121 tattgatcattaatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaattttt 50475195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 641 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811597
Alignment:
Q  641 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||   |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaactttg----catgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
Q  741 attactatt 749  Q
    |||||||||    
T  53811605 attactatt 53811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 55343472 - 55343403
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaat 493  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  55343472 aaaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaat 55343403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Original strand, 33698183 - 33698259
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |    || ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  33698183 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaa----ttctctagtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacac 33698259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 11835790 - 11835701
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||| |     ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11835790 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatca-----aaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtaca 11835701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40640684 - 40640634
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  40640684 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 40640634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 819
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844630
Alignment:
Q  766 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaa 35844630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 483
Target Start/End: Original strand, 29163839 - 29163894
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataa 483  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  29163839 gaaaattttatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactataa 29163894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 53818555 - 53818509
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  53818555 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 53818509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 426 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 879760 - 879345
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  879760 aggaaaattttaaggtgaagtcatgagaataatttttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatg 879661  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  879660 acatcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctca 879561  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879560 caaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 879461  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactt-ttttaaaaagtcag 824  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  879460 agcattactagatgaattattattgatcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcag 879361  T
Q  825 ttttttgactacacca 840  Q
    |||| |||||||||||    
T  879360 ttttctgactacacca 879345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 424 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 35021249 - 35020829
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  35021249 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacat 35021150  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    || | |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35021149 tggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 35021050  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  35021049 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattg 35020950  T
Q  724 caagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa- 818  Q
    ||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35020949 caaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaag 35020850  T
Q  819 agtcagttttttgactacacc 839  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  35020849 agtcagttttctgactacacc 35020829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 427 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 19089664 - 19089280
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  19089664 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataacttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatga 19089565  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| ||    
T  19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctac 19089465  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089464 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 19089365  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  19089364 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 19089280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 37663951 - 37663560
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |  |||||| || ||||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37663951 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttgatgaagttaacacta--acattaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatg 37663854  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  37663853 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacacccca 37663754  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663753 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 37663654  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37663653 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttattaaaaa 37663560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 426 - 840
Target Start/End: Original strand, 25184112 - 25184527
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  25184112 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatg 25184211  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  25184212 acatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctca 25184311  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25184312 caaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 25184411  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25184412 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 25184511  T
Q  825 ttttttgactacacca 840  Q
    |||| ||||| |||||    
T  25184512 ttttctgactgcacca 25184527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 425 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 55478108 - 55477715
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcac----tgtttgta 520  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||  |||    ||||||||    
T  55478108 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgta 55478009  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||    
T  55478008 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaaca 55477909  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  55477908 ccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatg 55477809  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55477808 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttt 55477715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 19440860 - 19440458
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaa-gtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||    
T  19440860 ggaaaattctatggtgaaagtcatgagaatgacttttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatg 19440761  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  19440760 gcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacacccca 19440661  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    ||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19440660 caacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 19440561  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19440560 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 19440461  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  19440460 ttt 19440458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 28003197 - 28002796
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||  || |||| |||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||    
T  28003197 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtga 28003098  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 28002998  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28002997 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcta 28002898  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28002897 acattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 28002798  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  28002797 tt 28002796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 34361704 - 34361301
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  34361704 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaat 34361605  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  34361604 gacattaaaagttcag-cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 34361506  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34361505 acaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgc 34361406  T
Q  725 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34361405 aagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtc 34361306  T
Q  823 agttt 827  Q
    |||||    
T  34361305 agttt 34361301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 430 - 839
Target Start/End: Original strand, 6864038 - 6864448
Alignment:
Q  430 aaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 529  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| || ||| |||||    ||| ||||||||||  |||    
T  6864038 aaattgtatggtgatgtcatgagaatgacttttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcat 6864137  T
Q  530 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaga 629  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |    
T  6864138 caaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaa 6864237  T
Q  630 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca 729  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6864238 gtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagca 6864337  T
Q  730 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagtttt 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6864338 ttactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttt 6864437  T
Q  829 ttgactacacc 839  Q
     ||||| ||||    
T  6864438 ctgactgcacc 6864448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 25701271 - 25700875
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||||||||     
T  25701271 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgataatgacttttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacag 25701172  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-cc 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  25701171 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 25701072  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||| || ||||| ||    
T  25701071 ccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagatttt 25700972  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25700971 gcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 25700875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 32912793 - 32912389
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   | | |||||| |||    
T  32912793 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaat 32912694  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    || |||||||||||||  |||||| |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  32912693 gatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 32912594  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912593 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 32912494  T
Q  725 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||||||||    
T  32912493 aagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaattttttcaaaaaagtc 32912394  T
Q  823 agttt 827  Q
    |||||    
T  32912393 agttt 32912389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 36493897 - 36493508
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  36493897 aaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgaca 36493798  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || |||||     
T  36493797 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaa 36493699  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36493698 agtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagc 36493599  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  36493598 attactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaa 36493508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 422 - 839
Target Start/End: Original strand, 3042606 - 3043032
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |  | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  ||| |||| |||    
T  3042606 aaaaaggaaaattctatggtgaaatcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatacaaaatgtaatgagtaataccccaccgtttatac 3042705  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatca--------tcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 613  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||||        ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  3042706 aatgacatcaaaaattcagtcattagagtatcaatgtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataag 3042805  T
Q  614 cgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtc 713  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3042806 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtc 3042905  T
Q  714 caagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3042906 caacatgttgcaagcattactagatgaattagtattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 3043005  T
Q  814 -taaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
      ||||||||| ||| |||||| ||||    
T  3043006 caaaaaagtcaatttcttgactgcacc 3043032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 422 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 29584414 - 29584025
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  29584414 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctcactgtttgtac 29584317  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||    
T  29584316 aatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacac 29584217  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29584216 cccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgt 29584117  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29584116 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 29584025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 429 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 34948306 - 34947923
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | || ||    
T  34948306 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggcgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggca 34948207  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| | |||||||||||     
T  34948206 tcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaa 34948107  T
Q  629 agtgtaac--acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34948106 agtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaa 34948007  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactt 810  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34948006 gcattactagatgaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 34947923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 422 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 55241320 - 55240915
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  55241320 aaaatggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtac 55241221  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  55241220 agtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcagat-aagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 55241122  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55241121 ctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 55241022  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaag 820  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||    
T  55241021 tgcaaacattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttttcaaaaaag 55240922  T
Q  821 tcagttt 827  Q
    |||||||    
T  55240921 tcagttt 55240915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 7703517 - 7703910
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||  |||    
T  7703517 ggaaaattctatgttaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtga 7703616  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  7703617 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccac 7703708  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7703709 aaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaa 7703808  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7703809 gcattactagatgaattactatttatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 7703908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 535 - 834
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815708
Alignment:
Q  535 gttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgta 634  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  635 acacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattact 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattact 1815608  T
Q  735 agatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtcagttttttgact 834  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1815609 agatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaagtcaattttctgact 1815708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 457 - 839
Target Start/End: Original strand, 17173320 - 17173703
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  17173320 acttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatctccatagtatcatt 17173419  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173420 aattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 17173519  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  17173520 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatg 17173619  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  17173620 aataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcacc 17173703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 429 - 827
Target Start/End: Original strand, 47253751 - 47254141
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  || ||||| |||| |||||    
T  47253751 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacacc-cattgtttatacagtgaca 47253849  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  47253850 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 47253941  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  47253942 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagc 47254041  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47254042 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 47254141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Original strand, 33341397 - 33341790
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatg----tagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||    | | ||| |||||  ||||||||||||| |    
T  33341397 aaaattctatagtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaaattaacactatatcatcaaaattgattgttgcgaggaacaccccactgtttgtacagt 33341496  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  33341497 ggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctc 33341595  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  33341596 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgt 33341695  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  33341696 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttttaaaaa 33341790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 444 - 839
Target Start/End: Original strand, 23761089 - 23761484
Alignment:
Q  444 agtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcc 543  Q
    ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23761089 agtcatgagaatgactattcttgtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtcc 23761188  T
Q  544 tcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaag 643  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || | ||||| ||| |||||    
T  23761189 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatct-accttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaag 23761287  T
Q  644 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 743  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761288 actatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 23761387  T
Q  744 actattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  23761388 attattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactacacc 23761484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 457 - 827
Target Start/End: Original strand, 17167743 - 17168114
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  17167743 acttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcattctccatagtatcatt 17167842  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17167843 aattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 17167942  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17167943 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatt 17168042  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  17168043 aattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagttt 17168114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 424 - 827
Target Start/End: Original strand, 50697239 - 50697643
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |  |  | |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||   || ||||||||||    
T  50697239 aaaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgatttttttagtgaagtaaacactataacataaaaaatataacgagtaacaccctaccgtttgtacaa 50697338  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||     
T  50697339 tgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacacca 50697437  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgca-tgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50697438 cacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgtt 50697537  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagt 821  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  |||||||    
T  50697538 gtaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaagt 50697637  T
Q  822 cagttt 827  Q
    ||||||    
T  50697638 cagttt 50697643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 49375966 - 49376368
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaactttt-ctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  49375966 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgactttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtg 49376065  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||  ||||||    ||||||||    
T  49376066 gcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacacccca 49376165  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  49376166 caatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaa 49376265  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49376266 agcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 49376365  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  49376366 ttt 49376368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 429 - 827
Target Start/End: Original strand, 27396618 - 27397015
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||  ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27396618 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaatgaca 27396717  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||| |     
T  27396718 tcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataa 27396817  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27396818 agtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagc 27396917  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac-ttttttaaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27396918 attactagatgaattactattgatcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttttaaaaaatcagttt 27397015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 456 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 46888339 - 46887968
Alignment:
Q  456 aacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 555  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  46888339 aacttttctgatgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcagtccccatactatcgt 46888240  T
Q  556 cagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataa 655  Q
     | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  46888239 taattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacactta-gactatcacataa 46888141  T
Q  656 tatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat 755  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46888140 tatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcat 46888041  T
Q  756 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46888040 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 46887968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Original strand, 50764732 - 50765112
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||      
T  50764732 aaaggaaaattttatg---aagtcatgagaataacttttttgatgaagttaacacta--acatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacgg 50764826  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |          |||||||||    
T  50764827 tgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctacgt----------gtaacaccc 50764916  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||| |||||| || | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50764917 cacaaagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 50765016  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50765017 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaa 50765112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 459 - 819
Target Start/End: Original strand, 37775701 - 37776050
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||   |||  |||||||||||     
T  37775701 ttttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcccccct--tagtatcatcaa 37775798  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||         ||||| ||||    
T  37775799 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cacatgatat 37775889  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775890 cagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 37775989  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37775990 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttttaaaaa 37776050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 424 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 30002838 - 30002466
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |  |  | ||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  30002838 aaaggaaaactctatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacag 30002739  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30002738 tgacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 30002647  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||         ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  30002646 cacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttg 30002556  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30002555 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 30002466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 424 - 828
Target Start/End: Original strand, 32579441 - 32579848
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgt---a 520  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| || |||||||| |||  || |||||||   |    
T  32579441 aaaggaaaattttatggtgaagttctgagaatgacttttctggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgta 32579540  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    |  || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  32579541 cggtgccatcaaaagtttagtc-tcatagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaga 32579639  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
    || || | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32579640 cctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 32579739  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaa 819  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||    
T  32579740 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaa 32579839  T
Q  820 gtcagtttt 828  Q
    |||||||||    
T  32579840 gtcagtttt 32579848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 426 - 820
Target Start/End: Original strand, 42199728 - 42200123
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| || |  | |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||  || | |||||| ||||    
T  42199728 aggaaaaatctatggtgaaatcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgtagaatg 42199827  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  42199828 acataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacacccta 42199927  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacc-tgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42199928 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgc 42200027  T
Q  725 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaag 820  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  42200028 aagcattactagatgaatatactactgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatc-aaattaactttttcaaaaag 42200123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 430 - 839
Target Start/End: Original strand, 32592096 - 32592497
Alignment:
Q  430 aaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 529  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |  |||||| || |||||||||||||| | ||| |||| ||| | |||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  32592096 aaattttattgtgaagtcattataatgacttttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacat 32592195  T
Q  530 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaga 629  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  32592196 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 32592295  T
Q  630 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca 729  Q
    ||||||||||         || || || ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32592296 gtgtaacact---------catatgatttcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagca 32592386  T
Q  730 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagtttt 828  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  32592387 ttactaaatgaattactattgatcgttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttt 32592486  T
Q  829 ttgactacacc 839  Q
     ||||| ||||    
T  32592487 atgactgcacc 32592497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 429 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 33816742 - 33816326
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |  | |||||||||||||| |||| | ||  || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||  || ||    
T  33816742 aaaattatatgcttaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacattgtagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactatttatacggtggca 33816643  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca--- 625  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||       
T  33816642 tcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaa 33816543  T
Q  626 --------------cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaag 711  Q
                  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  33816542 agtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaag 33816443  T
Q  712 tccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 811  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33816442 tccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttt 33816343  T
Q  812 tt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||  |||||||||||||    
T  33816342 ttcaaaaaagtcagttt 33816326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 459 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 5048144 - 5047785
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||||||||  ||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||     
T  5048144 ttttctggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcagttcccatagtatcatcaa 5048045  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5048044 ttcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccg-caaaatgtaacacttaagactatcacatgatat 5047946  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  5047945 cataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagataaattattattgatcagtaa 5047846  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  5047845 tcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaa 5047785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Original strand, 37287732 - 37288121
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  37287732 aggaaaattctatggtgaagtaatgagaatgactttttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 37287831  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||||| ||||| |||    
T  37287832 ggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataag--------attaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgccc 37287923  T
Q  624 c-acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37287924 ccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 37288023  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataaga-tcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  37288024 gcaagcattattagatgaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaactttttcaaaaa 37288121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 428 - 827
Target Start/End: Original strand, 4597994 - 4598383
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  4597994 gaaaattttatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggc 4598092  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| | | || ||||||| |||||||||||||    
T  4598093 atcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgttttaagtgtaacaccccaca 4598191  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     |||||||||||         ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  4598192 aagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaag 4598282  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac-ttttttaaaaagtcagtt 826  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  4598283 cattattagattaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttacaaaaagtcagtt 4598382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 464 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 4934375 - 4934012
Alignment:
Q  464 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttca 562  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4934375 tggtgaagttaacactag--tataaaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttca 4934278  T
Q  563 ttagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 662  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4934277 tcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatc 4934178  T
Q  663 aactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcac 762  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||           |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||     
T  4934177 aactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaatcag 4934089  T
Q  763 taatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactt-ttttaaaaagtcagttttttgactaca 837  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4934088 taatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaacttgttcaaaaaagtcagtttattgactaca 4934012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 526 - 813
Target Start/End: Original strand, 17272067 - 17272350
Alignment:
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17272067 acatcaaaagttcagtc----tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacccca 17272162  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
       ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17272163 tgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 17272262  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17272263 agcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 17272350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 421 - 742
Target Start/End: Original strand, 38011848 - 38012169
Alignment:
Q  421 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 520  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| || |||  |||||||||||    
T  38011848 taaaaaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgta 38011947  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  38011948 cggtgccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaaca 38012047  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
     |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38012048 tcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 38012147  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaat 742  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  38012148 ttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 425 - 812
Target Start/End: Original strand, 9139245 - 9139612
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| |    
T  9139245 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaattgacttttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaat--agtgagtaacaccccaccgtttgtacagt 9139342  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||     
T  9139343 gacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccct 9139442  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||                || |||| ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  9139443 acaaagtgtaacacttaag----------------ataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgc 9139526  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9139527 aagcattactagacgaattactattgatcattaatcaataatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 9139612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 624 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 7152218 - 7152013
Alignment:
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7152218 cacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttg 7152119  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  7152118 caagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataactttttcaaaaaagtc 7152019  T
Q  823 agtttt 828  Q
    ||||||    
T  7152018 agtttt 7152013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 569 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883933
Alignment:
Q  569 taacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacttt 668  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaa-actatcacataatatcataaatttt 46884080  T
Q  669 gtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatca 768  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46884079 gtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 46883984  T
Q  769 acaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  46883983 acaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaa 46883933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 629 - 819
Target Start/End: Original strand, 26896289 - 26896480
Alignment:
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcc-aagatgttgcaag 727  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||     
T  26896289 agtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaaa 26896387  T
Q  728 cattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26896388 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaa 26896480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 426 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 35025800 - 35025530
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |  | |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||||||| |||  ||    
T  35025800 aggaaaattctatgctgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttg 35025701  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||| | || ||||| |||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||    
T  35025700 acatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcag--------attaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacacccca 35025609  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtac 704  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  35025608 gaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 655 - 827
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400409
Alignment:
Q  655 atatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 754  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatca 39400335  T
Q  755 ttaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39400336 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 39400409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 659 - 839
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205397
Alignment:
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4205216 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaa 4205315  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  4205316 taagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcacc 4205397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 689 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025379
Alignment:
Q  689 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 788  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
Q  789 acaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagt 825  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35025415 acattaa-atcaaaattaactttttcataaaagtcagt 35025379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 457 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 54499420 - 54499193
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac-aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  54499420 acttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagtatcat 54499321  T
Q  556 cagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacata 654  Q
    || ||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||     
T  54499320 caattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatg 54499221  T
Q  655 atatcatcaactttgtttgcatgttaaa 682  Q
    |||| |  |||| ||||| |||||||||    
T  54499220 atattagtaactctgtttccatgttaaa 54499193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 698 - 827
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431956
Alignment:
Q  698 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataaga 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaa 23431925  T
Q  798 tcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23431926 ttaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 23431956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 427 - 633
Target Start/End: Original strand, 39397918 - 39398115
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || |||||||||| |||    
T  39397918 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttatggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtga 39398017  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  39398018 catcaaaagttcagtcttctcagtatcatca---------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccac 39398108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 417 - 532
Target Start/End: Original strand, 4205106 - 4205221
Alignment:
Q  417 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||||    
T  4205106 ttaataaaaaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtt 4205205  T
Q  517 tgtacaatgacatcaa 532  Q
    ||||||||||||||||    
T  4205206 tgtacaatgacatcaa 4205221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 733 - 819
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012654
Alignment:
Q  733 ctagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 38012654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 666 - 731
Target Start/End: Original strand, 56050169 - 56050234
Alignment:
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 731  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56050169 tttgtttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 507
Target Start/End: Original strand, 4396324 - 4396406
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 507  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |  |  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4396324 aaggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgacttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacac 4396406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 483
Target Start/End: Original strand, 52516599 - 52516653
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52516599 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttatggtgaagttaacactataa 52516653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 475
Target Start/End: Original strand, 2704510 - 2704560
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  2704510 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 2704560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7152319 - 7152237
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   |  ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||    
T  7152319 aaggaaaattctatggtgaagtcatgctaatgacttttctggtaaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagtaacac 7152237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 483
Target Start/End: Original strand, 17272009 - 17272067
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataa 483  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17272009 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataa 17272067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 38812310 - 38812260
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  38812310 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 38812260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20097537 - 20097485
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactat 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  20097537 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaaccctat 20097485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 23518473 - 23518400
Alignment:
Q  468 gaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagt 541  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||| ||||||    
T  23518473 gaagttaacactataacattaaaactgtagtgactaacaccccactgttaatacagtggcatcaaaaattcagt 23518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 428 - 840
Target Start/End: Original strand, 10922724 - 10923137
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10922724 gaaaattttatggtgaaatcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgac 10922823  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||    
T  10922824 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcaca 10922923  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10922924 aagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaag 10923023  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa-agtcagtt 826  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10923024 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaagagtcagtt 10923123  T
Q  827 ttttgactacacca 840  Q
    || ||||| |||||    
T  10923124 ttctgactgcacca 10923137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 464 - 839
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216464
Alignment:
Q  464 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 563  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
Q  564 tagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 663  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 32216287  T
Q  664 actttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcact 763  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32216288 actctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagt 32216387  T
Q  764 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32216388 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcacc 32216464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 429 - 839
Target Start/End: Original strand, 15752027 - 15752438
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15752027 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggca 15752126  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |     
T  15752127 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataa 15752226  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||      
T  15752227 agtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatt 15752326  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa-cttttttaaaaagtcagttt 827  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  15752327 tttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttttaaaaaatcaattt 15752426  T
Q  828 tttgactacacc 839  Q
    | ||||| ||||    
T  15752427 tctgactgcacc 15752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Original strand, 32267027 - 32267422
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  32267027 aaaggaaaattttatggtgaagtcataagaatgactttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 32267126  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |    
T  32267127 tgacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactc 32267226  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32267227 cacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttg 32267326  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  32267327 caagcattactagatgaattactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaa 32267422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 427 - 820
Target Start/End: Original strand, 23999343 - 23999737
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||  |||| |||||| |||||    
T  23999343 ggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatga 23999442  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||    
T  23999443 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 23999542  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999543 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 23999642  T
Q  727 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaag 820  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23999643 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaag 23999737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Original strand, 2959743 - 2960136
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||   ||||||||||||| ||    
T  2959743 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtg 2959842  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  2959843 acatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatccca 2959942  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2959943 caaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgca 2960042  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2960043 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 2960136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Original strand, 16415639 - 16416034
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-tcactgtttgtacaa 523  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  | | ||||||||||     
T  16415639 aaggaaaattctaaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacag 16415738  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  16415739 tggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 16415838  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16415839 cacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 16415938  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16415939 caagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaa 16416034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Original strand, 30254419 - 30254820
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |  |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30254419 aggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaataca-cactgtttgtacaatg 30254517  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  30254518 acatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacacccta 30254617  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30254618 taaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgca 30254717  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcag 824  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30254718 agcattactagatgaattactattgattattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 30254817  T
Q  825 ttt 827  Q
    |||    
T  30254818 ttt 30254820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 27227657 - 27227265
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||| |      ||| |||||||||||||| ||     
T  27227657 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtact------cacctcactgtttgtacagtgg 27227566  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27227565 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 27227466  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27227465 aaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 27227366  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtcagtt 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  27227365 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaacttttccaaaaagtcggtt 27227266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 467 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 28564921 - 28564571
Alignment:
Q  467 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattag 566  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  28564921 tgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcat 28564822  T
Q  567 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 666  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28564821 attaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacacttaa--ctatcacataatatcatcaact 28564724  T
Q  667 ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaat 766  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28564723 ctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataat 28564624  T
Q  767 caacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28564623 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 28564571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 426 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 10182189 - 10181802
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  10182189 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtg 10182090  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  10182089 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 10181990  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacc-tgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10181989 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgc 10181890  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10181889 aagcattactagatgaattactattgaacattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 10181802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Original strand, 15382927 - 15383322
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |  |  |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||    
T  15382927 aaggaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaat 15383026  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15383027 gtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacccc 15383126  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15383127 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgc 15383226  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15383227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 15383322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 426 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 19899950 - 19899563
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19899950 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatg 19899851  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |    
T  19899850 gcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacacccta 19899751  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19899750 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 19899651  T
Q  726 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19899650 agcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 19899563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 457 - 788
Target Start/End: Original strand, 51128885 - 51129216
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51128885 acttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatc 51128984  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51128985 aattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataat 51129084  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129085 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 51129184  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 788  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51129185 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 51129216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 417 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 238702 - 238301
Alignment:
Q  417 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 516  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||   |||||||    
T  238702 ttaatataaagaaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatc-cactgtt 238604  T
Q  517 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  238603 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgt 238504  T
Q  617 aacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 716  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||    
T  238503 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaa 238404  T
Q  717 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaa 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    
T  238403 gatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaactttttcaa 238304  T
Q  817 aaa 819  Q
    |||    
T  238303 aaa 238301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 38823210 - 38823611
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| ||     
T  38823210 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgt 38823309  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaac 38823409  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  38823410 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaa 38823509  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38823510 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 38823609  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  38823610 tt 38823611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Original strand, 28769651 - 28770041
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||||||||||||| |  | ||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  28769651 aaaattctatggtgaagtcataaaaataactttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacacc-caccgtttgtacaatggca 28769749  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc-aca 627  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||    
T  28769750 tcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccaca 28769849  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28769850 aagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaa 28769949  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  28769950 cattgctagatgaattactattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaa 28770041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 457 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 9903204 - 9902842
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9903204 acttttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccacatactatcatc 9903105  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9903104 aattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataat 9903005  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9903004 atcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaattactattgatcatt 9902905  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9902904 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 9902842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 457 - 819
Target Start/End: Original strand, 37451312 - 37451673
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37451312 acttttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatc 37451410  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451411 aatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacataat 37451510  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451511 atcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcatt 37451610  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  37451611 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaa 37451673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 425 - 834
Target Start/End: Original strand, 8222125 - 8222532
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  |  || ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||    
T  8222125 aaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgacctttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---acaat 8222221  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  8222222 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacacccc 8222321  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8222322 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 8222421  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  8222422 aagcattactagatgaatta-tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtc 8222520  T
Q  823 agttttttgact 834  Q
    |||||| |||||    
T  8222521 agttttctgact 8222532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 27267376 - 27266980
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||     
T  27267376 ggaaaattatatg-tgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtgg 27267280  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  27267279 cattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatct-accttgttttgagtgtaacaccccac 27267181  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27267180 aaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaa 27267081  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtcagtt 826  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27267080 gcattactagatgaattactattgataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaagtcagtt 27266981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 433 - 819
Target Start/End: Original strand, 47279191 - 47279577
Alignment:
Q  433 ttttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaa 532  Q
    |||| ||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||| |    
T  47279191 ttttttggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcga 47279290  T
Q  533 aagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtg 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||| | ||||    
T  47279291 aagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtg 47279390  T
Q  633 taacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatta 732  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47279391 taacacttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacatta 47279490  T
Q  733 ctagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  47279491 ttagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 47279577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 428 - 827
Target Start/End: Original strand, 14758038 - 14758429
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  || |    
T  14758038 gaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggc 14758137  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  14758138 atcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaga 14758237  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     |         ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14758238 aa---------ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 14758328  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagtt 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14758329 cattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 14758428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 7079254 - 7078851
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-----------tcactgt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||            |||||||    
T  7079254 ggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgt 7079155  T
Q  516 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcg 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  7079154 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtg 7079055  T
Q  616 taacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcca 715  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| |    
T  7079054 taacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtcta 7078955  T
Q  716 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta 815  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |    
T  7078954 agatattgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttca 7078855  T
Q  816 aaaa 819  Q
    ||||    
T  7078854 aaaa 7078851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 427 - 834
Target Start/End: Original strand, 42721035 - 42721439
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  | |||| ||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  42721035 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaa 42721134  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 42721234  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42721235 aaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaa 42721331  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtcagtt 826  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  42721332 ttattactagattaattactattgatcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttttaaaaaatcaatt 42721431  T
Q  827 ttttgact 834  Q
    || |||||    
T  42721432 ttctgact 42721439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 424 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 34012560 - 34012161
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |  || ||| || ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  34012560 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttatgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaag 34012461  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||    
T  34012460 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34012361  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| | ||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34012360 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttg 34012266  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtc 822  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34012265 caagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 34012166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 466 - 827
Target Start/End: Original strand, 46931446 - 46931807
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  46931446 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatca 46931545  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931546 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 46931643  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcacta 764  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  46931644 tctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaatcagta 46931743  T
Q  765 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46931744 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 46931807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 514 - 814
Target Start/End: Original strand, 25160715 - 25161016
Alignment:
Q  514 gtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 613  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  25160715 gtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataag 25160814  T
Q  614 cgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtc 713  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  25160815 tgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtc 25160914  T
Q  714 caagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  25160915 caagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaaccttt 25161014  T
Q  813 tt 814  Q
    ||    
T  25161015 tt 25161016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 427 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 47682673 - 47682260
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||    
T  47682673 ggaaaattttatggtgaagtcatgagagtgacttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtg 47682576  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | |||| ||||||| |||||||| ||    
T  47682575 gtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctca 47682476  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47682475 caaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgca 47682376  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactt-ttttaaaaagtcag 824  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  47682375 agcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaacttgttcaaaaaagtcag 47682276  T
Q  825 ttttttgactacacca 840  Q
    |||  ||||| |||||    
T  47682275 tttactgactgcacca 47682260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 426 - 791
Target Start/End: Original strand, 18422646 - 18423004
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  18422646 aggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 18422745  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  18422746 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacacccca 18422845  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18422846 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgca 18422945  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422946 agcattgctagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 18423004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 466 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 27763451 - 27763098
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |    
T  27763451 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacc-catagtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatca 27763353  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27763352 ggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaac 27763253  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcacta 764  Q
    | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27763252 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatatactattgatcattaatcagta 27763153  T
Q  765 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27763152 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 27763098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 422 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 11742535 - 11742156
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  11742535 aaaaaggaaaattttatcgtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtac 11742436  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||            
T  11742435 agtgacatcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaag-------- 11742345  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
             ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11742344 ---------tgtaacaattaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 11742254  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  11742253 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 11742156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 427 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 30327132 - 30326751
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |  |  |||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||   || |||||||||||      
T  30327132 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgactttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatag 30327033  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  30327032 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 30326933  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  30326932 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaa 30326833  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaa 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  30326832 gcattactagatgaattactattgatcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 423 - 827
Target Start/End: Original strand, 1547279 - 1547668
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  1547279 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgca 1547378  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  1547379 gtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcag--------attaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacc 1547470  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||        ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1547471 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 1547562  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagt 821  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  1547563 gcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagt 1547662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 440 - 812
Target Start/End: Original strand, 4330288 - 4330662
Alignment:
Q  440 gtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa-cactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagtt 537  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||| |||||||||||||||  | | |||||||||| ||  ||||||||||    
T  4330288 gtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagataaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagtt 4330387  T
Q  538 cagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaaca 637  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4330388 cagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaaca 4330487  T
Q  638 cttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4330488 cttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactaga 4330587  T
Q  738 tgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4330588 tgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 4330662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Original strand, 15168082 - 15168484
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||      
T  15168082 aaaggaaaattctatcgtgaagtgatgagaatgctttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacgt 15168181  T
Q  524 tga-------catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 616  Q
    ||        ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  15168182 tgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgt 15168281  T
Q  617 aacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 716  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15168282 aacacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaa 15168381  T
Q  717 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaa 816  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15168382 gatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaa 15168481  T
Q  817 aaa 819  Q
    |||    
T  15168482 aaa 15168484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 457 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 27533130 - 27532770
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| | | ||| ||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27533130 acttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagtatcatc 27533031  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27533030 aattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatgat 27532932  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532931 atcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 27532832  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27532831 aatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 27532770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 466 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 27564046 - 27563700
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||| ||| |||| ||||| |    
T  27564046 gtgaagttaacactataactttaaaaatatagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatca 27563947  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27563946 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaac 27563847  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 765  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27563846 tctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaa 27563747  T
Q  766 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27563746 tcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaactttt 27563700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 424 - 839
Target Start/End: Original strand, 3534925 - 3535332
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| || |  | |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||     
T  3534925 aaaggaaaattctattatgaagtcattagaattaattttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcag 3535024  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  3535025 tgacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccc 3535124  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||||         ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3535125 cacaaagtgtaacactta---------catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttg 3535215  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||| ||    
T  3535216 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaactttttaaaaaaaatc 3535315  T
Q  823 agttttttgactacacc 839  Q
    |||||  ||||||||||    
T  3535316 agtttcatgactacacc 3535332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Original strand, 39393376 - 39393772
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||     
T  39393376 aaaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacag 39393475  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  39393476 tggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatc 39393575  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39393576 ctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgtt 39393675  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  39393676 gcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaa 39393772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 422 - 813
Target Start/End: Original strand, 3309139 - 3309536
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  3309139 aaaatggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc-cactgtttgtac 3309237  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    | ||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||||  ||||||    
T  3309238 agtggtatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaaca 3309337  T
Q  621 ccccacag-----agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcca 715  Q
    || |||       |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3309338 cctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtcca 3309437  T
Q  716 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataaga-tcaaaattaacttttt 813  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  3309438 agatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaacttttt 3309536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 526 - 819
Target Start/End: Original strand, 22170806 - 22171099
Alignment:
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||||||||    
T  22170806 acatcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacacccca 22170905  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  22170906 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgca 22171005  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22171006 aacattattagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 22171099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 31621733 - 31621327
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||| || |||  |||| |||||| |||  | || |||||||  ||     
T  31621733 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtgg 31621634  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | || ||||||     
T  31621633 catcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccccag 31621534  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa-----agattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||     ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  31621533 a-agtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgt 31621435  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaattta-aaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaa 819  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  31621434 tgcaagcattagtagatgaactactattgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 31621335  T
Q  820 gtcagttt 827  Q
    ||||||||    
T  31621334 gtcagttt 31621327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 422 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 37619081 - 37618729
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc--actgtttgt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||| |  |||||||||    
T  37619081 aaaaaggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgt 37618982  T
Q  520 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtat--catcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgta 617  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  37618981 aaaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcata 37618882  T
Q  618 acaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaag 717  Q
    ||| |||| | |||||||||||         || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37618881 acatcccataaagtgtaacact---------catataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaag 37618791  T
Q  718 atgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37618790 atgttgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaatcaataatcaacaatttaaaa 37618729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 459 - 819
Target Start/End: Original strand, 40884841 - 40885202
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| |||     
T  40884841 ttttctggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaa 40884940  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||  ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40884941 ttcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatat 40885040  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885041 catcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaa 40885140  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaa-ttaacttttttaaaaa 819  Q
    | |  |||||| |||| ||||||||||| || | |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  40885141 ttagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaaggttaaaagttaacatttttaaaaa 40885202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 429 - 812
Target Start/End: Original strand, 41926161 - 41926537
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |  | |||| || ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| |   ||||||||||||| || ||    
T  41926161 aaaattctatggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggca 41926260  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||     
T  41926261 tcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa 41926360  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    |||||||||||      ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  41926361 agtgtaacact------tattaaataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagc 41926453  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  41926454 attactagatgaattactattgatcattaattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaattttt 41926537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 623 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 1359919 - 1359703
Alignment:
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1359919 ccacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgtt 1359820  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtc 822  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||| |||||    
T  1359819 gcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaattttttttttttaacaagtc 1359720  T
Q  823 agttttttgactacacc 839  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  1359719 agttttctgactgcacc 1359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 527 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 33725680 - 33725399
Alignment:
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||     
T  33725680 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccag 33725581  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  33725580 aaagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaa 33725481  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatt-taaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
     |            |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  33725480 ac------------attactattgatcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaactttttcaaaaa 33725399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 623 - 819
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353930
Alignment:
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatatt 48353833  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  48353834 gcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 48353930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 421 - 709
Target Start/End: Original strand, 48620627 - 48620906
Alignment:
Q  421 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 520  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || |  |  |||||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  48620627 taaaaaggaaaattctatgttgaagttattaaaatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 48620726  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  48620727 cagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca 48620826  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgta 709  Q
    ||||||| ||||||||||         |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||    
T  48620827 ccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgta 48620906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 487 - 744
Target Start/End: Original strand, 38759583 - 38759846
Alignment:
Q  487 aaaaaatgtagtgagtaacacatcact--gtttgtacaatgacatcaaaagttcag----tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattac 580  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||    || || || |||||||| ||||| | ||||| || | |||    
T  38759583 aaaaaatatagtgagtaacacctcgctctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactac 38759682  T
Q  581 acttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgtta 680  Q
    | ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38759683 atttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgtta 38759782  T
Q  681 aagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 744  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38759783 aaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 645 - 840
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21290010
Alignment:
Q  645 ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 744  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21289817 ctatcacataatatca---actctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatta 21289913  T
Q  745 ctattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt-ttaaaaagtcagttttttgactacacca 840  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||||    
T  21289914 ttattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagtcagttttttaactgcacca 21290010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 668 - 827
Target Start/End: Original strand, 31962853 - 31963014
Alignment:
Q  668 tgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatc 767  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  31962853 tgtttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatc 31962952  T
Q  768 aacaa-tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31962953 aacaattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 31963014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 575
Target Start/End: Original strand, 21289661 - 21289816
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactata------ata-taaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgt 519  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21289661 ggaaaaatctattgtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatatcataaataataaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgt 21289760  T
Q  520 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaag 575  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21289761 acagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 1360022 - 1359932
Alignment:
Q  467 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1360022 tgaagttaatactataacattaaaaatatagtga-taatatttcagtgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcag 1359932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 758 - 827
Target Start/End: Original strand, 48620916 - 48620986
Alignment:
Q  758 atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48620916 atcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 48620986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 526
Target Start/End: Original strand, 30254853 - 30254952
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |  |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  30254853 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatggataacac-ccactgtttgtacaatg 30254951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 430 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 6091363 - 6090953
Alignment:
Q  430 aaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 529  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  6091363 aaattctattgtgaagtcatgaaaataatttttttggtaaagttaaca-tgtaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccat 6091265  T
Q  530 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaga 629  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  6091264 caaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaa 6091165  T
Q  630 gtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6091164 gtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 6091065  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6091064 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtaagttt 6090965  T
Q  828 tttgactacacc 839  Q
    | ||||| ||||    
T  6090964 tctgactgcacc 6090953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 3880124 - 3879731
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  3880124 aggaaaattctatggtgaagtcacgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatg 3880025  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  3880024 acatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacacccca 3879925  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3879924 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgca 3879825  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  3879824 agcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 3879731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Original strand, 5627389 - 5627784
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||| |||||| |||    
T  5627389 aaggaaaattctaaggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaat 5627488  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||     
T  5627489 gacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccct 5627588  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5627589 acaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 5627688  T
Q  725 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5627689 aagcattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaatttttttaaaaa 5627784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Original strand, 1945831 - 1946237
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  1945831 aaggaaaattctacggtgaagtcataagaatgactttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaa 1945930  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1945931 tgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccc 1946030  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1946031 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtta 1946130  T
Q  724 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt--aaaaag 820  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  1946131 caagcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttcaaaaaag 1946230  T
Q  821 tcagttt 827  Q
    |||||||    
T  1946231 tcagttt 1946237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 418 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 4319016 - 4318626
Alignment:
Q  418 taataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgttt 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||  ||||||||    
T  4319016 taataaaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgttt 4318917  T
Q  518 gtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgt 616  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  4318916 gtacagtgacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgt 4318817  T
Q  617 aacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 716  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||  | ||||||||    
T  4318816 aacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaa 4318717  T
Q  717 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  4318716 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaa 4318626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 7235218 - 7234824
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||     
T  7235218 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttccggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgc 7235119  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  7235118 catcaaaagttcagtc-tcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 7235020  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7235019 aaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 7234920  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaat---cactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7234919 acattactagatgaattactattgatcattaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 7234824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 457 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 21017266 - 21016913
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21017266 acttttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatc 21017167  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017166 aattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 21017067  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21017066 atcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatg 21016973  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaa 816  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  21016972 aatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaacttttttaa 21016913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 428 - 819
Target Start/End: Original strand, 20768087 - 20768474
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| ||   || |||||||  | || |    
T  20768087 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcatc-cattgtttgtt-agtggc 20768184  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||| |    
T  20768185 atcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccata 20768282  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20768283 aagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaag 20768382  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20768383 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 20768474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Original strand, 8513232 - 8513622
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  8513232 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 8513331  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||      ||||||||     
T  8513332 acatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttt------taacaccct 8513425  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  8513426 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgc 8513525  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||    
T  8513526 aagcattactagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtca 8513618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Original strand, 29182165 - 29182553
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||  || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  29182165 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgattttattgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtgtca 29182264  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccccaca 627  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  29182265 tcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccata 29182364  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29182365 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaag 29182464  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||    
T  29182465 tattactagatgaattac---tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaactttttcaaaaa 29182553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 33893186 - 33892795
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || | || |||| | |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33893186 ggaaaattctatggtaaagtcattagaataatttttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 33893087  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||    
T  33893086 tattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccac 33892988  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||         ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33892987 aaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 33892897  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  33892896 acattactaaatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 33892797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 429 - 813
Target Start/End: Original strand, 6088910 - 6089282
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| | || ||    
T  6088910 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggca 6089009  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||      ||| | |||    
T  6089010 tcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cactctaca 6089103  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
      || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6089104 aggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaag 6089203  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  6089204 cattactatatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaatttttt 6089282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Original strand, 33618834 - 33619225
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| || |||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || | |||||||  ||     
T  33618834 ggaaaattctacggtgaagtcatgggaaatacttttctggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtgg 33618933  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||        || ||||||||| |     
T  33618934 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc--------agtgtaacaccctag 33619025  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa-----agattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33619026 a-agtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgt 33619124  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcatta---atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  33619125 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaactttttaaaaa 33619224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 426 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 7055400 - 7055141
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  7055400 aggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatg 7055301  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||| | |    
T  7055300 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgcta 7055201  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 685  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  7055200 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagat 7055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 429 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 30353540 - 30353256
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| | |||||| |  |||||||||||||| || ||    
T  30353540 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggca 30353441  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||     
T  30353440 tcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaa 30353341  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtc 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30353340 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 457 - 696
Target Start/End: Original strand, 15491645 - 15491884
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| || |||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15491645 acttttctcgtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatc 15491744  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||    
T  15491745 aattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgat 15491844  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa 696  Q
    |||| ||| | |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  15491845 atcagcaattctgtttggatgttaaagatgctaacgataa 15491884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 680 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 7054704 - 7054543
Alignment:
Q  680 aaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaa 778  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7054704 aaagattccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaa 7054605  T
Q  779 aatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  7054604 gatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcacc 7054543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 421 - 557
Target Start/End: Original strand, 18498427 - 18498564
Alignment:
Q  421 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgt 519  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||| |||||  | || ||||||    
T  18498427 taaaaaggaaaaatctatagtgaagtcatgagaatgactttcctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgt 18498526  T
Q  520 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 557  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498527 acagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 18498564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 753 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
Q  753 cattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac 808  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 11084204 - 11084152
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  11084204 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttctggtaaagttaa 11084152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 475
Target Start/End: Original strand, 19631747 - 19631797
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  19631747 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttctggtgaagttaa 19631797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 429 - 812
Target Start/End: Original strand, 699152 - 699535
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  699152 aaaattttatggtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 699251  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||     
T  699252 tcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaa 699351  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  699352 agtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagc 699451  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  699452 attactagatgaattactattgattattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 699535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 439 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 27318650 - 27318249
Alignment:
Q  439 ggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 538  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27318650 ggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagttt 27318551  T
Q  539 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacac 638  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27318550 agttctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 27318451  T
Q  639 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 738  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||| |||||||| ||    
T  27318450 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac--ataagtttaagatgttgcaaacattactatat 27318353  T
Q  739 gaattactattgatcattaatcactaatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagttttttgactac 836  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  27318352 gaattactattgatcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgc 27318253  T
Q  837 acca 840  Q
    ||||    
T  27318252 acca 27318249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 428 - 840
Target Start/End: Original strand, 22980794 - 22981207
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||  |||||||||  |||||||    
T  22980794 gaaaattttatgatgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgac 22980893  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  22980894 atcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcaca 22980993  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  22980994 aaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaat 22981093  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac-ttttttaaaaagtcagtt 826  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22981094 cattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcagtt 22981193  T
Q  827 ttttgactacacca 840  Q
    |  ||||| |||||    
T  22981194 tcctgactgcacca 22981207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 35826660 - 35826269
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  35826660 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgactttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagt 35826561  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||    
T  35826560 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactcc 35826462  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35826461 acaaagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 35826364  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35826363 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaa 35826269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 38528413 - 38528020
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||  || ||||| |||| |    
T  38528413 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttctgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagt 38528314  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38528313 gacatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacacccc 38528215  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38528214 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgc 38528115  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38528114 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 38528020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 423 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 22974261 - 22973843
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||   |||||||||||||    
T  22974261 aaaaggaaaattctatggtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtaca 22974162  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    || |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  22974161 ataacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacc 22974062  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
     |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22974061 tcacaaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 22973962  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagt 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  22973961 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaaat 22973862  T
Q  822 cagttttttgactacacca 840  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  22973861 cagttttctgactgcacca 22973843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Original strand, 22255179 - 22255583
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatat-aaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22255179 aaggaaaactctacggtgaagtcataaaaataacttttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaa 22255278  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || || |||||||||||||     
T  22255279 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacacca 22255378  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255379 cacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 22255478  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtc 822  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22255479 caagccttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtc 22255578  T
Q  823 agttt 827  Q
    |||||    
T  22255579 agttt 22255583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 425 - 839
Target Start/End: Original strand, 36860421 - 36860837
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36860421 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 36860520  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttatttt-aagcgtaacaccc 623  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  36860521 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccc 36860620  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  36860621 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttg 36860720  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtc 822  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36860721 caagcattactaaatgaattactattaatcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtc 36860820  T
Q  823 agttttttgactacacc 839  Q
    | |||| ||||| ||||    
T  36860821 aattttctgactgcacc 36860837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 427 - 839
Target Start/End: Original strand, 36866762 - 36867175
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  36866762 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgg 36866861  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36866862 catcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 36866961  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  36866962 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 36867061  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaagtcagt 825  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36867062 acattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaat 36867161  T
Q  826 tttttgactacacc 839  Q
    ||| ||||| ||||    
T  36867162 tttctgactgcacc 36867175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 424 - 840
Target Start/End: Original strand, 24886099 - 24886501
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttct--ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24886099 aaaggaaaattttatggtgaaatcatgagaatgacttttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 24886198  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||            
T  24886199 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataag-------- 24886290  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24886291 ---------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 24886381  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaag 820  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24886382 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 24886481  T
Q  821 tcagttttttgactacacca 840  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  24886482 tcagtttcttgactgcacca 24886501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 428 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 31705785 - 31705374
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||   || ||||||||||||||    
T  31705785 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgac 31705686  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||    
T  31705685 atcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcaca 31705587  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31705586 aaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaag 31705487  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagtt 826  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  31705486 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 31705387  T
Q  827 ttttgactacacc 839  Q
    | |||||| ||||    
T  31705386 tcttgactgcacc 31705374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 422 - 827
Target Start/End: Original strand, 19119854 - 19120260
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 521  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |  ||||||||  ||||||||||||    
T  19119854 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttgtggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtac 19119953  T
Q  522 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 621  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  19119954 agtgacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacac 19120053  T
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19120054 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgt 19120153  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaag 820  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  19120154 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaag 19120253  T
Q  821 tcagttt 827  Q
    |||||||    
T  19120254 tcagttt 19120260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 31786821 - 31786420
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||| |  |||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |   |  ||||||||||||| ||     
T  31786821 ggaaaattctatagtgaagtagtgagaatgacttttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtgg 31786722  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  31786721 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctac 31786622  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31786621 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaa 31786522  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31786521 gcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 31786422  T
Q  826 tt 827  Q
    ||    
T  31786421 tt 31786420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 441 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 30969485 - 30969107
Alignment:
Q  441 tgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 540  Q
    |||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30969485 tgaagtcatgagaatgatttatctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcag 30969386  T
Q  541 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacactt 640  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  30969385 tcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactt 30969286  T
Q  641 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 740  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30969285 aagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagatga 30969186  T
Q  741 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  30969185 gttactattaatcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaa 30969107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 424 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 8742065 - 8741668
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtaca 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||    
T  8742065 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtaca 8741966  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  8741965 atggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacacc 8741866  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataat-atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8741865 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgt 8741766  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  8741765 tgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 8741668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 466 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 17158166 - 17157814
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | ||||| |    
T  17158166 gtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaattcatca 17158068  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 665  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17158067 gattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaac 17157968  T
Q  666 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 765  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17157967 tctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 17157868  T
Q  766 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||    
T  17157867 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgactttttcaaaaa 17157814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Original strand, 39572818 - 39573212
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||    
T  39572818 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagttaagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtg 39572917  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  39572918 acatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccca 39573017  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||         ||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39573018 caaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaact--------ctgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 39573109  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39573110 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcag 39573209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 427 - 839
Target Start/End: Original strand, 40133385 - 40133798
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||     
T  40133385 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttgtggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgg 40133484  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40133485 catcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 40133584  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  40133585 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 40133684  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  40133685 gcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaat 40133784  T
Q  826 tttttgactacacc 839  Q
    ||| ||||| ||||    
T  40133785 tttctgactgcacc 40133798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 459 - 839
Target Start/End: Original strand, 5829929 - 5830305
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataat----ataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatca 554  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5829929 ttttttggtgaagttaacattataattaacataaaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatca 5830028  T
Q  555 tcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacata 654  Q
    |||         |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5830029 tca---------attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacata 5830119  T
Q  655 atatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 754  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830120 atatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 5830219  T
Q  755 ttaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||||    
T  5830220 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttccaaaatgtcaattttctgactgcacc 5830305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 425 - 840
Target Start/End: Original strand, 12910348 - 12910769
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  12910348 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 12910447  T
Q  525 -----gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaac 619  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12910448 acagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 12910547  T
Q  620 accccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 719  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||   ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12910548 accccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagat 12910647  T
Q  720 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt-ttaaaa 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||    
T  12910648 gttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaa 12910747  T
Q  819 agtcagttttttgactacacca 840  Q
    |||||||||  ||||| |||||    
T  12910748 agtcagtttcctgactgcacca 12910769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 425 - 813
Target Start/End: Original strand, 27330304 - 27330690
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  27330304 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacaccttactgtttgtacaat 27330401  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  27330402 ggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacccc 27330501  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    |   ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27330502 atgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgc 27330601  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27330602 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27330690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 439 - 828
Target Start/End: Original strand, 33908245 - 33908634
Alignment:
Q  439 ggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 538  Q
    |||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  33908245 ggtgaagtcatgagaatgaactttctggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttc 33908344  T
Q  539 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacac 638  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  33908345 agtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacac 33908444  T
Q  639 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 738  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908445 ttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 33908544  T
Q  739 gaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagtttt 828  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33908545 -aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttt 33908634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 489 - 819
Target Start/End: Original strand, 35504427 - 35504757
Alignment:
Q  489 aaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatc 588  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  35504427 aaaatgtaatgagtaacacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaata 35504526  T
Q  589 taattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttt 688  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  35504527 taattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttc 35504626  T
Q  689 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 788  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35504627 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35504726  T
Q  789 acaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  35504727 acattaaaatcaaaattgactttttcaaaaa 35504757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 459 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 7209006 - 7208638
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| |  |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7209006 ttttttggtgaagttaacattgtaacataaaaaatgcaacgagtaacaccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaa 7208908  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208907 ttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 7208808  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
      |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7208807 tttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaa 7208708  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7208707 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttaaaaaaagtcagttt 7208638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 25501099 - 25500709
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||    
T  25501099 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgcca 25501000  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  25500999 tcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 25500900  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25500899 agtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagc 25500800  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  25500799 attactagatgaaatactgttgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaactttttcaaaaa 25500709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 7693230 - 7693622
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||     
T  7693230 ggaaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgg 7693329  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7693330 catcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 7693429  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||         |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  7693430 aaagtgtaacac---------tcacatgatattagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaa 7693520  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagt 825  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7693521 gcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttagaaaagtcagt 7693620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 35511652 - 35511256
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |  || |||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  35511652 ggaaaatcctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttctgatgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtga 35511553  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  35511552 catcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 35511453  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | | ||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35511452 aaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaa 35511358  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagt 825  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35511357 gcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 35511258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 429 - 840
Target Start/End: Original strand, 5837557 - 5837969
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| || |||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  5837557 aaaattctacggtgaattcatgagaatgacttttctggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 5837656  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||| ||||||||     
T  5837657 tcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaa 5837756  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5837757 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagc 5837856  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa-cttttttaaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  5837857 attactagatgaattactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcagttt 5837956  T
Q  828 tttgactacacca 840  Q
      ||||| |||||    
T  5837957 gatgactgcacca 5837969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 23116397 - 23116013
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  |  |||||| |  ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||     
T  23116397 ggaaaattctatggtgacgtcatgaaaatgactttttttatgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtgg 23116298  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  23116297 aatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 23116198  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116197 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 23116098  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||        | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23116097 gcattac--------tgactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 23116013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 510 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 15992632 - 15992314
Alignment:
Q  510 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattt 609  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  ||    
T  15992632 cactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatt 15992533  T
Q  610 taagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgta 709  Q
    | || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||    
T  15992532 tgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggta 15992433  T
Q  710 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaact 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15992432 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaact 15992333  T
Q  810 tttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  15992332 ttttcaaaaaagtcagttt 15992314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Original strand, 9200232 - 9200616
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  9200232 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtg 9200331  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||    
T  9200332 acatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattcca 9200431  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||||         |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  9200432 caaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgca 9200522  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  9200523 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttcaaaaa 9200616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Original strand, 15724490 - 15724880
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15724490 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatga 15724589  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||| || |    
T  15724590 catcaaa-gttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgcccc 15724687  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | |||||| || |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  15724688 aaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaa 15724787  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||    
T  15724788 gcattactagatgaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaactttttcaaaaa 15724880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Original strand, 35933901 - 35934288
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| || ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||| |||||        | ||    
T  35933901 aggaaaattgtatggtgaagtcatgagaatgatttttttgatgaagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactt-------agtg 35933993  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  35933994 gcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccct 35934093  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35934094 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgc 35934193  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  35934194 aagcattactagttgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaa 35934288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 22019632 - 22020024
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    ||||| || ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||| |||||||||||  || |||||||| | |||    
T  22019632 ggaaatttctatggtgaagttattagaatgacttttctggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtga 22019731  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22019732 catcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 22019831  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||| |||||||         ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  22019832 aaagtataacact---------cacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaa 22019922  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22019923 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 22020022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 459 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 21088908 - 21088541
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  21088908 ttttttggtgaagttaa-actgtagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaa 21088810  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
    ||||| | | |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21088809 ttcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatat 21088710  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21088709 catcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattaatcatgaa 21088610  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa--cttttttaaaaagtcagtttt 828  Q
    | | ||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  21088609 taaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaatttttttttaaaaagtcagtttt 21088541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 424 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 14919707 - 14919313
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctgg-tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| | | ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |    
T  14919707 aaaggaaaattatatggtgaagtcatgagaattattttttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatata 14919608  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  14919607 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacc 14919508  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
     |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||    |||||||||||| ||    
T  14919507 tcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatatt 14919412  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagt 821  Q
    |||| |      ||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  14919411 gcaatc------agatgaattac-attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagt 14919319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 428 - 827
Target Start/End: Original strand, 32563150 - 32563541
Alignment:
Q  428 gaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 527  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |  | ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  32563150 gaaaattctatggtgaagtcattaaaatgatttttctgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgac 32563249  T
Q  528 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 627  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32563250 atcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccaca 32563349  T
Q  628 gagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 727  Q
     ||||||||||         |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32563350 aagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 32563440  T
Q  728 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagtt 826  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32563441 aattactagataaattattattgatcattaatcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 32563540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 435 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 43308819 - 43308434
Alignment:
Q  435 ttatggtgaagtcatgagtacaacttttctg-gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaa 533  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| |  || ||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  43308819 ttatggtgaagtcatgagaatgactttttttagtaaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgaataacacc-cactgttcgtacaatggcatcaaa 43308721  T
Q  534 agttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgt 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||   | |||||    
T  43308720 agttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgt 43308621  T
Q  634 aacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattac 733  Q
    |||||||||||||||        |||||||||| |  ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43308620 aacacttaagactat--------atcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattac 43308529  T
Q  734 tagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43308528 tagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 43308434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 440 - 827
Target Start/End: Original strand, 8436979 - 8437366
Alignment:
Q  440 gtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 539  Q
    ||||||||||||| |  | |||| ||||||| |||||||||||   |  ||| ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8436979 gtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtgacatcaaaagttca 8437078  T
Q  540 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacact 639  Q
    ||||||||  ||||||||   ||| ||||| |||| | ||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||    ||||||||||  ||||||||||    
T  8437079 gtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacact 8437177  T
Q  640 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 739  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8437178 taagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattactagatg 8437277  T
Q  740 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8437278 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 8437366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 14409501 - 14409124
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||| ||  |||  ||     
T  14409501 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtgg 14409402  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||           
T  14409401 catcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaact------ 14409309  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
            || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409308 --------actcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaa 14409217  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  14409216 acattactaaatgaattactattgatcattattcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaaa 14409124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 469 - 827
Target Start/End: Original strand, 42342775 - 42343122
Alignment:
Q  469 aagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagat 568  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||  |   ||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  42342775 aagttaatactataacatcaaaaatgttgtgagtaataccccactgtttatacagtgacatcaaaaaatt--tccccttagtatcatcaattcatcagat 42342872  T
Q  569 taacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacttt 668  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||| |||||||||||         ||||| |||||||||||| |    
T  42342873 taacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact---------cacatgatatcatcaactct 42342962  T
Q  669 gtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatca 768  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42342963 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatca 42343062  T
Q  769 acaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42343063 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 42343122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 578 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 2888469 - 2888207
Alignment:
Q  578 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatg 677  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  2888469 tacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatg 2888370  T
Q  678 ttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaa 777  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2888369 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 2888270  T
Q  778 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  2888269 aaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcacc 2888207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 426 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 1429321 - 1428983
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  1429321 aggaaaaatctatggtgaagtcatgaaaatgactcttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactg 1429222  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||                
T  1429221 gcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaag------------ 1429134  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429133 -----tgtaacacttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 1429039  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa---tcaacaatttaaa 778  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  1429038 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaatttaaa 1428983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 425 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 13956522 - 13956187
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13956522 aaggaaaattctacggtgaagtcatgaaaatgacttttctcatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgtacact 13956423  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
      |||                || ||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||     
T  13956422 tgcat----------------at-gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccct 13956340  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13956339 acaaagcgtaacacttaagactatcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgc 13956240  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaa 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13956239 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 13956187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 485 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 23954907 - 23954563
Alignment:
Q  485 ataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa-tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacact 583  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  23954907 ataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacact 23954808  T
Q  584 taatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaag 683  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23954807 taatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa- 23954709  T
Q  684 attttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatga 783  Q
    ||   |||||||||||| ||  ||||||| |||||||     | ||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  23954708 atgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg-----aacattacttgatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatga 23954621  T
Q  784 atcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacca 840  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||    
T  23954620 attaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcacca 23954563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 425 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 5112490 - 5112250
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  5112490 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagt 5112391  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||    
T  5112390 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-acccc 5112292  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 666  Q
    ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5112291 acaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaact 5112250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 578 - 819
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669968
Alignment:
Q  578 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatg 677  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||         ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccaca-agtgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcatg 25669826  T
Q  678 ttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaa 777  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25669827 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 25669926  T
Q  778 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  25669927 aaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaa 25669968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 488 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 6824595 - 6824329
Alignment:
Q  488 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt--tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacactta 585  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  6824595 aaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacactta 6824496  T
Q  586 atctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 685  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  6824495 atctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagat 6824397  T
Q  686 tttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 754  Q
     | || ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6824396 gtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 440 - 685
Target Start/End: Original strand, 26268087 - 26268332
Alignment:
Q  440 gtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 539  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  26268087 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttta 26268186  T
Q  540 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacact 639  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  26268187 gtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacact 26268286  T
Q  640 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 685  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26268287 taagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagat 26268332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 425 - 819
Target Start/End: Original strand, 8466743 - 8467118
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||| ||||||  | || |||||||| |    
T  8466743 aaggaaaattctatgatgaggtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgtacagt 8466841  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||                
T  8466842 ggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaa----------- 8466930  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
          |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||| |||||| | | |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  8466931 ------tgtaacacttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaaggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgc 8467023  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  8467024 aagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaaacattaaaaataaaattaactttttaaaaaa 8467118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 641 - 812
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889755
Alignment:
Q  641 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 740  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatga 25889683  T
Q  741 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25889684 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 25889755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 689 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 28416464 - 28416334
Alignment:
Q  689 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 788  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  28416464 aacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaagaatcaa 28416365  T
Q  789 acaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28416364 acattaagattaaaattaactttttcaaaaa 28416334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 466 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416490
Alignment:
Q  466 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 565  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||   ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| |    
T  28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatca 28416564  T
Q  566 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacact 639  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 692 - 827
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269210
Alignment:
Q  692 gataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 791  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaccaatca 26269173  T
Q  792 ataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
     |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26269174 ttaagattaaaattaactttttcataaaagtcagttt 26269210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 726 - 812
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254240
Alignment:
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 43254240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 582
Target Start/End: Original strand, 25668687 - 25668804
Alignment:
Q  464 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 563  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  25668687 tggtgaagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 25668785  T
Q  564 tagattaacaagattacac 582  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25668786 tagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 429 - 563
Target Start/End: Original strand, 11898004 - 11898138
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| | ||||  || |||| || | ||||||||||   |||  ||||||| |||||    
T  11898004 aaaattttagggtgaagtcatgataataacttttctggtaaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccctactagttgtacagtgaca 11898103  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 563  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11898104 tcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 11898138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16004552 - 16004474
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaa 504  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16004552 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaattgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaa 16004474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26317859 - 26317779
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 507  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||    
T  26317859 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacac 26317779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 481
Target Start/End: Original strand, 13380498 - 13380549
Alignment:
Q  430 aaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactat 481  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13380498 aaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaaccctat 13380549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 475
Target Start/End: Original strand, 22616491 - 22616542
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  22616491 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 22616542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 36055923 - 36055874
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  36055923 aggaaaattttatggtgatgtcatgagaatgacttttcttgtgaagttaa 36055874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 252; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 424 - 811
Target Start/End: Original strand, 7884 - 8271
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || || |  |||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  7884 aaagaaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 7983  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||    
T  7984 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccc 8083  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8084 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 8183  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  8184 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 8271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 423 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 2325577 - 2325189
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  2325577 aaaaggaaaattctatggtgaagttatgtgaatgacttttctcgtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtaca 2325478  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2325477 ctggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacc 2325386  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2325385 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgtt 2325286  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2325285 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaa 2325189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 464 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 43648411 - 43648056
Alignment:
Q  464 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 563  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  43648411 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcat 43648312  T
Q  564 tagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 663  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648311 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatca 43648212  T
Q  664 actttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcact 763  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43648211 actttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagt 43648112  T
Q  764 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43648111 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 43648056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 427 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 33551189 - 33550778
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33551189 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 33551090  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  33551089 catcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccac 33550990  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  33550989 aaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaa 33550891  T
Q  727 gcattactagatgaattactattga----tcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac--ttttttaaaaag 820  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  33550890 gcattactagatgaataactattgattatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttttaaaaat 33550791  T
Q  821 tcagttttttgac 833  Q
    |||||||| ||||    
T  33550790 tcagttttctgac 33550778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 426 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 11366585 - 11366191
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  11366585 aggaaaattctatggtgaaatcataagaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatg 11366486  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| | |||||||| |    
T  11366485 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacacccta 11366386  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366385 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 11366286  T
Q  726 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  11366285 agcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaa 11366191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 425 - 839
Target Start/End: Original strand, 4166920 - 4167335
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  4166920 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 4167019  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  4167020 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 4167119  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4167120 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgc 4167219  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  4167220 aagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 4167319  T
Q  824 gttttttgactacacc 839  Q
     |||| ||||| ||||    
T  4167320 attttctgactgcacc 4167335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 827
Target Start/End: Original strand, 3176931 - 3177340
Alignment:
Q  419 aataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttg 518  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||| | ||  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||   ||||||||    
T  3176931 aataaagagaaaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttg 3177030  T
Q  519 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3177031 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaa 3177130  T
Q  619 caccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaaga 718  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3177131 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaaga 3177230  T
Q  719 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaa 817  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  3177231 tattacaagcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaa 3177330  T
Q  818 aagtcagttt 827  Q
    ||||||||||    
T  3177331 aagtcagttt 3177340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Original strand, 26357577 - 26357969
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  26357577 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtga 26357676  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||| || ||||  | |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  26357677 catcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 26357776  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26357777 aaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaa 26357876  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26357877 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaa 26357969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 427 - 827
Target Start/End: Original strand, 4763628 - 4764033
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaaca---ctataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 523  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||   |||||  |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  4763628 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacaacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacag 4763727  T
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  4763728 tgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccc 4763827  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4763828 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 4763927  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac--ttttttaaaaagt 821  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4763928 caagcattactagttgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttttaaaaagt 4764027  T
Q  822 cagttt 827  Q
    ||||||    
T  4764028 cagttt 4764033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 459 - 819
Target Start/End: Original strand, 37905740 - 37906103
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37905740 ttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 37905839  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca--ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37905840 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataat 37905939  T
Q  657 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 756  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37905940 atcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaattactattgatcatt 37906039  T
Q  757 aatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  37906040 aatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaa 37906103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 426 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 19424832 - 19424444
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || ||||| || | ||    
T  19424832 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaatggcttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtg 19424733  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19424732 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacacccca 19424633  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||              |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19424632 caaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaag--------------atagtacctgcaagtctaagatgttgca 19424547  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19424546 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcag 19424447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 425 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 31570939 - 31570536
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  |||| ||| || | |    
T  31570939 aaggaaaattctatggtgaagttatgagaataacttttctggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagt 31570840  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  31570839 gacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacccc 31570740  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  31570739 acaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgc 31570640  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||  |||||||||    
T  31570639 aagcattgctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaactttttaaaaaaagtca 31570540  T
Q  824 gttt 827  Q
    ||||    
T  31570539 gttt 31570536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 423 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 19289525 - 19289125
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    |||||||||||| |||||||||||||     |  |||||| || ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||  || ||||||||||    
T  19289525 aaaaggaaaattctatggtgaagtca-----atgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtaca 19289431  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| |    
T  19289430 atgacatcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatc 19289331  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19289330 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatatt 19289231  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagt 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19289230 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagt 19289131  T
Q  822 cagttt 827  Q
    ||||||    
T  19289130 cagttt 19289125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 425 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 39167568 - 39167170
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||| || |||||||||||  ||| ||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39167568 aaggaaaattttatggtgaagtcacgagaatgatttttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaat 39167469  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||    
T  39167468 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatccc 39167369  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  39167368 acaaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgc 39167275  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtca 823  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  39167274 tagcattactagatgaattactattaattatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 39167175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 526 - 819
Target Start/End: Original strand, 41960939 - 41961232
Alignment:
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41960939 acatcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 41961038  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41961039 caaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgca 41961138  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41961139 agcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 41961232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 459 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 33709403 - 33709043
Alignment:
Q  459 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33709403 ttttatggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 33709304  T
Q  559 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatat 658  Q
     |  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33709303 atattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatat 33709204  T
Q  659 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 758  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709203 cagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 33709104  T
Q  759 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  33709103 tcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaa 33709043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 429 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 33660569 - 33660179
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |  |||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| || ||    
T  33660569 aaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctagttaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggca 33660470  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  33660469 tcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 33660370  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||          ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  33660369 agtgtaacacc---------cacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagc 33660279  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta-aaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33660278 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 33660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 425 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 29242343 - 29241954
Alignment:
Q  425 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  29242343 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 29242244  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  29242243 ggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 29242144  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  29242143 acaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat----- 29242049  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagt 821  Q
      | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  29242048 --gaattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaagt 29241954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 427 - 819
Target Start/End: Original strand, 44913662 - 44914059
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcact-gtttgtacaatg 525  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  44913662 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttatg-tgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatg 44913760  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctc-atagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  44913761 acataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccc 44913860  T
Q  625 -acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44913861 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 44913960  T
Q  724 caagcattactag---atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  44913961 caagcattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaa 44914059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 427 - 832
Target Start/End: Original strand, 35958909 - 35959298
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |  |  |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35958909 ggaaaattctatgatgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatga 35959008  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||| ||||||||||            ||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  35959009 cattaaaagttcag------------catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccac 35959095  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||||    
T  35959096 aaagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaa 35959191  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  35959192 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaat 35959291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 426 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17071941 - 17071646
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||    
T  17071941 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatg 17071842  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17071841 acatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccca 17071742  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17071741 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 423 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 18494475 - 18494071
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  |||              
T  18494475 aaaaggaaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac---------- 18494386  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||    
T  18494385 --gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acc 18494289  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
     |||| || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18494288 tcacaaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 18494189  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagt 821  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  18494188 gtaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagt 18494089  T
Q  822 cagttttttgactacacc 839  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  18494088 cagtttcatgactacacc 18494071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 426 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 27350143 - 27349789
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaac-ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 524  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  27350143 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataatattttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagt 27350044  T
Q  525 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 624  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  27350043 gacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacacccc 27349945  T
Q  625 acagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    ||| ||||||||||         |||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27349944 acaaagtgtaacac---------tcacatgatatcaggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgc 27349854  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27349853 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 27349789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 426 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17054300 - 17054005
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  17054300 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatg 17054201  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17054200 acatcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccca 17054101  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17054100 caaagtgtaacacttaanactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 427 - 828
Target Start/End: Original strand, 41465509 - 41465903
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||| |||   |  | | |||          
T  41465509 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaggtgtagtgagtagcaccctaacgctggta------ 41465602  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
      |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||     
T  41465603 --tcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcag 41465700  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41465701 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 41465800  T
Q  727 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagt 825  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41465801 acattactatatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 41465900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 426 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 4264281 - 4263926
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  4264281 aggaaaattctatggtgaagtcatcataatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtg 4264182  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  4264181 acatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacacccca 4264082  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatc-acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 724  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  4264081 caaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgc 4263982  T
Q  725 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaa 780  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4263981 aagcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 523 - 827
Target Start/End: Original strand, 31861948 - 31862253
Alignment:
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  31861948 atgatatcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacacc 31862047  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||   || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31862048 ccacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt 31862147  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagt 821  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31862148 gtagacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagt 31862247  T
Q  822 cagttt 827  Q
    ||||||    
T  31862248 cagttt 31862253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 464 - 779
Target Start/End: Original strand, 4478406 - 4478717
Alignment:
Q  464 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 563  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4478406 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 4478505  T
Q  564 tagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 662  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||     | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  4478506 cagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac-----aaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcacc 4478600  T
Q  663 aactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcac 762  Q
    |||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4478601 aactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcag 4478700  T
Q  763 taatcaacaatttaaaa 779  Q
    |||||||||||||||||    
T  4478701 taatcaacaatttaaaa 4478717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 423 - 819
Target Start/End: Original strand, 13711460 - 13711851
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 522  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  13711460 aaaatgaaaattctatggtgaagtcatcagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtaca 13711559  T
Q  523 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 622  Q
     |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |      ||||||| ||||||||    
T  13711560 gtgacatcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcatg-----ttttaagtgtaacacc 13711654  T
Q  623 ccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 722  Q
    ||| | ||| ||| | |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13711655 ccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgtt 13711754  T
Q  723 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | | || |||||||| ||||| |||||    
T  13711755 gcaaacaatactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaattttttcaaaaa 13711851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 429 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 43771039 - 43770650
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||||||||||||| || |  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  43771039 aaaattctatggtgaagtcattagaatgattttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggca 43770941  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||     
T  43770940 tcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaa 43770841  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    |||||||||||         ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  43770840 agtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagc 43770750  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43770749 attactagatgaatttctattgatcattaattagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 43770650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 426 - 813
Target Start/End: Original strand, 5881533 - 5881915
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaa-----tgtagtgagtaacacatcactgtttgta 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |  ||||||||||||||||| | | ||||| || ||||      ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  5881533 aggaaaattttattgtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttgatattataacatcaaaacaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 5881632  T
Q  521 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 620  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| |    
T  5881633 cagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaata 5881731  T
Q  621 ccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 720  Q
    || |||| |||||||||||         ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5881732 cctcacaaagtgtaacact---------cacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatg 5881822  T
Q  721 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5881823 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattattcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 5881915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 429 - 761
Target Start/End: Original strand, 44285951 - 44286283
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| || |||||||||||| | |  | ||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| | ||| || |  |||||||||||| | || ||    
T  44285951 aaaattatacggtgaagtcatgcgaatgatttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctcactgtttgtatagtggca 44286050  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  44286051 tcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 44286150  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44286151 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagc 44286250  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatca 761  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44286251 attgttagatgaattactattgatcattaatca 44286283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 429 - 732
Target Start/End: Original strand, 36641988 - 36642293
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||  || |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36641988 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaaattaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcactgtttgtacagtgaca 36642087  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa--ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  36642088 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctac 36642187  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 726  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36642188 aaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaa 36642287  T
Q  727 gcatta 732  Q
    ||||||    
T  36642288 gcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 427 - 766
Target Start/End: Original strand, 19313852 - 19314186
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||| | ||| ||| |||| |||    
T  19313852 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtga 19313951  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19313952 catcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccac 19314050  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctg---taagtccaagatgttg 723  Q
    | ||||||||       |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||   |||||| |||||||||    
T  19314051 aaagtgtaac-------actatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttg 19314143  T
Q  724 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19314144 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 19314186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 497 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 7007054 - 7006749
Alignment:
Q  497 gtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttta 596  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7007054 gtgagtaacatcccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaatttta 7006955  T
Q  597 tcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa 696  Q
    || |||||| |||||||                 |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  7006954 tcataccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataa 7006872  T
Q  697 aatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataag 796  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7006871 aatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatg 7006772  T
Q  797 atcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  7006771 attaaaattaactttttcaaaaa 7006749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 524 - 732
Target Start/End: Original strand, 45327817 - 45328025
Alignment:
Q  524 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 623  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  45327817 tgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 45327916  T
Q  624 cacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 723  Q
    || | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45327917 cagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 45328016  T
Q  724 caagcatta 732  Q
    |||||||||    
T  45328017 caagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 622 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 19500923 - 19500706
Alignment:
Q  622 cccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 721  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  19500923 cccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgt 19500824  T
Q  722 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagt 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  |||||||    
T  19500823 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattattttttcaaaaaagt 19500724  T
Q  822 cagttttttgactacacca 840  Q
     | |||||||||| |||||    
T  19500723 -aattttttgactgcacca 19500706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 427 - 680
Target Start/End: Original strand, 33902068 - 33902319
Alignment:
Q  427 ggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 526  Q
    |||||||| |||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  33902068 ggaaaattctatgatgaagtcgttagaatgacttttctggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatga 33902165  T
Q  527 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 626  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  33902166 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccac 33902265  T
Q  627 agagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgtta 680  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33902266 aaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 429 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 41464051 - 41463779
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |  || ||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  41464051 aaaattctatggtgaagtcgtgagaatgacatttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggca 41463952  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||||     
T  41463951 tcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaa 41463852  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatag 701  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41463851 aatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 568 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258198
Alignment:
Q  568 ttaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactt 667  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 18258250  T
Q  668 tgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 719  Q
    | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  18258249 tctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagtaactgcaagtctaagat 18258198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 692 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 41051238 - 41051112
Alignment:
Q  692 gataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 791  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41051238 gataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatcaacaattcaaaaatgaatcaaaca 41051139  T
Q  792 ataagatcaaaattaacttttttaaaa 818  Q
     ||| || |||||||| ||||| ||||    
T  41051138 ttaaaattaaaattaattttttcaaaa 41051112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 700 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 41463520 - 41463396
Alignment:
Q  700 agtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatc 799  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||     
T  41463520 agtacctctaagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagatt 41463421  T
Q  800 aaaattaacttttttaaaaagtcag 824  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41463420 aaaattaactttttaaaaaaatcag 41463396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 730 - 819
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902406
Alignment:
Q  730 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaa 33902406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 715 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257340
Alignment:
Q  715 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||     
T  18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaactttttc 18257354  T
Q  815 a-aaaagtcagttt 827  Q
    | ||||||||||||    
T  18257353 acaaaagtcagttt 18257340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 765 - 827
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328091
Alignment:
Q  765 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 45328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 457 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 41051379 - 41051263
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa-tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 555  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||  || |||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051379 acttttctgatgaagctaatactatagcatcaaaagtgttgtgtataacacttcactatttgtaccagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 41051280  T
Q  556 cagttcattagattaac 572  Q
    || ||||| ||||||||    
T  41051279 caattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 475
Target Start/End: Original strand, 19093410 - 19093461
Alignment:
Q  424 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  19093410 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 19093461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053931
Alignment:
Q  756 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactt-ttttaaaaagtcagttttt 829  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||   || |||||||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaatttttttttattttaaaaagtcagttttt 17053931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071601
Alignment:
Q  756 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaa 801  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17071601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501773
Alignment:
Q  530 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttat 597  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttat 19501773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 475
Target Start/End: Original strand, 22963395 - 22963448
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  22963395 aaaatggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctggtaaagttaa 22963448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22998082 - 22998029
Alignment:
Q  422 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaa 475  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  22998082 aaaatggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctggtaaagttaa 22998029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 426 - 813
Target Start/End: Original strand, 133 - 514
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  133 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatg 232  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  233 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacacccca 332  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  333 taaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgca 426  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 813  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  427 agcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 488 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 408552 - 408203
Alignment:
Q  488 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 587  Q
    ||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  408552 aaaaatgtaatgagtaacaccttaccgtttgtaaaatgaaatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaat 408454  T
Q  588 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattt 687  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  408453 ctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattc 408354  T
Q  688 taacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatca 787  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  408353 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatca 408254  T
Q  788 aacaataagatcaaaattaacttttttaaaaagtcagttttttgactacacc 839  Q
    |||| ||| || |||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  408253 aacattaaaataaaaattaa-ttttttcaaaagttaattttttgactgcacc 408203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 656 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 94056 - 93893
Alignment:
Q  656 tatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat 755  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94056 tatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcat 93957  T
Q  756 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaag 820  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  93956 taatcactaatcaacaattt-aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaag 93893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 457 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 94538 - 94331
Alignment:
Q  457 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 556  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  94538 acttttctgatgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatactatcatc 94439  T
Q  557 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaagactatcacataat 656  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  94438 aattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataat 94339  T
Q  657 atcatcaa 664  Q
    ||||||||    
T  94338 atcatcaa 94331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 429 - 834
Target Start/End: Original strand, 43959 - 44364
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||||||||||| | || |  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||    
T  43959 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 44058  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||     
T  44059 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 44158  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44159 agtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagc 44257  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  44258 attactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagttt 44357  T
Q  828 tttgact 834  Q
     ||||||    
T  44358 gttgact 44364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 429 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 154828 - 154423
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| |||||||||||| | || |  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||    
T  154828 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 154729  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||     
T  154728 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 154629  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  154628 agtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagc 154530  T
Q  729 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttt 827  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  154529 attactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagttt 154430  T
Q  828 tttgact 834  Q
     ||||||    
T  154429 gttgact 154423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12300
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgta-caatg 525  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||  | | |||||||| || ||    
T  11908 aaaattctatggtgaagtcatgagaaatgacttttctggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtg 12007  T
Q  526 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 625  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  12008 gtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacacccca 12107  T
Q  626 cagagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 725  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12108 caaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgca 12207  T
Q  726 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12208 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaa 12300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 429 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 146199 - 145808
Alignment:
Q  429 aaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 528  Q
    |||||| || ||||||||||| || |  | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  || | |||||| |||||||    
T  146199 aaaattctacggtgaagtcataagaatgatttttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgaca 146100  T
Q  529 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacag 628  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||     
T  146099 tcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaa 146000  T
Q  629 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  145999 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagc 145900  T
Q  729 attactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 819  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  145899 attactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 145808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 475 - 840
Target Start/End: Original strand, 267331 - 267690
Alignment:
Q  475 acactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgttt-gtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaaca 573  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  267331 acactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacagtgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagca 267430  T
Q  574 agattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacagagtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactttgttt 672  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267431 agactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgttt 267530  T
Q  673 gcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaa 772  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||         |  ||||| ||||||||||    
T  267531 gcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaattactagatgaatta---------accaatcagtaatcaacaa 267621  T
Q  773 tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaagtcagttttttgactacacca 840  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  267622 tttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcacca 267690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 426 - 507
Target Start/End: Original strand, 42347 - 42428
Alignment:
Q  426 aggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  42347 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaataatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacac 42428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 648 - 772
Target Start/End: Original strand, 100948 - 101058
Alignment:
Q  648 tcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 747  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgat------------gtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta 101035  T
Q  748 ttgatcattaatcactaatcaacaa 772  Q
      |||||||||||| ||||||||||    
T  101036 --gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 500
Target Start/End: Original strand, 100817 - 100894
Alignment:
Q  423 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagtacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtga 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  100817 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaacgtagtga 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University