View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5072_low_5 (Length: 393)

Name: NF5072_low_5
Description: NF5072
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5072_low_5
NF5072_low_5
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (1-377)||(27604830-27605213)
chr6 (1-312)||(28780889-28781201)
chr6 (1-301)||(27228995-27229294)
chr6 (1-312)||(27724970-27725281)
chr6 (1-272)||(31284078-31284350)
chr6 (1-312)||(27698619-27698929)
chr6 (1-301)||(28786039-28786340)
chr6 (1-301)||(26802199-26802504)
chr6 (1-312)||(27718504-27718816)
chr6 (1-279)||(27611127-27611406)
chr6 (1-277)||(28792184-28792461)
chr6 (1-301)||(26655750-26656051)
chr6 (1-301)||(26761721-26762022)
chr6 (2-317)||(27338191-27338500)
chr6 (2-317)||(27398931-27399240)
chr6 (1-234)||(26622805-26623038)
chr6 (1-234)||(26728783-26729016)
chr6 (1-299)||(26823609-26823902)
chr6 (2-233)||(26861446-26861677)
chr6 (1-300)||(27678716-27679008)
chr6 (1-231)||(27677739-27677969)
chr6 (1-300)||(27706527-27706819)
chr6 (1-231)||(27593145-27593375)
chr6 (89-294)||(27427816-27428020)
chr6 (1-182)||(27531322-27531503)
chr6 (1-234)||(26646302-26646541)
chr6 (1-234)||(26752270-26752509)
chr6 (1-203)||(26884023-26884225)
chr6 (1-169)||(25579613-25579781)
chr6 (2-189)||(28234438-28234625)
chr6 (1-169)||(26142759-26142927)
chr6 (3-169)||(25481636-25481802)
chr6 (1-169)||(26055820-26055988)
chr6 (1-169)||(26075790-26075958)
chr6 (71-230)||(27665312-27665471)
chr6 (71-168)||(25071554-25071651)
chr6 (204-298)||(26055724-26055818)
chr6 (205-298)||(25481540-25481633)
chr6 (205-298)||(25538338-25538431)
chr6 (205-298)||(26048643-26048736)
chr6 (205-298)||(26069812-26069905)
chr6 (205-298)||(26075694-26075787)
chr6 (205-298)||(26142663-26142756)
chr6 (42-168)||(26635585-26635711)
chr6 (42-168)||(26741551-26741677)
chr6 (2-168)||(28226845-28227011)
chr6 (2-207)||(28185222-28185427)
chr6 (1-169)||(25538434-25538602)
chr6 (1-169)||(26048739-26048907)
chr6 (1-169)||(26069908-26070076)
chr6 (42-161)||(26959067-26959186)
chr6 (2-165)||(28242702-28242865)
chr6 (205-314)||(25579499-25579610)
chr6 (70-168)||(26949556-26949654)
chr6 (42-132)||(29825958-29826048)
chr6 (71-168)||(27214312-27214409)
chr6 (71-168)||(27234819-27234916)
chr6 (2-207)||(28180970-28181175)
chr6 (203-283)||(27531503-27531582)
chr6 (74-229)||(28098567-28098725)
chr6 (71-168)||(26848555-26848652)
chr6 (71-168)||(26974947-26975044)
chr6 (110-201)||(28325343-28325434)
chr6 (1-79)||(25507034-25507112)
chr6 (2-150)||(28139454-28139602)
chr6 (2-89)||(28149912-28149998)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-312)||(13757-14069)
scaffold0277 (1-301)||(4796-5102)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (1-317)||(42-352)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-317)||(7277-7587)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (1-312)||(3547-3858)
scaffold0349 (1-312)||(14480-14790)
scaffold0349 (137-312)||(8062-8238)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (5-311)||(18699516-18699821)
chr4 (5-301)||(18731620-18731915)
chr4 (5-311)||(18655593-18655898)
chr4 (5-301)||(18679683-18679978)
chr4 (5-236)||(18724201-18724432)
chr4 (89-294)||(17989250-17989454)
chr4 (89-294)||(18073535-18073739)
chr4 (71-162)||(5091149-5091240)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (1-229)||(29273895-29274123)
chr8 (32-186)||(31903728-31903882)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (1-236)||(268469-268704)
chr1 (42-259)||(28164515-28164733)
chr1 (67-256)||(28127858-28128042)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (89-294)||(59343-59547)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (2-189)||(34599-34786)
scaffold0038 (2-168)||(27343-27509)
scaffold0038 (2-165)||(42864-43027)
scaffold0038 (110-201)||(116658-116749)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (2-189)||(58408-58595)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (42-168)||(17993850-17993976)
chr2 (1-159)||(3279592-3279750)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 27604830 - 27605213
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||   |||| || | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27604830 aaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtca 27604929  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27604930 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagagg 27605029  T
Q  201 aagagga------aggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaa-agagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtgg 293  Q
    | |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605030 atgaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtgg 27605129  T
Q  294 tctgtgatttggagtctttaatataacatggagaaattgttcttaagaaatggttatttttgtcataagtttttgcggtctgtg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27605130 tctgtgatttggagtctttaatataacaaggagaaattgttcttaataaatagttattttggtcataagtttttgcggtctgtg 27605213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28781201 - 28780889
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28781201 aaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 28781102  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28781101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagagg 28781002  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28781001 aagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28780902  T
Q  300 atttggagtcttt 312  Q
    ||||  |||||||    
T  28780901 atttaaagtcttt 28780889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27229294 - 27228995
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27229294 aaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgatttcgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 27229195  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  27229194 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagagg 27229095  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtga 300  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27229094 aagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg-aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagtatgtttttgtggtatgtga 27228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 27724970 - 27725281
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27724970 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 27725069  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27725070 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagg 27725169  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  27725170 atgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgtt 27725268  T
Q  300 atttggagtcttt 312  Q
    || || |||||||    
T  27725269 atgtgaagtcttt 27725281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31284350 - 31284078
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284350 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 31284251  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  31284250 gtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagagg 31284151  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaa-aaagagtttgagaatgcagaata 272  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31284150 aagaggaagatgattgcatagccatgagatttgagagaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 27698619 - 27698929
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27698619 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 27698718  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  27698719 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtgg 27698818  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtga 300  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  27698819 atgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa-attttgtgttctgtga 27698917  T
Q  301 tttggagtcttt 312  Q
    | || |||||||    
T  27698918 tgtgaagtcttt 27698929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28786340 - 28786039
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28786340 aaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 28786241  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28786240 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagg 28786141  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28786140 atgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28786041  T
Q  300 at 301  Q
    ||    
T  28786040 at 28786039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26802504 - 26802199
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26802504 aaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 26802405  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  26802404 ataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagagg 26802305  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-----aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtc 295  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802304 atgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtc 26802205  T
Q  296 tgtgat 301  Q
    ||||||    
T  26802204 tgtgat 26802199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 27718504 - 27718816
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27718504 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 27718603  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  27718604 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagagg 27718703  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  27718704 atgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 27718803  T
Q  300 atttggagtcttt 312  Q
    || || |||||||    
T  27718804 atgtgaagtcttt 27718816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 27611127 - 27611406
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27611127 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 27611226  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  27611227 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaag 27611326  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611327 aagaggaagctaattgcatagccatgaaaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28792461 - 28792184
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28792461 aaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 28792362  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28792361 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagg 28792262  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 277  Q
    | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28792261 atgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26656051 - 26655750
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  26656051 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 26655952  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||| ||||||||    
T  26655951 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagagg 26655852  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26655851 atgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26655752  T
Q  300 at 301  Q
    ||    
T  26655751 at 26655750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26762022 - 26761721
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  26762022 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 26761923  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||| ||||||||    
T  26761922 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagagg 26761823  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26761822 atgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26761723  T
Q  300 at 301  Q
    ||    
T  26761722 at 26761721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 317
Target Start/End: Original strand, 27338191 - 27338500
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | || ||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||| | |||||||||||||     
T  27338191 aaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaa 27338290  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||  ||||  || ||||||||||||||||    
T  27338291 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagagga 27338390  T
Q  202 agaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtga 300  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338391 agaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtga 27338483  T
Q  301 tttggagtctttaatat 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  27338484 tgtggagtctttaatat 27338500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 317
Target Start/End: Original strand, 27398931 - 27399240
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | || ||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||| | |||||||||||||     
T  27398931 aaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaa 27399030  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||  ||||  || ||||||||||||||||    
T  27399031 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagagga 27399130  T
Q  202 agaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtga 300  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27399131 agaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtga 27399223  T
Q  301 tttggagtctttaatat 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  27399224 tgtggagtctttaatat 27399240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26623038 - 26622805
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26623038 aaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 26622939  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  26622938 gtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagagg 26622839  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattga 234  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26622838 aagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26729016 - 26728783
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26729016 aaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 26728917  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  26728916 gtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagagg 26728817  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattga 234  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26728816 aagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26823902 - 26823609
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26823902 aaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtct 26823803  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||  |||| |||| |||||||     
T  26823802 gtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaactgaagag- 26823704  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaa-aaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
         |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  26823703 -----gaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaattggacgaagaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtatgttactgtggtgtgtg 26823609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26861677 - 26861446
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26861677 aaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcag 26861578  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| || |||||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  26861577 taagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagagga 26861478  T
Q  202 agaggaaggtaattgcatagccatgagaattg 233  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26861477 agagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27679008 - 27678716
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||   | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27679008 aaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtca 27678909  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  || |  ||||||||||||||| ||    
T  27678908 gtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtgg 27678809  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27678808 aagaggaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgag-aagtttttgtggtctgtg 27678717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27677739 - 27677969
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27677739 aaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtca 27677838  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||| | ||||| ||||||||  || |  ||||||||||||||| ||    
T  27677839 tcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtgg 27677938  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaat 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27677939 aagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 27706527 - 27706819
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27706527 aaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtca 27706626  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
      || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||   || || ||||| ||||| ||||||||  || |  ||||||||||||||| ||    
T  27706627 tcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtgg 27706726  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27706727 aagagaaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgag-aagtttttgtggtctgtg 27706818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27593145 - 27593375
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||  |||||||||||  ||   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27593145 aaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtca 27593244  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  || |  ||||||||||||||| ||    
T  27593245 gtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtgg 27593344  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaat 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27593345 aagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Original strand, 27427816 - 27428020
Alignment:
Q  89 attcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagg 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  27427816 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcatagg 27427915  T
Q  189 aaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttt 288  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  27427916 aaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttt 27428014  T
Q  289 tgtggt 294  Q
    ||||||    
T  27428015 tgtggt 27428020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 27531322 - 27531503
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27531322 aaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtca 27531421  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatg 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27531422 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatg 27531503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26646541 - 26646302
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26646541 aaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtca 26646442  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||| | ||||||||| ||||||    
T  26646441 gtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagagg 26646342  T
Q  201 aaga------ggaaggtaattgcatagccatgagaattga 234  Q
    ||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26646341 aagaggaataggaaggagattgcatagccatgagaattga 26646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26752509 - 26752270
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26752509 aaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtca 26752410  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||| | ||||||||| ||||||    
T  26752409 gtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagagg 26752310  T
Q  201 aaga------ggaaggtaattgcatagccatgagaattga 234  Q
    ||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26752309 aagaggaataggaaggagattgcatagccatgagaattga 26752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26884225 - 26884023
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||| | |||||||    |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26884225 aaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtta 26884126  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26884125 gtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagg 26884026  T
Q  201 aag 203  Q
    |||    
T  26884025 aag 26884023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25579781 - 25579613
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  25579781 aaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtca 25579682  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  25579681 acaagagccttatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28234625 - 28234438
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | | |||||||| |||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28234625 aaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgac 28234526  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagga 189  Q
     ||||||  | ||||||||  |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||    
T  28234525 aaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 28234438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26142927 - 26142759
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  26142927 aaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtca 26142828  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||   ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26142827 acaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25481802 - 25481636
Alignment:
Q  3 aaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||| ||  | ||||||||||||      
T  25481802 aaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaac 25481703  T
Q  103 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  25481702 aagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26055988 - 26055820
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  26055988 aaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtca 26055889  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  26055888 acaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26075958 - 26075790
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  26075958 aaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtca 26075859  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  26075858 acaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Original strand, 27665312 - 27665471
Alignment:
Q  71 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacactt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |    
T  27665312 tcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtgaaaccaaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacacat 27665411  T
Q  171 ggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaa 230  Q
     | |  ||||  |||| || |  || ||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  27665412 cgaagttgaaatcataagagagggaggaggaggaagtaggtaattgcatagccatgagaa 27665471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25071651 - 25071554
Alignment:
Q  71 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  25071651 tcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccggtaaaaccgaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 25071554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055724
Alignment:
Q  204 aggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26055724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481540
Alignment:
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 25481540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538338
Alignment:
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgattaa-tttgtgtggtctgt 25538338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048643
Alignment:
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26048643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069812
Alignment:
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26069812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075694
Alignment:
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26075694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142663
Alignment:
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26635711 - 26635585
Alignment:
Q  42 tgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagt 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||||| || ||||    
T  26635711 tgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaaccgaattgagt 26635612  T
Q  142 gtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26635611 gtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26635585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26741677 - 26741551
Alignment:
Q  42 tgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagt 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||||| || ||||    
T  26741677 tgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaaccgaattgagt 26741578  T
Q  142 gtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26741577 gtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26741551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28227011 - 28226845
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||   ||||||||| | |||||||| |||| |||||| || | |||||||| ||| ||||| |||||||| | |     
T  28227011 aaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttac 28226912  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
     |||| |  |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  28226911 aaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 28226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28185427 - 28185222
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||| || |||| |||||| || |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  28185427 aaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcac 28185328  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 201  Q
     ||||||  | | |||||| || |||||||  || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |  || |||||| ||||||| |  ||||||||    
T  28185327 aaagagctctattgagatttccagtaaaacgataacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagagga 28185228  T
Q  202 agagga 207  Q
     |||||    
T  28185227 tgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25538602 - 25538434
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||    ||||||||||||    
T  25538602 aaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtca 25538503  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||   ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  25538502 acaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26048907 - 26048739
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||   | | |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||    ||||||||||||    
T  26048907 aaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtca 26048808  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
     | |||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26048807 atgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26070076 - 26069908
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||   | | |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||    ||||||||||||    
T  26070076 aaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtca 26069977  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacact 169  Q
     | |||||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26069976 atgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26959186 - 26959067
Alignment:
Q  42 tgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagt 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||| | |||||||    
T  26959186 tgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaactgaatcgagt 26959087  T
Q  142 gtcagtgcccctaaaactaa 161  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  26959086 gtcggtgcccctgaaactaa 26959067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28242865 - 28242702
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | | ||||  || |||| | ||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| | |     
T  28242865 aaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttac 28242766  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaa 165  Q
     |||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  28242765 aaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25579610 - 25579499
Alignment:
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg---aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||     
T  25579610 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaataaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tgtgtgtggtctgtgag 25579512  T
Q  302 ttggagtctttaa 314  Q
     |||| |||||||    
T  25579511 gtggattctttaa 25579499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26949654 - 26949556
Alignment:
Q  70 atcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||| || || || ||||||| ||||||    
T  26949654 atcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccggtgaaaccgaatcgagtgtcggtacctctgaaactaatgaacac 26949556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29826048 - 29825958
Alignment:
Q  42 tgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaacc 132  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29826048 tgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27214409 - 27214312
Alignment:
Q  71 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  27214409 tcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Original strand, 27234819 - 27234916
Alignment:
Q  71 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  27234819 tcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28181175 - 28180970
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||| || |||| |||||| || |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  28181175 aaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcac 28181076  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 201  Q
     ||||||  | | |||||| || |||||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||| | |  || |||||| ||||||| |  ||||||||    
T  28181075 aaagagctctattgagatttccagtaaaaccataacgagtgtcaccacctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagagga 28180976  T
Q  202 agagga 207  Q
     |||||    
T  28180975 tgagga 28180970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 283
Target Start/End: Original strand, 27531503 - 27531582
Alignment:
Q  203 gaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 283  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27531503 gaggaaggtgattgcgtagccatgagaactgagagaaactt-atgacaaggagtttgagaatgcagaatgtgaatgagtaa 27531582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 28098567 - 28098725
Alignment:
Q  74 tcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggt 173  Q
    |||||||||||| ||| |||   ||||  |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |    
T  28098567 tcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaaccataccgagtgtcggtgcccctaaaattaagaaacacgtcat 28098666  T
Q  174 aagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaatt---gcatagccatgaga 229  Q
    | |||||| |||| || | ||||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||||    
T  28098667 aggtgaatccataagagaatgaagagaaagaggaagatgattggagcatagccatgaga 28098725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26848652 - 26848555
Alignment:
Q  71 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || |||||||| || || |||| | ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  26848652 tcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagattaccagtgaaactgaatctagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26848555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26975044 - 26974947
Alignment:
Q  71 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||||| |||||||||| || || || ||||||| ||||||    
T  26975044 tcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaaccgaatcgagtgtcggtacctctgaaactaatgaacac 26974947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28325434 - 28325343
Alignment:
Q  110 ttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 201  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||  ||||||||    
T  28325434 ttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 25507034 - 25507112
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatg 79  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| | |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  25507034 aaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtgatttcatctcctcttttcagatcacaatcatcaatg 25507112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28139602 - 28139454
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | |   ||||| || |||| |||||| || | ||||||||| || |||||||||||   ||||     
T  28139602 aaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcac 28139503  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcc 150  Q
     |||||| ||||||||||| || || |||||| | ||||||||| ||||    
T  28139502 gaagagctttgtagagatttccagtgaaaccgaaacgagtgtcactgcc 28139454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28149998 - 28149912
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtgga 89  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||| ||||||| || ||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  28149998 aaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 13757 - 14069
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13757 aaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 13856  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13857 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagagg 13956  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13957 aagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 14056  T
Q  300 atttggagtcttt 312  Q
    ||||  |||||||    
T  14057 atttaaagtcttt 14069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 4796 - 5102
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4796 aaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 4895  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4896 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagg 4995  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaa-gagtttgagaatgcagaatatgaat-----gagtaagtttttgtggt 294  Q
    | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     || ||||||||||||||    
T  4996 atgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaatgaataagtttttgtggt 5095  T
Q  295 ctgtgat 301  Q
    |||||||    
T  5096 ctgtgat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 42 - 352
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42 aaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 141  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  142 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagagg 241  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  242 aagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 334  T
Q  300 atttggagtctttaatat 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  335 atgtggagtctttaatat 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7587 - 7277
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7587 aaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 7488  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7487 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagagg 7388  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7387 aagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 7295  T
Q  300 atttggagtctttaatat 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  7294 atgtggagtctttaatat 7277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3858
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3547 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 3646  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3647 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagg 3746  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 299  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  3747 atgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgtt 3845  T
Q  300 atttggagtcttt 312  Q
    || || |||||||    
T  3846 atgtgaagtcttt 3858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 14480 - 14790
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14480 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 14579  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  14580 gtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtgg 14679  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtga 300  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  14680 atgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa-attttgtgttctgtga 14778  T
Q  301 tttggagtcttt 312  Q
    | || |||||||    
T  14779 tgtgaagtcttt 14790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 312
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8238
Alignment:
Q  137 cgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgaga 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgaga 8161  T
Q  237 gaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgatttggagtcttt 312  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||    
T  8162 gaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtgatgtgaagtcttt 8238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Original strand, 18699516 - 18699821
Alignment:
Q  5 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699516 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 18699615  T
Q  105 gagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaaga 204  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||    
T  18699616 gagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatga 18699715  T
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgattt 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||  || |    
T  18699716 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaactagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--ggttaagtttttgtggtctgaaatgt 18699813  T
Q  304 ggagtctt 311  Q
    ||||||||    
T  18699814 ggagtctt 18699821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 18731620 - 18731915
Alignment:
Q  5 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731620 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 18731719  T
Q  105 gagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaaga 204  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||    
T  18731720 gagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatga 18731819  T
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||    
T  18731820 ggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttgtggtatgtgat 18731915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Original strand, 18655593 - 18655898
Alignment:
Q  5 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655593 atcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 18655692  T
Q  105 gagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaaga 204  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||    
T  18655693 gagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatga 18655792  T
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgattt 303  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| |    
T  18655793 ggaaggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttgtggtatgtgatgt 18655890  T
Q  304 ggagtctt 311  Q
    ||||||||    
T  18655891 ggagtctt 18655898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 18679683 - 18679978
Alignment:
Q  5 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18679683 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaa 18679782  T
Q  105 gagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaaga 204  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||    
T  18679783 gagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaatga 18679882  T
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||    
T  18679883 ggaaggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttgtggtatgtgat 18679978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Original strand, 18724201 - 18724432
Alignment:
Q  5 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18724201 atcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaa 18724300  T
Q  105 gagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaaga 204  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||    
T  18724301 gagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatga 18724400  T
Q  205 ggaaggtaattgcatagccatgagaattgaga 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18724401 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaga 18724432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Original strand, 17989250 - 17989454
Alignment:
Q  89 attcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagg 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  17989250 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcatagg 17989349  T
Q  189 aaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttt 288  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17989350 aaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttt 17989448  T
Q  289 tgtggt 294  Q
    ||||||    
T  17989449 tgtggt 17989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18073739 - 18073535
Alignment:
Q  89 attcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagg 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  18073739 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcatagg 18073640  T
Q  189 aaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttt 288  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18073639 aaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttt 18073541  T
Q  289 tgtggt 294  Q
    ||||||    
T  18073540 tgtggt 18073535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 162
Target Start/End: Original strand, 5091149 - 5091240
Alignment:
Q  71 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaag 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||| |  |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5091149 tcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaactaag 5091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29273895 - 29274123
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273895 aaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 29273994  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||  ||| |||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  29273995 gtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagagg 29274094  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgaga 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29274095 aagaggaaggtgattgcatagccatgaga 29274123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903728
Alignment:
Q  32 agtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaac 131  Q
    ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaac 31903783  T
Q  132 cgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcata 186  Q
    | || ||||||||   ||| ||||| || |||||||| | ||| |||||| ||||    
T  31903782 catagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaatccata 31903728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 268469 - 268704
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268469 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 268568  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||  ||| || ||  | ||||| || ||||| |  ||| |||| || ||||||||||    
T  268569 gtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagagg 268668  T
Q  201 aagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgaga 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  268669 aagaggaaggtgattgcatagccatgagaactgaga 268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Original strand, 28164515 - 28164733
Alignment:
Q  42 tgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagt 141  Q
    ||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||  |||||    
T  28164515 tgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagt 28164614  T
Q  142 gtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaat 241  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||| ||||||    
T  28164615 gtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacagaaat 28164714  T
Q  242 tggatga-aaaagagtttg 259  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  28164715 tggatgagaaaagagtttg 28164733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 256
Target Start/End: Original strand, 28127858 - 28128042
Alignment:
Q  67 acaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaac 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  28127858 acaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaac 28127957  T
Q  167 acttggtaagtgaatgcataggaaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatga-aaaagagt 256  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||      ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28127958 acttggtatgtgaatccataggaaatt------gaagaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggatgagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 59547 - 59343
Alignment:
Q  89 attcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagg 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  59547 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcatagg 59448  T
Q  189 aaattgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttt 288  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  59447 aaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg-agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttt 59349  T
Q  289 tgtggt 294  Q
    ||||||    
T  59348 tgtggt 59343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34786 - 34599
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | | |||||||| |||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  34786 aaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgac 34687  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagga 189  Q
     ||||||  | ||||||||  |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||    
T  34686 aaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 34599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27509 - 27343
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||   ||||||||| | |||||||| |||| |||||| || | |||||||| ||| ||||| |||||||| | |     
T  27509 aaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttac 27410  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
     |||| |  |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  27409 aaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 27343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43027 - 42864
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | | ||||  || |||| | ||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| | |     
T  43027 aaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttac 42928  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaa 165  Q
     |||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42927 aaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 116749 - 116658
Alignment:
Q  110 ttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaattgaagagga 201  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||  ||||||||    
T  116749 ttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 58408 - 58595
Alignment:
Q  2 aaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 101  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||   ||||||| | | ||||| || |||| |||||| || |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  58408 aaaatcctagactctttaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcac 58507  T
Q  102 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatagga 189  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| || || |||||| |||||||    
T  58508 aaagagctctgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccatagga 58595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Original strand, 17993850 - 17993976
Alignment:
Q  42 tgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagt 141  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17993850 tgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagattaccggtgaaaccatatcgagt 17993949  T
Q  142 gtcagtgcccctaaaactaaggaacac 168  Q
     || || ||||| ||||||| ||||||    
T  17993950 atcggtacccctgaaactaatgaacac 17993976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3279750 - 3279592
Alignment:
Q  1 aaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacaatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtca 100  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||| | ||||||  | |||||||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||  || |||   ||||    
T  3279750 aaaaatcatggactcttcgatggccttgacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtca 3279651  T
Q  101 gtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaact 159  Q
     | | |||  | |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3279650 cttaaagctctatagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtcagtgcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University